View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20327_high_8 (Length: 484)

Name: NF20327_high_8
Description: NF20327
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20327_high_8
NF20327_high_8
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (21-311)||(24508742-24509032)
chr6 (207-471)||(24508523-24508787)
chr6 (21-140)||(24509703-24509822)
chr6 (21-292)||(20752039-20752322)
chr6 (21-330)||(11183050-11183370)
chr6 (139-311)||(21937716-21937888)
chr6 (207-330)||(21936490-21936613)
chr6 (19-122)||(21936783-21936886)
chr6 (21-136)||(21275773-21275888)
chr6 (139-311)||(21936568-21936740)
chr6 (21-127)||(2887490-2887596)
chr6 (19-119)||(21937568-21937668)
chr6 (21-127)||(2889212-2889318)
chr6 (207-328)||(20751944-20752065)
chr6 (207-327)||(21937843-21937963)
chr6 (139-292)||(24509850-24510006)
chr6 (139-291)||(21275923-21276075)
chr6 (207-292)||(24509980-24510064)
chr6 (268-326)||(12909533-12909591)
chr6 (268-326)||(12934640-12934698)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (21-326)||(47071408-47071728)
chr4 (21-326)||(54859044-54859361)
chr4 (21-326)||(14643612-14643934)
chr4 (21-312)||(34279394-34279695)
chr4 (21-296)||(32429190-32429487)
chr4 (135-326)||(22118851-22119044)
chr4 (135-312)||(3409489-3409666)
chr4 (139-330)||(30019718-30019901)
chr4 (19-127)||(18670838-18670946)
chr4 (21-139)||(30019936-30020054)
chr4 (20-233)||(34128220-34128442)
chr4 (21-136)||(35096028-35096143)
chr4 (21-127)||(18737162-18737268)
chr4 (21-136)||(35090915-35091030)
chr4 (21-127)||(18716489-18716595)
chr4 (135-296)||(18670976-18671137)
chr4 (207-331)||(25618110-25618234)
chr4 (185-296)||(25618204-25618315)
chr4 (21-122)||(3424802-3424904)
chr4 (139-291)||(35091065-35091217)
chr4 (139-291)||(35096178-35096330)
chr4 (207-326)||(34279320-34279440)
chr4 (172-264)||(34601967-34602059)
chr4 (49-110)||(34602060-34602121)
chr4 (195-297)||(18716686-18716788)
chr4 (195-296)||(18737359-18737460)
chr4 (135-205)||(3424698-3424768)
chr4 (46-129)||(3409693-3409781)
chr4 (238-312)||(3424253-3424327)
chr4 (266-312)||(18671048-18671094)
chr4 (207-291)||(18671107-18671191)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (21-329)||(144096-144410)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (21-329)||(13654335-13654649)
chr1 (23-330)||(19310826-19311154)
chr1 (19-330)||(1187826-1188152)
chr1 (23-291)||(43358755-43359045)
chr1 (21-206)||(17414555-17414740)
chr1 (21-140)||(10186664-10186783)
chr1 (21-326)||(16051206-16051522)
chr1 (135-296)||(10186478-10186639)
chr1 (21-127)||(35626172-35626278)
chr1 (21-252)||(44523972-44524226)
chr1 (21-136)||(3465473-3465588)
chr1 (21-136)||(3468067-3468182)
chr1 (21-136)||(28574297-28574412)
chr1 (21-136)||(28598309-28598424)
chr1 (139-312)||(21431562-21431736)
chr1 (32-127)||(21431770-21431865)
chr1 (207-330)||(10185907-10186030)
chr1 (172-326)||(35653120-35653274)
chr1 (139-291)||(28574447-28574599)
chr1 (139-291)||(28598459-28598611)
chr1 (208-330)||(35626398-35626519)
chr1 (139-291)||(3468218-3468370)
chr1 (207-330)||(10186385-10186508)
chr1 (198-292)||(35626329-35626423)
chr1 (207-292)||(21431523-21431608)
chr1 (207-291)||(3701367-3701451)
chr1 (19-63)||(29681588-29681632)
chr1 (19-63)||(48366213-48366257)
chr1 (21-127)||(3696404-3696510)
chr1 (241-295)||(1188218-1188272)
chr1 (244-296)||(10185885-10185937)
chr1 (266-326)||(44523957-44524017)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (21-309)||(18608534-18608832)
chr8 (21-309)||(25953058-25953363)
chr8 (19-278)||(10340882-10341163)
chr8 (21-127)||(34108229-34108335)
chr8 (21-136)||(14315000-14315115)
chr8 (21-136)||(14318704-14318819)
chr8 (21-136)||(26981965-26982080)
chr8 (21-136)||(26987078-26987193)
chr8 (139-330)||(43956713-43956904)
chr8 (21-127)||(18494274-18494380)
chr8 (23-136)||(43956938-43957051)
chr8 (51-326)||(1781869-1782152)
chr8 (22-93)||(18885065-18885136)
chr8 (139-291)||(14314813-14314965)
chr8 (139-291)||(14318517-14318669)
chr8 (139-291)||(26981777-26981929)
chr8 (139-291)||(26986891-26987043)
chr8 (139-291)||(34108381-34108533)
chr8 (242-297)||(25953011-25953066)
chr8 (139-291)||(18494079-18494230)
chr8 (185-221)||(18616168-18616204)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (21-330)||(42780184-42780514)
chr2 (139-312)||(716404-716577)
chr2 (21-127)||(14917480-14917586)
chr2 (21-136)||(17720615-17720730)
chr2 (21-136)||(30283530-30283645)
chr2 (21-136)||(45120386-45120501)
chr2 (21-115)||(716267-716361)
chr2 (208-330)||(716532-716654)
chr2 (139-278)||(30283365-30283504)
chr2 (21-127)||(16284437-16284544)
chr2 (139-291)||(14917284-14917436)
chr2 (139-291)||(17720428-17720580)
chr2 (139-291)||(45120537-45120689)
chr2 (139-308)||(20892235-20892403)
chr2 (207-287)||(20892197-20892277)
chr2 (172-236)||(16286004-16286068)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (21-326)||(173358-173680)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (21-312)||(2022964-2023276)
chr5 (139-330)||(13556167-13556358)
chr5 (56-326)||(43540650-43540928)
chr5 (21-204)||(4555653-4555835)
chr5 (21-122)||(13556408-13556509)
chr5 (21-136)||(9877628-9877743)
chr5 (207-330)||(35368705-35368828)
chr5 (21-136)||(39903845-39903960)
chr5 (21-136)||(39908958-39909073)
chr5 (21-136)||(9872513-9872628)
chr5 (21-127)||(35368989-35369095)
chr5 (135-296)||(35368798-35368959)
chr5 (139-291)||(9872326-9872478)
chr5 (139-291)||(9877441-9877593)
chr5 (139-291)||(39909108-39909260)
chr5 (45-115)||(25184116-25184186)
chr5 (207-278)||(43379660-43379731)
chr5 (21-75)||(43378437-43378491)
chr5 (147-291)||(39904003-39904147)
chr5 (155-292)||(43379554-43379686)
chr5 (135-323)||(43402001-43402191)
chr5 (207-291)||(2023230-2023314)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (19-205)||(18024168-18024354)
chr3 (21-206)||(20891059-20891244)
chr3 (19-278)||(49784494-49784775)
chr3 (21-136)||(1302334-1302449)
chr3 (21-136)||(6858144-6858259)
chr3 (21-136)||(8458311-8458426)
chr3 (21-136)||(8464750-8464865)
chr3 (21-136)||(31081596-31081711)
chr3 (21-127)||(5458110-5458216)
chr3 (21-127)||(5481586-5481692)
chr3 (45-296)||(29827448-29827710)
chr3 (21-136)||(4049807-4049922)
chr3 (21-136)||(6853041-6853156)
chr3 (21-136)||(10591384-10591499)
chr3 (21-136)||(10673027-10673142)
chr3 (21-136)||(10678142-10678257)
chr3 (21-136)||(31076491-31076606)
chr3 (21-136)||(33702689-33702804)
chr3 (21-136)||(33703299-33703414)
chr3 (21-127)||(4054941-4055047)
chr3 (19-127)||(3187552-3187660)
chr3 (21-136)||(10584947-10585062)
chr3 (207-330)||(29827680-29827803)
chr3 (139-291)||(4049958-4050110)
chr3 (139-291)||(1302146-1302298)
chr3 (139-291)||(4055092-4055244)
chr3 (147-291)||(8458470-8458614)
chr3 (139-291)||(10584760-10584912)
chr3 (139-291)||(10672840-10672992)
chr3 (139-291)||(6852854-6853006)
chr3 (139-291)||(6857957-6858109)
chr3 (139-291)||(10591197-10591349)
chr3 (139-291)||(31076304-31076456)
chr3 (139-291)||(31081409-31081561)
chr3 (139-291)||(33702501-33702653)
chr3 (139-291)||(5481390-5481542)
chr3 (139-291)||(5457913-5458065)
chr3 (139-291)||(8464900-8465052)
chr3 (139-291)||(10677953-10678107)
chr3 (207-266)||(20891281-20891340)
chr3 (207-266)||(20891354-20891413)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (21-136)||(12851674-12851789)
chr7 (21-136)||(14610364-14610479)
chr7 (32-249)||(4181347-4181574)
chr7 (21-136)||(12856789-12856904)
chr7 (21-136)||(26051021-26051136)
chr7 (21-136)||(26056134-26056249)
chr7 (21-136)||(26060380-26060495)
chr7 (21-136)||(26065493-26065608)
chr7 (19-252)||(37459804-37460047)
chr7 (21-116)||(11056625-11056720)
chr7 (135-276)||(5440217-5440358)
chr7 (135-276)||(5449227-5449368)
chr7 (21-120)||(5440393-5440492)
chr7 (21-120)||(5449403-5449502)
chr7 (139-291)||(12856939-12857091)
chr7 (21-94)||(35352422-35352495)
chr7 (171-291)||(14610511-14610631)
chr7 (147-291)||(26051179-26051323)
chr7 (147-291)||(26056292-26056436)
chr7 (147-291)||(26060538-26060682)
chr7 (147-291)||(26065651-26065795)
chr7 (139-291)||(12851826-12851978)
chr7 (283-326)||(37459789-37459832)
chr7 (19-63)||(5436692-5436736)
chr7 (135-278)||(35352235-35352379)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (21-120)||(2124-2223)
scaffold0223 (139-291)||(1921-2073)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508742
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  121 cataattttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24508932 cataattttgtacaaaattaatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgt 24508833  T
Q  221 taaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggt 311  Q
    || |||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24508832 tatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggt 24508742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 207 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24508787 - 24508523
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24508787 acttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaagcgcccatttacca 24508688  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagatcacctaacatgttgctgtagaacaatcactagcaaggcgatgcatggcatgaatttgacttcatgaatattgagga 406  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24508687 aatgtttcaatatatatgaaagatcacctaacatgttgctgtagaacaatcactaacaaggtgatgcatgacatgaatttgacttcatgaatattgagga 24508588  T
Q  407 atttttcattacgtaaagtccatagcttgcatcattcttttaatgaatgatctaatgtataattt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24508587 atttttcattacgtaaagtccatagcttgcatcattcttttagtgaatgatctaatgtataattt 24508523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24509822
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  121 cataattttgtacaaaatta 140  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24509803 cataattttgtacaaaatta 24509822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20752039
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  121 cataattttgtacaaaa------------ttaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgac 208  Q
    || |||| | | |||||            |||||| | |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  20752222 caaaattctttccaaaactgtgtgtcaagttaatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgac 20752123  T
Q  209 ttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    |||||| |||| || |||||||||| || |  |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20752122 ttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgtcaaaggttatggccatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaa 20752039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183050
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  121 cataat----------tttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagta---cataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttga 207  Q
    || |||          | ||| ||||  ||||  |||||||||||  |||     ||   ||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  11183270 caaaattcatgttttttctgtccaaa--taattcccaaatgccaataattatttctatgtcattatatgagccttcacatgggagaacacacccatttga 11183173  T
Q  208 cttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaa 307  Q
    ||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | ||| ||||    
T  11183172 cttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgccaa 11183073  T
Q  308 aggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  11183072 atgttccaatgtatatgaaagat 11183050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Original strand, 21937716 - 21937888
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |    
T  21937716 taatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcacatgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacc 21937815  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggt 311  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  21937816 cttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgataaagttaattaaacaccccttttccaaaggt 21937888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21936613 - 21936490
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21936613 acttgaataaattctaaggttcactaaacacccctttgccaaaggtcatgatcatataaacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacccatttgcca 21936514  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||    
T  21936513 aaggttcaaatgtatataaaagat 21936490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936783
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  119 aaca 122  Q
    ||||    
T  21936786 aaca 21936783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21275888
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  21275873 caaaattctgtccaaa 21275888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21936740 - 21936568
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| |||||||  || |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| || |    
T  21936740 taatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacc 21936641  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggt 311  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||| | ||| ||||||||    
T  21936640 tttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaataaattctaaggttcactaaacacccctttgccaaaggt 21936568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21937668
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatgt 21937667  T
Q  119 a 119  Q
    |    
T  21937668 a 21937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20752065 - 20751944
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | |    
T  20752065 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacacccctttgtcaaaggttataataatatacacttgaaccaatgctaaggtttattaagcacccatttgcta 20751966  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaag 328  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  20751965 aaggttataatgtatatgaaag 20751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 327
Target Start/End: Original strand, 21937843 - 21937963
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| | |    
T  21937843 acttgaatcaatgataaagttaattaaacaccccttttccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaaccacccctttgcta 21937942  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaa 327  Q
    || ||| ||||||||| ||||    
T  21937943 aatgttccaatgtatacgaaa 21937963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 292
Target Start/End: Original strand, 24509850 - 24510006
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||      
T  24509850 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacaca 24509949  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatg---atcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    | |||| |||| || |||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24509950 cttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaaggttcattaa 24510006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 21275923 - 21276075
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  21275923 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 21276022  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  21276023 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 21276075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 292
Target Start/End: Original strand, 24509980 - 24510064
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24509980 acttgaattaatgttaaggttcattaat-acccttttgtcaaagatcatgattatatacacttgaattaatgttaaggttcattaa 24510064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 326
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909591
Alignment:
Q  268 ttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaa 12909591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 326
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934698
Alignment:
Q  268 ttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaa 12934698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071728
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  121 cataattt-------tgta--caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatg------agagaaaacaccccttt 205  Q
    || |||||       |||   | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||      |||||||||||   |||    
T  47071508 caaaatttctgttcttgttgtccaaattaatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacatgaacatgagagaaaacactttttt 47071607  T
Q  206 gacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacc 305  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||    
T  47071608 gacttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgcc 47071707  T
Q  306 aaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  47071708 aaaggttccaatgtatatgaa 47071728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859044
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  121 cataatt----------ttgta-caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccc-tttgac 208  Q
    || ||||          ||||  | ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  54859261 caaaattccatttttggttgtgtccaaattaatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgac 54859162  T
Q  209 ttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaa 308  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| | ||| |||||    
T  54859161 ttgaatcaatgttatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaa 54859062  T
Q  309 ggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    |||| |||||||||||||    
T  54859061 ggttccaatgtatatgaa 54859044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643612
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  121 cataatt-----------------ttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccct 203  Q
    || ||||                 || |   |||||||||  |||||  |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14643834 caaaattcttttttctgtattttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccat 14643735  T
Q  204 ttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcattta 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||     
T  14643734 ttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttg 14643635  T
Q  304 ccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14643634 ccaaaggttccaatgtatatgaa 14643612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279394
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  121 cataattt----------tgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgactt 210  Q
    || ||||           |||   |||||||||  |||||| | | |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34279595 caaaattcatgttctgtgtgtgtcaaattaatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgactt 34279496  T
Q  211 gaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaagg 310  Q
    |||| |||| || |||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34279495 gaatcaatgttatggttaattgaacacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttaaatcaatgttaaggtttattaagcactcatttgccaaagg 34279396  T
Q  311 tt 312  Q
    ||    
T  34279395 tt 34279394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429190
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  121 cataattttgtacaaaat----------------------taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaaca 198  Q
    || |||| ||| ||||||                      |||||  |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaatgagagaaaaca 32429288  T
Q  199 cccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  32429287 cccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcac 32429190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 326
Target Start/End: Original strand, 22118851 - 22119044
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaa--cacccctttgacttgaattaatgctaaggttcatta 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  22118851 aaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcatta 22118950  T
Q  233 aacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    | || ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  22118951 agcacccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgccaaaggttccaatgtaaatgaa 22119044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3409666 - 3409489
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  3409666 aaattaatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgctatgattcattaag 3409567  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtt 312  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  3409566 cacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggtt 3409489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30019901 - 30019718
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || || |||||||||| || |    
T  30019901 taatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatca-tgttatggttcattaagcacc 30019803  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30019802 tttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac-------ccaaaggttccaatgtatatgaaagat 30019718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18670946
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  119 aacataatt 127  Q
    |||||||||    
T  18670938 aacataatt 18670946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019936
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  121 cataattttgtacaaaatt 139  Q
    || |||| ||| |||||||    
T  30019954 caaaattctgtccaaaatt 30019936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128220
Alignment:
Q  20 atattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgta 119  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  120 acataat---------tttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgactt 210  Q
    ||| |||         || ||   ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34128342 acaaaattcttgtttcttagtgtcaaattaatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgactt 34128243  T
Q  211 gaattaatgctaaggttcattaa 233  Q
    |||| |||| ||  |||||||||    
T  34128242 gaatcaatgttatagttcattaa 34128220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096143
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  35096128 caaaattctgtccaaa 35096143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737268
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  18737262 caaaatt 18737268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091030
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  35091015 caaaattctgtccaaa 35091030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716595
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  18716589 caaaatt 18716595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Original strand, 18670976 - 18671137
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  18670976 aaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaag 18671075  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    |   | ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  18671076 ccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcac 18671137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25618234 - 25618110
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||  ||    
T  25618234 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgcaaaagttcattaagaacccttttgtca 25618135  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagatc 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  25618134 aaggttacaatgtatatgaaagatc 25618110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25618315 - 25618204
Alignment:
Q  185 catgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaagg 284  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || | |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  25618315 catgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcatccagttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgg 25618216  T
Q  285 ttcattaagcac 296  Q
    ||||||||||||    
T  25618215 ttcattaagcac 25618204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424802
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggaga-attatgttgttaatgta 119  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  120 aca 122  Q
    |||    
T  3424804 aca 3424802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 35091065 - 35091217
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  35091065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 35091164  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  35091165 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 35091217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 35096178 - 35096330
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  35096178 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 35096277  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  35096278 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 35096330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34279440 - 34279320
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||| ||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  34279440 acttaaatcaatgttaaggtttattaagcactcatttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgtca 34279341  T
Q  307 aaggtttc-aatgtatatgaa 326  Q
    || | ||| ||||||||||||    
T  34279340 aaagattctaatgtatatgaa 34279320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34602059 - 34601967
Alignment:
Q  172 atatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatata 264  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  34602059 atatgaccattcacatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatgctatagttcattaaacatccatttgtcaaaggttatgatcatata 34601967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602060
Alignment:
Q  49 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgtt 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaattgtgtt 34602060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 18716686 - 18716788
Alignment:
Q  195 aacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagc 294  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |   | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18716686 aacacccatttgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagc 18716785  T
Q  295 act 297  Q
    |||    
T  18716786 act 18716788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Original strand, 18737359 - 18737460
Alignment:
Q  195 aacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagc 294  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |   | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18737359 aacacccatttgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagc 18737458  T
Q  295 ac 296  Q
    ||    
T  18737459 ac 18737460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3424768 - 3424698
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacaccccttt 205  Q
    ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3424768 aaattaatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccttt 3424698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409693
Alignment:
Q  46 aattcactcatgcattagagaatt----gatggatgatttagagtaaaagaatgatggaga-attatgttgttaatgtaacataatttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||| || ||||||    
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatttt 3409693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3424327 - 3424253
Alignment:
Q  238 ccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtt 312  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3424327 ccctttgtcaaaggttatgatcatatcgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 3424253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 312
Target Start/End: Original strand, 18671048 - 18671094
Alignment:
Q  266 acttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtt 312  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18671048 acttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggtt 18671094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671191
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| || |  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatgtcatggttcatta 18671191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144410
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagt--aaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  119 aacataattttgtacaaaattaa-tgtccaa---atgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaat 214  Q
    |||| |||| | | |||||||   |||| ||   |||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144196 aacaaaattctatccaaaattgtgtgtcaaattaatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaat 144295  T
Q  215 taatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttc 314  Q
     |||| || ||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  144296 caatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaaggttcc 144395  T
Q  315 aatgtatatgaaaga 329  Q
    |||||||||||||||    
T  144396 aatgtatatgaaaga 144410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654649
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagt--aaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  119 aacataattttgtacaaaattaa-tgtccaa---atgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaat 214  Q
    |||| |||| | | |||||||   |||| ||   |||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13654435 aacaaaattctatccaaaattgtgtgtcaaattaatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaat 13654534  T
Q  215 taatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttc 314  Q
     |||| || ||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  13654535 caatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatcatacacacttgagtcaatgcaaaagttcattaagcacctatttgccaaaggttcc 13654634  T
Q  315 aatgtatatgaaaga 329  Q
    |||||||||||||||    
T  13654635 aatgtatatgaaaga 13654649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 330
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311154
Alignment:
Q  23 ttttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaaca 122  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  123 taattttgtacaa---------------------aattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacaccc 201  Q
     || | ||| |||                     |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19310926 aaactctgtccaaaattatgttgcttttgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgagagaaagcaccc 19311025  T
Q  202 ctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatt 301  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  19311026 ctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccctt 19311125  T
Q  302 taccaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19311126 tgccaaaggttccaatgtatatgaaagat 19311154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 330
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1188152
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  119 aacataatt----------------ttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccc 202  Q
    |||| ||||                ||||   ||||||||| ||||||| ||| || |||   |  || ||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  1187925 aacaaaattcttgttctgtgttttgttgtgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacacatgagagtaaacacccc 1188024  T
Q  203 tttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcattt 302  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||    
T  1188025 tttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggttcattaatcatcctttt 1188124  T
Q  303 accaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1188125 gccaaatgttccaatgtatatgaaagat 1188152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 291
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43359045
Alignment:
Q  23 ttttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaaca 122  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  123 taattttgtacaaaat----------------------taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacc 200  Q
     ||||  || ||||||                      ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||     
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatgagagaaagcact 43358954  T
Q  201 cctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  43358955 catttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 43359045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414555
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  121 cataatt-ttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttg 206  Q
    || ||||  ||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17414640 caaaattcatgt-ccaaattgatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaccacccatttg 17414555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186664
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  121 cataattttgtacaaaatta 140  Q
    || |||| ||| ||||||||    
T  10186683 caaaattctgtccaaaatta 10186664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051522
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttg-ttaatgta 119  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||   ||||  |||  | ||||||||    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagaaaatgagtaagaaa-atgagggttaatgta 16051304  T
Q  120 acataatt----------ttgta-caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgac 208  Q
    ||| ||||          ||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16051305 acaaaattcttgttcttgttgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgac 16051404  T
Q  209 ttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaa 308  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||    
T  16051405 ttgaatcaatgatatggttcattaagcactcatttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagtatccatttaccaaa 16051504  T
Q  309 ggtttcaatgtatatgaa 326  Q
     |||  ||||||||||||    
T  16051505 tgttataatgtatatgaa 16051522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10186639 - 10186478
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  10186639 aaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaag 10186540  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10186539 cacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcattaagcac 10186478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626278
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  35626272 caaaatt 35626278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523972
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  121 cataattttgtacaa---------------------aattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctc--atgagagaaaac 197  Q
    ||  ||| ||| |||                     |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttgttgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatatgagggaaaac 44524027  T
Q  198 acccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggt 252  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  44524026 acccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggt 44523972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465588
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  3465573 caaaattctgtccaaa 3465588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468182
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  3468167 caaaattctgtccaaa 3468182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574412
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  28574397 caaaattctgtccaaa 28574412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598424
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  28598409 caaaattctgtccaaa 28598424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21431736 - 21431562
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccc-tttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacat 237  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| ||     
T  21431736 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcaccccctttgacttaaatcaatgttatggttcattaagcac 21431637  T
Q  238 ccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtt 312  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21431636 ccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaaggtt 21431562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431770
Alignment:
Q  32 tttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataatt 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 21431770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10186030
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| || |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaacgctaaggttcattaagcacccatttgcta 10186006  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10186007 aaggtttcaatgtatatgaaagat 10186030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35653274 - 35653120
Alignment:
Q  172 atatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttga 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| || |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35653274 atatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcactcctttgtcaaaggttatgatcatatacacttga 35653175  T
Q  272 atcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    ||| || | || |||| |||||||| | ||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  35653174 atcgatcctaaagttcgttaagcaccccttttccaaaggctccaatatatatgaa 35653120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 28574447 - 28574599
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  28574447 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 28574546  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  28574547 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 28574599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 28598459 - 28598611
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  28598459 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 28598558  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  28598559 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 28598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 330
Target Start/End: Original strand, 35626398 - 35626519
Alignment:
Q  208 cttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaa 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||| ||||    
T  35626398 cttgaatcaatgctaaggttcattaaata-ccttttgtcaaaggttataatcatatacacttgaatcaaagcagaagttcattaagtacctatttgccaa 35626496  T
Q  308 aggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    || ||  ||||||||||||||||    
T  35626497 agattctaatgtatatgaaagat 35626519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 3468218 - 3468370
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  3468218 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 3468317  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  3468318 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 3468370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10186508 - 10186385
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||| || |  | |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| | ||| | |    
T  10186508 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaagttacaaccatataaacttcaatcaatgataaggctcattaagcacccctttgcta 10186409  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  10186408 aaagtttcaatgtatatgaaagat 10186385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Original strand, 35626329 - 35626423
Alignment:
Q  198 acccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||| |||| || ||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35626329 acccctttgacttgcatcaatgttatggttcatttaacacccttttgccaaaagttatgattatacactcttgaatcaatgctaaggttcattaa 35626423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21431608 - 21431523
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || || || |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21431608 acttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaaggttataattatatacacttgaatcaatgcaaaaattcattaa 21431523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701367
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||||| |||  || |||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacacttgaatcaatgctatggttcatta 3701367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattag 63  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattag 63  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3696510 - 3696404
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaag-aatgatggagaattatgttgttaatgta 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||| || |  || ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  3696510 tattttacaaatt-atggttccatcaattcattcattctgcagagaattgatggatgatttatagaatgagaaatggaagagaattgtgttgttaatgta 3696412  T
Q  120 acataatt 127  Q
    ||| ||||    
T  3696411 acaaaatt 3696404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 295
Target Start/End: Original strand, 1188218 - 1188272
Alignment:
Q  241 tttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagca 295  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  1188218 tttgccaaaggttatgataatatacacttgtatcaatgttaagattcattaagca 1188272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Original strand, 10185885 - 10185937
Alignment:
Q  244 gccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  10185885 gccaagggttatgatcatatatacttgaatcaatgatatggttcattaagcac 10185937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44524017 - 44523957
Alignment:
Q  266 acttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  44524017 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtttaaatgtatatgaa 44523957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608534
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  121 cataatt--------ttgta---caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgact 209  Q
    || ||||        ||||    | ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18608732 caaaattcttgtttcttgtgtgcccaaattaatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatgacc-ttcacatgagagaaaacacccctttaact 18608634  T
Q  210 tgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaag 309  Q
    ||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  18608633 tgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcatcaagcacccctttgccaaag 18608534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953058
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  121 cataattttgtacaaaatt------------aatgtcca----aatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctt 204  Q
    || |||| ||| |||||||              ||||||    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  25953263 caaaattctgtccaaaattgtgttgttattgtttgtccaaattaatgccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaacacccatt 25953164  T
Q  205 tgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc-aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcattta 303  Q
    |||||| ||| |||  || |||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  25953163 tgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatattaaggttcatcaagcactcaattg 25953064  T
Q  304 ccaaag 309  Q
    ||||||    
T  25953063 ccaaag 25953058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10340882
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  119 aacataattttgtacaaaat----------------------taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaa 196  Q
    |||| |||| ||| ||||||                      ||||| ||||||||||| ||||||  || ||| ||||||| |||| ||||||| |||     
T  10341063 aacaaaattctgtccaaaattgtatgtttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcacatgagaaaaag 10340964  T
Q  197 cacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 278  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10340963 cacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatg 10340882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108335
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  34108329 caaaatt 34108335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14315000
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  14315015 caaaattctgtccaaa 14315000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318704
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  14318719 caaaattctgtccaaa 14318704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981965
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26981980 caaaattctgtccaaa 26981965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26987078
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26987093 caaaattctgtccaaa 26987078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43956904 - 43956713
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||| || |    
T  43956904 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 43956805  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
      |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  43956804 tttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgtaaatgttcattaagcacctatttgccaaagattccaatgtatatgaaagat 43956713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494274
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  18494280 caaaatt 18494274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956938
Alignment:
Q  23 ttttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaaca 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  123 taattttgtacaaa 136  Q
     |||| ||| ||||    
T  43956951 aaattatgtccaaa 43956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 326
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1782152
Alignment:
Q  51 actcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataattt-tgt----------acaaaatt 139  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||           | |||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaacggaatttctgttgttgtgtcctccaaatt 1781968  T
Q  140 aatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatcc 239  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||| |||| ||| |||||||||||| ||   |||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |    
T  1781969 aatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacgc 1782068  T
Q  240 ctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
     ||| | ||| |   | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  1782069 attttctaaatg---ttatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactgatttgccaaaggttccaatacatatgaa 1782152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  22 attttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaa 93  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14314965 - 14314813
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  14314965 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14314866  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  14314865 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 14314813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14318669 - 14318517
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  14318669 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14318570  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  14318569 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 14318517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26981929 - 26981777
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  26981929 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26981830  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | | |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26981829 cttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26981777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26987043 - 26986891
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  26987043 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26986944  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26986943 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26986891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 34108381 - 34108533
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  34108381 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 34108480  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  34108481 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 34108533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25953066 - 25953011
Alignment:
Q  242 ttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcact 297  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25953066 ttgccaaagctcatgataatatacacttgaatcaatgcaagggttcattaagcact 25953011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18494230 - 18494079
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  18494230 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacct-tttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 18494132  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  18494131 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 18494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Original strand, 18616168 - 18616204
Alignment:
Q  185 catgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18616168 catgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgct 18616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780514
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgtagt-aatgtaa 42780282  T
Q  121 cataattttgtacaaaatt----------------------aatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaaca 198  Q
    || |||| ||| |||||||                      |||| |||| || ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaaca 42780382  T
Q  199 cccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactc 298  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||      
T  42780383 cccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaagcacct 42780482  T
Q  299 atttaccaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    |||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  42780483 atttgctaaaagttccaatgtatatgaaagat 42780514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 312
Target Start/End: Original strand, 716404 - 716577
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |    
T  716404 taatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaacacc 716503  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtt 312  Q
      |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  716504 tttttgccaaaggttatgatcatacactcttgaatcaatgctaagcttcattaagcacccctttaccaaaggtt 716577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917480
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  14917486 caaaatt 14917480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720615
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  17720630 caaaattctgtccaaa 17720615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283530
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaa 30283530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120501
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  45120486 caaaattctgtccaaa 45120501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716361
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaa 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaa 716361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 330
Target Start/End: Original strand, 716532 - 716654
Alignment:
Q  208 cttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaa 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |    
T  716532 cttgaatcaatgctaagcttcattaagcacccctttaccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggtttattaaacacctatttaccta 716631  T
Q  308 aggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  716632 aggttccaatgtatatgaaagat 716654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30283504 - 30283365
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||| || |    
T  30283504 taatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgaaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaagcacc 30283405  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 278  Q
    | |||||||||| | || | |||||| |||||||||||||    
T  30283404 cttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatg 30283365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284544
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatga-tttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgta 119  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  120 acataatt 127  Q
    ||| ||||    
T  16284537 acaaaatt 16284544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14917436 - 14917284
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  14917436 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14917337  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  14917336 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 14917284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17720580 - 17720428
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  17720580 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 17720481  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||  | |||||||||    
T  17720480 cttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttcatta 17720428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 45120537 - 45120689
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  45120537 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 45120636  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  45120637 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 45120689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20892403 - 20892235
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||| | ||||| |||||| |||| |  |||||||||| || |    
T  20892403 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatgttt-ggttcattaagcacc 20892305  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaa 308  Q
      |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| || |||||    
T  20892304 tttttggcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcattaatcactcacttgccaaa 20892235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20892277 - 20892197
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttc 287  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20892277 acttgaatcaatgttatggttcattaatcactcacttgccaaatgtcatgatcatatacacttgaatcaatacaaatgttc 20892197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 16286004 - 16286068
Alignment:
Q  172 atatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaaca 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| || | ||  ||||||||||||    
T  16286004 atatgacccttcacatgagagaaaacacccatttaacttcaatcaacgttatagttcattaaaca 16286068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173680
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  121 cataatt-----------------ttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccct 203  Q
    || ||||                 || |   |||||||||  |||||  |||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  173458 caaaattcttttttctgtattttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccat 173557  T
Q  204 ttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcattta 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||     
T  173558 ttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttg 173657  T
Q  304 ccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  173658 ccaaaggttccaatgtatatgaa 173680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023276
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  121 cataattttgtacaaaat----------------------taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaaca 198  Q
    || |||| ||| ||||||                      ||||| ||| ||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca 2023163  T
Q  199 cccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactc 298  Q
     ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |    
T  2023164 -ccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccc 2023262  T
Q  299 atttaccaaaggtt 312  Q
     ||| |||||||||    
T  2023263 ttttgccaaaggtt 2023276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13556358 - 13556167
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| || |    
T  13556358 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 13556259  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
      |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13556258 tttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgcaaatgttcattaagcacctatttgccaaaggttccaatgtatatgaaagat 13556167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540650
Alignment:
Q  56 tgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataattt-------tgta----caaaattaatgt 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       |||     | |||||||||     
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatttctattcatgttatgtccaaattaatgc 43540829  T
Q  145 ccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttg 244  Q
    ||| |||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||| | |||| || |||||||||| || || ||||    
T  43540828 ccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaa--cactcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaagca-ccttttg 43540732  T
Q  245 ccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43540731 tcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgccaaaggttccaatgtatatgaa 43540650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555835
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  121 cataattttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctt 204  Q
    || |||| ||| | ||||  ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  4555753 caaaattgtgt-ccaaatcgatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactattaacatgagagaaaacacccctt 4555835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556408
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  121 ca 122  Q
    ||    
T  13556409 ca 13556408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877628
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  9877643 caaaattctgtccaaa 9877628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35368828 - 35368705
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35368828 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacctctttgtcaaaggttataatcatatacacttaaatcaatgctaaggttcattaagcactcatttgcca 35368729  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  35368728 aaggttccaatgtatatgaaagat 35368705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39903960
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  39903945 caaaattctgtccaaa 39903960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909073
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  39909058 caaaattctgtccaaa 39909073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872513
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  9872528 caaaattctgtccaaa 9872513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368989
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||| ||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  35368995 caaaatt 35368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35368959 - 35368798
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  35368959 aaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaa 35368860  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    || |  |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35368859 cacctttttatcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcac 35368798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9872478 - 9872326
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  9872478 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 9872379  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  9872378 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 9872326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9877593 - 9877441
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  9877593 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 9877494  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  9877493 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 9877441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 39909108 - 39909260
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  39909108 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 39909207  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  39909208 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 39909260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 25184116 - 25184186
Alignment:
Q  45 caattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaa 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  25184116 caattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaaatatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 278
Target Start/End: Original strand, 43379660 - 43379731
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 278  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  43379660 acttgaatcaatgctacggttcattaaacatcactttaccaaaagttatgatcatatacgcttaaatcaatg 43379731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378491
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatgga 75  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 39904003 - 39904147
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| ||    ||||||    
T  39904003 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgcc 39904102  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  39904103 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 39904147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 292
Target Start/End: Original strand, 43379554 - 43379686
Alignment:
Q  155 aacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtca 254  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||     ||||||| | ||| |||||||| |||| || | |||| ||| ||  | ||| |||||| | |    
T  43379554 aacatttatagtgcattatatgacccttcacat-----aaaacactcattttacttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagttta 43379648  T
Q  255 tgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43379649 tgatcatatacacttgaatcaatgctacggttcattaa 43379686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43402191 - 43402001
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||  |||| |||||||| |  ||||| | |||| |||| || ||||||||||     
T  43402191 aaattaatgcctcaatgacaaacatttatagtgcattatatgatccttcatatgaaagaaaacatcaatttgattcgaatcaatgttatggttcattaag 43402092  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacact--tgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatat 323  Q
     |||  |||| |||| || || ||||||||| ||  ||||||||||  || ||||||||| |||||||||  |||| ||| |||| |||||    
T  43402091 tatcaatttgtcaaaagttataatcatatacgctgttgaatcaatgttaacgttcattaaacactcatttgtcaaatgttccaatatatat 43402001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023314
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||||| |||| || | |||||||| || || |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatgtcatggttcatta 2023314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024168
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  119 aacataattttgta-caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacaccccttt 205  Q
    |||| ||||  ||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18024254 aacaaaatta-gtatccaaattgatgaccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacctcttt 18024168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891244
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  121 cataatt-ttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttg 206  Q
    || | ||  ||| | ||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20891159 caaagttcgtgttc-aaattgatacccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttg 20891244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784775
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  119 aacataattttgtacaaaat----------------------taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaa 196  Q
    |||| |||| ||| ||||||                      ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaa 49784693  T
Q  197 cacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 278  Q
    ||| | |||||||||||| |||| || | |||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  49784694 cactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttatgatcatatacacttgaatcaatg 49784775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302334
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||||||| ||||    
T  1302349 caaaattttgtccaaa 1302334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6858144
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  6858159 caaaattctgtccaaa 6858144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458426
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  8458411 caaaattctgtccaaa 8458426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8464865
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  8464850 caaaattctgtccaaa 8464865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081596
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  31081611 caaaattctgtccaaa 31081596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5458110
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  5458116 caaaatt 5458110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481586
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  5481592 caaaatt 5481586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 296
Target Start/End: Original strand, 29827448 - 29827710
Alignment:
Q  45 caattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataatt-ttgtaca--------- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||  |             
T  29827448 caattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaacaaaattcttgtttatgttttttg 29827547  T
Q  135 --aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcatta 232  Q
      ||| ||||| ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  29827548 tcaaactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatgact-ttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcatta 29827646  T
Q  233 aacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcac 296  Q
    | || |  |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29827647 agcaccattttgccaaagattatgaccatacacacttgaatcaatgctaaggttcattaagcac 29827710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4049922
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  4049907 caaaattctgtccaaa 4049922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6853041
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  6853056 caaaattctgtccaaa 6853041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591384
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  10591399 caaaattctgtccaaa 10591384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10673027
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  10673042 caaaattctgtccaaa 10673027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10678142
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  10678157 caaaattctgtccaaa 10678142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076491
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  31076506 caaaattctgtccaaa 31076491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702689
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  33702704 caaaattctgtccaaa 33702689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703414
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  33703399 caaaattatgtccaaa 33703414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055047
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  121 cataatt 127  Q
    || ||||    
T  4055041 caaaatt 4055047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187552
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  119 aacataatt 127  Q
     ||| ||||    
T  3187560 cacaaaatt 3187552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584947
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  10584962 caaaattctgtccaaa 10584947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Original strand, 29827680 - 29827803
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaagcactcatttacca 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |  |||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||    
T  29827680 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcaccaatttgtcaaatgttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcattaaacacctgtttgcca 29827779  T
Q  307 aaggtttcaatgtatatgaaagat 330  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  29827780 aaggttccaatctatatgaaagat 29827803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 4049958 - 4050110
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  4049958 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 4050057  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  4050058 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 4050110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1302298 - 1302146
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  1302298 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 1302199  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  1302198 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 1302146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 4055092 - 4055244
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  4055092 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 4055191  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  4055192 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 4055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 8458470 - 8458614
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || || ||||||    
T  8458470 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgcc 8458569  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  8458570 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttcatta 8458614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10584912 - 10584760
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  10584912 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10584813  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| | |||||||||||  | |||||||||    
T  10584812 cttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttcatta 10584760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10672992 - 10672840
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  10672992 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10672893  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10672892 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 10672840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6853006 - 6852854
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | ||||| || || |    
T  6853006 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacc 6852907  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  6852906 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 6852854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6858109 - 6857957
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | ||||| || || |    
T  6858109 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacc 6858010  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  6858009 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 6857957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10591349 - 10591197
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  10591349 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10591250  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10591249 cttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 10591197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31076456 - 31076304
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  31076456 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 31076357  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  31076356 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 31076304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31081561 - 31081409
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  31081561 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 31081462  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  31081461 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 31081409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33702653 - 33702501
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  33702653 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 33702554  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | | |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  33702553 cttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 33702501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5481542 - 5481390
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  5481542 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 5481443  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  5481442 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 5481390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5458065 - 5457913
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  5458065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 5457966  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  5457965 cttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 5457913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 8464900 - 8465052
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  8464900 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 8464999  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
      |||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||  | |||||||||    
T  8465000 attttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttcatta 8465052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10678107 - 10677953
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatg--acccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaaca 236  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||| ||    
T  10678107 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcacatgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagca 10678008  T
Q  237 tccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
     || |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10678007 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 10677953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891340
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatataca 266  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatataca 20891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891413
Alignment:
Q  207 acttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatataca 266  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatggtcatataca 20891413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851789
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||||||| ||||    
T  12851774 caaaattttgtccaaa 12851789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610479
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  14610464 caaaattctgtccaaa 14610479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4181574 - 4181347
Alignment:
Q  32 tttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataat----- 126  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||         
T  4181574 tttatggttcgagcaat-cactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctcg 4181476  T
Q  127 ------tttgtacaaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgc 220  Q
          | |||   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  4181475 tttatgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgt 4181376  T
Q  221 taaggttcattaaacatccctttgccaaa 249  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4181375 taaggttcattaagcacccctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12856904
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  12856889 caaaattctgtccaaa 12856904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051136
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26051121 caaaattctgtccaaa 26051136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056249
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26056234 caaaattctgtccaaa 26056249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060495
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26060480 caaaattctgtccaaa 26060495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065608
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  121 cataattttgtacaaa 136  Q
    || |||| ||| ||||    
T  26065593 caaaattctgtccaaa 26065608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459804
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgt 118  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  119 aacataat-------tttgta---caaaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgac 208  Q
    ||||||||       ||||||   | | ||||||| ||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||     
T  37459947 aacataattcctatatttgtatgtccatattaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacacgcatttgat 37459848  T
Q  209 ttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggt 252  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  37459847 ttgaattgatgttatggttcattaaacactcatttgccaaaggt 37459804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaat 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5440358 - 5440217
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  5440358 aaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaat 5440259  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaa 276  Q
    || |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  5440258 cacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5449368 - 5449227
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaa 234  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  5449368 aaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaat 5449269  T
Q  235 catccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaa 276  Q
    || |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  5449268 cacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440393
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449403
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 12856939 - 12857091
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  12856939 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 12857038  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  12857039 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 12857091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352422
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaat 94  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggtttatagtaagagaat 35352422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Original strand, 14610511 - 14610631
Alignment:
Q  171 aatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttg 270  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||| || || |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  14610511 aatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttg 14610610  T
Q  271 aatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    ||||||||  | |||||||||    
T  14610611 aatcaatgtcatggttcatta 14610631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 26051179 - 26051323
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || || ||||||    
T  26051179 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 26051278  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26051279 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26051323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 26056292 - 26056436
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || || ||||||    
T  26056292 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 26056391  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26056392 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26056436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 26060538 - 26060682
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || || ||||||    
T  26060538 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 26060637  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26060638 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26060682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 26065651 - 26065795
Alignment:
Q  147 aaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatccctttgcc 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || || ||||||    
T  26065651 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 26065750  T
Q  247 aaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  26065751 aaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 26065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Original strand, 12851826 - 12851978
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||  | | |||||||| || |    
T  12851826 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 12851925  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  12851926 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 12851978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37459832 - 37459789
Alignment:
Q  283 ggttcattaagcactcatttaccaaaggtttcaatgtatatgaa 326  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37459832 ggttcattaaacactcatttgccaaaggttacaatgtatatgaa 37459789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  19 aatattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattag 63  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35352379 - 35352235
Alignment:
Q  135 aaattaatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctca-tgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaa 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| ||  || ||| ||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||||| | || | |  ||||||||||    
T  35352379 aaattaatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttcaaaatgagagaaaatgtctctttgacttgattcaacgatttggttcattaa 35352280  T
Q  234 acatccctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 278  Q
     || || |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35352279 gcacccatttatcaaaggttatgattatatacacttgaatcaatg 35352235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 2124
Alignment:
Q  21 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2073 - 1921
Alignment:
Q  139 taatgtccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaattaatgctaaggttcattaaacatc 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| || |    
T  2073 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 1974  T
Q  239 cctttgccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 291  Q
    | |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  1973 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University