View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2022_low_6 (Length: 255)

Name: NF2022_low_6
Description: NF2022
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2022_low_6
NF2022_low_6
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (12-255)||(25706-25950)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (16-255)||(18535-18774)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (16-255)||(2041-2281)
scaffold0234 (16-255)||(10932-11172)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (16-255)||(22171734-22171974)
chr8 (17-255)||(21940912-21941151)
chr8 (16-255)||(15326445-15326685)
chr8 (16-255)||(15506814-15507054)
chr8 (16-255)||(6094370-6094610)
chr8 (16-255)||(24642896-24643135)
chr8 (16-156)||(28548393-28548534)
chr8 (130-247)||(24797224-24797340)
chr8 (32-254)||(8371270-8371488)
chr8 (82-255)||(14983710-14983880)
chr8 (32-254)||(12562190-12562408)
chr8 (32-254)||(21969400-21969618)
chr8 (32-254)||(25611262-25611480)
chr8 (32-254)||(27007534-27007752)
chr8 (32-254)||(27014677-27014895)
chr8 (32-254)||(27880504-27880722)
chr8 (32-254)||(28020685-28020903)
chr8 (32-254)||(22130626-22130844)
chr8 (32-254)||(22659511-22659729)
chr8 (32-253)||(21916744-21916961)
chr8 (32-254)||(45534290-45534508)
chr8 (32-254)||(38232116-38232336)
chr8 (32-254)||(26240551-26240769)
chr8 (112-247)||(18835424-18835556)
chr8 (100-246)||(8781959-8782102)
chr8 (32-254)||(6430953-6431171)
chr8 (10-122)||(24796715-24796826)
chr8 (32-177)||(20535227-20535371)
chr8 (31-254)||(2962948-2963171)
chr8 (213-255)||(2375258-2375300)
chr8 (42-164)||(29645675-29645797)
chr8 (195-232)||(32872741-32872778)
chr8 (56-176)||(32872609-32872729)
chr8 (32-128)||(36970439-36970534)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (16-255)||(17684189-17684429)
chr6 (16-255)||(17691160-17691400)
chr6 (16-255)||(27380972-27381212)
chr6 (16-255)||(27471355-27471595)
chr6 (16-255)||(11651970-11652210)
chr6 (16-254)||(27296877-27297116)
chr6 (16-255)||(29309137-29309377)
chr6 (16-255)||(29316097-29316336)
chr6 (16-255)||(188697-188937)
chr6 (24-255)||(25536919-25537151)
chr6 (17-235)||(16559193-16559412)
chr6 (16-255)||(16394165-16394405)
chr6 (32-173)||(13359010-13359152)
chr6 (37-254)||(10359073-10359285)
chr6 (32-254)||(16789138-16789356)
chr6 (32-254)||(22859905-22860123)
chr6 (32-254)||(27508364-27508582)
chr6 (32-254)||(27527950-27528168)
chr6 (32-254)||(1586125-1586343)
chr6 (26-255)||(2669540-2669768)
chr6 (100-252)||(20736413-20736562)
chr6 (59-254)||(18019885-18020076)
chr6 (32-254)||(14074547-14074765)
chr6 (32-254)||(8612982-8613204)
chr6 (112-254)||(21994655-21994794)
chr6 (84-244)||(8510181-8510338)
chr6 (118-255)||(17850321-17850455)
chr6 (93-156)||(28172899-28172963)
chr6 (31-171)||(28756144-28756283)
chr6 (32-128)||(33317055-33317150)
chr6 (32-254)||(17120522-17120740)
chr6 (100-247)||(5758565-5758709)
chr6 (143-254)||(22560311-22560419)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (16-255)||(24695186-24695426)
chr5 (16-255)||(19714218-19714458)
chr5 (16-255)||(18569581-18569821)
chr5 (16-255)||(19706939-19707178)
chr5 (32-255)||(17298638-17298859)
chr5 (12-177)||(27347252-27347417)
chr5 (16-122)||(24701950-24702057)
chr5 (137-255)||(39538835-39538953)
chr5 (32-254)||(17285487-17285707)
chr5 (32-254)||(22941317-22941535)
chr5 (32-254)||(31966-32184)
chr5 (32-254)||(20941094-20941312)
chr5 (32-254)||(23545989-23546207)
chr5 (32-254)||(25805402-25805620)
chr5 (32-254)||(12789680-12789898)
chr5 (102-255)||(18806843-18806994)
chr5 (32-254)||(24933323-24933541)
chr5 (32-252)||(20100260-20100476)
chr5 (32-254)||(31096883-31097101)
chr5 (32-247)||(5097725-5097936)
chr5 (12-234)||(18806393-18806613)
chr5 (102-234)||(18806663-18806793)
chr5 (191-252)||(22546912-22546973)
chr5 (32-247)||(12765007-12765222)
chr5 (32-254)||(7865447-7865669)
chr5 (112-254)||(26129789-26129928)
chr5 (109-253)||(18829377-18829519)
chr5 (32-247)||(9811750-9811965)
chr5 (32-247)||(12703891-12704106)
chr5 (12-100)||(28719471-28719558)
chr5 (16-96)||(39538954-39539035)
chr5 (32-254)||(26245169-26245387)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (16-255)||(18262459-18262699)
chr4 (16-255)||(18269320-18269560)
chr4 (16-255)||(55612930-55613170)
chr4 (16-252)||(8858417-8858654)
chr4 (16-255)||(868844-869084)
chr4 (16-255)||(5707567-5707807)
chr4 (16-255)||(5714195-5714435)
chr4 (16-255)||(26963887-26964127)
chr4 (16-255)||(26970710-26970950)
chr4 (16-252)||(19926480-19926717)
chr4 (16-255)||(28392854-28393094)
chr4 (16-255)||(10621053-10621293)
chr4 (16-255)||(10628132-10628372)
chr4 (16-252)||(8845453-8845690)
chr4 (16-247)||(5667849-5668079)
chr4 (16-247)||(35223815-35224047)
chr4 (16-255)||(4426336-4426564)
chr4 (24-247)||(10677311-10677534)
chr4 (24-247)||(10890951-10891174)
chr4 (12-255)||(20311539-20311781)
chr4 (32-254)||(15461564-15461782)
chr4 (32-254)||(34975618-34975836)
chr4 (32-254)||(2677080-2677298)
chr4 (32-254)||(15815088-15815306)
chr4 (32-254)||(18111060-18111278)
chr4 (33-254)||(17299977-17300194)
chr4 (32-254)||(19365586-19365805)
chr4 (116-255)||(21453961-21454099)
chr4 (32-254)||(26531680-26531898)
chr4 (32-254)||(3369040-3369258)
chr4 (32-254)||(19362477-19362695)
chr4 (32-254)||(20244004-20244222)
chr4 (32-254)||(1941791-1942009)
chr4 (32-254)||(4676000-4676218)
chr4 (32-254)||(18163229-18163447)
chr4 (117-253)||(32636552-32636685)
chr4 (33-254)||(5870485-5870702)
chr4 (32-254)||(5528496-5528714)
chr4 (32-247)||(5616469-5616680)
chr4 (100-247)||(9487625-9487769)
chr4 (37-235)||(30040511-30040705)
chr4 (32-247)||(9538033-9538243)
chr4 (100-254)||(4546147-4546298)
chr4 (93-143)||(24701361-24701411)
chr4 (32-255)||(32646540-32646761)
chr4 (112-255)||(33888605-33888743)
chr4 (43-124)||(9937745-9937826)
chr4 (190-247)||(56516311-56516368)
chr4 (39-232)||(11421096-11421285)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (16-255)||(6110311-6110551)
chr3 (16-255)||(8490742-8490982)
chr3 (16-255)||(16482203-16482443)
chr3 (16-255)||(10579075-10579315)
chr3 (16-255)||(15341939-15342179)
chr3 (16-255)||(15600604-15600844)
chr3 (16-255)||(15607149-15607389)
chr3 (16-255)||(32056619-32056860)
chr3 (16-255)||(10572312-10572552)
chr3 (16-255)||(15357306-15357546)
chr3 (16-255)||(17780838-17781078)
chr3 (16-255)||(18520222-18520462)
chr3 (24-255)||(18522910-18523142)
chr3 (16-255)||(13211549-13211789)
chr3 (16-255)||(13248854-13249094)
chr3 (12-255)||(17199900-17200144)
chr3 (16-255)||(1647241-1647481)
chr3 (16-255)||(13517058-13517294)
chr3 (16-242)||(17136613-17136840)
chr3 (16-255)||(29925218-29925458)
chr3 (16-255)||(29974371-29974611)
chr3 (16-252)||(16200680-16200917)
chr3 (32-254)||(21034305-21034523)
chr3 (32-254)||(15846553-15846771)
chr3 (32-254)||(20147571-20147789)
chr3 (32-254)||(21398859-21399077)
chr3 (32-254)||(55427088-55427306)
chr3 (32-253)||(12299978-12300195)
chr3 (32-254)||(14890458-14890676)
chr3 (32-254)||(25978745-25978963)
chr3 (49-247)||(15526827-15527021)
chr3 (32-173)||(28088251-28088391)
chr3 (33-247)||(24253130-24253340)
chr3 (113-247)||(14147095-14147226)
chr3 (53-168)||(30464147-30464261)
chr3 (187-254)||(11787654-11787721)
chr3 (100-254)||(15317257-15317408)
chr3 (89-177)||(32280415-32280507)
chr3 (191-243)||(4189223-4189275)
chr3 (112-176)||(36138033-36138097)
chr3 (154-221)||(28954028-28954093)
chr3 (112-176)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (16-255)||(18252277-18252517)
chr1 (16-255)||(18532234-18532474)
chr1 (16-255)||(27131130-27131369)
chr1 (16-255)||(27310297-27310537)
chr1 (16-255)||(16358755-16358995)
chr1 (16-255)||(3855639-3855879)
chr1 (16-255)||(36816354-36816593)
chr1 (16-255)||(22641594-22641830)
chr1 (16-255)||(27277278-27277517)
chr1 (143-255)||(21171081-21171193)
chr1 (41-208)||(9916523-9916689)
chr1 (32-254)||(19706456-19706674)
chr1 (32-254)||(28134740-28134958)
chr1 (32-254)||(43802382-43802600)
chr1 (32-254)||(9456183-9456401)
chr1 (32-254)||(20779662-20779880)
chr1 (32-254)||(22670274-22670492)
chr1 (32-254)||(42817006-42817224)
chr1 (32-254)||(20391256-20391474)
chr1 (35-254)||(634001-634216)
chr1 (32-254)||(22612559-22612777)
chr1 (93-255)||(12014084-12014244)
chr1 (182-255)||(22657108-22657181)
chr1 (53-247)||(8727741-8727931)
chr1 (16-255)||(23507147-23507385)
chr1 (32-254)||(29096789-29097007)
chr1 (213-254)||(47667668-47667709)
chr1 (115-247)||(21881475-21881604)
chr1 (32-173)||(47667502-47667642)
chr1 (32-128)||(28145740-28145835)
chr1 (190-254)||(35930649-35930713)
chr1 (213-255)||(9917837-9917878)
chr1 (102-176)||(24301691-24301765)
chr1 (82-162)||(12006332-12006413)
chr1 (194-247)||(51997353-51997406)
chr1 (117-176)||(10852402-10852461)
chr1 (154-233)||(31236402-31236478)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (16-253)||(12751075-12751313)
chr7 (24-255)||(15152690-15152922)
chr7 (16-255)||(29328031-29328271)
chr7 (16-255)||(11535782-11536022)
chr7 (16-255)||(11542700-11542940)
chr7 (16-255)||(12738783-12739023)
chr7 (34-255)||(18561254-18561466)
chr7 (16-255)||(13392397-13392637)
chr7 (32-255)||(18257582-18257802)
chr7 (33-255)||(2365169-2365389)
chr7 (34-254)||(41680987-41681203)
chr7 (32-254)||(2204619-2204837)
chr7 (32-254)||(18400171-18400389)
chr7 (32-254)||(18407155-18407373)
chr7 (32-254)||(48808513-48808731)
chr7 (32-254)||(8465066-8465284)
chr7 (16-254)||(30254205-30254440)
chr7 (32-254)||(15729818-15730036)
chr7 (32-254)||(18139355-18139573)
chr7 (16-254)||(47166859-47167094)
chr7 (32-254)||(19230955-19231173)
chr7 (32-247)||(34128647-34128858)
chr7 (100-247)||(19388626-19388774)
chr7 (37-254)||(24443349-24443562)
chr7 (37-243)||(25845498-25845700)
chr7 (37-243)||(25845917-25846119)
chr7 (53-254)||(19393462-19393659)
chr7 (34-163)||(39112138-39112267)
chr7 (32-254)||(10668918-10669137)
chr7 (32-254)||(18259141-18259359)
chr7 (32-254)||(28130628-28130846)
chr7 (112-247)||(14591924-14592056)
chr7 (112-247)||(16011515-16011647)
chr7 (101-240)||(31190524-31190660)
chr7 (89-164)||(22948499-22948574)
chr7 (115-247)||(22969024-22969153)
chr7 (199-255)||(7396471-7396527)
chr7 (34-203)||(15169309-15169474)
chr7 (189-232)||(3132943-3132986)
chr7 (222-254)||(19859189-19859221)
chr7 (105-169)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (16-255)||(7354-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (16-255)||(6654-6894)
scaffold0390 (16-255)||(13670-13910)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (16-255)||(21329968-21330208)
chr2 (16-255)||(18796753-18796993)
chr2 (10-255)||(18620051-18620296)
chr2 (16-250)||(20978127-20978360)
chr2 (32-254)||(30174444-30174662)
chr2 (32-255)||(6991850-6992072)
chr2 (16-245)||(36270423-36270650)
chr2 (32-254)||(24250049-24250267)
chr2 (32-255)||(18822330-18822551)
chr2 (100-254)||(15342086-15342237)
chr2 (44-178)||(17241034-17241167)
chr2 (32-255)||(22183223-22183443)
chr2 (35-254)||(24229235-24229450)
chr2 (32-247)||(29800545-29800756)
chr2 (40-245)||(41316305-41316506)
chr2 (82-162)||(36799745-36799826)
chr2 (100-247)||(19616509-19616653)
chr2 (112-247)||(21626824-21626955)
chr2 (190-252)||(19279538-19279600)
chr2 (100-176)||(28740910-28740986)
chr2 (113-247)||(40301034-40301164)
chr2 (213-254)||(24763751-24763792)
chr2 (188-251)||(28718943-28719006)
chr2 (213-247)||(18851977-18852011)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (34-253)||(1242-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-255)||(230111-230351)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (12-255)||(5776-6013)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (32-254)||(12966-13184)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (32-254)||(3692-3910)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (32-254)||(250-468)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (32-254)||(119797-120015)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (32-254)||(67391-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (53-254)||(130262-130459)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (84-254)||(26609-26775)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (112-254)||(8372-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (39-254)||(40012-40223)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (43-245)||(8807-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (32-205)||(102-271)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (112-247)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (32-247)||(11543-11758)


Alignment Details
Target: scaffold0186 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25950
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  111 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  211 gatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 25950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18535
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 18675  T
Q  116 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18674 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 18575  T
Q  216 atccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18574 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2281
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11172
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171734
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtg 22171734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940912
Alignment:
Q  17 atgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  116 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  216 atccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 21940912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326445
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 15326445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506814
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 15506814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094370
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 6094370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642896
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 24642896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 247
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797340
Alignment:
Q  130 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  230 ttactcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttata 24797340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 8371270 - 8371488
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  8371270 ccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 8371368  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  8371369 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 8371465  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  8371466 actcttaatatttatacctatgt 8371488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 255
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983880
Alignment:
Q  82 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttta 180  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  181 taacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatat-aatattactcctaatatctacatctatgtg 14983880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12562408 - 12562190
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  12562408 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 12562310  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  12562309 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 12562213  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12562212 actcctaatatttatatctatgt 12562190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21969618 - 21969400
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  21969618 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 21969520  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  21969519 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 21969423  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21969422 actcctaatatttatatctatgt 21969400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25611480 - 25611262
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  25611480 ccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 25611382  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  25611381 gagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 25611285  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25611284 actcctaatatttatatctatgt 25611262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 27007534 - 27007752
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  27007534 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 27007632  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  27007633 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 27007729  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27007730 actcctaatatttatatctatgt 27007752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 27014677 - 27014895
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  27014677 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 27014775  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  27014776 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 27014872  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27014873 actcctaatatttatatctatgt 27014895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 27880504 - 27880722
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  27880504 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 27880602  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  27880603 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 27880699  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27880700 actcctaatatttatatctatgt 27880722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 28020685 - 28020903
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  28020685 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 28020783  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  28020784 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 28020880  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  28020881 actcctaatatttatatctatgt 28020903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 22130626 - 22130844
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  22130626 ccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaa 22130724  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  22130725 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 22130821  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22130822 actcctaatatttatatctatgt 22130844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 22659511 - 22659729
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  22659511 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 22659609  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||| |||| |||||    
T  22659610 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtatacatatt 22659706  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  22659707 actcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21916961 - 21916744
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  21916961 ccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 21916863  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  21916862 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 21916766  T
Q  232 actcataatatttatatctatg 253  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21916765 actcctaatatttatatctatg 21916744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 45534290 - 45534508
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  45534290 ccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 45534388  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  45534389 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 45534485  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  45534486 acttctaatatttatatctatgt 45534508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 38232116 - 38232336
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||  |    
T  38232116 ccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctga 38232215  T
Q  132 gggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    || |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38232216 ggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatat 38232312  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||| |||||||| | |||||||||    
T  38232313 tacccataatatgtgtatctatgt 38232336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26240769 - 26240551
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  26240769 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggttttaggtctaa 26240671  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  26240670 gagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 26240574  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  26240573 actcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835424
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 18835424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttat 246  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6431171 - 6430953
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  |    
T  6431171 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtgatttcaggtctta 6431073  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||| | ||||||||||    
T  6431072 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatatt 6430976  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  6430975 actcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 24796715 - 24796826
Alignment:
Q  10 catcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 108  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24796715 catcaacatgatttgcggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagg 24796812  T
Q  109 gtacatagtggttt 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  24796813 gtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 20535227 - 20535371
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| ||    
T  20535227 ccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtctaa 20535325  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 177  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535326 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 2962948 - 2963171
Alignment:
Q  31 accatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 130  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  2962948 accatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcatagtggtttcaggtcta 2963046  T
Q  131 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaa 227  Q
    || | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  |   | || ||||| ||||||    
T  2963047 agagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtaggtctatccagtataaa 2963144  T
Q  228 tattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2963145 tattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375258
Alignment:
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtg 2375258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  42 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 141  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  142 caccactatcactatgagaatat 164  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872778
Alignment:
Q  195 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatatta 32872778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 32872609 - 32872729
Alignment:
Q  56 ctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta 155  Q
    |||||| ||||||||||||||     |||||| ||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||  | ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  32872609 ctgttatggacaacgtttgaacaacaacaaagtacttgacttctacatcaaggatagatagtggtttcaaattgaagggtgacatacaccaatatcacta 32872708  T
Q  156 tgagaatatcttatgacactt 176  Q
    ||| ||||  |||||| ||||    
T  32872709 tgataataatttatgatactt 32872729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36970534 - 36970439
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 128  Q
    |||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  36970534 ccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684429
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 17684429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691400
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 17691400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381212
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 27381212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471595
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 27471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651970
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 11651970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309137
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 29309137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316097
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 29316097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188937
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 188937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Original strand, 25536919 - 25537151
Alignment:
Q  24 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25536919 atggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtggttt 25537018  T
Q  123 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25537019 caggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 25537118  T
Q  223 ataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  25537119 ataaatatgacacctaatatttatatctatgtg 25537151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559412
Alignment:
Q  17 atgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  116 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  216 atccaatataaatattactc 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactc 16559412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394405
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 16394405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359152
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgaca 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca 13359152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359285
Alignment:
Q  37 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 136  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactca 236  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||  |    
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  237 taatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10359268 taatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16789356 - 16789138
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  16789356 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 16789258  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  16789257 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 16789161  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16789160 actcctaatatttatatctatgt 16789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 22859905 - 22860123
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  22859905 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 22860003  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  22860004 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 22860100  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22860101 actcctaatatttatatctatgt 22860123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 27508364 - 27508582
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  27508364 ccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 27508462  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||    
T  27508463 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatatt 27508559  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27508560 actcctaatatttatatctatgt 27508582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 27527950 - 27528168
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  27527950 ccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 27528048  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||    
T  27528049 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatatt 27528145  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27528146 actcctaatatttatatctatgt 27528168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 1586125 - 1586343
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  1586125 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 1586223  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  1586224 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 1586320  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  1586321 acttctaatatttatatctatgt 1586343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669540
Alignment:
Q  26 ggagtacca-tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 124  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  125 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 223  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  224 taaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtg 2669540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 252
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 254
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020076
Alignment:
Q  59 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 158  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  159 gaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 18020076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14074765 - 14074547
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  14074765 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 14074667  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  14074666 gagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccattataaatatt 14074570  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  14074569 actcccaatatttatacctatgt 14074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8613204 - 8612982
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  8613204 ccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 8613106  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||    
T  8613105 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaat 8613008  T
Q  229 attactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8613007 attactcctaatatttatacctatgt 8612982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510181
Alignment:
Q  84 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 183  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  184 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatattt 244  Q
    | ||  |||||||||||| ||||    | |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattt 8510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850455
Alignment:
Q  118 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 216  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  217 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtg 17850455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  93 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 156  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Original strand, 28756144 - 28756283
Alignment:
Q  31 accatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 130  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||      
T  28756144 accatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcat 28756242  T
Q  131 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 171  Q
    ||| ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756243 aggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33317150 - 33317055
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 128  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33317150 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 17120522 - 17120740
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  17120522 ccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcatagtggtttcaggtctaa 17120620  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||    || |||||||| |||||||| |    
T  17120621 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtcaatccagtataaatact 17120717  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| || |||||||| ||||||    
T  17120718 actcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560419
Alignment:
Q  143 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatat 242  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  243 ttatatctatgt 254  Q
    ||| | ||||||    
T  22560408 ttaaacctatgt 22560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695426
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 24695426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714458
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 19714458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569821
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18569821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707178
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtg 19707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 17298638 - 17298859
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17298638 ccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacatattggtttcaggttgaa 17298737  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  17298738 gggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatat 17298834  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17298835 tactcttaatatttatatctatgtg 17298859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 110  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  111 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 177  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  115 agtggttt 122  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538835
Alignment:
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactca 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||     
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  237 taatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtg 39538835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 17285487 - 17285707
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  17285487 ccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacatattgatttcaggtcgaa 17285586  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  17285587 gagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggtcaatccaatataaatat 17285683  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  17285684 tactcttaatatttatatctatgt 17285707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22941535 - 22941317
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  22941535 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 22941437  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  22941436 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 22941340  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22941339 actcctaatatttatatctatgt 22941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 31966
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  32184 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 32086  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  32085 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 31989  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  31988 actcctaatatttatatctatgt 31966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20941312 - 20941094
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  20941312 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 20941214  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  20941213 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 20941117  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  20941116 actcctaatatttatatctatgt 20941094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23546207 - 23545989
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  23546207 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 23546109  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  23546108 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 23546012  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23546011 actcctaatatttatatctatgt 23545989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 25805402 - 25805620
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  25805402 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtgtaa 25805500  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  25805501 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 25805597  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25805598 actcctaatatttatatctatgt 25805620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 12789680 - 12789898
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  12789680 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 12789778  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  12789779 gagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 12789875  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  12789876 acttctaatatttatatctatgt 12789898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 255
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18806994
Alignment:
Q  102 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  201 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtg 18806994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 24933323 - 24933541
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  24933323 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 24933421  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  24933422 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 24933518  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  24933519 acttctaatatttatatctatgt 24933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 20100260 - 20100476
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||    
T  20100260 ccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatgtctaa 20100358  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| ||||| ||||    
T  20100359 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataagtatt 20100455  T
Q  232 actcataatatttatatctat 252  Q
    |||| ||||||| ||| ||||    
T  20100456 actcctaatattgatacctat 20100476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31097101 - 31096883
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  31097101 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaa 31097003  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  31097002 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 31096906  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||  ||||||| ||||||    
T  31096905 actcctataatttatacctatgt 31096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5097936 - 5097725
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||    
T  5097936 ccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcatagtggtttcaggtctaa 5097838  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||    
T  5097837 gagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatatt 5097741  T
Q  232 actcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||||||    
T  5097740 actcataatatttata 5097725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 18806393 - 18806613
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 111  Q
    |||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||| |||  || |||| | |   |||||| || ||||||  | |||||| |||    
T  18806393 tcatcatgattcgtagagtacaatcaaccgactttataatcatccctttatggatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcatatctagtgta 18806492  T
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  |||||||||  |    
T  18806493 catagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18806589  T
Q  211 gatcaatccaatataaatattact 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18806590 gatcaatccaatataaacattact 18806613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806793
Alignment:
Q  102 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  201 tctcatgacggatcaatccaatataaatattact 234  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattact 18806793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22546973
Alignment:
Q  191 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 22546973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 12765007 - 12765222
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||    
T  12765007 ccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcaggtctaa 12765105  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  12765106 gagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaat 12765203  T
Q  229 attactcataatatttata 247  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12765204 attactcctaatatttata 12765222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 7865447 - 7865669
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  7865447 ccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 7865545  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||    
T  7865546 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaat 7865643  T
Q  229 attactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7865644 attactcctaatatttatacctatgt 7865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 26129789 - 26129928
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| |  ||    
T  26129789 catagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgg 26129885  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26129886 gtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 253
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829519
Alignment:
Q  109 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatg 207  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  || ||  ||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaac-ttacataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  208 acggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatg 253  Q
      || |||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatg 18829519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 9811750 - 9811965
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||    
T  9811750 ccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcaggtctaa 9811848  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  9811849 gagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaat 9811946  T
Q  229 attactcataatatttata 247  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  9811947 attactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 12703891 - 12704106
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||    
T  12703891 ccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcaggtctaa 12703989  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  12703990 gagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaat 12704087  T
Q  229 attactcataatatttata 247  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12704088 attactcctaatatttata 12704106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttgac-ggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 96  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26245387 - 26245169
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||| |||||||||||| ||    
T  26245387 ccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcataatggtttcaggtctaa 26245289  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |    ||||||||| | ||||||||||    
T  26245288 gagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatatt 26245192  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  26245191 actcctaatatttatacctatgt 26245169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262459
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18262459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269320
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18269320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612930
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 55612930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858417
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 8858417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868844
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 868844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707567
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 5707567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714195
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 5714195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963887
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtg 26963887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970710
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtg 26970710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926717
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 19926717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393094
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtac-catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtg 28393094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621293
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtg 10621293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628372
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 10628372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845453
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 8845453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668079
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttata 5668079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223815
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtac-catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttata 35223815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426564
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 4426564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 247
Target Start/End: Original strand, 10677311 - 10677534
Alignment:
Q  24 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 122  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10677311 atggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggttt 10677409  T
Q  123 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 222  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| |    
T  10677410 caagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagt 10677509  T
Q  223 ataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  10677510 ataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 247
Target Start/End: Original strand, 10890951 - 10891174
Alignment:
Q  24 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 122  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10890951 atggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtggttt 10891049  T
Q  123 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 222  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| |    
T  10891050 caagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagt 10891149  T
Q  223 ataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  10891150 ataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311539
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 110  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  111 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgac 209  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |  ||  |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  210 ggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtg 20311539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15461782 - 15461564
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  15461782 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 15461684  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  15461683 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 15461587  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  15461586 actcctaatatttatatctatgt 15461564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34975836 - 34975618
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  34975836 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 34975738  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  34975737 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 34975641  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  34975640 actcctaatatttatatctatgt 34975618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2677298 - 2677080
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  2677298 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 2677200  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  2677199 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 2677103  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  2677102 actcctaatatttatatctatgt 2677080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15815306 - 15815088
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  15815306 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 15815208  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  15815207 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 15815111  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  15815110 actcctaatatttatatctatgt 15815088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 18111060 - 18111278
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18111060 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 18111158  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  18111159 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 18111255  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18111256 actcctaatatttatatctatgt 18111278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Original strand, 17299977 - 17300194
Alignment:
Q  33 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 132  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  17299977 catcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaag 17300075  T
Q  133 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
     | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  17300076 agcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatta 17300172  T
Q  233 ctcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  17300173 ctcctaatatttatatctatgt 17300194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19365805 - 19365586
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  19365805 ccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaa 19365707  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    | |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  19365706 gagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaatat 19365610  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19365609 tactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454099
Alignment:
Q  116 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  216 atccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtg 21454099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26531898 - 26531680
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  26531898 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 26531800  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  26531799 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 26531703  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  26531702 actcctaatatttatatttatgt 26531680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 3369040 - 3369258
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||    
T  3369040 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcatagtggtttcaggtctaa 3369138  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||    
T  3369139 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatatt 3369235  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  3369236 actcctaatatttatatctatgt 3369258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20244222 - 20244004
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  20244222 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 20244124  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  20244123 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 20244027  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  20244026 acttctaatatttatatctatgt 20244004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1942009 - 1941791
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  1942009 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 1941911  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||    
T  1941910 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatatt 1941814  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  1941813 actcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 4676000 - 4676218
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  4676000 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 4676098  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  4676099 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 4676195  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  4676196 acttctaatatttatatctatgt 4676218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18163447 - 18163229
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18163447 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 18163349  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || | |||||||||||||||||    
T  18163348 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatatt 18163252  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  18163251 acttctaatatttatatctatgt 18163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636552
Alignment:
Q  117 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 216  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  217 tccaatataaatattactcataatatttatatctatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5870702 - 5870485
Alignment:
Q  33 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 132  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  5870702 catcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaag 5870604  T
Q  133 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
     | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  5870603 agcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatta 5870507  T
Q  233 ctcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5870506 ctcctaatatttatatctatgt 5870485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 5528496 - 5528714
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  ||    
T  5528496 ccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtataa 5528594  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||     
T  5528595 gagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatatc 5528691  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  5528692 actcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5616680 - 5616469
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || ||    
T  5616680 ccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatctaa 5616582  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    |  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||    
T  5616581 gattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatatt 5616485  T
Q  232 actcataatatttata 247  Q
    |||  |||||||||||    
T  5616484 acttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9487769 - 9487625
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  9487769 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 9487673  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9487672 ttctcacgatgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 30040511 - 30040705
Alignment:
Q  37 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 136  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||    
T  30040511 aaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtg 30040609  T
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactc 235  Q
      |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||  || |||||| | ||||||||||||||    
T  30040610 atatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtcaatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9538243 - 9538033
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| ||    
T  9538243 ccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtctaa 9538145  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    |  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  9538144 gactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatatt 9538049  T
Q  232 actcataatatttata 247  Q
    |||| ||| |||||||    
T  9538048 actcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546147
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  93 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 32646540 - 32646761
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  32646540 ccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacagagttgtttcaggtcgaa 32646639  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| |||   | |||||||||| |||||||    
T  32646640 gggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgac-ttatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggtcaatccaatgtaaatat 32646736  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  32646737 tattcctaatatttatatctatgtg 32646761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888605
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||   | | ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataa--atcattatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
     ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33888645 gtcaattc---ataaatattacacataatatttatatctatgtg 33888605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  43 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516311
Alignment:
Q  190 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttata 56516311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11421285 - 11421096
Alignment:
Q  39 ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgga 138  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  ||||||||||||||||| | | |||      
T  11421285 ccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcatagtggtttcaggtctatgagtgat 11421187  T
Q  139 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
    |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||    
T  11421186 atacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110311
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 6110311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490742
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 8490742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482443
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 16482443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579315
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 10579315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342179
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtg 15342179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600844
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 15600844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607389
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 15607389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056860
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataata-tttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtg 32056860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572552
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 10572552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357546
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtg 15357546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781078
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 17781078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520222
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18520222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18523142 - 18522910
Alignment:
Q  24 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523142 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 18523043  T
Q  123 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18523042 caggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatccaat 18522943  T
Q  223 ataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18522942 ataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18522910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211549
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 13211549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248854
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 13248854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200144
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  111 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  211 gatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtg 17200144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647481
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtac-catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtg 1647481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517058
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgg----ggccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 13517058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136613
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatat 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactcctaatat 17136613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925218
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 29925218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974371
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 29974371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200680
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctat 16200680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21034523 - 21034305
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  21034523 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 21034425  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  21034424 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 21034328  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21034327 actcctaatatttatatctatgt 21034305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 15846553 - 15846771
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  15846553 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 15846651  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  15846652 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 15846748  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  15846749 actcctaatatttatatctatgt 15846771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 20147571 - 20147789
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  20147571 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 20147669  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  20147670 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 20147766  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  20147767 actcctaatatttatatctatgt 20147789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21399077 - 21398859
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  21399077 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 21398979  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  21398978 gagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 21398882  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  21398881 actcctaatatttatacctatgt 21398859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55427306 - 55427088
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  55427306 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 55427208  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  55427207 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 55427111  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  55427110 acttctaatatttatatctatgt 55427088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12300195 - 12299978
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  12300195 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 12300097  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  12300096 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 12300000  T
Q  232 actcataatatttatatctatg 253  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  12299999 actcctaacatttatatctatg 12299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14890676 - 14890458
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  || |||| ||||||||| ||    
T  14890676 ccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcacagtgctttcaggtctaa 14890578  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  14890577 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 14890481  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  14890480 actcctaatatttatatctatgt 14890458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 25978745 - 25978963
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  25978745 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 25978843  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||    
T  25978844 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatatt 25978940  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||    
T  25978941 actcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  49 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  149 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28088391 - 28088251
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  28088391 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 28088293  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 173  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088292 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253340
Alignment:
Q  33 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaa- 24253228  T
Q  133 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  | ||  ||||| ||  ||||| | ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |    
T  24253229 tgtggaatacaccgttatcactatgagaataacttatga-tccttaaataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  233 ctcataatatttata 247  Q
    ||| |||| ||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttata 24253340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147095
Alignment:
Q  113 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 212  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttata 14147095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  53 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  153 ctatgagaatatctta 168  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11787721 - 11787654
Alignment:
Q  187 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11787721 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 15317257 - 15317408
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  |||||||||||    
T  15317257 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagta 15317353  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||| |  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15317354 ttctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280415
Alignment:
Q  89 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacacttt 32280415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4189275 - 4189223
Alignment:
Q  191 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatt 243  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4189275 tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 176
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 176  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28954028
Alignment:
Q  154 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaa 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||| || | |||||||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataac--ttattatgtagtattctcatgatgggttaatccaa 28954028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252277
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18252277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532474
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18532474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131369
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 27131369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310537
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 27310537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16358995
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 16358995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855879
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacca-tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtg 3855879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816593
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataat-ttttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 36816593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641830
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| | ||||||||||| || |||   |||||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtg 22641830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277517
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtaccat-caaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||  || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtg 27277517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171193
Alignment:
Q  143 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  243 ttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||    
T  21171181 ttatatctatgtg 21171193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Original strand, 9916523 - 9916689
Alignment:
Q  41 aactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtgg-tttcaggtcgaagggtggaa 139  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9916523 aactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacatagtggttttcaggtcgaagggtggaa 9916622  T
Q  140 tacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9916623 tacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 19706456 - 19706674
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  19706456 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 19706554  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  19706555 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 19706651  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  19706652 actcctaatatttatatctatgt 19706674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 28134740 - 28134958
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  28134740 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcaggtctaa 28134838  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28134839 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatcaatccaatataaatatt 28134935  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  28134936 actcctaatatttatatctatgt 28134958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 43802382 - 43802600
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  43802382 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 43802480  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  43802481 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 43802577  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  43802578 actcctaatatttatatctatgt 43802600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9456401 - 9456183
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  9456401 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 9456303  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  9456302 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 9456206  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  9456205 actcctaatatttatatctatgt 9456183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 20779662 - 20779880
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  20779662 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 20779760  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  20779761 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 20779857  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  20779858 actcctaatatttatatctatgt 20779880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 22670274 - 22670492
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  22670274 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 22670372  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  22670373 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 22670469  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22670470 actcctaatatttatatctatgt 22670492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 42817006 - 42817224
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  42817006 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 42817104  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  42817105 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 42817201  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  42817202 actcctaatatttatatctatgt 42817224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 20391256 - 20391474
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  20391256 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcatagtggtttcaggtctaa 20391354  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  20391355 gagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 20391451  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  20391452 actcctaacatttatatctatgt 20391474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634001
Alignment:
Q  35 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 134  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  135 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 234  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  235 cataatatttatatctatgt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22612777 - 22612559
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  22612777 ccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcatagtggtttcaggtctaa 22612679  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||    
T  22612678 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataaaaatatt 22612582  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  22612581 actcccaatatttatatctatgt 22612559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014244
Alignment:
Q  93 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 191  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  192 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtg 12014244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657181
Alignment:
Q  182 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 22657181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8727931 - 8727741
Alignment:
Q  53 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 152  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||    
T  8727931 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcatagtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatca 8727833  T
Q  153 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  8727832 ctaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatcaatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507147
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||  || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  214 caatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtg 23507147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29097007 - 29096789
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  29097007 ccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtctaa 29096909  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||||    
T  29096908 gagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatatt 29096812  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    | || |||||| |||| ||||||    
T  29096811 attcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 254
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667709
Alignment:
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 47667709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 47667502 - 47667642
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  47667502 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcatagtggtttcaggtctaa 47667600  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 173  Q
    | | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  47667601 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca 47667642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Original strand, 28145740 - 28145835
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 128  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28145740 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930649
Alignment:
Q  190 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 35930649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917878
Alignment:
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtg 9917878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301765
Alignment:
Q  102 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 176  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatactt 24301765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  82 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 162  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  194 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  117 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  154 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751075
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatg 12751075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15152922 - 15152690
Alignment:
Q  24 atggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152922 atggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 15152823  T
Q  123 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15152822 caggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 15152723  T
Q  223 ataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15152722 ataaatattactcctaatatttatatctatgtg 15152690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29328031
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 29328031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536022
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtg 11536022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542940
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 11542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738783
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtg 12738783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18561466 - 18561254
Alignment:
Q  34 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561466 atcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcgaagg 18561367  T
Q  134 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  18561366 gtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtcaatccaatataaatattac 18561276  T
Q  234 tcataatatttatatctatgtg 255  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  18561275 tcctaatatttatatctatgtg 18561254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392397
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtg 13392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 18257582 - 18257802
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  18257582 ccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 18257680  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||   ||||||||| |||||| | |  || | |||||||||||||||||    
T  18257681 gagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgac--atactatgtaatattctgacggtgggttaatccaatataaatatt 18257778  T
Q  232 actcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  18257779 actcctaatatttatatctatgtg 18257802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2365389 - 2365169
Alignment:
Q  33 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  2365389 catcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacatagtggctttaggtcgaat 2365290  T
Q  133 ggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||  || |||||||| ||| |||||  || |||||||||| ||||||||    
T  2365289 ggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataac--ttcctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatatt 2365193  T
Q  232 actcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  2365192 actcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Original strand, 41680987 - 41681203
Alignment:
Q  34 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 133  Q
    |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||     
T  41680987 atcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaaga 41681085  T
Q  134 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 233  Q
    | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||    
T  41681086 gcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattac 41681182  T
Q  234 tcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  41681183 tcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2204837 - 2204619
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  2204837 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 2204739  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  2204738 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 2204642  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  2204641 actcctaatatttatatctatgt 2204619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18400389 - 18400171
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18400389 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaa 18400291  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  18400290 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 18400194  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18400193 actcctaatatttatatctatgt 18400171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18407373 - 18407155
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18407373 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtccaa 18407275  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  18407274 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 18407178  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18407177 actcctaatatttatatctatgt 18407155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 48808513 - 48808731
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  48808513 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 48808611  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  48808612 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 48808708  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  48808709 actcctaatatttatatctatgt 48808731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8465284 - 8465066
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||    
T  8465284 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtctaa 8465186  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  8465185 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 8465089  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  8465088 actcctaatatttatatctatgt 8465066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30254440 - 30254205
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30254440 catgatttatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30254342  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  30254341 agtggtttcaagtctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 30254245  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30254244 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgt 30254205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15730036 - 15729818
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  15730036 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 15729938  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  15729937 gagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 15729841  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  15729840 acttctaatatttatatctatgt 15729818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 18139355 - 18139573
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  18139355 ccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 18139453  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||    
T  18139454 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatatt 18139550  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18139551 actcctaatatttatatctatgt 18139573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 47166859 - 47167094
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  47166859 catgatttatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 47166957  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  47166958 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 47167054  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47167055 tatctagtataaatattactcataatatttatacctatgt 47167094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19231173 - 19230955
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  19231173 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcatagtggtttcaggtctaa 19231075  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  19231074 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatatt 19230978  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  19230977 actcctaatatttatatctatgt 19230955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34128858 - 34128647
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  34128858 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcaggtctaa 34128760  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  34128759 gagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatctatccagtataaatatt 34128663  T
Q  232 actcataatatttata 247  Q
    |||| |||||||||||    
T  34128662 actcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 197  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  198 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 254
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443562
Alignment:
Q  37 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactca 236  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || | |||| | ||||||||||||||     
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  237 taatatttatatctatgt 254  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgt 24443562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  37 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 136  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactca 236  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||     
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  237 taatatt 243  Q
    |||||||    
T  25845694 taatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  37 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 136  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  137 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactca 236  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||     
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  237 taatatt 243  Q
    |||||||    
T  25846113 taatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393659
Alignment:
Q  53 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 152  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  153 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |   | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39112267 - 39112138
Alignment:
Q  34 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 133  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||      
T  39112267 atcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcatgttgaata 39112168  T
Q  134 gtggaatacaccactatcactatgagaata 163  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112167 atggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 10668918 - 10669137
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||    
T  10668918 ccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcatagtggtttcaggtctaa 10669016  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    | | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||| | |||||||||    
T  10669017 gagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatat 10669113  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgt 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  10669114 tactcctaatatttatacctatgt 10669137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 18259141 - 18259359
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||    
T  18259141 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcataagggtttcaggtctaa 18259239  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| |  || || ||||| ||||||||||    
T  18259240 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtctatccagtataaatatt 18259336  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||   |||||||||| ||||||    
T  18259337 actttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28130846 - 28130628
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||    
T  28130846 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcatagtgatttcaggtctaa 28130748  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    |  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||    || |||||||| ||||||||||    
T  28130747 gaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatatt 28130651  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| | ||||||||| ||||||    
T  28130650 actcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  101 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 200  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  201 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataat 240  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 164
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  89 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 164  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396471
Alignment:
Q  199 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtg 7396471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 203
Target Start/End: Original strand, 15169309 - 15169474
Alignment:
Q  34 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 133  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  ||||||||||| ||| | |||     
T  15169309 atcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcatagtggttttaggactaaga 15169407  T
Q  134 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 203  Q
    || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169408 gtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132943
Alignment:
Q  189 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 232  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta 3132943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859189
Alignment:
Q  222 tataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgt 19859189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  105 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 169  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7354
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 7354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6894
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 6894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13910
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtg 13910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330208
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 21330208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796753
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 18796753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620051
Alignment:
Q  10 catcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 108  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  109 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacac-tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  209 cggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
     || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtg 18620051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978127
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 213  Q
    ||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  ||| | || ||  ||||||||| ||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataa--ttttccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  214 caatccaatataaatattactcataatatttatatct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatct 20978127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30174662 - 30174444
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  30174662 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 30174564  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  30174563 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 30174467  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30174466 actcctaatatttatatctatgt 30174444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 6991850 - 6992072
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  6991850 ccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggccga 6991949  T
Q  131 agggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||  ||||  ||| ||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6991950 agggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcac-ttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataaata 6992046  T
Q  230 ttactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||||| | | ||||||| |||||||    
T  6992047 ttactcctgagatttatacctatgtg 6992072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270423
Alignment:
Q  16 catgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 213  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||||  ||| |||||||  ||||||||| ||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  214 caatccaatataaatattactcataatattta 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatattta 36270423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 24250049 - 24250267
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  24250049 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 24250147  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  24250148 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 24250244  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  24250245 actcctaatatttatatctatgt 24250267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18822551 - 18822330
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18822551 ccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcaggtcgaa 18822452  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18822451 gggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgaga-tctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatataaatat 18822355  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  18822354 taccattaatatttatatctatgtg 18822330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 15342086 - 15342237
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||    
T  15342086 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagta 15342182  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    || ||| |  || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15342183 ttttcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17241167 - 17241034
Alignment:
Q  44 tttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 143  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  17241167 tttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaataca 17241069  T
Q  144 ccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 178  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241068 ccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 22183223 - 22183443
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||   |||||||||||| ||    
T  22183223 ccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtcaaa 22183322  T
Q  132 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22183323 gggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgac-ttttacataacatt--atatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaatat-aatat 22183418  T
Q  231 tactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22183419 tactcttaatatttatatctatgtg 22183443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Original strand, 24229235 - 24229450
Alignment:
Q  35 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 134  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||| | | ||| |    
T  24229235 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatagtggtttcaaggctaagag 24229333  T
Q  135 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 234  Q
     |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||    
T  24229334 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattact 24229430  T
Q  235 cataatatttatatctatgt 254  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  24229431 cctaatatttatacctatgt 24229450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29800756 - 29800545
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  29800756 ccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaa 29800658  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  29800657 gagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatatt 29800561  T
Q  232 actcataatatttata 247  Q
    |||| |||||||||||    
T  29800560 actcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  40 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 139  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  140 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataa 239  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||||||||||  || || ||  | ||||||||||||||||||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  240 tattta 245  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  82 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 162  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  200 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279538
Alignment:
Q  190 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctat 19279538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  100 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 176  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  113 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 212  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||   |||||||||||||  |||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 254
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763792
Alignment:
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 24763792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  188 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatcta 251  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852011
Alignment:
Q  213 tcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttata 18852011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1242
Alignment:
Q  34 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 133  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  134 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  234 tcataatatttatatctatg 253  Q
    || |||||||||||||||||    
T  1261 tcttaatatttatatctatg 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230351
Alignment:
Q  16 catgatttatggagta-ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 114  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  115 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 214  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  215 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 230351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5776
Alignment:
Q  12 tcatcatgatttatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  111 acatagtggtttcaggtcg-aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatga 208  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaat---------gcactatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  209 cggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 12966 - 13184
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  12966 ccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 13064  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||  ||||||||||    
T  13065 gagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataaatatt 13161  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  13162 actcctaatatttatacctatgt 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3910
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  3692 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 3790  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  3791 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 3887  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  3888 actcctaatatttatatctatgt 3910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 250
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  468 ccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 370  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  369 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 273  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  272 actcctaatatttatatctatgt 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 120015 - 119797
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  120015 ccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaa 119917  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  119916 gagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 119820  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  119819 actcctaatatttatatctatgt 119797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Original strand, 67391 - 67609
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  67391 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaa 67489  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 231  Q
    | | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  67490 gagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 67586  T
Q  232 actcataatatttatatctatgt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  67587 actcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130459
Alignment:
Q  53 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 152  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  153 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctat 252  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26775 - 26609
Alignment:
Q  84 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 183  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26775 aaagcactcgagtcca-catatagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataa 26678  T
Q  184 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
    | |  ||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26677 cat--actatatagtattctcaaggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8372
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt 254  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 8372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 254
Target Start/End: Original strand, 40012 - 40223
Alignment:
Q  39 ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgga 138  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||       
T  40012 ccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcatagtggtttcaagtctaagagttat 40110  T
Q  139 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcata 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    || |||||||  |||||||||||||| ||    
T  40111 atacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtcaatccggtataaatattactccta 40207  T
Q  239 atatttatatctatgt 254  Q
    ||||||||| ||||||    
T  40208 atatttatacctatgt 40223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  43 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 142  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  143 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcataatat 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 271 - 102
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  271 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcagagtggtttcaggtctaa 173  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 205  Q
    | |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  172 gagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  112 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 211  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  212 atcaatccaatataaatattactcataatatttata 247  Q
     |||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 11543 - 11758
Alignment:
Q  32 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  11543 ccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaaagtggtttcaggtctaa 11641  T
Q  132 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 228  Q
    | | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||    || || ||||| |||||||    
T  11642 gagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaat 11739  T
Q  229 attactcataatatttata 247  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  11740 attactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University