View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2028_low_9 (Length: 412)

Name: NF2028_low_9
Description: NF2028
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2028_low_9
NF2028_low_9
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (10-395)||(42939-43324)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-395)||(23080024-23080418)
chr5 (12-395)||(22381238-22381621)
chr5 (11-395)||(22502718-22503102)
chr5 (11-395)||(14886936-14887320)
chr5 (11-395)||(37545441-37545826)
chr5 (11-395)||(20342321-20342705)
chr5 (10-395)||(22235864-22236249)
chr5 (11-395)||(25848114-25848498)
chr5 (1-395)||(17269268-17269662)
chr5 (11-395)||(24798342-24798726)
chr5 (10-395)||(24749498-24749883)
chr5 (10-395)||(22461991-22462376)
chr5 (11-395)||(21890704-21891088)
chr5 (14-395)||(20821492-20821873)
chr5 (14-395)||(28923716-28924097)
chr5 (14-395)||(28894890-28895271)
chr5 (14-393)||(20773801-20774179)
chr5 (112-395)||(24735657-24735940)
chr5 (10-188)||(972-1150)
chr5 (10-330)||(23573864-23574184)
chr5 (10-330)||(21339230-21339550)
chr5 (10-336)||(16356618-16356944)
chr5 (10-336)||(34566610-34566936)
chr5 (15-212)||(21563922-21564119)
chr5 (47-318)||(21831724-21831995)
chr5 (10-336)||(19770076-19770402)
chr5 (10-336)||(23516657-23516983)
chr5 (10-324)||(37291440-37291754)
chr5 (10-336)||(26738649-26738975)
chr5 (10-336)||(27518523-27518849)
chr5 (10-336)||(40708896-40709222)
chr5 (13-354)||(22134766-22135107)
chr5 (187-395)||(23442414-23442622)
chr5 (10-336)||(27610470-27610796)
chr5 (10-336)||(27668434-27668760)
chr5 (10-330)||(20798882-20799202)
chr5 (13-330)||(21497983-21498300)
chr5 (10-330)||(21984249-21984569)
chr5 (10-225)||(23471456-23471671)
chr5 (10-117)||(24716470-24716577)
chr5 (11-330)||(27685345-27685664)
chr5 (15-324)||(14999688-14999997)
chr5 (10-354)||(29476017-29476361)
chr5 (10-113)||(24620239-24620342)
chr5 (10-324)||(20468040-20468354)
chr5 (10-336)||(41770958-41771284)
chr5 (10-356)||(18775873-18776212)
chr5 (10-330)||(25423311-25423631)
chr5 (13-336)||(22332834-22333157)
chr5 (10-330)||(23440347-23440667)
chr5 (14-170)||(28916361-28916517)
chr5 (10-276)||(22348599-22348865)
chr5 (10-330)||(21404942-21405264)
chr5 (13-99)||(21496493-21496579)
chr5 (103-333)||(11210731-11210961)
chr5 (103-338)||(24581307-24581542)
chr5 (136-338)||(23503539-23503741)
chr5 (103-338)||(21937225-21937460)
chr5 (125-198)||(21229232-21229305)
chr5 (103-338)||(27011180-27011415)
chr5 (89-159)||(21680429-21680499)
chr5 (296-395)||(24737015-24737114)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-395)||(248769-249163)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-393)||(13021474-13021866)
chr7 (10-395)||(12455817-12456202)
chr7 (1-395)||(16950211-16950605)
chr7 (1-395)||(6413626-6414020)
chr7 (1-395)||(1147-1541)
chr7 (1-384)||(14129999-14130382)
chr7 (1-395)||(8211868-8212262)
chr7 (11-384)||(14433817-14434190)
chr7 (11-395)||(11306013-11306397)
chr7 (1-349)||(12456940-12457288)
chr7 (14-395)||(49152416-49152797)
chr7 (11-395)||(26118355-26118739)
chr7 (1-384)||(14286116-14286499)
chr7 (10-395)||(15102352-15102735)
chr7 (1-366)||(15340575-15340940)
chr7 (11-395)||(14263994-14264378)
chr7 (11-395)||(19147326-19147710)
chr7 (11-395)||(20746725-20747109)
chr7 (1-395)||(18053693-18054087)
chr7 (11-395)||(16072044-16072428)
chr7 (10-395)||(13665663-13666037)
chr7 (1-395)||(23199483-23199877)
chr7 (1-395)||(23505610-23506004)
chr7 (11-296)||(13968418-13968703)
chr7 (1-395)||(11388168-11388561)
chr7 (11-338)||(12206550-12206877)
chr7 (10-336)||(8198801-8199127)
chr7 (10-336)||(44791122-44791448)
chr7 (10-354)||(12687656-12688000)
chr7 (10-354)||(14954775-14955119)
chr7 (10-336)||(10871168-10871494)
chr7 (10-330)||(8707784-8708104)
chr7 (10-330)||(18551529-18551849)
chr7 (10-351)||(17087-17428)
chr7 (10-330)||(9596236-9596556)
chr7 (10-354)||(18177897-18178241)
chr7 (11-330)||(15160829-15161148)
chr7 (13-336)||(23516543-23516866)
chr7 (11-330)||(13686243-13686562)
chr7 (10-336)||(14332570-14332896)
chr7 (265-395)||(26288041-26288170)
chr7 (10-330)||(15204058-15204378)
chr7 (13-354)||(11552876-11553217)
chr7 (11-329)||(15624732-15625050)
chr7 (10-336)||(15154428-15154749)
chr7 (10-237)||(11236984-11237211)
chr7 (10-225)||(14039980-14040195)
chr7 (10-225)||(14350010-14350225)
chr7 (44-351)||(35964655-35964962)
chr7 (1-330)||(11772003-11772332)
chr7 (10-351)||(21662119-21662460)
chr7 (103-338)||(7824071-7824306)
chr7 (103-338)||(21674397-21674632)
chr7 (103-338)||(27107638-27107873)
chr7 (136-338)||(12368473-12368675)
chr7 (103-216)||(12193849-12193962)
chr7 (103-375)||(14936481-14936753)
chr7 (103-318)||(45146746-45146961)
chr7 (103-192)||(15364257-15364346)
chr7 (103-186)||(17923986-17924069)
chr7 (151-276)||(13353384-13353509)
chr7 (217-330)||(14037986-14038099)
chr7 (217-330)||(14348016-14348129)
chr7 (208-324)||(23641702-23641818)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (1-395)||(22061629-22062023)
chr8 (1-395)||(31416670-31417064)
chr8 (1-395)||(29303622-29304016)
chr8 (11-395)||(803879-804263)
chr8 (11-395)||(6679302-6679686)
chr8 (11-395)||(12304949-12305333)
chr8 (11-395)||(6603849-6604233)
chr8 (11-395)||(14565333-14565717)
chr8 (11-395)||(1266430-1266813)
chr8 (10-395)||(23655118-23655503)
chr8 (1-395)||(22051054-22051448)
chr8 (1-395)||(31571038-31571432)
chr8 (11-319)||(16271430-16271738)
chr8 (15-385)||(21840618-21840988)
chr8 (11-392)||(19851605-19851986)
chr8 (11-392)||(19857641-19858022)
chr8 (12-395)||(20010107-20010490)
chr8 (10-231)||(20975856-20976077)
chr8 (11-351)||(20388334-20388674)
chr8 (199-395)||(21324803-21324999)
chr8 (13-330)||(15533636-15533953)
chr8 (10-351)||(19978202-19978543)
chr8 (1-354)||(20396321-20396674)
chr8 (10-330)||(16408250-16408570)
chr8 (10-354)||(32600376-32600720)
chr8 (10-336)||(20017955-20018281)
chr8 (191-395)||(21681856-21682060)
chr8 (173-395)||(20008041-20008263)
chr8 (13-330)||(23949176-23949492)
chr8 (10-336)||(17674228-17674554)
chr8 (10-336)||(19112940-19113266)
chr8 (10-336)||(19485075-19485401)
chr8 (10-276)||(22046683-22046949)
chr8 (10-336)||(21166742-21167068)
chr8 (10-336)||(21921940-21922266)
chr8 (10-324)||(22133246-22133560)
chr8 (10-354)||(22120379-22120723)
chr8 (11-354)||(30313350-30313693)
chr8 (10-384)||(22377659-22378032)
chr8 (10-384)||(22383834-22384207)
chr8 (10-336)||(23650291-23650617)
chr8 (11-330)||(21788565-21788883)
chr8 (10-276)||(22040169-22040435)
chr8 (10-305)||(18856858-18857153)
chr8 (11-330)||(21394071-21394390)
chr8 (10-330)||(21251198-21251517)
chr8 (50-354)||(22164436-22164740)
chr8 (11-155)||(22371371-22371515)
chr8 (14-100)||(27355034-27355120)
chr8 (10-235)||(22987552-22987777)
chr8 (103-338)||(16877393-16877628)
chr8 (136-351)||(20652664-20652879)
chr8 (308-395)||(28982548-28982635)
chr8 (308-395)||(28987768-28987855)
chr8 (314-395)||(16265127-16265208)
chr8 (103-375)||(21196800-21197072)
chr8 (103-324)||(21850635-21850856)
chr8 (103-214)||(22982806-22982917)
chr8 (103-237)||(23157309-23157443)
chr8 (103-375)||(22315402-22315674)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (10-395)||(19276-19661)
scaffold0058 (167-224)||(74227-74284)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-395)||(20891107-20891501)
chr4 (1-395)||(1649030-1649424)
chr4 (11-395)||(3264557-3264941)
chr4 (1-395)||(33223043-33223442)
chr4 (11-395)||(11206994-11207378)
chr4 (11-395)||(29453300-29453684)
chr4 (11-395)||(44661629-44662013)
chr4 (13-395)||(15358855-15359237)
chr4 (1-395)||(16146037-16146433)
chr4 (10-391)||(27900515-27900896)
chr4 (10-395)||(15246049-15246434)
chr4 (11-395)||(15003127-15003511)
chr4 (71-395)||(15070538-15070862)
chr4 (15-330)||(15077825-15078140)
chr4 (59-395)||(51605992-51606328)
chr4 (11-330)||(8706108-8706427)
chr4 (11-330)||(15414789-15415108)
chr4 (10-336)||(29038906-29039232)
chr4 (10-354)||(14680733-14681077)
chr4 (10-354)||(18226948-18227292)
chr4 (10-336)||(8386596-8386922)
chr4 (13-354)||(14266404-14266745)
chr4 (1-336)||(27711520-27711855)
chr4 (10-336)||(18297389-18297715)
chr4 (10-335)||(8053125-8053450)
chr4 (11-324)||(12523872-12524185)
chr4 (10-330)||(12476790-12477110)
chr4 (10-330)||(14850868-14851188)
chr4 (10-336)||(19778295-19778621)
chr4 (10-237)||(15147386-15147613)
chr4 (10-329)||(1639927-1640246)
chr4 (11-354)||(40473206-40473549)
chr4 (10-336)||(14303480-14303806)
chr4 (12-330)||(16354949-16355267)
chr4 (10-336)||(23955931-23956257)
chr4 (44-384)||(14159628-14159968)
chr4 (10-351)||(16251947-16252288)
chr4 (242-395)||(16752718-16752871)
chr4 (10-336)||(7090616-7090942)
chr4 (136-338)||(9291017-9291219)
chr4 (87-330)||(14652498-14652741)
chr4 (103-338)||(14997498-14997733)
chr4 (103-324)||(15293012-15293233)
chr4 (103-276)||(16685498-16685670)
chr4 (103-338)||(55375213-55375448)
chr4 (103-336)||(13247829-13248062)
chr4 (103-186)||(12342718-12342801)
chr4 (252-330)||(15149750-15149828)
chr4 (318-395)||(42703028-42703105)
chr4 (252-352)||(16676447-16676547)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-395)||(42089-42483)
scaffold0010 (10-395)||(47164-47549)
scaffold0010 (11-120)||(2352-2461)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-395)||(10468747-10469141)
chr6 (1-395)||(14381365-14381759)
chr6 (11-395)||(24364401-24364785)
chr6 (10-395)||(17415475-17415860)
chr6 (1-395)||(27560515-27560909)
chr6 (15-395)||(22796544-22796924)
chr6 (66-382)||(8766111-8766427)
chr6 (1-395)||(28282711-28283105)
chr6 (10-293)||(19453511-19453794)
chr6 (59-395)||(18800931-18801267)
chr6 (10-395)||(25768180-25768565)
chr6 (11-393)||(21471592-21471974)
chr6 (10-395)||(21564039-21564424)
chr6 (14-395)||(15459325-15459706)
chr6 (1-206)||(5297104-5297308)
chr6 (10-338)||(1640818-1641146)
chr6 (14-395)||(34645497-34645878)
chr6 (1-195)||(27559886-27560080)
chr6 (14-327)||(18794747-18795060)
chr6 (1-366)||(19879316-19879681)
chr6 (10-354)||(1542991-1543335)
chr6 (10-336)||(27187484-27187810)
chr6 (10-336)||(27261430-27261756)
chr6 (10-336)||(29591827-29592153)
chr6 (14-366)||(11280416-11280768)
chr6 (10-330)||(16927547-16927867)
chr6 (10-336)||(16626624-16626950)
chr6 (10-324)||(22433929-22434243)
chr6 (13-395)||(23078458-23078840)
chr6 (10-330)||(5839126-5839446)
chr6 (10-330)||(16963274-16963594)
chr6 (10-329)||(24313075-24313394)
chr6 (14-336)||(28263108-28263430)
chr6 (14-336)||(28341857-28342179)
chr6 (10-330)||(25609768-25610088)
chr6 (10-354)||(25112582-25112926)
chr6 (10-336)||(2874710-2875036)
chr6 (10-324)||(19864747-19865061)
chr6 (10-336)||(27331340-27331666)
chr6 (10-336)||(27392080-27392406)
chr6 (10-324)||(28292279-28292593)
chr6 (10-330)||(18407849-18408170)
chr6 (10-98)||(21569898-21569986)
chr6 (14-330)||(22762366-22762682)
chr6 (87-330)||(12498080-12498323)
chr6 (87-354)||(12510578-12510845)
chr6 (135-336)||(25765322-25765523)
chr6 (103-375)||(15078364-15078636)
chr6 (103-375)||(16098059-16098331)
chr6 (10-329)||(22078597-22078914)
chr6 (87-330)||(12505409-12505652)
chr6 (103-338)||(16382373-16382608)
chr6 (107-338)||(18837912-18838143)
chr6 (105-338)||(1648786-1649019)
chr6 (103-338)||(23996294-23996529)
chr6 (185-395)||(11287680-11287890)
chr6 (143-338)||(16233255-16233450)
chr6 (167-330)||(18197611-18197774)
chr6 (103-338)||(25743088-25743322)
chr6 (296-395)||(25750798-25750897)
chr6 (285-395)||(14131361-14131471)
chr6 (10-178)||(17032589-17032757)
chr6 (307-395)||(25750935-25751023)
chr6 (103-338)||(21412938-21413173)
chr6 (1-54)||(8762831-8762884)
chr6 (104-191)||(1652266-1652353)
chr6 (152-240)||(17813870-17813958)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (1-391)||(11961015-11961405)
chr3 (1-395)||(16836491-16836885)
chr3 (1-395)||(18134327-18134721)
chr3 (11-395)||(10383723-10384107)
chr3 (11-395)||(16329652-16330034)
chr3 (10-382)||(12360532-12360904)
chr3 (10-375)||(11303763-11304128)
chr3 (15-395)||(15952963-15953343)
chr3 (11-395)||(47123698-47124082)
chr3 (1-395)||(8759063-8759457)
chr3 (1-395)||(41177276-41177670)
chr3 (1-395)||(13941778-13942172)
chr3 (10-290)||(17492489-17492769)
chr3 (10-395)||(16380918-16381302)
chr3 (1-372)||(44777024-44777395)
chr3 (1-393)||(13322633-13323025)
chr3 (14-395)||(10420039-10420420)
chr3 (10-394)||(12850269-12850653)
chr3 (11-290)||(28754177-28754456)
chr3 (11-285)||(4678302-4678576)
chr3 (10-395)||(13972110-13972495)
chr3 (16-351)||(15227447-15227782)
chr3 (1-395)||(14086427-14086821)
chr3 (1-219)||(26008974-26009192)
chr3 (11-288)||(13001770-13002046)
chr3 (10-336)||(16635576-16635902)
chr3 (10-336)||(43162900-43163226)
chr3 (10-351)||(16806927-16807268)
chr3 (10-330)||(12498057-12498377)
chr3 (10-336)||(20062055-20062381)
chr3 (14-330)||(16691969-16692285)
chr3 (10-336)||(10005403-10005729)
chr3 (10-336)||(14876500-14876826)
chr3 (10-336)||(15589393-15589719)
chr3 (10-336)||(16756586-16756912)
chr3 (14-336)||(53385023-53385345)
chr3 (10-191)||(14573887-14574068)
chr3 (10-330)||(16371222-16371542)
chr3 (11-330)||(26792401-26792720)
chr3 (10-336)||(15348246-15348572)
chr3 (10-330)||(15208700-15209020)
chr3 (10-330)||(15247956-15248276)
chr3 (10-336)||(9522522-9522848)
chr3 (10-336)||(10906013-10906339)
chr3 (10-336)||(13252493-13252819)
chr3 (10-336)||(48425250-48425576)
chr3 (187-395)||(14571602-14571810)
chr3 (10-354)||(15724935-15725278)
chr3 (10-330)||(17489659-17489979)
chr3 (11-330)||(16412284-16412603)
chr3 (10-336)||(5424931-5425257)
chr3 (65-336)||(6600550-6600821)
chr3 (11-330)||(16492183-16492502)
chr3 (10-336)||(15339072-15339398)
chr3 (10-336)||(15402511-15402837)
chr3 (11-101)||(16338503-16338593)
chr3 (1-180)||(11564673-11564852)
chr3 (20-351)||(15015755-15016086)
chr3 (103-338)||(16742797-16743032)
chr3 (10-159)||(14126595-14126744)
chr3 (103-338)||(8274493-8274728)
chr3 (143-338)||(17192905-17193100)
chr3 (143-378)||(15576521-15576756)
chr3 (10-99)||(15061796-15061885)
chr3 (136-333)||(18748481-18748678)
chr3 (101-223)||(13975138-13975259)
chr3 (103-234)||(6152945-6153076)
chr3 (10-42)||(16828192-16828224)
chr3 (106-216)||(267355-267465)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (10-395)||(51945-52329)
scaffold0067 (10-395)||(60979-61363)
scaffold0067 (10-395)||(67367-67751)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (11-395)||(21437-21821)
scaffold0235 (143-338)||(26019-26214)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-395)||(13657-14051)
scaffold0034 (10-395)||(4718-5103)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (1-382)||(10938-11319)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (10-395)||(20278-20663)
scaffold0114 (15-390)||(43666-44041)
scaffold0114 (15-390)||(44678-45053)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (11-395)||(11358177-11358561)
chr2 (11-395)||(20832741-20833125)
chr2 (10-395)||(23293714-23294099)
chr2 (1-395)||(23276532-23276926)
chr2 (11-395)||(1063507-1063891)
chr2 (11-395)||(31830414-31830798)
chr2 (1-395)||(12574109-12574503)
chr2 (1-395)||(27787497-27787891)
chr2 (1-237)||(19652345-19652578)
chr2 (1-395)||(27365372-27365766)
chr2 (11-351)||(23087250-23087590)
chr2 (10-176)||(24948564-24948730)
chr2 (11-184)||(20828226-20828399)
chr2 (10-336)||(9609951-9610277)
chr2 (11-336)||(16998815-16999140)
chr2 (10-330)||(24825584-24825904)
chr2 (10-336)||(16981967-16982293)
chr2 (10-336)||(17063532-17063858)
chr2 (10-336)||(17067190-17067516)
chr2 (10-330)||(21325568-21325888)
chr2 (10-276)||(10868725-10868991)
chr2 (10-351)||(24707784-24708125)
chr2 (11-330)||(24262191-24262510)
chr2 (10-329)||(45529333-45529652)
chr2 (10-336)||(24675304-24675630)
chr2 (10-336)||(24709848-24710174)
chr2 (10-336)||(27217831-27218157)
chr2 (47-336)||(16925075-16925364)
chr2 (10-237)||(41608687-41608914)
chr2 (10-336)||(44385871-44386197)
chr2 (10-330)||(23063898-23064218)
chr2 (10-336)||(22325158-22325484)
chr2 (10-336)||(27371084-27371410)
chr2 (47-354)||(24878334-24878641)
chr2 (10-330)||(22756767-22757085)
chr2 (10-351)||(30211219-30211560)
chr2 (65-395)||(21145387-21145717)
chr2 (13-330)||(23188829-23189145)
chr2 (103-375)||(22276055-22276327)
chr2 (103-338)||(12640314-12640549)
chr2 (105-324)||(25128474-25128693)
chr2 (103-328)||(22761964-22762189)
chr2 (107-338)||(23817452-23817683)
chr2 (309-395)||(24654101-24654187)
chr2 (103-240)||(24570063-24570200)
chr2 (143-240)||(24831622-24831719)
chr2 (11-60)||(21125460-21125509)
chr2 (351-395)||(24945123-24945167)
chr2 (281-330)||(23138858-23138907)
chr2 (281-330)||(23550648-23550697)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-395)||(22432941-22433335)
chr1 (11-395)||(37677219-37677604)
chr1 (11-395)||(20294552-20294936)
chr1 (11-395)||(20939898-20940282)
chr1 (11-395)||(41307965-41308349)
chr1 (1-395)||(19854454-19854847)
chr1 (1-395)||(20835713-20836107)
chr1 (10-395)||(20856595-20856980)
chr1 (128-395)||(31550133-31550400)
chr1 (10-336)||(20250049-20250375)
chr1 (1-154)||(24099428-24099581)
chr1 (10-201)||(19662975-19663161)
chr1 (1-395)||(17044840-17045234)
chr1 (10-330)||(16078486-16078806)
chr1 (10-354)||(19106548-19106892)
chr1 (10-336)||(16350433-16350759)
chr1 (10-336)||(33390863-33391189)
chr1 (10-336)||(51333327-51333653)
chr1 (245-395)||(20075128-20075278)
chr1 (10-395)||(50620078-50620463)
chr1 (10-330)||(19760700-19761020)
chr1 (10-336)||(41354303-41354629)
chr1 (227-395)||(11382734-11382902)
chr1 (10-237)||(21837248-21837475)
chr1 (195-393)||(19664895-19665093)
chr1 (10-318)||(21830520-21830828)
chr1 (10-330)||(16369502-16369822)
chr1 (10-330)||(20136983-20137303)
chr1 (1-132)||(31539822-31539953)
chr1 (298-395)||(20244340-20244437)
chr1 (135-337)||(21747732-21747934)
chr1 (10-126)||(21749350-21749466)
chr1 (138-338)||(22135520-22135720)
chr1 (103-338)||(20831319-20831554)
chr1 (10-99)||(22362078-22362167)
chr1 (143-395)||(20914350-20914602)
chr1 (358-395)||(20395175-20395212)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (10-395)||(48972-49357)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-395)||(254-648)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (10-395)||(322860-323245)
scaffold0004 (11-391)||(117728-118108)
scaffold0004 (11-395)||(385975-386359)
scaffold0004 (11-314)||(203234-203537)
scaffold0004 (10-395)||(112177-112562)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-395)||(26417-26801)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (11-395)||(16479-16863)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-395)||(2907-3301)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (10-395)||(20139-20524)
scaffold0298 (1-395)||(13117-13511)
scaffold0298 (1-395)||(16887-17281)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-395)||(4906-5300)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-395)||(1280-1674)
scaffold0120 (10-330)||(6244-6564)
scaffold0120 (167-338)||(22907-23078)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-339)||(5208-5546)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-395)||(57573-57966)
scaffold0053 (11-375)||(48800-49163)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-395)||(260464-260858)
scaffold0005 (10-336)||(278595-278921)
scaffold0005 (87-330)||(164551-164794)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (10-395)||(27675-28060)
scaffold0139 (11-375)||(915-1279)
scaffold0139 (10-42)||(34281-34313)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (10-395)||(14016-14401)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (13-395)||(5369-5751)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-395)||(11044-11438)
scaffold0124 (10-395)||(169-549)
scaffold0124 (103-221)||(7668-7786)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-395)||(25621-26015)
scaffold0113 (281-395)||(16832-16946)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (10-379)||(3120-3489)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (13-395)||(148726-149108)
scaffold0011 (10-395)||(195469-195852)
scaffold0011 (10-395)||(26298-26683)
scaffold0011 (103-238)||(180237-180372)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (10-395)||(90697-91082)
scaffold0001 (1-189)||(114542-114730)
scaffold0001 (95-330)||(448280-448515)
scaffold0001 (10-99)||(390965-391054)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (10-395)||(27382-27766)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (10-395)||(47280-47665)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (10-395)||(9848-10233)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-395)||(12541-12931)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (10-395)||(18302-18687)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (11-395)||(31566-31950)
scaffold0106 (10-340)||(17653-17982)
scaffold0106 (11-330)||(14260-14579)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (10-395)||(7003-7388)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-395)||(39895-40276)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (10-395)||(1950-2335)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-395)||(51629-52013)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (11-339)||(37414-37742)
scaffold0026 (175-395)||(38103-38324)
scaffold0026 (281-395)||(27373-27487)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (11-355)||(85-429)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (11-395)||(9954-10333)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (10-395)||(999-1384)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (11-395)||(26-409)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (13-395)||(4031-4413)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (10-395)||(6339-6725)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (13-276)||(6103-6368)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (10-395)||(26298-26683)
scaffold0192 (10-219)||(26856-27065)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-395)||(684-1069)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (14-395)||(95771-96152)
scaffold0029 (13-395)||(112715-113097)
scaffold0029 (10-354)||(109576-109920)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (122-395)||(38764-39037)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (15-395)||(6806-7186)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (79-395)||(5748-6064)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-395)||(33433-33827)
scaffold0076 (103-338)||(40471-40706)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-191)||(3151-3341)
scaffold0403 (10-324)||(6599-6913)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (11-351)||(28534-28875)
scaffold0064 (11-351)||(40525-40866)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-395)||(50270-50664)
scaffold0028 (10-354)||(43351-43695)
scaffold0028 (65-318)||(8718-8971)
scaffold0028 (65-240)||(15258-15433)
scaffold0028 (103-395)||(106431-106723)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-330)||(19070-19399)
scaffold0090 (1-330)||(23232-23561)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (47-384)||(180384-180721)
scaffold0020 (13-157)||(101320-101464)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (155-395)||(4912-5152)
scaffold0249 (10-159)||(1737-1886)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (11-327)||(24837-25153)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (10-354)||(14557-14901)
scaffold0044 (10-318)||(853-1161)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (11-338)||(10506-10832)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (161-395)||(4047-4281)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (13-330)||(12745-13062)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (10-330)||(8011-8331)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (10-395)||(9126-9511)
scaffold0507 (107-240)||(216-349)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (180-395)||(1104-1319)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-354)||(14844-15188)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (10-174)||(5063-5227)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (10-330)||(32517-32837)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-329)||(15099-15427)
scaffold0040 (10-99)||(113252-113341)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (10-276)||(12762-13028)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (10-324)||(229270-229584)
scaffold0012 (10-395)||(219182-219567)
scaffold0012 (266-338)||(33016-33088)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (10-123)||(41347-41460)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-330)||(25484-25804)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (50-330)||(65626-65906)
scaffold0042 (18-330)||(39592-39904)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (10-330)||(63796-64116)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (10-330)||(126964-127284)
scaffold0022 (10-69)||(80259-80318)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (10-120)||(2640-2750)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (71-192)||(136269-136390)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-329)||(898-1226)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (10-318)||(6247-6555)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (50-330)||(4210-4490)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-318)||(7172-7480)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (50-330)||(8817-9097)
scaffold0109 (50-354)||(33378-33682)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (11-330)||(4220-4539)
scaffold0023 (11-159)||(130540-130688)
scaffold0023 (10-240)||(59065-59295)
scaffold0023 (65-159)||(134634-134728)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (10-324)||(1366-1680)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (10-336)||(629-955)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (10-324)||(22094-22408)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-119)||(33075-33193)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (24-324)||(86283-86583)
scaffold0007 (10-237)||(46542-46769)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (11-354)||(7594-7937)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (10-108)||(11433-11531)
scaffold0149 (10-101)||(7002-7093)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (13-237)||(6363-6587)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (10-225)||(1234-1449)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (10-237)||(10-237)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (233-395)||(14241-14403)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (15-216)||(8098-8299)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (65-318)||(7610-7863)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (10-330)||(459-779)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (10-336)||(588-914)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-330)||(15876-16205)
scaffold0333 (254-330)||(15713-15789)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (10-323)||(5449-5762)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (10-330)||(4253-4572)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-237)||(1313-1540)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-324)||(116670-116984)
scaffold0037 (143-338)||(98228-98423)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (78-375)||(178-475)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (26-330)||(5372-5676)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (10-330)||(16181-16501)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (104-336)||(639-871)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (143-338)||(23607-23802)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (10-216)||(6-212)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (10-304)||(49740-50034)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (10-159)||(197243-197392)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (50-237)||(1579-1766)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (269-394)||(348-473)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (10-159)||(18970-19119)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-330)||(3361-3690)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (167-395)||(16387-16615)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (103-366)||(3733-3996)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (103-338)||(13121-13356)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (103-338)||(46367-46602)
scaffold0066 (13-84)||(68359-68430)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (105-324)||(71446-71665)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (11-237)||(9657-9883)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (10-120)||(3579-3689)
scaffold0375 (261-336)||(3735-3810)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (11-97)||(4884-4970)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (10-99)||(4864-4953)
scaffold0761 (152-338)||(293-479)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (138-375)||(3837-4074)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (88-330)||(17208-17450)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (103-240)||(7479-7616)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (10-119)||(19767-19876)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (107-375)||(3335-3603)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (103-338)||(14870-15104)
scaffold0132 (107-338)||(43751-43982)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (103-336)||(912-1145)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (106-321)||(14367-14582)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (144-338)||(14736-14930)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (89-159)||(33952-34022)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (45-338)||(25957-26250)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (103-192)||(8-97)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (114-338)||(1293-1517)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (167-338)||(8813-8984)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (323-395)||(4217-4289)
scaffold0574 (1-39)||(965-1003)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (284-395)||(10511-10622)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (143-238)||(28164-28259)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (103-192)||(18410-18499)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (12-61)||(25464-25513)


Alignment Details
Target: scaffold0060 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43324 - 42939
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43324 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 43225  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43224 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgctggtttg 43125  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43124 agtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 43025  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  43024 gaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtg 42939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 23080024 - 23080418
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23080024 tcatcctcagacagatggttagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 23080123  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23080124 ctaccgttgatagagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctctat 23080223  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23080224 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcatgagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 23080323  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23080324 gattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtg 23080418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22381621 - 22381238
Alignment:
Q  12 cagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22381621 cagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgat 22381522  T
Q  112 agagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgag 211  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22381521 tgagttcacatataacaacagctatcactcgagtataggtatggcactattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgag 22381422  T
Q  212 tcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacaga 311  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22381421 tcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaga 22381322  T
Q  312 agagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22381321 agagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtg 22381238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22503102 - 22502718
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  22503102 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattga 22503003  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22503002 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggcatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttga 22502903  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22502902 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacag 22502803  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22502802 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 22502718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 14886936 - 14887320
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  14886936 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 14887035  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14887036 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 14887135  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14887136 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 14887235  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14887236 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 14887320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 37545441 - 37545826
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  37545441 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 37545540  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545541 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcactgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 37545640  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37545641 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 37545740  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatg-tttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37545741 aacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtg 37545826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20342705 - 20342321
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  20342705 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 20342606  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20342605 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctagtttga 20342506  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20342505 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 20342406  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  20342405 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtg 20342321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 22235864 - 22236249
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22235864 gacagatggtcagtcggagaggatgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 22235963  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22235964 atagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttattctggtttg 22236063  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||| | || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  22236064 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccggagttggttcatcagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22236163  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22236164 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 22236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25848498 - 25848114
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  25848498 acagatggtcagtcggagagaacaattcaatcattggaagatttgttgaggatgtgtatgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 25848399  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25848398 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 25848299  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25848298 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 25848199  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  25848198 aagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctttgacgggtg 25848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 17269268 - 17269662
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17269268 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 17269367  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  17269368 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 17269467  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17269468 gttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 17269567  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  17269568 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtg 17269662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 24798342 - 24798726
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   || ||||    
T  24798342 acagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggaggagcttgggacagtcacttgcctttga 24798441  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24798442 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 24798541  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24798542 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcacgagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgagagcttcgcagagtcgacag 24798641  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24798642 aagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 24798726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 24749498 - 24749883
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24749498 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 24749597  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24749598 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 24749697  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||||  | || |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  24749698 agtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 24749797  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||    
T  24749798 gaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtg 24749883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22462376 - 22461991
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  22462376 gacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattg 22462277  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22462276 atagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcg 22462177  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  22462176 agtcgggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcatgaaactacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22462077  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22462076 aaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtg 22461991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 21890704 - 21891088
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21890704 acagatggtcagtcagagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgcacttgagcaacgtggagcttgggatactcacctaccgttga 21890803  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  21890804 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtacaagactccattatgttggtttga 21890903  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  21890904 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatag 21891003  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21891004 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtg 21891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20821873 - 20821492
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  20821873 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 20821774  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    |  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  20821773 aactcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtc 20821674  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20821673 gggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 20821574  T
Q  314 agttaccatgacaagcg-gagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||||||||  |||||| | || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20821573 agctaccatgacaagcgtaagaaagac-cttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtg 20821492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Original strand, 28923716 - 28924097
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28923716 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 28923815  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28923816 aattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtc 28923915  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  28923916 gggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 28924015  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || ||||||||||| || || |  || || |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28924016 agctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtg 28924097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Original strand, 28894890 - 28895271
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28894890 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagtgaatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 28894989  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28894990 aattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtc 28895089  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  28895090 gggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 28895189  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || ||||||||||| || || |  || || |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28895190 agctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtg 28895271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20774179 - 20773801
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  20774179 gatggtcagtcggagaggac-atccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 20774081  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  20774080 aattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaagactcctttatgttggttcgagtc 20773981  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20773980 gggagaaaatgttgttttgggaccggaattggttcatgagactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 20773881  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacggg 393  Q
    || || |||||||||||  | || |  ||  |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20773880 agctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttcaggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacggg 20773801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 395
Target Start/End: Original strand, 24735657 - 24735940
Alignment:
Q  112 agagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgag 211  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735657 agagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgag 24735756  T
Q  212 tcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacaga 311  Q
    || | ||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||||  | || |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  24735757 tcggaagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacaga 24735856  T
Q  312 agagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||    
T  24735857 agagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtg 24735940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 972 - 1150
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  972 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgttg 1071  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23574184 - 23573864
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  23574184 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 23574085  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23574084 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 23573985  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  23573984 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 23573885  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  23573884 aaagagttatcatgataagcg 23573864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 21339230 - 21339550
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  21339230 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagagaacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 21339329  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| ||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  21339330 atagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 21339429  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| | |||||||| |||    
T  21339430 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgaca 21339529  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21339530 aaagagttatcatgataagcg 21339550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16356944 - 16356618
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16356944 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16356845  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16356844 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16356745  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  16356744 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 16356645  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16356644 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 16356618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34566936 - 34566610
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  34566936 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 34566837  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  34566836 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 34566737  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  34566736 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 34566637  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  34566636 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 34566610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 21563922 - 21564119
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||   |||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21563922 atggtcagtcggagaaagcgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgataga 21564021  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21564022 gttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagt 21564119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 318
Target Start/End: Original strand, 21831724 - 21831995
Alignment:
Q  47 gaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagta 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||| ||||    
T  21831724 gaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttacctttctagta 21831823  T
Q  147 ttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggt 246  Q
    | || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  | ||    
T  21831824 taggaatgacaccatttgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggatattgt 21831923  T
Q  247 tcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagtta 318  Q
    |||  |||||||  | || |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21831924 tcaccagactacataaaaggttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagtta 21831995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19770402 - 19770076
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19770402 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19770303  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  19770302 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19770203  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  19770202 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 19770103  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19770102 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 19770076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23516983 - 23516657
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||    
T  23516983 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttg 23516884  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  23516883 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttggtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 23516784  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23516783 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 23516684  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23516683 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 23516657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 37291440 - 37291754
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  37291440 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 37291539  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  37291540 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 37291639  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| ||||||| || |||    
T  37291640 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgaca 37291739  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  37291740 aaagagttatcatga 37291754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 26738649 - 26738975
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  26738649 gacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 26738748  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  || |||| |||| ||| |||||||  ||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||||| |    
T  26738749 atagagttcacgtacaataacagttattattccagtaatggaatggcacaatttaaggctttgtatggttggagatgcagaactccattgtgttggttcg 26738848  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | || ||  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26738849 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 26738948  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26738949 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 26738975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27518849 - 27518523
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  27518849 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccgttg 27518750  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27518749 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27518650  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  27518649 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 27518550  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27518549 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 27518523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40709222 - 40708896
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  40709222 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 40709123  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  40709122 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 40709023  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  40709022 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 40708923  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40708922 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 40708896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22135107 - 22134766
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||  | ||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  22135107 agatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagagaatttgttgagaatttttgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 22135008  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  22135007 gagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagt 22134908  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  22134907 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 22134808  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  22134807 gagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcagga 22134766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 23442414 - 23442622
Alignment:
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23442414 caggactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaag 23442513  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctt 386  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| || ||||||     
T  23442514 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactccta 23442613  T
Q  387 tgacgggtg 395  Q
    |||||||||    
T  23442614 tgacgggtg 23442622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27610796 - 27610470
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |  ||||||    
T  27610796 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggagggacttgggacagtcatcttccgttg 27610697  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27610696 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27610597  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||||||  ||||||||| |||    
T  27610596 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgaca 27610497  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27610496 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 27610470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 27668434 - 27668760
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  27668434 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 27668533  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27668534 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27668633  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  27668634 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 27668733  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27668734 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 27668760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20799202 - 20798882
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  20799202 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 20799103  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20799102 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 20799003  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||||  |  | |||||  |||||||| |||| |||||||||||    || || |||||||| ||||| |||| |||    
T  20799002 agtcaggagaaagagaggtcttaggaccaaagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgaca 20798903  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  20798902 aaagagttatcatgataagcg 20798882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 21497983 - 21498300
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  21497983 agatggtcagccggagagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgata 21498082  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||    
T  21498083 gagttcacgtaaaataaaagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagt 21498182  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  21498183 caggtgaaagtgtggttttaggacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 21498282  T
Q  313 gagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21498283 gagttaccatgataagcg 21498300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 21984249 - 21984569
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |   | |||    
T  21984249 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcattg 21984348  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  21984349 atagagttcacgtacaataatagtaatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttg 21984448  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  21984449 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 21984548  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     || ||||| ||||| |||||    
T  21984549 aaaaagttatcatgataagcg 21984569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23471671 - 23471456
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  23471671 gacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaagggggaacttgggatagtcatctcccatta 23471572  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23471571 atagagttcacgtacaataacagctatcattctagtattggaatggcaccttttgatgctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 23471472  T
Q  210 agtcaggagagagtgt 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23471471 agtcaggtgagagtgt 23471456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Original strand, 24716470 - 24716577
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24716470 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 24716569  T
Q  110 atagagtt 117  Q
    ||||||||    
T  24716570 atagagtt 24716577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 27685345 - 27685664
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  27685345 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 27685444  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  27685445 tcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatgacacctttcgaggccttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 27685544  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || |  |||||||| |||||||||| |||     
T  27685545 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 27685644  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  27685645 aagagttatcatgataagcg 27685664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 14999688 - 14999997
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||| ||    
T  14999688 atggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaatttgggatagtcatcttccgttgatcga 14999787  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    ||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14999788 gttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgagactttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 14999887  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  14999888 ggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 14999987  T
Q  315 gttaccatga 324  Q
    |||| |||||    
T  14999988 gttatcatga 14999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 29476017 - 29476361
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  29476017 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattttttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 29476116  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  29476117 atcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 29476216  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| | ||||||  ||||||    || || ||||| || || |||| || |||    
T  29476217 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgaca 29476316  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  29476317 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 29476361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 24620239 - 24620342
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24620239 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 24620338  T
Q  110 atag 113  Q
    ||||    
T  24620339 atag 24620342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 20468040 - 20468354
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  20468040 gacagatggccagtctgaaaggatgattcagtcgttggaggacttgttgagattttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 20468139  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  20468140 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgcatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcg 20468239  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||  |  | |||||  | |||||| |||| |||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||  ||     
T  20468240 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgact 20468339  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
    ||||||||| |||||    
T  20468340 gaagagttatcatga 20468354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41771284 - 41770958
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  41771284 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 41771185  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||| |||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  41771184 atcgagctcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 41771085  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || || ||||||| |||    
T  41771084 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgaca 41770985  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41770984 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 41770958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18776212 - 18775873
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||       |||    
T  18776212 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaactttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtca-------ttg 18776120  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18776119 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 18776020  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || |  |||||||| ||| |||||| |||    
T  18776019 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgaca 18775920  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggagg 356  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||||||||    
T  18775919 aaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggagg 18775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25423631 - 25423311
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |  || |||    
T  25423631 gacagatggtcagacagagaagacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaactagggatagtcatcttccattg 25423532  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  25423531 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 25423432  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||  |  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25423431 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 25423332  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  25423331 aaagagttaccatgataagcg 25423311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 22332834 - 22333157
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  22332834 agatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttcagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 22332933  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||| | || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22332934 gagttcacagacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 22333033  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||||   ||||||    || || ||||| || ||||||| || ||| ||    
T  22333034 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaa 22333133  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||    
T  22333134 gagttatcatgataagcgtagaaa 22333157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23440667 - 23440347
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||    
T  23440667 gacagatggtcagtcggagagaaaaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccattg 23440568  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  23440567 attgagtttacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttcaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 23440468  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| |||||| || ||||| |||  ||| ||  | |||||  | |||||| |||||||||| |||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  23440467 agttaggagaaagagtggtcttaaaaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 23440368  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  23440367 aaagagttatcatgataagcg 23440347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 28916361 - 28916517
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28916361 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 28916460  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 170  Q
    | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28916461 aattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctt 28916517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22348865 - 22348599
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  |  | ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  22348865 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctcaatgatttgttggggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 22348766  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  22348765 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttg 22348666  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    ||||||| || || || || |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    
T  22348665 agtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 22348599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21405264 - 21404942
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |   | |||    
T  21405264 gacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcattg 21405165  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagc--tttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtt 207  Q
    || |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||     
T  21405164 atcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgtgttgtatggtcggagatgcagaacttcgttgtgttggta 21405065  T
Q  208 tgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaa 307  Q
    |||||| || |||| |||| |  | ||||| ||| | |||||  |||||||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||| |  || ||||||  |    
T  21405064 tgagtccggtgagattgtgatactgggaccagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagtaga 21404965  T
Q  308 cagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  21404964 caaaagagttatcatgataagcg 21404942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21496579 - 21496493
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21496579 agatggtcagtaggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtca 21496493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 333
Target Start/End: Original strand, 11210731 - 11210961
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||   |||||| |||||||| ||| ||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||  | || ||     
T  11210731 accgttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgt 11210830  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  | || || ||||||||  | ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||    
T  11210831 tggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcaga 11210930  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggag 333  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  11210931 gtagacagaagagttatcatgataagaggag 11210961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24581542 - 24581307
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  24581542 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 24581443  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || || ||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  24581442 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaaccacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 24581343  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24581342 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 24581307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23503741 - 23503539
Alignment:
Q  136 tcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||| || || ||||   ||||||||    
T  23503741 tcattctagtgtcggtatggctccgtttaaggctttgtatggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagtgctttgttagga 23503642  T
Q  236 ccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaa 335  Q
    |||||  |||| || ||||||||  | || |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  23503641 ccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 23503542  T
Q  336 agg 338  Q
    |||    
T  23503541 agg 23503539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 21937225 - 21937460
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  21937225 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 21937324  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||| || |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  21937325 tggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 21937424  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21937425 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 21937460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 21229232 - 21229305
Alignment:
Q  125 aacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccttt 198  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21229232 aacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactccttt 21229305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27011415 - 27011180
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  27011415 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 27011316  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  27011315 tggtttgagttcggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 27011216  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  27011215 gtagacataagagttatcatgataagaggaggaagg 27011180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Original strand, 21680429 - 21680499
Alignment:
Q  89 tgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  21680429 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 21680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 395
Target Start/End: Original strand, 24737015 - 24737114
Alignment:
Q  296 tcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||    
T  24737015 tcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtg 24737114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 249163 - 248769
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249163 tcatcctcagacagatggtcagtctgagaggacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 249064  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||| |||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  249063 ctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttat 248964  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  248963 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgaacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 248864  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  248863 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtg 248769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13021866 - 13021474
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13021866 tcatcctcagacagatggttagtcggagaggactatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggataatcac 13021767  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13021766 ctactgttgatagagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctat 13021667  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13021666 gttggtttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 13021567  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacggg 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13021566 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacggg 13021474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12456202 - 12455817
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12456202 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggaattgttgacagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgctg 12456103  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12456102 atagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggtaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 12456003  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12456002 agtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggtacatgagactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 12455903  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12455902 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 12455817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 16950211 - 16950605
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  16950211 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagtatggaatagtcac 16950310  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16950311 ctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 16950410  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16950411 gctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgca 16950510  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16950511 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtg 16950605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6414020 - 6413626
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6414020 tcatcctcagacagaaggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggggcttgggatagtcac 6413921  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6413920 ctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 6413821  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6413820 gctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgca 6413721  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6413720 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtg 6413626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1541
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1147 tcatcctcagacagatggttagtcggaaaagacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 1246  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1247 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcagaggtgaaggactcctttat 1346  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1347 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcaca 1446  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||    
T  1447 gattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtg 1541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14130382 - 14129999
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14130382 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcac 14130283  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14130282 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttat 14130183  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14130182 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 14130083  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||    
T  14130082 gagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactcc 14129999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 8211868 - 8212262
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8211868 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcac 8211967  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
       || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8211968 ttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcgccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 8212067  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8212068 gctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgca 8212167  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8212168 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 8212262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14434190 - 14433817
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14434190 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccattga 14434091  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14434090 tagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttga 14433991  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14433990 gtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 14433891  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||    
T  14433890 aaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactcc 14433817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 11306013 - 11306397
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  11306013 acagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttacctttga 11306112  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11306113 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 11306212  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11306213 gtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 11306312  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11306313 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 11306397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12457288 - 12456940
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12457288 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttattgagagtgtctgtgcttgagcaaggtggaacttgagatagtcac 12457189  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12457188 ctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttat 12457089  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12457088 gctagtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttcataagagaaaagatgaaagcttcgca 12456989  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagttt 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  12456988 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 49152797 - 49152416
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |    
T  49152797 gatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtatgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattg 49152698  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49152697 agtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 49152598  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49152597 gggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaag 49152498  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49152497 agttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 49152416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 26118355 - 26118739
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  26118355 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 26118454  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26118455 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 26118554  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26118555 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacag 26118654  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26118655 aagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 26118739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 14286116 - 14286499
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14286116 tcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 14286215  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14286216 ctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgt 14286315  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14286316 gctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgta 14286415  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  14286416 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactcc 14286499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 15102352 - 15102735
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15102352 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 15102451  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15102452 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggttcg 15102551  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||    
T  15102552 agtcaggagagagtgt--tgttgggaccggatttgattcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgaca 15102649  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  15102650 aaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtg 15102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15340940 - 15340575
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15340940 tcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatcaaataattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcac 15340841  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || |||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15340840 ctaccattgatagagttcacctacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactccgttat 15340741  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  15340740 gctagtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagctgataagggaaaagatgaaagcgtcaca 15340641  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgt 366  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15340640 gagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgt 15340575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 14263994 - 14264378
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  14263994 acagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgttagaggatttgatgagagtgtctgtactcgagcaaggtggagcttgggatagtcatctactgttga 14264093  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14264094 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttga 14264193  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14264194 gtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcatcagactacgaagaatgtcaagatgataagcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 14264293  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  14264294 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtg 14264378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19147710 - 19147326
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19147710 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagcaaggtggagcttggaatagtcacctaccgttga 19147611  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19147610 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttga 19147511  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19147510 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 19147411  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||    
T  19147410 aagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtg 19147326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20747109 - 20746725
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20747109 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagcaaggtggagcttggaatagtcacctaccgttga 20747010  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20747009 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttga 20746910  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20746909 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 20746810  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||    
T  20746809 aagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtg 20746725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 18053693 - 18054087
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18053693 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 18053792  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  18053793 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgagggtgcaggactccgttgt 18053892  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  18053893 gttggttcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 18053992  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||    
T  18053993 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtg 18054087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 16072044 - 16072428
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  16072044 acagatggtcagtcagagaggacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctatggttga 16072143  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  16072144 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggcgcataactcctttatgttggtttga 16072243  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| | ||||||   |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16072244 gtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgtcagactatggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 16072343  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16072344 aagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtg 16072428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13666037 - 13665663
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13666037 gacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 13665938  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13665937 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggggcatgactcctttatgctggtttg 13665838  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||| | ||||           | ||||||| | |||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  13665837 agtcaggagagagttttgtgt-----------tgggttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 13665749  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13665748 gaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 13665663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 23199483 - 23199877
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23199483 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 23199582  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  23199583 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgt 23199682  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  23199683 gttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcaca 23199782  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  23199783 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 23199877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 23505610 - 23506004
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23505610 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 23505709  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  23505710 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgt 23505809  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  23505810 gttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcaca 23505909  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  23505910 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 23506004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 296
Target Start/End: Original strand, 13968418 - 13968703
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  13968418 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 13968517  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13968518 ttgggttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtatgactcctttatgctggtttga 13968617  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagctt 296  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  13968618 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcagattgataagggaaaagatgaaagctt 13968703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 11388168 - 11388561
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11388168 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 11388267  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  11388268 ctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgttcgaaggtgcagaactcctttgt 11388367  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||||  | || |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  11388368 gttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgca 11388467  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  11388468 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaagagga-gatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 11388561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 12206550 - 12206877
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12206550 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccgttga 12206649  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12206650 tagagttcacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatgatcggaggtgcaatactccgttatgttggtttga 12206749  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||||||  | |||||  |||||||  | || || ||  ||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||     
T  12206750 gtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcagcagactacagaaaaggtcaaattgataaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 12206849  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  12206850 aagagttatcatgacaagtgtagaaagg 12206877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8199127 - 8198801
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  8199127 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 8199028  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  8199027 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 8198928  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  8198927 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 8198828  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8198827 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 8198801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 44791122 - 44791448
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  44791122 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 44791221  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  44791222 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 44791321  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  44791322 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 44791421  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  44791422 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 44791448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12688000 - 12687656
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  12688000 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 12687901  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  12687900 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 12687801  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || ||  |||| |||||||| ||  | || ||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  12687800 agtcaggtgaaagaatggtcttaggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 12687701  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||||||    
T  12687700 aaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagga 12687656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14955119 - 14954775
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14955119 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14955020  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  14955019 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 14954920  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | || ||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  14954919 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14954820  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||    
T  14954819 aaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcagga 14954775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10871494 - 10871168
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  10871494 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 10871395  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  10871394 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 10871295  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  10871294 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 10871195  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10871194 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 10871168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8708104 - 8707784
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  8708104 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 8708005  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  8708004 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 8707905  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  8707904 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 8707805  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  8707804 aaagagttatcatgataagcg 8707784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 18551529 - 18551849
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  18551529 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 18551628  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  18551629 attgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 18551728  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  18551729 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 18551828  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  18551829 aaagagttatcatgataagcg 18551849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 17087 - 17428
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||    
T  17087 gacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcagtttccgttg 17186  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||     
T  17187 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttc 17286  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  17287 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 17386  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     || ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  17387 aaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 17428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9596556 - 9596236
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  9596556 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 9596457  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || || |||||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||| | || || |||||||    
T  9596456 atcgagttcacatacaataatagtcatcattctattattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttg 9596357  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||  ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  9596356 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 9596257  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  9596256 aaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18178241 - 18177897
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  18178241 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatctgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 18178142  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18178141 atcgagttcacatacaataatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 18178042  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  18178041 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 18177942  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  18177941 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 18177897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 15160829 - 15161148
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  15160829 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 15160928  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15160929 tcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 15161028  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || |  |||||||| |||||||||| |||     
T  15161029 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 15161128  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  15161129 aagagttatcatgataagcg 15161148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 23516543 - 23516866
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||||     
T  23516543 agatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagagcatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatc 23516642  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  23516643 gagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgccggtttgagt 23516742  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||  ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| ||| ||    
T  23516743 caggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaa 23516842  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||    
T  23516843 gagttatcatgataagcgtagaaa 23516866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13686562 - 13686243
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  13686562 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 13686463  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  13686462 tcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttga 13686363  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || |  |||||||| |||||||||| |||     
T  13686362 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaa 13686263  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  13686262 aagagttatcatgataagcg 13686243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14332896 - 14332570
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14332896 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttattgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14332797  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  14332796 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 14332697  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | | |||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  14332696 aataaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14332597  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| || || ||||| |||||    
T  14332596 aaagagttatcacgataagcgtagaaa 14332570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 395
Target Start/End: Original strand, 26288041 - 26288170
Alignment:
Q  265 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  26288041 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcat 26288139  T
Q  365 gtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26288140 gtttttctgagggttactcctatgacgggtg 26288170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15204378 - 15204058
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |  ||||||    
T  15204378 gacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttggaatagtcatcttccgttg 15204279  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||| ||| || |||||  ||||||||| |||||| |||||||| || || ||||| |    
T  15204278 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggaaccatttgaagcgctgtatggtcagaggtgtaggactccgttgtgttggttcg 15204179  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| ||| || ||||| || || ||||| || || |||||  | |||||  |||| |||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15204178 agtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 15204079  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  15204078 aaagagttatcatgataagcg 15204058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Original strand, 11552876 - 11553217
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |   | ||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  11552876 agatggacagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgaggatccgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 11552975  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  11552976 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 11553075  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||  ||| ||    
T  11553076 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa 11553175  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||    
T  11553176 gagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcagga 11553217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15625050 - 15624732
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |  | |||||    
T  15625050 acagatggtcagtcggaaagaacaatccagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagcatggaggaacttgggatagtcatcttctgttga 15624951  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || || |||||  ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  15624950 tagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattagaatgacaccattcgaagcactgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcga 15624851  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| ||||||||  | || ||||| ||  | |||||| | |||||| |||| |||||| ||||    || ||||||||||| |||||||||| | ||    
T  15624850 gtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaactacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatag 15624751  T
Q  311 aagagttaccatgacaagc 329  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  15624750 aagagttatcatgataagc 15624732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 15154428 - 15154749
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  15154428 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcaatcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 15154527  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  15154528 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattgggatggcaccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 15154627  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||   ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||  || | ||||| |||    
T  15154628 agtcaggtgaaagagtggtcttagga---ga--ttgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgaca 15154722  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15154723 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 15154749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 11236984 - 11237211
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  11236984 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 11237083  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  11237084 atcgagttcacatacaataatagttaccattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttg 11237183  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  11237184 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 11237211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14040195 - 14039980
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  14040195 gacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 14040096  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  14040095 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttg 14039996  T
Q  210 agtcaggagagagtgt 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14039995 agtcaggtgagagtgt 14039980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14350225 - 14350010
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  14350225 gacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 14350126  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  14350125 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttg 14350026  T
Q  210 agtcaggagagagtgt 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14350025 agtcaggtgagagtgt 14350010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 351
Target Start/End: Original strand, 35964655 - 35964962
Alignment:
Q  44 ttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcga 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |  ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||| |    
T  35964655 ttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatcgagttcacttataataacagttaccattcta 35964754  T
Q  144 gtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggactt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||| || || ||||| ||  | ||||| ||| |    
T  35964755 gtattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtctggcgatagtgtagtactgggaccagacat 35964854  T
Q  244 ggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcacta 343  Q
     |||||  | |||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||     
T  35964855 tgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatctt 35964954  T
Q  344 gagtttca 351  Q
    ||||||||    
T  35964955 gagtttca 35964962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 11772003 - 11772332
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||     
T  11772003 tcatctgcagacagatggttagtcggaaaaaacgattcagtcattggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagaaacttgggatagtcat 11772102  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  || |||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||  | |||||||| ||| | || |    
T  11772103 cttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttaaggctttgtgtggaagaaggtgcagaacttcgttgt 11772202  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||| ||||||| | ||| |    
T  11772203 gttgatttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccggaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgta 11772302  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  11772303 gagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 11772332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21662460 - 21662119
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||  || |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  21662460 gacagatggatagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaagggggatcttgggatagtcatcttccatta 21662361  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| || || || ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||   ||    
T  21662360 atcgagttcacttacaataatagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgtgatg 21662261  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || |||||||||||  | ||||| ||| | |||||  |||||| | | || |||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||  |||    
T  21662260 agtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagaca 21662161  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  21662160 aaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 21662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7824306 - 7824071
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  7824306 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 7824207  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||| || |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  7824206 tggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 7824107  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  7824106 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 7824071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 21674397 - 21674632
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||  | || ||     
T  21674397 accgttgattgaatttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaagacaacgttgtgt 21674496  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | |||  |||||||||    || ||||||||||| || || |    
T  21674497 tggtttgagtcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatataagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaa 21674596  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21674597 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 21674632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 27107638 - 27107873
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  27107638 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 27107737  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||| || |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  27107738 tggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 27107837  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27107838 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 27107873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 338
Target Start/End: Original strand, 12368473 - 12368675
Alignment:
Q  136 tcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||   |||| |||    
T  12368473 tcattctagtattggtatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggttcgaatccggagaaagtgctttgtttgga 12368572  T
Q  236 ccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaa 335  Q
    |||||  | || || |||||||| || || |||||||||||    || || ||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  12368573 ccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 12368672  T
Q  336 agg 338  Q
    |||    
T  12368673 agg 12368675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12193962 - 12193849
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||  |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||     
T  12193962 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattaaagtatcagtatgacaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttgtgt 12193863  T
Q  203 tggtttgagtcagg 216  Q
    |||| |||||||||    
T  12193862 tggtatgagtcagg 12193849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14936753 - 14936481
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | || ||     
T  14936753 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgt 14936654  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| ||||| ||  |||   |||||||||||||  | || ||  | ||||   | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||    
T  14936653 tggtttgaatcaggtgaaggtgctttgttaggaccggaagttgtgcaataaactaaggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaga 14936554  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  14936553 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 14936481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45146961 - 45146746
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||    ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  45146961 accgttgattgagtttacttacaacaacagtttgcattctagtatcggtatgacaccgttggaggctctgtatggtcggaggtgtaggacgccattgtgt 45146862  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| ||||| || ||||   ||||||||||| |  |  | || ||||||||  | || |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||    
T  45146861 tggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaggttatgcaagagactacggaaaatgttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcaga 45146762  T
Q  303 gtcaacagaagagtta 318  Q
    || || ||||||||||    
T  45146761 gtaaatagaagagtta 45146746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15364346 - 15364257
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggac 192  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15364346 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggac 15364257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17924069 - 17923986
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    |||||||||  |||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17924069 accgttgattaagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctctgtatggtcggaggtg 17923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13353509 - 13353384
Alignment:
Q  151 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcat 250  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||  | || || |||| ||||||||| || ||||   |||||||||||||  | || ||     
T  13353509 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaa 13353410  T
Q  251 gagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    |||||||| || || |||||||||||    
T  13353409 gagactacgaaaaaggttaagatgat 13353384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14038099 - 14037986
Alignment:
Q  217 agagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagt 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  14038099 agagagtgtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagt 14038000  T
Q  317 taccatgacaagcg 330  Q
    || ||||| |||||    
T  14037999 tatcatgataagcg 14037986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14348129 - 14348016
Alignment:
Q  217 agagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagt 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  14348129 agagagtgtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagt 14348030  T
Q  317 taccatgacaagcg 330  Q
    || ||||| |||||    
T  14348029 tatcatgataagcg 14348016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23641818 - 23641702
Alignment:
Q  208 tgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaa 307  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  | || || |||||||| ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||| || |||| | |     
T  23641818 tgagttaggagagagtgttttgttaggaccgaaagttgtgcacgagactacgaagaaagttcagatgattcaggataagatgaaagcgtctcagaataag 23641719  T
Q  308 cagaagagttaccatga 324  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  23641718 cagaagacttatcatga 23641702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 22061629 - 22062023
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22061629 tcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggagtatttgttgagagtgtgtgtgcttgaggaaggtggagcttgggatagtcac 22061728  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061729 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 22061828  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  22061829 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgca 22061928  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22061929 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtg 22062023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 31416670 - 31417064
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31416670 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 31416769  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31416770 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttat 31416869  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31416870 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaaggtgaaagcgtcgca 31416969  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31416970 gagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtg 31417064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 29303622 - 29304016
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29303622 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggatgatttgttaagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagccac 29303721  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29303722 ctaccgttgatagagttcacttataacaacaactatcattcgagtataggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 29303821  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29303822 gctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 29303921  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  29303922 gagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtg 29304016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 803879 - 804263
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  803879 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttacctttga 803978  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  803979 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 804078  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  804079 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactactaagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 804178  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  804179 aaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 804263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6679686 - 6679302
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  6679686 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 6679587  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6679586 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 6679487  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6679486 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 6679387  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6679386 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 6679302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12305333 - 12304949
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  12305333 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacatgccattga 12305234  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305233 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagcattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggacccctttatgctggtttga 12305134  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12305133 gtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 12305034  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12305033 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtg 12304949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6604233 - 6603849
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  6604233 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttacctttga 6604134  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  6604133 ttgagtttacgtataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttga 6604034  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6604033 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 6603934  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6603933 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 6603849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14565717 - 14565333
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  14565717 acagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 14565618  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14565617 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 14565518  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14565517 gtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcacgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 14565418  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14565417 aaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 14565333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1266813 - 1266430
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1266813 acagatggtcggtcggagaggacgatccaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattga 1266714  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1266713 tagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcaggactcctttgtgctagtttga 1266614  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  1266613 gtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgag-aaggtaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 1266515  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1266514 aagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccgatgacgggtg 1266430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23655503 - 23655118
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  23655503 gacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcctgggacagtcacctaccgttg 23655404  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23655403 atagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttg 23655304  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |    
T  23655303 agtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgata 23655204  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23655203 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtg 23655118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22051448 - 22051054
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22051448 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcgttggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcac 22051349  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| || ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22051348 ctaccatttatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttat 22051249  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22051248 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcaacagacgacagagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 22051149  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||||||    
T  22051148 gagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggtg 22051054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 31571038 - 31571432
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31571038 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 31571137  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31571138 ctaccattgatagagttcacctacaacaatagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 31571237  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  31571238 gttggttcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 31571337  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||    
T  31571338 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtg 31571432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Original strand, 16271430 - 16271738
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  16271430 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 16271529  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16271530 ttgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgc 16271629  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16271630 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 16271729  T
Q  311 aagagttac 319  Q
    | |||||||    
T  16271730 aggagttac 16271738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21840988 - 21840618
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  21840988 atggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctatcgttgataga 21840889  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
     ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||     
T  21840888 attcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcg 21840789  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  21840788 ggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaata 21840689  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcct 385  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||||||    
T  21840688 gttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcct 21840618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19851986 - 19851605
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19851986 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggtatagtcatctaccgttga 19851887  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  19851886 tagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttga 19851787  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19851786 gtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacag 19851687  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  19851686 aagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacgg 19851605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19858022 - 19857641
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19858022 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggtatagtcatctaccgttga 19857923  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  19857922 tagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttga 19857823  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19857822 gtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacag 19857723  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  19857722 aagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacgg 19857641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 395
Target Start/End: Original strand, 20010107 - 20010490
Alignment:
Q  12 cagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgat 111  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20010107 cagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgat 20010206  T
Q  112 agagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgag 211  Q
    ||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20010207 agagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaaactttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgag 20010306  T
Q  212 tcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacaga 311  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| || || |||||| ||||||   |||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20010307 tcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcatcagactatagagaaggtccagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaga 20010406  T
Q  312 agagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||  |||||||||    
T  20010407 agagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgatgacgggtg 20010490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 20975856 - 20976077
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20975856 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactttagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 20975955  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20975956 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 20976055  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgtt 231  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20976056 agtcaggagagagtgttgtgtt 20976077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20388674 - 20388334
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20388674 acagatggtcagtcggagagaaagattcagtcgttagaggattttttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 20388575  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||  || ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  20388574 tagagttcatgtacaacaacagttaccattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactccgttgtgttggtttga 20388475  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||  | | ||| ||||| ||||  ||  | |||||| ||||||| || || || ||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||     
T  20388474 gtcgggttaaaatgtagtgttgggacgagatatagttcatcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacat 20388375  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  20388374 aagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttca 20388334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 395
Target Start/End: Original strand, 21324803 - 21324999
Alignment:
Q  199 atgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcg 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  21324803 atgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcg 21324902  T
Q  299 cagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21324903 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 21324999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15533953 - 15533636
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  15533953 agatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 15533854  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  15533853 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagt 15533754  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||||||| ||||||   || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15533753 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 15533654  T
Q  313 gagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  15533653 gagttatcatgataagcg 15533636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19978543 - 19978202
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19978543 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagatttagtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19978444  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || ||||   ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||    
T  19978443 atagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcacctttggaggctttatatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19978344  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19978343 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 19978244  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||    
T  19978243 aaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttca 19978202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 20396321 - 20396674
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||     
T  20396321 tcatctgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgcgacttgggatagtcat 20396420  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  ||||||||||||||||| || || ||||   ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  20396421 cttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactccgttgt 20396520  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || || ||||  ||  | |||||  | |||||| |||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||    
T  20396521 gttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgggactagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgca 20396620  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  20396621 gagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcagga 20396674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16408250 - 16408570
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16408250 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16408349  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| || || |||||||    
T  16408350 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgttggtttg 16408449  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||  |||||||||| |||    
T  16408450 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgaca 16408549  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16408550 aaagagttatcatgataagcg 16408570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32600720 - 32600376
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  32600720 gacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgttataggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 32600621  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||     
T  32600620 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttc 32600521  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
     |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||| |||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  32600520 ggtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 32600421  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||||||    
T  32600420 gaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagga 32600376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 20017955 - 20018281
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  20017955 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 20018054  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20018055 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 20018154  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  20018155 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 20018254  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20018255 aaagagttatcatgacaagcgtagaaa 20018281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 395
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682060
Alignment:
Q  191 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  291 aagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgac 390  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  391 gggtg 395  Q
    |||||    
T  21682056 gggtg 21682060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20008263 - 20008041
Alignment:
Q  173 tatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaaga 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||  |||| || ||||    
T  20008263 tatggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaaga 20008164  T
Q  273 tgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttct 372  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  20008163 tgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttct 20008064  T
Q  373 gagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||| ||||||||| |||||||||    
T  20008063 gagagttactcctatgacgggtg 20008041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23949492 - 23949176
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  23949492 agatggtcagtcggaaataacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgata 23949393  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  23949392 gagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaagctctatatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagt 23949293  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||  | ||| |  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  23949292 caggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agcaaactactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 23949194  T
Q  313 gagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  23949193 gagttatcatgataagcg 23949176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 17674228 - 17674554
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  17674228 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 17674327  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  17674328 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 17674427  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  17674428 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 17674527  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  17674528 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 17674554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19113266 - 19112940
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  19113266 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccattg 19113167  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  19113166 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19113067  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  |  ||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  19113066 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 19112967  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19112966 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 19112940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 19485075 - 19485401
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19485075 gacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19485174  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  19485175 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19485274  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | || || || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | || ||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  19485275 aatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 19485374  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19485375 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 19485401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22046949 - 22046683
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  22046949 gacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 22046850  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  22046849 atcgagttcacatacaataatggttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttg 22046750  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    | ||||| || || |||||  ||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22046749 aatcaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgat 22046683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 21166742 - 21167068
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  21166742 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 21166841  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||| || || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||  || || |||||||    
T  21166842 atagagtttacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcgaagatgcagaactcaattgtgttggtttg 21166941  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| |  || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  21166942 aatcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 21167041  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21167042 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 21167068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 21921940 - 21922266
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  21921940 gacagatggtcagtcgtagaggacgattcaatagctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 21922039  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| | |||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  21922040 atagagttcacgtataataatagttatcattctactattggaatggcaccttatgaggctttctatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 21922139  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |  || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| | || |||||||||||    |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  21922140 agtcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccaca 21922239  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21922240 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 21922266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 22133246 - 22133560
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  22133246 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 22133345  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  22133346 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgcgggtttg 22133445  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  22133446 agtcaagtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 22133545  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  22133546 aaagagttatcatga 22133560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 22120379 - 22120723
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  22120379 gacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 22120478  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  22120479 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 22120578  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||| | ||  | |||||  |||||||| ||||||||  ||||||    || || ||||| || ||||||| || |||    
T  22120579 agtgaggtgaaagagtggtcttaggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgaca 22120678  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  22120679 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 22120723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 30313350 - 30313693
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  30313350 acagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggattagttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 30313449  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  30313450 tcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttga 30313549  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |  ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||  |||||||||| |||     
T  30313550 gtcaggtgaaagagtggtcttagggctcgagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaa 30313649  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||||||    
T  30313650 aagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcagga 30313693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 384
Target Start/End: Original strand, 22377659 - 22378032
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  22377659 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 22377758  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  22377759 atagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatggaagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcg 22377857  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||  | ||| |  | |||||  |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22377858 agtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22377957  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || |   | ||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22377958 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactcc 22378032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 384
Target Start/End: Original strand, 22383834 - 22384207
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  22383834 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 22383933  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  22383934 atagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatggaagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcg 22384032  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||  | ||| |  | |||||  |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22384033 agtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22384132  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || |   | ||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22384133 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactcc 22384207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23650617 - 23650291
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  23650617 gacagatggtcaatcggagagaacgattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgcgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 23650518  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23650517 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 23650418  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    || ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  23650417 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgaca 23650318  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  23650317 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 23650291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 21788565 - 21788883
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||    
T  21788565 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccattga 21788664  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| |    
T  21788665 tagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggc-ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaa 21788763  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||| |  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| | |||||||| |||     
T  21788764 atcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaa 21788863  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21788864 aagagttatcatgataagcg 21788883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22040435 - 22040169
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  ||||||    
T  22040435 gacagatggtcagttggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttg 22040336  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || |  ||  ||||||| |||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  22040335 atcgagttcacatacaatattagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 22040236  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    | | ||| || || |||||  ||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22040235 aatgaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgat 22040169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18857153 - 18856858
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  18857153 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 18857054  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||  || ||||||||||    
T  18857053 atcgagttcacatacaataataggtatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcataactctgttgtgctggtttg 18856954  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtc 305  Q
    ||||||| || || || || |||||||| ||  | |||||  | |||||||||||||||  ||||||    || || |||||||| ||||||||||    
T  18856953 agtcaggtgaaagagtcgtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtc 18856858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 21394071 - 21394390
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||    
T  21394071 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccattga 21394170  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtat-ggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||     
T  21394171 tagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggc-ttgtatgggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttta 21394269  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||| |  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| | |||||||| |||    
T  21394270 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgaca 21394369  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21394370 aaagagttatcatgataagcg 21394390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21251517 - 21251198
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  21251517 gacagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 21251418  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||  ||| |||| |   | |||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||    
T  21251417 atagagttcacgtataataacagttatcattctagtattgagatgacaccttattacgctttgtatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttg 21251318  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| ||||||||||| |  | | |||||||||| |||||||||  |||    
T  21251317 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattaaag-agagatgaaagcgtcgcagagttgaca 21251219  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21251218 aaagagttatcatgataagcg 21251198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Original strand, 22164436 - 22164740
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||    
T  22164436 gatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 22164535  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttca 249  Q
    | |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||| ||||||||||| | || || ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  22164536 gaatggcaccttttgaggctttgtacggtcggtgatgcagaactccgttgtgcaggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttcggacccgagattgttca 22164635  T
Q  250 tgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagttt 349  Q
      | |||||| ||||||||||||||||    || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  || ||||||    
T  22164636 gcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttt 22164735  T
Q  350 cagga 354  Q
    |||||    
T  22164736 cagga 22164740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22371515 - 22371371
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22371515 acagatggtgagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgtacttgagcaacgtggagcttgggatagtcacctaccgttga 22371416  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatgg 155  Q
    |||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22371415 tagatttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgg 22371371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27355120 - 27355034
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355120 gatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 27355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22987777 - 22987552
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||     
T  22987777 gacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatta 22987678  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||  || || ||||   ||||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |    
T  22987677 atagagttcatgtacaataacaattatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttcg 22987578  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22987577 agttaggtgagagtgtggttttagga 22987552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 16877393 - 16877628
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  16877393 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcaggacaccgttatgt 16877492  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  16877493 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 16877592  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  16877593 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 16877628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 351
Target Start/End: Original strand, 20652664 - 20652879
Alignment:
Q  136 tcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||   ||||||||    
T  20652664 tcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttaagtccggagaaagtgccttgttagga 20652763  T
Q  236 ccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaa 335  Q
    |||||  |||| || ||||||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  20652764 ccggaggtggtgcaagagactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaa 20652863  T
Q  336 aggcactagagtttca 351  Q
    |||   ||||||||||    
T  20652864 aggatatagagtttca 20652879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28982635 - 28982548
Alignment:
Q  308 cagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28982635 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtg 28982548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28987855 - 28987768
Alignment:
Q  308 cagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28987855 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtg 28987768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 395
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265208
Alignment:
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtg 16265208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Original strand, 21196800 - 21197072
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  21196800 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 21196899  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||||||||||||  | || || |||||||   | ||||||||||||||    || || |||||||| || ||||    
T  21196900 tggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatgtaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcaga 21196999  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||   |||| |||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  21197000 gttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgtgtttttgag 21197072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 324
Target Start/End: Original strand, 21850635 - 21850856
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  21850635 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 21850734  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   |||||||||||| || || ||||    
T  21850735 tggtttgagtccggagagagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcaga 21850834  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatga 324  Q
    ||  ||||||||| || |||||    
T  21850835 gtagacagaagagctatcatga 21850856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22982917 - 22982806
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||    |||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  22982917 accgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 22982818  T
Q  203 tggtttgagtca 214  Q
    ||||||||||||    
T  22982817 tggtttgagtca 22982806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Original strand, 23157309 - 23157443
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  23157309 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 23157408  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||||||| ||||| || ||||   ||||||||||    
T  23157409 tggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggacc 23157443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22315674 - 22315402
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| || || || || ||     
T  22315674 accgttgattgagtttacttataacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccattgtgt 22315575  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||| ||||||||| || |||     | ||||||||||  | ||||| || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  22315574 tggtatgagtcaggtgaaagttcttgggtaggaccggaagttgttcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 22315475  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  22315474 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 22315402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19661 - 19276
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19661 gacagatggtcagtcggagacgacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgttg 19562  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19561 atagagttcacatacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttattctggtttg 19462  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19461 agtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 19362  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19361 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 74284 - 74227
Alignment:
Q  167 gctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  74284 gctttgtatggtcggaggtgtaggatgccgttgtgttggtttgagtccggagagagtg 74227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20891501 - 20891107
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891501 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 20891402  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20891401 ctaccattgattgagttcacatataacaatagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggccggaggtgtaggactcctttat 20891302  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891301 gctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgca 20891202  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20891201 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 20891107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 1649030 - 1649424
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649030 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagtgtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 1649129  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1649130 ctaccgttgatagagttcacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatgtcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttat 1649229  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  1649230 gctggtttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaagaaagtcaagataatcagagaaaagatgaaagcgtcgca 1649329  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  1649330 gagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtg 1649424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 3264557 - 3264941
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  3264557 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 3264656  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3264657 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 3264756  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3264757 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 3264856  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3264857 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 3264941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33223442 - 33223043
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagagga-----cgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggata 95  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33223442 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggagaggacgatccaatcattggaagatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggata 33223343  T
Q  96 gtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcc 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |   | || | ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33223342 gtcacctaccgttgatagagttcacataaaacaaaaaataacaatagagtattggtatgacaccattcaaagcattgtatggtcggaggtgcaggactcc 33223243  T
Q  196 tttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33223242 tttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggttcatgaaactactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagct 33223143  T
Q  296 tcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33223142 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 33223043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 11206994 - 11207378
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||     
T  11206994 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgg 11207093  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11207094 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 11207193  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11207194 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 11207293  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11207294 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11207378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 29453300 - 29453684
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  29453300 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 29453399  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29453400 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 29453499  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29453500 gtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 29453599  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29453600 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 29453684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 44661629 - 44662013
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    | ||||    
T  44661629 acagatggtcagtcgaagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggacagtctcttgtctttga 44661728  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44661729 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 44661828  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44661829 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 44661928  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661929 aagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 44662013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Original strand, 15358855 - 15359237
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358855 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtctgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgata 15358954  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358955 gagttcacatacaacaacagttaccattcatgtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 15359054  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15359055 caggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 15359154  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  15359155 gagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtg 15359237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16146433 - 16146037
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtg--cttgagcaaggtggagcttgggatagtc 98  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16146433 tcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatctttggaggatttactaagagtgtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtc 16146334  T
Q  99 accaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccttt 198  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16146333 acctaccgttgatagaattcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggtcggaggtgtaggactccttt 16146234  T
Q  199 atgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16146233 atgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcg 16146134  T
Q  299 cagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16146133 cagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 16146037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27900896 - 27900515
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27900896 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttc 27900797  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27900796 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttg 27900697  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| | |    
T  27900696 agtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgata 27900597  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacg 391  Q
    |||||| || ||||||||||| || || |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27900596 gaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacg 27900515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15246434 - 15246049
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15246434 gacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattagaggatttggtgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggaggttgggatagtcaactaccgttg 15246335  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  15246334 atagagttgacgtacaacaacagtcaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttattctagtttg 15246235  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15246234 agtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 15246135  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15246134 aaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtg 15246049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 15003127 - 15003511
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15003127 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctaagcgtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttga 15003226  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15003227 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtggaggactcctttatgttggtttga 15003326  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||     
T  15003327 gtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 15003426  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  15003427 aagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtg 15003511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 71 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15070862 - 15070538
Alignment:
Q  71 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070862 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 15070763  T
Q  171 tgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaa 270  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||    
T  15070762 tgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaa 15070663  T
Q  271 gatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgttttt 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||    
T  15070662 gatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgttt 15070563  T
Q  371 ctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| || |||||| |||||||||    
T  15070562 ctgagagtcactcctatgacgggtg 15070538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15078140 - 15077825
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15078140 atggtcagtcgaagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgataga 15078041  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||     
T  15078040 gttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcg 15077941  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15077940 ggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaga 15077841  T
Q  315 gttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||||||||||    
T  15077840 gttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Original strand, 51605992 - 51606328
Alignment:
Q  59 agagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcac 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| || |||||||    
T  51605992 agagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcac 51606091  T
Q  159 cgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactac 258  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  51606092 cattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactac 51606191  T
Q  259 taagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggat 358  Q
      | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |    
T  51606192 agaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggt 51606291  T
Q  359 gatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||| ||| | || || |||||  |||||||||    
T  51606292 gatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtg 51606328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8706427 - 8706108
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  8706427 acagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttga 8706328  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  8706327 tagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtatatgaatgacaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaacttcgttatgttggtttga 8706228  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | |||||  ||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||     
T  8706227 gtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacac 8706128  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  8706127 aagagttatcacgacaagcg 8706108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 15414789 - 15415108
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  15414789 acagatagccagtcggagagaacgattcaatcgttagatgatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagtttgggatagtcatctgccgttga 15414888  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15414889 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttga 15414988  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||| ||  | |||||  |||||||  | || || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||     
T  15414989 gtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacggaaaaggtcaaattgataagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 15415088  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  15415089 aagagttatcatgataagcg 15415108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 29038906 - 29039232
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  29038906 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 29039005  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  29039006 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 29039105  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  29039106 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 29039205  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29039206 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 29039232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14681077 - 14680733
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14681077 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14680978  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||| ||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  14680977 atcgagttcatatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 14680878  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||  |||||||||| |||    
T  14680877 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgaca 14680778  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||||||    
T  14680777 aaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagga 14680733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 18226948 - 18227292
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  18226948 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 18227047  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||     
T  18227048 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttt 18227147  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  18227148 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 18227247  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| || |||   || |||||||||||    
T  18227248 aaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttcagga 18227292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8386922 - 8386596
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  8386922 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 8386823  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  8386822 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcgccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 8386723  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  8386722 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 8386623  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8386622 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 8386596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 354
Target Start/End: Original strand, 14266404 - 14266745
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  14266404 agatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 14266503  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14266504 gagttcacatacaataatagctatcattccagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 14266603  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| ||| |||||||  | || || |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  14266604 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 14266703  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  14266704 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 14266745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27711855 - 27711520
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  27711855 tcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 27711756  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  27711755 cttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgt 27711656  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||    
T  27711655 gttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgca 27711556  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27711555 gagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 27711520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18297715 - 18297389
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  18297715 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 18297616  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  18297615 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 18297516  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  18297515 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 18297416  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18297415 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 18297389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 8053125 - 8053450
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  8053125 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 8053224  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||    
T  8053225 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttg 8053324  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  8053325 aatcaggagagagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 8053424  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaa 335  Q
     |||||||| || || ||||| ||||    
T  8053425 aaagagttatcacgataagcgtagaa 8053450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12524185 - 12523872
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||    
T  12524185 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattga 12524086  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  12524085 tcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 12523986  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||     
T  12523985 gtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 12523886  T
Q  311 aagagttaccatga 324  Q
    |||||||| |||||    
T  12523885 aagagttatcatga 12523872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12477110 - 12476790
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  12477110 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgcaagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 12477011  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  12477010 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 12476911  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| || ||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  12476910 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 12476811  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  12476810 aaagagttatcatgataagcg 12476790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 14850868 - 14851188
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14850868 gacagatggtcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14850967  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||| | |    
T  14850968 atagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactccgttgtgttggctcg 14851067  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||| | |||| ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  14851068 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14851167  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  14851168 aaagagttatcatgataagcg 14851188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 19778295 - 19778621
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19778295 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19778394  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  19778395 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19778494  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  19778495 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 19778594  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19778595 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 19778621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 15147386 - 15147613
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  15147386 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 15147485  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  15147486 attgagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 15147585  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||    
T  15147586 agtcaggagaaagagtgttcttaggacc 15147613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 1639927 - 1640246
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||    
T  1639927 gacagatggttagtcggaaagaacgattcagtcgctggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccattg 1640026  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || |   ||||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  1640027 atagagttcacttacaataatatttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggctttgtatggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttg 1640126  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||  |||    
T  1640127 agtcaggtgagagggtggttttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgaca 1640226  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagc 329  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  1640227 aaagagttatcatgataagc 1640246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40473549 - 40473206
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  40473549 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 40473450  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  || |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  40473449 ttgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcga 40473350  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  | |||||| |||||||| | |||||    || || |||||||| ||| |||||| |||     
T  40473349 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaa 40473250  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  40473249 aagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 40473206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 14303480 - 14303806
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14303480 gacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14303579  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  14303580 atcgagttcacatacaataatagttatcatgctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 14303679  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||  ||||||    || || ||||| || ||||||| || |||    
T  14303680 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgaca 14303779  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14303780 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 14303806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Original strand, 16354949 - 16355267
Alignment:
Q  12 cagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  16354949 cagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 16355048  T
Q  112 agagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgag 211  Q
     ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||| | |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || | ||| || || |||||||||    
T  16355049 tgagttcacatacaataatagttatcattctagtatttgaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatggagaattccgttgtgttggtttgag 16355148  T
Q  212 tcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacaga 311  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| |    
T  16355149 tcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaa 16355248  T
Q  312 agagttaccatgacaagcg 330  Q
    | | ||| ||||| |||||    
T  16355249 ataattatcatgataagcg 16355267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23956257 - 23955931
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||| |||  |||| |  ||||||    
T  23956257 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttaggaccgtcatcttccgttg 23956158  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23956157 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 23956058  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  23956057 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 23955958  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23955957 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 23955931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14159968 - 14159628
Alignment:
Q  44 ttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcga 143  Q
    ||||| || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||| || || || ||  ||||||| |    
T  14159968 ttggaagacttgctgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcaccttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattcta 14159869  T
Q  144 gtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggactt 243  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  |    
T  14159868 gtattggaatggcaccttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgggaccggagat 14159769  T
Q  244 ggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcacta 343  Q
     |||||  |||||||| | || |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||     
T  14159768 tgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatctt 14159669  T
Q  344 gagtttc-aggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    || |||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14159668 gaatttcaaggagga-gatcatgtgttcctgagagttactcc 14159628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 16251947 - 16252288
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16251947 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcactagaggatttgttgtaagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16252046  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| || || || ||  ||||||| | |||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16252047 atcgagttcacgtacaataatagttatcattctattattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 16252146  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  |  ||||  |||||||| |||| |||||||||||    || || || ||||| |||||||||| |||    
T  16252147 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgaca 16252246  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  16252247 aaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16252288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16752871 - 16752718
Alignment:
Q  242 ttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcac 341  Q
    ||||||||| | || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16752871 ttggttcatcaaacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggccc 16752772  T
Q  342 tagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  16752771 ttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 16752718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7090942 - 7090616
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  7090942 gacagatagtcagtcggagaggacgatttagtcgttagaagatttgttgagggtttgggttctttagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 7090843  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||| | |||| ||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||    
T  7090842 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattagaatggaaccttatgaggctttatatggtcggagatgcagaactcagttgtgttggtttg 7090743  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  7090742 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgaca 7090643  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  7090642 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 7090616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9291219 - 9291017
Alignment:
Q  136 tcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||   ||||||||    
T  9291219 tcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttgttagga 9291120  T
Q  236 ccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaa 335  Q
    |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  9291119 ccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 9291020  T
Q  336 agg 338  Q
    |||    
T  9291019 agg 9291017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14652741 - 14652498
Alignment:
Q  87 cttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||||| || ||||| ||| |||| || || ||| |||||||||| |||||    
T  14652741 cttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgtatggtcgaaggtg 14652642  T
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    ||||||    
T  14652641 cagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaag 14652542  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  14652541 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 14652498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14997733 - 14997498
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  14997733 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 14997634  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||||||  |||||||||   ||||||||||| |  | || || || |||||  | || |||||||||||    ||||||||||| || || ||||    
T  14997633 tggtttgagtccagagagagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcaga 14997534  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  14997533 gtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaagg 14997498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 324
Target Start/End: Original strand, 15293012 - 15293233
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  15293012 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 15293111  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  15293112 tggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 15293211  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatga 324  Q
    ||  |||||||||||| |||||    
T  15293212 gtagacagaagagttatcatga 15293233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16685670 - 16685498
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || ||  | |||||     
T  16685670 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggaaggaggtgtagaacgtcgttatgt 16685571  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggactt-ggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||  | ||  || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16685570 tggtatgagtcaggatagagtgctttgttaggacc--atttatgtgcaagagactacgaagaaagttaagatgat 16685498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 55375213 - 55375448
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||     
T  55375213 accgttgattgagtttacttacaacaacagtttacattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgt 55375312  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| ||||| || ||||   |||||||||| ||  | || || || |||||  | || |||||||||||   | | ||||||||||| || ||||    
T  55375313 tggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtacaagaaactacggaaaaggttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcaga 55375412  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  55375413 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 55375448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13248062 - 13247829
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||| | ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || || || ||     
T  13248062 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattaggatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgt 13247963  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| || || ||||    
T  13247962 tggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaga 13247863  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  13247862 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaa 13247829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 12342718 - 12342801
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  12342718 accgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattgggatggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtg 12342801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 15149750 - 15149828
Alignment:
Q  252 agactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  15149750 agactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 15149828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 42703105 - 42703028
Alignment:
Q  318 accatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||    
T  42703105 accatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtg 42703028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 352
Target Start/End: Original strand, 16676447 - 16676547
Alignment:
Q  252 agactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  16676447 agactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16676546  T
Q  352 g 352  Q
    |    
T  16676547 g 16676547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 42089 - 42483
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42089 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 42188  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42189 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 42288  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  42289 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgca 42388  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42389 gagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 42483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 47164 - 47549
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  47164 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttaagatagtcacctaccgttg 47263  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47264 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgaaggactcctttatgctggtttg 47363  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||     
T  47364 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgact 47463  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47464 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 47549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2461 - 2352
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |  || ||||    
T  2461 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttggggtagtcatcttccattga 2362  T
Q  111 tagagttcac 120  Q
    ||||||||||    
T  2361 tagagttcac 2352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 10468747 - 10469141
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10468747 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctcgagcaaggtgaagcttgggatagtcac 10468846  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10468847 ctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 10468946  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10468947 gctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgca 10469046  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10469047 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 10469141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 14381365 - 14381759
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14381365 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatcaaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttaagcaaggtggaacttgggacagtcac 14381464  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14381465 ctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 14381564  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14381565 gctggtttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgca 14381664  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14381665 gagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 14381759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24364785 - 24364401
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  24364785 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 24364686  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24364685 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcatcgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 24364586  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24364585 gtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 24364486  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24364485 aagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 24364401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17415860 - 17415475
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17415860 gacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggaggatttgctgatagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtcg 17415761  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17415760 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgatatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 17415661  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  17415660 agtcagaagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 17415561  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  17415560 gaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtg 17415475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 27560515 - 27560909
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27560515 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 27560614  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  27560615 ctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccattgt 27560714  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27560715 gttggtttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgca 27560814  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  27560815 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtg 27560909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Original strand, 22796544 - 22796924
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22796544 atggtcagtcggagagaacgattcaatcgtcagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagattgggatagtcacctaccgttgataga 22796643  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22796644 gttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtacggtcggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtca 22796743  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  22796744 ggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcatcagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataaga 22796843  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22796844 gttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtg 22796924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 66 - 382
Target Start/End: Original strand, 8766111 - 8766427
Alignment:
Q  66 gtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcga 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766111 gtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcga 8766210  T
Q  166 agctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaa 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  8766211 agctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcatgagactacagagaaa 8766310  T
Q  266 gttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatg 365  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  8766311 gtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatg 8766410  T
Q  366 tttttctgagggttact 382  Q
    | |||||||||||||||    
T  8766411 tgtttctgagggttact 8766427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 28282711 - 28283105
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28282711 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 28282810  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  28282811 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 28282910  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  28282911 gttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 28283010  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  28283011 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 28283105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19453794 - 19453511
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19453794 gacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattg 19453695  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453694 atagagttcgcatacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 19453595  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19453594 agtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaag 19453511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18801267 - 18800931
Alignment:
Q  59 agagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcac 158  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||  | ||||||||||||||||||||      
T  18801267 agagtgtgtgtactagagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtttatagagttcatttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcct 18801168  T
Q  159 cgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactac 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18801167 cgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactac 18801068  T
Q  259 taagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggat 358  Q
      ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||      
T  18801067 ggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggg 18800968  T
Q  359 gatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18800967 gatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 18800931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25768565 - 25768180
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25768565 gacagatggtcagtcggagaaaacgattcagtcattcgaggatttgctaagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttg 25768466  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25768465 atagagttcacgtacaacaactgttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttg 25768366  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| | |||||  |||| || ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25768365 agtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcatcaaactacggagaaggtcaagttgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 25768266  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| | |||||||||    
T  25768265 gaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttatgacgggtg 25768180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21471974 - 21471592
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21471974 acagatggtcagtgggagagaactattcagtcattagaggactttctaagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatttaccgttga 21471875  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21471874 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggacggaggtgcaggactcctttgtgttggtttga 21471775  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21471774 gtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagttaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 21471675  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacggg 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  21471674 aagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacggg 21471592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 21564039 - 21564424
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21564039 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 21564138  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || | ||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21564139 atagagttcacctacatcaatagttaccattcgagtattggtatggttccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgccggactcctttatgttggtttg 21564238  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  ||||||  || || |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  21564239 agtcaggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactaaaaaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 21564338  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||    
T  21564339 gaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctttgacaggtg 21564424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15459706 - 15459325
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  15459706 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 15459607  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  15459606 aattcacatacaataacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtc 15459507  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15459506 gggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 15459407  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || |||||||||||||| || || |  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15459406 agctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtg 15459325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 5297104 - 5297308
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5297104 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagct-gggatagtcac 5297202  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5297203 ctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 5297302  T
Q  201 gctggt 206  Q
    ||||||    
T  5297303 gctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1641146 - 1640818
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1641146 gacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattg 1641047  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  1641046 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgcatggacggaggtgcagaactccgttatgttggttta 1640947  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || || |||||  |||| ||||| ||  | |||||| |||||||  | || || ||  ||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||    
T  1640946 agtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcatcagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgaca 1640847  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1640846 gaagagttatcatgacaagcgtagaaagg 1640818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Original strand, 34645497 - 34645878
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  34645497 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcaaggtggagcgtgggatagccacttaccgttgatag 34645596  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | || || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  34645597 aatttacttataacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtgttggtttgagtc 34645696  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  34645697 gggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttgataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaag 34645796  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  34645797 agctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtg 34645878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27559886 - 27560080
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27559886 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 27559985  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcc 195  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27559986 ctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcc 27560080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18795060 - 18794747
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18795060 gatggtcaatcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatag 18794961  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    |||| || || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||     
T  18794960 agtttacctacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccatttgaagccttgtacggtcgaaggtgcataactcctttgtgttggtttgagtt 18794861  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||| | || ||  |||||||  | || |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18794860 aggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaacagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaag 18794761  T
Q  314 agttaccatgacaa 327  Q
    || || ||||||||    
T  18794760 agctatcatgacaa 18794747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19879681 - 19879316
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19879681 tcatcctcagacagatggacagtcagagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 19879582  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  19879581 ctaccattgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggacgaaggtgcagaactcctttgt 19879482  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| ||| |||||||||  |||||    
T  19879481 gttggtttgaatcgggagaaagtgtgatgttggggccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagggtcgca 19879382  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgt 366  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  19879381 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgt 19879316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 1542991 - 1543335
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  1542991 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttg 1543090  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| || || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||    
T  1543091 atcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgctggtttg 1543190  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| || ||||||| |||    
T  1543191 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgaca 1543290  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  1543291 aaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcagga 1543335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27187810 - 27187484
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  27187810 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 27187711  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  27187710 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttg 27187611  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  27187610 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 27187511  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27187510 aaagagttatcatgataagcgaagaaa 27187484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 27261430 - 27261756
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  27261430 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 27261529  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  27261530 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttg 27261629  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  27261630 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 27261729  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27261730 aaagagttatcatgataagcgaagaaa 27261756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 29591827 - 29592153
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  29591827 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 29591926  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  29591927 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 29592026  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  29592027 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 29592126  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29592127 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 29592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 11280416 - 11280768
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11280416 gatggccagtcagagaggacaatgcaatccttagaagatcttttgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgacag 11280515  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | || || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11280516 aatttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtc 11280615  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11280616 gggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaag 11280715  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgt 366  Q
    || || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  11280716 agctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgt 11280768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16927547 - 16927867
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |  |||||     
T  16927547 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgaggatttgtgtgctagagcaagctggaacttgggacagtcatctcccgtta 16927646  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16927647 atagagttcacgtataacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16927746  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||   |||||| ||||||||    ||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  16927747 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaa 16927846  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16927847 aaagagttatcatgataagcg 16927867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 16626624 - 16626950
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16626624 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16626723  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16626724 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16626823  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||| | |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  16626824 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 16626923  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16626924 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 16626950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22434243 - 22433929
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  22434243 gacagatgattagtcggagaggacgattaagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgtacttgagcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttg 22434144  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  22434143 atagagttcacttacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 22434044  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  22434043 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22433944  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  22433943 aaagagttatcatga 22433929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23078840 - 23078458
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || || |||    
T  23078840 agatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaatacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatttata 23078741  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||    
T  23078740 gagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgttggtttgagt 23078641  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  23078640 caggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaa 23078541  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||| ||||  ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  23078540 gagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtg 23078458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 5839126 - 5839446
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  5839126 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 5839225  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| || || ||| | || || |||||||    
T  5839226 atagagttcacgtataataatagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttg 5839325  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||  ||||||| ||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  5839326 aatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 5839425  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  5839426 gaagagttatcatgataagcg 5839446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16963274 - 16963594
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |  |||||     
T  16963274 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagagaatttgttaaggatttgtgtgctagagcaaggtgaaacttgggacagtcatctcccgtta 16963373  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  16963374 atagagttcacgtctaacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgatttg 16963473  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||  ||||||| ||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16963474 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 16963573  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16963574 aaagagttatcatgataagcg 16963594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 24313075 - 24313394
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  24313075 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 24313174  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  24313175 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 24313274  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  24313275 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 24313374  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagc 329  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  24313375 aaagagttatcatgataagc 24313394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 28263108 - 28263430
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||||| |    
T  28263108 gatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcg 28263207  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  28263208 agttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 28263307  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| ||| |||    
T  28263308 aggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 28263407  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28263408 agttatcatgataagcgtagaaa 28263430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 28341857 - 28342179
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||||| |    
T  28341857 gatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcg 28341956  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  28341957 agttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 28342056  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| ||| |||    
T  28342057 aggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 28342156  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28342157 agttatcatgataagcgtagaaa 28342179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 25609768 - 25610088
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  25609768 gacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 25609867  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||| ||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  25609868 ataaagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgatgctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttg 25609967  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||| |||    
T  25609968 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgaca 25610067  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  25610068 aaagagttaccatgataagcg 25610088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25112926 - 25112582
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  25112926 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 25112827  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  25112826 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttg 25112727  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |   | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || || ||||| |||||||||| |||    
T  25112726 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgaca 25112627  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  25112626 aaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 25112582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 2874710 - 2875036
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  2874710 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 2874809  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  2874810 atcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttg 2874909  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||  ||||||    || || ||||| || ||||||| || |||    
T  2874910 agtcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgaca 2875009  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2875010 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 2875036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19865061 - 19864747
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||| |  ||||||    
T  19865061 gacagatggtcagtcggataggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacctgggctagtcatcttccgttg 19864962  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||   ||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  19864961 attgagttcacgtataataatagttatcattttggtattggaatggcaccttttgcggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 19864862  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | | |||  |||||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  19864861 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 19864762  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  19864761 aaagagttatcatga 19864747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 27331340 - 27331666
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  27331340 gacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 27331439  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||| |||||  || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27331440 atagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27331539  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||    |||||  | |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  27331540 agtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgaca 27331639  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  27331640 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 27331666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 27392080 - 27392406
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  27392080 gacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 27392179  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||| |||||  || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27392180 atagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27392279  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||    |||||  | |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  27392280 agtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgaca 27392379  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  27392380 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 27392406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 28292279 - 28292593
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || ||| | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |  || |||    
T  28292279 gacagatggtcagttggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttcggacagtcatcttccattg 28292378  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  28292379 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 28292478  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  28292479 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 28292578  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  28292579 aaagagttatcatga 28292593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 18407849 - 18408170
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  18407849 gacagagggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 18407948  T
Q  110 atagagttcacatataacaac-agccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttt 208  Q
    ||||||||||| || ||  || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  18407949 atagagttcacgtacaaatactagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 18408048  T
Q  209 gagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaac 308  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||| ||    || ||||||||||| ||| |||||| ||    
T  18408049 gagtcaggtgaaagagtggtattaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgac 18408148  T
Q  309 agaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  18408149 aaaatagttaccatgataagcg 18408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 21569898 - 21569986
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569898 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtc 21569986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 22762366 - 22762682
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||| |  || |||||||    
T  22762366 gatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgaggaaggaggaacttgagatagtcatcttccattgatag 22762465  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    ||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||  |||||| ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  22762466 agttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgagactttgtgtggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 22762565  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    ||| || || || || |||||||| ||  | |||||  | | |||| |||| |||||||||||    || |||||||||| |||| |||||| |||  ||    
T  22762566 aggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatag 22762665  T
Q  314 agttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| |||| |||||    
T  22762666 agttacaatgataagcg 22762682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12498323 - 12498080
Alignment:
Q  87 cttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12498323 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatg 12498224  T
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || ||     
T  12498223 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaa 12498124  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  12498123 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 12498080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 354
Target Start/End: Original strand, 12510578 - 12510845
Alignment:
Q  87 cttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12510578 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatg 12510677  T
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || ||     
T  12510678 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaa 12510777  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||||||    
T  12510778 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcagga 12510845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 336
Target Start/End: Original strand, 25765322 - 25765523
Alignment:
Q  135 atcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagg 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| |||||    
T  25765322 atcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttagg 25765421  T
Q  235 accggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggaga 334  Q
    ||| ||  | |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    || || |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  25765422 accagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaga 25765521  T
Q  335 aa 336  Q
    ||    
T  25765522 aa 25765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Original strand, 15078364 - 15078636
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| || || ||     
T  15078364 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgt 15078463  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  15078464 tggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcaga 15078563  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| |||  ||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  15078564 gtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgag 15078636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16098331 - 16098059
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  16098331 accgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 16098232  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    || ||||||||||| ||  |||    
T  16098231 tggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttaga 16098132  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  16098131 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 16098059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 22078597 - 22078914
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||| ||||  || |||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  22078597 gacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgctggaagatttgttgaaagtttgtgaactcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 22078696  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||| ||||||| || || || ||  ||  ||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  22078697 ataaagttcacgtacaataatagttat--ttctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 22078794  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || |  ||||| |||||||  ||  | |||||  | || ||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22078795 agtcaggtgaaaaagtggtcttaggactagagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgattccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 22078894  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagc 329  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  22078895 aaagagttatcatgataagc 22078914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12505652 - 12505409
Alignment:
Q  87 cttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || | ||| ||||||||||| ||    
T  12505652 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggttttttatggtcggagatg 12505553  T
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||  | |||||| | |||||| |||| |||||||||||    || ||     
T  12505552 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagagaat 12505453  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  12505452 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 12505409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 16382373 - 16382608
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  16382373 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 16382472  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  16382473 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 16382572  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16382573 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 16382608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Original strand, 18837912 - 18838143
Alignment:
Q  107 ttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 206  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||    
T  18837912 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatccgaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 18838011  T
Q  207 ttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtca 306  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    ||||||||||| || || ||||||      
T  18838012 ttgagtccggagagagtgctatgttagcaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtac 18838111  T
Q  307 acagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  18838112 atagaagagttatcatgataagaggagaaagg 18838143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 338
Target Start/End: Original strand, 1648786 - 1649019
Alignment:
Q  105 cgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctg 204  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  1648786 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttg 1648885  T
Q  205 gtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagt 304  Q
    ||||||||| ||||||| ||   | |||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   |||||||||||| || || ||||||    
T  1648886 gtttgagtccggagagaatgctttattaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagt 1648985  T
Q  305 caacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
      ||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  1648986 agacagaagagctatcatgataagaggagaaagg 1649019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23996529 - 23996294
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  23996529 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 23996430  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  23996429 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 23996330  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  23996329 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 23996294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Original strand, 11287680 - 11287890
Alignment:
Q  185 tgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaa 284  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| |||     
T  11287680 tgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaac 11287779  T
Q  285 agatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || || ||    
T  11287780 atatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccc 11287879  T
Q  385 tttgacgggtg 395  Q
    | |||||||||    
T  11287880 tatgacgggtg 11287890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16233450 - 16233255
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||      
T  16233450 agtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggactggaag 16233351  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | || || ||||||||  | || |||||||| ||    ||||||||||| || || || |||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16233350 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 16233255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 18197611 - 18197774
Alignment:
Q  167 gctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaag 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |   | ||| |  |||||||| |||| |    
T  18197611 gctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttcgtttaagtcaggtgagaatgtggttttaggaccagcgattgtttaacagactactgagaagg 18197710  T
Q  267 ttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    | ||||||||    ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  18197711 taaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 18197774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 25743088 - 25743322
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  25743088 accgttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtaggacaccgttgtgt 25743187  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||||||||| || ||||   || ||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    || ||||||| ||| || ||||    
T  25743188 tggtttgagtcaggtgaaagtgctttg-taggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcaga 25743286  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25743287 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 25743322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25750897 - 25750798
Alignment:
Q  296 tcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| | |||||||||    
T  25750897 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggtg 25750798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 395
Target Start/End: Original strand, 14131361 - 14131471
Alignment:
Q  285 agatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14131361 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcc 14131460  T
Q  385 tttgacgggtg 395  Q
    | |||| ||||    
T  14131461 tatgacaggtg 14131471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17032757 - 17032589
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  17032757 gacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 17032658  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 178  Q
    || |||||||| || |  || ||  ||||||| |||||  | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  17032657 atcgagttcacttacactaatagttatcattctagtatcagaatggcaccttttgaagctttatatggt 17032589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25751023 - 25750935
Alignment:
Q  307 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  25751023 acagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtg 25750935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 21412938 - 21413173
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||   |||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  21412938 accgttgattgagtttacttacaataacagttttcattctaatatcggtatggcactgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 21413037  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| || |   ||||||||||||   | || || || |||||  | || |||||||||||    |||||||||||||| || ||||    
T  21413038 tggtttgaatccggagaaagcgcattgttaggaccgggagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcaga 21413137  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  || ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21413138 gtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaagg 21413173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 8762831 - 8762884
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggattt 54  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  8762831 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggatgatacaatctttggaggattt 8762884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1652353 - 1652266
Alignment:
Q  104 ccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 191  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  1652353 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagga 1652266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17813958 - 17813870
Alignment:
Q  152 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | || || |||| |||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  17813958 atggcacagtttgaagctttttatggtcgaaggtgcaggacgacgttgtgttggtatgagtcaggataaagtgctttgttaggaccgga 17813870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 11961015 - 11961405
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11961015 tcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 11961114  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11961115 ctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 11961214  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| | || || || |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  11961215 gctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatgagacgactgaaaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaggctttgca 11961314  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacg 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11961315 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacg 11961405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 16836491 - 16836885
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16836491 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatccttggaggatttgttgagagtgcgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcac 16836590  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||| |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16836591 ctaccattggtagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttat 16836690  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836691 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatgagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcaca 16836790  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  16836791 gagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 16836885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 18134327 - 18134721
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134327 tcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 18134426  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18134427 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggaatcctttat 18134526  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  | ||||| || |||||  | || ||||||||||| |||||    
T  18134527 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgca 18134626  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18134627 gagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtg 18134721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10384107 - 10383723
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  10384107 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 10384008  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10384007 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgctggtttga 10383908  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10383907 gtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 10383808  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10383807 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 10383723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 16329652 - 16330034
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16329652 acagatggttagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgta--ctttagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattga 16329749  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  16329750 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttga 16329849  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  16329850 gtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcacagagtcgacat 16329949  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16329950 aagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtg 16330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 12360532 - 12360904
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12360532 gacagatggtcagtcggagaggaccatacaatctttggaggatttattgaaagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttcggatagtcacctaccgttg 12360631  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12360632 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgctggtttg 12360731  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  12360732 agtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcatcggactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgaca 12360831  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttact 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12360832 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttact 12360904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 375
Target Start/End: Original strand, 11303763 - 11304128
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303763 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtacttgagcaagttggagcttgggatagtcacctaccgttg 11303862  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||| |||||||||| || |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303863 atatagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtaaggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 11303962  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||| || ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  11303963 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccgaatttgattcatcaggctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgaca 11304062  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11304063 gaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgag 11304128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Original strand, 15952963 - 15953343
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15952963 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggagttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgataga 15953062  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  15953063 gttcacgtacaacaacagttgccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtcg 15953162  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15953163 ggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 15953262  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  15953263 gttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtg 15953343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47124082 - 47123698
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  47124082 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 47123983  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | || || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47123982 ttgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 47123883  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47123882 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcag 47123783  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47123782 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 47123698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 8759063 - 8759457
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8759063 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 8759162  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  8759163 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 8759262  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  8759263 gttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 8759362  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8759363 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 8759457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41177670 - 41177276
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41177670 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacatggtggagcttgggatagtcac 41177571  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  41177570 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 41177471  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  41177470 gttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 41177371  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  41177370 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 41177276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13942172 - 13941778
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13942172 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcaatggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 13942073  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  13942072 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 13941973  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  13941972 gttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 13941873  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  13941872 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 13941778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17492769 - 17492489
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17492769 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggatcttgggatagtcacctaccgttg 17492670  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17492669 atagagttcacatacaacaatagttatcattcgaatattggtatggcaccgatcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttaagctggtttg 17492570  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatga 290  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17492569 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatga 17492489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 16380918 - 16381302
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  16380918 gacagatggtcagtcggagaggatgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggataatcacctaccattg 16381017  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16381018 atagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgctggtttg 16381117  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtg--ttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaa 307  Q
    |||| |||||||||||  ||  |  |||||||| |||||||||||||||||  | || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |    
T  16381118 agtccggagagagtgttatggttggggaccggatttggttcatgagactacagaaaaggtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcga 16381217  T
Q  308 cagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||    
T  16381218 c---agagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagttactccgatgacgggtg 16381302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44777395 - 44777024
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44777395 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 44777296  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44777295 ctgccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattatatggtcgaaggtgcaggactcctttgt 44777196  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  44777195 gttggttcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 44777096  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttct 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  44777095 gagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttct 44777024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 13322633 - 13323025
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13322633 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatccttagaggatttcctaagagtatgtgtgcttgagcaaggtgaagcttgggatagtcac 13322732  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| ||||||||||| || || |||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13322733 ctacctttgatagagtttacctacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtacggtcggaggtgcagaactcctttat 13322832  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  13322833 gctggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgca 13322932  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacggg 393  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || || |  || | |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13322933 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacggg 13323025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Original strand, 10420039 - 10420420
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  10420039 gatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 10420138  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  10420139 aattcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtc 10420238  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10420239 gggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagaccacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 10420338  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || |||||||||||||| || || |  || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10420339 agctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtg 10420420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 394
Target Start/End: Original strand, 12850269 - 12850653
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  12850269 gacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagattgtgtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctatcgttg 12850368  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || |||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  12850369 atagagttcacgtacaacaacaattaccattcaagtattggtatggcaccgttcaaagatttgtatggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttg 12850468  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| | |||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  12850469 agtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacataaaaagtcaaattgataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgaca 12850568  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  12850569 gaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggt 12850653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28754456 - 28754177
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  28754456 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 28754357  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28754356 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 28754257  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatga 290  Q
    ||| || || ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  28754256 gtcgggtgaaagtgttgcgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 28754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4678576 - 4678302
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4678576 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattga 4678477  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  4678476 tagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttga 4678377  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaa 285  Q
    ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  4678376 gtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacataaaaagtcaagatgatcagagaaaa 4678302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 13972110 - 13972495
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13972110 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 13972209  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  13972210 atagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttg 13972309  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  13972310 agtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgaca 13972409  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  13972410 gaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 13972495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15227782 - 15227447
Alignment:
Q  16 tggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagag 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15227782 tggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtacttaagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagag 15227683  T
Q  116 ttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcag 215  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||      
T  15227682 ttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggttggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcga 15227583  T
Q  216 gagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagag 315  Q
    | ||  ||||  |||| ||||| || || |||||  ||||||| || || || ||  ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  15227582 gtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcagcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagag 15227483  T
Q  316 ttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  15227482 ttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttca 15227447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14086821 - 14086427
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086821 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 14086722  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  14086721 ctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgt 14086622  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  14086621 gttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgca 14086522  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  14086521 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 14086427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26008974 - 26009192
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26008974 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 26009073  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||| |||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  26009074 ctaccgttgagagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgt 26009173  T
Q  201 gctggtttgagtcaggaga 219  Q
    | |||||||||||||||||    
T  26009174 gttggtttgagtcaggaga 26009192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13002046 - 13001770
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |    
T  13002046 acagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgatgagagtgtgtgtacttgagcaagg-ggagcttgggatagtcatttaccgttaa 13001948  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13001947 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactccattatgttggtttga 13001848  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagat 288  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| | |||||  | || || ||| ||||||| ||||||||    
T  13001847 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaatgtcaagttgataagagaaaagat 13001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16635902 - 16635576
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16635902 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16635803  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16635802 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16635703  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  16635702 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 16635603  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16635602 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 16635576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43163226 - 43162900
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  43163226 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 43163127  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  43163126 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 43163027  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  43163026 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 43162927  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43162926 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 43162900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 16806927 - 16807268
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16806927 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16807026  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16807027 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 16807126  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |||| |||    
T  16807127 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgaca 16807226  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||    
T  16807227 gaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttca 16807268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12498377 - 12498057
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  12498377 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 12498278  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  12498277 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 12498178  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  12498177 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 12498078  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  12498077 aaagagttatcatgataagcg 12498057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 20062055 - 20062381
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  20062055 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 20062154  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20062155 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 20062254  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  20062255 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 20062354  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20062355 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 20062381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16692285 - 16691969
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||| |    
T  16692285 gatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccattgatcg 16692186  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16692185 agttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 16692086  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| | ||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16692085 aggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaag 16691986  T
Q  314 agttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  16691985 agttatcatgataagcg 16691969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10005729 - 10005403
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  10005729 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 10005630  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  10005629 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 10005530  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  10005529 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 10005430  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10005429 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 10005403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 14876500 - 14876826
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    ||||||    
T  14876500 gacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatattccgttg 14876599  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  14876600 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 14876699  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||| ||  | |||||  |||||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  14876700 agtcaggtgaaagagcggtcttaggacccgagattgttcagcagactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14876799  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14876800 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 14876826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 15589393 - 15589719
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  15589393 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 15589492  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  15589493 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 15589592  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  15589593 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 15589692  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15589693 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 15589719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 16756586 - 16756912
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  16756586 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 16756685  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16756686 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcatcgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16756785  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||  || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  16756786 agtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 16756885  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16756886 gaagagttatcatgataagcgtagaaa 16756912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 53385023 - 53385345
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||| |    
T  53385023 gatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcg 53385122  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  53385123 agttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtc 53385222  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| |||    
T  53385223 aggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 53385322  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  53385323 agttatcatgataagcgtagaaa 53385345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14574068 - 14573887
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14574068 gacagatggtcagtcagagagtacgattcagtcgttagaggatttgctgatggtgtgtatacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttg 14573969  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 191  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14573968 atagagttcacgtacaacaacagttaccaatcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 14573887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16371542 - 16371222
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |   | |||    
T  16371542 gacagatggtcggtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatattcatctttcattg 16371443  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16371442 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16371343  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  16371342 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 16371243  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16371242 aaagagttatcatgataagcg 16371222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 26792401 - 26792720
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  26792401 acagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 26792500  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26792501 tcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattatgctggtttga 26792600  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||     
T  26792601 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 26792700  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  26792701 aagagttatcatgataagcg 26792720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 15348246 - 15348572
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  15348246 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 15348345  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  15348346 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 15348445  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||  |  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  15348446 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 15348545  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15348546 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 15348572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15209020 - 15208700
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| || || || || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |  |  |||    
T  15209020 gacagatggtcagtctgagagaatgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtatttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattg 15208921  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  15208920 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggacggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 15208821  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  15208820 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 15208721  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  15208720 gaagagttatcatgataagcg 15208700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15248276 - 15247956
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | || || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |  |  |||    
T  15248276 gacagatggtcagttggagagaacgatttagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtaattgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattg 15248177  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||| ||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  15248176 atatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatagtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttg 15248077  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  15248076 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgaca 15247977  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  15247976 gaagagttatcatgataagcg 15247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9522848 - 9522522
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||    
T  9522848 gacagatggtcagtcggagaggacgtttcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccattg 9522749  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||    
T  9522748 atagagttcacgtataataatatttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtcttggtttg 9522649  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| ||||| |||||    |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  9522648 agtcaggtgagagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgaca 9522549  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  9522548 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 9522522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10906339 - 10906013
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  10906339 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacgaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 10906240  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  10906239 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 10906140  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  10906139 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 10906040  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10906039 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 10906013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13252819 - 13252493
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  13252819 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 13252720  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13252719 atcgagttcacatataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttg 13252620  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || ||||||| || |||    
T  13252619 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgaca 13252520  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13252519 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 13252493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48425576 - 48425250
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  48425576 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 48425477  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  48425476 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcaaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 48425377  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  48425376 aatcaggagaaagagtggtcttaggactagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 48425277  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  48425276 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 48425250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14571810 - 14571602
Alignment:
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14571810 caggactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaag 14571711  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctt 386  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||     
T  14571710 atgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactccta 14571611  T
Q  387 tgacgggtg 395  Q
    |||||||||    
T  14571610 tgacgggtg 14571602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 15724935 - 15725278
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  15724935 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 15725034  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  15725035 atcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 15725134  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||| ||  ||||||    || || ||||| || ||||||| || |||    
T  15725135 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgaca 15725233  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  15725234 aaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 15725278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17489979 - 17489659
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  17489979 gacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatctgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 17489880  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  17489879 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 17489780  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17489779 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 17489680  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  17489679 aaagagttatcatgataagcg 17489659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 16412284 - 16412603
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  16412284 acagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 16412383  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16412384 tcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 16412483  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||   ||     
T  16412484 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaa 16412583  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  16412584 aagagttatcatgataagcg 16412603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 5424931 - 5425257
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  5424931 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 5425030  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  5425031 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttg 5425130  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  5425131 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 5425230  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5425231 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 5425257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6600821 - 6600550
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcg 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |   ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6600821 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcg 6600722  T
Q  165 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaa 264  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||    
T  6600721 aggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 6600622  T
Q  265 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    |||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6600621 agttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 6600550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 16492183 - 16492502
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || ||||    
T  16492183 acagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttaagggtttgtgttcttgagcaaggaggtacttgggatagtcatcttccattga 16492282  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||     
T  16492283 tagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacaccttgtgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgt 16492382  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
     ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||     
T  16492383 atcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 16492482  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  16492483 aagagttatcatgataagcg 16492502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15339398 - 15339072
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||     
T  15339398 gacagatggtcagtcgaagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtta 15339299  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||    
T  15339298 atcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgctggtttg 15339199  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||| | |||||| |||| ||| |||||||    ||  | |||||||| |||||||||| |||    
T  15339198 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 15339099  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| || || ||||| |||||    
T  15339098 aaagagttatcacgataagcgtagaaa 15339072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 15402511 - 15402837
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||     
T  15402511 gacagctggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtta 15402610  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  15402611 atcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttacatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 15402710  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| ||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  15402711 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 15402810  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| || || ||||| |||||    
T  15402811 aaagagttatcacgataagcgtagaaa 15402837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Original strand, 16338503 - 16338593
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16338503 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgtttagggtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacc 16338593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11564673 - 11564852
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| || || ||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  11564673 tcatctgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgagaaaggaggaacttgggatagtcat 11564772  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcg 180  Q
    |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  11564773 cttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcg 11564852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 351
Target Start/End: Original strand, 15015755 - 15016086
Alignment:
Q  20 cagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttca 119  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |   | ||||| |||||||    
T  15015755 cagtcggagaggacaattcagacgttggaggacttgttgagaatttgtgtacttgagcaaggcggaacttgggatagtcatctctcattgatcgagttca 15015854  T
Q  120 catataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggaga 219  Q
    | |  || |||||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || || ||    
T  15015855 cttgcaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcattgtatgatcggagatgcagaactccattgtgttggtatgaatccggtga 15015954  T
Q  220 gagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttac 319  Q
    || ||||||  ||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||     
T  15015955 gaatgtggtactaggaccagaaattgttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttat 15016054  T
Q  320 catgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  15016055 catgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 15016086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 16742797 - 16743032
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  16742797 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttttgt 16742896  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  16742897 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 16742996  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16742997 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 16743032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 14126595 - 14126744
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14126595 gacagatggtcagtcggtgaggaggattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14126694  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  14126695 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 14126744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 8274493 - 8274728
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  8274493 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 8274592  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  8274593 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 8274692  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8274693 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 8274728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17193100 - 17192905
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||      
T  17193100 agtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttacgaccggaag 17193001  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | || || |||| |||  | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17193000 ttgtgcaagagagtacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 17192905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15576756 - 15576521
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||      
T  15576756 agtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaag 15576657  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcact 342  Q
    | || |  ||||||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||||   |    
T  15576656 ttgtgcgagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatat 15576557  T
Q  343 agagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggt 378  Q
     ||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||    
T  15576556 tgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggt 15576521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15061885 - 15061796
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15061885 gacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgttcttgagcaaggtggaacttgggatagtca 15061796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18748678 - 18748481
Alignment:
Q  136 tcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagga 235  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||  | || || |||||||| ||||| || ||||   ||||||||    
T  18748678 tcattctagtatcggtatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttagga 18748579  T
Q  236 ccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggag 333  Q
    |||||  | || || ||||||||  | ||||||||||||||    || ||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18748578 ccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggag 18748481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 13975138 - 13975259
Alignment:
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  13975138 caaccgttgattgagtt-acttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgt 13975236  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagt 223  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  13975237 gttggtttgagtccggagagagt 13975259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 6152945 - 6153076
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||    |||||| ||||| |  ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  6152945 accgttgattgagtttacatacaacaacaattttcattctagtatcgagatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 6153044  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagg 234  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  6153045 tggtttgaatccggagaaagtgttgtgttagg 6153076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Original strand, 16828192 - 16828224
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16828192 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatc 16828224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Original strand, 267355 - 267465
Alignment:
Q  106 gttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctgg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||| || || |||    
T  267355 gttgattgagtttacctacaacaacagttttcattcgagtattgggataacaccgtttgaagctttatatgggaggaggtgtaggaatccgttgtgttgg 267454  T
Q  206 tttgagtcagg 216  Q
    | |||||||||    
T  267455 tatgagtcagg 267465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 51945 - 52329
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  51945 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttg 52043  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52044 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 52143  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  52144 agtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 52243  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52244 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtg 52329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 60979 - 61363
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  60979 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttg 61077  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61078 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 61177  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  61178 agtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 61277  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  61278 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtg 61363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 67367 - 67751
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  67367 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttg 67465  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67466 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 67565  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  67566 agtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 67665  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  67666 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtg 67751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 21437 - 21821
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21437 acagacggtcagtcggagacgacgatacaatctttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttga 21536  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 21636  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21637 gtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 21736  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21737 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 21821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26214 - 26019
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||   |||| ||||||||      
T  26214 agtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaag 26115  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || || |||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26114 ttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 26019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 13657 - 14051
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13657 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaagtggagcttgggatagtcac 13756  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13757 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagatgcaggactcctttat 13856  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13857 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 13956  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||    
T  13957 gagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtg 14051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 4718 - 5103
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4718 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagaaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 4817  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818 atagagttcacatacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaatctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 4917  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  4918 agtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcattagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 5017  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5018 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 5103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11319 - 10938
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 11220  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11219 ctactgctgatagagttcacatacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttat 11120  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |    
T  11119 gctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtctta 11020  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttact 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  11019 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttcttagggttact 10938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20663 - 20278
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20663 gacaggtggtcaatcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccactg 20564  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20563 atagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatgacattgttcgaagctttgtatagtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 20464  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20463 agtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaaaaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 20364  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  20363 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcttatgacgggtg 20278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44041 - 43666
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  44041 atggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgataga 43942  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||| |||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43941 gttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtca 43842  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  43841 ggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaga 43742  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgac 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43741 gttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgac 43666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45053 - 44678
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  45053 atggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgataga 44954  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||| |||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44953 gttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtca 44854  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  44853 ggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaga 44754  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgac 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44753 gttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgac 44678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 11358177 - 11358561
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  11358177 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctagagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 11358276  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11358277 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 11358376  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11358377 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 11358476  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11358477 aagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11358561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20833125 - 20832741
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  20833125 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 20833026  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20833025 ttgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 20832926  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20832925 gtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacag 20832826  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20832825 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 20832741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23294099 - 23293714
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23294099 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggagggtttgctgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 23294000  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  23293999 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggttgaggactcctttatgtcggtttg 23293900  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  23293899 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacg 23293800  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23293799 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 23293714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23276926 - 23276532
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23276926 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgaaagtgtttgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcat 23276827  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23276826 ctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttat 23276727  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  23276726 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 23276627  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  23276626 gagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtg 23276532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1063891 - 1063507
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  1063891 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcatgggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 1063792  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1063791 ttgagtttacttataacaacagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 1063692  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||  | |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1063691 gtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacag 1063592  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1063591 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 1063507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31830798 - 31830414
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||    
T  31830798 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttga 31830699  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | || || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31830698 ttgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 31830599  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31830598 gtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcag 31830499  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31830498 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 31830414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12574503 - 12574109
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12574503 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggacagtcac 12574404  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  12574403 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 12574304  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  12574303 gttggttcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 12574204  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  12574203 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtg 12574109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27787891 - 27787497
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27787891 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcac 27787792  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  27787791 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgt 27787692  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| || || ||||||||||| || ||    
T  27787691 gttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaaggtgatcagagagaagatgaaagcgtcaca 27787592  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  27787591 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtg 27787497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19652345 - 19652578
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652345 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 19652444  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652445 ctaccgttgatagagttcacat---acaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 19652541  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19652542 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggacc 19652578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 27365372 - 27365766
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365372 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 27365471  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  27365472 ctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggacgaaggtgcagaactcctttgt 27365571  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  27365572 gttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagcgtcgca 27365671  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  27365672 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtg 27365766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23087590 - 23087250
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23087590 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtactttagcaaggtggagcttgggatagtcacctatcgttga 23087491  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  23087490 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgactattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcggaactccgttatgttggtttga 23087391  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||| ||  | |||| | |||||| | | || |||||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  23087390 gtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgtcagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacag 23087291  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||||||    
T  23087290 aagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttca 23087250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24948730 - 24948564
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24948730 gacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 24948631  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24948630 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 24948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20828399 - 20828226
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  20828399 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 20828300  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagg 184  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20828299 ttgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagg 20828226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9610277 - 9609951
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  9610277 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 9610178  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  9610177 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 9610078  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  9610077 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 9609978  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9609977 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 9609951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16999140 - 16998815
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  16999140 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 16999041  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  16999040 tcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 16998941  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||     
T  16998940 atcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaa 16998841  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16998840 aagagttatcatgataagcgtagaaa 16998815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 24825584 - 24825904
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || ||  |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  24825584 gacagatggtcaatcggaaagaacgattcagtcgctggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcatctcccgttg 24825683  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||    
T  24825684 atagagttcacgtataataatagttaacattctagtattggtatggcaccttttgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttgggttg 24825783  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24825784 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 24825883  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     | |||||| ||||| |||||    
T  24825884 aaggagttatcatgataagcg 24825904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16982293 - 16981967
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16982293 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16982194  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16982193 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16982094  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  16982093 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 16981994  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16981993 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 16981967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17063858 - 17063532
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  17063858 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 17063759  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  17063758 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 17063659  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  17063658 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 17063559  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  17063558 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 17063532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17067516 - 17067190
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  17067516 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 17067417  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  17067416 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 17067317  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  17067316 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 17067217  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  17067216 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 17067190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 21325568 - 21325888
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  21325568 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 21325667  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  || |||| |||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  21325668 atcgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatctggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 21325767  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | || || || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | || ||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21325768 aatcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 21325867  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21325868 aaagagttatcatgataagcg 21325888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10868991 - 10868725
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  10868991 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttg 10868892  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  10868891 atcgagttcacttataacaatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 10868792  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    
T  10868791 aatcaggagaaagggtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 10868725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 24707784 - 24708125
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  24707784 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagatttattgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 24707883  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  24707884 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 24707983  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  24707984 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 24708083  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     ||||  || ||||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  24708084 aaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 24708125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24262510 - 24262191
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  24262510 acagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttga 24262411  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||| |||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  24262410 tcgagtccacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 24262311  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||     
T  24262310 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 24262211  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  24262210 aagagttatcatgataagcg 24262191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45529652 - 45529333
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  || |||    
T  45529652 gacagatggacagacgtagaggacaattcagtcgttggaggacttgttcagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccattg 45529553  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||  ||||| |||||  | ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || || |||| ||    
T  45529552 atcgagttcatttataataacagttaccattttagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcaaaactccattgtgttggtatg 45529453  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  45529452 agtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattgttcaacagactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagaca 45529353  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagc 329  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  45529352 aaagagttatcatgataagc 45529333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24675630 - 24675304
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  24675630 gacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgctagaggatttgctgagagtctgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 24675531  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  24675530 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttg 24675431  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| ||| |||||| |||    
T  24675430 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgaca 24675331  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24675330 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 24675304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24710174 - 24709848
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  24710174 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 24710075  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  24710074 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 24709975  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  24709974 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 24709875  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24709874 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 24709848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27218157 - 27217831
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||     
T  27218157 gacagatggtcagtcggacagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtta 27218058  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27218057 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 27217958  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  |  ||||  | |||||| |||||||| ||||||||   || || ||||| || |||||||||| |||    
T  27217957 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 27217858  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27217857 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 27217831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16925364 - 16925075
Alignment:
Q  47 gaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagta 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||| ||||    
T  16925364 gaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagta 16925265  T
Q  147 ttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggt 246  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||    
T  16925264 ttggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgt 16925165  T
Q  247 tcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    |||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16925164 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 16925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 41608687 - 41608914
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  41608687 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 41608786  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  41608787 atcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 41608886  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  41608887 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 41608914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 44385871 - 44386197
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  44385871 gacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttg 44385970  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  44385971 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 44386070  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || | ||| || |||||||||| |||    
T  44386071 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgaca 44386170  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  44386171 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 44386197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23064218 - 23063898
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||    
T  23064218 gacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcttttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggtacttgggatagtcatcttccattg 23064119  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  23064118 atagagttcacgtacaataatagttatcattcaagtattggaatggcaccttatgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 23064019  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||  | ||| |  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||  |||    
T  23064018 agtcaggtgaaagtgtggtcttaggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagaca 23063919  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  23063918 aaagagttaccatgataagcg 23063898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 22325158 - 22325484
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||    
T  22325158 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttg 22325257  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||    
T  22325258 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgtggtgttggtttg 22325357  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| || ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  22325358 aatcaggagaaagagcggtcttagggccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 22325457  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22325458 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 22325484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27371410 - 27371084
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  27371410 gacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 27371311  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||   || || |||||||    
T  27371310 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgaagaactatgttgtgttggtttg 27371211  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  27371210 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 27371111  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27371110 aaagagctatcatgataagcgtagaaa 27371084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 354
Target Start/End: Original strand, 24878334 - 24878641
Alignment:
Q  47 gaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagta 146  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||  ||||    
T  24878334 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattatagta 24878433  T
Q  147 ttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggt 246  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||    
T  24878434 ttggaatgacacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 24878533  T
Q  247 tcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagag 346  Q
    |||  | |||||| ||||||||  ||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||    
T  24878534 tcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgag 24878633  T
Q  347 tttcagga 354  Q
    ||||||||    
T  24878634 tttcagga 24878641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 22756767 - 22757085
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||  ||| ||||||||| |  ||||||    
T  22756767 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagggtttgtgtacttgagaaaggagggacttcggatagtcatcttccgttg 22756866  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| ||||| || || |||||  | | ||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| || || |||  ||    
T  22756867 atagacttcacgtacaataacagttaccgttctagtattggaatggcaccctttgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgttgg--tg 22756964  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  ||| |||| ||||||||||| ||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  22756965 agtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaaggtgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 22757064  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  22757065 aaagagttatcatgataagcg 22757085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 30211219 - 30211560
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  30211219 gacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccattg 30211318  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
     | |||||||| || || |||||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  || || |||| ||    
T  30211319 gtcgagttcacttacaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaaacgttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtatg 30211418  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||    |||||||| ||  || ||||  || |  ||||  |||||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  30211419 agtccaatgagagtgtagtactaagaccatacattattcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagaca 30211518  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
     |||||||||| ||| ||||| || ||||  || ||||||||    
T  30211519 aaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 30211560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 395
Target Start/End: Original strand, 21145387 - 21145717
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcg 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21145387 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagccatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 21145486  T
Q  165 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaa 264  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||  |  | || ||  | |||||| ||||    
T  21145487 aggctttatatggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgtccagcaaactactgagaa 21145586  T
Q  265 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcat 364  Q
    |||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| |  || ||     
T  21145587 agttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 21145686  T
Q  365 gtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||| |||| || |||||| |||||||||    
T  21145687 gtgtttttgagagtcactcctatgacgggtg 21145717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23189145 - 23188829
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  23189145 agatggtcagtcggagaggacagttcagtcgctagaggatttattgagagtttgtgtttttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatc 23189046  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||    
T  23189045 gagttcacatacaacaatagttatcattctagtttaggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactcc-gtgtgttggtttgagt 23188947  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||| |||||   |||    || || |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  23188946 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 23188847  T
Q  313 gagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  23188846 gagttatcatgataagcg 23188829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22276327 - 22276055
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  22276327 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 22276228  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  22276227 tggtttgagtccggagagagtgccttgttaggactggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 22276128  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  22276127 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 22276055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 12640314 - 12640549
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  12640314 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgt 12640413  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  12640414 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 12640513  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  12640514 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 12640549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25128693 - 25128474
Alignment:
Q  105 cgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctg 204  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  25128693 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattcaagtatcggtatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttatgttg 25128594  T
Q  205 gtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagt 304  Q
    ||||||||| || || |||||  |||||||| ||||  | || || ||||||||  | ||||||||||||||    || ||||||||||| || ||||||    
T  25128593 gtttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagt 25128494  T
Q  305 caacagaagagttaccatga 324  Q
      |||||||||||| |||||    
T  25128493 agacagaagagttatcatga 25128474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 328
Target Start/End: Original strand, 22761964 - 22762189
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||     
T  22761964 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgt 22762063  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||    
T  22762064 tggtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcaga 22762163  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaag 328  Q
    ||    |||||||||| |||||||||    
T  22762164 gtaggaagaagagttatcatgacaag 22762189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Original strand, 23817452 - 23817683
Alignment:
Q  107 ttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 206  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||    
T  23817452 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggt 23817551  T
Q  207 ttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtca 306  Q
    |||||||| || | ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | ||||||||||||||    || ||||| ||||| || ||||||      
T  23817552 ttgagtcaagataaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtag 23817651  T
Q  307 acagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  23817652 acagaagagttatcatgataaaaggagaaagg 23817683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24654187 - 24654101
Alignment:
Q  309 agaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24654187 agaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 24654101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Original strand, 24570063 - 24570200
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||     
T  24570063 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtaggacaccgttgtgt 24570162  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  24570163 tggtttgagttaggagaaagtgttttgttaggaccgga 24570200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Original strand, 24831622 - 24831719
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||    
T  24831622 agtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagaatgctttgttaggaccgga 24831719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 21125460 - 21125509
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgag 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21125460 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgag 21125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24945167 - 24945123
Alignment:
Q  351 aggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24945167 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 24945123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23138907 - 23138858
Alignment:
Q  281 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  23138907 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 23138858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23550697 - 23550648
Alignment:
Q  281 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  23550697 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 23550648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 22432941 - 22433335
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22432941 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtggttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 22433040  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22433041 ctactgctgatagagttcacatataacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgtaggactcctttat 22433140  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22433141 gctggtttgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgca 22433240  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  22433241 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtg 22433335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37677604 - 37677219
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  37677604 acagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgcgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 37677505  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37677504 ttgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 37677405  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37677404 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 37677305  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttc-tgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37677304 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggtg 37677219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20294936 - 20294552
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||    
T  20294936 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcagggtggagcttcggatagtcaccttccattga 20294837  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20294836 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 20294737  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20294736 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 20294637  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20294636 aagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 20294552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 20939898 - 20940282
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20939898 acagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttattgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttga 20939997  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  20939998 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagtttga 20940097  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||   ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20940098 gtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcaaactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacag 20940197  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20940198 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 20940282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41308349 - 41307965
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41308349 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttga 41308250  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41308249 tagagttcacgtacaacaacaattagcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttga 41308150  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41308149 gttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttcatcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 41308050  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41308049 aagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtg 41307965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19854847 - 19854454
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19854847 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcactggaggatttactgagagtgtgcgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcac 19854748  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19854747 ctaccgttgat-gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcacggttcgaagctttgtatagtcggaggtgcaggactcctttac 19854649  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19854648 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 19854549  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19854548 aagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 19854454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 20835713 - 20836107
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20835713 tcatcctcagacagacggtcaatcggagagaacgataccatccttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 20835812  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20835813 ctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttat 20835912  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20835913 gctggtttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 20836012  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20836013 gagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtg 20836107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 20856595 - 20856980
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  20856595 gacatatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattg 20856694  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20856695 atagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcg 20856794  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||    
T  20856795 agtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcatgaaactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgaca 20856894  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || || |||||||| || ||||  || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20856895 aaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtg 20856980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 31550133 - 31550400
Alignment:
Q  128 aacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtgg 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  31550133 aacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttg 31550232  T
Q  228 tgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaa 327  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31550233 tgttgggaccggatttagttcatgagactacggagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaa 31550332  T
Q  328 gcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31550333 gcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 31550400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20250375 - 20250049
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||    
T  20250375 gacagatggtcagttggagaggacgattcagtcgttggaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccattg 20250276  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  20250275 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 20250176  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20250175 agtcaagcgaaagagtggtcttaggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 20250076  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20250075 aaagagttaccatgataagcgtagaaa 20250049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24099428 - 24099581
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24099428 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 24099527  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatg 154  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  24099528 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatg 24099581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 19662975 - 19663161
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19662975 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaaact-----gagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 19663069  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatg 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19663070 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtccatgactcctttatg 19663161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 17044840 - 17045234
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||     
T  17044840 tcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcat 17044939  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  17044940 cttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgt 17045039  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||    
T  17045040 gttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 17045139  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  17045140 gagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtg 17045234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16078486 - 16078806
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||    
T  16078486 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttg 16078585  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16078586 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttaaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 16078685  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  16078686 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 16078785  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16078786 aaagagttatcatgataagcg 16078806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19106892 - 19106548
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19106892 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19106793  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  19106792 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagtctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcg 19106693  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  19106692 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 19106593  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||    
T  19106592 aaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcagga 19106548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 16350433 - 16350759
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  16350433 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 16350532  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  16350533 atcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 16350632  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  16350633 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 16350732  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16350733 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 16350759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 33390863 - 33391189
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  33390863 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 33390962  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  33390963 atcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 33391062  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  33391063 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 33391162  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33391163 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 33391189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 51333327 - 51333653
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  51333327 gacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 51333426  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  51333427 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 51333526  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  51333527 aatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 51333626  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  51333627 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 51333653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 20075128 - 20075278
Alignment:
Q  245 gttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactag 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20075128 gttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttg 20075227  T
Q  345 agtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20075228 agtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtg 20075278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 50620078 - 50620463
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  || |||    
T  50620078 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgtacttgagcaaggaggaaattgggatagtcatcttccattg 50620177  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  50620178 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaattgcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 50620277  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||     |||||||||| || |||||||||| |||    
T  50620278 agtcaggtgaaagtgtggttttaggacctgagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgaca 50620377  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  50620378 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtg 50620463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 19760700 - 19761020
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  19760700 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgctgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 19760799  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||  || || |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  19760800 atagagttcatgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacacctttcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcg 19760899  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||| ||||    |||||||||||||| | |||||||| |||    
T  19760900 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgaca 19760999  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  19761000 aaagagttatcatgataagcg 19761020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 41354303 - 41354629
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  41354303 gacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 41354402  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  41354403 atcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 41354502  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | || || || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | || ||| |||||||| |||||||  | || || ||||| || |||||||||| |||    
T  41354503 aatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 41354602  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41354603 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 41354629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11382902 - 11382734
Alignment:
Q  227 gtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgaca 326  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11382902 gtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgaca 11382803  T
Q  327 agcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||| || ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11382802 agcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 11382734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21837475 - 21837248
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  21837475 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 21837376  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||    
T  21837375 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgacgctttgtatggtcggagatgcacaactccgttgtgttggtttg 21837276  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21837275 aatcaggagaaagagtggtcttaggacc 21837248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 393
Target Start/End: Original strand, 19664895 - 19665093
Alignment:
Q  195 ctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagc 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  19664895 ctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagc 19664994  T
Q  295 ttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacggg 393  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19664995 gtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacggg 19665093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21830828 - 21830520
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||     
T  21830828 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgttctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtta 21830729  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  21830728 atcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttg 21830629  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| ||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  21830628 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 21830529  T
Q  310 gaagagtta 318  Q
     ||||||||    
T  21830528 aaagagtta 21830520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16369822 - 16369502
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |  || |||    
T  16369822 gacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacgtgggatagtcatcttccattg 16369723  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| |||  || || |||||||||||| |||||||||| ||| | || || |||||||    
T  16369722 atagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacactttttgaggctttgtatggtaggaggtgcagaacttcgttgtgttggtttg 16369623  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||| ||  | |||||  | |||| | | || || ||||||||    |||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16369622 agtgaggtgagaatgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 16369523  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     ||| |||| ||||| |||||    
T  16369522 aaagggttatcatgataagcg 16369502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20137303 - 20136983
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||    
T  20137303 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccattg 20137204  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| ||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||    
T  20137203 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtataggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaacttcgttgtgttggtttg 20137104  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||  |||||||||| |||    
T  20137103 agttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgaca 20137004  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  20137003 aaagagttaccatgataagcg 20136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 31539822 - 31539953
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31539822 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggacagtcac 31539921  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacag 132  Q
       || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31539922 ttgcctttgattgagtttacttataacaacag 31539953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244340
Alignment:
Q  298 gcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtg 20244340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21747934 - 21747732
Alignment:
Q  135 atcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttagg 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  21747934 atcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgctcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggcgaaagagtggtcttagg 21747835  T
Q  235 accggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggaga 334  Q
    ||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  21747834 accagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgtaga 21747735  T
Q  335 aag 337  Q
    |||    
T  21747734 aag 21747732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21749466 - 21749350
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  21749466 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 21749367  T
Q  110 atagagttcacatataa 126  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  21749366 ataaagttcacgtataa 21749350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 338
Target Start/End: Original strand, 22135520 - 22135720
Alignment:
Q  138 attcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||   ||||||||||    
T  22135520 attctagtatcgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggacc 22135619  T
Q  238 ggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaag 337  Q
     ||  | || || || ||||| || ||||||||||||||   ||  ||||||||||| || ||||||   ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22135620 agaagttgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggagaaag 22135719  T
Q  338 g 338  Q
    |    
T  22135720 g 22135720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Original strand, 20831319 - 20831554
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  20831319 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 20831418  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||| || |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  20831419 tggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 20831518  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20831519 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 20831554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 22362078 - 22362167
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22362078 gacatatggtcagtcggagaggacgatttagttgttggaagatttgttcagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtca 22362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20914602 - 20914350
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||      
T  20914602 agtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagaaagtgctatgttagaaccggaag 20914503  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcact 342  Q
    | || || ||||||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||||  | |||||||||| ||| | ||  |||||||||   |    
T  20914502 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatat 20914403  T
Q  343 agagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||| |  | ||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| ||||    
T  20914402 tgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtg 20914350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 395
Target Start/End: Original strand, 20395175 - 20395212
Alignment:
Q  358 tgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20395175 tgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtg 20395212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 48972 - 49357
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  48972 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattg 49071  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49072 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttg 49171  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  49172 agtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 49271  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  49272 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtg 49357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 254
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  648 tcatcctcagacagatggtcagacggagaggatgatccaatctttggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcat 549  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  548 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattcgtatggcaccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgtaggactcctttat 449  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  448 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgta 349  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  348 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 323245 - 322860
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  323245 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 323146  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323145 atagagttcacatacaacaacagttaccattccagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgatcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 323046  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  323045 aatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 322946  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  322945 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 322860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 118108 - 117728
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  118108 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggtatagtcacctaccgttga 118009  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  118008 tagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgttggtttga 117909  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||| ||||    
T  117908 gtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcatactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacag 117809  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacg 391  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  117808 aagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacg 117728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 386359 - 385975
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  386359 acagatggtcagtcggagataacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 386260  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  386259 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcactgttctaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttga 386160  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  386159 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcattagactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacag 386060  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||  |||||| | |||||||| || ||||||  ||||||||    
T  386059 aagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttcaagagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtg 385975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 203234 - 203537
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||    
T  203234 acagatggtcagtcggagaggacgattctgccattagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgctga 203333  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  203334 tagagttcacgtacaacaaaagttaccattctagtataggaatggcaccattcaaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatgttggtttga 203433  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||| |  | |||||  |||||||  | || |||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  203434 gtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaatattgttcaccagactacataaaaggttaagctaataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacag 203533  T
Q  311 aaga 314  Q
    ||||    
T  203534 aaga 203537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 112562 - 112177
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  112562 gacagatggtcagtcgaaaaggacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 112463  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||||| |||||||  ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  112462 atagagttcacatgcaataacagttatcattctagtattgaaatgacaccatttgaagctctgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggttcg 112363  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||| | |||| |||||| ||||    |||||||||| ||| || ||||||| |||    
T  112362 agtcaggagagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgaca 112263  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || ||||| ||||| |  ||||  || ||||||||||| |  || ||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  112262 aaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtg 112177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26801 - 26417
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  26801 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattga 26702  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26701 ttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattgggatggtaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgttggtttga 26602  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26601 gtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatgagactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacag 26502  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26501 aagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 26417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 16479 - 16863
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  16479 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttga 16578  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16579 ttgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttaa 16678  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16679 gtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagccgacag 16778  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16779 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 16863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 2907
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3301 tcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacaatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggtgcttgggatagtcac 3202  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3201 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 3102  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3101 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgca 3002  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||   ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  3001 gagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtg 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20139
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20524 gacagatgtttagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 20425  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20424 atagagttcacatacaacaaaagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 20325  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  20324 agtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaactcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcccagagtcgaca 20225  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20224 aaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 20139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 13117 - 13511
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13117 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttaggatagtcac 13216  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13217 ctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttat 13316  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  13317 gctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 13416  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  13417 gagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtg 13511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 16887 - 17281
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16887 tcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttaggatagtcac 16986  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16987 ctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttat 17086  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17087 gctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 17186  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17187 gagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtg 17281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 4906
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300 tcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttagaggattttccgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 5201  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5200 ctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactcctttat 5101  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5100 aatggtttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgca 5001  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5000 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1674
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 1379  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1380 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttat 1479  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1480 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 1579  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  1580 gagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtg 1674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6564 - 6244
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  6564 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcactagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 6465  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  6464 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 6365  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||  |  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  6364 agtctggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 6265  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  6264 aaagagttaccatgataagcg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23078 - 22907
Alignment:
Q  167 gctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaag 266  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || || || |||||||||||||| || ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |    
T  23078 gctttgtatggtaggaggtgttggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaagg 22979  T
Q  267 ttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| |  || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22978 ttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 22907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 5208 - 5546
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 5307  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5308 ctaccaatgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttggatggtcggaggtgtaggactcctttct 5407  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5408 gatggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgca 5507  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggc 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5508 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggc 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 57573 - 57966
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  57573 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaagacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacgaggtggagcttgggatagtcac 57672  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  57673 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttat 57772  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57773 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagagggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 57872  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  57873 gagttgaca-aaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 57966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 48800 - 49163
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  48800 acagatggtcagtcggaaaggacgattcaatcattagaggattgctt-agagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 48898  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  48899 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtacgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggttcga 48998  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||| | || |||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  48999 gtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatag 49098  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||   ||||||| ||||||||    
T  49099 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctgag 49163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 260858 - 260464
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  260858 tcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatctaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggacagtcac 260759  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  260758 ctaccactgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactctgttat 260659  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  260658 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgca 260559  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  260558 gagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 260464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 278595 - 278921
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  278595 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 278694  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||| |||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  278695 attgagttcgcatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 278794  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || |||||  ||||||  ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  278795 aatcaggagaaagagtggtcctaggacaagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 278894  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  278895 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 278921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Original strand, 164551 - 164794
Alignment:
Q  87 cttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 186  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||||| || ||||| ||| |||| || || ||| |||||||||| |||||    
T  164551 cttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgtatggtcgaaggtg 164650  T
Q  187 caggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaag 286  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    ||||||    
T  164651 cagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaag 164750  T
Q  287 atgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  164751 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 164794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28060 - 27675
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28060 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 27961  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27960 atagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 27861  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27860 agtcaggagaaagtgttgtgttgggaccagattcggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 27761  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  27760 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtg 27675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 915 - 1279
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  915 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatctgctgagagtgtgtgtactcgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 1014  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1015 tagagttcatgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttga 1114  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||| |||| | ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1115 gtcaagagaaaatgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 1214  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  1215 aaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgag 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 34313 - 34281
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34313 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatc 34281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 14016 - 14401
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14016 gacagatggtcagtcgaagagaacgatccaatctttggaggatttactgagaatgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 14115  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14116 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatcctggtttg 14215  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||   ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14216 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggtttatcagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14315  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14316 gaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 14401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5369
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5751 agatggttagtcggaaaggacgatccaatcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaacttggagcttgggatagtcacctaccgttgata 5652  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5651 gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtaatggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagt 5552  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5551 caggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataaggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 5452  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  5451 aagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 5369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11438 - 11044
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11438 tcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttaggatagtcac 11339  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11338 ctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttat 11239  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11238 gctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgca 11139  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11138 gagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtg 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 169 - 549
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  169 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaaact-----gagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 263  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  264 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttg 363  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  364 agtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 463  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  464 gaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtg 549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Original strand, 7668 - 7786
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  7668 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 7767  T
Q  203 tggtttgagtcaggagaga 221  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  7768 tggtttgagtccggagaga 7786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 25621 - 26015
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25621 tcatcctcagacagatggtcggtcagagaggatgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgggtacatgagcaaggtggagcttgggatagtcac 25720  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25721 ctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagaatcctttat 25820  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25821 gctggtttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccatcagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatgaaagcgtctca 25920  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25921 gagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 26015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16832
Alignment:
Q  281 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggtta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16946 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 16847  T
Q  381 ctcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||    
T  16846 ctcctttgacgggtg 16832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Original strand, 3120 - 3489
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3120 gacagatggtcagtcggagggcacgatccaatctttggaggatttgttgcgagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattg 3219  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220 atagagttcacatagaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 3319  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  3320 agtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 3419  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggtt 379  Q
    ||||||||| | ||| || || || ||||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3420 gaagagttatcgtgataaacgtaggaaggcccttttgtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggtt 3489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 149108 - 148726
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  149108 agatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggaggttgggatagtcacctaccattgata 149009  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149008 gagttcacatacaacagcagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaacctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 148909  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  148908 caggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaggatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaa 148809  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  148808 gagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 148726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 195469 - 195852
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  195469 gacagatggtc-gtcggagaggacgatacaatctttgaaggatttactgagagtgtgtgtacctgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 195567  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195568 atagagttcacatacaacaacagttaccatccgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 195667  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||| |||| | |||    
T  195668 agtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgaca 195767  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  195768 gaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatg-ttttctgagggttactcctatgacgggtg 195852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 26298 - 26683
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    | ||||    
T  26298 gacagatggtcagtcggaaaaaacgattcagttattggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatgttctgttg 26397  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| || ||||| ||| |||| || || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||| |    
T  26398 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactccgttgtgttggttcg 26497  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||   |  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26498 agttaggtgagagtgtggttttaggacaataaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 26597  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |  || ||||| ||||| |  ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  26598 aaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtg 26683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 180372 - 180237
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  180372 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgt 180273  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccg 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  180272 tggtttgagtccggagaaagtgttttgttaggaccg 180237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 90697 - 91082
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  90697 gacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgctg 90796  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  90797 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttg 90896  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  90897 agtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 90996  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  90997 gaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtg 91082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 114730 - 114542
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114730 tcatcctcagacagatggtcagtcggagtggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 114631  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcag 189  Q
    | |||||||||||||||||| || || ||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114630 ctaccgttgatagagttcacgtacaataacacttaccactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcag 114542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 448515 - 448280
Alignment:
Q  95 agtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactc 194  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||  | |||||||| ||||    
T  448515 agtcacctcccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactc 448416  T
Q  195 ctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagc 294  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||     
T  448415 cgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttttgaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagt 448316  T
Q  295 ttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  448315 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcg 448280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 390965 - 391054
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  390965 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtca 391054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27766 - 27382
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27766 gacagatggtcagtcggagaggactatacaatcattggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 27667  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27666 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcg 27567  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||    
T  27566 agtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgaca 27467  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||   ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  27466 gaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttgaatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtg 27382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47665 - 47280
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47665 gacaaatggtcagtcagagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 47566  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47565 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttg 47466  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  47465 agtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 47366  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  47365 gaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtg 47280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 9848 - 10233
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9848 gacatatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 9947  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9948 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 10047  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
     ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  10048 ggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 10147  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || ||||||||||| || || |  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10148 aaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtg 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 12541 - 12931
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    |    
T  12541 tcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacatggtggagcttgtgcta----c 12636  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12637 ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcttttat 12736  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12737 gctggtttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgta 12836  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  12837 gagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtg 12931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 18302 - 18687
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18302 gacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattagaggatttgctaaaagtgtgtgtacatgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttg 18401  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  18402 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactcctttatgttgatttg 18501  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18502 agtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 18601  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18602 gaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtg 18687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31950 - 31566
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31950 acagattgtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaagtggagcttgggatagtcacctaccgttga 31851  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31850 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgatatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttga 31751  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    || |||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31750 gttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcatcaaactacatagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 31651  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  31650 aatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtg 31566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17982 - 17653
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||  ||    
T  17982 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccactg 17883  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||| | || || ||| |||    
T  17882 atcgagttcacataaaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcagagatgtagaacttcgttgtgttgg-ttg 17784  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  17783 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 17684  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggca 340  Q
     ||| ||||  |||| ||||| || ||||||    
T  17683 aaagtgttataatgataagcgtaggaaggca 17653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14579 - 14260
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||| |  || ||||    
T  14579 acagatgctcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggaaagtcatcttccattga 14480  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    || ||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  14479 tatagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttga 14380  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||  |  | |||||  | ||||| ||||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||     
T  14379 atcaggtgaaagagtggtcttaggaccatagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 14280  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  14279 aagagttatcatgataagcg 14260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 7003 - 7388
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  7003 gacagatggtcagtcggagtggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaacgttg 7102  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7103 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcgccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 7202  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
     |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7203 tgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 7302  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  7303 taagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtg 7388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40276 - 39895
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  40276 agatggtcagtcggagaggacgattcagtcattggaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctacctttgata 40177  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40176 gagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaatgtttgaagctctgtatggtcggaggtgca-gactcctttatgttggtttgagt 40078  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40077 cgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaagattataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 39978  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39977 gagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtg 39895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 1950
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2335 gacagatggtcagtcggagaggacgatttaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtgtagcttgggatagtcacctaccgttg 2236  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2235 atagagttcacgtacaactacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggttcg 2136  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||| | |||||||  |||  || ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  2135 agtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattcttcagactacggagagggtcaagatgataagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgaca 2036  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||    
T  2035 aaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtg 1950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 51629 - 52013
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||| |||||||||| || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  51629 acagatggttagtcggagagaacaattcaatcagtagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 51728  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  51729 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatagtcggaggtgcatgactcctttgtgttggtttga 51828  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51829 gtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcaaactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacag 51928  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  51929 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtg 52013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37742 - 37414
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  37742 acagatggtcagtcggagaggacgattcaatcactagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgagatagtcatctaccgttga 37643  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | |||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  37642 tggagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttga 37543  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37542 gtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 37443  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggc 339  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37442 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggc 37414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 175 - 395
Target Start/End: Original strand, 38103 - 38324
Alignment:
Q  175 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttt-gagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||  |||| |||||||  ||||||| |||||    
T  38103 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagat 38202  T
Q  274 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctg 373  Q
    ||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  38203 gattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 38302  T
Q  374 agggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  38303 agagttactcctatgacgggtg 38324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Original strand, 27373 - 27487
Alignment:
Q  281 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggtta 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  27373 gaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagtta 27472  T
Q  381 ctcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| |||||||||    
T  27473 ctcctatgacgggtg 27487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 85
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  429 acagatggtcaaatggagaggacgatacaatctttagaggatttagtaagagtgtgtgtgcttgagcaatgtggagcttgggatagtcacctaccgttga 330  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  329 tagagttcacatacaacaaccgttaccattcgagtatttgtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttga 230  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  229 gtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcgacag 130  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggag 355  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  129 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttttaggag 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10333 - 9954
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10333 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtctacttgaacaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttga 10234  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10233 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttga 10134  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10133 gacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 10034  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| |     | ||  |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  10033 aagagttaccatgacaagcgta-----ggacgtgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtg 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 999 - 1384
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  999 gacagatggtcattcggaaaggacgatccaatctttagaggatttactaagagtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattg 1098  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1099 atagaatttacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcg 1198  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    || | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  1199 agacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgaca 1298  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || ||||||||||| || || |  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1299 aaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtg 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 26
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  409 acagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgaccaaggtggagcttgggatagtcatctaccgatga 310  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  309 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggaac-gttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgttggtttga 211  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||    
T  210 gtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcag 111  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  110 aagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtg 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4413 - 4031
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4413 agatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgatagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgata 4314  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4313 gagttcacgtacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaagcttcgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagt 4214  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  4213 cgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaa 4114  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||||||||||||||| || || |  || |||||||| ||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| ||||    
T  4113 gagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtg 4031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6725 - 6339
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||  | ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||    
T  6725 gacagatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctgaggatatgtgtacttgagcagggaggagtttgggatagtcacctaccattg 6626  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6625 atagaattcacatacaacaatagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgcttgtttg 6526  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  6525 agttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 6426  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgttttt-ctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || ||||||||||| || || |  || ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6425 aaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtg 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 6103 - 6368
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgt--gtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  6103 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctga 6202  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6203 tagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 6302  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  6303 gtcagaagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatgat 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26683 - 26298
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  26683 gacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagctttttatagtcatctaccgttg 26584  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  26583 atagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttg 26484  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  26483 agtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgaca 26384  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||    
T  26383 gaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtg 26298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27065 - 26856
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  27065 gacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttcagatagtcatctaccgttg 26966  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  26965 atagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttg 26866  T
Q  210 agtcaggaga 219  Q
    |||| |||||    
T  26865 agtcgggaga 26856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1069 - 684
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1069 gacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgcgatagtcacctaccgttg 970  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  969 atagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggctcctttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 870  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||||  | || |||||| |||||||  || |||||||||| |||||||||| |||    
T  869 agtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 770  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||||| || | ||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||    
T  769 taagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactcctatgacaggtg 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 395
Target Start/End: Original strand, 95771 - 96152
Alignment:
Q  14 gatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatag 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  95771 gatggtcagtcggaaaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatag 95870  T
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  95871 aattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtc 95970  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  95971 gggagaaagtgttgtgttggggccggacttggttcatgagactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 96070  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    || || ||||||||||| || || |  || || |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  96071 agctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtg 96152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 113097 - 112715
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  113097 agatggtcagttagagaggacgatacaatccttagaagatctgttgagggtgtgtgtacttgtgcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgata 112998  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    ||||| || || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  112997 gagtttacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaat 112898  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    | || || |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || || ||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  112897 cgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacataaaaggtaaacttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 112798  T
Q  313 gagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  112797 gagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 112715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 109576 - 109920
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  109576 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttg 109675  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  109676 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 109775  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  109776 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 109875  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  109876 gaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 109920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Original strand, 38764 - 39037
Alignment:
Q  122 tataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagaga 221  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38764 tataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgaga 38863  T
Q  222 gtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttacca 321  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  38864 gcgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatca 38963  T
Q  322 tgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||| |||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38964 tgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtg 39037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Original strand, 6806 - 7186
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6806 atggtcagtcggagagaacgattcagccgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgataga 6905  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||     
T  6906 gttcacgtataacaacaattaccattcgagtattggtatgataccgttcgaagcattgtatggtcggaggtgcagaactcaattgtgttggtttgagtcg 7005  T
Q  215 ggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaaga 314  Q
      ||| ||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||  | || || ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7006 acagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaga 7105  T
Q  315 gttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7106 gttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggtg 7186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 395
Target Start/End: Original strand, 5748 - 6064
Alignment:
Q  79 aggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5748 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 5847  T
Q  179 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataa 278  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| | | |||||  | || || ||| ||||||    
T  5848 cggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgtcaaactacagaaaaggtcaagttgataa 5947  T
Q  279 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggt 378  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  | |||||| |||||||||||    
T  5948 gagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggt 6047  T
Q  379 tactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6048 tactcctatgacgggtg 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 33433 - 33827
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33433 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 33532  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  33533 ctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgt 33632  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  33633 gttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgca 33732  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  33733 gagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 33827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40706 - 40471
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  40706 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 40607  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || ||||| ||||   |||| || |||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  40606 tggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 40507  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40506 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 40471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 3151
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3341 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 3242  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 191  Q
    | |||||||||||||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3241 ctaccgttgatagagttcacgtacaagaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6913 - 6599
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  6913 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 6814  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||    
T  6813 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttg 6714  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    ||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  6713 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 6614  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     ||||||||||||||    
T  6613 aaagagttaccatga 6599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Original strand, 28534 - 28875
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  28534 acagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagcaaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttga 28633  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||    
T  28634 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgtttga 28733  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataag-ggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||  || || ||||  ||||| |||||  |  | |||||| ||||||   | || || ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  28734 gttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgaca 28833  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  28834 gaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttca 28875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 351
Target Start/End: Original strand, 40525 - 40866
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  40525 acagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagcaaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttga 40624  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||    
T  40625 tagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgtttga 40724  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataag-ggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||  || || ||||  ||||| |||||  |  | |||||| ||||||   | || || ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  40725 gttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgaca 40824  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttca 351  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  40825 gaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttca 40866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 50270 - 50664
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50270 tcatcctcagacggatggtcagtcggagagaacgatacaatccttaaaggatctattgagggtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 50369  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  50370 ctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgt 50469  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||| | |||||  | |||||  | || |||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  50470 gttggtttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgca 50569  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||| ||||||||| |  ||| ||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||    
T  50570 gagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtg 50664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43695 - 43351
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  43695 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttg 43596  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| || || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  43595 atcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgttcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 43496  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| ||||| |||| |||    
T  43495 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgaca 43396  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||||||||| ||| | ||||| |  || |||||||||||    
T  43395 aaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcagga 43351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8971 - 8718
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcg 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8971 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 8872  T
Q  165 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaa 264  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  |||||||| ||||    
T  8871 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaa 8772  T
Q  265 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagtta 318  Q
    |||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  8771 agttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagtta 8718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15433 - 15258
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcg 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15433 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 15334  T
Q  165 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15333 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccgga 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 395
Target Start/End: Original strand, 106431 - 106723
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  106431 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgttgtgt 106530  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| ||  |||| ||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||| ||||||   ||| ||||||||||| || ||||    
T  106531 tggtttgaatccagagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcaga 106630  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||  ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||   | |||||||| |  | ||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| ||||    
T  106631 gtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtg 106723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19399 - 19070
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19399 tcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 19300  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||  |||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  19299 ctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgt 19200  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||  || | |||||  |||||||  | ||  ||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  19199 gttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgca 19100  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19099 gagtcaacagaagagctatcatgacaagcg 19070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23561 - 23232
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23561 tcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 23462  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    | |||||||  |||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  23461 ctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgt 23362  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||  || | |||||  |||||||  | ||  ||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  23361 gttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgca 23262  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23261 gagtcaacagaagagctatcatgacaagcg 23232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 180721 - 180384
Alignment:
Q  47 gaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagta 146  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||    
T  180721 gaggatttgttgagagtttgggtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagta 180622  T
Q  147 ttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggt 246  Q
    |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||    
T  180621 ttggaatgacaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgt 180522  T
Q  247 tcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagag 346  Q
    |||  |||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  || |||    
T  180521 tcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgag 180422  T
Q  347 tttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcc 384  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  180421 tttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactcc 180384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Original strand, 101320 - 101464
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  101320 agatggtcagtcagagaggatgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgata 101419  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  101420 gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggca 101464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5152
Alignment:
Q  155 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||  | || |||||| |||    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcaga 5011  T
Q  255 ctactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    | ||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  5012 ccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaaga 5111  T
Q  355 ggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||  |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||    
T  5112 gggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtg 5152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 1737 - 1886
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || | || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  1737 gacagatggtcagtcggagagaacgatttaaccgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctgtcgttg 1836  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    ||| ||||||| || |||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  1837 ataaagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcacc 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 24837 - 25153
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  24837 acagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttaagcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttga 24936  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  24937 tagagttcacgtacaacaacagttatcattctagtatttggatgacaccattcgaagctttgcatggtcggaggtgcagaactccgttctgttggtttga 25036  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | |||||  |||||||  | || |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25037 gtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacag 25136  T
Q  311 aagagttaccatgacaa 327  Q
    |||| ||| || |||||    
T  25137 aagacttatcacgacaa 25153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14901 - 14557
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14901 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14802  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  14801 atcgagttcacatacaataatagtcatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttg 14702  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  14701 agtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 14602  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| || ||||  || |||||||||||    
T  14601 aaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagga 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 853
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  ||||||    
T  1161 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttaggatagtcatcttccgttg 1062  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  1061 atcgagttcacatacaataatagttatcattaaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 962  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||| |||||||||| |||||||    || || ||||| || |||||||||| |||    
T  961 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgaca 862  T
Q  310 gaagagtta 318  Q
     ||||||||    
T  861 aaagagtta 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 10506 - 10832
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  10506 acagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggaatagtcacttgtcgttga 10605  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    ||| ||| || || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  10606 tagtgtttacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttga 10705  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||| ||  | |||||  |||||||  |||| |  ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||     
T  10706 gtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacagagaaggccaa-ttgataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 10804  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  10805 aagagttatcatgacaagtgtagaaagg 10832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4281 - 4047
Alignment:
Q  161 ttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactacta 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||| || |||||||      
T  4281 ttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacgg 4182  T
Q  261 agaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatga 360  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||    
T  4181 agaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggaga 4082  T
Q  361 tcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4081 tcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtg 4047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 12745 - 13062
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  12745 agatggtcagtcggaaagaacgatacagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgata 12844  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  12845 gagttcacatataataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagt 12944  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaa 312  Q
    ||||  ||||||  || || ||||| ||  |  ||||  | |||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  12945 caggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaa 13044  T
Q  313 gagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  13045 gagttatcatgataagcg 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8011
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  8331 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 8232  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||    
T  8231 atcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttg 8132  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| |||| |||||||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  8131 agtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 8032  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  8031 gaagagttatcatgataagcg 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9511 - 9126
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  9511 gacagattgtcagtcggaaagaacgattcaatcgttggaagacttgttgagggtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 9412  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||    
T  9411 atagagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtagaaggtgcaggactccgttgtgttggtttg 9312  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| |||||| |||| |||| ||| ||  | |||||  | ||| || |||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9311 attcaggtgagagtctggttttagcaccagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 9212  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| || |  |||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  9211 aaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtg 9126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Original strand, 216 - 349
Alignment:
Q  107 ttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 206  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  216 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccatttgaggctttgtgtggtcgaaggtgtaggacgcggttatgttggt 315  T
Q  207 ttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    |||| ||||| || ||||   |||||||||||||    
T  316 ttgattcaggtgaaagtgctttgttaggaccgga 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 395
Target Start/End: Original strand, 1104 - 1319
Alignment:
Q  180 ggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataag 279  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||| |||||    
T  1104 ggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttatgttgggaccggatttggttcattagactacggagaaggtcaagataataag 1203  T
Q  280 ggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggtt 379  Q
     |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||    
T  1204 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtt 1303  T
Q  380 actcctttgacgggtg 395  Q
    |||||| |||||||||    
T  1304 actcctatgacgggtg 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 14844 - 15188
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||   || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  14844 gacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgccgggggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 14943  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| |    
T  14944 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgtatggtcggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcg 15043  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15044 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgaca 15143  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||||||    
T  15144 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcagga 15188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 5063 - 5227
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5063 gacagatggtcagtctgagatgacgattcaatctttagagtatttactgagagtgtgtgttcttgagcaagttggagcttgggatagtcacctaccgttg 5162  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgta 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5163 atagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgta 5227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 32517 - 32837
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  32517 gacagatggtcagtcggagagaacgatccagtcgttagaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 32616  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||| | || || |||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||    
T  32617 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcatcttttgaggctttgtatgatcggagatgaagaactccgttgtgttggtttg 32716  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  32717 agtcaggtgggagtgtggttttagggccagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgaca 32816  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  32817 aaagagttatcatgataagcg 32837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15427 - 15099
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  15427 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttgaaggacttgttgagaggttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggataatcat 15328  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  || |||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||| |||||| ||||| || |    
T  15327 cttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattccagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggtaggaagtgcagaactccattgt 15228  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| || ||    
T  15227 gttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctca 15128  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagc 329  Q
    ||||| ||| | |||||| ||||| ||||    
T  15127 gagtcgacatatgagttatcatgataagc 15099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 113252 - 113341
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  | || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  113252 gacagatggtcagtcagagagaacgattcggtctctagaagatttgttgagagtttgcgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtca 113341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13028 - 12762
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |  ||||||    
T  13028 gacagatggtcagtcggagaggacaatttagtcactagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagacatcttccgttg 12929  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  12928 attgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 12829  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgat 276  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  12828 agttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgat 12762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 229584 - 229270
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  || |||    
T  229584 gacaaatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatattcatcttccattg 229485  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || | ||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  229484 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggttttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 229385  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  229384 agtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 229285  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     ||||||||||||||    
T  229284 aaagagttaccatga 229270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 395
Target Start/End: Original strand, 219182 - 219567
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||     
T  219182 gacagatggtcagtcgaagagaacgattcattcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttt 219281  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| ||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || | |||| ||||  | |||||||| ||||| || || |||||      
T  219282 atagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggttttgaatggaagaaggtgcagaactccgttgtgttggttca 219381  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  219382 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 219481  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || |  || |||||||| || || ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  219482 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtg 219567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Original strand, 33016 - 33088
Alignment:
Q  266 gttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    |||||||||||   |||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  33016 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 33088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41460 - 41347
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41460 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 41361  T
Q  110 atagagttcacata 123  Q
    ||||||||||||||    
T  41360 atagagttcacata 41347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 25484 - 25804
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||| || || || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  25484 gacagatggtcagtctgaaagaacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactttagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccgttg 25583  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || || ||||| |    
T  25584 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcagaagtgtagaactccgttgtgttggttcg 25683  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||| | ||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25684 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 25783  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||| ||| ||||| |||||    
T  25784 aaagaattatcatgataagcg 25804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 65906 - 65626
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||    
T  65906 gatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaagaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 65807  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttca 249  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||    
T  65806 gaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttca 65707  T
Q  250 tgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
      |||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  65706 gcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 65626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 330
Target Start/End: Original strand, 39592 - 39904
Alignment:
Q  18 gtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagtt 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  39592 gtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagattt 39691  T
Q  118 cacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagga 217  Q
    |||||| || |||||  ||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||     
T  39692 cacatacaataacagttatcattctagtattggaatggtaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgtcgtgttggtttgaatcaggt 39791  T
Q  218 gagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagtt 317  Q
    || |  ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  39792 gaaaaagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagtt 39891  T
Q  318 accatgacaagcg 330  Q
    | ||||| |||||    
T  39892 atcatgataagcg 39904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 63796 - 64116
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| |  ||||||    
T  63796 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaagaggaacttgggataatcatcttccgttg 63895  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || ||||   | ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  63896 atagagttcacgtacaataacaattaacattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 63995  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||| |||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  63996 agttaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 64095  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||| ||| ||||| |||||    
T  64096 aaagaattatcatgataagcg 64116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 126964 - 127284
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||    
T  126964 gacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttataggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcgtccattg 127063  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||| | || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||     
T  127064 atagagttcgcgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttta 127163  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||| |  ||||||| |||    
T  127164 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgaca 127263  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  127264 gaagagttatcatgataagcg 127284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 80259 - 80318
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgt 69  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  80259 gacagatggtcattcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 80318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 2640 - 2750
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2640 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttg 2739  T
Q  110 atagagttcac 120  Q
    |||||||||||    
T  2740 atagagttcac 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 136390 - 136269
Alignment:
Q  71 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136390 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttacaattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 136291  T
Q  171 tgtatggtcggaggtgcaggac 192  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  136290 tgtatggtcggaggtgtaggac 136269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 898
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || |||| |||||||||| || |||||||| || ||  | ||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  1226 tcatcctcagacatatggtcagtccgaaaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgcgtacttgagcaagaaggaacttgggatagtcat 1127  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  |  |||||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
T  1126 cttctattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgttcggagatgcagaactccgttgt 1027  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||    
T  1026 gttggtttgagtcaggtgatagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgca 927  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagc 329  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  926 gagtcaacaaaagagttatcatgataagc 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6555 - 6247
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  6555 gacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgttcttgatcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 6456  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||    
T  6455 attgagttcacatacaataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttg 6356  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || ||  | |||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  6355 aatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 6256  T
Q  310 gaagagtta 318  Q
     ||||||||    
T  6255 aaagagtta 6247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 330
Target Start/End: Original strand, 4210 - 4490
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||    
T  4210 gatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 4309  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttca 249  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||    
T  4310 gaatggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttca 4409  T
Q  250 tgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
      |||||||  ||||||||||||||||    || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  4410 acagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 4490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7480 - 7172
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||     
T  7480 gacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgttctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtta 7381  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  7380 atcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttg 7281  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| ||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| |||    
T  7280 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgaca 7181  T
Q  310 gaagagtta 318  Q
     ||||||||    
T  7180 aaagagtta 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9097 - 8817
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||    
T  9097 gatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 8998  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttca 249  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||    
T  8997 gaatggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttca 8898  T
Q  250 tgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
      |||||||  ||||||||||||||||    || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  8897 acagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 8817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 354
Target Start/End: Original strand, 33378 - 33682
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||    
T  33378 gatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 33477  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttca 249  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||    
T  33478 gaatggcaccttttgaagctttgtatggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttca 33577  T
Q  250 tgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagttt 349  Q
      |||||||  ||||||||||||||||    || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |  || ||||||    
T  33578 acagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttt 33677  T
Q  350 cagga 354  Q
    |||||    
T  33678 cagga 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 4220 - 4539
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| | | |||||| |||||| || || ||||    
T  4220 acagatggtcagttggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtttacttcagcaaggagtaacttgggctagtcatcatccattga 4319  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    || ||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||  || || |||||||| || ||||| ||    
T  4320 tatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggttggatttgtagaactcctttgtgttggttcga 4419  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| | ||  ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||     
T  4420 gtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 4519  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4520 aagagttaccatgataagcg 4539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 130688 - 130540
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| || ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  || ||||    
T  130688 acagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgctgagggtatgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccattga 130589  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  130588 tagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcacc 130540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 59295 - 59065
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |   | |||    
T  59295 gacagatgggcagacagagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctctcattg 59196  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||  || || |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||    
T  59195 atcgagttcatgtacaataacagttaccattctagcattgggatggcaccattcgaagcattgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtatg 59096  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    | || ||  ||| ||||||  ||||||||||    
T  59095 aatccggtaagaatgtggtactaggaccgga 59065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 134728 - 134634
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  134728 tgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcacc 134634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1680 - 1366
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  1680 gacagatggtcagttggagaggacgatgcactcgttggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 1581  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||  |||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  1580 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattgaaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttg 1481  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    |||| || || || ||||| |||||||  ||  | |||||  | |||||  |||| |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  1480 agtcgggtgaaagagtggtcttaggactagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 1381  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     || |||||||||||    
T  1380 aaaaagttaccatga 1366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 955 - 629
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  955 gacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttg 856  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  855 atcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 756  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | |||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || | ||| || |||||||||| |||    
T  755 aatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgaca 656  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  655 aaagagttatcatgataagcgtagaaa 629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22408 - 22094
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||    
T  22408 gacagatggtcagtcggagtggacaattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgtccttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttg 22309  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || ||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||| || || |||||||    
T  22308 atcgagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagatctccgttgtgttggtttg 22209  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  |||||| | |||||||||| |||||    || ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22208 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 22109  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  22108 aaagagttatcatga 22094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 33075 - 33193
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33075 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtatgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggataatcac 33174  T
Q  101 caaccgttgatagagttca 119  Q
    | |||||||||||||||||    
T  33175 ctaccgttgatagagttca 33193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 324
Target Start/End: Original strand, 86283 - 86583
Alignment:
Q  24 cggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacata 123  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||    
T  86283 cggagaggacaattcaatcattggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcactta 86382  T
Q  124 taacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagt 223  Q
    ||| |||||  | ||||| || ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || || |||| |||||| || |||| |    
T  86383 taataacagttaccattctagcattgcaatggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtccggtgagact 86482  T
Q  224 gtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatg 323  Q
    |||||  | ||||| ||| |  ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||| ||||    
T  86483 gtggtactgggaccagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatg 86582  T
Q  324 a 324  Q
    |    
T  86583 a 86583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46769 - 46542
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  46769 gacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 46670  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    || |||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  46669 atcgagttcacttacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgttgtgctggtttg 46570  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  46569 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 46542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7937 - 7594
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  7937 acagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 7838  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    | ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  7837 tcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggttttttatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 7738  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacag 310  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||  |  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    || || |||||||| ||||| |||| |||     
T  7737 gttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaa 7638  T
Q  311 aagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcagga 354  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||    
T  7637 atgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 11433 - 11531
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgtt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11433 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 11531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 7002 - 7093
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7002 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacc 7093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6587 - 6363
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgata 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  6587 agatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgata 6488  T
Q  113 gagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 212  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |    
T  6487 gagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccctatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgaat 6388  T
Q  213 caggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||| || || ||||| ||||||||    
T  6387 caggtgaaagagtggtcttaggacc 6363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1234
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| ||||| | || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| |||||||| |  ||||||    
T  1449 gacagatggttagtcgaaaagaacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgaataaggtggaacttgagatagtcatcttccgttg 1350  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || || |||||||    
T  1349 atagagttcacgtacaataacagttatcattttagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactctgttgtgttggtttg 1250  T
Q  210 agtcaggagagagtgt 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1249 agtcaggtgagagtgt 1234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 10
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  237 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtctcttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 138  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||    
T  137 atagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaacttcattatgttggtttg 38  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||    
T  37 agtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14403 - 14241
Alignment:
Q  233 ggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcgga 332  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  14403 ggaccggatttggttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcata 14304  T
Q  333 gaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  14303 gaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtg 14241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 8098 - 8299
Alignment:
Q  15 atggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgataga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||||||||    
T  8098 atggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtatgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgataga 8197  T
Q  115 gttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtca 214  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  8198 gttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatca 8297  T
Q  215 gg 216  Q
    ||    
T  8298 gg 8299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7863 - 7610
Alignment:
Q  65 tgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcg 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7863 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 7764  T
Q  165 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaa 264  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    |||||  |||||||| ||||    
T  7763 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagactgttcaacagactactgagaa 7664  T
Q  265 agttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagtta 318  Q
    |||| |||||||    || || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  7663 agttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagtta 7610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 459 - 779
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||| |  || |||    
T  459 gacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaagaaggaacttgagataatcatctcccattg 558  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||    
T  559 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttg 658  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||  ||||||||||||||||    || ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  659 agtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgaca 758  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  759 aaagagttatcatgataagcg 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 588 - 914
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || | |    
T  588 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagttgctagaggatttgttgagtgtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatgg 687  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || ||||   ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  688 atagagttcacgtacaataacaattatcattccagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 787  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||  | |||||||| ||  | |||||  | |||||  ||||||||||||||||    || |||||| |||| || ||||||| |||    
T  788 aatcaggtgaaagagtcatcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgaca 887  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  888 aaagagttatcatgaaaagcgtagaaa 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 15876
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  16205 tcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 16106  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  || ||||||| |||||| || || || |   ||||||| |||||||| |||||| | |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |    
T  16105 cttccattgatagtgttcacgtacaataatatttatcattctagtattggaatggcatcttatgaggctttttttggtcggagatgcagaactccgttgt 16006  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||| |||||||  ||  | |||||  | |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||    
T  16005 gttggtttgagttaggtgaaagggtggttttaggacacgagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgca 15906  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  15905 gagtcgacaaaagagttaccatgataagcg 15876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15789 - 15713
Alignment:
Q  254 actactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    |||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  15789 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcg 15713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5762 - 5449
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || ||  | || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  5762 gacagattgttagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagtttgcgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 5663  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || || ||  ||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  5662 atagagttcacgtacaataatagttatcattccagtatcggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 5563  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| | || |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5562 attcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 5463  T
Q  310 gaagagttaccatg 323  Q
     |||||||| ||||    
T  5462 aaagagttatcatg 5449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4572 - 4253
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||| |  || ||     
T  4572 gacagatggtcggtcggagaggacgattcagtcgttgaaggacttcttgagagtttgtttacttgagcaaggagaaacttgggatagtcatcttccatta 4473  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| || || ||||   ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||   || |||||| ||| | || || ||||| |    
T  4472 atagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgg-aagaagtgcagaacttcgttgtgttggttcg 4374  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4373 aatcaggtgagagtgtagttttaggaccagaaatcgttcaataaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 4274  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     ||||||||| |||| |||||    
T  4273 aaagagttactatgataagcg 4253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1540 - 1313
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | || || || |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||  |||||||||||| |  || |||    
T  1540 gacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagaaaggaggaatttgggatagtcatcttccattg 1441  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||  | ||||   ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  1440 atagagttcacgtactataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttg 1341  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  1340 agtcaggtgagaatgtggttttaggacc 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 116670 - 116984
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| |  ||||||    
T  116670 gacagatggtcagtcgaaaagaacgattccgtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactagagcaaggaggaacttgggttagtcatcttccgttg 116769  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||||||| || || || |||||  ||||||| |||||||| ||| |||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||  || || ||||| |    
T  116770 atagagttgacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccatttgaagttctgtatggtcggaggtgtaggactctgttgtgttggttcg 116869  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||  |  | |||||  | |||||| |||| |||||| ||||    |||||||||||||| | |||||||| |||    
T  116870 agtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgaca 116969  T
Q  310 gaagagttaccatga 324  Q
     |||||||| |||||    
T  116970 aaagagttatcatga 116984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 98423 - 98228
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||      
T  98423 agtatcggtatggtaccgtttgaggttttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaag 98324  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  98323 ttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaagg 98228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 475 - 178
Alignment:
Q  78 aaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 177  Q
    |||||||| |||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||   || |||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  475 aaggtggaacttgtgatagccatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattataattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 376  T
Q  178 tcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgata 277  Q
    | |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||  |||||| | |||||||||||||||      
T  375 ttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggactagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgagt 276  T
Q  278 agggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
       || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||  || |||||||| |||| | ||||||| ||| ||||    
T  275 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgag 178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 5372 - 5676
Alignment:
Q  26 gagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatata 125  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||| | |  || ||||| |||||||| ||||    
T  5372 gagaggacaattcattcgttcgaggatttgttgagagtttgtgtactcgagcaaggaggaacttgggatagtaatcttccattgattgagttcacgtata 5471  T
Q  126 acaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgt 225  Q
    | |||||  | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||| || |||| |||    
T  5472 ataacagttaccattctagcattggaatgacaccgttcgaagcgttgtttggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtccggtgagaatgt 5571  T
Q  226 ggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgac 325  Q
    |||  ||||||| ||  | |||||  | || ||  |||| |||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||     
T  5572 ggtactaggacctgaaattgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgat 5671  T
Q  326 aagcg 330  Q
    |||||    
T  5672 aagcg 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16181 - 16501
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || ||     
T  16181 gacaaatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgcgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccatta 16280  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||| ||||| || || || ||  ||||||| |||||||  ||| |||| || || |||||||||||   ||||||||  ||||| || || ||||| |    
T  16281 atagaattcacgtacaataatagttatcattctagtattgcaatgacaccatttgaggctttgtatggaacgaggtgcaaaactccgttgtgttggttcg 16380  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || | ||  | |||||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  16381 agtcaggtgagagtgtggttttaagaacagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgaca 16480  T
Q  310 gaagagttaccatgacaagcg 330  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  16481 aaagagttatcatgataagcg 16501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 639 - 871
Alignment:
Q  104 ccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgct 203  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||  ||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  639 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcgttctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgct 738  T
Q  204 ggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagag 303  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||| |||||||    || || |||||||| ||| ||||    
T  739 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagag 838  T
Q  304 tcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  839 tcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23802 - 23607
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggact 242  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||      
T  23802 agtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggagg 23703  T
Q  243 tggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  23702 ttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 23607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 6
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| | || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  212 gacagatggttagtcggatagtacgtttcagtcttttgatgatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattg 113  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||    
T  112 atagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttg 13  T
Q  210 agtcagg 216  Q
    | |||||    
T  12 aatcagg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50034 - 49740
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| | |  || |||    
T  50034 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgtaagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagcaaggaggaactttcgatagttatcctccattg 49935  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttg 209  Q
    |||| |||||| || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  49934 atagtgttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttg 49835  T
Q  210 agtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagt 304  Q
    |||||||  | || || || |||||||  ||  | |||||  | |||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||| |||||||||    
T  49834 agtcaggttaaagggttgttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagt 49740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 197243 - 197392
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  197243 gacagatggtcggtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttg 197342  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    |||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  197343 atagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcacc 197392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1766 - 1579
Alignment:
Q  50 gatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattg 149  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || || || ||  ||||||| ||| |||    
T  1766 gattttttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtgttg 1667  T
Q  150 gtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    | |||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  1666 gaatggcaccttatgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 348
Alignment:
Q  269 aagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgttt 368  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || || |  || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  473 aagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgttt 374  T
Q  369 ttctgagggttactcctttgacgggt 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  373 ttctgagggttactcctatgacgggt 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 18970 - 19119
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  || |||    
T  18970 gacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttattgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttaggatagtcatcttcctttg 19069  T
Q  110 atagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    ||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19070 atagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacc 19119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3690 - 3361
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcac 100  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| || |||||  | || ||| | || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | | |||||||||||||     
T  3690 tcatctgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgatttagtcgttgaaagacttgttgagagtttctgtacttgagcaaggagaaacttgggatagtcat 3591  T
Q  101 caaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttat 200  Q
    |  ||||| ||||||||||  || || |||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  3590 cttccgttaatagagttcatgtacaataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggccggagatgcagaactccattgt 3491  T
Q  201 gctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgca 300  Q
    | | |||||||||| | ||||||||    || || || ||  | || ||  | |||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||| | |||    
T  3490 gttagtttgagtcaagtgagagtgtaaatttggggccagaaatcgtgcaacaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgca 3391  T
Q  301 gagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  3390 gagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 3361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 395
Target Start/End: Original strand, 16387 - 16615
Alignment:
Q  167 gctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaag 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |  | |||||  | |||||| |||| |    
T  16387 gctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccaaaaattgttcaacaaactactgagaagg 16486  T
Q  267 ttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgt 366  Q
    ||||||||||     ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| ||||  ||||| ||    
T  16487 ttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgt 16586  T
Q  367 ttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
     ||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  16587 atttttgagagtcactcctgtgactggtg 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 366
Target Start/End: Original strand, 3733 - 3996
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  3733 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgt 3832  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| ||  |||||||||   ||||||| | |||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||    
T  3833 tggtttgaatccagagagagtgctttgttaggcctggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcaga 3932  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgt 366  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  3933 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgt 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13356 - 13121
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||     
T  13356 accgttgattgagtttacctacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccattgtgt 13257  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||| || |||||||| |   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || ||||| |||||    || ||||||||||| || ||||    
T  13256 tggtttgaatccggagagagagccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcaga 13157  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13156 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 13121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46602 - 46367
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||     
T  46602 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgt 46503  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || || |||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||    
T  46502 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaga 46403  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  46402 gtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaagg 46367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 68359 - 68430
Alignment:
Q  13 agatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtgg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  68359 agatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttaaaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtgg 68430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 71665 - 71446
Alignment:
Q  105 cgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctg 204  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||    
T  71665 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttg 71566  T
Q  205 gtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagt 304  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||    
T  71565 gtttgaatctggagaaagtgttgtgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagt 71466  T
Q  305 caacagaagagttaccatga 324  Q
      |||||||||||| |||||    
T  71465 agacagaagagttatcatga 71446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9883 - 9657
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttga 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||  | || || ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| || ||| || ||| | ||| ||||    
T  9883 acagatgatcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagcttgtgtacttgagcaaggaggaactagggttaatcatctaccattga 9784  T
Q  111 tagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttga 210  Q
    || ||||||| || ||  | ||  ||||||| |||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||    
T  9783 taaagttcacgtacaatgatagttatcattctagtattggaagggcaccttacgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttga 9684  T
Q  211 gtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||    
T  9683 gtcaggtgaaagagtggttttaggacc 9657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 3579 - 3689
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  |||||     
T  3579 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttcggatagtcatcttccgttc 3678  T
Q  110 atagagttcac 120  Q
    |||||||||||    
T  3679 atagagttcac 3689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Original strand, 3735 - 3810
Alignment:
Q  261 agaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3735 agaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4884
Alignment:
Q  11 acagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4970 acagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggaatagt 4884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 4864 - 4953
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4864 gacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtca 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Original strand, 293 - 479
Alignment:
Q  152 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatg 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || ||||   |||||||||||||  | ||  | |    
T  293 atggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaag 392  T
Q  252 agactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    |||||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 375
Target Start/End: Original strand, 3837 - 4074
Alignment:
Q  138 attcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggacc 237  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  3837 attctagtatcggcatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaagacc 3936  T
Q  238 ggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaag 337  Q
    |||  | || || |||||||| || || |||||||||||   ||| |||||||| || || || |||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  3937 ggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaag 4036  T
Q  338 gcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    |   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  4037 gatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 4074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17208
Alignment:
Q  88 ttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgc 187  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||||| || ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||||     
T  17450 ttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatggcaccttttgaggctctgtatggtcggaggtgt 17351  T
Q  188 aggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaaga 287  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| ||  |  ||||  | ||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  17350 agaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtagttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaagatgattcaagaaaaga 17251  T
Q  288 tgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcg 330  Q
    ||||||  | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  17250 tgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7616 - 7479
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||     
T  7616 accgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattggaatggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgt 7517  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccgga 240  Q
    |||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  7516 tggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgga 7479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 19767 - 19876
Alignment:
Q  10 gacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttg 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || |||    
T  19767 gacagatggtcagtcggtgaagacaattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccattg 19866  T
Q  110 atagagttca 119  Q
    ||||||||||    
T  19867 atagagttca 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3603 - 3335
Alignment:
Q  107 ttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 206  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || | ||| || || || | ||    
T  3603 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaagacaccgttgtgttagt 3504  T
Q  207 ttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtca 306  Q
    |||| |||||||| ||||   |||||||||||||  | || || |||||||   | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||      
T  3503 ttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 3404  T
Q  307 acagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgag 375  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  3403 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 3335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15104 - 14870
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  15104 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgatatagcaccgtttgaggttttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtg- 15006  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||   ||| |||||||| |  || ||||    
T  15005 tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcaga 14906  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||  |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  14905 gtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaagg 14870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43982 - 43751
Alignment:
Q  107 ttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggt 206  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||| ||  | || ||||    
T  43982 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtatgacaccgctgtgttggt 43883  T
Q  207 ttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtca 306  Q
    ||||||| ||||| ||||   | |||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||      
T  43882 ttgagtccggagaaagtgctttattaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtag 43783  T
Q  307 acagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43782 acataagagttatcatgataagaggagaaagg 43751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 912 - 1145
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgc 202  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | |||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||     
T  912 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatacaagtatcagaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgt 1011  T
Q  203 tggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcaga 302  Q
    |||||||||| ||| || ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || ||||||||| |    || ||||||||||| || ||||    
T  1012 tggtttgagttaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcaga 1111  T
Q  303 gtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 336  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  1112 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaa 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14582 - 14367
Alignment:
Q  106 gttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctgg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||    
T  14582 gttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcgccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttgg 14483  T
Q  206 tttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtc 305  Q
    ||||| || ||||| |||    |||||||||||||  | || || || ||||| || |||||||||||||     || || |||||||| || ||||||     
T  14482 tttgaatccggagaaagttctttgttaggaccggaagtcgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgaatcaagagaaaatgaaagcatctcagagta 14383  T
Q  306 aacagaagagttacca 321  Q
     |||||||||||||||    
T  14382 gacagaagagttacca 14367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14930 - 14736
Alignment:
Q  144 gtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggactt 243  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||   | || || | |||||||||||| || |||||  |||||||||||||  |    
T  14930 gtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggatgtcgttgtgtttgtttgagtcaggtgaaagtgttttgttaggaccggaagt 14831  T
Q  244 ggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
     || || ||||||||  | ||| ||||||||||    || ||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  14830 tgtgcaagagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 14736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34022 - 33952
Alignment:
Q  89 tgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcacc 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  34022 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 25957 - 26250
Alignment:
Q  45 tggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcaccaaccgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgag 144  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |||||||||      ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||| | ||    
T  25957 tggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttgggatagatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctag 26056  T
Q  145 tattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttg 244  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || || || |||||| | || || || |||    |||||||||  ||  |     
T  26057 tatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgttggttttaatccggtgaaagttctttgttaggactagaagtt 26156  T
Q  245 gttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    || || || |||||  | || |||||||||||   |||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26157 gtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaagg 26250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 97 - 8
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggac 192  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  97 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggac 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 338
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1517
Alignment:
Q  114 agttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtc 213  Q
    ||||||| || ||||||||   |||||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| || || || | |||||||||    
T  1293 agttcacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagtttgagtc 1392  T
Q  214 aggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaagttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaag 313  Q
    ||| || ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |||||||||||    || ||||||||||| || ||||||  | |||||    
T  1393 aggtgaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaag 1492  T
Q  314 agttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||    
T  1493 agttatcatgataagaagagaaagg 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 338
Target Start/End: Original strand, 8813 - 8984
Alignment:
Q  167 gctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactaagaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||   |||||||||||||  | || || ||||||||  | || |    
T  8813 gctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccgaagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaagg 8912  T
Q  267 ttaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 338  Q
    ||||||||||    || ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8913 ttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagg 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 395
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4289
Alignment:
Q  323 gacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtg 395  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||    
T  4217 gacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtg 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 965 - 1003
Alignment:
Q  1 tcatcttccgacagatggtcagtcggagaggacgatcca 39  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 tcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatcca 1003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10622 - 10511
Alignment:
Q  284 aagatgaaagcttcgcagagtcaacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcactagagtttcaggaggatgatcatgtttttctgagggttactc 383  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||   | |||||||| |  | ||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  10622 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 10523  T
Q  384 ctttgacgggtg 395  Q
    ||||||| ||||    
T  10522 ctttgaccggtg 10511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 28164 - 28259
Alignment:
Q  143 agtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttaggaccg 238  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||   |||||||||||    
T  28164 agtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacaccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccg 28259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18410
Alignment:
Q  103 accgttgatagagttcacatataacaacagccatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggac 192  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||   |||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  18499 accgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggacagaggtgtaggac 18410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25513 - 25464
Alignment:
Q  12 cagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgaga 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||    
T  25513 cagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgaga 25464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University