View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20257_low_10 (Length: 345)

Name: NF20257_low_10
Description: NF20257
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20257_low_10
NF20257_low_10
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (18-335)||(10474116-10474434)
chr5 (78-335)||(24127024-24127283)
chr5 (86-335)||(2724061-2724311)
chr5 (87-335)||(658220-658464)
chr5 (87-335)||(37705644-37705891)
chr5 (87-335)||(17818352-17818601)
chr5 (78-335)||(18511064-18511323)
chr5 (78-335)||(41585588-41585855)
chr5 (70-335)||(40221690-40221963)
chr5 (92-335)||(1189474-1189720)
chr5 (78-335)||(20505695-20505952)
chr5 (85-315)||(26098146-26098380)
chr5 (78-332)||(2818186-2818443)
chr5 (78-335)||(18596813-18597071)
chr5 (78-335)||(21948194-21948460)
chr5 (108-335)||(26097900-26098127)
chr5 (78-321)||(36402178-36402425)
chr5 (109-335)||(18509201-18509429)
chr5 (78-311)||(21288953-21289185)
chr5 (78-335)||(36208744-36208999)
chr5 (78-335)||(25904271-25904528)
chr5 (78-335)||(39854651-39854913)
chr5 (69-335)||(16092044-16092311)
chr5 (93-335)||(17073051-17073298)
chr5 (78-334)||(2954586-2954841)
chr5 (78-321)||(6756674-6756919)
chr5 (83-334)||(31465846-31466089)
chr5 (87-335)||(696045-696292)
chr5 (78-335)||(6745236-6745499)
chr5 (83-335)||(6747473-6747730)
chr5 (84-335)||(16776326-16776580)
chr5 (77-335)||(25804193-25804456)
chr5 (89-335)||(25921333-25921584)
chr5 (85-332)||(12555773-12556032)
chr5 (78-287)||(20043206-20043416)
chr5 (78-335)||(18466852-18467115)
chr5 (78-335)||(27912704-27912967)
chr5 (87-335)||(38882274-38882509)
chr5 (78-335)||(27910618-27910864)
chr5 (87-335)||(10528955-10529210)
chr5 (87-335)||(34476910-34477163)
chr5 (87-335)||(34479275-34479528)
chr5 (87-335)||(21684310-21684562)
chr5 (86-335)||(2175087-2175323)
chr5 (69-332)||(18469182-18469449)
chr5 (87-335)||(10587000-10587236)
chr5 (87-335)||(4236797-4237049)
chr5 (78-335)||(39798215-39798460)
chr5 (86-317)||(20054021-20054251)
chr5 (87-335)||(6661053-6661297)
chr5 (177-321)||(31472563-31472710)
chr5 (78-334)||(38959980-38960241)
chr5 (135-335)||(39397915-39398104)
chr5 (87-335)||(10749869-10750121)
chr5 (69-335)||(31179212-31179481)
chr5 (78-335)||(3372985-3373247)
chr5 (87-333)||(15445135-15445376)
chr5 (87-335)||(4410191-4410442)
chr5 (87-335)||(10757345-10757597)
chr5 (87-335)||(9020386-9020633)
chr5 (210-334)||(23665213-23665337)
chr5 (210-334)||(23741844-23741968)
chr5 (210-334)||(23793250-23793374)
chr5 (69-190)||(34530558-34530679)
chr5 (95-198)||(20045292-20045395)
chr5 (89-298)||(31542939-31543153)
chr5 (210-334)||(15354560-15354684)
chr5 (210-334)||(15356836-15356960)
chr5 (154-335)||(15143634-15143817)
chr5 (86-335)||(15552414-15552668)
chr5 (210-335)||(31545249-31545374)
chr5 (159-319)||(4897913-4898071)
chr5 (221-330)||(23667492-23667601)
chr5 (260-335)||(17413202-17413278)
chr5 (85-144)||(15354429-15354487)
chr5 (85-144)||(15356705-15356763)
chr5 (85-144)||(23665411-23665469)
chr5 (85-144)||(23741712-23741770)
chr5 (85-144)||(23793118-23793176)
chr5 (86-308)||(2144437-2144647)
chr5 (289-335)||(34530731-34530777)
chr5 (157-317)||(34033503-34033660)
chr5 (288-335)||(42770978-42771025)
chr5 (225-263)||(19806493-19806531)
chr5 (225-263)||(32636954-32636992)
chr5 (225-273)||(9353376-9353425)
chr5 (225-273)||(17004004-17004053)
chr5 (225-269)||(31300644-31300689)
chr5 (225-273)||(36932394-36932443)
chr5 (219-289)||(42238376-42238448)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (78-332)||(2949087-2949341)
chr1 (78-335)||(31424870-31425128)
chr1 (78-335)||(11457330-11457588)
chr1 (69-335)||(17319055-17319322)
chr1 (78-335)||(25251129-25251388)
chr1 (85-335)||(14097830-14098083)
chr1 (78-335)||(18839755-18840014)
chr1 (78-335)||(50248425-50248685)
chr1 (86-335)||(12302367-12302618)
chr1 (97-335)||(18307277-18307516)
chr1 (78-335)||(47906438-47906696)
chr1 (78-335)||(50307397-50307659)
chr1 (78-335)||(31490081-31490337)
chr1 (78-332)||(6995548-6995810)
chr1 (78-335)||(41647088-41647347)
chr1 (78-335)||(25248406-25248665)
chr1 (85-335)||(27336799-27337052)
chr1 (78-336)||(39462686-39462948)
chr1 (78-335)||(17324486-17324749)
chr1 (78-332)||(28206920-28207176)
chr1 (92-335)||(13215249-13215496)
chr1 (78-335)||(23816054-23816315)
chr1 (78-335)||(4131229-4131493)
chr1 (78-335)||(16429125-16429379)
chr1 (86-335)||(9240950-9241199)
chr1 (116-335)||(50076566-50076785)
chr1 (85-335)||(27338990-27339243)
chr1 (69-335)||(15823714-15823985)
chr1 (83-335)||(38925341-38925591)
chr1 (78-335)||(40134112-40134370)
chr1 (86-335)||(51750207-51750461)
chr1 (87-335)||(15294694-15294947)
chr1 (78-335)||(25128040-25128299)
chr1 (94-335)||(17324231-17324484)
chr1 (92-332)||(28998116-28998363)
chr1 (92-332)||(29003832-29004079)
chr1 (78-336)||(16432561-16432813)
chr1 (78-335)||(31422714-31422986)
chr1 (78-333)||(39932243-39932506)
chr1 (111-335)||(16428821-16429043)
chr1 (83-335)||(17185992-17186241)
chr1 (78-332)||(47451813-47452057)
chr1 (78-335)||(10399677-10399941)
chr1 (87-335)||(2510202-2510438)
chr1 (78-335)||(6114961-6115216)
chr1 (87-335)||(13762005-13762257)
chr1 (78-335)||(46431556-46431820)
chr1 (193-335)||(3579587-3579729)
chr1 (78-335)||(31735373-31735634)
chr1 (153-335)||(6756694-6756877)
chr1 (87-335)||(2617684-2617939)
chr1 (86-335)||(14183470-14183705)
chr1 (105-335)||(28840848-28841083)
chr1 (78-331)||(15916562-15916813)
chr1 (78-335)||(24325831-24326093)
chr1 (87-200)||(50078653-50078766)
chr1 (183-335)||(50078779-50078934)
chr1 (212-335)||(6823182-6823306)
chr1 (87-335)||(28842663-28842915)
chr1 (78-335)||(9459285-9459529)
chr1 (78-335)||(9463112-9463356)
chr1 (69-335)||(23786008-23786279)
chr1 (87-298)||(13358778-13358995)
chr1 (87-335)||(20302627-20302863)
chr1 (78-308)||(51757725-51757965)
chr1 (87-335)||(30790266-30790514)
chr1 (87-251)||(13447133-13447301)
chr1 (87-335)||(18800439-18800686)
chr1 (78-212)||(3579439-3579572)
chr1 (78-335)||(8348913-8349165)
chr1 (210-335)||(51752532-51752657)
chr1 (87-335)||(20291625-20291878)
chr1 (78-335)||(16226336-16226599)
chr1 (83-335)||(8347139-8347386)
chr1 (108-335)||(15669281-15669507)
chr1 (86-335)||(47177531-47177785)
chr1 (86-335)||(47179882-47180136)
chr1 (177-335)||(42922398-42922556)
chr1 (195-333)||(49495182-49495322)
chr1 (78-189)||(30780361-30780474)
chr1 (78-335)||(16231732-16231994)
chr1 (87-192)||(25860270-25860371)
chr1 (86-333)||(28279436-28279680)
chr1 (86-335)||(13125326-13125571)
chr1 (87-335)||(16561635-16561878)
chr1 (259-335)||(21948225-21948301)
chr1 (177-319)||(27916681-27916822)
chr1 (157-335)||(30738561-30738743)
chr1 (195-335)||(26613211-26613353)
chr1 (247-308)||(155901-155963)
chr1 (277-335)||(48665346-48665404)
chr1 (205-316)||(13127669-13127782)
chr1 (87-163)||(51752715-51752789)
chr1 (251-332)||(43104332-43104414)
chr1 (225-278)||(47102880-47102934)
chr1 (163-247)||(26520061-26520143)
chr1 (219-289)||(2393277-2393348)
chr1 (225-263)||(834167-834205)
chr1 (86-147)||(10116125-10116184)
chr1 (225-274)||(13598402-13598452)
chr1 (225-263)||(28220226-28220264)
chr1 (225-263)||(28265554-28265592)
chr1 (225-263)||(45644354-45644392)
chr1 (225-273)||(9476265-9476314)
chr1 (225-273)||(19072932-19072981)
chr1 (225-273)||(19120822-19120871)
chr1 (219-297)||(21353342-21353423)
chr1 (225-273)||(26644941-26644990)
chr1 (225-273)||(47703980-47704029)
chr1 (225-269)||(196907-196951)
chr1 (225-268)||(4552637-4552681)
chr1 (87-158)||(26519305-26519373)
chr1 (225-268)||(31659362-31659406)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (86-335)||(19007784-19008034)
chr2 (78-335)||(14837411-14837671)
chr2 (78-335)||(6258670-6258928)
chr2 (65-335)||(22287176-22287447)
chr2 (83-335)||(28196781-28197032)
chr2 (78-335)||(6264001-6264260)
chr2 (87-335)||(22707613-22707864)
chr2 (86-335)||(17849261-17849511)
chr2 (117-335)||(22407346-22407565)
chr2 (78-333)||(21520542-21520802)
chr2 (92-335)||(42923373-42923620)
chr2 (78-335)||(43623431-43623691)
chr2 (90-289)||(3022362-3022562)
chr2 (98-335)||(5375218-5375457)
chr2 (78-313)||(22162877-22163111)
chr2 (87-335)||(28459054-28459301)
chr2 (93-335)||(23870960-23871205)
chr2 (105-335)||(17848585-17848814)
chr2 (78-335)||(27104942-27105204)
chr2 (140-335)||(44288982-44289179)
chr2 (91-249)||(15539396-15539553)
chr2 (78-335)||(45279850-45280095)
chr2 (99-335)||(7462819-7463059)
chr2 (87-335)||(23452094-23452348)
chr2 (141-335)||(40031968-40032169)
chr2 (78-335)||(34979442-34979690)
chr2 (86-335)||(13909902-13910155)
chr2 (210-335)||(42452925-42453050)
chr2 (78-336)||(11739429-11739672)
chr2 (78-335)||(36560989-36561251)
chr2 (97-335)||(17897125-17897357)
chr2 (90-335)||(24162084-24162333)
chr2 (87-335)||(19504194-19504457)
chr2 (69-335)||(36558720-36558974)
chr2 (86-335)||(11577974-11578220)
chr2 (210-335)||(19501996-19502122)
chr2 (105-335)||(42064659-42064878)
chr2 (177-335)||(18800267-18800425)
chr2 (185-335)||(22874274-22874425)
chr2 (108-335)||(31732666-31732888)
chr2 (155-335)||(20146540-20146720)
chr2 (87-190)||(38020370-38020473)
chr2 (86-335)||(35215449-35215696)
chr2 (78-335)||(45238850-45239088)
chr2 (86-335)||(35217826-35218073)
chr2 (78-335)||(45332028-45332291)
chr2 (78-199)||(38414036-38414156)
chr2 (158-315)||(35107458-35107618)
chr2 (156-319)||(40699534-40699697)
chr2 (86-263)||(20592295-20592467)
chr2 (78-158)||(22874431-22874511)
chr2 (78-309)||(37962799-37963027)
chr2 (87-164)||(42453798-42453874)
chr2 (87-158)||(19501859-19501930)
chr2 (225-263)||(17057369-17057407)
chr2 (225-263)||(17085352-17085390)
chr2 (155-263)||(8173547-8173653)
chr2 (294-335)||(27136195-27136236)
chr2 (219-268)||(42288105-42288154)
chr2 (222-319)||(13828338-13828438)
chr2 (225-273)||(21629948-21629996)
chr2 (225-263)||(723744-723782)
chr2 (225-263)||(11151591-11151629)
chr2 (225-274)||(14699050-14699100)
chr2 (225-263)||(34139770-34139808)
chr2 (86-240)||(35028814-35028959)
chr2 (225-263)||(39284966-39285004)
chr2 (219-271)||(1345587-1345640)
chr2 (219-271)||(2838076-2838129)
chr2 (225-273)||(8390194-8390243)
chr2 (225-273)||(13569332-13569381)
chr2 (260-308)||(33604092-33604141)
chr2 (249-289)||(17921887-17921927)
chr2 (276-335)||(20589835-20589895)
chr2 (249-289)||(37170778-37170818)
chr2 (92-124)||(42923315-42923347)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (69-332)||(2891516-2891781)
chr4 (78-335)||(38928032-38928288)
chr4 (78-335)||(36919437-36919695)
chr4 (78-335)||(36921346-36921604)
chr4 (78-335)||(22800713-22800973)
chr4 (87-309)||(47563009-47563230)
chr4 (78-335)||(40091267-40091526)
chr4 (78-332)||(14787282-14787539)
chr4 (78-316)||(27499283-27499528)
chr4 (78-335)||(22802585-22802845)
chr4 (83-335)||(33415347-33415599)
chr4 (90-335)||(40637296-40637545)
chr4 (78-335)||(12395698-12395956)
chr4 (78-335)||(12400660-12400918)
chr4 (78-335)||(24889018-24889278)
chr4 (78-335)||(13547376-13547635)
chr4 (78-335)||(16453531-16453788)
chr4 (85-335)||(4215528-4215775)
chr4 (87-335)||(17662108-17662356)
chr4 (92-335)||(47274948-47275190)
chr4 (86-289)||(6133105-6133309)
chr4 (78-335)||(48486541-48486801)
chr4 (125-335)||(24879211-24879425)
chr4 (78-289)||(14789281-14789495)
chr4 (87-335)||(36378514-36378761)
chr4 (78-335)||(37089220-37089482)
chr4 (78-335)||(5101151-5101396)
chr4 (78-335)||(16455463-16455706)
chr4 (125-335)||(24880673-24880889)
chr4 (87-335)||(5635334-5635587)
chr4 (78-335)||(14633540-14633802)
chr4 (78-321)||(24446510-24446738)
chr4 (85-335)||(22046542-22046796)
chr4 (78-335)||(6765066-6765327)
chr4 (87-335)||(36380571-36380818)
chr4 (78-335)||(11437585-11437847)
chr4 (87-335)||(8631276-8631530)
chr4 (83-335)||(11435177-11435434)
chr4 (87-335)||(24348440-24348676)
chr4 (85-335)||(22044247-22044501)
chr4 (78-336)||(619306-619559)
chr4 (78-333)||(19096107-19096362)
chr4 (78-335)||(47868623-47868886)
chr4 (87-335)||(2484731-2484983)
chr4 (83-335)||(37312937-37313177)
chr4 (78-335)||(49088791-49089036)
chr4 (85-335)||(51015468-51015722)
chr4 (78-335)||(9148475-9148719)
chr4 (78-335)||(53405357-53405618)
chr4 (87-335)||(31849456-31849709)
chr4 (86-263)||(52942346-52942526)
chr4 (87-335)||(5198642-5198879)
chr4 (87-335)||(7941545-7941798)
chr4 (86-335)||(18847376-18847628)
chr4 (72-335)||(30136771-30137031)
chr4 (87-335)||(38409427-38409679)
chr4 (83-335)||(41997714-41997962)
chr4 (89-335)||(22134476-22134727)
chr4 (87-335)||(11006111-11006347)
chr4 (87-335)||(8756119-8756363)
chr4 (87-335)||(19322915-19323161)
chr4 (86-335)||(38890090-38890337)
chr4 (87-335)||(11008425-11008676)
chr4 (91-335)||(18537345-18537586)
chr4 (89-335)||(26085836-26086087)
chr4 (86-335)||(25357863-25358107)
chr4 (87-335)||(9174003-9174256)
chr4 (78-260)||(3937134-3937309)
chr4 (78-335)||(16931639-16931899)
chr4 (87-335)||(9176331-9176584)
chr4 (86-335)||(18409209-18409458)
chr4 (91-335)||(18534703-18534944)
chr4 (90-335)||(16185707-16185946)
chr4 (78-335)||(44599688-44599948)
chr4 (85-245)||(3824464-3824630)
chr4 (87-335)||(12102309-12102550)
chr4 (87-319)||(28453920-28454151)
chr4 (89-335)||(22132248-22132502)
chr4 (87-335)||(15032410-15032660)
chr4 (78-332)||(56030669-56030937)
chr4 (78-335)||(22780220-22780483)
chr4 (86-335)||(18709020-18709274)
chr4 (78-335)||(16933996-16934253)
chr4 (85-335)||(22782592-22782848)
chr4 (245-335)||(13544181-13544272)
chr4 (229-335)||(47210756-47210863)
chr4 (155-335)||(47150826-47151005)
chr4 (84-319)||(9863945-9864182)
chr4 (88-191)||(47210655-47210755)
chr4 (206-333)||(3982156-3982286)
chr4 (84-319)||(10113108-10113337)
chr4 (70-319)||(31983383-31983623)
chr4 (225-274)||(54867188-54867237)
chr4 (87-217)||(5664576-5664706)
chr4 (92-170)||(38270016-38270091)
chr4 (155-309)||(22295412-22295565)
chr4 (200-289)||(31300540-31300630)
chr4 (283-335)||(3824629-3824681)
chr4 (283-335)||(5637524-5637576)
chr4 (225-273)||(31985678-31985726)
chr4 (194-289)||(5336747-5336846)
chr4 (222-319)||(26557823-26557922)
chr4 (215-273)||(4874469-4874528)
chr4 (200-289)||(4884990-4885081)
chr4 (219-273)||(15317090-15317145)
chr4 (86-144)||(52043427-52043483)
chr4 (225-274)||(10047383-10047433)
chr4 (225-263)||(12739550-12739588)
chr4 (86-124)||(18311232-18311270)
chr4 (225-263)||(26175636-26175674)
chr4 (225-263)||(36463389-36463427)
chr4 (225-274)||(39245998-39246048)
chr4 (225-263)||(48893638-48893676)
chr4 (225-273)||(5396715-5396764)
chr4 (219-289)||(8529383-8529455)
chr4 (195-273)||(10114601-10114680)
chr4 (226-273)||(36315273-36315321)
chr4 (226-273)||(36329482-36329530)
chr4 (225-268)||(52467354-52467398)
[»] chr3 (118 HSPs)
chr3 (87-335)||(1626543-1626792)
chr3 (87-332)||(27635515-27635764)
chr3 (78-335)||(36011975-36012235)
chr3 (78-335)||(1313557-1313814)
chr3 (78-335)||(43421268-43421524)
chr3 (78-335)||(53915346-53915605)
chr3 (83-335)||(53917519-53917773)
chr3 (78-335)||(43423316-43423572)
chr3 (78-335)||(5926617-5926873)
chr3 (69-335)||(45883087-45883358)
chr3 (78-335)||(4308130-4308390)
chr3 (78-335)||(3314832-3315092)
chr3 (86-335)||(6484508-6484757)
chr3 (83-312)||(12267832-12268061)
chr3 (87-335)||(53468313-53468565)
chr3 (86-335)||(880312-880560)
chr3 (87-335)||(51674626-51674875)
chr3 (78-335)||(18099018-18099279)
chr3 (86-335)||(32219232-32219486)
chr3 (78-335)||(27101030-27101290)
chr3 (85-335)||(32263896-32264148)
chr3 (78-335)||(47701528-47701780)
chr3 (78-335)||(3306909-3307168)
chr3 (99-332)||(51943521-51943758)
chr3 (78-335)||(18096748-18097009)
chr3 (83-335)||(47148758-47149004)
chr3 (85-335)||(25688015-25688270)
chr3 (87-335)||(42990452-42990701)
chr3 (78-335)||(24979855-24980118)
chr3 (83-335)||(43228439-43228692)
chr3 (78-335)||(28101856-28102111)
chr3 (97-332)||(48361538-48361777)
chr3 (85-335)||(4666664-4666913)
chr3 (78-335)||(9604455-9604716)
chr3 (87-335)||(10955883-10956136)
chr3 (87-299)||(41849243-41849454)
chr3 (87-335)||(1321627-1321881)
chr3 (78-335)||(43226233-43226487)
chr3 (78-335)||(18162811-18163072)
chr3 (78-321)||(53591346-53591589)
chr3 (78-335)||(54691425-54691683)
chr3 (87-335)||(10958179-10958432)
chr3 (78-272)||(15781090-15781285)
chr3 (87-335)||(6231948-6232192)
chr3 (87-335)||(10084245-10084498)
chr3 (141-335)||(39715617-39715809)
chr3 (78-335)||(25533590-25533834)
chr3 (85-335)||(5899820-5900074)
chr3 (85-335)||(5886347-5886601)
chr3 (87-335)||(51726863-51727116)
chr3 (87-333)||(5191803-5192052)
chr3 (78-335)||(17795406-17795661)
chr3 (78-335)||(19103846-19104101)
chr3 (78-335)||(23633602-23633854)
chr3 (86-246)||(28181242-28181401)
chr3 (88-335)||(38890188-38890441)
chr3 (87-335)||(11168249-11168503)
chr3 (177-335)||(30005989-30006150)
chr3 (68-335)||(28761285-28761538)
chr3 (162-335)||(42992418-42992594)
chr3 (86-334)||(25389055-25389309)
chr3 (87-335)||(10191168-10191419)
chr3 (108-319)||(26720711-26720928)
chr3 (87-335)||(5522482-5522735)
chr3 (210-335)||(11170552-11170678)
chr3 (87-335)||(4103752-4104004)
chr3 (78-318)||(31151508-31151746)
chr3 (85-335)||(3859676-3859914)
chr3 (87-335)||(561640-561886)
chr3 (69-335)||(746906-747178)
chr3 (87-335)||(25634035-25634278)
chr3 (87-265)||(42992605-42992783)
chr3 (78-335)||(7606451-7606696)
chr3 (78-238)||(880092-880251)
chr3 (69-274)||(53893892-53894105)
chr3 (78-335)||(38210519-38210781)
chr3 (69-335)||(50494148-50494418)
chr3 (87-335)||(22114159-22114414)
chr3 (78-335)||(6065641-6065904)
chr3 (233-335)||(889779-889882)
chr3 (87-335)||(458433-458686)
chr3 (78-335)||(10621374-10621638)
chr3 (210-290)||(35919098-35919179)
chr3 (87-335)||(456056-456309)
chr3 (86-335)||(36871166-36871410)
chr3 (87-335)||(25635529-25635772)
chr3 (197-335)||(24181528-24181668)
chr3 (78-335)||(6063291-6063554)
chr3 (131-247)||(8183040-8183154)
chr3 (262-335)||(29956834-29956907)
chr3 (227-335)||(35917944-35918052)
chr3 (155-281)||(1674166-1674292)
chr3 (78-335)||(28412878-28413140)
chr3 (231-335)||(13420189-13420295)
chr3 (86-332)||(1620328-1620567)
chr3 (87-335)||(53597384-53597628)
chr3 (241-286)||(28181185-28181230)
chr3 (195-319)||(14634408-14634535)
chr3 (87-191)||(11170670-11170772)
chr3 (271-320)||(54884317-54884367)
chr3 (249-332)||(11007545-11007630)
chr3 (219-289)||(47878165-47878237)
chr3 (225-264)||(5236457-5236496)
chr3 (225-274)||(1736338-1736388)
chr3 (206-289)||(10612761-10612844)
chr3 (225-274)||(18552916-18552966)
chr3 (225-274)||(30709823-30709873)
chr3 (182-308)||(31021120-31021244)
chr3 (225-263)||(32744436-32744474)
chr3 (225-263)||(40913423-40913461)
chr3 (225-263)||(44331675-44331713)
chr3 (225-273)||(8370520-8370569)
chr3 (225-273)||(21711227-21711276)
chr3 (225-273)||(27974986-27975035)
chr3 (225-273)||(27986480-27986529)
chr3 (225-274)||(40844656-40844705)
chr3 (218-265)||(29845141-29845189)
chr3 (219-263)||(30236255-30236299)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (87-335)||(30480365-30480614)
chr8 (86-321)||(33541271-33541507)
chr8 (78-335)||(14419043-14419302)
chr8 (78-335)||(15072935-15073194)
chr8 (86-335)||(14807975-14808235)
chr8 (83-332)||(41382889-41383141)
chr8 (78-335)||(15068205-15068464)
chr8 (78-332)||(41384971-41385225)
chr8 (86-335)||(28251427-28251678)
chr8 (87-335)||(36865759-36866012)
chr8 (83-279)||(37214122-37214319)
chr8 (78-335)||(25952744-25953002)
chr8 (84-334)||(15185578-15185825)
chr8 (70-335)||(13858334-13858595)
chr8 (78-335)||(15956181-15956435)
chr8 (78-335)||(27106755-27107008)
chr8 (78-335)||(28283070-28283330)
chr8 (89-335)||(1225390-1225626)
chr8 (78-321)||(35872309-35872537)
chr8 (84-335)||(3874234-3874473)
chr8 (78-290)||(14477519-14477732)
chr8 (87-335)||(27829521-27829774)
chr8 (87-335)||(15809442-15809695)
chr8 (78-335)||(43530339-43530601)
chr8 (87-335)||(27827210-27827463)
chr8 (86-335)||(5372042-5372289)
chr8 (86-320)||(22684509-22684749)
chr8 (87-335)||(4424242-4424496)
chr8 (87-335)||(32339533-32339787)
chr8 (78-335)||(21482534-21482790)
chr8 (193-335)||(27911238-27911380)
chr8 (193-335)||(27957657-27957799)
chr8 (87-335)||(31162433-31162683)
chr8 (78-335)||(21480726-21480982)
chr8 (87-335)||(2467995-2468241)
chr8 (87-335)||(608958-609214)
chr8 (78-335)||(18810932-18811194)
chr8 (89-335)||(44721068-44721318)
chr8 (132-241)||(181798-181905)
chr8 (78-335)||(18813106-18813368)
chr8 (86-335)||(43082198-43082451)
chr8 (87-335)||(3005502-3005743)
chr8 (86-335)||(43079827-43080080)
chr8 (86-319)||(31578148-31578373)
chr8 (84-200)||(27911439-27911553)
chr8 (84-200)||(27957858-27957972)
chr8 (78-193)||(3883444-3883556)
chr8 (155-335)||(31035342-31035522)
chr8 (193-319)||(6376229-6376356)
chr8 (263-316)||(14419732-14419786)
chr8 (78-335)||(24873047-24873291)
chr8 (86-273)||(31566425-31566605)
chr8 (224-319)||(16833789-16833886)
chr8 (260-335)||(181726-181798)
chr8 (260-318)||(3896063-3896122)
chr8 (78-136)||(183244-183302)
chr8 (86-289)||(17847789-17847986)
chr8 (219-263)||(10930193-10930237)
chr8 (228-268)||(18106084-18106124)
chr8 (219-289)||(23179555-23179627)
chr8 (225-263)||(15212916-15212954)
chr8 (225-263)||(27811408-27811446)
chr8 (225-263)||(33352280-33352318)
chr8 (225-263)||(40321210-40321248)
chr8 (226-263)||(4733836-4733873)
chr8 (225-273)||(9765863-9765912)
chr8 (225-273)||(19752438-19752487)
chr8 (225-273)||(26403274-26403323)
chr8 (232-268)||(1292471-1292507)
chr8 (87-123)||(2467797-2467833)
chr8 (87-123)||(2467896-2467932)
chr8 (225-268)||(12702634-12702678)
chr8 (219-289)||(17799418-17799490)
chr8 (225-261)||(43036555-43036591)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (87-335)||(14247-14493)
scaffold0131 (204-335)||(15196-15326)
scaffold0131 (78-114)||(15395-15431)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (78-335)||(9020129-9020390)
chr6 (65-335)||(3629706-3629975)
chr6 (78-335)||(3631792-3632049)
chr6 (78-335)||(11982880-11983140)
chr6 (84-335)||(30728683-30728939)
chr6 (70-335)||(15346550-15346813)
chr6 (95-335)||(1069588-1069830)
chr6 (78-335)||(24338303-24338558)
chr6 (78-335)||(15367234-15367490)
chr6 (69-335)||(32280199-32280464)
chr6 (78-335)||(13057397-13057651)
chr6 (160-335)||(13039957-13040132)
chr6 (86-335)||(1230105-1230360)
chr6 (83-334)||(15541003-15541250)
chr6 (87-335)||(28241179-28241432)
chr6 (78-335)||(3233575-3233841)
chr6 (177-335)||(12161510-12161668)
chr6 (90-335)||(14507037-14507286)
chr6 (86-335)||(4816087-4816342)
chr6 (78-334)||(14466527-14466783)
chr6 (152-335)||(12186000-12186183)
chr6 (78-335)||(14458615-14458878)
chr6 (85-335)||(26065186-26065440)
chr6 (85-335)||(26085155-26085409)
chr6 (87-335)||(2628743-2628996)
chr6 (87-335)||(30967404-30967657)
chr6 (87-335)||(30034463-30034714)
chr6 (187-306)||(10584227-10584348)
chr6 (78-335)||(26068243-26068505)
chr6 (78-335)||(29754557-29754819)
chr6 (88-335)||(19704422-19704679)
chr6 (69-335)||(26065960-26066234)
chr6 (217-335)||(15532674-15532792)
chr6 (206-335)||(3390582-3390713)
chr6 (87-334)||(33309061-33309313)
chr6 (66-335)||(3027699-3027965)
chr6 (86-335)||(20915213-20915466)
chr6 (87-334)||(33311330-33311582)
chr6 (78-211)||(3394695-3394829)
chr6 (78-233)||(22490921-22491071)
chr6 (83-335)||(26932416-26932672)
chr6 (87-319)||(25465460-25465686)
chr6 (83-335)||(26945347-26945597)
chr6 (155-308)||(12937126-12937278)
chr6 (65-335)||(5273050-5273326)
chr6 (87-319)||(19696659-19696887)
chr6 (205-335)||(25477477-25477616)
chr6 (68-335)||(12195352-12195625)
chr6 (177-335)||(15719845-15720004)
chr6 (86-218)||(15530022-15530156)
chr6 (162-308)||(22857893-22858038)
chr6 (78-335)||(17012243-17012494)
chr6 (78-155)||(18322482-18322558)
chr6 (204-335)||(25078537-25078669)
chr6 (222-335)||(16455421-16455537)
chr6 (267-335)||(15530166-15530233)
chr6 (87-192)||(6610378-6610478)
chr6 (78-144)||(8717203-8717268)
chr6 (78-198)||(25480219-25480338)
chr6 (86-319)||(28078063-28078291)
chr6 (87-217)||(22610999-22611122)
chr6 (157-289)||(30443537-30443670)
chr6 (222-335)||(28037722-28037841)
chr6 (219-289)||(3577484-3577555)
chr6 (200-308)||(12911421-12911531)
chr6 (233-333)||(30445729-30445832)
chr6 (289-335)||(22490843-22490889)
chr6 (78-123)||(13040179-13040224)
chr6 (177-217)||(26505339-26505379)
chr6 (219-289)||(13467461-13467532)
chr6 (87-125)||(10584357-10584395)
chr6 (225-263)||(33211185-33211223)
chr6 (225-273)||(5757522-5757571)
chr6 (225-273)||(21356040-21356089)
chr6 (225-274)||(22963704-22963753)
chr6 (225-274)||(23824640-23824689)
chr6 (225-273)||(31936591-31936640)
chr6 (225-268)||(603088-603132)
chr6 (225-261)||(16569154-16569190)
chr6 (219-289)||(17694846-17694918)
chr6 (219-289)||(25941785-25941857)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (78-335)||(13099325-13099587)
chr7 (92-335)||(44724757-44725000)
chr7 (99-335)||(21592018-21592254)
chr7 (95-332)||(21990331-21990570)
chr7 (85-335)||(443773-444027)
chr7 (87-335)||(31434910-31435158)
chr7 (78-335)||(4295789-4296045)
chr7 (78-335)||(42330854-42331108)
chr7 (90-335)||(27306096-27306341)
chr7 (78-335)||(9680998-9681257)
chr7 (83-335)||(9679237-9679491)
chr7 (85-335)||(37411982-37412238)
chr7 (86-335)||(11355436-11355688)
chr7 (95-335)||(39145856-39146098)
chr7 (87-335)||(24748772-24749017)
chr7 (78-334)||(21678245-21678498)
chr7 (78-335)||(21680205-21680464)
chr7 (86-335)||(42223336-42223584)
chr7 (78-335)||(20626216-20626473)
chr7 (78-335)||(20630107-20630364)
chr7 (78-335)||(20642526-20642783)
chr7 (87-335)||(7092070-7092323)
chr7 (78-335)||(7471829-7472091)
chr7 (78-335)||(38394164-38394426)
chr7 (69-335)||(22393900-22394162)
chr7 (78-335)||(44742-45004)
chr7 (85-335)||(40836599-40836853)
chr7 (87-335)||(48457831-48458084)
chr7 (177-335)||(20137063-20137220)
chr7 (83-335)||(20299638-20299895)
chr7 (92-245)||(22251452-22251605)
chr7 (83-335)||(26295625-26295872)
chr7 (87-335)||(7094317-7094571)
chr7 (83-262)||(26804762-26804942)
chr7 (78-335)||(28487731-28487993)
chr7 (88-335)||(1850159-1850411)
chr7 (78-335)||(20297540-20297802)
chr7 (78-335)||(28485744-28486005)
chr7 (83-335)||(35807-36064)
chr7 (78-335)||(3035902-3036164)
chr7 (78-335)||(7469872-7470133)
chr7 (69-335)||(25542707-25542977)
chr7 (92-335)||(18345719-18345967)
chr7 (87-335)||(43253374-43253628)
chr7 (87-335)||(24813364-24813610)
chr7 (78-335)||(27832496-27832744)
chr7 (89-335)||(40946506-40946759)
chr7 (78-271)||(11759369-11759567)
chr7 (78-335)||(3878755-3879019)
chr7 (78-335)||(24465715-24465967)
chr7 (87-335)||(38396813-38397070)
chr7 (68-334)||(1606559-1606829)
chr7 (86-321)||(7188731-7188962)
chr7 (212-335)||(1049283-1049406)
chr7 (87-335)||(2935447-2935700)
chr7 (78-334)||(9027042-9027303)
chr7 (212-335)||(1046912-1047035)
chr7 (210-334)||(22108246-22108370)
chr7 (210-334)||(22137257-22137381)
chr7 (86-335)||(25276319-25276550)
chr7 (210-334)||(40550006-40550130)
chr7 (210-334)||(40552284-40552408)
chr7 (86-335)||(7351508-7351762)
chr7 (87-335)||(24817219-24817465)
chr7 (199-335)||(24258641-24258783)
chr7 (210-335)||(31155896-31156021)
chr7 (181-319)||(11081703-11081842)
chr7 (156-335)||(6332398-6332574)
chr7 (129-316)||(16296932-16297115)
chr7 (260-335)||(20091583-20091656)
chr7 (86-215)||(6349097-6349220)
chr7 (106-263)||(20091041-20091194)
chr7 (86-335)||(7349134-7349383)
chr7 (187-289)||(6067159-6067264)
chr7 (283-335)||(11757408-11757460)
chr7 (264-335)||(22828672-22828744)
chr7 (85-144)||(40550204-40550262)
chr7 (228-274)||(55955-56001)
chr7 (225-273)||(9190052-9190101)
chr7 (68-144)||(22137454-22137529)
chr7 (157-271)||(40281316-40281430)
chr7 (68-144)||(40552481-40552556)
chr7 (86-150)||(1046774-1046839)
chr7 (86-217)||(6049170-6049295)
chr7 (225-274)||(20284093-20284143)
chr7 (225-263)||(27347947-27347985)
chr7 (225-263)||(41317434-41317472)
chr7 (225-274)||(46516353-46516403)
chr7 (225-273)||(2580394-2580443)
chr7 (225-273)||(21983288-21983337)
chr7 (219-268)||(26417440-26417489)
chr7 (225-273)||(29159807-29159856)
chr7 (225-262)||(43864375-43864412)
chr7 (86-155)||(1049146-1049216)
chr7 (87-139)||(1502832-1502883)
chr7 (219-289)||(2075231-2075303)
chr7 (225-273)||(5817314-5817362)
chr7 (219-289)||(7464513-7464585)
chr7 (225-268)||(14069833-14069877)
chr7 (225-268)||(14379861-14379905)
chr7 (87-123)||(25357324-25357360)
chr7 (219-289)||(25410246-25410318)
chr7 (233-269)||(31519027-31519063)
chr7 (219-289)||(34546874-34546946)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (78-332)||(52191-52448)
scaffold0005 (78-289)||(50235-50449)
scaffold0005 (78-335)||(183490-183752)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (78-335)||(79362-79623)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (78-335)||(80036-80297)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (92-335)||(4173-4415)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (78-335)||(85407-85665)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (78-335)||(11322-11584)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (87-335)||(41341-41594)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (78-289)||(35817-36031)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (87-335)||(69149-69402)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (87-335)||(29348-29600)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (80-335)||(1303-1563)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (87-335)||(1509-1754)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (78-335)||(6377-6638)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (210-334)||(22294-22418)
scaffold0140 (210-334)||(24569-24693)
scaffold0140 (85-144)||(22491-22549)
scaffold0140 (85-144)||(24766-24824)
scaffold0140 (225-273)||(8463-8512)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (78-259)||(1300-1485)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (88-335)||(219-455)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (87-335)||(3057-3309)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (177-335)||(15775-15933)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (86-335)||(16516-16762)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (87-274)||(4535-4729)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (78-193)||(12723-12835)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (259-335)||(2218-2294)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (225-263)||(20415-20453)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (225-274)||(5687-5737)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (83-124)||(9-49)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Original strand, 10474116 - 10474434
Alignment:
Q  18 tttgtttgttaaaatgaacttaaagaaagactatgatttaaataaacctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10474116 tttgtttgttaaaatgaacttaaagaaagactatgatttaaataaacctatgtgttgtgtattcgatgaaaaattacatcaataataaacttgatgtgtg 10474215  T
Q  118 gagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10474216 gagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaaaggaagagagaacaca 10474315  T
Q  218 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatat 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10474316 aaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatat 10474415  T
Q  317 caatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||| ||| |||||    
T  10474416 caatgggttacaaaaataa 10474434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24127283 - 24127024
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  24127283 attcgatgaaaaatcacacaaataacaaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacataagtc 24127184  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24127183 aaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 24127084  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24127083 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 24127024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2724311 - 2724061
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2724311 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 2724212  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2724211 aaacagcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttca 2724112  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2724111 ctatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 2724061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 658220 - 658464
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  658220 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaacataagccaaaagtagaa 658319  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcact 286  Q
    ||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  658320 aaca--gcaagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--gagagcagccatccgtttcact 658415  T
Q  287 atatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  658416 atatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 658464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 37705644 - 37705891
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  37705644 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaacacaagccaaaagtagaa 37705743  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  37705744 aacagcgagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcac 37705841  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37705842 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 37705891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 17818352 - 17818601
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17818352 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 17818451  T
Q  187 aacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||| ||    
T  17818452 aacagcgagagagagaaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggg-gagagaagccctctgttcca 17818550  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17818551 ctgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17818601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 18511064 - 18511323
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  18511064 attcgatgataaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcaa 18511163  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18511164 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 18511263  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18511264 tccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 18511323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 41585588 - 41585855
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  41585588 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 41585687  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaga---------gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41585688 aaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagag 41585787  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  41585788 agcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgacttacaaaaataa 41585855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40221963 - 40221690
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221963 tgttgtaaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 40221864  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggg 262  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||      |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40221863 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 40221764  T
Q  263 gagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40221763 gagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40221690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Original strand, 1189474 - 1189720
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||      
T  1189474 cacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactg 1189573  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg--ggagagagcagccatccgtttcactat- 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||     
T  1189574 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactata 1189673  T
Q  289 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1189674 attatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1189720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 20505695 - 20505952
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20505695 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaag 20505794  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20505795 ccaaaactagaaaacaacgagagaaaat--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagcagcc 20505891  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20505892 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 20505952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Original strand, 26098146 - 26098380
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26098146 gaaaactcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 26098245  T
Q  185 aaaacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  26098246 aaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgt 26098345  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagata 315  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098346 ttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 2818186 - 2818443
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  2818186 attcgatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 2818284  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2818285 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagt 2818384  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2818385 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 2818443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18597071 - 18596813
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  18597071 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 18596972  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18596971 aaagtagaaaaca--gcgagagaaaagaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagcca 18596874  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18596873 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataa 18596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21948460 - 21948194
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21948460 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagc 21948361  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
     |||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21948360 caaaagtagaaaatagcgagagagagggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagaga 21948261  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  21948260 gcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataa 21948194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097900
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttaca 26097929  T
Q  307 aaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26097928 aaagagatatcaatgagttacaagaataa 26097900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 321
Target Start/End: Original strand, 36402178 - 36402425
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  36402178 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaacacaagct 36402277  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  36402278 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcaga 36402377  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36402378 catctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 36402425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 109 - 335
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509429
Alignment:
Q  109 tgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaag 207  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttaca 18509400  T
Q  307 aaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18509401 aaatagatatcaacgagttacaagaataa 18509429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21289185 - 21288953
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  21289185 attcgatgaaaaatcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagcca 21289086  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21289085 aaagtagaaaacaacgagagaacaa--aagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 21288988  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21288987 ccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaaga 21288953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36208999 - 36208744
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |    
T  36208999 attcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatcacaagcca 36208900  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |    
T  36208899 aaagtagaaaacaacga--gagaaagaaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaaagagcagcccgc 36208803  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36208802 cgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36208744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25904528 - 25904271
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  25904528 attcgatgagaaaacacacca-taataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaacca 25904430  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25904429 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 25904330  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25904329 ccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataa 25904271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39854913 - 39854651
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| | || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  39854913 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 39854814  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39854813 aaaagtaaaaaacaacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcag 39854714  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39854713 ccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 39854651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 16092044 - 16092311
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16092044 gtgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataacaaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaa 16092142  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  16092143 cgcaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagag 16092242  T
Q  268 agcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16092243 agcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataa 16092311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17073298 - 17073051
Alignment:
Q  93 acaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa- 191  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  17073298 acaccaataataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaac 17073199  T
Q  192 --cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat 288  Q
      ||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17073198 agcgagagaaaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactat 17073099  T
Q  289 -atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17073098 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17073051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2954841 - 2954586
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattata-aacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||     
T  2954841 attcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaagcc 2954742  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||     
T  2954741 aaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccc 2954644  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2954643 tccgcttcactatatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaagaata 2954586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6756919 - 6756674
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||     
T  6756919 attcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcc 6756820  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  6756819 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccc 6756720  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6756719 t-cgtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg 6756674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 31465846 - 31466089
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31465846 atgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaag 31465945  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||          
T  31465946 tagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc------ 31466039  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
        |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31466040 ----ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata 31466089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 696292 - 696045
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaa-acaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  696292 aaaatcataccaataacagacttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaaac-aaaagtaga 696194  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  696193 aaacaac---agagaaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttca 696097  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  696096 ctataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 696045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6745499 - 6745236
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6745499 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaag 6745400  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagca 271  Q
    | |||||| ||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6745399 ccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagca 6745300  T
Q  272 gccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6745299 gccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6745236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6747730 - 6747473
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaa 179  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6747730 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaa 6747631  T
Q  180 agtagaaaacaac-gagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  6747630 agtcgaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccct 6747531  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6747530 ccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataa 6747473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16776580 - 16776326
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| || | |||| |||||||    
T  16776580 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattat-aatacaagccaaaagta 16776482  T
Q  184 gaaaacaa---cgagagagaaagga-agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    ||||||||   ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||    
T  16776481 gaaaacaacagcgagagaaaaagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctcc 16776382  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16776381 gatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-gttacaagaataa 16776326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25804456 - 25804193
Alignment:
Q  77 tattccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||    
T  25804456 tattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agc 25804360  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804359 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 25804260  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  25804259 gcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25804193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 25921333 - 25921584
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||    
T  25921333 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaa 25921429  T
Q  189 caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  25921430 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgt 25921529  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  25921530 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 332
Target Start/End: Original strand, 12555773 - 12556032
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  12555773 gaaaactcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtag 12555872  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaa----------ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  12555873 aaaacaacgagagagaaaagaagagaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagc 12555972  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttac-aaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | |||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12555973 cctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 12556032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20043416 - 20043206
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataa-tcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  20043416 attcaatgagaaaacacatcaataacaaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 20043317  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20043316 aaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaacca 20043218  T
Q  276 tccgtttcacta 287  Q
    | ||||||||||    
T  20043217 ttcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18467115 - 18466852
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  18467115 attcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcca 18467018  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18467017 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 18466918  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||  |||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18466917 cagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18466852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27912967 - 27912704
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  27912967 attcgatgaaaaatcccaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcta 27912870  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27912869 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 27912770  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||   || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27912769 cagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27912704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38882509 - 38882274
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38882509 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38882413  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  38882412 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccac 38882323  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38882322 tatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38882274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27910864 - 27910618
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  27910864 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatacaagcta 27910767  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||| ||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |    
T  27910766 aaagtataaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctct 27910677  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27910676 ccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27910618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 10528955 - 10529210
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10528955 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10529051  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccat 276  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10529052 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcctt 10529151  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10529152 ccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10529210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 34476910 - 34477163
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  34476910 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 34477006  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34477007 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 34477106  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34477107 cgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34477163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 34479275 - 34479528
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||  ||| |||||||||    
T  34479275 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaatgca--agccaaaagtaga 34479371  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34479372 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 34479471  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34479472 cgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 34479528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 21684310 - 21684562
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||||||    
T  21684310 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aataaaagccaaaagtagaa 21684406  T
Q  187 aacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||| |||||||       |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21684407 aacaacg-gagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 21684505  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21684506 cgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 21684562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2175323 - 2175087
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  2175323 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtaga 2175227  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  2175226 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2175137  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2175136 ctatatgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2175087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18469449 - 18469182
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  18469449 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaa 18469352  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 260  Q
     | |||| ||||||||||||||||| | ||||       || |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  18469351 tacaagccaaaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct- 18469254  T
Q  261 gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  18469253 gggagagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 18469182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10587236 - 10587000
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||  ||||||||||    
T  10587236 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagga-taatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagtcaaaagtagaa 10587140  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||    
T  10587139 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatcca 10587050  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  10587049 ctatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttaaaagaataa 10587000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4237049 - 4236797
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  4237049 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 4236953  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    |  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  4236952 aacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctcc 4236854  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4236853 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4236797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39798460 - 39798215
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  39798460 attcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 39798364  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  39798363 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccct 39798274  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  39798273 ccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 39798215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20054251 - 20054021
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| || | |||||||||    
T  20054251 aaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaacacaaac-aaaagtaga 20054155  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||      
T  20054154 aaacgaagagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttct 20054056  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatc 317  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20054055 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatc 20054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 6661053 - 6661297
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  6661053 aaaatcacaccaattaaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgga--agttataaacacaagc-aaaagtagaa 6661149  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |||| |   |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  6661150 aacaacgagaga-aaagaaagagaacacacga---aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttcca 6661245  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6661246 ctataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6661297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 321
Target Start/End: Original strand, 31472563 - 31472710
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaa-aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  31472563 aaaattagaaaacaatgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaacc 31472662  T
Q  275 atccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31472663 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31472710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 334
Target Start/End: Original strand, 38959980 - 38960241
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  38959980 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 38960076  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgaga--gagaaaggaaga------gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||   ||||       ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  38960077 aaagtagaaaacaacgacaagaagaacaaaagaaaaaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagaga 38960176  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  38960177 gcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 38960241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 335
Target Start/End: Original strand, 39397915 - 39398104
Alignment:
Q  135 acaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccc 234  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||            ||||||||||||||| | ||||||     
T  39397915 acaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag------------agaacacaaaagaatgttttgacct 39398002  T
Q  235 agttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39398003 agttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 39398102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10750121 - 10749869
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10750121 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10750025  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10750024 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10749926  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10749925 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10749869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 31179212 - 31179481
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  31179212 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataat--taaa 31179308  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaa-aacaacgagagaga-------aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 259  Q
    || |||| |||||||||| ||||||| | ||||       || |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31179309 cacaagccaaaagtagaagaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga--aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 31179405  T
Q  260 -ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  31179406 gggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatgaatgggttacaagaataa 31179481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 3372985 - 3373247
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  |||     
T  3372985 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agcc 3373081  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacg------agagagaaag--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||||      ||||  ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3373082 aaaagtagaaaacaacggcgagaagagcaaaagaagaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 3373180  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| || |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3373181 agcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3373247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Original strand, 15445135 - 15445376
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||  |||||||||| |||| |||  |||||    
T  15445135 aaaaacacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaa--attataaacacaagcaaaagatagaa 15445230  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| |||||||  ||| |||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15445231 aacatcgagaga--aagaaagagaaaacacacga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctgggaagagagcagcccttcgttccac 15445327  T
Q  286 tata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  15445328 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 15445376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4410442 - 4410191
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  4410442 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 4410347  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||| ||      ||||   || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  4410346 aacagcggcgaaaagagcacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctcc 4410247  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
      | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  4410246 aatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaataggttacaagaataa 4410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10757597 - 10757345
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10757597 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10757501  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10757500 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10757402  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  10757401 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagaaaaatcaatgggttacaagaataa 10757345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9020633 - 9020386
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9020633 aaaatcacacgaataaaatatttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 9020538  T
Q  187 aacaacgagagagaaagga-agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    || ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||   |||||| | ||| |||||||||||||||||| | |    
T  9020537 aataacgataga-aaagaagagagagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatcc 9020439  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9020438 actataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665213
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23665239  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  23665238 agagaaatcaatgggttacaagaata 23665213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23741968
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23741942  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  23741943 agagaaatcaatgggttacaagaata 23741968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793374
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23793348  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  23793349 agagaaatcaatgggttacaagaata 23793374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Original strand, 34530558 - 34530679
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34530558 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaa 34530657  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    || |||  ||||||||| ||||    
T  34530658 cacaagtcaaaagtagacaaca 34530679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20045395 - 20045292
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20045395 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacga 20045296  T
Q  195 gaga 198  Q
    ||||    
T  20045295 gaga 20045292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31543153 - 31542939
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  31543153 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaa 31543057  T
Q  189 caacga----gagag-aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||     ||||  ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  31543056 caacggcgaggagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaa 31542957  T
Q  281 ttcactatatgatgagta 298  Q
    | ||||||||||||||||    
T  31542956 tccactatatgatgagta 31542939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354684
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15354658  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15354659 agagaaatcaatgggttacaagaata 15354684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15356960
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-ctggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15356934  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15356935 agagaaatcaatgggttacaagaata 15356960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143634
Alignment:
Q  154 tggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgac 252  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  | |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  253 ctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 15143634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15552668 - 15552414
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |||||||||    
T  15552668 aaaaatcacaccaataac-aacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagctaaaagtaga 15552572  T
Q  186 aaacaa---cgagagaga----aaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||| ||   ||||| |||    || |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  15552571 aaataatggcgaga-agaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccc 15552473  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15552472 tccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15552414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545249
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||   |||| ||    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac-aa 31545276  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  31545275 agagaaatcaatgggttacaagaataa 31545249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4898071 - 4897913
Alignment:
Q  159 caattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagt 257  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||    
T  4898071 caattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagag-gaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagt 4897977  T
Q  258 ctgggg-agagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
     ||||| ||| |||||||  | ||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4897976 atgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaa 4897913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23667601 - 23667492
Alignment:
Q  221 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  23667601 gaatttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaa 23667503  T
Q  320 tgagttgcaag 330  Q
    || ||||||||    
T  23667502 tgggttgcaag 23667492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 17413202 - 17413278
Alignment:
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17413202 ggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 17413278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15354429 - 15354487
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  15354429 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 15354487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15356705 - 15356763
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  15356705 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 15356763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23665469 - 23665411
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23665469 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23665411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 23741712 - 23741770
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23741712 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23741770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 23793118 - 23793176
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23793118 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23793176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 308
Target Start/End: Original strand, 2144437 - 2144647
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| ||   |  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2144437 aaaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagtaa--aataatcaagcaactaaaacaatgtgggt--aacaattataaacacaagc-aaaagtaga 2144531  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||       ||||||||||||| | ||   |||| || |||||||||||||| |||||| |    
T  2144532 aaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aattt-------cagttcggtccaatactggtttagtttgagggagagagcagccctccgttcc 2144621  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  2144622 actataatgatgagtaactttacaaa 2144647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Original strand, 34530731 - 34530777
Alignment:
Q  289 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34530731 atgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 34530777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 317
Target Start/End: Original strand, 34033503 - 34033660
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaccta 255  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||  |||   |||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  34033503 aacaattataaacacaagc-aaaagtt-ataacaacgagagagaagagaa---agaacacaagcaaatttgtttacccagttcgatccaatactgaccta 34033597  T
Q  256 gtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatc 317  Q
    ||| |||||||||||||   |  ||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34033598 gtcaggggagagagcagttctatgttccacagtaatgatgagtaactttacaaaagagatatc 34033660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770978
Alignment:
Q  288 tatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 42770978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806493
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 19806493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636954
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 32636954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353376
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 9353376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17004004
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 17004004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932394
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 36932394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42238448 - 42238376
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42238448 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 42238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 2949087 - 2949341
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  2949087 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 2949186  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2949187 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggagagagcagccctc 2949286  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2949287 tgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 2949341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 31424870 - 31425128
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||  |    
T  31424870 attcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaacacaagtca 31424969  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31424970 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccttc 31425069  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31425070 cgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31425128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 11457330 - 11457588
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  11457330 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaagcca 11457429  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11457430 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacat 11457529  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11457530 ccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 11457588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17319322 - 17319055
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  17319322 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcgcaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaa 17319223  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17319222 cacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggagaga 17319123  T
Q  269 gcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17319122 gcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataa 17319055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 25251129 - 25251388
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  25251129 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagcca 25251228  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-ctggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  25251229 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccct 25251328  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  25251329 ctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataa 25251388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 14097830 - 14098083
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14097830 gaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagta 14097929  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  14097930 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgttt 14098029  T
Q  283 cactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14098030 cactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18840014 - 18839755
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  18840014 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 18839915  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |    
T  18839914 aaactagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccct 18839815  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18839814 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18839755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 50248425 - 50248685
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  50248425 attcgatgataaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaccacaagcca 50248524  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag--cagcc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  50248525 aaagttgaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaacc 50248624  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  50248625 atctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 50248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 12302367 - 12302618
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  12302367 aaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtag 12302466  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12302467 aaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttc 12302566  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12302567 actatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataa 12302618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 97 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18307516 - 18307277
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  18307516 caataacaaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgaga 18307417  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18307416 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactataatgatga 18307317  T
Q  296 gtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18307316 gtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaataa 18307277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47906696 - 47906438
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  47906696 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacaagcca 47906598  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  47906597 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccc 47906498  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  47906497 tccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47906438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 50307397 - 50307659
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  50307397 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 50307496  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaagg-aagagagaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcag 272  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50307497 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 50307596  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50307597 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 50307659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31490337 - 31490081
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  |    
T  31490337 attcgatgaaaaatcacaccaata-caaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagtca 31490239  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31490238 aaagtagaaaacagggagagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggggagagcagccctc 31490139  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31490138 cgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31490081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 6995548 - 6995810
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |    
T  6995548 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaacacaagcca 6995647  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaaag----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagag 269  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6995648 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagag 6995747  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6995748 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagttacaagaa 6995810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41647347 - 41647088
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||      
T  41647347 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaacacaagtc 41647248  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  41647247 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccc 41647148  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41647147 tccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 41647088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 25248406 - 25248665
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |    
T  25248406 attcgatgaaaaatcacaacaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacaaaagtca 25248505  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |    
T  25248506 aaagtagaaaacagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcct 25248605  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25248606 ccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25248665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 27336799 - 27337052
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27336799 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27336898  T
Q  184 gaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  27336899 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 27336998  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27336999 tccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27337052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39462948 - 39462686
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  39462948 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 39462849  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39462848 aaaattagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 39462749  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataat 336  Q
      |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  39462748 tctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataat 39462686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 17324486 - 17324749
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||     
T  17324486 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataagcc 17324585  T
Q  177 a-aaagtagaaaacaacgagaga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagca 271  Q
    | ||||||||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17324586 agaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 17324685  T
Q  272 gccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17324686 gccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17324749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 28206920 - 28207176
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  28206920 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 28207019  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28207020 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 28207119  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28207120 cctccgtttcac--tatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 28207176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13215496 - 13215249
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  13215496 cacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 13215397  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-a 289  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  13215396 cgagagagaaaggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataa 13215299  T
Q  290 tgatgagtaaccttacaaaagag----atatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||  |||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||    
T  13215298 tgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataa 13215249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23816315 - 23816054
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |    
T  23816315 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtca 23816217  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaagg---aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  23816216 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcat 23816117  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  23816116 ccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23816054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 4131229 - 4131493
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  4131229 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 4131328  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4131329 aaaaatagaaaacaacgagagagaaaagaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 4131428  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaag----agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||    
T  4131429 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataa 4131493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16429379 - 16429125
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || | |    
T  16429379 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaacca 16429282  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16429281 aaagt-gaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 16429185  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16429184 ccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16429125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 9240950 - 9241199
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||    
T  9240950 aaaaatcacaccaataacaaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtaga 9241049  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  9241050 aaaca--gcgagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttcca 9241147  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9241148 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 9241199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 50076566 - 50076785
Alignment:
Q  116 tggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaaca 215  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50076566 tggagcaatgaataataaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aagagagaaca 50076664  T
Q  216 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50076665 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagat 50076764  T
Q  315 atcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||  || |||||||||    
T  50076765 atcaatggattacaagaataa 50076785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 27338990 - 27339243
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27338990 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27339089  T
Q  184 gaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  27339090 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccga 27339189  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27339190 tccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27339243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15823985 - 15823714
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15823985 gtgttgcaaattcctttaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataa 15823886  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacga---gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gggg 263  Q
     || |||  |||||||||||||||| |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15823885 tcacaaggcaaaagtagaaaacaacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctggggg 15823786  T
Q  264 agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15823785 agagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15823714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 38925341 - 38925591
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaa 180  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  38925341 atgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataaacacaagccaaaa 38925440  T
Q  181 gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38925441 gtagaaaacaatgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgt 38925538  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38925539 tttac--tatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38925591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40134370 - 40134112
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag-ga-ataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||| |  ||||    
T  40134370 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatctcaagc 40134273  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40134272 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 40134174  T
Q  275 atccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40134173 atccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 40134112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51750461 - 51750207
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  51750461 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 51750365  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  51750364 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 51750265  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  51750264 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51750207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 15294694 - 15294947
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  15294694 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 15294790  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15294791 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 15294890  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15294891 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25128299 - 25128040
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |  ||||||||| || ||       
T  25128299 attcaatgaaaactcacgtcaataacaaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat- 25128203  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagaga--gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25128202 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagc 25128103  T
Q  274 catccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25128102 cctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataa 25128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324231
Alignment:
Q  94 caccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  17324484 caccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagtg 17324385  T
Q  194 agagaga------------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  17324384 agagagagagagagagagaaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgt 17324287  T
Q  281 ttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17324286 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17324231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 332
Target Start/End: Original strand, 28998116 - 28998363
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28998116 cacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 28998215  T
Q  189 caacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||    
T  28998216 caacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttca 28998315  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28998316 ccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 28998363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 332
Target Start/End: Original strand, 29003832 - 29004079
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29003832 cacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 29003931  T
Q  189 caacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||||   ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||    
T  29003932 caacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttca 29004031  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29004032 ccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 29004079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16432813 - 16432561
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||| ||   |||||||||||| | |    
T  16432813 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaag--ttataaacataaacca 16432716  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |     
T  16432715 aaagtagaaaa-------acagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtcc 16432623  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataat 336  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16432622 gccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataat 16432561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 31422714 - 31422986
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa-cataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||||| || |||      
T  31422714 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaacacaagtc 31422813  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31422814 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccc 31422913  T
Q  276 tccg------------tttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |            ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  31422914 tctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataa 31422986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39932506 - 39932243
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  39932506 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcca 39932409  T
Q  178 aaagtagaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--agag 267  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  39932408 aaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagag 39932309  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  39932308 agcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 39932243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 111 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16429043 - 16428821
Alignment:
Q  111 atgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagaga 210  Q
    |||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  16429043 atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaag--ttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaa--gaagaga 16428948  T
Q  211 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcact-atatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16428947 gaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaa 16428848  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16428847 agagatatcaatgggttacaagaataa 16428821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 17185992 - 17186241
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||    
T  17185992 atgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagt 17186088  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  17186089 agaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgtt 17186186  T
Q  282 tcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  17186187 ccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 17186241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47452057 - 47451813
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  47452057 attcaatgaaaaatcacatcaataacaaatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 47451958  T
Q  178 aaagtagaaa---acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||             | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  47451957 aaagtagaaagcaacaacgagaga-aaaggaagagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagt 47451872  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47451871 cattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 47451813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 10399677 - 10399941
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||    
T  10399677 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agc 10399773  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10399774 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 10399873  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10399874 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10399941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 2510202 - 2510438
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||| |||||    
T  2510202 aaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaaaca--agtcaaaaatagaa 2510298  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510299 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcac 2510388  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2510389 tatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaataa 2510438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 6114961 - 6115216
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||   ||||||| | |||  |    
T  6114961 attcaatgaaaaatcacaccggtaatatacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataaatacaagtca 6115058  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  6115059 aaagtagaagacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcatt 6115156  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6115157 ccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataa 6115216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13762257 - 13762005
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  13762257 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 13762161  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  13762160 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctcc 13762061  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  13762060 ggtccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13762005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 46431556 - 46431820
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  46431556 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca--agcca 46431652  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggaga 266  Q
    ||||||||||||||||  ||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  46431653 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggaga 46431752  T
Q  267 gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  46431753 gagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 46431820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Original strand, 3579587 - 3579729
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatg 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  3579587 gagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atg 3579685  T
Q  292 atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3579686 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3579729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 31735373 - 31735634
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  31735373 attcgatgagaaattacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 31735469  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||| ||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31735470 aaa-tagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 31735568  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  31735569 cagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 31735634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756694
Alignment:
Q  153 atggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgac 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagag-gaaag-aagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgac 6756780  T
Q  253 ctagtct--ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6756779 ctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataa 6756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2617939 - 2617684
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  2617939 aaaaccacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 2617843  T
Q  186 aaacaac---gagagagaa----aggaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    |||||||   |||||| ||    | ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2617842 aaacaacagcgagagaaaacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 2617743  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2617742 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2617684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 14183470 - 14183705
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| |||    
T  14183470 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagaaga 14183566  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||||||||||               ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14183567 aaacaacgagagac--------------cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcc 14183652  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14183653 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 14183705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840848
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa- 201  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||     
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  202 ---aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgag 296  Q
       | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 28840886  T
Q  297 taaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28840885 taacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28840848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15916813 - 15916562
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15916813 attcgatgaaaagtcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaagcca 15916717  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||| |  | |||| |||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15916716 aaagtagaaaa-acagcgagaaaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15916619  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaaga 331  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  15916618 tccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24326093 - 24325831
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||  ||  |    
T  24326093 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaattaaataca--agtca 24325997  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagag 269  Q
    || ||| |||||||||  |||| |||    | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24325996 aaggtaaaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagag 24325897  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24325896 cagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24325831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 200
Target Start/End: Original strand, 50078653 - 50078766
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50078653 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 50078752  T
Q  187 aacaacgagagaga 200  Q
    ||||||||||||||    
T  50078753 aacaacgagagaga 50078766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 335
Target Start/End: Original strand, 50078779 - 50078934
Alignment:
Q  183 agaaaacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  50078779 agaaaacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgt 50078878  T
Q  281 ttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  50078879 tccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 50078934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823182
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  311 agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataa 6823182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28842915 - 28842663
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  28842915 aaaatcacactaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 28842819  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  28842818 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctcc 28842719  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28842718 gttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28842663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 9459285 - 9459529
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  9459285 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 9459381  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | ||||         ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9459382 aaagtagaaaacaacg-gcgaga---------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9459471  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  9459472 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9459529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 9463112 - 9463356
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  9463112 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 9463208  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | ||||         ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9463209 aaagtagaaaacaacg-gcgaga---------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9463298  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  9463299 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataa 9463356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23786279 - 23786008
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  23786279 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 23786181  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-g 260  Q
    || |  | |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  23786180 ca-agccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 23786082  T
Q  261 gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  23786081 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23786008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13358995 - 13358778
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  13358995 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 13358899  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13358898 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 13358799  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagta 298  Q
    || | |||||||||| |||||    
T  13358798 cgatccactatatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20302863 - 20302627
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20302863 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 20302767  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| | ||    
T  20302766 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatcca 20302677  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20302676 ctatctgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20302627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51757965 - 51757725
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||  ||| |    
T  51757965 attcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattgaataca--agcca 51757869  T
Q  178 aaagtag-----aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gggga 264  Q
    |||||||     |||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51757868 aaagtagggaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 51757769  T
Q  265 gagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||| |||||| | |||||||    
T  51757768 gagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa 51757725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 30790266 - 30790514
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag-- 184  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || | |||| |||      
T  30790266 aaaatcacaccaataaaatacctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaacaaaaa-tagta 30790362  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||| |  | ||||||||| ||||||| |||||  | | |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  30790363 aaaagacagcgagagaaagaaagagagcacacacga-attttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggaagagagcagtcatccattcc 30790461  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30790462 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30790514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 13447133 - 13447301
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||||||||    
T  13447133 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagccaaaagtagaa 13447229  T
Q  187 aacaac-gagagaga-----aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 251  Q
    |||||| | |||| |     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447230 aacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 18800439 - 18800686
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18800439 aaaatcacaccaacaaaatacttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaagccaaaagtagaa 18800536  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||||||  | |||||||| |||| ||| ||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||    
T  18800537 aacaacgagaga-aaacaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgcttca 18800634  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  18800635 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataa 18800686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Original strand, 3579439 - 3579572
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  3579439 attcgatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 3579537  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagaga 212  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3579538 aaagtagaaaacagagagagagagagggagagaga 3579572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 8348913 - 8349165
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| || | |    
T  8348913 attcgatgaaaaatcacaccaataa-aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-a 8349007  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||| || ||     
T  8349008 aaagtagaaaacaattagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccc 8349104  T
Q  276 tccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8349105 tctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataa 8349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51752657 - 51752532
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||| | |||| ||    
T  51752657 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aa 51752559  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  51752558 agagaaatcaatgggttacaagaataa 51752532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20291878 - 20291625
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20291878 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 20291782  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||    
T  20291781 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctc 20291682  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20291681 cgatccactatatgatgagaatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20291625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16226599 - 16226336
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  16226599 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 16226503  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16226502 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 16226403  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16226402 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16226336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 8347139 - 8347386
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||    
T  8347139 atgaaaaatcacacaagtaa-atacttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaag--ttataaacataagc-aaaagt 8347233  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||  | ||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  8347234 agaaaacagcgataga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgt 8347330  T
Q  281 ttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8347331 tccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 8347386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 15669281 - 15669507
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||   ||||||||| || | ||||||| || ||| ||||||| |||| |||    
T  15669281 ttgatgtgtgaagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaag--ttataaacacaaac-aaaagtataacacagcgagaga-aaagaaag 15669376  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaacctta 304  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||    
T  15669377 agagaacacaacaaaatttgtttacacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagcttta 15669476  T
Q  305 caaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15669477 cgagagagatatcaatgggttacaagaataa 15669507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47177785 - 47177531
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  47177785 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataattaaataca--agccaaaagtag 47177689  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  47177688 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggggagagagcagccct 47177589  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  47177588 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47177531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47180136 - 47179882
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  47180136 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataattaaataca--agccaaaagtag 47180040  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  47180039 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggagagagcagccct 47179940  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  47179939 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47179882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42922556 - 42922398
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  42922556 aaaagtagaaaacaacgggaga--aagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 42922460  T
Q  275 atccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42922459 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42922398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 333
Target Start/End: Original strand, 49495182 - 49495322
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tga 292  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||| |||    
T  49495182 gagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatga 49495281  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49495282 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 49495322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30780474 - 30780361
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatg--gagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||      
T  30780474 attcgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaaat 30780375  T
Q  176 gaaaagtagaaaac 189  Q
     |||||||||||||    
T  30780374 caaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16231994 - 16231732
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||  | | ||||||| | ||||     
T  16231994 attcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcc 16231898  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaga 266  Q
    ||||||||||||||||| | ||||       || |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16231897 aaaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttga-ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 16231800  T
Q  267 gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16231799 gagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16231732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 25860270 - 25860371
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25860270 aaaaccacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 25860365  T
Q  187 aacaac 192  Q
    ||||||    
T  25860366 aacaac 25860371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28279680 - 28279436
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||   ||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28279680 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagt--taaacaaacaaccaaatcaacgtgggtg--acaattataaacacaagcgaaa-gtaga 28279586  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct--ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||||| | |  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| || || | |||||||||||  ||||| ||| || |  ||  ||     
T  28279585 aaacaacgaaaaa--aagggagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttcgatctaatactgacctagtctagggggaaagaacaactctcaattc 28279488  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  28279487 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaat 28279436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 13125326 - 13125571
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  13125326 aaaaatcacaccaataaattacttgatgtgtggagcaaa-aataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaga 13125420  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggag-agagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | |||||||||  |||| | |||||| |  |||||| |    
T  13125421 aaacaacgagagaaagaa-aagagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttcc 13125518  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13125519 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 13125571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16561878 - 16561635
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||| ||     ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16561878 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtga---gaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 16561785  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||  |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| || |  ||| |    
T  16561784 aaacggcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttcc 16561688  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  16561687 actgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 16561635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 335
Target Start/End: Original strand, 21948225 - 21948301
Alignment:
Q  259 tggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  21948225 tggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 21948301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27916822 - 27916681
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27916822 aaaagtagaaaacaacgagagagaaa--aaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagcc 27916726  T
Q  275 atccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
     |||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27916725 ctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 27916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 335
Target Start/End: Original strand, 30738561 - 30738743
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacct 254  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||    
T  30738561 aacaattataaacacaagc-aagagtagaaaaaatagtgagagaaagaaaagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacct 30738658  T
Q  255 agtctggg-gagagagcagccatccgtttcactata---tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  30738659 agtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataa 30738743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 335
Target Start/End: Original strand, 26613211 - 26613353
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactata-tg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| |||  || ||| ||||||| ||    
T  26613211 gagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatg 26613309  T
Q  292 atgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  26613310 attagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 26613353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155901
Alignment:
Q  247 attgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  155963 attgacctagtttggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 155901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665346
Alignment:
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48665404 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 48665346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 316
Target Start/End: Original strand, 13127669 - 13127782
Alignment:
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacc 301  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||     
T  13127669 aagagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaact 13127767  T
Q  302 ttacaaaagagatat 316  Q
    |||||||||||||||    
T  13127768 ttacaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51752789 - 51752715
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatt 163  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51752789 aaaatcacaccaataataa-ctt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatt 51752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43104414 - 43104332
Alignment:
Q  251 acctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||||||||||  ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  43104414 acctagtctgggaggagagcatctctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 43104332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102880
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatcc 47102880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 247
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520143
Alignment:
Q  163 tataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa 247  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-tatttgtttacccagtttggtccaaa 26520143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 2393277 - 2393348
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2393277 aagaatttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 2393348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834205
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggg 834205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10116184 - 10116125
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaa 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  10116184 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--attaatcaaataaccaaaacaa 10116125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598452
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 13598452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220264
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 28220264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265592
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 28265592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644392
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 45644392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476314
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagc 9476314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072981
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 19072981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120871
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 19120871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353423
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagt 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagt 21353423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644941
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 26644941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703980
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 47703980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 196907 - 196951
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagag 269  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  196907 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagag 196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 26519305 - 26519373
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa 158  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  26519305 aaaatcacaccaataaaatactt--tgtgtggagcaagtaataatcaagcaacc-aaacaaagtgtatggaa 26519373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19008034 - 19007784
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19008034 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 19007935  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  19007934 aaacaacgagagagaaatgaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttca 19007835  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19007834 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19007784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14837671 - 14837411
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaa-acttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  14837671 attcgatgagaaatcacatcaataacaatacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagcc 14837572  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14837571 aaaagtataaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatcca 14837472  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14837471 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 14837411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 6258670 - 6258928
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |    
T  6258670 attcgatgagaaaacataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagcta 6258769  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6258770 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccctc 6258869  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6258870 cgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6258928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 335
Target Start/End: Original strand, 22287176 - 22287447
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    |||| ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22287176 ctatttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaatta 22287275  T
Q  165 taaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gggg 263  Q
    |||| | |||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22287276 taaaaacaagtcaaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 22287375  T
Q  264 agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22287376 agagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 22287447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28197032 - 28196781
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  28197032 atgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagt 28196933  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28196932 agaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtt 28196835  T
Q  282 tcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28196834 tcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28196781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 6264001 - 6264260
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||      
T  6264001 attcgatgagaaaacacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaacacaagccg 6264100  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6264101 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 6264200  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6264201 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6264260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 22707613 - 22707864
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  22707613 aaaaccacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaggcagaagtagaa 22707712  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||| || |||||    
T  22707713 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttc 22707812  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22707813 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17849511 - 17849261
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  17849511 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattttaaacacaagccaaaagtaga 17849412  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  17849411 aaacaacgggagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagcc-cccgtttca 17849313  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17849312 ctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 17849261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 117 - 335
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407565
Alignment:
Q  117 ggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacac 216  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  217 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagata 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagata 22407545  T
Q  316 tcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  22407546 tcaatgggttacaagaataa 22407565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 333
Target Start/End: Original strand, 21520542 - 21520802
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  21520542 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 21520641  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcag 272  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21520642 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 21520741  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21520742 ccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21520802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923620
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  42923373 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaaca 42923472  T
Q  191 acgagagaga--aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcacta 287  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42923473 acgagagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcacta 42923572  T
Q  288 tatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  42923573 tatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 42923620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 43623431 - 43623691
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  43623431 attcgatgaaaaatcacaccaataactaacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataatcataagcc 43623530  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43623531 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 43623630  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43623631 ctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 43623691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 90 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3022562 - 3022362
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3022562 atcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaaac 3022463  T
Q  190 aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3022462 aacgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattat 3022363  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  3022362 a 3022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Original strand, 5375218 - 5375457
Alignment:
Q  98 aataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa-caacgaga 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | |||    
T  5375218 aataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaaga 5375317  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatga 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5375318 gagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatga 5375417  T
Q  296 gtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5375418 gtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 5375457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 313
Target Start/End: Original strand, 22162877 - 22163111
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||| |    
T  22162877 attcgatgagaaaacacaccaataacaattttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataagcacaagcca 22162976  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  22162977 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctct 22163074  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagaga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22163075 ccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 28459054 - 28459301
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28459054 aaaatcacaccaataaaacacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaa 28459153  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcact 286  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  28459154 aaca--gggagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggtagagagaagccctccgtttcact 28459251  T
Q  287 at-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28459252 ataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28459301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23871205 - 23870960
Alignment:
Q  93 acaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa--caattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  23871205 acaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaacaattaaataaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaaca 23871106  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23871105 gcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata 23871006  T
Q  290 tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  23871005 tgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataa 23870960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848585
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 203  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||| ||      
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaa-- 17848717  T
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17848716 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgt 17848617  T
Q  303 tacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17848616 tacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataa 17848585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27105204 - 27104942
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||  ||| |    
T  27105204 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaatgca--agcca 27105107  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27105106 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 27105007  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27105006 cagccctccgatccactatatgatgagtaatgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 140 - 335
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289179
Alignment:
Q  140 caaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 239  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  240 ggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataa 44289179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 249
Target Start/End: Original strand, 15539396 - 15539553
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15539396 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggatta-tcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaaca 15539494  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539495 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 45279850 - 45280095
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  45279850 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 45279946  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  45279947 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 45280036  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  45280037 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 45280095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 7462819 - 7463059
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagag 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | |||    
T  7462819 ataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgag 7462918  T
Q  198 agaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatg 294  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  7462919 agaaagagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatg 7463018  T
Q  295 agtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7463019 ggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 7463059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 23452094 - 23452348
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  23452094 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agctaaaagtaga 23452190  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23452191 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 23452290  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  23452291 caatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 23452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 335
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032169
Alignment:
Q  141 aaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  239 cggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaag----agatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    ||||||||||| ||| ||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaa 40032166  T
Q  333 taa 335  Q
    |||    
T  40032167 taa 40032169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 34979442 - 34979690
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  34979442 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtca 34979541  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||| ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||     
T  34979542 aaagtagaaaacagcg------------agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagccc 34979629  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  34979630 ttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaagaataa 34979690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 13909902 - 13910155
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  13909902 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 13909998  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13909999 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 13910098  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     | | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  13910099 tgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 13910155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452925
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa 42452951  T
Q  310 gagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  42452950 gagaaatcaatgggttacaagaataa 42452925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Original strand, 11739429 - 11739672
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||  |    
T  11739429 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaagtca 11739528  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||                 | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11739529 aaag-----------------ggaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 11739611  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataat 336  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11739612 ccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataat 11739672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 36560989 - 36561251
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |  | |    
T  36560989 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaatacg-agccaa 36561086  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  36561087 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 36561186  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  36561187 cagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36561251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 335
Target Start/End: Original strand, 17897125 - 17897357
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17897125 caataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgaga 17897219  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatg 294  Q
    ||  ||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17897220 ga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctggggagagagcagccatccgttctactataatgatg 17897316  T
Q  295 agtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  17897317 agtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataa 17897357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 24162084 - 24162333
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  24162084 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaac 24162180  T
Q  190 aacga-gagagaaag-----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-ctggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    ||||  |||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  24162181 aacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaat 24162280  T
Q  282 tcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24162281 ccactatatgatgagtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24162333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 19504194 - 19504457
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  19504194 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 19504290  T
Q  186 a---------aacaacg---agagaga---aaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |         |||||||   ||| | |   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19504291 agaaaaaaaaaacaacggcaagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagata 19504390  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19504391 gcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 19504457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 36558720 - 36558974
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  36558720 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 36558818  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |  |  | ||||||||||||||||  | |||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36558819 cg-agccaaaaagtagaaaacaact-gcgagaa---------gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 36558907  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  36558908 agcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 36558974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 11577974 - 11578220
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    | |||||| |||| |||||||||    
T  11577974 aaaaatcacattaataa-aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaag---tttaaacacaagccaaaagtaga 11578069  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||||||| | |  |||||| ||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||      
T  11578070 aaacaacgagagaaagaa-aagagaaaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcg 11578167  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11578168 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 11578220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 19501996 - 19502122
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| | |||||||    
T  19501996 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 19502095  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19502096 agagaaatcaatgggttacaagaataa 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064659
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaagg 204  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||         |     
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaaaacaacg---------gc 42064790  T
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacct 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||   |    
T  42064789 aaga-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 42064691  T
Q  303 tacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  42064690 tac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 42064659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 18800267 - 18800425
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtctggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||     
T  18800267 aaaagtagaaaacagc-aga-agaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctggggagagagtagccc 18800364  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18800365 tccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18800425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22874425 - 22874274
Alignment:
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||    
T  22874425 aaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttc 22874327  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22874326 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 22874274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732888
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||| || || | |||||||||||||| ||||||| ||||  |     
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaag--ttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagaga-aaag--at 31732760  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttac 305  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  31732761 agagaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttac 31732858  T
Q  306 aaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31732859 aaaagagatatcaatgggttacaagaataa 31732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146720
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||     
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgact 20146636  T
Q  254 tagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20146637 tagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataa 20146720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38020473 - 38020370
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38020473 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtagaa 38020374  T
Q  187 aaca 190  Q
    ||||    
T  38020373 aaca 38020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 35215449 - 35215696
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||  ||  |||||||||    
T  35215449 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataattaaataca--agtcaaaagtaga 35215545  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||||  |||| |||   |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |     
T  35215546 aaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35215644  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35215645 cactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 35215696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 45238850 - 45239088
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagt--atatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||| | ||||  ||||  |||| |||||| || |||    
T  45238850 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatc-aacagttataatcacaag 45238948  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||                    ||||||||||| ||||||||||    
T  45238949 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaaaaatttgttgac--------------------ctagtctgggggagagagcagc 45239026  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45239027 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 45239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 35217826 - 35218073
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||  |||||||||    
T  35217826 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--agtcaaaagtaga 35217922  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||||  |||| |||   |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |     
T  35217923 aaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35218021  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  35218022 cactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaacgggttacaagaataa 35218073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 45332028 - 45332291
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  | || |||||||| | ||| |  | |    
T  45332028 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtttgtaacaattaaataca-agccaa 45332125  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  45332126 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 45332225  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  45332226 gcagccctccaattcactatatgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatgggttacaataataa 45332291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 199
Target Start/End: Original strand, 38414036 - 38414156
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |  ||||| |  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |    
T  38414036 attccatgaaaaatcacaccaa-aacaaaattggtgtgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggta 38414134  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38414135 aaagtagaaaacaacgagagag 38414156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35107618 - 35107458
Alignment:
Q  158 acaattataaacataagcgaaaagtagaaaa--caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacct 254  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||| | ||||||    
T  35107618 acaattataaacataagt-aaaggtagaaaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacct 35107521  T
Q  255 agtctgggga-gagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagata 315  Q
    |||||||| | |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107520 agtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagata 35107458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699534
Alignment:
Q  156 gaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacct 254  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||    
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaata-gcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgacct 40699601  T
Q  255 agtctgggg-agagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||||||| | |||||| || || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40699600 agtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40699534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20592467 - 20592295
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||| |||||||||    
T  20592467 aaaaatcacaccaataaaatacgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaagc-aaaagtaga 20592371  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg 263  Q
    ||| | |   |||||||| |||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20592370 aaatatc--aagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggg 20592295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22874511 - 22874431
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  22874511 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Original strand, 37962799 - 37963027
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||| ||  || ||||||| ||| ||| |||   |||||| || ||   |    
T  37962799 attcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaag--ttataatcacaaat-a 37962895  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |      
T  37962896 aaagtagaaaacaacttgaga-aaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtcca 37962993  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaa 309  Q
    | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  37962994 ctgtttcactataatgatgaataactttacaaaa 37963027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42453874 - 42453798
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  42453874 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaacaatta 42453798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 19501859 - 19501930
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc-aaaacaaagtatatggaa 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  19501859 aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19501930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057407
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggg 17057407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085390
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggg 17085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8173653 - 8173547
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  8173653 ggaacaattataaacacaaac-aaaggtaaaaaacaacgagaga-aaagaaagagtgaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacc 8173557  T
Q  254 tagtctgggg 263  Q
    |||| |||||    
T  8173556 tagtatgggg 8173547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136236
Alignment:
Q  294 gagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 27136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 268
Target Start/End: Original strand, 42288105 - 42288154
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42288105 aagaaattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctggggagaga 42288154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828438
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtcca-aattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatca 318  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | | ||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  319 a 319  Q
    |    
T  13828438 a 13828438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 21629948 - 21629996
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  21629948 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagc 21629996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723782
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 723782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151629
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 11151629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699050
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 14699050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139808
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 34139808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35028959 - 35028814
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||  |||||||||||| | ||||  ||| ||||    
T  35028959 aaaaatcacaccaataaaatatttaatgtgtggagcaa--aataatcaaacaatcaaaacaacgtggat--aacaattataaaaacaagc--aaaataga 35028866  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcg 240  Q
    |||||  | || |||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  35028865 aaaca--gtgaaagaaagaaagagagaatacaaaa-aatttgtttagccagttcg 35028814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284966
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 39284966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1345640 - 1345587
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagca 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  1345640 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 1345587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2838129 - 2838076
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagca 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2838129 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390194
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagc 8390194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569381
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 13569381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33604141 - 33604092
Alignment:
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  33604141 ggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921887
Alignment:
Q  249 tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  17921927 tgacctagtctgggtagagagcagccctccgttccactata 17921887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589835
Alignment:
Q  276 tccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataa 20589835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Original strand, 37170778 - 37170818
Alignment:
Q  249 tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  37170778 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 37170818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Original strand, 42923315 - 42923347
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42923315 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaag 42923347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 69 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2891781 - 2891516
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2891781 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaa 2891682  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  2891681 cacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagag 2891582  T
Q  268 agcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2891581 agcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 2891516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 38928032 - 38928288
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |    
T  38928032 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca 38928131  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  38928132 aaagtagaaaacaac--gagataaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 38928229  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38928230 ccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 38928288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 36919437 - 36919695
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  36919437 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 36919536  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36919537 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccat 36919636  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36919637 ctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36919695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 36921346 - 36921604
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  36921346 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 36921445  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  36921446 aaagtagaaaacagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccat 36921545  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36921546 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 36921604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 22800713 - 22800973
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22800713 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagcca 22800812  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22800813 aaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 22800912  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22800913 ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22800973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 87 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47563230 - 47563009
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47563230 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagtagaa 47563131  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47563130 aaca--gcgagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcac 47563033  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaa 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  47563032 tataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 40091267 - 40091526
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaat-cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  40091267 attcgatgaaaaattcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaacacaagcc 40091366  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  40091367 aaaagtagaaaatagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccc 40091466  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40091467 tctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 40091526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Original strand, 14787282 - 14787539
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  14787282 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 14787381  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14787382 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 14787479  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14787480 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 14787539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27499528 - 27499283
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  27499528 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagtca 27499429  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27499428 aaagtagaaaacaacgagagagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaaagagca 27499329  T
Q  272 gccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatat 316  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499328 gcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 27499283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 22802585 - 22802845
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  22802585 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 22802684  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  22802685 aaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaacc 22802784  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22802785 ctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22802845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 33415347 - 33415599
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  33415347 atgagaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaacacaagccaaaag 33415446  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  33415447 tagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgt 33415544  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33415545 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 33415599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40637545 - 40637296
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  40637545 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 40637447  T
Q  188 acaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40637446 acaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcca 40637347  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  40637346 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40637296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 12395698 - 12395956
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | || |    
T  12395698 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgcca 12395797  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  12395798 aaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccc 12395897  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  12395898 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12395956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 12400660 - 12400918
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | || |    
T  12400660 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgcca 12400759  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  12400760 aaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccc 12400859  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  12400860 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataa 12400918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24889278 - 24889018
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  24889278 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 24889180  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24889179 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 24889080  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  24889079 cctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataa 24889018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13547635 - 13547376
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  13547635 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 13547536  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13547535 aaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 13547436  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13547435 tccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 13547376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16453788 - 16453531
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||| |    
T  16453788 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaagcca 16453689  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16453688 aaagtagaaaaca--gtgagagaaaagaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccat 16453591  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16453590 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16453531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4215775 - 4215528
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4215775 gaaaactcacacaaataacaa-cttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtag 4215677  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||  ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4215676 aaaactgcgagagaaaa--gaa-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcc 4215580  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4215579 actatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4215528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 17662108 - 17662356
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  17662108 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacatgccaaaagtagaa 17662206  T
Q  187 aacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  17662207 aacaac-agcgagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 17662305  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  17662306 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 17662356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47275190 - 47274948
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  47275190 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 47275091  T
Q  192 cgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatat 290  Q
    |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47275090 cgagaga--aatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatat 47274993  T
Q  291 gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47274992 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47274948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6133309 - 6133105
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  6133309 aaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtaga 6133210  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  6133209 aaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttcca 6133110  T
Q  285 ctata 289  Q
    |||||    
T  6133109 ctata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48486801 - 48486541
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |    
T  48486801 attcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgcgtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagcca 48486702  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48486701 aaagtagaaaacaacatcaagaga-aaaggaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 48486603  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  48486602 catccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataa 48486541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24879425 - 24879211
Alignment:
Q  125 gaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24879425 gaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagaga 24879326  T
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  24879325 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaat 24879226  T
Q  321 gagttgcaagaataa 335  Q
    | ||| |||||||||    
T  24879225 gggttacaagaataa 24879211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Original strand, 14789281 - 14789495
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  14789281 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 14789380  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14789381 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 14789478  T
Q  273 ccatccgtttcactata 289  Q
    || ||||||||||||||    
T  14789479 ccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36378761 - 36378514
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36378761 aaaatcacaccaataaaatacttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaaacgaaaagtagaa 36378663  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  36378662 aacagc-ag-gagaaaagaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccac 36378565  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36378564 tataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataa 36378514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 37089220 - 37089482
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  37089220 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 37089317  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37089318 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 37089417  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37089418 cagccctccgttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 37089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5101396 - 5101151
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  5101396 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 5101297  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    || | |||||||| ||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5101296 aagggagaaaacaccgagagagaa------------cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagatagcagccctc 5101209  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  5101208 cgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaataa 5101151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16455706 - 16455463
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  16455706 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcataagcta 16455607  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||| ||||||||| |||||||                ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16455606 aaactagaaaacagcgagaga----------------acacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 16455523  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16455522 ccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 16455463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24880889 - 24880673
Alignment:
Q  125 gaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaa 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  24880889 gaataatcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaga 24880790  T
Q  221 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24880789 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatca 24880690  T
Q  319 atgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  24880689 atgggttacaagaataa 24880673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 5635334 - 5635587
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5635334 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5635430  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5635431 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 5635530  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5635531 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5635587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14633802 - 14633540
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  14633802 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 14633706  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14633705 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagag 14633606  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14633605 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14633540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 321
Target Start/End: Original strand, 24446510 - 24446738
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  24446510 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagcca 24446609  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||| ||    
T  24446610 aaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat------------gggagagagcagccctc 24446694  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24446695 cgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 24446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 22046542 - 22046796
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||    
T  22046542 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtag 22046638  T
Q  185 aaaacaacga-gagag-----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||| ||||      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22046639 aaaacaacgacgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22046738  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22046739 ccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22046796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6765327 - 6765066
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  6765327 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttataaatacaagcca 6765231  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    || |||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765230 aa-gtagaaaacaacggcgagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 6765132  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6765131 cagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6765066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36380818 - 36380571
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36380818 aaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 36380720  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||    
T  36380719 aaca--gaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccac 36380622  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36380621 tataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 36380571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11437847 - 11437585
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  11437847 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 11437751  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11437750 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 11437651  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11437650 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11437585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 8631276 - 8631530
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  8631276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 8631372  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8631373 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 8631472  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  8631473 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 8631530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11435434 - 11435177
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||    
T  11435434 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaag 11435338  T
Q  182 tagaaaacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||||||   ||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11435337 tagaaaacaatggcgaga-agaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 11435239  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11435238 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11435177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24348676 - 24348440
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||  ||| |||| |||||    
T  24348676 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaactaaataca--agccaaaaatagaa 24348580  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||    
T  24348579 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccac 24348490  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24348489 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 24348440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 22044247 - 22044501
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  22044247 gaaaaataacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtag 22044343  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||      |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22044344 aaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22044443  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  22044444 ccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 22044501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Original strand, 619306 - 619559
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| |||| ||  ||   ||| |||||| || |||| |    
T  619306 attcgatgagaaaacacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatcacaagc-a 619401  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  619402 aaagtagaaaacaacagcagagaa-gaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttaggggagagagcagtcatc 619500  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  619501 cgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataat 619559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19096362 - 19096107
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||    |  | |||| |||||| || || | |    
T  19096362 attcgatgaaaaatcacactaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaag---tgggtaacagttataatcacaaac-a 19096267  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaa---aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19096266 aaagtagaaaacaacgagagaaaataaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 19096167  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
      |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19096166 tctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 19096107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47868886 - 47868623
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||  |||     
T  47868886 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataaaataca--agcc 47868790  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agaga 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47868789 aaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 47868690  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  47868689 gcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 47868623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 2484731 - 2484983
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  2484731 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 2484827  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2484828 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2484927  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2484928 gatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2484983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 37312937 - 37313177
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37312937 atgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcataagccaaaagt 37313036  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||| |              ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  37313037 agaaaacagc--------------gagagaaaacaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgtt 37313122  T
Q  282 tcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  37313123 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 37313177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49089036 - 49088791
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  49089036 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 49088937  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||||||              |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       
T  49088936 aaagtagaaaacaacga--------------gagaacgc-aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttc 49088852  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag-agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  49088851 tctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51015722 - 51015468
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  51015722 gaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 51015626  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  51015625 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacct 51015526  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  51015525 ccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51015468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9148719 - 9148475
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  9148719 attcgatgagaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 9148623  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9148622 aaagtagaaaacaacg-gtgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9148533  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  9148532 ccgttccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53405618 - 53405357
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||   ||||||| | |||| |    
T  53405618 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaag--ttataaatacaagcca 53405521  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagc 270  Q
    ||||||||||||| ||      |||    || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53405520 aaagtagaaaacatcggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagc 53405422  T
Q  271 agccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  53405421 agctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 53405357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 31849456 - 31849709
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  31849456 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 31849552  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31849553 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 31849652  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  31849653 cgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 31849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 263
Target Start/End: Original strand, 52942346 - 52942526
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52942346 aaaaatcacacaaataacaaatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 52942445  T
Q  185 aaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942446 aaaacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 52942526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5198879 - 5198642
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5198879 aaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5198783  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    || ||||| | |||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||    
T  5198782 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5198693  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5198692 ctatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5198642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7941798 - 7941545
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||  ||  ||||||||||    
T  7941798 aaaatcacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatgaaataca--aggcaaaagtagaa 7941702  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7941701 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 7941603  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7941602 caatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7941545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18847628 - 18847376
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||| |  | |||||||||    
T  18847628 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataattaaataca-agccaaaaagtaga 18847532  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatcc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18847531 aaacaacggcgagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctcc 18847432  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
      | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18847431 aatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18847376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30137031 - 30136771
Alignment:
Q  72 ttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacat 171  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| | | ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||||     
T  30137031 ttgtaaattcgatgtaaaatcacatcaataa-atatttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaag--ttataaacac 30136936  T
Q  172 aagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-ctggggagagagc 270  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  30136935 aaaccaaaagtagaaaacaacaagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagc 30136837  T
Q  271 agccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  30136836 agccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaataa 30136771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38409679 - 38409427
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38409679 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38409583  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||      |||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  38409582 aacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 38409483  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38409482 gatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38409427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41997962 - 41997714
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||    
T  41997962 atgaaaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagt 41997866  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||||||||  |  | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41997865 agaaaacagcgagagc-aaagaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctggggagagagcggccctccgttt 41997768  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  41997767 cactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 41997714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 22134476 - 22134727
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag--aa 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||   ||    
T  22134476 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaagaaa 22134572  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccg 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22134573 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctcca 22134672  T
Q  280 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22134673 atccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22134727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 11006111 - 11006347
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  11006111 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaa 11006207  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    || ||||| | |||||         ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  11006208 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 11006297  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11006298 ctatatgatgagtaccattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 8756119 - 8756363
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  8756119 aaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaaaa 8756214  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  8756215 aacaacgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttcca 8756311  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8756312 ctataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 8756363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19323161 - 19322915
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||   |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  19323161 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaag--ttataaacacgagc-aaaagtataa 19323065  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||| |  ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||    
T  19323064 aacacctggaga--aagaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttcca 19322967  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  19322966 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 19322915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 38890090 - 38890337
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||  |||| ||||    
T  38890090 aaaaatcacaccaataaaatatttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaaggcaaaattaga 38890186  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| |    
T  38890187 aaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttcc 38890284  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38890285 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 38890337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 11008425 - 11008676
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  11008425 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaa 11008521  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11008522 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 11008621  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||| | ||||||   ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11008622 caatccactatatgatgagtaccattacaa---agaaatcaatgggttacaagaataa 11008676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 335
Target Start/End: Original strand, 18537345 - 18537586
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| || | ||||||| ||||||    
T  18537345 tcacacctataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaaac-aaaagtataaaaca 18537441  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc-caaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat 288  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18537442 ac--gagagaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactat 18537538  T
Q  289 -atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18537539 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18537586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 26085836 - 26086087
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||||    
T  26085836 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaa 26085932  T
Q  188 acaacga-gagagaaag-----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccg 279  Q
    ||||||  |||| |||      ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26085933 acaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccg 26086032  T
Q  280 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  26086033 atccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaaacaatgggttacaagaataa 26086087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25358107 - 25357863
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || | |  ||||| ||||||| ||||| ||    |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25358107 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaggaaagca--atcaagcaaccaataacaacgtg---ggaacaattataaacacaagc-aaaagtag 25358014  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  25358013 aaaacaacgagagaaa---gaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttc 25357917  T
Q  283 cactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25357916 tactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25357863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 9174003 - 9174256
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  9174003 aaaatcacactaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataattaaataca--agccaaaagtagaa 9174099  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatc 277  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9174100 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctc 9174199  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9174200 caatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 9174256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Original strand, 3937134 - 3937309
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  || || || || | |    
T  3937134 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaatcacaaac-a 3937228  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3937229 aaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctg 3937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 16931639 - 16931899
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||| |    
T  16931639 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--agcca 16931735  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagc 270  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16931736 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagc 16931835  T
Q  271 agccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16931836 agccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16931899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 9176331 - 9176584
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  9176331 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca--agccaaaagtagaa 9176427  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    || |||||  |||| |||    | |||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9176428 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 9176527  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  9176528 caatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9176584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 18409209 - 18409458
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || |||  |||||||||    
T  18409209 aaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaagacaaaagtaga 18409306  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||| | ||||||| |||  || | | || | | | ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||    
T  18409307 aaatagcgagagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttc 18409406  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18409407 actataatgatgggtaa-cttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18409458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 335
Target Start/End: Original strand, 18534703 - 18534944
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| || | |||||||||||| |    
T  18534703 tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaaac-aaaagtagaaaata 18534799  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat 288  Q
      | ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  18534800 --gcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactat 18534896  T
Q  289 -atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || |||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18534897 aattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 18534944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 16185707 - 16185946
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16185707 atcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--attaatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaac 16185800  T
Q  190 aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcacta 287  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  16185801 aacgagaaacaaaa-aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccacta 16185898  T
Q  288 t-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  16185899 taatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaagggttgcaagaataa 16185946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 44599688 - 44599948
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||  |    
T  44599688 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagga-taattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--aggca 44599783  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44599784 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 44599883  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44599884 cagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 44599948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Original strand, 3824464 - 3824630
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataag-cgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  3824464 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagt 3824563  T
Q  183 agaaaa----caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 245  Q
    ||||||    || | |||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824564 agaaaaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12102550 - 12102309
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  12102550 aaaatcacaccaataaactacttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtaaaa 12102454  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||  | |||||||||  |||||| | || |||   |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  12102453 aaca--gtgagagaaag--agagagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttcca 12102361  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  12102360 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataa 12102309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28454151 - 28453920
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||    ||||||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28454151 aaaatcacaccaatatattacttgatgtgtgaagcaa--aataatcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaa 28454057  T
Q  187 aacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||   ||||||     
T  28454056 aacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttc 28453958  T
Q  283 cactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28453957 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28453920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 22132248 - 22132502
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag--a 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||   |    
T  22132248 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaagaa 22132344  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  22132345 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccct 22132444  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22132445 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 15032410 - 15032660
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  15032410 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacataaac-aaaagtagaa 15032505  T
Q  187 aa-caacgagaga--gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccc-agttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgt 280  Q
    || || |||||||  ||||| |||| ||||||||  | |||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||    
T  15032506 aaacagcgagagaaagaaagaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgt 15032604  T
Q  281 ttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15032605 tccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15032660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 56030937 - 56030669
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | || | |    
T  56030937 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaaac-a 56030841  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagaga--gaaag----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt-------------ccaaattgacctagtc 258  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  56030840 aaagtagaaaacagcgagagaaagaaagaagtgaatagagaacacgaaataatttgttgacccagttcggtgacccagttcggtccaaattgacctagtc 56030741  T
Q  259 t-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  56030740 taggggagagagcagccctccgtttc---atatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttacaagaa 56030669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 22780220 - 22780483
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||  ||   ||||||| ||||||     
T  22780220 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatcaaag--ttataaatataagcc 22780316  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22780317 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 22780416  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22780417 agcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22780483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 18709020 - 18709274
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| || ||||||    
T  18709020 aaaaaccacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaatagtaga 18709116  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  18709117 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcct 18709216  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18709217 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18709274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 16933996 - 16934253
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |  || || |||||||||||| |  ||||||| ||||| | |||  ||| |    
T  16933996 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaaggga--attaagcaaccaaaacaa-gcgtatggaataattaaataca--agcca 16934089  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagc 270  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16934090 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagc 16934189  T
Q  271 agccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16934190 agccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 16934253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 22782592 - 22782848
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   ||||||| | |||| |||||||    
T  22782592 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagta 22782688  T
Q  184 gaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22782689 gaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22782788  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22782789 ctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22782848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544181
Alignment:
Q  245 aaattgacctagtctgggga-gagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 335
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47210863
Alignment:
Q  229 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgc 327  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttac 47210855  T
Q  328 aagaataa 335  Q
    ||||||||    
T  47210856 aagaataa 47210863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47151005
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgacc 47150921  T
Q  254 tagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||| | || | ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  47150922 tagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 47151005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9864182 - 9863945
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa--cataagcgaaaag 181  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||  |||||||||  |||||||| |||||    |||||| |||||||  || |||| |||||    
T  9864182 tgaaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataaaatcacaagc-aaaag 9864087  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct---ggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||||  ||    
T  9864086 tagaaaacaacga--gagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctc 9863990  T
Q  278 cgtttcactat----atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||| ||||||    |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9863989 cgttccactataatgatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 9863945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Original strand, 47210655 - 47210755
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |||||||||||    
T  47210655 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagccaaaagtagaaa 47210751  T
Q  188 acaa 191  Q
    ||||    
T  47210752 acaa 47210755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 333
Target Start/End: Original strand, 3982156 - 3982286
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacct 302  Q
    ||||||||||||  | || ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  3982156 agagagaacacatgaaaaattgtttaccttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactt 3982255  T
Q  303 tacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3982256 tacaaaagagatatcaaagtgttacaagaat 3982286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10113337 - 10113108
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10113337 tgaaaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagta 10113243  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtc-tggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    || ||||  |||||||  || |||| ||||||||  | | ||| || |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  10113242 gataacattgagagag--agaaagaaagaacacatga-attttttttacccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccatt 10113146  T
Q  282 tcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
     |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10113145 ccactataatgattagtaacattac-aaagagatatcaa 10113108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 319
Target Start/End: Original strand, 31983383 - 31983623
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||||||||||||    
T  31983383 tgttgtaaattcgatgaaaaaatcacatcaataaaatatttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattataa 31983477  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaga 266  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||| || | | ||||||| | ||||||    
T  31983478 acacaagt-aaaagtagaaaacaacgagaga------aagaaagaacacacga-aatttgtttacccagtttggtctaatacttacctagtattgggaga 31983569  T
Q  267 gagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  31983570 gagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaa 31983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867237
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcc 54867237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5664706 - 5664576
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||  | || | ||||||||||    
T  5664706 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatgacaaaccaaaagtagaa 5664609  T
Q  187 aac---aacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||   ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5664608 aacattaacgagaga-aaagaaagagagaacaca 5664576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 38270016 - 38270091
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38270016 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataaaca 38270091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| | || ||    
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagaga--aaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgccc 22295470  T
Q  254 tagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaa 309  Q
    |||| | ||||||||||||    ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22295469 tagtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31300630 - 31300540
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||| |||  ||| || |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31300630 aaaggaagaaagagaacacaataatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggagagagcagccctccgttccactata 31300540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 335
Target Start/End: Original strand, 3824629 - 3824681
Alignment:
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3824629 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3824681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 335
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637576
Alignment:
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5637576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985678
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagc 31985678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 289
Target Start/End: Original strand, 5336747 - 5336846
Alignment:
Q  194 agagagaaaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  5336747 agagataaaggaagaaggagaacacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactata 5336846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatca 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 4874469 - 4874528
Alignment:
Q  215 acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4874469 acaaaagaatttgtttacccagttcagttcaatattgacctactctggggagagcgcagc 4874528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4885081 - 4884990
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  4885081 aaaggaagaaagagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15317145 - 15317090
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15317145 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggagagagcagc 15317090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 52043427 - 52043483
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  52043427 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagca--gaataatcaagcaaccaaaa 52043483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047433
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 10047433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739588
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 12739588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Original strand, 18311232 - 18311270
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18311232 aaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaag 18311270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175674
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 26175674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463427
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 36463427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246048
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 39246048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893676
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 48893676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396715
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagc 5396715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8529455 - 8529383
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  8529455 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 8529383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10114680 - 10114601
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10114680 gagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacctaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagc 10114601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315273
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 36315273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329482
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 36329482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 52467354 - 52467398
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  52467354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagaga 52467398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 118)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 1626543 - 1626792
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||    
T  1626543 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaa 1626642  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1626643 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcac 1626742  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1626743 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1626792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 27635515 - 27635764
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27635515 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 27635614  T
Q  187 aacaacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||| ||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27635615 aacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttt 27635714  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27635715 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 27635764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36012235 - 36011975
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012235 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcga 36012136  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  36012135 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagcc 36012036  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36012035 ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 36011975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1313814 - 1313557
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  1313814 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtc 1313715  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1313714 aaaagtagaaaacaacga--gagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 1313617  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1313616 tccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 1313557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 43421268 - 43421524
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  43421268 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 43421367  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43421368 aaagtataaaaca--gcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccat 43421465  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43421466 ctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 43421524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 53915346 - 53915605
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  53915346 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 53915445  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  53915446 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 53915545  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53915546 tccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53915605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 53917519 - 53917773
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  53917519 atgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagt 53917618  T
Q  183 agaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  53917619 agaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgt 53917718  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53917719 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53917773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 43423316 - 43423572
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  43423316 attcgatgaaaaattacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 43423415  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  43423416 aaagtagaaaaca--gcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctct 43423513  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43423514 cagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 43423572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 5926617 - 5926873
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  5926617 attcgatgaaaactcacaccaataacaaacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc-a 5926715  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5926716 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacac-aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcat 5926814  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  5926815 ccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataa 5926873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45883358 - 45883087
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  45883358 gtgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataat 45883259  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggg 263  Q
    || |||| | |||||||||||| | ||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45883258 cacaagccagaagtagaaaacagcaagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggg 45883159  T
Q  264 agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45883158 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 45883087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 4308130 - 4308390
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  4308130 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 4308228  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4308229 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 4308328  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4308329 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4308390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3315092 - 3314832
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  3315092 attcgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 3314993  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  3314992 aaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccc 3314893  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3314892 tccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3314832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6484757 - 6484508
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6484757 aaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtag 6484658  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6484657 aaaacagcgagagagaat--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttc 6484560  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6484559 actatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataa 6484508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 312
Target Start/End: Original strand, 12267832 - 12268061
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12267832 atgaaaaattacaccaataacaaatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagt 12267931  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||    
T  12267932 agaaaacaacgagagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtt 12268030  T
Q  282 tcactatatgatgagtaaccttacaaaagag 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12268031 tcactatatgatgagtaacgttacaaaagag 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 53468313 - 53468565
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  53468313 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaa 53468412  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta--gtctggggag-agagcagccatccgtttc 283  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53468413 aatagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttc 53468512  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53468513 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 53468565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 880312 - 880560
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || | |||||||||    
T  880312 aaaaatcacacccataacaaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtaga 880411  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  880412 aaaca--gcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttta 880509  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  880510 ctatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 880560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 51674626 - 51674875
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  51674626 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaacacaagccaaaagtagaa 51674725  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||     
T  51674726 aacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcag 51674825  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  51674826 tatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 51674875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 18099018 - 18099279
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  18099018 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagcc 18099117  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18099118 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaaa-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcag 18099216  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18099217 ccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32219486 - 32219232
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32219486 aaaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 32219387  T
Q  185 aaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32219386 aaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtt 32219287  T
Q  282 tcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  32219286 tcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataa 32219232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 27101030 - 27101290
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  27101030 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagca 27101128  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27101129 aaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagc 27101228  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27101229 catccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 27101290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 32263896 - 32264148
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32263896 gaaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 32263995  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  32263996 aaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 32264094  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttac-aaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32264095 actataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32264148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 47701528 - 47701780
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  47701528 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt---gatcaagtaataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacacaagcca 47701624  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  47701625 aaagtagaaaacaatgagaga--aaggaa-agagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccct 47701721  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47701722 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47701780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3307168 - 3306909
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  3307168 attcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagc 3307069  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcca 275  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  3307068 caaaagtagaaaacagcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct-aggagagagcaacca 3306970  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3306969 tccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3306909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51943758 - 51943521
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagag- 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||     
T  51943758 ataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 51943659  T
Q  198 --agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatg 294  Q
      ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943658 aaagaagagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatg 51943559  T
Q  295 agtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  51943558 agtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa 51943521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 18096748 - 18097009
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  18096748 attcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 18096847  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18096848 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 18096946  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||    
T  18096947 ctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataa 18097009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 47148758 - 47149004
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  47148758 atgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggg-------ataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagt 47148850  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||    
T  47148851 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtt 47148950  T
Q  282 tcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47148951 tcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 47149004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 25688015 - 25688270
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  25688015 gaaaactcacaccaataacaaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagta 25688114  T
Q  184 gaaaaca---acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccg 279  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25688115 gaaaacatcaacgagaga-aaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 25688213  T
Q  280 tttcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25688214 tttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25688270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42990701 - 42990452
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  42990701 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 42990604  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  42990603 aacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattc 42990504  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42990503 accatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42990452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24980118 - 24979855
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  24980118 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 24980019  T
Q  177 aaaagtagaaaa----caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagca 271  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24980018 aaaagtagaaaaacaacaacgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagca 24979920  T
Q  272 gccatccgtttcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||  ||| |||||||||    
T  24979919 gccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataa 24979855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43228692 - 43228439
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||| |    
T  43228692 atgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aaatacaagccaaaatt 43228595  T
Q  183 agaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccg 279  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43228594 agaaaacaacagcgagagtaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 43228495  T
Q  280 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  43228494 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43228439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 28101856 - 28102111
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  || |  ||||||  |||| || |     
T  28101856 attcgatgaaaaattacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caatta--aacacaaccc 28101951  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctag-tctggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28101952 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagcca 28102051  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28102052 tccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28102111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 332
Target Start/End: Original strand, 48361538 - 48361777
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  48361538 caataacaaacttaatgtatggaacaatgaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgaga 48361637  T
Q  197 g---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatga 292  Q
    |   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  48361638 gaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatatta 48361737  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48361738 tgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 48361777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4666913 - 4666664
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  || ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||     
T  4666913 gaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtat 4666814  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4666813 aaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--agagcagccctccgtttca 4666716  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4666715 ctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 4666664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 9604455 - 9604716
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | || |    
T  9604455 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataatcacaggcca 9604553  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaa-aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||| |||||||||||   |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9604554 aaaatagaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcag 9604653  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  9604654 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 9604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 10955883 - 10956136
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10955883 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10955979  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10955980 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctcc 10956079  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10956080 gttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10956136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41849454 - 41849243
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  41849454 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 41849358  T
Q  187 aacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41849357 aacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttca 41849258  T
Q  285 ctatatgatgagtaa 299  Q
    |||||||||||||||    
T  41849257 ctatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1321881 - 1321627
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  1321881 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 1321784  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1321783 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 1321684  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1321683 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1321627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43226487 - 43226233
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||| |    
T  43226487 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaatta-aaatacaagcca 43226391  T
Q  178 aaagtagaaa--acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43226390 aaagtagaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 43226294  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  43226293 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43226233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18163072 - 18162811
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  18163072 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 18162973  T
Q  177 aaaagtagaaaac---aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcag 272  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18162972 aaaagtagaaaactgcagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcag 18162875  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaac-cttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  18162874 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataa 18162811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53591589 - 53591346
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |    
T  53591589 attcaatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacataagtca 53591490  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaat--ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcca 275  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  53591489 aaagcagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctggggagagagcatccc 53591392  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53591391 ttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatg 53591346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 54691425 - 54691683
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |    
T  54691425 attcgatgagaaaacacatcaataacaaattt-atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagcca 54691523  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  54691524 aaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaaacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccc 54691623  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  54691624 tccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataa 54691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 10958179 - 10958432
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10958179 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10958275  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10958276 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 10958375  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10958376 gttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 10958432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15781285 - 15781090
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |    
T  15781285 attcgatggaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaagtca 15781186  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15781185 aaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcag 15781090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6232192 - 6231948
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| || ||    
T  6232192 aaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagtaa----taatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaaataaaa 6232097  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  6232096 aacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcac 6231999  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6231998 tgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 6231948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 10084245 - 10084498
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10084245 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10084341  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10084342 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctcc 10084441  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  10084442 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataa 10084498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 141 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715617
Alignment:
Q  141 aaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaagg-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  240 ggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtatgggg-gagagcaaccatctgtttcac--tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 39715617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25533834 - 25533590
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  25533834 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 25533739  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25533738 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 25533649  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  25533648 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25533590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5900074 - 5899820
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  5900074 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5899977  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||       |||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5899976 aaaacaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5899877  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5899876 cgatccactatatgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5899820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5886601 - 5886347
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  5886601 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5886504  T
Q  185 aaaacaacgagag-----agaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||| | ||     |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5886503 aaaacaacaacagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5886404  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  5886403 cgatccactatatgatgagtaacgtttc-aaagacaaatcaatgggttacaagaataa 5886347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 51726863 - 51727116
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  51726863 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaag-aataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 51726958  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51726959 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 51727058  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  51727059 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 51727116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5192052 - 5191803
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5192052 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5191956  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  5191955 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagaacagccctct 5191857  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaat 333  Q
    | | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  5191856 gatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat 5191803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17795661 - 17795406
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||| || || | |    
T  17795661 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataatcacaaac-a 17795565  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17795564 aaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcctt 17795466  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17795465 ccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 17795406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19104101 - 19103846
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||| || || | |    
T  19104101 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataatcacaaac-a 19104005  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19104004 aaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcctt 19103906  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19103905 ccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 19103846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23633854 - 23633602
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  23633854 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaacacaagcca 23633758  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
     |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23633757 caagtagaaaacatcgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctggggagagagcagccctc 23633660  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  23633659 cttttcactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcatcgggttacaagaataa 23633602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28181401 - 28181242
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28181401 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggac-aatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 28181303  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa 246  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28181302 aaacagcgacagagaaaagaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890188
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38890441 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38890345  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  38890344 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctcc 38890245  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38890244 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38890188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11168503 - 11168249
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  11168503 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 11168407  T
Q  186 aaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||      |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11168406 aaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 11168307  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11168306 cgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11168249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30006150 - 30005989
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30006150 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagc 30006051  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30006050 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 30005989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 335
Target Start/End: Original strand, 28761285 - 28761538
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  28761285 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaa--attataa 28761382  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggg-ag 265  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  28761383 tcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa--------------caaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggag 28761467  T
Q  266 agagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28761468 agagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 28761538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42992594 - 42992418
Alignment:
Q  162 ttataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 259  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992594 ttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 42992495  T
Q  260 -ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42992494 gggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 42992418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25389309 - 25389055
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |  | |||||||||    
T  25389309 aaaaatcataccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-agccaaaaagtaga 25389212  T
Q  186 aaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||  ||||       ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25389211 aaacaacggcgagaagaatacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 25389112  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  25389111 ccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 25389055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 10191168 - 10191419
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10191168 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10191264  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  10191265 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctcc 10191362  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| || || | ||| |||||||||    
T  10191363 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataa 10191419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720711
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa---- 201  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||        
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  202 aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaa 299  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtat 26720731  T
Q  300 ccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  26720730 cgttacaaaagagaaatcaa 26720711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 5522482 - 5522735
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || | ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  5522482 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 5522578  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5522579 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctc 5522678  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5522679 cgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5522735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170552
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataa 11170552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 4103752 - 4104004
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||   ||||||| | | |  ||||||| ||    
T  4103752 aaaatcacaccaataacaaacttgatgcgtggagcaagga-tagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaag--ttataaatacatgtcaaaagtaaaa 4103848  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  4103849 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctcc 4103948  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4103949 gatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4104004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31151746 - 31151508
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||  |    
T  31151746 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagt-a 31151651  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    | |||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  31151650 agagtagaaaaaca-gcgagagaaaagaagagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccc 31151552  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatca 318  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31151551 tccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca 31151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3859914 - 3859676
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  3859914 gaaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aaatacaagccaaaagtag 3859817  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |    
T  3859816 aaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatcc 3859727  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3859726 actatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgtgttacaagaataa 3859676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 561640 - 561886
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  561640 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaacc-aaacaaagtgtatgga--agttataaacacaagc-aaaagtagaa 561735  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtctg--gggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||| ||||||| | || ||||||||||||   | |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |    
T  561736 aacatcgagaga-agagaaagagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttcc 561833  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  561834 actataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataa 561886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 747178 - 746906
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||    
T  747178 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataa 747082  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaac-gagaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 259  Q
    | | |||| |||||||||||||||| | |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  747081 atacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 746982  T
Q  260 -ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  746981 gggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 746906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25634278 - 25634035
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |  | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25634278 aaaatcacaccaataa-atacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacaattataaacacaagc-aaaagtagaa 25634184  T
Q  187 aacaacgagag--agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||   ||||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25634183 aacaacaagagtaagaaagga---gagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttc 25634088  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  25634087 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 25634035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42992783 - 42992605
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| |  ||||| ||||    
T  42992783 aaaatcacactaataacaaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatatatgtcaaaagcagaa 42992686  T
Q  187 aacaa---cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggag 265  Q
    |||||   ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992685 aacaatggcgaga-agaaaaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggag 42992605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 7606451 - 7606696
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||    |     
T  7606451 attcgatgaaaaat-acaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaatacaggc-ca 7606547  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||||| || |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7606548 aaaagtagaaaacaac-agcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 7606637  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7606638 tccgatccactatatgacgagtaacgttac-aaatagaaatcaatgtgttacaagaataa 7606696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Original strand, 880092 - 880251
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||| || || |     
T  880092 attcgatgaaaaagtcacaccaataataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaaacc 880191  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtt 238  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  880192 aaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 53893892 - 53894105
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |    
T  53893892 gtgttgtaaattcgatcgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaata 53893990  T
Q  169 cataagcgaaaagtag-aaaacaacgagagaga-------aaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 258  Q
    || |||| |||||||| ||||||||| | ||||       || |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53893991 ca-aagccaaaagtagaaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 53894088  T
Q  259 t-ggggagagagcagcc 274  Q
    | |||||||||||||||    
T  53894089 tgggggagagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38210781 - 38210519
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||  |||| | |||| |    
T  38210781 attcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataat--taaatacaagcca 38210685  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||| | ||||       || ||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  38210684 aaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagag 38210586  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||  |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38210585 agcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 38210519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50494418 - 50494148
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |    
T  50494418 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaata 50494320  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-g 260  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  50494319 ca--agccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 50494222  T
Q  261 gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  50494221 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 50494148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 22114159 - 22114414
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  22114159 aaaatcacaccaatagcaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 22114255  T
Q  186 aaacaa----cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||| ||    ||||| ||||    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||| || ||     
T  22114256 aaaaaaacggcgaga-agaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccc 22114354  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22114355 tccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 22114414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 6065641 - 6065904
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  6065641 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 6065737  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||||  ||||       |||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6065738 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagag 6065837  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6065838 agcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6065904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 335
Target Start/End: Original strand, 889779 - 889882
Alignment:
Q  233 ccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaaga 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  332 ataa 335  Q
    ||||    
T  889879 ataa 889882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 458686 - 458433
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  458686 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 458590  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  458589 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctc 458490  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  458489 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 458433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 10621374 - 10621638
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| |||| ||   ||||||| | ||||    
T  10621374 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagc 10621470  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaga 266  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  10621471 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggaga 10621570  T
Q  267 gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10621571 gagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 10621638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919179
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatat 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 456309 - 456056
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  | | ||||||| | |||| ||||||||||    
T  456309 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 456213  T
Q  187 aacaacgagagaga-------aaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||| | ||||       || |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  456212 aacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccct 456114  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  456113 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 456056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 36871166 - 36871410
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||  ||||    
T  36871166 aaaaatcacaccgataa-atacttgatgtgtggagcaag-aataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagataga 36871260  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  36871261 aaacagcgagaga-aaataaagagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 36871358  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  36871359 actataatgatgattaactttac-aaagagataacaaagggttgcaagaataa 36871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25635772 - 25635529
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |  | |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25635772 aaaatcacactaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacagttataaacacaagc-aaaagtagaa 25635678  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| |||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || || ||||||    
T  25635677 aacaacgagtga--aagaaagaagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttca 25635581  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25635580 ccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataa 25635529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24181668 - 24181528
Alignment:
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcactata-tgat 293  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  24181668 gagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgat 24181570  T
Q  294 gagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  24181569 gagtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataa 24181528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 6063291 - 6063554
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   ||||||| | ||||     
T  6063291 attcgatgaaaaatcacaccgataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagcc 6063387  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    |||||||||||||||||  ||||       |||| | |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6063388 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 6063487  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6063488 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6063554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 247
Target Start/End: Original strand, 8183040 - 8183154
Alignment:
Q  131 tcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttg 230  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8183040 tcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgttg 8183137  T
Q  231 acccagttcggtccaaa 247  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  8183138 acccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956834
Alignment:
Q  262 ggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29956834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918052
Alignment:
Q  227 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagtt 325  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  326 gcaagaataa 335  Q
     |||||||||    
T  35918043 acaagaataa 35918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674166
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||||    
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagaga-aaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacc 1674195  T
Q  254 tagtctgg-ggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674194 tagtctggtggagagagcagccatccgtt 1674166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 28412878 - 28413140
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||| ||   ||||||| | |||  |    
T  28412878 attcgatgaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaag--ttataaatacaagtca 28412973  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  28412974 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagag 28413073  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28413074 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28413140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Original strand, 13420189 - 13420295
Alignment:
Q  231 acccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgca 328  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13420189 acccatttcggtccaaaactgacctagtctggtgagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttaca 13420288  T
Q  329 agaataa 335  Q
    |||||||    
T  13420289 agaataa 13420295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 1620328 - 1620567
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  1620328 aaaaatcacaccaataa-aaacttgatatgtggagaaa--attaatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaga 1620420  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||| |||||| | |||| | ||||||||||| || | |||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  1620421 aaaccacgagata-aaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttcc 1620518  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  1620519 actataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaa 1620567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53597628 - 53597384
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  53597628 aaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataaacacaagcaaaaa-taga 53597535  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaag-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||  | |||| | | ||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || ||| ||     
T  53597534 aaacaacgagaga--aagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattc 53597438  T
Q  283 cactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  53597437 cactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataa 53597384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181185
Alignment:
Q  241 gtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcact 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtctagggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 14634408 - 14634535
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggga-gagagcagccatccgtttcactat-atg 291  Q
    ||||||||| ||||||||| | |  | |||||||| ||| ||||||||| || | | ||||||||||  || ||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  14634408 gagagaaagaaagagagaaaatacgaaaatttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccatccgttccactattatg 14634507  T
Q  292 atgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14634508 atgagtaactttacaaaagagatatcaa 14634535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11170772 - 11170670
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||  ||| |||||||||    
T  11170772 aaaatcacattaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataattaaataca--agccaaaagtaga 11170676  T
Q  186 aaacaa 191  Q
    ||||||    
T  11170675 aaacaa 11170670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884317
Alignment:
Q  271 agccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 320  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 54884317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 332
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007630
Alignment:
Q  249 tgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaa 11007630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 47878165 - 47878237
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  47878165 aagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactata 47878237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Original strand, 5236457 - 5236496
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5236457 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctgggga 5236496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736338
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 1736338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Original strand, 10612761 - 10612844
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10612761 agagagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 10612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552916
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 18552916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709823
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 30709823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 308
Target Start/End: Original strand, 31021120 - 31021244
Alignment:
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||    ||| || ||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  31021120 tagaaaacaacgagagagagagagagagagaacacgaat---tttttttacctagttcgatcctatactgacctagtctggggtgagagcagccctccg- 31021215  T
Q  281 ttcactat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  31021216 ttcaatataatgatgagtaactttacaaa 31021244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 32744436 - 32744474
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32744436 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 32744474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913423
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 40913423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331675
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 44331675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370520
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 8370520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711276
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 21711276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974986
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 27974986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986480
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 27986480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 40844656 - 40844705
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40844656 ttgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagcc 40844705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29845189 - 29845141
Alignment:
Q  218 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta-gtctggggag 265  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29845189 aaagactttgttcacccagttcggcccaaattgacctacgtctggggag 29845141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236255
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggg 30236255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 30480365 - 30480614
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  30480365 aaaatgacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaa 30480464  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30480465 aacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcac 30480564  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30480565 tatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 30480614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 321
Target Start/End: Original strand, 33541271 - 33541507
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33541271 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 33541370  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33541371 aatcagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttca 33541470  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541471 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 14419043 - 14419302
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  14419043 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 14419142  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14419143 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccat 14419242  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  14419243 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataa 14419302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15073194 - 15072935
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15073194 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 15073095  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15073094 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15072995  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15072994 tccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15072935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14808235 - 14807975
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14808235 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtaga 14808136  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-----------ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  14808135 aaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagcc 14808036  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14808035 ctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14807975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 83 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41383141 - 41382889
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  41383141 atgaaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagccagaagt 41383042  T
Q  183 agaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccg 279  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  41383041 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctg 41382942  T
Q  280 tttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41382941 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 41382889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15068464 - 15068205
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |    
T  15068464 attcgatgaaaaatcacaccaacaacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaacacaagcca 15068365  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15068364 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15068265  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15068264 tccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15068205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41385225 - 41384971
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  41385225 attccatgaaaaatcacacaaataacaaacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 41385130  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41385129 aaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagagaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 41385030  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41385029 cctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 41384971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 28251427 - 28251678
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  28251427 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccacaagtaga 28251525  T
Q  186 aaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |     
T  28251526 aaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatc 28251625  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  28251626 cactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataa 28251678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36866012 - 36865759
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36866012 aaaaccacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaa 36865913  T
Q  187 aacaacgagag--agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  36865912 aacaacgagagaaagaaaaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgttt 36865813  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  36865812 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataa 36865759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 279
Target Start/End: Original strand, 37214122 - 37214319
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37214122 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagt 37214221  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccg 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37214222 agaaaacaacgagagagaaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25953002 - 25952744
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || | |    
T  25953002 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaacacaatcca 25952903  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25952902 aaagtagaaaacggcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccct 25952804  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25952803 ccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 25952744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 334
Target Start/End: Original strand, 15185578 - 15185825
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||| | |||||||    
T  15185578 tgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcataaac-aaaagta 15185674  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  15185675 gaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgttt 15185772  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15185773 cactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15185825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Original strand, 13858334 - 13858595
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  13858334 tgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataagaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaac 13858431  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13858432 acaagccaaaagtagaaaaca--gtgagagaaagaaagggagaacac-aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagaga 13858528  T
Q  269 gcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  13858529 gcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaagaataa 13858595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15956435 - 15956181
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  | | |||||| || || ||     
T  15956435 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataatcacaaacg- 15956339  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |    
T  15956338 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccct 15956241  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15956240 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15956181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 27106755 - 27107008
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || |  | |    
T  27106755 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacagac-a 27106851  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  27106852 aaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccct 27106949  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  27106950 ccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataa 27107008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 28283070 - 28283330
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  ||||| | |||| |    
T  28283070 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaatacaagcca 28283166  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagc 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283167 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagc 28283266  T
Q  271 agccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28283267 agccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttgcaagaataa 28283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1225626 - 1225390
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  1225626 aatcacgccaataacatacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaa----------caattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 1225537  T
Q  189 caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcacta 287  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1225536 cagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcacta 1225439  T
Q  288 tatgatgagtaaccttac-aaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1225438 tatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 1225390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 321
Target Start/End: Original strand, 35872309 - 35872537
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  35872309 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagcca 35872408  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||| ||    
T  35872409 aaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat------------gggagagagcagccctc 35872493  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35872494 cgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 35872537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3874473 - 3874234
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  3874473 tgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagta 3874377  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |     
T  3874376 gaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatc 3874287  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3874286 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3874234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14477732 - 14477519
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |    
T  14477732 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaacacaagcca 14477633  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-cagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcca 275  Q
    |||  | |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  14477632 aaa-aaaaaaaaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagcca 14477534  T
Q  276 tccgtttcactatat 290  Q
    |||||||||||||||    
T  14477533 tccgtttcactatat 14477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27829774 - 27829521
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||  ||||||||||    
T  27829774 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatataagtcaaaagtagaa 27829677  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27829676 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 27829577  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27829576 gatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27829521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15809695 - 15809442
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||  |||| |||||    
T  15809695 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--aggcaaaaatagaa 15809599  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  15809598 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctct 15809499  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15809498 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 15809442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43530601 - 43530339
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  43530601 attcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 43530505  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagaga 268  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43530504 aaagtagaaaacaatggcaaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagaca 43530406  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  43530405 gcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataa 43530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27827463 - 27827210
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  27827463 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 27827366  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  27827365 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctcc 27827266  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  27827265 gatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 27827210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 5372042 - 5372289
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||| ||||  ||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  5372042 aaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtag 5372141  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||| ||||||      |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||    
T  5372142 aaaacaatgagaga------aagaaagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgttt 5372235  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5372236 cactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 5372289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 320
Target Start/End: Original strand, 22684509 - 22684749
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  22684509 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 22684605  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  22684606 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccct 22684705  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22684706 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaat 22684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4424496 - 4424242
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  4424496 aaaatcacaccaataacaa-cttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 4424400  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4424399 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 4424300  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     | | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  4424299 tgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataa 4424242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32339787 - 32339533
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||  |||||||||    
T  32339787 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtaga 32339691  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||| ||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32339690 aaataacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 32339591  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32339590 cgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32339533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21482790 - 21482534
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| |  |||| |||||||   |||||| || || |    
T  21482790 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaag--ttataatcacaaac 21482693  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21482692 -aaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 21482596  T
Q  275 atccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21482595 ctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21482534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27911380 - 27911238
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatatga 292  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27911380 gagagagagagagagagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatga 27911281  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911280 tgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27911238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27957799 - 27957657
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatatga 292  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27957799 gagagagagagagagagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatga 27957700  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27957699 tgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataa 27957657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31162683 - 31162433
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||  | ||||||| | |||| ||||||||||    
T  31162683 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaa 31162586  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct---ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||| || |||     
T  31162585 aacaacgagagaaaagaaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttc 31162487  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31162486 cactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 31162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21480982 - 21480726
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||| || || |    
T  21480982 attcgatgaaaaataacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac 21480885  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480884 -aaaagaagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 21480788  T
Q  275 atccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21480787 ctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 21480726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 2467995 - 2468241
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||   |||||| || ||   |||| |||||    
T  2467995 aaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaag--ttataatcacaaaacaaaattagaa 2468092  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  2468093 aacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcac 2468190  T
Q  286 tata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  2468191 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataa 2468241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 609214 - 608958
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  609214 aaaatcgcaccaataacaa-cttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtag 609118  T
Q  185 aaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
    |||||||||   ||| ||||    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  609117 aaaacaacggcaaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagcc 609019  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  609018 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 608958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18811194 - 18810932
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  18811194 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 18811098  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    ||||||||||||| || || |||||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  18811097 aaaagtagaaaacgac-agcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagag 18810999  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||  | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18810998 agcagccctccaatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18810932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44721318 - 44721068
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||  ||  ||||||||||||    
T  44721318 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca--agtcaaaagtagaaaa 44721222  T
Q  189 caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||      
T  44721221 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaa 44721122  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  44721121 tccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44721068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 181905 - 181798
Alignment:
Q  132 caaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttga 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  181905 caaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacga--gagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttga 181808  T
Q  232 cccagttcgg 241  Q
    ||||||||||    
T  181807 cccagttcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18813368 - 18813106
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  18813368 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 18813272  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  18813271 aaaagtagaaaacgacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagaga 18813172  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18813171 gcagccctccaatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18813106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43082451 - 43082198
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  43082451 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 43082355  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43082354 aaacaacgtcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 43082255  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  43082254 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43082198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 3005502 - 3005743
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||  |||||    |    
T  3005502 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaatacaag--aaaaggtaca 3005596  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||||||||   || ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  3005597 aacaacgagaga---agaaagggagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttcca 3005691  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  3005692 ctataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataa 3005743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43080080 - 43079827
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||  |||||||||    
T  43080080 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagtcaaaagtaga 43079984  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43079983 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 43079884  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  43079883 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 43079827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 319
Target Start/End: Original strand, 31578148 - 31578373
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||| |  || |||  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31578148 aaaaatcacacgaataaaatacttgatgtgtgtagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa-tatgggcaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 31578243  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||||||||||      |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||   |||||| |    
T  31578244 aaacaacgagaga------aagagagagcacacaa-aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttcc 31578336  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31578337 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 31578373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27911553 - 27911439
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27911553 tgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataattaga-aactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagta 27911456  T
Q  184 gaaaacaacgagagaga 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  27911455 gaaaacaacgagagaga 27911439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27957972 - 27957858
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27957972 tgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataattaga-aactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagta 27957875  T
Q  184 gaaaacaacgagagaga 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  27957874 gaaaacaacgagagaga 27957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 3883444 - 3883556
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  3883444 attcgatgaaaaatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 3883540  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg 193  Q
    ||||||||||||||||    
T  3883541 aaagtagaaaacaacg 3883556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31035522 - 31035342
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacc 253  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  31035522 ggaacaattaaaaacacaagc-aaaactagaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacc 31035427  T
Q  254 ta--gtctgggg-agagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  31035426 tatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaagggttacaagaataa 31035342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6376356 - 6376229
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactat-a 289  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |    
T  6376356 gagagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataa 6376258  T
Q  290 tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6376257 tgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 6376229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  263 gagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 24873047 - 24873291
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc-aaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||  | | ||||||| | ||||     
T  24873047 attcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcc 24873143  T
Q  177 aaaa-gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||         |||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24873144 aaaaggtagaaaacaacg-gcgaga---------agaacacaga--aatttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagcc 24873231  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  24873232 ctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatcggttacaagaataa 24873291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 31566425 - 31566605
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |  || | |  | |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  31566425 aaaaatcacaccaataaaatacttgatctatggagcaa--aataatcaaacaactaatatcaa-tgtgggtaacaattataaacacaagc-agaagtaga 31566520  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  31566521 aaacagcgagaga--aagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggg-gagagcagc 31566605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833789
Alignment:
Q  224 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaa 16833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 181798 - 181726
Alignment:
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  181798 ggggagagagcagtcatctgtttcactat--gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataa 181726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3896122 - 3896063
Alignment:
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3896122 ggggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 183302 - 183244
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaac 136  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  183302 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaac 183244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17847986 - 17847789
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||  | |||| || |||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  17847986 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaaaaa--attaattaagcaaccaaaacaatgtaggtg--acaattataaacacaagc-aagagtaga 17847892  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||| |    ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  17847891 aaaaat---gagagaaataaagagagaacacatgaaaattagttttcccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattcc 17847795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930237
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 10930237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Original strand, 18106084 - 18106124
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18106084 ttgacccagttcggtccaacttgacctattctggggagaga 18106124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 23179555 - 23179627
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23179555 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactata 23179627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212916
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 15212916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811408
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 27811408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352280
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 33352280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321210
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 40321210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733836
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 4733836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765863
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752438
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403274
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 26403274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292507
Alignment:
Q  232 cccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaacttgacctactctggggagaga 1292507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 2467797 - 2467833
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2467797 aaaatcacactaataataaacttgatgtatggagcaa 2467833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 2467896 - 2467932
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2467896 aaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaa 2467932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 12702634 - 12702678
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12702634 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 12702678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 17799418 - 17799490
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  17799418 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggagagagagcagctctccgttccactata 17799490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43036591 - 43036555
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43036591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgg 43036555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 14247 - 14493
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14247 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 14345  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  14346 aacagcgagagagaaaggaagagagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccac 14443  T
Q  286 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14444 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 14493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15326 - 15196
Alignment:
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacct 302  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  15326 gaagagagaacacaa--gaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactt 15229  T
Q  303 tacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15228 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15431 - 15395
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15431 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9020390 - 9020129
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  9020390 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagcca 9020291  T
Q  178 aaagtagaaaacaa---cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9020290 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagc 9020191  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9020190 cccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9020129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 335
Target Start/End: Original strand, 3629706 - 3629975
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3629706 ctatgtgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta 3629805  T
Q  165 taaacataagcgaaaa-gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3629806 taaacacaagccaaaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg 3629903  T
Q  264 agagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3629904 agagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3629975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 3631792 - 3632049
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  3631792 attcgatgaaaaaacacaccaataacaaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 3631891  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  3631892 aaagtagaaaacatcgagagaaaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gggacagagcagccctc 3631990  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3631991 cgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3632049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 11982880 - 11983140
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| |    
T  11982880 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatcacaagcca 11982978  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11982979 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 11983078  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11983079 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11983140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 30728683 - 30728939
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  30728683 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagta 30728782  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  30728783 gaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttc 30728882  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaag----agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  30728883 cactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgagttacaaaaataa 30728939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15346813 - 15346550
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346813 tgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 15346714  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    | |||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15346713 acaagccaaaagtagaaaacaac--aagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 15346617  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15346616 gcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataa 15346550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 335
Target Start/End: Original strand, 1069588 - 1069830
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  1069588 accaataacaaattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcga 1069687  T
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactat-atga 292  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  1069688 gagagaaaagaagagagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatga 1069787  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1069788 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 24338303 - 24338558
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  24338303 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaacca 24338402  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  24338403 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggg-gagagcagccctc 24338499  T
Q  278 cgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24338500 cgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24338558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15367490 - 15367234
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15367490 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 15367391  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--gagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  15367390 aaagtagaaaaatac--gagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagcct 15367294  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  15367293 tccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataa 15367234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32280464 - 32280199
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||    |  | ||||||||||||    
T  32280464 gtgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacaattataaa 32280368  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
     | |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32280367 tacaagccaaaagtagaaaataacatgagagaaaggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 32280268  T
Q  268 agcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32280267 agcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 32280199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13057651 - 13057397
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| | |||||    | ||||||||||| || || | |    
T  13057651 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataatcacaaac-a 13057556  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  13057555 aaagtagaaaacagatagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccct 13057457  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13057456 ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13057397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13040132 - 13039957
Alignment:
Q  160 aattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 259  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13040132 aattataatcataaac-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtct 13040035  T
Q  260 -ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13040034 aggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13039957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 1230105 - 1230360
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| |||| ||||||| |    
T  1230105 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaataca-aagccaaaagtata 1230202  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1230203 aaacaacggcgagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 1230302  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1230303 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1230360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 15541003 - 15541250
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatgg-aacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||   ||| |||| |||||| || || | ||||     
T  15541003 atgaaaaatcaaaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaa-gt---tggtaacagttataatcacaaac-aaaat 15541097  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  15541098 tagaaaacaacgagagagaaaa-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgt 15541196  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15541197 ttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 15541250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 28241179 - 28241432
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  28241179 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 28241275  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||      |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28241276 aacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctcc 28241375  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28241376 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28241432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 3233575 - 3233841
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || |     
T  3233575 attcgatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaacacaaacc 3233674  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc-----ggtccaaattgacctagtctgggg-agaga 268  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  3233675 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagaga 3233774  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3233775 gcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 3233841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 12161510 - 12161668
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||    
T  12161510 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttagggagagaacagccat 12161609  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12161610 ccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 12161668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 14507037 - 14507286
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  14507037 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaac 14507133  T
Q  190 aacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtt 281  Q
    ||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  14507134 aacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgat 14507233  T
Q  282 tcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14507234 tcactatatgataagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14507286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 4816087 - 4816342
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  |||||||||    
T  4816087 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtaga 4816183  T
Q  186 aaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||| |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4816184 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 4816283  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4816284 ccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 4816342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14466783 - 14466527
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| |||| ||||||||||||| | |||| ||   |||||| || || | |    
T  14466783 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaag--ttataatcacaaac-a 14466687  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||    
T  14466686 aaagtagaaaacagcagcgagagaaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtca 14466587  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14466586 tccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaata 14466527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186183
Alignment:
Q  152 tatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattga 12186097  T
Q  252 cctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12186098 cctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 12186183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 14458615 - 14458878
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  14458615 attcgatgaaaaatcacaccaataatag-cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 14458711  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14458712 aaaagtagaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14458811  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14458812 gcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 14458878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26065440 - 26065186
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||    
T  26065440 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26065342  T
Q  184 gaaaacaac-----gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||||     ||   | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26065341 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctcc 26065242  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  26065241 gatccactatataacgagtaacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26065186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26085409 - 26085155
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||    
T  26085409 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26085311  T
Q  184 gaaaacaac-----gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||||     ||   | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26085310 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctcc 26085211  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  26085210 gatccactatataacgagtaacgttac-aaagagaagtcaatgggttacaagaataa 26085155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 2628743 - 2628996
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  2628743 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 2628839  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2628840 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 2628939  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2628940 cgatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2628996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30967657 - 30967404
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  30967657 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataattaaataca--agtcaaaagtagaa 30967561  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||    
T  30967560 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctcc 30967461  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30967460 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30967404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 30034463 - 30034714
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  30034463 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagga-taatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaag--ttataaatacaagctaaaagtagaa 30034557  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  30034558 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctc 30034656  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30034657 cgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 30034714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10584348 - 10584227
Alignment:
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10584348 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcac 10584249  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttaca 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  10584248 tataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 26068243 - 26068505
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |  | |    
T  26068243 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca-agccaa 26068340  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26068341 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 26068440  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26068441 cagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26068505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 29754557 - 29754819
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |  | |    
T  29754557 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaatacg-agccaa 29754654  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  29754655 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 29754754  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  29754755 cagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 29754819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 19704422 - 19704679
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  19704422 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 19704518  T
Q  186 aaa--caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||  |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19704519 aaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 19704618  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa-agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||  | |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19704619 tccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataa 19704679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 26065960 - 26066234
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  26065960 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 26066058  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 258  Q
    || |  | ||||||||||||||||   ||||   | ||| |||||      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066059 ca-agccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 26066157  T
Q  259 t-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26066158 taggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26066234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 335
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532792
Alignment:
Q  217 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatat 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagggatagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatat 15532773  T
Q  317 caatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  15532774 caatgggttacaagaataa 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390582
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaacctt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  304 acaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 3390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33309313 - 33309061
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  33309313 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 33309217  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33309216 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 33309117  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33309116 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33309061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 335
Target Start/End: Original strand, 3027699 - 3027965
Alignment:
Q  66 tatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattat 165  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||| |||||||   ||||    
T  3027699 tatgtgttgtgaattcaatgaaaaatcacaccgataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaag--ttat 3027794  T
Q  166 aaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggga 264  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  3027795 aaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggg 3027891  T
Q  265 ga--gagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  3027892 gaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataa 3027965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 20915213 - 20915466
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20915213 aaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataattaaataca--agccaaaagtaga 20915309  T
Q  186 aaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||| |||||| |||| |||    | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20915310 aaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 20915408  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20915409 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20915466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33311582 - 33311330
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  33311582 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 33311486  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  33311485 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctc 33311386  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33311385 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 33311330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3394829 - 3394695
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  3394829 attcgatgagaaaacacaccaataaaaatcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 3394730  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagag 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3394729 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagag 3394695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22491071 - 22490921
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||    |  | |||||||||||||||| || |    
T  22491071 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaag---tgggtaacaattataaacataggcca 22490975  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 233  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22490974 aaagtagaaaacaacga--gagaaagaaagagagagcacaaaagaatttgttgacc 22490921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 26932416 - 26932672
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||| ||    
T  26932416 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaggt 26932512  T
Q  183 agaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||| |||||  |||| |||    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |    
T  26932513 agaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaac 26932611  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26932612 cctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 26932672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 319
Target Start/End: Original strand, 25465460 - 25465686
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25465460 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattataaactcaagc-aaaagtaga 25465553  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||| | |||||| |    
T  25465554 aaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttcc 25465650  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25465651 actataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 25465686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26945597 - 26945347
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | || | |||| |||||||||| || |||| |||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  26945597 atgaaaaatcacaccaataaaacacttgatatgtgaaacaagtaataatcaaagaatcaaa-caaagtgtaaggaag--ttataaacacaagccaaaagt 26945501  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||| |||| |||||| ||| | |||    
T  26945500 agaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgt 26945403  T
Q  281 ttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26945402 tctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataa 26945347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937278
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacc 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||   ||||    
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacc 12937222  T
Q  254 tagtctggggagagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  12937223 tagtctggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 12937278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 335
Target Start/End: Original strand, 5273050 - 5273326
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaat 162  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   |    
T  5273050 ctatgtgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--t 5273146  T
Q  163 tataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta 255  Q
    | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273147 tttaaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta 5273246  T
Q  256 gtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  5273247 gtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 5273326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19696887 - 19696659
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||   ||  ||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  19696887 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaag--taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaa 19696793  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||  | | ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  19696792 aaaca-gcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttcca 19696695  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19696694 ctataatgatgaataactttacaaaagagatatcaa 19696659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477477
Alignment:
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atgat-------ga 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||       ||    
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacga 25477517  T
Q  296 gtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25477516 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 25477477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 335
Target Start/End: Original strand, 12195352 - 12195625
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattata 166  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   |||||    
T  12195352 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaag--ttata 12195448  T
Q  167 aacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 258  Q
    || | |||| |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12195449 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 12195548  T
Q  259 t-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  12195549 tgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 12195625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15720004 - 15719845
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaga--gagcagcc 274  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |     
T  15720004 aaaaatagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaact 15719907  T
Q  275 atccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15719906 ctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15719845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Original strand, 15530022 - 15530156
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||   |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  15530022 aaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataatcagacaatcaaaatttaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtag 15530121  T
Q  185 aaaacaacgagagag-aaaggaagagagaacacaa 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||||||||||||||    
T  15530122 aaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 308
Target Start/End: Original strand, 22857893 - 22858038
Alignment:
Q  162 ttataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctg 260  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22857893 ttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  261 ggg-agagagcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17012494 - 17012243
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||| |||| |    
T  17012494 attcgatgaaaaatcacaacaataaaatacttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaac-gtta-aaacacaagcca 17012398  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||| |  |   |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | |      
T  17012397 aaagtagaaaata--gtgagagaaagaaagagagaatatga---aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctc 17012303  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17012302 tatg-ttccctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 17012243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18322558 - 18322482
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatg 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18322558 attctatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Original strand, 25078537 - 25078669
Alignment:
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacc 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||| | |||||| |||| || ||| |||||||     
T  25078537 gaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactgggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaact 25078635  T
Q  302 ttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25078636 ttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataa 25078669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 335
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455537
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatca 318  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  319 atgagttgcaagaataa 335  Q
    | | ||| |||||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataa 16455537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 335
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530233
Alignment:
Q  267 gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg-gttacaagaataa 15530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 6610378 - 6610478
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6610378 aaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtggat--aacaattataaacataagc-aaaagtataa 6610472  T
Q  187 aacaac 192  Q
    ||||||    
T  6610473 aacaac 6610478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Original strand, 8717203 - 8717268
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8717203 attcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25480338 - 25480219
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| |||| ||| || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||  |    
T  25480338 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagtca 25480240  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagaga 198  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  25480239 aaagtagaaaacagcgagaga 25480219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 319
Target Start/End: Original strand, 28078063 - 28078291
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  28078063 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa-aaataatcaagcaaccaatatcaacgt---gggaagaattataaacacaagc-aaaagtag 28078157  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc-caaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttt 282  Q
     |||||  | ||||||||| || ||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| | |    |     
T  28078158 -aaaca--gcgagagaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatc 28078253  T
Q  283 cactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28078254 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22611122 - 22610999
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22611122 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaaagt---gggaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 22611029  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||||    
T  22611028 aaacaa--tgagaaaaagaaagagagaacaca 22610999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30443670 - 30443537
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaccta 255  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| | |   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | | |||||    
T  30443670 aacaattttaaacacaagcaaaaa-tagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttaccta 30443572  T
Q  256 gtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  30443571 gtctcggggagagagcagctctccgttacactata 30443537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 335
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037841
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgt---ttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagata 315  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||   | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  316 tcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataa 28037841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 3577484 - 3577555
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  3577484 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 3577555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 12911421 - 12911531
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactat-atgatgag 296  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12911421 aaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgag 12911519  T
Q  297 taaccttacaaa 308  Q
    |||| |||||||    
T  12911520 taactttacaaa 12911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30445832 - 30445729
Alignment:
Q  233 ccagttcggtccaa-attgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaa 329  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  30445832 ccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 30445733  T
Q  330 gaat 333  Q
    ||||    
T  30445732 gaat 30445729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490843
Alignment:
Q  289 atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22490843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13040224 - 13040179
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13040224 attcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaa 13040179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Original strand, 26505339 - 26505379
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26505339 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaaagagagaacaca 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 13467461 - 13467532
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13467461 aagaatttgtttacctagttcggtctaatcatgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 13467532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10584395 - 10584357
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10584395 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg 10584357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211223
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggg 33211223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757522
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356089
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagc 21356089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 22963704 - 22963753
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  22963704 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagcc 22963753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23824689 - 23824640
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23824689 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagcc 23824640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936640
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagc 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 603088 - 603132
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  603088 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 603132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16569190 - 16569154
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16569190 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgg 16569154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 17694846 - 17694918
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  17694846 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata 17694918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25941857 - 25941785
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  25941857 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25941785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 13099325 - 13099587
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  13099325 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 13099424  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13099425 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 13099524  T
Q  275 atccgtttcactat-atgatgagtaaccttac-aaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13099525 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 13099587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44725000 - 44724757
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaaca-attataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44725000 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 44724901  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44724900 acgagaga--aatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 44724803  T
Q  290 tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44724802 tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 44724757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 21592018 - 21592254
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  21592018 ataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 21592116  T
Q  199 gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagt 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21592117 gaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagt 21592216  T
Q  298 aaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21592217 aacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 21592254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 95 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21990570 - 21990331
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacg 193  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  21990570 accaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcg 21990471  T
Q  194 agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccatccgtttcactatatga 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  21990470 agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatga 21990371  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21990370 tgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaa 21990331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 444027 - 443773
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  444027 gaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtag 443928  T
Q  185 aaaacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc--tggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||    
T  443927 aaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgt 443828  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  443827 ttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataa 443773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 31434910 - 31435158
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31434910 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 31435009  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  31435010 aacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccac 31435107  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31435108 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 31435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 4295789 - 4296045
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  4295789 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaacacaagcca 4295888  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |    
T  4295889 aaagtagaaa--atggcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccct 4295986  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4295987 ctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataa 4296045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 42330854 - 42331108
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  42330854 attcgatgagaaatcacgccaataataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 42330953  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |    
T  42330954 aaagtagaaaacagcgagagaga----aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccct 42331049  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42331050 ccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 42331108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 27306096 - 27306341
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  27306096 atcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagaagaaaac 27306195  T
Q  190 aac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcacta 287  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27306196 aacagcgagagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccacta 27306293  T
Q  288 tatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27306294 tatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataa 27306341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9681257 - 9680998
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  9681257 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 9681158  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9681157 aaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 9681058  T
Q  276 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9681057 tccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataa 9680998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9679491 - 9679237
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9679491 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaag 9679392  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgt 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||    
T  9679391 tagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgt 9679292  T
Q  281 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9679291 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 9679237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 37411982 - 37412238
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||    
T  37411982 gaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactag 37412081  T
Q  185 aaaacaacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgt 280  Q
    |||||||||||||   ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37412082 aaaacaacgagagaaaagaagagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgt 37412181  T
Q  281 ttcactat-atgatgagtaaccttac-aaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412182 tccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataa 37412238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11355688 - 11355436
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11355688 aaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 11355589  T
Q  185 aaaacaacgagagaga-aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgttt 282  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||     
T  11355588 aaaacaacaagagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttc 11355489  T
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11355488 cactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataa 11355436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 335
Target Start/End: Original strand, 39145856 - 39146098
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39145856 accaataacaaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacga 39145955  T
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactat-atga 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  39145956 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatga 39146055  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39146056 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataa 39146098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24749017 - 24748772
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||||||    
T  24749017 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagtagaa 24748921  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtttcac 285  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24748920 aacaacgagagaaata--aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcac 24748823  T
Q  286 tat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24748822 tataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24748772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21678498 - 21678245
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  21678498 attcgatgaaaaatcacaccgataacaaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagcca 21678399  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||      
T  21678398 aaagtagaaaaca--gcgggagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagccca 21678303  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21678302 ctgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaata 21678245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21680464 - 21680205
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  21680464 attcgatgaaaacccacaccaataacaagcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 21680365  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacc---cagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21680364 aaagtagaaaacaacga--gagaaaagaagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagc 21680267  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  21680266 tctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataa 21680205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42223584 - 42223336
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  42223584 aaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaacacaaggcaaaagtaga 42223485  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  42223484 aaacaa--tgagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttca 42223387  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  42223386 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataa 42223336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20626473 - 20626216
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20626473 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20626377  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20626376 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20626277  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20626276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20626216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20630364 - 20630107
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20630364 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20630268  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20630267 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20630168  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20630167 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20630107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20642783 - 20642526
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20642783 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20642687  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20642686 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20642587  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20642586 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20642526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 7092070 - 7092323
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||  || |||||  ||||||||||    
T  7092070 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta--aatataagtcaaaagtagaa 7092167  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7092168 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctcc 7092266  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7092267 gattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7092323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 7471829 - 7472091
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  7471829 attcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 7471925  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7471926 aaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 7472025  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7472026 cagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7472091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38394426 - 38394164
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  38394426 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 38394330  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38394329 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 38394230  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38394229 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 38394164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22394162 - 22393900
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||     
T  22394162 gtgttgtgaattcgatgaaaaattccaccaataataaacttgatgt--ggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataat 22394067  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagag 267  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22394066 cacaaaccaaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagag 22393969  T
Q  268 agcagccatccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22393968 aacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22393900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45004 - 44742
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  45004 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaa 44908  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44907 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaag 44808  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  44807 cagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 44742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 40836599 - 40836853
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  40836599 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 40836695  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||      |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40836696 aaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 40836795  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  40836796 ccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 40836853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48458084 - 48457831
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  48458084 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 48457988  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  48457987 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 48457888  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  48457887 gttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 48457831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 20137063 - 20137220
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20137063 aaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccct 20137160  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20137161 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20137220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20299895 - 20299638
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||    
T  20299895 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagt 20299799  T
Q  183 agaaaacaac-gagaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||| | |||| |||    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20299798 agaaaacaactgcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaacc 20299699  T
Q  275 atccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20299698 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20299638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 245
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251605
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  22251452 cacaccaataacaaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 22251551  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 245  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251552 caagagagaaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26295872 - 26295625
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||| ||||||    
T  26295872 atgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaa--attataaacacaagccaaaagt 26295776  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccatccgtt 281  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  26295775 agaaaacaacgaaaga--aagaaagagataacacaa--gaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtt 26295680  T
Q  282 tcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26295679 tcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 26295625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 7094317 - 7094571
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  7094317 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 7094414  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7094415 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 7094514  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7094515 gattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7094571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26804942 - 26804762
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  26804942 atgagaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagt 26804843  T
Q  183 agaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 262  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804842 agaaaacaacatcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28487993 - 28487731
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  |    
T  28487993 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtca 28487897  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28487896 aaagtagaaaacaacggctaga-agaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28487798  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| || || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28487797 gcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 28487731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1850411 - 1850159
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||    
T  1850411 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtagaaa 1850315  T
Q  188 acaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    ||||| || || ||       | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  1850314 acaac-agtgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 1850216  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1850215 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1850159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20297802 - 20297540
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  20297802 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 20297706  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20297705 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 20297606  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20297605 cagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 20297540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28486005 - 28485744
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  28486005 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 28485909  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaa-------aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagag 269  Q
    |||||||||||||||| || ||||       | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485908 aaagtagaaaacaacg-gatagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgaggagagag 28485810  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || || || | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  28485809 caaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataa 28485744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36064 - 35807
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |  | ||||||    
T  36064 atgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaatacaaa--ccaaaagt 35968  T
Q  183 agaaaacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    |||||||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35967 agaaaacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagc 35869  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
      |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35868 tctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3036164 - 3035902
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  3036164 attcgatgagaaatcacaccaataacaat-ttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 3036068  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036067 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 3035968  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3035967 cagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3035902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 7469872 - 7470133
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  7469872 attcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaggga-taatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 7469967  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7469968 aaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggag 7470067  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7470068 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7470133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25542977 - 25542707
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  25542977 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaattaaata 25542879  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-g 260  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25542878 ca--agccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctag 25542781  T
Q  261 gggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  25542780 gggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 25542707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18345967 - 18345719
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||    
T  18345967 cacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaacaa 18345871  T
Q  192 cga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |    
T  18345870 cggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatcc 18345771  T
Q  284 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  18345770 actatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 18345719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 43253374 - 43253628
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  43253374 aaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 43253470  T
Q  187 aa----caacgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccat 276  Q
    ||    || ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  43253471 aaacaacagcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 43253569  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43253570 ctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa 43253628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 24813364 - 24813610
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||    | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24813364 aaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaacgtg---gtaacaattataaacataaac-aaaagtaga 24813459  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  24813460 aaacaacgagaga-aaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctcc 24813557  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  24813558 actataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataa 24813610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 27832496 - 27832744
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||  | |||||| || || | |    
T  27832496 attcgatgaaaaatcataccaataacaaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaaacca 27832593  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  27832594 aaagtagaaaaca--gtgagagaaagaaagagataacac--aagaatttgtttacccagtt-----caaattgacctagtctgggggagagagaagccct 27832684  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27832685 ccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataa 27832744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40946759 - 40946506
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||| |||||||    
T  40946759 aatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaaatagaaaa 40946663  T
Q  189 caa-----cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
     ||     ||||| ||||    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  40946662 aaaaacggcgaga-agaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctt 40946564  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  40946563 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataa 40946506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11759567 - 11759369
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  11759567 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 11759471  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||| | ||||       || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11759470 aaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11759372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3879019 - 3878755
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaag-tatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| |  |     
T  3879019 attcgatgagaaatcacatcaataataa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaattaaatacaaa--cc 3878923  T
Q  177 aaaagtagaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agag 267  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  3878922 aaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagag 3878823  T
Q  268 agcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3878822 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3878755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24465967 - 24465715
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || || | |    
T  24465967 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaaacca 24465870  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |   |||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  24465869 aaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcac 24465774  T
Q  277 ccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  24465773 ccgtttcattataatgatgagt-actttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaataa 24465715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38397070 - 38396813
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38397070 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38396974  T
Q  187 aacaa--------cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcag 272  Q
    || ||        ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38396973 aaaaaaacaacggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaag 38396875  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  38396874 ccctccgatccactatatgatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgggttacaaaaataa 38396813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1606829 - 1606559
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||  |||    
T  1606829 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataat--taa 1606733  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaa---cgaga--gagaaaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct- 259  Q
    | | |||| |||||||||||||||   |||||   | ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||     
T  1606732 atacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctg 1606633  T
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  1606632 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 1606559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7188962 - 7188731
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||||||    
T  7188962 aaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaagc-aaaagtaga 7188866  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||  || |||   |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  7188865 aaacagcgagaga-aaagaaagagaacacgcaa---aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttcc 7188770  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 321  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  7188769 actataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatg 7188731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049406
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaag 1049381  T
Q  311 agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1049382 agaaatcaatgggttacaagaataa 1049406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2935700 - 2935447
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |  | ||||||||||    
T  2935700 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca-agccaaaaagtagaa 2935603  T
Q  187 aacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2935602 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2935503  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  2935502 gatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 2935447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 334
Target Start/End: Original strand, 9027042 - 9027303
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  9027042 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 9027138  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa-------aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaga 266  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||       |  |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  9027139 aaagtagaaaacaacggctaga-agaacataattaataaga-agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 9027236  T
Q  267 gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    |||||||| |||  | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  9027237 gagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaata 9027303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047035
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaag 1047010  T
Q  311 agatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1047011 agaaatcaatgggttacaagaataa 1047035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108246
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22108272  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  22108271 agagaaatcaatgggttacaagaata 22108246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137257
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22137283  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  22137282 agagaaatcaatgggttacaagaata 22137257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25276550 - 25276319
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||| | ||||||  ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||    
T  25276550 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagt--taatcaagcaaccaatatcaaagtggat--aacaatta--aacacaagtaaaaagtag 25276458  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||           ||||| ||    
T  25276457 aaaacaacgagagaaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctggggag-----------ccgttcca 25276371  T
Q  285 ctat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  25276370 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataa 25276319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40550006
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40550032  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  40550031 agagaaatcaatgggttacaagaata 40550006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552284
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40552310  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  40552309 agagaaatcaatgggttacaagaata 40552284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 7351508 - 7351762
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  7351508 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 7351604  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccat 276  Q
    ||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  7351605 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccct 7351704  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7351705 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7351762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 24817219 - 24817465
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||  || ||| | ||| ||    | |||| ||||||||| || | |||| ||||    
T  24817219 aaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaagtaataatcaagaaaacaatatcaacgtg---gtaacagttataaacacaaac-aaaattaga 24817314  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  24817315 aaacaacgagaga-aaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttcc 24817412  T
Q  284 actata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24817413 actataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataa 24817465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24258783 - 24258641
Alignment:
Q  199 gaaaggaagagagaacacaaaagaattt-gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcactata----tga 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||    |||    
T  24258783 gaaaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatga 24258684  T
Q  293 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24258683 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 24258641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156021
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttac-aa 31155994  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  31155995 agagaaatcaatgggttacaagaataa 31156021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081703
Alignment:
Q  181 gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagag-gaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatcc 11081745  T
Q  279 gtttcactatat-gatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 319  Q
    ||| || | ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11081744 gttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332398
Alignment:
Q  156 gaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacct 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacaga--aag--agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacct 6332481  T
Q  255 agtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  6332480 agtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataa 6332398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 316
Target Start/End: Original strand, 16296932 - 16297115
Alignment:
Q  129 aatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||    |||||||    
T  16296932 aatcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagaga--aag--agagagaacacacggaaatttgt 16297024  T
Q  229 tgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatat 316  Q
    | || ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16297025 ttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatat 16297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 335
Target Start/End: Original strand, 20091583 - 20091656
Alignment:
Q  260 ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20091583 ggggagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 20091656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6349220 - 6349097
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||||||| |||| |||||||||    
T  6349220 aaaactcacaccaataa-atacttgacgtatggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaagc-aaaagtaga 6349125  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaaca 215  Q
    ||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  6349124 aaata--gcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 263
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091194
Alignment:
Q  106 acttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaa-acaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaagg 204  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||   |||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaag--ttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaga 20091136  T
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg 263  Q
    ||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20091137 aagagagaacac--acgaatttatttatccagttcggtccaatactgacctagtctgggg 20091194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 7349134 - 7349383
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||| |    
T  7349134 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagta-a 7349229  T
Q  186 aaacaacg------agagagaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccat 276  Q
    ||||||||      |||  | || |||||   ||||||||||  |||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7349230 aaacaacggcgagaagaacgcaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 7349325  T
Q  277 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7349326 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Original strand, 6067159 - 6067264
Alignment:
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttc 283  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6067159 aacaacaagagagaaaagaaaagaagaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttc 6067258  T
Q  284 actata 289  Q
    ||||||    
T  6067259 actata 6067264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11757460 - 11757408
Alignment:
Q  283 cactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11757460 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11757408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828744
Alignment:
Q  264 agagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 22828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40550262 - 40550204
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  40550262 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 40550204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Original strand, 55955 - 56001
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagcc 274  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55955 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagcc 56001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190052
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22137529 - 22137454
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||    
T  22137529 tgtgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa 22137454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281430
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaccta 255  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||| | ||| |||    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagaga-aaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaacta 40281413  T
Q  256 gtct-ggggagagagca 271  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40281414 gtctgggggagagagca 40281430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40552556 - 40552481
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||    
T  40552556 tgtgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa 40552481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 1046774 - 1046839
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc--aaaacaaagt 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||    
T  1046774 aaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagt 1046839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6049295 - 6049170
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||| |  |  | ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6049295 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--attaatcaagcaaccaatatcaacg--tgggtaacaattataaacataagc-aaaattag 6049201  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||| | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6049200 aaaatagcgagagaaaaag--agagagaacaca 6049170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284143
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 20284143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347947
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 27347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317472
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 41317472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516353
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagcc 46516353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580443
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 2580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983337
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 21983337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26417489 - 26417440
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagaga 268  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  26417489 aagaaattgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctggggagaga 26417440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159856
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagc 29159856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43864412 - 43864375
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43864412 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 43864375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 1049146 - 1049216
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc--aaaacaaagtatatg 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  1049146 aaaattcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg 1049216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Original strand, 1502832 - 1502883
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaac 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  1502832 aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075231
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactata 2075231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5817362 - 5817314
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagc 273  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  5817362 ttgttaactcagttcggtccaatatgacctactctggggagagagcagc 5817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 7464513 - 7464585
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  7464513 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactata 7464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 14069833 - 14069877
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-tggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  14069833 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagaga 14069877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 14379861 - 14379905
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14379861 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 14379905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25357360 - 25357324
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25357360 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaa 25357324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25410318 - 25410246
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  25410318 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31519027
Alignment:
Q  233 ccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagag 269  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaacttgacctactctggggagagag 31519027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 289
Target Start/End: Original strand, 34546874 - 34546946
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactata 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  34546874 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 34546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52448 - 52191
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  52448 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 52349  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  52348 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 52251  T
Q  273 ccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaa 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52250 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 52191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50449 - 50235
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  50449 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 50350  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcag 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50349 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 50252  T
Q  273 ccatccgtttcactata 289  Q
    || ||||||||||||||    
T  50251 ccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 183490 - 183752
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  183490 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 183586  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagag 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  183587 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagag 183686  T
Q  270 cagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  183687 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 183752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 79623 - 79362
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  79623 attcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 79524  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79523 aaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 79424  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  79423 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 79362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 80297 - 80036
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  80297 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaacacaagcc 80198  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 273  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80197 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 80098  T
Q  274 catccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  80097 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataa 80036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4173
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  4415 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 4316  T
Q  192 cgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactatat 290  Q
    |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4315 cgagaga--aatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatat 4218  T
Q  291 gatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4217 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 85665 - 85407
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  85665 attcgatgaaaaatcacaccaataacaatcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtc 85566  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcca 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  85565 aaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtca 85468  T
Q  276 tccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  85467 tccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataa 85407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11584
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||| |  |||| |||||||||||||||| || |||    
T  11322 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaattataatcacaag 11420  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagca 271  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11421 ccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11520  T
Q  272 gccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||  |||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11521 gctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 41341 - 41594
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  41341 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 41437  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatcc 278  Q
    |||||||      |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41438 aacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctcc 41537  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  41538 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 41594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36031 - 35817
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||     
T  36031 attcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcc 35932  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  35931 aaaactcgaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagcc 35832  T
Q  275 atccgtttcactata 289  Q
     |||||| |||||||    
T  35831 ctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 69149 - 69402
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  69149 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 69246  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatcc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  69247 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 69346  T
Q  279 gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  69347 gatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 69402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29600 - 29348
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||||||    
T  29600 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aataaaagccaaaagtagaa 29504  T
Q  187 aacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||| |||||||       |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29503 aacaacg-gagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 29405  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    || | ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29404 cgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataa 29348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 335
Target Start/End: Original strand, 1303 - 1563
Alignment:
Q  80 tccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||    
T  1303 tccataaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaattaaataca--agccaaa 1399  T
Q  180 agtagaaaa-caacga-gaga-ga----aaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagc 270  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1400 agtagaaaaacaacggcgagaagatcacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagc 1499  T
Q  271 agccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1500 agccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1754
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  1509 aaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaagccaaaagtagaa 1604  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttca 284  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  1605 aacaatgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttcca 1702  T
Q  285 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1703 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6377
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||| |||   ||| | ||||     
T  6638 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataat---aaatacaagcc 6543  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagaga 268  Q
    |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6542 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 6443  T
Q  269 gcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6442 gcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 6377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22294
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22320  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22319 agagaaatcaatgagttacaagaata 22294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24569
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 24595  T
Q  309 agagatatcaatgagttgcaagaata 334  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24594 agagaaatcaatgagttacaagaata 24569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22549 - 22491
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22549 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 22491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24824 - 24766
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  24824 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 24766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8463
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 8463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 259
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1485
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  1300 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 1396  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaag-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||       || |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1397 aaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 219
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  455 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 359  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttca 284  Q
    || ||||| | |||||         |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||    
T  358 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T
Q  285 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  268 ctatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3309 - 3057
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataag-cgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||| | |||||||||    
T  3309 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaag--ttataaatacaagtcaaaaagtaga 3214  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatc 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  3213 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctc 3114  T
Q  278 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    |  | |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3113 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataa 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 15775 - 15933
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  15775 aaaagtagaaaacaacgggaga--aagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 15871  T
Q  275 atccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
     |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15872 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 15933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16762
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||   ||||||| | |||| |||| ||||    
T  16516 aaaaattataccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaa-caaagtgcatggaag--ttataaatacaagcaaaaa-taga 16611  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttc 283  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||  | || |  ||  |    
T  16612 aaacaacgagaga-aaagaaagagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtccc 16709  T
Q  284 actat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16710 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataa 16762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Original strand, 4535 - 4729
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  4535 aaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 4631  T
Q  187 aacaa---cgagag----agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    |||||   |||||     | ||| |||||   | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4632 aacaatggcgagaagaacaaaaaagaagaagaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 12723 - 12835
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  12723 attcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 12819  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg 193  Q
    |||||||| |||||||    
T  12820 aaagtagacaacaacg 12835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2294 - 2218
Alignment:
Q  259 tggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttgcaagaataa 335  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  2294 tggggagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataa 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20453
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 20453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5737
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 9
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49 atgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaag 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University