View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20326_low_11 (Length: 343)

Name: NF20326_low_11
Description: NF20326
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20326_low_11
NF20326_low_11
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (1-337)||(12497799-12498135)
chr3 (1-337)||(14876742-14877078)
chr3 (3-337)||(17489401-17489735)
chr3 (1-337)||(16370964-16371300)
chr3 (3-337)||(16492426-16492760)
chr3 (1-337)||(16807169-16807505)
chr3 (3-337)||(9522270-9522604)
chr3 (1-337)||(16691711-16692047)
chr3 (3-325)||(10905773-10906095)
chr3 (3-337)||(15348490-15348824)
chr3 (3-325)||(10005163-10005485)
chr3 (3-325)||(48425010-48425332)
chr3 (3-325)||(13252253-13252575)
chr3 (3-325)||(15589637-15589959)
chr3 (3-325)||(16635336-16635658)
chr3 (3-325)||(43162660-43162982)
chr3 (3-337)||(15402755-15403089)
chr3 (3-325)||(20062299-20062621)
chr3 (3-337)||(53385263-53385597)
chr3 (1-337)||(15725177-15725512)
chr3 (3-330)||(26792644-26792971)
chr3 (3-337)||(5425175-5425508)
chr3 (3-337)||(15208442-15208776)
chr3 (3-337)||(15338820-15339154)
chr3 (3-337)||(16412527-16412861)
chr3 (3-337)||(6600298-6600632)
chr3 (3-337)||(16756830-16757164)
chr3 (3-310)||(15247725-15248032)
chr3 (29-319)||(15227228-15227518)
chr3 (36-310)||(13972387-13972661)
chr3 (9-337)||(14571409-14571737)
chr3 (1-319)||(13322884-13323202)
chr3 (1-301)||(15953200-15953500)
chr3 (1-336)||(47123506-47123841)
chr3 (1-336)||(10383531-10383866)
chr3 (29-319)||(18134606-18134896)
chr3 (36-310)||(14086261-14086535)
chr3 (9-337)||(10420285-10420613)
chr3 (36-271)||(12850546-12850781)
chr3 (3-198)||(15015989-15016184)
chr3 (48-322)||(16329938-16330212)
chr3 (1-301)||(8759314-8759614)
chr3 (1-301)||(13941621-13941921)
chr3 (1-301)||(41177119-41177419)
chr3 (36-337)||(11304040-11304341)
chr3 (2-319)||(12360775-12361092)
chr3 (36-322)||(11961301-11961587)
chr3 (1-337)||(44776808-44777144)
chr3 (29-301)||(16381190-16381459)
chr3 (193-337)||(31945033-31945177)
chr3 (15-178)||(8274656-8274819)
chr3 (36-310)||(16836777-16837045)
chr3 (195-337)||(31689049-31689191)
chr3 (1-178)||(16742946-16743123)
chr3 (1-178)||(15576470-15576647)
chr3 (1-162)||(18748401-18748562)
chr3 (15-100)||(17192892-17192977)
chr3 (15-178)||(13975302-13975465)
chr3 (60-178)||(6153141-6153259)
chr3 (15-77)||(6712666-6712728)
chr3 (60-162)||(21686681-21686783)
chr3 (284-340)||(320781-320836)
chr3 (276-337)||(12854365-12854426)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-337)||(23573606-23573942)
chr5 (3-337)||(23440089-23440423)
chr5 (10-337)||(23516405-23516732)
chr5 (1-337)||(18775641-18775977)
chr5 (3-337)||(21984493-21984827)
chr5 (3-337)||(25423053-25423387)
chr5 (1-302)||(20798659-20798960)
chr5 (3-323)||(26738893-26739213)
chr5 (3-337)||(14999927-15000261)
chr5 (1-337)||(22333073-22333409)
chr5 (1-337)||(22134532-22134868)
chr5 (3-337)||(19769824-19770158)
chr5 (3-337)||(27610218-27610552)
chr5 (3-325)||(40708656-40708978)
chr5 (3-337)||(27668678-27669012)
chr5 (3-337)||(27685588-27685922)
chr5 (3-325)||(34566370-34566692)
chr5 (3-325)||(16356378-16356700)
chr5 (3-337)||(27518271-27518605)
chr5 (3-337)||(41770706-41771040)
chr5 (1-337)||(37291682-37292018)
chr5 (3-337)||(23471093-23471427)
chr5 (3-312)||(22348314-22348621)
chr5 (1-337)||(29476259-29476595)
chr5 (3-337)||(20468284-20468618)
chr5 (96-337)||(20573385-20573626)
chr5 (123-325)||(21343666-21343868)
chr5 (3-258)||(21498224-21498479)
chr5 (29-300)||(21564180-21564451)
chr5 (1-319)||(21890945-21891263)
chr5 (1-310)||(23442479-23442788)
chr5 (36-319)||(24735832-24736115)
chr5 (36-319)||(24749775-24750058)
chr5 (3-319)||(22461816-22462132)
chr5 (41-319)||(24737011-24737289)
chr5 (29-337)||(28923982-28924290)
chr5 (1-337)||(20773606-20773942)
chr5 (29-337)||(28895156-28895464)
chr5 (1-336)||(37545682-37546018)
chr5 (1-336)||(14887177-14887512)
chr5 (1-340)||(22236106-22236445)
chr5 (75-337)||(21662300-21662561)
chr5 (36-336)||(25847922-25848222)
chr5 (1-336)||(20342129-20342464)
chr5 (103-322)||(21404715-21404934)
chr5 (1-322)||(23080275-23080596)
chr5 (47-322)||(24798629-24798904)
chr5 (1-319)||(20821317-20821635)
chr5 (75-301)||(21665761-21665986)
chr5 (36-322)||(22381060-22381346)
chr5 (36-322)||(22502540-22502826)
chr5 (3-125)||(21339474-21339596)
chr5 (1-301)||(17269519-17269819)
chr5 (1-178)||(11210880-11211057)
chr5 (15-178)||(27011089-27011252)
chr5 (1-162)||(23503464-23503625)
chr5 (15-178)||(21937388-21937551)
chr5 (15-178)||(24581216-24581379)
chr5 (249-337)||(21625382-21625470)
chr5 (1-82)||(21404939-21405020)
chr5 (9-158)||(25244546-25244695)
chr5 (9-158)||(25308698-25308847)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-337)||(24675052-24675388)
chr2 (5-337)||(22757011-22757343)
chr2 (1-337)||(24708026-24708362)
chr2 (6-337)||(21325815-21326146)
chr2 (1-337)||(23188571-23188907)
chr2 (3-331)||(21145576-21145904)
chr2 (26-337)||(23138600-23138911)
chr2 (26-337)||(23550390-23550701)
chr2 (3-313)||(23063664-23063974)
chr2 (3-325)||(16924835-16925157)
chr2 (3-325)||(16998575-16998897)
chr2 (3-325)||(16981727-16982049)
chr2 (3-325)||(17063292-17063614)
chr2 (3-337)||(24709596-24709930)
chr2 (3-337)||(44386115-44386449)
chr2 (3-325)||(9609711-9610033)
chr2 (3-337)||(22325402-22325736)
chr2 (3-337)||(24261933-24262267)
chr2 (3-337)||(24878541-24878875)
chr2 (3-325)||(27217591-27217913)
chr2 (3-337)||(27370832-27371166)
chr2 (3-325)||(10868425-10868747)
chr2 (87-337)||(27377101-27377351)
chr2 (3-325)||(17066953-17067272)
chr2 (29-337)||(23087013-23087321)
chr2 (1-322)||(30211461-30211782)
chr2 (3-238)||(24825828-24826063)
chr2 (36-310)||(27365658-27365932)
chr2 (1-317)||(45529100-45529410)
chr2 (1-336)||(31830222-31830557)
chr2 (1-322)||(11358418-11358739)
chr2 (1-337)||(23276339-23276675)
chr2 (9-319)||(23293539-23293849)
chr2 (160-337)||(41609047-41609224)
chr2 (36-336)||(20832549-20832849)
chr2 (1-336)||(1063315-1063650)
chr2 (29-301)||(27787340-27787612)
chr2 (60-299)||(24653946-24654185)
chr2 (1-301)||(12573952-12574252)
chr2 (240-322)||(24833356-24833438)
chr2 (136-301)||(24944966-24945131)
chr2 (15-178)||(22276001-22276164)
chr2 (1-160)||(25128387-25128546)
chr2 (16-77)||(27368391-27368452)
chr2 (1-162)||(24570212-24570373)
chr2 (15-178)||(12640477-12640640)
chr2 (293-337)||(45676685-45676729)
chr2 (15-162)||(22762127-22762274)
chr2 (1-100)||(23817597-23817696)
chr2 (15-178)||(24831745-24831908)
chr2 (294-337)||(23599834-23599877)
chr2 (276-316)||(17967577-17967617)
chr2 (114-162)||(23817750-23817798)
chr2 (114-162)||(28144701-28144749)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-335)||(278837-279171)
scaffold0005 (3-337)||(164718-165052)
scaffold0005 (1-337)||(308622-308958)
scaffold0005 (36-337)||(260271-260572)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-337)||(30313591-30313927)
chr8 (3-337)||(21166986-21167320)
chr8 (1-337)||(19977965-19978301)
chr8 (1-337)||(16408492-16408828)
chr8 (1-337)||(15533378-15533714)
chr8 (3-337)||(22164640-22164974)
chr8 (1-337)||(32600142-32600478)
chr8 (3-337)||(22133490-22133824)
chr8 (3-337)||(21250940-21251273)
chr8 (1-337)||(22046372-22046707)
chr8 (3-337)||(21394314-21394648)
chr8 (3-337)||(21788807-21789141)
chr8 (3-337)||(21922184-21922518)
chr8 (3-337)||(23650039-23650373)
chr8 (3-337)||(17674472-17674806)
chr8 (28-337)||(22032030-22032339)
chr8 (3-325)||(19112700-19113022)
chr8 (3-337)||(20018199-20018533)
chr8 (6-337)||(19485322-19485653)
chr8 (3-337)||(22987199-22987533)
chr8 (1-337)||(22120621-22120957)
chr8 (96-337)||(15441179-15441420)
chr8 (3-322)||(20396574-20396893)
chr8 (62-337)||(23948887-23949162)
chr8 (29-301)||(20388133-20388405)
chr8 (1-337)||(21681917-21682253)
chr8 (3-190)||(22377902-22378089)
chr8 (3-190)||(22384077-22384264)
chr8 (36-319)||(20010382-20010665)
chr8 (1-319)||(20007866-20008184)
chr8 (1-337)||(23654925-23655261)
chr8 (36-319)||(1266255-1266538)
chr8 (1-336)||(6679110-6679445)
chr8 (36-319)||(19851427-19851710)
chr8 (36-319)||(19857463-19857746)
chr8 (1-337)||(22061880-22062216)
chr8 (1-319)||(21324856-21325175)
chr8 (36-336)||(804155-804455)
chr8 (1-319)||(31416921-31417239)
chr8 (1-337)||(21840415-21840751)
chr8 (36-336)||(14565141-14565441)
chr8 (1-336)||(6603657-6603992)
chr8 (1-301)||(31571289-31571589)
chr8 (36-322)||(29303908-29304194)
chr8 (63-337)||(16265127-16265401)
chr8 (60-336)||(28982356-28982632)
chr8 (60-336)||(28987576-28987852)
chr8 (36-322)||(12304771-12305057)
chr8 (1-178)||(20652780-20652957)
chr8 (125-336)||(27347225-27347436)
chr8 (12-178)||(21196960-21197126)
chr8 (3-97)||(23949158-23949252)
chr8 (15-178)||(22982593-22982756)
chr8 (36-180)||(22051018-22051162)
chr8 (15-178)||(16877556-16877719)
chr8 (15-178)||(21850798-21850961)
chr8 (15-162)||(22315364-22315511)
chr8 (3-59)||(18856853-18856909)
chr8 (1-32)||(22040162-22040193)
chr8 (9-159)||(25282307-25282457)
chr8 (93-169)||(19863223-19863299)
chr8 (93-169)||(19867860-19867936)
chr8 (305-337)||(22179309-22179341)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-337)||(16355189-16355525)
chr4 (1-337)||(16252189-16252525)
chr4 (3-337)||(12523608-12523942)
chr4 (1-337)||(14680499-14680835)
chr4 (1-337)||(18227190-18227526)
chr4 (1-304)||(15149750-15150053)
chr4 (3-337)||(7090365-7090698)
chr4 (3-337)||(14652240-14652574)
chr4 (3-337)||(19778539-19778873)
chr4 (3-325)||(23955691-23956013)
chr4 (3-337)||(14851112-14851446)
chr4 (3-325)||(18297149-18297471)
chr4 (3-325)||(8386356-8386678)
chr4 (3-337)||(27711268-27711602)
chr4 (1-337)||(14159424-14159760)
chr4 (1-337)||(14303722-14304057)
chr4 (3-325)||(12476544-12476866)
chr4 (3-325)||(29039150-29039472)
chr4 (3-337)||(40472972-40473306)
chr4 (3-337)||(14266645-14266979)
chr4 (3-337)||(8053369-8053703)
chr4 (72-325)||(15364330-15364583)
chr4 (1-319)||(15003368-15003686)
chr4 (149-337)||(14927151-14927339)
chr4 (1-336)||(3264798-3265133)
chr4 (1-336)||(11207235-11207570)
chr4 (1-322)||(15070360-15070681)
chr4 (36-319)||(16145862-16146145)
chr4 (1-336)||(29453541-29453876)
chr4 (1-132)||(16676447-16676578)
chr4 (36-337)||(15245856-15246157)
chr4 (36-319)||(1649316-1649599)
chr4 (3-322)||(33222865-33223184)
chr4 (36-322)||(20890930-20891215)
chr4 (1-322)||(44661870-44662191)
chr4 (30-169)||(15415059-15415198)
chr4 (1-301)||(51606185-51606485)
chr4 (3-125)||(1640171-1640293)
chr4 (1-220)||(15359094-15359313)
chr4 (250-337)||(18607823-18607910)
chr4 (15-178)||(13247736-13247899)
chr4 (90-301)||(42702871-42703082)
chr4 (1-196)||(27900459-27900654)
chr4 (140-282)||(18164332-18164474)
chr4 (1-162)||(12132413-12132574)
chr4 (15-176)||(55375376-55375537)
chr4 (15-178)||(14997407-14997570)
chr4 (36-197)||(16752665-16752826)
chr4 (15-178)||(16445230-16445393)
chr4 (9-202)||(9849490-9849683)
chr4 (15-178)||(9290926-9291089)
chr4 (15-178)||(15293175-15293338)
chr4 (227-319)||(15415209-15415301)
chr4 (204-337)||(15319515-15319648)
chr4 (36-109)||(8706078-8706151)
chr4 (1-162)||(16685361-16685522)
chr4 (305-337)||(15351934-15351966)
chr4 (1-79)||(15077825-15077903)
chr4 (266-319)||(15359326-15359379)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (1-337)||(65369-65704)
scaffold0042 (129-337)||(39924-40132)
scaffold0042 (3-81)||(39828-39906)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-337)||(14323-14659)
scaffold0044 (1-337)||(583-919)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (3-335)||(12497824-12498156)
chr6 (3-335)||(12510745-12511077)
chr6 (1-337)||(19864483-19864819)
chr6 (1-337)||(25765439-25765774)
chr6 (3-335)||(12505153-12505485)
chr6 (1-337)||(16963516-16963852)
chr6 (49-337)||(21833178-21833466)
chr6 (1-337)||(16927789-16928125)
chr6 (6-337)||(22078842-22079173)
chr6 (3-337)||(25610012-25610346)
chr6 (3-331)||(1543235-1543563)
chr6 (1-337)||(5839368-5839704)
chr6 (3-337)||(23078265-23078599)
chr6 (3-337)||(27331584-27331918)
chr6 (3-337)||(27392324-27392658)
chr6 (3-337)||(16626868-16627202)
chr6 (3-337)||(18408094-18408428)
chr6 (3-337)||(25112348-25112682)
chr6 (3-337)||(24313319-24313653)
chr6 (3-337)||(28263348-28263682)
chr6 (3-337)||(28342097-28342431)
chr6 (3-325)||(29592071-29592393)
chr6 (3-337)||(2874954-2875288)
chr6 (3-337)||(27187232-27187566)
chr6 (3-337)||(27261674-27262008)
chr6 (5-337)||(22762608-22762940)
chr6 (3-337)||(28292523-28292857)
chr6 (113-337)||(17032358-17032582)
chr6 (1-311)||(18197696-18198006)
chr6 (36-322)||(21471412-21471698)
chr6 (42-337)||(25750605-25750900)
chr6 (1-319)||(15459150-15459468)
chr6 (200-337)||(22433793-22433930)
chr6 (36-310)||(14131363-14131637)
chr6 (36-301)||(25768023-25768288)
chr6 (1-337)||(22796781-22797117)
chr6 (1-322)||(10468998-10469319)
chr6 (36-319)||(18794504-18794787)
chr6 (36-319)||(19879112-19879395)
chr6 (36-310)||(21564316-21564590)
chr6 (36-283)||(34645770-34646017)
chr6 (1-322)||(24364223-24364544)
chr6 (36-308)||(11287782-11288054)
chr6 (1-254)||(17415365-17415618)
chr6 (36-308)||(11280689-11280961)
chr6 (1-319)||(8766297-8766615)
chr6 (27-127)||(11291818-11291918)
chr6 (1-301)||(27560766-27561066)
chr6 (1-235)||(14381616-14381850)
chr6 (29-190)||(1640715-1640876)
chr6 (55-179)||(25750900-25751024)
chr6 (1-75)||(22433927-22434001)
chr6 (1-178)||(25743236-25743413)
chr6 (1-205)||(18800870-18801074)
chr6 (1-301)||(28282962-28283262)
chr6 (15-178)||(16098005-16098168)
chr6 (15-162)||(18571622-18571769)
chr6 (15-178)||(16382536-16382699)
chr6 (12-160)||(25655456-25655604)
chr6 (212-319)||(18787702-18787809)
chr6 (15-178)||(23996203-23996366)
chr6 (1-178)||(18838057-18838234)
chr6 (15-162)||(1648947-1649094)
chr6 (222-319)||(1640613-1640710)
chr6 (1-178)||(15078513-15078690)
chr6 (15-162)||(21413101-21413248)
chr6 (1-175)||(16233167-16233341)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-337)||(17329-17665)
chr7 (3-337)||(11553117-11553451)
chr7 (1-337)||(12687422-12687758)
chr7 (3-337)||(15154667-15155001)
chr7 (1-337)||(14954541-14954877)
chr7 (3-337)||(8707526-8707860)
chr7 (3-337)||(14332318-14332652)
chr7 (3-325)||(8198561-8198883)
chr7 (3-337)||(10870916-10871250)
chr7 (3-337)||(14037728-14038062)
chr7 (3-337)||(14347758-14348092)
chr7 (3-337)||(15161072-15161406)
chr7 (3-337)||(11237228-11237562)
chr7 (3-337)||(18551773-18552107)
chr7 (3-337)||(18177663-18177997)
chr7 (3-337)||(23516784-23517118)
chr7 (3-325)||(44791366-44791688)
chr7 (3-337)||(13685984-13686319)
chr7 (3-337)||(15203800-15204134)
chr7 (3-271)||(15624539-15624807)
chr7 (28-319)||(12206818-12207109)
chr7 (1-337)||(15102592-15102928)
chr7 (1-319)||(19147151-19147469)
chr7 (1-319)||(20746550-20746868)
chr7 (36-337)||(14264270-14264571)
chr7 (36-319)||(11388454-11388736)
chr7 (36-336)||(11306289-11306589)
chr7 (36-319)||(8212154-8212437)
chr7 (36-319)||(16072320-16072603)
chr7 (1-322)||(21661900-21662218)
chr7 (1-336)||(49152224-49152559)
chr7 (3-319)||(13665493-13665804)
chr7 (1-301)||(16950462-16950762)
chr7 (1-301)||(18053944-18054244)
chr7 (1-340)||(6413430-6413769)
chr7 (3-154)||(35964865-35965016)
chr7 (1-322)||(13021294-13021615)
chr7 (36-301)||(14286402-14286667)
chr7 (30-301)||(23199763-23200034)
chr7 (30-301)||(23505890-23506161)
chr7 (1-322)||(12455640-12455960)
chr7 (36-337)||(14129795-14130096)
chr7 (36-337)||(14433613-14433914)
chr7 (1-79)||(9596236-9596314)
chr7 (3-109)||(11772256-11772362)
chr7 (15-162)||(14936443-14936590)
chr7 (36-301)||(26288063-26288327)
chr7 (1-301)||(1398-1698)
chr7 (15-178)||(12368603-12368766)
chr7 (1-178)||(4440008-4440185)
chr7 (276-337)||(12254326-12254387)
chr7 (1-217)||(26118596-26118812)
chr7 (15-178)||(7823980-7824143)
chr7 (15-162)||(15364036-15364183)
chr7 (15-178)||(27107801-27107964)
chr7 (17-178)||(21674562-21674723)
chr7 (186-301)||(15340454-15340569)
chr7 (1-162)||(45146652-45146812)
chr7 (195-319)||(15479323-15479447)
chr7 (1-77)||(17923862-17923938)
chr7 (243-322)||(26118817-26118896)
chr7 (55-169)||(41213-41327)
chr7 (3-160)||(12193654-12193811)
chr7 (18-158)||(17145288-17145428)
chr7 (1-160)||(13378796-13378955)
chr7 (36-98)||(12456940-12457002)
chr7 (1-33)||(5764718-5764750)
chr7 (134-162)||(13353247-13353275)
chr7 (305-337)||(13634038-13634070)
chr7 (36-100)||(15340590-15340654)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-337)||(33580-33916)
scaffold0109 (1-337)||(8559-8895)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-337)||(17045091-17045427)
chr1 (3-337)||(19106314-19106648)
chr1 (3-337)||(20249797-20250131)
chr1 (3-337)||(20136725-20137059)
chr1 (1-337)||(16078728-16079045)
chr1 (3-337)||(16350677-16351011)
chr1 (3-337)||(50620322-50620656)
chr1 (3-337)||(21747482-21747815)
chr1 (3-337)||(33391107-33391441)
chr1 (3-337)||(19760944-19761278)
chr1 (3-337)||(51333571-51333905)
chr1 (3-337)||(21830250-21830584)
chr1 (3-337)||(21836897-21837231)
chr1 (6-337)||(41354550-41354881)
chr1 (18-314)||(16369267-16369563)
chr1 (111-337)||(50612602-50612828)
chr1 (1-319)||(19664952-19665270)
chr1 (183-337)||(21163227-21163381)
chr1 (9-301)||(20940147-20940439)
chr1 (1-319)||(19854279-19854597)
chr1 (3-319)||(20856839-20857155)
chr1 (36-336)||(37677027-37677328)
chr1 (36-322)||(20294374-20294660)
chr1 (36-322)||(31550292-31550578)
chr1 (1-337)||(22433192-22433528)
chr1 (36-322)||(20075170-20075456)
chr1 (36-218)||(41307891-41308073)
chr1 (46-301)||(20244183-20244438)
chr1 (1-271)||(20835964-20836237)
chr1 (36-202)||(11382676-11382842)
chr1 (126-336)||(20395194-20395404)
chr1 (15-178)||(20831482-20831645)
chr1 (1-178)||(20914316-20914493)
chr1 (15-178)||(46518827-46518990)
chr1 (243-337)||(24476927-24477021)
chr1 (9-162)||(21202371-21202524)
chr1 (12-123)||(22135645-22135756)
chr1 (116-178)||(22142232-22142294)
chr1 (10-102)||(20184364-20184456)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-337)||(64038-64374)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (3-337)||(639-973)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-337)||(4412-4748)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (3-337)||(5977-6311)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-337)||(127208-127542)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (3-337)||(703-1036)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (3-337)||(5986-6320)
scaffold0120 (36-301)||(1566-1831)
scaffold0120 (1-178)||(22816-22993)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-337)||(180180-180516)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (3-337)||(219426-219760)
scaffold0012 (3-337)||(229006-229340)
scaffold0012 (15-178)||(33016-33179)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (3-337)||(6335-6669)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (3-337)||(32761-33095)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (3-337)||(16950-17284)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (3-337)||(832-1165)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-337)||(7340-7676)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (36-337)||(27930-28231)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (3-331)||(109820-110148)
scaffold0029 (36-319)||(112540-112823)
scaffold0029 (1-337)||(96009-96345)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (3-331)||(43123-43451)
scaffold0028 (1-337)||(8448-8784)
scaffold0028 (1-132)||(13834-13965)
scaffold0028 (36-310)||(50556-50830)
scaffold0028 (15-178)||(106594-106757)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (38-337)||(26-325)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (3-337)||(1102-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-337)||(5184-5518)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (10-337)||(14002-14329)
scaffold0106 (10-337)||(31373-31700)
scaffold0106 (1-82)||(17660-17741)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (15-337)||(9306-9628)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (3-337)||(15456-15789)
scaffold0333 (3-123)||(15832-15952)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (3-337)||(377-711)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-325)||(3115-3437)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (3-337)||(3995-4329)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (3-337)||(16474-16808)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-337)||(14840-15174)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (3-337)||(15088-15422)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (3-325)||(26542-26864)
scaffold0011 (1-337)||(195710-196045)
scaffold0011 (36-319)||(148551-148834)
scaffold0011 (136-337)||(68582-68783)
scaffold0011 (15-178)||(121971-122134)
scaffold0011 (15-77)||(180147-180209)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (3-337)||(448022-448356)
scaffold0001 (17-337)||(162076-162396)
scaffold0001 (1-301)||(90939-91239)
scaffold0001 (1-178)||(78636-78813)
scaffold0001 (136-211)||(175352-175427)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (3-337)||(6900-7236)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (3-337)||(968-1301)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (3-337)||(111984-112318)
scaffold0004 (36-337)||(203510-203811)
scaffold0004 (3-336)||(117532-117865)
scaffold0004 (1-301)||(322703-323003)
scaffold0004 (1-322)||(385797-386118)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (3-324)||(269-590)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-301)||(1-301)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (3-322)||(116914-117233)
scaffold0037 (15-178)||(98137-98300)
scaffold0037 (81-178)||(23553-23650)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-236)||(7854-8089)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (3-287)||(49506-49790)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (3-337)||(12986-13320)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-235)||(21932-22166)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (3-337)||(16425-16759)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (115-337)||(16920-17142)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (3-322)||(886-1205)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (3-322)||(25728-26047)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (29-322)||(25106-25399)
scaffold0234 (36-195)||(16213-16372)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (9-322)||(5606-5918)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (29-319)||(10774-11064)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-322)||(86511-86832)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (7-223)||(9047-9263)
scaffold0507 (225-337)||(6940-7052)
scaffold0507 (12-178)||(351-517)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (3-175)||(7522-7694)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (30-301)||(28805-29076)
scaffold0064 (30-301)||(40796-41067)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-310)||(26132-26441)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (3-199)||(789-985)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-301)||(47123-47423)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-337)||(13908-14244)
scaffold0034 (1-265)||(4960-5224)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-301)||(3874-4174)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (36-256)||(58448-58668)
scaffold0058 (1-300)||(19120-19419)
scaffold0058 (264-322)||(59042-59100)
scaffold0058 (60-162)||(74038-74140)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (36-310)||(7078-7352)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-319)||(27500-27818)
scaffold0139 (1-337)||(1156-1491)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-319)||(10090-10408)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (36-301)||(5956-6220)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-310)||(21678-21987)
scaffold0235 (15-102)||(26004-26091)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (1-337)||(18544-18880)
scaffold0326 (276-337)||(3637-3698)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-337)||(9761-10092)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-337)||(13368-13704)
scaffold0298 (36-310)||(19973-20247)
scaffold0298 (1-337)||(17138-17474)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-337)||(14049-14384)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-319)||(79-397)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-301)||(51872-52170)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (136-286)||(4567-4717)
scaffold0023 (222-337)||(36974-37089)
scaffold0023 (3-100)||(4463-4560)
scaffold0023 (249-301)||(18993-19045)
scaffold0023 (30-82)||(58972-59024)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-337)||(10851-11187)
scaffold0124 (1-310)||(406-715)
scaffold0124 (15-178)||(7831-7994)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-301)||(37201-37501)
scaffold0026 (1-220)||(38181-38400)
scaffold0026 (40-220)||(27383-27563)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (36-319)||(18830-19113)
scaffold0090 (36-217)||(23094-23275)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-290)||(4760-5049)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (36-301)||(2750-3015)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-319)||(6164-6483)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (1-319)||(3872-4190)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (29-319)||(172-462)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (36-310)||(1211-1485)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (36-301)||(5044-5309)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (36-337)||(39702-40003)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-337)||(61220-61556)
scaffold0067 (1-337)||(52186-52522)
scaffold0067 (1-301)||(67608-67908)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-337)||(42340-42676)
scaffold0010 (1-337)||(47406-47742)
scaffold0010 (120-198)||(2252-2330)
scaffold0010 (240-271)||(2212-2243)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (9-319)||(14266-14576)
scaffold0203 (156-319)||(9039-9202)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (92-310)||(1167-1385)
scaffold0165 (276-337)||(26203-26264)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-319)||(27207-27524)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (36-310)||(33719-33993)
scaffold0076 (15-178)||(40380-40543)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-319)||(49214-49532)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-337)||(49040-49376)
scaffold0053 (36-337)||(57859-58159)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (36-319)||(25907-26190)
scaffold0113 (36-322)||(16654-16940)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (36-319)||(509-792)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (12-319)||(20103-20410)
scaffold0114 (1-334)||(43471-43804)
scaffold0114 (1-334)||(44483-44816)
scaffold0114 (136-319)||(36036-36219)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (36-336)||(38929-39229)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (36-322)||(16755-17041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-322)||(26239-26560)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-301)||(248612-248912)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (90-337)||(4235-4482)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (151-301)||(2023-2173)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (36-301)||(12823-13088)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (141-337)||(136082-136278)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (4-301)||(7248-7543)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-299)||(42784-43082)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (121-301)||(13380-13560)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (9-85)||(3734-3810)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (240-335)||(6238-6333)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (37-178)||(1916-2057)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (1-178)||(8217-8394)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (1-162)||(14661-14822)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (15-176)||(23518-23679)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (15-195)||(28287-28467)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (15-178)||(46276-46439)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (15-178)||(3281-3444)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (15-178)||(14758-14921)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (36-202)||(5311-5477)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (1-162)||(1061-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-178)||(393-570)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-178)||(13030-13207)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (276-337)||(7498-7559)
scaffold0101 (9-85)||(5467-5543)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-145)||(1241-1385)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (15-178)||(3896-4059)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (24-178)||(940-1094)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (1-162)||(8898-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-162)||(9125-9286)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (1-178)||(14779-14956)
scaffold0132 (1-101)||(43737-43837)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-169)||(1-169)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (15-178)||(24002-24165)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (213-310)||(45835-45932)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (30-162)||(10493-10625)
scaffold0447 (30-162)||(5879-6011)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (15-162)||(3965-4112)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-82)||(3362-3443)
scaffold0222 (213-337)||(3487-3611)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (30-162)||(8488-8620)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-45)||(12742-12786)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (232-337)||(9182-9287)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-102)||(1431-1532)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (1-154)||(13397-13550)
scaffold0021 (1-77)||(71442-71518)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (15-102)||(26178-26265)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (1-202)||(10867-11068)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (243-319)||(886-962)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (15-175)||(10781-10941)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (12-67)||(14370-14425)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-77)||(18332-18394)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12498135 - 12497799
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12498135 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 12498036  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498035 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 12497936  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497935 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12497836  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497835 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 12497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 14876742 - 14877078
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14876742 agactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttca 14876841  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876842 agaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 14876941  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876942 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14877041  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14877042 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 14877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17489735 - 17489401
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17489735 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 17489636  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489635 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 17489536  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  17489535 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 17489436  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17489435 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 17489401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16371300 - 16370964
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16371300 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttca 16371201  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371200 agaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16371101  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371100 atatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16371001  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371000 ttctagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16370964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16492426 - 16492760
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16492426 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 16492525  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16492526 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagat 16492625  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  16492626 attggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 16492725  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16492726 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16492760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16807169 - 16807505
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16807169 agactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttca 16807268  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16807269 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttttcggtccgtatcag 16807368  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807369 atatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaattatg 16807468  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807469 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16807505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9522604 - 9522270
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9522604 actactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgactttcaag 9522505  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522504 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 9522405  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9522404 atcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 9522305  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9522304 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9522270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16692047 - 16691711
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  16692047 agactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttca 16691948  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  16691947 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaa 16691848  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16691847 atatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 16691748  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16691747 ttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16691711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10906095 - 10905773
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10906095 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaag 10905996  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  10905995 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 10905896  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10905895 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 10905796  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10905795 ccggatccatctcatgtaatcca 10905773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 15348490 - 15348824
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15348490 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 15348589  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15348590 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 15348689  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15348690 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15348789  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15348790 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15348824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10005485 - 10005163
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10005485 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 10005386  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  10005385 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 10005286  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10005285 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 10005186  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10005185 ccggatccatctcatgtaatcca 10005163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48425332 - 48425010
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  48425332 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 48425233  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  48425232 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 48425133  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48425132 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 48425033  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  48425032 ccggatccatctcatgtaatcca 48425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13252575 - 13252253
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13252575 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 13252476  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  13252475 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 13252376  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13252375 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 13252276  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  13252275 ccggatccatctcatgtaatcca 13252253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 15589637 - 15589959
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15589637 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 15589736  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15589737 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 15589836  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15589837 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15589936  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  15589937 ccggatccatctcatgtaatcca 15589959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16635658 - 16635336
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16635658 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16635559  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16635558 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16635459  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16635458 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16635359  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16635358 ccggatccatctcatgtaatcca 16635336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43162982 - 43162660
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43162982 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 43162883  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  43162882 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 43162783  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43162782 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 43162683  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  43162682 ccggatccatctcatgtaatcca 43162660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 15402755 - 15403089
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15402755 actactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttcagg 15402854  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15402855 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatcagat 15402954  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402955 attggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15403054  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15403055 ccagatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15403089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 20062299 - 20062621
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20062299 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 20062398  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  20062399 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 20062498  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20062499 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 20062598  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  20062599 ccggatccatctcatgtaatcca 20062621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 53385263 - 53385597
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  53385263 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 53385362  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  53385363 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 53385462  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53385463 tttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 53385562  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  53385563 ccggatccatctcatgtaattcagagcgacgatgt 53385597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15725177 - 15725512
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725177 agactactgagaaa-ttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 15725275  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  15725276 ggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 15725375  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15725376 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15725475  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15725476 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 15725512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Original strand, 26792644 - 26792971
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26792644 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 26792743  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  26792744 aaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 26792843  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792844 attggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 26792943  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtg 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26792944 ccggatccatctcatgtaatccaaagtg 26792971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 5425175 - 5425508
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5425175 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcagg 5425274  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  5425275 aaggagaccacgtgcttt-gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 5425373  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5425374 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 5425473  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5425474 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 5425508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15208776 - 15208442
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15208776 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaag 15208677  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15208676 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagat 15208577  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15208576 atcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 15208477  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15208476 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 15208442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15339154 - 15338820
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15339154 actactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagttttagg 15339055  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15339054 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 15338955  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15338954 attggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15338855  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15338854 ccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15338820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16412527 - 16412861
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  16412527 actactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtaggaatgaccttgagtttcatg 16412626  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16412627 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16412726  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16412727 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 16412826  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16412827 ccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 16412861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6600632 - 6600298
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  6600632 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcaagg 6600533  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  6600532 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 6600433  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6600432 tttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 6600333  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6600332 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 6600298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16756830 - 16757164
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  16756830 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaagg 16756929  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||    
T  16756930 aaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatat 16757029  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16757030 tttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16757129  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16757130 ccggatccatctcatgtcattcagagtgacgatgt 16757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15248032 - 15247725
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||    
T  15248032 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacaatgagtttcaag 15247933  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15247932 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggtccgtattagat 15247833  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15247832 atcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatgtt 15247733  T
Q  303 ccggatcc 310  Q
    | ||||||    
T  15247732 ctggatcc 15247725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15227518 - 15227228
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227518 agagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 15227419  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  15227418 actcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcat 15227319  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15227318 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15227228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 13972387 - 13972661
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  13972387 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 13972486  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13972487 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 13972586  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  13972587 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatcc 13972661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14571737 - 14571409
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||    
T  14571737 gagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggag 14571638  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    | || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14571637 atcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctga 14571538  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
     || |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  14571537 gagggttggaacagtggcatatagagtgggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtacgtagcggat 14571438  T
Q  309 ccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || || ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14571437 ccttcgcatgttatcccgagagatgatgt 14571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 13322884 - 13323202
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  13322884 agactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttca 13322983  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || |||||||| |||||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  13322984 ggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 13323083  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||| |  | || || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13323084 atattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13323183  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  13323184 tagcggatccgtcgcatgt 13323202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15953200 - 15953500
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  15953200 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 15953299  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||| | |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||| ||||||||    
T  15953300 agagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatcag 15953399  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15953400 atatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15953499  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  15953500 t 15953500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47123841 - 47123506
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47123841 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 47123742  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  47123741 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 47123642  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||| |||||    
T  47123641 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatg 47123542  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  47123541 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 47123506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10383866 - 10383531
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10383866 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10383767  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10383766 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcag 10383667  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  10383666 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 10383567  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  10383566 ttgcggatccttctcatgtgatcccgagggatgatg 10383531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 18134606 - 18134896
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || || |  || ||| |||||||     
T  18134606 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagtt 18134705  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |    
T  18134706 actcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggctt 18134805  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    || |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  18134806 atagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 18134896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14086535 - 14086261
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  14086535 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 14086436  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||    
T  14086435 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 14086336  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  14086335 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 14086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 337
Target Start/End: Original strand, 10420285 - 10420613
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  10420285 gagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtg 10420384  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    | || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||||| || ||    
T  10420385 atcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcaga 10420484  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || |||    
T  10420485 aagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgat 10420584  T
Q  309 ccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10420585 ccttcacatgttattccgagagatgatgt 10420613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 12850546 - 12850781
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| ||    
T  12850546 atgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctg 12850645  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  12850646 tgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 12850745  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 271  Q
    ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12850746 gggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgt 12850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 15015989 - 15016184
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||   ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15015989 actacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaag 15016088  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  15016089 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccgaggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 16329938 - 16330212
Alignment:
Q  48 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  16329938 cagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttg 16330037  T
Q  148 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccacc 247  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||| |  || || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||    
T  16330038 gacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 16330137  T
Q  248 gcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16330138 acatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 16330212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 8759314 - 8759614
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8759314 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8759413  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  8759414 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 8759513  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8759514 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcggaagtatg 8759613  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  8759614 t 8759614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13941921 - 13941621
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  13941921 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 13941822  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  13941821 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 13941722  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13941721 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 13941622  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  13941621 t 13941621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41177419 - 41177119
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  41177419 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 41177320  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  41177319 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 41177220  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  41177219 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 41177120  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  41177119 t 41177119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 11304040 - 11304341
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||||||| || || || || ||| |||||||    | |     
T  11304040 atgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttcccta 11304139  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||| ||||    
T  11304140 tgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagt 11304239  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || |  |||||||||    
T  11304240 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcctagtgatgat 11304339  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  11304340 gt 11304341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 12360775 - 12361092
Alignment:
Q  2 gactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaa 101  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||     
T  12360775 gactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcag 12360874  T
Q  102 gaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaga 201  Q
    || || || || || ||| ||||||| |||  | ||||  |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  12360875 gagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 12360974  T
Q  202 tatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    | || || |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12360975 tttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 12361074  T
Q  302 tccggatccatctcatgt 319  Q
      ||||||| || |||||    
T  12361075 agcggatccttcgcatgt 12361092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 11961301 - 11961587
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  11961301 atgaaggctttgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 11961400  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    ||||  ||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  11961401 tgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagt 11961500  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     |  || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  11961501 tgatttgcccccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 11961587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44777144 - 44776808
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || |  |||||||| ||    
T  44777144 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttcca 44777045  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||| |||||||||    
T  44777044 agagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcag 44776945  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||  | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||    
T  44776944 atttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 44776845  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  44776844 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 44776808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Original strand, 16381190 - 16381459
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || || || ||||| |||||     
T  16381190 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca---gagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagtt 16381286  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || ||  |||| |||||||| |    
T  16381287 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcat 16381386  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  16381387 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagcttcggaaatatgt 16381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945033
Alignment:
Q  193 cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcg 292  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  293 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31945033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 8274656 - 8274819
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  8274656 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 8274755  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8274756 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 8274819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 16836777 - 16837045
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  16836777 atgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16836876  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| | ||| ||||    
T  16836877 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtgacatatagagt 16836976  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
     || || ||||| || |      | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  16836977 tggtttgccaccacacc------acttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatcc 16837045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689191
Alignment:
Q  195 tatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 294  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  295 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31689191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16742946 - 16743123
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||    
T  16742946 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtca 16743045  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16743046 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15576647 - 15576470
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  15576647 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 15576548  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
     |  || || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15576547 ggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18748562 - 18748401
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||  |  ||||||||||    
T  18748562 agactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttca 18748463  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||  || || || |||||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18748462 agttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17192977 - 17192892
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  17192977 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 17192892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13975302 - 13975465
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  13975302 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 13975401  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  13975402 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcc 13975465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 178
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153259
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||  || || || |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  160 agtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||  |  |||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcc 6153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 6712666 - 6712728
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  6712666 gttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 6712728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21686783 - 21686681
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||  || || || || ||||| ||||| | |||||| || | |||||||||||||||||    
T  21686783 aagagttatcattataagaggagaaaagatattcagtttcaagttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttga 21686684  T
Q  160 agt 162  Q
    |||    
T  21686683 agt 21686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 320836 - 320781
Alignment:
Q  284 gcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  320836 gcaacttcggaagtatgctccggatccatctc-cgtgatccaaagagatgatgtcca 320781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 12854365 - 12854426
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  12854365 catgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 12854426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23573942 - 23573606
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23573942 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 23573843  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573842 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 23573743  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573742 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23573643  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23573642 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23440423 - 23440089
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23440423 actactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaag 23440324  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440323 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 23440224  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440223 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 23440124  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440123 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23440089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23516732 - 23516405
Alignment:
Q  10 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 109  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23516732 agaaggttaagatcattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggaga 23516633  T
Q  110 ccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23516632 ccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaa 23516533  T
Q  210 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23516532 agagttggaacggtggcatatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatttcccggatc 23516433  T
Q  310 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516432 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 23516405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18775977 - 18775641
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18775977 agactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 18775878  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775877 ggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 18775778  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775777 atatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18775678  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775677 ttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 18775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 21984493 - 21984827
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21984493 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 21984592  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984593 agggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21984692  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||     
T  21984693 atcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaggtatgta 21984792  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21984793 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25423387 - 25423053
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25423387 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 25423288  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25423287 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttattggcccgtatcagat 25423188  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||     
T  25423187 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaactatgta 25423088  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25423087 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25423053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20798960 - 20798659
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20798960 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 20798861  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20798860 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaa 20798761  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20798760 atatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaaatatg 20798661  T
Q  301 tt 302  Q
    ||    
T  20798660 tt 20798659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 323
Target Start/End: Original strand, 26738893 - 26739213
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26738893 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaag 26738992  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    || |||| ||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26738993 aaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 26739092  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26739093 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 26739192  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26739193 ccggatccatctcatgtgatc 26739213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 14999927 - 15000261
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14999927 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagttccaag 15000026  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15000027 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 15000126  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15000127 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15000226  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15000227 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15000261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22333073 - 22333409
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333073 agactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 22333172  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  22333173 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 22333272  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333273 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22333372  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22333373 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22333409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22134868 - 22134532
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134868 agactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttca 22134769  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  22134768 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 22134669  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134668 atattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22134569  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22134568 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22134532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19770158 - 19769824
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19770158 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 19770059  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  19770058 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 19769959  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19769958 attggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 19769859  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19769858 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19769824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27610552 - 27610218
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27610552 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 27610453  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27610452 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27610353  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27610352 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 27610253  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27610252 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27610218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40708978 - 40708656
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40708978 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 40708879  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  40708878 aaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 40708779  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40708778 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 40708679  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  40708678 ccggatccatctcatgtaatcca 40708656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 27668678 - 27669012
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27668678 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 27668777  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  27668778 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 27668877  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27668878 tttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 27668977  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27668978 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27669012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 27685588 - 27685922
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27685588 actactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 27685687  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27685688 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27685787  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27685788 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 27685887  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27685888 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27685922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34566692 - 34566370
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34566692 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 34566593  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  34566592 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 34566493  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34566492 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 34566393  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  34566392 ccggatccatctcatgtaatcca 34566370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16356700 - 16356378
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16356700 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16356601  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16356600 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16356501  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16356500 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16356401  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16356400 ccggatccatctcatgtaatcca 16356378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27518605 - 27518271
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27518605 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 27518506  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27518505 aaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27518406  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27518405 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcacaacttcgaaagtatgtt 27518306  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27518305 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27518271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41771040 - 41770706
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41771040 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 41770941  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  41770940 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 41770841  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41770840 tttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 41770741  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41770740 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 41770706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 37291682 - 37292018
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  37291682 agactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagttcca 37291781  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  37291782 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 37291881  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  37291882 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtctcaacttcgaaagtaag 37291981  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  37291982 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 37292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23471427 - 23471093
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  23471427 actattgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagaccttgagtttcaag 23471328  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  23471327 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattggtccgtatcaggt 23471228  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23471227 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 23471128  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23471127 ccggatccatcacatgtgatccaaagagatgatgt 23471093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22348621 - 22348314
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  22348621 actactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaa--tcttgagtttcggg 22348524  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  22348523 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 22348424  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348423 attggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 22348324  T
Q  303 ccggatccat 312  Q
    ||||||||||    
T  22348323 ccggatccat 22348314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 29476259 - 29476595
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476259 agactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 29476358  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| ||||||    
T  29476359 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttcattggtccatatcag 29476458  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29476459 gtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29476558  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29476559 tttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 29476595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 20468284 - 20468618
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20468284 actactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttcagg 20468383  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  20468384 aaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcagat 20468483  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||  |||||| | | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20468484 attagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 20468583  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  20468584 tcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 20468618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573385
Alignment:
Q  96 tttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 195  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  196 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaa 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  296 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20573426 gtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 20573385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 325
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343868
Alignment:
Q  123 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  223 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T
Q  323 cca 325  Q
    |||    
T  21343866 cca 21343868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 258
Target Start/End: Original strand, 21498224 - 21498479
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||    
T  21498224 actaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatagacatcgagtttcaag 21498323  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||| || ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498324 agggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21498423  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcga 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21498424 atcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Original strand, 21564180 - 21564451
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| | ||||| || ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21564180 agagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 21564279  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||| |    
T  21564280 actcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcat 21564379  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564380 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 21890945 - 21891263
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  21890945 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 21891044  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  21891045 agagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcag 21891144  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21891145 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21891244  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  21891245 tagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 23442479 - 23442788
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  23442479 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttgagtttca 23442578  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  23442579 agagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23442678  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
     |||| || || |||||||| ||||| ||   |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23442679 ttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23442778  T
Q  301 ttccggatcc 310  Q
    |  |||||||    
T  23442779 tagcggatcc 23442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 24735832 - 24736115
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  24735832 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 24735931  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  24735932 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagt 24736031  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24736032 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24736115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 24749775 - 24750058
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  24749775 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 24749874  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  24749875 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagt 24749974  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24749975 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24750058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22462132 - 22461816
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  22462132 actacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcagg 22462033  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || |||||    
T  22462032 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 22461933  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  22461932 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 22461833  T
Q  303 ccggatccatctcatgt 319  Q
    || ||||| || |||||    
T  22461832 ccagatccttcgcatgt 22461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 319
Target Start/End: Original strand, 24737011 - 24737289
Alignment:
Q  41 agcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgact 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||     
T  24737011 agcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacg 24737110  T
Q  141 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggat 240  Q
    ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  24737111 ggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtt 24737210  T
Q  241 taccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24737211 tgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24737289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 28923982 - 28924290
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||     
T  28923982 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28924081  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  28924082 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgt 28924181  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 328  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | |||    
T  28924182 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgag 28924281  T
Q  329 tgatgatgt 337  Q
     ||||||||    
T  28924282 agatgatgt 28924290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20773942 - 20773606
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  20773942 agactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttca 20773843  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||| | ||| || ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  20773842 ggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 20773743  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20773742 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20773643  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20773642 taccagatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 20773606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 28895156 - 28895464
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||     
T  28895156 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28895255  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||    
T  28895256 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgt 28895355  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 328  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | |||    
T  28895356 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgag 28895455  T
Q  329 tgatgatgt 337  Q
     ||||||||    
T  28895456 agatgatgt 28895464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 37545682 - 37546018
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37545682 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 37545781  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttt-tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 199  Q
     || || || || || |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  37545782 ggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 37545881  T
Q  200 gatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
    ||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  37545882 gatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtat 37545981  T
Q  300 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  37545982 gttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 37546018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 14887177 - 14887512
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14887177 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 14887276  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14887277 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 14887376  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  14887377 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14887476  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14887477 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 14887512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 22236106 - 22236445
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  22236106 agactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 22236205  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  22236206 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 22236305  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||| | ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22236306 atatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 22236405  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 340  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  22236406 tagcggatccttcgcatgttattccgagggatgatgtcca 22236445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 337
Target Start/End: Original strand, 21662300 - 21662561
Alignment:
Q  75 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21662300 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21662399  T
Q  175 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 274  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21662400 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21662498  T
Q  275 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  21662499 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgattccgagggatgatgt 21662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25848222 - 25847922
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||| |     
T  25848222 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctt 25848123  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  25848122 tgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatacagagt 25848023  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  25848022 tggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgat 25847923  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  25847922 g 25847922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20342464 - 20342129
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20342464 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 20342365  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||  | || || || ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  20342364 ggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 20342265  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20342264 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20342165  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  20342164 ttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgatg 20342129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21404934 - 21404715
Alignment:
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  21404934 aaggagatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagat 21404835  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21404834 ttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 21404735  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     | |||||||||||||||||    
T  21404734 tcagatccatctcatgtgat 21404715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 23080275 - 23080596
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||||||    
T  23080275 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttca 23080374  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  23080375 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23080474  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23080475 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  23080575 tagcggatccttcacatgtgat 23080596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 322
Target Start/End: Original strand, 24798629 - 24798904
Alignment:
Q  47 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 146  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  24798629 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtt 24798728  T
Q  147 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccac 246  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||    
T  24798729 ggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccac 24798828  T
Q  247 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24798829 cacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 24798904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20821635 - 20821317
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  20821635 agactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttca 20821536  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||| || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  20821535 ggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 20821436  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20821435 atttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20821336  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    | || ||||| || |||||    
T  20821335 tacctgatccttcgcatgt 20821317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 21665761 - 21665986
Alignment:
Q  75 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21665761 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21665860  T
Q  175 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 274  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21665861 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21665959  T
Q  275 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    
T  21665960 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgt 21665986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22381346 - 22381060
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||       
T  22381346 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccga 22381247  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| ||||    
T  22381246 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggcttatagagt 22381147  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  22381146 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccgtcacatgtgat 22381060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22502826 - 22502540
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  22502826 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 22502727  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  22502726 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagt 22502627  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22502626 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 22502540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 21339474 - 21339596
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21339474 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 21339573  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgaga 125  Q
    || ||||||| || |||||||||    
T  21339574 aacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 17269519 - 17269819
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  17269519 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 17269618  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  17269619 agagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 17269718  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||  | || |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  17269719 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaactccggaagtatg 17269818  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  17269819 t 17269819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 11210880 - 11211057
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  11210880 agactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttca 11210979  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11210980 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27011252 - 27011089
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  27011252 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27011153  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27011152 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 27011089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23503625 - 23503464
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23503625 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 23503526  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |   || || || |||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23503525 aattggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagt 23503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21937388 - 21937551
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  21937388 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21937487  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21937488 tgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 21937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24581379 - 24581216
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  24581379 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 24581280  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||| | || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24581279 tgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21625470 - 21625382
Alignment:
Q  249 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  21625470 catctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgattccgagagatgatgt 21625382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21405020 - 21404939
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 82  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21405020 agactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtag 21404939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 25244546 - 25244695
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    | ||| | ||| ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  25244546 gagaatgttaagatgattcagaagaagatgaaagcgcgtgacagtaggcaagagagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggag 25244645  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 158  Q
    | || |||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25244646 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25244695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 25308698 - 25308847
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    | ||| | ||| ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  25308698 gagaatgttaagatgattcagaagaagatgaaagcgcgtgacagtaggcaagagagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggag 25308797  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 158  Q
    | || |||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25308798 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 305; Significance: 1e-172; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24675388 - 24675052
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675388 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 24675289  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675288 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 24675189  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24675188 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 24675089  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675088 ttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 24675052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 22757011 - 22757343
Alignment:
Q  5 tactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaa 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22757011 tactgagaaagttaaggtgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaa 22757110  T
Q  105 ggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatat 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757111 agagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatat 22757210  T
Q  205 cggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757211 cggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttcc 22757310  T
Q  305 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757311 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22757343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 24708026 - 24708362
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24708026 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 24708125  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24708126 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcag 24708225  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24708226 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24708325  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24708326 ttccggatccatctcatgtgatccacagtgatgatgt 24708362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 21325815 - 21326146
Alignment:
Q  6 actgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaag 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21325815 actgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaag 21325914  T
Q  106 gagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21325915 gagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatc 21326014  T
Q  206 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21326015 ggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccg 21326114  T
Q  306 gatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326115 gatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21326146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23188907 - 23188571
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  23188907 agactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtca 23188808  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23188807 ggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcag 23188708  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188707 atatcggaaagagttggaacgatggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23188608  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23188607 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Original strand, 21145576 - 21145904
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21145576 actactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 21145675  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||    
T  21145676 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatcagat 21145775  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145776 attggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 21145875  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtga 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21145876 ccggatccatctcatgtaatccagagtga 21145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23138911 - 23138600
Alignment:
Q  26 tcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgaga 125  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23138911 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23138812  T
Q  126 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23138811 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23138712  T
Q  226 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138711 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23138612  T
Q  326 gagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||    
T  23138611 aagtgatgatgt 23138600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23550701 - 23550390
Alignment:
Q  26 tcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgaga 125  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23550701 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23550602  T
Q  126 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23550601 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23550502  T
Q  226 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550501 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23550402  T
Q  326 gagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||    
T  23550401 aagtgatgatgt 23550390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23063974 - 23063664
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23063974 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 23063875  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23063874 aaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtttcagat 23063775  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||     
T  23063774 atctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgta 23063675  T
Q  303 ccggatccatc 313  Q
    || ||||||||    
T  23063674 ccagatccatc 23063664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16925157 - 16924835
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925157 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16925058  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16925057 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16924958  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16924957 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16924858  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16924857 ccggatccatctcatgtaatcca 16924835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16998897 - 16998575
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16998897 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16998798  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16998797 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16998698  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16998697 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16998598  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16998597 ccggatccatctcatgtaatcca 16998575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16982049 - 16981727
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16982049 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 16981950  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16981949 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16981850  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16981849 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16981750  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16981749 ccggatccatctcatgtaatcca 16981727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17063614 - 17063292
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17063614 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 17063515  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17063514 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 17063415  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17063414 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 17063315  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17063314 ccggatccatctcatgtaatcca 17063292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24709930 - 24709596
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24709930 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 24709831  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||    
T  24709830 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagat 24709731  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24709730 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 24709631  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24709630 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24709596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 44386115 - 44386449
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  44386115 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcagg 44386214  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  44386215 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagat 44386314  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44386315 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 44386414  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  44386415 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 44386449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9610033 - 9609711
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9610033 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 9609934  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  9609933 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 9609834  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9609833 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 9609734  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  9609733 ccggatccatctcatgtaatcca 9609711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 22325402 - 22325736
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22325402 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 22325501  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  22325502 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 22325601  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22325602 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 22325701  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22325702 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22325736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24262267 - 24261933
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24262267 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 24262168  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||| ||    
T  24262167 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcatat 24262068  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24262067 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 24261968  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24261967 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24261933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 24878541 - 24878875
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24878541 actactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 24878640  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  24878641 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 24878740  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24878741 attggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatctgtcgcaacttcgaaagtatgtt 24878840  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24878841 ccggatccatctcaagtaatccagagtgacgatgt 24878875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27217913 - 27217591
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27217913 actactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 27217814  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27217813 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27217714  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27217713 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 27217614  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27217613 ccggatccatctcatgtaatcca 27217591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27371166 - 27370832
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371166 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 27371067  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27371066 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27370967  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27370966 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 27370867  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27370866 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27370832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10868747 - 10868425
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  10868747 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcagg 10868648  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  10868647 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 10868548  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10868547 attggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 10868448  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10868447 ccggatccatctcatgtaatcca 10868425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 87 - 337
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377351
Alignment:
Q  87 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  187 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  287 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 27377351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17067272 - 17066953
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17067272 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 17067173  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17067172 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 17067073  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  17067072 attggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgca-cacgtttttcatgtgtcgc-acttcgaaagtatgtt 17066976  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17066975 ccggatccatctcatgtaatcca 17066953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23087321 - 23087013
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23087321 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 23087222  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23087221 actcttgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgt 23087122  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 328  Q
    || ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||  ||    
T  23087121 atagagtgtgtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaag 23087022  T
Q  329 tgatgatgt 337  Q
     ||||||||    
T  23087021 agatgatgt 23087013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 30211461 - 30211782
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30211461 agactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 30211560  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30211561 agaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcag 30211660  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || ||||||| ||||||   ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  30211661 atttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 30211760  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    ||  ||||| ||||||||||||    
T  30211761 ttttggatcaatctcatgtgat 30211782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 24825828 - 24826063
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  24825828 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttttagg 24825927  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24825928 aaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggttcgtatcagat 24826027  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggg 238  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24826028 atcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagtggg 24826063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 27365658 - 27365932
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |     
T  27365658 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactccta 27365757  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27365758 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 27365857  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||    
T  27365858 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatcc 27365932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45529410 - 45529100
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||  ||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |    
T  45529410 agactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttgagtttga 45529311  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||      ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||  || ||||||    
T  45529310 aga------ccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcag 45529217  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  45529216 atttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagcatg 45529117  T
Q  301 ttccggatccatctcat 317  Q
    || | ||||| ||||||    
T  45529116 tttcagatccctctcat 45529100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31830557 - 31830222
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31830557 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 31830458  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31830457 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 31830358  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  31830357 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 31830258  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  31830257 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 31830222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 11358418 - 11358739
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11358418 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 11358517  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11358518 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11358617  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || | |||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11358618 atttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11358717  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  11358718 ttgcggatccttctcatgtgat 11358739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23276675 - 23276339
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  23276675 agactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 23276576  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| ||||| | |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |  || |||||||||||||||    
T  23276575 ggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatcag 23276476  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  23276475 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 23276376  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23276375 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23276339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23293849 - 23293539
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || || |    
T  23293849 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtg 23293750  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    | || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||    
T  23293749 atcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaga 23293650  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
     || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23293649 gagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggat 23293550  T
Q  309 ccatctcatgt 319  Q
    || || |||||    
T  23293549 ccttcgcatgt 23293539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 337
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609224
Alignment:
Q  160 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaa 259  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  260 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41609224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20832849 - 20832549
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20832849 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20832750  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  20832749 tgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 20832650  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  20832649 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 20832550  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  20832549 g 20832549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1063650 - 1063315
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1063650 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 1063551  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  1063550 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 1063451  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| |||| || ||||| ||| |||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  1063450 atttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 1063351  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  1063350 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 1063315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27787612 - 27787340
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | |||||     
T  27787612 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtg 27787513  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| |    
T  27787512 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcat 27787413  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  27787412 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 27787340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653946
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  160 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaa 259  Q
    |||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |  |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  260 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 24653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12574252 - 12573952
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||    
T  12574252 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 12574153  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | || || || |   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12574152 agagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 12574053  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||  |||| |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | ||||||||||    
T  12574052 atttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 12573953  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  12573952 t 12573952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Original strand, 24833356 - 24833438
Alignment:
Q  240 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24833356 ttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 24833438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24945131 - 24944966
Alignment:
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  24945131 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagggttggaacagtggcatatagagt 24945032  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24945031 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 24944966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22276164 - 22276001
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  22276164 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 22276065  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  22276064 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcc 22276001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25128546 - 25128387
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| |  | || || ||  ||||||||||    
T  25128546 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttca 25128447  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 160  Q
    ||  || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25128446 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Original strand, 27368391 - 27368452
Alignment:
Q  16 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368391 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 24570212 - 24570373
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  24570212 agactacggaaaaggttaagatgaatcaagagaagatgaaaacgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 24570311  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     |  || || || || || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24570312 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12640477 - 12640640
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || |    
T  12640477 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 12640576  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  12640577 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12640640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 337
Target Start/End: Original strand, 45676685 - 45676729
Alignment:
Q  293 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676685 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 45676729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 22762127 - 22762274
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||| |  || || || |    
T  22762127 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtaggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22762226  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22762227 tgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggtttgaagt 22762274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 23817597 - 23817696
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  23817597 agactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 23817696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24831745 - 24831908
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  24831745 gttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 24831844  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || | ||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24831845 tgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23599877 - 23599834
Alignment:
Q  294 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23599877 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23599834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 316
Target Start/End: Original strand, 17967577 - 17967617
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 316  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17967577 catgtgtcccaacttcgaaagtatgttcccgatccatctca 17967617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 162
Target Start/End: Original strand, 23817750 - 23817798
Alignment:
Q  114 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23817750 gtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 23817798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28144749 - 28144701
Alignment:
Q  114 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28144749 gtgtttttgagagtgaatcttgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 28144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 278837 - 279171
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278837 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 278936  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  278937 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcag 279036  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  279037 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 279136  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  279137 ttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 164718 - 165052
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  164718 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 164817  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  164818 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagat 164917  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  164918 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatgtt 165017  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  165018 ccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 165052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 308958 - 308622
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308958 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 308859  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||    
T  308858 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaaagtttattggtccgtatcag 308759  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  308758 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgtaacttcgaaagtatg 308659  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  308658 ttctggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 308622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 260572 - 260271
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  260572 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 260473  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || || ||  || |||||||||| ||| ||||    
T  260472 tgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagt 260373  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
      | || |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  260372 ttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 260273  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  260272 gt 260271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 30313591 - 30313927
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30313591 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 30313690  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313691 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 30313790  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313791 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 30313890  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313891 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 30313927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 21166986 - 21167320
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166986 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 21167085  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167086 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21167185  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  21167186 atcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcgaaaatatgtt 21167285  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167286 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21167320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19978301 - 19977965
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19978301 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttca 19978202  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978201 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 19978102  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19978101 atatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19978002  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19978001 taccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 19977965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16408492 - 16408828
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||    
T  16408492 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttcca 16408591  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408592 agaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16408691  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16408692 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtgtg 16408791  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16408792 tcccggatctatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15533714 - 15533378
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15533714 agactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 15533615  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533614 agaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 15533515  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533514 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15533415  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533414 tttcggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15533378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 22164640 - 22164974
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22164640 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcagg 22164739  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164740 aaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 22164839  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22164840 atcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtc 22164939  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22164940 ccggatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22164974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32600478 - 32600142
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  32600478 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 32600379  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32600378 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 32600279  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600278 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 32600179  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600178 ttccggatctatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 32600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 22133490 - 22133824
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  22133490 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcagg 22133589  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133590 aaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 22133689  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22133690 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtc 22133789  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22133790 ccgaatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21251273 - 21250940
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21251273 actaccgagaaggttaagatgattaaagagaga-tgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaat 21251175  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251174 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21251075  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21251074 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 21250975  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21250974 ccagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21250940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22046707 - 22046372
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| |    
T  22046707 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcaggaaggatcttgagtttta 22046608  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22046607 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgaggtttattggttcgtatcag 22046508  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046507 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22046408  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22046407 ttccggatccatctcatgtgat-caaagtgatgatgt 22046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 21394314 - 21394648
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21394314 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaag 21394413  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394414 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21394513  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||     
T  21394514 atcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatgta 21394613  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21394614 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21394648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 21788807 - 21789141
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21788807 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaag 21788906  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788907 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 21789006  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||     
T  21789007 atcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatgta 21789106  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21789107 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21789141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 21922184 - 21922518
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922184 actactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 21922283  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21922284 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagat 21922383  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21922384 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 21922483  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21922484 ctggatccatcccatgtgatccaaagcgatgatgt 21922518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23650373 - 23650039
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650373 actactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 23650274  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650273 aaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 23650174  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||     
T  23650173 atcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgttgcaacttcggaagtatgta 23650074  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23650073 ctggatccatcccatgtgatccaaagtgataatgt 23650039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 17674472 - 17674806
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674472 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 17674571  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17674572 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 17674671  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17674672 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 17674771  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17674772 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 17674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032030
Alignment:
Q  28 aagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  128 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  228 tatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaga 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaa 22032040  T
Q  328 gtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||    
T  22032039 gtgatgatgt 22032030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19113022 - 19112700
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19113022 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 19112923  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  19112922 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 19112823  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19112822 attggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 19112723  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  19112722 ccggatccatctcatgtaatcca 19112700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 20018199 - 20018533
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |    
T  20018199 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgaatttgagg 20018298  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  20018299 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 20018398  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20018399 actggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 20018498  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20018499 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 20018533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 19485322 - 19485653
Alignment:
Q  6 actgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaag 105  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  19485322 actgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaag 19485421  T
Q  106 gagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||||| |     
T  19485422 gagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagatttt 19485521  T
Q  206 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 305  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485522 ggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 19485621  T
Q  306 gatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19485622 gatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19485653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22987533 - 22987199
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22987533 actattgagaaagataatatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaag 22987434  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22987433 aaggagatcatgtattttttagagtcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagat 22987334  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22987333 atcataaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 22987234  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22987233 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 22987199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22120621 - 22120957
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120621 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 22120720  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  || |||||||| ||||||    
T  22120721 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttcattggtccatatcag 22120820  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22120821 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 22120920  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22120921 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 96 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441179
Alignment:
Q  96 tttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 195  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  196 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  296 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15441220 gtatgttttggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15441179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Original strand, 20396574 - 20396893
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20396574 actactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcagg 20396673  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  20396674 aaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtctgtatcagat 20396773  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  20396774 atcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcggaagtgtgtt 20396873  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20396874 tcggatccatctcatgtgat 20396893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 62 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948887
Alignment:
Q  62 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaag 161  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  162 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatt 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  262 tgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatgt 23948887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20388405 - 20388133
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20388405 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 20388306  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||| | |    
T  20388305 actctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacat 20388206  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20388205 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgt 20388133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 21681917 - 21682253
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  21681917 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 21682016  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  21682017 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 21682116  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21682117 atatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21682216  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
       ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21682217 aaacggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 22377902 - 22378089
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  22377902 actacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcagg 22378001  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 190  Q
    ||| ||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22378002 aagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 22378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 22384077 - 22384264
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  22384077 actacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcagg 22384176  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 190  Q
    ||| ||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384177 aagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 22384264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 20010382 - 20010665
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||       
T  20010382 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccga 20010481  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  20010482 tgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 20010581  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  20010582 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 20010665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20008184 - 20007866
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||    
T  20008184 agactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttcca 20008085  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  20008084 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcag 20007985  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20007984 atatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20007885  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  20007884 tagcggatccttcgcatgt 20007866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23655261 - 23654925
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  23655261 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 23655162  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| ||  ||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  23655161 agacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23655062  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || ||| |||| ||||  |||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23655061 atatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23654962  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23654961 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1266538 - 1266255
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| ||||       
T  1266538 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccga 1266439  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  1266438 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagt 1266339  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1266338 tggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacggatccttcgcatgt 1266255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6679445 - 6679110
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6679445 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6679346  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6679345 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 6679246  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6679245 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6679146  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6679145 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19851710 - 19851427
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||       
T  19851710 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgt 19851611  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||    
T  19851610 tgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagt 19851511  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19851510 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19851427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19857746 - 19857463
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||       
T  19857746 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgt 19857647  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||    
T  19857646 tgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagt 19857547  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19857546 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19857463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22061880 - 22062216
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   | | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22061880 agactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttca 22061979  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  22061980 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaa 22062079  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22062080 atatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22062180 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22062216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 21324856 - 21325175
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  21324856 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttca 21324955  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  21324956 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 21325055  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatc-tttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
    |||||  | || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21325056 atatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 21325155  T
Q  300 gttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  21325156 gtagcggatccttcgcatgt 21325175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Original strand, 804155 - 804455
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  804155 atgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 804254  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| ||||    
T  804255 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagt 804354  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  804355 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 804454  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  804455 g 804455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 31416921 - 31417239
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaa--tgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||||||||    
T  31416921 agactactgagaaagtcaagatgat--aagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagttt 31417018  T
Q  99 caagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 198  Q
    || || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||     
T  31417019 caggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatt 31417118  T
Q  199 agatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagta 298  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| |  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  31417119 agatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagta 31417218  T
Q  299 tgttccggatccatctcatgt 319  Q
    |||  ||||||| || |||||    
T  31417219 tgtagcggatccttcgcatgt 31417239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21840751 - 21840415
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||    
T  21840751 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttca 21840652  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| | ||||| |||| | | || ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  21840651 agagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcag 21840552  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21840551 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcggaagtatg 21840452  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21840451 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21840415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14565441 - 14565141
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  14565441 atgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 14565342  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14565341 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 14565242  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  14565241 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 14565142  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  14565141 g 14565141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6603992 - 6603657
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6603992 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6603893  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  6603892 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaa 6603793  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6603792 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6603693  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6603692 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6603657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31571289 - 31571589
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  31571289 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 31571388  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  31571389 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcag 31571488  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  31571489 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 31571588  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  31571589 t 31571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 29303908 - 29304194
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||       
T  29303908 atgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaa 29304007  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |   | || |||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  29304008 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggcttatagagt 29304107  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  29304108 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatgtagaggatccttcacatgtgat 29304194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 337
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265401
Alignment:
Q  63 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  163 caaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattt 262  Q
    | | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  263 gcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatgt 16265401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982356
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  160 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaa 259  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  260 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28982356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987576
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  160 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaa 259  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  260 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28987576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12305057 - 12304771
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||| |     
T  12305057 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctt 12304958  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| ||| ||||    
T  12304957 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagt 12304858  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12304857 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 12304771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20652780 - 20652957
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||||    
T  20652780 agactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttca 20652879  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || || ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20652880 agttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347225
Alignment:
Q  125 agtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtg 224  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  225 gcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 324  Q
    || |||  ||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattc 27347237  T
Q  325 agagtgatgatg 336  Q
     ||| |||||||    
T  27347236 cgagggatgatg 27347225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 21196960 - 21197126
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||| || |    
T  21196960 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatc 21197059  T
Q  112 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | |||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  21197060 atgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcc 21197126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23949252 - 23949158
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23949252 actactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22982756 - 22982593
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| |  || || || |    
T  22982756 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22982657  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
     |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  22982656 cgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcc 22982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22051162 - 22051018
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||||| ||| ||||       
T  22051162 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccga 22051063  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 180  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22051062 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccga 22051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16877556 - 16877719
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || |    
T  16877556 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 16877655  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16877656 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21850798 - 21850961
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  21850798 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21850897  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  21850898 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcc 21850961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22315511 - 22315364
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |    
T  22315511 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 22315412  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||||||||||| | || ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22315411 tgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18856909 - 18856853
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaa 59  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18856909 actactaagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22040193 - 22040162
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagag 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040193 agactactgagaaagttaagatgattcaagag 22040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25282457 - 25282307
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||  | |||| | || |||||||||||| ||||| | || || ||  | ||||||||||  || |    
T  25282457 gagaaggttaagatcattcaagagaagatgagagtgtctcggagtaggcagaagagttatcataataagaggaggaaggacatcgagtttcaagttggtg 25282358  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    | || |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  25282357 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaaccagtgttggacgtactttga 25282307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19863299 - 19863223
Alignment:
Q  93 gagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 169  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19863299 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19863223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19867936 - 19867860
Alignment:
Q  93 gagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 169  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19867936 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 337
Target Start/End: Original strand, 22179309 - 22179341
Alignment:
Q  305 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22179309 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 22179341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16355189 - 16355525
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16355189 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttca 16355288  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355289 agaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16355388  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355389 atatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16355488  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355489 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16355525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16252189 - 16252525
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16252189 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16252288  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252289 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16252388  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16252389 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatg 16252488  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16252489 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16252525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12523942 - 12523608
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12523942 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtaggaaagatcttgagtttcaag 12523843  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12523842 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagat 12523743  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523742 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 12523643  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12523642 ccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12523608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14680835 - 14680499
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  14680835 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 14680736  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14680735 ggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 14680636  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680635 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14680536  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680535 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 18227190 - 18227526
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  18227190 agactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttca 18227289  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18227290 ggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcag 18227389  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18227390 atatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18227489  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227490 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 18227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15149750 - 15150053
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15149750 agactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 15149849  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15149850 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcag 15149949  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15149950 atatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15150049  T
Q  301 ttcc 304  Q
    ||||    
T  15150050 ttcc 15150053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7090698 - 7090365
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090698 actactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 7090599  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7090598 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgct-cgtatcagat 7090500  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  7090499 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 7090400  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7090399 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 7090365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14652574 - 14652240
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14652574 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 14652475  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14652474 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagat 14652375  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14652374 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatgtt 14652275  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14652274 ccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 14652240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 19778539 - 19778873
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778539 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 19778638  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  19778639 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 19778738  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19778739 attggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 19778838  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19778839 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19778873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23956013 - 23955691
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23956013 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 23955914  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  23955913 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 23955814  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23955813 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 23955714  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  23955713 ccggatccatctcatgtaatcca 23955691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 14851112 - 14851446
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  14851112 actattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaaaaccttgagtttcaag 14851211  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14851212 aaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgaggtttattggtccgtatcagat 14851311  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14851312 ataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaaattcggaagtatgtt 14851411  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  14851412 ccggatccatctcatgtgctcccaagagatgatgt 14851446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18297471 - 18297149
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18297471 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 18297372  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  18297371 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 18297272  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18297271 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 18297172  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  18297171 ccggatccatctcatgtaatcca 18297149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8386678 - 8386356
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8386678 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 8386579  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  8386578 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 8386479  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8386478 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 8386379  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8386378 ccggatccatctcatgtaatcca 8386356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27711602 - 27711268
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27711602 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 27711503  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  27711502 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 27711403  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27711402 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatgtt 27711303  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  27711302 ccggatccatctcatgtaattcaaagtgacgatgt 27711268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14159760 - 14159424
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159760 agactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttca 14159661  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    || |||||| || |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14159660 aggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttattggtccatatcag 14159561  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14159560 atatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaacttcggaagtatg 14159461  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14159460 ttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatgt 14159424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 14303722 - 14304057
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303722 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 14303821  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  14303822 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccgaagttcattggtccgtatcag 14303920  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14303921 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 14304020  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14304021 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 14304057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12476866 - 12476544
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12476866 actactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 12476767  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  12476766 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 12476667  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12476666 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtatcgcaacttcgaaagtatgtt 12476567  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12476566 ccggatccatctcatgtaatcca 12476544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 29039150 - 29039472
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29039150 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 29039249  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  29039250 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 29039349  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29039350 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 29039449  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  29039450 ccggatccatctcatgtaatcca 29039472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40473306 - 40472972
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40473306 actactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 40473207  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||    
T  40473206 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagat 40473107  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473106 attggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 40473007  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40473006 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 40472972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 14266645 - 14266979
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14266645 actactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 14266744  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  14266745 aaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 14266844  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266845 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 14266944  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14266945 tcggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 14266979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 8053369 - 8053703
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8053369 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttcagg 8053468  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  8053469 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 8053568  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |  |||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8053569 actggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 8053668  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8053669 tcggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 8053703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364330
Alignment:
Q  72 gataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  172 tgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 271  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgt 15364384  T
Q  272 cttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15364383 tttccatatgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 15364330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 15003368 - 15003686
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  15003368 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttca 15003467  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  15003468 agagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatcag 15003567  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15003568 atatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15003667  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  15003668 tagcggatccttcgcatgt 15003686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 149 - 337
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927339
Alignment:
Q  149 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 248  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  249 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14927339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 3264798 - 3265133
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3264798 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 3264897  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3264898 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 3264997  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  3264998 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 3265097  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  3265098 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 3265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 11207235 - 11207570
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11207235 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 11207334  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11207335 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11207434  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11207435 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11207534  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  11207535 ttgcggatccttcacatgtgataccgagggatgatg 11207570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070360
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  15070681 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttca 15070582  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||  |||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||| || |||    
T  15070581 agagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccataccag 15070482  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15070481 atatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15070382  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
       ||||||| || ||||||||    
T  15070381 cagcggatccttcgcatgtgat 15070360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16146145 - 16145862
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||| |     
T  16146145 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactccta 16146046  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16146045 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 16145946  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16145945 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16145862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 29453541 - 29453876
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29453541 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 29453640  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  29453641 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 29453740  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  29453741 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 29453840  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  29453841 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 29453876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16676447 - 16676578
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16676447 agactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16676546  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 132  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676547 gcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15246157 - 15245856
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |   |||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || | |     
T  15246157 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttaccccta 15246058  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  15246057 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagt 15245958  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  15245957 gcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 15245858  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  15245857 gt 15245856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 1649316 - 1649599
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| |||| |     
T  1649316 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactccta 1649415  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  1649416 tgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcatatagagt 1649515  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1649516 tgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgt 1649599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33223184 - 33222865
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  33223184 actactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcagg 33223085  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  33223084 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagat 33222985  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  33222984 ttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgta 33222885  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  33222884 gcggatccttcacatgtgat 33222865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20891215 - 20890930
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20891215 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20891116  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |  |    
T  20891115 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataggat 20891016  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    ||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20891015 ggg-tttccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 20890930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 44661870 - 44662191
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44661870 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 44661969  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  44661970 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 44662069  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  44662070 atttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 44662169  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  44662170 ttgcggatccttctcatgtgat 44662191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 15415059 - 15415198
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15415059 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 15415158  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 169  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15415159 ctcttgtgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaa 15415198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 51606185 - 51606485
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  |||||||||||    
T  51606185 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttca 51606284  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  51606285 agagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 51606384  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  51606385 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 51606484  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  51606485 t 51606485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 1640171 - 1640293
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  1640171 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagaccttgagttccaag 1640270  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgaga 125  Q
    ||||||| || || |||||||||    
T  1640271 aaggagatcatgtatttttgaga 1640293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15359094 - 15359313
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  15359094 agactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttca 15359193  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || |||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  15359194 agagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 15359293  T
Q  201 atatcggaaagagttggaac 220  Q
    ||||| || || ||||||||    
T  15359294 atatcagagagggttggaac 15359313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 337
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607910
Alignment:
Q  250 atctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgaagatgt 18607910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13247899 - 13247736
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  || || || |    
T  13247899 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatg 13247800  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | |||||||| || | ||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  13247799 tatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13247736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42703082 - 42702871
Alignment:
Q  90 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 189  Q
    |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||    
T  42703082 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 42702983  T
Q  190 gtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaact 289  Q
    ||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  42702982 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 42702883  T
Q  290 tcggaagtatgt 301  Q
    ||||||||||||    
T  42702882 tcggaagtatgt 42702871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27900654 - 27900459
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27900654 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 27900555  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgta 196  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | ||||  |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  27900554 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 282
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  140 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 239  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  |||||||     
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  240 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 282  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 12132413 - 12132574
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||| | || ||||||| |||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  12132413 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 12132512  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||  || || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132513 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 55375376 - 55375537
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  55375376 gttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 55375475  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 176  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375476 tgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14997570 - 14997407
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  14997570 gttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 14997471  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14997470 tgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14997407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16752826 - 16752665
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  16752826 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16752727  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtat 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16752726 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16445230 - 16445393
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  16445230 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16445329  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| || || | || ||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16445330 tgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 9849490 - 9849683
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||| |  | ||||||| ||||||||| |  || || ||| |||| |||||||  ||||    
T  9849490 gagaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcatcgtagagtaggtagaagagttgtcatgataaacagaggaaggatattgaatttcaagtcggag 9849589  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||  |||||||||||||    |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  9849590 atcaaatgtttttgagagttgacctagtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtccaagaagttgacaccgtgttttattggtccttatcagat 9849683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9291089 - 9290926
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  9291089 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcagg 9290990  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | |||||||| || | || |||||| | |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  9290989 tatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 9290926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 15293175 - 15293338
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  15293175 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 15293274  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || ||||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15293275 tgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 319
Target Start/End: Original strand, 15415209 - 15415301
Alignment:
Q  227 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15415209 gtatagagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15415301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15319648 - 15319515
Alignment:
Q  204 tcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttc 303  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||      
T  15319648 tcggagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtag 15319549  T
Q  304 cggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15319548 cggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15319515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8706151 - 8706078
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  8706151 atgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagaccttgaatttaaggaaggaga 8706078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16685522 - 16685361
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||| | || || | ||||||||||||| | |  || ||| || | |||||    
T  16685522 agactacgaagaaagttaagatgattcaggagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaaaatttatcatgataagaggatgaaggatatttaatttca 16685423  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||  || || || | |||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  16685422 agttggtgatcatgggtttttgagagtgaatcatgtaaccggtgttgggtgtgctttgaagt 16685361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 337
Target Start/End: Original strand, 15351934 - 15351966
Alignment:
Q  305 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351934 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 15351966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15077903 - 15077825
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 79  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077903 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 319
Target Start/End: Original strand, 15359326 - 15359379
Alignment:
Q  266 tgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15359326 tgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15359379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 65704 - 65369
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65704 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 65605  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65604 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 65505  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65504 atatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 65405  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65404 ttccggatccatctcatgtgatcca-agtgatgatgt 65369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 129 - 337
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40132
Alignment:
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 328  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  329 tgatgatgt 337  Q
    |||||||||    
T  40124 tgatgatgt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Original strand, 39828 - 39906
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgta 81  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39828 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgta 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14659 - 14323
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  14659 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 14560  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559 ggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 14460  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14459 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgtgtcgaaacttcggaagtatg 14360  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14359 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 919 - 583
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  919 agactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatcttgagtttca 820  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||     
T  819 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaa 720  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  719 atattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 620  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  619 tttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12498156 - 12497824
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  12498156 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcagg 12498057  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12498056 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagat 12497957  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497956 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 12497857  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12497856 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12497824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 12510745 - 12511077
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  12510745 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcagg 12510844  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12510845 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagat 12510944  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510945 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 12511044  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12511045 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19864819 - 19864483
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19864819 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttca 19864720  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864719 agaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 19864620  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19864619 atatcggaaagatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 19864520  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864519 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 19864483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 25765439 - 25765774
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765439 agactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 25765538  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25765539 agaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcag 25765637  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25765638 atatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgttccatgtgtcgtaactttggaagtatg 25765737  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765738 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 25765774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12505485 - 12505153
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  12505485 actactgagaatgttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcagg 12505386  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12505385 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagat 12505286  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505285 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 12505186  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12505185 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12505153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16963516 - 16963852
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16963516 agactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 16963615  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16963616 agaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccgagatttattggtccatatcag 16963715  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16963716 atatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16963815  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963816 taccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16963852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 49 - 337
Target Start/End: Original strand, 21833178 - 21833466
Alignment:
Q  49 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21833178 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttgg 21833277  T
Q  149 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833278 aggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 21833377  T
Q  249 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21833378 catctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 21833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16927789 - 16928125
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16927789 agactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 16927888  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927889 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16927988  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16927989 atattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16928088  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16928089 taccggatccatctcatgtgatacagagtgatgatgt 16928125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 22078842 - 22079173
Alignment:
Q  6 actgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22078842 actgagaaggttaagatgattccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaag 22078941  T
Q  106 gagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatc 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22078942 gagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatc 22079041  T
Q  206 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22079042 ggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagcaacttcggaagtatgttcct 22079141  T
Q  306 gatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22079142 gatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22079173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 25610012 - 25610346
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25610012 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 25610111  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25610112 aaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgagatttattggtccgtattagat 25610211  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  25610212 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 25610311  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25610312 tcggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25610346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Original strand, 1543235 - 1543563
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1543235 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcagg 1543334  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||    
T  1543335 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagat 1543434  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543435 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 1543534  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtga 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1543535 ccggatccatctcatgtaatccagagtga 1543563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 5839368 - 5839704
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5839368 agactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 5839467  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5839468 agaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcag 5839567  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839568 atatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 5839667  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5839668 taccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 5839704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23078599 - 23078265
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23078599 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 23078500  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23078499 agggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagat 23078400  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23078399 atcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgtatcgcaacttcggaagtatgtt 23078300  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23078299 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23078265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 27331584 - 27331918
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27331584 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaag 27331683  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27331684 aaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagat 27331783  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27331784 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 27331883  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27331884 ctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27331918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 27392324 - 27392658
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27392324 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaag 27392423  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27392424 aaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagat 27392523  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27392524 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 27392623  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27392624 ctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16626868 - 16627202
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16626868 actattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16626967  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16626968 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16627067  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16627068 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 16627167  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16627168 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 16627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 18408094 - 18408428
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18408094 actaccgagaaggttaagataattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 18408193  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408194 aagaagaccacgtatttttgagagtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 18408293  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||      
T  18408294 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgca 18408393  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18408394 ccggattcatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 18408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25112682 - 25112348
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25112682 actactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 25112583  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  25112582 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 25112483  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25112482 attggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatgtt 25112383  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25112382 ccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 25112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 24313319 - 24313653
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24313319 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttccaag 24313418  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  24313419 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 24313518  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313519 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 24313618  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24313619 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24313653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 28263348 - 28263682
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  28263348 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaagg 28263447  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  28263448 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 28263547  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263548 attggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 28263647  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28263648 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 28342097 - 28342431
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  28342097 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaagg 28342196  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  28342197 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 28342296  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342297 attggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 28342396  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28342397 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28342431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 29592071 - 29592393
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29592071 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 29592170  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  29592171 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 29592270  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29592271 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 29592370  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  29592371 ccggatccatctcatgtaatcca 29592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 2874954 - 2875288
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2874954 actactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagattttgagtttcaag 2875053  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  2875054 aaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 2875153  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2875154 attggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 2875253  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2875254 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 2875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27187566 - 27187232
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  27187566 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaagg 27187467  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27187466 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagat 27187367  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187366 tttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 27187267  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27187266 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27187232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 27261674 - 27262008
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  27261674 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaagg 27261773  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27261774 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagat 27261873  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261874 tttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 27261973  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27261974 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27262008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 22762608 - 22762940
Alignment:
Q  5 tactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaa 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22762608 tacttagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaa 22762707  T
Q  105 ggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatat 204  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22762708 ggagaccacgtatttgtgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatat 22762807  T
Q  205 cggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttcc 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22762808 cggaaagagttggaacgatggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatc 22762907  T
Q  305 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22762908 ggatccctcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22762940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 28292523 - 28292857
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |    
T  28292523 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaatttaagg 28292622  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  28292623 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 28292722  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28292723 tttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 28292822  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28292823 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28292857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17032582 - 17032358
Alignment:
Q  113 cgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaaga 212  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032582 cgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaaga 17032483  T
Q  213 gttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 312  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032482 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 17032383  T
Q  313 ctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  17032382 ctcatgtgatccagagtgacgatgt 17032358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 18197696 - 18198006
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  18197696 agactactgagaaggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttca 18197795  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||| | || || ||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  18197796 agagggatatcatgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataag 18197895  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18197896 atatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtttcgcaacttcggaagtatg 18197995  T
Q  301 ttccggatcca 311  Q
    ||| |||||||    
T  18197996 ttctggatcca 18198006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21471698 - 21471412
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |     
T  21471698 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 21471599  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  21471598 tgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 21471499  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21471498 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 21471412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25750900 - 25750605
Alignment:
Q  42 gcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactg 141  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  25750900 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgg 25750801  T
Q  142 gtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggatt 241  Q
    ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||    
T  25750800 gtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggttt 25750701  T
Q  242 accaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  25750700 gccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 25750605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15459468 - 15459150
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15459468 agactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttca 15459369  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  15459368 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 15459269  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | ||||||||||    
T  15459268 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtatcacagttgcggaagtatg 15459169  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    | || ||||| || |||||    
T  15459168 tacctgatccttcgcatgt 15459150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 200 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22433930 - 22433793
Alignment:
Q  200 gatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22433930 gatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 22433831  T
Q  300 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433830 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22433793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 14131363 - 14131637
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||| |     
T  14131363 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactccta 14131462  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  14131463 tgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 14131562  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||    
T  14131563 gggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatcc 14131637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25768288 - 25768023
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |     
T  25768288 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactctta 25768189  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  25768188 tgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 25768089  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  25768088 gggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgt 25768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22796781 - 22797117
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    || || |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  22796781 agactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 22796880  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||     
T  22796881 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatcat 22796980  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22796981 atatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22797080  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
       ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22797081 cagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22797117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 10468998 - 10469319
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10468998 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10469097  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  10469098 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 10469197  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10469198 atttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 10469297  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  10469298 tagcggatccttcacatgtgat 10469319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18794787 - 18794504
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  18794787 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 18794688  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  18794687 tgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagt 18794588  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || |||||    
T  18794587 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacgaaagtatgtaccggatccgtcgcatgt 18794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19879395 - 19879112
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  19879395 atgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 19879296  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    || | ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  19879295 tggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 19879196  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19879195 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 19879112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 21564316 - 21564590
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  21564316 atgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctt 21564415  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||    
T  21564416 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagt 21564515  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || || || ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21564516 gggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatgtaccggatcc 21564590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Original strand, 34645770 - 34646017
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |     
T  34645770 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactccta 34645869  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |    
T  34645870 tgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaat 34645969  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtc 283  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34645970 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtc 34646017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24364544 - 24364223
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24364544 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 24364445  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  24364444 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 24364345  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24364344 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24364245  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  24364244 ttgcggatccttctcatgtgat 24364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Original strand, 11287782 - 11288054
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | |     
T  11287782 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcaccccta 11287881  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  11287882 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11287981  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11287982 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17415618 - 17415365
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||    
T  17415618 agactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttca 17415519  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  17415518 agagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 17415419  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctt 254  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  17415418 atatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Original strand, 11280689 - 11280961
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| | |     
T  11280689 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacaccta 11280788  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  11280789 tgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11280888  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11280889 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11280961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 8766297 - 8766615
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8766297 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8766396  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| |||| || |||  | ||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  8766397 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 8766496  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8766497 atttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  8766597 tagcggatccttcgcatgt 8766615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  27 caagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27560766 - 27561066
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  27560766 agactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 27560865  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27560866 agagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 27560965  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||  ||||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||    
T  27560966 atttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcggaagtatg 27561065  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  27561066 t 27561066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14381616 - 14381850
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  14381616 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 14381715  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  14381716 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 14381815  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14381816 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagt 14381850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1640876 - 1640715
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||| | ||||||    
T  1640876 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtc 1640777  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 190  Q
    || | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1640776 acccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750900
Alignment:
Q  55 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 154  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  155 tttgaagtcaaagaagttgactccg 179  Q
     ||||| || ||||||| |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactccg 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22434001 - 22433927
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434001 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 25743236 - 25743413
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  25743236 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 25743335  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || ||||||||||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25743336 agttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 25743413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18801074 - 18800870
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  18801074 agactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 18800975  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| ||||||| |||| | |||| |||||  ||||||  |||||||| ||| |||||||| | |  || |||||||| ||||||    
T  18800974 agagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtccatatcag 18800875  T
Q  201 atatc 205  Q
    |||||    
T  18800874 atatc 18800870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 28282962 - 28283262
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  28282962 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 28283061  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  28283062 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 28283161  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||  | || |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  | ||||||||||    
T  28283162 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 28283261  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  28283262 t 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16098168 - 16098005
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  16098168 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 16098069  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16098068 tgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18571769 - 18571622
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  18571769 gttaagatgattcaggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 18571670  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    | |||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18571669 tatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagt 18571622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16382536 - 16382699
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  16382536 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16382635  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16382636 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 16382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25655604 - 25655456
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || |    
T  25655604 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatc 25655505  T
Q  112 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 160  Q
    | |||||||||||||| | ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  25655504 atgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgctttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787702
Alignment:
Q  212 agttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 311  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||     
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatcct 18787710  T
Q  312 tctcatgt 319  Q
    || |||||    
T  18787709 tcgcatgt 18787702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23996366 - 23996203
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  23996366 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 23996267  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23996266 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 18838057 - 18838234
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  18838057 agactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18838156  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || ||||||||| | || | || |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18838157 agttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 18838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 1648947 - 1649094
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  1648947 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 1649046  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1649047 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1640710 - 1640613
Alignment:
Q  222 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||||| ||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  1640710 gtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttcacatgt 1640613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 15078513 - 15078690
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| | ||||||||    
T  15078513 agactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttca 15078612  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
     |  || || || || ||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15078613 ggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 21413101 - 21413248
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||      
T  21413101 gttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcata 21413200  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |||| ||| |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21413201 tgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16233341 - 16233167
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  16233341 agactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 16233242  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 175  Q
    ||  || || || |||||||| || || | || |||||| || ||||| ||||| |||||||  | |||||||||    
T  16233241 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 17329 - 17665
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17329 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 17428  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17429 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggcccgtatcag 17528  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17628  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17629 ttccggatccatctcatgtgatccaaactgatgatgt 17665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 11553117 - 11553451
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  11553117 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcagg 11553216  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  11553217 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagat 11553316  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553317 atcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 11553416  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11553417 ccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 11553451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12687758 - 12687422
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12687758 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 12687659  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  12687658 ggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 12687559  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687558 atatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12687459  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12687458 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12687422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 15154667 - 15155001
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15154667 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaag 15154766  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154767 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 15154866  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15154867 atcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 15154966  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15154967 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15155001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14954877 - 14954541
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14954877 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttca 14954778  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||    
T  14954777 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataag 14954678  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14954677 atatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtatcgcaacttcggaagtatg 14954578  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14954577 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14954541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8707860 - 8707526
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8707860 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 8707761  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  8707760 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 8707661  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8707660 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 8707561  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8707560 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 8707526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14332652 - 14332318
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14332652 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 14332553  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  14332552 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 14332453  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14332452 actggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 14332353  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14332352 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8198883 - 8198561
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8198883 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 8198784  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  8198783 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 8198684  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8198683 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 8198584  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  8198583 ccggatccatctcatgtaatcca 8198561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10871250 - 10870916
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  10871250 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcagg 10871151  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10871150 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatcagat 10871051  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10871050 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 10870951  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10870950 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 10870916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14038062 - 14037728
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14038062 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaag 14037963  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  14037962 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagat 14037863  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14037862 atcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgtt 14037763  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14037762 ccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14037728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14348092 - 14347758
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14348092 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaag 14347993  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  14347992 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagat 14347893  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14347892 atcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgtt 14347793  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14347792 ccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14347758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 15161072 - 15161406
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15161072 actactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 15161171  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  15161172 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 15161271  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15161272 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 15161371  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15161372 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15161406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 11237228 - 11237562
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237228 actactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 11237327  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  11237328 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 11237427  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11237428 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 11237527  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11237528 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 11237562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 18551773 - 18552107
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18551773 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 18551872  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  18551873 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 18551972  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18551973 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 18552072  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18552073 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 18552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18177997 - 18177663
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18177997 actactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 18177898  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  18177897 aaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 18177798  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177797 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 18177698  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18177697 ccagatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 18177663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 23516784 - 23517118
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23516784 actactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcagg 23516883  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  23516884 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 23516983  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23516984 tttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatatt 23517083  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  23517084 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 23517118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 44791366 - 44791688
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44791366 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaag 44791465  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  44791466 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 44791565  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44791566 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 44791665  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44791666 ccggatccatctcatgtaatcca 44791688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13686319 - 13685984
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13686319 actactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaag 13686220  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||    
T  13686219 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaaat 13686120  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatg-tcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13686119 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgt 13686020  T
Q  302 tccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13686019 tccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 13685984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15204134 - 15203800
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15204134 actacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 15204035  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15204034 aaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagat 15203935  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
      | |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15203934 tacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 15203835  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15203834 ccggatccatctcatgtgatcgaaagagatgatgt 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15624807 - 15624539
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  15624807 actacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcagg 15624708  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15624707 aaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagat 15624608  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 271  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15624607 atcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 12206818 - 12207109
Alignment:
Q  28 aagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12206818 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagt 12206917  T
Q  128 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 227  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  12206918 cactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggca 12207017  T
Q  228 tatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  12207018 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 12207109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15102592 - 15102928
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  15102592 agactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 15102691  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  15102692 agagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 15102791  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15102792 atatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15102891  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15102892 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15102928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19147469 - 19147151
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  19147469 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttca 19147370  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  19147369 agagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcag 19147270  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19147269 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19147170  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  19147169 tagcggatccttcacatgt 19147151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20746868 - 20746550
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  20746868 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttca 20746769  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20746768 agagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcag 20746669  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20746668 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20746569  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  20746568 tagcggatccttcacatgt 20746550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 14264270 - 14264571
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |     
T  14264270 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 14264369  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14264370 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagt 14264469  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14264470 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14264569  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  14264570 gt 14264571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 11388454 - 11388736
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  11388454 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaaga-ggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 11388552  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  11388553 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagt 11388652  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11388653 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 11388736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Original strand, 11306289 - 11306589
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  11306289 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 11306388  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  11306389 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 11306488  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  11306489 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 11306588  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  11306589 g 11306589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 8212154 - 8212437
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  8212154 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 8212253  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  8212254 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 8212353  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212354 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 8212437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 16072320 - 16072603
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| |     
T  16072320 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 16072419  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |    |||    
T  16072420 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagt 16072519  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16072520 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21662218 - 21661900
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| ||| || |||||| |||||  ||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21662218 agactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 21662119  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||   ||||||| ||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  21662118 ag---gagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggtttattggcccgtatcag 21662022  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || ||| ||||||||||  |||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  21662021 atttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaactacaaaagtatg 21661922  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || |  ||||||||||||||||    
T  21661921 tttcatatccatctcatgtgat 21661900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 49152559 - 49152224
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  49152559 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttca 49152460  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  49152459 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 49152360  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49152359 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 49152260  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  49152259 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 49152224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13665804 - 13665493
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||    
T  13665804 actacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaag 13665705  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |     |||||||||||    
T  13665704 aggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatcagat 13665610  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  13665609 ttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgta 13665510  T
Q  303 ccggatccatctcatgt 319  Q
     ||||||| || |||||    
T  13665509 gcggatccttcgcatgt 13665493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16950462 - 16950762
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | |||||||||    
T  16950462 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttca 16950561  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  16950562 ggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 16950661  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16950662 atttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcggaagtatg 16950761  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16950762 t 16950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18053944 - 18054244
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||    
T  18053944 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 18054043  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  18054044 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 18054143  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||| | ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  18054144 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 18054243  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  18054244 t 18054244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6413769 - 6413430
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   ||||||||||    
T  6413769 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttca 6413670  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || |||||| || |||||    
T  6413669 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatcag 6413570  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6413569 atttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatg 6413470  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 340  Q
    |   |||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  6413469 tagtggatccttcgcatgttattccgagagatgatgtcca 6413430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 35964865 - 35965016
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35964865 actactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaag 35964964  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 154  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  35964965 aaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13021615 - 13021294
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  || ||||||||    
T  13021615 agactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttca 13021516  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||| | |||| || ||   |||||| |||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13021515 agacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcag 13021416  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13021415 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13021316  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  13021315 tagcggatctttcacatgtgat 13021294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 14286402 - 14286667
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  14286402 atgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 14286501  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||| ||  | ||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  14286502 tgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagt 14286601  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14286602 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 14286667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Original strand, 23199763 - 23200034
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |    
T  23199763 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23199862  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 229  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||  | |||||| || | ||    
T  23199863 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23199962  T
Q  230 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    | |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23199963 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23200034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Original strand, 23505890 - 23506161
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||| |    
T  23505890 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23505989  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 229  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||  | |||||| || | ||    
T  23505990 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23506089  T
Q  230 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    | |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23506090 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23506161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12455960 - 12455640
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||    
T  12455960 agactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttca 12455861  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |  || ||||||| |||||||    
T  12455860 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcag 12455761  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || |||||| |||| ||||| ||| || | || || ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12455760 atttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  12455661 tagcggatccttcacatgtgat 12455640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14130096 - 14129795
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||       
T  14130096 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccga 14129997  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||| ||| ||||    
T  14129996 tgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagt 14129897  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14129896 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14129797  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  14129796 gt 14129795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14433914 - 14433613
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||       
T  14433914 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccga 14433815  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||| ||| ||||    
T  14433814 tgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagt 14433715  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14433714 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14433615  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  14433614 gt 14433613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9596314 - 9596236
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596314 agactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 11772256 - 11772362
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11772256 actactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 11772355  T
Q  103 aaggaga 109  Q
    |||||||    
T  11772356 aaggaga 11772362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14936590 - 14936443
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |    
T  14936590 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 14936491  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14936490 tgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 26288063 - 26288327
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || ||||| || || || || || ||| |||| || |||| |     
T  26288063 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactccta 26288161  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||    
T  26288162 tgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagt 26288261  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  26288262 tggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaaatatgt 26288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 1398 - 1698
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    || || ||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |  |||||||||||    
T  1398 agactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttca 1497  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| ||| ||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  1498 ggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 1597  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || |  ||||| ||||||||  |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |||    
T  1598 atttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcggaaggatg 1697  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  1698 t 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12368603 - 12368766
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || ||||    
T  12368603 gttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacg 12368702  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  12368703 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12368766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4440185 - 4440008
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  4440185 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 4440086  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
     |  || || || |||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4440085 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 4440008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 12254326 - 12254387
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12254326 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 12254387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26118596 - 26118812
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaa--atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 98  Q
    |||||||||||||||| | | ||||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  26118596 agactactgagaaagtcaggttgat--aagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagttt 26118693  T
Q  99 caagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 198  Q
    || || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  26118694 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatc 26118793  T
Q  199 agatatcggaaagagttgg 217  Q
    |||| || || ||||||||    
T  26118794 agatttcagatagagttgg 26118812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7824143 - 7823980
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  7824143 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7824044  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  7824043 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 7823980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15364183 - 15364036
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |    
T  15364183 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 15364084  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15364083 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 27107801 - 27107964
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  27107801 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27107900  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  27107901 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 27107964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 21674562 - 21674723
Alignment:
Q  17 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||| |||||||  || || || |||    
T  21674562 taagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtg 21674661  T
Q  117 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21674662 tttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcc 21674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15340569 - 15340454
Alignment:
Q  186 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 285  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  15340569 attggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcac 15340470  T
Q  286 aacttcggaagtatgt 301  Q
    | ||||||||||||||    
T  15340469 agcttcggaagtatgt 15340454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45146812 - 45146652
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  | | |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||    
T  45146812 agactacggaaaatgttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtaaatagaagagttatcattataagagtaggaaggacattgtgtttca 45146713  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||  || || || |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45146712 agttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatg-gactggtgttggacgtgctttgaagt 45146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 15479323 - 15479447
Alignment:
Q  195 tatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 294  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||  | ||||    
T  15479323 tatcagatctctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcgga 15479422  T
Q  295 agtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||||||| || ||||| || |||||    
T  15479423 agtatgtacctgatccttcgcatgt 15479447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17923938 - 17923862
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || ||||||| ||||||||||    
T  17923938 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagaataggcagaagagttgtcatgataag 17923862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 26118817 - 26118896
Alignment:
Q  243 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26118817 ccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 26118896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Original strand, 41213 - 41327
Alignment:
Q  55 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 154  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |  | |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  41213 gacagaagagctatcatgataaacgaagaaaataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgc 41312  T
Q  155 tttgaagtcaaagaa 169  Q
    ||||||||| |||||    
T  41313 tttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12193811 - 12193654
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| | || ||||||||||||| |||| | || || ||  |||| ||||| |    
T  12193811 actacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgttaagaggaggaatgacattgattttcagg 12193712  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 160  Q
      || || || || |||||||| || | || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12193711 ttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaa 12193654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Original strand, 17145288 - 17145428
Alignment:
Q  18 aagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgt 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |  |||||| | || |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  ||||  || ||||    
T  17145288 aagatgattcaagaaaatatgaaagcttctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggagctcatgtgt 17145387  T
Q  118 ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 158  Q
    |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||| ||||    
T  17145388 ttttaagagtgaataatgtaaccggtgttggacgtgttttg 17145428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13378955 - 13378796
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||| ||||| |||||||| | |||||  |  ||||||||||    
T  13378955 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttca 13378856  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 160  Q
     |  || || || |||||||||||||| | || | | ||| | ||||| |||||||||||    
T  13378855 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaa 13378796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12457002 - 12456940
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 98  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12457002 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 5764750 - 5764718
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagaga 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5764750 agactactgagaaagttaaaatgattcaagaga 5764718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13353275 - 13353247
Alignment:
Q  134 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353275 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 13353247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 337
Target Start/End: Original strand, 13634038 - 13634070
Alignment:
Q  305 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13634038 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 13634070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15340654 - 15340590
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  15340654 atgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttca 15340590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 33580 - 33916
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33580 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 33679  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33680 ggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 33779  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 33879  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33880 ttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 33916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8895 - 8559
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8895 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 8796  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8795 agaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcag 8696  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8695 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 8596  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8595 ttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 17045091 - 17045427
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17045091 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 17045190  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17045191 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 17045290  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045291 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17045390  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045391 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 17045427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19106648 - 19106314
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19106648 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcagg 19106549  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19106548 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccatatcagat 19106449  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106448 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 19106349  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19106348 ccggatccatctcatgtgatctagagtgacgatgt 19106314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20250131 - 20249797
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250131 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 20250032  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  20250031 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagat 20249932  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20249931 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 20249832  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20249831 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 20249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20137059 - 20136725
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137059 actactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 20136960  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20136959 aaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagat 20136860  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20136859 atcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 20136760  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20136759 tttgatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 20136725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16078728 - 16079045
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                      
T  16078728 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcag------------------ 16078809  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078810 -gaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16078908  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078909 atatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactacggaagtatg 16079008  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16079009 ttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16079045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16350677 - 16351011
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16350677 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 16350776  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16350777 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 16350876  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350877 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 16350976  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  16350977 ccggatccatctcatgtaattcagaatgacgatgt 16351011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 50620322 - 50620656
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50620322 actactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 50620421  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50620422 aggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 50620521  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620522 atcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgtt 50620621  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50620622 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21747815 - 21747482
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21747815 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgtagaaa-gatcttgagtttctag 21747717  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21747716 aaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccgagatttattggttcgtatcagat 21747617  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21747616 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 21747517  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21747516 ccggatccatcccatgtaatccaaagtgatgatgt 21747482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 33391107 - 33391441
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391107 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaag 33391206  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  33391207 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 33391306  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33391307 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 33391406  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33391407 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 33391441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 19760944 - 19761278
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19760944 actactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 19761043  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19761044 aaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggaccgtatcagat 19761143  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19761144 atccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcggtagtatgtt 19761243  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  19761244 tcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 19761278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 51333571 - 51333905
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51333571 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaat 51333670  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||    
T  51333671 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatat 51333770  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51333771 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 51333870  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51333871 ctggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 51333905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21830584 - 21830250
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21830584 actactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaag 21830485  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  21830484 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 21830385  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830384 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 21830285  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21830284 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21830250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21837231 - 21836897
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21837231 actactgagacagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttccaag 21837132  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  21837131 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 21837032  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21837031 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatgtt 21836932  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21836931 ccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 41354550 - 41354881
Alignment:
Q  6 actgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaag 105  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  41354550 actgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaag 41354649  T
Q  106 gagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||||| |     
T  41354650 gagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagatttt 41354749  T
Q  206 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 305  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354750 ggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccg 41354849  T
Q  306 gatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41354850 gatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41354881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16369563 - 16369267
Alignment:
Q  18 aagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgt 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |    
T  16369563 aagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtat 16369464  T
Q  118 ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16369463 ttttgagagtcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttgg 16369364  T
Q  218 aacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 314  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369363 aacggtggcgtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 16369267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612828
Alignment:
Q  111 cacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaa 210  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  211 gagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatcc 50612801  T
Q  311 atctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  50612802 atctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50612828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 19664952 - 19665270
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  19664952 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttca 19665051  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  19665052 agagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 19665151  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19665152 atttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19665251  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  19665252 tagcggatccttcgcatgt 19665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163227
Alignment:
Q  183 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgt 21163282  T
Q  283 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163281 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 20940147 - 20940439
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || |    
T  20940147 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtg 20940246  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    | || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||    
T  20940247 atcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaga 20940346  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20940347 gagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 20940439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19854597 - 19854279
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  19854597 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 19854498  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  19854497 agagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 19854398  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19854397 atttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 19854298  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  19854297 tagcggatccttcgcatgt 19854279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 20856839 - 20857155
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| |    
T  20856839 actacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcagg 20856938  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || |||||    
T  20856939 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 20857038  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  20857039 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 20857138  T
Q  303 ccggatccatctcatgt 319  Q
    || ||||| || |||||    
T  20857139 ccagatccttcgcatgt 20857155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37677328 - 37677027
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttt-ttgagagtcactcat 134  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| ||||| ||||||| |    
T  37677328 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcct 37677229  T
Q  135 gtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgag 234  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||    
T  37677228 ttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagag 37677129  T
Q  235 tgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 334  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||    
T  37677128 ttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 37677029  T
Q  335 tg 336  Q
    ||    
T  37677028 tg 37677027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20294660 - 20294374
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20294660 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20294561  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  20294560 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 20294461  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20294460 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 20294374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 31550292 - 31550578
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  31550292 atgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 31550391  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  31550392 tgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 31550491  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31550492 tggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 31550578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22433192 - 22433528
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  22433192 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttca 22433291  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||| ||||||||    
T  22433292 ggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcag 22433391  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||| ||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22433392 atttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22433492 tagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 22433528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 20075170 - 20075456
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | ||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||| |     
T  20075170 atgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctt 20075269  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  20075270 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagt 20075369  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  20075370 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgtgat 20075456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41308073 - 41307891
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||| |     
T  41308073 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactccta 41307974  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 218  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41307973 tgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttgga 41307891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20244438 - 20244183
Alignment:
Q  46 tgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||    
T  20244438 tgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgt 20244339  T
Q  146 tggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattacca 245  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || |||    
T  20244338 gggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttcca 20244239  T
Q  246 ccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20244238 ccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 20244183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 20835964 - 20836237
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |  ||| ||||| |    
T  20835964 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagtttta 20836063  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaaga---agttgactccgagatttattggtccgtat 197  Q
     || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||| | || ||||| ||||   |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  20836064 ggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgtat 20836163  T
Q  198 cagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 271  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20836164 cagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11382842 - 11382676
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||||||||||| |     
T  11382842 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 11382743  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11382742 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 11382676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 336
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395404
Alignment:
Q  126 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 225  Q
    ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || || |||||||||||||| || || ||||||||||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  226 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    | ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |     
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattcc 20395393  T
Q  326 gagtgatgatg 336  Q
    ||| |||||||    
T  20395394 gagggatgatg 20395404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20831482 - 20831645
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  20831482 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 20831581  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  20831582 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 20831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20914493 - 20914316
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| || | |||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  20914493 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttca 20914394  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || || |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20914393 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46518990 - 46518827
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||  |||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  46518990 gttaagatgattcaggagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46518891  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46518890 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46518827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24477021 - 24476927
Alignment:
Q  243 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  24477021 ccaccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgattccgagagatgatgt 24476927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 21202371 - 21202524
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||  | || |||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |  || |    
T  21202371 gagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtg 21202470  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    | ||  ||||||||||||| | || | | || |||||||||||| |||||||||    
T  21202471 atcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 22135645 - 22135756
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||||| |  || ||||    
T  22135645 aaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgacc 22135744  T
Q  112 acgtgtttttga 123  Q
    | ||||||||||    
T  22135745 atgtgtttttga 22135756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 22142232 - 22142294
Alignment:
Q  116 gtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22142232 gtttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 22142294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20184456 - 20184364
Alignment:
Q  10 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  || ||  |||||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  20184456 agaaagtgaagatgatccaagagaagatgtgagtgtctcagagtaggcagaagagttataatgataagaggaggaaagatattgagtttcaag 20184364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 64038 - 64374
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  64038 agactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcca 64137  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  64138 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggtccgtatcag 64237  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  64238 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 64337  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64338 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 64374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 973 - 639
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  973 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcatagaaaagatcttgagtttcaag 874  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  873 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 774  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  773 atcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 674  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  673 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4748
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4412 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 4511  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4512 agaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcag 4611  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4612 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 4711  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4712 ttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6311 - 5977
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  6311 actactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttcaag 6212  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6211 agggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 6112  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6111 attagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 6012  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6011 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 127208 - 127542
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  127208 actactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaag 127307  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  127308 aaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgatccgtatcagat 127407  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  127408 atcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgtt 127507  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127508 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 127542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 703 - 1036
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  703 actaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaag 802  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  803 aaggagaccacgtgtttt-gagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 901  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||     
T  902 atcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgtggagcaacttcggaagtatgta 1001  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1002 ccggatccatcccatgtgatccaaagtggtgatgt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6320 - 5986
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6320 actaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaag 6221  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6220 aaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagat 6121  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  6120 atcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 6021  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6020 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 5986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 1566 - 1831
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  ||||||||||| |  | ||| || || |||  |||||| |||| |     
T  1566 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactccta 1665  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  1666 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagt 1765  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1766 tggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22993 - 22816
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  22993 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 22894  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22893 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 22816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 180516 - 180180
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  180516 agactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttca 180417  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  180416 agagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 180317  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  180316 atatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagtgtcgcaacttcggaagtatg 180217  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  180216 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgttgatgt 180180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 219426 - 219760
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  219426 actactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 219525  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  219526 aagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 219625  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  219626 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgtt 219725  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  219726 ccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 219760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 229340 - 229006
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  229340 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaag 229241  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  229240 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagat 229141  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  229140 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 229041  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  229040 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 229006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 33016 - 33179
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  33016 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 33115  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33116 tgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 33179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6669 - 6335
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6669 actacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaag 6570  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 6470  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || |||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||     
T  6469 attggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 6370  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  6369 ctggatccatcccatgtgatcctaggtgatgatgt 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 32761 - 33095
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  32761 actactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaag 32860  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32861 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagat 32960  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32961 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 33060  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33061 acggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17284 - 16950
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17284 actactgtgaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 17185  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17184 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 17085  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17084 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 16985  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16984 ctggatgcatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 832 - 1165
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  832 actaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaag 931  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  932 aaggagaccacgt-tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 1030  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||  |||| || ||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1031 ataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 1130  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1131 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7676 - 7340
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7676 agactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttca 7577  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  7576 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 7477  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7476 atattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 7377  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7376 ttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27930
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  |    
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 27932  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  27931 gt 27930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Original strand, 109820 - 110148
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  109820 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 109919  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  109920 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 110019  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110020 attggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 110119  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtga 331  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  110120 ccggatccctctcatgtaattcagagtga 110148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 112823 - 112540
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  112823 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 112724  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  112723 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 112624  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  112623 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 112540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 96009 - 96345
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  96009 agactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttca 96108  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  96109 ggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 96208  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  96209 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 96308  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  96309 tacctgatccttcacatgttattccgagagatgatgt 96345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43451 - 43123
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  43451 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcagg 43352  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  43351 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagat 43252  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251 attggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 43152  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtga 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43151 ccggatccatctcatgtaatccagagtga 43123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8784 - 8448
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8784 agactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttta 8685  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  8684 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 8585  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8584 atattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 8485  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  8484 ttccggatccatctcatgaaatctagagtgacgatgt 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13965 - 13834
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13965 agactactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttta 13866  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 132  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13865 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 50556 - 50830
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  50556 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 50655  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||    
T  50656 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 50755  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  50756 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatcc 50830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 106594 - 106757
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  106594 gttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 106693  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  106694 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcc 106757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 26 - 325
Alignment:
Q  38 gaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  138 actggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgg 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  238 gattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1102
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1436 actaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaag 1337  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1336 aaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatcagat 1237  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||     
T  1236 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgcaacttcggaagtatgta 1137  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1136 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5518 - 5184
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||    
T  5518 actactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaag 5419  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5418 aaggagaccacatatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagat 5319  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  5318 atcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgtaattatgtt 5219  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5218 ctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14329 - 14002
Alignment:
Q  10 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14329 agaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggaga 14230  T
Q  110 ccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaa 209  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14229 ccacatgtttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaa 14130  T
Q  210 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||| | | |||    
T  14129 agagttggaacggtggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaacttccgaagtatgtacagaatc 14030  T
Q  310 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||||    
T  14029 cattccatgtgatccaaactgatgatgt 14002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31700 - 31373
Alignment:
Q  10 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 109  Q
    ||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |    
T  31700 agaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggata 31601  T
Q  110 ccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaa 209  Q
     || |||||| ||||||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||     
T  31600 tcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgat 31501  T
Q  210 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 309  Q
    ||  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31500 aggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatc 31401  T
Q  310 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31400 cttcgcatgttattccgagagatgatgt 31373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17741 - 17660
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17741 agactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgtag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9306
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9628 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacg 9529  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagt 214  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9528 tattgttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagt 9429  T
Q  215 tggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  9428 tggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttctagatccatcc 9329  T
Q  315 catgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  9328 catgtgatccaaagtgatgatgt 9306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15789 - 15456
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  15789 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaag 15690  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15689 aaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagat 15590  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589 atcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaacttcggaagtatgtt 15491  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15490 ccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15952 - 15832
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  15952 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaag 15853  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttga 123  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  15852 aaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 711 - 377
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  711 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcagg 612  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  611 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagat 512  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  511 attggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 412  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  411 ccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3115
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  3437 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaag 3338  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  3337 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagat 3238  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3237 atttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 3138  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  3137 ccggatccatcttacgtgatcca 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 3995
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4329 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaag 4230  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4229 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagat 4130  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4129 atcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 4030  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4029 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 3995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16474 - 16808
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16474 actactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 16573  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16574 agggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagat 16673  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |   |||||| ||||||||||    
T  16674 atcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatatgttccatgtattaaaacttcagaagtatgtt 16773  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16774 ccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15174 - 14840
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  15174 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatg 15075  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15074 aaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaat 14975  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14974 atcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 14875  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14874 ccggatccatctcatgtgatccagagagatgatgt 14840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 15088 - 15422
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  15088 actactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcagg 15187  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||    
T  15188 aaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtctgtatcagat 15287  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15288 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 15387  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15388 tcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatgt 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26864
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  26542 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccagg 26641  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26642 aaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagat 26741  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26742 atcagaaaggattgaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 26841  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26842 ccggatccatctcatgtgatcca 26864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 195710 - 196045
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  195710 agactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 195809  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  195810 ggagggtgatcatgt-tttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 195908  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  195909 atatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 196008  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  196009 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 196045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 148834 - 148551
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| || || || || ||| ||||||| |||| |     
T  148834 atgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttactccta 148735  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  148734 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcatacagagt 148635  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  148634 aggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 148551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Original strand, 68582 - 68783
Alignment:
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  68582 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 68681  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  68682 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 68781  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  68782 gt 68783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 121971 - 122134
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  121971 gttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 122070  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  122071 tatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 180209 - 180147
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  180209 gttaagatgattcaggagaagatgaagtcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 180147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 448356 - 448022
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  448356 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 448257  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  448256 aaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaat 448157  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  448156 atcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatttt 448057  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  448056 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 448022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 162396 - 162076
Alignment:
Q  17 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtg 116  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  162396 taagatgatttaagaaagagtgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgta 162297  T
Q  117 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttg 216  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  162296 tttttgagagtcactcctatgactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttg 162197  T
Q  217 gaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 316  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  162196 gaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatccca 162097  T
Q  317 tgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  162096 tgtgatccaaagtgatgatgt 162076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 90939 - 91239
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  90939 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 91038  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||| ||| ||    
T  91039 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatattag 91138  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  91139 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcggaagtatg 91238  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  91239 t 91239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 78636 - 78813
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||  |||| ||||| || |  |||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  78636 agactacggaaaaggttatgatgattcagtagaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 78735  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  78736 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 78813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175352
Alignment:
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaag 211  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaag 175352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7236 - 6900
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7236 actactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaag 7137  T
Q  103 aaggagaccacgtgt-ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaga 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||    
T  7136 aaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaga 7037  T
Q  202 tatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgca-tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7036 tattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 6937  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6936 ttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 968
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  1301 actactgagaaggttaagacgatt-aagaaaaagtgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaag 1203  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1202 aaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggat 1103  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1102 atcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatgtt 1003  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1002 ctggatccatcttatgtgatccaaggtgatgatgt 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 112318 - 111984
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| |    
T  112318 actattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcagg 112219  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  112218 aaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtccgtatcagat 112119  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  112118 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtt 112019  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  112018 tcggatccatctcatgtgatcccaagagatgatgt 111984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 203510 - 203811
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  203510 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttg 203609  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  203610 tgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcatatagagt 203709  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  203710 gggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgattccgagggatgat 203809  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  203810 gt 203811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 117865 - 117532
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |    
T  117865 actacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcagg 117766  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | || || || || ||| |||| || |||| | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  117765 agggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagat 117666  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  117665 atcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 117566  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 336  Q
     ||||||| || ||||| || | ||| |||||||    
T  117565 gcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 323003 - 322703
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  323003 agactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 322904  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  322903 ggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatcag 322804  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || ||||||||  |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  322803 atatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 322704  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  322703 t 322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 386118 - 385797
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||   ||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  386118 agactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttca 386019  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| ||  | ||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| | || |||    
T  386018 agagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccag 385919  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  385918 atatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  385818 tagcggatccttcgcatgtgat 385797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 269 - 590
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  269 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaag 368  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369 aaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 468  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  469 atcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 568  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatcc 324  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  569 atggatccatctcatgtgatcc 590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 301 - 1
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  301 agactattgagaaagttaagatgagtcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttca 202  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||  | || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 agagggttatcatgtgtttttgagagtcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 102  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  101 atatcggaaagagttggaatagtggcatatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  1 t 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Original strand, 116914 - 117233
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  116914 actactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaag 117013  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    || |||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  117014 aaagagaacaagtatttttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaat 117113  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  117114 atcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgtt 117213  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     | |||| ||||||||||||    
T  117214 tcagatctatctcatgtgat 117233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 98300 - 98137
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  98300 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 98201  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  98200 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 98137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Original strand, 23553 - 23650
Alignment:
Q  81 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23553 agaaaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8089 - 7854
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8089 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 7990  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7989 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 7890  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7889 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtg 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49790 - 49506
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49790 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 49691  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  49690 aaggagaccacatattttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagat 49591  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  49590 atcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaa 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 12986 - 13320
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12986 actactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaag 13085  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  13086 aaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatcagat 13185  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| | |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13186 atcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatttt 13285  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
     |||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  13286 tcggatccatctcatatgatcctaagagatgatgt 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22166 - 21932
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  22166 agactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttca 22067  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 21967  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21966 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 16425 - 16759
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||||||    
T  16425 actactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaag 16524  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16525 aaggagatcatgtattttttagggtcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagat 16624  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16625 atcagaaagaattggaatggtggcgtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 16724  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16725 cgggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16920
Alignment:
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  215 tggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 314  Q
    |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccattt 16943  T
Q  315 catgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16942 catgtgatccagagtgatgatgt 16920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1205 - 886
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||  |||||  ||| ||||| || || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  1205 actactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcagg 1106  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1105 aaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtccatatcagat 1006  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  1005 atcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttggaagtatgtt 906  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     |||||||||||||||||||    
T  905 tcggatccatctcatgtgat 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Original strand, 25728 - 26047
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |    
T  25728 actactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttcagg 25827  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  25828 aaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcagat 25927  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 302  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25928 atcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 26027  T
Q  303 ccggatccatctcatgtgat 322  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26028 tcggatccatctcatgtgat 26047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 25106 - 25399
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  25106 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtc 25205  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25206 actcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcat 25305  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25306 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcacatgtgat 25399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 195
Target Start/End: Original strand, 16213 - 16372
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| | || |||||||  || || || |||||||| || || | || ||    
T  16213 atgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcctg 16312  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 195  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  16313 tgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccgt 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 5606 - 5918
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5606 gagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggag 5704  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| |||| |||| ||||||| || ||  |    
T  5705 accatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcata 5804  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5805 aagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacatcggaagtatgttccggat 5904  T
Q  309 ccatctcatgtgat 322  Q
    ||||||||||||||    
T  5905 ccatctcatgtgat 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 10774 - 11064
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10774 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 10873  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| |    
T  10874 actcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcat 10973  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  10974 atagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgt 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 86511 - 86832
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||   ||| || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  86511 agactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgagtttca 86610  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||     
T  86611 agaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgtatcaa 86710  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  86711 atttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 86810  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  86811 tttcagatccatctcatgtgat 86832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9263 - 9047
Alignment:
Q  7 ctgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagg 106  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9263 ctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagg 9164  T
Q  107 agaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcg 206  Q
     || || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  9163 ggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatca 9064  T
Q  207 gaaagagttggaacggt 223  Q
    |||||| ||||||||||    
T  9063 gaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7052 - 6940
Alignment:
Q  225 gcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 324  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052 gcgtatcgagtgggtttgccaccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 6953  T
Q  325 agagtgatgatgt 337  Q
    | || ||||||||    
T  6952 aaagagatgatgt 6940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 351 - 517
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  112 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7694 - 7522
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7694 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 7595  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Original strand, 28805 - 29076
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28805 gagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 28904  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 229  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28905 ctcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcata 29004  T
Q  230 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    | ||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29005 tagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 29076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Original strand, 40796 - 41067
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40796 gagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 40895  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 229  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  40896 ctcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcata 40995  T
Q  230 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    | ||||||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  40996 tagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 41067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26441 - 26132
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |  |||||||||||    
T  26441 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttca 26342  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  26341 agagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccag 26242  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26241 atatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26142  T
Q  301 ttccggatcc 310  Q
    |  |||||||    
T  26141 tagcggatcc 26132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 789 - 985
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  789 actactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttaagg 888  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  889 aaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47423 - 47123
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  47423 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttca 47324  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| || |||| | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  47323 agagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 47224  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47223 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47124  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  47123 t 47123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 13908 - 14244
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  13908 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 14007  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||    
T  14008 agagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatcag 14107  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14108 atatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14207  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14208 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 14244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5224
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4960 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 5059  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  5060 ggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 5159  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 265  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  5160 atatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4174 - 3874
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4174 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttca 4075  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4074 agagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcag 3975  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3974 atatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3875  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  3874 t 3874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 256
Target Start/End: Original strand, 58448 - 58668
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  58448 atgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatg 58547  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  58548 tgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagt 58647  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttc 256  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  58648 gggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19419 - 19120
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  19419 agactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttca 19320  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  19319 ggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcag 19220  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19219 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 322
Target Start/End: Original strand, 59042 - 59100
Alignment:
Q  264 catgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  59042 catgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggatgtatgtttcggatccatctcatgtgat 59100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 74140 - 74038
Alignment:
Q  60 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 159  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||| |  |  || || |||||| ||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||    
T  74140 aagagctatcatgataagagcaggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttga 74041  T
Q  160 agt 162  Q
    |||    
T  74040 agt 74038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 7078 - 7352
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || |||||| |||| || |||| |     
T  7078 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactccta 7177  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  7178 tgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagt 7277  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7278 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatcc 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27818 - 27500
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  27818 agactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 27719  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||| ||    
T  27718 ggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtataag 27619  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27618 atatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 27519  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  27518 tagcggatccttcgcatgt 27500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 1156 - 1491
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  1156 agactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 1255  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||| ||| || | |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1256 agagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccga-agttattggtccgtatcag 1354  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||   ||| || ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1355 atatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1454  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  1455 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 10090 - 10408
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10090 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 10189  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  10190 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcag 10289  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |  || |||||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  10290 agttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 10389  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    | |||||||| || |||||    
T  10390 taccggatccttcgcatgt 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 5956 - 6220
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || |||||| |||| || |||| |     
T  5956 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactccta 6055  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6056 tgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagt 6155  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6156 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgt-tttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 21678 - 21987
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  21678 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 21777  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||  |||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||| ||    
T  21778 agagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataag 21877  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21878 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21977  T
Q  301 ttccggatcc 310  Q
    |  |||||||    
T  21978 tagcggatcc 21987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26091 - 26004
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26091 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 18544 - 18880
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  18544 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 18643  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||  |||||||    
T  18644 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatcag 18743  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18744 atatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18843  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  18844 tagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatgt 18880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 3637 - 3698
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  3637 catgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatgt 3698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9761
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |     | |||||||||    
T  10092 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtgagtttca 9998  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9997 agagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcag 9898  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9897 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 9798  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  9797 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 9761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 13368 - 13704
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  13368 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttca 13467  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  13468 ggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 13567  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13568 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 13667  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  13668 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 13704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20247 - 19973
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| |     
T  20247 atgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactccta 20148  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||  ||||    
T  20147 tgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagt 20048  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20047 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 19973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 17138 - 17474
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  17138 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttca 17237  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  17238 ggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 17337  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17338 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17437  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  17438 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 17474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14384 - 14049
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||    
T  14384 agactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttgagtttca 14285  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  ||    
T  14284 agagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttcgtactag 14185  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||   |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14184 atatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 14086  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14085 tagcggatccttcacatgttattccgagggatgatgt 14049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 397 - 79
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||| | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  |||||||||||    
T  397 agactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttca 298  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  297 agagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 198  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  197 atatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 98  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  97 tagcggatccttcgcatgt 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 51872 - 52170
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||| | | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||    
T  51872 actacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaag 51971  T
Q  103 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    | ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||    
T  51972 agggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagat 52071  T
Q  203 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52072 atctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgt 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 286
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4717
Alignment:
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 286  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatctgtcgca 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 337
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37089
Alignment:
Q  222 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtga 321  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctgatgtga 37073  T
Q  322 tccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||| |||||||||    
T  37074 tccagaatgatgatgt 37089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 4463 - 4560
Alignment:
Q  3 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4463 actactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatctcgagtttca 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 18993 - 19045
Alignment:
Q  249 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18993 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 19045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 59024 - 58972
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 82  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  59024 gagaagatgaaagcgtcgtagagtagacaaaagcgttatcatgatcagcgtag 58972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11187 - 10851
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  11187 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttca 11088  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11087 ggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 10988  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10987 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 10888  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10887 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 406 - 715
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  406 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttca 505  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  506 ggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 605  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  606 atttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 705  T
Q  301 ttccggatcc 310  Q
    |  |||||||    
T  706 tagcggatcc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 7831 - 7994
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  7831 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7930  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7931 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 7994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37501 - 37201
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||||    
T  37501 agactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttca 37402  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||   |||| || |||||| | |||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  37401 agggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcag 37302  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  37301 atatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcggaagtatg 37202  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  37201 t 37201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 38181 - 38400
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||    
T  38181 agactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 38280  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  38281 agagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcag 38380  T
Q  201 atatcggaaagagttggaac 220  Q
    ||||| || || ||||||||    
T  38381 atatctgagagggttggaac 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 27383 - 27563
Alignment:
Q  40 aagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgac 139  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | ||||    
T  27383 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgac 27482  T
Q  140 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 220  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27483 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaac 27563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19113 - 18830
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |     
T  19113 atgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactccta 19014  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||    
T  19013 tgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagt 18914  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| || |||||    
T  18913 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattgtggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 18830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23275 - 23094
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |     
T  23275 atgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactccta 23176  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgg 217  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  23175 tgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5049 - 4760
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  5049 agactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttca 4950  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||    
T  4949 agagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataag 4850  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 290  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4849 atatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3015 - 2750
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||| |||| |     
T  3015 atgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactccta 2916  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  2915 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagt 2816  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2815 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6483 - 6164
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6483 agactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 6384  T
Q  101 agaaggagaccacgtgttt-ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 199  Q
     ||||| ||||| || |||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||    
T  6383 ggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 6284  T
Q  200 gatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||| ||| || | || || ||| | | |||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||    
T  6283 gatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtat 6184  T
Q  300 gttccggatccatctcatgt 319  Q
    || || ||||| || |||||    
T  6183 gtaccagatccttcgcatgt 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4190 - 3872
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4190 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 4091  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  4090 agatggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcag 3991  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||   ||| |  || || || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3990 atatctgagagggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3891  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  3890 tagcggatccttcgcatgt 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 172
Alignment:
Q  29 agagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||     
T  462 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggtt 363  T
Q  129 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 228  Q
    |||| | |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  362 actcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcat 263  T
Q  229 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    || |||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  262 atagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 1211 - 1485
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| |     
T  1211 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 1310  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   | |    
T  1311 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaat 1410  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1411 aggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 5044 - 5309
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| |     
T  5044 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcactccta 5143  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||  |||| ||   |||    
T  5144 tgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagatatctaagagggttggaacactggcatacatagt 5243  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5244 gggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40003 - 39702
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||| |     
T  40003 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactccta 39904  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  39903 tgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 39804  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || | ||| ||||||    
T  39803 gggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtagcggatccttctcatgttattccgagagatgat 39704  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  39703 gt 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 61220 - 61556
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  61220 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 61319  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  61320 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 61419  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  61420 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  61520 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 61556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 52186 - 52522
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  52186 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 52285  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  52286 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 52385  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52386 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  52486 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 52522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 67608 - 67908
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  67608 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 67707  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  67708 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 67807  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  67808 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  67908 t 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 42340 - 42676
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  42340 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 42439  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  42440 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 42539  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42540 atttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 42639  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  42640 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 42676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 47406 - 47742
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  47406 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 47505  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||  ||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  47506 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 47605  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47606 atttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47705  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  47706 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 47742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2252
Alignment:
Q  120 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 198  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2330 ttgagagtcactctagtgataggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2243 - 2212
Alignment:
Q  240 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 14266 - 14576
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 108  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| | || || |    
T  14266 gagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtg 14365  T
Q  109 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgga 208  Q
    | || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||    
T  14366 atcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaga 14465  T
Q  209 aagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 308  Q
     || |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14466 gagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggat 14565  T
Q  309 ccatctcatgt 319  Q
    || || |||||    
T  14566 ccttcgcatgt 14576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9202
Alignment:
Q  156 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttt 255  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||  ||| || || ||||| |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  256 cgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1167
Alignment:
Q  92 tgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 191  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  192 ccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttc 291  Q
    | ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  292 ggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatcc 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 26203 - 26264
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26203 catgtatcgtaacttcggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 26264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27524 - 27207
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |  ||||| |||||    
T  27524 agactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttgaatttca 27426  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||| | || || ||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  27425 agagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 27326  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27325 atatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 27226  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  27225 tagcggatccttcgcatgt 27207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 33719 - 33993
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  33719 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 33818  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||    
T  33819 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 33918  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  33919 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40380
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  40543 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 40444  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  40443 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 40380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 49214 - 49532
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49214 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 49313  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| || || || |||||| |||| |||| || | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  49314 agagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 49413  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49414 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T
Q  301 ttccggatccatctcatgt 319  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  49514 tagcggatccttcgcatgt 49532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 49040 - 49376
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  49040 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 49139  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
    ||| ||| | || |||||| ||||||| || | | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  49140 agagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcag 49239  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    ||||| || || |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49240 atatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 49339  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  49340 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 49376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 57859 - 58159
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | || || || || ||||||||||| ||||       
T  57859 atgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 57957  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  57958 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagt 58057  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  58058 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 58157  T
Q  336 gt 337  Q
    ||    
T  58158 gt 58159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 25907 - 26190
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| |||| |     
T  25907 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactccta 26006  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  26007 tgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagt 26106  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  26107 gggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgt 26190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16940 - 16654
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  16940 atgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16841  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || |||||||  ||||| ||| | ||    
T  16840 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgt 16741  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16740 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 509
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |     
T  792 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactccta 693  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  692 tgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagt 593  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  592 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgt 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20410 - 20103
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 111  Q
    ||||| |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || |    
T  20410 aaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatc 20311  T
Q  112 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaag 211  Q
    | |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || ||    
T  20310 atgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagag 20211  T
Q  212 agttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 311  Q
     |||||||  ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||     
T  20210 tgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatcct 20111  T
Q  312 tctcatgt 319  Q
    || |||||    
T  20110 tcgcatgt 20103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43804 - 43471
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || |||||||||| | |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  43804 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 43705  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  43704 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 43605  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43604 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 334  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  43504 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44816 - 44483
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || |||||||||| | |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  44816 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 44717  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  44716 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 44617  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44616 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 334  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  44516 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 44483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36036
Alignment:
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || || |||||||  ||||| ||| ||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 36036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Original strand, 38929 - 39229
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |||||||||||| |     
T  38929 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 39028  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  39029 tgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagt 39128  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
     || || ||||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  39129 tggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcagagggatgat 39228  T
Q  336 g 336  Q
    |    
T  39229 g 39229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 16755 - 17041
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  16755 atgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16854  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16855 tgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagt 16954  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 322  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16955 tggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 17041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26560 - 26239
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||    || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||||||    
T  26560 agactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttca 26461  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  26460 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 26361  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || || || ||||| ||||| ||| |||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  26360 atttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 26261  T
Q  301 ttccggatccatctcatgtgat 322  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  26260 tggcggatctttcgcatgtgat 26239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 248912 - 248612
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  248912 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 248813  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  248812 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 248713  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 300  Q
    || || || | ||||||||  ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  248712 atttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  248612 t 248612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 337
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4482
Alignment:
Q  90 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 189  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |    
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  190 gtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaact 289  Q
    ||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 4434  T
Q  290 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  4435 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 4482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 301
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2173
Alignment:
Q  151 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgca 250  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  251 tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 12823 - 13088
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| | |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  12823 atgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 12922  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 235  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||  || |||||||||||| |||| || || ||  ||||||||||||| ||  ||||    
T  12923 tgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagt 13022  T
Q  236 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  13023 tggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgt 13088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136082
Alignment:
Q  141 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggat 240  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  241 taccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatcccgagagatgatgt 136082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 301
Target Start/End: Original strand, 7248 - 7543
Alignment:
Q  4 ctactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaaga 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||| ||||||| ||    
T  7248 ctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcagga 7347  T
Q  104 aggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagata 203  Q
     || || || || ||| |||| || |||  | |||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||||     
T  7348 gggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatt 7447  T
Q  204 tcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
    || ||| |  ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7448 tcagaagg--ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgt 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43082 - 42784
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  43082 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 42983  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || || ||| | || ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  42982 ggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 42883  T
Q  201 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 299  Q
    || || || |  |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42882 atttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 42784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13560
Alignment:
Q  121 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 220  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||  |||||||||||| || || ||||||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  221 ggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 301  Q
     ||| | ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 13560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 3734 - 3810
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3734 gagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 6238
Alignment:
Q  240 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6333 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1916
Alignment:
Q  37 tgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgt 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |    
T  2057 tgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctat 1958  T
Q  137 gactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1957 gacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8394 - 8217
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  8394 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 8295  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  8294 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcc 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14822 - 14661
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  14822 agactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 14723  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     |  || || || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14722 ggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23518
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||   | || ||||    
T  23679 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacg 23580  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 176  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  23579 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 28287 - 28467
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||| || || |    
T  28287 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatg 28386  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 195  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  28387 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgatttgttggaccgt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46439 - 46276
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  46439 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46340  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | || ||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46339 tgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3444 - 3281
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |  || || || |    
T  3444 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatg 3345  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3344 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 3281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 14758 - 14921
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || || |    
T  14758 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatg 14857  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14858 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5311
Alignment:
Q  36 atgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||       
T  5477 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 5378  T
Q  136 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 202  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  5377 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagat 5311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1222
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  1061 agactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttct 1160  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     |  || || || || ||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1161 ggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 393 - 570
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 492  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || |  || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  493 agttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13030
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  13207 agactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 13108  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
     |  || || || ||||| |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13107 ggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 7498 - 7559
Alignment:
Q  276 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7498 catgtgtcgcaacttcggaagtttgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 5467 - 5543
Alignment:
Q  9 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 85  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5467 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1241 - 1385
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1241 agactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 1340  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgt 145  Q
     ||||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| |||||    
T  1341 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3896 - 4059
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  3896 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatg 3995  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  3996 tgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 940 - 1094
Alignment:
Q  24 attcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttga 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||    
T  940 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 1039  T
Q  124 gagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    | || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1040 gggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 8898 - 9059
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  8898 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 8997  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     |  || || ||  |||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  8998 ggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagt 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9286 - 9125
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  9286 agactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagatgagaaaggatattgagtttca 9187  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     |  || || || || || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9186 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14956 - 14779
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||| | ||  |||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  14956 agactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 14857  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||  || || || |||||||| || || | || ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14856 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 43837 - 43737
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43837 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 43738  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  43737 a 43737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 169 - 1
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  169 agactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 70  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 169  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  69 agagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24165 - 24002
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  24165 gttaagatgattcaggagaagattaaagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 24066  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 178  Q
    ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24065 tgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45932 - 45835
Alignment:
Q  213 gttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 310  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45932 gttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 45835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || ||||||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 3965 - 4112
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  3965 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 4064  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
    ||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4065 tgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 3362 - 3443
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3362 agactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 337
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3611
Alignment:
Q  213 gttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 312  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatcctt 3586  T
Q  313 ctcatgtgatccagagtgatgatgt 337  Q
    | ||||| || | ||| ||||||||    
T  3587 cacatgttattccgagagatgatgt 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  30 gagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 129  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || ||||||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  130 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 162  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 12786 - 12742
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12786 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgt 12742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9287 - 9182
Alignment:
Q  232 gagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 331  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||    
T  9287 gagtgggattgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagaga 9188  T
Q  332 tgatgt 337  Q
    ||||||    
T  9187 tgatgt 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1532
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  1431 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T
Q  101 ag 102  Q
    ||    
T  1531 ag 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13550 - 13397
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  13550 agactacagaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 13451  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 154  Q
     |  || || ||||| || |||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  13450 ggttggtgatcacgtattcttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 71518 - 71442
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  71518 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 102
Target Start/End: Original strand, 26178 - 26265
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 102  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26178 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11068 - 10867
Alignment:
Q  1 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  11068 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 10969  T
Q  101 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 200  Q
     || || || || |||||| | || || |||  | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  10968 ggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 10869  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  10868 at 10867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Original strand, 886 - 962
Alignment:
Q  243 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  886 ccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10941 - 10781
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||| | || |||||||| ||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |    
T  10941 gttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcatagtaggcagaagagttaccatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 10842  T
Q  115 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 175  Q
    ||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  10841 tgtttttgagagtgaattttgtaaccggtgttggacgtgctttcaagtgttagaagttgac 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14425 - 14370
Alignment:
Q  12 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagtta 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  14425 aaagttaagatgaatcaagagaaaatgaaagcatctcagagtagacagaagagtta 14370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18394 - 18332
Alignment:
Q  15 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18394 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 18332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University