View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2027_low_4 (Length: 435)

Name: NF2027_low_4
Description: NF2027
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2027_low_4
NF2027_low_4
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (26-429)||(19063235-19063637)
chr7 (258-429)||(1274307-1274478)
chr7 (26-228)||(1274508-1274711)
chr7 (26-159)||(22909108-22909241)
chr7 (26-149)||(2477658-2477782)
chr7 (26-149)||(3544918-3545042)
chr7 (26-149)||(12183866-12183990)
chr7 (26-149)||(24482744-24482868)
chr7 (26-149)||(12090498-12090622)
chr7 (26-149)||(45500748-45500872)
chr7 (27-149)||(12190843-12190966)
chr7 (26-149)||(8107926-8108050)
chr7 (26-149)||(10346343-10346467)
chr7 (26-149)||(1953957-1954081)
chr7 (26-149)||(2631396-2631520)
chr7 (26-149)||(2797601-2797725)
chr7 (26-149)||(22321838-22321962)
chr7 (26-149)||(31158314-31158438)
chr7 (26-149)||(19472301-19472425)
chr7 (26-149)||(22818412-22818536)
chr7 (26-149)||(23795094-23795218)
chr7 (30-149)||(31664536-31664656)
chr7 (26-167)||(29032822-29032965)
chr7 (26-149)||(31878601-31878724)
chr7 (66-149)||(6172527-6172611)
chr7 (90-149)||(33160182-33160242)
chr7 (26-74)||(19472227-19472275)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (40-188)||(34913410-34913558)
chr6 (26-219)||(14270610-14270795)
chr6 (26-149)||(5989041-5989164)
chr6 (26-149)||(34006502-34006626)
chr6 (26-159)||(25976940-25977072)
chr6 (26-149)||(24878865-24878989)
chr6 (27-149)||(32806801-32806924)
chr6 (26-149)||(3539047-3539171)
chr6 (26-149)||(14479560-14479684)
chr6 (26-149)||(24161293-24161417)
chr6 (26-149)||(26515466-26515590)
chr6 (26-149)||(21596565-21596693)
chr6 (26-149)||(21631180-21631306)
chr6 (27-150)||(1454795-1454918)
chr6 (27-150)||(1466487-1466610)
chr6 (26-139)||(32821812-32821925)
chr6 (26-149)||(9932843-9932967)
chr6 (31-150)||(13173859-13173978)
chr6 (31-150)||(13182392-13182511)
chr6 (26-149)||(26604339-26604463)
chr6 (68-149)||(26510392-26510474)
chr6 (296-392)||(6856341-6856437)
chr6 (293-417)||(13106938-13107064)
chr6 (26-109)||(15642457-15642540)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (26-156)||(8996300-8996430)
chr1 (26-149)||(11738835-11738959)
chr1 (26-149)||(13218083-13218207)
chr1 (26-149)||(16129659-16129783)
chr1 (26-149)||(41000141-41000265)
chr1 (26-149)||(9667733-9667857)
chr1 (26-149)||(33492236-33492360)
chr1 (26-149)||(38121970-38122094)
chr1 (26-149)||(39001219-39001343)
chr1 (26-149)||(44505308-44505432)
chr1 (26-149)||(12168254-12168378)
chr1 (26-163)||(15161087-15161226)
chr1 (26-149)||(49249072-49249196)
chr1 (26-149)||(432378-432502)
chr1 (26-149)||(16832820-16832944)
chr1 (26-109)||(16130254-16130337)
chr1 (26-149)||(13830288-13830411)
chr1 (90-162)||(36080205-36080279)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (26-159)||(13509954-13510087)
chr8 (26-159)||(13599484-13599617)
chr8 (26-166)||(22243282-22243423)
chr8 (26-150)||(22233889-22234013)
chr8 (26-149)||(16958550-16958674)
chr8 (26-150)||(22222703-22222829)
chr8 (26-150)||(22229045-22229171)
chr8 (26-165)||(17992876-17993018)
chr8 (26-149)||(8743321-8743445)
chr8 (26-149)||(9068205-9068329)
chr8 (22-149)||(12538157-12538285)
chr8 (26-149)||(16580085-16580209)
chr8 (26-149)||(22180601-22180725)
chr8 (26-149)||(28370093-28370217)
chr8 (26-149)||(28926181-28926305)
chr8 (26-149)||(41577369-41577493)
chr8 (26-165)||(4861988-4862130)
chr8 (26-150)||(1607284-1607409)
chr8 (26-149)||(3298802-3298926)
chr8 (26-149)||(11309025-11309149)
chr8 (26-149)||(27348026-27348150)
chr8 (26-123)||(24040743-24040840)
chr8 (66-149)||(34006838-34006922)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (30-159)||(12244-12373)
scaffold0298 (30-159)||(16014-16143)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (30-159)||(12185-12314)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (22-149)||(36557556-36557684)
chr2 (26-149)||(28457915-28458039)
chr2 (26-149)||(36040300-36040424)
chr2 (26-149)||(36667907-36668031)
chr2 (26-149)||(42702244-42702368)
chr2 (27-149)||(23925070-23925193)
chr2 (26-149)||(29223715-29223839)
chr2 (26-149)||(29337014-29337138)
chr2 (26-149)||(32522929-32523053)
chr2 (26-149)||(5784562-5784686)
chr2 (26-149)||(13230379-13230503)
chr2 (26-145)||(14700645-14700765)
chr2 (26-149)||(27257385-27257509)
chr2 (26-109)||(21160006-21160089)
chr2 (26-147)||(43991533-43991649)
chr2 (27-109)||(9787145-9787227)
chr2 (26-149)||(24663169-24663293)
chr2 (90-162)||(492724-492798)
chr2 (84-149)||(8687769-8687835)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (26-149)||(33247988-33248112)
chr3 (26-149)||(3588400-3588524)
chr3 (26-149)||(20837094-20837218)
chr3 (26-149)||(27030721-27030845)
chr3 (26-149)||(36469473-36469596)
chr3 (30-149)||(45527647-45527767)
chr3 (26-149)||(7653260-7653384)
chr3 (26-149)||(8615503-8615627)
chr3 (26-149)||(9989396-9989520)
chr3 (26-149)||(10386108-10386232)
chr3 (26-149)||(22097667-22097791)
chr3 (26-149)||(27850588-27850711)
chr3 (26-167)||(2357141-2357284)
chr3 (26-149)||(37471724-37471848)
chr3 (26-165)||(23193905-23194046)
chr3 (26-166)||(1232529-1232676)
chr3 (30-149)||(23385396-23385516)
chr3 (26-149)||(48168231-48168355)
chr3 (26-149)||(52308123-52308247)
chr3 (293-347)||(30046052-30046106)
chr3 (26-123)||(4743038-4743135)
chr3 (46-149)||(20963711-20963815)
chr3 (66-145)||(26335121-26335201)
chr3 (26-149)||(49434097-49434220)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (26-167)||(8-154)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (26-149)||(26069725-26069849)
chr4 (26-149)||(30218429-30218553)
chr4 (26-149)||(40995587-40995711)
chr4 (26-129)||(53895400-53895503)
chr4 (26-147)||(46692074-46692196)
chr4 (26-149)||(4839174-4839298)
chr4 (26-166)||(33110741-33110884)
chr4 (26-149)||(19247865-19247989)
chr4 (26-149)||(20948745-20948869)
chr4 (26-149)||(21677705-21677829)
chr4 (26-149)||(42532925-42533049)
chr4 (26-149)||(323438-323562)
chr4 (26-149)||(1187965-1188089)
chr4 (26-149)||(22047681-22047805)
chr4 (30-149)||(26373671-26373791)
chr4 (26-149)||(44432091-44432215)
chr4 (26-149)||(55326774-55326900)
chr4 (26-149)||(5273600-5273713)
chr4 (66-149)||(52618514-52618598)
chr4 (26-149)||(6639977-6640101)
chr4 (65-149)||(35416760-35416845)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (26-158)||(14176-14308)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (26-149)||(116605-116729)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (26-149)||(27167135-27167259)
chr5 (68-156)||(32226826-32226914)
chr5 (26-149)||(34869784-34869908)
chr5 (26-149)||(7314965-7315089)
chr5 (26-149)||(9404424-9404548)
chr5 (26-149)||(11723314-11723438)
chr5 (26-149)||(11766755-11766879)
chr5 (26-149)||(31845980-31846104)
chr5 (26-149)||(33434603-33434727)
chr5 (26-149)||(34456297-34456421)
chr5 (26-149)||(14344469-14344593)
chr5 (26-149)||(16904647-16904771)
chr5 (26-149)||(30607114-30607238)
chr5 (26-157)||(37251943-37252073)
chr5 (26-149)||(24835735-24835859)
chr5 (26-149)||(6269890-6270014)
chr5 (26-149)||(39656076-39656199)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (26-149)||(28937-29061)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (26-149)||(6732-6856)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (26-149)||(76489-76613)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (27-149)||(16512-16635)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (26-149)||(1564-1688)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (26-149)||(8742-8866)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (26-149)||(25688-25812)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (26-149)||(1022-1145)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (22-162)||(35317-35458)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19063637 - 19063235
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  19063637 ctacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcc 19063538  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgatattgctctctgcccaaacagtgatgtgccgctgcttgt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19063537 taacaccttactttgtgtttctctagaaataccatctctctatctctccaaaaatatgtgatattgctctctgcccaaagagtgatgtgccgctccttgt 19063438  T
Q  226 tgtcaacgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatctcaagtgacctagttctctcctattttgatatcgggtcaacacaacaatattactatcattgac 325  Q
    ||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19063437 tgtcaacgtg-tttttctttccttccctttttaatctcaagtgacctagttctctcctattttgatatcgggtaaacacaacaatatcactatcattgac 19063339  T
Q  326 caataaaccaatcccacttgtatctacttctttatacaccctccaagagtttcttcacgtggccaatcaatgtacacaagtttcttggatttgcttcatc 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19063338 caataaaccaagcccacttgtatctacatctttatacaccctccaagagtttcttcacgtggccaatctatgtacttaagtttcttggatttgcttcatt 19063239  T
Q  426 tcac 429  Q
    ||||    
T  19063238 tcac 19063235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 258 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1274478 - 1274307
Alignment:
Q  258 aatctcaagtgacctagttctctcctattttgatatcgggtcaacacaacaatattactatcattgaccaataaaccaatcccacttgtatctacttctt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1274478 aatctcaagtgacctagttctctcctattttgatatcgggtcaacacaacaatattactatcattgaccaataaaccaagcccacttgtatctacttctt 1274379  T
Q  358 tatacaccctccaagagtttcttcacgtggccaatcaatgtacacaagtttcttggatttgcttcatctcac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1274378 tatacaccctccaagagtttcttcacgtggccaatcaatgtacacaagtttcttggatttgcttcatttcac 1274307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1274711 - 1274508
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||     
T  1274711 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaatctactca 1274612  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgatattgctctctgccc-aaacagtgatgtgccgctgcttg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  1274611 taacaccttactttgtgtttctctagaaatgccatctctctatctctccaaaaatatgtgatattgctctctgcccaaaatagtgatgtgccgctccttg 1274512  T
Q  225 ttgt 228  Q
    ||||    
T  1274511 ttgt 1274508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22909241 - 22909108
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  22909241 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattgaatctactcc 22909142  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22909141 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 22909108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2477782 - 2477658
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  2477782 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 2477683  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  2477682 taactaccttgctttgtgtttctct 2477658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 3544918 - 3545042
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  3544918 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 3545017  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||    
T  3545018 taactacctttctttttgtttctct 3545042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12183990 - 12183866
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  12183990 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 12183891  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12183890 taactaccttgctttgtgtttctct 12183866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24482868 - 24482744
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||     
T  24482868 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttgatctactca 24482769  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  24482768 taactcccttgctttgtgtttctct 24482744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 12090498 - 12090622
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  12090498 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatttactcc 12090597  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12090598 taactaccttgctttgtgtttctct 12090622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 45500748 - 45500872
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  45500748 ctacatatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactca 45500847  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  45500848 taactaccttgctttgtgtttctct 45500872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12190966 - 12190843
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  12190966 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 12190867  T
Q  127 aac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  12190866 aactaccttgctttgtgtttctct 12190843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 8107926 - 8108050
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  8107926 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 8108025  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8108026 taactaccttgctttgtgtttctct 8108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 10346343 - 10346467
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  10346343 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 10346442  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  10346443 taactaccttgctttgtgtttctct 10346467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1954081 - 1953957
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||     
T  1954081 ctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactcc 1953982  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  1953981 taactacattgctttgtgtttctct 1953957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2631520 - 2631396
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  2631520 ctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 2631421  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  2631420 taactaccttgctttgtgtttctct 2631396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 2797601 - 2797725
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  2797601 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcc 2797700  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  2797701 taactaccttgttttgtgtttctct 2797725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 22321838 - 22321962
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  22321838 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 22321937  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| | |||||||||| |||||||    
T  22321938 taactaacttgctttgtatttctct 22321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 31158314 - 31158438
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  31158314 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 31158413  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31158414 taactaccttgctttgtgtttctct 31158438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 19472301 - 19472425
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  19472301 ctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 19472400  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  19472401 taactaccttgctttgtgtttctct 19472425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22818536 - 22818412
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  22818536 ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 22818437  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||    
T  22818436 taactaccttgccttgtatttctct 22818412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23795218 - 23795094
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  23795218 ctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 23795119  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  23795118 taactaccttgctttgagtttctct 23795094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Original strand, 31664536 - 31664656
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  31664536 atatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 31664635  T
Q  130 -accttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  31664636 taccttgctttgtgtttctct 31664656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 29032822 - 29032965
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||  | |||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||   | |||| |||||     
T  29032822 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcc 29032921  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctc--tagaaatgccatctctcta 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29032922 taacaccttactttgtgtttctctatagaaatgccatctctcta 29032965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31878724 - 31878601
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  31878724 ctacatatgtctttgatagttttgcaaaggatgaaaaa-agatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcc 31878626  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31878625 taactaccttgctttgtgtttctct 31878601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6172611 - 6172527
Alignment:
Q  66 gatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6172611 gatgaagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 6172527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33160242 - 33160182
Alignment:
Q  90 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33160242 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 33160182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Original strand, 19472227 - 19472275
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagat 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  19472227 ctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaggatgaagat 19472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34913558 - 34913410
Alignment:
Q  40 gatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgcttt 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34913558 gatagctttgcataggatgatgaagagatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgcttt 34913459  T
Q  140 gtgtttctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgata 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34913458 gtgtttctctagaaatgtcatctctctatctctccaaaaatatgtgata 34913410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14270795 - 14270610
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  14270795 ctacatatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 14270696  T
Q  126 taacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatctctctatttctccaaaaatatgtgatattgctctctgcccaaacagtgatgtgccgct 219  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||        |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14270695 taacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgtcatc--------tctccaaaa--atgtgatattgctccctccccaaacagtgatgtgccgct 14270610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 5989041 - 5989164
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  5989041 ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaaaa-agatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 5989139  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5989140 taactaccttgctttgtgtttctct 5989164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34006626 - 34006502
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  34006626 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcc 34006527  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  34006526 taactaccttgctttgtgtttctct 34006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25977072 - 25976940
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||  | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  25977072 ctacatatgtctatgatagctttgcaaag-atgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcc 25976974  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25976973 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 25976940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24878989 - 24878865
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  24878989 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcc 24878890  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  24878889 taactaccttgttttgtgtttctct 24878865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 32806801 - 32806924
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  32806801 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 32806900  T
Q  127 aac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  32806901 aactaccttgctttgtgtttctct 32806924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3539171 - 3539047
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  3539171 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 3539072  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  3539071 taactaccttgctttgtgtttctct 3539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14479684 - 14479560
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  14479684 ctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 14479585  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  14479584 taactaccttgctttgtgtttctct 14479560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 24161293 - 24161417
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  24161293 ctacatatgtctatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaatctactcc 24161392  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24161393 taactaccttgctttgtgtttctct 24161417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 26515466 - 26515590
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  26515466 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 26515565  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26515566 taactaccttgctttgtgtttctct 26515590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 21596565 - 21596693
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgc----ctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  21596565 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatcta 21596664  T
Q  122 ctcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21596665 ctcctaactaccatgctttgtgtttctct 21596693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21631306 - 21631180
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaa--gagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||    
T  21631306 ctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttaaatctact 21631207  T
Q  124 cttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21631206 cttaactaccttgctttatgtttctct 21631180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1454918 - 1454795
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  1454918 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcct 1454819  T
Q  127 aacaccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1454818 aacaccttgctttgtgtttctcta 1454795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1466610 - 1466487
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  1466610 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcct 1466511  T
Q  127 aacaccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1466510 aacaccttgctttgtgtttctcta 1466487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32821925 - 32821812
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||     
T  32821925 ctacatttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttgaatctattcc 32821826  T
Q  126 taacaccttgcttt 139  Q
    ||| ||||||||||    
T  32821825 taataccttgcttt 32821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 9932843 - 9932967
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||     
T  9932843 ctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaatctactcc 9932942  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  9932943 taactaccttgttttgtgtttctct 9932967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 13173859 - 13173978
Alignment:
Q  31 tatgtctatgatagctttgcataggatgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  13173859 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13173956  T
Q  129 caccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  13173957 caccttactttgtgtttttcta 13173978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 13182392 - 13182511
Alignment:
Q  31 tatgtctatgatagctttgcataggatgaag--aagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||   ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  13182392 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaa 13182489  T
Q  129 caccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  13182490 caccttactttgtgtttttcta 13182511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26604463 - 26604339
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatg-aagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactc 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||     
T  26604463 ctacatatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaa-agatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactt 26604365  T
Q  125 ttaaca-ccttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  26604364 ctaacacccttgctttgtgtttctct 26604339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 149
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510474
Alignment:
Q  68 tgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 26510474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6856437 - 6856341
Alignment:
Q  296 ggtcaacacaacaa--tattactatc-attgaccaataaaccaatcccacttgtatctacttctttatacaccctccaagagtttcttcacgtggccaat 392  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6856437 ggtcaacacatcaaagtattactatccattgaccaatacaccaaacccacttatgtctactt---tatacaccctccaaaagtttcttcatgtggccaat 6856341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 417
Target Start/End: Original strand, 13106938 - 13107064
Alignment:
Q  293 tcgggtcaacacaacaatattactatc-attgaccaa-taaaccaatcccacttgtatctacttctttatacaccctccaagagtttcttcacgtggcca 390  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||    
T  13106938 tcgggtcaacaccacattgttactatccattgaccaaataaaccaagcccacttgtgtctgtttgtttatacaccctccaaaagtgccttcacgctgcca 13107037  T
Q  391 atcaatgtacacaagtttcttggattt 417  Q
    ||  || || |||||||| ||||||||    
T  13107038 attcatatagacaagtttattggattt 13107064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15642540 - 15642457
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 109  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15642540 ctacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatctt 15642457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Original strand, 8996300 - 8996430
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  8996300 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcc 8996399  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996400 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 8996430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 11738835 - 11738959
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||     
T  11738835 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaatttactcc 11738934  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11738935 taactaccttgctttgtgtttctct 11738959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 13218083 - 13218207
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  13218083 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 13218182  T
Q  126 taa-caccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  13218183 taaccaccttgctttgtgtttctct 13218207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16129783 - 16129659
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  16129783 ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 16129684  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  16129683 taactatcttgctttgtgtttctct 16129659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 41000141 - 41000265
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  41000141 ctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 41000240  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  41000241 taactaccttgctttgtgtttctct 41000265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 9667733 - 9667857
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  9667733 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 9667832  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||    
T  9667833 taactaccttgccttgtatttctct 9667857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 33492236 - 33492360
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  33492236 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 33492335  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  33492336 taactaccttgctttgtgtttctct 33492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 38121970 - 38122094
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  38121970 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 38122069  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  38122070 taactaccttgctttgtgtttctct 38122094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 39001219 - 39001343
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  39001219 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 39001318  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  39001319 taactaccttgctttgtgtttctct 39001343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 44505308 - 44505432
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||     
T  44505308 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcc 44505407  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  44505408 taactaccttgctttgtgtttctct 44505432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 12168254 - 12168378
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |     
T  12168254 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacacc 12168353  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12168354 taactaccttgctttgtgtttctct 12168378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15161226 - 15161087
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||     
T  15161226 ctacatatgtctatgatagctttgcagaggatgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcc 15161127  T
Q  126 taacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatctc 163  Q
    ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15161126 taatatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 15161087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49249196 - 49249072
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  49249196 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 49249097  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  49249096 taactaccttactttgtgtttctct 49249072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 432378 - 432502
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||| | |||||     
T  432378 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagtctactcc 432477  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||    
T  432478 taactaccttgccttgtatttctct 432502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16832820 - 16832944
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  16832820 ctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 16832919  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16832920 taactaccttactttgtgtttctct 16832944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16130337 - 16130254
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16130337 ctacatatgtctatgataactttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctt 16130254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13830411 - 13830288
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | | |||||||||  ||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||     
T  13830411 ctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatctactcc 13830312  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||| | | ||||||||||||    
T  13830311 taacacccttccttgtgtttctct 13830288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36080279 - 36080205
Alignment:
Q  90 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatct 162  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36080279 atgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 36080205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13510087 - 13509954
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  13510087 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttc 13509988  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13509987 taacatcttgctttgtgtttctctagaaatgcca 13509954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13599617 - 13599484
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  13599617 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttc 13599518  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599517 taacatcttgctttgtgtttctctagaaatgcca 13599484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 22243282 - 22243423
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  22243282 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttc 22243381  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctctagaaatgccatctctct 166  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22243382 taactaccttgttttgtgtttctctagaaatgtcatctctct 22243423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 22233889 - 22234013
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||     
T  22233889 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcc 22233988  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22233989 taacaccttgctttgtgtttctcta 22234013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16958674 - 16958550
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16958674 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactct 16958575  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  16958574 taactaccttgctttgtgtttctct 16958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 22222703 - 22222829
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaa--gagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22222703 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctact 22222802  T
Q  124 cttaacaccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  22222803 cctaacaccttgctttgtgtttctcta 22222829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Original strand, 22229045 - 22229171
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaa--gagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22229045 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctact 22229144  T
Q  124 cttaacaccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  22229145 cctaacaccttgctttgtgtttctcta 22229171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17993018 - 17992876
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||    
T  17993018 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactct 17992919  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtt--tctctagaaatgccatctctc 165  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17992918 taactaccttgccttgtgtttctctctagaaatgccatctctc 17992876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 8743321 - 8743445
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  8743321 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 8743420  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8743421 taactaccttgctttgtgtttctct 8743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 9068205 - 9068329
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  9068205 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 9068304  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  9068305 taactaccttgctttgtgtttctct 9068329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12538285 - 12538157
Alignment:
Q  22 gtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatata 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  12538285 gtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttgaatcta 12538186  T
Q  122 ctcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
     || |||| |||||| |||||||||||||    
T  12538185 atcctaactaccttgatttgtgtttctct 12538157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16580209 - 16580085
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  16580209 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 16580110  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  16580109 taactaccttgctttgtgtttctct 16580085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22180725 - 22180601
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  22180725 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 22180626  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  22180625 taactaccttgctttttgtttctct 22180601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28370217 - 28370093
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  28370217 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 28370118  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28370117 taactaccttgctttgtgtttctct 28370093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 28926181 - 28926305
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  28926181 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 28926280  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28926281 taactaccttgctttgtgtttctct 28926305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 41577369 - 41577493
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  41577369 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 41577468  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  41577469 taactaccttgctttgtgtttctct 41577493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 4861988 - 4862130
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  4861988 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactct 4862087  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtt--tctctagaaatgccatctctc 165  Q
    |||| ||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  4862088 taactaccttaccttgtgtttctctctaaaaatgccatctctc 4862130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1607409 - 1607284
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1607409 ctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaagaatatactct 1607310  T
Q  126 taaca-ccttgctttgtgtttctcta 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1607309 taacacccttgctttgtgtttctcta 1607284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3298926 - 3298802
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  3298926 ctacatatgtctatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 3298827  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  3298826 taactaccttgctttgtgtttctct 3298802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 11309025 - 11309149
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  11309025 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 11309124  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11309125 taactaccttgctttgtgtttctct 11309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27348150 - 27348026
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  27348150 ctacatatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 27348051  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27348050 taactaccttgctttgtgtttctct 27348026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24040840 - 24040743
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24040840 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 24040743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Original strand, 34006838 - 34006922
Alignment:
Q  66 gatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34006838 gatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 34006922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Original strand, 12244 - 12373
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12244 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12343  T
Q  130 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12344 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 12373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16143
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16014 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 16113  T
Q  130 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 16143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12314 - 12185
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12314 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac 12215  T
Q  130 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12214 accttgctttgtgtttctctagaaatgcca 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 36557556 - 36557684
Alignment:
Q  22 gtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36557556 gtacctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatcta 36557655  T
Q  122 ctcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  36557656 ctcctaactaccttgctatgtgtttctct 36557684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 28457915 - 28458039
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||     
T  28457915 ctacatatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcc 28458014  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28458015 taactaccttgctttgtgtttctct 28458039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 36040300 - 36040424
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  36040300 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 36040399  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36040400 taactaccttgctttgtgtttctct 36040424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 36667907 - 36668031
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || | | |||||     
T  36667907 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcc 36668006  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36668007 taactaccttgctttgtgtttctct 36668031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 42702244 - 42702368
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  42702244 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggaggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 42702343  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  42702344 taactaccttgctttgtgtttctct 42702368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 23925070 - 23925193
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  23925070 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttgaatctactcct 23925169  T
Q  127 aac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  23925170 aactaccttgctttgtgtttctct 23925193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29223839 - 29223715
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  29223839 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 29223740  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  29223739 taactaccttgctttgtgtttctct 29223715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29337138 - 29337014
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  29337138 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 29337039  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  29337038 taactaccttgctttgtgtttctct 29337014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32523053 - 32522929
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||     
T  32523053 ctacatatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcc 32522954  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  32522953 taactaccttgctttgtgtttctct 32522929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 5784562 - 5784686
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  5784562 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 5784661  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  5784662 taacttccttgctttgtgtttctct 5784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 13230379 - 13230503
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||     
T  13230379 ctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactca 13230478  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  13230479 taactaccttgctttgtgtttctct 13230503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14700765 - 14700645
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14700765 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactct 14700666  T
Q  126 taac-accttgctttgtgttt 145  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14700665 taactaccttgctttgtgttt 14700645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27257509 - 27257385
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||     
T  27257509 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaatctcctcc 27257410  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||| |||||| |||||||||||||    
T  27257409 aaactaccttgttttgtgtttctct 27257385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21160089 - 21160006
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21160089 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatctt 21160006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43991649 - 43991533
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  43991649 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaa------aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 43991556  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttct 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  43991555 taactaccttgccttgtgtttct 43991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 109
Target Start/End: Original strand, 9787145 - 9787227
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9787145 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatctt 9787227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 24663169 - 24663293
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |  ||||  |||||     
T  24663169 ctacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcc 24663268  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24663269 taacaaccttgctttgtgtttctct 24663293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 492798 - 492724
Alignment:
Q  90 atgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgttt--ctctagaaatgccatct 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  492798 atgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctctctagaaatgccatct 492724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Original strand, 8687769 - 8687835
Alignment:
Q  84 agatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8687769 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 8687835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33248112 - 33247988
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  33248112 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 33248013  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  33248012 taactaccttgctttgtgtttctct 33247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3588524 - 3588400
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  3588524 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 3588425  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  3588424 taactaccttgctttgtgtttctct 3588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20837218 - 20837094
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  20837218 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 20837119  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||    
T  20837118 taactaccttgccttgtatttctct 20837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 27030721 - 27030845
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  27030721 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 27030820  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27030821 taactaccttgctttgtgtttctct 27030845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 36469473 - 36469596
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  36469473 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 36469572  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  36469573 taactaccttgc-ttgtgtttctct 36469596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45527767 - 45527647
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  45527767 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 45527668  T
Q  130 -accttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  45527667 taccttgctttgtgtttctct 45527647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 7653260 - 7653384
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  7653260 ctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 7653359  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  7653360 taactaccttgctttgtgtttctct 7653384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8615627 - 8615503
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  8615627 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 8615528  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8615527 taactaccttgctttgtgtttctct 8615503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9989520 - 9989396
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  9989520 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 9989421  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  9989420 taactaccttgctttgtgtttctct 9989396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 10386108 - 10386232
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||||     
T  10386108 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcc 10386207  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  10386208 taactaccttgctttgtgtttctct 10386232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22097791 - 22097667
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  22097791 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 22097692  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  22097691 taactaccttactttgtgtttctct 22097667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 27850588 - 27850711
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  27850588 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 27850687  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  27850688 taactaccttgc-ttgtgtttctct 27850711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2357284 - 2357141
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  2357284 ctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcc 2357185  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctc--tagaaatgccatctctcta 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2357184 taacatcttgctttgtgtttctctatagaaatgtcatctctcta 2357141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 37471724 - 37471848
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||  |||||||||||| || | |||||| |||||     
T  37471724 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcc 37471823  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  37471824 taactactttgctttgtgtttctct 37471848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23194046 - 23193905
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  23194046 ctacatatgtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactct 23193948  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtt--tctctagaaatgccatctctc 165  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  23193947 taactaccttgccttgtgtttctctctaaaaatgccatctctc 23193905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 1232529 - 1232676
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||| |||||     
T  1232529 ctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcc 1232628  T
Q  126 taacacc-----ttgctttgtgtt--tctctagaaatgccatctctct 166  Q
    |||||||     ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1232629 taacaccttattttgctttgtgtttctctctagaaatgtcatctctct 1232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23385516 - 23385396
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  23385516 atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 23385417  T
Q  130 -accttgctttgtgtttctct 149  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  23385416 taccttgctttttgtttctct 23385396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 48168231 - 48168355
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||   |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  48168231 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 48168330  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  48168331 taactaccttgcttcgtgtttctct 48168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 52308123 - 52308247
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| || | | |||| |||||     
T  52308123 ctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcc 52308222  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  52308223 taactaccttgctttgtgtttctct 52308247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30046106 - 30046052
Alignment:
Q  293 tcgggtcaacacaacaatattactatcattgaccaataaaccaatcccacttgta 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30046106 tcgggtcaacacaacaatattactatcattgaccaataaaccaaacccacttgta 30046052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 4743038 - 4743135
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4743038 ctacatatgtctatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttgaatctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Original strand, 20963711 - 20963815
Alignment:
Q  46 tttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtt 144  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20963711 tttgcaaatgatgaagagaagatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 20963810  T
Q  145 tctct 149  Q
    |||||    
T  20963811 tctct 20963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26335201 - 26335121
Alignment:
Q  66 gatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgttt 145  Q
    ||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26335201 gatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgctttgtgttt 26335121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49434220 - 49434097
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | |||| ||||||  || |||| |   || || |||||||||||||| ||| |||| |||||     
T  49434220 ctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcc 49434121  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  49434120 taacaccttgctttgtgtttctct 49434097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 8 - 154
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||     
T  8 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaatctactcc 107  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtt----tctctagaaatgccatctctcta 167  Q
     ||| |||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||    
T  108 caactaccttgctttgtctttctctctctagaaatgccctctctcta 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26069849 - 26069725
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||      
T  26069849 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttc 26069750  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26069749 taactaccttgctttgtgtttctct 26069725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 30218429 - 30218553
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30218429 ctacatatgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactct 30218528  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  30218529 taactaccttgctttgtgtttctct 30218553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 40995587 - 40995711
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  40995587 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 40995686  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  40995687 taactaccttgatttgtgtttctct 40995711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 53895503 - 53895400
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  53895503 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttt 53895404  T
Q  126 taac 129  Q
    ||||    
T  53895403 taac 53895400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 46692074 - 46692196
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  46692074 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 46692173  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttct 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  46692174 taactaccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 4839174 - 4839298
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  4839174 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 4839273  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4839274 taactaccttgctttgtgtttctct 4839298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 33110741 - 33110884
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33110741 ctacatatgtctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactct 33110840  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtt--tctctagaaatgccatctctct 166  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33110841 taactaccttgccttgtgtttctctctagaaatgtcatctctct 33110884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 19247865 - 19247989
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| || | |||||| |||||     
T  19247865 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctactcc 19247964  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  19247965 caactaccttgctttgtgtttctct 19247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20948869 - 20948745
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |    
T  20948869 ctacatatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttt 20948770  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  20948769 taactaccttgctttgtgtttctct 20948745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 21677705 - 21677829
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| || ||     
T  21677705 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcc 21677804  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  21677805 taactactttgctttgtgtttctct 21677829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 42532925 - 42533049
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||  | |||||| |||||     
T  42532925 ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttgaatctactcc 42533024  T
Q  126 taa-caccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  42533025 taaccaccttgctttgtgtttctct 42533049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 323562 - 323438
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  323562 ctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 323463  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  323462 taactatcttgctttgtgtttctct 323438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1188089 - 1187965
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||   |||||| |||||     
T  1188089 ctacatatgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcc 1187990  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  1187989 taactaccttgctttgtgtttctct 1187965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22047805 - 22047681
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| | |||     
T  22047805 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaatcttctcc 22047706  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  22047705 taactaccttgctttgtgtttctct 22047681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Original strand, 26373671 - 26373791
Alignment:
Q  30 atatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||    
T  26373671 atatgtctatgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctactcctaac 26373770  T
Q  130 -accttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26373771 taccttgctttgtgtttctct 26373791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 44432091 - 44432215
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||     
T  44432091 ctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatgatgtctcaagaaatcttggcttgaatctactcc 44432190  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  44432191 taactaccttgctttgagtttctct 44432215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 55326900 - 55326774
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaata--tact 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||    
T  55326900 ctacatatgtctatgatagctttggaatggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatatctact 55326801  T
Q  124 cttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    | |||| | |||||| |||||||||||    
T  55326800 cctaactatcttgctatgtgtttctct 55326774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 5273600 - 5273713
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           || ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  5273600 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaa-----------tccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 5273688  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5273689 taactaccttgctttgtgtttctct 5273713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52618598 - 52618514
Alignment:
Q  66 gatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52618598 gatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctct 52618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6640101 - 6639977
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggat-gaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactc 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||  | ||||||||||||||| || ||  |||| |||||    
T  6640101 ctacatatgtctatgaaagctttggaaaagatagaagaa-agatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactc 6640003  T
Q  125 ttaaca-ccttgctttgtgtttctct 149  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  6640002 ctaacacccttgctttgtgtttctct 6639977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Original strand, 35416760 - 35416845
Alignment:
Q  65 agatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  35416760 agatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatctttctttgtgtttctct 35416845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14308 - 14176
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||| |   ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||     
T  14308 ctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcc 14209  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgcc 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14208 taacaccttgctttgtgtctctctagaaatgcc 14176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 116605 - 116729
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  116605 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 116704  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  116705 taactaccttgctttgtgtttctct 116729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 27167135 - 27167259
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||     
T  27167135 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcc 27167234  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27167235 taactaccttgctttgtgtttctct 27167259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32226914 - 32226826
Alignment:
Q  68 tgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactcttaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32226914 tgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctagaaatg 32226826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 34869784 - 34869908
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  34869784 ctacatatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 34869883  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  34869884 taactaccttgttttgtgtttctct 34869908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7315089 - 7314965
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  7315089 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 7314990  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  7314989 taactaccttgctttgtgtttctct 7314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9404548 - 9404424
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  9404548 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 9404449  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  9404448 taactaccttgctttgtgtttctct 9404424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 11723314 - 11723438
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  11723314 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 11723413  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11723414 taactaccttgctttgtgtttctct 11723438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11766879 - 11766755
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  11766879 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 11766780  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11766779 taactaccttgctttgtgtttctct 11766755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31846104 - 31845980
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  31846104 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 31846005  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31846004 taactaccttgctttgtgtttctct 31845980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33434727 - 33434603
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  33434727 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 33434628  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  33434627 taactaccttgctttgtgtttctct 33434603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34456421 - 34456297
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  34456421 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 34456322  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  34456321 taactaccttgctttgtgtttctct 34456297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14344593 - 14344469
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  14344593 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 14344494  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  14344493 taactaccttgctttgagtttctct 14344469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 16904647 - 16904771
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |     
T  16904647 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacccc 16904746  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  16904747 taactaccttgctttgtgtttctct 16904771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 30607114 - 30607238
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||     
T  30607114 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcc 30607213  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  30607214 taactaccttgctttgtgtttctct 30607238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Original strand, 37251943 - 37252073
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |     
T  37251943 ctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacc 37252041  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctctagaaatgc 157  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  37252042 taacaccttgttttgtgtctctctaaaaatgc 37252073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24835859 - 24835735
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |   |||||| |||||     
T  24835859 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcc 24835760  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  24835759 taactaccttgatttgtgtttctct 24835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6270014 - 6269890
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || | ||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||     
T  6270014 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaatctactca 6269915  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| || || ||||||||||||||    
T  6269914 taactacatttctttgtgtttctct 6269890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 39656076 - 39656199
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||| ||  |||||  || ||||||||  | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| |||||     
T  39656076 ctacatatgtctttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcc 39656175  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  39656176 taacaccttacgttgtgtttctct 39656199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 28937 - 29061
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  28937 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 29036  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  29037 taactaccttgctttgtgtttctct 29061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6732
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  6856 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 6757  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||    
T  6756 taactaccttgccttgtatttctct 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 76489 - 76613
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  76489 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 76588  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  76589 taactaccttgctttgtgtttctct 76613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 16512 - 16635
Alignment:
Q  27 tacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactctt 126  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16512 tacatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactctt 16611  T
Q  127 aac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16612 aactaccttactttgtgtttctct 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1688 - 1564
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  1688 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 1589  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  1588 taactaccttgctttgtgtttctct 1564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8866 - 8742
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  8866 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 8767  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  8766 taactaccttgccttgtgtttctct 8742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 25688 - 25812
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||     
T  25688 ctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 25787  T
Q  126 taac-accttgctttgtgtttctct 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  25788 taactaccttgctttgtgtttctct 25812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1145
Alignment:
Q  26 ctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatatactct 125  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||| | | |||| |||||     
T  1022 ctacatatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcc 1121  T
Q  126 taacaccttgctttgtgtttctct 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  1122 taacaccttactttgtgtttctct 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Original strand, 35317 - 35458
Alignment:
Q  22 gtacctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatata 121  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  | | |||||||||  || || |||   || ||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  35317 gtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtagaatcta 35416  T
Q  122 ctcttaacaccttgctttgtgtttct-ctagaaatgccatct 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35417 ctcctaacaccttgctttgtgtttctcctagaaatgccatct 35458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University