View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20233_high_1 (Length: 617)

Name: NF20233_high_1
Description: NF20233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20233_high_1
NF20233_high_1
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (1-585)||(22449071-22449656)
chr1 (55-585)||(18181981-18182508)
chr1 (1-569)||(17678393-17678960)
chr1 (73-585)||(3472804-3473313)
chr1 (5-565)||(8761442-8761999)
chr1 (235-585)||(6151573-6151924)
chr1 (88-571)||(21787935-21788422)
chr1 (257-585)||(22831449-22831774)
chr1 (55-594)||(42865071-42865614)
chr1 (238-594)||(20091520-20091873)
chr1 (1-429)||(3704870-3705302)
chr1 (55-594)||(21714264-21714809)
chr1 (1-392)||(24782906-24783290)
chr1 (1-429)||(45310172-45310602)
chr1 (1-429)||(45489549-45489977)
chr1 (1-429)||(18393769-18394199)
chr1 (142-594)||(22468644-22469102)
chr1 (237-453)||(21022488-21022705)
chr1 (334-551)||(48603026-48603244)
chr1 (334-551)||(22131224-22131441)
chr1 (153-421)||(33049984-33050242)
chr1 (1-392)||(36819114-36819490)
chr1 (1-392)||(16080250-16080622)
chr1 (1-287)||(1010744-1011023)
chr1 (1-185)||(21022767-21022952)
chr1 (123-217)||(20229074-20229168)
chr1 (1-181)||(22831183-22831363)
chr1 (123-223)||(33797358-33797458)
chr1 (55-181)||(6151988-6152114)
chr1 (251-392)||(21313044-21313185)
chr1 (493-585)||(21022305-21022396)
chr1 (370-576)||(34509516-34509726)
chr1 (474-551)||(41781782-41781859)
chr1 (405-551)||(38801598-38801750)
chr1 (143-287)||(20228757-20228894)
chr1 (453-577)||(20248008-20248134)
chr1 (515-594)||(21709721-21709798)
chr1 (453-576)||(33680734-33680860)
chr1 (1-224)||(33797610-33797833)
chr1 (1-223)||(19211943-19212167)
chr1 (410-475)||(21022374-21022439)
chr1 (143-279)||(16375406-16375535)
chr1 (143-279)||(21407384-21407513)
chr1 (370-551)||(27250905-27251091)
chr1 (144-223)||(1925084-1925160)
chr1 (506-551)||(20134941-20134986)
chr1 (370-489)||(20847330-20847450)
chr1 (144-223)||(20924098-20924174)
chr1 (453-551)||(22922136-22922237)
chr1 (143-223)||(52639618-52639699)
chr1 (123-187)||(1925394-1925458)
chr1 (123-187)||(20924408-20924472)
chr1 (144-204)||(39244096-39244156)
chr1 (144-204)||(39247651-39247711)
chr1 (144-204)||(41388196-41388256)
chr1 (466-551)||(21753800-21753887)
chr1 (512-571)||(24783366-24783424)
chr1 (506-577)||(50210534-50210604)
chr1 (513-571)||(20847459-20847516)
chr1 (138-551)||(22532029-22532446)
chr1 (506-551)||(431498-431543)
chr1 (506-551)||(13213204-13213249)
chr1 (506-551)||(16361686-16361731)
chr1 (506-551)||(20916030-20916075)
chr1 (506-551)||(21840406-21840451)
chr1 (490-551)||(22123429-22123490)
chr1 (506-551)||(29776418-29776463)
chr1 (515-569)||(21172777-21172831)
chr1 (515-569)||(21312893-21312947)
chr1 (466-551)||(41050317-41050404)
chr1 (513-551)||(14295901-14295939)
chr1 (513-551)||(15860380-15860418)
chr1 (513-551)||(16275753-16275791)
chr1 (368-449)||(20916093-20916174)
chr1 (513-551)||(21341872-21341910)
chr1 (513-551)||(21346736-21346774)
chr1 (513-551)||(21477402-21477440)
chr1 (490-551)||(27161824-27161886)
chr1 (506-551)||(16368608-16368653)
chr1 (506-551)||(16758406-16758451)
chr1 (514-551)||(20454907-20454944)
chr1 (510-551)||(40388932-40388973)
chr1 (506-551)||(45575231-45575276)
chr1 (515-551)||(31612055-31612091)
chr1 (506-577)||(52928294-52928365)
chr1 (516-551)||(21161504-21161539)
chr1 (252-392)||(23763120-23763259)
chr1 (515-569)||(36819584-36819638)
chr1 (453-548)||(22237382-22237480)
chr1 (466-551)||(50622226-50622315)
chr1 (241-392)||(20138008-20138151)
chr1 (506-551)||(21896579-21896624)
chr1 (506-547)||(29297880-29297921)
chr1 (518-551)||(40129356-40129389)
chr1 (307-392)||(46975393-46975478)
chr1 (242-392)||(19211792-19211934)
chr1 (371-449)||(21161588-21161668)
chr1 (515-551)||(21706942-21706978)
chr1 (515-551)||(21711484-21711520)
chr1 (478-571)||(3705340-3705432)
chr1 (410-453)||(21022442-21022485)
chr1 (1-52)||(21305563-21305614)
chr1 (506-549)||(35261359-35261402)
chr1 (144-187)||(39243898-39243941)
chr1 (144-187)||(39247453-39247496)
chr1 (515-573)||(52639053-52639110)
chr1 (515-552)||(16080691-16080729)
chr1 (167-288)||(20135214-20135336)
chr1 (466-551)||(26064689-26064778)
chr1 (466-551)||(50614398-50614487)
chr1 (515-571)||(1010237-1010292)
chr1 (515-571)||(1925691-1925746)
chr1 (515-571)||(16375995-16376050)
chr1 (476-532)||(18394235-18394291)
chr1 (515-571)||(20924705-20924760)
chr1 (515-571)||(33797033-33797088)
chr1 (515-571)||(39244456-39244511)
chr1 (515-571)||(39248011-39248066)
chr1 (476-532)||(45490013-45490069)
chr1 (286-392)||(21437703-21437808)
chr1 (155-187)||(41388014-41388046)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-585)||(14815-15397)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (1-585)||(4156-4741)
scaffold0676 (144-223)||(526-602)
[»] chr6 (152 HSPs)
chr6 (1-585)||(18906837-18907422)
chr6 (140-585)||(16523330-16523774)
chr6 (1-571)||(18180235-18180803)
chr6 (167-571)||(21766434-21766839)
chr6 (1-571)||(22408111-22408668)
chr6 (1-432)||(20907787-20908221)
chr6 (76-608)||(15894310-15894852)
chr6 (235-585)||(21740072-21740426)
chr6 (305-585)||(18692022-18692302)
chr6 (55-594)||(25642043-25642587)
chr6 (55-594)||(19862695-19863239)
chr6 (159-551)||(22074176-22074547)
chr6 (76-594)||(19872837-19873360)
chr6 (1-392)||(17804113-17804497)
chr6 (367-571)||(21830612-21830815)
chr6 (1-429)||(27567415-27567846)
chr6 (252-594)||(22334955-22335297)
chr6 (234-585)||(22431974-22432326)
chr6 (234-585)||(22438524-22438876)
chr6 (1-429)||(19790585-19791013)
chr6 (12-392)||(25766985-25767358)
chr6 (95-248)||(21834790-21834941)
chr6 (1-289)||(22429836-22430117)
chr6 (155-392)||(27325569-27325808)
chr6 (235-429)||(27553612-27553808)
chr6 (252-578)||(16965367-16965694)
chr6 (1-421)||(23657226-23657638)
chr6 (167-438)||(15041522-15041794)
chr6 (317-569)||(31164964-31165213)
chr6 (1-287)||(22862967-22863246)
chr6 (123-223)||(23414721-23414821)
chr6 (123-223)||(27556479-27556579)
chr6 (57-223)||(14472347-14472513)
chr6 (123-217)||(31478075-31478169)
chr6 (123-217)||(1644455-1644549)
chr6 (370-551)||(35245343-35245530)
chr6 (123-223)||(27416123-27416223)
chr6 (443-577)||(16960271-16960404)
chr6 (59-223)||(18955628-18955792)
chr6 (1-181)||(21739827-21740008)
chr6 (411-577)||(22831241-22831407)
chr6 (348-551)||(1561061-1561268)
chr6 (370-569)||(20638459-20638663)
chr6 (493-551)||(2077017-2077075)
chr6 (3-164)||(22059550-22059712)
chr6 (370-551)||(29060300-29060485)
chr6 (143-287)||(1644726-1644863)
chr6 (392-551)||(25611925-25612090)
chr6 (143-279)||(8243890-8244019)
chr6 (348-551)||(11185271-11185479)
chr6 (143-279)||(11566891-11567020)
chr6 (123-187)||(16760072-16760136)
chr6 (143-279)||(19870619-19870748)
chr6 (143-279)||(23395097-23395226)
chr6 (1-160)||(27415748-27415907)
chr6 (453-576)||(22080995-22081121)
chr6 (124-187)||(22948885-22948948)
chr6 (124-187)||(22952841-22952904)
chr6 (124-187)||(23871329-23871392)
chr6 (124-187)||(23875285-23875348)
chr6 (1-392)||(12706614-12706988)
chr6 (474-540)||(20908252-20908317)
chr6 (515-569)||(27325902-27325955)
chr6 (144-223)||(16760370-16760446)
chr6 (506-551)||(19773996-19774041)
chr6 (506-551)||(22780543-22780588)
chr6 (370-551)||(25629530-25629714)
chr6 (506-551)||(28496788-28496833)
chr6 (506-551)||(29809199-29809244)
chr6 (144-223)||(31477765-31477841)
chr6 (411-551)||(16920847-16920993)
chr6 (143-222)||(18917214-18917294)
chr6 (144-204)||(22949199-22949259)
chr6 (144-204)||(22953155-22953215)
chr6 (144-204)||(23871643-23871703)
chr6 (144-204)||(23875599-23875659)
chr6 (143-279)||(23989949-23990078)
chr6 (143-279)||(12618793-12618921)
chr6 (498-569)||(15041803-15041873)
chr6 (1-102)||(27553413-27553515)
chr6 (263-448)||(31155466-31155644)
chr6 (506-551)||(1595288-1595333)
chr6 (370-493)||(4738725-4738846)
chr6 (144-223)||(16624207-16624283)
chr6 (506-551)||(23992199-23992244)
chr6 (506-551)||(25603707-25603752)
chr6 (506-551)||(25644091-25644136)
chr6 (506-551)||(34963142-34963187)
chr6 (375-493)||(4186199-4186315)
chr6 (127-187)||(14472048-14472108)
chr6 (127-187)||(18956032-18956092)
chr6 (506-549)||(17288112-17288155)
chr6 (515-569)||(17803962-17804016)
chr6 (506-577)||(19303812-19303882)
chr6 (506-577)||(20593553-20593623)
chr6 (506-576)||(27333448-27333518)
chr6 (506-576)||(27394188-27394258)
chr6 (513-551)||(3852407-3852445)
chr6 (513-551)||(8227773-8227811)
chr6 (490-551)||(20557254-20557316)
chr6 (506-548)||(30677014-30677056)
chr6 (307-392)||(16741131-16741216)
chr6 (453-551)||(19651947-19652048)
chr6 (506-551)||(19848343-19848388)
chr6 (506-551)||(20361234-20361279)
chr6 (515-551)||(4738854-4738890)
chr6 (466-544)||(20076470-20076550)
chr6 (76-179)||(22438936-22439040)
chr6 (507-551)||(23019156-23019200)
chr6 (252-392)||(34298681-34298820)
chr6 (517-551)||(31155695-31155729)
chr6 (506-551)||(16448866-16448911)
chr6 (518-551)||(18926657-18926690)
chr6 (476-571)||(19791049-19791143)
chr6 (506-551)||(20108888-20108933)
chr6 (515-568)||(25135949-25136000)
chr6 (476-571)||(27553844-27553938)
chr6 (515-551)||(9100904-9100940)
chr6 (515-551)||(13019242-13019278)
chr6 (519-551)||(18456478-18456510)
chr6 (519-551)||(18461638-18461670)
chr6 (238-281)||(12496336-12496379)
chr6 (144-187)||(16624438-16624481)
chr6 (466-551)||(19668124-19668211)
chr6 (405-448)||(25603601-25603644)
chr6 (513-551)||(4643003-4643041)
chr6 (515-564)||(1588008-1588055)
chr6 (515-571)||(1644024-1644079)
chr6 (307-392)||(2685414-2685499)
chr6 (515-571)||(8243347-8243402)
chr6 (515-571)||(11566376-11566431)
chr6 (515-571)||(12619379-12619434)
chr6 (515-571)||(14471727-14471782)
chr6 (515-571)||(16623868-16623923)
chr6 (252-351)||(19808473-19808573)
chr6 (515-571)||(19870104-19870159)
chr6 (515-564)||(21702069-21702116)
chr6 (307-392)||(22592898-22592983)
chr6 (515-571)||(22862460-22862515)
chr6 (515-571)||(22948597-22948652)
chr6 (515-571)||(22952553-22952608)
chr6 (515-571)||(23394582-23394637)
chr6 (515-571)||(23414419-23414474)
chr6 (515-571)||(23871041-23871096)
chr6 (515-571)||(23874997-23875052)
chr6 (515-571)||(23989434-23989489)
chr6 (515-571)||(27556177-27556232)
chr6 (476-532)||(27567882-27567938)
chr6 (515-547)||(4186118-4186150)
chr6 (297-337)||(14471967-14472007)
chr6 (370-449)||(19773898-19773978)
chr6 (232-288)||(19848033-19848089)
[»] chr8 (122 HSPs)
chr8 (55-585)||(30643151-30643682)
chr8 (1-585)||(20465844-20466434)
chr8 (55-572)||(17926567-17927081)
chr8 (1-571)||(22010484-22011042)
chr8 (1-571)||(16861132-16861700)
chr8 (55-585)||(16410115-16410638)
chr8 (55-490)||(15611329-15611754)
chr8 (55-490)||(15602877-15603302)
chr8 (235-608)||(376973-377347)
chr8 (1-568)||(20856230-20856801)
chr8 (73-552)||(23776713-23777195)
chr8 (135-571)||(39094864-39095302)
chr8 (76-566)||(16184464-16184966)
chr8 (235-571)||(21168772-21169111)
chr8 (76-449)||(24755577-24755959)
chr8 (235-571)||(21162099-21162438)
chr8 (55-594)||(19982809-19983352)
chr8 (55-551)||(19898852-19899354)
chr8 (235-475)||(19259632-19259872)
chr8 (235-489)||(17353984-17354237)
chr8 (334-551)||(44384988-44385207)
chr8 (1-178)||(377414-377592)
chr8 (56-178)||(19259443-19259565)
chr8 (123-223)||(14398038-14398138)
chr8 (370-551)||(5866450-5866637)
chr8 (370-551)||(21249143-21249329)
chr8 (370-551)||(21254981-21255167)
chr8 (474-551)||(23913816-23913893)
chr8 (499-582)||(22873574-22873656)
chr8 (499-585)||(24755482-24755568)
chr8 (493-583)||(19259850-19259939)
chr8 (370-551)||(45131172-45131359)
chr8 (393-551)||(13597816-13597980)
chr8 (1-392)||(16231281-16231656)
chr8 (348-551)||(21490753-21490960)
chr8 (143-287)||(43251834-43251971)
chr8 (370-551)||(21389626-21389813)
chr8 (370-551)||(21396156-21396343)
chr8 (370-551)||(21778952-21779139)
chr8 (370-551)||(21790649-21790836)
chr8 (453-551)||(6520116-6520217)
chr8 (392-551)||(17140671-17140840)
chr8 (405-551)||(18818620-18818770)
chr8 (143-279)||(19278231-19278360)
chr8 (123-187)||(21828279-21828343)
chr8 (143-279)||(21972533-21972662)
chr8 (143-279)||(21976618-21976747)
chr8 (507-555)||(23406135-23406183)
chr8 (411-551)||(7372538-7372682)
chr8 (124-187)||(18862911-18862974)
chr8 (151-337)||(21383634-21383801)
chr8 (144-223)||(18862600-18862676)
chr8 (506-551)||(18879545-18879590)
chr8 (506-551)||(20535968-20536013)
chr8 (144-223)||(21827969-21828045)
chr8 (506-551)||(21919272-21919317)
chr8 (143-223)||(22111928-22112009)
chr8 (506-551)||(31971059-31971104)
chr8 (123-187)||(21410727-21410791)
chr8 (453-551)||(21673458-21673558)
chr8 (123-187)||(21805219-21805283)
chr8 (1-108)||(39094747-39094855)
chr8 (144-223)||(21387149-21387228)
chr8 (506-551)||(14409785-14409830)
chr8 (506-551)||(16413696-16413741)
chr8 (506-551)||(17612408-17612453)
chr8 (506-551)||(18678381-18678426)
chr8 (506-551)||(18717570-18717615)
chr8 (506-551)||(19896004-19896049)
chr8 (348-448)||(31971123-31971222)
chr8 (506-551)||(41597927-41597972)
chr8 (506-551)||(45291074-45291119)
chr8 (149-223)||(21411025-21411096)
chr8 (149-223)||(21805517-21805588)
chr8 (506-577)||(22626472-22626542)
chr8 (453-551)||(38855484-38855586)
chr8 (513-551)||(13508408-13508446)
chr8 (370-451)||(16199820-16199901)
chr8 (167-288)||(18678074-18678196)
chr8 (513-551)||(19937438-19937476)
chr8 (513-551)||(26223649-26223687)
chr8 (167-288)||(32121759-32121881)
chr8 (506-547)||(4083738-4083779)
chr8 (506-551)||(15203609-15203654)
chr8 (506-551)||(21673401-21673446)
chr8 (506-551)||(22874829-22874874)
chr8 (453-551)||(23761112-23761213)
chr8 (453-551)||(26355929-26356030)
chr8 (514-551)||(32121548-32121585)
chr8 (466-551)||(24352772-24352862)
chr8 (252-392)||(20527358-20527497)
chr8 (1-210)||(22028647-22028857)
chr8 (313-392)||(22044809-22044888)
chr8 (138-288)||(23648580-23648730)
chr8 (1-91)||(23834382-23834473)
chr8 (513-551)||(22965478-22965516)
chr8 (513-551)||(25484657-25484695)
chr8 (510-551)||(983733-983774)
chr8 (307-392)||(15531815-15531900)
chr8 (506-551)||(16092612-16092657)
chr8 (307-392)||(23847110-23847195)
chr8 (307-392)||(24445601-24445686)
chr8 (515-568)||(30309029-30309080)
chr8 (524-572)||(15603304-15603351)
chr8 (524-572)||(15611756-15611803)
chr8 (307-360)||(17828677-17828732)
chr8 (515-551)||(28649329-28649365)
chr8 (55-181)||(21168581-21168708)
chr8 (307-392)||(15538374-15538459)
chr8 (515-568)||(17055656-17055707)
chr8 (515-571)||(18863207-18863262)
chr8 (515-571)||(21386847-21386902)
chr8 (515-571)||(21410439-21410494)
chr8 (515-571)||(21804931-21804986)
chr8 (515-571)||(21828576-21828631)
chr8 (140-449)||(21918946-21919255)
chr8 (515-571)||(22111445-22111500)
chr8 (307-392)||(23834097-23834182)
chr8 (515-571)||(30940639-30940694)
chr8 (515-564)||(32598460-32598507)
chr8 (515-564)||(32604992-32605039)
chr8 (515-571)||(43251325-43251380)
[»] chr7 (156 HSPs)
chr7 (1-583)||(12321547-12322128)
chr7 (55-585)||(14429610-14430138)
chr7 (1-571)||(2759880-2760442)
chr7 (1-429)||(3271706-3272134)
chr7 (1-594)||(17137868-17138461)
chr7 (142-429)||(39267847-39268133)
chr7 (252-585)||(12186743-12187078)
chr7 (1-429)||(9445964-9446395)
chr7 (55-594)||(19649344-19649889)
chr7 (142-392)||(9751703-9751952)
chr7 (234-585)||(9702988-9703340)
chr7 (76-594)||(18154717-18155240)
chr7 (2-358)||(11312596-11312947)
chr7 (142-392)||(2832389-2832639)
chr7 (252-594)||(32216606-32216948)
chr7 (1-392)||(15580617-15580991)
chr7 (55-432)||(20569457-20569833)
chr7 (1-392)||(12318052-12318427)
chr7 (252-585)||(24054190-24054523)
chr7 (334-594)||(15211171-15211431)
chr7 (1-392)||(16583181-16583555)
chr7 (1-392)||(13635275-13635650)
chr7 (5-388)||(15605082-15605447)
chr7 (155-429)||(42203876-42204151)
chr7 (1-287)||(70571-70850)
chr7 (1-287)||(74680-74959)
chr7 (1-223)||(33184-33407)
chr7 (348-551)||(11996183-11996390)
chr7 (334-434)||(18301918-18302016)
chr7 (123-216)||(25927432-25927525)
chr7 (123-223)||(13918709-13918809)
chr7 (123-287)||(1859015-1859169)
chr7 (370-551)||(26211754-26211940)
chr7 (167-392)||(14932705-14932932)
chr7 (167-392)||(15356140-15356367)
chr7 (167-392)||(15360254-15360481)
chr7 (143-287)||(39722287-39722424)
chr7 (392-551)||(10588795-10588960)
chr7 (257-392)||(14152048-14152183)
chr7 (474-572)||(15580448-15580545)
chr7 (348-551)||(34200542-34200751)
chr7 (505-585)||(11858305-11858384)
chr7 (158-223)||(7519322-7519387)
chr7 (370-551)||(9508948-9509135)
chr7 (474-551)||(20487341-20487418)
chr7 (405-551)||(14258019-14258169)
chr7 (515-585)||(9752035-9752104)
chr7 (466-540)||(18301846-18301920)
chr7 (1-392)||(9593270-9593645)
chr7 (370-551)||(13032517-13032704)
chr7 (143-279)||(12714893-12715022)
chr7 (143-279)||(12718697-12718826)
chr7 (123-187)||(15083973-15084037)
chr7 (143-279)||(16114270-16114399)
chr7 (143-279)||(16117423-16117552)
chr7 (143-279)||(16907149-16907278)
chr7 (143-279)||(18283395-18283524)
chr7 (143-287)||(26292416-26292553)
chr7 (506-569)||(3564619-3564681)
chr7 (124-187)||(45170272-45170335)
chr7 (506-551)||(15755269-15755314)
chr7 (506-551)||(16402753-16402798)
chr7 (143-223)||(18279480-18279561)
chr7 (506-551)||(28505657-28505702)
chr7 (506-551)||(40443212-40443257)
chr7 (5-157)||(42205257-42205410)
chr7 (144-223)||(45169961-45170037)
chr7 (123-187)||(39722043-39722107)
chr7 (143-210)||(12723670-12723737)
chr7 (155-223)||(18425513-18425578)
chr7 (506-551)||(67493-67538)
chr7 (1-121)||(12187207-12187328)
chr7 (506-551)||(12256144-12256189)
chr7 (506-551)||(12698591-12698636)
chr7 (143-223)||(12704607-12704688)
chr7 (506-551)||(13869122-13869167)
chr7 (506-551)||(15144348-15144393)
chr7 (513-569)||(15605547-15605603)
chr7 (506-551)||(16213355-16213400)
chr7 (506-551)||(17062212-17062257)
chr7 (453-551)||(18005398-18005499)
chr7 (506-551)||(20110293-20110338)
chr7 (506-551)||(27848104-27848149)
chr7 (506-551)||(29329256-29329301)
chr7 (506-551)||(44116290-44116335)
chr7 (506-551)||(47831554-47831599)
chr7 (466-551)||(2282531-2282618)
chr7 (515-569)||(12317901-12317955)
chr7 (515-569)||(14933051-14933105)
chr7 (515-569)||(15356486-15356540)
chr7 (515-569)||(15360600-15360654)
chr7 (466-551)||(16056081-16056168)
chr7 (466-551)||(22072746-22072833)
chr7 (506-549)||(24274898-24274941)
chr7 (406-533)||(28505496-28505629)
chr7 (126-223)||(2530322-2530420)
chr7 (466-550)||(12901074-12901160)
chr7 (513-551)||(16495135-16495173)
chr7 (516-576)||(811467-811527)
chr7 (1-223)||(9644384-9644608)
chr7 (87-183)||(9703397-9703494)
chr7 (506-551)||(13647057-13647102)
chr7 (510-551)||(15082263-15082304)
chr7 (506-551)||(38898718-38898763)
chr7 (506-551)||(44013931-44013976)
chr7 (506-551)||(48273129-48273174)
chr7 (476-532)||(42203785-42203840)
chr7 (1-108)||(48593262-48593370)
chr7 (252-392)||(11262237-11262376)
chr7 (252-392)||(14953106-14953245)
chr7 (252-392)||(14959072-14959211)
chr7 (516-551)||(15605818-15605853)
chr7 (516-551)||(16220050-16220085)
chr7 (252-392)||(44408395-44408534)
chr7 (466-551)||(1868238-1868327)
chr7 (515-561)||(14152280-14152325)
chr7 (466-551)||(15008780-15008869)
chr7 (370-451)||(27848006-27848087)
chr7 (513-551)||(42376345-42376383)
chr7 (241-392)||(19096-19239)
chr7 (515-568)||(8917205-8917256)
chr7 (506-551)||(18456704-18456749)
chr7 (348-451)||(15755043-15755145)
chr7 (307-360)||(18556928-18556983)
chr7 (76-183)||(24054599-24054707)
chr7 (513-548)||(13831154-13831189)
chr7 (515-571)||(32623-32678)
chr7 (515-571)||(71304-71359)
chr7 (515-571)||(75413-75468)
chr7 (515-571)||(1859361-1859416)
chr7 (499-540)||(9446454-9446494)
chr7 (1-199)||(11987312-11987512)
chr7 (515-571)||(12705196-12705251)
chr7 (307-392)||(13149080-13149165)
chr7 (519-568)||(13461538-13461585)
chr7 (515-571)||(13919032-13919087)
chr7 (515-564)||(14216706-14216753)
chr7 (515-571)||(15083685-15083740)
chr7 (515-564)||(15728106-15728153)
chr7 (515-571)||(16113755-16113810)
chr7 (515-571)||(16116908-16116963)
chr7 (515-568)||(16457632-16457683)
chr7 (515-571)||(16907748-16907803)
chr7 (515-571)||(18282880-18282935)
chr7 (515-571)||(18425174-18425229)
chr7 (515-571)||(25927778-25927833)
chr7 (515-571)||(26291886-26291941)
chr7 (515-564)||(35151422-35151469)
chr7 (506-551)||(38227243-38227288)
chr7 (515-571)||(39721755-39721810)
chr7 (241-289)||(11987231-11987279)
chr7 (515-569)||(16583031-16583086)
chr7 (155-187)||(18425748-18425780)
chr7 (155-187)||(18425948-18425980)
chr7 (506-551)||(20220474-20220521)
chr7 (286-392)||(26419908-26420013)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-585)||(16926-17501)
[»] chr4 (139 HSPs)
chr4 (55-585)||(16487938-16488467)
chr4 (55-571)||(16356813-16357326)
chr4 (55-571)||(16348525-16349038)
chr4 (16-571)||(5338801-5339352)
chr4 (76-608)||(12569717-12570259)
chr4 (78-585)||(15093499-15094009)
chr4 (1-429)||(15353112-15353544)
chr4 (142-438)||(13812966-13813261)
chr4 (237-585)||(15121843-15122193)
chr4 (87-585)||(23843202-23843705)
chr4 (1-429)||(16351654-16352088)
chr4 (257-594)||(44675348-44675686)
chr4 (234-585)||(13569227-13569579)
chr4 (294-585)||(15125141-15125434)
chr4 (1-429)||(11250367-11250795)
chr4 (142-392)||(20157407-20157657)
chr4 (1-392)||(36133768-36134152)
chr4 (306-585)||(12423429-12423696)
chr4 (334-551)||(17048453-17048670)
chr4 (232-421)||(25555371-25555559)
chr4 (57-287)||(17810293-17810515)
chr4 (142-392)||(22634369-22634603)
chr4 (318-429)||(631105-631214)
chr4 (1-287)||(14757228-14757507)
chr4 (1-266)||(25555550-25555816)
chr4 (370-577)||(14053477-14053690)
chr4 (123-223)||(43256342-43256442)
chr4 (370-551)||(12902517-12902702)
chr4 (370-551)||(23374529-23374715)
chr4 (405-551)||(17046245-17046397)
chr4 (392-551)||(44052588-44052753)
chr4 (143-287)||(9556551-9556688)
chr4 (515-602)||(22634677-22634764)
chr4 (74-178)||(44675767-44675872)
chr4 (1-223)||(27534103-27534325)
chr4 (474-540)||(13813450-13813516)
chr4 (99-171)||(15125057-15125130)
chr4 (144-217)||(15224962-15225035)
chr4 (469-537)||(631243-631311)
chr4 (143-287)||(4561282-4561419)
chr4 (506-577)||(7798508-7798579)
chr4 (124-187)||(14954433-14954496)
chr4 (124-187)||(25689647-25689710)
chr4 (1-392)||(1951567-1951942)
chr4 (143-223)||(5756886-5756967)
chr4 (506-551)||(7893462-7893507)
chr4 (144-223)||(10712928-10713004)
chr4 (144-223)||(10926698-10926774)
chr4 (405-551)||(16240181-16240331)
chr4 (506-551)||(16377837-16377882)
chr4 (506-551)||(22636195-22636240)
chr4 (506-551)||(52873578-52873623)
chr4 (123-187)||(10712633-10712697)
chr4 (123-187)||(10926403-10926467)
chr4 (123-187)||(12487488-12487552)
chr4 (144-204)||(12487802-12487862)
chr4 (144-204)||(14954122-14954182)
chr4 (144-204)||(25689961-25690021)
chr4 (508-551)||(3096096-3096139)
chr4 (143-279)||(33742407-33742535)
chr4 (466-551)||(39706575-39706662)
chr4 (466-551)||(52243477-52243564)
chr4 (1-224)||(43255967-43256190)
chr4 (506-551)||(12773842-12773887)
chr4 (506-551)||(14038462-14038507)
chr4 (506-551)||(14280091-14280136)
chr4 (506-551)||(16270508-16270553)
chr4 (506-551)||(19618565-19618610)
chr4 (506-551)||(20149607-20149652)
chr4 (506-551)||(52312249-52312294)
chr4 (466-551)||(14132-14219)
chr4 (466-551)||(12288492-12288579)
chr4 (506-549)||(14928061-14928104)
chr4 (513-551)||(14971150-14971188)
chr4 (474-532)||(15353577-15353634)
chr4 (513-551)||(15367426-15367464)
chr4 (513-551)||(15369754-15369792)
chr4 (513-551)||(15373262-15373300)
chr4 (513-551)||(19242450-19242488)
chr4 (87-179)||(13569646-13569739)
chr4 (466-569)||(14157584-14157688)
chr4 (515-571)||(20157731-20157787)
chr4 (515-552)||(36134226-36134263)
chr4 (506-551)||(43198875-43198920)
chr4 (506-551)||(44102033-44102078)
chr4 (506-551)||(54799090-54799135)
chr4 (515-551)||(12613-12649)
chr4 (515-571)||(13818054-13818109)
chr4 (475-569)||(14164289-14164384)
chr4 (370-449)||(15551683-15551762)
chr4 (506-550)||(18215653-18215697)
chr4 (127-187)||(27533803-27533863)
chr4 (252-392)||(41385803-41385942)
chr4 (513-551)||(12610685-12610723)
chr4 (513-551)||(15705149-15705187)
chr4 (513-551)||(23803697-23803735)
chr4 (513-551)||(51464214-51464252)
chr4 (515-568)||(14708912-14708963)
chr4 (515-568)||(18236670-18236721)
chr4 (307-392)||(19757696-19757781)
chr4 (307-392)||(19782025-19782110)
chr4 (370-449)||(3096159-3096238)
chr4 (252-392)||(14678872-14679010)
chr4 (519-551)||(15375548-15375580)
chr4 (1-223)||(17152293-17152516)
chr4 (516-568)||(18603009-18603059)
chr4 (466-513)||(13813353-13813400)
chr4 (474-532)||(16352122-16352179)
chr4 (515-561)||(28569697-28569741)
chr4 (466-551)||(46640699-46640788)
chr4 (466-551)||(53082434-53082523)
chr4 (307-392)||(2014704-2014789)
chr4 (515-571)||(4561862-4561917)
chr4 (515-571)||(5757467-5757522)
chr4 (515-571)||(9556044-9556099)
chr4 (515-571)||(10712369-10712424)
chr4 (515-571)||(10926139-10926194)
chr4 (476-532)||(11250831-11250887)
chr4 (515-571)||(12487199-12487254)
chr4 (393-438)||(13813292-13813337)
chr4 (393-438)||(13813381-13813426)
chr4 (515-571)||(14757964-14758019)
chr4 (515-571)||(14954729-14954784)
chr4 (73-114)||(15121681-15121722)
chr4 (515-571)||(15224556-15224611)
chr4 (307-392)||(16243495-16243580)
chr4 (515-568)||(17152761-17152812)
chr4 (515-571)||(17809788-17809843)
chr4 (519-568)||(18609584-18609631)
chr4 (262-392)||(23838342-23838471)
chr4 (515-571)||(25689383-25689438)
chr4 (307-392)||(26243760-26243845)
chr4 (515-571)||(33741894-33741949)
chr4 (516-568)||(3412576-3412626)
chr4 (307-360)||(9530390-9530445)
chr4 (252-392)||(14685080-14685218)
chr4 (155-187)||(15225190-15225222)
chr4 (237-289)||(17152520-17152572)
chr4 (241-289)||(18222416-18222464)
[»] chr2 (113 HSPs)
chr2 (66-571)||(22811782-22812287)
chr2 (55-572)||(25963577-25964091)
chr2 (1-571)||(21327372-21327945)
chr2 (1-571)||(21318441-21319014)
chr2 (73-585)||(37524410-37524905)
chr2 (1-571)||(40428202-40428776)
chr2 (76-571)||(22799007-22799504)
chr2 (1-429)||(24716336-24716762)
chr2 (164-419)||(21916068-21916322)
chr2 (76-585)||(23019587-23020099)
chr2 (257-585)||(45678192-45678521)
chr2 (235-585)||(24673290-24673645)
chr2 (235-585)||(40622251-40622603)
chr2 (240-585)||(24679907-24680259)
chr2 (1-429)||(24174680-24175111)
chr2 (1-429)||(24655144-24655575)
chr2 (55-578)||(22740820-22741349)
chr2 (1-429)||(25961340-25961768)
chr2 (2-429)||(24869760-24870190)
chr2 (55-585)||(22758575-22759111)
chr2 (1-392)||(24735319-24735703)
chr2 (1-217)||(19688562-19688779)
chr2 (58-287)||(10101509-10101730)
chr2 (474-585)||(24716796-24716907)
chr2 (123-223)||(31344953-31345053)
chr2 (370-551)||(38292-38478)
chr2 (474-551)||(9784555-9784632)
chr2 (370-551)||(23072125-23072312)
chr2 (138-551)||(23060272-23060690)
chr2 (370-551)||(23103571-23103757)
chr2 (405-551)||(23654598-23654749)
chr2 (371-551)||(21900630-21900816)
chr2 (508-594)||(23031092-23031176)
chr2 (3-164)||(44370106-44370268)
chr2 (143-287)||(24649378-24649515)
chr2 (77-181)||(24673709-24673813)
chr2 (73-167)||(21918194-21918288)
chr2 (370-551)||(22336885-22337069)
chr2 (143-287)||(12901460-12901597)
chr2 (143-287)||(27379381-27379518)
chr2 (143-287)||(27383427-27383564)
chr2 (143-279)||(27601825-27601954)
chr2 (474-571)||(25961802-25961899)
chr2 (143-223)||(41530958-41531035)
chr2 (144-223)||(1283464-1283540)
chr2 (144-223)||(30344946-30345022)
chr2 (123-187)||(41531269-41531333)
chr2 (123-187)||(30345256-30345320)
chr2 (466-551)||(22413418-22413505)
chr2 (506-552)||(7679370-7679416)
chr2 (474-571)||(24655609-24655704)
chr2 (506-551)||(299110-299155)
chr2 (506-551)||(6725734-6725779)
chr2 (506-551)||(8946416-8946461)
chr2 (506-551)||(23076250-23076295)
chr2 (506-551)||(23130638-23130683)
chr2 (506-551)||(23133105-23133150)
chr2 (506-551)||(23712391-23712436)
chr2 (143-223)||(24628427-24628508)
chr2 (506-551)||(24643328-24643373)
chr2 (506-551)||(25616001-25616046)
chr2 (123-187)||(1283166-1283230)
chr2 (509-577)||(23657571-23657638)
chr2 (466-551)||(18787184-18787271)
chr2 (515-569)||(19691922-19691976)
chr2 (512-551)||(20322405-20322444)
chr2 (474-571)||(24174550-24174646)
chr2 (515-569)||(24735168-24735222)
chr2 (474-571)||(24869630-24869726)
chr2 (513-551)||(22105104-22105142)
chr2 (509-551)||(22731553-22731595)
chr2 (506-548)||(22738495-22738537)
chr2 (55-216)||(23103256-23103418)
chr2 (515-576)||(25175578-25175639)
chr2 (513-551)||(38967151-38967189)
chr2 (513-551)||(43137032-43137070)
chr2 (506-551)||(8056-8101)
chr2 (506-551)||(21177725-21177770)
chr2 (506-551)||(23040507-23040552)
chr2 (506-551)||(23713211-23713256)
chr2 (506-551)||(32215313-32215358)
chr2 (2-114)||(45677961-45678074)
chr2 (519-577)||(28405717-28405775)
chr2 (143-193)||(15477711-15477761)
chr2 (513-551)||(19671633-19671671)
chr2 (466-551)||(24688570-24688659)
chr2 (167-288)||(25616212-25616334)
chr2 (515-568)||(18855735-18855786)
chr2 (307-392)||(19928597-19928682)
chr2 (515-568)||(23186854-23186905)
chr2 (515-568)||(23598117-23598168)
chr2 (459-551)||(23791024-23791120)
chr2 (506-551)||(24367513-24367558)
chr2 (515-568)||(26124962-26125013)
chr2 (76-129)||(40622089-40622142)
chr2 (506-551)||(24697850-24697897)
chr2 (149-181)||(45678074-45678106)
chr2 (252-392)||(24503019-24503158)
chr2 (370-451)||(20308972-20309053)
chr2 (466-551)||(20520435-20520524)
chr2 (515-564)||(60599-60646)
chr2 (515-571)||(1282902-1282957)
chr2 (515-571)||(10102190-10102245)
chr2 (506-551)||(10822942-10822987)
chr2 (515-571)||(12902053-12902108)
chr2 (307-392)||(18855554-18855639)
chr2 (515-571)||(24629016-24629071)
chr2 (515-571)||(24648869-24648924)
chr2 (515-571)||(27601306-27601361)
chr2 (515-571)||(30345553-30345608)
chr2 (515-571)||(31344651-31344706)
chr2 (515-571)||(41531542-41531597)
chr2 (515-551)||(22134526-22134562)
[»] chr5 (132 HSPs)
chr5 (55-571)||(21366526-21367040)
chr5 (73-568)||(20805293-20805788)
chr5 (76-568)||(20766715-20767207)
chr5 (3-429)||(23451227-23451655)
chr5 (3-429)||(23462732-23463160)
chr5 (1-602)||(18769809-18770412)
chr5 (3-429)||(23458471-23458899)
chr5 (1-429)||(1858782-1859210)
chr5 (1-551)||(22032080-22032630)
chr5 (1-571)||(123111-123681)
chr5 (76-585)||(21872978-21873487)
chr5 (1-540)||(17918957-17919489)
chr5 (1-429)||(24221757-24222188)
chr5 (235-585)||(23201083-23201436)
chr5 (1-429)||(22757010-22757436)
chr5 (76-582)||(14078877-14079386)
chr5 (1-429)||(12028371-12028799)
chr5 (142-392)||(24767493-24767743)
chr5 (1-429)||(26680464-26680890)
chr5 (1-429)||(26952071-26952497)
chr5 (4-489)||(23571899-23572390)
chr5 (235-571)||(23511839-23512174)
chr5 (234-594)||(26703793-26704152)
chr5 (234-594)||(26973526-26973885)
chr5 (370-551)||(22107789-22107973)
chr5 (237-432)||(31342027-31342221)
chr5 (265-429)||(23439860-23440027)
chr5 (139-388)||(17410360-17410602)
chr5 (257-452)||(23501418-23501612)
chr5 (1-392)||(23535395-23535768)
chr5 (368-551)||(19661009-19661197)
chr5 (123-337)||(18355938-18356133)
chr5 (123-223)||(20911100-20911200)
chr5 (123-217)||(10753111-10753205)
chr5 (370-551)||(21808565-21808751)
chr5 (474-585)||(1859244-1859355)
chr5 (370-577)||(9077689-9077898)
chr5 (1-287)||(15236586-15236865)
chr5 (499-585)||(21887013-21887099)
chr5 (370-551)||(21293145-21293332)
chr5 (370-551)||(1096228-1096412)
chr5 (405-551)||(21729276-21729427)
chr5 (370-551)||(22074779-22074965)
chr5 (466-571)||(23439730-23439834)
chr5 (466-571)||(23451097-23451201)
chr5 (466-571)||(23458341-23458445)
chr5 (466-571)||(23462602-23462706)
chr5 (370-551)||(24493328-24493514)
chr5 (1-238)||(18356390-18356627)
chr5 (499-585)||(21877258-21877344)
chr5 (123-191)||(11225107-11225175)
chr5 (55-577)||(37723635-37724163)
chr5 (370-548)||(8287019-8287203)
chr5 (1-224)||(20910606-20910829)
chr5 (370-548)||(21997709-21997892)
chr5 (368-569)||(24528963-24529168)
chr5 (123-187)||(11220525-11220589)
chr5 (123-187)||(11228934-11228998)
chr5 (123-187)||(11230923-11230987)
chr5 (143-279)||(20295876-20296005)
chr5 (393-548)||(13025073-13025233)
chr5 (393-548)||(13095257-13095417)
chr5 (55-181)||(23501205-23501332)
chr5 (125-187)||(11226944-11227006)
chr5 (144-223)||(10753439-10753515)
chr5 (143-279)||(19472668-19472797)
chr5 (453-550)||(22959798-22959898)
chr5 (522-585)||(23571821-23571883)
chr5 (252-392)||(25534897-25535036)
chr5 (466-551)||(27989210-27989297)
chr5 (490-551)||(11581562-11581624)
chr5 (76-181)||(23201500-23201606)
chr5 (506-551)||(14047860-14047905)
chr5 (506-551)||(17517504-17517549)
chr5 (506-551)||(20918325-20918370)
chr5 (506-551)||(23064287-23064332)
chr5 (506-551)||(23390812-23390857)
chr5 (506-551)||(24066929-24066974)
chr5 (510-551)||(25421290-25421331)
chr5 (506-551)||(25431154-25431199)
chr5 (506-551)||(31060803-31060848)
chr5 (506-551)||(38619250-38619295)
chr5 (1-100)||(17410647-17410747)
chr5 (123-187)||(40723852-40723916)
chr5 (466-551)||(20027222-20027309)
chr5 (474-571)||(24221627-24221723)
chr5 (516-571)||(33896074-33896128)
chr5 (506-548)||(22411929-22411971)
chr5 (513-551)||(36314310-36314348)
chr5 (506-551)||(18319329-18319374)
chr5 (453-551)||(19668649-19668749)
chr5 (506-551)||(21329820-21329865)
chr5 (506-551)||(21565294-21565339)
chr5 (506-551)||(29329673-29329718)
chr5 (506-546)||(20902308-20902348)
chr5 (515-569)||(17410245-17410299)
chr5 (252-392)||(21295321-21295460)
chr5 (499-578)||(23501619-23501696)
chr5 (252-392)||(24554443-24554582)
chr5 (513-551)||(20807088-20807126)
chr5 (515-561)||(24767837-24767882)
chr5 (55-129)||(26704251-26704325)
chr5 (55-129)||(26973984-26974058)
chr5 (513-551)||(41095966-41096004)
chr5 (506-551)||(10776011-10776056)
chr5 (506-551)||(21502481-21502526)
chr5 (506-551)||(32027132-32027177)
chr5 (516-568)||(17730685-17730735)
chr5 (136-183)||(31342254-31342301)
chr5 (515-561)||(21885466-21885510)
chr5 (515-561)||(26172249-26172293)
chr5 (241-392)||(26742784-26742927)
chr5 (515-564)||(4036000-4036047)
chr5 (515-571)||(10752704-10752759)
chr5 (515-571)||(11226656-11226711)
chr5 (515-571)||(11230635-11230690)
chr5 (476-532)||(12028835-12028891)
chr5 (515-571)||(15237372-15237427)
chr5 (307-392)||(16674078-16674163)
chr5 (515-571)||(19473255-19473310)
chr5 (307-392)||(20232476-20232561)
chr5 (515-571)||(20295361-20295416)
chr5 (515-571)||(20911471-20911526)
chr5 (476-571)||(22756880-22756974)
chr5 (515-564)||(25229683-25229730)
chr5 (515-564)||(25293839-25293886)
chr5 (307-392)||(26666226-26666311)
chr5 (515-568)||(26743021-26743072)
chr5 (307-392)||(26937823-26937908)
chr5 (307-392)||(33409154-33409239)
chr5 (307-392)||(42805345-42805430)
chr5 (241-289)||(21340804-21340852)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-585)||(1889-2470)
[»] chr3 (187 HSPs)
chr3 (55-584)||(18383777-18384305)
chr3 (55-585)||(11862519-11863049)
chr3 (55-585)||(322318-322847)
chr3 (55-571)||(12496000-12496513)
chr3 (55-571)||(19725772-19726277)
chr3 (55-565)||(11298389-11298900)
chr3 (235-571)||(12172537-12172872)
chr3 (1-429)||(12037758-12038185)
chr3 (1-585)||(855864-856449)
chr3 (95-383)||(11851510-11851797)
chr3 (235-585)||(16369125-16369476)
chr3 (1-429)||(11557190-11557621)
chr3 (1-429)||(1982616-1983047)
chr3 (337-583)||(15067409-15067656)
chr3 (235-571)||(14878557-14878894)
chr3 (142-392)||(14665320-14665570)
chr3 (235-594)||(15878092-15878451)
chr3 (1-428)||(3389741-3390171)
chr3 (55-453)||(15051367-15051774)
chr3 (1-429)||(11594945-11595373)
chr3 (379-585)||(11849041-11849248)
chr3 (142-392)||(14668476-14668726)
chr3 (1-428)||(3402761-3403191)
chr3 (235-489)||(23053128-23053383)
chr3 (1-392)||(20461306-20461690)
chr3 (263-429)||(26196500-26196666)
chr3 (235-602)||(23077518-23077866)
chr3 (1-392)||(2897629-2898012)
chr3 (1-392)||(7793152-7793540)
chr3 (233-551)||(23408187-23408506)
chr3 (1-392)||(326970-327355)
chr3 (73-429)||(42325824-42326180)
chr3 (1-392)||(15482588-15482962)
chr3 (235-400)||(15060196-15060360)
chr3 (1-178)||(16909885-16910063)
chr3 (57-287)||(30065970-30066192)
chr3 (318-421)||(12852662-12852763)
chr3 (370-551)||(13210504-13210690)
chr3 (123-223)||(5223140-5223240)
chr3 (123-223)||(12339542-12339642)
chr3 (1-222)||(11300317-11300539)
chr3 (9-287)||(11854757-11855028)
chr3 (55-178)||(15060427-15060550)
chr3 (123-217)||(4589038-4589132)
chr3 (1-178)||(16369543-16369721)
chr3 (474-572)||(26196700-26196797)
chr3 (123-223)||(11300695-11300795)
chr3 (123-223)||(15464941-15465041)
chr3 (417-551)||(16796056-16796192)
chr3 (57-223)||(14499405-14499571)
chr3 (57-287)||(11070092-11070314)
chr3 (57-279)||(11165392-11165606)
chr3 (123-217)||(19775515-19775609)
chr3 (57-279)||(55022899-55023113)
chr3 (493-585)||(16909598-16909689)
chr3 (1-108)||(26190814-26190922)
chr3 (1-392)||(15849891-15850264)
chr3 (334-436)||(16796195-16796295)
chr3 (370-551)||(12398968-12399154)
chr3 (405-551)||(14682140-14682291)
chr3 (474-569)||(3403226-3403321)
chr3 (143-287)||(15617398-15617535)
chr3 (110-181)||(12172936-12173007)
chr3 (466-540)||(12852797-12852871)
chr3 (1-289)||(31097360-31097642)
chr3 (405-551)||(14670618-14670769)
chr3 (405-551)||(25476596-25476744)
chr3 (143-279)||(7109730-7109859)
chr3 (143-279)||(7113665-7113794)
chr3 (143-279)||(22336751-22336880)
chr3 (143-279)||(27409592-27409721)
chr3 (143-279)||(28949756-28949885)
chr3 (124-187)||(15964749-15964812)
chr3 (124-187)||(15968673-15968736)
chr3 (124-187)||(15972597-15972660)
chr3 (466-551)||(16097119-16097206)
chr3 (506-552)||(13442076-13442122)
chr3 (392-551)||(17487616-17487780)
chr3 (392-551)||(17499098-17499262)
chr3 (405-551)||(18438294-18438443)
chr3 (515-585)||(23053391-23053460)
chr3 (466-551)||(23083633-23083722)
chr3 (411-569)||(40213937-40214098)
chr3 (144-223)||(4111204-4111280)
chr3 (144-223)||(15965047-15965123)
chr3 (144-223)||(15968971-15969047)
chr3 (144-223)||(15972895-15972971)
chr3 (144-223)||(16750543-16750619)
chr3 (410-475)||(16909667-16909732)
chr3 (144-223)||(19775843-19775919)
chr3 (143-223)||(22321744-22321825)
chr3 (506-551)||(26683114-26683159)
chr3 (144-223)||(37439591-37439667)
chr3 (506-551)||(43840692-43840737)
chr3 (123-187)||(37439901-37439965)
chr3 (144-223)||(8489420-8489501)
chr3 (476-538)||(11557657-11557718)
chr3 (467-529)||(12038212-12038274)
chr3 (513-569)||(2898108-2898164)
chr3 (144-223)||(4107352-4107428)
chr3 (506-551)||(8499294-8499339)
chr3 (506-551)||(8898833-8898878)
chr3 (506-551)||(10556761-10556806)
chr3 (506-551)||(10901491-10901536)
chr3 (506-551)||(13543751-13543796)
chr3 (515-571)||(14665167-14665223)
chr3 (515-571)||(14668323-14668379)
chr3 (506-551)||(15412205-15412250)
chr3 (506-551)||(16283189-16283234)
chr3 (506-551)||(17447032-17447077)
chr3 (506-551)||(20698753-20698798)
chr3 (506-551)||(24153500-24153545)
chr3 (506-551)||(27165026-27165071)
chr3 (506-551)||(41123631-41123676)
chr3 (506-551)||(46821993-46822038)
chr3 (453-551)||(52523996-52524097)
chr3 (466-551)||(14972618-14972705)
chr3 (405-551)||(30029594-30029742)
chr3 (506-577)||(32307405-32307476)
chr3 (515-569)||(327452-327506)
chr3 (515-569)||(7793637-7793691)
chr3 (252-392)||(55148887-55149026)
chr3 (513-551)||(15076316-15076354)
chr3 (513-551)||(17736971-17737009)
chr3 (135-181)||(23053017-23053063)
chr3 (393-551)||(23274446-23274609)
chr3 (513-551)||(24341003-24341041)
chr3 (513-551)||(28194471-28194509)
chr3 (506-548)||(43550867-43550909)
chr3 (506-551)||(606648-606693)
chr3 (506-551)||(11425031-11425076)
chr3 (506-551)||(14234231-14234276)
chr3 (506-551)||(15467630-15467675)
chr3 (55-179)||(17525012-17525137)
chr3 (252-332)||(17525216-17525297)
chr3 (506-551)||(53301848-53301893)
chr3 (506-550)||(1644996-1645040)
chr3 (515-551)||(14572370-14572406)
chr3 (474-571)||(1983081-1983177)
chr3 (508-571)||(14872290-14872352)
chr3 (515-569)||(20461787-20461841)
chr3 (252-392)||(24187686-24187825)
chr3 (515-576)||(9512666-9512727)
chr3 (515-576)||(9520641-9520702)
chr3 (466-550)||(12174531-12174617)
chr3 (506-548)||(37251449-37251491)
chr3 (513-551)||(44494544-44494582)
chr3 (515-576)||(49668390-49668451)
chr3 (513-551)||(50242600-50242638)
chr3 (517-551)||(53071011-53071045)
chr3 (307-361)||(1598574-1598630)
chr3 (506-551)||(12120108-12120153)
chr3 (515-568)||(16809156-16809207)
chr3 (506-551)||(17661198-17661243)
chr3 (234-392)||(20722910-20723067)
chr3 (506-551)||(22110675-22110720)
chr3 (307-392)||(38814310-38814395)
chr3 (506-551)||(38962226-38962271)
chr3 (307-360)||(3833630-3833685)
chr3 (171-223)||(11854493-11854545)
chr3 (515-569)||(15482439-15482494)
chr3 (476-571)||(11595409-11595504)
chr3 (476-571)||(42325693-42325788)
chr3 (515-571)||(4589450-4589505)
chr3 (515-571)||(7109213-7109268)
chr3 (515-571)||(7113148-7113203)
chr3 (515-571)||(11069585-11069640)
chr3 (515-571)||(14498842-14498897)
chr3 (515-571)||(15616891-15616946)
chr3 (515-571)||(15964461-15964516)
chr3 (515-571)||(15968385-15968440)
chr3 (515-571)||(15972309-15972364)
chr3 (515-564)||(16696567-16696614)
chr3 (515-571)||(19775084-19775139)
chr3 (515-571)||(22321181-22321236)
chr3 (515-571)||(22336236-22336291)
chr3 (515-571)||(27410181-27410236)
chr3 (515-571)||(28949239-28949294)
chr3 (231-288)||(30029867-30029924)
chr3 (515-571)||(30065464-30065520)
chr3 (515-571)||(37440174-37440229)
chr3 (515-571)||(55022382-55022437)
chr3 (370-449)||(11424934-11425014)
chr3 (515-551)||(14577135-14577171)
chr3 (155-187)||(16749960-16749992)
chr3 (155-187)||(16750158-16750190)
chr3 (155-187)||(16750356-16750388)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (55-585)||(46587-47119)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (55-585)||(123-649)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-576)||(1295-1861)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (73-571)||(42370-42860)
scaffold0124 (320-421)||(24949-25048)
scaffold0124 (466-536)||(25082-25152)
scaffold0124 (506-551)||(38599-38644)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (55-571)||(5335-5841)
scaffold0476 (55-571)||(6530-7036)
scaffold0476 (506-551)||(12514-12559)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (55-585)||(621-1152)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (55-469)||(1-416)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-571)||(19097-19664)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (1-571)||(1541-2102)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (73-571)||(1571-2067)
scaffold0104 (73-571)||(9254-9749)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (55-571)||(6276-6780)
scaffold0412 (515-571)||(14036-14091)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (152-552)||(73725-74124)
scaffold0022 (466-551)||(44355-44442)
scaffold0022 (466-551)||(78076-78163)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (55-490)||(1315-1749)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (1-429)||(30550-30977)
scaffold0008 (499-572)||(34148-34220)
scaffold0008 (515-568)||(1654-1705)
scaffold0008 (506-551)||(15023-15068)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (87-594)||(16241-16749)
[»] scaffold0003 (7 HSPs)
scaffold0003 (1-429)||(413856-414284)
scaffold0003 (123-223)||(71138-71238)
scaffold0003 (1-160)||(71454-71613)
scaffold0003 (474-571)||(414318-414415)
scaffold0003 (370-544)||(340122-340299)
scaffold0003 (515-569)||(100849-100901)
scaffold0003 (307-392)||(139637-139722)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (55-429)||(43964-44336)
[»] scaffold0550 (3 HSPs)
scaffold0550 (26-429)||(7355-7757)
scaffold0550 (530-585)||(9599-9654)
scaffold0550 (474-571)||(7224-7321)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (76-585)||(38360-38872)
scaffold0023 (370-539)||(119646-119820)
scaffold0023 (506-551)||(40417-40462)
scaffold0023 (453-551)||(100103-100204)
scaffold0023 (508-551)||(17997-18040)
scaffold0023 (107-223)||(23578-23695)
scaffold0023 (506-551)||(44193-44238)
scaffold0023 (506-577)||(101265-101336)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-585)||(21611-22197)
scaffold0210 (1-585)||(29503-30089)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (76-585)||(34791-35311)
scaffold0042 (307-360)||(75694-75749)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (1-429)||(422337-422767)
scaffold0001 (1-392)||(173217-173590)
scaffold0001 (499-594)||(204600-204693)
scaffold0001 (474-571)||(422802-422898)
scaffold0001 (506-551)||(160437-160482)
scaffold0001 (506-551)||(500853-500898)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (236-552)||(2589-2907)
scaffold0158 (236-552)||(6255-6573)
scaffold0158 (73-181)||(2972-3080)
scaffold0158 (73-181)||(6638-6746)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (60-571)||(15075-15588)
scaffold0017 (60-571)||(19597-20110)
scaffold0017 (334-585)||(193117-193369)
[»] scaffold0327 (3 HSPs)
scaffold0327 (55-429)||(171-535)
scaffold0327 (474-551)||(37-114)
scaffold0327 (506-551)||(3642-3687)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (305-571)||(21635-21900)
scaffold0037 (55-255)||(21429-21629)
scaffold0037 (123-217)||(80619-80713)
scaffold0037 (453-576)||(22937-23063)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (98-368)||(6212-6482)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (87-585)||(4697-5199)
[»] scaffold0311 (3 HSPs)
scaffold0311 (334-585)||(7269-7520)
scaffold0311 (1-178)||(6883-7061)
scaffold0311 (235-338)||(7128-7231)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-540)||(7076-7617)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (257-585)||(280953-281288)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (1-429)||(2241-2673)
scaffold0439 (1-429)||(10101-10533)
scaffold0439 (474-571)||(10566-10662)
scaffold0439 (474-543)||(2706-2773)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-551)||(1637-2190)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-356)||(18461-18821)
scaffold0080 (297-551)||(18810-19073)
scaffold0080 (458-571)||(16740-16852)
scaffold0080 (506-551)||(20128-20173)
scaffold0080 (405-545)||(39679-39823)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (164-565)||(33298-33695)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (55-594)||(69511-70055)
scaffold0004 (1-199)||(10390-10588)
scaffold0004 (262-392)||(60835-60964)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (235-594)||(5811-6171)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-551)||(7053-7604)
scaffold0114 (371-551)||(15641-15827)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (87-530)||(13969-14425)
scaffold0056 (368-577)||(17394-17607)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-582)||(3469-4055)
scaffold0149 (1-582)||(7900-8486)
[»] scaffold0081 (6 HSPs)
scaffold0081 (235-572)||(23417-23755)
scaffold0081 (235-572)||(38841-39179)
scaffold0081 (235-572)||(14401-14740)
scaffold0081 (76-181)||(14804-14910)
scaffold0081 (76-181)||(23819-23925)
scaffold0081 (76-181)||(39243-39349)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (235-585)||(9004-9355)
scaffold0101 (506-551)||(1576-1621)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (1-392)||(66221-66605)
scaffold0036 (268-571)||(68616-68921)
scaffold0036 (515-569)||(66702-66756)
[»] scaffold0031 (7 HSPs)
scaffold0031 (1-392)||(53481-53865)
scaffold0031 (234-585)||(65838-66189)
scaffold0031 (123-187)||(36351-36415)
scaffold0031 (144-223)||(36041-36117)
scaffold0031 (515-569)||(53330-53384)
scaffold0031 (370-551)||(128509-128697)
scaffold0031 (515-571)||(36648-36703)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (1-434)||(4030-4465)
scaffold0184 (513-551)||(1419-1457)
scaffold0184 (476-532)||(4473-4529)
[»] scaffold0029 (8 HSPs)
scaffold0029 (1-520)||(12550-13072)
scaffold0029 (57-223)||(80790-80955)
scaffold0029 (143-287)||(65476-65613)
scaffold0029 (123-217)||(80462-80556)
scaffold0029 (143-287)||(61560-61697)
scaffold0029 (515-585)||(10454-10523)
scaffold0029 (513-551)||(11101-11139)
scaffold0029 (515-571)||(66061-66116)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (252-594)||(10580-10918)
scaffold0297 (55-594)||(15529-16078)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (235-594)||(7858-8216)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (142-392)||(9990-10240)
scaffold0166 (515-561)||(10334-10379)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (234-594)||(17953-18313)
scaffold0043 (55-183)||(18370-18499)
scaffold0043 (515-569)||(77448-77500)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (234-582)||(18494-18844)
scaffold0174 (76-178)||(18334-18437)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (1-429)||(8443-8871)
scaffold0637 (476-571)||(8312-8407)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (76-594)||(23562-24082)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (235-594)||(1056-1415)
scaffold0261 (55-183)||(1470-1599)
scaffold0261 (513-551)||(15443-15481)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (55-551)||(19739-20242)
scaffold0139 (466-551)||(38182-38271)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (2-403)||(192123-192528)
scaffold0015 (398-538)||(195119-195258)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (305-585)||(32171-32450)
scaffold0111 (99-178)||(32570-32650)
scaffold0111 (241-281)||(8527-8567)
scaffold0111 (241-281)||(15671-15711)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (310-571)||(27238-27501)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (263-551)||(10252-10543)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (76-551)||(36213-36696)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (234-595)||(48500-48847)
scaffold0102 (506-551)||(19014-19059)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (1-392)||(12829-13204)
scaffold0044 (1-392)||(19113-19488)
scaffold0044 (515-569)||(12680-12735)
scaffold0044 (515-552)||(18981-19019)
scaffold0044 (515-564)||(62042-62089)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (371-551)||(3276-3458)
scaffold0165 (371-551)||(7339-7522)
scaffold0165 (466-551)||(27993-28080)
[»] scaffold0410 (3 HSPs)
scaffold0410 (155-432)||(2048-2325)
scaffold0410 (1-232)||(11457-11680)
scaffold0410 (476-532)||(1960-2015)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (1-288)||(35316-35605)
scaffold0171 (371-551)||(31918-32105)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (142-303)||(2913-3074)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (252-578)||(178632-178957)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (1-392)||(2479-2853)
scaffold0013 (506-551)||(30076-30121)
scaffold0013 (515-569)||(2947-3001)
scaffold0013 (515-571)||(73856-73911)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (395-571)||(2016-2193)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (123-281)||(207767-207927)
scaffold0016 (506-551)||(1611-1656)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-209)||(13293-13501)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (57-287)||(3738-3960)
scaffold0525 (515-571)||(4406-4461)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-392)||(18438-18813)
scaffold0228 (506-551)||(21848-21893)
scaffold0228 (515-569)||(18907-18962)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-130)||(501-631)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (57-279)||(12451-12665)
scaffold0349 (515-571)||(11936-11991)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (318-429)||(7942-8051)
scaffold0142 (466-540)||(8077-8151)
scaffold0142 (506-551)||(16516-16561)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (123-223)||(30960-31060)
scaffold0051 (506-551)||(66294-66338)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (1-130)||(45288-45418)
scaffold0109 (143-287)||(35891-36027)
scaffold0109 (127-187)||(36209-36269)
scaffold0109 (515-568)||(11579-11630)
scaffold0109 (515-568)||(6739-6790)
scaffold0109 (515-571)||(36526-36581)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (410-551)||(404-548)
scaffold0484 (334-438)||(542-644)
[»] scaffold0819 (2 HSPs)
scaffold0819 (493-585)||(1848-1939)
scaffold0819 (410-475)||(1917-1982)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (123-223)||(6756-6856)
scaffold0299 (313-392)||(6606-6685)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (1-392)||(19823-20197)
scaffold0120 (506-551)||(15917-15962)
scaffold0120 (466-551)||(33227-33314)
scaffold0120 (466-551)||(45691-45778)
scaffold0120 (466-551)||(17600-17686)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (213-392)||(29013-29192)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-392)||(228179-228553)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (405-490)||(8359-8445)
scaffold0673 (525-585)||(8290-8350)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (370-551)||(10600-10787)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (370-548)||(11620-11803)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (370-551)||(4471-4657)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (474-569)||(1005-1100)
scaffold1873 (306-392)||(1172-1258)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (370-551)||(13254-13441)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (348-571)||(4291-4517)
scaffold0046 (370-571)||(1736-1941)
scaffold0046 (370-551)||(28172-28359)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (474-551)||(6375-6452)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (370-551)||(31826-32012)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (370-551)||(168154-168340)
scaffold0011 (506-551)||(51673-51718)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (1-199)||(9471-9670)
scaffold0405 (313-392)||(9767-9846)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (123-223)||(20394-20494)
scaffold0293 (515-571)||(20741-20796)
[»] scaffold0289 (2 HSPs)
scaffold0289 (346-429)||(2450-2532)
scaffold0289 (515-571)||(2335-2390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (506-585)||(65022-65100)
scaffold0064 (370-551)||(46753-46940)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (370-551)||(1708-1897)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (411-551)||(16039-16186)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (370-551)||(2576-2763)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (499-578)||(995-1073)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (405-551)||(5339-5491)
[»] scaffold0372 (2 HSPs)
scaffold0372 (143-287)||(5049-5186)
scaffold0372 (515-571)||(5636-5691)
[»] scaffold0130 (4 HSPs)
scaffold0130 (370-551)||(27638-27821)
scaffold0130 (1-91)||(5806-5897)
scaffold0130 (515-560)||(6277-6321)
scaffold0130 (515-560)||(8276-8320)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (405-551)||(51339-51492)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (370-551)||(8239-8426)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (370-551)||(174524-174711)
scaffold0021 (506-551)||(121569-121614)
scaffold0021 (466-551)||(136665-136752)
scaffold0021 (55-221)||(174858-175026)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (453-551)||(1306-1407)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (370-551)||(8704-8890)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (123-187)||(14352-14416)
scaffold0141 (144-223)||(14042-14118)
scaffold0141 (506-547)||(37112-37153)
scaffold0141 (515-571)||(14649-14704)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (143-279)||(58667-58796)
scaffold0028 (515-577)||(132441-132503)
[»] scaffold0012 (8 HSPs)
scaffold0012 (123-187)||(189642-189706)
scaffold0012 (144-223)||(189332-189408)
scaffold0012 (1-197)||(24774-24971)
scaffold0012 (307-392)||(25065-25150)
scaffold0012 (515-561)||(25245-25290)
scaffold0012 (507-551)||(225240-225284)
scaffold0012 (515-571)||(189939-189994)
scaffold0012 (523-551)||(5021-5049)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (263-390)||(29479-29606)
scaffold0205 (515-571)||(29326-29382)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (144-223)||(472-548)
scaffold0415 (123-184)||(174-236)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (506-551)||(5148-5193)
[»] scaffold0292 (3 HSPs)
scaffold0292 (506-551)||(3230-3275)
scaffold0292 (506-551)||(10267-10312)
scaffold0292 (370-449)||(210-290)
[»] scaffold0229 (2 HSPs)
scaffold0229 (144-223)||(11456-11532)
scaffold0229 (123-187)||(11766-11830)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (138-551)||(12972-13388)
scaffold0193 (307-392)||(9346-9431)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (506-551)||(33-78)
scaffold0175 (370-551)||(33881-34068)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (506-551)||(38564-38609)
scaffold0145 (506-551)||(32279-32324)
scaffold0145 (506-551)||(32745-32790)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (87-225)||(1119-1258)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (506-577)||(1842-1913)
scaffold0621 (506-577)||(6259-6330)
scaffold0621 (504-551)||(8219-8266)
[»] scaffold0157 (3 HSPs)
scaffold0157 (144-204)||(32615-32675)
scaffold0157 (123-187)||(32925-32989)
scaffold0157 (515-571)||(33223-33278)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (506-577)||(4971-5041)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (506-577)||(3463-3533)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (466-551)||(24165-24252)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (506-548)||(6397-6439)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (506-548)||(12641-12683)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (506-551)||(1150-1195)
[»] scaffold0697 (2 HSPs)
scaffold0697 (506-551)||(6341-6386)
scaffold0697 (262-387)||(6529-6653)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (453-551)||(6571-6672)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (506-551)||(8383-8428)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (506-551)||(10412-10457)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (506-551)||(11802-11847)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (506-551)||(8881-8926)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (506-551)||(20428-20473)
scaffold0305 (476-571)||(4649-4743)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (506-551)||(5397-5442)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (506-551)||(16912-16957)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (453-551)||(46059-46160)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (506-551)||(47043-47088)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (506-551)||(10075-10120)
scaffold0088 (405-489)||(20734-20819)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (506-551)||(52302-52347)
scaffold0075 (466-551)||(53830-53917)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (365-429)||(205235-205297)
scaffold0014 (476-532)||(205333-205389)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (453-551)||(129658-129759)
scaffold0010 (252-392)||(241966-242105)
scaffold0010 (506-551)||(117949-117994)
scaffold0010 (307-392)||(23141-23226)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (506-551)||(161431-161476)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (370-551)||(4609-4794)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (265-359)||(531-626)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (504-551)||(76-123)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (370-549)||(1045-1234)
scaffold0106 (506-551)||(15530-15575)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (512-551)||(39006-39045)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (466-551)||(103912-103999)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (466-551)||(32286-32373)
scaffold0034 (515-564)||(16941-16988)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (370-451)||(1225-1306)
scaffold0598 (515-551)||(1333-1369)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (498-551)||(2460-2514)
scaffold0247 (513-551)||(18350-18388)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-224)||(15224-15446)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (506-551)||(786-831)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (515-568)||(9114-9165)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (506-551)||(11197-11242)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (143-196)||(956-1009)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (234-392)||(19484-19641)
scaffold0242 (234-392)||(25658-25815)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (453-551)||(8340-8441)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (453-551)||(29036-29137)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (506-551)||(10058-10103)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (506-547)||(77659-77700)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (508-551)||(304-347)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (515-577)||(31843-31905)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (515-576)||(3420-3481)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (235-317)||(26822-26904)
scaffold0215 (76-129)||(27008-27061)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (515-568)||(1677-1728)
scaffold0546 (515-568)||(6517-6568)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (506-551)||(12321-12366)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (466-549)||(16344-16429)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (506-551)||(2966-3011)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (1-223)||(3336-3560)
scaffold0168 (237-360)||(3564-3681)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (515-568)||(36086-36137)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (506-551)||(25699-25744)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (370-449)||(1224-1303)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (516-568)||(146-196)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (515-551)||(3422-3458)
scaffold0628 (515-551)||(7982-8018)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (506-550)||(6360-6404)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (286-392)||(2718-2823)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (466-551)||(2427-2517)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (506-545)||(1730-1769)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (466-546)||(2079-2161)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (515-571)||(53-108)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (515-571)||(9366-9421)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (515-564)||(15118-15165)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (235-312)||(4984-5061)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (515-564)||(9685-9732)
scaffold0070 (307-392)||(9829-9914)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (506-551)||(6551-6598)
scaffold0420 (506-551)||(14005-14052)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (241-289)||(18398-18446)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (506-551)||(56048-56095)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 22449071 - 22449656
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||    
T  22449071 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacatatataaga 22449170  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22449171 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 22449270  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22449271 tgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatgagtctatacaagatg 22449370  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22449371 attaagatgatgctgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 22449470  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22449471 ggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttaggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgg 22449570  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22449571 gggctcattccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcaatgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22449656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 18181981 - 18182508
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  18181981 ttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgat 18182080  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18182081 tcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattat 18182180  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182181 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 18182280  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    || ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18182281 tg-tttaaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgaaggagcatttgctcaaaataat 18182378  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18182379 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatg-ttggggctcatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttg 18182476  T
Q  555 tcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18182477 ttgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 18182508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 569
Target Start/End: Original strand, 17678393 - 17678960
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||    
T  17678393 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 17678492  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| | | || ||| |||| || ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17678493 tgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaaga 17678591  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||    
T  17678592 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcgttataagatg 17678690  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17678691 aataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatatgttggg 17678789  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 497  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  17678790 ggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataaattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaactgtt 17678889  T
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
     |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  17678890 gggggatcatgctctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 17678960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 73 - 585
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3473313
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaatgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaatt 3472902  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3472903 acttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaagtgatttgatattatgaagttaa--tactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 3473000  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3473001 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagttgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgag 3473099  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccc 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3473100 tccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagctttgtcctcaccacgatggagcttttgctcaaaataattgttgggggcttatgccc 3473199  T
Q  472 tgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3473200 tgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttagtttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 3473298  T
Q  572 -tgatgaatgatgtt 585  Q
     ||||||| ||||||    
T  3473299 ttgatgaaagatgtt 3473313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 565
Target Start/End: Original strand, 8761442 - 8761999
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8761442 cacttccagaactgagtgcttttgagaacgtcgtgacctgagttgcttggattggttaggaatggaactttaggtagtagtgaaacctatataagatgtt 8761541  T
Q  104 aactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgtt 203  Q
    || || ||||| |||||| |||||||| |  |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  8761542 aaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagatgtt 8761641  T
Q  204 gttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatt 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||           
T  8761642 gttgaaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtctatacaa------- 8761734  T
Q  303 aggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttgttgg 398  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8761735 --gatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttgg 8761832  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 497  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8761833 gggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgtt 8761932  T
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
     ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  8761933 ggggtctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 8761999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 6151924 - 6151573
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    |||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6151924 tgttgttgtgatctgcccgtgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 6151825  T
Q  335 atatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6151824 atatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 6151726  T
Q  435 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6151725 gagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccttgaattggtaccacatgcat 6151626  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6151625 ataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 6151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 88 - 571
Target Start/End: Original strand, 21787935 - 21788422
Alignment:
Q  88 acctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattat 186  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| || | | ||||||||| |||| || ||||| |||  |||||||||| | |||||||    
T  21787935 acctatataagaagttaactgcaatctatgcagctgttatgaaatgttgatgttgattatgatgttatataatg-ttatgtgcattacttaagatattat 21788033  T
Q  187 taaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga 285  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  21788034 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatga 21788133  T
Q  286 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatg-ttttaagatgattgagtccatgtatta 383  Q
    ||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  21788134 gtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgtttttaaga-gatcgagtctatgcatta 21788232  T
Q  384 gcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatatt 483  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21788233 gcatacatatgttgggggctcataccctggagcttagtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatt 21788332  T
Q  484 aatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21788333 aatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcatagtcgagtcaa 21788422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 257 - 585
Target Start/End: Original strand, 22831449 - 22831774
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatg 356  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22831449 tgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgt-gaactccaaattattggatatatatgagatgaatattaagatg 22831547  T
Q  357 ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 456  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |     
T  22831548 ttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataacga 22831646  T
Q  457 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtc 556  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  22831647 tgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtt 22831745  T
Q  557 gcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22831746 gcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22831774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Original strand, 42865071 - 42865614
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  42865071 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtga 42865170  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg--ttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||  ||||||||  || |  ||| || | |||  |||  | || |||||||||  |||||     
T  42865171 tttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgagatgttgcttttatttgatatcgttatg-tgatgtcatactgttgttgcaatctgc 42865269  T
Q  251 ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgat 349  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  42865270 atatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgat 42865369  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42865370 taagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaa 42865468  T
Q  450 ataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
     ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865469 ctagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 42865568  T
Q  547 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42865569 tgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 42865614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 238 - 594
Target Start/End: Original strand, 20091520 - 20091873
Alignment:
Q  238 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtat 336  Q
    |||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  20091520 tgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaat 20091619  T
Q  337 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 436  Q
    | ||||||||| ||  ||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20091620 aagagatgatgtttttgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgga 20091717  T
Q  437 gcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 536  Q
    || || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20091718 gctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 20091817  T
Q  537 aggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20091818 aggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 20091873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 3704870 - 3705302
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||  || ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||    
T  3704870 cgagcacttccagaaccgagtgcttttgacaatgttatgacctgatttgtttggattggctaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 3704969  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||  |||| ||| |  ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  3704970 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 3705069  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga-t 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3705070 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatt 3705169  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3705170 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtt 3705269  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3705270 gggggctcatgccctggagctttctcctcacca 3705302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 21714809 - 21714264
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||| ||| ||||||    
T  21714809 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtga 21714710  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatc 247  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| |||   | | |||||||     |||||  | || |||||||||| |||    
T  21714709 tataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatc 21714610  T
Q  248 tgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgat 346  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21714609 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgat 21714510  T
Q  347 gattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    ||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  21714509 gattgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc 21714412  T
Q  447 aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta 543  Q
     |||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714411 -aaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtcta 21714313  T
Q  544 agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21714312 agttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 21714264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 24782906 - 24783290
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||  || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||    
T  24782906 cgagcacttctagaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaagttatagtgagacctacttaaga 24783005  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||  | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24783006 tgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 24783104  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  24783105 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagat 24783196  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24783197 gattaagatgatgatgaaatccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgttt--agatgattgagttcatgcattagcatacatt 24783290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 45310172 - 45310602
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||    
T  45310172 cgagcactttcagaactgagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggcctatttaaga 45310271  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| || ||| | |  ||    
T  45310272 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgcttgatttattcttgaataaccttga 45310371  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
     |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  45310372 agttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcattataaga 45310471  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  45310472 tgaata-gatgttgttgaactccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcactagcatac--ttgt 45310568  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45310569 tgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 45310602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 45489549 - 45489977
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  45489549 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 45489647  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  ||| | |  ||    
T  45489648 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaataaacttga 45489747  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  45489748 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatgagtcattataagat 45489847  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  45489848 gaata-gatgttgttgagctccaaattaatggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgtt 45489944  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45489945 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 45489977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 18393769 - 18394199
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  18393769 cgagcacttatagaacggagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 18393868  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||    
T  18393869 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 18393968  T
Q  200 tgttgttgaaatgaa--ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
     ||||||||||  ||  ||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18393969 agttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataaga 18394068  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  18394069 tgaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattaagtccatgcattagcatac--ttgt 18394165  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  18394166 tgggggctcatgctctggaactttgtcctcacca 18394199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 594
Target Start/End: Original strand, 22468644 - 22469102
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgt 240  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22468644 attatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgt 22468742  T
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa----ctccaaattattgga-tgta 335  Q
    ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||| || ||||     |||||||| ||||| | ||    
T  22468743 tgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggactata 22468842  T
Q  336 tatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    || ||| |    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||    
T  22468843 tacgaggttgtttgattaagatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggctcatgccctggagcttagtacccaacacgat 22468940  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22468941 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 22469040  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22469041 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgaagaaagatg-ttaagatgct 22469102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21022705 - 21022488
Alignment:
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattgg--atgt 334  Q
    |||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  21022705 ttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatat 21022606  T
Q  335 atatgagatgatga-ttaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  21022605 atatgagatgataatttaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtt-ggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacgat 21022508  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataa 453  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21022507 ggagcattagctcaaaataa 21022488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 334 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48603244 - 48603026
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48603244 tataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 48603147  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aata--tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48603146 ggagctttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 48603047  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48603046 tataagaggtctaagttgcat 48603026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 334 - 551
Target Start/End: Original strand, 22131224 - 22131441
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22131224 tataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 22131321  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22131322 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgaat 22131421  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22131422 ataagaggtctaagttgcat 22131441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 421
Target Start/End: Original strand, 33049984 - 33050242
Alignment:
Q  153 atttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatt 252  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33049984 atttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgatgaaatggattgttattatgaaattatgaagttgttgtgatctgatt 33050083  T
Q  253 atgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgatta 351  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||         
T  33050084 atgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtttatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgaga-gat----- 33050177  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgt 421  Q
       |||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33050178 ---tgttttagattgattgagtccatgtattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgt 33050242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 36819114 - 36819490
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  36819114 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 36819213  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||| ||  | || ||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  36819214 tattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagt-gattatattgtgatttatttattgattgcatttcttgaattattattgaatgatcaaga 36819312  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||| |||||||||       ||| |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  36819313 agttgttgaaaatgaatt-------tgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 36819396  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36819397 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttaatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 36819490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 16080250 - 16080622
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  16080250 cgagcacttccagaactgagtgcattcgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 16080349  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
      |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  16080350 gattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattggatgatcaaga 16080448  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||| ||||||||||||| |   || |||     ||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  16080449 agttgttgaaaatgaattgataat---aagtta-----ttgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagtc---------t 16080531  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || |   |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16080532 gaat---atgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgacttgatgattaagatgtttt--gttgatagggtccatgcattagcatacatt 16080622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1011023 - 1010744
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  1011023 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 1010924  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  1010923 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 1010825  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1010824 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21022952 - 21022767
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||   | |||||||| || ||||| | ||||| | |||||||||| || ||||| |||||||    
T  21022952 cgagcacttccagaactcagtactagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataaga 21022853  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022852 tgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcattacttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 20229074 - 20229168
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229074 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 20229168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 22831183 - 22831363
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||   | || || || |||| ||||| |||||   |||||||||| || ||||| |||| ||    
T  22831183 cgagcacttcctgaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatatagga 22831282  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831283 tgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 22831363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33797458 - 33797358
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33797458 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 33797359  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  33797358 a 33797358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6152114 - 6151988
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  6152114 ttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgat 6152015  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6152014 ttaatgattaattgcattacttgaaat 6151988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313044
Alignment:
Q  251 ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatga 348  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatga 21313086  T
Q  349 ttaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21313085 ttaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 21313044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21022396 - 21022305
Alignment:
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21022396 atgttggggcctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtccatgatgaatgatgtt 21022305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 34509726 - 34509516
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | |||| |||| ||    
T  34509726 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcattgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggtccttgat 34509628  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 563  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34509627 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcacattgt 34509529  T
Q  564 cgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||| ||||    
T  34509528 cgagtcaaagatg 34509516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Original strand, 41781782 - 41781859
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41781782 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatacatataagaggtctaatttgcat 41781859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 38801598 - 38801750
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |    
T  38801598 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattaactcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 38801697  T
Q  500 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801698 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38801750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 20228757 - 20228894
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  20228757 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 20228848  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  20228849 atgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 20228894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 453 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20248134 - 20248008
Alignment:
Q  453 atgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248134 atgttggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 20248035  T
Q  551 tttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
     | |||||| |||||||||||| |||||    
T  20248034 -tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 20248008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 21709798 - 21709721
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21709798 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 21709721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 453 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 33680860 - 33680734
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33680860 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 33680761  T
Q  550 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  33680760 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 33680734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33797833 - 33797610
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  33797833 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattaattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 33797734  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta-ttaaatgatcaag 198  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||  |||| || |||  |||||    
T  33797733 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatgtttta-tgcattactt-aagaattatttgaatattcaag 33797637  T
Q  199 atgttgttgaaatg-aattgatattat 224  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  33797636 atgttgttgaattgaaattgatattat 33797610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19212167 - 19211943
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  19212167 cgagcacttccaaaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgcttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctataaaaga 19212068  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | || ||||  | || ||||||  ||||||| || |||| ||||||||| |||| |||  |||| |||| | ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  19212067 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaag 19211969  T
Q  199 atgttgttga-aatgaattgatatta 223  Q
    |  ||||||| ||||||||| |||||    
T  19211968 aaattgttgagaatgaattgttatta 19211943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 410 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21022439 - 21022374
Alignment:
Q  410 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 475  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21022439 atggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataatgttggggcctcatgccctgaa 21022374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 16375406 - 16375535
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  16375406 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 16375497  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16375498 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 16375535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21407513 - 21407384
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  21407513 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 21407422  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21407421 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 21407384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 27250905 - 27251091
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atg 468  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | ||||  | ||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||    
T  27250905 gagtccatgcattagcattcattgataggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatg 27251004  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     |||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251005 tcctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27251091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 1925084 - 1925160
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  1925084 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 1925160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20134986 - 20134941
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20134986 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20134941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 489
Target Start/End: Original strand, 20847330 - 20847450
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||    
T  20847330 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgat 20847428  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact 489  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20847429 gccctggaagtatattaatact 20847450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 20924098 - 20924174
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  20924098 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 20924174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 22922136 - 22922237
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922136 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22922235  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  22922236 at 22922237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52639699 - 52639618
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  52639699 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 52639618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 1925394 - 1925458
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1925394 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 1925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 20924408 - 20924472
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20924408 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 20924472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Original strand, 39244096 - 39244156
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39244096 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 39244156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Original strand, 39247651 - 39247711
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39247651 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 39247711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Original strand, 41388196 - 41388256
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41388196 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 41388256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21753887 - 21753800
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgttt-ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21753887 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgaggggttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21753800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 571
Target Start/End: Original strand, 24783366 - 24783424
Alignment:
Q  512 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24783366 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcatggtcgagtcaa 24783424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 50210534 - 50210604
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  50210534 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtataagttgca-tagtcacattgtcgagtcaaagatga 50210604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 513 - 571
Target Start/End: Original strand, 20847459 - 20847516
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  20847459 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgtattgtcgagtcaa 20847516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22532446 - 22532029
Alignment:
Q  138 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctg 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| | | |||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| |  | ||||||    
T  22532446 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctg 22532348  T
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat 336  Q
    || ||||   |||  |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||   |  ||| |||| | ||||||| ||   ||||||||||||||| |||    
T  22532347 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt--tccaaattattggat-tat 22532251  T
Q  337 atgagatgatg----attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
    || ||| | ||    |||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  22532250 ataagaggttgtcgaattaagatgttt-aagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 22532153  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccaca 526  Q
     |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  22532152 ttggagctttagctcaat-taccgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataccgatggggacttgatgctctgtattggtaccaca 22532054  T
Q  527 tgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22532053 tgcatataagaggtctaagttgcat 22532029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 431543 - 431498
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431543 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 431498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 13213204 - 13213249
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213204 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13213249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16361731 - 16361686
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361731 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16361686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20916075 - 20916030
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20916075 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20916030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21840451 - 21840406
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840451 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 22123429 - 22123490
Alignment:
Q  490 aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123429 aatacgttgggggcttgtgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22123490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29776463 - 29776418
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776463 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29776418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21172831 - 21172777
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21172831 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 21172777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21312947 - 21312893
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21312947 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 21312893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 41050317 - 41050404
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41050317 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 41050404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 14295901 - 14295939
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295901 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14295939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 15860380 - 15860418
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860380 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15860418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 16275753 - 16275791
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275753 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16275791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 368 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20916174 - 20916093
Alignment:
Q  368 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  20916174 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 20916093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21341910 - 21341872
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341910 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21341872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21346774 - 21346736
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346774 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21346736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21477440 - 21477402
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477440 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21477402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 27161824 - 27161886
Alignment:
Q  490 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27161824 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatctaagttgcat 27161886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16368608 - 16368653
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16368608 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16368653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16758451 - 16758406
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16758451 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16758406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 551
Target Start/End: Original strand, 20454907 - 20454944
Alignment:
Q  514 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454907 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20454944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40388973 - 40388932
Alignment:
Q  510 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40388973 cctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40388932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 45575231 - 45575276
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45575231 atgccccgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttgcat 45575276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31612091 - 31612055
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612091 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31612055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 52928294 - 52928365
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  52928294 atgccctagattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 52928365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 516 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21161539 - 21161504
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161539 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21161504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23763259 - 23763120
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  23763259 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 23763161  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  23763160 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 23763120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 36819584 - 36819638
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36819584 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 36819638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22237480 - 22237382
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237480 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacattcatataagaggtctaagttg 22237382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 50622226 - 50622315
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  50622226 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 50622315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20138151 - 20138008
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--t 338  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  20138151 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 20138060  T
Q  339 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  20138059 gataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 20138008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 21896579 - 21896624
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21896579 atgccctggattggtaccacatgcacataagaggtttaagttgcat 21896624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29297921 - 29297880
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29297921 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagtt 29297880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40129389 - 40129356
Alignment:
Q  518 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129389 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40129356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46975478 - 46975393
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  46975478 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 46975393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19211934 - 19211792
Alignment:
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tg 339  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19211934 gtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtg 19211843  T
Q  340 agatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | | | ||||||||||||||   | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19211842 ataagttgattaagatgttt--cgttgatagagtccatgcattagcattcatt 19211792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21161668 - 21161588
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatga-tggagcatttgctcaaa 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  21161668 agtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgattggagctttagctcaaa 21161588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21706978 - 21706942
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21706978 attggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 21706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21711520 - 21711484
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21711520 attggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 21711484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 571
Target Start/End: Original strand, 3705340 - 3705432
Alignment:
Q  478 tatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3705340 tatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-gttggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 3705432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21022485 - 21022442
Alignment:
Q  410 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 453  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21022485 atggagctttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataa 21022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21305614 - 21305563
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  21305614 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctt 21305563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 549
Target Start/End: Original strand, 35261359 - 35261402
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261359 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 35261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Original strand, 39243898 - 39243941
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39243898 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 39243941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Original strand, 39247453 - 39247496
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39247453 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 39247496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 52639110 - 52639053
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaatg 573  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  52639110 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaatg 52639053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 552
Target Start/End: Original strand, 16080691 - 16080729
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16080691 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcatt 16080729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20135336 - 20135214
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaat-tgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||  | |||||||||||||| || |  ||||||||| |  | ||| ||||||||| |||||  |||| ||||| |||    
T  20135336 tgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgt 20135237  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  20135236 tgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26064778 - 26064689
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26064778 atgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 26064689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 50614398 - 50614487
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  50614398 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 50614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 1010292 - 1010237
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1010292 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 1010237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 1925691 - 1925746
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1925691 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1925746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 16375995 - 16376050
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16375995 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16376050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 18394235 - 18394291
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18394235 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 18394291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 20924705 - 20924760
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20924705 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20924760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 33797088 - 33797033
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgc-attgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33797088 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcaattgtcgagtcaa 33797033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 39244456 - 39244511
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39244456 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39244511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 39248011 - 39248066
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39248011 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39248066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 45490013 - 45490069
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45490013 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 45490069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21437808 - 21437703
Alignment:
Q  286 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattag 384  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||  | |||| ||||||||| |||||    
T  21437808 gtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgattt--gttgatagagtccatgcattag 21437711  T
Q  385 catacatt 392  Q
    ||| ||||    
T  21437710 cattcatt 21437703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 41388014 - 41388046
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41388014 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 41388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15397 - 14815
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15397 cgagcactttcagaactgagtgcatttgagaatgttttgacctgagttgctttaattgatttggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 15298  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15297 tgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 15198  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15197 tgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctgt-gttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagtgtatacaagatg 15099  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15098 attaagatgatgttgaactccaacttattgggtgtatatgagatgatgattaagatattttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 14999  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  14998 ggctca--ccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaattgttgg 14901  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14900 gggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcgatgatgaatgatgtt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4741 - 4156
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||   | |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4741 cgagcacttccagaactgagttcaagtgagaatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataaga 4642  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
     |||||||| || || |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4641 agttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatgatcaaga 4542  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4541 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatg 4442  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4441 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 4342  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4341 ggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggaacatttgctcaaaataatgttgggggtgcatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgg 4242  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4241 gggttcatgccctgaattggtaccacatgtatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 526
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  602 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 18907422 - 18906837
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||   | || || ||  ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| | |||||    
T  18907422 cgagcacttccagaacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 18907323  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18907322 tgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 18907223  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18907222 tgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatg 18907123  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18907122 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 18907023  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18907022 ggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgg 18906923  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18906922 gggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 18906837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 140 - 585
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523774
Alignment:
Q  140 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||   ||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataaagttg 16523428  T
Q  240 ttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatg 339  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatg 16523528  T
Q  340 agatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagca 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16523529 agatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagca 16523627  T
Q  440 tttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 538  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523628 tttgctcaaaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 16523727  T
Q  539 gtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16523728 gtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 16523774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 18180803 - 18180235
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||    
T  18180803 cgagcacttccagaactgaatgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 18180704  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| | | || ||| | || || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18180703 tgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaaga 18180605  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||    
T  18180604 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatg 18180506  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18180505 aataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatatgttggg 18180407  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgttt 498  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  18180406 ggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaactgttg 18180307  T
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18180306 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcacattgtcgagtcaa 18180235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 167 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766434
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgtt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgtt 21766740  T
Q  267 atttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaag 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21766739 atttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-g 21766641  T
Q  364 atgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcc 463  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21766640 atgattgagcccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagttttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggc 21766541  T
Q  464 ttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 563  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21766540 ttatgccttgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccacatgcatataataggtataagttgca-ttgtcgcattgt 21766442  T
Q  564 cgagtcaa 571  Q
    ||||||||    
T  21766441 cgagtcaa 21766434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 22408111 - 22408668
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||    
T  22408111 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactt-aggtagtagtaagacttatttaaga 22408209  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || ||||| |||  | ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  22408210 tgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctaga 22408308  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  22408309 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgcacgagtctatacaagagg 22408408  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408409 ac---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgat---taagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 22408495  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 497  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22408496 ggctcatgtcctggagctttgtcgtcaccacgatggagcatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgat 22408595  T
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408596 aggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 22408668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 20907787 - 20908221
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||    
T  20907787 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 20907886  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||  |||||  ||||  |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  20907887 tgttaactagaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatcaaga 20907986  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20907987 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatg 20908086  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20908087 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagattgttttagattgatagagtccatgcattagcatacttttgttg 20908186  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20908187 ggggctcatgccctggagctttgtcctcactatga 20908221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 76 - 608
Target Start/End: Original strand, 15894310 - 15894852
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 175  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15894310 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15894409  T
Q  176 tgaaatattattaaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||| ||| | |||||    |  || || || ||||  | | |||||||     |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15894410 tgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgt 15894509  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagat 365  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15894510 tatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaacttattggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga- 15894608  T
Q  366 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt 465  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  15894609 gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctagagcttagtacacaacacgatggagcattagctc-aaataacgatgggggctt 15894707  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattg 562  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15894708 atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattg 15894806  T
Q  563 tcgagtc-aatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 608  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15894807 ttgagtcaaatgatgaaagatgtttaagatgc-tatgttgaagatgt 15894852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Original strand, 21740072 - 21740426
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21740072 tgttgttgtgatctgcccgtgttgctattgttatttaactatgttgcacgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 21740171  T
Q  335 atatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21740172 atatgagatgaagattaagatgttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 21740270  T
Q  435 gagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa------tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 528  Q
    ||||||  |||||||||||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21740271 gagcatcagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaggtatattaatactaaaatattaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 21740370  T
Q  529 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21740371 catataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagttaatgatgaatgatgtt 21740426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 305 - 585
Target Start/End: Original strand, 18692022 - 18692302
Alignment:
Q  305 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18692022 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctt 18692120  T
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  18692121 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggc 18692220  T
Q  504 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18692221 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 18692302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Original strand, 25642043 - 25642587
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||  || ||| ||||| ||| ||||||    
T  25642043 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 25642142  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||   | | |||||||     | |||  | || |||||||||| ||||    
T  25642143 tataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatct 25642241  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25642242 gtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggataaataagagatgatg 25642341  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  25642342 attaagatgttt-aaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 25642439  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25642440 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagtggtataa 25642539  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25642540 gttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 25642587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 19863239 - 19862695
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||| | | ||||||    
T  19863239 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtga 19863140  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||   | | |||||||     | |||  | || |||||||||| ||||    
T  19863139 tataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttgctgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatct 19863041  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
       |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19863040 tcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg 19862941  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  19862940 attatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacataagttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 19862843  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19862842 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaa 19862743  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19862742 gttgc-ttagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19862695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 159 - 551
Target Start/End: Original strand, 22074176 - 22074547
Alignment:
Q  159 tgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt-atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgtt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  22074176 tgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaaatgttgctgaaatgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgct 22074275  T
Q  258 gctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgt 357  Q
    | || | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074276 gttattattatttaactatgatgcatgagtctatacaagatg---------atgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgt 22074366  T
Q  358 tttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatt-tgctcaaaataatgt 456  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||| || | ||||  |  ||      
T  22074367 ttt-agatgattgagtgcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgattgagctttgtcctcaccacgat-- 22074463  T
Q  457 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
        ||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074464 ----gcctta-------aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 19873360 - 19872837
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19873360 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattac 19873261  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatt 269  Q
    ||||||||| | | ||||||  |||||||| | |  |  ||||||||     | |||  | || |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||    
T  19873260 ttgaaatatgaatgaatgattgagatgttgct-atttttattgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatt 19873162  T
Q  270 taactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 368  Q
    |||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  19873161 taaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttaaaccttcaaattattggataaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gat 19873064  T
Q  369 tgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
     ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||    
T  19873063 cgagtccatgcattagcatacataatttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatg 19872964  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  19872963 ccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcg 19872865  T
Q  566 agtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19872864 agtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17804497 - 17804113
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  17804497 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 17804398  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17804397 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 17804299  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  17804298 agttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 17804207  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17804206 aattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 17804113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 367 - 571
Target Start/End: Original strand, 21830612 - 21830815
Alignment:
Q  367 attgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctta 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830612 attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctta 21830711  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcga 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21830712 tgccctgaaagtatattaatactataatgttggaggttcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-ttgtcgcattgtcga 21830810  T
Q  567 gtcaa 571  Q
    |||||    
T  21830811 gtcaa 21830815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 27567415 - 27567846
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||  ||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  27567415 cgagcacttccagaactgagtgttttttataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgcttaggaatggaacattaggtagtactgaaacctatttaaga 27567514  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||| | | | ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||  || ||| | | |||    
T  27567515 tgtcagccgaaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgatttatgcttgaataaactaga 27567614  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  27567615 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattacgatgtttttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagtctatacatgatg 27567714  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | ||  ||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27567715 aataacatgttgttgagctccaagttattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttg 27567814  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27567815 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 27567846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 252 - 594
Target Start/End: Original strand, 22334955 - 22335297
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22334955 tatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggatgaataagagatgatgatt 22335054  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| || |||||||     
T  22335055 aagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtacgcaacacgatggagctttagctcaaat 22335152  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335153 tagcgatgggggcttttgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 22335252  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||| | |||||||  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22335253 gca-tagtcgcataatcgagtcaaagataaaagatg-ttaagatgct 22335297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22432326 - 22431974
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22432326 ctgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgtat 22432227  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||    
T  22432226 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacga 22432129  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22432128 tggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 22432029  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22432028 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaaagatgtt 22431974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22438876 - 22438524
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||| | |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22438876 ctgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgtat 22438777  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||    
T  22438776 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacga 22438679  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22438678 tggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 22438579  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22438578 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaaagatgtt 22438524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 19790585 - 19791013
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  19790585 cgagcacttccagaactgaatgtttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 19790683  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||    
T  19790684 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 19790783  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  19790784 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 19790883  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||  |||||    
T  19790884 gaata-gatgttgttgagctccaaattactggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagttcatgcattagcatac--ttgtt 19790980  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19790981 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 19791013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 25766985 - 25767358
Alignment:
Q  12 agaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgca 110  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||      
T  25766985 agaactgattgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgag 25767084  T
Q  111 atctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaa- 209  Q
    | || |||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  25767085 aactgtgaaactattatgaaatgctaagt-gattataatgtaatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaag 25767183  T
Q  210 atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatga 309  Q
    ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||  ||   ||||    
T  25767184 atgaattgat--------attaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagtctgaataagatatttgaaatga 25767275  T
Q  310 tgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25767276 tgatgaaatccaaattattggatgtataagagatttgatggttaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 25767358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Original strand, 21834790 - 21834941
Alignment:
Q  95 taagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgat 194  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  21834790 taagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattattgaatgat 21834887  T
Q  195 caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21834888 caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatct 21834941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 22429836 - 22430117
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||    
T  22429836 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatggtgagacctatttaaga 22429935  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| |||  | || |||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22429936 tgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattaaatgatcaaga 22430034  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
      |||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  22430035 aattgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagtct 22430117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 392
Target Start/End: Original strand, 27325569 - 27325808
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg--aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  27325569 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgatt 27325668  T
Q  253 atgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgatt 350  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  27325669 atgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattgaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttaatgatt 27325768  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27325769 aagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 27325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 429
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553808
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||     
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 27553711  T
Q  335 ata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27553712 atattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 27553808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 578
Target Start/End: Original strand, 16965367 - 16965694
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac----tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| || | ||||||      ||||||||||||||   |||| |||||||     
T  16965367 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattggacaaatataagatgata 16965466  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  16965467 attgagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagtattcatatgatgggggcttatgctctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctca 16965564  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
    |||||| | | ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16965565 aaataacgattggggctcttgccctgaa-gtatattaatacttattacgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 16965663  T
Q  547 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    |||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16965664 tgca-tagtctcatagtcgagtcaatgatgaa 16965694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 23657226 - 23657638
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |  || || | | |||    
T  23657226 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgttcggattggttaagaatggaactttaggtagtaatatgatctatgtgaga 23657325  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| ||| || |||||||  || |||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |   |    
T  23657326 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttaa 23657424  T
Q  200 tg-ttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    || ||||||||| ||||||| | | ||||||||||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||          |    
T  23657425 tgattgttgaaaatgaattgttctgatgaaattataatgctgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag----------a 23657514  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagat-gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  23657515 tgaatag-atgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttaggttgattgagtccatgcattagcatacctt-gt 23657612  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgt 421  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23657613 tgggggctcatgccctggagctttgt 23657638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 438
Target Start/End: Original strand, 15041522 - 15041794
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt-gatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||||||||| || ||||| |||  | |||||||| ||||| || ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||  |||| | ||| |||    
T  15041522 tgcattacttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgt 15041621  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaag 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  15041622 tatttaactaagttgcatgagtctttataagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatataaaagagttgatgattgagat-ttttaag 15041720  T
Q  364 atgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 438  Q
    | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15041721 a-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagc 15041794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 569
Target Start/End: Original strand, 31164964 - 31165213
Alignment:
Q  317 ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-aagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggag 415  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |   ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31164964 ctccaaattactggatatataagagatgattaacgagatgtttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatt-gttgggggctcatgccctggag 31165061  T
Q  416 ctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgt 514  Q
    ||| ||||||| || |||||||| || |||| || ||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||    
T  31165062 cttagtactcaacacgatggagctttagctcgaa-tagcgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatacttatagcgatgggggctcatgccctgt 31165159  T
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  31165160 attggtaccacatgcatatgagatgtctaggttgca-tagtcgcattgtcgagtc 31165213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22863246 - 22862967
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  22863246 cgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 22863147  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | |||||| ||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |    
T  22863146 tgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagaa 22863048  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22863047 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23414821 - 23414721
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23414821 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 23414722  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  23414721 a 23414721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27556579 - 27556479
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27556579 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 27556480  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  27556479 a 27556479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14472513 - 14472347
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  14472513 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 14472415  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14472414 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 14472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 31478075 - 31478169
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31478075 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1644549 - 1644455
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644549 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 1644455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35245530 - 35245343
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  35245530 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 35245432  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245431 tgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 35245343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 27416123 - 27416223
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27416123 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 27416222  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  27416223 a 27416223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 577
Target Start/End: Original strand, 16960271 - 16960404
Alignment:
Q  443 gctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 541  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960271 gctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatacttattacgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 16960369  T
Q  542 taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16960370 taagctgca-tagtctcatagtcgagtcaatgatga 16960404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 223
Target Start/End: Original strand, 18955628 - 18955792
Alignment:
Q  59 ttaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |  | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||| |     
T  18955628 ttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattgat 18955726  T
Q  159 tgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18955727 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatatta 18955792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 21739827 - 21740008
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   | ||  | ||  ||| ||||| |||||   |||||||||| || ||||| |||| ||    
T  21739827 cgagcacttccagaactgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatatagga 21739926  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21739927 tgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcattacttgaaat 21740008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 411 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22831407 - 22831241
Alignment:
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc-at 507  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||  ||    
T  22831407 tggagctttgtactcacgacgttggagcattagctaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatg---ggggcttgat 22831311  T
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  22831310 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaatgatga 22831241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1561268 - 1561061
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    |||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1561268 attaagttgttttaagagg-tcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 1561171  T
Q  447 aaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 541  Q
    ||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   |    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561170 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgagaagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 1561071  T
Q  542 taagttgcat 551  Q
    ||||||||||    
T  1561070 taagttgcat 1561061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 569
Target Start/End: Original strand, 20638459 - 20638663
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  20638459 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 20638558  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 563  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  20638559 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagttgcattgt 20638657  T
Q  564 cgagtc 569  Q
    ||||||    
T  20638658 cgagtc 20638663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 493 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2077075 - 2077017
Alignment:
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2077075 atgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 2077017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Original strand, 22059550 - 22059712
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |   | |||||    
T  22059550 agcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgaggaatgaaactttaggtagtagtgagatatagtttagatg 22059649  T
Q  102 ttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgatta 164  Q
    ||||  | ||| | |||||| |||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22059650 ttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatta 22059712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29060485 - 29060300
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  29060485 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 29060387  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060386 gccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29060300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1644863 - 1644726
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  1644863 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 1644772  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  1644771 atgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 1644726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Original strand, 25611925 - 25612090
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25611925 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaatttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 25612024  T
Q  490 aatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     | ||   | | ||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25612025 caaatagcgatgggggcttgatgccgtatattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25612090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8244019 - 8243890
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  8244019 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 8243928  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8243927 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 8243890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11185479 - 11185271
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  11185479 attaagttgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggatttttgtactcaccgcgttggagcattagctc 11185382  T
Q  447 aaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    ||||| |  | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185381 aaaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 11185282  T
Q  541 ctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||    
T  11185281 ctaagttgcat 11185271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11567020 - 11566891
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  11567020 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 11566929  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11566928 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 11566891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16760136 - 16760072
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16760136 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 16760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19870748 - 19870619
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        | || ||||||| |    
T  19870748 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------aataagctgttgat 19870657  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19870656 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 19870619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23395226 - 23395097
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  23395226 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 23395135  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23395134 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 23395097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27415748 - 27415907
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  27415748 cgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 27415847  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatg 160  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  27415848 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 27415907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 453 - 576
Target Start/End: Original strand, 22080995 - 22081121
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080995 atgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatactaattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22081094  T
Q  550 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  22081095 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 22081121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948885
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 22948885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952841
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 22952841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871329
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 23871329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875285
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 23875285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12706988 - 12706614
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgag-aatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |  |||    
T  12706988 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggaatgt-gagacttgagttgcttggattgattaggaa-gaaactttaggtactaatgagacctattaaag 12706891  T
Q  99 atgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaaatattattaaatgatcaa 197  Q
    || || ||||  | || ||||||  ||||||| || ||||| || |||||  ||| |||  |||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  12706890 atattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagt-gaatataaaatgaattatggattgattgcatttacttgaattatttttgaatgatcaa 12706792  T
Q  198 gatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaag 296  Q
    ||  ||| ||||| ||||||| ||||| |           ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      |    
T  12706791 gaaattgctgaaaatgaattgttattaagc----------ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------g 12706708  T
Q  297 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12706707 a--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12706614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 540
Target Start/End: Original strand, 20908252 - 20908317
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20908252 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 20908317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 27325902 - 27325955
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27325902 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 27325955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16760446 - 16760370
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16760446 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 16760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 19773996 - 19774041
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773996 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19774041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 22780543 - 22780588
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780543 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22780588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 25629530 - 25629714
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  25629530 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 25629628  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25629629 gccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataggaggtctaaattgcat 25629714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 28496788 - 28496833
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496788 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28496833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 29809199 - 29809244
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809199 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29809244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 31477765 - 31477841
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  31477765 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 31477841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 411 - 551
Target Start/End: Original strand, 16920847 - 16920993
Alignment:
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa-taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc 505  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||| ||     
T  16920847 tggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaatagcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggtctt 16920946  T
Q  506 -atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16920947 gatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16920993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 18917214 - 18917294
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  18917214 ttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 18917294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22949259 - 22949199
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22949259 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 22949199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22953215 - 22953155
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22953215 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 22953155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23871703 - 23871643
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23871703 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 23871643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23875659 - 23875599
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23875659 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 23875599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23990078 - 23989949
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        | || ||||||| |    
T  23990078 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------aataagctgttgat 23989987  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23989986 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 23989949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 12618793 - 12618921
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttg 242  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |        || | ||||||| |     
T  12618793 ttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttgaaatgaattggt--------atcaagctgttgata 12618884  T
Q  243 tgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12618885 taatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 12618921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 569
Target Start/End: Original strand, 15041803 - 15041873
Alignment:
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15041803 tggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatatgagatgtctaggttgca-tagtcgcattgtcgagtc 15041873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 27553413 - 27553515
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  27553413 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 27553512  T
Q  100 tgt 102  Q
    |||    
T  27553513 tgt 27553515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 448
Target Start/End: Original strand, 31155466 - 31155644
Alignment:
Q  263 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||     |||||||||||||  ||| |  || | || ||||||||||| ||    
T  31155466 tgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatgtt-----ccaaattattggac-tatttacgaagttgtttaagatgttt-aa 31155558  T
Q  363 gatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 448  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  31155559 gatg-tcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaa 31155644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1595333 - 1595288
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595333 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1595288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 493
Target Start/End: Original strand, 4738725 - 4738846
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |   | ||||| ||||||    
T  4738725 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaact--cgatgggggcttatg 4738822  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaata 493  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  4738823 -cctgacaatatattaatactaata 4738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16624283 - 16624207
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16624283 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 16624207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23992244 - 23992199
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992244 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23992199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 25603707 - 25603752
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25603707 atgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25603752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25644136 - 25644091
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644136 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25644091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34963187 - 34963142
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963187 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 34963142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186199
Alignment:
Q  375 catgtattagcatacatttgttgggggctca-tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctg 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |   | ||||| |||||| ||||    
T  4186315 catgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaact--cgatgggggcttatg-cctg 4186219  T
Q  474 aaagtatattaatactaata 493  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4186218 acagtatattaatactaata 4186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14472108 - 14472048
Alignment:
Q  127 tgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14472108 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 14472048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Original strand, 18956032 - 18956092
Alignment:
Q  127 tgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18956032 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 18956092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 549
Target Start/End: Original strand, 17288112 - 17288155
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17288112 atgccctgtattggtaccacatgtatataagaggtctaagttgc 17288155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 17804016 - 17803962
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17804016 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 17803962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 19303812 - 19303882
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||    
T  19303812 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcatattgtcgagtcaaagatga 19303882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20593623 - 20593553
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  20593623 atgccctggtttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgttgagtcaaagatga 20593553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 576
Target Start/End: Original strand, 27333448 - 27333518
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt-gtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  27333448 atgccctggattgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattcgtcgagtcaaagatg 27333518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 576
Target Start/End: Original strand, 27394188 - 27394258
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt-gtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  27394188 atgccctggattgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattcgtcgagtcaaagatg 27394258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 3852407 - 3852445
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852407 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3852445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 8227773 - 8227811
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8227773 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8227811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 20557254 - 20557316
Alignment:
Q  490 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20557254 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 20557316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 30677014 - 30677056
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30677014 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 30677056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16741216 - 16741131
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16741216 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16741131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19652048 - 19651947
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19652048 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatttaagttgc 19651949  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  19651948 at 19651947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 19848343 - 19848388
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19848343 atgccccgtattggtaccacatgcatatgagaggtctaagttgcat 19848388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 20361234 - 20361279
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20361234 atgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaaattgcat 20361279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 4738854 - 4738890
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738854 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 4738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20076550 - 20076470
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076550 atgccctggaagtatattaatactaatagcgatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaa 20076470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22439040 - 22438936
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  22439040 ggtagtaatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagtttaattacattac 22438941  T
Q  175 ttgaa 179  Q
    |||||    
T  22438940 ttgaa 22438936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23019200 - 23019156
Alignment:
Q  507 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019200 tgccctggattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23019156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Original strand, 34298681 - 34298820
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  34298681 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 34298779  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  34298780 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 34298820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 551
Target Start/End: Original strand, 31155695 - 31155729
Alignment:
Q  517 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155695 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31155729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16448866 - 16448911
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448866 atgccctggattggtaccatatgcatataggaggtctaagttgcat 16448911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18926690 - 18926657
Alignment:
Q  518 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926690 ggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18926657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Original strand, 19791049 - 19791143
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19791049 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19791143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20108933 - 20108888
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20108933 atgccctggattggtaccacatgcatttaagaggtttaagttgcat 20108888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 25135949 - 25136000
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25135949 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 25136000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Original strand, 27553844 - 27553938
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27553844 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccttg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27553938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 9100904 - 9100940
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9100904 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 9100940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13019278 - 13019242
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019278 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 13019242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18456510 - 18456478
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456510 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18456478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18461670 - 18461638
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461670 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18461638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12496379 - 12496336
Alignment:
Q  238 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 281  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  12496379 tgttgtgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgc 12496336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16624481 - 16624438
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16624481 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 16624438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19668211 - 19668124
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatacta-atatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19668211 atgccctggaagtatattaatactttatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatccatataagaggtttaagttgcat 19668124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 448
Target Start/End: Original strand, 25603601 - 25603644
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25603601 atgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaa 25603644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 4643003 - 4643041
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4643003 gtattggtacgacatgcatataagaggtctaaattgcat 4643041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Original strand, 1588008 - 1588055
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  1588008 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 1588055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 1644079 - 1644024
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1644079 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1644024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 2685414 - 2685499
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||||    
T  2685414 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgtttaagtccatgcattagcattcatt 2685499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 8243402 - 8243347
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8243402 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 8243347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11566431 - 11566376
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11566431 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11566376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 12619379 - 12619434
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12619379 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 12619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14471782 - 14471727
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14471782 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14471727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 16623923 - 16623868
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16623923 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 16623868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19808573 - 19808473
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  19808573 tatgttgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 19808475  T
Q  350 ta 351  Q
    ||    
T  19808474 ta 19808473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 19870159 - 19870104
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19870159 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 19870104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21702116 - 21702069
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21702116 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 21702069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 22592898 - 22592983
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  22592898 tgatgatgaactccaaattatttgatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 22592983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22862515 - 22862460
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22862515 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22862460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22948652 - 22948597
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22948652 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22948597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22952608 - 22952553
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22952608 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22952553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23394637 - 23394582
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23394637 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 23394582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23414474 - 23414419
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23414474 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23414419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23871096 - 23871041
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23871096 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23871041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23875052 - 23874997
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23875052 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 23874997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23989489 - 23989434
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23989489 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 23989434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 27556232 - 27556177
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27556232 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27556177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 27567882 - 27567938
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttggg-gctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27567882 agtatattaatactatgatgttggggagctcatgccctg-attggtaccacatgcata 27567938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 547
Target Start/End: Original strand, 4186118 - 4186150
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4186118 attggtaccacatgtatataagaggtctaagtt 4186150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14472007 - 14471967
Alignment:
Q  297 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata 337  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14472007 atgaataggttgatgatgaactccaaattattggatgtata 14471967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Original strand, 19773898 - 19773978
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  19773898 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa 19773978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 19848033 - 19848089
Alignment:
Q  232 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19848033 tgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19848089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 30643151 - 30643682
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaa-gccgttatgaattgctaagttgattataatgtga 153  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| || ||||||||||||||| |||    
T  30643151 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatga 30643250  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30643251 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgatta 30643350  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 353  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643351 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctattcaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 30643450  T
Q  354 atgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30643451 atgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggaactttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa 30643550  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30643551 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tt 30643649  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30643650 gtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 30643682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 20465844 - 20466434
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    | ||||||||  ||||||||| | ||| | |||||||||| || ||||| |||||||    
T  20465844 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataaga 20465943  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20465944 ggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 20466043  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc--tatacaaga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  20466044 tgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataaga 20466143  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20466144 tgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatataagagatgattattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgt 20466242  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---t 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||        
T  20466243 tgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctgaaagtatattaatacaaaaata 20466342  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466343 atgttggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 20466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 572
Target Start/End: Original strand, 17926567 - 17927081
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  17926567 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgat 17926665  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  17926666 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctat 17926765  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17926766 gctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatacgagattatgattaaga 17926865  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17926866 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagtatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 17926964  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  17926965 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttg 17927063  T
Q  555 tcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17927064 tcgcattgtcgagtcaat 17927081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 22010484 - 22011042
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||    
T  22010484 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 22010583  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| ||| |  ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  22010584 tgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctaga 22010682  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||   |||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22010683 tgttg---aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatg 22010779  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22010780 at---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttagg 22010869  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  22010870 ggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgct 22010969  T
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  22010970 gggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgttgagtcaa 22011042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 16861132 - 16861700
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  16861132 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaatcgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacatatttaaga 16861231  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
     |||| ||| ||||| | | || ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16861232 ggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatgattaaga 16861330  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||| ||||||  || ||||||    
T  16861331 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaat-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagtcattataagatg 16861429  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  16861430 aataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgtttt-aggtgattgagtccatgcattaacatacatatgttggg 16861528  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgttt 498  Q
    ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  16861529 ggcacatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttg 16861628  T
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16861629 ggggctcatgccctgaattgataccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcacattgtcgagtcaa 16861700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 16410115 - 16410638
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||| ||||||| ||| | ||| || ||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  16410115 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgat 16410213  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16410214 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16410313  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgatta 351  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||         ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16410314 gctgctattgttatttcactaagttgcatgagtcattataagatgat---------gttgaatatccaaattattggatatgtatatgagatgatgatta 16410404  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410405 agatggttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 16410503  T
Q  452 aa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16410504 aactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacattcatataagaggtttaggttgca 16410603  T
Q  551 tttgtcgcattgtcgag-tcaatgatgaatgatgtt 585  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  16410604 -ttgtcgcattgtcgagttaaatgatgaaagatgtt 16410638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 55 - 490
Target Start/End: Original strand, 15611329 - 15611754
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||   || | ||||||||  | |||||||||    
T  15611329 ttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtttgaaactactaagttgtctgtaatgtgat 15611428  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15611429 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattat 15611528  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | || |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611529 gctggttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 15611619  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611620 tgtctta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 15611718  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611719 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 15611754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 490
Target Start/End: Original strand, 15602877 - 15603302
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||   || ||||||||||  | |||||||||    
T  15602877 ttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtttgaaactgctaagttgtctgtaatgtgat 15602976  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15602977 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattat 15603076  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603077 gctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 15603167  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603168 tgtctta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagatttctactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 15603266  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603267 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 15603302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 235 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 376973
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtatatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 377248  T
Q  335 atat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  377247 atatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatccatttgcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 377149  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  377148 tggagctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 377049  T
Q  533 taagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatg-aatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 608  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  377048 taagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgt 376973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Original strand, 20856230 - 20856801
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||    
T  20856230 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaaattcaggtagtaatgtgacctattaaaga 20856329  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| |||  |||| |||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  20856330 tgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaataacctaga 20856429  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  20856430 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 20856528  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20856529 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgtt 20856628  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatac-taatat 494  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  20856629 gggggctcatgccctggagtcttgtcctcacaacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacttaaact 20856728  T
Q  495 gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  20856729 gttgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtctcattgtcgagt 20856801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 552
Target Start/End: Original strand, 23776713 - 23777195
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 171  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || | | ||||| ||| |||| || ||||| |||  |||||    
T  23776713 ttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatg-ttatgtgcat 23776811  T
Q  172 tacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttattt 270  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||||||    
T  23776812 tacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttattt 23776911  T
Q  271 aactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgatt 369  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  23776912 aactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattgagatgttttaaga-gatc 23777010  T
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 469  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  23777011 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgc 23777110  T
Q  470 cctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 552  Q
    | || ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777111 cttggaagtatattaatactcaataatgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 23777195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 571
Target Start/End: Original strand, 39094864 - 39095302
Alignment:
Q  135 taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatg 233  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||     
T  39094864 taagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttata 39094963  T
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatg 333  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  39094964 atgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagctccaaattattggctg 39095063  T
Q  334 tatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
     |||| | |||| ||||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  39095064 catattgggatgttgattgagattattttagattgattgagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacg 39095163  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39095164 atgaagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcat 39095262  T
Q  532 ataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39095263 ataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 39095302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 16184966 - 16184464
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16184966 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgc 16184867  T
Q  175 ttgaaatattattaa----atgatcaagatgttg-ttgaaatgaattgatatt-----atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 264  Q
    ||||||| ||| |||    |||||  ||||| || |||   | | || ||||      ||||  | ||  |||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16184866 ttgaaatgttaataaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttaatatctctacatgatgtgataatgttgttgtgatatgcttatgctgctattg 16184767  T
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaga 364  Q
    || |||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16184766 ttgtttaaccaacttgcatgattctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga 16184667  T
Q  365 tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcct 464  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||    
T  16184666 -gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggct 16184568  T
Q  465 tatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16184567 tatgccctggaagaatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca-ttgtcgcatt 16184469  T
Q  562 gtcga 566  Q
    |||||    
T  16184468 gtcga 16184464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21169111
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 21168871  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagt--ccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  21168872 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacg 21168970  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21168971 atggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccatgtattagtaccacatgc 21169070  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21169071 atataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 21169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24755959 - 24755577
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 175  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24755959 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 24755860  T
Q  176 tgaaatattattaaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||| ||| | |||||    |  || || || ||||  | | |||||||     |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24755859 tgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgt 24755760  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagat 365  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24755759 tatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga- 24755661  T
Q  366 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24755660 gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaa 24755577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162438
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 21162198  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagt--ccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  21162199 cttaagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacg 21162297  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaata-ctaat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21162298 atggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatacccaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 21162397  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21162398 atataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 21162438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 19983352 - 19982809
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  |||||||  | ||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||    
T  19983352 ttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 19983253  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg--ttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||  | ||||||  || |  ||| || | |||  |||  | || |||||||||  |||||     
T  19983252 tttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatgttgcttttatttgatatcgttatg-tgatgtcatactgttgttgcaatctgc 19983154  T
Q  251 ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgat 349  Q
     |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||  | | || |||||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||||    
T  19983153 ctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagattgtcaagacgatgttgaacctccaaattattagatacataaaagatgatgat 19983054  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||| | |||||||    
T  19983053 taagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtagtcaacacgatggagcactagctcaaa 19982955  T
Q  450 ataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
     ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19982954 ttaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcaggccctgaattggtaccacatgcctataagaggtctaagt 19982855  T
Q  547 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19982854 tgca-tagtcgcatagtcgagtcattgatgaaagatg-ttaagatgct 19982809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19899354 - 19898852
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||    
T  19899354 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 19899255  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| | | | ||||  | |||||| |   ||   |||||||     | |||  | || || ||||||  ||||    
T  19899254 tttaatgattaatttcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatgttgcttttat---ttgatatcgtcatgtgatgtcatactattgttgcaatct 19899158  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| || |||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||    
T  19899157 gcctatgctgctattgatatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattattggatacctaagagatgatg 19899058  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19899057 attaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattcgctca 19898959  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898958 aattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggcgcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaa 19898859  T
Q  545 gttgcat 551  Q
    |||||||    
T  19898858 gttgcat 19898852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 475
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259872
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||     
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgtacctccaaattattggata 19259731  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||| |||    
T  19259732 tatatgagatgataattaagatgttttaata-gattgagtccatgcagtagcatacatttgttgggggctcatgccctagaactttttcctcaccacgat 19259830  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19259831 ggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 19259872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 489
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354237
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 17354083  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||    
T  17354084 aataagagatgatgattatgatgttt-aagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgat 17354181  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17354182 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatact 17354237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 334 - 551
Target Start/End: Original strand, 44384988 - 44385207
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgatt-gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44384988 tataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gattcgagtccatgcattagcattcatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 44385085  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | | | | ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44385086 tggagcattagctcaaattaacgattgaggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgcccttaattggtaccacatgc 44385185  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44385186 atataagaggtctaagttgcat 44385207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 377592 - 377414
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| |||||||    
T  377592 cgagcacttccagaactgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataaga 377493  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377492 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 178
Target Start/End: Original strand, 19259443 - 19259565
Alignment:
Q  56 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatt 155  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19259443 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatt 19259542  T
Q  156 taatgattaattgcattacttga 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  19259543 taatgattaatttcattacttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 14398038 - 14398138
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14398038 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaatgaattgttatt 14398137  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  14398138 a 14398138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 5866450 - 5866637
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  5866450 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 5866548  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866549 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5866637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21249329 - 21249143
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21249329 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 21249231  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249230 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21249143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21255167 - 21254981
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21255167 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 21255069  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255068 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21254981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23913893 - 23913816
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23913893 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23913816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 499 - 582
Target Start/End: Original strand, 22873574 - 22873656
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 582  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22873574 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgat 22873656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 499 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24755568 - 24755482
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24755568 ggggctcaagccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 24755482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 493 - 583
Target Start/End: Original strand, 19259850 - 19259939
Alignment:
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatg 583  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19259850 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacgtgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg 19259939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 45131172 - 45131359
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  45131172 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 45131270  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131271 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctctattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45131359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 551
Target Start/End: Original strand, 13597816 - 13597980
Alignment:
Q  393 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt-tggggccttatgccctgaaagtatattaatact- 489  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |  |||||| | |||||||| ||||||| |||||||     
T  13597816 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaattagcgactggggcttgatgccctggaagtataataatactc 13597915  T
Q  490 -aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13597916 aaatagtgattggggcttgatgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13597980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 16231281 - 16231656
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgct-tgcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |  | ||| ||||||| || |||||||||| || |||||||| |  ||||    
T  16231281 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgttcggattggttaggaaagggactttaggtactaatgagacctattaaaga 16231380  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | || ||||  | || ||||||  ||||||| || |||| ||| ||||| |||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16231381 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 16231479  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |  |||||| |||||||||| ||||| |           ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||    
T  16231480 aatttgttgaaaatgaattgttattaag----------cttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga 16231563  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
      |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16231564 --attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16231656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21490960 - 21490753
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21490960 attaagatgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcgtt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 21490863  T
Q  447 aaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 541  Q
    ||| ||  | ||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||| | ||   | ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21490862 aaattagcgattgtggcttgatgccctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatgcatataaaaggtc 21490763  T
Q  542 taagttgcat 551  Q
    ||||||||||    
T  21490762 taagttgcat 21490753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43251971 - 43251834
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  43251971 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 43251880  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  43251879 atgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21389626 - 21389813
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  | ||| | ||| |    
T  21389626 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttga 21389724  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389725 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21389813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21396156 - 21396343
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||| | ||| |    
T  21396156 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21396254  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396255 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21396343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21778952 - 21779139
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  | ||| | ||| |    
T  21778952 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttga 21779050  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21779051 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21779139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21790649 - 21790836
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||| | ||| |    
T  21790649 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21790747  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790748 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21790836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6520217 - 6520116
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520217 atgttgggggcttgatgccctgaaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 6520118  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  6520117 at 6520116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17140840 - 17140671
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaata 487  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  17140840 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaata 17140741  T
Q  488 ct---aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatat-aagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||   ||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140740 ctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataaagaggtctaagttgcat 17140671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 18818620 - 18818770
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttgg 500  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||    
T  18818620 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatggg 18818718  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818719 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18818770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 19278231 - 19278360
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  19278231 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 19278322  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19278323 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 19278360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 21828279 - 21828343
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21828279 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 21828343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 21972533 - 21972662
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  21972533 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 21972624  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21972625 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 21972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 21976618 - 21976747
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  21976618 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 21976709  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21976710 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 21976747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 507 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23406183 - 23406135
Alignment:
Q  507 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406183 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgt 23406135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 411 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7372682 - 7372538
Alignment:
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc- 505  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |    | | |||| |      
T  7372682 tggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tattgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaacagcgatgggggattg 7372584  T
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372583 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7372538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862974
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 18862974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383634
Alignment:
Q  151 tgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctga 250  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |           ||| |||||| |||    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaatgaattgttattaag----------cttgatgtgatttga 21383712  T
Q  251 ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata 337  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||         |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21383711 ttatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt---------atgaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtata 21383634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 18862600 - 18862676
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  18862600 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 18862676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 18879545 - 18879590
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879545 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18879590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20536013 - 20535968
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536013 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20535968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 21827969 - 21828045
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  21827969 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 21828045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 21919272 - 21919317
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919272 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21919317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22112009 - 22111928
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  22112009 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 22111928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31971104 - 31971059
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971104 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31971059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21410791 - 21410727
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21410791 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 21410727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21673558 - 21673458
Alignment:
Q  453 atgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21673558 atgttggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca 21673459  T
Q  551 t 551  Q
    |    
T  21673458 t 21673458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21805283 - 21805219
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21805283 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 21805219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 39094747 - 39094855
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||  |||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||    
T  39094747 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagaaatggaacttaaggtagtaatgtgacctatttaaga 39094846  T
Q  100 tgttaactg 108  Q
    |||||||||    
T  39094847 tgttaactg 39094855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387149
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 21387149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 14409785 - 14409830
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409785 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14409830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16413696 - 16413741
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413696 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16413741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 17612408 - 17612453
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17612408 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17612453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 18678381 - 18678426
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678381 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18678426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 18717570 - 18717615
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18717570 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18717615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19896049 - 19896004
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896049 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19896004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31971222 - 31971123
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31971222 attaagttgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 31971125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41597972 - 41597927
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41597972 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41597927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 45291074 - 45291119
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45291074 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45291119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21411025
Alignment:
Q  149 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 21411025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805517
Alignment:
Q  149 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 21805517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22626542 - 22626472
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  22626542 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgca-tagtcacattgtcgagtcaaagatga 22626472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 38855484 - 38855586
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa--tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |  || |||  |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855484 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaattacgttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgcatataagaggtctaagttg 38855583  T
Q  549 cat 551  Q
    |||    
T  38855584 cat 38855586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 13508408 - 13508446
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13508408 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13508446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 451
Target Start/End: Original strand, 16199820 - 16199901
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16199820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 16199901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Original strand, 18678074 - 18678196
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| || |||||||||| | |  |  |||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||    
T  18678074 tgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgt 18678173  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  18678174 tatttaactaagttgcatgagtc 18678196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 19937438 - 19937476
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937438 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19937476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26223687 - 26223649
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223687 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26223649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32121881 - 32121759
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| || |||||||||| | |  |  |||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||    
T  32121881 tgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgt 32121782  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32121781 tatttaactaagttgcatgagtc 32121759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4083779 - 4083738
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4083779 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 4083738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 15203609 - 15203654
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15203609 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 15203654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21673446 - 21673401
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21673446 atgccctggattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 21673401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22874874 - 22874829
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22874874 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcat 22874829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 23761112 - 23761213
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |  ||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761112 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacatttagggcttgatgccatagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 23761211  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  23761212 at 23761213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 26355929 - 26356030
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26355929 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatacaagaggtttaagttgc 26356028  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  26356029 at 26356030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32121585 - 32121548
Alignment:
Q  514 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121585 tattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 32121548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24352862 - 24352772
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24352862 atgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24352772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20527497 - 20527358
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20527497 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 20527399  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  20527398 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 20527358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22028857 - 22028647
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgct-tgcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||  |||||| |  | ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |  ||||    
T  22028857 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgttcggattggttaggaaaggaactttaagtactaatgagacctattgaaga 22028758  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | || |||   | || ||||||  ||||||| || |||| ||| ||||| |||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22028757 tattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 22028659  T
Q  199 atgttgttgaaa 210  Q
    |  |||||||||    
T  22028658 aaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22044888 - 22044809
Alignment:
Q  313 tgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22044888 tgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 22044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23648730 - 23648580
Alignment:
Q  138 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctg 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||| | ||||| |||  | |||||||||||| | || || ||||||||| |  | ||| ||    
T  23648730 gttgattatgatgtgatataatg-ttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttg 23648632  T
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23648631 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23834473 - 23834382
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  23834473 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacct 23834382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22965516 - 22965478
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22965516 gtattggtaccacatgcatacaagaggtctaagttgcat 22965478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 25484657 - 25484695
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25484657 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 25484695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Original strand, 983733 - 983774
Alignment:
Q  510 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  983733 cctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 983774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15531900 - 15531815
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  15531900 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 15531815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16092612 - 16092657
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16092612 atgccctggattggtaccacatgcatataacatgtctaagttgcat 16092657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 23847110 - 23847195
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  23847110 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 23847195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 24445601 - 24445686
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatga--tgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  24445601 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataaattgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 24445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 30309029 - 30309080
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30309029 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 30309080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 572
Target Start/End: Original strand, 15603304 - 15603351
Alignment:
Q  524 acatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15603304 acatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 15603351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 572
Target Start/End: Original strand, 15611756 - 15611803
Alignment:
Q  524 acatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15611756 acatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 15611803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Original strand, 17828677 - 17828732
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  17828677 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgtttt 17828732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 28649329 - 28649365
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649329 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 28649365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Original strand, 21168581 - 21168708
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||| |   |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |    
T  21168581 ttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaa 21168680  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21168681 gatgatgtttaattgcattacttgaaat 21168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15538459 - 15538374
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  15538459 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatatttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 15538374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 17055656 - 17055707
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17055656 attggtaccacatgcatacagga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17055707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 18863207 - 18863262
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18863207 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 18863262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21386902 - 21386847
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21386902 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21386847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21410494 - 21410439
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21410494 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21410439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21804986 - 21804931
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21804986 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21804931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 21828576 - 21828631
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21828576 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 21828631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 449
Target Start/End: Original strand, 21918946 - 21919255
Alignment:
Q  140 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatta-aatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgt 237  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||  |||  | |||||||||||||| || |||||||||||| |  | |||||||    
T  21918946 tgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 21919043  T
Q  238 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata 337  Q
    | ||||   |||  |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| || | | ||||||| ||   |||||||||||||||  |||    
T  21919044 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt--tccaaattattggattaata 21919141  T
Q  338 tgagatgatg----attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    | ||| | ||    |||||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |     
T  21919142 taagaggttgtcgaattaagatgttt-aagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 21919238  T
Q  433 tggagcatttgctcaaa 449  Q
    |||||| || |||||||    
T  21919239 tggagctttagctcaaa 21919255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22111500 - 22111445
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22111500 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22111445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23834182 - 23834097
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  23834182 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 23834097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 30940639 - 30940694
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30940639 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30940694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 32598507 - 32598460
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32598507 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 32598460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 32605039 - 32604992
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32605039 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 32604992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 43251380 - 43251325
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43251380 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 43251325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 12321547 - 12322128
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||   | || || ||  ||||||||| |||||   |||||||||| || ||||| |||||||    
T  12321547 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataaga 12321646  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12321647 tgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaaga 12321746  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12321747 tgttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatg 12321846  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12321847 attaagaagatgttaaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 12321946  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |    
T  12321947 ggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaacgtatatttatactaaaatgttgg 12322046  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatg 583  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12322047 gggctcatcccctgaattggtaccacatgc--ataagaggtctaagtttca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatg 12322128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 14430138 - 14429610
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  14430138 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgat 14430039  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  14430038 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-atactgttgttgtgatctgattat 14429940  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14429939 gcggctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 14429840  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14429839 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcataca-ttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 14429742  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  14429741 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 14429643  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14429642 gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 14429610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2760442 - 2759880
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||    
T  2760442 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagattgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 2760343  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2760342 tgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgagatattattgaatgatcatga 2760244  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2760243 tgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagat 2760144  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2760143 gat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 2760054  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2760053 gggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgcttaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgt 2759954  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  2759953 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgttgcattgtcgagtcaa 2759880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3272134 - 3271706
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3272134 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 3272035  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || ||| | |||||| |||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3272034 tgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttgaa-tattattgaataatcaaga 3271936  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||    
T  3271935 tgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagat 3271836  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3271835 gaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agataattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 3271737  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3271736 gggctcatgccctggagctttgtcctcacca 3271706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 594
Target Start/End: Original strand, 17137868 - 17138461
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  17137868 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 17137967  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||||| |||||| | |||||  || |   ||||| ||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  17137968 agttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 17138065  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  17138066 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataaga 17138163  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17138164 tgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtt 17138262  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---ta 493  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    |    
T  17138263 gggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataa 17138362  T
Q  494 tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgc 593  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17138363 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgc 17138460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 142 - 429
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39268133
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttttaatgttgtg 39267946  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267947 gtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 39268046  T
Q  342 atgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39268047 atgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 39268133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12187078 - 12186743
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12187078 tatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgatt 12186979  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12186978 aagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaa 12186880  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186879 taacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttggaggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 12186780  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12186779 gca-tagtcgcatagtcgagtcagtgatgaatgatgtt 12186743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 9445964 - 9446395
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||    
T  9445964 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgttgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacatatttaaga 9446063  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  9446064 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 9446163  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9446164 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatg 9446263  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  9446264 aataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatatttagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtcg 9446363  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9446364 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 9446395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Original strand, 19649344 - 19649889
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |   || ||  ||||| ||| ||||||    
T  19649344 ttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagcagttaagtgatgttagtgttgaatatgatgtga 19649443  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgc-----tgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| ||   | | |||||||| | |  | |||      ||||||||| ||||    
T  19649444 tataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctgtttttatttgatattgttatgtgatgtcatattgttgttgtaatct 19649543  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19649544 gtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg 19649643  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  19649644 attatgatattt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 19649741  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19649742 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatggatataagaggtctaa 19649841  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19649842 gttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 19649889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751952
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaatgaattgatattatgaa-ttatactgttgat 9751801  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagat 9751901  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  9751902 atttgatgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 9751952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 234 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9703340 - 9702988
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9703340 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattggat 9703241  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  9703240 acataagagatgatgattaatatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 9703142  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9703141 tggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctg-attggtaccacatgc 9703043  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9703042 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 9702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 594
Target Start/End: Original strand, 18154717 - 18155240
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||  || ||| ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  18154717 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattac 18154816  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatt 269  Q
    ||||| ||| | | ||||||  |||||||| |    | | |||||||     | |||  | || |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  18154817 ttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatt 18154916  T
Q  270 taactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 368  Q
    |||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  18154917 taaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgaagttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgagatgttt-aaga-gat 18155014  T
Q  369 tgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||  | ||||| ||||||    
T  18155015 cgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggcttatg 18155113  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18155114 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcg 18155212  T
Q  566 agtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18155213 agtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 18155240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11312947 - 11312596
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  11312947 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagat 11312848  T
Q  101 gttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagat 200  Q
     |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  11312847 attaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 11312749  T
Q  201 gttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||     
T  11312748 gttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagata 11312657  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgtt 358  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  11312656 attaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtt 11312596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832639
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatattgttgat 2832488  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2832489 gggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaactccaaattattggatttataagag 2832588  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  2832589 atttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtctatacattagcatacatt 2832639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 252 - 594
Target Start/End: Original strand, 32216606 - 32216948
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  32216606 tatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggttacataagagatgatgatt 32216705  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||     
T  32216706 aagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtacttaacacgatggagcattagctcaaat 32216804  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    ||  | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32216805 tagcgatgggggcttatgccttgaaaatattttaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata-aagaggtctaagtt 32216903  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32216904 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 32216948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15580991 - 15580617
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||    
T  15580991 cgagcacttccaaaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatagtgagacctatttagga 15580892  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| || || ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  15580891 tgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattattgaatgataaaaa 15580793  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||         |    
T  15580792 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagtc---------t 15580710  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga-tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15580709 gaataagatgatgatgaactccaaattattggatgtatgagagattgatgattaagatgttt--agatgattgagtccatgcattagcatacatt 15580617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Original strand, 20569457 - 20569833
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||  |  | |||||  |||| ||| || ||||||| || |||||||||    
T  20569457 ttgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgat 20569555  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  20569556 ttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatatgatta 20569655  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20569656 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattatgggatgcatattgagatgttgattaa 20569754  T
Q  353 ga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    || |||||||   ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20569755 gattgttttagattgattgagttcatgcattagcat--atttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccatga 20569833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12318427 - 12318052
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgct-tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||   || ||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  12318427 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagaccggagttgcttggaatggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 12318328  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12318327 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaaga 12318229  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  12318228 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 12318146  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12318145 gaataagatgatgatgaactccaaactattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12318052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24054523 - 24054190
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |    |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24054523 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaaagagatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 24054424  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
      ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| || |||| |||    
T  24054423 gtgatgttt-aag-tgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacgcgatggagctttagctc-aaa 24054327  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054326 tagagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 24054227  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24054226 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgtatgatgtt 24054190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 334 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 15211431 - 15211171
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15211431 tataagagatgatgattaagatgttttaaga-gttagagtccatgcattagcatacataagttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgat 15211333  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | ||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15211332 ggagctttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaatattcaaataacgttgggggctcatgccctgtattggtgccacatgca 15211233  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15211232 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagttgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 15211171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16583555 - 16583181
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  16583555 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaagtgaaccttaggtactaatgagacctatataaga 16583456  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  16583455 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgattt-atgattgattgcattacttgaattattgttgaatgatcgaga 16583358  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||         |    
T  16583357 aattgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagtc---------t 16583275  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat--atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16583274 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtattagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 16583181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 13635275 - 13635650
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  ||||||||  |  |||| ||||||| || |||| ||| | |||||    
T  13635275 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattagataatgaaccttaggtactaatgaggcctatttaaga 13635374  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | ||||| |  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13635375 tattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 13635473  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  13635474 aattgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 13635556  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13635557 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgttaattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 13635650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 388
Target Start/End: Original strand, 15605082 - 15605447
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgtt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||    
T  15605082 cacttctagaactgagtgcatttgaggactttgagacccgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatt 15605181  T
Q  104 aactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgtt 203  Q
    |||||  | || ||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  15605182 aactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagtt 15605280  T
Q  204 gttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatt 302  Q
    |||| |||||||||       ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||         ||| |    
T  15605281 gttgaaaatgaatt-------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagtc---------tgaat 15605364  T
Q  303 aggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 388  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||    
T  15605365 ---atgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcata 15605447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42204151 - 42203876
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  || || |||||||||||||    
T  42204151 ttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgctgtgatctgatta 42204052  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaa 352  Q
    || ||||  |||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42204051 tgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaa 42203953  T
Q  353 ga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
     | |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42203952 aattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 42203876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 70571 - 70850
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  70571 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 70670  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||    
T  70671 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaag-tgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaataattagga 70769  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  70770 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 74680 - 74959
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  74680 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 74779  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||    
T  74780 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaag-tgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaataattagga 74878  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  74879 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33407 - 33184
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  33407 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgtttggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 33308  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  33307 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 33209  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  33208 agttgttgaaaatgaattgatatta 33184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Original strand, 11996183 - 11996390
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||    
T  11996183 attaagatgttttaagagg-ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc 11996280  T
Q  447 aaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 541  Q
    ||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996281 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 11996380  T
Q  542 taagttgcat 551  Q
    ||||||||||    
T  11996381 taagttgcat 11996390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18302016 - 18301918
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  18302016 tatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 18301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Original strand, 25927432 - 25927525
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 216  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927432 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 25927525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 13918709 - 13918809
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13918709 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 13918808  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  13918809 a 13918809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 287
Target Start/End: Original strand, 1859015 - 1859169
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1859015 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagaattgttatt 1859114  T
Q  223 atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
    | |           |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1859115 aag----------cttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1859169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26211940 - 26211754
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggg-cctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||  | ||||| |||| |    
T  26211940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcagattagcgatgggggccttga 26211842  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211841 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26211754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 14932705 - 14932932
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg--aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 264  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||  | ||  ||||||||||||   |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| ||    
T  14932705 tgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattg 14932804  T
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaa 362  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||      
T  14932805 ttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt-- 14932902  T
Q  363 gatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  14932903 gttgatagagttcatgcattagcatacatt 14932932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 15356140 - 15356367
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg--aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 264  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||  | ||  ||||||||||||   |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| ||    
T  15356140 tgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattg 15356239  T
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaa 362  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||      
T  15356240 ttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt-- 15356337  T
Q  363 gatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15356338 gttgatagagttcatgcattagcatacatt 15356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 15360254 - 15360481
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg--aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 264  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||  | ||  ||||||||||||   |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| ||    
T  15360254 tgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattg 15360353  T
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaa 362  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||      
T  15360354 ttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt-- 15360451  T
Q  363 gatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15360452 gttgatagagttcatgcattagcatacatt 15360481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39722424 - 39722287
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||        |||| ||||||| |    
T  39722424 ttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgagttgat--------attaagctgttgat 39722333  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39722332 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10588960 - 10588795
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10588960 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 10588861  T
Q  490 aatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     | ||   | | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10588860 caaatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10588795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 392
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152183
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaaga 354  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaaga 14152147  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14152148 tgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 14152183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15580545 - 15580448
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15580545 aaagtatattaatattatgatgatgggggctcatgccctgtaatgctaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcattgtcgagtcaat 15580448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34200751 - 34200542
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34200751 attaagttgttttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc 34200654  T
Q  447 aaaataa-tgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact---aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 539  Q
    ||||| | || || ||  || ||||| || |||||||||||||||   ||||  | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200653 aaaattagtgatgagggtttgatgccttggaagtatattaatactcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 34200554  T
Q  540 tctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||    
T  34200553 tctaagttgcat 34200542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 505 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11858384 - 11858305
Alignment:
Q  505 catgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11858384 catgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 11858305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 7519322 - 7519387
Alignment:
Q  158 atgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7519322 atgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 7519387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9509135 - 9508948
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||  | |||||  || ||    
T  9509135 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggtttgat 9509036  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509035 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcatgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 9508948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20487418 - 20487341
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20487418 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattgataccatatgcatataagaggtctaagttgcat 20487341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14258169 - 14258019
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa--tat-gtttggg 501  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |    | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |  ||| | | |||    
T  14258169 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattgcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaattatcgatgggg 14258070  T
Q  502 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258069 gcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14258019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 585
Target Start/End: Original strand, 9752035 - 9752104
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9752035 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagttgagtcaatgatgaatgatgtt 9752104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18301920 - 18301846
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18301920 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatacatataagaggt 18301846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9593645 - 9593270
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||  |||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    ||||    
T  9593645 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 9593546  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |  ||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9593545 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagt-gaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 9593447  T
Q  199 atgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||||| |           ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||    
T  9593446 aaattgttgaaaatgaattgttattaagc----------ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga 9593363  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
      |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9593362 --attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 9593270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13032704 - 13032517
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||    ||||| ||| ||    
T  13032704 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcaatgggggcttgat 13032605  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13032604 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccttgtattggtaacacatgcatataagaggtctaagttgcat 13032517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12715022 - 12714893
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  12715022 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 12714931  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12714930 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 12714893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12718826 - 12718697
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  12718826 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 12718735  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12718734 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 12718697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15084037 - 15083973
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15084037 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 15083973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16114399 - 16114270
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        | || ||||||| |    
T  16114399 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------aataagctgttgat 16114308  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16114307 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 16114270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16117552 - 16117423
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        | || ||||||| |    
T  16117552 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------aataagctgttgat 16117461  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16117460 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 16117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 16907149 - 16907278
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  16907149 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 16907240  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16907241 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 16907278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18283524 - 18283395
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  18283524 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 18283433  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18283432 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 18283395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26292553 - 26292416
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  26292553 ttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 26292462  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26292461 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 569
Target Start/End: Original strand, 3564619 - 3564681
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3564619 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcgagtc 3564681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Original strand, 45170272 - 45170335
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45170272 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 45170335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 15755269 - 15755314
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755269 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15755314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16402753 - 16402798
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16402753 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16402798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18279561 - 18279480
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  18279561 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 18279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 28505657 - 28505702
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505657 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28505702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40443257 - 40443212
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443257 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40443212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42205410 - 42205257
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgtt 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||    
T  42205410 cacttccagaactgagttcttttgagaatgatgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttgagatgtt 42205311  T
Q  104 aactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattta 157  Q
    |||||  | || |||||| ||||||||||  |||| |  || ||||||||||||    
T  42205310 aactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctatttgtaatgtgattta 42205257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 45169961 - 45170037
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  45169961 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 45170037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39722107 - 39722043
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39722107 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 39722043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12723737 - 12723670
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12723737 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 12723670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18425578 - 18425513
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  18425578 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 18425513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 67538 - 67493
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67538 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 67493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12187328 - 12187207
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||     ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  12187328 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctatataaga 12187229  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagc 121  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  12187228 agttaactgcaatctgtgaagc 12187207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 12256144 - 12256189
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256144 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12256189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12698636 - 12698591
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12698636 atgccctgtattggtaccacatgcttataagaggtctaagttgcat 12698591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 12704607 - 12704688
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  12704607 ttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 12704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13869167 - 13869122
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869167 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13869122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 15144348 - 15144393
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144348 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15144393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 569
Target Start/End: Original strand, 15605547 - 15605603
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15605547 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 15605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16213400 - 16213355
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213400 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16213355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 17062212 - 17062257
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062212 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17062257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18005499 - 18005398
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005499 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 18005400  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  18005399 at 18005398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20110338 - 20110293
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110338 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20110293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 27848104 - 27848149
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27848104 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27848149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 29329256 - 29329301
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329256 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 29329301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44116335 - 44116290
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116335 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 47831599 - 47831554
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831599 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 47831554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 2282531 - 2282618
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2282531 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 2282618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 12317955 - 12317901
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12317955 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 12317901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 14933051 - 14933105
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14933051 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 14933105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 15356486 - 15356540
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15356486 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 15356540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 15360600 - 15360654
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15360600 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt-tcgcatttgtcgagtc 15360654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16056168 - 16056081
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16056168 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 16056081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22072833 - 22072746
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072833 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgattccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22072746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24274941 - 24274898
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274941 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 24274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 533
Target Start/End: Original strand, 28505496 - 28505629
Alignment:
Q  406 tgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  28505496 tgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 28505595  T
Q  501 ggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatat 533  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505596 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatat 28505629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Original strand, 2530322 - 2530420
Alignment:
Q  126 atgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||  |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  2530322 atgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttatta 2530420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 12901160 - 12901074
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12901160 atgccttggaagtatattaatacttaatacgttgagggctcgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgca 12901074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16495173 - 16495135
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495173 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16495135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 576
Target Start/End: Original strand, 811467 - 811527
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  811467 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 811527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9644608 - 9644384
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    ||||    
T  9644608 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 9644509  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |  |||| ||| ||||| || | |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9644508 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaag-tgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 9644410  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    |  |||||| |||||||||| |||||    
T  9644409 aaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9703494 - 9703397
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatat 183  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||| |||    
T  9703494 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattat 9703397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13647102 - 13647057
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13647102 atgccccgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttgcat 13647057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Original strand, 15082263 - 15082304
Alignment:
Q  510 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15082263 cctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15082304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 38898718 - 38898763
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38898718 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcat 38898763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44013976 - 44013931
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44013976 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44013931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48273174 - 48273129
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48273174 atgccctggattggtaccacatgcacataagaggtctaagttgcat 48273129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 42203840 - 42203785
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42203840 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 42203785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 48593262 - 48593370
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  48593262 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaaga 48593361  T
Q  100 tgttaactg 108  Q
    | |||||||    
T  48593362 tattaactg 48593370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11262376 - 11262237
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11262376 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 11262278  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  11262277 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 11262237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14953245 - 14953106
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14953245 tatgctgcttctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14953147  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14953146 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 14953106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14959211 - 14959072
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14959211 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14959113  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14959112 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 14959072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 516 - 551
Target Start/End: Original strand, 15605818 - 15605853
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605818 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15605853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 516 - 551
Target Start/End: Original strand, 16220050 - 16220085
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16220050 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16220085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Original strand, 44408395 - 44408534
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  44408395 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 44408493  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  44408494 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 44408534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 1868238 - 1868327
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1868238 atgccctggaagtatattaatacttaatatgttgagggcttaatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 1868327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 14152280 - 14152325
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14152280 attggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 14152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 15008780 - 15008869
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15008780 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagagatctaagttgcat 15008869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 451
Target Start/End: Original strand, 27848006 - 27848087
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27848006 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaaat 27848087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 42376345 - 42376383
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42376345 gtattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcat 42376383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 392
Target Start/End: Original strand, 19096 - 19239
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--t 338  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  19096 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataact 19187  T
Q  339 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19188 gataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8917256 - 8917205
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8917256 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 8917205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 18456704 - 18456749
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18456704 atgccctggattggtaccacatgcatataaaagatctaagttgcat 18456749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 451
Target Start/End: Original strand, 15755043 - 15755145
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    |||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||    
T  15755043 attaagttgttttaagagg-tcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggtgcattacctc 15755140  T
Q  447 aaaat 451  Q
    |||||    
T  15755141 aaaat 15755145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18556983 - 18556928
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  18556983 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt 18556928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24054707 - 24054599
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||||||| ||||||| | ||| |||| | ||||||    
T  24054707 ggtagtaatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattac 24054608  T
Q  175 ttgaaatat 183  Q
    ||||| |||    
T  24054607 ttgaattat 24054599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13831189 - 13831154
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831189 gtattggtaacacatgcatataagaggtctaagttg 13831154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 32678 - 32623
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32678 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 32623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 71304 - 71359
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  71304 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 71359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 75413 - 75468
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  75413 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 75468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 1859361 - 1859416
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1859361 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatctgtcgagtcaa 1859416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 540
Target Start/End: Original strand, 9446454 - 9446494
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9446454 ggggctcatgccctg-attggtaccacatgcataaaagaggt 9446494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11987512 - 11987312
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacct-ttataag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || | || |||||| || | ||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  11987512 cgagcacttccagaactgagtgcatttgatgattgtgaggcttgagttgtttggattggttaagaaaggaaccttaggtactagtgagacctattaaaag 11987413  T
Q  99 atgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaa 197  Q
    || || ||||  | || ||||||  ||||||| || |||||  || |||| |||| |||  |||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  11987412 atattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataa-gtgaattatggattgattgcatttacttgatttattattgaatgatcaa 11987314  T
Q  198 ga 199  Q
    ||    
T  11987313 ga 11987312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 12705196 - 12705251
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12705196 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 12705251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13149165 - 13149080
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  13149165 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 13149080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 13461585 - 13461538
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13461585 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 13461538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 13919032 - 13919087
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13919032 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatctgtcgagtcaa 13919087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14216753 - 14216706
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14216753 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 14216706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15083740 - 15083685
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15083740 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15083685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15728153 - 15728106
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15728153 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 15728106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 16113810 - 16113755
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16113810 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16113755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 16116963 - 16116908
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16116963 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16116908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 16457632 - 16457683
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16457632 attggtaccacatgcatataa-ttgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 16457683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 16907748 - 16907803
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16907748 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 16907803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 18282935 - 18282880
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18282935 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 18282880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 18425229 - 18425174
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18425229 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 18425174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 25927778 - 25927833
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25927778 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25927833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26291941 - 26291886
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26291941 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 26291886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35151469 - 35151422
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35151469 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 35151422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38227288 - 38227243
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38227288 atgccctggattggtaaaaaatgcatataagaggtctaagttgcat 38227243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39721810 - 39721755
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39721810 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 39721755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11987279 - 11987231
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11987279 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 11987231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 16583086 - 16583031
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16583086 attggtaccacatgcatgtaagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 16583031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18425780 - 18425748
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18425780 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 18425748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18425980 - 18425948
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18425980 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 18425948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 20220474 - 20220521
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20220474 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 20220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26420013 - 26419908
Alignment:
Q  286 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattag 384  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||| |||||    
T  26420013 gtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagcgtccatgcattag 26419916  T
Q  385 catacatt 392  Q
    ||| ||||    
T  26419915 cattcatt 26419908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 16926 - 17501
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  16926 cgagcacttcaagaaccgagtgcatttgagaatgccgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctat------ 17019  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
       |||||| | ||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17020 ---taactgaattctatgaagctattataaactg-taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaaga 17115  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17116 tgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtctatacaagat 17215  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  17216 gattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgatcgagtccatgcattagcatacaattgtt-g 17314  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgttt 498  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  17315 gggctaatgccctggagcttcatactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaattgttg 17414  T
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17415 ggggctcatgccctgtattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttatcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 17501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 16487938 - 16488467
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||| || | ||| | ||||||||||| ||  |||| ||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  16487938 ttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgat 16488037  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  16488038 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattat 16488137  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488138 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 16488237  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16488238 tgttttaagatgattgagtacatgcattagcatacattcgtt-ggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataat 16488336  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16488337 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggctcattccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttg 16488435  T
Q  555 tcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16488436 ttgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 16488467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Original strand, 16356813 - 16357326
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||  || |||||||||    
T  16356813 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgat 16356911  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16356912 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16357011  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357012 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 16357111  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357112 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 16357210  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  16357211 gttggaggcttatgccctaaaagtatattaatactgtaatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttg 16357309  T
Q  555 tcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||    
T  16357310 tcgcattgtcgagtcaa 16357326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Original strand, 16348525 - 16349038
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||  || | || |||||||||| || |||||||||    
T  16348525 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgat 16348623  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16348624 ttaatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16348723  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348724 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactctaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 16348823  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348824 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 16348922  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  16348923 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttg 16349021  T
Q  555 tcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||    
T  16349022 tcgcattgtcgagtcaa 16349038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 571
Target Start/End: Original strand, 5338801 - 5339352
Alignment:
Q  16 ctgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  5338801 ctgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgaattgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatct 5338900  T
Q  115 atgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa 214  Q
      ||||| ||||||||    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5338901 gagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttgaaatgaa 5339000  T
Q  215 ttgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt 313  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||         |||    
T  5339001 ttgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtctatacaagatgat---------gtt 5339091  T
Q  314 gaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5339092 gaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaaaatgttgattaagatgatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccc 5339191  T
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgc 509  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  5339192 tggagccttgtcatcaccacgatggagctttagctctaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgc 5339291  T
Q  510 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5339292 cctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 5339352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 76 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12570259 - 12569717
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 175  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570259 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 12570160  T
Q  176 tgaaatattattaaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||| ||| | |||||    |  || || || ||||  | | |||||||     |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  12570159 tgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgt 12570060  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagat 365  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  12570059 tatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga- 12569961  T
Q  366 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt 465  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  12569960 gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttataccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataacgatgggggctt 12569862  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattg 562  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12569861 atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattg 12569763  T
Q  563 tcgagtc-aatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttgatgatgt 608  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12569762 tcgagtcaaatgatgaaagatgtttaagatgc-tatgttgaagatgt 12569717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15094009 - 15093499
Alignment:
Q  78 tagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 176  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  15094009 tagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctctgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattactt 15093911  T
Q  177 gaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaacta 275  Q
     | |||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| ||||||||    
T  15093910 aatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaacta 15093811  T
Q  276 agttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtc 374  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15093810 agttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgtttttaga-gatcgagtc 15093712  T
Q  375 catgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctga 474  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  | ||| | |||||||||||     
T  15093711 catgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatggtggcttatgccctgg 15093612  T
Q  475 aagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aa 571  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  15093611 aagtatattaatactcaataacgatgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgta-ttgtcgcattgtcgagtcaaa 15093513  T
Q  572 tgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||| ||||||    
T  15093512 tgatgaaagatgtt 15093499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 15353112 - 15353544
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||    
T  15353112 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatctaaga 15353211  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa-g 198  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| |||   |    
T  15353212 tgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataatccttg 15353311  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15353312 atgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgat 15353411  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15353412 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtt 15353511  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15353512 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 15353544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813261
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttttaatgttgtg 13813065  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813066 gtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 13813165  T
Q  342 atgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813166 atgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgattgagc 13813261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 237 - 585
Target Start/End: Original strand, 15121843 - 15122193
Alignment:
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgta 335  Q
    ||||||| |||||  |||| || || ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatata 15121942  T
Q  336 tatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15121943 tatgagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 15122041  T
Q  436 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15122042 agcattagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 15122141  T
Q  533 taagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15122142 taagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcaagtcaatgatgaatgatgtt 15122193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23843705 - 23843202
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  23843705 gacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgagttatga 23843606  T
Q  186 ttaaatgatcaagatgttg--ttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgct 282  Q
     | | ||||  ||||||||  || |  ||| || | |||  |||  | || ||||||||   |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||     
T  23843605 atgagtgattgagatgttgcttttatttgatatcgttatg-tgatgtcatactgttgtttcaatctgtctatgctgctattgttatttaactatgttgca 23843507  T
Q  283 tgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtat 381  Q
    |||||| ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  23843506 tgagtcgatataagatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcat 23843408  T
Q  382 tagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtata 481  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23843407 tagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattggctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtata 23843308  T
Q  482 ttaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    |||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  23843307 ttaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaa 23843209  T
Q  579 tgatgtt 585  Q
     ||||||    
T  23843208 agatgtt 23843202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 16351654 - 16352088
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  16351654 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 16351753  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| | | ||| | |||||   ||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  16351754 tgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 16351853  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta---tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaag 296  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |    
T  16351854 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaatttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgctgttatttaacttagttgcatgtgtctatacatg 16351953  T
Q  297 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttg 394  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  16351954 atgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttctg 16352053  T
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16352054 ttgggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 16352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 44675686 - 44675348
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagat 355  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  44675686 tgctattgttatttaactatgttgcatgaatagatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattactggatacataagagatgatgattaagat 44675587  T
Q  356 gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg 455  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  44675586 gttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacg 44675488  T
Q  456 ttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 552  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44675487 atgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-t 44675389  T
Q  553 tgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44675388 agtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 44675348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 234 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 13569579 - 13569227
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13569579 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattggat 13569480  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  13569479 acataagagatgatgattaatatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 13569381  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13569380 tggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctg-attggtaccacatgc 13569282  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13569281 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 13569227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 294 - 585
Target Start/End: Original strand, 15125141 - 15125434
Alignment:
Q  294 aagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||     
T  15125141 aagatgattaagatgatgtcgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacata 15125239  T
Q  393 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaat 492  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  15125240 tgttgggggctcattccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaa 15125339  T
Q  493 at---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15125340 ataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgaatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 15125434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 11250367 - 11250795
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  11250367 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 11250465  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| | |  ||    
T  11250466 tgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacatgaattattcttgaataaacttga 11250565  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  11250566 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 11250665  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  11250666 gaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgactccatgcattagcatac--ttgtt 11250762  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11250763 gggggatcatgccctggagttttgtcctcacca 11250795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157657
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttataccgttgat 20157506  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20157507 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatgaactccaaattattggatgtataagag 20157606  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20157607 atttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20157657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 36133768 - 36134152
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  36133768 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaagaaactttaggtattaatgagacctatttaaga 36133867  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  36133868 tattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgagttattattgaatgatcagga 36133966  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| |||||| |||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  36133967 agttgttgaagatgaatggat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 36134058  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36134059 aattaaaatgatgatgaactccaaattattgaatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 36134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 306 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12423696 - 12423429
Alignment:
Q  306 atgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12423696 atgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttttagattgattgagtccatgcgttaacatacatttgttgggggctc 12423597  T
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatt-tgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 503  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || | ||||              |   ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  12423596 atgccctggagctttgtcctcaccacgattgagctttgtcctca-------------ccacgatgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggc 12423510  T
Q  504 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12423509 tcatgtcctgaattggtaccaaatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 12423429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 334 - 551
Target Start/End: Original strand, 17048453 - 17048670
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17048453 tataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 17048550  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17048551 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcat 17048650  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17048651 ataagaggtctaagttgcat 17048670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 232 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25555559 - 25555371
Alignment:
Q  232 tgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattgga 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25555559 tgctgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattactgga 25555461  T
Q  332 tgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgt 421  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25555460 tgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgaatccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgt 25555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17810515 - 17810293
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  17810515 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagt-gtttataatgtgattt 17810417  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  17810416 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 17810325  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17810324 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634603
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||        |||| |||||||     
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttga 22634460  T
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatga 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||         ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22634461 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtc---------tgaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataaga 22634551  T
Q  341 ga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22634552 gatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 22634603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Original strand, 631105 - 631214
Alignment:
Q  318 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  631105 tccaaattattggatatatatgagatgataattaagatgttt--agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 631202  T
Q  418 ttgtactcacca 429  Q
    |||| |||||||    
T  631203 ttgtcctcacca 631214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14757228 - 14757507
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||| |||  |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  14757228 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaagttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 14757327  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  14757328 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 14757426  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14757427 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25555816 - 25555550
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || | | |||||    
T  25555816 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacttatttaaga 25555718  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||    
T  25555717 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 25555618  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgtt 266  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25555617 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 25555550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 577
Target Start/End: Original strand, 14053477 - 14053690
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  14053477 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 14053575  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-tt 561  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  14053576 tgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattt 14053674  T
Q  562 gtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| |||||||    
T  14053675 gtcgagtcgatgatga 14053690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 43256342 - 43256442
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43256342 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 43256441  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  43256442 a 43256442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12902702 - 12902517
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  12902702 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 12902604  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902603 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgaaggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12902517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 23374529 - 23374715
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||    
T  23374529 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgattggggcttgat 23374627  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||   | ||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23374628 gccctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatttatataagaggtctaagttgcat 23374715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17046397 - 17046245
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 499  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||   | | |    
T  17046397 atgccctggagctttgcactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgg 17046298  T
Q  500 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046297 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17046245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44052753 - 44052588
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44052753 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 44052654  T
Q  490 --aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
      ||||| | | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052653 caaatatcgatgggggcttgatgtcctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44052588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9556688 - 9556551
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  9556688 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 9556597  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9556596 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 602
Target Start/End: Original strand, 22634677 - 22634764
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt-taagatgcttatgttga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  22634677 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcaagtcaatgatgaatgatgttatgagatgtttatgttga 22634764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44675872 - 44675767
Alignment:
Q  74 taggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    ||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44675872 taggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcatt 44675773  T
Q  173 acttga 178  Q
    ||||||    
T  44675772 acttga 44675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27534325 - 27534103
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||| || |||||||| | | |||    
T  27534325 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttag-aaccgaactttaggtactaatgagacctatctgaga 27534227  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |  | ||||||  |  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  27534226 tgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttg-ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatcattattgaatgattaaga 27534128  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27534127 agttattgaaaatgaattgatatta 27534103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 540
Target Start/End: Original strand, 13813450 - 13813516
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13813450 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 13813516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 15125057 - 15125130
Alignment:
Q  99 atgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15125057 atgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15225035 - 15224962
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15225035 tataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttaaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Original strand, 631243 - 631311
Alignment:
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataaga 537  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  631243 ccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaga 631311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 4561282 - 4561419
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| |||| |||||||        |||| ||||||| |    
T  4561282 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgat--------attaagctgttgat 4561373  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  4561374 atgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 7798579 - 7798508
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  7798579 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 7798508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954496
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 14954496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689647
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 25689647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 1951567 - 1951942
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||  |||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    ||||    
T  1951567 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttgaattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 1951666  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |  ||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1951667 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagt-gaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 1951765  T
Q  199 atgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||||| |           ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||    
T  1951766 aaattgttgaaaatgaattgttattaagc----------ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga 1951849  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
      |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  1951850 --attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagttcatgcattagcatacatt 1951942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 5756886 - 5756967
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  5756886 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 5756967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7893507 - 7893462
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893507 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7893462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10713004 - 10712928
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10713004 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10712928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10926774 - 10926698
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10926774 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10926698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 16240181 - 16240331
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  16240181 atgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcaga-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 16240279  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240280 agcttgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16240331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16377837 - 16377882
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377837 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16377882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22636240 - 22636195
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636240 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22636195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 52873578 - 52873623
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873578 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52873623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10712697 - 10712633
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10712697 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 10712633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10926467 - 10926403
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10926467 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 10926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12487552 - 12487488
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12487552 gttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 12487488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12487862 - 12487802
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12487862 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 12487802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Original strand, 14954122 - 14954182
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14954122 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 14954182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25690021 - 25689961
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25690021 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 25689961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 508 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3096139 - 3096096
Alignment:
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096139 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3096096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33742535 - 33742407
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttg 242  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |        || | ||||||| |     
T  33742535 ttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttgaaatgaattggt--------atcaagctgttgata 33742444  T
Q  243 tgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33742443 taatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 33742407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 39706575 - 39706662
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706575 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 39706662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 52243477 - 52243564
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243477 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52243564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 43255967 - 43256190
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||   |||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  43255967 cgagcacttccagaaccgagtgcatttgaggatttttagacctaagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 43256066  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta-ttaaatgatcaag 198  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||  |||| || |||  |||||    
T  43256067 tgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataat-attatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaag 43256163  T
Q  199 atgttgttgaaatg-aattgatattat 224  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  43256164 atgttgttgaattgaaattgatattat 43256190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12773887 - 12773842
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12773887 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12773842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14038507 - 14038462
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038507 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14038462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14280136 - 14280091
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280136 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14280091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16270508 - 16270553
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270508 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 16270553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 19618565 - 19618610
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618565 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19618610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20149652 - 20149607
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149652 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20149607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 52312294 - 52312249
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312294 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52312249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 14132 - 14219
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14132 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 12288492 - 12288579
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12288492 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 12288579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 549
Target Start/End: Original strand, 14928061 - 14928104
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14928061 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 14928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 14971150 - 14971188
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14971150 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14971188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 474 - 532
Target Start/End: Original strand, 15353577 - 15353634
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15353577 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 15353634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15367464 - 15367426
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367464 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15367426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15369792 - 15369754
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369792 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15369754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15373300 - 15373262
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373300 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15373262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19242488 - 19242450
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242488 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19242450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13569739 - 13569646
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 179  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  13569739 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaa 13569646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 14157688 - 14157584
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 563  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14157688 atgccctagaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatgtatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgt 14157590  T
Q  564 cgagtc 569  Q
    ||||||    
T  14157589 cgagtc 14157584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 20157731 - 20157787
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20157731 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttaca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20157787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 552
Target Start/End: Original strand, 36134226 - 36134263
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134226 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 36134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 43198875 - 43198920
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43198875 atgccctggattggtaccacatgcatatatgaggtctaagttgcat 43198920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44102078 - 44102033
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44102078 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 44102033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 54799090 - 54799135
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54799090 atgccctgcattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcat 54799135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 12613 - 12649
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12613 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 13818054 - 13818109
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13818054 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 13818109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 14164384 - 14164289
Alignment:
Q  475 aagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||  |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14164384 aagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatgtatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgtcgagtc 14164289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15551762 - 15551683
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15551762 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 15551683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 550
Target Start/End: Original strand, 18215653 - 18215697
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18215653 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaatttgca 18215697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27533863 - 27533803
Alignment:
Q  127 tgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27533863 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatataatgattaaatgcattactcgaaatattatt 27533803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Original strand, 41385803 - 41385942
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  41385803 tatgttgctgcggttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 41385901  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  41385902 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 41385942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12610723 - 12610685
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12610723 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 12610685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15705187 - 15705149
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705187 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 15705149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 23803697 - 23803735
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23803697 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 23803735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 51464214 - 51464252
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51464214 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 51464252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 14708912 - 14708963
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14708912 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 14708963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 18236721 - 18236670
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18236721 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18236670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 19757696 - 19757781
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19757696 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19757781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19782110 - 19782025
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19782110 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19782025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3096238 - 3096159
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  3096238 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgaagcattagctcaaa 3096159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14679010 - 14678872
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14679010 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 14678912  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||    |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14678911 tacgatgtttt---gtgatagagtccatgcattagcattcatt 14678872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15375580 - 15375548
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375580 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17152293 - 17152516
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || |||| |||||| ||| || | ||||| | ||||||||||||  || |||||||| |  ||||    
T  17152293 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacttgagttgtttggtttggttagggaaggaactttaggtgttaatgagacctattaaaga 17152392  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt-acttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | || ||||  | || |||||   ||||||  || ||||| || ||||| |||| |||  |||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17152393 tattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagt-gaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaag 17152491  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
       |||||||||||||||| |||||    
T  17152492 gaattgttgaaatgaattgttatta 17152516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 568
Target Start/End: Original strand, 18603009 - 18603059
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18603009 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18603059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 513
Target Start/End: Original strand, 13813353 - 13813400
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctg 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  13813353 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg 13813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 474 - 532
Target Start/End: Original strand, 16352122 - 16352179
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16352122 aaagtatattaatactatgatgttgggagctcatgccctg-attgctaccacatgcata 16352179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 28569697 - 28569741
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28569697 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 28569741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 46640699 - 46640788
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  46640699 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaagaggtctaagttgcat 46640788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 53082434 - 53082523
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  53082434 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 53082523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2014789 - 2014704
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  2014789 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 2014704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 4561862 - 4561917
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4561862 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 4561917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 5757467 - 5757522
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5757467 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 5757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 9556099 - 9556044
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9556099 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 9556044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10712424 - 10712369
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10712424 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10712369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10926194 - 10926139
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10926194 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10926139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 11250831 - 11250887
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11250831 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 11250887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 12487254 - 12487199
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12487254 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 12487199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 13813292 - 13813337
Alignment:
Q  393 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813292 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 13813381 - 13813426
Alignment:
Q  393 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagc 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813381 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 14757964 - 14758019
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14757964 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 14758019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 14954729 - 14954784
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14954729 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14954784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 114
Target Start/End: Original strand, 15121681 - 15121722
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatct 114  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15121681 ttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatct 15121722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15224611 - 15224556
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15224611 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15224556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 16243495 - 16243580
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  16243495 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 16243580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 17152761 - 17152812
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17152761 attggtactacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17152812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 17809843 - 17809788
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17809843 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 17809788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 568
Target Start/End: Original strand, 18609584 - 18609631
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18609584 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18609631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23838471 - 23838342
Alignment:
Q  262 ctgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttt 359  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||    
T  23838471 ctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttt 23838373  T
Q  360 taagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  23838372 t--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 23838342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 25689438 - 25689383
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25689438 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25689383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 26243760 - 26243845
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  26243760 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 26243845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 33741949 - 33741894
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33741949 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 33741894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 516 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 3412626 - 3412576
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3412626 ttggtagcacatgcatataagtg-tctaagttgcatt-gtcgcattgtcgagt 3412576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9530445 - 9530390
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    
T  9530445 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt 9530390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14685218 - 14685080
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||    
T  14685218 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattaatatgatgat 14685120  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||    |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14685119 tacgatgtttt---gtgatagagtccatgcattagcattcatt 14685080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15225222 - 15225190
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15225222 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 15225190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 289
Target Start/End: Original strand, 17152520 - 17152572
Alignment:
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17152520 ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct 17152572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Original strand, 18222416 - 18222464
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18222416 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 18222464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 571
Target Start/End: Original strand, 22811782 - 22812287
Alignment:
Q  66 tggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaa 165  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811782 tggacctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaa 22811881  T
Q  166 -ttgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactg 264  Q
     ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22811882 attgcattacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattg 22811981  T
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaga 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811982 ttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaacgccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaga 22812081  T
Q  365 tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcct 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22812082 tgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaatattgttgggggct 22812181  T
Q  465 tatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  22812182 tatgcccttaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tggtcgcattgtc 22812280  T
Q  565 gagtcaa 571  Q
    |||||||    
T  22812281 gagtcaa 22812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 572
Target Start/End: Original strand, 25963577 - 25964091
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  25963577 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgat 25963675  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25963676 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 25963775  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963776 gctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 25963875  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25963876 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 25963974  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  25963975 gttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttg 25964073  T
Q  555 tcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  25964074 tcgcattgtcgggtcaat 25964091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 21327372 - 21327945
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |    
T  21327372 cgagcactcccagaactgagtgtatttgagaatgttttgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacatatttaaaa 21327471  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || | ||| |||||| |||||||| |  |||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  21327472 tgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaaga 21327571  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21327572 tgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagat 21327671  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgat-taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21327672 gaataagatgttgttgaactccaaattattggatgtatataagatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttg 21327771  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  21327772 ggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatgttaatactaaacagt 21327871  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21327872 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21327945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 21318441 - 21319014
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||    
T  21318441 cgagcactcccagaactaagtgtatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacatatttaaga 21318540  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || | | | |||||| | |||||| |  |||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  21318541 tgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaaga 21318640  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21318641 tgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagat 21318740  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgat-taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21318741 gaatgagatgttgttgaactccaaattattggatgtatataagatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttg 21318840  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21318841 ggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatattaatactaaactgt 21318940  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21318941 tgggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgga-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21319014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 73 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37524905 - 37524410
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||| || | ||| |||||| | |||||| || || | ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  37524905 ttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgatttaat-------tgcatt 37524814  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  37524813 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaatgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 37524714  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37524713 ccaagttgcatgagtctatacaagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgag 37524624  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccc 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37524623 tccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccc 37524524  T
Q  472 tgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37524523 tgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgttgcattgtcgagtcaa 37524425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 40428776 - 40428202
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaa-ctgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataag 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||  |||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||    
T  40428776 cgagcacttccagaaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaag 40428677  T
Q  99 atgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | |  |    
T  40428676 atgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttaaataaccttg 40428577  T
Q  199 atgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||    
T  40428576 atgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaactaagttgcatgagtcattgtaaga 40428477  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40428476 tgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacatatgt 40428377  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatg 495  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40428376 tgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactg 40428277  T
Q  496 tttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40428276 ttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 40428202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 76 - 571
Target Start/End: Original strand, 22799007 - 22799504
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||    
T  22799007 ggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgccttac 22799105  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaac 273  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  22799106 ttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaac 22799205  T
Q  274 taagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  22799206 taagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gaccgag 22799304  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccct 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  22799305 tccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccct 22799404  T
Q  473 gaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtca 570  Q
    | ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22799405 ggaagtatattaatactcaataacgataggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtca 22799503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 24716336 - 24716762
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24716336 cgagcacttctagagccgagtgcaattgagaatgttgagacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaaga 24716435  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| || || ||| || ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | ||    
T  24716436 tgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattactagacatattattgaatgattatga 24716534  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||    
T  24716535 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatg 24716633  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24716634 aataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgggttaa-atgattgagtccatgcattaacatacatttgttggg 24716732  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24716733 ggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 164 - 419
Target Start/End: Original strand, 21916068 - 21916322
Alignment:
Q  164 aattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |    
T  21916068 aattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  264 gttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaag 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-ag 21916266  T
Q  364 atgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagcttt 419  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21916267 atgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 21916322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 76 - 585
Target Start/End: Original strand, 23019587 - 23020099
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||  ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||  ||||||||    
T  23019587 ggtagtaatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgtgaagcttttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattac 23019685  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaac 273  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  23019686 ttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaac 23019785  T
Q  274 taagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    ||||||   |||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23019786 taagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatgtcgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgag 23019884  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccct 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  23019885 tccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggtgaattagctcaaattagcgatgggggcttatgccct 23019984  T
Q  473 gaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc- 569  Q
    | | ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23019985 ggatgtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtca 23020083  T
Q  570 aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||| ||||||    
T  23020084 aatgatgaaagatgtt 23020099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 257 - 585
Target Start/End: Original strand, 45678192 - 45678521
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatg 356  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45678192 tgctattgttatttaactatgttgcatgagtccatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggaaatatatgagatgatgattaagatg 45678291  T
Q  357 ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 456  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  45678292 ttttagga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacga 45678390  T
Q  457 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||   | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45678391 tgggggctaatgcactgaaagtatattaatactaaaataaagatgggggctcatgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ta 45678489  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45678490 gtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 45678521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24673645 - 24673290
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    |||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24673645 tgttattgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctgtacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatat 24673546  T
Q  335 atat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24673545 atatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 24673447  T
Q  433 tggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 528  Q
    |||||| || |||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24673446 tggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 24673347  T
Q  529 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24673346 catataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatgtt 24673290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Original strand, 40622251 - 40622603
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40622251 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 40622350  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40622351 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgtgggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgat 40622449  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    |||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40622450 ggagcattagctcaaaataacgatgtgggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 40622549  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40622550 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 40622603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 240 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24680259 - 24679907
Alignment:
Q  240 ttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat- 338  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  24680259 ttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcttgagtctgtacaagatgattaagatggtgttgaacttcaaattattggatatatata 24680160  T
Q  339 ---gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 435  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24680159 tatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 24680061  T
Q  436 agcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24680060 agcattagctcaaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcat 24679961  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24679960 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaatgatgtt 24679907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24175111 - 24174680
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  24175111 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24175012  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  24175011 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24174912  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24174911 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatg 24174812  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24174811 aataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttg 24174712  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24174711 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24174680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 24655144 - 24655575
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  24655144 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaagtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24655243  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| | | ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  24655244 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24655343  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24655344 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatg 24655443  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24655444 aataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttg 24655543  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24655544 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24655575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 55 - 578
Target Start/End: Original strand, 22740820 - 22741349
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||  || ||| ||||| ||| ||||||    
T  22740820 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 22740919  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||   | | |||||||     | |||  | || |||||||||| ||||    
T  22740920 tataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatct 22741018  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22741019 gtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggataaataagagatgatg 22741118  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  22741119 attaagatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 22741216  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22741217 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaa 22741316  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  22741317 gttgca-tagtcgaatagtcgagtcaatgatgaa 22741349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 25961340 - 25961768
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  25961340 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 25961439  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| ||||||| | ||||   |||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  25961440 tgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttg-ttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctaga 25961538  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  25961539 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcatta-aagat 25961637  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  25961638 gaataagatgttgttgagctccaaattattggattcatattgagatg-tgattaagatgttttagattgattgagtcaatgcattagcatacttttgttg 25961736  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25961737 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 25961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24870190 - 24869760
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||||  ||  |||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  24870190 gagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatgaaacattaggtagtaatgaaacctatttaagat 24870091  T
Q  101 gttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagat 200  Q
    |||| | | ||||| ||| |  |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| || ||| | | ||||    
T  24870090 gttagccggaatctgtgaggttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatacattactcgaattattcttgaataaactagat 24869991  T
Q  201 gttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga 300  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24869990 gttgttgaaatgaattgttgttatgaatttatgattttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatga 24869891  T
Q  301 ttaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
     || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  24869890 ataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagagtgattgagtccatggattagcatacttttgttag 24869791  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24869790 gggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24869760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 22758575 - 22759111
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||| ||| ||||||    
T  22758575 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 22758674  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatg-----ctgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| ||   | | || ||||| | |  | |||     |||||||||| ||||    
T  22758675 tataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctgttttta-ttaatattgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatct 22758773  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22758774 gtctatgctgctattgttatttaaactagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacatccaaattattggataaataagagatgatg 22758873  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  22758874 attaagatgtat-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 22758971  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||   | | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22758972 aattagcgatgggggcctatgccctggaagtatataaatactcaaataacgatgggggctcatgccttgaattggtaccacatgcacataagaggtctaa 22759071  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22759072 gttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 22759111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24735703 - 24735319
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||  ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  24735703 cgagcacttccagaactgattgcatttgaggattttgacacccgagttgcttggattgattaagaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 24735604  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24735603 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgatcgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 24735505  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  24735504 agttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 24735413  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24735412 aattaaagtgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 24735319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 19688562 - 19688779
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  19688562 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 19688661  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19688662 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 19688760  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattg 217  Q
      |||||||| ||||||||    
T  19688761 aattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Original strand, 10101509 - 10101730
Alignment:
Q  58 attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattta 157  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  10101509 attaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattta 10101607  T
Q  158 atgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgt 256  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||     
T  10101608 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgc 10101699  T
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10101700 tgctattgttatttaactaagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 474 - 585
Target Start/End: Original strand, 24716796 - 24716907
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-t 572  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24716796 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatt 24716894  T
Q  573 gatgaatgatgtt 585  Q
    |||||| ||||||    
T  24716895 gatgaaagatgtt 24716907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31345053 - 31344953
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31345053 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 31344954  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  31344953 a 31344953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 38292 - 38478
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  38292 gagtccatgcattagcattcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 38390  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38391 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9784632 - 9784555
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784632 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 9784555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 23072125 - 23072312
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  23072125 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 23072223  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072224 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23072312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23060690 - 23060272
Alignment:
Q  138 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctg 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| ||    
T  23060690 gttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttg 23060592  T
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat 336  Q
    || ||||   |||  |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||| ||   ||||||||||||||| |||    
T  23060591 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt-tccaaattattggat-tat 23060494  T
Q  337 atgagatgatg----attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
    || ||| | ||    |||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |    
T  23060493 ataagaggttgtcgaattaagatgttt-aagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 23060396  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccaca 526  Q
    ||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23060395 atggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 23060297  T
Q  527 tgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  23060296 tgcatataagaggtgtaagttgcat 23060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 23103571 - 23103757
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  23103571 gagtccatgcattagcactcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 23103669  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23103670 gccctgaaagtatattactactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgcat 23103757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 23654598 - 23654749
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  23654598 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 23654697  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654698 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23654749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 551
Target Start/End: Original strand, 21900630 - 21900816
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atg 468  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||    
T  21900630 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaatttagcgatgggggcttgatg 21900729  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21900730 ccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatttaagaggtctaagttgcat 21900816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 508 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 23031176 - 23031092
Alignment:
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23031176 gccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 23031092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Original strand, 44370106 - 44370268
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |   | |||||    
T  44370106 agcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgaggaatgaaactttaggtagtagtgagatatagtttagatg 44370205  T
Q  102 ttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgatta 164  Q
    ||||  | ||| | |||||| |||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  44370206 ttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatta 44370268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24649515 - 24649378
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  24649515 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 24649424  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  24649423 atgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24673813 - 24673709
Alignment:
Q  77 gtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 176  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||  ||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24673813 gtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattactt 24673714  T
Q  177 gaaat 181  Q
    |||||    
T  24673713 gaaat 24673709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Original strand, 21918194 - 21918288
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaatt 167  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918194 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaatt 21918288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22337069 - 22336885
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |   | |||||| | |||    
T  22337069 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacaatggagctttagctcaaattgc-gatggggcttgatg 22336971  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336970 ccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22336885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 12901460 - 12901597
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  12901460 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 12901551  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  12901552 atgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 12901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 27379381 - 27379518
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  27379381 ttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 27379472  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27379473 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 27383427 - 27383564
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  27383427 ttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 27383518  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27383519 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27601954 - 27601825
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  27601954 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 27601863  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27601862 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 27601825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 25961802 - 25961899
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25961802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 25961899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 41530958 - 41531035
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  41530958 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 41531035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1283540 - 1283464
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  1283540 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 1283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 30344946 - 30345022
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  30344946 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 30345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 41531269 - 41531333
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  41531269 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcnaaatattatt 41531333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 30345256 - 30345320
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30345256 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 30345320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 22413418 - 22413505
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22413418 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 22413505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 7679416 - 7679370
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 552  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679416 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 7679370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 24655609 - 24655704
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24655609 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgttgcattgtcgagtcaa 24655704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 299110 - 299155
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299110 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 299155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6725779 - 6725734
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6725779 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6725734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8946461 - 8946416
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8946461 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 8946416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23076295 - 23076250
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076295 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtgtaagttgcat 23076250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23130683 - 23130638
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130683 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23130638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23133150 - 23133105
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133150 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 23712391 - 23712436
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712391 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23712436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 24628427 - 24628508
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  24628427 ttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 24628508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 24643328 - 24643373
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643328 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24643373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25616046 - 25616001
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616046 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25616001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1283230 - 1283166
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1283230 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgattaaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 1283166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 509 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 23657638 - 23657571
Alignment:
Q  509 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||    
T  23657638 ccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattttcgagtcaaagatga 23657571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 18787184 - 18787271
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18787184 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 18787271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 19691922 - 19691976
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19691922 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 19691976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20322444 - 20322405
Alignment:
Q  512 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20322444 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20322405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 24174646 - 24174550
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24174646 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24174550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 24735222 - 24735168
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24735222 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 24735168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 24869726 - 24869630
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24869726 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24869630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22105142 - 22105104
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105142 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22105104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 509 - 551
Target Start/End: Original strand, 22731553 - 22731595
Alignment:
Q  509 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22731553 ccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcttagttgcat 22731595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 22738495 - 22738537
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738495 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 22738537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 23103256 - 23103418
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||  | | ||||||    
T  23103256 ttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttggatttgatgtga 23103355  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaatt 216  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||| ||| | | ||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  23103356 tataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatt 23103418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 25175639 - 25175578
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25175639 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 25175578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38967189 - 38967151
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967189 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43137070 - 43137032
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137070 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 43137032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 8056 - 8101
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8056 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 21177725 - 21177770
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21177725 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 23040507 - 23040552
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23040507 atgccctgtattggtaacatatgcatataagaggtctaagttgcat 23040552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 23713211 - 23713256
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23713211 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 32215313 - 32215358
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215313 atgccccgtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 32215358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 45677961 - 45678074
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttg-cttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | || || ||  ||||||||| |||||   |||||||||| || ||||| |||| |||    
T  45677961 gagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggat 45678060  T
Q  101 gttaactgcaatct 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  45678061 gttaattgcaatct 45678074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 519 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 28405775 - 28405717
Alignment:
Q  519 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  28405775 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 28405717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15477761 - 15477711
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatga 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15477761 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19671671 - 19671633
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19671671 gtattggtaccacatgcataaaagaggtctaagttgcat 19671633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 24688570 - 24688659
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctca-tgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||   |||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24688570 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgaaggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24688659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25616334 - 25616212
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| || |||||||||| | |  |  |||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||    
T  25616334 tgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgt 25616235  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  25616234 aatttaactaagttgcatgagtc 25616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 18855735 - 18855786
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18855735 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 18855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 19928597 - 19928682
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  19928597 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 19928682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 23186905 - 23186854
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23186905 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 23186854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 23598168 - 23598117
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23598168 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 23598117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 459 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23791120 - 23791024
Alignment:
Q  459 gggccttatgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23791120 gggctttatgccctgcaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 23791024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24367558 - 24367513
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24367558 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 24367513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26125013 - 26124962
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26125013 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 26124962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 40622089 - 40622142
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatga 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40622089 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 40622142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 24697850 - 24697897
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24697850 atgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcat 24697897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 181
Target Start/End: Original strand, 45678074 - 45678106
Alignment:
Q  149 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45678074 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 45678106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24503158 - 24503019
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||    
T  24503158 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatataatgat 24503060  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  24503059 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 24503019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 20309053 - 20308972
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20309053 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaat 20308972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 20520435 - 20520524
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20520435 atgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 20520524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 60646 - 60599
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  60646 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 60599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 1282957 - 1282902
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1282957 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1282902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 10102190 - 10102245
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10102190 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 10102245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 10822942 - 10822987
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10822942 atgctctggattggtaccacatgcatagaagaggtttaagttgcat 10822987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 12902053 - 12902108
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12902053 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 12902108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 18855554 - 18855639
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  18855554 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 18855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 24629016 - 24629071
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24629016 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 24629071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 24648924 - 24648869
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24648924 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 24648869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 27601361 - 27601306
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27601361 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 27601306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 30345553 - 30345608
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30345553 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30345608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 31344706 - 31344651
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31344706 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 31344651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 41531542 - 41531597
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41531542 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 41531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 22134526 - 22134562
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22134526 attggtaccacatgcatataagagatttaagttgcat 22134562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 132)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Original strand, 21366526 - 21367040
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  21366526 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgat 21366625  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  21366626 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattat 21366724  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366725 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 21366824  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21366825 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 21366923  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  21366924 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 21367022  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21367023 gtcgcattgtcgagtcaa 21367040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 73 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 20805788 - 20805293
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20805788 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 20805690  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  20805689 acttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttgaa-tgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaa 20805591  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgatt 369  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20805590 ctaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgatt 20805492  T
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatg 468  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20805491 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatg 20805392  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20805391 ccctgaaagtatattaatactataatgctgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagt 20805293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 76 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20766715
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 175  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  176 tgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaacta 275  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttgaa-tgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaacta 20767010  T
Q  276 agttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    |||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20767009 agttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa-atgattgag 20766911  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccc 471  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  20766910 tccatgcattagcatacatatgttgggggttcatgccctatagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgagggcttatgccc 20766811  T
Q  472 tgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20766810 tgaaattatattaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagt 20766715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23451655 - 23451227
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23451655 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23451556  T
Q  102 ttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatg 201  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23451555 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23451457  T
Q  202 ttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgat 301  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||     
T  23451456 ttgttgaaaagaattgatgttatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaa 23451358  T
Q  302 taggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23451357 taagataatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 23451258  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23451257 gggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23451227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23463160 - 23462732
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23463160 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23463061  T
Q  102 ttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatg 201  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23463060 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23462962  T
Q  202 ttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgat 301  Q
     |||||||| |||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||     
T  23462961 ctgttgaaaagaattgctgttatgaagt-atagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaa 23462863  T
Q  302 taggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23462862 taagatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 23462763  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23462762 gggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23462732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 602
Target Start/End: Original strand, 18769809 - 18770412
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18769809 cgagcacttccagaactgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 18769908  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||||| |||||| | |||||  || |   ||||| ||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  18769909 agttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 18770006  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  || ||||||| |||||| ||| ||||    
T  18770007 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataaga 18770104  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttg 394  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  18770105 tgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatagatgagatgatgattaagatgttttaaga-gactgagtccatgcattagcatacatttg 18770203  T
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa--- 491  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||       
T  18770204 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaat 18770303  T
Q  492 tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagat 591  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18770304 aatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagat 18770401  T
Q  592 gcttatgttga 602  Q
    |||||||||||    
T  18770402 gcttatgttga 18770412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23458899 - 23458471
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23458899 agcacttcaagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23458800  T
Q  102 ttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatg 201  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23458799 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23458701  T
Q  202 ttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgat 301  Q
     |||||||| |||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||     
T  23458700 ctgttgaaaagaattgctgttatgaagt-atagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaa 23458602  T
Q  302 taggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23458601 taagatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 23458502  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23458501 gggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23458471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 1858782 - 1859210
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||    
T  1858782 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacttgagttgattgaattgattaggattggaactt-aggtagtagtgagacatatttaaga 1858880  T
Q  100 tgttaactgcaa-tctatgaagccgttatgaattgctaa--gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatca 196  Q
    |||||| || || ||| ||| || ||| |||| | ||||  |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1858881 tgttaattgaaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaattgttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatta 1858979  T
Q  197 agatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaag 296  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||    
T  1858980 tgatgttgttgaaatgaattgttgttatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataag 1859078  T
Q  297 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1859079 atgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agttgattgagtccatgcattagcatacatttgtt 1859177  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1859178 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 1859210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22032630 - 22032080
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  22032630 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 22032531  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||||| |||||| | || ||  || |   ||||| ||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  22032530 agttaactgcaatctgtgaagctgatacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 22032433  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctg-ttgtt-gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaag 296  Q
    |||||| |||| ||||||| |||     ||||||  || ||||| || |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  22032432 atgttgatgaattgaattggtat-----aattatcatgattgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataag 22032338  T
Q  297 atgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22032337 atgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgt 22032239  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---t 492  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||        
T  22032238 tgagggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaata 22032139  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032138 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22032080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 123111 - 123681
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| || ||  |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| | | |||    
T  123111 cgagcacttccagaattgagtgcttttgttaatgtcgtaacctgagttgtttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaatatgacctatgtgaga 123210  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| ||| || ||||||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| |    ||    
T  123211 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgaattattcttgaataactttga 123309  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  123310 tgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 123409  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
     | || || |   |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||   || ||||    
T  123410 aaataagacg---ttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcaatgatatgtt 123506  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  123507 gggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactat 123606  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  123607 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 123681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 76 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21873487 - 21872978
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  21873487 ggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattac 21873389  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaac 273  Q
    || | |||||||| |||| | |||||||||   |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||   |||  |||| ||||  |||||||||||    
T  21873388 ttaagatattattgaatggttaagatgttg---aaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaac 21873292  T
Q  274 taagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  21873291 taagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaccctccaaattattggatacatatgagatgatcattaacatgttttaaga-gatcgag 21873193  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccct 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||    
T  21873192 tccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccct 21873093  T
Q  473 gaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc- 569  Q
    | ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  21873092 ggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatattcgagtcg 21872994  T
Q  570 aatgatgaatgatgtt 585  Q
     |||||||| ||||||    
T  21872993 tatgatgaaagatgtt 21872978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Original strand, 17918957 - 17919489
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||| |    
T  17918957 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttaggaatgaaactttaggtagtaaggaaacctatttaata 17919056  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||| | ||   ||| |||  | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||    
T  17919057 tgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 17919155  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  17919156 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 17919255  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    | |         ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  17919256 gtt---------gttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgtt 17919346  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17919347 gggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcattaactcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgt 17919446  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17919447 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggt 17919489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24222188 - 24221757
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  24222188 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24222089  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
     |||| | | ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | | |||    
T  24222088 cgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24221989  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24221988 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatgagtctatacatgatg 24221889  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  24221888 aataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatacttttgttg 24221789  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24221788 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24221757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201083
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggata 23201337  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  23201336 cataagagatgatgattatgatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 23201238  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201237 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgcactggaagtatattaatacttaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 23201138  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  23201137 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 23201083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22757436 - 22757010
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||    
T  22757436 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagttgtgaaacctatttaaga 22757338  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | |  ||    
T  22757337 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattattgaataaacttga 22757238  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  || |||||    
T  22757237 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttacatgagtcattataagat 22757138  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  22757137 gaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttag-tgattgagtccatgcattagcatac--ttgttg 22757042  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22757041 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 22757010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 14079386 - 14078877
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14079386 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 14079287  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatt 269  Q
    ||||  ||| | | | ||||  | ||||  ||    | |||||||||     | |||  | || |||||||||  |||||  |||| ||||| |||||||    
T  14079286 ttgagttatgaatgagtgattgaaatgtgctt----ttaattgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatt 14079191  T
Q  270 taactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgatt 369  Q
    |||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14079190 taactatgttgcatgaattgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatc 14079092  T
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 469  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  14079091 gagtccatgcattagcatacatgtgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgc 14078992  T
Q  470 cctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcga 566  Q
    |||| ||||||||||||||| |    | | |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  14078991 cctggaagtatattaatactcaactaacgatgagggctcatgccccgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcga 14078893  T
Q  567 gtcaatgatgaatgat 582  Q
    ||||||||||||||||    
T  14078892 gtcaatgatgaatgat 14078877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 12028371 - 12028799
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  12028371 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 12028469  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  ||| | |  ||    
T  12028470 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaataaacttga 12028569  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  12028570 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 12028669  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  12028670 gaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgtt 12028766  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12028767 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 12028799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767743
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactattgat 24767592  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24767593 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatgaactccaaattattggatgtataagag 24767692  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  24767693 atttgatgattaagatgtttt--gttgatagaatccatgcattagcatacatt 24767743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26680890 - 26680464
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||  |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  26680890 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 26680792  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa-g 198  Q
    |||||||||  |  | |||||  |||| |||   |||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| || ||| | |   |    
T  26680791 tgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaataaaccttg 26680695  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26680694 atgttattgaaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgat 26680595  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  26680594 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatac--ttgtt 26680497  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26680496 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26680464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26952497 - 26952071
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||  |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  26952497 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 26952399  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa-g 198  Q
    |||||||||  |  | |||||  |||| |||   |||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| || ||| | |   |    
T  26952398 tgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaataaaccttg 26952302  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26952301 atgttattgaaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgat 26952202  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  26952201 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatac--ttgtt 26952104  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26952103 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26952071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23572390 - 23571899
Alignment:
Q  4 gcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  23572390 gcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagt 23572291  T
Q  103 taactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatg 201  Q
    |||||||||| | |||||  | |||||  || |  |||||||||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    ||||||    
T  23572290 taactgcaatttgtgaagttgatatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataagatg 23572193  T
Q  202 ttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga 300  Q
    ||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  |||||||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23572192 ttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatga 23572095  T
Q  301 ttaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat--------gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||        || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23572094 ttaagatgatgttcaattccaaattattggatatatatatatatatgacatgatgattaaaatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatt 23571996  T
Q  393 tgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23571995 tgtttggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagcttaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 23571899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23511839
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 23512075  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttt-taagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| |||||||||||| ||||||   || ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23512074 cataagagatgatgattaagatgtttataaga-gatcgagctcatgcattagcatacatatgttgg---cttatgccctggagcttagtactcaccacga 23511979  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    |||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23511978 tggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatattcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 23511879  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23511878 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 23511839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 26704152 - 26703793
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26704152 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattggat 26704053  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26704052 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 26703955  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || ||||  ||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26703954 tggagctttagctc--aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctaaattggtaccacaagc 26703857  T
Q  530 atataagaggtc-taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  26703856 atataagaggtcttaagttgca-tagtcgcatagtcgagccaatgatgaaagatg-ttaagatgct 26703793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 26973885 - 26973526
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26973885 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattggat 26973786  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26973785 aaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 26973688  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || ||||  ||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26973687 tggagctttagctc--aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctaaattggtaccacaagc 26973590  T
Q  530 atataagaggtc-taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  26973589 atataagaggtcttaagttgca-tagtcgcatagtcgagccaatgatgaaagatg-ttaagatgct 26973526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 22107789 - 22107973
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgc 469  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  22107789 gagtctatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgc 22107888  T
Q  470 cctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107889 cctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22107973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31342221 - 31342027
Alignment:
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31342221 ttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcat 31342122  T
Q  337 a-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    | ||||||  ||||||||||  ||||   |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31342121 attgagatattgattaagattgtttagattgatcgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatga 31342027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23440027 - 23439860
Alignment:
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgtt--tta 361  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  23440027 ttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagataatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatgttgatta 23439928  T
Q  362 agatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23439927 agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23439860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17410602 - 17410360
Alignment:
Q  139 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgt 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |         |||    
T  17410602 ttgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagt--------tgt 17410511  T
Q  238 tgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata 337  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17410510 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtata 17410411  T
Q  338 tgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 388  Q
     ||||  | ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||    
T  17410410 agagattttatgattaagatgtttt--gttgatggagtccatgcattagcata 17410360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 452
Target Start/End: Original strand, 23501418 - 23501612
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagat 355  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| |||    
T  23501418 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaaatattggataaatacgagatgatgtttatgat 23501517  T
Q  356 gttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaata 452  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23501518 gttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaata 23501612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 23535395 - 23535768
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |||  |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  23535395 cgagcacttccagaactgagtgcattttaggattgtgagacctgagttgcttggtttgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctgtttaaga 23535494  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||| ||  | || ||||||   |||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  23535495 tattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagt-gattatac-gtgatttattgatagattgcattactttaattattattgaatgatcaaga 23535592  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
      ||||||||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  23535593 aattgttgaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc---------tg 23535675  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23535676 aataagttgatgatgaactccaatttattggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 23535768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 368 - 551
Target Start/End: Original strand, 19661009 - 19661197
Alignment:
Q  368 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 465  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||     
T  19661009 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttg 19661107  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661108 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19661197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18356133 - 18355938
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18356133 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 18356034  T
Q  223 atgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaa 322  Q
    |  ||         ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||         |||| || | ||||| ||||||||||    
T  18356033 a--aa--------cttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt---------atgaataagttgatgatgaactccaa 18355953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 20911100 - 20911200
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20911100 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 20911199  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  20911200 a 20911200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10753205 - 10753111
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10753205 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21808565 - 21808751
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | |||||  || ||    
T  21808565 gagtccatgcattagccttcatt-gttgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgat 21808663  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808664 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21808751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 474 - 585
Target Start/End: Original strand, 1859244 - 1859355
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-t 572  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  1859244 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-tagtcgcattgtcgagtcaatt 1859342  T
Q  573 gatgaatgatgtt 585  Q
    |||||| ||||||    
T  1859343 gatgaaagatgtt 1859355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 9077898 - 9077689
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  9077898 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 9077800  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9077799 gccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcg 9077701  T
Q  566 agtcaatgatga 577  Q
    |||||| |||||    
T  9077700 agtcaaagatga 9077689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 15236586 - 15236865
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttg-attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||  |||| | ||| ||| |||||||||||||| || |||| || |||||||| | |||||    
T  15236586 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaacctttggtactaatgagacctatctaaga 15236685  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||| | ||    
T  15236686 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattcttgaatgattagga 15236784  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  15236785 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 499 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21887099 - 21887013
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  21887099 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcgtatgatgaaagatgtt 21887013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 21293145 - 21293332
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  21293145 gagtccatgaattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 21293243  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21293244 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtagcat 21293332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1096412 - 1096228
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||  | |||||| | |||    
T  1096412 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacatgatggagctttagctcaaa-tagcgatggggcttgatg 1096314  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096313 ccctgaaagtatattaatacttaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1096228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 21729276 - 21729427
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | |||||  || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  21729276 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 21729375  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729376 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21729427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22074965 - 22074779
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  22074965 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtttgagtattagctcaaattagcgatgggggcttgat 22074867  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074866 gccctggaagtatattaatactcagatagtgatgggggcttgatgccctgtattgctaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 22074779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23439834 - 23439730
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  23439834 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtagcattgtcg 23439736  T
Q  566 agtcaa 571  Q
    ||||||    
T  23439735 agtcaa 23439730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23451201 - 23451097
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  23451201 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtagcattgtcg 23451103  T
Q  566 agtcaa 571  Q
    ||||||    
T  23451102 agtcaa 23451097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23458445 - 23458341
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23458445 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 23458347  T
Q  566 agtcaa 571  Q
    ||||||    
T  23458346 agtcaa 23458341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 23462706 - 23462602
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23462706 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcg 23462608  T
Q  566 agtcaa 571  Q
    ||||||    
T  23462607 agtcaa 23462602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24493514 - 24493328
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  24493514 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 24493416  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493415 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24493328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18356627 - 18356390
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| |||| || || |||||||| | |||||    
T  18356627 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttagatactaatgagacctatttaaga 18356528  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| | | ||  || |||  ||||||    
T  18356527 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatgtttta-tgcattacttaagaaatatttgaatattcaaga 18356430  T
Q  200 tgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgtt 238  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||    
T  18356429 tgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtt 18356390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 499 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21877344 - 21877258
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||||    
T  21877344 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcataatcgagtcgtatgatgaaagatgtt 21877258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11225175 - 11225107
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaat 191  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11225175 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattaaat 11225107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 37724163 - 37723635
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  || ||  ||||| ||| ||||||    
T  37724163 ttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttttgagatgttagtgttgaatatgatgtga 37724064  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgat-ctgat 251  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| |||| | || ||||||| || |  | ||||||||||    || |||      
T  37724063 tataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgt----atactgcc 37723968  T
Q  252 tatgttgct-actgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatg-- 347  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |  |||||| |   || |||||||||  ||||||||||||||   |  | ||| | ||      
T  37723967 tatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgtt---gaagatgttgaagttccaaattattggactaaattaagaggttgtc 37723871  T
Q  348 --attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggc-tcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 444  Q
      |||||| || ||||||| | | ||||||||| |||||||| || | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37723870 gaattaagttg-tttaaga-ggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgc 37723774  T
Q  445 tcaaaa-taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 538  Q
    |||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||  | | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37723773 tcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcgaatagcgatgggggcttgatgccctgtattagtaccacatgcatataagat 37723674  T
Q  539 gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  37723673 gtctaagctgcatat-tcgcatttgtcgagtcgatgatga 37723635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 8287019 - 8287203
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||| | ||| ||    
T  8287019 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacccaccacgttggagctttagctcaaattagcgatggaggcttgat 8287118  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287119 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 8287203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20910606 - 20910829
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||| || |||||||| | |||||    
T  20910606 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccctaggtactaatgagacctatttaaga 20910705  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta-ttaaatgatcaag 198  Q
    ||||| |||    || ||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||  |||| || |||| |||||    
T  20910706 tgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaag-tgattataatgtgatataatgtttta-tgcattactt-aagaattatttgaatgttcaag 20910802  T
Q  199 atgttgttgaaatg-aattgatattat 224  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  20910803 atgttgttgaattgaaattgatattat 20910829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 21997709 - 21997892
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  21997709 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacatgatggagcttgagctcaaa-tagcgatgggggctttat 21997807  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997808 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 21997892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 24529168 - 24528963
Alignment:
Q  368 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 465  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  | |||||||| || ||||||| ||  | ||||| |||     
T  24529168 ttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacttaatacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttt 24529070  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  24529069 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacatt 24528971  T
Q  562 gtcgagtc 569  Q
    ||||||||    
T  24528970 gtcgagtc 24528963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11220589 - 11220525
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11220589 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11220525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11228998 - 11228934
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11228998 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11228934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11230987 - 11230923
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11230987 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11230923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20296005 - 20295876
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  20296005 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 20295914  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20295913 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 20295876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13025233 - 13025073
Alignment:
Q  393 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13025233 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 13025135  T
Q  491 atat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    | ||   | |  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025134 aaatagcgatgagagcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 13025073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13095417 - 13095257
Alignment:
Q  393 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13095417 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 13095319  T
Q  491 atat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    | ||   | |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095318 aaatagcgatgagggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 13095257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Original strand, 23501205 - 23501332
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  23501205 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgatgtga 23501304  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
      | ||| ||||||||||||||||||||    
T  23501305 gatgatgtttaattgcattacttgaaat 23501332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226944
Alignment:
Q  125 tatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11226944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10753515 - 10753439
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10753515 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 10753439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 19472668 - 19472797
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  19472668 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 19472759  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19472760 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 19472797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 550
Target Start/End: Original strand, 22959798 - 22959898
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959798 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 22959897  T
Q  550 a 550  Q
    |    
T  22959898 a 22959898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23571883 - 23571821
Alignment:
Q  522 ccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23571883 ccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 23571821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25535036 - 25534897
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  25535036 tatgttgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatattgatatgatgat 25534938  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  25534937 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 25534897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 27989210 - 27989297
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27989210 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttaagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 27989297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 11581562 - 11581624
Alignment:
Q  490 aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581562 aatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11581624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23201606 - 23201500
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  23201606 ggtagtaatgagacctatagaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgacgtgagatgatgtttaattgcattac 23201507  T
Q  175 ttgaaat 181  Q
    |||||||    
T  23201506 ttgaaat 23201500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14047905 - 14047860
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047905 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14047860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 17517504 - 17517549
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517504 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 20918325 - 20918370
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918325 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20918370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23064332 - 23064287
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064332 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23064287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 23390812 - 23390857
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390812 atgccctgtaatggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23390857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24066974 - 24066929
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24066974 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24066929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25421331 - 25421290
Alignment:
Q  510 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421331 cctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25421290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25431199 - 25431154
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25431199 atgccctgtattggtaccacatgcatgtaagaggtctaagttgcat 25431154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31060848 - 31060803
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31060848 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31060803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38619295 - 38619250
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619295 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38619250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17410747 - 17410647
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  17410747 cgagcacttccagaactgagtgcacttgaggattttgatacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 17410648  T
Q  100 t 100  Q
    |    
T  17410647 t 17410647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 40723852 - 40723916
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  40723852 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaatattatt 40723916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 20027222 - 20027309
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20027222 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 20027309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 24221723 - 24221627
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24221723 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 24221627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 571
Target Start/End: Original strand, 33896074 - 33896128
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33896074 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgttgagtcaa 33896128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22411971 - 22411929
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22411971 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 22411929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36314348 - 36314310
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314348 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 36314310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 18319329 - 18319374
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319329 atgccctggattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 18319374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19668749 - 19668649
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19668749 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtacca-atgcatataagaggtctaagttgc 19668651  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  19668650 at 19668649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 21329820 - 21329865
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21329820 atgccctggattggtaccacatgcatataacaggtctaagttgcat 21329865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21565339 - 21565294
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565339 atgccctggattggtaccacaagcatataagaggtctaagttgcat 21565294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29329718 - 29329673
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329718 atgccctggattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcat 29329673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Original strand, 20902308 - 20902348
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902308 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 20902348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 17410299 - 17410245
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17410299 attggtaccacatgcatataagaggtataagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 17410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Original strand, 21295321 - 21295460
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21295321 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 21295419  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  21295420 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 21295460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 499 - 578
Target Start/End: Original strand, 23501619 - 23501696
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  23501619 ggggctcatgccatgaat-ggtaccacatgcatataagagttttaagttgca-tagtcgcatagttgagtcaatgatgaa 23501696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24554582 - 24554443
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  24554582 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 24554484  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  24554483 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 24554443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 20807088 - 20807126
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20807088 gtattggtactacatgcatataagaggtctaagttgcat 20807126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 24767837 - 24767882
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24767837 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 24767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26704325 - 26704251
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatga 129  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26704325 ttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 26704251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26974058 - 26973984
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatga 129  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26974058 ttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 26973984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 41095966 - 41096004
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41095966 gtattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41096004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 10776011 - 10776056
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10776011 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 10776056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 21502481 - 21502526
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21502481 atgccctggattggtaccacatgcatctaaaaggtctaagttgcat 21502526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32027177 - 32027132
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027177 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 32027132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 568
Target Start/End: Original strand, 17730685 - 17730735
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17730685 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 17730735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31342301 - 31342254
Alignment:
Q  136 aagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatat 183  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31342301 aagttgtttgtaatgtgatttaacgattaattgcattacttgaattat 31342254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 21885466 - 21885510
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21885466 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 21885510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 26172293 - 26172249
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26172293 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcatt 26172249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 392
Target Start/End: Original strand, 26742784 - 26742927
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--t 338  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||  ||        || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  26742784 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtctgaac--------taagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagt 26742875  T
Q  339 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  26742876 gataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 26742927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4036047 - 4036000
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  4036047 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 4036000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10752759 - 10752704
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10752759 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11226711 - 11226656
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11226711 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11226656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11230690 - 11230635
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11230690 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11230635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 12028835 - 12028891
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12028835 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 12028891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 15237372 - 15237427
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15237372 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15237427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16674163 - 16674078
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  16674163 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaaaatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 16674078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 19473255 - 19473310
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19473255 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19473310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20232561 - 20232476
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||||    
T  20232561 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgtttaagtccatgcattagcattcatt 20232476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 20295416 - 20295361
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20295416 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 20295361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 20911471 - 20911526
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20911471 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20911526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22756974 - 22756880
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttg-gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22756974 agtatattaatactatgattgttgagggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 22756880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Original strand, 25229683 - 25229730
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25229683 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 25229730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Original strand, 25293839 - 25293886
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25293839 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 25293886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 26666226 - 26666311
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||||    
T  26666226 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgtttaagtccatgcattagcattcatt 26666311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 26743021 - 26743072
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26743021 attgataccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 26743072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 26937823 - 26937908
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||||    
T  26937823 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgtttaagtccatgcattagcattcatt 26937908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33409239 - 33409154
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  33409239 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgatcaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 33409154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42805430 - 42805345
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  42805430 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 42805345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Original strand, 21340804 - 21340852
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21340804 tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagtct 21340852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2470
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | || || ||  | |||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||    
T  1889 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 1988  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaat-tgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | ||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  1989 tattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcattgaatgatcaag 2088  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  2089 atgttgttgaaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaataaaagat 2188  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2189 gaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtatt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 2287  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgttt 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |       
T  2288 gggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-ataag--- 2383  T
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2384 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg-tgttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 2470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 187)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 584
Target Start/End: Original strand, 18383777 - 18384305
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| |||||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  18383777 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgat 18383876  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  18383877 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattat 18383975  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383976 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 18384075  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18384076 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 18384174  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  18384175 tgttgggggtttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 18384273  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgt 584  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18384274 gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgt 18384305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11863049 - 11862519
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| || || ||||| | ||||||||||  || ||||| |||||| | |||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  11863049 ttgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgat 11862950  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || | |||||||||||||    
T  11862949 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattat 11862850  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862849 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctttacaagatgattaagatgatgttgtgctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 11862750  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11862749 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataac 11862651  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11862650 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgatgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tt 11862552  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11862551 gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 11862519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 322847 - 322318
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||   |||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  322847 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgat 322748  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||  | ||||||||||||||||||    
T  322747 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataatattgttgtgatctgattat 322649  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  322648 gccgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattatgatgatgttgaactccaaattattggatgcatatgacatgatgattaaga 322549  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  322548 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 322450  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  322449 tgttgggggcttatgccgtgaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 322351  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  322350 gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 322318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 12496513 - 12496000
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  12496513 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgat 12496415  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12496414 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtagaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgatta 12496315  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 353  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496314 tgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 12496215  T
Q  354 atgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 453  Q
    || | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12496214 at-tatttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttttactcaccatgatggagcattttctcaaaataa 12496116  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  12496115 tgttgggg-gttataccctaaaagtatattaatactataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 12496018  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | ||||||||||||||||    
T  12496017 gccgcattgtcgagtcaa 12496000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Original strand, 19725772 - 19726277
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||  | |||||||| ||||| ||||| |||| | | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  19725772 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgat 19725871  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  19725872 ttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgag-tcatgctgttgatgtgatctgattat 19725970  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19725971 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaaga 19726061  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19726062 tgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgcgggttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 19726160  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  19726161 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-tt 19726259  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19726260 gtcgcattgtcgagtcaa 19726277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 55 - 565
Target Start/End: Original strand, 11298389 - 11298900
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||| ||||||| ||| | ||| || ||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  11298389 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgat 11298487  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  11298488 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctat 11298587  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattgg--atgtatatgagatgatgatta 351  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11298588 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgatta 11298687  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298688 agatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatctgttgggggttcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 11298786  T
Q  452 aa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  11298787 aattgttgggggcttatgccctgaaagtataataatactataatgttgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggtcgca 11298886  T
Q  551 tttgtcgcattgtcg 565  Q
     |||| |||||||||    
T  11298887 -ttgttgcattgtcg 11298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172537
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattatgatgatgttgaacctccaaattattggata 12172773  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  12172772 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagctttgtactcaccacgat 12172674  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 533  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12172673 ggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatattaaaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 12172574  T
Q  534 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12172573 aagaggtctaagttgca-ttctcgcattgtcgagtcaa 12172537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 12037758 - 12038185
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  ||||||| |  |  |||| |  | || || | || ||    
T  12037758 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacctgagttgcttgaattgatttagaatggacccctgagtagcaacgtgatctatttagga 12037857  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||| | || ||||| |||| || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12037858 tgtttaatgaaatctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaaga 12037957  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12037958 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatg 12038056  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12038057 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-atatgatagagtccatgcattagcatacatttgttggg 12038155  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12038156 ggctcatgccctggagctttgtcctcacca 12038185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 856449 - 855864
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  856449 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 856350  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatga-attgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||||| ||||||   ||||| ||   |  || || ||| ||||  | ||||| |||  || ||||||||||   | |||  ||    |||    
T  856349 agttaactgcaatctgtgaagcttatatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgttta--tgtattacttgaagattaattgtatacataag 856252  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgct-gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||   || ||| | |||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  856251 atgttgttgaattgaattggtataat--tatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataaga 856154  T
Q  298 tgattaggatgatgttga-actccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  856153 tgattaagatgatgtttatcctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattaacatacatttgtt 856055  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---ta 493  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  856054 ggaggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaataa 855955  T
Q  494 tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  855954 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 855864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 95 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11851797 - 11851510
Alignment:
Q  95 taagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgat 194  Q
    |||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11851797 taagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaa 11851698  T
Q  195 caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctataca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11851697 caagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttgcatgagtctataca 11851598  T
Q  295 agatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtatta 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11851597 agatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcatta 11851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16369476 - 16369125
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16369476 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggata 16369377  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16369376 tatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggagcttatgccctggagctttgtactcaccacgat 16369278  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369277 ggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttaaggctcatgccctgcattggtaccacatgcat 16369178  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16369177 ataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 16369125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 11557190 - 11557621
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||     
T  11557190 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagg 11557289  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| |   |||    
T  11557290 tgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaattaga 11557389  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  11557390 tgttgatgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtttatacatgatg 11557489  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11557490 aataagatgttgctgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttg 11557589  T
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11557590 ggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 11557621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 1982616 - 1983047
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||||| || |||||   |||||    
T  1982616 cgagcacttccagaactgagtacatttgagaagtttgagacctgagttgtttggattggttaggaatggagccttaggtagtaatgtgacctaattaaga 1982715  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| | | |    
T  1982716 tgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagtt-attgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaactatttttgaatgacctata 1982814  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1982815 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgat 1982914  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    ||  | |||| |||||| |||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1982915 gaaaaagatgttgttgagctccaaattattaggtgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtt 1983014  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  1983015 gggggctcatgccctggagctatgtcctcacca 1983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 337 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15067656 - 15067409
Alignment:
Q  337 atgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgga 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15067656 atgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgga 15067558  T
Q  437 gcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 533  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15067557 gcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15067458  T
Q  534 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatg 583  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15067457 aagaggtctaagttgca-tagccgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg 15067409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 235 - 571
Target Start/End: Original strand, 14878557 - 14878894
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14878557 tgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggata 14878656  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  14878657 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgtagggggctcatgccctggagattagtactcaccacgat 14878755  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    ||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14878756 ggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttggaggctcatgccctatattggtaccacatgcat 14878855  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14878856 ataagaagtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 14878894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665320
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattttaaagttatactgttgat 14665471  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14665470 gtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaactccaaattattggatgtataagag 14665371  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14665370 atttgatgattaagatatttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 14665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 594
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878451
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 15878191  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15878192 aataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 15878289  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15878290 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 15878389  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15878390 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 15878451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 3389741 - 3390171
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  3389741 cgagcacttccagaactaagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 3389840  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||  | |  ||    
T  3389841 tgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaaaaaccttga 3389940  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  3389941 tgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 3390040  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3390041 gaataagatgttgttgagctccaatttagtggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac-tttgtt 3390139  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacc 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3390140 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacc 3390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15051774 - 15051367
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15051774 ttgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgat 15051675  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatatt-----atgaaattatgctgttgttgtg 244  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || ||| | |||||    |  || || || ||||  | | ||||||||     ||||  | ||  ||||||||||    
T  15051674 ttaatgattaatttcattacctgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatattcctatatgatgtcataatgttgttgtg 15051575  T
Q  245 atctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatg 344  Q
    | |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15051574 aactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatcttgaactccaaattattggatgtatatgagatg 15051475  T
Q  345 atgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15051474 atgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttggggcctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagc 15051376  T
Q  445 tcaaaataa 453  Q
    |||||||||    
T  15051375 tcaaaataa 15051367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 11594945 - 11595373
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  11594945 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 11595043  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||    
T  11595044 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 11595143  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  11595144 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 11595243  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  11595244 gaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgtt 11595340  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11595341 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 11595373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 379 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11849248 - 11849041
Alignment:
Q  379 tattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaag 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11849248 tattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaag 11849149  T
Q  478 tatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatg 576  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11849148 tatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaattgatg 11849050  T
Q  577 aatgatgtt 585  Q
    || ||||||    
T  11849049 aaagatgtt 11849041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668476
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactgttgat 14668627  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14668626 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaactccaaattattggatgtataagag 14668527  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  |||||||||| |||||||  | |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14668526 atttgatgattaaaatgtttt--gttgatagagtccatgcattaacatacatt 14668476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 3402761 - 3403191
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||  ||||||  ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  3402761 cgagcacttccagaactaagtacttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatgaaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 3402860  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || ||||||  |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| || ||| | |  ||    
T  3402861 tgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattccttgatttattcttgaataaccttga 3402960  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  3402961 tgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 3403060  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3403061 gaataagatgttgttgagctccaaattagtggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatac-tttgtt 3403159  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacc 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3403160 gggggctcatgccctggagctttgtcctcacc 3403191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 489
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053383
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgattaagataatgttgaactccaaattattggatgt 23053227  T
Q  335 atat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  23053228 atataagagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggatcatgccttggagcttagtactcaacacga 23053326  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  23053327 tggagcattagctcaaactagaaatgggggcttatgccctggaaatatattaatact 23053383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 20461306 - 20461690
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  20461306 cgagcacttccagaactgagtgcatttaaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 20461405  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20461406 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 20461504  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| ||||||||||        |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  20461505 agttgttgaagatgaattgat--------attaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 20461596  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20461597 aattaaaatgatgatgaacttcaaattattggatgtataagagatttgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20461690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 263 - 429
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196666
Alignment:
Q  263 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaa 26196599  T
Q  363 gatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26196600 gatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26196666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 235 - 602
Target Start/End: Original strand, 23077518 - 23077866
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23077518 tgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattagtggatat 23077617  T
Q  335 atatgagatgatgattaagatg-ttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  23077618 ataagagatgatgattgagatgtttttaaga-gatcgagtccattcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 23077716  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 533  Q
    ||||||||  |||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |                   | |||||||||||||||||||    
T  23077717 ggagcattatctcaaactagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa------------------cgaattggtaccacatgcatat 23077798  T
Q  534 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgcttatgttga 602  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23077799 gagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagttgagtcaatgatgaaagatgtttatgatgcttatgttga 23077866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 2897629 - 2898012
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||    
T  2897629 cgagcacttccagaacttagtgcatttgaggagtttgagacctgagttgcttagattgattaggagtggaactttaggtaatagtgaggcctatttaaga 2897728  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  2897729 tgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattactggaattattattgaatgatcaaga 2897827  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     |||| || |||| |||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  2897828 agttgatgaaaataaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagat 2897919  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2897920 aatcaagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgaagattaagatgttt---aatgatagagtccatgcattagcatacatt 2898012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 7793152 - 7793540
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttg---attaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttata 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | |||   |||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  7793152 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattta 7793251  T
Q  97 agatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatca 196  Q
    |||| |||||||  | || ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7793252 agatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttgttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 7793350  T
Q  197 agatgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctg-attatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctataca 294  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |    
T  7793351 agaagttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 7793442  T
Q  295 agatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7793443 agataattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgatgaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 7793540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23408506 - 23408187
Alignment:
Q  233 gctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattgga 331  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23408506 gctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga 23408407  T
Q  332 tgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
    |  ||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  23408406 taaataagagatgatgattttgatgttt-aaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacg 23408309  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 528  Q
    ||||||| || |||| |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23408308 atggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 23408210  T
Q  529 catataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23408209 catataagaggtctaagttgcat 23408187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 326970 - 327355
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||  ||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  326970 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 327069  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  327070 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 327168  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctga-ttatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
      |||||||| ||||||||||        |||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  327169 aattgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 327260  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  327261 taattaaattgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcatgagcatacatt 327355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325824
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  | |||||  |||| ||| || ||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttattta 271  Q
    ||||||| |||| |  ||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtttttta 42325981  T
Q  272 actaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgatt 369  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||    
T  42325980 actaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgatt 42325882  T
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42325881 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcataccctggagctttgtcctcacca 42325824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15482962 - 15482588
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| || |||||||| | |||||    
T  15482962 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactt-aggtactaatgagacctatttaaga 15482864  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15482863 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgctcaaga 15482765  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  15482764 aattgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 15482682  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15482681 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgacttgttgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 15482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060196
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgt 15060261  T
Q  335 atatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15060260 atatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 15060196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16910063 - 16909885
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| || ||||    
T  16910063 cgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaaga 16909964  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16909963 tgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattttattacttga 16909885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30066192 - 30065970
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  30066192 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 30066094  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  30066093 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 30066002  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30066001 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 421
Target Start/End: Original strand, 12852662 - 12852763
Alignment:
Q  318 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12852662 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 12852759  T
Q  418 ttgt 421  Q
    ||||    
T  12852760 ttgt 12852763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 13210504 - 13210690
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  13210504 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 13210602  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210603 gccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13210690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5223240 - 5223140
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5223240 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 5223141  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  5223140 a 5223140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12339642 - 12339542
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12339642 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 12339543  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  12339542 a 12339542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 11300317 - 11300539
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  11300317 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 11300416  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |  | | ||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11300417 tgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 11300515  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatatt 222  Q
     ||| ||| |||||||||||||||    
T  11300516 agttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11855028 - 11854757
Alignment:
Q  9 tccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaact 107  Q
    ||||||||||||||  |||||| |  ||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    
T  11855028 tccagaactgagtgtttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaact 11854929  T
Q  108 gcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg 207  Q
    |  |  | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  11854928 gttaattgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattg 11854830  T
Q  208 -aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||         ||| | ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  11854829 aaaatgaattgat--------gttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15060550 - 15060427
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15060550 ttgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgat 15060451  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15060450 ttaatgattaatttcattacttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 4589038 - 4589132
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589038 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 4589132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16369721 - 16369543
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||  ||||||||| ||  | | |||||||||| || || || |||||||    
T  16369721 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgatatgtgttgcttgaattgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatctatataaga 16369622  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    |||||||| |||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16369621 tgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttga 16369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 474 - 572
Target Start/End: Original strand, 26196700 - 26196797
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26196700 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctttattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtctcattgtcgagtcaat 26196797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 11300695 - 11300795
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11300695 gttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 11300794  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  11300795 a 11300795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15465041 - 15464941
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15465041 gttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 15464942  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  15464941 a 15464941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16796192 - 16796056
Alignment:
Q  417 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggggctcatgccctgt 514  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||      
T  16796192 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctaa 16796093  T
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796092 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16796056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14499571 - 14499405
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  14499571 gattaggaatgaaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaa-ttgtttataatgtgattt 14499473  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14499472 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 14499405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11070314 - 11070092
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |   ||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  11070314 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 11070216  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11070215 attgattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 11070124  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  11070123 ctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Original strand, 11165392 - 11165606
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | |||| |  |  |||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  11165392 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagt-gtttataatgtgattt 11165490  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11165491 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 11165582  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  11165583 ctgctattgttatttaactaagtt 11165606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19775609 - 19775515
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19775609 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55023113 - 55022899
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  55023113 gattaggaatggaactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 55023015  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||     
T  55023014 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattata 55022923  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  55022922 ctgctattgttatttaactaagtt 55022899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16909689 - 16909598
Alignment:
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16909689 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacttgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 16909598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 26190814 - 26190922
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  26190814 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcatgacctgagttgcttggattgattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatttaaga 26190913  T
Q  100 tgttaactg 108  Q
    |||||||||    
T  26190914 tgttaactg 26190922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 15849891 - 15850264
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || | ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  15849891 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtacttggattgattaggattggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 15849990  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | || | ||  |||  ||||||  ||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||  |||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  15849991 tatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaat-gattatattgtgatatatggattgattgcataacttgaattattgttgaatgatcaaga 15850089  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
      ||||  |||||||||| |||||   || |       || | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||         |    
T  15850090 aattgtgaaaatgaattgttatta---aact-------tgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagact---------g 15850170  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | || | |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15850171 aataagttgatgaagaactccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttt-tgttgatagagtccatgcattagcatacatt 15850264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16796295 - 16796195
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16796295 tataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 16796198  T
Q  434 gga 436  Q
    |||    
T  16796197 gga 16796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12399154 - 12398968
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  12399154 gagtccatgcattagcattcatt-gttggtggcttgatgccctggagcactgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 12399056  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatatgt---ttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||     | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399055 gccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12398968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14682291 - 14682140
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  14682291 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 14682192  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682191 ggcttgatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14682140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 474 - 569
Target Start/End: Original strand, 3403226 - 3403321
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3403226 aaagtatatcaatattatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 3403321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15617535 - 15617398
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  15617535 ttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 15617444  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15617443 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12173007 - 12172936
Alignment:
Q  110 aatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173007 aatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 12172936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 540
Target Start/End: Original strand, 12852797 - 12852871
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12852797 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 12852871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 31097360 - 31097642
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||  |||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  31097360 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaaga 31097459  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatga-attgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || ||||||  |||||| | ||||||| |||||||  |||||| || ||||| ||| || |||||||| |||| || ||||||||||    
T  31097460 tattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaag-tgattatgttgtgatatattgattgattccactacttgaattattgttgaatgatcaag 31097558  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    |  |||||| |||||||||| |        |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  31097559 aaattgttgaaaatgaattgtt--------attaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagtct 31097642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14670769 - 14670618
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||   | | ||    
T  14670769 atgccttggagctttgtagtcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagcatattaatactcaaatagcgatggg 14670670  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670669 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14670618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 25476596 - 25476744
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttg-ggg 502  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| || || |||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||    || |||    
T  25476596 atgccctggagctttgtactcaacaagatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggttgatgccctgtaagtatattaatactcaatagcgatgaggg 25476694  T
Q  503 ctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476695 cttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 25476744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7109859 - 7109730
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  7109859 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 7109768  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7109767 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 7109730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7113794 - 7113665
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  7113794 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 7113703  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7113702 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 7113665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22336880 - 22336751
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  22336880 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 22336789  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22336788 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 22336751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 27409592 - 27409721
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  27409592 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 27409683  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27409684 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 27409721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28949885 - 28949756
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  28949885 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 28949794  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28949793 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 28949756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964749
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 15964749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968673
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 15968673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972597
Alignment:
Q  124 ttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 15972597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16097206 - 16097119
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggct-catgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097206 atgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttcatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16097119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13442122 - 13442076
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442122 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatt 13442076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17487780 - 17487616
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17487780 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17487682  T
Q  490 --aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
      |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17487681 caaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcat 17487616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17499262 - 17499098
Alignment:
Q  392 ttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17499262 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17499164  T
Q  490 --aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
      |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17499163 caaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 17499098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18438443 - 18438294
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact-aatat-gtttggg 501  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | |||    
T  18438443 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagttttagctcaaa-tagtgaagggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatgggg 18438345  T
Q  502 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438344 gcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18438294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 585
Target Start/End: Original strand, 23053391 - 23053460
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  23053391 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcgatgatgaaagatgtt 23053460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 23083633 - 23083722
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083633 atgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23083722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 411 - 569
Target Start/End: Original strand, 40213937 - 40214098
Alignment:
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatatg----tttggggctc 505  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||     | ||||  |     
T  40213937 tggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgtgggcttg 40214035  T
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  40214036 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgtcgagtc 40214098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 4111204 - 4111280
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  4111204 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 4111280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15965123 - 15965047
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15965123 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15965047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15969047 - 15968971
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15969047 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15968971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15972971 - 15972895
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  15972971 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 15972895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 16750543 - 16750619
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  16750543 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 16750619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16909732 - 16909667
Alignment:
Q  410 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 475  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16909732 atggagctttgtactaaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 16909667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19775919 - 19775843
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  19775919 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 19775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22321825 - 22321744
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  22321825 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtatta 22321744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26683159 - 26683114
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683159 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 26683114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 37439591 - 37439667
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  37439591 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 37439667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43840737 - 43840692
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840737 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 43840692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 37439901 - 37439965
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37439901 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 37439965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 8489420 - 8489501
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatat--tattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8489420 tatactgtgatttaattattaaatgcattgctcgaaatatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatta 8489501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 538
Target Start/End: Original strand, 11557657 - 11557718
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 538  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11557657 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagag 11557718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 529
Target Start/End: Original strand, 12038212 - 12038274
Alignment:
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12038212 tgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 12038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 569
Target Start/End: Original strand, 2898108 - 2898164
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2898108 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 2898164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 4107352 - 4107428
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  4107352 tatactgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 4107428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8499339 - 8499294
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499339 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8499294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8898878 - 8898833
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898878 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8898833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10556806 - 10556761
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556806 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10556761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 10901491 - 10901536
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10901491 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10901536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13543796 - 13543751
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543796 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 13543751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14665223 - 14665167
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14665223 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14665167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14668379 - 14668323
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14668379 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14668323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15412250 - 15412205
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412250 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15412205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16283189 - 16283234
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283189 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16283234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 17447032 - 17447077
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17447032 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17447077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 20698753 - 20698798
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698753 atgccctgtattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcat 20698798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 24153500 - 24153545
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153500 atgccctgcattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24153545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27165071 - 27165026
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165071 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27165026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41123676 - 41123631
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123676 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 41123631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 46822038 - 46821993
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822038 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 46821993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 52523996 - 52524097
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523996 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 52524095  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  52524096 at 52524097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14972705 - 14972618
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc--tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||   | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972705 atgccctggaagtatattaatacttatagggatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14972618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30029742 - 30029594
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggg 501  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||  ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||   | | |||    
T  30029742 atgccctggagctttgtactcaacatgttggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttatgcc-tggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 30029645  T
Q  502 gctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029644 gcttgatgccccatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 30029594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 32307476 - 32307405
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  32307476 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 32307405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 327452 - 327506
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  327452 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 327506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 7793637 - 7793691
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7793637 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 7793691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55149026 - 55148887
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  55149026 tatgttgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 55148928  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  55148927 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 55148887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 15076316 - 15076354
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15076316 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15076354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17737009 - 17736971
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737009 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 17736971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 23053017 - 23053063
Alignment:
Q  135 taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23053017 taagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaaat 23053063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23274609 - 23274446
Alignment:
Q  393 tgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  | | ||||| | ||||||||  |||||| |||||||     
T  23274609 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgataggggcttgatgccctg-gagtataataatactc 23274511  T
Q  491 atat---gtttgggg-ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    | ||   | | ||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274510 aaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 23274446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 24341003 - 24341041
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341003 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24341041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28194509 - 28194471
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194509 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28194471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 43550867 - 43550909
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43550867 atgccctgtattggtaccacatgcatataataggtctaagttg 43550909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 606648 - 606693
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  606648 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 606693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 11425031 - 11425076
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425031 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11425076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14234276 - 14234231
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14234276 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 14234231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15467675 - 15467630
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15467675 atgccctggattggtaccacatacatataagaggtctaagttgcat 15467630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Original strand, 17525012 - 17525137
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||    
T  17525012 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 17525111  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaa 179  Q
      | | | ||||||||||||||||||    
T  17525112 gatgacgtttaattgcattacttgaa 17525137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 332
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525297
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggat 332  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattggat 17525297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 53301848 - 53301893
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301848 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 53301893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 550
Target Start/End: Original strand, 1644996 - 1645040
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1644996 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtcgaagttgca 1645040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14572406 - 14572370
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572406 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 14572370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 1983081 - 1983177
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1983081 aaagtatattaatactatgatgttggggcctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 1983177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 571
Target Start/End: Original strand, 14872290 - 14872352
Alignment:
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14872290 gccctgtattggtaccacattcatataagaagtccaagttgca-ttgtggcatagtcgagtcaa 14872352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 20461787 - 20461841
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20461787 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 20461841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24187825 - 24187686
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  24187825 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 24187727  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  24187726 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 24187686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 9512727 - 9512666
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  9512727 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 9512666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 9520702 - 9520641
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  9520702 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 9520641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 550
Target Start/End: Original strand, 12174531 - 12174617
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12174531 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtataagatgca 12174617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 37251449 - 37251491
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37251449 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttg 37251491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44494582 - 44494544
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44494582 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 44494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 576
Target Start/End: Original strand, 49668390 - 49668451
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  49668390 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 49668451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 50242638 - 50242600
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50242638 gtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 50242600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 551
Target Start/End: Original strand, 53071011 - 53071045
Alignment:
Q  517 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071011 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 53071045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 361
Target Start/End: Original strand, 1598574 - 1598630
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgtttta 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  1598574 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttta 1598630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 12120108 - 12120153
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12120108 atgctctgtattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 12120153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 16809156 - 16809207
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16809156 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 16809207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 17661198 - 17661243
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17661198 atgccctggattgttaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 17661243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20723067 - 20722910
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 332  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||  |||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  20723067 ctgttattgtgacctgactatgctgctgttgttatttaaataagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggat 20722969  T
Q  333 gtata-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | ||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  20722968 gcatattgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 20722910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 22110675 - 22110720
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22110675 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 22110720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38814395 - 38814310
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  38814395 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 38814310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 38962226 - 38962271
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38962226 atgccctggattggtaccacatgcatatagaaggtctaagttgcat 38962271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3833685 - 3833630
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  3833685 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataggttgattaagatgtttt 3833630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854493
Alignment:
Q  171 ttacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaatgaattgttatta 11854493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15482494 - 15482439
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15482494 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 15482439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Original strand, 11595409 - 11595504
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11595409 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 11595504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 42325788 - 42325693
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42325788 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 42325693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 4589450 - 4589505
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4589450 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4589505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7109268 - 7109213
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7109268 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 7109213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7113203 - 7113148
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7113203 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 7113148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11069640 - 11069585
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11069640 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11069585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14498897 - 14498842
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14498897 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 14498842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15616946 - 15616891
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15616946 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 15616891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15964516 - 15964461
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15964516 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15964461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15968440 - 15968385
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15968440 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15968385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15972364 - 15972309
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15972364 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 15972309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 16696614 - 16696567
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16696614 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 16696567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 19775139 - 19775084
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19775139 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 19775084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22321236 - 22321181
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22321236 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22321181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22336291 - 22336236
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22336291 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 22336236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 27410181 - 27410236
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27410181 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 27410236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28949294 - 28949239
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28949294 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 28949239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30029924 - 30029867
Alignment:
Q  231 atgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30029924 atgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 30029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 30065520 - 30065464
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30065520 attggtaccacatgcatataaagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 30065464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 37440174 - 37440229
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37440174 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 37440229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 55022437 - 55022382
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  55022437 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 55022382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Original strand, 11424934 - 11425014
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  11424934 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa 11425014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 14577135 - 14577171
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14577135 attggtaccacatgcatataagacgtctaagatgcat 14577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 16749960 - 16749992
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16749960 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 16749992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 16750158 - 16750190
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16750158 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 16750190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 16750356 - 16750388
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16750356 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattatt 16750388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Original strand, 46587 - 47119
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46587 ttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgat 46686  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||    
T  46687 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctat 46786  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattgg--atgtatatgagatgatgatta 351  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  46787 gctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtcattataagacgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatatatatgagatgatgatta 46886  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46887 agatgttttatga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaat 46985  T
Q  452 aatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  46986 aatgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtcgca- 47084  T
Q  552 ttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47085 ttgtttcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 47119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 123
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||  |||| ||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  649 ttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgat 550  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  549 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaagaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattat 450  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  449 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga---tgattaaga 353  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  352 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 254  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattt 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||    
T  253 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctaggggctcatgccctgaattggtaccgcatgcatataagaggtttaggttgca-tt 155  T
Q  554 gtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  154 gt-gcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 576
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1861
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||    
T  1295 cgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaatgatgagacctgagttgcttggattgactaggaatggaactttagttagtaatgtgacctatttaaga 1394  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1395 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 1494  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1495 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatg 1594  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    ||          ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1595 ata---------ttgaactccaaattattggatttatgtgagatgatgattaagatgttttagattgattgagtccatacattagcatacatttgttggg 1685  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttg 499  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  1686 ggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgg 1785  T
Q  500 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1786 gggctcatgccctgaattggtaccacatgcatatatgaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaatgatg 1861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 73 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42370
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg---aaatgaattgatattatgaagttaa--tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 42666  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42665 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga---tgattaagatgtttt-agatgattgag 42570  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa--tgttggggccttatgcc 470  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  42569 tccatgcattagcatacatttgttgggggatcatgccctggaggtttgtactcaccacgatggagtatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgcc 42470  T
Q  471 ctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtca 570  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  42469 ctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattatcgagtca 42371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 421
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25048
Alignment:
Q  320 caaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagcttt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24949 caaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccttgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 25046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 466 - 536
Target Start/End: Original strand, 25082 - 25152
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataag 536  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25082 atgccctaaaagtatattaatactatgatgtttggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataag 25152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 38599 - 38644
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38599 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctacgttgcat 38644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 5841 - 5335
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5841 ttgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgat 5743  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5742 taaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatg-aactatgctgttgttgtgatctgatta 5644  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga-ttaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgatta 351  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||       
T  5643 tgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttga--- 5547  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||      
T  5546 -------ttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaata 5454  T
Q  452 aatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  5453 attgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca- 5355  T
Q  552 ttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5354 ttgtcgcattgtcgagtcaa 5335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7036 - 6530
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7036 ttgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgat 6938  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6937 taaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatg-aactatgctgttgttgtgatctgatta 6839  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatga-ttaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgatta 351  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||       
T  6838 tgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttga--- 6742  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||      
T  6741 -------ttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaata 6649  T
Q  452 aatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  6648 attgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca- 6550  T
Q  552 ttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6549 ttgtcgcattgtcgagtcaa 6530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12559 - 12514
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12559 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 12514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 621
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||  |||||||||| || |||||||||    
T  1152 ttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgat 1054  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1053 ttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 954  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgatta 351  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  953 gctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtgtatgagatgatgatta 854  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  853 agatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 755  T
Q  452 aat-gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  754 aattgttggggg-ttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctaaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca 656  T
Q  551 tttgtcgcattgtcgag-tcaatgatgaatgatgtt 585  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  655 -ttgtcgcattgtcgagttaaatgatgaaagatgtt 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 55 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 416 - 1
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||   |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  416 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgat 317  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  316 ttaatgactaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgatta 217  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 353  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  216 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 117  T
Q  354 atgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116 atgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataa 17  T
Q  454 tgttggggccttatgc 469  Q
    ||| |||| |||||||    
T  16 tgtagggggcttatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Original strand, 19097 - 19664
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19097 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 19196  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  19197 tgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaga 19296  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgat-attatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||||| | ||  |||||||||||||       
T  19297 tgttgttgaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatttgcttgtgctgttattgttatttaactatgatggatgagtctatacaa--- 19393  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgtt--ttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttg 394  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  19394 ------gatgatgttgaactccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatg 19487  T
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaata 493  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19488 ttgggggctcatgccctagagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaac 19587  T
Q  494 tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19588 tgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 19664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2102 - 1541
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2102 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgccccgagttgattgaatttattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 2003  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||| || ||| | ||| || ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  2002 tgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataacga 1904  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1903 tgttattgaaatgaattgtggttatgaacttataatgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatgaggctatacaagatg 1804  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    ||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1803 at---------gttgaactccaaattattagatgtatatgagatgatgattaggatgtttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 1713  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgttt 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  1712 gggctcatgccctggagctttgtcctcaccatgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 1613  T
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  1612 ggcgctcatgccatgaattgataccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattttcgagtcaa 1541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 73 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1571
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    ||||| |||| || ||||| | |||||||||||| | ||||| |||| | ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2067 ttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 1969  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  1968 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaa 1869  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  1868 ctaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagttt-agatgattgag 1770  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccc 471  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  1769 tctatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccc 1670  T
Q  472 tgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1669 taaaagtatagtaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgtattgtcgagtcaa 1571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 73 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 9749 - 9254
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    ||||| |||| || ||||| | |||||||||||| | ||||| |||| | ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9749 ttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 9651  T
Q  173 acttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9650 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgag-ttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaa 9552  T
Q  273 ctaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9551 ctaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagttt-agatgattgag 9453  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccc 471  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9452 tctatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccc 9353  T
Q  472 tgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  9352 taaaagtatagtaatactataatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgtattgtcgagtcaa 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 55 - 571
Target Start/End: Original strand, 6276 - 6780
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| |||||| ||| || |||||||||    
T  6276 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgat 6374  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  6375 ttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctat 6474  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6475 gctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcattataagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatatgagataatgattaaga 6565  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6566 tgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctagagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 6664  T
Q  455 gttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttg 554  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  6665 gttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactataatgccgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttg 6763  T
Q  555 tcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||    
T  6764 tcgcattgtcgagtcaa 6780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14091
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 14091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 152 - 552
Target Start/End: Original strand, 73725 - 74124
Alignment:
Q  152 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgatta 351  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaaatccaaattattggatgtatatgagatgatgatta 73923  T
Q  352 agatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  73924 agatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactaaccacgatggagcatttgctcaaaat 74022  T
Q  452 aa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  74023 aattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatacaataatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca 74122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44442 - 44355
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44442 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 44355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 78163 - 78076
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  78163 atgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 78076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1315
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  1749 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgat 1650  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  1649 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaatgaattgatatgatgaagt-ataaagttgttgtgatctgattat 1551  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1550 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaggtgatgattaaga 1451  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa- 453  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||     
T  1450 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatagagcattttctcaaaataat 1352  T
Q  454 tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351 tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 30550 - 30977
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  30550 cgagcacttacagaactgagtgcatttgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagttgtgagacctatttaaga 30649  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| | |||  ||| |||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30650 tgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataaaga 30748  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||    
T  30749 tgtagttgaaatgaattgttgttatgaagt-ataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatg 30847  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30848 aataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 30947  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30948 ggctcatgccctggagctttgtcctcacca 30977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 572
Target Start/End: Original strand, 34148 - 34220
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34148 ggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatatgagagatttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaat 34220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1705 - 1654
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1705 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 15023 - 15068
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15023 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 87 - 594
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16749
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta 185  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  |||||||||| | ||||||    
T  16241 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaagatatta 16339  T
Q  186 ttaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga 285  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16340 ttgaatgattaagatgttgttgaaattaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16439  T
Q  286 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattag 384  Q
    ||| ||| |||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  16440 gtcaatataagatgaacaatatgatgttgaatctctaaattattggatacataagagatgatgattatgacgttttaaga-gatcgagtccatgcattag 16538  T
Q  385 catacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatatta 484  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16539 catacatatgttgggggatcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatta 16638  T
Q  485 atactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatga 581  Q
    ||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16639 atactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaatgatgaatga 16737  T
Q  582 tgtttaagatgct 594  Q
    || ||||||||||    
T  16738 tg-ttaagatgct 16749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 7)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 413856 - 414284
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  || || | |||||||    
T  413856 cgagcacttccagaactgaatgtaattgagaatgttatgacctgagttgcttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaaagaaacatatataaga 413955  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  413956 tgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctaga 414055  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  414056 tgttgttgaaacgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgcgtctatacatgatg 414155  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttggg 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  414156 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaaatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatacttttgttggg 414254  T
Q  400 ggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  414255 ggctcatgccctggagctttgtcctcacca 414284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 71238 - 71138
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71238 gttatgaactgttaagttgtttgtaatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 71139  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  71138 a 71138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 71613 - 71454
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  71613 cgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 71514  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatg 160  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  71513 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 71454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 414318 - 414415
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  414318 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggcaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 414415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 544
Target Start/End: Original strand, 340122 - 340299
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| || |||||||| || ||| |||||   | ||||| ||| ||    
T  340122 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagct-aaaattgcgatgggggcttgat 340220  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340221 gccctggaagtatattaatactaatagcgatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatataagaggtctaa 340299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 100901 - 100849
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100901 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtc 100849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 139722 - 139637
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  139722 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 139637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 55 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44336 - 43964
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||  || | || |||||||||| || |||||||||    
T  44336 ttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgat 44238  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44237 ttaatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 44138  T
Q  255 gttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 354  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44137 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactctaaattattggatgtatatgagatgatgattaaga 44038  T
Q  355 tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44037 tgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcacca 43964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7757 - 7355
Alignment:
Q  26 ttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgt 124  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||    
T  7757 ttgagaatgttatgacctgagttgcttagattggttaggaatggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgt 7658  T
Q  125 tatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattat 224  Q
    || ||| || ||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7657 taagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaatgaattgttgttat 7558  T
Q  225 gaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaat 324  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7557 gaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatgttgaactccaaat 7458  T
Q  325 tattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtact 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  7457 tattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt-agatgatagagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctagagctttgtcct 7360  T
Q  425 cacca 429  Q
    |||||    
T  7359 cacca 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 585
Target Start/End: Original strand, 9599 - 9654
Alignment:
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9599 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 9654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7321 - 7224
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7321 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttatatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 7224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 76 - 585
Target Start/End: Original strand, 38360 - 38872
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||  ||||||||    
T  38360 ggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattac 38458  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaac 273  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  38459 ttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaac 38558  T
Q  274 taagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgag 372  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38559 taagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatttataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgag 38657  T
Q  373 tccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccct 472  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||    
T  38658 tccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgattgagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccct 38757  T
Q  473 gaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtca 570  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  38758 agaagtatattaatactcaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgca-ttgtcacattgtcgagtca 38856  T
Q  571 a-tgatgaatgatgtt 585  Q
    | ||||||| ||||||    
T  38857 agtgatgaaggatgtt 38872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 119820 - 119646
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  119820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 119722  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 539  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119721 gccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagagg 119646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 40417 - 40462
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40417 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 40462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 100204 - 100103
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100204 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcctgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 100105  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  100104 at 100103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 551
Target Start/End: Original strand, 17997 - 18040
Alignment:
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997 gccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Original strand, 23578 - 23695
Alignment:
Q  107 tgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgt 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||  |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  23578 tgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgt 23676  T
Q  206 tgaaatg-aattgatatta 223  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23677 tgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44238 - 44193
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44238 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 44193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 101336 - 101265
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  101336 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaggatga 101265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 21611 - 22197
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  21611 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 21710  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  || |   ||||||||  ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  21711 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 21808  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  21809 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataaga 21906  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttgt 395  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21907 tgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagcccatgcattagcattacatttgt 22005  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---t 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||        
T  22006 tgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaata 22105  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22106 atgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatatacgaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 22197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 585
Target Start/End: Original strand, 29503 - 30089
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  29503 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 29602  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||  || |   ||||||||  ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  29603 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 29700  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  29701 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataaga 29798  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcat-acatttgt 395  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29799 tgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagcccatgcattagcattacatttgt 29897  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---t 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||        
T  29898 tgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaata 29997  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29998 atgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatatacgaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 30089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 76 - 585
Target Start/End: Original strand, 34791 - 35311
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 175  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  176 tgaaatattattaaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgt 265  Q
    |||||| ||| | |||||    |  || || || ||||  | | |||||||     |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtgataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgt 34990  T
Q  266 tatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagat 365  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  34991 tatttaactatgatgcatgagtctatataaaatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga- 35089  T
Q  366 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt 465  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  35090 gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataacgatgggggctt 35188  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattg 562  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35189 atgccctggaagtatattaatactcaaataacaatgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcattg 35287  T
Q  563 tcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    
T  35288 tcgagtcaaatgatgaaagatgtt 35311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 75749 - 75694
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    
T  75749 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt 75694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 422337 - 422767
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||   |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||    
T  422337 cgagcacttccagaacagagtgcttttgaggatgtaatgatctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 422436  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||  ||||| |||||  |||| ||| |  ||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  422437 tgttaactagaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctaga 422536  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  422537 tgttgttgaaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatg 422636  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgg 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  422637 attaagatgatgttgaactccaaattattggatgtaaatgagatgatgattaagatggttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgg 422736  T
Q  399 gggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  422737 gggcttatgccctggagctttgtcctcacca 422767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 173590 - 173217
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |  ||||    
T  173590 cgagcacttccataactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaaagagacctattaaaga 173491  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  173490 tattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagt-gattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaattattattgaatgataaaga 173392  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||| |||||||||| ||||| |           ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||         |    
T  173391 aattgttgaaaatgaattgttattaag----------cttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc---------t 173311  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  173310 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 173217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 499 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 204693 - 204600
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  204693 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca-ctgtcgcatagtcgagtcaataatgaaagatg-ttaagatgct 204600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 422802 - 422898
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  422802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccagatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 422898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 160482 - 160437
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160482 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 160437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 500898 - 500853
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  500898 atgccccgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 500853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 236 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2589
Alignment:
Q  236 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 335  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatata 2808  T
Q  336 tatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2807 tatgagatgatgattaagatgttttaag-tgattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccacgatgg 2709  T
Q  436 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2708 agctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 2609  T
Q  533 taagaggtctaagttgcatt 552  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2608 taagaggtctaagttgcatt 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 236 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6255
Alignment:
Q  236 gttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgta 335  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatata 6474  T
Q  336 tatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatgg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6473 tatgagatgatgattaagatgttttaag-ggattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatgg 6375  T
Q  436 agcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6374 agctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatacaaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 6275  T
Q  533 taagaggtctaagttgcatt 552  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6274 taagaggtctaagttgcatt 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 2972
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3080 ttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 2981  T
Q  173 acttgaaat 181  Q
    |||||||||    
T  2980 acttgaaat 2972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6746 - 6638
Alignment:
Q  73 ttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 172  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746 ttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 6647  T
Q  173 acttgaaat 181  Q
    |||||||||    
T  6646 acttgaaat 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 60 - 571
Target Start/End: Original strand, 15075 - 15588
Alignment:
Q  60 taggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaat 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||   ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  15075 taggaatggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaat 15174  T
Q  160 gattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttg 258  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| || ||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  15175 gattaaatgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatg 15274  T
Q  259 ctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgt 357  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||      
T  15275 cttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattg 15374  T
Q  358 tttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 456  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||    
T  15375 ttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgt 15474  T
Q  457 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgt 555  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||    
T  15475 tgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaattgttgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgt 15572  T
Q  556 cgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||    
T  15573 cgcattgtcgagtcaa 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 60 - 571
Target Start/End: Original strand, 19597 - 20110
Alignment:
Q  60 taggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaat 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||   ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  19597 taggaatggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaat 19696  T
Q  160 gattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttg 258  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| || ||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  19697 gattaaatgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctg 19796  T
Q  259 ctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgt 357  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||      
T  19797 cttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattg 19896  T
Q  358 tttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgt 456  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||  | |||    
T  19897 ttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgt 19996  T
Q  457 tggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgt 555  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||    
T  19997 tgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaaattgttgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgt 20094  T
Q  556 cgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||    
T  20095 cgcattgtcgagtcaa 20110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 334 - 585
Target Start/End: Original strand, 193117 - 193369
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  193117 tataagagatgatgattaagatgctttaaca-gttagagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgat 193215  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  193216 ggagctttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataatgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgca 193315  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  193316 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 193369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 535 - 171
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |           
T  535 ttgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca------- 443  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
        ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  442 ----tgaataattgcattactttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgatta 347  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 353  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346 tgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaag 247  T
Q  354 atgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  246 atgttttaagatgaaagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 37
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 aaagtatattaatactaaattgttaggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 3642 - 3687
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 305 - 571
Target Start/End: Original strand, 21635 - 21900
Alignment:
Q  305 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21635 gatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 21733  T
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggc 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21734 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgggggc 21833  T
Q  504 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21834 tcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 21900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 21429 - 21629
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgat 154  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| | |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  21429 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgat 21528  T
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21529 ttaatgattaattgtattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattat 21628  T
Q  255 g 255  Q
    |    
T  21629 g 21629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 80619 - 80713
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  80619 gttatgaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 80713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 576
Target Start/End: Original strand, 22937 - 23063
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22937 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagagatctaagttgc 23036  T
Q  550 atttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  23037 a-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 23063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 98 - 368
Target Start/End: Original strand, 6212 - 6482
Alignment:
Q  98 gatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa 197  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6212 gatgttaaatgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaa 6311  T
Q  198 gatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6312 gaagttgttgaaatgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaaga 6411  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6412 tgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 6482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 585
Target Start/End: Original strand, 4697 - 5199
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta 185  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||  |  ||||||| | ||||||    
T  4697 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtatattacttaagatatta 4794  T
Q  186 ttaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttg 284  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  4795 ttgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatg 4894  T
Q  285 agtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtat 381  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  4895 agtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcaa 4993  T
Q  382 tagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtata 481  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4994 tagcatagatatgttgggggcttatgccctaaagcttagtactcaacatgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtata 5093  T
Q  482 ttaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaa 578  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5094 ttaatactcaataatgatgggggctcataccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatcgtcgagtcaaatgatgaa 5192  T
Q  579 tgatgtt 585  Q
     ||||||    
T  5193 agatgtt 5199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 334 - 585
Target Start/End: Original strand, 7269 - 7520
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  7269 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtaatcaccacgat 7368  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7369 ggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtttattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatat 7468  T
Q  534 aagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc-aatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7469 aagaggtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaaatgatgaaagatgtt 7520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6883 - 7061
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | || || ||  ||||||||| ||||  | |||||||||| || ||||| |||||||    
T  6883 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataaga 6982  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6983 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 338
Target Start/End: Original strand, 7128 - 7231
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgt 334  Q
    |||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7128 tgttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaattccaaattattggatat 7227  T
Q  335 atat 338  Q
    ||||    
T  7228 atat 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Original strand, 7076 - 7617
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  || || | | |||    
T  7076 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtaacctgagttgtttggattgtttaggaatggaactttaggtagtattatgatctatgtgaga 7175  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  |||| ||| || ||||||||  | |||  || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||| |    ||    
T  7176 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataactttga 7274  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  7275 tgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 7374  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
     | || |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  7375 taataagatgttgttgagctcaaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattaatatgtt 7474  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgt 496  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7475 gggggctcatgccctgaagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgt 7574  T
Q  497 ttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7575 tgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatataagaggt 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 257 - 585
Target Start/End: Original strand, 280953 - 281288
Alignment:
Q  257 tgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatg-------agatgatgat 349  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||||||    
T  280953 tgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatatatatatatatatgatgat 281052  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  281053 taagatgttttaaga--attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaa 281150  T
Q  450 ataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---tatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  281151 ataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 281250  T
Q  547 tgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  281251 tgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgatgtt 281288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2673
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | |||    
T  2241 cgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaacctatcttaga 2340  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa-g 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| || ||| |||   |    
T  2341 tgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaataatccttg 2440  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  2441 atgttgttgaattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtctatacatgat 2540  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2541 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtt 2640  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2641 gggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 2673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10533
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | |||    
T  10101 cgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaacctatcttaga 10200  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaa-g 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| || ||| |||   |    
T  10201 tgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaataatccttg 10300  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  10301 atgttgttgaattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtctatacatgat 10400  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10401 gaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgtt 10500  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10501 gggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 571
Target Start/End: Original strand, 10566 - 10662
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10566 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtctagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 10662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 543
Target Start/End: Original strand, 2706 - 2773
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta 543  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2706 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtcta 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2190 - 1637
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||   | ||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2190 cgagcacttcgagaactgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 2091  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||||| |||||| | |||||  || |   ||||  ||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||  || |||  ||    |||    
T  2090 agttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagaataattgtatacataag 1993  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  1992 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataaga 1895  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1894 tgattaagatgatgttgaacctccaaaatattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtt 1796  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---t 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||        
T  1795 gggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaaaata 1696  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1695 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaggggtctaagttgcat 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 18461 - 18821
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    | |||||||   |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18461 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 18560  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18561 agttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaaga 18660  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc--tatacaaga 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  18661 tgttgttgaaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataaga 18760  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattgg--atgtatatgagatgatgattaagatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  18761 tgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatatatgagataatgattaagatg 18821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 297 - 551
Target Start/End: Original strand, 18810 - 19073
Alignment:
Q  297 atgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat--------gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcata 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18810 atgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcata 18908  T
Q  389 catttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatac 488  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18909 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatggggtcttatgccctgaaagtatattaatac 19008  T
Q  489 t--aatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19009 taaaatatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 458 - 571
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16852
Alignment:
Q  458 ggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcg 557  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  16740 gggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataaaaggtttaggttgca-ttgtcg 16838  T
Q  558 cattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||    
T  16839 cattgtcgagtcaa 16852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 20128 - 20173
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20128 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 20173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39823 - 39679
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  39823 atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggagcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 39725  T
Q  501 ggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 545  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39724 ggcttgatgccctctattggtactacatgcatataagaggtctaag 39679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 164 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33695 - 33298
Alignment:
Q  164 aattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgata-ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctac 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||     
T  33695 aattgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttgaaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttat 33596  T
Q  263 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgtt--t 359  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  |    
T  33595 tgttatttaactatgatggatgagtctatacaagatgat---------gttgaactccaaattattggatgtatattgagatgttttttaagatgttgat 33505  T
Q  360 taagatgattgagtccatgtattagcata-catttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gtt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||    
T  33504 taagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttgcgggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgtt 33405  T
Q  458 ggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcg 557  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  33404 gggggcttatgccctgaatgtatattaatactaaactgtcgggggctcatgccctgaattcgtaccacatgcatataagaggtttaggttgca-ttgtcg 33306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 70055 - 69511
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||| ||| ||||||    
T  70055 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtga 69956  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatct 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| ||   | | |||||||     | |||  | || |||||||||| ||||    
T  69955 tataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatct 69857  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  69856 gcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg 69757  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  69756 attatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctca 69659  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69658 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaa 69559  T
Q  545 gttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  69558 gttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 69511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10390 - 10588
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||  ||||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| | |||||    
T  10390 cgagcacttcaagaaatgagtgcatttaagaattttgagacctgagttgcttggattgataaggaaaagaactttaagtactaatgagacctatttaaga 10489  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10490 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 10588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 60835 - 60964
Alignment:
Q  262 ctgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttt 359  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  60835 ctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttt 60933  T
Q  360 taagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  60934 t--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 60964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 235 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 5811
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 6072  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  6071 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 5973  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5972 ggagctttagctcaaattagcgatgggagcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggcttatgtcctgaattggtaccacatgca 5873  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5872 tataagaggtctaagttgca-ttgttgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7604 - 7053
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| | |  |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  7604 cgagcacttccaaaactgagtgcaagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 7505  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     ||||||||||||||||||| | | |||||  || |   ||||| ||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  7504 agttaactgcaatctatgaaactgatatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 7407  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||  ||| || |  || ||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||||    
T  7406 atgttgatgaattgaatttgtataattatcatgat--tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaaga 7309  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7308 tgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgtt 7210  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaa---ta 493  Q
      ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    |    
T  7209 ttgggttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataa 7111  T
Q  494 tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7110 tgttgggggctcataccctgaattggtgccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 551
Target Start/End: Original strand, 15641 - 15827
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 467  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  15641 agtccatgcattaacattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 15739  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15740 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacattcatataagaggtctaagttgcat 15827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 530
Target Start/End: Original strand, 13969 - 14425
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattat 186  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  13969 gacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaa 14068  T
Q  187 taaatga----tcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaa 276  Q
    | |||||    |  || || || ||||  | | |||||||     |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||     
T  14069 tgaatgaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactat 14168  T
Q  277 gttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtc 374  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14169 gatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtc 14267  T
Q  375 catgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctga 474  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||     
T  14268 catgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataacgatgggggcttatgccctgg 14366  T
Q  475 aagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||||||||||||| | ||   | | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14367 aagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccatatgca 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 577
Target Start/End: Original strand, 17394 - 17607
Alignment:
Q  368 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt- 465  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| |||     
T  17394 ttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggaggtttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttg 17492  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  17493 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacatt 17591  T
Q  562 gtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||||| |||||    
T  17592 gtcgagtcaaagatga 17607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 3469
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtga-ctggagttgcttgcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| | | || |  ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| |||||||    
T  4055 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgta-tcgcatatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataaga 3957  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||  ||    
T  3956 tattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaataagtgattgag 3857  T
Q  199 atgttg--ttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaa 295  Q
    ||||||  || |  ||| || | |||  |||  | || |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  |||    |||  ||| ||    
T  3856 atgttgcttttatttgatatcgttatg-tgatgtcatactgttgttgcaatctgtctatgctgctattgttaattaactattttgtacaagttgatataa 3758  T
Q  296 gatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttg 394  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||    
T  3757 gatgatcaagatgattctgaacctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagtatacatatg 3659  T
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat 494  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  3658 ttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaat 3559  T
Q  495 ---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 582  Q
       | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3558 aacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgat 3469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 8486 - 7900
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtga-ctggagttgcttgcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| | | || |  ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| |||||||    
T  8486 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgta-tcgcatatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataaga 8388  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||  ||    
T  8387 tattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaataagtgattgag 8288  T
Q  199 atgttg--ttgaaatga-attgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaa 295  Q
    ||||||  || |  ||| || | |||  |||  | || |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  |||    |||  ||| ||    
T  8287 atgttgcttttatttgatatcgttatg-tgatgtcatactgttgttgcaatctgtctatgctgctattgttaattaactattttgtacaagttgatataa 8189  T
Q  296 gatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttg 394  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||    
T  8188 gatgatcaagatgattctgaacctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagtatacatatg 8090  T
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat 494  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  8089 ttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaat 7990  T
Q  495 ---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 582  Q
       | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7989 aacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatggtcgagtcaatgatgaatgat 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 235 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23417
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggata 23656  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  23655 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 23557  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    | ||| ||| |||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23556 gtagctttttctcaaattatcgatgggggcttattccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 23457  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23456 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 23417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 235 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 38841
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggata 39080  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  39079 cataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgat 38981  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 531  Q
    | |||||| ||||||| ||  |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38980 gcagcattagctcaaattagcgaagggggcttataccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcat 38881  T
Q  532 ataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38880 ataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 38841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14401
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgtt-gaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatgtttgaacctccaaattatttgat 14641  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  14640 acataagggatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 14542  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    || |||||| ||||||| ||  |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14541 tgtagcattagctcaaattagcgaagggggcttattccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 14442  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaat 572  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14441 tataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaat 14401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14910 - 14804
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |  | ||| |||||||||||||    
T  14910 ggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattac 14811  T
Q  175 ttgaaat 181  Q
    |||||||    
T  14810 ttgaaat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23925 - 23819
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |  | ||| |||||||||||||    
T  23925 ggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattac 23826  T
Q  175 ttgaaat 181  Q
    |||||||    
T  23825 ttgaaat 23819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39349 - 39243
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| |||| |  | ||| |||||||||||||    
T  39349 ggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattac 39250  T
Q  175 ttgaaat 181  Q
    |||||||    
T  39249 ttgaaat 39243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 235 - 585
Target Start/End: Original strand, 9004 - 9355
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9004 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 9103  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  9104 aataagagatgatgattatgatgttt-aagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 9201  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat--atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    |||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9202 ggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattaacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 9301  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9302 tataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgcatgatgtt 9355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1621
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1576 atgccctgaattggtaccacatgcatataggaggtctaagttgcat 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 66221 - 66605
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  66221 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 66320  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  66321 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 66419  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  66420 agttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 66511  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  66512 aattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 66605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 268 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 68921 - 68616
Alignment:
Q  268 tttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat- 365  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  68921 tttaantaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgtcgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatt 68822  T
Q  366 gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  68821 gattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt 68722  T
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||    
T  68721 atgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgt 68624  T
Q  564 cgagtcaa 571  Q
    ||||||||    
T  68623 cgagtcaa 68616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 66702 - 66756
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  66702 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 66756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 7)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53865 - 53481
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  53865 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 53766  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  53765 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 53667  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
     ||||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  53666 agttgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 53575  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  53574 aattaaaatgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 53481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 585
Target Start/End: Original strand, 65838 - 66189
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||   || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 65937  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||    
T  65938 aaataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgaactcaacacga 66035  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || |||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  66036 tggagctttagctc-aaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggctcatgccctgaaatggtaccacatgc 66134  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  66135 ataaaagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatgtt 66189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 36351 - 36415
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36351 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 36415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 36041 - 36117
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  36041 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 36117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 53384 - 53330
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53384 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 53330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 128697 - 128509
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  128697 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgat 128599  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatatgt---ttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgc--atataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||     | ||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  128598 gcccttgaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccgcatgcatatataagaggtctaagttgcat 128509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 36648 - 36703
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36648 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 36703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4465
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  4030 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacttgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 4129  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  || | |||| | ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||    
T  4130 tgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 4229  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaa-ttgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
     |||||||||| |||| ||| | ||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  4230 agttgttgaaaatgaaattgttgttatcgaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataaga 4329  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  4330 tgaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatac--ttgt 4426  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatg 434  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  4427 tgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgatg 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1457
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1419 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 4473 - 4529
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4473 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 8)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13072 - 12550
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  13072 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 12973  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
     |||||||||||| | ||||||   |||||  || |  |||||||||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||   | |||  ||    |||    
T  12972 agttaactgcaatttgtgaagctaatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataag 12875  T
Q  199 atgttgttgaaatgaattgatattatgaa-attatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| || |  || ||  |||||||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12874 atgttgatgaattgaattggtataattatcatgat--tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataaga 12777  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat--gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgt 395  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12776 tgattaagatgatgttaaattccaaatcgttggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgt 12678  T
Q  396 tgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aat- 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||  |||     
T  12677 tgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagtgatgggggcttacgctctggaagtatactaatactcaaata 12578  T
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggt 520  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12577 atgttgggggctcatgccctgaattggt 12550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 80955 - 80790
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | |||||| ||  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  80955 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 80857  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    | | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  80856 attaattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagatgttgaaatgaattgttatta 80790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 65476 - 65613
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  65476 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 65567  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  65568 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 80556 - 80462
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattg 217  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80556 gttatgaactactaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttaaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 61560 - 61697
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |    
T  61560 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgat 61651  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  61652 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 515 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10454
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10523 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 10454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11139 - 11101
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 66061 - 66116
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  66061 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 66116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 252 - 594
Target Start/End: Original strand, 10580 - 10918
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  10580 tatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat-attggataaataagagatgatgatt 10678  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||     
T  10679 atgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattaggatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaat 10776  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777 taa---tgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 10873  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10874 gca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 10918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 594
Target Start/End: Original strand, 15529 - 16078
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||    
T  15529 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 15628  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatc 247  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||| || |||     | |||||||     |||||  | ||  ||||||||| |||    
T  15629 gataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttatatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatc 15728  T
Q  248 tgatta----tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgaga 342  Q
    ||  ||    || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||    
T  15729 tgcgtagctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga 15828  T
Q  343 tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcattt 442  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||     
T  15829 tgatgattatgatgttt-aaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgcgggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcatta 15926  T
Q  443 gctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
     |||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15927 actcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgatgggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatataggaggt 16026  T
Q  541 ctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16027 ctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 16078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 594
Target Start/End: Original strand, 7858 - 8216
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaact-ccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7858 tgttgttgtaatctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggata 7957  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  7958 aataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgat 8055  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8056 ggagcattagctcaaattagtgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccct-aaatggtaccacatgca 8154  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8155 tataagaggtttaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10240
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattataaagttatactattgat 10089  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgag 341  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10090 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatgaactccaaattattggatgtataagag 10189  T
Q  342 a--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |  ||||||||||||||||||  | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  10190 atttgatgattaagatgtttt--gttgatagaatccatgcattagcatacatt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 10334 - 10379
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10334 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatt 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18313 - 17953
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18313 ctgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat 18214  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||    
T  18213 aaataagagatgatgattatgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagcttagtactgaacacga 18116  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aat--atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18115 tggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattattgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 18016  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18015 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatg-ttaagatgct 17953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18370
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  18499 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtga 18400  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatat 183  Q
      | | | |||||||||||||||||| |||    
T  18399 gattacgtttaattgcattacttgaattat 18370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 77448 - 77500
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtc 569  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  77448 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgttgcattgtcgagtc 77500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 582
Target Start/End: Original strand, 18494 - 18844
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggat 332  Q
    |||||||||  |||||  |||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||    
T  18494 ctgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgataaagaagatgttgaacctccaaattattggat 18593  T
Q  333 gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
      ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||    
T  18594 acataagagatgaagattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 18692  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgc 529  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18693 tggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaaatggtaacacatgc 18792  T
Q  530 atataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgat 582  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18793 atataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgat 18844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 178
Target Start/End: Original strand, 18334 - 18437
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  18334 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattac 18433  T
Q  175 ttga 178  Q
    ||||    
T  18434 ttga 18437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8871 - 8443
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||  ||| ||||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  8871 cgagcatttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattggttaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaaga 8773  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||    
T  8772 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 8673  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  8672 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagat 8573  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaaga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgtt 396  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  8572 gaata-gatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattcattgagtccatgcattagcatac--ttgtt 8476  T
Q  397 gggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8475 gggggctcatgccctggagctttttcctcacca 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 8407 - 8312
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8407 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 24082 - 23562
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||  || ||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  24082 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatg-ttaatttcattac 23984  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatg-----ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatt 269  Q
    ||||| ||| | | ||||||  |||||||| ||   | | |||||||| | | || |||     |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||    
T  23983 ttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgtttt-atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatt 23885  T
Q  270 taactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgat 368  Q
    |||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  23884 taaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gat 23787  T
Q  369 tgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||  |||| || ||||| ||||||    
T  23786 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaacacgatagagctttagctc--aatagtgatgggggcttatg 23689  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcg 565  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||   | | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  23688 ccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggagctcatgccccgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtctcatagtcg 23590  T
Q  566 agtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23589 agtcaatgatgaaagatg-ttaagatgct 23562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1056
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatg 333  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1415 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 1316  T
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
     ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || |||    
T  1315 aataagagatgatgattttgat-ttttaagat-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgttctggagctttgtactcaacacgat 1218  T
Q  434 ggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgca 530  Q
    ||||| || ||||||| ||  | ||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1217 ggagctttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgca 1118  T
Q  531 tataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgct 594  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  1117 taaaagaggtctaagttgca-tagtcacatagtcgagtcaatgacgaaagatg-ttaagatgct 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1599 - 1470
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| |  || ||  ||||| ||| ||||||    
T  1599 ttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttaaatgcaatctacgaagctgttattagatgttagtgttgaatatgatgtga 1500  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatat 183  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1499 tataatgattaattgcattacttgaattat 1470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15481 - 15443
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20242 - 19739
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||  || ||  ||||| ||| ||||||    
T  20242 ttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtga 20143  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatg-----ctgttgttgtgatct 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||| || |    | | |||||||| | | || |||     |||||||||| ||||    
T  20142 tataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgttttatttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatct 20043  T
Q  249 gattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatg 347  Q
    |  |||| | ||| ||||||||||  ||| ||| ||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  20042 gcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagataatg 19943  T
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 447  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| || |||||    
T  19942 attatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagttttgtactcaacacgatggagctttagctca 19845  T
Q  448 aaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaa 544  Q
    |  ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 at-tagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaa 19746  T
Q  545 gttgcat 551  Q
    |||||||    
T  19745 gttgcat 19739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38271 - 38182
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  38271 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 38182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 403
Target Start/End: Original strand, 192123 - 192528
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgctt-gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  || || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||    
T  192123 gagcacttccagaattgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgatttgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagat 192222  T
Q  101 gttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagat 200  Q
    ||||||||  |||| |||||  ||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  |||    
T  192223 gttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaattaccttgat 192322  T
Q  201 gttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||    
T  192323 gttgttgaaaatgaattgttataatgaagttataatgttgttgtgatttgaatatgctgcctttgttatttaactaagttgtgtgagtcattataagatg 192422  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttttaaga-tgattgagtccatgtattagcatacatttgttg 397  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  192423 aataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattattttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttg 192522  T
Q  398 ggggct 403  Q
    ||||||    
T  192523 ggggct 192528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 398 - 538
Target Start/End: Original strand, 195119 - 195258
Alignment:
Q  398 ggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtt 497  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  195119 ggggctcatgccctggagcttaatcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgtt 195218  T
Q  498 tggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagag 538  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  195219 gggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatataagag 195258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 305 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 32450 - 32171
Alignment:
Q  305 gatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggct 403  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  32450 gatgatgtcgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaaga-gatcgagtccatgcattatcatacatatgttgggggct 32352  T
Q  404 catgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttgg 500  Q
    |||||| || ||||   || ||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||    
T  32351 catgccctgaagct---tagtcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatggg 32255  T
Q  501 ggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32254 ggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgattgatgtt 32171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32650 - 32570
Alignment:
Q  99 atgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 178  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650 atgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 32570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8567 - 8527
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 281  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8567 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgc 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15711 - 15671
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 281  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15711 tgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgc 15671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 310 - 571
Target Start/End: Original strand, 27238 - 27501
Alignment:
Q  310 tgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagat-gattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatg 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27238 tgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatg 27337  T
Q  408 ccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcat 507  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||    
T  27338 ccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacacttgggggctcat 27437  T
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtcta-agttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27438 accctg-attggtaccacatgcatataagaggtttagatttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 263 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10252
Alignment:
Q  263 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta 361  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||   || ||||||| |||||||||||||||    
T  10543 tgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattcttggatacctaagagatgacgattaagatgtttta 10444  T
Q  362 agatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggg 461  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||    
T  10443 aga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggtgctcatgcccttgagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggg 10345  T
Q  462 ccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10344 gcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagtcgcat 10252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36696 - 36213
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 174  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36696 ggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattac 36597  T
Q  175 ttgaaatattattaaatgatcaagatgttgt-tgaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttat 268  Q
    ||||| ||| | | ||||||  ||||||||  ||     | |||||||     |||||  | ||  ||||||||| || ||  |||| | ||| ||||||    
T  36596 ttgaactatgaatgaatgattgagatgttgcgtgtttatatttgatatcgttatatgatgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttat 36497  T
Q  269 ttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatga 367  Q
    ||||| ||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |     
T  36496 ttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aagagg- 36399  T
Q  368 ttgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttat 467  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | ||||| || ||    
T  36398 ttgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcat 36300  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36299 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggctcatgccctgaattagtaccacatgcatataagaggtctaacttgcat 36213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 234 - 595
Target Start/End: Original strand, 48500 - 48847
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatt-aggatgatgttgaa-ctccaaattattgga 331  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||| || ||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48500 ctgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgtgtcgatataagatgaatcaagatgatgttgaatctccaaattattgga 48599  T
Q  332 tgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatg 431  Q
    || ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||      
T  48600 tgaataagagatgatgtttacgatgttt-aagaag-tcgagtccatgcattagcatacatatgttgg---------------agctttgtactcaccaca 48682  T
Q  432 atggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatg 528  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48683 atggagctttagctcaaaataaagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatg 48782  T
Q  529 catataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtttaagatgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48783 catataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaaagatg-ttaagatgctt 48847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19059 - 19014
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059 atgctctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 19014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13204 - 12829
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  13204 cgagcacttccagaaccgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 13105  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13104 tattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 13006  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  13005 aattgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 12923  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12922 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 12829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19488 - 19113
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||| || |||||  | | |||||    
T  19488 cgagcacttccagaactgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttagattgattaggaaatgaactttcggtactaatgagatatatttaaga 19389  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  19388 tattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaaga 19290  T
Q  200 tgttgttgaa-atgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      |||||||| ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||         |    
T  19289 aattgttgaagatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagtc---------t 19207  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19206 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 12735 - 12680
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12735 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 12680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 19019 - 18981
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19019 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcatt 18981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 62089 - 62042
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  62089 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 62042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3276
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgcc 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  3458 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 3359  T
Q  471 ctgaaagtatattaatact-aat-atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358 ctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7339
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgcc 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  7522 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 7423  T
Q  471 ctgaaagtatattaatact-aata--tgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7422 ctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 7339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 27993 - 28080
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27993 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 28080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2325 - 2048
Alignment:
Q  155 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgatta 253  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  2325 ttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatttgatta 2226  T
Q  254 tgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaa 352  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  2225 tgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaata-gatgttcttgaactccaaattattggatgcatattgagatgttgattaa 2127  T
Q  353 ga-tgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    || |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2126 gattgttttagattgatttagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatga 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11680 - 11457
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||| | |||||    
T  11680 cgagcacttccataactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttatgtagtaaggaaacctatttaaga 11581  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| ||||||          || ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |  ||    
T  11580 tgttaactggaatctgtgaagc----------tgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 11491  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattat 232  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  11490 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattat 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1960
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2015 agtatattaatactataatgttgggggctaatgccttg-attggtaccacatgcata 1960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 35316 - 35605
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||  ||  |||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| | | |||    
T  35316 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgacgtgacctgagttgaatgagttgagtaggaatggagctttatgtagtaatgtgacctatttgaga 35415  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| | |  ||    
T  35416 tgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 35515  T
Q  200 tgttgttgaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtc 288  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35516 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32105 - 31918
Alignment:
Q  371 agtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-at 467  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  32105 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggggcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 32006  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32005 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 31918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2913
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaattaattgatattataaagttatattgttgat 2975  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgatta 303  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  2974 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtctatataagattatta 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 178957 - 178632
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 350  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||  |  |||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  178957 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 178858  T
Q  351 aagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 450  Q
      ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||  ||    
T  178857 gtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagctttgtacttaacatgatggagctttagctc--aa 178762  T
Q  451 taatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    ||  | ||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |  |   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178761 tagcgatgggggcttatgccctggcggtatattaacactcaattagcgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 178662  T
Q  548 gcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  178661 gca-tactcgcatagtcgagtcaatgatgaa 178632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 2479 - 2853
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  2479 cgagcacttccagaattgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 2578  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  |  | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  2579 tattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagt-gattatattgtgatatattgattgattggattacttgaattgttattgaatgatcaaga 2677  T
Q  200 tgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatg 299  Q
      |||||||||||||||| |        |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||         ||    
T  2678 aattgttgaaatgaattgtt--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagtc---------tg 2760  T
Q  300 attaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  2761 aataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtacatgcattagcatacatt 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30121 - 30076
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 30076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 2947 - 3001
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2947 attgataccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 73856 - 73911
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  73856 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 73911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2016
Alignment:
Q  395 ttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aata 493  Q
    ||||||||| || || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2193 ttgggggcttataccctggagcttactactcaccacgatggagcattagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaata 2094  T
Q  494 t-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2093 aagttgggggctcatgccctgtatttgtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatagtcgagtcaa 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 281
Target Start/End: Original strand, 207767 - 207927
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgtt--gaaatgaattgata 220  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  207767 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgata 207866  T
Q  221 ttatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgc 281  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  207867 ttatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgc 207927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1656 - 1611
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1656 atgccctgtaatggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13293 - 13501
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||| | |||||    
T  13293 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaattttaggtactaatgagacctatttaaga 13392  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | |||||||  | || || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  13393 tattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaaga 13491  T
Q  200 tgttgttgaa 209  Q
     |||||||||    
T  13492 agttgttgaa 13501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 287
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3960
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  3738 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 3836  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  3837 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 3928  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3929 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 4406 - 4461
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4406 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 18438 - 18813
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgcttga-ttaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||  |||||| |||  | | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |  ||||    
T  18438 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattagttaggaagggaactttaggtactgctgagacctattaaaga 18537  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaaga 199  Q
    | || | ||  | || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  18538 tattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatttttgaatgatcaaga 18636  T
Q  200 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagat 298  Q
      || ||| |||||||||| |        |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||         |    
T  18637 aattattgaaaatgaattgtt--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagtc---------t 18719  T
Q  299 gattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18720 gaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 18813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21893 - 21848
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 21848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 18907 - 18962
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagag-gtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18907 attggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 18962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 501
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  631 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 532  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaa 130  Q
    |||||| || ||||| |||||  ||||||||    
T  531 tgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaa 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12665 - 12451
Alignment:
Q  57 gattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  12665 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgattt 12567  T
Q  157 aatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatg 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  12566 attgattgattgcattacttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatg 12475  T
Q  256 ttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  12474 ctgctattgttatttaactaagtt 12451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 11991 - 11936
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11991 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 11936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8051
Alignment:
Q  318 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7942 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt--agatgatagagtccctacattagcatacattcgttgggggctcatgccctggagct 8039  T
Q  418 ttgtactcacca 429  Q
    |||| |||||||    
T  8040 ttgtcctcacca 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 540
Target Start/End: Original strand, 8077 - 8151
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggt 540  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8077 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctaatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggt 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16561 - 16516
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561 atgccctggataggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31060 - 30960
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31060 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 30961  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  30960 a 30960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 66338 - 66294
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  66338 atgccctgtattggtaccacatgcatataaga-gactaagttgcat 66294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45418 - 45288
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgcttgc-ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  45418 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacaataggtagtagtgagacctatataaga 45319  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaa 130  Q
    |||||| || ||||| |||||  ||||||||    
T  45318 tgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaa 45288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 35891 - 36027
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttg 242  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||        |||| ||||||| |     
T  35891 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaattaattgat--------attaagctgttgata 35982  T
Q  243 tgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35983 tgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Original strand, 36209 - 36269
Alignment:
Q  127 tgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36209 tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 36269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 11579 - 11630
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11579 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6790 - 6739
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6790 attggtaccacatgcatataag-tgtccaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 6739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 36526 - 36581
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36526 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 36581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 410 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 404
Alignment:
Q  410 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaaagtatattaatact-aatatgttt--ggggctca 506  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||    
T  548 atggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctca 449  T
Q  507 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  448 tgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 644 - 542
Alignment:
Q  334 tatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatgat 433  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  644 tataagagatgatgattatgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcaggccctggagctttgtactcaccacaat 547  T
Q  434 ggagc 438  Q
    |||||    
T  546 ggagc 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1939 - 1848
Alignment:
Q  493 atgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1939 atgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 410 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1982 - 1917
Alignment:
Q  410 atggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatgccctgaa 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1982 atggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6756
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6856 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgttatt 6757  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  6756 a 6756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6685 - 6606
Alignment:
Q  313 tgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6685 tgaactccaaattattggatgtataattgaaaagttgattaagatgttct--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 19823 - 20197
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  ||||    
T  19823 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 19922  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||| ||  | || ||||||  |||||||  | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19923 tattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 20021  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |  |||||| |||||||||| ||||| |           ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||             
T  20022 aaattgttgaaaatgaattgttattaag----------cttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgaatc--------- 20102  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20103 tgaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 20197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15917
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 33227 - 33314
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227 atgccctggaagtatattaatacttataccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 33314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 45778 - 45691
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45778 atgccctggaagtatattaatacttataccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 45691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 17600 - 17686
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17600 atgccctggaagtatattaatacttatagcgatggggcttgattccctggattggtaccacatgcatagaagaggtctaagttgcat 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29192 - 29013
Alignment:
Q  213 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 312  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||   |||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||     
T  29192 aattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtctatacatgatgattaagttgatga 29093  T
Q  313 tgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29092 tgaattccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 29013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 228179 - 228553
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||   |||||    
T  228179 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctacttaaga 228278  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || |||||   ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  228279 tattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaag-tgattatatagtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 228377  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaaga 297  Q
    |  | |||| |||||||||| ||||| |           ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||             
T  228378 aaatagttgaaaatgaattgttattaag----------cttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtc--------- 228458  T
Q  298 tgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  228459 tgaataagttgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8359
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggggccttatgccctgaaagtatattaatacta 490  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8445 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 8359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 525 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 8350 - 8290
Alignment:
Q  525 catgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa-tgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8350 catgcatataagaggtttaggttgcatt-gtcgcattgtcgagtcaattgatgaaagatgtt 8290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 10600 - 10787
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  10600 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 10698  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 548
Target Start/End: Original strand, 11620 - 11803
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  11620 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 11718  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11719 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 11803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4657 - 4471
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  4657 gagtccatgcattagcattcatt-gttaggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 4559  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558 gccctggaagtatattaatactcaaataccgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 474 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 1005
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtc 569  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1100 aaagtatattaatactatgatgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtc 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 1172
Alignment:
Q  306 atgatgttgaactccaaattattggatgtatatgaga--tgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1258 atgatgatgaactccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13441 - 13254
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  13441 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 13343  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13342 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 4517 - 4291
Alignment:
Q  348 attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 446  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  4517 attaagatgtttttagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacctcgttggagcattagctc 4420  T
Q  447 aaaataatg-ttggggccttatgccctgaaagtatattaatact--aatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtc 541  Q
    ||| ||  | ||||||| | ||||| |  ||||||| |||||||  ||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419 aaattagcgattggggcttgatgcctttgaagtataataatactcaaatatcgattggggcttgatgccccttattggtaccacatgcatataagaggtc 4320  T
Q  542 taagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4319 taagttgca-tagtcgcattgtcgagtcaa 4291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 1941 - 1736
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatg-ttggggccttat 467  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||||| | ||    
T  1941 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgat 1843  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgt 563  Q
    |||||  ||||||| ||||||| | ||   | ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1842 gccctagaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcattgt 1744  T
Q  564 cgagtcaa 571  Q
    ||||||||    
T  1743 cgagtcaa 1736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28359 - 28172
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttat- 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||   ||||| ||||      
T  28359 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggaggtttagctcaaattaacaatgggggcttaaa 28260  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259 gccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccatgtattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 28172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 474 - 551
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6452
Alignment:
Q  474 aaagtatattaatactaatatgtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6375 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31826
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  32012 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgat 31914  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact--aatatgtttgggg--ctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||    |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31913 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcat 31826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 168154 - 168340
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| ||    
T  168154 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 168252  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168253 gccctggaagtattttaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 168340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51673
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51718 atgccctgtattgctaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 51673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 9471 - 9670
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||  |||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  9471 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattatgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 9570  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | |||||||  | || ||||||  ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9571 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaag-tgattataatgtgatttattgattgatcgcatttacttgaattattattgaatgatcaag 9669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 9767 - 9846
Alignment:
Q  313 tgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9767 tgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgataaagtccatgaattagcatacatt 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20494
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatt 222  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20394 gttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaatgaattgttatt 20493  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  20494 a 20494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 20741 - 20796
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20741 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 20796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2450
Alignment:
Q  346 tgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2532 tgattaagatgtttta-gacgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 2450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2335
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2390 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgca-ttgtcgcattgtcgagtcaa 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 585
Target Start/End: Original strand, 65022 - 65100
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaatgatgtt 585  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  65022 atgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatagtcgagtcaatgatgaatgatgtt 65100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 46940 - 46753
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  46940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactccccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 46842  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46841 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 46753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1708
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat---gttggggcctt 465  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |   | ||||| |||    
T  1897 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaaattagcgatgggggctt 1799  T
Q  466 -atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
     |||||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1798 gatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16186 - 16039
Alignment:
Q  411 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggct 504  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||||||    
T  16186 tggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 16087  T
Q  505 c-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16086 tgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2763
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aatgttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||| |    
T  2576 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactcacaacgttggagcattagctcaaaattaacgatgggggcttga 2674  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675 tgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgtcttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 499 - 578
Target Start/End: Original strand, 995 - 1073
Alignment:
Q  499 ggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatgaa 578  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  995 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-taatcgcatagtcgagtcaatgatgaa 1073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5491
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttg 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| | ||   | | |    
T  5339 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 5438  T
Q  500 gggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5439 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 5049 - 5186
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |    
T  5049 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagttgttgat 5140  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagt 287  Q
     ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5141 atgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 5636 - 5691
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5636 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 5691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27821 - 27638
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggccttatg 468  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | || |||||||| || ||||||| ||  | |||||| | |||    
T  27821 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactaaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatggggcttgatg 27723  T
Q  469 ccctgaaagtatattaatactaatat-gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27722 ccctggaagtatattaatacttatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 27638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 5806 - 5897
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || |||  |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  5806 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacct 5897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 560
Target Start/End: Original strand, 6277 - 6321
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat 560  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6277 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcatttgtcgcat 6321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 560
Target Start/End: Original strand, 8276 - 8320
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat 560  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8276 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcatttgtcgcat 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 51492 - 51339
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa--taatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttg 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    ||    
T  51492 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatg 51393  T
Q  500 gggc--tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51392 ggaacttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 51339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8426 - 8239
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||| || |  | ||||| ||| |    
T  8426 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggatctttgtactcaccacattggagcattagctcaacattagcgatggggacttga 8328  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327 tgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 174711 - 174524
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  174711 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagaatttgctcaaaattagcgatgggggcttga 174613  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174612 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggtggcttgatgccttgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 174524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 121614 - 121569
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121614 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 136665 - 136752
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  136665 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcctgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 136752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 175026 - 174858
Alignment:
Q  55 ttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtga 153  Q
    ||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||  || ||  ||||| ||| | ||||    
T  175026 ttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtga 174927  T
Q  154 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaa-ttgatat 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  174926 tataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatat 174858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1407
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 1405  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  1406 at 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Original strand, 8704 - 8890
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||||||  || || ||||| ||| ||    
T  8704 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaat-tagtgatgggggcttgat 8802  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||   | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803 gccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 14352 - 14416
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14352 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 14416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 14042 - 14118
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  14042 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 37112
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37153 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 37112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 14649 - 14704
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14649 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 14704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 58667 - 58796
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |        |||| ||||||| |    
T  58667 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggt--------attaagctgttgat 58758  T
Q  242 gtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagtt 279  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  58759 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 58796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 132503 - 132441
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  132503 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 132441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 8)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 189642 - 189706
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  189642 gttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 189706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 189332 - 189408
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  189332 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 189408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24774 - 24971
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || |||  |||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  ||||    
T  24774 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 24873  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaa 197  Q
    | || ||||  | || ||||||  ||| ||| || |||| ||||||||| |||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24874 tattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaag-tgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaa 24971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Original strand, 25065 - 25150
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25065 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcatacatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 561
Target Start/End: Original strand, 25245 - 25290
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25245 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgca-ttgtcgcatt 25290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 225284 - 225240
Alignment:
Q  507 tgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  225284 tgccctggattggtaccatatgcatataagaggtttaagttgcat 225240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 189939 - 189994
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  189939 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 189994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 551
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5049
Alignment:
Q  523 cacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021 cacatgcatataagaggtctaagttgcat 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29606 - 29479
Alignment:
Q  263 tgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgtttt 360  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  29606 tgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaactccaaattattggatgtataagtaatatgatgattaagatgtttt 29507  T
Q  361 aagatgattgagtccatgtattagcataca 390  Q
      | |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29506 --gttgatagagtctatgcattagcataca 29479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 29382 - 29326
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29382 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 29326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 472
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  548 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagat---gttgaaatgaattgttatta 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 236 - 174
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattat-aatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatt 184  Q
    |||||||| |||||||||| || | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  236 gttatgaactgctaagttgttttttaatgcgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatt 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 5148 - 5193
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5148 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3275 - 3230
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3275 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10312 - 10267
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 210
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggc-tcatgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  290 gagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagctttgcactcaacacgatggagctttagctcaaa 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11532
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatgaattgatatta 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  11456 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga---tgttgaaatgaattgttatta 11532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 11766 - 11830
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11766 gttatgaactgctaagttgtttttaatgcgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 11830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13388 - 12972
Alignment:
Q  138 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctg 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||  || |||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | ||||||    
T  13388 gttgattatgatgtgatataatg-ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 13290  T
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat 336  Q
    || ||||   |||  |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| |||| | ||||||| ||   ||||||||||||||| |||    
T  13289 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt--tccaaattattggat-tat 13193  T
Q  337 atgagatgatg----attaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaccatga 432  Q
    || ||| | ||    |||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||    |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| |     
T  13192 ataagaggttgtcgaattaagatgttt-aagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 13095  T
Q  433 tggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacat 527  Q
    |||||| || ||||||  ||  | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   | | ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  13094 tggagctttagctcaat-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacat 12996  T
Q  528 gcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  12995 gcatataagatgtctaagttgcat 12972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9431 - 9346
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagat--gatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  9431 tgatgatgaactccaaattattggatgtatatgtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 9346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 78 - 33
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34068 - 33881
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat-gttggggcctt-a 466  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |  | ||||| ||| |    
T  34068 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgatgggggcttga 33970  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   | | |||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33969 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattcgtaccatatgcatataagaggtctaagttgcat 33881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38609 - 38564
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38609 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 38564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32324 - 32279
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32324 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 32279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32790 - 32745
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32790 atgccctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Original strand, 1119 - 1258
Alignment:
Q  87 gacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta 185  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |  ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||||||| || | ||||||    
T  1119 gacctatataagaagttaactgcaatcagtgaagctgttatgaaatattaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattatttaagatatta 1217  T
Q  186 ttaaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatg 225  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1218 ttgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatg 1258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1842
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  1913 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 6330 - 6259
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  6330 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8219
Alignment:
Q  504 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8266 tcatgccatgcattggtaccacaagcatataagaggtttaagttgcat 8219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Original strand, 32615 - 32675
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatcaagatgttg 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32615 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 32675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 32925 - 32989
Alignment:
Q  123 gttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatt 187  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32925 gttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatt 32989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 33223 - 33278
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcat-tgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33223 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatatgtcgagtcaa 33278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 4971 - 5041
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||    
T  4971 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcacattgttgagtcaaagatga 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 3463 - 3533
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagtcaatgatga 577  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  3463 atgccctggattggtaccacattcatataagaggtctaagttgca-taatcgcattgtcgagtcaaagatga 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 24165 - 24252
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatac-taatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24165 atgccctggaagtatattaatacataatacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 24252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 6397 - 6439
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6397 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12683
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttg 12683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1195 - 1150
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1195 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6341
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6386 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6653 - 6529
Alignment:
Q  262 ctgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgattaagatgttt 359  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||    
T  6653 ctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttt 6555  T
Q  360 taagatgattgagtccatgtattagcat 387  Q
    |  | |||| ||||||||| ||||||||    
T  6554 t--gttgatagagtccatgcattagcat 6529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6672 - 6571
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6672 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctcagttgc 6573  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  6572 at 6571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 8383 - 8428
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8383 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10457 - 10412
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10457 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11847 - 11802
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 11802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8926 - 8881
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20473 - 20428
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20473 atgccctgtattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcat 20428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 4743 - 4649
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4743 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata-aagaggtttagattgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5442 - 5397
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 16912 - 16957
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16912 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 46059 - 46160
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46059 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactatgttaagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtataagttgc 46158  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  46159 at 46160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 47043 - 47088
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47043 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 47088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10120 - 10075
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 atgccctatattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20819 - 20734
Alignment:
Q  405 atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatact 489  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20819 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 20734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 52302 - 52347
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52302 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 52347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 53830 - 53917
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53830 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 53917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 429
Target Start/End: Original strand, 205235 - 205297
Alignment:
Q  365 tgattgagtccatgtattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcacca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  205235 tgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 205297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 532
Target Start/End: Original strand, 205333 - 205389
Alignment:
Q  476 agtatattaatactaatat-gtttggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 532  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  205333 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 205389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 129759 - 129658
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  129759 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacattcatataagaggtctaagttgc 129660  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  129659 at 129658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 242105 - 241966
Alignment:
Q  252 tatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtata-tgagatgatgat 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  242105 tatgctgctgctgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgat 242007  T
Q  350 taagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    || ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  242006 tacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 241966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 117949 - 117994
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  117949 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 117994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23226 - 23141
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  23226 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 23141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 161431 - 161476
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161431 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 161476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4794 - 4609
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttggggcctt-at 467  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| || | ||||  ||  | ||||| ||| ||    
T  4794 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagttttgtactcaccacgttggagctttaggtcaat-tagcgatgggggcttgat 4697  T
Q  468 gccctgaaagtatattaatact--aata-tgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||| || |||||||||||||||  |||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4696 gccttggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacattcttataagaggtctaagttgcat 4609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 626 - 531
Alignment:
Q  265 ttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt 359  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  626 ttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgtttatgatgttt 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 551
Target Start/End: Original strand, 76 - 123
Alignment:
Q  504 tcatgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76 tcatgccctgtattagtaccacatgtatataagaggtctaagttgcat 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 1234 - 1045
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggct-catgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa-taatgttggggcctt-a 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||| |    
T  1234 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 1136  T
Q  467 tgccctgaaagtatattaatactaatat---gtttggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgcata----taagaggtctaagttgc 549  Q
    || |||| ||||||||||| ||| | ||   | | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  1135 tgtcctggaagtatattaaaactcaaatagcggtcggggcttgatgccccgtattggtaccacatgcatataattaagaggtctaagttgc 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15575
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15530 atgccctggattggtaccacatgcatataacaagtctaagttgcat 15575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 551
Target Start/End: Original strand, 39006 - 39045
Alignment:
Q  512 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39006 tgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 39045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Original strand, 103912 - 103999
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact-aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  103912 atgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 103999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32373 - 32286
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32373 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcat 32286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Original strand, 16941 - 16988
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16941 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 16988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 370 - 451
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1306
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 451  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  1225 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 1333 - 1369
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 1369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 551
Target Start/End: Original strand, 2460 - 2514
Alignment:
Q  498 tggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2460 tggggctcgatgctctgtattggtacaacatgcatataagaggtctaagttgcat 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 551
Target Start/End: Original strand, 18350 - 18388
Alignment:
Q  513 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18350 gtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 18388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15224 - 15446
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgc-ttgcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||| || |||| || |||||| | | ||| |    
T  15224 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctttgattgattaggagaggaacctttggtactaatgagacatat-taaaa 15322  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatatta-ttaaatgatcaag 198  Q
    |||||||||  | || ||||||  || |||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||  |||| || |||  |||||    
T  15323 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataag-tgattataatgtgatataatgtttta-tgcattactt-aagaattatttgaatattcaag 15419  T
Q  199 atgttgttgaaatg-aattgatattat 224  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  15420 atgttgttgaattgaaattgatattat 15446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 786
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  831 atgccctggattggtaccacatgcatataagagttctaagttgcat 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9165 - 9114
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9165 attggtaccacatgcatataaga-gtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 9114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11242 - 11197
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11242 atgctctgtattggtaccacatgcatataagaggtctacgttgcat 11197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Original strand, 956 - 1009
Alignment:
Q  143 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattaaatgatca 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  956 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19641 - 19484
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 332  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19641 ctgttattgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggat 19543  T
Q  333 gtata-tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | ||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19542 gcatattgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 19484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25815 - 25658
Alignment:
Q  234 ctgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttga-gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggat 332  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25815 ctgttattgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggat 25717  T
Q  333 gta-tatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    | | | ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  25716 gcattttgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattagcattcatt 25658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 8340 - 8441
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8340 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 8439  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  8440 at 8441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 551
Target Start/End: Original strand, 29036 - 29137
Alignment:
Q  453 atgttggggcctt-atgccctgaaagtatattaatactaa-tatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29036 atgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttactacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatggatataagaggtctaagttgc 29135  T
Q  550 at 551  Q
    ||    
T  29136 at 29137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10103 - 10058
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10103 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 10058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 547
Target Start/End: Original strand, 77659 - 77700
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 547  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77659 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggtctaagtt 77700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 347 - 304
Alignment:
Q  508 gccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  347 gccctggattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcat 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 31905 - 31843
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatga 577  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  31905 attggtatcacatgcatataagaggtctaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatga 31843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 3481 - 3420
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaatgatg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  3481 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgca-tagtcgcatttgtcgagtcaaagatg 3420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26904 - 26822
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaac 317  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  26904 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatgttgaac 26822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27061 - 27008
Alignment:
Q  76 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctatgaagccgttatga 129  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27061 ggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatga 27008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1728 - 1677
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1728 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 1677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Original strand, 6517 - 6568
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6517 attggtaccacatgcatataag-tgtccaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 6568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12366 - 12321
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12366 atgccctggattggtaccacatgcatataagaggattaagttgcat 12321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 549
Target Start/End: Original strand, 16344 - 16429
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgc 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16344 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgc 16429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3011
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2966 atgccctggattgctaccacatgcatataagaggtataagttgcat 3011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3336 - 3560
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgtgactggagttgctt-gcttgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||   ||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||  |  ||||    
T  3336 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagaccttagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacccattaaaga 3435  T
Q  100 tgttaactgcaatctatgaagccgttatgaattgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgca-ttacttgaaatattattaaatgatcaag 198  Q
    | || ||||  | || ||||||  ||||||| || |||| ||| ||||  |||| |||  |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  3436 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgaatatagagtgaattatggattgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaag 3534  T
Q  199 atgttgttg-aaatgaattgatatta 223  Q
    |  |||||| |||||||||| |||||    
T  3535 aaattgttgaaaatgaattgttatta 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 360
Target Start/End: Original strand, 3564 - 3681
Alignment:
Q  237 ttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtat 336  Q
    ||| |||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||      ||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564 ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct------ga--attaagttgatgatgaactccaaattattggatgtat 3655  T
Q  337 a--tgagatgatgattaagatgtttt 360  Q
    |  ||| | | |||||||||||||||    
T  3656 aagtgataagttgattaagatgtttt 3681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 36137 - 36086
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36137 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 36086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25744 - 25699
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25744 atgccctagattggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcat 25699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Original strand, 1224 - 1303
Alignment:
Q  370 gagtccatgtattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 449  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  1224 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 196 - 146
Alignment:
Q  516 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtcgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  196 ttggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtcgagt 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 3422 - 3458
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3422 attggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcat 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 551
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8018
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7982 attggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcat 8018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6360
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgca 550  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404 atgccgtggattggtagcacatgcatataagaggtctaagttgca 6360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2823 - 2718
Alignment:
Q  286 gtctatacaagatgattaggatgatgttgaactccaaattattggatgtatat-gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattag 384  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||| |||||    
T  2823 gtctatatatgatgattaagatgacgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgtttt--gttgatagagtccatgcattag 2726  T
Q  385 catacatt 392  Q
    ||| ||||    
T  2725 cattcatt 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2517 - 2427
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatact--aatatgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2517 atgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 1769 - 1730
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaag 545  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1769 atgccttggattggtaccacatgcatataagaggtctaag 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2161
Alignment:
Q  466 atgccctgaaagtatattaatactaat-atgtttggggctc-atgccctgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagt 546  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||  |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2079 atgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcatataagaggtttaagt 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Original strand, 53 - 108
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9366
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgca-ttgtcgagtcaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9421 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcatttgtcgagtcaa 9366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15165 - 15118
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15165 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 15118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 312
Target Start/End: Original strand, 4984 - 5061
Alignment:
Q  235 tgttgttgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtctatacaagatgattaggatgatgt 312  Q
    ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||||    
T  4984 tgttgttgtgatctccctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcaatatgagatgaataagatgatgt 5061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9732 - 9685
Alignment:
Q  515 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatttgtcgcattgtc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9732 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgca-ttgtcgcattgtc 9685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9829
Alignment:
Q  307 tgatgttgaactccaaattattggatgtata--tgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgtattagcatacatt 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  9914 tgatgatgaactccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttt--gttgttagagtccatgcattagcattcatt 9829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 6551 - 6598
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6551 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 14005 - 14052
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14005 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 14052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 289
Target Start/End: Original strand, 18398 - 18446
Alignment:
Q  241 tgtgatctgattatgttgctactgttatttaactaagttgcttgagtct 289  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18398 tgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtct 18446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 506 - 551
Target Start/End: Original strand, 56048 - 56095
Alignment:
Q  506 atgccctgtattggtaccacatgcat--ataagaggtctaagttgcat 551  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  56048 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcat 56095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University