View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20341_low_24 (Length: 245)

Name: NF20341_low_24
Description: NF20341
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20341_low_24
NF20341_low_24
[»] chr7 (106 HSPs)
chr7 (35-233)||(27871042-27871240)
chr7 (39-233)||(32265354-32265548)
chr7 (55-233)||(33421096-33421273)
chr7 (55-226)||(1292435-1292606)
chr7 (43-233)||(19339883-19340073)
chr7 (35-233)||(48063446-48063644)
chr7 (18-233)||(12174974-12175184)
chr7 (67-233)||(24795349-24795515)
chr7 (35-226)||(14424839-14425032)
chr7 (35-233)||(48806514-48806713)
chr7 (35-233)||(330977-331174)
chr7 (55-233)||(15705122-15705299)
chr7 (58-231)||(2266151-2266323)
chr7 (55-231)||(35954542-35954718)
chr7 (55-229)||(9710442-9710617)
chr7 (43-233)||(21382063-21382253)
chr7 (78-233)||(13138531-13138686)
chr7 (78-233)||(23280587-23280742)
chr7 (74-233)||(30945993-30946152)
chr7 (74-233)||(48237475-48237634)
chr7 (55-233)||(15087895-15088072)
chr7 (55-233)||(15574215-15574392)
chr7 (55-196)||(8182304-8182447)
chr7 (55-233)||(44466438-44466618)
chr7 (55-233)||(16557224-16557402)
chr7 (55-233)||(16608260-16608438)
chr7 (78-233)||(33692335-33692490)
chr7 (55-231)||(28622995-28623173)
chr7 (78-233)||(4820854-4821007)
chr7 (58-230)||(14187036-14187210)
chr7 (37-233)||(13731308-13731506)
chr7 (58-233)||(2914244-2914421)
chr7 (58-233)||(11318752-11318929)
chr7 (58-233)||(13879517-13879694)
chr7 (54-233)||(16310540-16310721)
chr7 (35-230)||(19711650-19711844)
chr7 (78-233)||(9069127-9069281)
chr7 (58-233)||(21284007-21284184)
chr7 (58-233)||(19328647-19328821)
chr7 (78-226)||(22579825-22579972)
chr7 (55-233)||(16545971-16546149)
chr7 (55-233)||(16619513-16619691)
chr7 (55-233)||(4493919-4494100)
chr7 (58-233)||(13034470-13034648)
chr7 (55-233)||(11792254-11792434)
chr7 (78-233)||(15467285-15467440)
chr7 (78-233)||(12367370-12367527)
chr7 (78-213)||(13259055-13259192)
chr7 (78-213)||(13266395-13266532)
chr7 (55-227)||(5001465-5001639)
chr7 (58-233)||(10883805-10883981)
chr7 (58-233)||(13302208-13302384)
chr7 (55-233)||(16317188-16317367)
chr7 (78-233)||(13261248-13261405)
chr7 (35-183)||(24787685-24787836)
chr7 (78-233)||(19237668-19237825)
chr7 (63-233)||(4433168-4433343)
chr7 (91-233)||(14425928-14426071)
chr7 (35-233)||(29935977-29936178)
chr7 (58-233)||(33604254-33604430)
chr7 (78-233)||(16315173-16315328)
chr7 (114-233)||(21691763-21691885)
chr7 (55-226)||(39285143-39285316)
chr7 (78-226)||(30025302-30025452)
chr7 (63-233)||(4412595-4412771)
chr7 (78-233)||(41843057-41843214)
chr7 (55-137)||(602110-602191)
chr7 (76-171)||(2499428-2499526)
chr7 (79-233)||(13027534-13027688)
chr7 (35-227)||(13645777-13645968)
chr7 (74-233)||(7488537-7488697)
chr7 (105-167)||(16155463-16155525)
chr7 (118-233)||(13683004-13683121)
chr7 (55-146)||(21211267-21211357)
chr7 (163-233)||(16112519-16112588)
chr7 (55-233)||(9099672-9099849)
chr7 (63-147)||(3165285-3165367)
chr7 (55-179)||(9098916-9099043)
chr7 (78-146)||(16308432-16308499)
chr7 (78-146)||(16411376-16411443)
chr7 (39-146)||(17064199-17064305)
chr7 (65-137)||(24883073-24883143)
chr7 (64-147)||(588764-588845)
chr7 (39-137)||(3477019-3477116)
chr7 (186-233)||(8999491-8999537)
chr7 (146-233)||(13473130-13473217)
chr7 (63-146)||(16105652-16105733)
chr7 (85-147)||(9159302-9159363)
chr7 (85-147)||(9169757-9169818)
chr7 (67-137)||(13175294-13175362)
chr7 (85-147)||(21770610-21770671)
chr7 (85-147)||(25212518-25212579)
chr7 (78-179)||(26042774-26042877)
chr7 (85-147)||(38594350-38594411)
chr7 (85-147)||(40055421-40055482)
chr7 (200-233)||(2499529-2499562)
chr7 (65-137)||(8933115-8933185)
chr7 (65-137)||(8999624-8999694)
chr7 (197-233)||(9802668-9802704)
chr7 (65-137)||(12734843-12734913)
chr7 (78-146)||(18362253-18362320)
chr7 (65-137)||(18440746-18440816)
chr7 (63-147)||(20490557-20490639)
chr7 (65-137)||(26210227-26210297)
chr7 (65-137)||(29589539-29589609)
chr7 (65-137)||(38403891-38403961)
[»] chr3 (115 HSPs)
chr3 (35-233)||(40850305-40850503)
chr3 (63-233)||(2782835-2783005)
chr3 (35-233)||(2025419-2025614)
chr3 (55-233)||(21640215-21640393)
chr3 (35-233)||(30054813-30055006)
chr3 (65-233)||(9700670-9700838)
chr3 (18-229)||(50299548-50299756)
chr3 (35-226)||(46797036-46797226)
chr3 (37-233)||(49669122-49669315)
chr3 (35-226)||(22463672-22463863)
chr3 (35-226)||(22465130-22465321)
chr3 (55-233)||(33582580-33582758)
chr3 (78-233)||(28581477-28581632)
chr3 (55-233)||(14954778-14954956)
chr3 (35-233)||(1728648-1728847)
chr3 (55-233)||(5212927-5213105)
chr3 (71-230)||(29854770-29854928)
chr3 (55-233)||(40799245-40799424)
chr3 (55-233)||(21638906-21639083)
chr3 (63-233)||(1241719-1241884)
chr3 (71-233)||(47207069-47207231)
chr3 (112-233)||(2784470-2784591)
chr3 (35-233)||(38178276-38178475)
chr3 (55-233)||(47406055-47406233)
chr3 (74-233)||(20628065-20628224)
chr3 (55-233)||(11222910-11223090)
chr3 (78-233)||(3238063-3238219)
chr3 (35-233)||(13781217-13781417)
chr3 (35-233)||(25398888-25399085)
chr3 (63-226)||(53057369-53057532)
chr3 (78-233)||(17667777-17667931)
chr3 (78-233)||(31302720-31302874)
chr3 (55-226)||(52283137-52283311)
chr3 (78-233)||(12726866-12727023)
chr3 (35-233)||(13823397-13823592)
chr3 (78-233)||(46350478-46350634)
chr3 (78-233)||(14968735-14968889)
chr3 (55-233)||(17239554-17239733)
chr3 (78-233)||(49554132-49554284)
chr3 (55-233)||(18122245-18122423)
chr3 (78-229)||(6090098-6090252)
chr3 (74-233)||(11222182-11222342)
chr3 (35-233)||(12963716-12963916)
chr3 (35-233)||(20645482-20645681)
chr3 (35-233)||(49643393-49643593)
chr3 (78-233)||(41494370-41494526)
chr3 (63-233)||(37411992-37412167)
chr3 (38-222)||(13939227-13939412)
chr3 (55-234)||(20724436-20724618)
chr3 (41-233)||(2560520-2560714)
chr3 (78-233)||(22128449-22128602)
chr3 (63-233)||(45862187-45862362)
chr3 (36-222)||(29952078-29952266)
chr3 (36-222)||(30001232-30001420)
chr3 (78-213)||(11189384-11189518)
chr3 (78-233)||(23538793-23538951)
chr3 (78-233)||(26418306-26418464)
chr3 (79-233)||(8874750-8874907)
chr3 (78-233)||(12753250-12753411)
chr3 (146-233)||(14393635-14393722)
chr3 (78-233)||(14063619-14063777)
chr3 (58-233)||(15902547-15902723)
chr3 (91-233)||(22804654-22804797)
chr3 (55-230)||(19249985-19250162)
chr3 (78-233)||(16031967-16032124)
chr3 (78-195)||(52919836-52919956)
chr3 (63-233)||(13953620-13953794)
chr3 (55-233)||(6252769-6252949)
chr3 (55-233)||(12967656-12967837)
chr3 (55-233)||(19889545-19889723)
chr3 (66-233)||(51340340-51340512)
chr3 (63-116)||(2783225-2783278)
chr3 (78-146)||(22770577-22770644)
chr3 (63-233)||(15832765-15832939)
chr3 (82-146)||(11078131-11078194)
chr3 (78-233)||(11909669-11909830)
chr3 (78-146)||(13410758-13410825)
chr3 (114-233)||(16659223-16659346)
chr3 (63-146)||(9007098-9007179)
chr3 (63-146)||(27882947-27883028)
chr3 (82-233)||(12396444-12396596)
chr3 (78-210)||(15848513-15848650)
chr3 (65-134)||(17960968-17961036)
chr3 (41-137)||(21735707-21735802)
chr3 (55-146)||(6174684-6174774)
chr3 (39-146)||(8996546-8996652)
chr3 (65-137)||(13199847-13199917)
chr3 (78-146)||(21316925-21316992)
chr3 (65-137)||(29947945-29948016)
chr3 (65-137)||(29997099-29997170)
chr3 (65-137)||(31114592-31114662)
chr3 (64-147)||(4403840-4403921)
chr3 (64-147)||(11206661-11206742)
chr3 (64-147)||(11217312-11217393)
chr3 (35-137)||(17282033-17282134)
chr3 (64-147)||(19121428-19121509)
chr3 (64-147)||(24707143-24707224)
chr3 (64-147)||(48336808-48336889)
chr3 (85-147)||(4433347-4433408)
chr3 (63-137)||(13147650-13147722)
chr3 (85-147)||(19887941-19888002)
chr3 (191-233)||(24776164-24776205)
chr3 (85-147)||(28168697-28168758)
chr3 (86-147)||(11163418-11163478)
chr3 (200-233)||(14077919-14077952)
chr3 (86-147)||(14258652-14258712)
chr3 (200-233)||(22770460-22770493)
chr3 (86-147)||(29461800-29461860)
chr3 (64-137)||(29906780-29906851)
chr3 (41-137)||(51989751-51989846)
chr3 (63-147)||(933192-933274)
chr3 (65-137)||(1053274-1053344)
chr3 (65-137)||(16076494-16076564)
chr3 (78-134)||(16305781-16305836)
chr3 (55-107)||(19885814-19885866)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (35-233)||(13431251-13431449)
chr8 (35-233)||(14990723-14990920)
chr8 (55-233)||(22673141-22673318)
chr8 (35-233)||(14990112-14990305)
chr8 (55-231)||(18152310-18152485)
chr8 (55-233)||(43639124-43639301)
chr8 (55-233)||(22662428-22662606)
chr8 (55-233)||(40846018-40846198)
chr8 (35-195)||(6407079-6407239)
chr8 (41-233)||(33560846-33561038)
chr8 (55-233)||(17442450-17442627)
chr8 (35-233)||(45292166-45292354)
chr8 (63-233)||(15336718-15336891)
chr8 (63-233)||(15425783-15425956)
chr8 (63-233)||(15517087-15517260)
chr8 (64-233)||(43773470-43773639)
chr8 (79-233)||(39692901-39693054)
chr8 (58-233)||(19942580-19942757)
chr8 (78-233)||(29692676-29692833)
chr8 (55-233)||(45539068-45539246)
chr8 (55-233)||(17796763-17796941)
chr8 (55-233)||(21932224-21932402)
chr8 (55-179)||(30422086-30422211)
chr8 (55-226)||(16206612-16206781)
chr8 (78-233)||(23264257-23264410)
chr8 (78-230)||(25163435-25163589)
chr8 (55-233)||(9319909-9320090)
chr8 (55-233)||(12758367-12758546)
chr8 (55-233)||(18121738-18121918)
chr8 (55-233)||(15934290-15934471)
chr8 (58-233)||(17526366-17526543)
chr8 (78-233)||(16681883-16682040)
chr8 (55-166)||(1744528-1744639)
chr8 (38-233)||(18679140-18679335)
chr8 (38-233)||(18718329-18718524)
chr8 (55-145)||(36104681-36104771)
chr8 (35-233)||(20256141-20256342)
chr8 (41-233)||(19956966-19957161)
chr8 (35-233)||(18321787-18321984)
chr8 (114-227)||(19153432-19153547)
chr8 (58-233)||(26832420-26832597)
chr8 (78-233)||(21287766-21287927)
chr8 (78-233)||(21298346-21298507)
chr8 (78-233)||(45568544-45568705)
chr8 (78-233)||(18772056-18772214)
chr8 (78-197)||(19706880-19707002)
chr8 (55-137)||(20383066-20383147)
chr8 (63-142)||(21540312-21540390)
chr8 (78-231)||(43644261-43644416)
chr8 (78-146)||(24679107-24679174)
chr8 (130-222)||(2810285-2810379)
chr8 (195-233)||(1744635-1744673)
chr8 (160-233)||(24645779-24645851)
chr8 (65-137)||(15969525-15969595)
chr8 (110-146)||(17928483-17928519)
chr8 (78-146)||(25850708-25850775)
chr8 (56-176)||(16376022-16376141)
chr8 (64-147)||(18153315-18153396)
chr8 (158-233)||(22707777-22707852)
chr8 (64-147)||(23270560-23270641)
chr8 (64-147)||(40213790-40213871)
chr8 (85-147)||(19224532-19224593)
chr8 (67-137)||(29378961-29379029)
chr8 (85-142)||(28902839-28902895)
chr8 (65-137)||(3843100-3843170)
chr8 (65-137)||(17519787-17519857)
chr8 (63-143)||(19506063-19506141)
chr8 (63-147)||(20161852-20161934)
chr8 (65-137)||(22136494-22136564)
chr8 (65-137)||(22167659-22167729)
chr8 (110-150)||(39692862-39692902)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (18-233)||(22801782-22801993)
chr2 (35-233)||(16494671-16494869)
chr2 (55-233)||(40331131-40331309)
chr2 (35-233)||(44839757-44839955)
chr2 (35-233)||(40331438-40331631)
chr2 (58-231)||(45087562-45087735)
chr2 (30-233)||(34322511-34322709)
chr2 (56-233)||(28551497-28551674)
chr2 (55-233)||(22782193-22782371)
chr2 (55-233)||(22786233-22786411)
chr2 (74-233)||(28701791-28701949)
chr2 (35-233)||(1587610-1587810)
chr2 (74-233)||(28712277-28712435)
chr2 (46-233)||(22188681-22188868)
chr2 (55-233)||(30557898-30558080)
chr2 (55-233)||(6574675-6574854)
chr2 (55-233)||(20152578-20152759)
chr2 (78-233)||(13964556-13964707)
chr2 (55-233)||(31801465-31801645)
chr2 (58-233)||(24376453-24376631)
chr2 (58-233)||(22316939-22317114)
chr2 (58-233)||(20569327-20569504)
chr2 (104-233)||(33073621-33073749)
chr2 (78-233)||(22257568-22257724)
chr2 (77-233)||(35744555-35744710)
chr2 (78-233)||(23234376-23234530)
chr2 (55-233)||(38780741-38780918)
chr2 (58-233)||(19539763-19539940)
chr2 (35-233)||(26366984-26367182)
chr2 (35-233)||(24575358-24575558)
chr2 (55-233)||(24851239-24851419)
chr2 (79-233)||(25188766-25188923)
chr2 (78-233)||(25037838-25037995)
chr2 (63-233)||(31328540-31328712)
chr2 (63-233)||(31335261-31335433)
chr2 (35-233)||(39038217-39038414)
chr2 (78-233)||(22455534-22455693)
chr2 (78-222)||(18702107-18702254)
chr2 (55-195)||(6392006-6392150)
chr2 (78-233)||(28141178-28141335)
chr2 (35-233)||(10010328-10010524)
chr2 (58-233)||(40781823-40781999)
chr2 (78-233)||(22271497-22271656)
chr2 (58-233)||(25828509-25828684)
chr2 (91-233)||(23184878-23185022)
chr2 (91-233)||(23596141-23596285)
chr2 (55-233)||(41122262-41122441)
chr2 (71-233)||(14580932-14581080)
chr2 (66-233)||(1083368-1083540)
chr2 (55-233)||(18431514-18431694)
chr2 (67-133)||(31968460-31968526)
chr2 (55-229)||(24838449-24838624)
chr2 (114-233)||(24778774-24778896)
chr2 (114-222)||(27296842-27296954)
chr2 (38-146)||(21537852-21537959)
chr2 (78-179)||(26623083-26623187)
chr2 (66-233)||(23393242-23393412)
chr2 (114-233)||(17963844-17963965)
chr2 (110-146)||(15671240-15671276)
chr2 (65-137)||(20647232-20647302)
chr2 (78-137)||(24802224-24802282)
chr2 (64-147)||(28721922-28722003)
chr2 (64-147)||(30794350-30794431)
chr2 (63-137)||(2561028-2561100)
chr2 (85-147)||(28732508-28732569)
chr2 (78-210)||(24815112-24815249)
chr2 (85-146)||(27978989-27979049)
chr2 (110-164)||(44880673-44880731)
chr2 (65-137)||(17970886-17970956)
chr2 (65-137)||(19303044-19303114)
chr2 (65-137)||(19313610-19313680)
chr2 (65-137)||(19355857-19355927)
chr2 (65-137)||(19498583-19498653)
chr2 (114-146)||(21845564-21845596)
chr2 (78-146)||(22382852-22382919)
chr2 (85-137)||(22754873-22754924)
chr2 (63-147)||(22915470-22915552)
chr2 (86-146)||(28065518-28065577)
chr2 (65-137)||(36785417-36785487)
chr2 (63-147)||(40221872-40221954)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (57-233)||(17399264-17399440)
chr4 (35-233)||(3106008-3106202)
chr4 (35-236)||(40859994-40860195)
chr4 (35-233)||(22190169-22190367)
chr4 (55-233)||(16939344-16939521)
chr4 (55-233)||(56533651-56533829)
chr4 (55-233)||(6516831-6517008)
chr4 (41-233)||(9752129-9752321)
chr4 (65-233)||(27189233-27189401)
chr4 (35-233)||(3500242-3500439)
chr4 (35-233)||(17701345-17701543)
chr4 (55-233)||(55731191-55731368)
chr4 (55-226)||(19884076-19884247)
chr4 (35-233)||(14154584-14154779)
chr4 (55-233)||(13576705-13576884)
chr4 (46-233)||(20976793-20976979)
chr4 (56-233)||(45832731-45832907)
chr4 (78-233)||(16631806-16631963)
chr4 (63-233)||(16852854-16853026)
chr4 (55-233)||(38513251-38513429)
chr4 (55-233)||(56033916-56034094)
chr4 (63-233)||(16847898-16848070)
chr4 (78-231)||(22676114-22676267)
chr4 (55-230)||(54679271-54679446)
chr4 (37-233)||(55379637-55379834)
chr4 (55-233)||(29120708-29120887)
chr4 (58-233)||(19665711-19665888)
chr4 (55-233)||(37436128-37436301)
chr4 (55-233)||(8103627-8103808)
chr4 (35-179)||(39420348-39420492)
chr4 (78-233)||(10072300-10072455)
chr4 (58-233)||(14605493-14605670)
chr4 (55-233)||(11900534-11900714)
chr4 (55-233)||(6641028-6641206)
chr4 (81-218)||(19610939-19611075)
chr4 (78-233)||(11915067-11915225)
chr4 (78-226)||(3395016-3395165)
chr4 (132-233)||(25651684-25651784)
chr4 (72-233)||(15014973-15015136)
chr4 (117-233)||(15475733-15475849)
chr4 (65-146)||(14190088-14190169)
chr4 (78-227)||(17788633-17788785)
chr4 (78-233)||(19912468-19912624)
chr4 (101-226)||(14904892-14905017)
chr4 (35-233)||(23749849-23750047)
chr4 (58-233)||(41115344-41115522)
chr4 (78-233)||(12600126-12600280)
chr4 (78-165)||(36470335-36470425)
chr4 (78-164)||(23120903-23120989)
chr4 (55-233)||(8686029-8686211)
chr4 (78-233)||(16475966-16476123)
chr4 (78-233)||(37986200-37986357)
chr4 (78-233)||(15135095-15135253)
chr4 (63-146)||(13693199-13693280)
chr4 (78-178)||(29681159-29681261)
chr4 (58-144)||(22089632-22089717)
chr4 (78-171)||(18773461-18773553)
chr4 (78-146)||(18473433-18473500)
chr4 (63-146)||(11535428-11535509)
chr4 (63-146)||(19889657-19889739)
chr4 (65-147)||(3370300-3370380)
chr4 (65-146)||(10290211-10290290)
chr4 (65-146)||(10300120-10300199)
chr4 (65-137)||(14711383-14711453)
chr4 (65-137)||(14779047-14779117)
chr4 (65-137)||(18007693-18007763)
chr4 (65-137)||(23508728-23508798)
chr4 (63-147)||(40454942-40455024)
chr4 (63-147)||(40471180-40471262)
chr4 (64-147)||(19143597-19143678)
chr4 (64-147)||(47152641-47152722)
chr4 (85-147)||(3390059-3390120)
chr4 (85-147)||(25656741-25656802)
chr4 (65-146)||(24713013-24713092)
chr4 (78-146)||(10661844-10661911)
chr4 (78-146)||(10875989-10876056)
chr4 (78-146)||(14903090-14903157)
chr4 (114-146)||(16325173-16325205)
chr4 (65-137)||(16819953-16820023)
chr4 (65-137)||(18775287-18775357)
chr4 (78-146)||(20571672-20571739)
chr4 (65-137)||(36210714-36210784)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (18-233)||(18349-18560)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (35-233)||(35932620-35932818)
chr5 (35-233)||(10848096-10848296)
chr5 (35-231)||(4886293-4886485)
chr5 (44-233)||(15516306-15516494)
chr5 (63-233)||(30116450-30116619)
chr5 (18-233)||(33932575-33932792)
chr5 (55-233)||(3246055-3246232)
chr5 (63-233)||(28464951-28465120)
chr5 (55-233)||(30742328-30742506)
chr5 (63-233)||(42243036-42243205)
chr5 (55-233)||(9088316-9088493)
chr5 (55-233)||(29139018-29139195)
chr5 (55-233)||(35986846-35987024)
chr5 (55-233)||(28138950-28139131)
chr5 (55-233)||(26764850-26765028)
chr5 (105-233)||(14087153-14087281)
chr5 (78-226)||(13736694-13736842)
chr5 (63-233)||(11993242-11993414)
chr5 (35-233)||(17814289-17814489)
chr5 (41-233)||(7746306-7746500)
chr5 (35-233)||(6513043-6513241)
chr5 (55-233)||(33022008-33022189)
chr5 (35-195)||(31146255-31146415)
chr5 (78-233)||(31487606-31487760)
chr5 (78-232)||(13546138-13546290)
chr5 (35-233)||(21659538-21659735)
chr5 (58-233)||(23413586-23413763)
chr5 (78-233)||(12353406-12353564)
chr5 (86-233)||(19536910-19537058)
chr5 (78-233)||(31117247-31117403)
chr5 (78-233)||(90034-90192)
chr5 (55-233)||(643312-643492)
chr5 (91-233)||(23392218-23392360)
chr5 (78-222)||(22000650-22000796)
chr5 (78-233)||(25097438-25097595)
chr5 (78-233)||(25155408-25155565)
chr5 (55-233)||(21100314-21100495)
chr5 (63-228)||(11208623-11208793)
chr5 (122-235)||(21072846-21072962)
chr5 (78-233)||(23880434-23880591)
chr5 (63-210)||(25112509-25112661)
chr5 (63-210)||(25171600-25171752)
chr5 (58-233)||(26766448-26766624)
chr5 (78-233)||(26783722-26783878)
chr5 (79-233)||(21199612-21199768)
chr5 (78-233)||(9399227-9399385)
chr5 (63-233)||(32160102-32160277)
chr5 (35-143)||(6498640-6498746)
chr5 (78-233)||(20968616-20968768)
chr5 (18-134)||(37395475-37395589)
chr5 (37-89)||(23407403-23407455)
chr5 (78-146)||(31589643-31589710)
chr5 (65-137)||(36096343-36096413)
chr5 (65-137)||(36097800-36097870)
chr5 (55-146)||(39799542-39799632)
chr5 (200-233)||(25740631-25740664)
chr5 (63-147)||(1108615-1108697)
chr5 (63-147)||(1121373-1121455)
chr5 (63-147)||(19464679-19464761)
chr5 (63-147)||(19478709-19478791)
chr5 (65-137)||(20215827-20215897)
chr5 (65-233)||(23487908-23488079)
chr5 (65-137)||(40033449-40033519)
chr5 (198-233)||(4886512-4886547)
chr5 (64-147)||(8522549-8522630)
chr5 (64-147)||(20552523-20552604)
chr5 (64-147)||(23407153-23407234)
chr5 (158-233)||(23477828-23477903)
chr5 (64-147)||(24925609-24925690)
chr5 (64-147)||(24982890-24982971)
chr5 (64-147)||(36085168-36085249)
chr5 (64-147)||(36229446-36229527)
chr5 (85-147)||(20563033-20563094)
chr5 (85-147)||(21702616-21702677)
chr5 (85-147)||(21705456-21705517)
chr5 (85-147)||(23393108-23393169)
chr5 (197-233)||(12078354-12078390)
chr5 (65-137)||(13522581-13522651)
chr5 (65-137)||(13533338-13533408)
chr5 (65-137)||(20625485-20625555)
chr5 (64-136)||(20798414-20798484)
chr5 (35-107)||(21075923-21075995)
chr5 (63-147)||(22560144-22560226)
chr5 (65-137)||(23477732-23477802)
chr5 (65-137)||(35543819-35543889)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (35-233)||(21121618-21121816)
chr1 (35-233)||(21215230-21215428)
chr1 (35-233)||(21983924-21984122)
chr1 (35-233)||(46088317-46088515)
chr1 (35-233)||(44824314-44824507)
chr1 (46-233)||(42283980-42284167)
chr1 (46-233)||(23024132-23024319)
chr1 (35-233)||(10250317-10250513)
chr1 (35-233)||(21135714-21135911)
chr1 (63-233)||(21205426-21205596)
chr1 (55-233)||(48570783-48570960)
chr1 (35-233)||(29215125-29215322)
chr1 (69-233)||(21702177-21702340)
chr1 (18-233)||(14263984-14264199)
chr1 (55-233)||(2266447-2266625)
chr1 (71-233)||(25449110-25449274)
chr1 (35-233)||(37640336-37640535)
chr1 (78-233)||(22600741-22600895)
chr1 (71-233)||(2327990-2328151)
chr1 (78-233)||(22153226-22153385)
chr1 (63-233)||(30571556-30571724)
chr1 (58-233)||(7309170-7309345)
chr1 (78-233)||(23037060-23037214)
chr1 (35-233)||(32786492-32786692)
chr1 (58-231)||(38281917-38282089)
chr1 (91-233)||(2834070-2834213)
chr1 (78-233)||(1577238-1577392)
chr1 (55-233)||(16235861-16236038)
chr1 (63-233)||(19214967-19215140)
chr1 (55-233)||(10756772-10756953)
chr1 (78-233)||(36133575-36133729)
chr1 (78-233)||(12283793-12283951)
chr1 (78-233)||(22427890-22428047)
chr1 (55-233)||(33256903-33257083)
chr1 (55-233)||(33277075-33277255)
chr1 (58-213)||(38281736-38281890)
chr1 (55-233)||(1899695-1899872)
chr1 (78-229)||(12625109-12625262)
chr1 (55-233)||(22202287-22202466)
chr1 (35-213)||(26702701-26702880)
chr1 (78-233)||(21192416-21192574)
chr1 (55-233)||(30892442-30892620)
chr1 (128-233)||(35039588-35039692)
chr1 (86-226)||(48703642-48703783)
chr1 (114-233)||(17025514-17025638)
chr1 (78-233)||(22465362-22465519)
chr1 (78-233)||(34256066-34256227)
chr1 (84-226)||(14293182-14293327)
chr1 (70-137)||(7745701-7745767)
chr1 (55-179)||(28492888-28493013)
chr1 (152-233)||(2267977-2268057)
chr1 (78-146)||(22601225-22601291)
chr1 (78-233)||(20908782-20908939)
chr1 (39-146)||(12944677-12944783)
chr1 (65-233)||(19170876-19171048)
chr1 (65-233)||(17370400-17370572)
chr1 (65-146)||(20196325-20196404)
chr1 (168-233)||(21543534-21543599)
chr1 (63-147)||(154920-155002)
chr1 (78-142)||(17017962-17018025)
chr1 (65-137)||(19037366-19037436)
chr1 (65-137)||(20251163-20251233)
chr1 (65-137)||(23058953-23059023)
chr1 (65-137)||(23926421-23926491)
chr1 (65-137)||(28379352-28379422)
chr1 (85-147)||(4251199-4251260)
chr1 (86-147)||(17956754-17956814)
chr1 (65-137)||(674941-675011)
chr1 (63-147)||(5973252-5973334)
chr1 (65-137)||(11195711-11195781)
chr1 (65-137)||(14388771-14388841)
chr1 (78-146)||(16233765-16233832)
chr1 (114-146)||(18130619-18130651)
chr1 (65-137)||(26548909-26548979)
chr1 (65-137)||(46181495-46181566)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (35-233)||(11526-11725)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (35-233)||(19066640-19066838)
chr6 (55-233)||(12422613-12422790)
chr6 (55-233)||(33352850-33353027)
chr6 (46-233)||(19482092-19482279)
chr6 (35-233)||(26588926-26589126)
chr6 (55-233)||(21617595-21617772)
chr6 (35-226)||(22077004-22077196)
chr6 (55-233)||(21234507-21234686)
chr6 (35-233)||(22801468-22801667)
chr6 (55-233)||(17380925-17381103)
chr6 (55-233)||(19833600-19833778)
chr6 (55-233)||(17317116-17317294)
chr6 (63-233)||(16876260-16876432)
chr6 (58-233)||(13601518-13601695)
chr6 (78-233)||(15986725-15986883)
chr6 (58-233)||(21624443-21624617)
chr6 (78-233)||(9717215-9717370)
chr6 (78-233)||(10631506-10631660)
chr6 (78-233)||(15532248-15532402)
chr6 (55-233)||(15954047-15954224)
chr6 (78-227)||(18377814-18377962)
chr6 (55-233)||(12716043-12716223)
chr6 (63-233)||(20731326-20731496)
chr6 (37-229)||(16528643-16528836)
chr6 (78-233)||(32543637-32543792)
chr6 (80-233)||(19952193-19952345)
chr6 (78-233)||(14101058-14101215)
chr6 (35-233)||(19623312-19623508)
chr6 (35-226)||(20113264-20113457)
chr6 (58-233)||(13435237-13435410)
chr6 (35-233)||(25593397-25593597)
chr6 (78-233)||(29917399-29917550)
chr6 (35-233)||(15301544-15301743)
chr6 (79-233)||(24116200-24116356)
chr6 (58-233)||(26941787-26941966)
chr6 (55-233)||(18434887-18435068)
chr6 (55-233)||(19085507-19085687)
chr6 (102-233)||(19688179-19688308)
chr6 (91-233)||(16914809-16914954)
chr6 (63-233)||(19470024-19470196)
chr6 (78-233)||(7763024-7763183)
chr6 (58-233)||(14070690-14070870)
chr6 (58-142)||(14052095-14052179)
chr6 (58-233)||(14732737-14732915)
chr6 (78-233)||(17927164-17927320)
chr6 (55-233)||(25929827-25930006)
chr6 (58-179)||(3680465-3680588)
chr6 (78-137)||(12041223-12041282)
chr6 (55-234)||(19625159-19625341)
chr6 (58-233)||(25591974-25592150)
chr6 (78-233)||(12347464-12347620)
chr6 (55-233)||(17303893-17304072)
chr6 (65-146)||(31571932-31572011)
chr6 (78-173)||(29537984-29538081)
chr6 (85-147)||(16124134-16124195)
chr6 (65-146)||(17746384-17746463)
chr6 (65-146)||(18835233-18835312)
chr6 (58-146)||(32335194-32335281)
chr6 (65-137)||(7586875-7586945)
chr6 (55-99)||(16333090-16333134)
chr6 (78-146)||(18172931-18172998)
chr6 (78-146)||(18226803-18226870)
chr6 (63-210)||(20635079-20635230)
chr6 (78-146)||(24719443-24719510)
chr6 (65-137)||(25687362-25687432)
chr6 (65-137)||(31930965-31931035)
chr6 (64-147)||(7376357-7376438)
chr6 (64-147)||(20030502-20030583)
chr6 (64-147)||(20063253-20063334)
chr6 (63-146)||(27167042-27167123)
chr6 (85-147)||(25787239-25787300)
chr6 (85-147)||(30120491-30120552)
chr6 (85-147)||(32756937-32756998)
chr6 (184-233)||(7811524-7811573)
chr6 (65-146)||(18826838-18826917)
chr6 (65-146)||(29765053-29765132)
chr6 (65-137)||(11205487-11205557)
chr6 (65-137)||(11235010-11235080)
chr6 (65-137)||(17609025-17609095)
chr6 (65-137)||(18554812-18554882)
chr6 (110-146)||(19875242-19875278)
chr6 (65-137)||(21127591-21127661)
chr6 (63-147)||(26043728-26043810)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (41-233)||(16300-16491)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (35-233)||(210730-210927)
scaffold0004 (55-233)||(219589-219769)
scaffold0004 (35-233)||(378129-378334)
scaffold0004 (55-233)||(244861-245042)
scaffold0004 (71-146)||(87775-87849)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (18-233)||(88184-88399)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (37-233)||(1404-1599)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (46-226)||(2564-2744)
scaffold0116 (146-233)||(21587-21674)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (35-226)||(35335-35527)
scaffold0056 (46-233)||(26251-26422)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (41-229)||(145038-145225)
scaffold0011 (55-233)||(65989-66166)
scaffold0011 (63-233)||(165211-165386)
scaffold0011 (78-146)||(58937-59004)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (55-226)||(3259-3429)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (63-233)||(24361-24531)
scaffold0028 (78-233)||(80768-80926)
scaffold0028 (63-147)||(14130-14212)
scaffold0028 (63-147)||(54750-54832)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (55-233)||(2330-2509)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (43-211)||(5874-6042)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (74-233)||(78938-79100)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (55-233)||(22713-22890)
scaffold0217 (78-233)||(18404-18559)
scaffold0217 (78-124)||(606-652)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (55-233)||(523-702)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (63-233)||(63695-63868)
scaffold0007 (71-233)||(46030-46194)
scaffold0007 (120-233)||(142511-142624)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (75-233)||(7323-7483)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (35-233)||(28009-28213)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (78-233)||(48704-48861)
scaffold0084 (35-227)||(31917-32109)
scaffold0084 (63-233)||(967-1142)
scaffold0084 (65-137)||(57422-57492)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (78-233)||(6274-6428)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (78-233)||(236-390)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (78-233)||(83765-83921)
scaffold0009 (78-146)||(268155-268222)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (78-233)||(9336-9493)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (114-233)||(90639-90758)
scaffold0003 (78-146)||(88-155)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (59-233)||(25813-25989)
scaffold0163 (65-137)||(29018-29088)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (58-233)||(9258-9434)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (58-233)||(211708-211885)
scaffold0005 (65-137)||(60613-60683)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (63-233)||(19206-19377)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (36-233)||(7158-7351)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (55-233)||(1008-1188)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (55-233)||(14467-14646)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (35-229)||(20054-20249)
scaffold0035 (114-233)||(99850-99968)
scaffold0035 (37-108)||(110306-110375)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (63-164)||(23988-24089)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (55-233)||(73931-74112)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (41-233)||(10689-10883)
scaffold0161 (41-233)||(15353-15547)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (55-230)||(32370-32547)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (91-233)||(108-250)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (55-233)||(1966-2146)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (78-233)||(16710-16867)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (116-195)||(5509-5588)
scaffold0607 (35-89)||(5458-5510)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (35-229)||(7992-8185)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (55-145)||(2797-2887)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (55-233)||(44442-44624)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (55-231)||(7275-7451)
scaffold0026 (78-226)||(59452-59598)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (157-233)||(5634-5710)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (78-233)||(9329-9487)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (157-233)||(5644-5720)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (91-233)||(1238-1381)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (36-233)||(2599-2796)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (55-233)||(2641-2821)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (150-233)||(8602-8684)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (63-233)||(38664-38839)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (78-233)||(2603-2761)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (78-233)||(1215-1371)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (78-233)||(13416-13573)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (82-233)||(111233-111385)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (63-233)||(9325-9500)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (55-200)||(37360-37507)
scaffold0120 (114-200)||(41556-41645)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (37-233)||(7960-8164)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (81-233)||(76621-76774)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (78-233)||(56-217)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (84-233)||(144284-144436)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (78-198)||(5587-5711)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (55-233)||(102919-103100)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (63-226)||(5760-5927)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (78-233)||(2363-2524)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (146-233)||(158553-158640)
scaffold0022 (78-173)||(36802-36899)
scaffold0022 (78-173)||(134862-134959)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (78-233)||(2374-2519)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (78-137)||(1205-1264)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (55-146)||(671-761)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (55-146)||(650-740)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (158-233)||(4478-4553)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (158-228)||(20019-20089)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (64-137)||(7521-7592)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (63-147)||(1758-1840)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (63-147)||(44-126)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (110-146)||(4033-4069)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (65-137)||(129-199)
scaffold0570 (65-137)||(2354-2424)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (65-137)||(291-361)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (65-137)||(1653-1723)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (65-137)||(11091-11161)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (35-126)||(14295-14386)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (35-126)||(1337-1428)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (65-137)||(40994-41064)
scaffold0017 (39-137)||(174901-174998)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (65-137)||(61090-61160)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (114-226)||(5097-5213)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (35-98)||(17658-17721)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (63-137)||(30-102)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (85-210)||(1538-1668)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (85-210)||(1731-1861)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (63-137)||(15273-15345)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (78-211)||(16338-16476)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (85-147)||(8393-8454)
scaffold0068 (85-147)||(11233-11294)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (78-233)||(4488-4649)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (63-147)||(18753-18838)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (78-210)||(7086-7223)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (65-137)||(778-848)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (65-137)||(5442-5512)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (63-147)||(8696-8778)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (65-137)||(12756-12826)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (120-199)||(13801-13883)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (78-146)||(9658-9725)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (78-146)||(19450-19517)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (65-137)||(32350-32420)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (65-137)||(40049-40119)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (158-210)||(35073-35125)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (65-137)||(4844-4914)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 106)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 27871042 - 27871240
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27871042 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 27871141  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27871142 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 27871240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32265548 - 32265354
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagc 138  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |     
T  32265548 ataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttctaagggga 32265449  T
Q  139 gttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32265448 gttcactatgtaatatctgattaaaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 32265354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 33421096 - 33421273
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33421096 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 33421195  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33421196 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33421273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 1292435 - 1292606
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1292435 gagagaataaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 1292534  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1292535 ctgattacaaatgctaactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacacaactgcaagagacttc 1292606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19340073 - 19339883
Alignment:
Q  43 aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19340073 aacagagagaaagagagaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttc 19339974  T
Q  143 actatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19339973 actatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 19339883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48063644 - 48063446
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || | || || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48063644 gcggataaaacagagagaaagtgataagaaagacacaagcaaattatacaggtttcttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 48063545  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  48063544 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 48063446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12175184 - 12174974
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtc 117  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| || |    
T  12175184 gttcagaactagttgcagcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaaacaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcttgcc 12175089  T
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagca 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  12175088 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgca 12174990  T
Q  218 agagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  12174989 agagacttcctatgct 12174974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24795515 - 24795349
Alignment:
Q  67 acacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24795515 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattacaaat 24795416  T
Q  167 gctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24795415 gctcactattaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 24795349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 14424839 - 14425032
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaa-ag-gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcca 132  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14424839 gcggataaaacagagagagagagagagaagaaaaatacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcca 14424938  T
Q  133 aggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14424939 aagagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 14425032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48806713 - 48806514
Alignment:
Q  35 gcggataa-aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48806713 gcggataagaacagagagaaagagagaagcaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaa 48806614  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48806613 gaggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcaatactaaacttagtatgagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48806514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 330977 - 331174
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  330977 gcggataaaacagagagaa--aaagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaag 331074  T
Q  135 gagcgttcactat--gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  331075 gagagttcactataagtaatatctgattacaaatgctcactgctaaacctagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 331173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15705299 - 15705122
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15705299 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcattatgtaatat 15705200  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15705199 cttattacaattgctctctactaaatttagtaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15705122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2266323 - 2266151
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatctt 157  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  2266323 agaagaaagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttg 2266224  T
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2266223 attacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactggaagagacttcctatg 2266151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35954718 - 35954542
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35954718 gagagaagaaagacacaaaacaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 35954619  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35954618 tctgattacaattcctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 35954542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9710617 - 9710442
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9710617 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaata 9710518  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    ||| ||||||| | |||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9710517 tctgattacaatttctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttccta 9710442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21382253 - 21382063
Alignment:
Q  43 aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  21382253 aacagagagaaagagagaagagagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcctagttgagttc 21382154  T
Q  143 actatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21382153 actatgtaatatctgattacaattgctcatttctatatttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21382063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13138686 - 13138531
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact- 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  13138686 ttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactatgtaatatcttattacaattgctcactgcta 13138587  T
Q  177 aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13138586 aaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 13138531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23280742 - 23280587
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  23280742 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 23280643  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23280642 aaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23280587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30946152 - 30945993
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30946152 caatttatataggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaactgctcact 30946053  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30946052 gctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30945993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48237634 - 48237475
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  48237634 caatttatacgggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgattacagttgctcact 48237535  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48237534 gctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 15087895 - 15088072
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15087895 gagagaagaaggacacaaagaaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 15087994  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15087995 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15088072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15574392 - 15574215
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15574392 gagagaagaaagacacaagcaatttatacagtttccttccacaaatcggaagtcaaacctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatat 15574293  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15574292 ctgataacaattgctcactactaaaattagtaatagacttcaaa-cgctcatgcacaactgcaagagacttcctatgct 15574215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 8182304 - 8182447
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8182304 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 8182403  T
Q  155 cttatt--acaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttca 196  Q
    || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8182404 ctgattacacaaatgttcactactaaacttagtaagagacttca 8182447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 44466438 - 44466618
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  44466438 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 44466536  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44466537 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 44466618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16557402 - 16557224
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16557402 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 16557303  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16557302 tctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 16557224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 16608260 - 16608438
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16608260 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 16608359  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16608360 tctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 16608438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33692490 - 33692335
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  33692490 ttatacagattccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgatcactgcta 33692391  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33692390 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33692335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28623173 - 28622995
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28623173 gagagaagaaagacacaaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 28623074  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| ||||||| |||||||| || |||  ||| |||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  28623073 tctaattacaattgctcactgctaaaaactagcaagagacttcaaattactcaagtacaattgcaagagacttcctatg 28622995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 4820854 - 4821007
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  4820854 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtagtatttgattacaattgctcactacta 4820952  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4820953 tacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 4821007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 14187036 - 14187210
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaata 153  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  14187036 agaagaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaatcggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaata 14187134  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14187135 tctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 14187210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13731506 - 13731308
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagg 135  Q
    |||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13731506 ggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggtttcttccacaagctggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagg 13731408  T
Q  136 agcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    || |||||||   ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13731407 agagttcactaaaatgtaatatctgattacaaatgttcaatgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 13731309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2914421 - 2914244
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||    
T  2914421 agaagaaagacacaaagcaatt-atataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataatgtaata 2914323  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2914322 tctgattacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 2914244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 11318752 - 11318929
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |   ||||||||    
T  11318752 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcaataaaatgtaata 11318850  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11318851 tctgattacaaatgttcactgctaaacttaacaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 11318929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 13879517 - 13879694
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13879517 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatatct 13879615  T
Q  157 tattaca---aatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||   |||||||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13879616 gattacaattaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaacaacaagagacttcctatgct 13879694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16310721 - 16310540
Alignment:
Q  54 ggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgt 149  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||   |||    
T  16310721 ggagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcaattccatggagagttcactaaaatgt 16310624  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  16310623 aatatctgattacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 16310540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19711844 - 19711650
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| | ||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  19711844 gcggataaaacagagagaaggagagaagagagacacaaagcaatt-atactggttccttccataaaccagaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaa 19711747  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19711746 ggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactccaagagacttcctat 19711650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 9069127 - 9069281
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||  | |||    
T  9069127 ttatacaggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtagtatctgattacagctgctctttgcta 9069226  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9069227 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 9069281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21284184 - 21284007
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  21284184 agaagaaagacacaaagcaatt-atacatgttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 21284086  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21284085 tctgattacaactgttcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21284007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19328821 - 19328647
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19328821 agaagaaagacacaaagcaatt-atacagattccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct 19328723  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||| || |||||||| |||||  ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19328722 gattataattgctcactgctaaaactatcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgctagagacttcctatgct 19328647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22579972 - 22579825
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22579972 ttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 22579873  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22579872 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 22579825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16546149 - 16545971
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16546149 gagagaagaaagacacaaaacaatttgtacaggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaata 16546050  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16546049 tctcattacaattgctcactattaaaactagcaagagacttcaaa-tactcaaccacaactgcaagagacttcctatgct 16545971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 16619513 - 16619691
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16619513 gagagaagaaagacacaaaacaatttgtacaggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaata 16619612  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16619613 tctcattacaattgctcactattaaaactagcaagagacttcaaa-tactcaaccacaactgcaagagacttcctatgct 16619691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 4493919 - 4494100
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||    
T  4493919 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttcctttcacaaaccggaagtat-tcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaaatgt 4494016  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4494017 aatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 4494100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13034648 - 13034470
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatat 154  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  13034648 agaagaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatat 13034549  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| | |||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13034548 ctgattacaacttctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13034470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 11792254 - 11792434
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  11792254 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 11792352  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  11792353 tatctgattacaactgctcattgctaaacttagcaagagacttcaaattacttaagaacaaatgcaagagacttcctatgct 11792434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 15467285 - 15467440
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  15467285 ttatacaagttccttccacaaaccagaaatcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgattacaattgctcatttcta 15467384  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15467385 aaactagcaagagacttcaaatttctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 15467440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12367527 - 12367370
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  12367527 ttatacaggttccttccacaaactggaagtagtt-atgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 12367429  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  12367428 ctaaacttagcaagaaacttcaaattaatcaagcaaaactgcaagagatttcctatgct 12367370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13259192 - 13259055
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13259192 ttatacaggttccttccacaaatcggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 13259094  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13259093 ttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaac 13259055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13266532 - 13266395
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13266532 ttatacaggttccttccacaaatcggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 13266434  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13266433 ttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaac 13266395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5001639 - 5001465
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  5001639 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcgaaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 5001542  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||  |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  5001541 atatctgattacaactactcactgctaaacttatcaagagacttcaaattacacaagcacaactgcaagagatttcc 5001465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10883981 - 10883805
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  10883981 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttcctttcacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 10883884  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10883883 tttgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 10883805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 13302208 - 13302384
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||    
T  13302208 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatgtaata 13302305  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13302306 tcttattacaactgctgactgctaaaactagcaagaggcttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctttgct 13302384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16317367 - 16317188
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||  |||||| |  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||    
T  16317367 gagagaagaaagacacaaagcaatc-atacaggttccttccacaaacaggaagtagtcc--gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaattta 16317271  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16317270 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 16317188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13261405 - 13261248
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||| |||     
T  13261405 ttatacatgttccttccacaaactggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgcttactg 13261307  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13261306 ttaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13261248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 24787685 - 24787836
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24787685 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacacaacaatt-atacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 24787783  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaactta 183  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  24787784 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactactcactgctaaactta 24787836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19237825 - 19237668
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  19237825 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcactg 19237727  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| || |||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  19237726 ctaaaactagcaaaaaacttcaaactactcaagcacacaagcaagagatttcctatgct 19237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4433343 - 4433168
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  | ||||   | ||    
T  4433343 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaact 4433245  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  4433244 gattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 4433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 14425928 - 14426071
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaa 187  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  14425928 ttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcac 14426026  T
Q  188 gaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14426027 gagacttaaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14426071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29936178 - 29935977
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  29936178 gcggatgaaacagagagagaaagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccc-ttgcacttccaag 29936081  T
Q  135 gagcgttcacta-----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    ||| ||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||    
T  29936080 gagagttcactaaaaaatgtaatatctaattacaattgctcactgctaaacttagcaaaagtcttcaaattactcaagcacaactgcaagagattttcta 29935981  T
Q  230 tgct 233  Q
    ||||    
T  29935980 tgct 29935977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 33604254 - 33604430
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    || |||    
T  33604254 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttccacttccaaggagagttcgctaaaaagtcata 33604351  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33604352 tctgattacaactgctcactgttaaacttagcaagatacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 33604430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16315328 - 16315173
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16315328 ttatacaggttcctttcacaaaccggaagtag-tcatg-cccccttgcacttccaaggagaattcactaaaaagtaatatctaattacaactgctcactg 16315231  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  16315230 ctaaacttagcaagagacttcaaat-gctcaagtacaactgtaagagacttcctatgct 16315173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 21691763 - 21691885
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  21691763 tgtcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatgttatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaaatactcaagcac 21691862  T
Q  211 aacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  21691863 aactgcaagagatttcctatgct 21691885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39285316 - 39285143
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||    
T  39285316 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtctcccttccacttccaaagagagttcactaaaatgtaa 39285218  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  39285217 tatctgattacaactgctcactactaaaactagcaagaaacttcaaactacttaaacacaactgcaagagacttc 39285143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 30025302 - 30025452
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  30025302 ttatacatgttccttcaacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttccacttccagagagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 30025400  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30025401 ctaaacttagcaagagacttcaaattgctcatgcacaactgcaagaaacttc 30025452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4412771 - 4412595
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagt-cggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atc 155  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | |    
T  4412771 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaac 4412673  T
Q  156 ttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  4412672 tgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 4412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41843214 - 41843057
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  41843214 ttatacaagttccttccataaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 41843116  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| | |||||| | |||||||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  41843115 ctaaaactagcaagagatttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcatatgct 41843057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Original strand, 602110 - 602191
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  602110 gagagagaaaagacaca-gcaatttatacaggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggag 602191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Original strand, 2499428 - 2499526
Alignment:
Q  76 atttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2499428 atttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctca 2499526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13027688 - 13027534
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | |||||||| |||||   |||||||| |    
T  13027688 tatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaattttaatatctgattac---tgctcacttc 13027592  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13027591 taaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 13027534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 13645777 - 13645968
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13645777 gcggataaaacagagaga--gaaagaggaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccgtaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaa 13645872  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    | || |||||||   ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |  ||| |||| ||||  || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13645873 gcagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactactcactaatataactagcaagagacttttaa-tactcaagcacaactgcaagagacttcc 13645968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7488697 - 7488537
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgt--aatatcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     ||||||| |||||||||| |||    
T  7488697 caatttatagtggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctaattacaaatgttca 7488599  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||  ||| || | |||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  7488598 ctactcaaaatagcaaaagacttcaaattactcaagcacaatttcaagagatttcctatgct 7488537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16155525 - 16155463
Alignment:
Q  105 agtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatg 167  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16155525 agtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagaattcactatgtaatatctgattacaaatg 16155463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 13683004 - 13683121
Alignment:
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaaca 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||     
T  13683004 ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattgcaactgctcattgctaaaactaggaagagacttcaaa-tactcaagcacaact 13683102  T
Q  215 gcaagagacttcctatgct 233  Q
     || |||||||||||||||    
T  13683103 acatgagacttcctatgct 13683121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21211357 - 21211267
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21211357 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcacta 21211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16112588 - 16112519
Alignment:
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16112588 aaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16112519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9099849 - 9099672
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| | || ||||||||||||||||| || ||||    ||||    
T  9099849 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atagaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatattcctcttgcacttccaaggagagtccactaaaaatgt 9099752  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| | ||||||| |||||||| |||||  ||  |||| |||||||| | ||||||    || |||||||| ||||||||||    
T  9099751 aatatttgattacaattgctcactgctaaaactaccaagagacttcaaactactcaag----actgcaagagatttcctatgct 9099672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 3165285 - 3165367
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3165285 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 3165367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9099043 - 9098916
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||| | || ||||||||||||||||| || ||||    ||||    
T  9099043 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atagaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatattcctcttgcacttccaaggagagtccactaaaaatgt 9098946  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    ||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  9098945 aatatttgattacaattgctcactgctaaa 9098916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16308499 - 16308432
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16308499 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 16308432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 16411376 - 16411443
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16411376 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcacta 16411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17064305 - 17064199
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaa-aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17064305 ataaaacagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtccat-tcccccttgcacttccaaggag 17064208  T
Q  138 cgttcacta 146  Q
      |||||||    
T  17064207 atttcacta 17064199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24883143 - 24883073
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  24883143 agacacaagcaatt-atcccggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 24883073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 588764 - 588845
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  588764 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 588845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3477116 - 3477019
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaa-aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  3477116 ataaaacagagtagagaaaagaaagaaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 3477019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8999537 - 8999491
Alignment:
Q  186 aagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8999537 aagaaacttcaaat-gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 8999491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13473217 - 13473130
Alignment:
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || | |||||||| | |||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  13473217 atgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaaaagacttcaaactactcaagcacaagtgcaagagattttctatgct 13473130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16105733 - 16105652
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | || || || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16105733 aaagacacaagcaatt-atacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgccctccttgcacttctaaggagagttcacta 16105652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 9159302 - 9159363
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9159302 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 9159363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 9169757 - 9169818
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9169757 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 9169818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13175362 - 13175294
Alignment:
Q  67 acacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  13175362 acacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 13175294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21770671 - 21770610
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21770671 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 21770610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25212579 - 25212518
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25212579 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 25212518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 179
Target Start/End: Original strand, 26042774 - 26042877
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |   ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26042774 ttatacaggttcattccacaaactggaagtcggtactgtctcccttgcactttcaaagagagttcattaaaatg-aatatctgattacaactgctcacta 26042872  T
Q  175 ctaaa 179  Q
     ||||    
T  26042873 ttaaa 26042877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38594411 - 38594350
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38594411 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 38594350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40055482 - 40055421
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40055482 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40055421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Original strand, 2499529 - 2499562
Alignment:
Q  200 tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2499529 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 2499562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 8933115 - 8933185
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  8933115 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 8933185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8999694 - 8999624
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  8999694 agacacaagcaatt-atactgattccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 8999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 9802668 - 9802704
Alignment:
Q  197 aattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9802668 aattgctcaagcacataagcaagagacttcctatgct 9802704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12734913 - 12734843
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  12734913 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 12734843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18362320 - 18362253
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| || | ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18362320 ttatacatgttcctttcccaattcggaagt-ggtcctgtcccccttgcccttccaaggagagttcacta 18362253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 18440746 - 18440816
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  18440746 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 18440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 20490557 - 20490639
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20490557 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20490639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26210297 - 26210227
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  26210297 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 26210227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 29589539 - 29589609
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29589539 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38403961 - 38403891
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  38403961 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 38403891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 115)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 40850305 - 40850503
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40850305 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 40850404  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40850405 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagagttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40850503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 2782835 - 2783005
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  2782835 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactatgtaatatctgattac 2782934  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2782935 aaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcatatgct 2783005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 2025419 - 2025614
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2025419 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaacaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 2025516  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2025517 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 2025614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 21640215 - 21640393
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21640215 gagagaatatagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccgcttgcacgtccaaggagagttcattatgtaatat 21640314  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21640315 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21640393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30055006 - 30054813
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30055006 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacgagcaatttacacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 30054911  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  30054910 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcac-actaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagactttctatgct 30054813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9700838 - 9700670
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  9700838 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaa 9700739  T
Q  165 atgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9700738 atgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 9700670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 50299548 - 50299756
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtc 117  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  50299548 gttcagaactagttgcagcggataaaacagagaga--gagagaagaaagacataagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtc 50299645  T
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagca 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  50299646 ccccttgcacttccaaggagagttcactata-aatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcg 50299744  T
Q  218 agagacttccta 229  Q
    ||||||||||||    
T  50299745 agagacttccta 50299756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46797226 - 46797036
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46797226 gcggataaaacagagatagagagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaag 46797127  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46797126 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgatcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 46797036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49669315 - 49669122
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49669315 ggataaaacagagaga--gagagaagaaagacacaaacaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaagga 49669218  T
Q  137 gcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49669217 gagttcactatgtaatatctcattacaaatgctaactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgttaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 49669122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22463863 - 22463672
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22463863 gcggataaaacagagagaaagagagaataaagaaacaggcaatttatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 22463764  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22463763 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactattaaacttagtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 22463672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22465321 - 22465130
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22465321 gcggataaaacagagagaaagagagaataaagaaacaggcaatttatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 22465222  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22465221 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactattaaacttagtatgagactccgaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 22465130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 33582580 - 33582758
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33582580 gagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccaaaaaccgaaagtcagtcccgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 33582679  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33582680 ctgattacaattgctcactactaaacatagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33582758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 28581477 - 28581632
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  28581477 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 28581576  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28581577 aaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28581632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 14954778 - 14954956
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14954778 gagagaagaaaaacacaagcaatttatacaggttcctttcataaagcggaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 14954877  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  14954878 ctgattacaaatgctcactaccaaacttagtaagagacttcaaattgatcaaacacaattgcaagagactttctatgct 14954956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1728847 - 1728648
Alignment:
Q  35 gcggataa-aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1728847 gcggataagaacagagagaaagagagaagagagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 1728748  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1728747 ggggagttcactatgtaatatctgattacaattgttcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1728648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 5212927 - 5213105
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcat-gtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5212927 gagagaagaaagacacaagcaatttatacagattccttccacaaaccgaaagttagtcctccccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 5213026  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5213027 tcttattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 5213105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 29854770 - 29854928
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctc 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||     
T  29854770 aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactttgtaatatctgattacaattgcta 29854869  T
Q  171 actactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29854870 actactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 29854928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 40799245 - 40799424
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40799245 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaata 40799344  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40799345 tctgattacaattgctcacttctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21639083 - 21638906
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21639083 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 21638984  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  21638983 ctgattacaattgtttgctactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcatatgct 21638906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1241884 - 1241719
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1241884 aaagacacaagcaatttatacaggttc----cacaaatcggaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaagagagttcactatttaatatctgattac 1241790  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1241789 aaatgctcacgactaaacttagtaagagacttcaaattactcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 1241719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 47207069 - 47207231
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctc 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47207069 aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctc 47207168  T
Q  171 actactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  47207169 actgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagatacttcatatgct 47207231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 2784470 - 2784591
Alignment:
Q  112 catgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcaca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2784470 catgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacaca 2784569  T
Q  212 acagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  2784570 acagcaagagacttcatatgct 2784591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38178475 - 38178276
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaa-ag-gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcca 132  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38178475 gcggataaaacagagagagagagagagaagaaagacacaaagtaattatacaggttcattccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcca 38178376  T
Q  133 aggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38178375 agaagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 38178277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47406233 - 47406055
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  47406233 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttcaaaggagaattcactatgtaata 47406135  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47406134 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 47406055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20628224 - 20628065
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    
T  20628224 caatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactttgtaatatctgattacaattgctcatt 20628125  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20628124 gctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20628065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 11222910 - 11223090
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg--ttcactatgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11222910 gagagaagaaagacacaaaacaatttatacaggttctttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttttcactatgtaa 11223009  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11223010 tatctgattacaattgctcaccgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 11223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 3238063 - 3238219
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3238063 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcacta 3238161  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  3238162 ctaaacttagtaagagacttcaaatt-ctcaagcgcaactgcaagcgacttcctatgct 3238219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13781417 - 13781217
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  13781417 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaag 13781318  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| |||||||   ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13781317 gagagttcactaaaatgaaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 13781219  T
Q  232 ct 233  Q
    ||    
T  13781218 ct 13781217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25399085 - 25398888
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   | |||||||  ||| |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  25399085 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaaaacaattatacaaattccttccacaaactggaagttagtcatgtccctcttgcacttccaag 25398986  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25398985 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcgctgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 25398888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53057532 - 53057369
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttatta 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  53057532 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatataatatctgatta 53057433  T
Q  162 caaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53057432 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 53057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 17667777 - 17667931
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17667777 ttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgaaatatctgattacaactgctcactacta 17667876  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  17667877 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtctttctatgct 17667931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 31302720 - 31302874
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||    
T  31302720 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatacctgattacaattgctcactgcta 31302819  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31302820 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31302874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 52283137 - 52283311
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  52283137 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaactgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagta 52283236  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  52283237 atatctgattacaatttctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttc 52283311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12727023 - 12726866
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12727023 ttatataggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcacta 12726924  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12726923 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 12726866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 13823397 - 13823592
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13823397 gcggataaaacagagaga--gagaaaagaaagatacaaagcaatt-atacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 13823493  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   |  |||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13823494 ggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaaccatcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactacaagagacttcctatgct 13823592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46350634 - 46350478
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact- 176  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||     
T  46350634 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccccttatacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 46350535  T
Q  177 aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  46350534 aaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 46350478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 14968735 - 14968889
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  14968735 ttatacaggtctgttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttgactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 14968834  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14968835 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14968889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17239733 - 17239554
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||    
T  17239733 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgta 17239636  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17239635 a-atctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 17239554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49554284 - 49554132
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| |||    
T  49554284 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctgat--caattgttcactgcta 49554187  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49554186 aaactagcaaaagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 49554132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18122423 - 18122245
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  18122423 gagagaagaaagacacaaagcaatt-ataaaggttccttccacaaatcgaaagtcagttttgtccccgttgcacttccaagaagagttcactatgtgata 18122325  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||  |||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18122324 tctgattacaattgctcactgctaaaactatcaagagacctcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 18122245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 6090098 - 6090252
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  6090098 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagctcactaaaaatgtagtatctgattacaacttctcact 6090196  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6090197 gctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttccta 6090252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 11222182 - 11222342
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg--ttcactatgtaatatcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11222182 caatttatacaggttccttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttttcactatgtaatatctgattacaattgctca 11222281  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |  |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11222282 ccgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 11222342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12963916 - 12963716
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  12963916 gcggataaaacagagagagagagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcggaagt-aatcatgtcccccttacacttccaa 12963819  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||   | ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||| ||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12963818 ggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaactgctcaatgataaacttagcaagagctttgaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctat 12963719  T
Q  231 gct 233  Q
    |||    
T  12963718 gct 12963716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 20645482 - 20645681
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20645482 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgtttcttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaa 20645579  T
Q  134 ggagcgttcac---tatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| ||||||    || |||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20645580 ggagagttcaccaaaatttaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 20645678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49643593 - 49643393
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  ||  ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  49643593 gcggataaaacagagagagagaaggaagaaagacacaaagcaatt-atacagattccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaa 49643495  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49643494 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactggtcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 49643396  T
Q  231 gct 233  Q
    |||    
T  49643395 gct 49643393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 41494370 - 41494526
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| |     
T  41494370 ttatacaggttccttccataaaccggaagtcaatcatgtccccct-gcactttcaaggagagttcactataatgtaatatctgattacaactgctcattg 41494468  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41494469 ctaaacttaacaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 41494526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 37411992 - 37412167
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  37411992 aaagacacaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 37412090  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  37412091 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgct 37412167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Original strand, 13939227 - 13939412
Alignment:
Q  38 gataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    ||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13939227 gataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagttg-tcatgtcccccttgcacttccaagga 13939324  T
Q  137 gcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
    | |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13939325 gagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcagtgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagaga 13939412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 20724436 - 20724618
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    ||||    
T  20724436 gagagaagaaagacacaaaacaattatataggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgta 20724534  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgcta 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  20724535 atatctgattacaactgctcactgctaaaattagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgcta 20724618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Original strand, 2560520 - 2560714
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg 139  Q
    |||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2560520 aaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagag 2560617  T
Q  140 ttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  || | |||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  2560618 ttcactaaaaatgtaatatctgattacaattgcttactgctaaacttatcaacagacttcaaa-tgctcaaacacaactgtaatagacttcctatgct 2560714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 22128449 - 22128602
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||    
T  22128449 ttatacaggttccttctacaaaccggaagtcagtcttgtcccctttgcacttccaaggagag-tcagtatgtaacatctgattacaattgctcactgtta 22128547  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22128548 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 22128602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45862362 - 45862187
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  45862362 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 45862264  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45862263 gattacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 45862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29952266 - 29952078
Alignment:
Q  36 cggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||||  || | || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||| ||||    
T  29952266 cggataaaacagagaaagagaaaaaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccctttgcactttcaag 29952169  T
Q  135 gagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
    | | ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  29952168 gggagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaga 29952078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30001420 - 30001232
Alignment:
Q  36 cggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||||  || | || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||| ||||    
T  30001420 cggataaaacagagaaagagaaaaaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccctttgcactttcaag 30001323  T
Q  135 gagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
    | | ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  30001322 gggagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaga 30001232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Original strand, 11189384 - 11189518
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  11189384 ttatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagttcactacgtaatatctgattacaattgctcactgcta 11189483  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
    ||  ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  11189484 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaaccacaac 11189518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23538951 - 23538793
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    | |||||||| ||||||| |||||| |    
T  23538951 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtccccattgcacttccaaggagagttcactaaaaatataatatctgattacaactgctcaat 23538853  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  23538852 gctaaaactagcaagaaacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 23538793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26418464 - 26418306
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26418464 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 26418366  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26418365 gctaaaactagcaagagacttcaatctactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26418306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8874907 - 8874750
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||   || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||     
T  8874907 tatacagattctttccacaaagcagaagtaa-tcttctcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgtaatatttgattacaactgctcactg 8874809  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8874808 ccaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 8874750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12753411 - 12753250
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  12753411 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 12753312  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  12753311 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 12753250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14393722 - 14393635
Alignment:
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14393722 atgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 14393635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14063777 - 14063619
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14063777 ttataaaggttccttccacaaactggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 14063679  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  14063678 gctaaaactagaaagagacttcaaactactcaagcacaagtgcaagagatttcatatgct 14063619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 15902547 - 15902723
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||     
T  15902547 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcaaaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagag-tcactaaaatgtaatt 15902644  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| | |||||| |||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15902645 tctgattacaactactcactgctaaactttgcaagaggcttcaaa-tgctcaagcacaattacaagagacttcgtatgct 15902723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22804797 - 22804654
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta--tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaag 188  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  ||||  |  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||  |||    
T  22804797 ttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaatgagatttcataaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaatttaacaag 22804699  T
Q  189 aaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  22804698 aaacttcaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgct 22804654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19250162 - 19249985
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||  |||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||   | |||    
T  19250162 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggtttcttccacaaatcaaaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaatgaaagttcactaaaatataa 19250064  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19250063 tatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaacaacaagagatttcctat 19249985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 16031967 - 16032124
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| | || ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16031967 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtag-tcttgtcccc-ttgcacttctaagaagagttcactaaaaatgtaatatctaattacaactgctcact 16032064  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16032065 gctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaagtgcaagagatttcctatgct 16032124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 195
Target Start/End: Original strand, 52919836 - 52919956
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52919836 ttatacaggtttcttccacaaatcggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 52919934  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttc 195  Q
     |||||||| | |||| |||||    
T  52919935 gctaaactttgcaagagacttc 52919956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 13953620 - 13953794
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | ||    
T  13953620 aaagacacaggcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 13953717  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  13953718 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgct 13953794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 6252769 - 6252949
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |   |||    
T  6252769 gagagaagaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatcaat 6252868  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || | |||||||  ||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  6252869 atttgattacaacagctcactgctaaaactagcaagagacttgaaactactcaatcacaactgcaagagatttcctatgct 6252949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 12967656 - 12967837
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||  || |||| | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    ||||    
T  12967656 gagagaagaaagacacaaatcaattatacaagttccttccacaacccgaaagtag-tcatgtccccattgcactttcaaggagagttcactaaaaatgta 12967754  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |  ||||| |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  12967755 atatctgattacaactagtcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 12967837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19889723 - 19889545
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||   ||||    
T  19889723 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atgtaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccc-ttgcacttcgaatgagagttcactaaaatgta 19889627  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19889626 atatctgattaaaactgctaactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gctaaagcacaactacaagagacttcctatgct 19889545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 51340340 - 51340512
Alignment:
Q  66 gacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttat 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | || ||    
T  51340340 gacacaagcaatt-atacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 51340438  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  51340439 tacaactgctcaatactacacctagtatgagatttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 51340512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 116
Target Start/End: Original strand, 2783225 - 2783278
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  2783225 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgt 2783278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22770644 - 22770577
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22770644 ttatacaggttccttccacaattcggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 22770577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 15832765 - 15832939
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | ||    
T  15832765 aaagacacaggcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 15832862  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  15832863 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 15832939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 11078131 - 11078194
Alignment:
Q  82 acaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11078131 acaggttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11078194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11909830 - 11909669
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  11909830 ttatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 11909731  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||    
T  11909730 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgct 11909669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13410825 - 13410758
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13410825 ttatacatgttccttccacaattcggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13410758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16659346 - 16659223
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta-----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||     |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  16659346 tgtcccccttgcacttccaaggagacttctctaaaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactaacaagagacttcaaa-tgctcaagc 16659248  T
Q  209 acaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||   |||||||||| |||||||    
T  16659247 acaatttcaagagactttctatgct 16659223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9007179 - 9007098
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9007179 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 9007098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 27882947 - 27883028
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27882947 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 27883028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 12396444 - 12396596
Alignment:
Q  82 acaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgt--aatatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| | || | || ||||||||||||||||||| |||| |||     | ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  12396444 acaggatccttccacaaaccggaagtag-tcctatctcccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcactatctgattacaattgctcactgctaaa 12396542  T
Q  180 cttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
      ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  12396543 aatagcaagagacttcaaattactcaagcacaactacaagagattttctatgct 12396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Original strand, 15848513 - 15848650
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  15848513 ttatactggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 15848611  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15848612 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 15848650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 17960968 - 17961036
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  17960968 agacacaagcaatttatactggttccttccacaatccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaag 17961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 21735707 - 21735802
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaa-agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  21735707 aaaacagagcaaagaaaagaaagagagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 21735802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Original strand, 6174684 - 6174774
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||  ||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6174684 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgtttcttccataaaccggaagtagttc-tgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 6174774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8996652 - 8996546
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaa-aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  8996652 ataaaacagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaatt-attttggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 8996555  T
Q  138 cgttcacta 146  Q
      |||||||    
T  8996554 atttcacta 8996546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13199917 - 13199847
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  13199917 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 13199847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 21316925 - 21316992
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21316925 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 21316992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29948016 - 29947945
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29948016 agacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29947945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29997170 - 29997099
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29997170 agacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29997099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31114662 - 31114592
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  31114662 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 31114592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 4403840 - 4403921
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4403840 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 4403921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11206742 - 11206661
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11206742 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 11206661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11217393 - 11217312
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11217393 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 11217312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17282134 - 17282033
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaa-agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  17282134 gcggataaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcagaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaa 17282037  T
Q  134 ggag 137  Q
    ||||    
T  17282036 ggag 17282033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19121509 - 19121428
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19121509 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19121428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24707224 - 24707143
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24707224 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 24707143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 48336808 - 48336889
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48336808 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 48336889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 4433347 - 4433408
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4433347 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 4433408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 13147650 - 13147722
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  13147650 aaagacacatgcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 13147722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19888002 - 19887941
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19888002 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19887941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24776205 - 24776164
Alignment:
Q  191 acttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24776205 acttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 24776164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 28168697 - 28168758
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28168697 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 28168758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 11163418 - 11163478
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11163418 gttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 11163478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14077952 - 14077919
Alignment:
Q  200 tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14077952 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14077919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14258712 - 14258652
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14258712 gttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 14258652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770460
Alignment:
Q  200 tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22770460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29461860 - 29461800
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29461860 gttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 29461800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29906851 - 29906780
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29906851 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29906780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 51989846 - 51989751
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaa-agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  51989846 aaaacagagtaaagaaaagaaagagagacacaagcaatt-atactgattccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 51989751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 933192 - 933274
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  933192 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 933274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 1053274 - 1053344
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  1053274 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 1053344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 16076494 - 16076564
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  16076494 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 16076564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16305836 - 16305781
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  16305836 ttatacaggttccttccacaattcggaagt-agacctgtcccccttgcacttccaag 16305781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19885866 - 19885814
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagt 107  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19885866 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccggaagt 19885814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13431449 - 13431251
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13431449 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcactttcaag 13431350  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13431349 gggagttcactatgtaatatctgattgcaaatgctcactactaaacttagtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13431251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14990920 - 14990723
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  14990920 gcggataaaacagagagagagagagaagaaagacaccagcaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaag 14990821  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14990820 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14990723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 22673141 - 22673318
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22673141 gagagagaaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 22673240  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22673241 ctgattacaaatgctcactactaaacttattaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22673318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14990305 - 14990112
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14990305 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacagattccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 14990210  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14990209 gagagttcactatataatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14990112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18152485 - 18152310
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18152485 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 18152386  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18152385 ctgattacaaatgctcattactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 18152310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 43639124 - 43639301
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43639124 gagagaagaaagatacaatcaatttatacatgttccttccacaact-ggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 43639222  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43639223 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 43639301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 22662428 - 22662606
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22662428 gagagagaaaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 22662527  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctc-aagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22662528 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22662606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40846198 - 40846018
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40846198 gagagaagaaagacacaatcaatttatacaagtttcttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 40846099  T
Q  155 c---ttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40846098 ctgattattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 195
Target Start/End: Original strand, 6407079 - 6407239
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6407079 gcggataaaacagagatagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacataccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 6407178  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttc 195  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6407179 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttc 6407239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33561038 - 33560846
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgt 140  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33561038 aaaacagagagaaagagagaagcaagacataagcaatttatacaggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagt 33560939  T
Q  141 tcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33560938 tcactatgtaatatctgattacaaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgct 33560846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17442627 - 17442450
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17442627 gagagaagaaagacacagagaaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccgaggagagttcactatgtaatat 17442528  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17442527 ctgattacaattgctcactactaaaaatagaaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17442450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 45292166 - 45292354
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||        || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45292166 gcggataaaacagggagaaagagagaagagagacacaagtaatttatacaggttc--------aaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 45292257  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  45292258 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctca--gacaactgcaagagacttcctatgct 45292354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15336891 - 15336718
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatctta 158  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||| |    
T  15336891 aaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 15336792  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15336791 ttgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15336718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15425956 - 15425783
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatctta 158  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||| |    
T  15425956 aaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 15425857  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15425856 ttgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15425783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15517260 - 15517087
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatctta 158  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||| |    
T  15517260 aaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 15517161  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15517160 ttgcaatttctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15517087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 43773470 - 43773639
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattaca 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43773470 aagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattaca 43773569  T
Q  164 aatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| || |||||  ||| |||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43773570 aatgctctctgctaaaactagcaagagatttcaacttgcttaagcacaactgcaagatacttcctatgct 43773639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 39692901 - 39693054
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaa 178  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39692901 tatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactatgtaatatctgattacaactgctcactcctaa 39693000  T
Q  179 acttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39693001 aactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 39693054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 19942580 - 19942757
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  19942580 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccgaaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 19942677  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19942678 tctgattacaactgctcactgctaaacttagaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19942757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 29692676 - 29692833
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  29692676 ttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactactcacta 29692775  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29692776 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 29692833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45539246 - 45539068
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  45539246 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactacgtaata 45539148  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac-aacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  45539147 tcttattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaaactgcaagagacttcatatgct 45539068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 17796763 - 17796941
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17796763 gagagaagaaagacacaaaacagttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccatgtaatat 17796862  T
Q  155 cttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17796863 ctgattacaattgctcactactaaaaactagcaagagacttcaaa-tggtcaagcacaactgcaagagacttcttatgct 17796941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 21932224 - 21932402
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21932224 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atagaggttactttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaata 21932322  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21932323 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaacatacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 21932402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30422211 - 30422086
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30422211 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatataata 30422112  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  30422111 tctgattacaattgctcacaactaaa 30422086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 16206612 - 16206781
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16206612 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 16206709  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||  ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16206710 tctgattacaattgctcaatgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaacagcaagagacttc 16206781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23264410 - 23264257
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  23264410 ttatataggttccatccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 23264311  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23264310 aaactagcaagagacttcaa--tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23264257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 25163435 - 25163589
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25163435 ttatacaggttccttccataaaccggaagtaga-cttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcacta 25163533  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25163534 ctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctat 25163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 9319909 - 9320090
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  9319909 gagagaagaaagacacaaaacaatttatacaggttcataccataaaccggaagtcagacctatcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagta 9320008  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9320009 atatctgattacaattgctcactgctaaactttgcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 9320090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12758546 - 12758367
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||   ||||    
T  12758546 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcactgttaaggagagttcactaaaatgta 12758449  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12758448 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagactttaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 12758367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18121918 - 18121738
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc---actatgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  18121918 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactactatgta 18121820  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||   |  |||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18121819 atatctgattacaattgctcactgctaaaaccatcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactacaagagacttcctatgct 18121738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15934471 - 15934290
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||    
T  15934471 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgt 15934374  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  15934373 aatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcctatgct 15934290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17526543 - 17526366
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  17526543 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttttacaaaccggaagtcaattatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 17526445  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17526444 tctgattacaactgctcactgctaaacatagcaagagagttcaaa-tgctgaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17526366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16682040 - 16681883
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16682040 ttatacaagttctttccacaaaccagaagtcactcctgtccaccttgcacttctaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 16681941  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  16681940 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaaacacagctgcaagagacttcctatgct 16681883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 1744528 - 1744639
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  1744528 gagagaagagagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatat 1744627  T
Q  155 cttattacaaat 166  Q
    || |||||||||    
T  1744628 ctgattacaaat 1744639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 18679140 - 18679335
Alignment:
Q  38 gataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18679140 gataaaatagagaaa--gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccataaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacatccaagga 18679235  T
Q  137 gcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
      ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  18679236 cagttcactaaaaatgtaatatctgattacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatt-ctcaaacacaacttcaagagacttcctatgc 18679334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 18718329 - 18718524
Alignment:
Q  38 gataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18718329 gataaaatagagaaa--gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccataaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacatccaagga 18718424  T
Q  137 gcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
      ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  18718425 cagttcactaaaaatgtaatatctgattacaaatgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaatt-ctcaaacacaacttcaagagacttcctatgc 18718523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 36104681 - 36104771
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36104681 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagggttcact 36104771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20256342 - 20256141
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  20256342 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaaatag-tcatgtctcccttgcacttccaa 20256245  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac-agcaagagacttccta 229  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | | ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  20256244 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacccaagcacaacttgcaagagatttccta 20256145  T
Q  230 tgct 233  Q
    ||||    
T  20256144 tgct 20256141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19957161 - 19956966
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg 139  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||| |    
T  19957161 aaaatagagagagggagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtagccc-tatcccccttgcacttccaaggagag 19957064  T
Q  140 ttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaa-ttgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19957063 ttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttaaaacttactcaatcacaactgcaagagatttcctatgct 19956966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18321984 - 18321787
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||   | ||||||| |||| || |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  18321984 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaagtaattatacatgttcctttcacaaaccggaagtagtt-atgtcccccttgcacttccaag 18321888  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||  ||| |||   | ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18321887 gaaagtttactaaaaagtaatatctgaatacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcac-actgcaagagatttcctatg 18321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 19153432 - 19153547
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  19153432 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacctcaaa-tgctcaagcac 19153530  T
Q  211 aacagcaagagacttcc 227  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19153531 aactgcaagagacttcc 19153547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 26832420 - 26832597
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgt---aata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||||    
T  26832420 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaacaggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaagaaaata 26832517  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26832518 tctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26832597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 21287766 - 21287927
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  21287766 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 21287865  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||    
T  21287866 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgct 21287927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 21298346 - 21298507
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  21298346 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 21298445  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  21298446 atactacacctagtatgagacttcaaattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgct 21298507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45568705 - 45568544
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  45568705 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 45568606  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  45568605 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgct 45568544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 18772056 - 18772214
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||    | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18772056 ttatacaggttcctttcacaaaccagaagtag-tcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcactaaaaaagtaatatctgattacaactgctcact 18772154  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||   ||| |||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18772155 gctaacactagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagatttcctatgct 18772214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 19706880 - 19707002
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  19706880 ttatacaggttccttccacaaatcgaaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctaattacaacttctcact 19706978  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaa 197  Q
     |||||  ||| |||| |||||||    
T  19706979 cctaaaactagcaagagacttcaa 19707002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20383147 - 20383066
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20383147 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggag 20383066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Original strand, 21540312 - 21540390
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21540312 aaagacacatgcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttc 21540390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 43644261 - 43644416
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| | || || |||||||||| |||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||| ||||||||     
T  43644261 ttatacatgttccttccacaatccggaagtag-tcctgccccccttgcaattccaaggagagttcactaaaatataatatctgattacaactgctcactg 43644359  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||   |  |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  43644360 ctaaaaccaacaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagattttctatg 43644416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24679174 - 24679107
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24679174 ttatacaggttccttccacaatctggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24679107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 2810285 - 2810379
Alignment:
Q  130 ccaaggagcgttcactat--gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2810285 ccaaggagagttcactaaaagtaatatttgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactgctcaagcacaactgcaagaga 2810379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 1744635 - 1744673
Alignment:
Q  195 caaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1744635 caaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1744673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 233
Target Start/End: Original strand, 24645779 - 24645851
Alignment:
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24645779 tacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 24645851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15969595 - 15969525
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15969595 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtag-tccggtcccccttgcacttccaaggag 15969525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Original strand, 17928483 - 17928519
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17928483 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 17928519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25850775 - 25850708
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25850775 ttatacatgttccttccacaatccggaagttg-tcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 25850708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16376141 - 16376022
Alignment:
Q  56 agagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaata 153  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |   ||||    
T  16376141 agagaagaaagacacaa-caatt-atataggtttcttccacaaaccggaagtag-tcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatcaata 16376045  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactact 176  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  16376044 tctgattacaactgctcactact 16376022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 18153315 - 18153396
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18153315 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 18153396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Original strand, 22707777 - 22707852
Alignment:
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  22707777 attacaaatgctcactgctcaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagattccctatgct 22707852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23270641 - 23270560
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23270641 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 23270560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40213871 - 40213790
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40213871 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40213790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 19224532 - 19224593
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19224532 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19224593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Original strand, 29378961 - 29379029
Alignment:
Q  67 acacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29378961 acacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29379029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Original strand, 28902839 - 28902895
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28902839 ggttccttccacagatcggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggagagttc 28902895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 3843100 - 3843170
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  3843100 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 3843170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17519857 - 17519787
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17519857 agacacaagcaatt-atactggttccttccaaaaaccggaagtagttca-gttccccttgcacttccaaggag 17519787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19506141 - 19506063
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttca 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19506141 aaagacacaagcaatt-atacaggttacttcgacaatccggaagtag-tcatgttccacttgcacttccaaggagagttca 19506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20161934 - 20161852
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20161934 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcagaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20161852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22136564 - 22136494
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22136564 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 22136494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22167729 - 22167659
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22167729 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 22167659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Original strand, 39692862 - 39692902
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgta 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  39692862 gtcatgtcccccttgcactttcaagaagagttcactatgta 39692902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22801782 - 22801993
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtc 117  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22801782 gttcagaactagttgcagcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtc 22801877  T
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagca 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22801878 ccccttgcacttccaaggagtgttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgca 22801977  T
Q  218 agagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  22801978 agagacttcctatgct 22801993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 16494671 - 16494869
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16494671 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 16494770  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16494771 gggagttcactgtgtaatatctgattgcaaatgctcactactaaacttagtaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16494869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 40331131 - 40331309
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40331131 gagagaagaaagacacaagcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 40331230  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40331231 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40331309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 44839757 - 44839955
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44839757 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaag 44839856  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44839857 gagaattcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 44839955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 40331438 - 40331631
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40331438 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttcctcccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaag 40331532  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40331533 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 40331631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45087735 - 45087562
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatctt 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  45087735 agaagaaagacacaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagacagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactacgtaatatctg 45087636  T
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45087635 attacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 45087562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34322709 - 34322511
Alignment:
Q  30 ttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcactt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34322709 ttgtagcggataaaacagaga----gagagaagaaatacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactt 34322614  T
Q  130 ccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34322613 ccaaagagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttccta 34322515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28551674 - 28551497
Alignment:
Q  56 agagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatc 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28551674 agagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcgctatgtaatatc 28551575  T
Q  156 ttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28551574 tgattgcaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 28551497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22782371 - 22782193
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22782371 gagagaagaaagacacatgcaatttatacaggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatat 22782272  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22782271 ctgattacaaatgctcactacaaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcataactgcaacagacttcctatgct 22782193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22786411 - 22786233
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22786411 gagagaagaaagacacatgcaatttatatgggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagtttactatgtaatat 22786312  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22786311 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatgct 22786233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28701949 - 28701791
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28701949 caatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcact 28701850  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28701849 actaaacttagtaagaaacttcaaatt-ctcaagaacaactgcaagagacttcctatgct 28701791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1587810 - 1587610
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaag--gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtccccc-ttgcacttcc 131  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  1587810 gcggataaaacagagagaggaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccccttgcacttca 1587711  T
Q  132 aaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1587710 aaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgttcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tcctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 1587612  T
Q  232 ct 233  Q
    ||    
T  1587611 ct 1587610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28712435 - 28712277
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28712435 caatttagacaggttccttccataaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaattgctcact 28712336  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28712335 actaaacttagtacgagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28712277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22188868 - 22188681
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcac 144  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22188868 agagaaagagagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggtttcttccacaaaccggaaatcagttttgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22188770  T
Q  145 tatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22188769 tatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22188681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30558080 - 30557898
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  30558080 gagagaagaaagacacaaatcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagta 30557981  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30557980 atatctgattacagttgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30557898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6574854 - 6574675
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  6574854 gagagaagaaagacacaaagccatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttactatttaata 6574755  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6574754 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctaaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 6574675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20152759 - 20152578
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20152759 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagttagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 20152660  T
Q  154 tcttattacaa--atgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||  |  |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20152659 tctgattacaattactctcactgctaaaactagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttactatgct 20152578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13964707 - 13964556
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  13964707 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcaccatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 13964608  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||   | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13964607 aa---actaagagacttcaaa-tgctcaagcgcaactgcaagagacttcctatgct 13964556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31801645 - 31801465
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   | |||    
T  31801645 gagagaagaaagacacaaaacaatttatacagattctt-ccacaaaccggaagtcattcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaaagta 31801547  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31801546 atatctgattacaattgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31801465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 24376453 - 24376631
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaat 152  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||    
T  24376453 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaaatgtaat 24376550  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24376551 atctgattacaactgctcacttctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 24376631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 22316939 - 22317114
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22316939 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaaaatct 22317037  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||||| |||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22317038 gattacaattgctcactgctaaaactagcaagtgacttcagattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22317114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20569504 - 20569327
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  20569504 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 20569406  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20569405 tctgattacaactggtcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20569327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 33073621 - 33073749
Alignment:
Q  104 aagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgct 203  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  33073621 aagtcagtcttgtcccccttgcacttccaattagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactttaaa-tgct 33073719  T
Q  204 caagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33073720 caagcacaactgcaagagatttcctatgct 33073749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 22257568 - 22257724
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22257568 ttatataggttccttccacaaatcggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaattacaactgctcactg 22257666  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22257667 ctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcccaactgcaagagacttcctatgct 22257724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35744710 - 35744555
Alignment:
Q  77 tttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact 176  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||    
T  35744710 tttatacatgtcccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcgatact 35744611  T
Q  177 aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || | |||||| |||||||    
T  35744610 aaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgccaaagactttctatgct 35744555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 23234376 - 23234530
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  23234376 ttatacaggttccttctacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactgcta 23234475  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23234476 aaactagcaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcttatgct 23234530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 38780741 - 38780918
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38780741 gagagaagaaagacacaaaacaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatattccccttgcatttcgaaggagagttcactatgtaatat 38780840  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  ||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38780841 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaacagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 38780918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 19539763 - 19539940
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | | || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  19539763 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaaatag-tcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 19539860  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19539861 tctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 19539940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26367182 - 26366984
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26367182 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagatacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaatcgaaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaa 26367087  T
Q  134 ggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26367086 ggagagttcactaaaatgtaatatcttattacaactgttcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctat 26366987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 24575358 - 24575558
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||| | ||||| ||||||||||||    
T  24575358 gcggataaaacagagatagagaaagaagaaagatacaaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaa 24575456  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24575457 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 24575555  T
Q  231 gct 233  Q
    |||    
T  24575556 gct 24575558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24851419 - 24851239
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  24851419 gagagaagaaagacacaaagatattatagaggttccttccacaaatcggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 24851321  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24851320 tatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttcctatgct 24851239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 25188766 - 25188923
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  25188766 tatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgc 25188865  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||  ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  25188866 taaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgct 25188923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25037995 - 25037838
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  25037995 ttatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 25037896  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||   || |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25037895 ctaaaacaagcaagagacttc-aagtgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 25037838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31328712 - 31328540
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatg--taatatcttat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||| ||    
T  31328712 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaagagaagttcactaaaaataatatctgat 31328613  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31328612 tacaattgttcaatactaaacttagtacgagacttcaaa-tgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 31328540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31335433 - 31335261
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatg--taatatcttat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||| ||    
T  31335433 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaagagaagttcactaaaaataatatctgat 31335334  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31335333 tacaattgttcaatactaaacttagtacgagacttcaaa-tgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 31335261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39038414 - 39038217
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||   | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  39038414 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagatacaaatcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaag 39038319  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||| | || ||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39038318 gagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcattgcttaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatg 39038219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22455693 - 22455534
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22455693 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 22455594  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac-agcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | | ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22455593 ctaaaactagcaagagacttcaaactacccaagcacaacttgcaagagatttcctatgct 22455534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 18702107 - 18702254
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18702107 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaattgctcact 18702205  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
     |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18702206 gctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagaga 18702254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 6392006 - 6392150
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagc-aatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  6392006 gagagaagaaagacacaaatgaatttttacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaaagta 6392105  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttc 195  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6392106 atatctgattacaattgctcactgctaaacttagcaagaaacttc 6392150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28141335 - 28141178
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||| || |||| | ||||||    
T  28141335 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgatcacaactactcact 28141237  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28141236 gctaaaactagcaagagacttcaaa-tactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10010524 - 10010328
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||| |||    
T  10010524 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttacactttcaa 10010431  T
Q  134 ggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||| ||||||||    |||||||| | ||||||| ||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10010430 ggagagttcactaaaaatgtaatatttgattacaactgcccactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gttcaagcacaactgcaagagacttccta 10010332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 40781823 - 40781999
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||  || ||||||||   |||||||    
T  40781823 agaataaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaataagagttcactaaaatgtaata 40781920  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40781921 tctgattacaactgctcactcctaaaactagcaagagacttccaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 40781999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 22271497 - 22271656
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta-----tgtaatatcttattacaaatgctcac 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||||||| |||||||    
T  22271497 ttatataggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcactaaaaagtgtaatatcttattacaactgctcac 22271595  T
Q  173 tactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22271596 tgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 22271656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 25828509 - 25828684
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatat 154  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  25828509 agaagaaagacacaaaccaattatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatat 25828606  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  25828607 ctgattacaactgctcactgctaaaactagcaatagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcttatgct 25828684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23185022 - 23184878
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaa 187  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| || ||  ||| ||    
T  23185022 ttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctcaaactagcaa 23184924  T
Q  188 gaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23184923 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 23184878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23596285 - 23596141
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaa 187  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| || ||  ||| ||    
T  23596285 ttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctcaaactagcaa 23596187  T
Q  188 gaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23596186 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 23596141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41122441 - 41122262
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  41122441 gagagaagaaagacacaa-caatt-atgcagattcctttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaa 41122344  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  41122343 tatctgattacaattgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagatatttcctatgct 41122262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 14580932 - 14581080
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctc 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||       ||| ||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14580932 aagcaatttatacaggttccttccacaa-------gtcagttctgtcccccttgcacttataaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctc 14581024  T
Q  171 actactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||       | ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  14581025 actactaaact-------agacttcaaattgttcaaccacaactgcaagatacttcctatgct 14581080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 1083368 - 1083540
Alignment:
Q  66 gacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttat 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | |||||    
T  1083368 gacacaagcaatt-atacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttat 1083466  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  1083467 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 1083540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18431694 - 18431514
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | || ||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||   |||||    
T  18431694 gagagaagaaagacacaaaacaattgtacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtccccgttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaa 18431596  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||| |||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  18431595 tatctgattacaactgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagtacaactgcaagagattttctatgct 18431514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31968526 - 31968460
Alignment:
Q  67 acacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31968526 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtccccattgcacttccaa 31968460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Original strand, 24838449 - 24838624
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||    
T  24838449 gagagaagaaagacacaaatcaattatacatgttccttccacaaatcggaagttgtt-atgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaat 24838547  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||| |||||||  | ||||| || ||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24838548 atctgattacaacagttcactgctcaaaataggaagagacttcaaaatactcaagcacaactgcaagagatttccta 24838624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 24778774 - 24778896
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  24778774 tgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacgactgttcactgctaaatttagcaagagacttcaaattactcaagcac 24778873  T
Q  211 aacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||| ||| ||||||||||    
T  24778874 agctgcaatagatttcctatgct 24778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 27296842 - 27296954
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    || ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  27296842 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgcaatatctcattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagca 27296941  T
Q  210 caacagcaagaga 222  Q
    |||| ||||||||    
T  27296942 caactgcaagaga 27296954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21537959 - 21537852
Alignment:
Q  38 gataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    ||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  21537959 gataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaagga 21537862  T
Q  137 gcgttcacta 146  Q
    | ||||||||    
T  21537861 gagttcacta 21537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26623187 - 26623083
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  26623187 ttatacatgttctttccacaaactggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcattaaaaatgcaatatctgattacaactgctcact 26623089  T
Q  174 actaaa 179  Q
    ||||||    
T  26623088 actaaa 26623083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23393412 - 23393242
Alignment:
Q  66 gacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt-aat---atcttatt 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||   | || |||    
T  23393412 gacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgatt 23393315  T
Q  161 acaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  23393314 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 23393242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17963965 - 17963844
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||   |||||||| | ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17963965 tgtcccccttgcacttttaaggaaagttcactaaaatgtaatatttgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaagcac 17963867  T
Q  211 aacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  17963866 aactgcaagagatttcctgtgct 17963844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15671276 - 15671240
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15671276 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15671240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20647302 - 20647232
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  20647302 agacacaggcaatt-atactggttctttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 20647232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24802282 - 24802224
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  24802282 ttatactggttctttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 24802224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28722003 - 28721922
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28722003 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 28721922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 30794350 - 30794431
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30794350 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 30794431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 2561028 - 2561100
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  2561028 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 2561100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28732569 - 28732508
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28732569 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 28732508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24815249 - 24815112
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  24815249 ttataccggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 24815151  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24815150 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 24815112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27979049 - 27978989
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27979049 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 27978989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Original strand, 44880673 - 44880731
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||||| |||||||    
T  44880673 gtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaa 44880731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17970956 - 17970886
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  17970956 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtag-tctagtcccccttgcacttccaaggag 17970886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19303114 - 19303044
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  19303114 agacacaagcaatt-atcctggttccctccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 19303044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19313680 - 19313610
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  19313680 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 19313610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 19355857 - 19355927
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  19355857 agacacaagcaatt-atcctggtttcttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 19355927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19498653 - 19498583
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  19498653 agacacaagcagtt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 19498583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 21845564 - 21845596
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21845564 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21845596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 22382852 - 22382919
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22382852 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtccccctggctcttccaaggagagttcacta 22382919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 22754873 - 22754924
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  22754873 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 22754924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22915552 - 22915470
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22915552 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 22915470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28065577 - 28065518
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28065577 gttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 28065518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36785487 - 36785417
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  36785487 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 36785417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 40221872 - 40221954
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40221872 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40221954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17399440 - 17399264
Alignment:
Q  57 gagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17399440 gagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct 17399341  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17399340 gattacaaatgctcactactaaacttagtaagagtcttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17399264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3106202 - 3106008
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3106202 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaag 3106107  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3106106 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgttcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 3106008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 40859994 - 40860195
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40859994 gcggataaaacagaaagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaag 40860093  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgcta 234  Q
    | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40860094 gggagttcactatgtaatatctgattaaaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgcta 40860193  T
Q  235 ct 236  Q
    ||    
T  40860194 ct 40860195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 22190169 - 22190367
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  22190169 gcggataaaacaaagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgttcccgttgcacttccaag 22190268  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22190269 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 16939344 - 16939521
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16939344 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 16939443  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16939444 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16939521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 56533829 - 56533651
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56533829 gagagaagaaagacacaagcaatttgtacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcttccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 56533730  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56533729 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 56533651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 6516831 - 6517008
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6516831 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 6516930  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6516931 ctgattaaaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 6517008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9752321 - 9752129
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgt 140  Q
    |||||| ||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  9752321 aaaacatagagaaagagagaagcaagacacatgcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtcccccttgcacttccaagaggagt 9752222  T
Q  141 tcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9752221 tcactatgtaatatctgattacaaatgctcaatactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacatcctatgct 9752129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27189401 - 27189233
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  27189401 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaagaggagttcactatgtaatatctgattacaa 27189302  T
Q  165 atgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27189301 atgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 27189233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3500439 - 3500242
Alignment:
Q  35 gcggataa-aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  3500439 gcggataagaacagagagaaagagagaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgtacttccaa 3500341  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3500340 ggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaatttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 3500242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17701543 - 17701345
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  17701543 gcggataaaacagggagaaagagaaaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaat 17701444  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17701443 gagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactactaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17701345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 55731191 - 55731368
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55731191 gagagaagaaaaacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 55731290  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55731291 ctgattacaaatgttcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgct 55731368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 19884076 - 19884247
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19884076 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 19884174  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19884175 tctgattacaattgctcactactaaaattagcaagaaacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 19884247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14154779 - 14154584
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14154779 gcggataaaacagagaaa----gagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 14154684  T
Q  135 gagcgttcacta--tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    |||  |||||||  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14154683 gagaattcactaggtgtaataactgattacaaatgttcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgc 14154585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13576884 - 13576705
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13576884 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactatgtaata 13576785  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| | |||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13576784 tctgattacaatttctcattgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 20976793 - 20976979
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  20976793 agagaaaag-agagaagaaagatacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaggagttcact 20976891  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20976892 atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20976979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 233
Target Start/End: Original strand, 45832731 - 45832907
Alignment:
Q  56 agagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45832731 agagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 45832829  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45832830 ctgattacaattgctcactgctaaacctagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 45832907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 16631806 - 16631963
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16631806 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatcttattacaaatgctcactg 16631905  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16631906 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagaaacttcctatgct 16631963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 16852854 - 16853026
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||    
T  16852854 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctgat 16852953  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16852954 tacaattgctcactactaaatttagtaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16853026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 38513251 - 38513429
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  38513251 gagagaagaaagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttacacttccaagaggagttcactatgtaatat 38513350  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| | |||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38513351 ctgattacaattactcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 38513429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 56033916 - 56034094
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  56033916 gagagaagaaagacacaaaacaattatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatat 56034015  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| || |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  56034016 ctgattaaaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 56034094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 16847898 - 16848070
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttat 159  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||    
T  16847898 aaagacacaaagaaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctgat 16847997  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16847998 tacaattgctcactactatatttagtaagagacttcaaa-tgcacaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16848070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22676267 - 22676114
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  22676267 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgttcactgcta 22676168  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22676167 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgtaagagacttcctatg 22676114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 54679271 - 54679446
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54679271 gagagagaaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 54679369  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    ||| |||| || |||||||| || |||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54679370 tctgattagaattgctcactgctaaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 54679446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Original strand, 55379637 - 55379834
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  55379637 ggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaacggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaagga 55379733  T
Q  137 gcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    | ||||||||    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  55379734 gagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgc 55379833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 29120708 - 29120887
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||    
T  29120708 gagagaagagagacacaaagcaatttatacaggttccttctacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagaattctctaagtaata 29120807  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29120808 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29120887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 19665711 - 19665888
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag--gagcgttcactatgtaatat 154  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  19665711 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagagtttactatgtaatat 19665809  T
Q  155 cttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19665810 ctgattacaactgctcactgctaaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 19665888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37436301 - 37436128
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     |||||    
T  37436301 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttca-----taata 37436207  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||| ||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37436206 tctgattacaattgcttactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 37436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 8103627 - 8103808
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  8103627 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagta 8103726  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8103727 atatttgattacaattgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaaggacaactgcaagagacttcctatgct 8103808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39420492 - 39420348
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  39420492 gcggataaaactgagagaaagagagaagaaggacacaaataatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaag 39420393  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  39420392 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 39420348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 10072300 - 10072455
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | |||    
T  10072300 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcgaaggagagttcattatgtaatatatgattacaattgctcattgcta 10072399  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10072400 aaactatcaaaagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 10072455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14605670 - 14605493
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  14605670 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 14605572  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  14605571 tctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcgcaactgcaagagacttcatatgct 14605493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 11900534 - 11900714
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  11900534 gagagaagaaagacacaaagtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 11900632  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| | |||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11900633 tatctaattacaattactcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 11900714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 6641028 - 6641206
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  6641028 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccg-aagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 6641125  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6641126 tatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 6641206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19611075 - 19610939
Alignment:
Q  81 tacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaac 180  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||     
T  19611075 tacaggttctttccacaaactggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaactgctcactgctaaaa 19610976  T
Q  181 ttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaa 218  Q
     ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19610975 ctagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaa 19610939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 11915067 - 11915225
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |    
T  11915067 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaaatgtaatatcttattacaattgctcatt 11915165  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11915166 gctaaaactagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 11915225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 3395016 - 3395165
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  3395016 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtag-tcatgtccctcttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctgattacaattgctcactg 3395114  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3395115 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcataactgcaagagacttc 3395165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25651784 - 25651684
Alignment:
Q  132 aaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25651784 aaggagagttcattatgtaatatcttattacaattgctcactactaaatttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagatttcctatg 25651686  T
Q  232 ct 233  Q
    ||    
T  25651685 ct 25651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15015136 - 15014973
Alignment:
Q  72 agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatg 167  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||    
T  15015136 agcaattt-tacaggttccttccacaaatcggaagtag-tcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctaattacaactg 15015039  T
Q  168 ctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15015038 ctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaattgcaagagatttcctatgct 15014973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15475849 - 15475733
Alignment:
Q  117 cccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15475849 cccccctgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaattgctcaatgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgc 15475750  T
Q  217 aagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  15475749 aagagacttcctatgct 15475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14190169 - 14190088
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14190169 agacacaaacaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17788785 - 17788633
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17788785 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatttgattacaactgctcact 17788687  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
     |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  17788686 gctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcc 17788633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19912624 - 19912468
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  19912624 ttatacaggttccttctacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcattttcaaggagagttcagtaaaatgtaatatctaattacaactgctcactg 19912526  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19912525 ctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaagcactactgcaagagacttcctatgct 19912468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14905017 - 14904892
Alignment:
Q  101 cggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaat 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||  |||| ||||||||     
T  14905017 cggaagtcagtcttgtcccccttgtacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaacctatcaagagacttcaaa- 14904919  T
Q  200 tgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||    
T  14904918 tgctcaagcacaactgcaagatacttc 14904892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 23749849 - 23750047
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  23749849 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacagattccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaa 23749944  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||| || | |||||||    
T  23749945 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgttcactgttaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggatatttcctat 23750044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41115522 - 41115344
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaat 152  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||    
T  41115522 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttcctcaaaccggaagtagccc-tgtcccccttgcacttccaaggagagttcactgaaaatgtaat 41115425  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || | ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41115424 atttgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagactttaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 41115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 12600126 - 12600280
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  12600126 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 12600224  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  12600225 ctacac-tag-aagagacttcaaa-tgctcaaccacaactgcaagagatttcctatgct 12600280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Original strand, 36470335 - 36470425
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaa 165  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  36470335 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaaa 36470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 164
Target Start/End: Original strand, 23120903 - 23120989
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaa 164  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  23120903 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtttgtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaatatctaattacaa 23120989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8686211 - 8686029
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta-----tgt 149  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||     |||    
T  8686211 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcctgccccccttgcactttcaaggagagttcactaaaaaatgt 8686113  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  8686112 aatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttaaaactactcaagcacaactacaagagatttcccatgct 8686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16476123 - 16475966
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||||  |||| || || | |||    
T  16476123 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaaatgtaatatcggattataactgtttact 16476025  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16476024 actaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcac-acaacaagagatttcctatgct 16475966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37986357 - 37986200
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcc-aaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||   |||||| ||||||||   |||||||||  ||||||| || |||||    
T  37986357 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcactttataaggagagttcactaaaatgtaatatccgattacaattgatcact 37986259  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  37986258 gctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagatttcgtatgct 37986200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 15135095 - 15135253
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||  |||||| |     
T  15135095 ttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaattacagctgctcattg 15135194  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
      |||  ||| |||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15135195 tgaaaactagcaagagacttcaaacaactcaagcacaacaacaagagatttcctatgct 15135253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 13693199 - 13693280
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13693199 aaagacacaagcaatt-atacaggttccttccataatccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29681261 - 29681159
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| | ||||||| | ||||||     
T  29681261 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatatgattacaacttctcactg 29681163  T
Q  175 ctaa 178  Q
    ||||    
T  29681162 ctaa 29681159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 22089632 - 22089717
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcac 144  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22089632 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaattag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 171
Target Start/End: Original strand, 18773461 - 18773553
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||    
T  18773461 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccccttgccctttcaaggagagttcactaatcaatatctgattacaattgctca 18773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 18473433 - 18473500
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18473433 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 18473500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 11535428 - 11535509
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11535428 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 11535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19889739 - 19889657
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19889739 aaagacacaaagaaattatataggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19889657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 3370300 - 3370380
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3370300 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 3370380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 10290211 - 10290290
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10290211 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10290290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 10300120 - 10300199
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10300120 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10300199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14711453 - 14711383
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  14711453 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 14711383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14779117 - 14779047
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  14779117 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 14779047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18007763 - 18007693
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  18007763 agacacaggcaatt-atactggttctttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 18007693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 23508728 - 23508798
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23508728 agacacaagcaatt-atcctggttcattccacaaaccggaagtag-tcaagtcccccttgcacttccaaggag 23508798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40455024 - 40454942
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40455024 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40454942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40471262 - 40471180
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40471262 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 40471180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19143678 - 19143597
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19143678 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19143597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47152722 - 47152641
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47152722 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 47152641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 3390059 - 3390120
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3390059 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 3390120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 25656741 - 25656802
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25656741 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 25656802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 24713013 - 24713092
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24713013 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtccccattgcacttccaaggagatttcacta 24713092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10661911 - 10661844
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10661911 ttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcacta 10661844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10876056 - 10875989
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10876056 ttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcacta 10875989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14903157 - 14903090
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14903157 ttatacaggttccttccacaatccgaaagtag-tcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 14903090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16325205 - 16325173
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16325205 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16325173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16820023 - 16819953
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  16820023 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 16819953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18775357 - 18775287
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  18775357 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 18775287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20571739 - 20571672
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20571739 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcacta 20571672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210714
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  36210784 agacacaaacaatt-atactggttcgttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 36210714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18560 - 18349
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtc 117  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18560 gttcagaacaaattgcagcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtctctcatgtc 18465  T
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagca 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||    
T  18464 ccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaagttgctcaagcacagctgca 18365  T
Q  218 agagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  18364 agagacttcctatgct 18349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35932818 - 35932620
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35932818 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 35932719  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35932718 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttaaaattgctcaagcacaactgcaggagacttcctatgct 35932620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 10848096 - 10848296
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaa--aggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcca 132  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10848096 gcggataaaacagagagagaaagagagatgaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcca 10848195  T
Q  133 aggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10848196 aggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 10848295  T
Q  233 t 233  Q
    |    
T  10848296 t 10848296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 4886293 - 4886485
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4886293 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 4886388  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4886389 gaaagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaaacacaattgcaagagacttcctatg 4886485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 15516306 - 15516494
Alignment:
Q  44 acagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttca 143  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15516306 acagagaaagagagagaagaaatacacaagcaatttatacaggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttca 15516405  T
Q  144 ctatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15516406 ctatgtaatatctaattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15516494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30116619 - 30116450
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30116619 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 30116520  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30116519 aaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30116450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 33932575 - 33932792
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaagg--agagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatg 115  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||    
T  33932575 gttcagaactagttgcagcggataaaacagagagagagatagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttg 33932674  T
Q  116 tcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacag 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33932675 tcccccttgcacttccaaggagagttcactatgcaatatctgattacaaatgctcactactaaatttactaagagacttcaaattgctcaagcacaactg 33932774  T
Q  216 caagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33932775 caagagacttcctatgct 33932792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3246232 - 3246055
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3246232 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 3246133  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3246132 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgtttaagcacaactgcaagagacttcatatgct 3246055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28465120 - 28464951
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28465120 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 28465021  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28465020 aaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28464951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 30742328 - 30742506
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30742328 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggttcactatgtaatat 30742427  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30742428 ctgattacaaatgctcactattaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 30742506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 42243036 - 42243205
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  42243036 aaagacacaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactatataatatctgattac 42243135  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42243136 aaatgttcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 42243205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 9088316 - 9088493
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9088316 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactatgtaatat 9088415  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  9088416 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagtgcaactgcaagagacttcttatgct 9088493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29139195 - 29139018
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29139195 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatat 29139096  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29139095 cttattacaattgctccctactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 29139018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35987024 - 35986846
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  35987024 gagagaagaaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagttcactatgtaatat 35986925  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35986924 ctgattacaaatgttcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 35986846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 28138950 - 28139131
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28138950 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatat 28139049  T
Q  155 cttattacaaatgctcacta----ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28139050 ctgattacaattgctcactacgtgctaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 28139131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 26764850 - 26765028
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26764850 gagagaagaaagagataagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatataatat 26764949  T
Q  155 cttattacaaa-tgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26764950 ctgattacaaattgctcactactaaagttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgct 26765028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14087281 - 14087153
Alignment:
Q  105 agtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctc 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14087281 agtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctc 14087182  T
Q  205 aagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14087181 aagcacaactgcaagagactttctatgct 14087153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13736842 - 13736694
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  13736842 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaattgctcactacta 13736743  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13736742 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 13736694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 11993242 - 11993414
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||| ||    
T  11993242 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaagtattatctaat 11993341  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11993342 tacaattgctcactactaaacttagtaagagaattcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 11993414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 17814289 - 17814489
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17814289 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaa 17814387  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17814388 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgatcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctat 17814486  T
Q  231 gct 233  Q
    |||    
T  17814487 gct 17814489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7746500 - 7746306
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg 139  Q
    |||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  7746500 aaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagag 7746403  T
Q  140 ttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7746402 ttcactagaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagtcttcctatgct 7746306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6513241 - 6513043
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6513241 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 6513144  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| |||||||   ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6513143 gagagttcactataatgtagtatctgattacaactgctcactgctaaacatagcaagagactttaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 6513045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 33022008 - 33022189
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33022008 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaata 33022107  T
Q  154 tcttattacaaat--gctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33022108 tctaattacaattgcgctcactgctaaaactagcaagagacttcaagtttctcaagcacatctgcaagagacttcctatgct 33022189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31146415 - 31146255
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  31146415 gcggataaaacagagagaaagagataagaaagacacaggcaatttatactggttccttccacaaaccggaagtcaatgatatcccccttgcacttccaag 31146316  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttc 195  Q
    | | ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31146315 gggagtttactatgtaatatctaaatgcaaatgctcactactaaacttagtaagagacttc 31146255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 31487606 - 31487760
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  31487606 ttatacaggttccttccacagaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 31487705  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||  |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31487706 aaactacaaagagacttcaaa-tgctcaagcacagctgcaagagacttcctatgct 31487760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13546290 - 13546138
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||| | |||    
T  13546290 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgattacaatagctcaatgcta 13546192  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13546191 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 13546138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 21659538 - 21659735
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||   | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  21659538 gcggataaaatagagagaaagagagaagagagacacaaatcaattatactggttccttccacaaaccggaagtag-tctagtcccccttgcactttcaag 21659636  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||   ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21659637 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcattgctaagactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21659735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23413763 - 23413586
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||    
T  23413763 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttacacaaaccggaagtag-tcttgtccccctttcacttccaaggagagttcattaaaatgtaata 23413666  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23413665 tctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagaaacttcaaattactcgagcacaactgcaagagatttcctatgct 23413586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12353564 - 12353406
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12353564 ttatacatgttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaaatgctcactg 12353465  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  12353464 ctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataattgcaagagatttcctatgct 12353406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536910
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaactt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagtag-tcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaact 19536960  T
Q  183 agtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19536959 agcaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19536910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 31117247 - 31117403
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| ||||||| | ||||||     
T  31117247 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaatgtaatatctgattacaactactcactg 31117345  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31117346 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 31117403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 90192 - 90034
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||||| || |||||    
T  90192 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactgttcact 90094  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  90093 gctaaacttagctagagacttcaaattactaaagcacaactgcaagagatttcctatgct 90034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 643492 - 643312
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  643492 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaagttccttctacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 643394  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  643393 tatctgattacaactgctcactactaaaactagcaagaggcttcaaattactcaagcataactgcaagagatttcttatgct 643312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23392360 - 23392218
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaa 190  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | ||     
T  23392360 ttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggagttcactatgtaatatctgattacaattgctcacggctaaaactagcaggag 23392261  T
Q  191 acttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23392260 acttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23392218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22000796 - 22000650
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22000796 ttatacaggtttcttccacaaaccagaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 22000698  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagaga 222  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  22000697 ctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaattgcaagaga 22000650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25097595 - 25097438
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  25097595 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcactg 25097497  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25097496 ctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgct 25097438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25155565 - 25155408
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  25155565 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtccccctagcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcactg 25155467  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25155466 ctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaattgcaagagatttcctatgct 25155408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21100495 - 21100314
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||   |||||    
T  21100495 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcattactgtcccccttgcatttccaatgagagttcactaaaatgtaa 21100396  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21100395 tatctgattacaacggctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21100314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11208793 - 11208623
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcactatgta-----atatct 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     | | ||    
T  11208793 aaagacacatgcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaact 11208694  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcct 228  Q
     ||||||| |||||| ||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11208693 gattacaactgctcaatactacaactagtatgagacttcaaaatgctcaagcac-acagcaagatacttcct 11208623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21072962 - 21072846
Alignment:
Q  122 ttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaa 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21072962 ttgcacttccaatgagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaa 21072863  T
Q  219 gagacttcctatgctac 235  Q
    || | ||||||||||||    
T  21072862 gatatttcctatgctac 21072846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 23880434 - 23880591
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||     
T  23880434 ttatacaggttcctttcacaaaccggatgtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactactcactg 23880532  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |  ||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  23880533 ctacaactagcaagagacttcaaattactcaagcccaactgcaagagatttcctatgct 23880591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25112661 - 25112509
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  25112661 aaagacacaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 25112563  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25112562 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 25112509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25171752 - 25171600
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  25171752 aaagacacaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 25171654  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25171653 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 25171600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26766624 - 26766448
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||   |||||||    
T  26766624 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcactaagatgtaata 26766527  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |  ||||| |||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26766526 tctgattacaactaatcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaagtacaaatgcaagagacttcctatgct 26766448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 26783722 - 26783878
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  26783722 ttatacaggttccttcaacaaaccggaagtag-tattgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatgtaacatctgtttacaactgctcactg 26783820  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26783821 ctaaaactagaaagagacttcaaat-gctcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 26783878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21199768 - 21199612
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||   | |||||||| |||| || | |||||| |    
T  21199768 tatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcactttcgaggagagttcactaaaatttaatatctgattataactactcactgc 21199670  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21199669 taaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21199612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9399385 - 9399227
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||| | ||||      
T  9399385 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactactcaga 9399287  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||| |  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  9399286 gctacaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaggagatttcctatgct 9399227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 32160102 - 32160277
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  32160102 aaagacacatgcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 32160200  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||    
T  32160201 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgct 32160277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Original strand, 6498640 - 6498746
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  6498640 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccac 6498736  T
Q  134 ggagcgttca 143  Q
    |||| |||||    
T  6498737 ggagagttca 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 20968616 - 20968768
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgt-aatatcttattacaaatgctcactact 176  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    |    
T  20968616 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcctccttgcacttccaagcagagttcactaaatcaatatcttattacaaatgctcaagcat 20968714  T
Q  177 aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||   || |||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20968715 aaa---agcaagagacttccaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgct 20968768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 37395475 - 37395589
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgt 116  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||| | ||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  37395475 gttcagaactagttgcagcggataaaacagaaagaa--agagaagaaaaacacatagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatg- 37395571  T
Q  117 cccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37395572 cccccttgcacttccaag 37395589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23407455 - 23407403
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttc 89  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  23407455 ggataaaacagagagaaggagagaagaaagacacaggtaatttatacaggttc 23407403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31589710 - 31589643
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31589710 ttatacaggttcattccacaatccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 31589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36096413 - 36096343
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36096413 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggag 36096343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36097870 - 36097800
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36097870 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggag 36097800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39799632 - 39799542
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39799632 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgttccttccacaattcagaagtagc-catgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 39799542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Original strand, 25740631 - 25740664
Alignment:
Q  200 tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25740631 tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 25740664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 1108615 - 1108697
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1108615 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1108697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 1121373 - 1121455
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1121373 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1121455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19464761 - 19464679
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19464761 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19478791 - 19478709
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19478791 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 19478709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20215897 - 20215827
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  20215897 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 20215827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 23487908 - 23488079
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc-actatgtaatatctt----at 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||   |||      ||    
T  23487908 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagat 23488005  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  23488006 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 23488079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40033519 - 40033449
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  40033519 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 40033449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 233
Target Start/End: Original strand, 4886512 - 4886547
Alignment:
Q  198 attgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4886512 attgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 4886547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8522630 - 8522549
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8522630 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 8522549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20552604 - 20552523
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20552604 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20552523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23407234 - 23407153
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23407234 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 23407153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Original strand, 23477828 - 23477903
Alignment:
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  23477828 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 23477903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 24925609 - 24925690
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24925609 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 24925690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Original strand, 24982890 - 24982971
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24982890 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 24982971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36085249 - 36085168
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36085249 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 36085168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36229527 - 36229446
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36229527 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 36229446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20563094 - 20563033
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20563094 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20563033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 21702616 - 21702677
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21702616 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 21702677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 21705456 - 21705517
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21705456 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 21705517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23393169 - 23393108
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23393169 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 23393108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 12078354 - 12078390
Alignment:
Q  197 aattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12078354 aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 12078390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 13522581 - 13522651
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  13522581 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 13522651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 13533338 - 13533408
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  13533338 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 13533408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20625555 - 20625485
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20625555 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtag-tctagtcccccttgcacttccaaggag 20625485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20798484 - 20798414
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  20798484 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaagga 20798414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21075995 - 21075923
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagt 107  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||   | |||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  21075995 gcggataaaacagagagagagagagaagaaagacacaaaacaattatacagattccttccacaaaccggaagt 21075923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22560226 - 22560144
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22560226 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 22560144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 23477732 - 23477802
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||    
T  23477732 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtccctcttgcacttccaaggag 23477802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35543889 - 35543819
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  35543889 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 35543819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21121816 - 21121618
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21121816 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaggacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 21121717  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21121716 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21121618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21215428 - 21215230
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21215428 gcggataaaacagagagaaagacagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 21215329  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21215328 gggaattcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaccttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21215230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 21983924 - 21984122
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21983924 gcggataaaacagagagaaagagaaaagaaagacacaaaaaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 21984023  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21984024 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagatacttcctatgct 21984122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 46088317 - 46088515
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46088317 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaag 46088416  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46088417 gagagttcactatgtaatatctgattacacatgctcacttctaaacttagtaagagacttcaaattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 46088515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44824507 - 44824314
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44824507 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 44824412  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44824411 gagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 44824314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 42283980 - 42284167
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42283980 agagagaaagagagaaaaaagacacagacaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcact 42284079  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42284080 atgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 42284167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 23024132 - 23024319
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||| || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23024132 agagagaaagagagagaacagacataagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 23024231  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23024232 atgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagaattcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 23024319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 10250317 - 10250513
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10250317 gcggataaaacagagatagagagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 10250416  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10250417 gagagttcactatctaatatcttattacaattgctcacaactaaa-ttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 10250513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21135911 - 21135714
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  21135911 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaggacacaagtaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccc-ttgcactttcaag 21135813  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21135812 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaatcttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgct 21135714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21205596 - 21205426
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21205596 aaagacataagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactatgtaatatctgattac 21205497  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21205496 aaatgctcactactaaccttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21205426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48570960 - 48570783
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48570960 gagagagagaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 48570861  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48570860 ctgattacaattgctaactactaaacttagtaagatacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 48570783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 29215125 - 29215322
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaag-caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29215125 gcggataaaacagagaaa--gagagaagagagacacaagacaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 29215222  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29215223 tgagagttcacaatataatatctaattacaaatgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29215322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 21702177 - 21702340
Alignment:
Q  69 acaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgc 168  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21702177 acaagcaatttaaacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgc 21702276  T
Q  169 tcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21702277 tcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21702340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14264199 - 14263984
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcat--- 114  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |       
T  14264199 gttcagaactagttgcagcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtc 14264104  T
Q  115 --gtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaa 212  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  14264103 ccgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgcttaagcacaa 14264005  T
Q  213 cagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  14264004 ctgcaagagacttcctatgct 14263984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 2266447 - 2266625
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2266447 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 2266545  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2266546 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgct 2266625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25449274 - 25449110
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatg 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||    
T  25449274 aagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataaagtaatatctgattacaattg 25449175  T
Q  168 ctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  25449174 ctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaatagacttcttatgct 25449110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 37640336 - 37640535
Alignment:
Q  35 gcggataa-aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  37640336 gcggataagaacagagagaaagagagaagcaagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaa 37640435  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37640436 gaggagttcactatgtaatatctgattacaactgctcaatactatacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 37640535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22600895 - 22600741
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22600895 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaattgctcactgcta 22600796  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22600795 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 22600741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2328151 - 2327990
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctc 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2328151 aagcaatttatacaggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgattacaattgctc 2328052  T
Q  171 actactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  2328051 actaccaaacatagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacgactgcaagagacttcatatgct 2327990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 22153226 - 22153385
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22153226 ttatacaggttccttccacaaactggaagtcggtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactagaaatgtaatatctgattacaattgctcact 22153325  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22153326 gctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22153385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 30571556 - 30571724
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30571556 aaagacacaagtaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtactttcaaggagag-tcactatgtaatatctgattac 30571654  T
Q  163 aaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30571655 aaatgttcactactaaatttagtaagagacttcaaa-tgcttaagcacaactgcaagagacttcctatgct 30571724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 7309170 - 7309345
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatat 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||    
T  7309170 agaaaaaagacacaagcaatt-atataggttccttccacaaatcggaagtagtac-tgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaatgtaatat 7309267  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7309268 ctgattacaaatgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 7309345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23037214 - 23037060
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  23037214 ttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcacagcta 23037115  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23037114 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 23037060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32786692 - 32786492
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaagg--agagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcc 131  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||  || |||| |||||||||||||    
T  32786692 gcggataaaacagagagagagaaagagaagaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttcc 32786594  T
Q  132 aaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32786593 aaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactatcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 32786494  T
Q  232 ct 233  Q
    ||    
T  32786493 ct 32786492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Original strand, 38281917 - 38282089
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38281917 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcgaaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct 38282015  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
     ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38282016 gattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgtaagagacttcctatg 38282089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 2834070 - 2834213
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaaga 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||    
T  2834070 ttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatttgattacaattgctcactgctaaaaactagcaaga 2834169  T
Q  190 aacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2834170 gacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 2834213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 1577238 - 1577392
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  1577238 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 1577337  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  1577338 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtcatcctatgct 1577392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16236038 - 16235861
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16236038 gagagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttttgtcccccttggacttccaaggagagttcactatgtaatat 16235939  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16235938 ctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaca-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 16235861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 19214967 - 19215140
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat--gtaatatcttat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||    
T  19214967 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaaatcaatcctgtcccctttgtacttccaaggagagttcactaaaagtaatatctgat 19215066  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19215067 tacaattgctcaatactaaacttagtatgagacttcaaaatgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 19215140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 10756772 - 10756953
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||    
T  10756772 gagagaagaaagacacaaatcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaaatgta 10756870  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10756871 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 10756953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 36133575 - 36133729
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  36133575 ttatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 36133674  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36133675 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 36133729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 12283793 - 12283951
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12283793 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatttgattacaactgctcact 12283891  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12283892 gctaaacttagcaagagacttcaaattacacaagcacaactgcaagagatttcctatgct 12283951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22428047 - 22427890
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22428047 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 22427949  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22427948 gctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgtgagagacttcctatgct 22427890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33257083 - 33256903
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||    
T  33257083 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcactaaaatgta 33256985  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33256984 atatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33256903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33277255 - 33277075
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||    
T  33277255 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcactaaaatgta 33277157  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33277156 atatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33277075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Original strand, 38281736 - 38281890
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38281736 agaagaaagacacaaagcaatt-ataaaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct 38281834  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
     ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38281835 gattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagtacaac 38281890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 1899695 - 1899872
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  1899695 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatattccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttctaaggagagttcattatgtaata 1899793  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||| || |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1899794 tctgattaaaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1899872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12625262 - 12625109
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  12625262 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 12625164  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12625163 ctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcataactgcaagagatttccta 12625109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22202466 - 22202287
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||    
T  22202466 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacagcttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatgta 22202369  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22202368 atatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaat-gctcaatcacaactgcaagagacttcctatgct 22202287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26702880 - 26702701
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26702880 gcggataaaacagagagaa--agagaagaaagatacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 26702784  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| || |||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | || |||||||||    
T  26702783 ggagagttcactaaaatgtaatatctgatcacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaac 26702701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21192574 - 21192416
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||     
T  21192574 ttatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattgcaactgctcactg 21192475  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21192474 ctaaaactagcaagagacatcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 21192416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 30892442 - 30892620
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  30892442 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacagattccttccacaaaccagaagtag-tcatgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 30892538  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30892539 atatctaattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctaaagaacaactgcaagagacttcctatgct 30892620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 35039588 - 35039692
Alignment:
Q  128 ttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35039588 ttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-agctcaagcacaactgcaagagacttcc 35039686  T
Q  228 tatgct 233  Q
    ||||||    
T  35039687 tatgct 35039692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Original strand, 48703642 - 48703783
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaactt 182  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |    
T  48703642 gttccttccacaaaccggaagtag-tcatgcccccattgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaact 48703740  T
Q  183 agtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48703741 agcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 48703783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17025638 - 17025514
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta-----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  17025638 tgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaaatgtaatatttgattacaactgctcacttctaaacttagcaagagacttcaaactactcaagc 17025539  T
Q  209 acaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17025538 acaactgcaagagatttcctatgct 17025514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22465519 - 22465362
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||    || |||||| | ||||||| ||||||||    
T  22465519 ttatacatgtttcttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatataatatttgattacaactgctcact 22465421  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  22465420 gctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcataattgcgagagacttcctatgct 22465362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34256227 - 34256066
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  34256227 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 34256128  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  34256127 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 34256066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14293327 - 14293182
Alignment:
Q  84 aggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaac 180  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||   |||||| |||||||| |||||     
T  14293327 aggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatccggttacaactgctcactgctaaaa 14293228  T
Q  181 ttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
     ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||    
T  14293227 ctagcaagagacttcaaactactcaaacacaactgcaaaagacttc 14293182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7745767 - 7745701
Alignment:
Q  70 caagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7745767 caagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agccatgtcccccttgcacttccaaggag 7745701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28493013 - 28492888
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  28493013 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctat-ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 28492917  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  28492916 atatctgattacaactgctcactgctaaa 28492888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 2267977 - 2268057
Alignment:
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2267977 tatctgattacaactactcactgctaaacttagcaagagacttcaaat-gctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 2268057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22601291 - 22601225
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22601291 ttatacaggttccttccacaa-tcggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22601225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 20908782 - 20908939
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtccccc-ttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |   ||||||| ||||||||||||||||     
T  20908782 ttatacaggttccttccacaaatctgaagt-agtcttgtccccctttgcacttccaaggagagttccctaaaatcaatatctgattacaaatgctcactt 20908880  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||  ||| | || |||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  20908881 ctcaaaatagcacgagacttgaaactactcaaacacaaccgcaagagatttcctatgct 20908939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Original strand, 12944677 - 12944783
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaa-aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  12944677 ataaaacagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 12944774  T
Q  138 cgttcacta 146  Q
      |||||||    
T  12944775 atttcacta 12944783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19171048 - 19170876
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc-actatgtaatat-----ctta 158  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||      |  |    
T  19171048 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacaga 19170951  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  19170950 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 19170876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Original strand, 17370400 - 17370572
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atctta 158  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | || |    
T  17370400 agacacatgcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtag-tcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 17370497  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  17370498 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 17370572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20196404 - 20196325
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20196404 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 20196325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 233
Target Start/End: Original strand, 21543534 - 21543599
Alignment:
Q  168 ctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  21543534 ctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagactttctatgct 21543599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 155002 - 154920
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  155002 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 154920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Original strand, 17017962 - 17018025
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17017962 ttatacaggttccttccataaatcagaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttc 17018025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 19037366 - 19037436
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||    
T  19037366 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtccaccttgcacttccaaggag 19037436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 20251163 - 20251233
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20251163 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtccat-tcccccttgcacttccaaggag 20251233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 23058953 - 23059023
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23058953 agacacaagcaact-atactggttccttccacaaaccggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggag 23059023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 23926421 - 23926491
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  23926421 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 23926491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 28379352 - 28379422
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28379352 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtccat-tcccccttgcacttccaaggag 28379422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4251260 - 4251199
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4251260 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 4251199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 17956754 - 17956814
Alignment:
Q  86 gttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17956754 gttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 17956814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 674941 - 675011
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  674941 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 675011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 5973252 - 5973334
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5973252 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 5973334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11195781 - 11195711
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  11195781 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 11195711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14388841 - 14388771
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  14388841 agacacaagcaatt-atcctggttcattccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 14388771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16233832 - 16233765
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16233832 ttatacatgttccttccacaatccggaagtag-tcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcacta 16233765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18130651 - 18130619
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18130651 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18130619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26548979 - 26548909
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  26548979 agacacatgcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 26548909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46181566 - 46181495
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  ||   |||||||||||||||||||||    
T  46181566 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggag 46181495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11725
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11526 gcggataaaacatagagaaggagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 11625  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11626 gggagttcactaagtaatatctgattacaaatgctcactactaaaaattagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 11725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19066838 - 19066640
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19066838 gcggataaaacagagagaaagagagaagaaagacactgacaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaag 19066739  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19066738 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19066640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 12422613 - 12422790
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12422613 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 12422712  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12422713 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcccatgct 12422790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33353027 - 33352850
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33353027 gagagaagaaagacacaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaaaat 33352928  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33352927 ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 33352850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 19482092 - 19482279
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19482092 agagagaaagagagaagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 19482191  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  19482192 atgtaatatctgattacaaatgctcattactaaacttagtatgagacttcaaattgctgaagcgcaactgtaagagacttcctatgct 19482279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 26588926 - 26589126
Alignment:
Q  35 gcggataa-aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26588926 gcggataagaacagagagaaagagagaagcgagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 26589025  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaa-tgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgc 232  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26589026 ggagagttcactatgtaatatctaattacaaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgc 26589125  T
Q  233 t 233  Q
    |    
T  26589126 t 26589126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 21617595 - 21617772
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21617595 gagagaagaaagacacaaacaatttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactatgtaatat 21617694  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21617695 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagaacaattgcaagagacttcctatgct 21617772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22077196 - 22077004
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaa-ag-gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttcca 132  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22077196 gcggataaaacagagagagagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccataaatcagaagtcagttatgtcccccttgcacttcca 22077097  T
Q  133 aggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22077096 agtagagttcactatgtaatatctgattacaattgctctctattaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 22077004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 21234507 - 21234686
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21234507 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 21234606  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21234607 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagatttcaaaatgctcaagcacaacggcaagagacttcctatgct 21234686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 22801468 - 22801667
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22801468 gcggataaaagagagagaaagagagaagaaagacacaaagcaatttatacagattccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcatttccaa 22801567  T
Q  134 ggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22801568 ggagatttcactatgtaatatctgattacaattgctcacttctaagactagtaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 22801667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 17380925 - 17381103
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17380925 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaata 17381024  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17381025 tctaattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17381103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19833778 - 19833600
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19833778 gagagaagaaagacacaaagcaatttataaaggttccttacacaaaccgaaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcaatatgtaata 19833679  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19833678 tcttattacaattgctcactactaaacttagtaacagatttcaaa-tgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 19833600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17317294 - 17317116
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17317294 gagagaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtccccctagcacttccaaggggagttcactatgtaatat 17317195  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| | |||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17317194 ctgattacaattactcactgctaaaactagcaagagacttcaacttgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 17317116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 16876260 - 16876432
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatctta 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||| |    
T  16876260 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccc-ttgcacttcgaaggagagttcactaaaaagtaatatctga 16876358  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16876359 ttacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16876432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 13601518 - 13601695
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  13601518 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 13601616  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13601617 tctgattacaactgctcactgctaaaactagcacgagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 13601695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 15986725 - 15986883
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  15986725 ttatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 15986824  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15986825 ctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 15986883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 21624443 - 21624617
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21624443 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatct 21624541  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21624542 aattacaattgctcactgctaaaactagcaagatacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 21624617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 9717215 - 9717370
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  9717215 ttatataggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcactaagtaatatctgattacaattgctcactgcta 9717314  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9717315 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgct 9717370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 10631506 - 10631660
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||    
T  10631506 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatgtttgattacaattgctcactgcta 10631605  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10631606 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcatatgct 10631660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15532402 - 15532248
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  15532402 ttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 15532303  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15532302 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 15532248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 15954047 - 15954224
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  15954047 gagagaagaaagacaaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactatttaatat 15954146  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  15954147 ctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagaattcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcatatgct 15954224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Original strand, 18377814 - 18377962
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18377814 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctaattacaaatgctcactgcta 18377913  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    ||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18377914 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcc 18377962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12716223 - 12716043
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  12716223 gagagaagaaagacacaaagcatatatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaa 12716124  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12716123 tatctgattacaactgctcattgctaaacttagcaagagactataaa-tgctcaagcacaactgcaagagaattcctatgct 12716043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20731496 - 20731326
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttatta 161  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  20731496 aaagacacaaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgtcccc-ttgcacttccaacgagagttcactctttaatatctgatta 20731398  T
Q  162 caaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20731397 caattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 20731326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 16528643 - 16528836
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16528643 ggataaaacagagagaa--agagaataaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaagga 16528740  T
Q  137 gcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    | |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  16528741 gagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactactaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacgactgcaagagatttccta 16528836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 32543637 - 32543792
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||| | |||    
T  32543637 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagagttcactatataatatctgattacagttgctcattgcta 32543736  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32543737 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagactttctatgct 32543792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19952345 - 19952193
Alignment:
Q  80 atacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  19952345 atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcattatgtaatatctgattacaattgctcactgctaaa 19952246  T
Q  180 cttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  19952245 attagcaaaagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagaaactttctatgct 19952193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14101215 - 14101058
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||| ||     
T  14101215 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctctctg 14101117  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14101116 ctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 19623312 - 19623508
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| ||    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19623312 gcggataaaacagagagaa----agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaa 19623405  T
Q  134 ggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| ||| ||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  19623406 ggagtgtttactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattattcaagcacaactgcaagaggtttcctat 19623505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20113457 - 20113264
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  20113457 gcggataaaactgagagagagagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttacttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaa 20113360  T
Q  134 ggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  20113359 ggagagttcactaaaatgtaatatctaattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagacttc 20113264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 13435237 - 13435410
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatct 156  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13435237 agaagaaagacacaaagcaatt-atgcaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatct 13435334  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13435335 gattacaattgttcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 13435410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 25593397 - 25593597
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||| ||||||    
T  25593397 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgccccccttgcatttccaa 25593495  T
Q  134 ggagcgttcac---tatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||| ||||||    || |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25593496 ggagagttcaccaaaatataatatttgattacaaatgctcactgctaaacttagcaaaagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctat 25593594  T
Q  231 gct 233  Q
    |||    
T  25593595 gct 25593597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 29917399 - 29917550
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     ||    
T  29917399 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatcttattacaattgctc---gtta 29917494  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29917495 aaattagcaagagacttgaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 29917550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 15301544 - 15301743
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  15301544 gcggataaaacagagagagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagtagacc-tgtcccccttgcacttccaag 15301642  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15301643 gagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagatttcaaa-agctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 15301741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 24116200 - 24116356
Alignment:
Q  79 tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  24116200 tatacaggttccttccacaaaccagaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcacttc 24116298  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  24116299 taaacttagcgagagactttaaattactcaagcacaactgcaagagattttctatgct 24116356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 26941787 - 26941966
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaat 152  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    ||||||    
T  26941787 agaagaaagacacaaagcaatt-atacagatttcttccacaaaccagaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttactaaaaatgtaat 26941885  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  26941886 atctgattacaactgctcactactaaacttagcaagagacttcaaactactcaatcacaactgcaagagattacctatgct 26941966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 18434887 - 18435068
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact-----atg 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||     |||    
T  18434887 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaacttccttccacaaatcggaagtac-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaaatg 18434984  T
Q  149 taatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18434985 taatatgtaattacaactgctcactgctaaatttagcaagagacttcaaa-tgatcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 18435068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 19085507 - 19085687
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||| | |  |||| ||||| ||||||||||||| |||||| |   ||||    
T  19085507 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacacattccttccacaaaccggaagtag-tattgtcgcccttacacttccaaggagagttcaccaaaatgta 19085604  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19085605 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 19085687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 19688179 - 19688308
Alignment:
Q  102 ggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattg 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | |||||| ||| || | | |||||| ||    
T  19688179 ggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattgcaatcgctcaatgctaaac-tagcaaaagatttcaaa-tg 19688276  T
Q  202 ctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19688277 ctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 19688308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 16914809 - 16914954
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaa 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||   ||||||||||| ||||| | | |||||| |||||  ||| ||    
T  16914809 ttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcatttctaaggagagtttactaaaatgtaatatctgattacgactactcactgctaaaactagcaa 16914908  T
Q  188 gaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16914909 gagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 16914954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 19470024 - 19470196
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttat 159  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   || |||||| ||    
T  19470024 aaagacacaaaaaaattatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataatgtgatatctgat 19470122  T
Q  160 tacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19470123 tacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 19470196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 7763024 - 7763183
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||||    ||||||||||| ||||||| || | | |    
T  7763024 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagttcactaaaaatgtaatatctgattacaattgttgagt 7763123  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  7763124 gctaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcatatgct 7763183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14070870 - 14070690
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgta-----a 151  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     |    
T  14070870 agaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatca 14070771  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     | || ||||||| |||||| ||||  |   |||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14070770 caactgattacaactgctcaatacttcaacaagtacgagacttcaaaatgctcaagcac-acaacaagagacttcctatgct 14070690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14052179 - 14052095
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14052179 agaagaaagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttc 14052095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14732915 - 14732737
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga-gcgttcacta---tgtaat 152  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| |||  | | ||||||||   ||||||    
T  14732915 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaactggaagttagtcctgtcccccttgcactttcaaacaagagttcactaaaatgtaat 14732817  T
Q  153 atcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||  ||| | || ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14732816 atctgattacaactgctcactgctaaaactagcacgagacttcaaat-gcacaagcacaactgcaagagacttcctatgct 14732737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 17927164 - 17927320
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |   ||||||| ||||||| |||||| | |    
T  17927164 ttatacaggttccttccacaaactggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaatatctgattacaactgctcaatgc 17927262  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  17927263 taaaattagcaagagacttcaaactactcaaacacaattgcaagagatttcctatgct 17927320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 25929827 - 25930006
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaa 151  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |   ||    
T  25929827 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttcaacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatcaa 25929924  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| || ||||||||||||| || ||  ||| |||| |||||||| | | |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25929925 tatctgatcacaaatgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactacgcaagtacaactgcaagagatttcctatgct 25930006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 179
Target Start/End: Original strand, 3680465 - 3680588
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  3680465 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaata 3680562  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||    
T  3680563 tcttattacaattgatcactgctaaa 3680588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 12041223 - 12041282
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12041223 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggag 12041282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 19625159 - 19625341
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||||||| |||| || ||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||     
T  19625159 gagagaagaaagacacaaatcaattatacaagttcctttcacaaactggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtt 19625257  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgcta 234  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| |||| || ||||| | ||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  19625258 atatctgattacaactgcttactactaaaactagcaagagacatcaaactactcgaacacaactgcaagagatttcctatgcta 19625341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 25591974 - 25592150
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatat 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  || |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||      
T  25591974 agaagaaagacacatagcaatt-atacaggttccttccacaatccgaaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaataaatca 25592071  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25592072 ctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 25592150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 12347464 - 12347620
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaatatcttattacaaatgctcactac 175  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |   ||||||| ||||||| || ||||| |    
T  12347464 ttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatcaatatctgattacaattgttcactgc 12347562  T
Q  176 taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | ||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  12347563 tcaaaatagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 12347620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17304072 - 17303893
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact--atgtaa 151  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |   ||    
T  17304072 gagagaagaaagacacatagcaatt-atatagatttcttccacaaaccggaagtag-tcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatcaa 17303975  T
Q  152 tatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||  ||| |||| |||||||| | || ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  17303974 tatctgattacaattgctcactgctcaaaatagcaagagacttcaaactactaaagcacaactgcaagagatttcatatgct 17303893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 31571932 - 31572011
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31571932 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagttca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 31572011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 29537984 - 29538081
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||   ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29537984 ttatataggttccttccataaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaagtagagtttactaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 29538081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16124195 - 16124134
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16124195 ggttccttccacaaatcggaagtag-tcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 16124134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17746463 - 17746384
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17746463 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 17746384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18835312 - 18835233
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18835312 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18835233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Original strand, 32335194 - 32335281
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  32335194 agaaaaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaatccggaaatag-tcatgtcccctttgcatttccaaggagagttcacta 32335281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7586945 - 7586875
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  7586945 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 7586875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 99
Target Start/End: Original strand, 16333090 - 16333134
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16333090 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaagttccttccacaaa 16333134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18172998 - 18172931
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18172998 ttatacaagttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcacta 18172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 18226803 - 18226870
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18226803 ttatacaagttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcacta 18226870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Original strand, 20635079 - 20635230
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  20635079 aaagacacaggcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 20635176  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20635177 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaactgctcaagcac 20635230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24719510 - 24719443
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24719510 ttatacaggttccttccacaatccagaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24719443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25687432 - 25687362
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  25687432 agacacaagcaatt-atcctggttctttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 25687362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 31930965 - 31931035
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  31930965 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 31931035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7376438 - 7376357
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7376438 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 7376357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20030583 - 20030502
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20030583 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20030502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20063334 - 20063253
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20063334 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 20063253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27167123 - 27167042
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  27167123 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcactttcaaggagatttcacta 27167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 25787239 - 25787300
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25787239 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 25787300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30120552 - 30120491
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30120552 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 30120491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Original strand, 32756937 - 32756998
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32756937 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 32756998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 233
Target Start/End: Original strand, 7811524 - 7811573
Alignment:
Q  184 gtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7811524 gtaagagatttcatattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgct 7811573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18826917 - 18826838
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18826917 agacacaagcaatt-atcctggttccttccataaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18826838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 29765053 - 29765132
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  29765053 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcctccttgcacttccaaggagatttcacta 29765132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 11205487 - 11205557
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11205487 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccagaagtagtccat-tcccccttgcacttccaaggag 11205557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 11235010 - 11235080
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11235010 agacacaagcaatt-atactgattccttccacaaaccggaagtagtccat-tcccccttgcacttccaaggag 11235080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17609095 - 17609025
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||    
T  17609095 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtctcccttgcacttccaaggag 17609025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 18554812 - 18554882
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  18554812 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 18554882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Original strand, 19875242 - 19875278
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19875242 gtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcacta 19875278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 21127591 - 21127661
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  21127591 agacataagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 21127661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 26043728 - 26043810
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26043728 aaagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 26043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16491 - 16300
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgt 140  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16491 aaaacagagagagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagt 16392  T
Q  141 tcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16391 tcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagatttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 16300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 210730 - 210927
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  210730 gcggataaaacagagagagagagagaagaaagacaccagcaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttatgtcccccctgcacttccaag 210829  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  210830 gagagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 210927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 219589 - 219769
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||    
T  219589 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggtttcttccacaaatcggaagtag-tcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatgta 219686  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  219687 atatctgattacaaaagctcactgataaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 219769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 378334 - 378129
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaa----aaagacacaa-gcaatt-tatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcact 128  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||    |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  378334 gcggataaaacagagagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaattatatacaagttccttccacaaactggaagtag-tcatgccccccttgcact 378236  T
Q  129 tccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagactt 225  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  378235 tccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtctt 378137  T
Q  226 cctatgct 233  Q
    | ||||||    
T  378136 cttatgct 378129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 245042 - 244861
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||    
T  245042 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcactaaaaatgt 244945  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  244944 aatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacagctgcaagaaatttcctatgct 244861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 87775 - 87849
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  87775 aagcaatttatagtggttccttccacaatccggaagtagttcac-tcccccttgcacttccaaggagagttcacta 87849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 88399 - 88184
Alignment:
Q  18 gttcaaaacaagttgttgcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtc 117  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  88399 gttcagaactagttgcagcggataaaacagagagaaagggagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagacatgtc 88300  T
Q  118 ccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagca 217  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||    
T  88299 ccctttgcacttccaaggggagttcaatatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacgtagtatgagacttcaaattgctcaagcacaactaca 88200  T
Q  218 agagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  88199 agagacttcctatgct 88184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1599 - 1404
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagga 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||     
T  1599 ggataaaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatttaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccc-ttgcacttccaaggg 1501  T
Q  137 gcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1500 gagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcacaacttcaagagacttcctatgct 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2744 - 2564
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2744 agagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttgcacaaatcggaagtcagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 2645  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2644 atgtaatatctgattacaaatgcccactacgaaacttattaagacacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttc 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21674 - 21587
Alignment:
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21674 atgtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaactgctcaaccacaactgcaagagacttcctatgct 21587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35527 - 35335
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35527 gcggatagaacagagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaag 35428  T
Q  135 gagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactac-taaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35427 gggagttcactatgtaatatctgattacaaatgctcacaacttaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaattgcaagagacttc 35335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26422 - 26251
Alignment:
Q  46 agagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||                 |||||    
T  26422 agagagaaagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccctt-----------------tcact 26340  T
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26339 atgtaatatctgattacaaatgctcactacttaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagtacaactgcaagagacttcctatgct 26251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 145225 - 145038
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgt 140  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  145225 aaaacagagagagtgagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtatagt 145126  T
Q  141 tcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  145125 tcactatgtaatatctgattacaaatgctcactactaaacttactaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttccta 145038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 66166 - 65989
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  66166 gagagaagaaagacacaagaaatttatgcaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagttcactatgtaatat 66067  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66066 ctgattacaaatgctcactactaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 65989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 165386 - 165211
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgtaatatc-----t 156  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||   |||     |    
T  165386 aaagacacaggcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaat 165288  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  165287 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgct 165211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 58937 - 59004
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  58937 ttatacaggtttcttccacaattcggaagt-agtcatgtccctcttgcatttccaaggagagttcacta 59004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3429 - 3259
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3429 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatat 3330  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3329 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttc 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24531 - 24361
Alignment:
Q  63 aaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttatta 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24531 aaagacacagagcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactatgtaatatcttatta 24432  T
Q  162 caaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24431 caattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 24361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 80768 - 80926
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  80768 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcctcattgtacttccaaggagagttcactaaaaatgtaatatctacttacaactgctcact 80866  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||  | | |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  80867 cctaaaactggcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagacatttcctatgct 80926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 14130 - 14212
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14130 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54832 - 54750
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54832 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 54750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 2330 - 2509
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2330 gagagaagaaagacacgaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaata 2429  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2430 tctgattacaaatgctcactactaaaaatagaaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaaaagacttcctatgct 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6042 - 5874
Alignment:
Q  43 aacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttc 142  Q
    |||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6042 aacagagagaaaaagagaagaaatacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttc 5943  T
Q  143 actatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcaca 211  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5942 actaagtaatatctgattacaaacgctcactactaaacttagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 79100 - 78938
Alignment:
Q  74 caatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctc 170  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||| |||||    
T  79100 caattaatacagattctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaattgctc 79001  T
Q  171 actactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  79000 actactaaacttagtaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 78938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22890 - 22713
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatat 154  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22890 gagagaagaaagacacgaggaatttatacaggttccttgcacaaacccaaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggagagttcactatgtaatat 22791  T
Q  155 cttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22790 ctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 22713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 18404 - 18559
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  18404 ttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 18503  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18504 aaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 606
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  652 ttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttg 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 523
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaata 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  702 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactttgtaata 603  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  602 tctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgttcaagcataactacaatagacttcctatgct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 63695 - 63868
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatg---taatatctta 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     |||||||| |    
T  63695 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttgaaggagagttcactaaaaaataatatctga 63794  T
Q  159 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  63795 ttacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 63868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Original strand, 46030 - 46194
Alignment:
Q  71 aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatg 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||  |||||| ||    
T  46030 aagcaatttatacaggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctggttacaattg 46129  T
Q  168 ctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46130 ctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 46194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 142511 - 142624
Alignment:
Q  120 ccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaag 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  142511 ccttgcacttctaaggagagttcactatgtaatatctaattacaattgctcactactaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcgcaactgcaag 142610  T
Q  220 agacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||    
T  142611 agacttcctatgct 142624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7483 - 7323
Alignment:
Q  75 aatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctca 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7483 aatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaattgctca 7384  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7383 ctactaaacttagtaagagatttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcccatgct 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28213 - 28009
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaa----aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcactt 129  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28213 gcggataaaacagagagagagagagaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactt 28115  T
Q  130 ccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28114 ccaaggagagttcactaaaatgtaatatctaattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttc 28016  T
Q  227 ctatgct 233  Q
    |||||||    
T  28015 ctatgct 28009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 48704 - 48861
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48704 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcacta 48803  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  48804 ctaaacttaacaagagacttcaaa-tgctcaaccacaaatgcaagagacttcctatgct 48861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 31917 - 32109
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31917 gcggataaaacagagaga--gaaagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 32013  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||  | | |||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32014 ggagagttcactaaaatgtaatatctgattaagactactcgatactaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagaacaactgcaagagacttcc 32109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 967
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  1142 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 1044  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacag-caagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  1043 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattactcaagcac-acagacaagagacttcctttgct 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 57492 - 57422
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  57492 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtag-tctagtcccccttgcacttccaaggag 57422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6428 - 6274
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  6428 ttatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgcta 6329  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  6328 aaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaaaagacttcttatgct 6274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 236
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  390 ttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactatgtaatatctgattacaattgctcattgcta 291  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  290 aaactagcatgaaacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 83765 - 83921
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactac-t 176  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |    
T  83765 ttatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactgctt 83864  T
Q  177 aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  83865 aaaactagcaagagacttcaaatttctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 83921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 268155 - 268222
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  268155 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctattccccttgcacttccaaggagagttcacta 268222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 9336 - 9493
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9336 ttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcacta 9435  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9436 ctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctaaagcacaactgcaagagacttactatgct 9493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 90758 - 90639
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  90758 tgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctaactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaac 90659  T
Q  214 agcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||||||||||||||    
T  90658 tgcaagagacttcctatgct 90639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 88 - 155
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  88 ttatacaggttccttccacaatccggaagtag-tcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcacta 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 233
Target Start/End: Original strand, 25813 - 25989
Alignment:
Q  59 gaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgtaata 153  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||    
T  25813 gaaaaaagacacaaagcaa-ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaaatgtaata 25910  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25911 tctgattacaactgctcattgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 25989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 29018 - 29088
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  29018 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 29088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 9258 - 9434
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  9258 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 9355  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9356 tctgattacaacttctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-cgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgct 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 211708 - 211885
Alignment:
Q  58 agaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaata 153  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  211708 agaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaata 211806  T
Q  154 tcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  211807 tctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagctcaactgcaagagacttcatatgct 211885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 60613 - 60683
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  60613 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggag 60683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19377 - 19206
Alignment:
Q  63 aaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttatta 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19377 aaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgatta 19278  T
Q  162 caaatgctcactact-aaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     || |||| | | || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19277 gaattgcttagtgctaaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagtgttcctatgct 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 7158 - 7351
Alignment:
Q  36 cggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagg 135  Q
    |||||||||||||||    |||||||  |||||||||   | |||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  7158 cggataaaacagaga----gagagaaggaagacacaaatcaattatacaggttccttccaaaaactggaagtcagtcctatcccccttacacttccaagg 7253  T
Q  136 agcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7254 agagttcactatgtaatatttgattacaattaatcactgctaaaactagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 1008 - 1188
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   |||||    
T  1008 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccttaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaatgagagttcactaaaatgta 1106  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1107 atatctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaa-tgctcaaggacaactgcaagagacttcctatgct 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 14467 - 14646
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||    
T  14467 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactaaaatgta 14564  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    | |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14565 a-atctgattacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 14646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20249 - 20054
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||     
T  20249 gcggataaaacagagaaa--gagagaagaaagatacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaa 20153  T
Q  135 gagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    ||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20152 gagagttcactaaaaatgtaatatcttattacaactgctcaacgctaaacatagcaagagacttcaaattactcaagcacaactgcaagagatttccta 20054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 99968 - 99850
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  99968 tgtcccccttgcacttccacggagagttcactatgtaatatcttattataattgctgactactaaacttggtaagagactttaaa-tgctcaagcacaac 99870  T
Q  214 agcaagagacttcctatgct 233  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  99869 tgcaagagatttcctatgct 99850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 110375 - 110306
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtc 108  Q
    |||||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  110375 ggataaaacagagaga--gagagagagaagacactagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtc 110306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Original strand, 23988 - 24089
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattac 162  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23988 aaaggcacaaccaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattac 24087  T
Q  163 aa 164  Q
    ||    
T  24088 aa 24089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 73931 - 74112
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||    
T  73931 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaattta 74029  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||| | ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  74030 atatttgattacaattgctcactgttaaacttagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcttatgct 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10883 - 10689
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg 139  Q
    |||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  |||| | || ||||||||||||||||||||| |  |    
T  10883 aaaacagagagagagaaagaagaaagacacaatgcaatt-atacaggttccttccacaaaccaaaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaagaaaag 10786  T
Q  140 ttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10785 ttcactaaaaagtaatatctgactacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 10689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15547 - 15353
Alignment:
Q  41 aaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg 139  Q
    |||||||||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  |||| | || ||||||||||||||||||||| |  |    
T  15547 aaaacagagagagagaaagaagaaagacacaatgcaatt-atacaggttccttccacaaaccaaaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaagaaaag 15450  T
Q  140 ttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||||    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15449 ttcactaaaaagtaatatctgactacaactgctcactgctaaacttagcaagagacttcaaattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 15353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32547 - 32370
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||    
T  32547 gagagaaaaaagacacaaagcaatt-atataggttccttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactaaaatgta 32450  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctat 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32449 atatctgattacaactgctcactgctaaaactagaaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctat 32370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 108 - 250
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaa 190  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | ||     
T  108 ttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaaagggagttcactatgtaatatctgattacaattgctcacggctaaaactagcaggag 207  T
Q  191 acttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  208 acttcaacttcctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2146 - 1966
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  2146 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgtttcttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 2049  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2048 atatctgattacaactgcgcactgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 1966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16867 - 16710
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| || ||||||||     
T  16867 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattataactgctcactt 16769  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16768 ctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactacaagagatttcctatgct 16710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 5509 - 5588
Alignment:
Q  116 tcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5509 tcccccttgcacttccaaggagagttcactatgtaatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttc 5588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Original strand, 5458 - 5510
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttc 89  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5458 gcggataaaacagagaga--gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttc 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 7992 - 8185
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaa 133  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7992 gcggataaaacagaga----gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgttccttccaataaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 8086  T
Q  134 ggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttccta 229  Q
    |||| ||||| |   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8087 ggagagttcagtaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagatttccta 8185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 2797 - 2887
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2797 gagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagggttcact 2887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44624 - 44442
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcac----tatgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||     ||||    
T  44624 gagagaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagt-agtcatgtcgcctttgcactttcaaggagagttcacaaaaaatgt 44526  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||| | ||||||| || ||||| |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44525 aatatttgattacaattggtcactgctaaaactaggaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 44442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Original strand, 7275 - 7451
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacaca-agcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  7275 gagagaagaaagacacatagcaatt-atacaggttccttccacaaaccgaaagt-agtcctat-ccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgta 7371  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7372 atatctgattacaactgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatg 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 59452 - 59598
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||   |||||| |||||||||    
T  59452 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatc---ttacaactgctcacta 59547  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
    |||||  ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  59548 ctaaaactagcaagagacttctaatt-ctcaagcacaactgcaagagacttc 59598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5710
Alignment:
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5634 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgatcaagcacaactgcaagcgacttcctatgct 5710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 9329 - 9487
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  9329 ttatacaggttcctttcacaaaccagaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactg 9428  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  9429 ctaaaactagcaagagacttcaaactattcaagcacaactgcaagagattttctatgct 9487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 5644 - 5720
Alignment:
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5644 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttcaaattgatcaagcacaactgcaagcgacttcctatgct 5720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1381 - 1238
Alignment:
Q  91 ttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaa 187  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  1381 ttccacaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcactaaaaagtaatatctgattacaactgctcactgctaaacttagcac 1283  T
Q  188 gaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1282 gagacttaaaat-gctcaagcacaactgcaagagacttcctatgct 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2796 - 2599
Alignment:
Q  36 cggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaag 134  Q
    ||||||||||||||| || |  |||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||  ||||||||||||||||    
T  2796 cggataaaacagagagaaagtaagaagaaagacacaaagcaa-ttatataggttccttccacaaaccggaagt-agtcctgt-gcccttgcacttccaag 2700  T
Q  135 gagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatg 231  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2699 gagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcactgttaaaactagcaagagacttcaaa-tgctcaagcacaattgcaagagacttcctatg 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2821 - 2641
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact----atgt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||    
T  2821 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaagttccttccacaatccggaagtag-tcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaaatgt 2724  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  2723 aatatcttattacaactgctcactgctaaaactagcaagagactt-aaactactcaagcacaactgcaagagatttcatatgct 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Original strand, 8602 - 8684
Alignment:
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8602 aatatctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagacttcaaa-tgctcaagcacaactacaagagacttcctatgct 8684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38839 - 38664
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  | ||||   | ||    
T  38839 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 38741  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||| |||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  38740 gattacaactgctcaatactacacctagtatgacacttcaaatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgct 38664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 2603 - 2761
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatc-ggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2603 ttatataggttccttccacaaaaccggaagtag-tcttgtcccccttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaactgctcact 2701  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||  | | |||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  2702 actaaaactggcaagagacttcaaactactcaaacacaactgcaagagatttcctatgct 2761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 1215 - 1371
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1215 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtag-tcatatcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaaagtaatatctgattacaattgctcacta 1312  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| |||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  1313 ctaaaactagcaagagactttaaaatactcaagcataactgcaagagatttcctatgct 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 13416 - 13573
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcacta 174  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||| ||| | | ||||||||     
T  13416 ttatacaggttcctttcacaaaccggaagttg-tcctgtcccccttacactaccaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattgcgactgctcactg 13514  T
Q  175 ctaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13515 ctaaaactagcaagagactacaaattactcaagcacaactgcaagagatttcctatgct 13573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 111385 - 111233
Alignment:
Q  82 acaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat---gtaatatcttattacaaatgctcactactaa 178  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  111385 acaggttccttccacaaaccggtagtca-tcttgtccctcttgcacttccaaggagatttcactaaaaggtaatatctgattacaattcctcactgctaa 111287  T
Q  179 acttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  111286 acttaacaagagacttcaaat-gctcaaacacaactgcaagagacttcctatgct 111233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Original strand, 9325 - 9500
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgt-tcactatg--taat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |  ||||   | ||    
T  9325 aaagacacaggcaatt-atacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagcttaatcacaact 9423  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||    
T  9424 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgct 9500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37507 - 37360
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgta 150  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||   || ||    
T  37507 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atacaggttccttccacaaatcggaagt-agtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatcta 37410  T
Q  151 atatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaatt 200  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  37409 atatctgattacaattgctgactgctaaacttagcaagagacttgaaatt 37360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 200
Target Start/End: Original strand, 41556 - 41645
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcact---atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaatt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||   || |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  41556 tgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatctaatatctgattacaattgctgactgctaaacttagcaagagacttgaaatt 41645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Original strand, 7960 - 8164
Alignment:
Q  37 ggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaagg 135  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||    
T  7960 ggataaaacatagagagagagagaagaaagacacaaagcaatt-atacatgttccttccacaaatcggaagtgagttctgccccccttgcacttccaagg 8058  T
Q  136 agcg----ttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcc 227  Q
    || |    | |||||    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  8059 agagagagtacactaaaaatgtaatatctgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttcaaactactcaagcacaactgcaagagatttcc 8158  T
Q  228 tatgct 233  Q
    ||||||    
T  8159 tatgct 8164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Original strand, 76621 - 76774
Alignment:
Q  81 tacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgt--aatatcttattacaaatgctcactactaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||     ||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  76621 tacaggttccttccacaaaccggaagtag-tcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatcaatatctgattacaactgctcactgctaa 76719  T
Q  179 acttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    |  ||| |||| |||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  76720 aactagcaagagacttcaaactactcaagaacaaaatcaagagacttcctatgct 76774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 56
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcg-ttcacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  217 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 118  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacag-caagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  117 atactacacctagtttgacacttcaaattgctcaagcac-acagacaagagacttcctttgct 56  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 233
Target Start/End: Original strand, 144284 - 144436
Alignment:
Q  84 aggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaa 179  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |  |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  144284 aggttccttccacaatccggaagtag-tcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcactaaaaatcaaatatctgtttacaattgctcactgctaaa 144382  T
Q  180 cttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
      ||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  144383 actagcaagagacttcaaattactcaagcacaaatgcaagagatttcctatgct 144436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Original strand, 5587 - 5711
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5587 ttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgagagttcactaaaactgtaatatctgattacaactgctcact 5686  T
Q  174 actaaacttagtaagaaacttcaaa 198  Q
     |||||  ||| |||| ||||||||    
T  5687 gctaaaactagcaagagacttcaaa 5711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 233
Target Start/End: Original strand, 102919 - 103100
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaa-gcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat----gt 149  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||     ||    
T  102919 gagagaagaaagacacaaagcaatt-atataagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaaaagt 103017  T
Q  150 aatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| | ||||  || || | ||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  103018 aatatctgattacaactgttcactgccaaaccaagcaaaagacttcaaat-gctcaagcacaactacaggagacttgctatgct 103100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5927
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atct 156  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | ||    
T  5760 aaagacacaggcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 5857  T
Q  157 tattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttc 226  Q
     ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5858 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2363
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  2524 ttatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 2425  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2424 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgct 2363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Original strand, 158553 - 158640
Alignment:
Q  146 atgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  158553 atgtaatatctgattacaattgctcactgctaaaactagcaagagacttcaaactgctcatgcacaactgcaagagatttcctatgct 158640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 36802 - 36899
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| | || | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36802 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtag-tcctatcccctttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcact 36899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 134862 - 134959
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| | || | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  134862 ttatacaggttccttccacaaaccagaagtag-tcctatcccctttgcacttacaaggagagttcactaaaatgtaatatctgattacaattgctcact 134959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 2374
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactatgtaatatcttattacaaatgctcactacta 177  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||      ||||||| |||||||| |||    
T  2519 ttatacaggttccttccacaattcggaagtag-tcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta---aa------attacaactgctcactgcta 2430  T
Q  178 aacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||  ||| |||| |||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2429 aaactagcaagagacttcaaactacttaagcacaactgcaagagatttcctatgct 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 1205 - 1264
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1205 ttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggag 1264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Original strand, 671 - 761
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| || |||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  671 gagaaaaaaaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccgaaagtag-tcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 740 - 650
Alignment:
Q  55 gagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| || |||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  740 gagaaaaaaaagacacaaaacaattatacaggttctttccacaaaccgaaagtag-tcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4478
Alignment:
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  4553 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgct 4478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 20019 - 20089
Alignment:
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcacaacagcaagagacttcct 228  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  20019 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcacgcaagcaagagacttcct 20089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7592 - 7521
Alignment:
Q  64 aagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  7592 aagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 7521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 1758 - 1840
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1758 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 1840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 44
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  126 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4069 - 4033
Alignment:
Q  110 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4069 gtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 129
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  199 agacacaagcaatt-atcctggttctttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2354
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  2424 agacacaaacaatt-atactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtctcccttgcacttccaaggag 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 291 - 361
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  291 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1723 - 1653
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  1723 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11161
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11091 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaatcggaagt-agtccagtcccctttgcacttccaaggag 11161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 14295 - 14386
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgca 126  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  14295 gcggataaaacagagagagagaaagaataaagacacaaagcaa-ttatacaggctccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccccttgca 14386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 1337 - 1428
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacac-aagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgca 126  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  1337 gcggataaaacagagagagagaaagaataaagacacaaagcaa-ttatacaggctccttccacaaaccagaagtcagtcttgtcccccttgca 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41064 - 40994
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41064 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtag-tctagtcccccttgcacttccaaggag 40994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 137
Target Start/End: Original strand, 174901 - 174998
Alignment:
Q  39 ataaaacagagaaaaggagagaaaaa-agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  174901 ataaaacagagcagaggaaagaaagagagacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 174998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 61090 - 61160
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  61090 agacacaagcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 61160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 5097 - 5213
Alignment:
Q  114 tgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta----tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagca 209  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| ||||    |||||||||| ||||||| |||| ||| | |||  ||| |||| |||| ||| | ||||||||    
T  5097 tgtcccccttgcacttccaaccagagttaactaaaaatgtaatatctgattacaactgcttactgcgaaaactagcaagagacttaaaactactcaagca 5196  T
Q  210 caacagcaagagacttc 226  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5197 caactgcaagagacttc 5213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 17658 - 17721
Alignment:
Q  35 gcggataaaacagagaaaaggagagaaaaaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaa 98  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17658 gcggataaaacagagagagagagagaggacaaacacaagcaatttatacaggttccttccacaa 17721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 30
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  102 aaagacacaggcaatt-atactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1668 - 1538
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctcactactaa 178  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| |||||| |||||     
T  1668 ggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactac 1570  T
Q  179 acttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1569 acctagtacgagacttcaaattgctcaagcac 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1861 - 1731
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctcactactaa 178  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| |||||| |||||     
T  1861 ggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactac 1763  T
Q  179 acttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1762 acctagtacgagacttcaaattgctcaagcac 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 15273 - 15345
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  15273 aaagacacaagcaatt-attctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16476
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaa-tcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 16436  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcaca 211  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16437 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcaca 16476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8454 - 8393
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8454 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 8393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11294 - 11233
Alignment:
Q  85 ggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11294 ggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 11233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Original strand, 4488 - 4649
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cacta--tgtaat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||   | || ||||||| ||||||    
T  4488 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 4586  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttc-aaattgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 233  Q
     ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  4587 atactacacctagtatgagacttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 18753 - 18838
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgt-cccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| |  |  || |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18753 aaagacacaagcgagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactat 18838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7223 - 7086
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgtt-cactatgt--aat---atcttattacaaatgctca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||  |||   | || ||||||| ||||||    
T  7223 ttataccggttccttccacaaatcggaagtagtcca-gtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctca 7125  T
Q  172 ctactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7124 atactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 7086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 778 - 848
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  778 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5512 - 5442
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  5512 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8778 - 8696
Alignment:
Q  63 aaagacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactat 147  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8778 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12826 - 12756
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  12826 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 12756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13801
Alignment:
Q  120 ccttgcacttccaaggagcgttcacta---tgtaatatcttattacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaat 199  Q
    |||||||||||||||||| || |||||   |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||| |||| |||||||||    
T  13883 ccttgcacttccaaggagagtacactacaatgtaatatctgattacaactgcccactgctaaaactagcaagagacttcaaat 13801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9725 - 9658
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9725 ttatacaggttccttccacaatccgaaagtag-tcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcacta 9658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 19450 - 19517
Alignment:
Q  78 ttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagcgttcacta 146  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19450 ttatacaggttcctttcataattcggaagtag-tcctgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 19517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 32350 - 32420
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32350 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagttca-gtccccctggcacttccaaggag 32420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 40049 - 40119
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  40049 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 40119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 35073 - 35125
Alignment:
Q  158 attacaaatgctcactactaaacttagtaagaaacttcaaattgctcaagcac 210  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35073 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaattgctcaagcac 35125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Original strand, 4844 - 4914
Alignment:
Q  65 agacacaagcaatttatacaggttctttccacaaatcggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggag 137  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  4844 agacacaagcaatt-atcctggttccttccacaaaccggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggag 4914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University