View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20244_low_18 (Length: 290)

Name: NF20244_low_18
Description: NF20244
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20244_low_18
NF20244_low_18
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (7-284)||(37016148-37016425)
chr1 (7-281)||(50116316-50116590)
chr1 (12-284)||(38691489-38691761)
chr1 (7-284)||(12649129-12649406)
chr1 (7-281)||(46974398-46974672)
chr1 (7-284)||(13175015-13175292)
chr1 (7-284)||(41455071-41455348)
chr1 (19-284)||(51663504-51663769)
chr1 (20-284)||(19498014-19498277)
chr1 (7-280)||(29355242-29355515)
chr1 (7-280)||(13630650-13630923)
chr1 (7-280)||(3947015-3947288)
chr1 (7-280)||(3984347-3984620)
chr1 (7-280)||(5079169-5079442)
chr1 (7-280)||(44466816-44467089)
chr1 (7-280)||(20350690-20350963)
chr1 (7-280)||(38774669-38774942)
chr1 (20-232)||(21942966-21943178)
chr1 (22-280)||(32106208-32106455)
chr1 (22-138)||(25231551-25231667)
chr1 (108-188)||(36360166-36360246)
chr1 (108-263)||(28863225-28863380)
chr1 (20-94)||(26466010-26466084)
chr1 (108-246)||(7403953-7404093)
chr1 (108-268)||(45472687-45472847)
chr1 (192-246)||(25231667-25231721)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (7-284)||(46991796-46992073)
chr3 (7-284)||(6504505-6504782)
chr3 (7-284)||(36816066-36816343)
chr3 (7-281)||(14399789-14400064)
chr3 (7-284)||(7841566-7841842)
chr3 (12-284)||(7838835-7839107)
chr3 (7-284)||(77570-77847)
chr3 (7-284)||(29949219-29949495)
chr3 (7-284)||(29998373-29998649)
chr3 (7-284)||(21954789-21955065)
chr3 (7-284)||(48249416-48249694)
chr3 (7-280)||(13746275-13746548)
chr3 (7-280)||(16445854-16446127)
chr3 (7-280)||(3949977-3950250)
chr3 (7-280)||(6742121-6742394)
chr3 (7-280)||(8159537-8159810)
chr3 (7-228)||(29908053-29908273)
chr3 (7-272)||(30946204-30946469)
chr3 (7-155)||(9428512-9428660)
chr3 (137-281)||(28610472-28610616)
chr3 (108-246)||(2284645-2284783)
chr3 (115-263)||(9556335-9556483)
chr3 (108-268)||(12491422-12491582)
chr3 (108-269)||(51548098-51548259)
chr3 (108-188)||(4120440-4120520)
chr3 (108-188)||(40467854-40467934)
chr3 (108-268)||(33940190-33940350)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (7-284)||(2145549-2145826)
chr8 (7-284)||(35965295-35965572)
chr8 (12-284)||(43371006-43371278)
chr8 (15-290)||(45455618-45455893)
chr8 (19-284)||(7169137-7169402)
chr8 (7-284)||(22581062-22581339)
chr8 (7-272)||(43688733-43688998)
chr8 (7-280)||(7341313-7341586)
chr8 (7-280)||(30304164-30304437)
chr8 (7-280)||(32377462-32377735)
chr8 (7-280)||(32431419-32431692)
chr8 (7-280)||(8422410-8422683)
chr8 (7-99)||(39751763-39751855)
chr8 (7-104)||(1116006-1116103)
chr8 (108-268)||(45116582-45116742)
chr8 (102-252)||(14401355-14401505)
chr8 (108-269)||(44321173-44321334)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (7-284)||(7799556-7799833)
chr5 (7-284)||(4202489-4202766)
chr5 (7-284)||(18536886-18537163)
chr5 (7-284)||(1036585-1036862)
chr5 (7-284)||(34079014-34079291)
chr5 (7-284)||(7020430-7020707)
chr5 (7-284)||(27866395-27866672)
chr5 (7-284)||(25895647-25895928)
chr5 (7-280)||(38858744-38859017)
chr5 (7-280)||(37819431-37819704)
chr5 (7-280)||(11032006-11032279)
chr5 (7-280)||(28884962-28885235)
chr5 (7-284)||(13566657-13566918)
chr5 (29-284)||(20287524-20287780)
chr5 (29-189)||(20286265-20286424)
chr5 (108-268)||(11819551-11819711)
chr5 (108-246)||(27013257-27013395)
chr5 (108-188)||(43295549-43295629)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (7-284)||(38463387-38463664)
chr4 (7-284)||(4976989-4977266)
chr4 (7-287)||(11502740-11503020)
chr4 (7-281)||(4769368-4769642)
chr4 (7-284)||(44049844-44050121)
chr4 (7-284)||(21472027-21472305)
chr4 (7-284)||(4978508-4978785)
chr4 (7-280)||(9891256-9891529)
chr4 (7-280)||(3405024-3405297)
chr4 (7-280)||(19072211-19072484)
chr4 (7-280)||(49565018-49565291)
chr4 (19-280)||(41024445-41024706)
chr4 (22-269)||(6182927-6183174)
chr4 (12-121)||(51643211-51643320)
chr4 (108-268)||(1591168-1591328)
chr4 (108-263)||(32716628-32716783)
chr4 (130-226)||(34979910-34980006)
chr4 (122-268)||(4617906-4618052)
chr4 (157-189)||(11693442-11693474)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (7-284)||(17303-17580)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (7-284)||(31147556-31147833)
chr6 (7-284)||(18607230-18607507)
chr6 (7-284)||(21357900-21358177)
chr6 (7-284)||(23961882-23962159)
chr6 (12-284)||(28357557-28357829)
chr6 (29-284)||(29287503-29287757)
chr6 (7-280)||(1611305-1611578)
chr6 (108-268)||(9095463-9095623)
chr6 (108-248)||(34111305-34111446)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (7-284)||(24604639-24604916)
chr2 (7-284)||(1098376-1098653)
chr2 (7-284)||(45476591-45476868)
chr2 (7-284)||(41007530-41007807)
chr2 (7-284)||(43948832-43949109)
chr2 (7-284)||(34920332-34920609)
chr2 (7-284)||(24750892-24751170)
chr2 (7-284)||(12907042-12907319)
chr2 (7-278)||(9655390-9655661)
chr2 (7-284)||(436545-436823)
chr2 (7-284)||(27274910-27275187)
chr2 (7-280)||(211995-212268)
chr2 (7-280)||(5348401-5348674)
chr2 (7-280)||(39795204-39795477)
chr2 (7-280)||(41561246-41561519)
chr2 (7-280)||(10623008-10623281)
chr2 (29-284)||(17996722-17996977)
chr2 (12-284)||(11692380-11692637)
chr2 (7-280)||(38946997-38947270)
chr2 (7-187)||(28354549-28354729)
chr2 (7-284)||(3802116-3802393)
chr2 (22-280)||(7264229-7264487)
chr2 (129-284)||(24941200-24941355)
chr2 (108-246)||(28423062-28423200)
chr2 (129-221)||(3353894-3353986)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (12-284)||(47062123-47062394)
chr7 (7-280)||(18106622-18106895)
chr7 (7-280)||(42500641-42500914)
chr7 (7-280)||(617303-617576)
chr7 (7-280)||(43827160-43827433)
chr7 (7-280)||(30787773-30788046)
chr7 (7-280)||(43622689-43622962)
chr7 (7-280)||(45764613-45764886)
chr7 (46-280)||(15067162-15067396)
chr7 (19-195)||(8400832-8401008)
chr7 (165-284)||(12116919-12117038)
chr7 (108-246)||(43378896-43379034)
chr7 (108-246)||(16794201-16794339)
chr7 (108-268)||(40794258-40794418)
chr7 (7-50)||(15060847-15060890)
chr7 (108-263)||(16795667-16795822)
chr7 (108-246)||(45172497-45172635)
chr7 (108-246)||(46791660-46791798)
chr7 (108-269)||(40445130-40445291)
chr7 (108-188)||(1297321-1297401)
chr7 (108-268)||(47867065-47867225)
chr7 (108-201)||(8193913-8194006)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (7-284)||(15907-16184)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (7-280)||(2115-2388)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (7-280)||(34043-34316)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (192-283)||(1-92)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (169-284)||(25496-25611)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (7-90)||(12497-12580)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 37016148 - 37016425
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016148 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 37016247  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  37016248 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 37016347  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37016348 tttgaggtagttggggtcatttcgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 37016425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 50116590 - 50116316
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116590 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatgtcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 50116491  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50116490 cttttgggctcatctaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 50116391  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagag 281  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50116390 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagag 50116316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38691761 - 38691489
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691761 aagaagccgttgcaatatctaatctcgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 38691662  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  38691661 gggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttga 38691562  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38691561 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 38691489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12649406 - 12649129
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649406 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatatctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 12649307  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12649306 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 12649207  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  12649206 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaa 12649129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 46974398 - 46974672
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974398 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 46974497  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  46974498 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatcttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacaggtacaagatgccaatg 46974597  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagag 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46974598 tttgaggtagttggggtcacttcaatcgatttgacatattcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagag 46974672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 13175015 - 13175292
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175015 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatttcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 13175114  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  13175115 cttttgtgctcatccaacatccgctaagttgtttaacaaatttccagcggttttggttatggactccacctacaaaaccatcatgtacaagatgccaatg 13175214  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13175215 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtgtggatttgtgacccatgagaaagaggaa 13175292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 41455071 - 41455348
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  41455071 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 41455170  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  41455171 attttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaaggatgccaatg 41455270  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41455271 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 41455348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 51663504 - 51663769
Alignment:
Q  19 cgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663504 cgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 51663603  T
Q  119 tccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagtt 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||| | ||||| ||||||||    
T  51663604 tccaacatcctttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatggactctacctacaaaaccaacatgtataaaatgccagtgtttgaggtagtt 51663703  T
Q  219 ggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  51663704 ggggtcacttcgaccgatttgacatatttggttgagtttgaatatgtgacacatgagaaagaggaa 51663769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19498014
Alignment:
Q  20 gttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagata-cttttgggctcat 19498179  T
Q  120 ccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 19498079  T
Q  220 gggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19498078 gggtcacttcgaccgatttgacatattcggtaggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 19498014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29355515 - 29355242
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  29355515 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 29355416  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  29355415 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 29355316  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29355315 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 29355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 13630650 - 13630923
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  13630650 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 13630749  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  13630750 attttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 13630849  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13630850 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 13630923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3947288 - 3947015
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  3947288 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 3947189  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  3947188 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 3947089  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3947088 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 3947015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 3984347 - 3984620
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  3984347 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 3984446  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  3984447 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 3984546  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3984547 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 3984620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 5079169 - 5079442
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  5079169 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 5079268  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  5079269 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttcaaacggttttggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 5079368  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5079369 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 5079442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 44466816 - 44467089
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  44466816 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 44466915  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  44466916 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 44467015  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44467016 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 44467089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 20350690 - 20350963
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  20350690 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 20350789  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  20350790 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 20350889  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20350890 tttgaggtagtttgggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 20350963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38774942 - 38774669
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  38774942 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 38774843  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  38774842 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 38774743  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  38774742 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaaga 38774669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21943178 - 21942966
Alignment:
Q  20 gttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943178 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 21943079  T
Q  120 ccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttg 219  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  21943078 ccatcattcgttaagttgtttaacaaattttcaacggttttggttatggattccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 21942979  T
Q  220 gggtcacttcgac 232  Q
    || ||||||||||    
T  21942978 ggatcacttcgac 21942966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32106455 - 32106208
Alignment:
Q  22 tgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 121  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||    
T  32106455 tgcattatataatctcaaagttggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatcc 32106356  T
Q  122 aacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  32106355 aacatccattaagttgtttaacaatttt-----------ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggg 32106267  T
Q  222 gtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||   |||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  32106266 gtcaccttgactgatttgacatattcagttgattttggatttttgacacatgagaaaga 32106208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Original strand, 25231551 - 25231667
Alignment:
Q  22 tgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 121  Q
    |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||| | | | | || |||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||    
T  25231551 tgcagtatctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatcc 25231650  T
Q  122 aacatccgttaagttgt 138  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25231651 aacatacgttaagttgt 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360166
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaac 188  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaac 36360166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863380
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| | ||  ||||| | ||||| || || |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 28863324  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggattt 263  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28863325 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatttgattggttttgcattt 28863380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26466084 - 26466010
Alignment:
Q  20 gttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactac 94  Q
    |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26466084 gttgcagtttctaatctcaaagttgaaggagcacaactatgtttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactac 26466010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404093
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgc--taat 205  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || ||||  || |    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatatt 7404052  T
Q  206 gtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    |||| |  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  7404053 gtttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatt 7404093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472847
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | |||||  |||| |||||||||||| | || || |||  | |||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 45472786  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  45472787 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45472847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Original strand, 25231667 - 25231721
Alignment:
Q  192 tacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25231667 tacaggataccaatgtttgagatagttagggtcacctcgaccgatttgacatatt 25231721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 46992073 - 46991796
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992073 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctttatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 46991974  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  46991973 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 46991874  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46991873 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 46991796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6504782 - 6504505
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504782 gtgacaagaagccgttgcaatatctaacctcgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 6504683  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6504682 cttttgggctcatccaacatccgttaagttttttaacaattttccaaccgttttggttatggactccacctacataaccaacatgtacaggatgccaatg 6504583  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6504582 tttgaggtagttgaggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgaggaagaggaa 6504505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36816343 - 36816066
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36816343 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatat 36816244  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  36816243 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 36816144  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36816143 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 36816066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 14399789 - 14400064
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399789 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 14399888  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  14399889 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 14399988  T
Q  207 tttaaggtagtt-ggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagag 281  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14399989 tttgaggtagttgggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagag 14400064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7841842 - 7841566
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841842 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactaa-cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 7841744  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  7841743 cttttgggttcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaggatgccaatg 7841644  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7841643 tttgaggtagttggggtcacttagaccgatttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaacgaggaa 7841566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 7838835 - 7839107
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838835 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 7838934  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  7838935 gggctcatccgacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggtcatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttga 7839034  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7839035 ggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagtggaa 7839107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 77847 - 77570
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  77847 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatat 77748  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  77747 cttttgggctcatccaacatttgttaagttgtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatg 77648  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  77647 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttttgacacatgagaaagaggaa 77570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 29949219 - 29949495
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29949219 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtagtacaatcgaagatat 29949317  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29949318 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 29949417  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29949418 tttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaagaggaa 29949495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 29998373 - 29998649
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29998373 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtagtacaatcgaagatat 29998471  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29998472 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 29998571  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29998572 tttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaagaggaa 29998649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21955065 - 21954789
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21955065 gtgacaagaagccgttgcaatat-taatctcgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagatac 21954967  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||     
T  21954966 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacaggatgccaata 21954867  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21954866 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 21954789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48249694 - 48249416
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249694 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 48249595  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  48249594 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 48249495  T
Q  207 tttaaggtagtt-ggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48249494 tttgaggtagttgggggtcactttgaccaatttgacatattcggttgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 48249416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13746548 - 13746275
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  13746548 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 13746449  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  13746448 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 13746349  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13746348 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 13746275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 16445854 - 16446127
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  16445854 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 16445953  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16445954 attttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 16446053  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16446054 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 16446127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 3949977 - 3950250
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  3949977 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 3950076  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  3950077 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 3950176  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3950177 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 3950250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 6742121 - 6742394
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  6742121 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 6742220  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  6742221 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 6742320  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6742321 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 6742394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8159810 - 8159537
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  8159810 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 8159711  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  8159710 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 8159611  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  8159610 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacacgagaaaga 8159537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 29908053 - 29908273
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29908053 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtagtacaatcgaagatat 29908151  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29908152 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 29908251  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcactt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  29908252 tttgaggtagttggggtcactt 29908273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30946469 - 30946204
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  30946469 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 30946370  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  30946369 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 30946270  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacat 272  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  30946269 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacat 30946204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9428660 - 9428512
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  9428660 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 9428561  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacg 155  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9428560 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacg 9428512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28610616 - 28610472
Alignment:
Q  137 gtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgat 236  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || ||    
T  28610616 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaagatgtcaatgtttgaggtagttggaatcacttcggccaat 28610517  T
Q  237 ttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagag 281  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28610516 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacatatgagaaagag 28610472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284645
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 2284684  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  2284683 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatt 2284645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556335
Alignment:
Q  115 ctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggt 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||  | ||||| |  |    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacaggatgtcattgtttgaaat 9556384  T
Q  215 agttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggattt 263  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  9556383 agttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcattt 9556335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491582
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||  ||||| | ||||| ||| | ||||||| |||| | || || |||  | |||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 12491521  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  12491522 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatttggttggttttgcatttatgac 12491582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548098
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 51548160  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgaca 269  Q
    || |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||||    
T  51548159 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 51548098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120440
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaac 188  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaac 4120440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467854
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaac 188  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaac 40467854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 33940190 - 33940350
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| |||||| | |||  | ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  33940190 ttttggactcatccaacatcggtaaagtcgtttaacactttctcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 33940289  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  33940290 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 33940350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2145826 - 2145549
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145826 gtgacaagaagttgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 2145727  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2145726 cttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 2145627  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2145626 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 2145549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35965572 - 35965295
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35965572 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatat 35965473  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  35965472 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaata 35965373  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35965372 tttgaggtagttggggtcccttcgaccgatttgacatattcgattgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 35965295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 43371006 - 43371278
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371006 aagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 43371105  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| |    
T  43371106 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgtcaacgtttga 43371205  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43371206 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 43371278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Original strand, 45455618 - 45455893
Alignment:
Q  15 aagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttggg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  45455618 aagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttggg 45455717  T
Q  115 ctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  45455718 ctcatccaacatccgttaagttgtttaaaatttttccaacggttttggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggt 45455817  T
Q  215 agttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaatacatc 290  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45455818 agttgggatcacttcgatcgatttgacatatttggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaatacatc 45455893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 7169137 - 7169402
Alignment:
Q  19 cgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 118  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169137 cgttgcaatatataatctcaaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 7169236  T
Q  119 tccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7169237 tccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatgaactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagtt 7169336  T
Q  219 ggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7169337 agggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 7169402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 22581062 - 22581339
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22581062 gtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatat 22581161  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  22581162 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgtacaagatgtcaatg 22581261  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22581262 tttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgcgacacatgagaaagaggaa 22581339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43688998 - 43688733
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43688998 gtgataagaagccgttgcaatttctaatttcgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatat 43688899  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  43688898 cttttgggctcatccaaaatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 43688799  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacat 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43688798 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacat 43688733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 7341313 - 7341586
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  7341313 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 7341412  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  7341413 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 7341512  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7341513 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 7341586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30304437 - 30304164
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  30304437 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 30304338  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  30304337 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 30304238  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30304237 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 30304164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32377735 - 32377462
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  32377735 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 32377636  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  32377635 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 32377536  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32377535 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 32377462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32431692 - 32431419
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  32431692 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 32431593  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  32431592 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 32431493  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32431492 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 32431419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8422683 - 8422410
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  8422683 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 8422584  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  8422583 tttttgggctcatccaacatccattatattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 8422484  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8422483 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 8422410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39751855 - 39751763
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcg 99  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39751855 gtgacaagaaaccattgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcg 39751763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 1116006 - 1116103
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagat 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||    
T  1116006 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagat 1116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116742
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 45116681  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| || || || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  45116682 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45116742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14401505 - 14401355
Alignment:
Q  102 gatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgc 201  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| | |   ||||| | || |||| |||||| ||||||||||  || ||||||     
T  14401505 gatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttttcgatagttttgttcatcgacttcacctataaaaccaacacgtataggatgt 14401406  T
Q  202 taatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattg 252  Q
     | ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||    
T  14401405 cattgtttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcgattg 14401355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321334
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || ||| || |||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgttattgt 44321272  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgaca 269  Q
    || |  ||||||| || || || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||||    
T  44321273 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 44321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7799833 - 7799556
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799833 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 7799734  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7799733 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 7799634  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7799633 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttaacatattcggttgggtttggatttgtgagacatgagaaagaggaa 7799556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4202766 - 4202489
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202766 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 4202667  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4202666 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacagttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatg 4202567  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4202566 tttgaggtagttgaggtcacttcgaccgatttgacatattctgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 4202489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18537163 - 18536886
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537163 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 18537064  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  18537063 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaactaacatgtacaagatgctaatg 18536964  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18536963 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacgcatgagaaagaggaa 18536886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 1036585 - 1036862
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036585 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 1036684  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1036685 cttttgggctcatctaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttacggactcaacctacaaaatcaacatgtataggatgccaatg 1036784  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1036785 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 1036862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 34079014 - 34079291
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  34079014 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatat 34079113  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  34079114 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 34079213  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34079214 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 34079291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7020707 - 7020430
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  7020707 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 7020608  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  7020607 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 7020508  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7020507 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttagatttatgacacatgagaaagaggaa 7020430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27866672 - 27866395
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  27866672 gtgacaagaaacctttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatat 27866573  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  27866572 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatg 27866473  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27866472 tttgaggtggttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 27866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25895928 - 25895647
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaa----gttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaag 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25895928 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatatctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaag 25895829  T
Q  103 atatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  25895828 atatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgcc 25895729  T
Q  203 aatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25895728 aatgcttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcgggtgagtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 25895647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38859017 - 38858744
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  38859017 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 38858918  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38858917 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatataggatgccaatg 38858818  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38858817 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 38858744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37819704 - 37819431
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  37819704 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 37819605  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  37819604 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 37819505  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37819504 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttaggtttggatttatgacacatgagaaaga 37819431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11032279 - 11032006
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  11032279 gtgacaagaaaccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 11032180  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  11032179 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 11032080  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11032079 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 11032006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28885235 - 28884962
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  28885235 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 28885136  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  |||||| ||||    
T  28885135 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtattggatgccaatg 28885036  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28885035 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacataatccgttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 28884962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13566918 - 13566657
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  13566918 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatat 13566819  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||                | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||    
T  13566818 cttttgggatcattcaacatccattaagttgt----------------ggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctaggatgccaatg 13566735  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13566734 tttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 13566657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 20287524 - 20287780
Alignment:
Q  29 tctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcc 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| || |  || |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20287524 tctaatctcaaagttggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatcc 20287623  T
Q  129 gttaagttgtttaaa-aattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcact 227  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||| || |||||||||||||     
T  20287624 gttaagtttttttaacaattttccaacggttctggttatggactccacctaccaaaccaacatgtacaagatgcctatgtttgagatagttggggtcacc 20287723  T
Q  228 tcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  20287724 tcgaccgatttgacatattcggttggctttgaatttgtgacgcatgagaaagaggaa 20287780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Original strand, 20286265 - 20286424
Alignment:
Q  29 tctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcc 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| | |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20286265 tctaatctcaaagttggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatcc 20286364  T
Q  129 gttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaaca 189  Q
    | | ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20286365 gcttagttg-ttatgaattttccaacagttttggttatggactccacctacctaaccaaca 20286424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819711
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgctattgt 11819650  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| |  ||  |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  11819651 ttgaaatagttggagtcaccttaacttatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 11819711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013257
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || || ||||| |||||||||||| | || || |||  | |||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 27013296  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  27013295 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatt 27013257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295629
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaac 188  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaac 43295629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38463664 - 38463387
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463664 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 38463565  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38463564 cttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgctaatg 38463465  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38463464 tttgaggtagttggagtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 38463387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 4976989 - 4977266
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976989 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 4977088  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4977089 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatg 4977188  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4977189 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 4977266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 11502740 - 11503020
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11502740 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatat 11502839  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  11502840 cttttgggctcatcaaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 11502939  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaatac 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11502940 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaatac 11503020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 4769368 - 4769642
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769368 gtgacaagaagccgttgcaatttctgatttcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 4769467  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  4769468 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatg 4769567  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagag 281  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4769568 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagag 4769642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 44049844 - 44050121
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44049844 gtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatat 44049943  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44049944 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 44050043  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  44050044 tttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttaaatttgtgacacatgagaaagaggaa 44050121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 21472027 - 21472305
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21472027 gtgacaagaagtcgttgcaatatttaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatat 21472126  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaa-accaacatatacaggatgctaat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  21472127 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaacaccaacatgtacaagatgccaat 21472226  T
Q  206 gtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21472227 gtttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 21472305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4978785 - 4978508
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978785 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 4978686  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  4978685 cttttgggctcttccaacgtctgttaagttgtttaacaattttcgaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgtcaatg 4978586  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4978585 tttgaggtagttagggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgatacatgagaaagaggaa 4978508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 9891256 - 9891529
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  9891256 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 9891355  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  9891356 tttttggactcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 9891455  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9891456 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 9891529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 3405024 - 3405297
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  3405024 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 3405123  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  3405124 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttcaaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 3405223  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3405224 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatggcacatgagaaaga 3405297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19072484 - 19072211
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  19072484 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 19072385  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  19072384 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 19072285  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19072284 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 19072211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49565291 - 49565018
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  49565291 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 49565192  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  49565191 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 49565092  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49565091 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 49565018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 280
Target Start/End: Original strand, 41024445 - 41024706
Alignment:
Q  19 cgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  41024445 cgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctca 41024544  T
Q  119 tccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagtt 218  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||| |||    
T  41024545 tccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggtt 41024644  T
Q  219 ggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41024645 ggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 41024706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 6182927 - 6183174
Alignment:
Q  22 tgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 121  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| | | | | |||||| |||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  6182927 tgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttcaccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatcc 6183026  T
Q  122 aacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggg 221  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  6183027 aacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaactccatctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggg 6183126  T
Q  222 gtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgaca 269  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  6183127 gtcatctcgaccgatttgacaaatttagttggttttggatttttgaca 6183174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 51643320 - 51643211
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51643320 aagacgccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatctttt 51643221  T
Q  112 gggctcatcc 121  Q
    ||||||||||    
T  51643220 gggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591328
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||| ||||| || ||||||||| | || || |||| | |||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 1591267  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1591268 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttgtgac 1591328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716783
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 32716727  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggattt 263  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  32716728 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcattt 32716783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 34979910 - 34980006
Alignment:
Q  130 ttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcac 226  Q
    ||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||  | ||||| || |||||||||||||    
T  34979910 ttaagttgtttaacaattttctgtctattttggtcatggacttcacctataaaaccaacatgtacataatgtcattgtttgagatagttggggtcac 34980006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 268
Target Start/End: Original strand, 4617906 - 4618052
Alignment:
Q  122 aacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggg 221  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || |||| || | ||||| |  |||||||     
T  4617906 aacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggacgccattgtttgaaatagttgga 4618005  T
Q  222 gtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    ||||| || ||  |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  4618006 gtcacctcaacttatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 4618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11693474 - 11693442
Alignment:
Q  157 ttttggttatggactccacctacaaaaccaaca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11693474 ttttggtcatggactccacctacaaaaccaaca 11693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 17303 - 17580
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17303 gtgacaagaagccgttgaaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 17402  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17403 cttttaggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 17502  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17503 tttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 17580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 31147556 - 31147833
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147556 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 31147655  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  31147656 cttttgggctcatacaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatg 31147755  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31147756 tttgaggtagttgtgttcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 31147833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 18607230 - 18607507
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607230 gtgataagaagccgttgcaatatctaatttttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 18607329  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  18607330 cttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaata 18607429  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18607430 tttgaagtagttggggtcacttcgacagatttgacatattcgattgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaa 18607507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21358177 - 21357900
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358177 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 21358078  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21358077 attttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 21357978  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21357977 tttgaggtagttcgggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaa 21357900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23962159 - 23961882
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962159 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 23962060  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  23962059 attttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 23961960  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23961959 tttgaggtagttcgggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagaggaa 23961882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357829
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtataggatgcaaatgtttga 28357756  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28357757 ggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 28357829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29287757 - 29287503
Alignment:
Q  29 tctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcc 128  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287757 tctaatatcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcc 29287658  T
Q  129 gttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcactt 228  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29287657 gttaatttgtttaaaa-ttttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29287559  T
Q  229 cgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29287558 cgatcgatttgacatattcggttggatttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 29287503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1611578 - 1611305
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  1611578 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 1611479  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  1611478 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatttataggatgccaatg 1611379  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1611378 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 1611305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095623
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| | || || |||  | |||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatagaatgtcattgt 9095562  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  9095563 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 9095623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34111446 - 34111305
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacga-ttttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||| | |||||  || | ||||| | ||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||||  |||    
T  34111446 ttttgggctcatcttgaatcagttaagttgtttaacagttttctgacaaattttgatcatgtactccaactatcaaaccaacatgtacaagatgccgatg 34111347  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttg 248  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  34111346 tttaagatagttagggtcacctcagccgatatgacatatttg 34111305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24604916 - 24604639
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24604916 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatat 24604817  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24604816 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 24604717  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24604716 tttgaggtagttggggtcacttcgatcgattggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 24604639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1098653 - 1098376
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098653 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatat 1098554  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  1098553 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatg 1098454  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1098453 tttgaggtagttggggtcacatcgaccgatttgacataatcggttgggtttagatttgtgacacatgagaaagaggaa 1098376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 45476591 - 45476868
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476591 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 45476690  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  45476691 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 45476790  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45476791 tttgaggtagttggggtcacttcaaacgatctgacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 45476868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41007807 - 41007530
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007807 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 41007708  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  41007707 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttctcaacggttttgattatggactccacctacaaaactaacatgtacaggatgccaatg 41007608  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41007607 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgatatattcggttgggtttcgatttgtgacacatgagaaagaggaa 41007530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43949109 - 43948832
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949109 gtgacaagaagccgttgcgttatctaatctcgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 43949010  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  43949009 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 43948910  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43948909 tttgaggtagttggggtcacttctactgatttgacatattcggttgggtttgaatttgtgacacatgagaaagaggaa 43948832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34920609 - 34920332
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920609 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatttcgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 34920510  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  34920509 cttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatattccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 34920410  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34920409 tttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgatatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 34920332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 24750892 - 24751170
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24750892 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatat 24750991  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacat-atacaggatgctaat 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||    
T  24750992 cttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgttataggatgccaat 24751091  T
Q  206 gtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24751092 gtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 24751170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12907319 - 12907042
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12907319 gtgacaagaagccgttgcaatttcaaatttcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatat 12907220  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  12907219 cttttggactcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggatttggttatggacttcacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatg 12907120  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12907119 tttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggtttggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 12907042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 9655390 - 9655661
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655390 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgtcgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 9655489  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  9655490 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatg 9655589  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaa 278  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9655590 tttgaggtagttggggtcatttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtaacacatgagaaa 9655661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 436545 - 436823
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  436545 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatat 436644  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaat- 205  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  436645 cttttgggctcatctaacatcttttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatg 436744  T
Q  206 gtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  436745 gtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattccgttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 436823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27275187 - 27274910
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  27275187 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 27275088  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  27275087 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 27274988  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27274987 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 27274910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 212268 - 211995
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  212268 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 212169  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  212168 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 212069  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  212068 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 5348401 - 5348674
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  5348401 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 5348500  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  5348501 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 5348600  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5348601 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 5348674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 39795204 - 39795477
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||| || ||||||||    
T  39795204 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatat 39795303  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  39795304 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 39795403  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39795404 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 39795477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 41561246 - 41561519
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  41561246 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 41561345  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  41561346 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 41561445  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41561446 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 41561519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10623281 - 10623008
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  10623281 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 10623182  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  10623181 tttttgggctcatctaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 10623082  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10623081 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 10623008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17996977 - 17996722
Alignment:
Q  29 tctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcc 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17996977 tctaatctcaaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatcc 17996878  T
Q  129 gttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcactt 228  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |    
T  17996877 gttacgttgtttaacaatattccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgagatagttggggtcacct 17996778  T
Q  229 cgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17996777 cgaccgatttgacatatttggttggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 17996722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11692637 - 11692380
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  11692637 aagaagccgttgcaatatttaatctcgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatatttt 11692538  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||               ||||| |||||||||    
T  11692537 gggcccatccaacatccgttaagttgtttaagaattttccaacggttttggttatggactccacctacaa---------------gatgccaatgtttaa 11692453  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11692452 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcagttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 11692380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 38946997 - 38947270
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  38946997 gtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 38947096  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||||    
T  38947097 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataagatgccaatg 38947196  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38947197 tttgaggtagttggggtgacttcaactgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 38947270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28354729 - 28354549
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354729 gtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 28354630  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354629 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3802393 - 3802116
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  3802393 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 3802294  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  3802293 tttttgggctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 3802194  T
Q  207 -tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
     ||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3802193 ttttgaggtagtt-gggtgacttcaaccgacttgacatattcagttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaa 3802116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264487
Alignment:
Q  22 tgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 121  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  122 aacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggg 221  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtataggatgccaatgtttgatgtagttggg 7264428  T
Q  222 gtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7264429 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 7264487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24941355 - 24941200
Alignment:
Q  129 gttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24941355 gttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 24941256  T
Q  229 cgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24941255 cgatcgattggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 24941200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28423200 - 28423062
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||| | |||    
T  28423200 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaaaccaacttgtacatgatgccattgt 28423101  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  28423100 ttgaaatagttggagtcacctcaaccgatgtgacatatt 28423062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3353986 - 3353894
Alignment:
Q  129 gttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  3353986 gttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacaggatgttattgtttgagatagttggg 3353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 47062123 - 47062394
Alignment:
Q  12 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  47062123 aagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaaaa-cacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttc 47062221  T
Q  112 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |    
T  47062222 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaaatttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaaatgtacaagatgccaatgtttga 47062321  T
Q  212 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47062322 ggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaa 47062394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 18106622 - 18106895
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  18106622 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 18106721  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18106722 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgctaatg 18106821  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18106822 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 18106895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 42500641 - 42500914
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  42500641 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 42500740  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  42500741 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 42500840  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42500841 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 42500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 617576 - 617303
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  617576 gtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 617477  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  617476 tttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 617377  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  617376 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 617303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43827433 - 43827160
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43827433 gtgacaagaagccgttgcaatatcta-tctcgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatat 43827335  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  43827334 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacgtgtacaagatgccaatg 43827235  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcac-ttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43827234 tttgaggtagtttgggtcactttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacatatgagaaaga 43827160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 30787773 - 30788046
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  30787773 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 30787872  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  30787873 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 30787972  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30787973 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 30788046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43622962 - 43622689
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  43622962 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 43622863  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  43622862 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 43622763  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43622762 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 43622689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 45764613 - 45764886
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  45764613 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 45764712  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||    
T  45764713 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccagcatgtataggatgccaatg 45764812  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45764813 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 45764886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 280
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067396
Alignment:
Q  46 aggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaa 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  146 ttttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatat 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatat 15067361  T
Q  246 ttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15067362 ttggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 15067396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 8400832 - 8401008
Alignment:
Q  19 cgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctca 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  8400832 cgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctca 8400931  T
Q  119 tccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatataca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  8400932 tccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggatttcacctacaaaaccaacatgtaca 8401008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12117038 - 12116919
Alignment:
Q  165 atggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttg 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12117038 atggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcggccgatttgacatattcggttgggtttggatttg 12116939  T
Q  265 tgacacataagaaagaggaa 284  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  12116938 tgacacatgagaaagaggaa 12116919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378896
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||| |||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtataggattctattgt 43378935  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  43378934 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatt 43378896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794201
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| | |||| ||||| | |||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16794240  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  16794239 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatt 16794201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 40794258 - 40794418
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||   ||||| ||||| ||||||| |||| | || || |||| | |||    
T  40794258 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactattttgagaatggattccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 40794357  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  40794358 tttaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 40794418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 15060847 - 15060890
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggag 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15060847 gtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16795822 - 16795667
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||||||| ||| | |||| ||||| | |||    
T  16795822 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16795723  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggattt 263  Q
    || |  ||||||   ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  16795722 ttgaaatagttgaactcacttcaacctatttgacatattcggttggttttgcattt 16795667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172497
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||  ||||| | || || ||||| |||||||||||| | || || |||| | | |    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattat 45172536  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  45172535 ttgaaatagtttgagtcacttcgacctatttgacatatt 45172497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791798
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| | || || |||| | |||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatagaatgccattgt 46791759  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatt 246  Q
    || |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  46791760 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatt 46791798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445130
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||  ||  ||||| | ||||| ||||  |||||||||||| | || || |||| | |||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 40445192  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgaca 269  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||||    
T  40445191 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 40445130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297401
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaac 188  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaac 1297401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867065
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||  ||   |||| | ||||||||||| ||||||| |||| | || || |||| | |||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 47867126  T
Q  208 ttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    || |  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  47867125 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 47867065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8194006 - 8193913
Alignment:
Q  108 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgc 201  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||| | ||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  8194006 ttttggactcatccaacattggtaaagttgtttaataattttccgactgttttgataatgcattccacgtacaaaaccaacttgtacatgatgc 8193913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16184 - 15907
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  16184 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 16085  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16084 tttttgggctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatg 15985  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagaggaa 284  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  15984 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaatttatgacacatgagaaagaggaa 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 2115 - 2388
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  2115 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 2214  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  2215 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 2314  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2315 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 2388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 34043 - 34316
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatat 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  34043 gtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatat 34142  T
Q  107 cttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaattttccaacgattttggttatggactccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatg 206  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  34143 tttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatg 34242  T
Q  207 tttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaaga 280  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34243 tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 34316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 1
Alignment:
Q  192 tacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgacacataagaaagagga 283  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  92 tacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagagga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25611 - 25496
Alignment:
Q  169 actccacctacaaaaccaacatatacaggatgctaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttgattgggtttggatttgtgac 268  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  25611 actccatctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccaatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 25512  T
Q  269 acataagaaagaggaa 284  Q
    | || |||||||||||    
T  25511 atatgagaaagaggaa 25496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 90
Target Start/End: Original strand, 12497 - 12580
Alignment:
Q  7 gtgagaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagta 90  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12497 gtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University