View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20345_low_3 (Length: 651)

Name: NF20345_low_3
Description: NF20345
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20345_low_3
NF20345_low_3
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (18-644)||(25568283-25568917)
chr4 (18-373)||(4333843-4334197)
chr4 (18-422)||(4322411-4322813)
chr4 (23-414)||(4358706-4359095)
chr4 (18-422)||(4125749-4126148)
chr4 (50-414)||(4135099-4135461)
chr4 (18-422)||(4343233-4343634)
chr4 (193-422)||(6499643-6499871)
chr4 (154-422)||(6674409-6674676)
chr4 (142-422)||(6547199-6547478)
chr4 (18-134)||(4351520-4351636)
chr4 (145-416)||(6649450-6649720)
chr4 (264-415)||(6814288-6814438)
chr4 (143-324)||(6714204-6714385)
chr4 (264-346)||(6756979-6757061)
chr4 (142-324)||(6834560-6834742)
chr4 (158-286)||(4351659-4351787)
chr4 (18-133)||(6726199-6726314)
chr4 (554-624)||(4319534-4319604)
chr4 (267-324)||(6589430-6589487)
chr4 (264-324)||(6751361-6751421)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (18-414)||(5395334-5395728)
chr6 (18-414)||(5183269-5183663)
chr6 (20-422)||(5068383-5068783)
chr6 (18-419)||(5075043-5075442)
chr6 (18-422)||(5424044-5424446)
chr6 (58-422)||(5348706-5349070)
chr6 (18-422)||(5691420-5691822)
chr6 (18-422)||(5094332-5094734)
chr6 (18-422)||(5148268-5148670)
chr6 (47-422)||(5368780-5369153)
chr6 (18-373)||(5341985-5342339)
chr6 (18-414)||(5355933-5356327)
chr6 (47-422)||(5133214-5133587)
chr6 (18-422)||(5104181-5104583)
chr6 (50-419)||(5175189-5175556)
chr6 (50-419)||(5277016-5277383)
chr6 (20-422)||(5158810-5159210)
chr6 (67-422)||(5261455-5261808)
chr6 (17-385)||(5445370-5445734)
chr6 (18-416)||(5381940-5382335)
chr6 (67-422)||(5285454-5285805)
chr6 (89-419)||(5431769-5432097)
chr6 (520-622)||(5353097-5353199)
chr6 (554-624)||(5101050-5101120)
chr6 (554-624)||(5136151-5136221)
chr6 (572-621)||(5351411-5351460)
chr6 (572-624)||(2938920-2938972)
chr6 (572-624)||(5156245-5156297)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (18-422)||(36215201-36215603)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (18-417)||(8876092-8876491)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (17-422)||(22585630-22586033)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (158-422)||(9977-10240)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (520-624)||(47985625-47985729)
chr3 (520-624)||(47994912-47995016)
chr3 (520-624)||(48004199-48004303)
chr3 (520-624)||(48013484-48013588)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 532; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 644
Target Start/End: Original strand, 25568283 - 25568917
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568283 atgcattcaagcaagcaagccctaaagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 25568382  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnn-taacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataa 216  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568383 gtcatatttgtttgataggggggggtaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataa 25568482  T
Q  217 gctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568483 gctatgatgctctaaatgatgatactcaggaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggttggtccgaaataatgtaatacatatattgaa 25568582  T
Q  317 tggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568583 tggttgtgaactttatgcagaaattggaataaacgtccttgttgagcgaagccttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 25568682  T
Q  417 gcgagaatgat-------tattattattataatgttaaataaaaattgagcctgttttcacaattacagattatgaataacgatggccattatggtgctt 509  Q
    |||||||||||       |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568683 gcgagaatgatgaaaaaattatattattatattgttaaataaaaattgagtctgttttcacaattacagattatgaataacgatggccattatggtgctt 25568782  T
Q  510 tcctacgccatgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaac 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568783 tcctacgccatgataattatccaaattggttgaccttgtacagtgaaggttcttcagtaatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaac 25568882  T
Q  610 aatgatttgcattgttgattcttggacctatgcta 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25568883 aatgatttgcattgttgattcttggacctatgcta 25568917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 4333843 - 4334197
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||| | || || | ||| |||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  4333843 atgcattcaagcaaacgagtcccacagaagatttttctgaaatttccagaaatgttgttaagtattctgggggattaccgctagctcttgaagtcctcgg 4333942  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||| |||||||||||||       ||  ||| |||     ||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4333943 gtcctatttgtttgatagggaga-tattagagtggatttgtgtattggagaaactcaaaataattcccaatgatcaagtacataagaagttaaaaataag 4334041  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||    
T  4334042 ctatgatggtttaaatgatgatactgagaaatcaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttattcaaatattaaat 4334141  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgt 373  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4334142 ggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagccttgt 4334197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4322813 - 4322411
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||  | |||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4322813 atgcattcaagcaagcgaggcctagcaaagatttttcagaaatttccacaaatgtagttcagtattctgggagattgccgctagctcttgaagtccttgg 4322714  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||| |||||||||||||       ||||||| |||     ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4322713 gtcctatttgtttgatagggagg-taacagagtggatttgtgtattggagaaactcaaaagaattcccaatgatcaagtacatcagaagttaaaaataag 4322615  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    ||| ||||   |||||||||||||  |||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||    
T  4322614 ctacgatggcttaaatgatgatacagagaaatcaatattccttgacattgcttgtttctttattgggatggatcgaaatgatgtcattcatatattaaat 4322515  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    |||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| ||  |||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  4322514 ggttctggatttttcgcagaaattggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaacggttgatg-ataagaacaagcttggcatgcatgatttgctg 4322416  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  4322415 cgaga 4322411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 414
Target Start/End: Original strand, 4358706 - 4359095
Alignment:
Q  23 ttcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcat 122  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  4358706 ttcaagcaaacaaggcctagagaagatttttctgaaatttccaaaaatgtagttaagtattctgcgggattgccactagctcttgaagtccttgggtctt 4358805  T
Q  123 atttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaa-tgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctat 221  Q
    ||||||||||||       |   ||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4358806 atttgtttgatagggagatttt-agagtgg-agatctgtattggataaactaaaaagaattcccaatgatcaagtgcataagaagttaaaaataagttat 4358903  T
Q  222 gatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggtt 321  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || | ||||||  |||| |    
T  4358904 gatggtttaaatgatgatacacagaaagaaatattccttgacatatcttgtttctttattggaatggaccggaatgatgttattcgtatattagatggct 4359003  T
Q  322 gtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttg 414  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  4359004 gtggattttttgcaggaattggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaacggttgatg-ataagaacaagcttggcatgcatgatttg 4359095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4126148 - 4125749
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4126148 atgctttcaagcaaacgagtcctagagatgattattctgaaatttctagaaatgtagttaaatattctgggggattgccactagctcttgaagtccttgg 4126049  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     || |||||||||||||       || |||| |||     ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4126048 atcctatttgtttgatagggagg-tatcagagtggatttgtgtattggagaaactcaaaagaattcccaatgatcaagtacataagaagttaaaaataag 4125950  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagat--atattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattga 315  Q
    |||||||| | ||||||||      |||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || | ||| || |    
T  4125949 ctatgatggtttaaatgata-----cagaaaaatcaatattccttgacatagcttgtttcttaattgggatggaccgaaatgatgttattcttattttaa 4125855  T
Q  316 atggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgt 415  Q
    |||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||     
T  4125854 atggctgtggacttttcgctgaaattggaataagtgtccttgttgaacgaagccttgtaacagttgatg-ataagaacaagcttggcatgcatgatttgc 4125756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4135461 - 4135099
Alignment:
Q  50 tttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaa 149  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  |  |||||| ||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||       ||||| ||    
T  4135461 tttgctcaaatttccataaatgttgtctagtattgtgggggactcccgctggctctggaagtccttgggtcctacttgtttgatagacagg-taacaaaa 4135363  T
Q  150 tgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcct-aacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaa 248  Q
    ||||||  | ||||||| || ||||| ||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||| |    
T  4135362 tgggagtgtctattggagaa-ctcaagagaattccccaatgatcaagtgcaaaagaagttgaaaataagctatgatggtttaaatgatgacaccgagaga 4135264  T
Q  249 gatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataa 348  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  4135263 gatatattccttgacattgcttttttctttattgggatggaccgaaacgatgttatggatatattaaatggttgtggtctttttgctgaaatcggaataa 4135164  T
Q  349 gtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttg 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  4135163 gtgtccttgttgagcgaagccttgtaactattgatg-ataaaaacaagcttggaatgcatgatttg 4135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Original strand, 4343233 - 4343634
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| ||  |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4343233 atgcattcaagctaacgagccctagagaagatttttctgaaatttccaaaaatg-agttaagtattgtgcgggattgcctctagctcttgaagtccttgg 4343331  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||| ||||||||||| |       ||  ||| |||     ||||||||| |||||||||| |||||| || | | |||| || |||||||| ||||||||    
T  4343332 gtcctatttgtttgagagggagc-tattagagtggatttctgtattggagaaactcaaaaaaattcccaatgatgaagtgcataagaagttaaaaataag 4343430  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    ||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| || | |||| | |||    
T  4343431 ctacgatggtttaaatgatgatacacagaaagaaatattcctcgacatatcttgtttctttattgggatggatcgaaatgatgttattcgtatactaaat 4343530  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||| | |||  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| |   |||||| ||  |||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  4343531 ggctgtggatttttcgcagaaatcggcataagtgtccttgttgagagaagccttgtaatggttgatg-ataagaacaagcttggcatgcatgatttgctg 4343629  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  4343630 cgaga 4343634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6499871 - 6499643
Alignment:
Q  193 aagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccg 292  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||   |||| |||| |||  ||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6499871 aagtacagaagaagttaaaagtaagctttgatggcttaaaagatgttacagagaaacacatattccttgatatagcttgcttctttattgggatggaccg 6499772  T
Q  293 aaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaa 392  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||| || | | ||||||  ||| ||||    
T  6499771 aaatgatgtaatacaaatattaaatgggtgtggattttttgctgatattggaattaaagtccttgtagagcgaagccttttaattattga-caataggaa 6499673  T
Q  393 cagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6499672 caagcttagaatgcatgatttgttgagaga 6499643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 422
Target Start/End: Original strand, 6674409 - 6674676
Alignment:
Q  154 agaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatat 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||  | | |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | |||| |||| |||  ||||| | ||    
T  6674409 agaatgttttggaaaaactcaaatgtatcccccatgatcaagtacaaaagaagctgaaagtaagcttcgatggtttaaaagatgttacagagaaacaaat 6674508  T
Q  254 attcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtc 353  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| || ||| ||| || |||||||| |  |||    
T  6674509 attccttgatatagcttgcttctttattgggatggaccgaaatgatgcaatacaaatattaaatgggtgtcaattttttgctgatattggaattaaagtc 6674608  T
Q  354 cttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    ||| | ||||||||| || | ||| ||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  6674609 cttttagagcgaagccttctaactgttga-caataggaacaagcttagaatgcatgatttattgagaga 6674676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6547478 - 6547199
Alignment:
Q  142 taacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatac 241  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||  | | | |||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | |||| |||| |||    
T  6547478 taacagagtggcagaaagtgttggagaaactcaaatgtattccccatgatgaagtacaaaagaagctgaaagtaagcttcgatggtttaaaagatgttac 6547379  T
Q  242 tcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaatt 341  Q
      | ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||| ||| || |||    
T  6547378 agacaaacaaatattccttgatatagcttgtttctttattgggatggacaaaaatgatgcaatacaaatattaaatgggtgtagattttttgctgatatt 6547279  T
Q  342 ggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6547278 ggaattaaagtccttgtagagcgaagccttgtaactgttga-caataggaacaagcttagaatgcatgatttgttgagaga 6547199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 4351520 - 4351636
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    ||||||||||||||   || || | ||| |||||| | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4351520 atgcattcaagcaaaagagtcccaaagaagatttttccgaaatttccataaatgtagttaagtactctggagggttgccgctagctcttgaagtccttgg 4351619  T
Q  118 gtcatatttgtttgata 134  Q
    ||| || ||||||||||    
T  4351620 gtcctacttgtttgata 4351636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 416
Target Start/End: Original strand, 6649450 - 6649720
Alignment:
Q  145 cagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactca 244  Q
    |||||||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||  | | ||||||||| |||||  ||||| | |||| ||||| | |||| ||||  ||  |    
T  6649450 cagaatggcagaaaatgttggagaaactcaaatgtattccccatgatcaagtacagaagaaactgaaagtcagctttgatggtttaaaagatgtaacaga 6649549  T
Q  245 gaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattgga 344  Q
    |||| | ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||| | ||| ||| || ||||||    
T  6649550 gaaacaaatattccttgatattgcttgtttctttattggaatggaccgaaatgatgcaatacaaatattaaatgggagtggattttttgctgatattgga 6649649  T
Q  345 ataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 416  Q
    || |  |||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  6649650 attaaagtccttgtagagagaagccttgtaactgttga-caataggaacaagcttagaatgcatgatttgtt 6649720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 415
Target Start/End: Original strand, 6814288 - 6814438
Alignment:
Q  264 atagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagc 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| |  || ||| || |||||||| |  |||||||||||||    
T  6814288 atagcttgtttctttattgggagggaccgaaatgatgtaatacgaatattaaatgggtgtggatattttgctgatattggaattaaagtccttgttgagc 6814387  T
Q  364 gaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgt 415  Q
    ||  | |||| ||| ||||  ||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  6814388 gagcccttgtaactgttga-caataggaacaagcttagaatgcatgatttgt 6814438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 324
Target Start/End: Original strand, 6714204 - 6714385
Alignment:
Q  143 aacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatact 242  Q
    |||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||| |||| |||     
T  6714204 aacagagtggcagaaagttttggagaaactcaaatgtattcctcatgatcaagtacagaagaagctgaaagtaagctttgatggtttaaaagatgttaca 6714303  T
Q  243 cagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtg 324  Q
     ||||| | |||||| |  | || |||||||||||||| ||||||| |  |||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6714304 gagaaacaaatattctttgatattgcttgtttctttatcgggatggacaaaaatgatataatacaaatattaaatgggtgtg 6714385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Original strand, 6756979 - 6757061
Alignment:
Q  264 atagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaat 346  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || ||||||||    
T  6756979 atagcttgtttctttattgggaaggacagaaatgatgtaatacaaatattaaatgggtgtggattttttgctgatattggaat 6757061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 324
Target Start/End: Original strand, 6834560 - 6834742
Alignment:
Q  142 taacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatac 241  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||  | | ||||||||| |||||| | | | |||||| ||||| | |||| |||| |||    
T  6834560 taacagagtggcagaaagttttggagaaactcaaatgtattccccatgatcaagtacagaagaagctaagagtaagctttgatggtttaaaagatgttac 6834659  T
Q  242 tcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtg 324  Q
      || || | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  6834660 agagcaacaaatatttctcgatatagcctgtttctttattgggatggaccaaaatgatgtaattcaaatattaaatgggtgtg 6834742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Original strand, 4351659 - 4351787
Alignment:
Q  158 tgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattc 257  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || |  |||||| | |||| | | |||||||||||  ||| | |||||||||| ||  |||||   ||||||    
T  4351659 tgtattggagaaactccaaagtattcccaatgagcaagtatataagaggctaaaaataagctaccatggtttaaatgatgacacggagaaatcaatattc 4351758  T
Q  258 ctcaacatagcttgtttctttattgggat 286  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4351759 cttgacatagcttgtttctttattgggat 4351787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 6726199 - 6726314
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||| ||  ||| | | |||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || |||||  ||||    
T  6726199 atgcattcaagcaatcaagtccaaaagaagattttgctaaacattcaacagatgtgattgcatattctgggggattgccactagcacttgaagtcattgg 6726298  T
Q  118 gtcatatttgtttgat 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  6726299 gtcatatttgtctgat 6726314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 4319604 - 4319534
Alignment:
Q  554 gaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcattgt 624  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||| ||||| || ||||||||    
T  4319604 gaaggttcttctgtaatttttgaagtccctcaagtggaaggacgtagcttgaagacaataatgtgcattgt 4319534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6589487 - 6589430
Alignment:
Q  267 gcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtg 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6589487 gcttgtttctttattgggatggacaaaaaggatgtaatacagatattaaatggttgtg 6589430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 6751361 - 6751421
Alignment:
Q  264 atagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtg 324  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  6751361 atagcctgtttctttattggaatggaccgaaatgatgtaattcaaatattaaatgggtgtg 6751421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Original strand, 5395334 - 5395728
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5395334 atgcattcaagcaagcgagtccaagagaagattttgcagaaatttcaagaaatgtagttgagtattctgggggattgccactagctctggaagtccttgg 5395433  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     ||| |||||||||| |       || |||| ||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5395434 atcacatttgtttga-attgggattagcagagtggaagtgtgtattagaaaaaatcaaaagaattcctaatgatcaagttcaaaagaagttaaaaataag 5395532  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||| |||    
T  5395533 ctatgatgctttaaatgatgacactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttttttattgggatggacaggaatgatgttatacatatattaaat 5395632  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttg 414  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  5395633 ggtagcgaactttttgcagaaattggagtaagtgtccttgttgagcgaagccttgtaactgttgatg-ataggaacagacttgcaatgcatgatttg 5395728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5183663 - 5183269
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5183663 atgcattcaagcaagcaggtcctagagaaggttttgctggaatttcaagaaatgtagttgagtattctgggggattgccactagctctggaagtccttgg 5183564  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     ||||||||||||||||       ||  ||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5183563 atcatatttgtttgatatgggga-tagaagaatggaagtgtgcattagaaaaactcaaaagaattcctaatgatcaagtacaaaagaagttaaaaataag 5183465  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||| |||    
T  5183464 ctacgatgctctaagtgatgacaccgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggacaggaatgatgttatacatatattaaat 5183365  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttg 414  Q
    ||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| || |||||| |||   |||||||||||||    
T  5183364 ggtagcgaattttttgcagaaattggagtaagtgtccttgttgagagaagccttgtaactgttgatg-ataggaacaaactgcaaatgcatgatttg 5183269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5068783 - 5068383
Alignment:
Q  20 gcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggt 119  Q
    ||||||||||||||  | |||| | | |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||    
T  5068783 gcattcaagcaagcgggtcctacaaaagattttgctgcaatttccagaaaggtcgttgagtattctgggggattgccactagctttggaagtccttgggt 5068684  T
Q  120 catatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagct 219  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5068683 catatttgtttgatagagagg-taacagaatggaaaagtgtattggacaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacaggagaagttaagaataagct 5068585  T
Q  220 atgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatgg 319  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||| |||||    
T  5068584 atgatgctttaaatgatgatactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttacacttatattaaatgg 5068485  T
Q  320 ttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcg 419  Q
     || | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | || | | ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5068484 atgcggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcgaagtctggttattgttgat-aaaaagaacaaacttggaatgcatgatttgttgcg 5068386  T
Q  420 aga 422  Q
    |||    
T  5068385 aga 5068383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5075442 - 5075043
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  5075442 atgcattcaaacaagcaagtcctatagaagattttgctggaatttcaagaaatgtagtggagtattctgggggattgccgctagctctacaagtcattgg 5075343  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    |||||||||||||||||       || |||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||    
T  5075342 gtcatatttgtttgataggggga-tagcagagtggaagtgtgtattggagaaactcataagaattcctaatgatcaagtgcagaagaagttaaaaataag 5075244  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | || |||||| |||    
T  5075243 ctatgatggtttaaacgatgacactgagaagaaaatattcctcgacatagcttgtttctttattgggatggatcgaaatgatgttacacttatattaaat 5075144  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  5075143 ggatgtgaactttttgctgaaattggagtaagtgtacttgttgagcgaagccttgtaactgtcgatg-ataggaacaagcttggaatgcatgatttgctg 5075045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Original strand, 5424044 - 5424446
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||| ||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  5424044 atgccttcaagcaagcgagtcctacaaaagattttgctgaaatttctagaaatgtagttgattattctggtggattgccactagctttggaagtccttgg 5424143  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    |||||||||||| || |       || |||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| | ||||||    
T  5424144 gtcatatttgttcgacagagggatta-cagaatggaaaagtgcattggaaaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacaggagaagttaagaataag 5424242  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | || |||||| |||    
T  5424243 ctatgatgctttaaatgatgatactgagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattggaatggacagaaatgatgttacacttatattaaat 5424342  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5424343 ggatgtggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcggagtcttgtcactgttgatg-ataataacaaacttggaatgcatgatttgttg 5424441  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  5424442 cgaga 5424446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 422
Target Start/End: Original strand, 5348706 - 5349070
Alignment:
Q  58 aatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||| | |     
T  5348706 aatttccagaaatgtagttgagtattctggaggattgccactagctttggaagtccttgggtcattattgtttgatagagggg-taacagaatggaaaag 5348804  T
Q  158 tgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattc 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5348805 tgtattggacaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacaggaaaagttaagaataagctacgatgctttgaatgatgatactgagaaagaaatattc 5348904  T
Q  258 ctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttg 357  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||    
T  5348905 cttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttacacttatattaaatggatgtgaactttttgctgaaattggaataagtatctttg 5349004  T
Q  358 ttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgc--atgatttgttgcgaga 422  Q
    |||| |||||  |||| ||| |||||| ||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5349005 ttgatcgaagtcttgtcactgttgatg-ataagaacaaacttggaatgcatatgatttgttgcgaga 5349070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5691822 - 5691420
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaag-ccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttg 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  5691822 atgctttcaagcaagcaagacccaagaaa-gattttgctgcattgtccaaaaatgtagttgagtattctgggggattgccactagctttggaagtccttg 5691724  T
Q  117 ggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataa 216  Q
    ||||| |||| ||||| |       |||||||||||||||  |||||| | |||||||||  |||||||||   |||||||||||| ||||| | |||||    
T  5691723 ggtcacatttatttgacaggatgg-taacagaatgggagagcgtattgaacaaactcaaagcaattcctaatcatcaagtacaaaaaaagttaagaataa 5691625  T
Q  217 gctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaa 316  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||  |    
T  5691624 gctatgatggtttaagtgattatacggagaaagaaatattccttgacgtggcttgtttctttattgggatggttcgaaatgatgttgtacatatattaga 5691525  T
Q  317 tggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 416  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5691524 tggttgtgatctttatgcaggaattggaataaatgtccttgtggagcgaagccttgtgactgttgatg-ataggaacaggcttagaatgcatgatttgtt 5691426  T
Q  417 gcgaga 422  Q
    ||||||    
T  5691425 gcgaga 5691420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Original strand, 5094332 - 5094734
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||||    
T  5094332 atgcattcaagcaagcgagtcctacaaacgattttgttgaaatttctagaaatgtagttgagtattctggggggttgccactagcattggaagtccttgg 5094431  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||||||||| || ||||       ||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||| | ||||||    
T  5094432 gtcatatttattcgatagggagg-taacagaatggaaaagtgcattggacaaactcaaaagaattcctaataatcaattacagaagaagttaagaataag 5094530  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | || |||||| |||    
T  5094531 ctatgatgctttaaatgatgacattgagaaagaaatattccttgatgtagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgacgttacacttatattaaat 5094630  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5094631 ggatgtggactttttgctgaaattggaataagtatccttgttgagcgtagtcttgtaactgttgatg-ataagaacaaacttggaatgcatgatttgttg 5094729  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  5094730 cgaga 5094734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5148670 - 5148268
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||   || |||||||||  ||  || ||||||||||||| |||||  ||||    
T  5148670 atgcattcaagcaagcgagtcctagagaagattttgctggaatatccagaaggatagttgagtatttggggcgactgccgctagctctggaagttattgg 5148571  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||| ||||| |||||||       ||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| ||||||||    
T  5148570 gtcgtatttatttgataggggga-taatagagtggaagtgtgtattggacaaactcaaaagaattcccaatgatcaagtgcagaagaagttaaaaataag 5148472  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||| | | ||||||||| |  |  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  5148471 ctatgacgatttaaatgatgttcttgtgaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtcatacatatattaaat 5148372  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||    
T  5148371 ggctgtgaactttatgcagaaattggaataaatgtcctactggagcgaagccttgtgactgttgatg-atatgaatcggcttggaatgcatgatttgttg 5148273  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  5148272 cgaga 5148268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 422
Target Start/End: Original strand, 5368780 - 5369153
Alignment:
Q  47 gattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaaca 146  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |       |||||    
T  5368780 gattttgctaaaatttctagaaatgtagtggagtattctgggggattgccactagctttggaagttattgggtcatatttgtttgacagaggga-taaca 5368878  T
Q  147 gaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcaga 246  Q
    |||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  5368879 gaatggaaaagtgcattggacaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacagaagaagttaagaataagctatgatgctttaaatgatgattatgaga 5368978  T
Q  247 aagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaat 346  Q
    |||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5368979 aagaaatattccttgatgtagcttgtttctttattgggaaggaccgaaatgatgttacacttatattagatggatgtggactttttgctgaaattggaat 5369078  T
Q  347 aagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5369079 aagtatccttgttgagcgaagtcttgtcactgttgatg-ataagaacaaacttggaatgcatgatttgttgcgaga 5369153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 5341985 - 5342339
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||   ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    
T  5341985 atgcgttcaagcaagcaagtccaagagatggttttgttggaatttctgaaaatgtagtcgagtattgtggtggattgccgctagctttggaagttctagg 5342084  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     ||||||||||||||||        |  ||||||| |   || ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5342085 ctcatatttgtttgatagaggggc-agtagaatggaactgtgcattagaaaaacttaaaagaattcctaacaatcaagtacaaaagaagttaaaaataag 5342183  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  5342184 ctatgatggtttaaatgacgagactgagaaagaaatatttcttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgtcatacaaatattaaat 5342283  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgt 373  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5342284 ggctgtggactttttgcagaaattggaataagtgttcttgttgagcgaagccttgt 5342339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5356327 - 5355933
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  5356327 atgcattcaagcaagcaagtcctacaaaagatttagctggaatttccagaaatgtagttgagtattctggaggattaccgctggctctagaagtccttgg 5356228  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||| |||||||| || |       || | || ||| | | ||  ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  | ||||||||    
T  5356227 gtcgtatttgttcgacagggagg-tagcggagtggtacagtgccttggagaaactcaaaagaattcctaacaaccaagtacaaaagaaactaaaaataag 5356129  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||| | ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | ||  ||||| |||    
T  5356128 ctatgatggtttaaatgatgatgccgagaaagaaatatttcttgacatagcttgtttctttattgggatcgaccgaaatgatgctacactaatattaaat 5356029  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttg 414  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||  ||| || ||| ||||||||||||||    
T  5356028 ggatgtggactttatgctgaaattggaataagtattcttgttgagcgaagccttgtaactgttgatg-ataagaataggcttagaatgcatgatttg 5355933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5133587 - 5133214
Alignment:
Q  47 gattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaaca 146  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||       |||      
T  5133587 gattttgctgaaatttctagagacgtagttgagtattctgggggattgcctctagctctagaagtccttgggtcatatttgctagataggagtg-taatc 5133489  T
Q  147 gaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcaga 246  Q
    || ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  5133488 gagtggcaatgtgtattggagaaactcagaagaattcctaataatcaagtacaaaagaagctaaaaataagctatgatgctttaaatgaagatattgaga 5133389  T
Q  247 aagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaat 346  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |  |||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5133388 aagaaatattccttaacatagcttgtttttttattgatatggacacaaatgatgttacacatatattaaatggttgtggactttttgccgaaattggaat 5133289  T
Q  347 aagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||  |  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5133288 aagtattcttattgagagaagccttgtaactgttgatg-ctaaggacaggcttggaatgcatgatttgttgagaga 5133214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5104583 - 5104181
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||  || || | | | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||||    
T  5104583 atgcattcaagcaagtgagtccgacaaaagattttattgaattttctagaaatgtagttgagtattctggggggttgccactagcattggaagtccttgg 5104484  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    ||||||||| || ||||       ||| ||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||    
T  5104483 gtcatatttattcgatagagaag-taagagaatggaaaagtacattggacaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacaaaagaagttaagaataag 5104385  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    ||| |||| | |||||||||| | | ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | || ||||||  ||    
T  5104384 ctacgatggtttaaatgatgacattgagaaagaaatattcctcgatgtagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgacgttacacttatattagat 5104285  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5104284 ggatgtggactttttgcagaaattggaataagtatccttgttgagcgaagtcttataactgttgatg-ataagaacaaacttggaatgcatgatttgttg 5104186  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  5104185 cgaga 5104181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 419
Target Start/End: Original strand, 5175189 - 5175556
Alignment:
Q  50 tttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaa 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |       ||||||||    
T  5175189 tttgttgaaatttccaaaaatgttgttaagtattctgggggattgccgttagctctagaagttcttgggcgctatttgtttgagaagaagg-taacagaa 5175287  T
Q  150 tgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaag 249  Q
    ||| |   ||||||| | |||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||   ||||||     
T  5175288 tggaattgtgtattgaagaaactagaaagaattcctaatgacaaagtacaaaagaagttaaaaataagctatgatggtttagacgatgattaccagaaat 5175387  T
Q  250 atatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataag 349  Q
      ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  5175388 caatattcctcgacgtagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgttatacatatattaaatggctgtggattttttgcagaagatggaataag 5175487  T
Q  350 tgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcg 419  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||  ||||| |||   ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  5175488 tgtcctggttgagcgaagcttagtaacggttgat-aataaaaacaagcttggaatgcataatttgttgcg 5175556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 419
Target Start/End: Original strand, 5277016 - 5277383
Alignment:
Q  50 tttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaa 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |       ||||||||    
T  5277016 tttgttgaaatttccaaaaatgttgttatgtattctgggggattgccgttagctctagaagttcttgggcgctatttgtttgagaagaagg-taacagaa 5277114  T
Q  150 tgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaag 249  Q
    ||| |   ||||||| | |||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||   ||||||     
T  5277115 tggaattgtgtattgaagaaactagaaagaattcctaatgacaaagtacaaaagaagttaaaaataagctatgatggtttagacgatgattaccagaaat 5277214  T
Q  250 atatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataag 349  Q
      ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  5277215 caatattcctcgacgtagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgttatacatatattaaatggctgtggattttttgcagaagatggaataag 5277314  T
Q  350 tgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcg 419  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||   ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  5277315 tgtccttgttgagcgaagcttagtaacggttgat-aataaaaacaagcttggaatgcataatttgttgcg 5277383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5159210 - 5158810
Alignment:
Q  20 gcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggt 119  Q
    |||||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||  | ||||| || ||||    
T  5159210 gcattcaagcaagcgagtcctacaaacgattttgttgaaatttctagaaatgtagttaagtattctggggggttgccactagcattggaagtcctagggt 5159111  T
Q  120 catatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagct 219  Q
    || |||| ||  |||       ||||||||||| | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||   ||||||||    
T  5159110 cacatttattcaatagggagg-taacagaatggaaaagtgcgttggacaaactcaaaagaattcctaataatcaagtacataagaagttacgaataagct 5159012  T
Q  220 atgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatgg 319  Q
    | |||||| ||||||||||   | ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || | || |||||| |||||    
T  5159011 acgatgctttaaatgatgactttgagaaagaaatattccttgatgtagcttgtttctttatagggatggaccgaaatgacgttacacttatattaaatgg 5158912  T
Q  320 ttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcg 419  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5158911 atgtgaactttttggtgaaattggaataagcatccttgttgagcgtagtcttgttactgttgatg-gtaagaacaaacttggaatgcatgatttgttgcg 5158813  T
Q  420 aga 422  Q
    |||    
T  5158812 aga 5158810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5261808 - 5261455
Alignment:
Q  67 aaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattgga 166  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||        | |  | ||||    |||||||||    
T  5261808 aaatgtagttgaatattgtggaggattgccgctagctctcgaagtccttgggtcttatttgtttgataagacgaa-atctaagtgggttcttgtattgga 5261710  T
Q  167 aaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacata 266  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| | |||||| ||||||| | | || |||||   | || |||| ||||| ||  |||||    
T  5261709 gaaactcaaaagaattcctaatgatcaagtgcagaagaagttaagaataagttatgatgatttgaaagatgacgatgagcaagaaatatttcttgacata 5261610  T
Q  267 gcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaa 366  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||   |||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5261609 gcttgtttcttaattggaatggaccgaaatgatgttatactcgtattaaatgactgtggacttcatgcagaaattggaataagcgtccttgttgagagaa 5261510  T
Q  367 gctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    || |||||| | |||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5261509 gccttgtgagtgttgatg-ataagaacatgcttggaatgcatggtttgttgcgaga 5261455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 385
Target Start/End: Original strand, 5445370 - 5445734
Alignment:
Q  17 aatgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttg 116  Q
    ||||||||||||| |||  | |||| | | ||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5445370 aatgcattcaagcgagcgtgtcctacaaaagattttgttagaatttccaaaaatgtagttgaatattctgagggattgccgctagctcttgaagtccttg 5445469  T
Q  117 ggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataa 216  Q
    |||| ||||||||| |||        | |||| |||||   ||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| |  || |    
T  5445470 ggtcttatttgtttaataagacgga-atcagagtgggaacttgtattggagacactcaaaagaattccttatgatcaagtgcagaagaagttaaggatga 5445568  T
Q  217 gctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaa 316  Q
    | ||||||| | ||||| |||   || ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||| || |||| |||| |||| | |||| ||    
T  5445569 gttatgatggtttaaatcatg---ctgagaaagaaatattccttcacattgcttgtttctttgtcgggatggaccaaaatgatgttatacttttattaaa 5445665  T
Q  317 tggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatga 385  Q
    || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  5445666 tgattgcggactttctgcagaaattggaataagtgtccttgttgctcgaagccttgtgactgttgatga 5445734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Original strand, 5381940 - 5382335
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||  | ||||||  | | |  || |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5381940 atgcattcaagcaaccaaggcctacagaagatttttttaaaatttgtaaagaaatagttgactactctgggggattgcctctagctctagaagtccttgg 5382039  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     || | ||||||||| |       || |||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||| || | | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  5382040 ttcttttttgtttga-aaggggagtagcagattggaagtgtgtattggagaaaatcaaaataattcccaatgatgaagtacaacggaagttaaaaataag 5382138  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||||| | ||||||| ||||   | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| | ||| ||||| |||    
T  5382139 ctatgatggtttaaatgacgatagcgaaaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttatt-ggatggaccgaaacgatgttacacaaatattaaat 5382237  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 416  Q
    || ||||  |||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  5382238 gggtgtgggctttttgctgatatcggaataagtgtccttgttgagagaagccttgtaactgtcgatg-ataagaatacacttggaatgcatgatttgtt 5382335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5285805 - 5285454
Alignment:
Q  67 aaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaa-tgggagaatgtattgg 165  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||        || | || |||||   ||||||||    
T  5285805 aaatgtagttgaatattgtggaggattgccgctagctctcgaagtccttgggtcttatttgtttgataaggcaa--aatataagtgggatcttgtattgg 5285708  T
Q  166 aaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacat 265  Q
    | |||||||||| ||||||| ||  |||||| || |||||||| | |||||| ||||||| | | || ||| ||  | || |||| ||||||||  |||     
T  5285707 agaaactcaaaataattcctcacaatcaagtgcagaagaagttaagaataagttatgatgatttgaaagataatgatgagcaagaaatattccttgaca- 5285609  T
Q  266 agcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcga 365  Q
     ||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||| ||||   |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5285608 -gcttgtttcttaattggaatggacagaaatgatgttatactcgtattaaatgactgtggactttatgcagaaattggaataagcgtccttgttgagaga 5285510  T
Q  366 agctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    ||| |||||| | |||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  5285509 agccttgtgagtgttgatg-ataagaacatgcttggaatgcatggtttgctgcgaga 5285454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 419
Target Start/End: Original strand, 5431769 - 5432097
Alignment:
Q  89 ggattgccgctagctctagaagtgcttgggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |       ||||||||||| |   |||| |||| |||||||||| |||||| ||     
T  5431769 ggattgccgctagctctagaagttcttgggcgatatttgtatgagagggatg-taacagaatggaaatgtgtactggagaaactcaaaacaattcccaat 5431867  T
Q  189 ggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatgg 288  Q
      | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || | ||| |  | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  5431868 aataaagtacaaaataagttaaaaataagctatgatggtttagacgataaatcccagaaagcaatattccttgacatagcttgtttctttattggtaagg 5431967  T
Q  289 tccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaatt 388  Q
      |||||| |||| ||||||||| | ||||| |||  | | | ||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||||| ||     
T  5431968 agcgaaatgatgttatacatatactaaatggctgtcgattgtttgctgaagatggaataagagtccttgttgagcgtagcttagtatatattgatg-atg 5432066  T
Q  389 ggaacagacttggaatgcatgatttgttgcg 419  Q
      ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5432067 ataacaagcttggaatgcatgatttgttgcg 5432097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 5353199 - 5353097
Alignment:
Q  520 tgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| | || ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||    
T  5353199 tgatagttatccaaattggttaaccttctactctgaaggttcttctgtaacttttcatgtccctctggtggaagggcgtaacttgaagacaatgatgtgc 5353100  T
Q  620 att 622  Q
    |||    
T  5353099 att 5353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 5101120 - 5101050
Alignment:
Q  554 gaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcattgt 624  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  5101120 gaaggttcttctgtaactttagaagtccctcaagtggaagggcgtaacttgaagacaatgatgtgcattgt 5101050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 5136221 - 5136151
Alignment:
Q  554 gaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcattgt 624  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  5136221 gaaggttcttctgtaactttagaagtccctcaagtggaagggcgtaacttgaagacaatgatgtgcattgt 5136151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 621
Target Start/End: Original strand, 5351411 - 5351460
Alignment:
Q  572 tttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcat 621  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  5351411 tttgaagttcctcaagtggaagggcgtgacttgaagacaatgatgtgcat 5351460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 624
Target Start/End: Original strand, 2938920 - 2938972
Alignment:
Q  572 tttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcattgt 624  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  2938920 tttgaagttcctcaagtggaagggcgtaacttgaagacaatgatgtgcattgt 2938972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 5156297 - 5156245
Alignment:
Q  572 tttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgcattgt 624  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  5156297 tttgaagttcctcaagtggaagggcgtaacttgaagacaatgatgtgcattgt 5156245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36215603 - 36215201
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||||||||||||||  || || | ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||    
T  36215603 atgcattcaagcaagtgaggcccaaagaagattttgctggaatttccagcaatgtagttgagtattctgggcaactaccgttagctctggaagtccttgg 36215504  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
    |||||||||||||||||       ||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36215503 gtcatatttgtttgataggggga-taatagagtggaagtgtgtattggacaaactcaaaagaattcccaatgaccaagtacaaaagaagttaaaaatgag 36215405  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaat 317  Q
    |||||| | |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  36215404 ctatgaaggtctaaatgatgacacggagaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggacagaaatgatgttatacatatattaaat 36215305  T
Q  318 ggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttg 417  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36215304 ggaagtgaactttttgcagaaattggagtaagtgttcttgtagagcgaagccttgtaactgttgatg-ataggaacaggcttggaatgcatgatttgctg 36215206  T
Q  418 cgaga 422  Q
    |||||    
T  36215205 cgaga 36215201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 417
Target Start/End: Original strand, 8876092 - 8876491
Alignment:
Q  18 atgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttgg 117  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  8876092 atgcgttcaagcaaccgagtcctagagaaaattttgttggaatgtccagaaatgtagttgagtattctgggggattgccaccagctctagaagttcttgg 8876191  T
Q  118 gtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataag 217  Q
     |||||||||||||| |       || | || ||| |   |||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8876192 atcatatttgtttga-aaggggggtagccgagtggaaatgtgtattggaaaaactcaaaaaaatccccaatgatcaagtacatgagaagttaaaaataag 8876290  T
Q  218 ctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatata--ttga 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  || |    
T  8876291 ctatgatggtctaaatgatgatattgcgaaagaaatattccttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaatgatgttatacatatattttaa 8876390  T
Q  316 atggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgt 415  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||    
T  8876391 atgggtgtgaactttatcctgaaattggaataagtgttcttgttgaacgaagccttgtaaccatggatgaa-aggaatatgcttggaatgcatgatttgt 8876489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22586033 - 22585630
Alignment:
Q  17 aatgcattcaagcaagcaagccctagagatgattttgctgaaatttccagaaatgtaattgagtattctggaggattgccgctagctctagaagtgcttg 116  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||  |||||| ||||||||||||  |||||  || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22586033 aatgcattcaagcaagcgagacccaaagtagatttttctgaaatttccatgaatgtggttaattattctggagggttgccgctagctctggaagtccttg 22585934  T
Q  117 ggtcatatttgtttgatannnnnnntaacagaatgggagaatgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataa 216  Q
    ||   |||||||||| ||       ||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| | |||||    
T  22585933 ggcgttatttgtttgctagagggg-taacagaatggcaatgtgtattggagaaactcaaaagaattcctaatgatcaagtgcagaagaagttaagaataa 22585835  T
Q  217 gctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattcctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaa 316  Q
    | ||||||| | |  | |||  |  | || |||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||    
T  22585834 gttatgatgatttggaagatactgatgagcaagaaatattccttgacatagcttttttcttaattggaatggaccgaaatgatgttatactcatattaaa 22585735  T
Q  317 tggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttgttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgtt 416  Q
    ||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| |    
T  22585734 tgactgtggacttcatgcagaaattggaataagcgtccttgttgagagaagccttgtgagtgttgatg-ataagaacaggcttggaatgcatgatttgct 22585636  T
Q  417 gcgaga 422  Q
    ||||||    
T  22585635 gcgaga 22585630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10240 - 9977
Alignment:
Q  158 tgtattggaaaaactcaaaagaattcctaacggtcaagtacaaaagaagttgaaaataagctatgatgctctaaatgatgatactcagaaagatatattc 257  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| || | | ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10240 tgtattggagaaaatcaaaataattcccaaagatgaagtacaacggaagttaaaagtaagctatgatggtttaaatgatgatacagaaaaagatatattc 10141  T
Q  258 ctcaacatagcttgtttctttattgggatggtccgaaataatgtaatacatatattgaatggttgtgaactttatgcagaaattggaataagtgtccttg 357  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||| ||||| ||||| |||| ||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  10140 cttgacatagcttgtttctttattgggatggaccgaaacgatgttacacaaatattaaatggatgtggactttttgctaatatcggaataagtgtccttg 10041  T
Q  358 ttgagcgaagctttgtgactattgatgaattggaacagacttggaatgcatgatttgttgcgaga 422  Q
    ||||||||||| || | ||| | |||| ||  ||| | |||||||||||||||||| || |||||    
T  10040 ttgagcgaagccttctaactgtcgatg-ataagaatacacttggaatgcatgatttattacgaga 9977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 47985729 - 47985625
Alignment:
Q  520 tgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |  ||| || |||||||| |||    
T  47985729 tgatagttatccaaattggttaacctttaattctgaaggttcttcggtaacttttgaagtccctcaagtggaaaggcataacttaaagacaatgatgtgc 47985630  T
Q  620 attgt 624  Q
    |||||    
T  47985629 attgt 47985625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 47995016 - 47994912
Alignment:
Q  520 tgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |  ||| || |||||||| |||    
T  47995016 tgatagttatccaaattggttaacctttaattctgaaggttcttcggtaacttttgaagtccctcaagtggaaaggcataacttaaagacaatgatgtgc 47994917  T
Q  620 attgt 624  Q
    |||||    
T  47994916 attgt 47994912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 48004303 - 48004199
Alignment:
Q  520 tgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |  ||| || |||||||| |||    
T  48004303 tgatagttatccaaattggttaacctttaattctgaaggttcttcggtaacttttgaagtccctcaagtggaaaggcataacttaaagacaatgatgtgc 48004204  T
Q  620 attgt 624  Q
    |||||    
T  48004203 attgt 48004199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 48013588 - 48013484
Alignment:
Q  520 tgataattatccaaattggttgaccttctacagtgaaggttcttcaataatttttgaagtacctcgagtggaagggcgtgtcttgaaaacaatgatttgc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |  ||| || |||||||| |||    
T  48013588 tgatagttatccaaattggttaacctttaattctgaaggttcttcggtaacttttgaagtccctcaagtggaaaggcataacttaaagacaatgatgtgc 48013489  T
Q  620 attgt 624  Q
    |||||    
T  48013488 attgt 48013484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University