View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20264_high_30 (Length: 259)

Name: NF20264_high_30
Description: NF20264
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20264_high_30
NF20264_high_30
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (18-244)||(32731719-32731945)
chr6 (18-239)||(34232875-34233096)
chr6 (18-240)||(2442389-2442611)
chr6 (18-235)||(30811109-30811326)
chr6 (18-240)||(31099982-31100197)
chr6 (18-235)||(12297334-12297551)
chr6 (18-235)||(20804960-20805176)
chr6 (18-204)||(558360-558547)
chr6 (18-197)||(12432581-12432760)
chr6 (18-204)||(34684976-34685161)
chr6 (43-235)||(14227521-14227712)
chr6 (18-235)||(31451922-31452131)
chr6 (18-161)||(5943035-5943178)
chr6 (24-235)||(7317577-7317788)
chr6 (20-197)||(33540688-33540865)
chr6 (18-204)||(10856133-10856312)
chr6 (18-240)||(34903924-34904132)
chr6 (18-197)||(6709656-6709835)
chr6 (20-197)||(5681527-5681704)
chr6 (19-204)||(34439683-34439868)
chr6 (19-204)||(28076423-28076608)
chr6 (18-157)||(2970722-2970860)
chr6 (22-204)||(3107970-3108153)
chr6 (19-197)||(5301563-5301741)
chr6 (20-240)||(29414886-29415093)
chr6 (20-206)||(33453734-33453913)
chr6 (19-198)||(29822997-29823176)
chr6 (86-235)||(1806343-1806491)
chr6 (19-204)||(11015590-11015775)
chr6 (60-214)||(3636643-3636796)
chr6 (19-145)||(21894311-21894437)
chr6 (53-159)||(31049379-31049485)
chr6 (19-147)||(12140840-12140968)
chr6 (19-197)||(7292510-7292688)
chr6 (19-135)||(15591112-15591228)
chr6 (60-197)||(23648201-23648338)
chr6 (58-188)||(6104671-6104801)
chr6 (19-140)||(20563458-20563579)
chr6 (23-144)||(9896766-9896885)
chr6 (63-161)||(1225475-1225573)
chr6 (58-145)||(5893894-5893981)
chr6 (19-134)||(19415351-19415466)
chr6 (19-117)||(11443033-11443131)
chr6 (67-135)||(26561419-26561487)
chr6 (24-135)||(32563209-32563321)
chr6 (32-103)||(20717487-20717558)
chr6 (58-145)||(15131386-15131473)
chr6 (53-101)||(18801813-18801861)
chr6 (44-76)||(27720634-27720666)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (18-243)||(4453480-4453705)
chr2 (18-235)||(3377360-3377576)
chr2 (18-235)||(16486850-16487066)
chr2 (18-238)||(28382637-28382857)
chr2 (18-238)||(36712493-36712712)
chr2 (18-235)||(13111699-13111917)
chr2 (18-240)||(36999452-36999673)
chr2 (18-240)||(41322718-41322940)
chr2 (18-235)||(650737-650953)
chr2 (18-235)||(9886960-9887176)
chr2 (18-235)||(21865213-21865431)
chr2 (18-240)||(40024899-40025121)
chr2 (18-235)||(2266109-2266325)
chr2 (18-219)||(37356151-37356353)
chr2 (18-239)||(38578958-38579186)
chr2 (35-246)||(8688936-8689146)
chr2 (18-240)||(2546281-2546503)
chr2 (18-204)||(43507519-43507705)
chr2 (18-235)||(10839537-10839753)
chr2 (18-211)||(15521470-15521663)
chr2 (18-197)||(39167756-39167935)
chr2 (18-240)||(24402010-24402224)
chr2 (18-235)||(5039742-5039952)
chr2 (19-204)||(29514832-29515016)
chr2 (18-240)||(8815176-8815404)
chr2 (18-206)||(10392992-10393180)
chr2 (18-235)||(17263710-17263920)
chr2 (20-235)||(26911479-26911693)
chr2 (18-233)||(4038304-4038511)
chr2 (60-235)||(6760603-6760778)
chr2 (18-203)||(31616350-31616528)
chr2 (18-214)||(4385489-4385678)
chr2 (18-235)||(13527861-13528076)
chr2 (18-235)||(18212087-18212290)
chr2 (24-235)||(38880745-38880957)
chr2 (18-223)||(43135597-43135794)
chr2 (18-199)||(7400341-7400529)
chr2 (22-214)||(8339967-8340159)
chr2 (19-214)||(10727818-10728013)
chr2 (30-214)||(6232249-6232433)
chr2 (60-240)||(41796741-41796921)
chr2 (24-235)||(44275630-44275840)
chr2 (20-197)||(8070579-8070756)
chr2 (60-206)||(40869358-40869504)
chr2 (18-163)||(43285657-43285795)
chr2 (19-162)||(38842875-38843018)
chr2 (20-152)||(2047280-2047411)
chr2 (60-161)||(42132708-42132809)
chr2 (19-135)||(25071437-25071553)
chr2 (20-157)||(9053089-9053226)
chr2 (19-204)||(23356942-23357128)
chr2 (19-145)||(2221446-2221572)
chr2 (64-162)||(7213664-7213762)
chr2 (58-193)||(24019895-24020030)
chr2 (19-144)||(15250163-15250288)
chr2 (19-135)||(7823505-7823621)
chr2 (18-240)||(18710153-18710347)
chr2 (22-162)||(598931-599071)
chr2 (58-135)||(16669119-16669196)
chr2 (19-141)||(4055951-4056073)
chr2 (25-204)||(5520032-5520211)
chr2 (18-235)||(6153426-6153622)
chr2 (64-159)||(2758874-2758969)
chr2 (58-130)||(6222636-6222708)
chr2 (44-162)||(39675059-39675177)
chr2 (60-211)||(34884801-34884952)
chr2 (58-120)||(41877821-41877883)
chr2 (17-124)||(37674497-37674597)
chr2 (19-103)||(6807492-6807569)
chr2 (58-118)||(13761842-13761900)
chr2 (19-115)||(7511668-7511764)
chr2 (19-115)||(7515952-7516048)
chr2 (18-118)||(13351568-13351660)
chr2 (60-115)||(7569853-7569908)
chr2 (26-101)||(44525898-44525973)
chr2 (127-212)||(7569775-7569861)
chr2 (26-127)||(10361481-10361581)
chr2 (26-95)||(43496281-43496350)
chr2 (58-138)||(33850121-33850201)
chr2 (58-137)||(2689067-2689145)
chr2 (19-73)||(2757301-2757355)
chr2 (190-240)||(29514803-29514853)
chr2 (22-127)||(7454620-7454724)
chr2 (171-204)||(13761777-13761810)
chr2 (53-101)||(7454449-7454497)
chr2 (200-240)||(8702860-8702900)
chr2 (174-214)||(13564523-13564563)
chr2 (53-101)||(18109653-18109701)
chr2 (172-204)||(22375955-22375987)
chr2 (53-101)||(26339972-26340020)
chr2 (53-101)||(32482183-32482231)
chr2 (20-64)||(42132798-42132842)
[»] chr3 (121 HSPs)
chr3 (18-238)||(29081246-29081466)
chr3 (18-240)||(26540925-26541147)
chr3 (18-240)||(37528688-37528910)
chr3 (18-235)||(16127104-16127321)
chr3 (18-231)||(37088258-37088471)
chr3 (18-233)||(28676855-28677070)
chr3 (18-240)||(44845589-44845811)
chr3 (18-235)||(35499572-35499788)
chr3 (18-235)||(38185741-38185957)
chr3 (18-239)||(40563328-40563549)
chr3 (18-235)||(2579892-2580109)
chr3 (18-235)||(19948283-19948500)
chr3 (18-235)||(25570349-25570566)
chr3 (18-235)||(45344973-45345189)
chr3 (18-235)||(24536519-24536736)
chr3 (18-235)||(29718166-29718382)
chr3 (18-235)||(54672145-54672361)
chr3 (18-240)||(50499728-50499949)
chr3 (18-204)||(52794896-52795082)
chr3 (19-204)||(55305075-55305260)
chr3 (18-235)||(38891951-38892167)
chr3 (18-204)||(4240279-4240465)
chr3 (18-233)||(46247936-46248143)
chr3 (18-235)||(49853008-49853225)
chr3 (18-240)||(40479993-40480208)
chr3 (18-235)||(8872843-8873053)
chr3 (18-235)||(44748758-44748967)
chr3 (18-233)||(47897567-47897786)
chr3 (43-245)||(52857856-52858058)
chr3 (18-204)||(53779032-53779218)
chr3 (24-235)||(52166061-52166272)
chr3 (18-220)||(30864412-30864613)
chr3 (17-199)||(24628163-24628345)
chr3 (18-235)||(33391873-33392090)
chr3 (18-204)||(50316994-50317180)
chr3 (18-191)||(2851831-2852004)
chr3 (18-157)||(21603846-21603985)
chr3 (18-231)||(21707125-21707331)
chr3 (24-235)||(46972003-46972214)
chr3 (20-163)||(2121869-2122012)
chr3 (18-204)||(37713937-37714116)
chr3 (18-204)||(43525744-43525923)
chr3 (18-159)||(30548790-30548931)
chr3 (20-199)||(46627464-46627644)
chr3 (18-204)||(48942992-48943169)
chr3 (20-204)||(52225286-52225474)
chr3 (18-204)||(54541907-54542086)
chr3 (20-161)||(51709055-51709196)
chr3 (43-235)||(12063718-12063910)
chr3 (18-240)||(44545196-44545403)
chr3 (20-231)||(46318733-46318938)
chr3 (18-204)||(39469914-39470086)
chr3 (20-197)||(39876622-39876792)
chr3 (60-206)||(42217662-42217808)
chr3 (20-152)||(42497047-42497179)
chr3 (20-197)||(41246257-41246427)
chr3 (19-204)||(44947167-44947352)
chr3 (22-240)||(45368575-45368793)
chr3 (20-132)||(45693353-45693465)
chr3 (60-231)||(48378200-48378371)
chr3 (18-145)||(51003307-51003434)
chr3 (22-235)||(41518331-41518544)
chr3 (58-204)||(193398-193544)
chr3 (55-232)||(42465029-42465206)
chr3 (22-161)||(7041105-7041244)
chr3 (19-239)||(20450424-20450644)
chr3 (19-199)||(32026375-32026555)
chr3 (64-206)||(30814261-30814403)
chr3 (20-195)||(27446437-27446612)
chr3 (99-235)||(41785779-41785915)
chr3 (85-219)||(47173554-47173688)
chr3 (60-211)||(37489931-37490082)
chr3 (53-162)||(29203027-29203136)
chr3 (64-204)||(52595345-52595485)
chr3 (58-211)||(35100181-35100328)
chr3 (22-197)||(37713107-37713285)
chr3 (58-192)||(2598608-2598742)
chr3 (19-190)||(33897866-33898030)
chr3 (18-159)||(43740258-43740384)
chr3 (58-140)||(52868184-52868266)
chr3 (18-162)||(52931117-52931241)
chr3 (25-130)||(5506704-5506809)
chr3 (60-198)||(39719361-39719498)
chr3 (62-159)||(32982921-32983011)
chr3 (44-132)||(22257726-22257814)
chr3 (19-135)||(25146383-25146499)
chr3 (134-235)||(51950326-51950427)
chr3 (19-127)||(51980820-51980926)
chr3 (171-235)||(52363012-52363076)
chr3 (171-233)||(24536807-24536869)
chr3 (70-146)||(24350282-24350358)
chr3 (19-103)||(41538407-41538490)
chr3 (181-235)||(889683-889736)
chr3 (171-224)||(28394172-28394225)
chr3 (20-81)||(47174486-47174547)
chr3 (126-199)||(45693479-45693552)
chr3 (26-93)||(43968263-43968330)
chr3 (148-204)||(52788677-52788733)
chr3 (37-95)||(42527978-42528036)
chr3 (190-240)||(53779003-53779053)
chr3 (57-158)||(612099-612200)
chr3 (26-115)||(12764771-12764859)
chr3 (20-75)||(41785943-41785998)
chr3 (62-121)||(43359249-43359307)
chr3 (26-101)||(44895977-44896052)
chr3 (149-204)||(5505852-5505907)
chr3 (171-204)||(2187314-2187347)
chr3 (26-115)||(12122085-12122173)
chr3 (171-204)||(31558316-31558349)
chr3 (22-127)||(41991591-41991695)
chr3 (56-101)||(50938176-50938221)
chr3 (26-119)||(51760567-51760659)
chr3 (61-101)||(22978191-22978231)
chr3 (53-101)||(32390052-32390100)
chr3 (53-101)||(36807035-36807083)
chr3 (53-101)||(38732263-38732311)
chr3 (53-101)||(40374446-40374494)
chr3 (61-101)||(41888921-41888961)
chr3 (20-64)||(42464087-42464131)
chr3 (53-101)||(46668454-46668502)
chr3 (53-101)||(49918349-49918397)
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (18-239)||(31581659-31581880)
chr8 (18-238)||(17115504-17115724)
chr8 (18-240)||(28716628-28716850)
chr8 (18-235)||(25023275-25023492)
chr8 (18-239)||(32541188-32541409)
chr8 (18-240)||(36681407-36681628)
chr8 (18-235)||(31478045-31478262)
chr8 (18-235)||(39702275-39702492)
chr8 (26-239)||(44827285-44827498)
chr8 (18-235)||(45141415-45141631)
chr8 (18-235)||(6338287-6338504)
chr8 (18-235)||(38171387-38171604)
chr8 (18-240)||(10618771-10618992)
chr8 (18-219)||(8270891-8271092)
chr8 (18-235)||(16422799-16423015)
chr8 (18-235)||(23676840-23677058)
chr8 (18-204)||(27781102-27781288)
chr8 (18-236)||(39871234-39871450)
chr8 (18-235)||(42142695-42142912)
chr8 (18-204)||(39320026-39320212)
chr8 (18-235)||(1893808-1894019)
chr8 (60-240)||(17081618-17081798)
chr8 (18-204)||(41693866-41694055)
chr8 (20-240)||(22877887-22878107)
chr8 (60-240)||(28709271-28709451)
chr8 (18-211)||(43276738-43276924)
chr8 (18-197)||(31688017-31688189)
chr8 (18-204)||(41313375-41313554)
chr8 (24-235)||(37560495-37560706)
chr8 (21-235)||(40223047-40223260)
chr8 (20-235)||(11298003-11298218)
chr8 (20-235)||(24652237-24652451)
chr8 (18-235)||(11741063-11741270)
chr8 (18-161)||(36112808-36112944)
chr8 (20-235)||(36590105-36590320)
chr8 (20-235)||(32099505-32099714)
chr8 (19-197)||(44157204-44157382)
chr8 (18-235)||(37587685-37587896)
chr8 (18-145)||(35243312-35243439)
chr8 (43-163)||(2642403-2642523)
chr8 (60-235)||(34395348-34395525)
chr8 (19-204)||(29189687-29189872)
chr8 (60-233)||(9210958-9211130)
chr8 (60-204)||(3427623-3427767)
chr8 (19-198)||(3511224-3511403)
chr8 (23-192)||(39746911-39747073)
chr8 (25-197)||(43849174-43849346)
chr8 (22-204)||(7378848-7379030)
chr8 (20-159)||(22957354-22957493)
chr8 (58-197)||(13969982-13970121)
chr8 (19-160)||(40045444-40045585)
chr8 (53-199)||(38780666-38780812)
chr8 (19-118)||(39677442-39677541)
chr8 (64-235)||(16831503-16831666)
chr8 (44-157)||(40551856-40551968)
chr8 (22-123)||(44263388-44263489)
chr8 (59-161)||(1363793-1363895)
chr8 (58-140)||(2855146-2855228)
chr8 (18-118)||(42203370-42203463)
chr8 (20-114)||(10651115-10651209)
chr8 (24-124)||(9370282-9370382)
chr8 (25-197)||(8436491-8436663)
chr8 (57-119)||(13888326-13888388)
chr8 (19-119)||(2773487-2773586)
chr8 (70-134)||(26293837-26293901)
chr8 (70-134)||(26307094-26307158)
chr8 (57-146)||(26036979-26037068)
chr8 (183-235)||(43276903-43276955)
chr8 (63-118)||(44318316-44318371)
chr8 (137-197)||(42203462-42203522)
chr8 (19-85)||(5320498-5320564)
chr8 (22-127)||(25100122-25100226)
chr8 (26-106)||(35004525-35004605)
chr8 (22-93)||(35397926-35397997)
chr8 (117-162)||(35151040-35151085)
chr8 (22-127)||(40529589-40529693)
chr8 (53-101)||(12208919-12208967)
chr8 (53-101)||(12453347-12453395)
chr8 (61-101)||(29725884-29725924)
[»] chr5 (88 HSPs)
chr5 (18-238)||(8023935-8024155)
chr5 (18-240)||(36685780-36686002)
chr5 (18-235)||(2236467-2236684)
chr5 (18-235)||(12774545-12774762)
chr5 (18-235)||(14647308-14647524)
chr5 (18-235)||(30299667-30299884)
chr5 (18-240)||(30412563-30412785)
chr5 (18-235)||(1711154-1711371)
chr5 (18-255)||(5591538-5591774)
chr5 (18-235)||(12713281-12713498)
chr5 (18-235)||(32382818-32383035)
chr5 (18-241)||(39744493-39744715)
chr5 (18-235)||(13228424-13228640)
chr5 (18-233)||(32381625-32381840)
chr5 (18-240)||(19525713-19525935)
chr5 (18-240)||(24793936-24794165)
chr5 (18-225)||(6603861-6604068)
chr5 (18-204)||(35235678-35235864)
chr5 (18-240)||(39275388-39275609)
chr5 (18-235)||(31168938-31169155)
chr5 (18-204)||(9160643-9160829)
chr5 (18-235)||(12363563-12363780)
chr5 (24-235)||(1174753-1174964)
chr5 (18-235)||(4221431-4221640)
chr5 (29-204)||(5997856-5998031)
chr5 (18-197)||(43402451-43402630)
chr5 (22-204)||(27130333-27130515)
chr5 (18-235)||(15443425-15443642)
chr5 (18-206)||(26699057-26699245)
chr5 (18-206)||(26968790-26968978)
chr5 (18-197)||(15530442-15530621)
chr5 (18-231)||(19956252-19956470)
chr5 (24-233)||(10697240-10697449)
chr5 (18-206)||(5381895-5382082)
chr5 (18-221)||(35639923-35640126)
chr5 (18-162)||(2178802-2178946)
chr5 (18-235)||(3037376-3037593)
chr5 (43-240)||(30774168-30774365)
chr5 (24-235)||(35236624-35236836)
chr5 (18-235)||(2671383-2671593)
chr5 (18-162)||(7651682-7651826)
chr5 (18-219)||(9587144-9587339)
chr5 (18-204)||(39246795-39246973)
chr5 (24-219)||(3670263-3670458)
chr5 (18-235)||(13156844-13157054)
chr5 (18-163)||(22977156-22977301)
chr5 (18-219)||(29392065-29392258)
chr5 (31-206)||(11062871-11063047)
chr5 (20-197)||(36027944-36028121)
chr5 (20-162)||(4379300-4379442)
chr5 (24-219)||(11663848-11664043)
chr5 (19-204)||(19347705-19347891)
chr5 (18-235)||(3669510-3669720)
chr5 (33-197)||(5521305-5521469)
chr5 (58-197)||(648538-648677)
chr5 (60-223)||(6893372-6893533)
chr5 (19-204)||(16474771-16474956)
chr5 (19-204)||(11100721-11100899)
chr5 (19-159)||(9627106-9627246)
chr5 (20-159)||(4875689-4875828)
chr5 (58-197)||(2497570-2497709)
chr5 (19-163)||(13936233-13936370)
chr5 (53-163)||(23920498-23920608)
chr5 (19-162)||(6280407-6280550)
chr5 (18-235)||(25872186-25872376)
chr5 (26-118)||(4657561-4657652)
chr5 (43-118)||(6349426-6349501)
chr5 (23-161)||(42323562-42323701)
chr5 (58-146)||(13921783-13921871)
chr5 (19-132)||(27005806-27005919)
chr5 (22-146)||(31407980-31408102)
chr5 (19-161)||(33694719-33694861)
chr5 (57-135)||(32321652-32321730)
chr5 (58-163)||(41471900-41472006)
chr5 (26-119)||(2890885-2890977)
chr5 (57-118)||(7896599-7896659)
chr5 (62-135)||(18480557-18480630)
chr5 (26-93)||(12049539-12049606)
chr5 (26-92)||(3033471-3033537)
chr5 (19-101)||(15524477-15524559)
chr5 (19-121)||(36959589-36959690)
chr5 (22-127)||(76502-76606)
chr5 (22-127)||(27812908-27813012)
chr5 (22-127)||(29525228-29525332)
chr5 (22-127)||(41734176-41734280)
chr5 (53-101)||(7948376-7948424)
chr5 (53-101)||(13019107-13019155)
chr5 (53-101)||(20768806-20768854)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (18-240)||(22559-22781)
[»] chr4 (130 HSPs)
chr4 (18-240)||(12233928-12234150)
chr4 (18-235)||(28307221-28307438)
chr4 (18-235)||(53407156-53407372)
chr4 (18-240)||(7706333-7706555)
chr4 (18-235)||(46895248-46895466)
chr4 (18-235)||(8829776-8829993)
chr4 (18-235)||(11600649-11600866)
chr4 (18-235)||(18582811-18583027)
chr4 (18-235)||(42116862-42117079)
chr4 (18-235)||(56372402-56372618)
chr4 (18-238)||(45906102-45906322)
chr4 (18-235)||(19513843-19514059)
chr4 (18-240)||(22038318-22038540)
chr4 (26-235)||(4517160-4517369)
chr4 (18-235)||(8941871-8942087)
chr4 (18-233)||(39087519-39087733)
chr4 (18-240)||(4392687-4392908)
chr4 (18-204)||(11151900-11152086)
chr4 (18-204)||(27397727-27397913)
chr4 (18-211)||(52669984-52670177)
chr4 (18-235)||(9043571-9043788)
chr4 (18-235)||(55495848-55496058)
chr4 (18-204)||(23867830-23868016)
chr4 (18-204)||(25440445-25440631)
chr4 (18-204)||(29413528-29413714)
chr4 (18-235)||(35777354-35777564)
chr4 (18-204)||(3009708-3009894)
chr4 (18-204)||(4939347-4939532)
chr4 (18-191)||(21369890-21370063)
chr4 (18-235)||(35822260-35822477)
chr4 (18-244)||(47417443-47417662)
chr4 (24-240)||(55764521-55764736)
chr4 (18-212)||(55856488-55856679)
chr4 (18-235)||(4355553-4355763)
chr4 (18-235)||(37115251-37115460)
chr4 (18-240)||(51011026-51011248)
chr4 (18-204)||(35468012-35468198)
chr4 (24-220)||(22892509-22892705)
chr4 (24-220)||(22944173-22944369)
chr4 (18-233)||(15635910-15636125)
chr4 (18-197)||(26826525-26826704)
chr4 (18-197)||(33114979-33115158)
chr4 (19-163)||(9031957-9032101)
chr4 (18-201)||(31678969-31679145)
chr4 (18-240)||(43225645-43225860)
chr4 (18-162)||(55358299-55358443)
chr4 (24-235)||(37970261-37970471)
chr4 (18-204)||(29663926-29664105)
chr4 (60-240)||(55828965-55829145)
chr4 (18-160)||(27185593-27185737)
chr4 (18-235)||(44442048-44442264)
chr4 (22-214)||(31338465-31338659)
chr4 (20-161)||(23162641-23162783)
chr4 (22-204)||(4391673-4391855)
chr4 (20-161)||(30366109-30366250)
chr4 (60-226)||(35580948-35581114)
chr4 (18-204)||(36007979-36008152)
chr4 (19-163)||(5465373-5465516)
chr4 (24-197)||(56270058-56270231)
chr4 (18-199)||(37831924-37832097)
chr4 (22-212)||(25235134-25235324)
chr4 (81-235)||(53273084-53273238)
chr4 (19-205)||(21633778-21633964)
chr4 (22-204)||(55684692-55684874)
chr4 (19-199)||(22430637-22430817)
chr4 (19-199)||(23113438-23113618)
chr4 (23-204)||(35190582-35190763)
chr4 (60-197)||(11050320-11050458)
chr4 (18-118)||(42124640-42124740)
chr4 (18-204)||(33005076-33005275)
chr4 (18-235)||(45780725-45780915)
chr4 (22-161)||(43078161-43078300)
chr4 (58-235)||(36196840-36197017)
chr4 (58-197)||(20511413-20511552)
chr4 (84-207)||(29656720-29656843)
chr4 (20-144)||(44525694-44525811)
chr4 (58-139)||(20148803-20148884)
chr4 (20-161)||(36486348-36486489)
chr4 (19-118)||(24954183-24954282)
chr4 (20-158)||(35842572-35842696)
chr4 (19-147)||(42085691-42085812)
chr4 (127-233)||(25199366-25199472)
chr4 (19-135)||(52713560-52713676)
chr4 (116-235)||(29656597-29656716)
chr4 (25-197)||(52707967-52708138)
chr4 (18-85)||(53274812-53274879)
chr4 (60-134)||(40497399-40497473)
chr4 (58-160)||(48056607-48056709)
chr4 (58-159)||(4465472-4465573)
chr4 (58-161)||(37047069-37047172)
chr4 (22-162)||(37337678-37337818)
chr4 (65-157)||(50502284-50502376)
chr4 (19-118)||(40119903-40120002)
chr4 (58-157)||(32101736-32101835)
chr4 (58-135)||(31435072-31435149)
chr4 (58-118)||(17715647-17715707)
chr4 (18-132)||(31953224-31953331)
chr4 (60-119)||(53224309-53224368)
chr4 (58-197)||(30562850-30562988)
chr4 (19-130)||(41864049-41864153)
chr4 (19-114)||(3932211-3932306)
chr4 (19-117)||(26443389-26443487)
chr4 (53-162)||(32948179-32948289)
chr4 (58-159)||(38048878-38048979)
chr4 (19-127)||(55495093-55495200)
chr4 (127-206)||(17715579-17715658)
chr4 (53-101)||(20530799-20530847)
chr4 (26-103)||(34032730-34032809)
chr4 (19-119)||(53431726-53431825)
chr4 (19-132)||(8716887-8716993)
chr4 (58-137)||(39068890-39068969)
chr4 (172-214)||(19169165-19169207)
chr4 (116-156)||(44525659-44525699)
chr4 (174-214)||(45520095-45520135)
chr4 (26-93)||(6287958-6288025)
chr4 (22-101)||(10656281-10656360)
chr4 (22-101)||(10870426-10870505)
chr4 (26-93)||(25687107-25687174)
chr4 (26-101)||(31997944-31998019)
chr4 (19-114)||(49239181-49239276)
chr4 (37-95)||(20987086-20987144)
chr4 (56-101)||(48953143-48953188)
chr4 (53-101)||(202403-202451)
chr4 (53-101)||(19912786-19912834)
chr4 (172-235)||(26443291-26443354)
chr4 (53-101)||(28459725-28459773)
chr4 (53-101)||(30411190-30411238)
chr4 (61-101)||(31624344-31624384)
chr4 (22-145)||(48977864-48977988)
chr4 (20-64)||(53224357-53224401)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (18-239)||(36246344-36246564)
chr7 (18-235)||(43254073-43254290)
chr7 (18-221)||(42587351-42587554)
chr7 (18-235)||(10311997-10312214)
chr7 (18-219)||(45686884-45687085)
chr7 (18-235)||(40637128-40637345)
chr7 (18-214)||(21374624-21374820)
chr7 (18-204)||(27089624-27089810)
chr7 (18-204)||(27188491-27188677)
chr7 (18-235)||(40258827-40259044)
chr7 (18-235)||(21254665-21254881)
chr7 (18-235)||(47470930-47471146)
chr7 (18-204)||(31511301-31511487)
chr7 (18-204)||(35587580-35587766)
chr7 (18-232)||(9487380-9487594)
chr7 (24-235)||(43134375-43134585)
chr7 (18-204)||(45222041-45222227)
chr7 (18-204)||(48832021-48832207)
chr7 (18-233)||(42375758-42375964)
chr7 (18-163)||(33026918-33027063)
chr7 (18-208)||(33203636-33203826)
chr7 (22-244)||(48313396-48313617)
chr7 (18-204)||(34709234-34709420)
chr7 (24-240)||(482956-483171)
chr7 (18-240)||(36436119-36436333)
chr7 (24-231)||(44596584-44596791)
chr7 (18-204)||(40105973-40106159)
chr7 (20-233)||(44743689-44743902)
chr7 (24-233)||(36407200-36407409)
chr7 (18-163)||(48590756-48590901)
chr7 (43-235)||(21741941-21742134)
chr7 (18-240)||(21313764-21313981)
chr7 (18-235)||(47587080-47587288)
chr7 (19-211)||(49148326-49148518)
chr7 (19-212)||(27655642-27655835)
chr7 (18-235)||(17192417-17192626)
chr7 (19-204)||(23029790-23029976)
chr7 (18-197)||(19831965-19832137)
chr7 (19-205)||(17844544-17844730)
chr7 (22-163)||(12345039-12345180)
chr7 (20-162)||(38531153-38531294)
chr7 (44-206)||(28425605-28425767)
chr7 (18-235)||(32168803-32168999)
chr7 (23-204)||(1342777-1342958)
chr7 (58-212)||(11466047-11466201)
chr7 (22-212)||(46879496-46879687)
chr7 (20-194)||(9485727-9485899)
chr7 (64-199)||(38481286-38481421)
chr7 (77-196)||(21316611-21316730)
chr7 (21-159)||(36612082-36612220)
chr7 (26-140)||(40893437-40893551)
chr7 (20-214)||(48620449-48620642)
chr7 (58-197)||(46757717-46757857)
chr7 (28-214)||(19757494-19757680)
chr7 (58-161)||(22642259-22642362)
chr7 (53-204)||(791336-791487)
chr7 (58-144)||(35000773-35000859)
chr7 (22-121)||(24170860-24170959)
chr7 (58-197)||(27869570-27869709)
chr7 (30-163)||(21740126-21740258)
chr7 (19-161)||(7884660-7884790)
chr7 (20-114)||(39698930-39699017)
chr7 (93-146)||(24170803-24170856)
chr7 (58-158)||(45672341-45672441)
chr7 (23-101)||(47403089-47403167)
chr7 (19-127)||(981425-981532)
chr7 (31-115)||(35669599-35669682)
chr7 (60-112)||(47584185-47584237)
chr7 (19-118)||(44072730-44072829)
chr7 (53-131)||(22621461-22621539)
chr7 (19-84)||(33609098-33609163)
chr7 (190-235)||(34709210-34709255)
chr7 (18-50)||(21744553-21744585)
chr7 (26-106)||(47869303-47869383)
chr7 (26-93)||(3370570-3370637)
chr7 (22-101)||(33979729-33979808)
chr7 (26-93)||(44818842-44818909)
chr7 (26-93)||(46349795-46349862)
chr7 (61-135)||(39229953-39230027)
chr7 (61-127)||(41406276-41406341)
chr7 (22-127)||(33982222-33982326)
chr7 (48-101)||(46334761-46334814)
chr7 (22-83)||(46535503-46535564)
chr7 (31-95)||(28235404-28235468)
chr7 (53-101)||(31030702-31030750)
chr7 (53-101)||(35670292-35670340)
chr7 (53-101)||(37658053-37658101)
chr7 (53-101)||(39869959-39870007)
chr7 (53-101)||(40061276-40061324)
chr7 (31-95)||(43156449-43156513)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (18-239)||(1917995-1918215)
chr1 (18-235)||(36838640-36838857)
chr1 (18-238)||(19898853-19899073)
chr1 (22-238)||(29704033-29704249)
chr1 (18-239)||(36301050-36301269)
chr1 (18-235)||(30721568-30721786)
chr1 (18-240)||(31150370-31150591)
chr1 (18-240)||(42064262-42064483)
chr1 (18-234)||(26204249-26204464)
chr1 (18-240)||(29586127-29586348)
chr1 (18-235)||(33524501-33524718)
chr1 (18-235)||(44909814-44910030)
chr1 (18-240)||(32368284-32368506)
chr1 (18-235)||(2497895-2498112)
chr1 (18-219)||(17499830-17500031)
chr1 (18-240)||(26843719-26843941)
chr1 (18-235)||(15313217-15313433)
chr1 (18-235)||(30774059-30774271)
chr1 (18-240)||(13121536-13121750)
chr1 (18-235)||(1507688-1507906)
chr1 (18-235)||(17046702-17046912)
chr1 (18-204)||(50351036-50351222)
chr1 (18-233)||(3660920-3661135)
chr1 (18-240)||(7710906-7711121)
chr1 (18-238)||(38676460-38676678)
chr1 (18-204)||(322869-323055)
chr1 (18-240)||(39826568-39826783)
chr1 (18-204)||(3270663-3270848)
chr1 (18-245)||(47134483-47134702)
chr1 (24-235)||(34319362-34319573)
chr1 (19-205)||(49220418-49220605)
chr1 (19-204)||(46369809-46369993)
chr1 (18-240)||(33561854-33562062)
chr1 (18-204)||(38967416-38967594)
chr1 (18-211)||(50171242-50171435)
chr1 (18-161)||(22098965-22099108)
chr1 (20-214)||(15348818-15349012)
chr1 (18-224)||(25601971-25602169)
chr1 (20-235)||(36043247-36043463)
chr1 (26-204)||(39583100-39583278)
chr1 (20-162)||(37672297-37672439)
chr1 (20-162)||(37703716-37703858)
chr1 (17-155)||(43727074-43727212)
chr1 (19-212)||(29374326-29374519)
chr1 (18-161)||(40887928-40888065)
chr1 (24-235)||(2479134-2479330)
chr1 (20-161)||(49185132-49185273)
chr1 (20-214)||(51422931-51423126)
chr1 (18-240)||(8221180-8221402)
chr1 (19-204)||(7781110-7781295)
chr1 (58-204)||(34086970-34087116)
chr1 (19-163)||(3391165-3391309)
chr1 (20-160)||(42614082-42614222)
chr1 (19-162)||(5697523-5697665)
chr1 (19-199)||(34318415-34318595)
chr1 (18-212)||(18347368-18347554)
chr1 (19-148)||(49822113-49822242)
chr1 (19-158)||(9769919-9770058)
chr1 (20-146)||(46928931-46929057)
chr1 (60-211)||(50540769-50540920)
chr1 (19-198)||(52703057-52703236)
chr1 (19-137)||(41004939-41005057)
chr1 (19-127)||(33151975-33152083)
chr1 (60-197)||(49240268-49240405)
chr1 (19-146)||(16085557-16085684)
chr1 (23-211)||(46087950-46088138)
chr1 (18-198)||(44718923-44719096)
chr1 (20-161)||(28429076-28429204)
chr1 (20-152)||(36379093-36379225)
chr1 (58-198)||(25134858-25134998)
chr1 (20-160)||(30495149-30495282)
chr1 (19-135)||(13570739-13570855)
chr1 (19-114)||(9894931-9895026)
chr1 (22-117)||(6814118-6814213)
chr1 (20-121)||(9169142-9169236)
chr1 (19-159)||(42963877-42964010)
chr1 (58-212)||(44956274-44956428)
chr1 (20-115)||(7024916-7025004)
chr1 (58-146)||(46056411-46056499)
chr1 (137-235)||(9169051-9169149)
chr1 (60-128)||(40719554-40719622)
chr1 (30-115)||(33632331-33632416)
chr1 (49-161)||(28868987-28869099)
chr1 (22-88)||(12891644-12891710)
chr1 (59-111)||(40935893-40935945)
chr1 (26-119)||(2459557-2459649)
chr1 (172-235)||(22099688-22099750)
chr1 (58-135)||(10628814-10628891)
chr1 (19-76)||(19715372-19715429)
chr1 (31-135)||(912726-912830)
chr1 (58-134)||(2028961-2029037)
chr1 (171-235)||(7024816-7024880)
chr1 (26-93)||(2937458-2937525)
chr1 (40-119)||(38058845-38058923)
chr1 (32-101)||(50940115-50940184)
chr1 (22-93)||(31496731-31496802)
chr1 (171-214)||(40719492-40719535)
chr1 (26-93)||(41865408-41865475)
chr1 (37-115)||(11332942-11333019)
chr1 (37-115)||(11490963-11491040)
chr1 (58-132)||(27659350-27659424)
chr1 (65-111)||(31434449-31434495)
chr1 (22-127)||(30358162-30358266)
chr1 (127-197)||(52071222-52071292)
chr1 (53-101)||(9223953-9224001)
chr1 (53-101)||(27667788-27667836)
chr1 (53-101)||(30899360-30899408)
chr1 (53-101)||(39325455-39325503)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (18-240)||(12677-12899)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (18-235)||(126720-126936)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (24-235)||(3-214)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (18-240)||(28036-28267)
scaffold0197 (18-204)||(30144-30323)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (18-235)||(7027-7243)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (18-197)||(431265-431444)
scaffold0002 (57-159)||(119238-119340)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (18-197)||(93346-93525)
scaffold0016 (58-135)||(84325-84402)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (20-197)||(63851-64028)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (19-204)||(192013-192198)
scaffold0009 (62-127)||(94351-94415)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (18-163)||(52988-53126)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (18-235)||(41725-41921)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (82-235)||(27158-27312)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (18-162)||(5451-5587)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (26-140)||(72733-72847)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (60-134)||(4562-4636)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (58-204)||(9230-9376)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (37-134)||(10833-10930)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (171-240)||(36319-36388)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (19-114)||(1206-1301)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (23-239)||(8928-9143)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (44-76)||(10053-10085)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32731945 - 32731719
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32731945 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 32731846  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32731845 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 32731746  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttcatc 244  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  32731745 tggggttaaccaaacagagccttcatc 32731719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 34232875 - 34233096
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232875 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 34232974  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34232975 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 34233074  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  34233075 ttgggataaccaaacagagcct 34233096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2442611 - 2442389
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2442611 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2442512  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2442511 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 2442412  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  2442411 tttagtttcccaaacagaccctt 2442389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 30811109 - 30811326
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30811109 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30811208  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30811209 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttt 30811308  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  30811309 ttgggtttcccaaacaga 30811326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 31099982 - 31100197
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31099982 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31100074  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31100075 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 31100174  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31100175 ttgggtttaccaaacagagcctt 31100197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12297551 - 12297334
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297551 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaatgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12297452  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12297451 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctcttttt 12297352  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  12297351 tggggttaaccaaacaga 12297334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20805176 - 20804960
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805176 gaaataataagagtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 20805077  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20805076 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctt-tt 20804978  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  20804977 tttggtttcccaaacaga 20804960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 558547 - 558360
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558547 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 558448  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558447 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 558360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 12432581 - 12432760
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432581 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatggcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12432680  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  12432681 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 12432760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 34684976 - 34685161
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34684976 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 34685075  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685076 gaaataagctataagctcat-gtgaaaatgtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 34685161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 14227521 - 14227712
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14227521 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 14227620  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14227621 aaaagtgttaccaaacaaagctttttta-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 14227712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 31451922 - 31452131
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31451922 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagct--------taagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagctcgt 31452013  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31452014 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 31452113  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || | ||| |||||||||    
T  31452114 tttgttttcccaaacaga 31452131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5943178 - 5943035
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5943178 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 5943079  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5943078 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacaga 5943035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 7317577 - 7317788
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7317577 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 7317676  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  7317677 agctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaacagagctttttctgtgaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaagctctttttttgagt 7317776  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  7317777 ttaccaaacaga 7317788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 33540688 - 33540865
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33540688 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtga 33540787  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  33540788 aataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 33540865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10856312 - 10856133
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856312 gaaataataagggtaaaattaaaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 10856220  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856219 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 10856133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34904132 - 34903924
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  34904132 gaaataataagggtaaaat-ggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata------- 34904041  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34904040 ------agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 34903947  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | | |||| ||||||||| ||||    
T  34903946 tggagtttcccaaacagaccctt 34903924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 6709656 - 6709835
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  6709656 gaaataataagggtaaaattagaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataatttcgt 6709755  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6709756 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacgaacttataagctataagct 6709835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5681704 - 5681527
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5681704 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 5681605  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||| || |||||||| ||||||||    
T  5681604 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaacagagctttttttgtcaaaagaacttataagttataagct 5681527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34439868 - 34439683
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34439868 aaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctgtaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 34439769  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34439768 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagttttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 34439683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28076608 - 28076423
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28076608 aaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtg 28076509  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||       |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28076508 aaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcagacgagtttataagctataagctataagct 28076423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2970860 - 2970722
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2970860 gaaataataagggtaaagt-ggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgt 2970762  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2970761 gaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaa 2970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 3107970 - 3108153
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3107970 taataagggtaaaattagaagaaaagataataagctataagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 3108069  T
Q  122 -taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3108070 ttaagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagct 3108153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 5301563 - 5301741
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301563 aaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 5301662  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5301663 aaataagctataagctcatggtgaaaaaacattaccaaacagaactttttttgtcatacgagcttataagctataagct 5301741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 29414886 - 29415093
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                
T  29414886 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagctt------------ 29414973  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||     
T  29414974 -ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataaactctttttta 29415072  T
Q  220 gggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||||||||||| ||||    
T  29415073 ggtgttaccaaacagaccctt 29415093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33453913 - 33453734
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453913 aataataacggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 33453821  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  33453820 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataaactataagctataagctaa 33453734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 29822997 - 29823176
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||      
T  29822997 aaataataagggtaaaaccggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgca 29823096  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29823097 aaataagctattagctcatggtgaaaaaatgttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagcta 29823176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Original strand, 1806343 - 1806491
Alignment:
Q  86 aatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  1806343 aatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagattttttagtcaaacgagcttat 1806442  T
Q  186 aagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1806443 aagctataagctataagctaaaagctctt-ttttgggttaaccaaacaga 1806491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11015775 - 11015590
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11015775 aaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctcaaaaatagcttgtaagctcgtg 11015676  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11015675 aaataagttataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagttttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 11015590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 3636643 - 3636796
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3636643 aagctataagttcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3636742  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||         ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3636743 ga-atttttttgtcaaacaagcttataagctataagttaagagctaaaagctctt 3636796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21894437 - 21894311
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21894437 aaatgataagcgtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 21894338  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21894337 aaataagctataatctcgtggtgaaaa 21894311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31049485 - 31049379
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31049485 aagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 31049386  T
Q  153 ccaaaca 159  Q
    |||||||    
T  31049385 ccaaaca 31049379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 12140840 - 12140968
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12140840 aaataataagggtaaaaaaggaacaaaagataataagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 12140939  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaag 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12140940 aaataaactataagctcatggtgaaaaag 12140968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 7292510 - 7292688
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  7292510 aaataataagagtaaaactggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgttacttgaagtagcttatgaaaaatagcttataagcttctg 7292609  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||        ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7292610 aaataagctataagctcattgtaaaaaagcgttatcaaacagagctttttttatccgacgagcttataagctataagct 7292688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 15591112 - 15591228
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15591112 aaataataagggtaaaattggaattaaaagtgacacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttataagctcgtg 15591211  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||||||    
T  15591212 aaataagctataagctc 15591228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23648338 - 23648201
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||  ||||||||||    
T  23648338 aagctataagctcagaagctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtaagagagcattaccaaaca 23648239  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||       ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23648238 gagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagct 23648201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 188
Target Start/End: Original strand, 6104671 - 6104801
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  6104671 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagtatctgaaaaatagcttataagctcgcgaaataagctataagctcgtggtgaaagaccattaccaaa 6104770  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataag 188  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||    
T  6104771 cagagcttttttggtcaaacgagcttataag 6104801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20563579 - 20563458
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  | | || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20563579 aaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaaactaaaagctataagctcagatgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtg 20563480  T
Q  119 aaataagctataagctcatggt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  20563479 aaataagctataagctcgtggt 20563458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9896885 - 9896766
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9896885 aatatgggtaaaattggaaaaaaa--tgataagctataagctattaactcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 9896788  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaa 144  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  9896787 aaactataagctcgtggtgaaa 9896766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1225573 - 1225475
Alignment:
Q  63 ctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  1225573 ctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagcttataaacttgtgaaataaaatataagctcttgatgaaaaagtgttatcaaacaga 1225475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Original strand, 5893894 - 5893981
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||    
T  5893894 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctggaaaataagttataagctagtaaaataagctaaaagcttgtggtgaaaa 5893981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19415466 - 19415351
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    | |||||||||    
T  19415466 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctgtaagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagcaacaagctcgtg 19415367  T
Q  119 aaataagctataagct 134  Q
    ||| | ||||||||||    
T  19415366 aaaaacgctataagct 19415351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11443131 - 11443033
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  11443131 aaataataaggatataaatggaagaaaagatgataagttaaaagatataagctcaaacgctacttgaaatagagtctggaaaataggttataagctcgt 11443033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26561487 - 26561419
Alignment:
Q  67 aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26561487 aagctcaaacgctacttgaaatagcgtttgaaaaataagttataagctcctgaaataaactataagctc 26561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 32563209 - 32563321
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaa-aaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  32563209 ataagggtaaaaatggaataagaaaatgataaactataagttataatctcaaacactatttgaaatagcgtctgaaaaataaattataagcttctgaaat 32563308  T
Q  123 aagctataagctc 135  Q
    ||| |||||||||    
T  32563309 aagttataagctc 32563321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20717558 - 20717487
Alignment:
Q  32 aaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 103  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  20717558 aaaaatggaagaaaaagtaaaaagctataatctataagttcaaacgctacttgaaataacgtctggaaaata 20717487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Original strand, 15131386 - 15131473
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||| || ||||||    
T  15131386 ataagctatatgcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagctataagttagtaaaataagttataagctcgtgatgaaaa 15131473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18801861 - 18801813
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18801861 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 18801813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 27720634 - 27720666
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaac 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27720634 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaac 27720666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 4453480 - 4453705
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4453480 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 4453579  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4453580 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 4453679  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttcat 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  4453680 tggggttaaccaaacagagccttcat 4453705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3377576 - 3377360
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377576 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 3377477  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3377476 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 3377378  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  3377377 ttgggttaaccaaacaga 3377360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16487066 - 16486850
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16487066 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 16486967  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16486966 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 16486868  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16486867 ttgggttaaccaaacaga 16486850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 28382637 - 28382857
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382637 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 28382736  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28382737 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttt 28382836  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  28382837 tggggttaaccaaacagagcc 28382857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 36712493 - 36712712
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36712493 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36712592  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36712593 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 36712691  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    || || | |||||||||||||    
T  36712692 tttggataaccaaacagagcc 36712712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 13111699 - 13111917
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111699 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 13111798  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacc-aaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13111799 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctatttt 13111898  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || |||||| |||||||||    
T  13111899 ttggggtttcccaaacaga 13111917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36999673 - 36999452
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36999673 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36999574  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36999573 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctt-tt 36999475  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    || ||||| ||||||||| ||||    
T  36999474 tttggtttcccaaacagaccctt 36999452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41322940 - 41322718
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322940 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 41322841  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41322840 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagataaaagctaaaagctcttttt 41322741  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||   ||| ||||||||| ||||    
T  41322740 ttttatttcccaaacagaccctt 41322718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 650737 - 650953
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650737 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 650836  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  650837 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct-aaagctaaaagctcttttt 650935  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  650936 tggggttaaccaaacaga 650953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9887176 - 9886960
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9887176 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgt 9887077  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9887076 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 9886978  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || |||| ||||||||||    
T  9886977 ttaggttaaccaaacaga 9886960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21865431 - 21865213
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21865431 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 21865332  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21865331 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 21865232  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  21865231 ttggggttaaccaaacaga 21865213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 40024899 - 40025121
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40024899 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40024998  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40024999 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaagctcttttt 40025098  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | | |||| ||||||||| ||||    
T  40025099 tggagtttcccaaacagaccctt 40025121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 2266109 - 2266325
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266109 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2266208  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  2266209 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaag-ttttttt 2266307  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  2266308 ttgggtttcccaaacaga 2266325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37356353 - 37356151
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356353 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 37356254  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37356253 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttt 37356154  T
Q  217 ttt 219  Q
    |||    
T  37356153 ttt 37356151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 38578958 - 38579186
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38578958 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 38579057  T
Q  111 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38579058 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagt 38579157  T
Q  211 tcttattttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  38579158 tcttttttagggttaaccaaacagagcct 38579186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 8688936 - 8689146
Alignment:
Q  35 attggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8688936 attggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 8689035  T
Q  135 catggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8689036 catggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctt-tttggggttaaccaaacag 8689134  T
Q  235 agccttcatctc 246  Q
    | || |||||||    
T  8689135 acccatcatctc 8689146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 2546281 - 2546503
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2546281 gaaataataaaggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2546380  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2546381 gaaataagctataagctcatggttaaaatttgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 2546480  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||||  |||||||| ||||    
T  2546481 tggggtttctcaaacagaccctt 2546503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 43507519 - 43507705
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507519 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43507618  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507619 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 43507705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 10839537 - 10839753
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10839537 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctagt 10839636  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10839637 gaaataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagctaaaagttctt-tt 10839735  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  10839736 tttggtttcccaaacaga 10839753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15521663 - 15521470
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521663 gaaataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 15521564  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521563 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagttttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 15521470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39167935 - 39167756
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167935 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39167836  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  39167835 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 39167756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 24402010 - 24402224
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402010 gaaataataagggtaaaattggaa-aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 24402108  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24402109 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagct-------tataagctaaaagctaaaagctcttttt 24402201  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  24402202 ttgggtttcccaaacagaccctt 24402224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5039952 - 5039742
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5039952 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 5039860  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5039859 gaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 5039760  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | |||||| |||||||||    
T  5039759 tggggtttcccaaacaga 5039742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29515016 - 29514832
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29515016 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 29514917  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29514916 aaataagctataagctcttggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 29514832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8815404 - 8815176
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815404 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 8815305  T
Q  111 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8815304 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaggc 8815205  T
Q  211 tcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  8815204 tctt-ttttgagttaaccaaatagaccctt 8815176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 10392992 - 10393180
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10392992 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaaactataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 10393091  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10393092 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 10393180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 17263710 - 17263920
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17263710 gaaatagtaagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 17263809  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17263810 gaaataagctataagctcatggtgaaaacatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagct-------tataagctaaaagctaaaagctcttttt 17263902  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  17263903 ttgggttttccaaacaga 17263920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26911693 - 26911479
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26911693 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 26911594  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26911593 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaagagag-tttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctctt-tttt 26911496  T
Q  220 gggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26911495 gggtgttaccaaacaga 26911479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 4038304 - 4038511
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4038304 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgt 4038396  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4038397 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttatcaaacgagcttgtaagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 4038495  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    ||||||| ||||||||    
T  4038496 ttgggttaaccaaaca 4038511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 6760603 - 6760778
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6760603 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 6760702  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6760703 gagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacaga 6760778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 31616350 - 31616528
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616350 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31616442  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616443 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagc 31616528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 4385489 - 4385678
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4385489 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgt 4385581  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4385582 gaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctt 4385678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 13527861 - 13528076
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13527861 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagttcaaacgttacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgt 13527960  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  13527961 gaaataagttataaactcatggtgaaaaggtgttaccgaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaag--cttttt 13528058  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || |||| ||||||||||    
T  13528059 tttggttaaccaaacaga 13528076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18212290 - 18212087
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||    
T  18212290 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttg--------------aaatagcttataagctcgt 18212205  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  18212204 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaagctaaaagctcctttt 18212105  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  18212104 tggggttaaccaaacaga 18212087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 38880745 - 38880957
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38880745 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaata 38880844  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttggg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |        || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||      
T  38880845 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagttaaaagctctttttttgaa 38880944  T
Q  223 tttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||    
T  38880945 tttaccaaacaga 38880957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43135794 - 43135597
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43135794 gaaataataagggtaaaattcaaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43135702  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43135701 gaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaacagagctttttttatcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 43135603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 7400341 - 7400529
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400341 gaaataataacggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 7400440  T
Q  111 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7400441 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaa 7400529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8340159 - 8339967
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||    
T  8340159 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctttaagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaattcgtaaaa 8340060  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8340059 taaactataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttcgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaagctctt 8339967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10728013 - 10727818
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  10728013 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagtttttgaaaaatagcttataagttcgtg 10727914  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10727913 aaataagctataagcttatgatgaaaaagtgttatcaaacagaactttttttatcaaacgggctaataagctataagctaaaagttaaaaactctt 10727818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 6232249 - 6232433
Alignment:
Q  30 gtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctat 129  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6232249 gtaaaactggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttgaaatatcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactat 6232348  T
Q  130 aagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6232349 aagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaatattttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagctaaaagctctt 6232433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 240
Target Start/End: Original strand, 41796741 - 41796921
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41796741 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttacgaaaca 41796840  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||        | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  41796841 gagctttttttataaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagctctttttattggtttaccaaacagaccctt 41796921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44275840 - 44275630
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44275840 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctaattggaataacttctgaaaaatagattataagctcgtgaaata 44275741  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |         || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  44275740 agctataagctcgtggtcaaaaagtgttaccaaacata-atttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttaggt 44275642  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  44275641 ttaccaaacaga 44275630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 8070579 - 8070756
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8070579 aataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 8070678  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8070679 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaagttttttttgtcaaacgagtttataagctagaagct 8070756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 40869358 - 40869504
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40869358 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40869457  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    || |       |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40869458 gaactttttttgtcaaatgagcttataaactataagctataagctaa 40869504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43285795 - 43285657
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43285795 gaaataataagggtaaaagtagaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcat 43285703  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43285702 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 43285657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38843018 - 38842875
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38843018 aaataatatgggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtg 38842919  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38842918 aaataagctataaactcatggtgaaaaagtattaccaaacagag 38842875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 152
Target Start/End: Original strand, 2047280 - 2047411
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2047280 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaataacttctgaaaaatagcttataaactcatga 2047379  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2047380 aataagctataaactcat-gtgaaaaagtgtta 2047411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42132809 - 42132708
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42132809 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaggtgttaccaaaca 42132710  T
Q  160 ga 161  Q
    ||    
T  42132709 ga 42132708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25071553 - 25071437
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25071553 aaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtg 25071454  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    |||||| ||||||||||    
T  25071453 aaataaactataagctc 25071437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 9053089 - 9053226
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9053089 aataataagagtaaaactgaaattaaaagtgagaagctgtaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaagaatagtttataagctcgtga 9053188  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  9053189 aataaactattagttcatggtgaataagtgttaccaaa 9053226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 23356942 - 23357128
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23356942 aaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaagctaaaagctataagctcagacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcatataagctcgtg 23357041  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataag-ctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||  |||||||||| |||       |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23357042 aaataagctataagctcgtggtaagagagcattaccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagcctataagctataagct 23357128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2221572 - 2221446
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2221572 aaataataagggtaaaataggaagaaaaaatgataagttataagttataagttcaaacgttacttggaatagcgtctgaaaaatagcttagaagctcgtg 2221473  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  2221472 aaataaactataaactcatggtgaaaa 2221446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 162
Target Start/End: Original strand, 7213664 - 7213762
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7213664 tataagcacaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtattatcaaacagag 7213762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24020030 - 24019895
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |   ||||||||    
T  24020030 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggttagagatcattaccaaa 24019931  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctata 193  Q
    || |||       |||||||||||||||||||||||    
T  24019930 caaagctttttttgtcaaacgagcttataagctata 24019895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15250288 - 15250163
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  15250288 aaatgataagggtagaaatggaacaaaacatgacaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgag 15250189  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaa 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15250188 aaataagctataagctcgtggtgaaa 15250163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 7823505 - 7823621
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7823505 aaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttataaaaaatagcttataagctcgtg 7823604  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||| ||||||    
T  7823605 aaataagctacaagctc 7823621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18710347 - 18710153
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          
T  18710347 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataa------ 18710261  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
                  ||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18710260 --------------gctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctt-tt 18710176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 599071 - 598931
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  599071 taataagggtaaaattaaaattaaaagtgagacgctataaactataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttttgaaa 598972  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||| |||||| ||| | || |||||| |||||||| |||||    
T  598971 taaactataaactcgttgtaaaaaagcgttaccaagcagag 598931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16669196 - 16669119
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16669196 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctc 16669119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4056073 - 4055951
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| |||| ||||||| || || ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4056073 aaatgataaaggtaaaaatgaaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagtgtctgaaaaatagctaataagctcgtg 4055974  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  4055973 aaataagctataagctcgtggtg 4055951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 5520032 - 5520211
Alignment:
Q  25 taagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  5520032 taagggtataaatggaataaaatatgataagctatatgctataagctcaaacgctatttgtaatagcatctgaaaaatagcttataaactcataaaataa 5520131  T
Q  125 gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5520132 gctataagctcgttgtaaaaaatcgttactaaacagagtttttttttacaaacgagcttataagctataagctataagct 5520211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 6153426 - 6153622
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||              
T  6153426 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaaatgagaagc-------tataagctcaaacactacttggaataacttctgaaaaatagctt---------- 6153508  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6153509 ---ataagctataagctcatggtaaaaaagttttaccaaacaaaac-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctt-tt 6153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2758969 - 2758874
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||    
T  2758969 tataagctcaaacgctacttggaatagcgtctaaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgttgtaaaaaactgtcaccaaaca 2758874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 6222636 - 6222708
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 130  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6222636 ataagctataagttcaaatgctgcttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 6222708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39675177 - 39675059
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 143  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| || ||    
T  39675177 aaaagtaagacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagcagcttttgaaaaatatcttataaactcttgaaataagttataagttcattgtaaa 39675078  T
Q  144 aaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  39675077 aaagttttaccaaatagag 39675059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34884952 - 34884801
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||   ||| ||||||    
T  34884952 aagctataagctgaaacactacttggaatagagtctgaaaaataggctataagctcgtgaaataaactataaactcgtggtggaaaacctttatcaaaca 34884853  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    |||        ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  34884852 gagttttttttgtcaaacaagcttataatctatcagctataagctataagct 34884801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41877883 - 41877821
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41877883 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaa 41877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37674597 - 37674497
Alignment:
Q  17 agaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcg 116  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||    
T  37674597 agaaataataaggataaaagtggaagaaaaagtgagaagctataaact-------caaacgctacttggaatagcgtctaaaatatagtttacaagctcg 37674505  T
Q  117 tgaaataa 124  Q
    ||||||||    
T  37674504 tgaaataa 37674497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6807569 - 6807492
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6807569 aaataataagggtaaaattggaagaaaaaatga-------taagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13761900 - 13761842
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761900 ataagctataagctcaaacgctacttgg--taacttctgaaaaatagcttataagctcgtg 13761842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Original strand, 7511668 - 7511764
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7511668 aaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttttgaaaaatagcttataagctc 7511764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Original strand, 7515952 - 7516048
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||| |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7515952 aaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttttgaaaaatagcttataagctc 7516048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 13351568 - 13351660
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13351568 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaaataagaagc-------tataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatag-ttataaactcgt 13351659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7569908 - 7569853
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7569908 aagctataagctcaaacgttacttaaaataacttctgaaaaatagcttataagctc 7569853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Original strand, 44525898 - 44525973
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  44525898 aaggttaaaattggaagaatatattaaaagctataagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 44525973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7569861 - 7569775
Alignment:
Q  127 tataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  7569861 tataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctgagagttaaaagctc 7569775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10361581 - 10361481
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    |||| ||||| |||||||||| || | ||  ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  10361581 aaggttaaaaatggaagaaaatgtaaaaaattatcagctataagctaaaaaactacttgaaatagcttcttaaaaaaag-ttataagctcgtgaaaaaag 10361483  T
Q  126 ct 127  Q
    ||    
T  10361482 ct 10361481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 43496350 - 43496281
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttct 95  Q
    |||| ||||| ||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43496350 aaggttaaaaatggaagaaaatataaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttct 43496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 138
Target Start/End: Original strand, 33850121 - 33850201
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatg 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || | ||||   ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  33850121 ataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtatggagaataagctataaactagtgaaatacgctataagctcatg 33850201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 2689067 - 2689145
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcat 137  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  2689067 ataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcttttggaaaataaactat-agcttctgaaataagctataagctcat 2689145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 2757355 - 2757301
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctca 73  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  2757355 aaataataagggtaaaaatgaaagaaaaaatgataagttataagttataagctca 2757301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29514853 - 29514803
Alignment:
Q  190 tataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  29514853 tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaatagaccctt 29514803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7454724 - 7454620
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  7454724 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 7454626  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  7454625 aaagct 7454620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13761810 - 13761777
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13761810 gtcaaacgagcttataagctataagctataagct 13761777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 7454449 - 7454497
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  7454449 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 7454497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 8702860 - 8702900
Alignment:
Q  200 aagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  8702860 aagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagagcctt 8702900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 13564523 - 13564563
Alignment:
Q  174 aaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13564523 aaacgagcttataagctataagttaagagttaaaagctctt 13564563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 18109653 - 18109701
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18109653 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 18109701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22375987 - 22375955
Alignment:
Q  172 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22375987 tcaaacgagcttataagctataagctataagct 22375955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 26339972 - 26340020
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26339972 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 26340020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 32482183 - 32482231
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  32482183 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 32482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 42132842 - 42132798
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct 64  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  42132842 aataataagggtaaaactgtaattaaaagtgagaagctataagct 42132798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 121)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 29081246 - 29081466
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081246 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 29081345  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29081346 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 29081445  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  29081446 tggggttaaccaaacagagcc 29081466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26541147 - 26540925
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26541147 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 26541048  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26541047 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 26540948  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  26540947 tggggttaaccaaacagaccctt 26540925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 37528688 - 37528910
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37528688 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 37528787  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  37528788 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagcttttttt 37528887  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  37528888 ttgggtttcccaaacagaccctt 37528910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 16127104 - 16127321
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127104 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 16127203  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16127204 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 16127303  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||| ||||    
T  16127304 tggggttaaccaatcaga 16127321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37088471 - 37088258
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37088471 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 37088372  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37088371 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 37088272  T
Q  218 ttgggtttaccaaa 231  Q
    |||||||| |||||    
T  37088271 ttgggtttcccaaa 37088258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 28676855 - 28677070
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28676855 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 28676954  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28676955 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 28677054  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    | |||||| |||||||    
T  28677055 tagggtttcccaaaca 28677070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44845811 - 44845589
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845811 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 44845712  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44845711 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttt 44845612  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |  |||| |||||||||| ||||    
T  44845611 tgaggttaaccaaacagaccctt 44845589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35499788 - 35499572
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35499788 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35499689  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35499688 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct-ttttt 35499590  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  35499589 ttgggtttcccaaacaga 35499572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38185957 - 38185741
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38185957 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 38185858  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38185857 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 38185759  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || |||| ||||||||||    
T  38185758 ttaggttaaccaaacaga 38185741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 40563328 - 40563549
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40563328 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40563427  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  40563428 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttt 40563527  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    | ||| | ||||||||||||||    
T  40563528 tggggataaccaaacagagcct 40563549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 2579892 - 2580109
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579892 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2579991  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2579992 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttt 2580091  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  2580092 tagggttaaccaaacaga 2580109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 19948283 - 19948500
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948283 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 19948382  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19948383 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctagaagctaaaagctcttttt 19948482  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  19948483 tggggttaaccaaacaga 19948500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25570566 - 25570349
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25570566 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagcttgt 25570467  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25570466 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 25570367  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  25570366 tttagtttcccaaacaga 25570349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 45344973 - 45345189
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45344973 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 45345072  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45345073 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctt-tt 45345171  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  45345172 tttggtttcccaaacaga 45345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 24536519 - 24536736
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536519 gaaataataagggtaaagttggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 24536618  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  24536619 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctctaagctaagagctaaaagctcttttt 24536718  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | | |||| | |||||||    
T  24536719 tggagtttccgaaacaga 24536736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 29718166 - 29718382
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29718166 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 29718265  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  29718266 gaaataagctataagctcatgatg-aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaaactaaaagcttttttt 29718364  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  29718365 tttggtttcccaaacaga 29718382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 54672145 - 54672361
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54672145 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 54672244  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  54672245 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagcttttttc-tcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttt 54672343  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  54672344 tttagtttcccaaacaga 54672361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50499949 - 50499728
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50499949 gaaataataagggtaaaataggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 50499850  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50499849 gaaataaactataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaactttttttatcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctt-tt 50499751  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  50499750 ttgggttaaccaaacagaccctt 50499728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52795082 - 52794896
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52795082 gaaataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 52794983  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794982 gaaataagctataagctcatggggaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 52794896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 55305075 - 55305260
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55305075 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtg 55305174  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305175 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 55305260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 38891951 - 38892167
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38891951 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaatgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataggctcgt 38892050  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38892051 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctt-tt 38892149  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || | || ||||||||||    
T  38892150 ttagattaaccaaacaga 38892167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4240465 - 4240279
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4240465 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 4240366  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4240365 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagttataagctaaaagct 4240279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 46247936 - 46248143
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46247936 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 46248028  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  46248029 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctt-tt 46248127  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    |||||||| |||||||    
T  46248128 ttgggtttcccaaaca 46248143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 49853008 - 49853225
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853008 gaaataataagggtaaaattagaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 49853107  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  49853108 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaagatagccttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaagagttaaaagctcttttt 49853207  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||  ||||||| ||||    
T  49853208 taggtgttaccaatcaga 49853225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 40479993 - 40480208
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40479993 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40480085  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40480086 aaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcatttt 40480185  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |  ||| ||||||||||||||||    
T  40480186 tgaggtgtaccaaacagagcctt 40480208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8873053 - 8872843
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873053 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 8872961  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8872960 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 8872861  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  8872860 ttgggtttcccaaacaga 8872843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 44748758 - 44748967
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748758 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 44748850  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44748851 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaagtttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 44748949  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  44748950 tttggtttcccaaacaga 44748967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 47897567 - 47897786
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaa----agtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47897567 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagc 47897666  T
Q  114 tcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47897667 tcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttactaaacagagctttttttgtcaaatgagtttataagctataaactaaaaggtaaaagctct 47897766  T
Q  214 tattttgggtttaccaaaca 233  Q
    | |||  |||| ||||||||    
T  47897767 tttttgcggttaaccaaaca 47897786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52858058 - 52857856
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52858058 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgatacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtca 52857959  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagccttca 242  Q
    |||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  52857958 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtaaaacgagcttataagctataaactaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagacccttaa 52857859  T
Q  243 tct 245  Q
    |||    
T  52857858 tct 52857856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53779218 - 53779032
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53779218 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 53779119  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53779118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 53779032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 52166061 - 52166272
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52166061 ataagggtaaaaatgagataaaaaatgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 52166160  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52166161 agctataagctcatggtcaaaaagtgttgccaaacagagatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggt 52166260  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  52166261 ttaccaaacaga 52166272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30864613 - 30864412
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30864613 gaaataatatgggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30864514  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  30864513 gaaataagctataagctaatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaac-agcttataagctataaactaaaagttaaaagctcttttt 30864415  T
Q  218 ttg 220  Q
    |||    
T  30864414 ttg 30864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 24628163 - 24628345
Alignment:
Q  17 agaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24628163 agaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaatgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctca 24628262  T
Q  117 tgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628263 tgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 24628345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33392090 - 33391873
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33392090 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaaactataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 33391991  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||    
T  33391990 gaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataagctctaagttaagagctaaaaactctt-tt 33391892  T
Q  218 ttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  33391891 ttgggtgttaccaaacaga 33391873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 50316994 - 50317180
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50316994 gaaataataaaggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 50317093  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |        |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50317094 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagttaaaagct 50317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2852004 - 2851831
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2852004 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 2851905  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagcta 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| |||||||||||    
T  2851904 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataagcta 2851831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21603985 - 21603846
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21603985 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaagtagcttataagctcgt 21603886  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21603885 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 21603846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21707331 - 21707125
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707331 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 21707239  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21707238 gaaataagctataatctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgttaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 21707139  T
Q  218 ttgggtttaccaaa 231  Q
    | ||||| ||||||    
T  21707138 tggggttaaccaaa 21707125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46972214 - 46972003
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46972214 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 46972115  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |         || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  46972114 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacataaatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagt 46972015  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  46972014 ttaccaaacaga 46972003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2122012 - 2121869
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2122012 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2121913  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2121912 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagc 2121869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 37713937 - 37714116
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37713937 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 37714029  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37714030 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 37714116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43525923 - 43525744
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525923 gaaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43525831  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43525830 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagctaaaagct 43525744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30548931 - 30548790
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30548931 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaaactgtaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgt 30548832  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30548831 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 30548790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 46627464 - 46627644
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  46627464 aataataagggtaaaagtgatagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaattagcttataacctcgtga 46627563  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46627564 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 46627644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 48943169 - 48942992
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48943169 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 48943077  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48943076 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacaga--tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 48942992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52225474 - 52225286
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaa----aagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52225474 aataataagggtaaaattggaattaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataaactc 52225375  T
Q  116 gtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52225374 gtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaacttttgttgtcaaacgagcttataagctatgagctataagct 52225286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 54541907 - 54542086
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54541907 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaa---at----tataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 54541999  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54542000 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacaaaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 54542086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51709196 - 51709055
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51709196 aataataagggtaaaaatggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtga 51709097  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51709096 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 51709055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 12063718 - 12063910
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12063718 aaaaaatgagaagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtca 12063817  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12063818 aaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacaagtttataagctataaactaagagctaaaagctcttttttggagtttaccaaacaga 12063910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44545403 - 44545196
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||              ||||||||||||||    
T  44545403 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaata--------------gcttataagctcgt 44545318  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44545317 gaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 44545219  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    || ||||| ||||||||| ||||    
T  44545218 tttggtttcccaaacagaccctt 44545196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 46318733 - 46318938
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46318733 aataataagggtaaaattggagttaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 46318825  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  46318826 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagcttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagataaaagctctt-ttt 46318924  T
Q  219 tgggt-ttaccaaa 231  Q
    ||||| ||||||||    
T  46318925 tgggtgttaccaaa 46318938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39470086 - 39469914
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||              ||||||| ||    
T  39470086 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaatagctt--------------ataagcttgt 39470001  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39470000 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 39469914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39876792 - 39876622
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39876792 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39876700  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39876699 aataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaacagagcttttttagtcaaacgaacttataagctataagct 39876622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42217808 - 42217662
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42217808 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 42217709  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42217708 gagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 42217662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42497179 - 42497047
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42497179 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42497080  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42497079 aataagttataagctcatgatgaaaaagtgtta 42497047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41246427 - 41246257
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246427 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 41246335  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41246334 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaactttttttgtcaaacgagtttataagctataagct 41246257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 44947167 - 44947352
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947167 aaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 44947266  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44947267 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctataagct 44947352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45368793 - 45368575
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45368793 taataaggataaaattggaattaaaagtaagatgttataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 45368694  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgg 221  Q
    |||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  45368693 taagctataagcttgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagctataagctcct-ttttgg 45368595  T
Q  222 gt-ttaccaaacagagcctt 240  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  45368594 gtgttaccaaacagaccctt 45368575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Original strand, 45693353 - 45693465
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45693353 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtga 45693452  T
Q  120 aataagctataag 132  Q
    |||||||||||||    
T  45693453 aataagctataag 45693465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48378371 - 48378200
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48378371 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctatagactcgtggtgaaaaaatgttaccaaaca 48378272  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt-ttaccaaa 231  Q
    ||         |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48378271 gatttttttttgtcaaatgagcttataagctataagctaagaggtaaaagctctt-ttttgggtgttaccaaa 48378200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 51003434 - 51003307
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  51003434 gaaataataaggataaaattagaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgt 51003335  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51003334 gaaataagctataagctcgtggtgaaaa 51003307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41518544 - 41518331
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41518544 taataagggtaaaactggaatcaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttataagctcttgaaa 41518445  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgg 221  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||        ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| ||    
T  41518444 taagctataagctcattgtaaaaaagcgttaccaaagaaagctttttttatcagacgagcttataagctatcagctataaactataagctcttttttagg 41518345  T
Q  222 gtttaccaaacaga 235  Q
      ||| ||||||||    
T  41518344 tgttatcaaacaga 41518331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 193544 - 193398
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  193544 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaa 193445  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  193444 cagagctatttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagct 193398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Original strand, 42465029 - 42465206
Alignment:
Q  55 gctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacc 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42465029 gctataagctataatctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagctataagctcatgccgaaaaaatgttacc 42465128  T
Q  155 aaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt-ttaccaaac 232  Q
    ||||| |         ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  42465129 aaacataattttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctctt-ttttgggtgttaccaaac 42465206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7041244 - 7041105
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7041244 taataagggtaaagttggaattaaaagtgagacgctataaactataagcttaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 7041145  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  7041144 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacaga 7041105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20450644 - 20450424
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20450644 aaataataagggtagaaatggaataaaagatgataaactataagttataagcacaaacgctacttgcaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgtg 20450545  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    ||||||| ||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | |||    
T  20450544 aaataagttataaacttgttgtaaaaaactgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctatccgctataagctataagctcgttttt 20450445  T
Q  219 tgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  20450444 tgggcttgccaaacagagcct 20450424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 32026375 - 32026555
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32026375 aaatagtaagggcaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagcttgtg 32026474  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||       ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32026475 aaataaactataagctcgtggtgaaaaaccattatcaaacagagctttttttgtcgaacgaacttataagctataagctaa 32026555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 30814261 - 30814403
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30814261 tataagttcaaacgctacttggaatagtttccgaaaaatatcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaac 30814360  T
Q  164 nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
           |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30814361 tttttttgtcaaacgagcttaaaagctataagctataagctaa 30814403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27446612 - 27446437
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27446612 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagatataagttataaactcagacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcatataaactcgtga 27446513  T
Q  120 aataagctat-aagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataag 195  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |       ||| |||||||||||||||||||||    
T  27446512 aataagctataaagctcat-gtgaaaaagtgttaccaaacataactttttttgtcgaacgagcttataagctataag 27446437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41785915 - 41785779
Alignment:
Q  99 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41785915 aaatagcctataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagtta 41785816  T
Q  199 aaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  41785815 aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 41785779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47173688 - 47173554
Alignment:
Q  85 gaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagctta 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |        |||||||||||||    
T  47173688 gaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcgttatcaaacagaactttttttatcaaacgagctta 47173589  T
Q  185 taagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  47173588 taacctataagctaagagctataagctcttttttt 47173554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 211
Target Start/End: Original strand, 37489931 - 37490082
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||| |    
T  37489931 aagctataagctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtggaaaatctttaacaaata 37490030  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||||       ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37490031 gagctttttttgtcaaacaagcttataagctatcagctataagctataagct 37490082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 29203027 - 29203136
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||  ||||    
T  29203027 aagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcgttgtaaaaaaccgtta 29203126  T
Q  153 ccaaacagag 162  Q
    ||||||||||    
T  29203127 ccaaacagag 29203136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Original strand, 52595345 - 52595485
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | |    
T  52595345 tataagctccaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatcttgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaaacattaccaaacataac 52595444  T
Q  164 nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
           |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  52595445 tttttttgtcagacgagcttataagctataagttataagct 52595485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35100328 - 35100181
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100328 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatggct--------cgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 35100237  T
Q  158 cagagc--nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    || | |          |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35100236 caaaactttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagaactaaaagct 35100181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 37713107 - 37713285
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctata--agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  37713107 taataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttatataagctcaaacgctacttagaataacttcttaaaaatagtttataagctcgtaa 37713206  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttac-caaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||||       |||||||||| |||||||| |||||||    
T  37713207 aataaactataagctcgttgtaaaaaaccgttactcaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagccataagct 37713285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2598742 - 2598608
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||    
T  2598742 ataagttataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagtttgtggtgaaaaaacattaccaaa 2598643  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctat 192  Q
    |||||         |||||||||||||||||||||    
T  2598642 cagagtttttttgatcaaacgagcttataagctat 2598608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 33897866 - 33898030
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||       |||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33897866 aaataataagggtacaataggaagaaaaaatga-------taagttataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagcttgtg 33897958  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagct 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  33897959 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagct 33898030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 43740258 - 43740384
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||              ||||||||||||||||||    
T  43740258 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaaactataagctataa-ttcaaacgctacttgg--------------aatagcttataagctcgt 43740342  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43740343 gaaataagctataaactcatggtgaaaaactgttaccaaaca 43740384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 52868184 - 52868266
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggt 140  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52868184 ataagttataagctcaaacactacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggt 52868266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 52931117 - 52931241
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||              
T  52931117 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagc-------tataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataactt---------- 52931199  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52931200 ---ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 52931241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5506809 - 5506704
Alignment:
Q  25 taagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5506809 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcataaaataa 5506710  T
Q  125 gctata 130  Q
    ||||||    
T  5506709 gctata 5506704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39719498 - 39719361
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||  |||| ||||||    
T  39719498 aagctataaactcaaacgctatttggaatagcttcttcataataacttataagctcgtgaaataagctataagcttgttgt-aaaaaacgttatcaaaca 39719400  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39719399 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagcta 39719361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 32982921 - 32983011
Alignment:
Q  62 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32982921 gctataagctcaagcattacttgaaatagcttccgaaaaatagcttataagctcgtaaa-------ataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32983011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22257814 - 22257726
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 132  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    |||||||  ||||||||||||||||    
T  22257814 aaaagtaagaagatataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatttgaaaaataagcaataagcttatgaaataagctataag 22257726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25146499 - 25146383
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||  |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||  ||||||| | |||    
T  25146499 aaatagtaagggtaaaaatggaattaaaagtgaaaaattataagttataagttcaaacgttacttgaaatagcgtcagaaaaataagttataagttggtg 25146400  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25146399 aaataagttataagctc 25146383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51950427 - 51950326
Alignment:
Q  134 tcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaaca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||| ||| ||  ||||||||||    
T  51950427 tcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagcgataaactcttttttaggtattaccaaaca 51950328  T
Q  234 ga 235  Q
    ||    
T  51950327 ga 51950326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51980926 - 51980820
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51980926 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctatcagctataagttaaaaagctacttgaaatagcttctgaaaaa-agc-tataagctcgtg 51980829  T
Q  119 aaataagct 127  Q
    ||| |||||    
T  51980828 aaaaaagct 51980820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52363076 - 52363012
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  52363076 gtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacaga 52363012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 24536807 - 24536869
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaaca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  24536807 gtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttggagtttcccaaaca 24536869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 24350282 - 24350358
Alignment:
Q  70 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24350282 ctcaaacgctaattgaaacagcgtctgaaaaataatttataaactcgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaaa 24350358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41538490 - 41538407
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||    
T  41538490 aaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgataagctacaagtta-aagctcaaacactacttgaaataacgtctggaaaata 41538407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 889736 - 889683
Alignment:
Q  181 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  889736 cttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tttagggttaaccaaacaga 889683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 28394172 - 28394225
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtt 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28394172 gtcaaacgagcttataagttataaggtaaaagctaaaagctcttttttggggtt 28394225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 47174547 - 47174486
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctac 81  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  47174547 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagttataagctatatgctccaacgctac 47174486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 45693479 - 45693552
Alignment:
Q  126 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||        ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45693479 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaataaagttttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaa 45693552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Original strand, 43968263 - 43968330
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43968263 aaggttaaaaatggaagaaaatatgaaaagctataagctacaagctcaaaagctacttgaaatagctt 43968330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52788733 - 52788677
Alignment:
Q  148 tgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52788733 tgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 52788677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Original strand, 42527978 - 42528036
Alignment:
Q  37 tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttct 95  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  42527978 tggaagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttct 42528036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53779053 - 53779003
Alignment:
Q  190 tataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  53779053 tataagctaaaagctaaaagctctttttttaggtttcccaaacagaccctt 53779003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 612200 - 612099
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||  |||||||||  | ||| || |||||||||| | || |||||  ||||||||    
T  612200 tataagctataagctcaaacgctacttgaaatggcgtatggaaaataagttataagcttctaaaagaaactataagctcgttgtaaaaaatcgttaccaa 612101  T
Q  157 ac 158  Q
    ||    
T  612100 ac 612099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12764859 - 12764771
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  12764859 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagatatcagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaatcgc-tataagctc 12764771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41785998 - 41785943
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaa 75  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41785998 aataataagggtaaagctggaattaaaagtgaaaagctataagctataagttcaaa 41785943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 121
Target Start/End: Original strand, 43359249 - 43359307
Alignment:
Q  62 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  43359249 gctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctagtgaaa 43359307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Original strand, 44895977 - 44896052
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  44895977 aaggttaaaaatggaataaaatatgaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttgaattagcttcttaaaaa 44896052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5505907 - 5505852
Alignment:
Q  149 gttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5505907 gttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagct 5505852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 204
Target Start/End: Original strand, 2187314 - 2187347
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2187314 gtcaaacgagcttataggctataagctaaaagct 2187347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 12122085 - 12122173
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||| ||||| |||||||||   | |||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12122085 aaggttaaaactggaagaaattataagaatctataagctataagtttaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctc 12122173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 204
Target Start/End: Original strand, 31558316 - 31558349
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31558316 gtcaaacgagcttataagctataagctcaaagct 31558349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 41991591 - 41991695
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  41991591 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 41991689  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  41991690 aaagct 41991695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Original strand, 50938176 - 50938221
Alignment:
Q  56 ctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  50938176 ctatcagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 50938221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 51760659 - 51760567
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||| || || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || | ||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  51760659 aagggtagaaatgaaagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaatgctacttgaaaaaacttttcaaaaaaagc-tataagctcgtga 51760567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22978231 - 22978191
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  22978231 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 22978191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 32390052 - 32390100
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  32390052 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 32390100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 36807083 - 36807035
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  36807083 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 36807035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38732311 - 38732263
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  38732311 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 38732263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 40374446 - 40374494
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40374446 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 40374494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41888961 - 41888921
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  41888961 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 41888921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 42464087 - 42464131
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct 64  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  42464087 aataataagggtaaaactagaattaaaagtgagaagctataagct 42464131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 46668502 - 46668454
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  46668502 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 46668454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 49918397 - 49918349
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  49918397 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 49918349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31581880 - 31581659
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581880 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31581781  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31581780 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 31581681  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    || || | ||||||||||||||    
T  31581680 tttggataaccaaacagagcct 31581659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17115724 - 17115504
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17115724 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 17115625  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17115624 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 17115525  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  17115524 tggggttaaccaaacagagcc 17115504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28716850 - 28716628
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28716850 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 28716751  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28716750 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 28716651  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | || ||| ||||||||| ||||    
T  28716650 tgggttttcccaaacagaccctt 28716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25023492 - 25023275
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25023492 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 25023393  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25023392 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 25023293  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  25023292 tttagtttcccaaacaga 25023275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32541409 - 32541188
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32541409 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 32541310  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32541309 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttt 32541210  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  32541209 tggggttaaccaaacagagcct 32541188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 36681407 - 36681628
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681407 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36681506  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36681507 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctctt-tt 36681605  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  36681606 tttagtttcccaaacagaccctt 36681628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31478262 - 31478045
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31478262 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 31478163  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31478162 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctcttt 31478063  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  31478062 tggggttaaccaaacaga 31478045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39702492 - 39702275
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702492 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39702393  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  39702392 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttatgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagttcttttt 39702293  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  39702292 tttagtttcccaaacaga 39702275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Original strand, 44827285 - 44827498
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44827285 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 44827384  T
Q  126 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||     
T  44827385 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttgaggtta 44827484  T
Q  226 accaaacagagcct 239  Q
    ||||||||||||||    
T  44827485 accaaacagagcct 44827498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 45141415 - 45141631
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141415 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 45141514  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45141515 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctt-tt 45141613  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||| || ||||||||||    
T  45141614 ttggattaaccaaacaga 45141631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6338504 - 6338287
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338504 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 6338405  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6338404 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagttttttttatcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctcttttt 6338305  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  6338304 tggggttaaccaaacaga 6338287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 38171387 - 38171604
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38171387 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacaacttataagctcgt 38171486  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38171487 gaaataagctataagctcatggtgaacaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttt 38171586  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | |||||| |||||||||    
T  38171587 tggggtttcccaaacaga 38171604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10618992 - 10618771
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618992 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 10618893  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  10618892 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctt-tt 10618794  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    || ||||| ||||||||| ||||    
T  10618793 tttggtttcccaaacagaccctt 10618771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8271092 - 8270891
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271092 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 8270993  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  8270992 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaaactaaaagctcttttt 8270893  T
Q  218 tt 219  Q
    ||    
T  8270892 tt 8270891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16423015 - 16422799
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16423015 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 16422916  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16422915 gaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttactaaacagagctttttttatcaaacgagcttataggctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 16422817  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16422816 ttgggttaaccaaacaga 16422799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23677058 - 23676840
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23677058 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgt 23676959  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23676958 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaagagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 23676859  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  23676858 ttggggttaaccaaacaga 23676840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27781288 - 27781102
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27781288 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgt 27781189  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781188 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27781102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39871450 - 39871234
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871450 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39871351  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39871350 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 39871253  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagag 236  Q
    ||  |||| ||||||||||    
T  39871252 tttagtttcccaaacagag 39871234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 42142695 - 42142912
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42142695 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagcgagaagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42142794  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42142795 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 42142894  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  42142895 tgaggttaaccaaacaga 42142912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 39320026 - 39320212
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39320026 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcgaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39320125  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39320126 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaatttataagctataagctaaaagct 39320212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 1893808 - 1894019
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1893808 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 1893900  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1893901 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 1894000  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  1894001 tttgggtttcccaaacaga 1894019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17081798 - 17081618
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081798 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17081699  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  17081698 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccctt 17081618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 41693866 - 41694055
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693866 gaaataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 41693965  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc---nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693966 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctaaaaattttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 41694055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 22877887 - 22878107
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22877887 aataataagggtaaaactggaattaaaagtaagaaactataagctataagctcaaacgctactgagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 22877986  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  22877987 aataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctctt-tttt 22878085  T
Q  220 gggt-ttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  22878086 gggtgttaccaaacagaccctt 22878107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28709451 - 28709271
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28709451 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28709352  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||    
T  28709351 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggttttcccaaacagaccctt 28709271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 43276738 - 43276924
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43276738 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43276830  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43276831 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagct 43276924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 31688017 - 31688189
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688017 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31688109  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  31688110 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 31688189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41313554 - 41313375
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41313554 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 41313462  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41313461 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagct 41313375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 37560495 - 37560706
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560495 ataagggtaaaaatgagacaaaaaaagagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 37560594  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  37560595 agctataagttcatgatcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctctttttttgagt 37560694  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  37560695 ttaccaaacaga 37560706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 40223047 - 40223260
Alignment:
Q  21 ataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40223047 ataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatag-ttataagctcgtgaa 40223145  T
Q  121 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc--nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  40223146 ataagctataagctcatggtg--aaagtgttaccaaacagagctttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctctt-ttt 40223242  T
Q  219 tgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  40223243 tgggtgttaccaaacaga 40223260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 11298003 - 11298218
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11298003 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttatttggaatagcttctgaaaaatatcttataagctcgtga 11298102  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  11298103 aataagctataagctgatgatgaaaaaatgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataacctctt-tttt 11298201  T
Q  220 gggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  11298202 gggtgttaccaaacaga 11298218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24652451 - 24652237
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24652451 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctaaaaaatggcttataagctcgtga 24652352  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  24652351 aataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaacagaactttctttgtcaaacgagcttataagctataagataagaggtaaaagctctt-tttt 24652254  T
Q  220 gggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24652253 gggtgttaccaaacaga 24652237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 11741063 - 11741270
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11741063 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagattctgaaaaatagcttataagctcgt 11741162  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||          |       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11741163 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtatta----------ctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttt 11741252  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  | || ||||||||||    
T  11741253 tgagattaaccaaacaga 11741270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 36112808 - 36112944
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36112808 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36112900  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36112901 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 36112944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36590320 - 36590105
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36590320 aataataagggtaaaactggaattaatagtgagaagctataagcta-aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36590222  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacag-agcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  36590221 aataagttataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaatttttttttgtcaaacgagtttataagctataaattaagagctaaaagctctt-ttt 36590123  T
Q  219 tgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  36590122 tgggtgttaccaaacaga 36590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32099714 - 32099505
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099714 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 32099622  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag-cnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  32099621 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagattttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataagctctt-ttt 32099523  T
Q  219 tgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  32099522 tgggtgttaccaaacaga 32099505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44157382 - 44157204
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44157382 aaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtg 44157283  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44157282 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaattttttttgtcagacgagcttataagctataagct 44157204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 37587685 - 37587896
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37587685 gaaataataaatgtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctaaaagc-------tcaaacgctacttggaataacttctgaaaaataacttataagctcgt 37587777  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  37587778 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactctt-t 37587876  T
Q  217 tttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  37587877 tttgggtgttaccaaacaga 37587896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 35243312 - 35243439
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35243312 gaaataataagggtaaaattgggagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgt 35243411  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35243412 gaaataagatataagctcgtggtgaaaa 35243439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Original strand, 2642403 - 2642523
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2642403 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtca 2642502  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  2642503 aaaaatattaccaaacagagc 2642523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 34395348 - 34395525
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa-atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34395348 aagctataagttcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaac 34395447  T
Q  159 agag-cnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  34395448 agagtttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttaaggtttaccaaacaga 34395525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 29189687 - 29189872
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  29189687 aaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttcttaaaaataacatataagctcgtg 29189786  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||  ||||| |||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29189787 aaataagctataagctcgtagtaaaaaaccgttactaaacagagcttttcttatcaaacgagtttataagctataagctataagct 29189872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9211130 - 9210958
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  9211130 aagctataagctcaaacgctacttgggatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaacg 9211031  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaaca 233  Q
    ||||       ||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9211030 gagctttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaagaattaaaagctctt-ttttgggtttatcaaaca 9210958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 204
Target Start/End: Original strand, 3427623 - 3427767
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3427623 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtgaaaaagcattaccaaaca 3427722  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||       |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3427723 gagctttttttgtcagacgagcttataacctataagctataagct 3427767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3511403 - 3511224
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511403 aaatattaagggtaaaagtggaagaaattttgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 3511304  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| |||        |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3511303 aaataagctacaagctcatggctaaaaagcattaccaaactgagtttttttcgtcagacgaacttataagctataagcta 3511224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 39746911 - 39747073
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39746911 aataagggtaaaattggaagaaaaaat-------tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 39747003  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctat 192  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  39747004 aagttataagctcgtggtgaaaaaacattaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataagctat 39747073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 43849174 - 43849346
Alignment:
Q  25 taagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43849174 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataa 43849273  T
Q  125 gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43849274 gctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttataagct 43849346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7379030 - 7378848
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7379030 taataagggtaacattggaattaaaaatcagatgctataagctataagctcaaacactacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaa 7378931  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  7378930 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagcttcttttgtcagacgaacttataagctataaactataagct 7378848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22957493 - 22957354
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22957493 aataataagggtaaaattgaaattgaaagtaagaagctataaactataaactcaaacactacttagaatagcttctgaaaaataacttataagcttgtga 22957394  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22957393 aataagctataagctcatggtaaaaaaatgttacgaaaca 22957354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13970121 - 13969982
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  13970121 ataagctataagctcaaacgctacttcgaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaa 13970022  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970021 cagagcttttttgatcaaacgagcttataagctataagct 13969982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40045585 - 40045444
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaat-agcttataagctcgt 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  40045585 aaataatgagggtaaaattggaagaaaaaataaaaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagcttataagctagt 40045486  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacag 160  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  40045485 -aaaaaagctataagctcttgatgaaaaacagttaccaaacag 40045444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38780812 - 38780666
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||   ||     
T  38780812 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagttataagttcgtggtgaaaaatcattg 38780713  T
Q  153 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
     |||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780712 tcaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaa 38780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39677541 - 39677442
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39677541 aaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtg 39677442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16831666 - 16831503
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16831666 tataagctcaaacgctacttaaaatagcttatgaaaaatagcttataaactc--------agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaactgaac 16831575  T
Q  164 nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
           ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  16831574 tttttttgtcaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaaactctttttttggtgttaccaaacaga 16831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40551968 - 40551856
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 143  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40551968 aaaagtgaggagttataaactataagctcaaacgctatctgaaatagcttctgaaaaatagct-ataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaa 40551870  T
Q  144 aaagtgttaccaaa 157  Q
    ||| ||||||||||    
T  40551869 aaaatgttaccaaa 40551856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44263489 - 44263388
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44263489 taataaggataaaattggaattaaaagtaagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 44263390  T
Q  122 ta 123  Q
    ||    
T  44263389 ta 44263388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 1363793 - 1363895
Alignment:
Q  59 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  1363793 taagctataagttcaaacgctacttagaatagcgtctgaataatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaaatattaccaaac 1363892  T
Q  159 aga 161  Q
    |||    
T  1363893 aga 1363895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2855228 - 2855146
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2855228 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggt 2855146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 42203370 - 42203463
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42203370 gaaataataagggtaaaattggaagaaaatgtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42203462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10651209 - 10651115
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10651209 aataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttaaaattgcttctaaaaaatagcttataagct 10651115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 124
Target Start/End: Original strand, 9370282 - 9370382
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9370282 ataagagtaaatttgaaagaaaagatgataagttataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 9370381  T
Q  124 a 124  Q
    |    
T  9370382 a 9370382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 8436491 - 8436663
Alignment:
Q  25 taagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  8436491 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgatatttgtaatagcatctgaaaaataacttataagctcataaaataa 8436590  T
Q  125 gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||| || | || |||||  |||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  8436591 gctataagttcgttgtaaaaaatcgttatcaaacagagttttttttatcaaacgagcttataagctataagct 8436663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13888388 - 13888326
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13888388 tataagctataagcttaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtga 13888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 2773487 - 2773586
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2773487 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaag-ttataagctcgtg 2773585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26293901 - 26293837
Alignment:
Q  70 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26293901 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataagct 26293837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26307158 - 26307094
Alignment:
Q  70 ctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26307158 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataagct 26307094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Original strand, 26036979 - 26037068
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  26036979 tataggctataaactcaaacgcaacttggaataacatctgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactcgtggtaaaaaa 26037068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 43276903 - 43276955
Alignment:
Q  183 tataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  43276903 tataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 43276955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44318371 - 44318316
Alignment:
Q  63 ctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44318371 ctataagctcaaatgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 44318316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 42203462 - 42203522
Alignment:
Q  137 tggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42203462 tggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagct 42203522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 5320498 - 5320564
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5320498 aaataataagggtaaaaatggaattaaaagtgatatgttataagctataagctcaaacactgcttgg 5320564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 25100122 - 25100226
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  25100122 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 25100220  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  25100221 aaagct 25100226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Original strand, 35004525 - 35004605
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagct 106  Q
    |||| |||||||||||||||   | |||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  35004525 aaggttaaaattggaagaaattataagaagctataagatataaggtaaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaacagct 35004605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 35397926 - 35397997
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  35397926 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagctt 35397997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35151085 - 35151040
Alignment:
Q  117 tgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  35151085 tgaaataagttataagctcgtggtgaaaaaatattaccaaacagag 35151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40529693 - 40529589
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  40529693 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 40529595  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  40529594 aaagct 40529589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12208967 - 12208919
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  12208967 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 12208919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12453395 - 12453347
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  12453395 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 12453347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29725924 - 29725884
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  29725924 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 29725884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 88)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 8023935 - 8024155
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8023935 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 8024034  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8024035 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 8024134  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  8024135 ttgggataaccaaacagagcc 8024155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36686002 - 36685780
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36686002 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36685903  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36685902 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 36685803  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  36685802 tggggttaaccaaacagaccctt 36685780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 2236467 - 2236684
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2236467 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2236566  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2236567 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 2236666  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  2236667 ttgggtttcccaaacaga 2236684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12774762 - 12774545
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774762 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12774663  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12774662 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 12774563  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | |||||| |||||||||    
T  12774562 tggggtttcccaaacaga 12774545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 14647308 - 14647524
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647308 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 14647407  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14647408 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 14647506  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || |||| ||||||||||    
T  14647507 ttaggttaaccaaacaga 14647524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30299884 - 30299667
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299884 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30299785  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30299784 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttt 30299685  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| || |||||||    
T  30299684 ttgggttaactaaacaga 30299667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 30412563 - 30412785
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30412563 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30412662  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30412663 gaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagcttttttt 30412762  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  30412763 ttgggtttcccaaacagaccctt 30412785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 1711154 - 1711371
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1711154 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 1711253  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1711254 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctcttttt 1711353  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1711354 ttgggtttcccaaacaga 1711371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5591774 - 5591538
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5591774 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgt 5591675  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5591674 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 5591576  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttcatctcactcgacaa 255  Q
    || ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  5591575 tttggtttcccaaacagaccctttatctctcttgacaa 5591538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12713498 - 12713281
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713498 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12713399  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12713398 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 12713299  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | |||||| |||||||||    
T  12713298 tggggtttcccaaacaga 12713281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32383035 - 32382818
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32383035 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 32382936  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32382935 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 32382836  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  32382835 tggggttaaccaaacaga 32382818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 39744493 - 39744715
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39744493 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39744592  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39744593 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttacaaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 39744691  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttc 241  Q
    || ||||| ||||||||| |||||    
T  39744692 tttggtttcccaaacagacccttc 39744715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 13228424 - 13228640
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13228424 gaaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 13228523  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13228524 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 13228622  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | | |||| |||||||||    
T  13228623 tggagtttcccaaacaga 13228640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 32381625 - 32381840
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32381625 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 32381724  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32381725 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 32381824  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    | ||||  ||||||||    
T  32381825 tggggtcaaccaaaca 32381840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19525935 - 19525713
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525935 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 19525836  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19525835 gaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataaactataaggtaaaagctaaaagctcttttt 19525736  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  19525735 tagggttaaccaaacagaccctt 19525713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24794165 - 24793936
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaag-------ctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794165 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 24794066  T
Q  111 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794065 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 24793966  T
Q  211 tcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |  | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  24793965 tactttttggggttaaccaaacagagcctt 24793936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 6603861 - 6604068
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603861 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 6603960  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6603961 gaaataagctataagctcacggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttt 6604060  T
Q  218 ttgggttt 225  Q
    | ||||||    
T  6604061 tggggttt 6604068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 35235678 - 35235864
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235678 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35235777  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35235778 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 35235864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39275609 - 39275388
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39275609 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 39275510  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  39275509 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctatt-tt 39275411  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  39275410 tttagtttcccaaacagaccctt 39275388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 31168938 - 31169155
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31168938 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31169037  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  31169038 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagttttttttgtcaaacgaacttataaactataaactaaaagctaaaaactcttttt 31169137  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  31169138 tttagtttcccaaacaga 31169155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 9160643 - 9160829
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160643 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 9160742  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9160743 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttaaaagctaaaagct 9160829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 12363563 - 12363780
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12363563 gaaataataagtgtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12363662  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12363663 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctctt-t 12363761  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  12363762 tctggattaaccaaacaga 12363780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1174964 - 1174753
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174964 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 1174865  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1174864 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggt 1174765  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  1174764 ttaccaaacaga 1174753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 4221431 - 4221640
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4221431 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 4221523  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4221524 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 4221622  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  4221623 ttgagttaaccaaacaga 4221640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 5997856 - 5998031
Alignment:
Q  29 ggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagcta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997856 ggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagcta 5997955  T
Q  129 taagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997956 taagctcacggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 5998031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43402630 - 43402451
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43402630 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 43402531  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  43402530 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 43402451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27130515 - 27130333
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130515 taataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 27130416  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27130415 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaaagagcttataagctataagctaaaagct 27130333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15443642 - 15443425
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15443642 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 15443543  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |       ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  15443542 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaccaaaactaaacttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagttaaaaactcttttt 15443443  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  15443442 ttgggtttcccagacaga 15443425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 26699057 - 26699245
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26699057 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcat 26699156  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26699157 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttatttgtcaaacgagcttataacctataagctataagctaa 26699245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 26968790 - 26968978
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26968790 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcat 26968889  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26968890 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttatttgtcaaacgagcttataacctataagctataagctaa 26968978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15530621 - 15530442
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15530621 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 15530522  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  15530521 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 15530442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 19956252 - 19956470
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19956252 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa-tagcttata 19956350  T
Q  111 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956351 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgttaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagc 19956450  T
Q  211 tcttattttgggtttaccaaa 231  Q
    |||| |||| |||| ||||||    
T  19956451 tctt-ttttaggttaaccaaa 19956470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10697449 - 10697240
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10697449 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 10697350  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10697349 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaatgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggt 10697250  T
Q  224 ttaccaaaca 233  Q
    ||||||||||    
T  10697249 ttaccaaaca 10697240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 5381895 - 5382082
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5381895 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 5381994  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5381995 gaaataagttataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 5382082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35640126 - 35639923
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35640126 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35640027  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||        ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  35640026 gaaataagctataaactcatggtgaaaaagtattatcaaacagagctttttttatcaaacgagcttataaattataagttaaaaactaaaagctcttttt 35639927  T
Q  218 ttgg 221  Q
    ||||    
T  35639926 ttgg 35639923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2178946 - 2178802
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2178946 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgt 2178847  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178846 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 2178802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 3037376 - 3037593
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3037376 gaaataataaggataaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 3037475  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |        |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3037476 gaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaacatacctttttttatcaaacaagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 3037575  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  3037576 tttagtttcccaaacaga 3037593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 30774168 - 30774365
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30774168 aaaaaatgagaagctaaaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtca 30774267  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  30774268 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaagagaccctt 30774365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 35236624 - 35236836
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35236624 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 35236723  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttggg 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35236724 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttatgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttttgg 35236823  T
Q  223 tttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||    
T  35236824 tttaccaaacaga 35236836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2671593 - 2671383
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2671593 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagcgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 2671501  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  2671500 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagtttttttt 2671401  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  2671400 tttagtttcccaaacaga 2671383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7651826 - 7651682
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7651826 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagattataagctcgt 7651727  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7651726 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 7651682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 9587144 - 9587339
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587144 gaaataataagggtaaaattggaataaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 9587236  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9587237 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctctttt 9587336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 39246795 - 39246973
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246795 gaaataataagtgtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39246887  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246888 gaaataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 39246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3670458 - 3670263
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670458 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 3670359  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||        || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3670358 agctataagcgcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtgaaacgagctcataagctataagctaagagctaaaagctcttttttt 3670263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 13156844 - 13157054
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13156844 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgt 13156936  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13156937 gaaataagctataagttaatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaaacttataagctataaggtaaaagctaaaagctcttttt 13157036  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  13157037 tggggtttttcaaacaga 13157054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 22977156 - 22977301
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22977156 gaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagtttataagctcat 22977255  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22977256 gaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaacagagc 22977301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 29392065 - 29392258
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29392065 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttttaaaaaatagcttataagctcgt 29392157  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29392158 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttt 29392256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 11062871 - 11063047
Alignment:
Q  31 taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11062871 taaaaatggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttata 11062970  T
Q  131 agctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11062971 agctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgccaaacgagcttataagctataagctataagctaa 11063047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 36027944 - 36028121
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36027944 aataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 36028043  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36028044 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagct 36028121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4379442 - 4379300
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4379442 aataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaaactataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4379343  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4379342 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 4379300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 11663848 - 11664043
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11663848 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaatttataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaata 11663947  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11663948 agctataaacttatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttt 11664043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19347891 - 19347705
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347891 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 19347792  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19347791 aaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagcttttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagct 19347705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3669720 - 3669510
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3669720 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 3669628  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3669627 gaaataagctacaagtttatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgaacttataaactataagctaagagctaaaagctcttttt 3669528  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||  |||| |||||||    
T  3669527 taggtgttacaaaacaga 3669510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5521469 - 5521305
Alignment:
Q  33 aaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 132  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521469 aaattggaagaaaagataatgagctataagctataaactcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 5521370  T
Q  133 ctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  5521369 ctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 5521305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 648677 - 648538
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  648677 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaa 648578  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  648577 cagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagct 648538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 6893372 - 6893533
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6893372 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaactagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 6893471  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6893472 gagc-ttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaagagctaacagctctt-ttttgggt 6893533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16474956 - 16474771
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16474956 aaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataatctcgtg 16474857  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||| |||||||||| |||| | | |   ||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16474856 aaataaactataagctcgtggtaagagaccattaccaaacagagctatttttgtcaaacgagtttataagctataagctataagct 16474771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 11100721 - 11100899
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11100721 aaataataagggtaaagatggaagaaaaaatga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 11100813  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||   |||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11100814 aaataagctataagctcgttgtaaaaagacgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 11100899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 9627106 - 9627246
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9627106 aaataataagagtaaaattggaattaaaagtgagacactataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctg 9627205  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  9627206 aaataagctataagctcattgtaaaaaagtgttatcaaaca 9627246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4875828 - 4875689
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |    
T  4875828 aataataagggtaaaactgaaattaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttaaaaaatagcttataaactcctaa 4875729  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||| |||||| ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  4875728 aataaactataaactcgtagtaaaaaaatgttaccaaaca 4875689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2497709 - 2497570
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2497709 ataagttataagctcaaacgctatttagaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtgaaataagttataatctcatggtgaaaaagcattaccaaa 2497610  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
     |||||       || | ||||||||||||||||||||||    
T  2497609 tagagcattttttgttagacgagcttataagctataagct 2497570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13936370 - 13936233
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13936370 aaataataagggtaataatggaataaaaagtga-------taagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcatg 13936278  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||    
T  13936277 aaataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaacagagc 13936233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23920608 - 23920498
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||    
T  23920608 aagctataaactctaagttcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcctggtgaaagatagtta 23920509  T
Q  153 ccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||    
T  23920508 ccaaacagagc 23920498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 6280407 - 6280550
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  6280407 aaatattaaggttaaaaatagaagaaattttgagaagttataagctataagcttaaatgctacttgaaataacttatgaaaaatagtttataaacccgtg 6280506  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  6280507 aaataaactataagctcatgatgaaaaagcgtcatcaaacagag 6280550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 25872186 - 25872376
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||                  
T  25872186 gaaataataagggtaaaattagaagaaaaggtgagaagctataagct-------caaactctacttggaatagcttctgaaaaata-------------- 25872264  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
      |||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  25872265 --aat----tataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagctacgagctaaaagctctt-tt 25872357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 4657561 - 4657652
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4657561 aagggtaaagatggaagaaaaa-tgataagttataagctataagctcaaactctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtg 4657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6349501 - 6349426
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6349501 aaaaagtgataagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtg 6349426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 42323562 - 42323701
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaag-tgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42323562 aataaggataaaagtggaagaaaaaaataataaactataagctataagctcaaacactacttagaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtaaaa 42323661  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    || | |||||| | |||||| ||||   ||||||||||||    
T  42323662 tatgttataaggttatggtgcaaaaacattaccaaacaga 42323701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13921871 - 13921783
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  13921871 ataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagttataagttcgtggtaaaaaa 13921783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 27005806 - 27005919
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||  |||||||||| ||    
T  27005806 aaataataaaggtaaaaagggaattaaaagtgaaaatttataagctataagctcaaacgttacttgaaatagcgtttggaaaataagttataagctcttg 27005905  T
Q  119 aaataagctataag 132  Q
    ||||||||||||||    
T  27005906 aaataagctataag 27005919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31408102 - 31407980
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31408102 taataagggtagtattggaagaaaaa-taataagctata-gttataatcttaaacgctaattggaatagcgtctgacaaatagcttataagctcgtgaaa 31408005  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    |||| ||| | ||| || |||||||    
T  31408004 taagttattaactcgtgctgaaaaa 31407980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33694861 - 33694719
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||  | ||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| || ||     
T  33694861 aaatagtaagggtaaaagtgaaagaaaaagcaataagttataagctacagactcaaacgctacttcgaataacgtctgaaaaataacttataaacttgta 33694762  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||||||    
T  33694761 aaataaattataagctcgtggtaaaaaactattcccaaacaga 33694719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 135
Target Start/End: Original strand, 32321652 - 32321730
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32321652 tataagctataagctcaaacgttatttgaaatagagtctgaaaaataagttgtaagttcgtgaaataagctataagctc 32321730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Original strand, 41471900 - 41472006
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa-agtgttaccaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||   || |||||| |||||||||||| ||| |  | ||||||| | |||||||||    
T  41471900 ataagctataagctcaaacactatttgaaatagcgtctggaaaataagctaaaagctcctgaaataagctacaagtttgttgtgaaaagactgttaccaa 41471999  T
Q  157 acagagc 163  Q
    |||||||    
T  41472000 acagagc 41472006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 119
Target Start/End: Original strand, 2890885 - 2890977
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||| ||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  2890885 aaggttaaaaatggaagaaaatgtaaaaagctatcagctataagctaaaaagctatttgaaatagtttctcaaaaaaagc-tataagctcgtga 2890977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7896659 - 7896599
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  7896659 tataagctataaactcaaacgctatttgaaatagcgtttg-aaaatagcttataagctcgtg 7896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 135
Target Start/End: Original strand, 18480557 - 18480630
Alignment:
Q  62 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18480557 gctataagctcaaatgctacttgagatagcgtctaaaaaataaactataagcttgtgaaataagatataagctc 18480630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Original strand, 12049539 - 12049606
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| |||||||||||||||   | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12049539 aaggttaaaattggaagaaattataagaagctataagttataagttcaaaagctacttgaaatagctt 12049606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3033537 - 3033471
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 92  Q
    |||| ||||| ||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3033537 aaggttaaaaatggaataaaatgtaaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttggattagct 3033471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15524559 - 15524477
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |   || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  15524559 aaataatagggttaaaattggaagaaaatatataaaactaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 15524477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36959690 - 36959589
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||| || ||||| || ||| | |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  36959690 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctatcagttataaactaaaaagttacttgaaatagcttct-caaaataaattataagctcgtg 36959592  T
Q  119 aaa 121  Q
    |||    
T  36959591 aaa 36959589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 76606 - 76502
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||| || |||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || |||||||||| ||||    
T  76606 taatagggttaaagttggaagaaaatataaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcgggaaa 76508  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  76507 aaagct 76502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 27812908 - 27813012
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  27812908 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctatcagctataagctaaaaagttacttgaaatagcttttcaaaaaatgc-tataagctcatgaaa 27813006  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  27813007 aaagct 27813012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 29525228 - 29525332
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  29525228 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 29525326  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  29525327 aaagct 29525332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 41734176 - 41734280
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||| || |||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  || ||||||||| |||||    
T  41734176 taatagggttaaagttggaagaaaatataaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaaacgc-tataagctcatgaaa 41734274  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  41734275 aaagct 41734280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 7948376 - 7948424
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  7948376 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 7948424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13019155 - 13019107
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  13019155 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 13019107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 20768806 - 20768854
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  20768806 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 20768854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22781 - 22559
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22781 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgt 22682  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22681 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 22582  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  22581 tcgggttaaccaaacagaccctt 22559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 130)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 12233928 - 12234150
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12233928 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12234027  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12234028 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttt 12234127  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  12234128 tggggttaaccaaacagaccctt 12234150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28307438 - 28307221
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28307438 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 28307339  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28307338 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaccgagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 28307239  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  28307238 ttgggtttcccaaacaga 28307221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53407372 - 53407156
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407372 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 53407273  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53407272 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 53407174  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  53407173 tggggttaaccaaacaga 53407156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7706555 - 7706333
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706555 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 7706456  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  7706455 gaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttc 7706356  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||    
T  7706355 ttggttttcccaaacagaccctt 7706333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46895466 - 46895248
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895466 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 46895367  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc-ttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  46895366 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 46895267  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  46895266 tttgggtttcccaaacaga 46895248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 8829776 - 8829993
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829776 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 8829875  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8829876 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttt 8829975  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | |||||| |||||||||    
T  8829976 tggggtttcccaaacaga 8829993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11600866 - 11600649
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11600866 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 11600767  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11600766 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 11600667  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  11600666 tggggttaaccaaacaga 11600649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18583027 - 18582811
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583027 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 18582928  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18582927 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 18582829  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  18582828 tttggtttcccaaacaga 18582811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42117079 - 42116862
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42117079 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42116980  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42116979 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 42116880  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  ||||| |||||||||    
T  42116879 tgaggtttcccaaacaga 42116862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56372618 - 56372402
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56372618 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 56372519  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56372518 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 56372420  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  56372419 tttggtttcccaaacaga 56372402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45906322 - 45906102
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45906322 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 45906223  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||    
T  45906222 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctactttt 45906123  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  45906122 tggggttaaccaaacagagcc 45906102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 19513843 - 19514059
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19513843 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctaaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 19513942  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19513943 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 19514041  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  19514042 tttggtttcccaaacaga 19514059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 22038318 - 22038540
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22038318 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcctataagctcga 22038417  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22038418 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttta 22038517  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  22038518 tggggttaaccaaacagaccctt 22038540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 4517160 - 4517369
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517160 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 4517259  T
Q  126 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggttt 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||     
T  4517260 ctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggatta 4517359  T
Q  226 accaaacaga 235  Q
    ||||||||||    
T  4517360 accaaacaga 4517369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8942087 - 8941871
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942087 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 8941988  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  8941987 aaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagttaaaagctctt-tt 8941889  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  8941888 tttggtttcccaaacaga 8941871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 39087519 - 39087733
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39087519 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgt 39087618  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39087619 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctctt-tt 39087717  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    || |||| ||||||||    
T  39087718 ttaggttaaccaaaca 39087733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 4392687 - 4392908
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4392687 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatg-aaaatagcttataagctcgt 4392785  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4392786 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttt 4392885  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |  |||| |||||||||| ||||    
T  4392886 tgaggttaaccaaacagaccctt 4392908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 11151900 - 11152086
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151900 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 11151999  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11152000 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 11152086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 27397727 - 27397913
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27397727 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgt 27397826  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397827 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27397913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52670177 - 52669984
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670177 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 52670078  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670077 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 52669984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 9043571 - 9043788
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043571 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 9043670  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggt-gaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9043671 gaaataagttataagctcatggtggaaaaagtgttaccaaacataactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-t 9043769  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  9043770 tttgagtttcccaaacaga 9043788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 55495848 - 55496058
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55495848 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 55495940  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55495941 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 55496040  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  55496041 tttagtttcccaaacaga 55496058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 23867830 - 23868016
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23867830 gaaataataagggtaaaattagaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 23867929  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23867930 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaaagagcttataagctataagctaaaagct 23868016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 25440445 - 25440631
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440445 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 25440544  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25440545 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 25440631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29413714 - 29413528
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413714 gaaataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 29413615  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413614 gaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29413528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 35777354 - 35777564
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777354 gaaataacaagggtaaaattggaagaaaaagtgagaaggtata-------agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35777446  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35777447 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 35777546  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  35777547 tggggttaaccaaacaga 35777564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3009894 - 3009708
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009894 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 3009795  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3009794 gaaataagctataagctcaaggtaaaaaaatgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagct 3009708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 4939347 - 4939532
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939347 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 4939446  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4939447 gaaataagctataagctcatggt-aaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagct 4939532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21370063 - 21369890
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21370063 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 21369964  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagcta 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  21369963 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagcta 21369890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 35822260 - 35822477
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35822260 gaaataatacgggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatctcgt 35822359  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35822360 gaaataagttgtaagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaaaagctaaaagctcttttt 35822459  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  35822460 tgaggttaaccaaacaga 35822477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 47417443 - 47417662
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47417443 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttata-------agctcaaacgctgcttggaatagcttatgaaagatagcttataagctcgt 47417535  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47417536 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 47417635  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttcatc 244  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  47417636 tggggtttcccaaacagacccttcatc 47417662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55764736 - 55764521
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55764736 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 55764637  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55764636 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagcttttttt-tgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggt 55764538  T
Q  224 ttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||||||| ||||    
T  55764537 ttaccaaacagaccctt 55764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 55856488 - 55856679
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55856488 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 55856587  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55856588 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttta---tcaaacaaacttataagctataagctaaaagttaaaagctc 55856679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 4355553 - 4355763
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4355553 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 4355652  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  4355653 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaactttttttgtcaaacgaatttataagctat-------aagctaaaagctcttttt 4355745  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4355746 ttgggtttaccaaacaga 4355763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 37115251 - 37115460
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37115251 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 37115343  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37115344 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaaactctt-tt 37115442  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    || ||||| |||||||||    
T  37115443 tttggtttcccaaacaga 37115460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 51011026 - 51011248
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51011026 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 51011125  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |         ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  51011126 gaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttgccaaatagaacttttttttatcaaacgagcttataagttataagctagaagctaaaagctctt-t 51011224  T
Q  217 tttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||    
T  51011225 tttgagttaaccaaacagaccctt 51011248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35468198 - 35468012
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35468198 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctatatgttataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35468099  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35468098 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagct 35468012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22892705 - 22892509
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892705 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 22892606  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22892605 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttg 22892509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22944369 - 22944173
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22944369 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 22944270  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22944269 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttg 22944173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15636125 - 15635910
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15636125 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaaatcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 15636026  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||        |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15636025 gaaataagctataaactcatagtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttatcaaacaagtttataagctataagctaagaggtaaaagctctt-tt 15635927  T
Q  218 ttgggt-ttaccaaaca 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15635926 ttgggtgttaccaaaca 15635910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26826704 - 26826525
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826704 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 26826605  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||    
T  26826604 gaaataagttataagctcatcgtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacaaacttataagctataagct 26826525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33115158 - 33114979
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115158 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgatacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 33115059  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33115058 gaaataagctataagctcacggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagct 33114979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 9031957 - 9032101
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9031957 aaataataagggtaaaattgtaataaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 9032056  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9032057 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 9032101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31679145 - 31678969
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31679145 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 31679053  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31679052 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaa 31678969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 43225645 - 43225860
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43225645 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43225737  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43225738 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaaaaactaaaagctctt-t 43225836  T
Q  217 tttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  43225837 ttttggtttcccaaacagaccctt 43225860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 55358299 - 55358443
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55358299 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 55358398  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55358399 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagag 55358443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37970471 - 37970261
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37970471 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaata 37970372  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||    
T  37970371 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagag-tttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaagagctaaaagctcatttttttggt 37970273  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  37970272 ttaccaaacaga 37970261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29664105 - 29663926
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29664105 gaaataataagggtaaaattggatgaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacctggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 29664013  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29664012 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29663926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55829145 - 55828965
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55829145 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 55829046  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  55829045 gagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccgaacagaccctt 55828965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 27185593 - 27185737
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185593 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 27185692  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggt-gaaaaagtgtt-accaaacag 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27185693 gaaataagctataagctcatggtagaaaaagtgttaaccaaacag 27185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44442264 - 44442048
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44442264 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatag-ttttaagctcgt 44442166  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44442165 gagataagcaataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacgaacttataaattataagctaaaagttaaaagctcttttt 44442066  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | | ||||  ||||||||    
T  44442065 tggagtttctcaaacaga 44442048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Original strand, 31338465 - 31338659
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31338465 taataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagcccgtgaaa 31338564  T
Q  122 taagctataagctcatggtg--aaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||       ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  31338565 taagctataagctcatggtgaaaaaaaatgttactaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctatcagttaagagctataagctctt 31338659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23162783 - 23162641
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagct-caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23162783 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaatctataagctataagcttcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 23162684  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23162683 aaataagctataagctcatggggaaaaagtgttaccaaacaga 23162641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 4391673 - 4391855
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4391673 taataagggtaaaattggaattaaaagtaagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 4391772  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4391773 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagct 4391855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 30366109 - 30366250
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30366109 aataataagtgtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 30366208  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30366209 aataagatataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaacaga 30366250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Original strand, 35580948 - 35581114
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35580948 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcctctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 35581047  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggttta 226  Q
    ||||       || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35581048 gagctttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctctttttttgggttta 35581114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 36007979 - 36008152
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||              
T  36007979 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacagctt---------- 36008068  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36008069 ---ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 36008152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 5465373 - 5465516
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465373 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaca-ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 5465471  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5465472 aaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagc 5465516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 56270058 - 56270231
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56270058 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaata 56270157  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||    
T  56270158 agctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaacagagttttttttgtgaaacgagcttataagctataagct 56270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37832097 - 37831924
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37832097 gaaataataagggtaaagt-ggaagaaaaagtgagaaactataacct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 37832006  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37832005 gaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 37831924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25235324 - 25235134
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25235324 taataagggtaaaattggaattaaaagtaagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 25235225  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  25235224 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagctttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataaactataagctc 25235134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53273238 - 53273084
Alignment:
Q  81 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgag 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |       ||||||||||    
T  53273238 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaactttttttgtcaaacgag 53273139  T
Q  181 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  53273138 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacaga 53273084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 21633778 - 21633964
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633778 aaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 21633877  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 205  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |   |||||||||| | |       ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21633878 aaataagctataagctcgtggtaagagaacattaccaaacaaaactttttttgtcaaacgaacttataagctataagctataagcta 21633964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55684874 - 55684692
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55684874 taataagggtaaaattggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 55684775  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||| |||||| | || ||||||  |||||||||| |||       |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  55684774 taagctagaagctcgttgtaaaaaagcattaccaaacaaagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagct 55684692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22430817 - 22430637
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22430817 aaatagtaagggcaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtg 22430718  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||        || |||||||||||||||||||||||||    
T  22430717 aaataagctataagctcgtggtgaaaaaccattatcaaatagagctttttttatcgaacgagcttataagctataagctaa 22430637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 23113438 - 23113618
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113438 aaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagttataaactcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtg 23113537  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||         |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23113538 aaataagctataagctcatggcgaaaaagtattaccaatcaaagttttttttatcaaacgagcttataaactataagctaa 23113618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 35190582 - 35190763
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35190582 aataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaat 35190681  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35190682 aagctacaaactcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagttttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 35190763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11050458 - 11050320
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11050458 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagcattaccaaaca 11050359  T
Q  160 gagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||        |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11050358 gagcttttttttgtcagacgagcttataagctataagct 11050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 42124640 - 42124740
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  42124640 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaagatagtttataagctcgt 42124739  T
Q  118 g 118  Q
    |    
T  42124740 g 42124740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 33005076 - 33005275
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata------- 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  33005076 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgt 33005168  T
Q  111 -------------agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  33005169 gaaataagctataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 33005268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 45780725 - 45780915
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  45780725 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa------ 45780811  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
                  |||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45780812 --------------gctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 45780897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Original strand, 43078161 - 43078300
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43078161 taataagggtaaaactggaattaaaaatgagaagttataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaa 43078260  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||    
T  43078261 taagttataagctcgtggcgaaaaaacattaccaaacaga 43078300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36197017 - 36196840
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |   ||| ||||    
T  36197017 ataagctataagctcaaacactacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtaagagacaattatcaaa 36196918  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||       ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |  |||| ||||||||||||    
T  36196917 cagagctatttttgtcaaacgagcttataaactataagctataaactataagctcatttaatgggcttaccaaacaga 36196840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20511552 - 20511413
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  20511552 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttatcaaa 20511453  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||        |||| |||| |||||||||||||||||    
T  20511452 cagagtgtttttggtcagacgaacttataagctataagct 20511413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 207
Target Start/End: Original strand, 29656720 - 29656843
Alignment:
Q  84 ggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagctt 183  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |       |||||||||||||    
T  29656720 ggaatagcttctgaaaaataaattattagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtgttaacaaacagaactttttctgtcaaacgagctt 29656819  T
Q  184 ataagctataagctaaaagctaaa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  29656820 ataagctataagctaagagctaaa 29656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44525811 - 44525694
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44525811 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtga 44525719  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaa 144  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  44525718 aataagctataaactcatagtgaaa 44525694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 139
Target Start/End: Original strand, 20148803 - 20148884
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148803 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 20148884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 36486348 - 36486489
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |    
T  36486348 aataataaggataaaactggaattaaaagtgagaagttataagctataagttcaaacgttacttaaaatagcttatgaaaaatagtttataagctcataa 36486447  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36486448 aataaactataaattcatggtgaaaaagtattaccaaacaga 36486489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 24954183 - 24954282
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24954183 aaatgataagggtaaaaatggaacaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 24954282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 35842572 - 35842696
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||| ||    
T  35842572 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg--------------aatagcttataagctcgcga 35842657  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35842658 aataatctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 35842696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 42085691 - 42085812
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42085691 aaatattaagggtaaaattgaaagaaaaaatga-------taagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaaaagcttataagctcgtg 42085783  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaag 147  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  42085784 aaataagctataagttcgtggtgaaaaag 42085812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 25199366 - 25199472
Alignment:
Q  127 tataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggttta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  25199366 tataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaa 25199465  T
Q  227 ccaaaca 233  Q
    |||||||    
T  25199466 ccaaaca 25199472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 52713676 - 52713560
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||| | |||    
T  52713676 aaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagtgtcttaaaaataacttataagtttgtg 52713577  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    ||||||| |||||||||    
T  52713576 aaataagttataagctc 52713560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 29656597 - 29656716
Alignment:
Q  116 gtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctta 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  29656597 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttcttgtcaaacgagcttaaaagctataaggtaagagctaaaagctctt- 29656695  T
Q  216 ttttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  29656696 ttttgggtgttaccaaacaga 29656716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 52707967 - 52708138
Alignment:
Q  25 taagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 124  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52707967 taagggtataaatggaataaaacatgataagatataagctataagctcaa-cgttacttgtaataacatctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataa 52708065  T
Q  125 gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||| | || |||||  ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  52708066 gctataagctcgttgtaaaaaatcgttaccaaacagagttttttctatcaaacgagcttataagctataagct 52708138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 53274879 - 53274812
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53274879 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg 53274812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 40497399 - 40497473
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40497399 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagct 40497473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 160
Target Start/End: Original strand, 48056607 - 48056709
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || | || ||||| ||||||||||    
T  48056607 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgtgaaataaactataagttcgttgtaaaaaattgttaccaaa 48056706  T
Q  158 cag 160  Q
    |||    
T  48056707 cag 48056709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 4465472 - 4465573
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  4465472 ataagctacaagctcaaacgctacttggaacagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcattgtaaaaagacgttaccaaa 4465571  T
Q  158 ca 159  Q
    ||    
T  4465572 ca 4465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37047172 - 37047069
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||    
T  37047172 ataagctataagctcaaacgctatttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctaaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttatcaaa 37047073  T
Q  158 caga 161  Q
    ||||    
T  37047072 caga 37047069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37337818 - 37337678
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  37337818 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagacactataaactataagttcaaacgctacttgaagtagcttatgaaaaatagcttataagtacctgaaa 37337719  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||  ||||||||||||||    
T  37337718 taagctatatgcttattataaaaaaccgttaccaaacagag 37337678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 50502376 - 50502284
Alignment:
Q  65 ataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||  |||||||||    
T  50502376 ataagctcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcgttgtaaaaaaccgttaccaaa 50502284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40120002 - 40119903
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40120002 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaatatgataagctataggctacaagctcaaatgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtg 40119903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 32101736 - 32101835
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |  |||||||||    
T  32101736 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacgtcttagaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggtaaaagaccgttaccaaa 32101835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31435149 - 31435072
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31435149 ataagttataacctcaaacgctacttggaatagcgtatgaaaaataacttataaactcgtgaaataagctataagctc 31435072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17715707 - 17715647
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17715707 ataagctataatctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 17715647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31953331 - 31953224
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||  ||||    
T  31953331 gaaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctata-------agctcaaacgctacttgaaataatgtctaaaaaatagtttataaagtcgt 31953239  T
Q  118 gaaataagctataag 132  Q
    |||||||||||||||    
T  31953238 gaaataagctataag 31953224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 53224368 - 53224309
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53224368 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaactcgtga 53224309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Original strand, 30562850 - 30562988
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||||| || | || |||||  |||||||||    
T  30562850 ataagctataagcttaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttat-tgctcataaaataagttataagttcgttgtaaaaaatcgttaccaaa 30562948  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    || | |       |||||||||||||||||||||||||||    
T  30562949 cataactttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 30562988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 41864049 - 41864153
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||        |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  41864049 aaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataaactt-------aaacgctatttggaatagcttcttaaaaatagcttataagttcgta 41864141  T
Q  119 aaataagctata 130  Q
    ||||||||||||    
T  41864142 aaataagctata 41864153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 3932211 - 3932306
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||    
T  3932211 aaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataacgtttgaaaaatggctcataagct 3932306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26443487 - 26443389
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | | |||| |||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26443487 aaataataaaggtaaaattggaattaaaagtgagacgttgtaagttataagcttaaacgttacttgaagtagcttttgaaaaatagtttataagctcgt 26443389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 32948179 - 32948289
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaag-tgtt 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  || | ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  32948179 aagctataaactataagctcaaacgctatttagaatagcgtctgaaaaatactttataatatcataaaataagatataaactcatgatgaaaaagttgtt 32948278  T
Q  152 accaaacagag 162  Q
    | |||||||||    
T  32948279 atcaaacagag 32948289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 38048878 - 38048979
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||  |||| ||||    
T  38048878 ataagctataaactcaaatgctatttggaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgtgaaataaattataagttcgtgatgaaaaaacgttaacaaa 38048977  T
Q  158 ca 159  Q
    ||    
T  38048978 ca 38048979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 55495093 - 55495200
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  55495093 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctatcagctataagttaaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaaac-tataagctcgtg 55495191  T
Q  119 aaataagct 127  Q
    ||| |||||    
T  55495192 aaaaaagct 55495200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17715658 - 17715579
Alignment:
Q  127 tataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17715658 tataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaa 17715579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 20530799 - 20530847
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20530799 aagctataagctataagctcaaaagctacttggaataacttctcaaaaa 20530847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34032809 - 34032730
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtg--agaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaata 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  34032809 aagggtaaaaatggaagaaaaaatgaaagaagttataagcgataagttcaaacgctatttggaatagcgtcggaaaaata 34032730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 53431825 - 53431726
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| || || ||| ||||||||||||    
T  53431825 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaattagcttctcaagaaaagc-tataagctcgtg 53431727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 8716887 - 8716993
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||       ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   ||||||||  ||    
T  8716887 aaataataagggtagaaatggaagaaaaaatga-------taaactataagctcaaacactacttgaaatagcctctggaaaataaactataagcttttg 8716979  T
Q  119 aaataagctataag 132  Q
    ||||||||||||||    
T  8716980 aaataagctataag 8716993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39068969 - 39068890
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcat 137  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  39068969 ataagttataagatcaaacgttacttgaaatatcgtctgaaaaataagttataaactcctgaaataagttataagctcat 39068890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Original strand, 19169165 - 19169207
Alignment:
Q  172 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19169165 tcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctctt 19169207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44525699 - 44525659
Alignment:
Q  116 gtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 156  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44525699 gtgaaataagctataaactcatagtgaaaaagtgttaccaa 44525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45520135 - 45520095
Alignment:
Q  174 aaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45520135 aaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactctt 45520095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6288025 - 6287958
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6288025 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagctt 6287958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10656360 - 10656281
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || |||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  10656360 taataaggttaaaattggaagaaaatgtataaaactaccagctataagctcaaaagttacttgaaatagcttctcaaaaa 10656281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10870505 - 10870426
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   || |||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  10870505 taataaggttaaaattggaagaaaatgtataaaactaccagctataagctcaaaagttacttgaaatagcttctcaaaaa 10870426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25687174 - 25687107
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  25687174 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctatcagctataagttcaaaagctacttgaaatagctt 25687107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31998019 - 31997944
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  31998019 aaggttaaaattggaagaaagtataaaaagttataagctacaagctcaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 31997944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 49239181 - 49239276
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||   | ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49239181 aaatagtaagggtaaaagtggaaaaaaaaacaataaattataaactataagttcaaacgttacttataatagcgtctgaaaaatagtttataagct 49239276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20987144 - 20987086
Alignment:
Q  37 tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttct 95  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  20987144 tggaataaaaagtggaaagctacaagctataagctcaaaagctacttgaattagcttct 20987086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48953188 - 48953143
Alignment:
Q  56 ctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  48953188 ctatcagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttcttaaaaa 48953143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 202451 - 202403
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  202451 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 202403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19912834 - 19912786
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  19912834 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 19912786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26443354 - 26443291
Alignment:
Q  172 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26443354 tcaaacgagcttataagctatctgctataagctataagctctt-ttttggatgttaccaaacaga 26443291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28459773 - 28459725
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  28459773 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 28459725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 30411190 - 30411238
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  30411190 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 30411238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Original strand, 31624344 - 31624384
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  31624344 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 31624384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48977988 - 48977864
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctg-aaaaatagcttataagctcgtgaa 120  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||  |||| |||||||  ||||||| |  | ||    
T  48977988 taataacggtaaatatggaataaaagatgataagttataagctataaggttaaacgctacttgaaaaagtgtctgaaaaaataagttataagttaataaa 48977889  T
Q  121 ataagctataagctcatggtgaaaa 145  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  48977888 ataaactataagttcatggtgaaaa 48977864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 53224401 - 53224357
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct 64  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  53224401 aataataagggtaaatctggaattaaaagtgagaagctataagct 53224357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 36246344 - 36246564
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246344 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36246443  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36246444 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctact-tt 36246542  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  36246543 ttgggttaaccaaacagagcct 36246564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43254290 - 43254073
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254290 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 43254191  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43254190 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 43254091  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  43254090 tttagtttcccaaacaga 43254073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 42587351 - 42587554
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587351 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42587450  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42587451 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 42587550  T
Q  218 ttgg 221  Q
    ||||    
T  42587551 ttgg 42587554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 10311997 - 10312214
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10311997 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 10312096  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10312097 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 10312196  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  10312197 tttagtttcccaaacaga 10312214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 45686884 - 45687085
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45686884 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 45686983  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45686984 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 45687083  T
Q  218 tt 219  Q
    ||    
T  45687084 tt 45687085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 40637128 - 40637345
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637128 gaaataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40637227  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40637228 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 40637327  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  40637328 tgaggttaaccaaacaga 40637345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21374820 - 21374624
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374820 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 21374721  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374720 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 21374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 27089624 - 27089810
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089624 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 27089723  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089724 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27089810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27188677 - 27188491
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188677 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 27188578  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188577 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27188491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40259044 - 40258827
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40259044 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40258945  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40258944 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagctttttctgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctctt-tt 40258846  T
Q  218 ttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  40258845 ttgggtgttaccaaacaga 40258827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 21254665 - 21254881
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21254665 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 21254764  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21254765 gaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctt-tt 21254863  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  21254864 ttaagttaaccaaacaga 21254881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 47470930 - 47471146
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47470930 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcgt 47471029  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  47471030 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaacgctctt-tt 47471128  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  47471129 ttgggttaaccaaacaga 47471146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31511487 - 31511301
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511487 gaaataataagggtaaaattggaggaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31511388  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511387 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 31511301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35587766 - 35587580
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587766 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 35587667  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587666 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 35587580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9487594 - 9487380
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487594 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 9487495  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9487494 gaaataagctataagctcatagtaaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcagacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 9487395  T
Q  218 ttgggtttaccaaac 232  Q
    | | ||| |||||||    
T  9487394 tggagttaaccaaac 9487380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43134585 - 43134375
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43134585 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 43134486  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43134485 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggt 43134387  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  43134386 ttaccaaacaga 43134375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 45222041 - 45222227
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45222041 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 45222140  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45222141 gaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagct 45222227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 48832021 - 48832207
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48832021 gaaataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 48832120  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48832121 gaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctaaaagct 48832207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 42375758 - 42375964
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42375758 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42375850  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42375851 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag-tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 42375948  T
Q  218 ttgggtttaccaaaca 233  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42375949 ttgggttaaccaaaca 42375964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33027063 - 33026918
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33027063 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 33026964  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33026963 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 33026918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Original strand, 33203636 - 33203826
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33203636 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 33203735  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33203736 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaaggaacttataaactataaactaaaagctaaaa 33203826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 48313396 - 48313617
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48313396 taatagggttaaagttggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 48313495  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  48313496 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaatcagagc-ttttttgtcaaacgaacttataaactataacctaaaagctaaaagctcttttttggg 48313594  T
Q  222 gtttaccaaacagagccttcatc 244  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  48313595 gttaaccaaacagacccttcatc 48313617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34709420 - 34709234
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34709420 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 34709321  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  34709320 gaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccagacagagcttttttagtcaaacaaacttataagctaaaagctaaaagct 34709234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 482956 - 483171
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482956 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 483055  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  483056 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctt-ttttaagt 483154  T
Q  224 ttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||||||| ||||    
T  483155 ttaccaaacagaccctt 483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36436333 - 36436119
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436333 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagct-------caaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36436241  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36436240 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagc-ttttttgtcaaacgagcttataagatataagctaaaagctaaaagctcttttt 36436142  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  36436141 tggggttaaccaaacagaccctt 36436119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44596791 - 44596584
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44596791 ataagggtaaaaatgaaacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 44596692  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  44596691 agctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtgaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagctctttttttaggt 44596592  T
Q  224 ttaccaaa 231  Q
    ||||||||    
T  44596591 ttaccaaa 44596584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 40105973 - 40106159
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40105973 gaaataataaaggtaaagttggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 40106072  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40106073 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaagagctaaaagct 40106159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44743902 - 44743689
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44743902 aataataaaggtaaaactggaattaaaagtgagaagttataagctataaactcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 44743803  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatttt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  44743802 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagct-ttttttt 44743704  T
Q  220 gggt-ttaccaaaca 233  Q
    |||| ||||||||||    
T  44743703 gggtgttaccaaaca 44743689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36407409 - 36407200
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36407409 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 36407310  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  36407309 agttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaagagttaaaagctctttttttgggt 36407210  T
Q  224 ttaccaaaca 233  Q
    ||||||||||    
T  36407209 ttaccaaaca 36407200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48590901 - 48590756
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48590901 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgt 48590802  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48590801 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 48590756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21742134 - 21741941
Alignment:
Q  43 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742134 aaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagctataagctcatggtga 21742035  T
Q  143 aaaagtgttaccaaacag-agcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||| |||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  21742034 aaaggtgttaccaaacagaatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaatctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 21741941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 21313764 - 21313981
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21313764 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagcttgt 21313856  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc--nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  21313857 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagttctt- 21313955  T
Q  216 ttttgggt-ttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  21313956 ttttgggtattaccaaacagaccctt 21313981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 47587080 - 47587288
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47587080 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 47587172  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  47587173 gaaataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaacagagttttttttatcagacgagtttataagctataagctaaaagctaaaatctctt-tt 47587270  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  47587271 ttgggtttctcaaacaga 47587288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49148518 - 49148326
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49148518 aaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagctcataagctcgtg 49148419  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  49148418 aaataagctataagctcatggtggaaaagtgttactaaacagagctttttttgtcaaaaaagcttataagctattagctaagagctaaaagct 49148326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 27655642 - 27655835
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27655642 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcttg 27655741  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  27655742 aaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagctataagctc 27655835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 17192417 - 17192626
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17192417 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 17192509  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    
T  17192510 gaaataagctataaactcatggtg-aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctt-tt 17192607  T
Q  218 ttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17192608 ttgggtgttaccaaacaga 17192626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23029976 - 23029790
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23029976 aaatattaagggtaaaattggaagaaatattgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaataatagtttataagctcgtg 23029877  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||        |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23029876 aaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaacaaagctaattttcgtcagacgagcttataagctataagctataagct 23029790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 19831965 - 19832137
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19831965 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 19832057  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||    
T  19832058 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagct 19832137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17844730 - 17844544
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844730 aaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 17844631  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  17844630 aaataagctataagctcatggtgaaatagcattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataaactataaactataagcta 17844544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 12345039 - 12345180
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12345039 taataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 12345138  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12345139 taagctataagctcttcgtgaaaaagtgttaccaaacagagc 12345180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 38531153 - 38531294
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38531153 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttg-aataacttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 38531251  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38531252 aataagctattagatcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 38531294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 206
Target Start/End: Original strand, 28425605 - 28425767
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425605 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttatgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 28425704  T
Q  144 aaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaa 206  Q
    |||  ||||||||||| | |       |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28425705 aaaaagttaccaaacaaaacattttttgtcaaacgagtttataagctataagctataagctaa 28425767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32168999 - 32168803
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||              ||||||||||    
T  32168999 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagctt--------------ataagctcgt 32168921  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32168920 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttt 32168821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1342958 - 1342777
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1342958 aataaggataaaaatggaagaaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctgaaat 1342859  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1342858 aagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 1342777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 212
Target Start/End: Original strand, 11466047 - 11466201
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11466047 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtattaccaaa 11466146  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  11466147 cagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataaactataagctc 11466201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 46879496 - 46879687
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46879496 taataagggtaaaattgaaattaaaagtaagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 46879595  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||        |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  46879596 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccagacagagcttttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataagctataagctc 46879687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9485899 - 9485727
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||  ||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9485899 aataataaggg--aaactggaattaaaaatgagaacctataagctataagctcaaatgatacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 9485802  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  9485801 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaagagagttttttttgtcaaacgaacttataagctataa 9485727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38481421 - 38481286
Alignment:
Q  64 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38481421 tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttatagactcgtgaaataagctataaattcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 38481322  T
Q  164 nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38481321 tgtttttgtcaaacgaacttataagctataagctaa 38481286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 196
Target Start/End: Original strand, 21316611 - 21316730
Alignment:
Q  77 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  21316611 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttatgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaacagagtttttttggtcaaa 21316710  T
Q  177 cgagcttataagctataagc 196  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21316711 cgagcttataagctataagc 21316730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 36612082 - 36612220
Alignment:
Q  21 ataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaa 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  36612082 ataataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctaaaaaatagcttataaactcctgaa 36612181  T
Q  121 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||    
T  36612182 ataagctaaaagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 36612220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40893551 - 40893437
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40893551 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 40893452  T
Q  126 ctataagctcatggt 140  Q
    |||||||||| ||||    
T  40893451 ctataagctcgtggt 40893437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48620642 - 48620449
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48620642 aataataagggtaaaactaaaattaaaagtgagaagatataaattatatgctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagtttataagctcgtga 48620543  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||        ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  48620542 aataaactataaactcatgatg-aaaagtgttaccaaacaaagttttttccgtcaaacaagtttataaactataagctaagagctaaaaactctt 48620449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46757857 - 46757717
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  46757857 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 46757758  T
Q  158 cagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||        |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46757757 cagagcttttttttgtcagacgagcttataagctataagct 46757717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 19757494 - 19757680
Alignment:
Q  28 gggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 127  Q
    ||||| || ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19757494 gggtagaaatggaagaaaatattataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttttgaaaaatagcttataagctcctgaattaagct 19757593  T
Q  128 ataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||| | || |||||| |||| |||||| ||        |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  19757594 ataagctcgttgtaaaaaagcgttatcaaacatagttttttttgtcagacgagcttataagctattagctataagttataagctctt 19757680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 22642259 - 22642362
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  22642259 ataagctataagctcaaatgctacttagaatagcgtttaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaaccgttaccaaa 22642358  T
Q  158 caga 161  Q
    ||||    
T  22642359 caga 22642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 791336 - 791487
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | || |||||  ||||    
T  791336 aagctataagctataagttcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagttcgttgtaaaaaatcgtta 791435  T
Q  153 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
     ||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  791436 tcaaacagagctttttttatcaaacgagcttataaactataaactataagct 791487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35000859 - 35000773
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  35000859 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagtttataaacttgtgaaataagctataagctcctgatgaaa 35000773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24170959 - 24170860
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24170959 taataagggtagtattggaagaaaaagtgataagctataagttataagctcaagcactacttggaataatgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaa 24170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Original strand, 27869570 - 27869709
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |   |||| |||    
T  27869570 ataagctataaactcaaacgctacttggaataacgtccgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagcgggtggtgaaagaccattactaaa 27869669  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||  |       |||||||||||||||||||||||||||    
T  27869670 caggactttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 27869709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Original strand, 21740126 - 21740258
Alignment:
Q  30 gtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctat 129  Q
    |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21740126 gtaaaactggaattaaaagtgagacactataagctataag-tcaaacgctatttcaagtagtttctgaaaaatagcttataaacttctgaaataagctat 21740224  T
Q  130 aagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||  | || |||||| |||||||||||||||    
T  21740225 aagcttgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagc 21740258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 7884660 - 7884790
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||     ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||    ||||||     
T  7884660 aaataataagggtaaaagtggaagaaaaa-----aa---ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttcacaaaaataactt----gctcgta 7884747  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7884748 aaatacgctataagttcatggtgaaaaagtattaacaaacaga 7884790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39699017 - 39698930
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39699017 aataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagct-------caaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttgtaagct 39698930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24170856 - 24170803
Alignment:
Q  93 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24170856 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaaa 24170803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45672441 - 45672341
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || | || ||||| |||||| |||    
T  45672441 ataaactataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagttcgtaaaataaattataagttcgttgtaaaaaattgttacgaaa 45672342  T
Q  158 c 158  Q
    |    
T  45672341 c 45672341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 47403089 - 47403167
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  47403089 aataaggttaaaattggaagaaaaaatgaaatgctataaactataagctcaaaagccacttgaaatagcttctcaaaaa 47403167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 981532 - 981425
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||| | | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  981532 aaataataaggttattattggaagaaaatgtaaaaagctgtcaactataagataaaaggctacttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctcgtg 981434  T
Q  119 aaataagct 127  Q
    ||| |||||    
T  981433 aaaaaagct 981425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Original strand, 35669599 - 35669682
Alignment:
Q  31 taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  35669599 taaaattggaagaaattataagaagctataagctataagttcaaaagatacttgaaatagcttctcaaaaaaag-ttataagctc 35669682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47584237 - 47584185
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47584237 aagctataaactcaaacgctatttggaataacttctgaaaaatagtttataag 47584185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44072829 - 44072730
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||| || |||  || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44072829 aaataataagagtaaaaatgtaataaaaaatgataaactataaactataaactcaaacgctatttagaacggcgtctgaaaaataacttataaactcgtg 44072730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 131
Target Start/End: Original strand, 22621461 - 22621539
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22621461 aagctataagttataagctcaaacgctgcttgaaataatgtctgaaaaataagttatgagctcctgaaataaactataa 22621539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 33609098 - 33609163
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttg 84  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33609098 aaataataagggtaaaaatgggacaaaagatgataagctataagctataagcttaaatgctacttg 33609163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34709255 - 34709210
Alignment:
Q  190 tataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  34709255 tataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 34709210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21744585 - 21744553
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21744585 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtg 21744553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Original strand, 47869303 - 47869383
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagct 106  Q
    |||| |||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  47869303 aaggttaaaattggaagaaattataagaagctataagttataagcttaaaagctatttgaaatagcctctcaaaaatagct 47869383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3370637 - 3370570
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3370637 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagctt 3370570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33979808 - 33979729
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | | ||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  33979808 taatagggttaaaattggaagaaaatataaaaaagtatcagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 33979729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 44818909 - 44818842
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  44818909 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctataagctataagctcaaaagttacttgaattagctt 44818842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Original strand, 46349795 - 46349862
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46349795 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagctt 46349862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39230027 - 39229953
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  39230027 agctataagctcaaacactatttaaaatagtatctgaaaaataagttataagttcgtgaaataggttataagctc 39229953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41406341 - 41406276
Alignment:
Q  61 agctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||    
T  41406341 agctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa-actttataagctagtgaaaaaagct 41406276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 33982222 - 33982326
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | | || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||  || |||||||| ||||||    
T  33982222 taatagggttaaaattggaagaaaatataaaaaactaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttatcaaaaaacgc-tataagctagtgaaa 33982320  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  33982321 aaagct 33982326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 46334814 - 46334761
Alignment:
Q  48 gtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| |||||    
T  46334814 gtgagaagctataagctataaactcgaatgctacttgaaatagcatctcaaaaa 46334761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 46535564 - 46535503
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactt 83  Q
    |||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  46535564 taataaggttaaaattggaagaaattataagaagctataaactataagttcaaaagctactt 46535503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28235468 - 28235404
Alignment:
Q  31 taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttct 95  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28235468 taaaaatggaagaaaatataaaaagttacaagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttct 28235404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 31030702 - 31030750
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  31030702 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 31030750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 35670292 - 35670340
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  35670292 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 35670340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 37658053 - 37658101
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  37658053 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 37658101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 39869959 - 39870007
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  39869959 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 39870007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40061324 - 40061276
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40061324 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 40061276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Original strand, 43156449 - 43156513
Alignment:
Q  31 taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttct 95  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43156449 taaaattggaagaaaatataaaaagctatgagctccaagctcaaaagctacttgaaatagcttct 43156513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1918215 - 1917995
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1918215 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 1918116  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  1918115 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctact-tt 1918017  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1918016 ttgggttaaccaaacagagcct 1917995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 36838640 - 36838857
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36838640 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36838739  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36838740 gaaataagctataagctcatggagaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 36838839  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  36838840 ttgggtttcccaaacaga 36838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 19898853 - 19899073
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898853 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 19898952  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19898953 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 19899052  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  19899053 tggggttaaccaaacagagcc 19899073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 29704033 - 29704249
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29704033 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 29704132  T
Q  122 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgg 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29704133 taagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaaattaaaagctcttattttgg 29704232  T
Q  222 gtttaccaaacagagcc 238  Q
    |||||||||||||||||    
T  29704233 gtttaccaaacagagcc 29704249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 36301050 - 36301269
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301050 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 36301149  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36301150 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 36301247  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  36301248 ttgggttaaccaaacagagcct 36301269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 30721568 - 30721786
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30721568 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30721667  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30721668 gaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttt 30721767  T
Q  217 tttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30721768 tttgggtttcccaaacaga 30721786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 31150370 - 31150591
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150370 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 31150469  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  31150470 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacccaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct-ttttt 31150568  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  31150569 ttgggtttcccaaacagaccctt 31150591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 42064262 - 42064483
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064262 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 42064361  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42064362 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 42064460  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  42064461 tttagtttcccaaacagaccctt 42064483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26204464 - 26204249
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204464 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 26204365  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26204364 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 26204266  T
Q  218 ttgggtttaccaaacag 234  Q
    ||||||| |||||||||    
T  26204265 ttgggttaaccaaacag 26204249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29586348 - 29586127
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586348 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 29586249  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29586248 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 29586150  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  29586149 tttagtttcccaaacagaccctt 29586127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33524718 - 33524501
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33524718 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 33524619  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33524618 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 33524519  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  33524518 tggggttaaccaaacaga 33524501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44910030 - 44909814
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44910030 gaaataataagggtaagattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 44909931  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44909930 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctt-tt 44909832  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  44909831 tggggttaaccaaacaga 44909814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 32368284 - 32368506
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32368284 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcatataagctcgt 32368383  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32368384 gaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttt 32368483  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  32368484 tagggttaaccaaacagaccctt 32368506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2498112 - 2497895
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2498112 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 2498013  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2498012 gaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctattt 2497913  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| || |||||||    
T  2497912 tagggttaactaaacaga 2497895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 17499830 - 17500031
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499830 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 17499929  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17499930 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttt 17500029  T
Q  218 tt 219  Q
    ||    
T  17500030 tt 17500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26843941 - 26843719
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26843941 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 26843842  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26843841 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctattttt 26843742  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||    
T  26843741 ttggattttccaaacagaccctt 26843719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15313433 - 15313217
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15313433 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 15313334  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  15313333 gaaataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagttcttttt 15313235  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||| |||||||||    
T  15313234 ttgggtttcccaaacaga 15313217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30774271 - 30774059
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30774271 gaaataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 30774172  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  30774171 gaaataagctataaacttatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttta----tcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagctctt-tt 30774077  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30774076 ttgggttaaccaaacaga 30774059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 13121536 - 13121750
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121536 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtga-------taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 13121628  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13121629 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 13121727  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| |||||||||| ||||    
T  13121728 tggggttaaccaaacagaccctt 13121750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 1507688 - 1507906
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507688 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 1507787  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttat 216  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  1507788 gaaataagctataaactaatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttctttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactctt-t 1507886  T
Q  217 tttgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  1507887 tttgggtgttaccaaacaga 1507906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17046912 - 17046702
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046912 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 17046820  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17046819 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 17046720  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  17046719 tggggttaaccaaacaga 17046702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50351222 - 50351036
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351222 gaaataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 50351123  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351122 gaaataagctataagctcatggttaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 50351036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3661135 - 3660920
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3661135 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgt 3661036  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  3661035 gaaataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttgttgtcaaatgagcttataagctataagctaagaactaaaagctctt-tt 3660937  T
Q  218 ttgggt-ttaccaaaca 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  3660936 ttgggtgttaccaaaca 3660920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 7710906 - 7711121
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7710906 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 7710998  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7710999 gaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 7711098  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  7711099 ttgggtttcccaaacagaccctt 7711121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38676678 - 38676460
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38676678 gaaataataagg-taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgt 38676580  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  38676579 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagttaaaagctaaaagct-ttttt 38676481  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcc 238  Q
    | |||||| |||| |||||||    
T  38676480 tggggtttcccaatcagagcc 38676460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 323055 - 322869
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  323055 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgt 322956  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  322955 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagct 322869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39826783 - 39826568
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39826783 gaaataataagggtaaaattggaagaaaatgtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 39826691  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  39826690 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttta 39826591  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    | ||||| ||||| |||| ||||    
T  39826590 tggggttaaccaatcagaccctt 39826568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3270848 - 3270663
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270848 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 3270749  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270748 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga-ttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 3270663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Original strand, 47134483 - 47134702
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47134483 gaaataataagggtaaaattagaagaaaaagtga-------taagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcat 47134575  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47134576 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaagctaaaagctctt-tt 47134674  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagccttcatct 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  47134675 ttgggttaaccaaacagaccctttatct 47134702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34319573 - 34319362
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34319573 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 34319474  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34319473 agctataaggtcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggt 34319374  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  34319373 ttaccaaacaga 34319362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 49220418 - 49220605
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagt-gagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220418 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtagagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 49220517  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220518 gaaataagctgtaagctcacggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 49220605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46369993 - 46369809
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  46369993 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagctt---agctcgtg 46369897  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag--cnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46369896 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 46369809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 33561854 - 33562062
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||    
T  33561854 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaata--------------gcttataagctcgt 33561939  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33561940 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 33562039  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||    
T  33562040 tttagtttcccaaacagaccctt 33562062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 38967416 - 38967594
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967416 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 38967508  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967509 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 38967594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 50171242 - 50171435
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50171242 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 50171341  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  50171342 gaaataagctataagctcatggtaaaaaggtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacaagcttataagctataaattaaaagcgaaaagct 50171435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22099108 - 22098965
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22099108 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataaactcgt 22099009  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22099008 gaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacaga 22098965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15349012 - 15348818
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15349012 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataatttataagctcgtga 15348913  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15348912 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagttttttttatcaaacgagcttataagctataagcaaagagctaaaagctctt 15348818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25602169 - 25601971
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25602169 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 25602077  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25602076 gaaataagctataaggtcatggtaaaaaagtgataccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataacctataagctaagagctaaaagctctt-tt 25601978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 36043247 - 36043463
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36043247 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtga 36043346  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacag-agcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |         ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  36043347 aataaactataagctcatggtgaaaaactgttaccaaacagaatttttttttgtcaaacgaacttatatgctataagctaagagctataagctctt-ttt 36043445  T
Q  219 tgggt-ttaccaaacaga 235  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  36043446 tgggtgttaccaaacaga 36043463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39583278 - 39583100
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39583278 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaggtataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgttaaataag 39583179  T
Q  126 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39583178 ttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaaaagct 39583100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 37672297 - 37672439
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37672297 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtga 37672396  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37672397 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 37672439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37703858 - 37703716
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703858 aataataagggtaaaactgtaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 37703759  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703758 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 37703716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43727212 - 43727074
Alignment:
Q  17 agaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  43727212 agaaataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctca 43727113  T
Q  117 tgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43727112 tgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacca 43727074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29374519 - 29374326
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29374519 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaactctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcttg 29374420  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  29374419 aaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctaaaagctataagctataagctc 29374326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40888065 - 40887928
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40888065 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 40887966  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
     |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  40887965 aaaataagctataagc------tgaaaaagtgttaccaaacaga 40887928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2479330 - 2479134
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||    
T  2479330 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt--------------ataagctcgtgaaata 2479245  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2479244 agctataaactcatgataaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tttttggt 2479146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Original strand, 49185132 - 49185273
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49185132 aataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagcttgtga 49185231  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49185232 aataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 49185273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 51422931 - 51423126
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  51422931 aataataagggtaaaattggaattaaaagtgggaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagtttataaactcgtga 51423030  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |         |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51423031 aataagctataagttcatggtgaaaaagtgttatcaaacagaacttttttttatcaaacaaacttataagctataagctaaaagttaaaagctctt 51423126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 8221180 - 8221402
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8221180 gaaatattaagggtaaaaatggaagaaaaagtgagaagctataagctataaattcaaacgctatttggaatagtttttgaaaaatagcttataagctcgt 8221279  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    |     
T  8221280 gaaataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataagctatccgctataagctataagctagcttc 8221379  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  8221380 ttggctttaccaaacagagcctt 8221402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 7781110 - 7781295
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781110 aaatgataagggtaaaaatgaaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 7781209  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7781210 aaataagctataagctcgtggtgaaaagacagtaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctataagct 7781295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34087116 - 34086970
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34087116 ataagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaattagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 34087017  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34087016 cagagctttttttgtcagacgagcttataagctataagctataagct 34086970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3391309 - 3391165
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3391309 aaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagctataagctataagcttaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtg 3391210  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3391209 aaataaactataagttcatggtgaaaaagtattaccaaacagagc 3391165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 42614082 - 42614222
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||| ||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42614082 aataataaaggtaaaactgaaattaaaagtgagatgctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 42614181  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacag 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42614182 aataagctagaagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacag 42614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5697665 - 5697523
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5697665 aaataataaaggtaaatttggaagaaaaa-tgataagttataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtg 5697567  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  5697566 aaataagctataagctcattgtaaaaaactgttaccaaatagag 5697523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34318595 - 34318415
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  34318595 aaatagtaagggcaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgta 34318496  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaa 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34318495 aaataagctataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaacagagctttttttgtcgaacaagcttataagctataagctaa 34318415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 18347368 - 18347554
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  18347368 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacactacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagcttgt 18347460  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||       ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18347461 gaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagc-ttttttgtcaaacaaacttataagctataagctataagctataagctc 18347554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 49822113 - 49822242
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49822113 aaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagtttataagctcgtg 49822212  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49822213 aaataagctataagctcatggtgaaaaagt 49822242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 9769919 - 9770058
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||   | |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9769919 aaatagtatgggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctagaagttataagctcaaacgttatttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtg 9770018  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9770019 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaac 9770058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 46928931 - 46929057
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46928931 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagcacaaacgctaattagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 46929030  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||    
T  46929031 aataagctataagttcttagtgaaaaa 46929057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50540920 - 50540769
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  50540920 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagtttatggtgaaaaagtattaccaaaca 50540821  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    || |        ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50540820 gaactttttttatcaaacgagtttataagctataagctataagttataagct 50540769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 52703057 - 52703236
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52703057 aaataataagggtaaaaatgaaataaaagataaaaagctaaaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtg 52703156  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||  ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703157 aaataagctataagctcgtggtaagagagcattaccaaacagaattttttttgtcaaacgagcttataagctataagcta 52703236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 41004939 - 41005057
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  41004939 aaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaataacttataagctcatg 41005038  T
Q  119 aaataagctataagctcat 137  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  41005039 aaataagctataaactcat 41005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33152083 - 33151975
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33152083 aaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttacaagctcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaatagcttataagctcgtg 33151984  T
Q  119 aaataagct 127  Q
    |||||||||    
T  33151983 aaataagct 33151975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Original strand, 49240268 - 49240405
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  49240268 aagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagttcatagtgaaaaagcattaccaaaca 49240367  T
Q  160 gagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||       |||| |||| |||||||||||||||||    
T  49240368 gagctttttttgtcatacgaacttataagctataagct 49240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 16085557 - 16085684
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16085557 aaataataagggtaaaattggaataaaaaataataagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgta 16085656  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  16085657 aaatagactataagatcgtggtgaaaaa 16085684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 211
Target Start/End: Original strand, 46087950 - 46088138
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46087950 aataagagtaaaattggaagaaaaaatgataagctataagctacaagctcaaatattacttggaataacgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaat 46088049  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagct 211  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||   ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||    
T  46088050 aagttataagctcgtggcgaaaaaacattatcaaacagagcttttctagtcaaacgagcttataaactatctgctataagctataagct 46088138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 44718923 - 44719096
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44718923 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctt-------aaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgt 44719015  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||       | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44719016 aaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagctttttttgccaaacaagcttataagctataagcta 44719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28429204 - 28429076
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||       |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429204 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctatacgct-------caaacgctacttg------cttctgaaaaatagcttataagctcgtga 28429118  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429117 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 28429076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 152
Target Start/End: Original strand, 36379093 - 36379225
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||    
T  36379093 aataataagggtaaaactaaaattaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaataacttataaactcatga 36379192  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 152  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  36379193 aataaactataaactcatcgtaaaaaagtgtta 36379225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25134998 - 25134858
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  25134998 ataagctataagctcaaacactacttaaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttaccaaa 25134899  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagcta 198  Q
    |||| |       |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25134898 cagaactttttttgtcagacgagcttataagctattagcta 25134858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 30495149 - 30495282
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  30495149 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagc-------tataagctgaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaactctaga 30495241  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacag 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30495242 aataagctataagctcatggtcaaaaagtattaccaaacag 30495282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 13570739 - 13570855
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13570739 aaatagtaaaggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagttcgtg 13570838  T
Q  119 aaataagctataagctc 135  Q
    |||||||||||||||||    
T  13570839 aaataagctataagctc 13570855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9895026 - 9894931
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9895026 aaataataagggtaaaattgaaagaaaaaatgacaagctataaactataagctcaaacgctactttgaatagcgtctgaaaaatagcttataagct 9894931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6814213 - 6814118
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6814213 taataagggtaaaattggaattaaaagtgaaaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgt 6814118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9169236 - 9169142
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9169236 aataataagggtaaaattggaagaaaaagggagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttggtga 9169144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42964010 - 42963877
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||        | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  42964010 aaataataagggtaaaagtggaagaaaaaa-------caataagctgtaagctcaaacgctacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataaactcgta 42963918  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 159  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  42963917 aaataaattataagctcatagtgaaaaagtattatcaaaca 42963877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44956428 - 44956274
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  44956428 ataagttataagctcaaactctacttggaatagcatctgaaaaataacttataatctcgttaaataagctataagctcatggtaaaaaaccattaccaaa 44956329  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctc 212  Q
    | || |       ||||||||||| |||||| |||  |||| |||||| ||||||    
T  44956328 cggaactttttttgtcaaacgagcatataagttattcgctataagctataagctc 44956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7025004 - 7024916
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7025004 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 7024916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Original strand, 46056411 - 46056499
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaa 146  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  46056411 ataagctataagcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataaactataagttcgtggtgaaaaa 46056499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9169149 - 9169051
Alignment:
Q  137 tggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  9169149 tggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttttcaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 9169051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40719622 - 40719554
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagcta 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40719622 aagctataaactcaaacgctacttgaaataacttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagcta 40719554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33632416 - 33632331
Alignment:
Q  30 gtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||| |||||||||   | ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33632416 gtaaaaatggaagaaattttaagaagctatcagcaataagctcaaacgctgtttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 33632331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Original strand, 28868987 - 28869099
Alignment:
Q  49 tgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagt 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||      
T  28868987 tgagaaactataagctataagctcaaacgttacttgaaataatttcttaaaaataatttataagctcgtgaaataaactataaactcgttgtaaaaaacc 28869086  T
Q  149 gttaccaaacaga 161  Q
     ||||||||||||    
T  28869087 tttaccaaacaga 28869099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12891710 - 12891644
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaat 88  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12891710 taataagcgtaaaaatggaaataaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaat 12891644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 111
Target Start/End: Original strand, 40935893 - 40935945
Alignment:
Q  59 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40935893 taagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagtttataa 40935945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 119
Target Start/End: Original strand, 2459557 - 2459649
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  2459557 aagggtataaatggaagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaaag-atataagctcgtga 2459649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 22099688 - 22099750
Alignment:
Q  172 tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  22099688 tcaaacgagcttataagctataagctaaaa-ctaaaagctcttttttttagtttcccaaacaga 22099750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Original strand, 10628814 - 10628891
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  10628814 ataagttataagctcaaacgctacttgaaataatgtctgaaaaataagttataagctagtaaaataaactataagctc 10628891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19715429 - 19715372
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaac 76  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19715429 aaataataagggtgaaattggaagtaaaaatgataagctataagttataagctcaaac 19715372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 912830 - 912726
Alignment:
Q  31 taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 130  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||  |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  912830 taaaaatgaaagaaaaaatgataagctataagttataagctcaaatgttatttgaaatagtgtctagaaaataggatataagctcctgaaataagttata 912731  T
Q  131 agctc 135  Q
    |||||    
T  912730 agctc 912726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 2028961 - 2029037
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  2028961 ataagttataatcttaaacggtacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgttaaataaactataagct 2029037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7024880 - 7024816
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  7024880 gtcaaacgaacttataagctatatgctaagagctaaaagctcttttttaggtgttaccaaacaga 7024816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2937525 - 2937458
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2937525 aaggttaaaattggaagaaattataagaagttataagctataagctcaaaagctacttgaaatagctt 2937458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38058923 - 38058845
Alignment:
Q  40 aagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  38058923 aagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaaagctatttgaaatagcttctcaaaaaaagc-tataagctcgtga 38058845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Original strand, 50940115 - 50940184
Alignment:
Q  32 aaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  50940115 aaaattggaagaaaacataaaaagctataagttataagctcaaaagctacttgaaatagtttctcaaaaa 50940184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31496802 - 31496731
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  | | |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  31496802 taataaggttaaaattggatgaaaatataaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttgaattagctt 31496731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40719535 - 40719492
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  40719535 gtcaaacgagcttataaactataaactcaaagctaaaagctctt 40719492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41865475 - 41865408
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 93  Q
    |||| ||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41865475 aaggttaaaattggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctcaaaagctacttgaaatagctt 41865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11333019 - 11332942
Alignment:
Q  37 tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||| || | |||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11333019 tggaagaaaatgtaaaaagcaattagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttcttaaaaaaagc-tataagctc 11332942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11491040 - 11490963
Alignment:
Q  37 tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 115  Q
    |||||||||| || | |||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11491040 tggaagaaaatgtaaaaagcaattagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttcttaaaaaaagc-tataagctc 11490963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 132
Target Start/End: Original strand, 27659350 - 27659424
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataag 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||   ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  27659350 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcgtttggaaaataaactataaactcctgaaataagttataag 27659424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31434495 - 31434449
Alignment:
Q  65 ataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 111  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31434495 ataagcttaaatcctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataa 31434449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30358266 - 30358162
Alignment:
Q  22 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 121  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | | ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||| |  |||||||||| |||||    
T  30358266 taataaggttaaagttggaagaaaatataaaaagctaccagctataagctaaaaagctacttgaaatagcttttcaaaaa-atgttataagctcatgaaa 30358168  T
Q  122 taagct 127  Q
     |||||    
T  30358167 aaagct 30358162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 52071222 - 52071292
Alignment:
Q  127 tataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52071222 tataagctcgtggtgaaaaaccattaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagct 52071292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9224001 - 9223953
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  9224001 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 9223953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27667836 - 27667788
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  27667836 aagctaaaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 27667788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 30899360 - 30899408
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  30899360 aagctataagctataagctaaaaagctacttgaattagcttcttaaaaa 30899408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Original strand, 39325455 - 39325503
Alignment:
Q  53 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  39325455 aagctacaagctataagctaaaaagctacttggattagcttcttaaaaa 39325503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 12677 - 12899
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12677 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 12776  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12777 caaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 12876  T
Q  218 ttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  12877 ttgggtttcccaaacagaccctt 12899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 126720 - 126936
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126720 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaagcgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 126819  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  126820 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tc 126918  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  126919 ttgggttaaccaaacaga 126936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 3 - 214
Alignment:
Q  24 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3 ataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 102  T
Q  124 agctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  103 agctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagt 202  T
Q  224 ttaccaaacaga 235  Q
    ||||||||||||    
T  203 ttaccaaacaga 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Original strand, 28036 - 28267
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28036 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 28135  T
Q  118 gaa---------ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaa 208  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28136 gaaaaatagcttataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaa 28235  T
Q  209 gctcttattttgggt-ttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  28236 gctctt-ttttgagtgttaccaaacagaccctt 28267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 30144 - 30323
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30144 gaaataataagggtaaaattgaaagaaaatgtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgt 30236  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30237 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaactataaactaaaagct 30323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7243 - 7027
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7243 gaaataataaggataaaattggaagaaatagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgt 7144  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7143 gaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttaaaagctataagctaaaaactaaaagctctt-tt 7045  T
Q  218 ttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  7044 tgaggttaaccaaacaga 7027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 431444 - 431265
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431444 gaaataataaaggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 431345  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  431344 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctaaaagct 431265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 119238 - 119340
Alignment:
Q  57 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||    
T  119238 tataagctataagctcaaactctacttggaataggatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttactaa 119337  T
Q  157 aca 159  Q
    |||    
T  119338 aca 119340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 93346 - 93525
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  93346 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgt 93445  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||    
T  93446 gaaataagctataagctcatggttttaaagtgttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagct 93525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 84402 - 84325
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctc 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84402 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctc 84325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 64028 - 63851
Alignment:
Q  20 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 119  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64028 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 63929  T
Q  120 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||  |||||||||||    
T  63928 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagatctttttttgtcaaacgagcttaagagctataagct 63851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 192198 - 192013
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 118  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  192198 aaataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtg 192099  T
Q  119 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  192098 aaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagagctttttttgtcatacgagcttataagctataagctataagct 192013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 127
Target Start/End: Original strand, 94351 - 94415
Alignment:
Q  62 gctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagct 127  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||| |||||    
T  94351 gctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaatgc-tataagctagtgaaaaaagct 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 52988 - 53126
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 53080  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53081 gaaataggctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 41725 - 41921
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  41725 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata------- 41817  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttatt 217  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41818 -------------agctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctt-tt 41903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Original strand, 27158 - 27312
Alignment:
Q  82 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgag 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  27158 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagctttattttgtcaaacgag 27257  T
Q  181 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacaga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  27258 cttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 27312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5587 - 5451
Alignment:
Q  18 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5587 gaaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgt 5495  T
Q  118 gaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 162  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5494 gaaataag-tataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagag 5451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Original strand, 72733 - 72847
Alignment:
Q  26 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 125  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72733 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 72832  T
Q  126 ctataagctcatggt 140  Q
    |||||||||| ||||    
T  72833 ctataagctcgtggt 72847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4562
Alignment:
Q  60 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4636 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagct 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9376 - 9230
Alignment:
Q  58 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |   ||| ||||    
T  9376 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctatgagctcgtggtaagagaccattaacaaa 9277  T
Q  158 cagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 204  Q
    |||||        |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9276 cagagttttttttgtcaaacgagcttataaggtataagctataagct 9230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10930 - 10833
Alignment:
Q  37 tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagct 134  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10930 tggaagaaatattgataagctataaaccgtaagctcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagct 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36388 - 36319
Alignment:
Q  171 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggtttaccaaacagagcctt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  36388 gtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacagagcctt 36319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1301
Alignment:
Q  19 aaataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||    
T  1206 aaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataacgtttgaaaaatggctcataagct 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 8928 - 9143
Alignment:
Q  23 aataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaat 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  | | ||| |||| | |||||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8928 aataaaggtaaaattggaagtaaagataataagttatacgatataagcttaaatgctacttgaaa-agtgtctgaaaaatagcttataaacttgtgaaat 9026  T
Q  123 aagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttggg 222  Q
    || |||||||||| |||||||||    ||||||||||||||        |||||  ||||||||||||||  |||| |||||| |||||    ||||||     
T  9027 aaactataagctcgtggtgaaaacccattaccaaacagagcttttttgatcaaataagcttataagctatccgctataagctataagctaactttttggt 9126  T
Q  223 tttaccaaacagagcct 239  Q
     ||||||||||||||||    
T  9127 cttaccaaacagagcct 9143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 10053 - 10085
Alignment:
Q  44 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaac 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10053 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaac 10085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University