View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20364_low_15 (Length: 316)

Name: NF20364_low_15
Description: NF20364
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20364_low_15
NF20364_low_15
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (10-299)||(20046280-20046566)
chr3 (10-299)||(20015873-20016159)
chr3 (29-299)||(20036294-20036561)
chr3 (70-299)||(19812437-19812669)
chr3 (29-299)||(19849150-19849423)
chr3 (10-299)||(26647161-26647447)
chr3 (10-272)||(17114900-17115159)
chr3 (29-299)||(19956244-19956511)
chr3 (29-299)||(19818714-19818987)
chr3 (29-181)||(19858344-19858496)
chr3 (29-299)||(19838553-19838820)
chr3 (106-299)||(26653309-26653499)
chr3 (70-294)||(19951286-19951507)
chr3 (30-191)||(19832134-19832295)
chr3 (107-181)||(19989797-19989871)
chr3 (140-288)||(30914814-30914959)
chr3 (28-181)||(24839667-24839820)
chr3 (32-181)||(19943989-19944138)
chr3 (250-299)||(19943876-19943925)
chr3 (107-181)||(19853766-19853840)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (10-294)||(12497371-12497651)
chr7 (10-294)||(12521236-12521516)
chr7 (10-288)||(12579763-12580032)
chr7 (10-288)||(12495667-12495934)
chr7 (216-293)||(12581555-12581632)
chr7 (10-95)||(12519468-12519553)
chr7 (10-129)||(12581647-12581766)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (29-299)||(9815194-9815461)
chr5 (30-299)||(26354619-26354885)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (10-293)||(6397411-6397691)
chr4 (67-279)||(6398440-6398650)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (106-181)||(22689444-22689519)
chr8 (107-181)||(11544345-11544419)
chr8 (229-299)||(22651781-22651851)
chr8 (250-299)||(22689564-22689613)
chr8 (229-274)||(22685596-22685641)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (150-299)||(1717371-1717517)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20046566 - 20046280
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20046566 aagaaaatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcgtgaaccttatgccacctaaacaataaagggtcgctgggattg 20046467  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046466 atcaacatgggttgtggtggtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 20046367  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20046366 cacc---accaaccggatattttaacagatcaataattgtgttcttaaataaacttaaatccttatatatgctacccaaaacagcaggtg 20046280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 20015873 - 20016159
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||    
T  20015873 aagaaaatcatcaatagctgagtctaatgccaccataacattgtcaattttcaaagcctgaaccttatgccacctaaacaataaagggtcttcatgattg 20015972  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||| | |||| | ||||    
T  20015973 atcaacatgggttgtggttgtaaaattttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaaataaatgggtgattgaagtgtaacttctaaaggatacctat 20016072  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||||||  ||    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20016073 caccacccacat---gatattttgacaaatcaacaattgttttcttaaacaaacttaaatctttatatatgctagccaagacagctggtg 20016159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Original strand, 20036294 - 20036561
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||  |||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |   | || | |||||||||||||||||    
T  20036294 gagtctaatgccatcctaacattgtcaatcatcaagggcttaaccttatgccacctaaacaaaaaagggtccccatggttcaacaacatgggttgtggtt 20036393  T
Q  129 gtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggata 228  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||    || |    
T  20036394 gtaaatttttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattcaagagtaacttctaaaggaagtctatcaccaccaacat---gaca 20036490  T
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  20036491 ttttgacaaatcaacaattgttttcttaaacaaagttaaatccttatatagactagctaaaacagcaggtg 20036561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19812669 - 19812437
Alignment:
Q  70 aaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgg------gttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttga 163  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||| |      |||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  19812669 aaccttatgccacctaaacaaaaaagggtcgccatggttgatcaacatagtttgttgttgtggttgcaaatttttgaacctctcccaaacccaaatttga 19812570  T
Q  164 accaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaac 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||  || |  |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19812569 accaagtaaaagggtgattgaagagtaatctccaagggaaatctatcaccaccaaca---ggatattttgacaaatcaacaattgttttcttaaacaaac 19812473  T
Q  264 ttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19812472 ttaaatctttatatatgctagccaagacagctggtg 19812437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19849423 - 19849150
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |   | ||| ||||||||| |||||| |    
T  19849423 gagtctaatgccaacctaacattgtcaattttcaaggcctgaaccttatgccatctaaacaataaaggatccccatggttggtcaacatggtttgtggct 19849324  T
Q  129 gt------aattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaac 222  Q
    ||      || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||  || |  |||||||||||||||||| ||      
T  19849323 gtggttgcaaatttttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaaataaaagggtgatttaagagtaatctccaagggaaatctatcaccaccaacat- 19849225  T
Q  223 tggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
      || ||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  19849224 --gacattttgacaaatcagtgattgttttcttaaacaaagttaaatccttatatagactagctaaaacagcaggtg 19849150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26647447 - 26647161
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| |||||| ||||  || |||| |||| |||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |   | |||    
T  26647447 aagaaaatcatcaacagccgaatctagtgcccacttaacactgtcaattttcaagatcttaaccttatgccacctaaacaacaaagggtctccttggttg 26647348  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||    
T  26647347 atcaaattgggttgtggttgtaaatttttgaacctttcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagagtaacttccaaaggatatctat 26647248  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||||||| ||   | |  ||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  26647247 caccaccatca---gaaatttttttcaaatcaacaagtgttttcttaaacaaacttaaatccttatataagctagctaaaacagccggtg 26647161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17115159 - 17114900
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |   | |||    
T  17115159 aagaaaatcatcgacagctaagtctaatgctagcttaacattgtcaattttcacggcctgaaccctatgccacctaaacaataaagggtctccatggttg 17115060  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||   | ||  || || ||| | |||||||||||    
T  17115059 atcaacatggattgtggttgtaaatttttgaacctctcccacatccaaatttgaaccaagtaaaagggcattcgacgagcaacttctaaaggaaatctat 17114960  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatcct 272  Q
       |||||  ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  17114959 ---caccataaacaggattttttgacaaatcaataatagttttcttaaacaaagtcaaatcct 17114900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19956511 - 19956244
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||  | || | ||||||||||||||| |    
T  19956511 gagtctaatgccatcctaacattgtcaactatcaagggcttaaccttatgccacctaaacaaaaaagggttcctatggttcaacaacatgggttgtggct 19956412  T
Q  129 gtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggata 228  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||   |||| |||||||||   |||| || |||||    
T  19956411 gtaaatttttgaacctttcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagagtaagttctgaaggatatctatcac---cacccacaggata 19956315  T
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||| ||| |||||   || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19956314 ttttgacaaatcaactgtttttttctttaacaaagttaaatccttatatatgctagctaaaacagctggtg 19956244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19818987 - 19818714
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtgg-- 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |   | || |||||||||| ||||||      
T  19818987 gagtctaatgccatcctaacattgtcaatttccaaggcctgaacatcatgccacctaaacaaaaaagggtctccatggtttatcaacatggtttgtggca 19818888  T
Q  127 ----ttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaac 222  Q
        ||| |  |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||   ||||||    
T  19818887 gtggttgcatatttttgaacctctcccacacccatatttgaaccaaataaaagggtgattgaagagtaagttctaaaggaaatctatcacc---accaac 19818791  T
Q  223 tggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
     | ||||||| ||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  19818790 agaatattttgacaaatcaactatttttttcttaaacaaacttaaatctttataaatgttagccaaaacagccggtg 19818714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19858496 - 19858344
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |   | |||||||||||||||||||| |    
T  19858496 gagtctaatgccaacttaacattgtcaactttcaaggccttaaccttatgccacctaaacaataaaggttctccatgcttgatcaacatgggttgtggct 19858397  T
Q  129 gtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
     ||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19858396 ctaaatttttgaacctttcccaaacccaaacttgaagcaagtaaaagggtgat 19858344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19838820 - 19838553
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    |||||||| |||| | ||| ||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |   | || | |||||| ||||||||||    
T  19838820 gagtctaaagccatcctaatattgtcaattatcaaggccttaactttatgccacctaaacaaaaaagggtccccctggttcaacaacattggttgtggtt 19838721  T
Q  129 gtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggata 228  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| || |||   ||| |||||| ||||     
T  19838720 gtaaatttttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagagtaacttctaaaggatatgtat---cacaaccaacaggatg 19838624  T
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||| ||| |||||   || ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19838623 ttttgacaaatcaactgtttttttctttaacaaagttaaatcattatatatgctagctaaaacagctggtg 19838553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26653499 - 26653309
Alignment:
Q  106 attgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaat 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||| | |||||||    
T  26653499 attgatcaacttgggttgtggttgcaaatttgtgaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgatcgtagattaacttccaaaggaaat 26653400  T
Q  206 ctatcaccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||||||||||| ||     ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  26653399 ctatcaccaccaacata---atattttgacaaaccaacaattgttttcttaaacaaagtcaagtccttatatatactagctaaaacagctggtg 26653309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19951507 - 19951286
Alignment:
Q  70 aaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |   | || |||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||| |||||||||     
T  19951507 aaccttatgccacctaaacaaaaaagggtctccatggtttatcggcatgggttgtggttgtaaatttttaaacctctcccaaatccaaatttgaaccaag 19951408  T
Q  170 taaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaat 269  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||  ||    |||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  19951407 taaaagggtgattgaagagtaagttctaaaggatatctatcaccacccacat---gatattttgacaaatcaacaattgcttttttaaacaaagttaaat 19951311  T
Q  270 ccttatatatgctagccaagacagc 294  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  19951310 ccttatatatgctagctaaaacagc 19951286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19832295 - 19832134
Alignment:
Q  30 agtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggttg 129  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  || |     || | ||||||||||||||| ||    
T  19832295 agtctaatgccatcctaacattgtcaattaccaaggccttaaccttatgccacctaaacaaaaatggttcccctttgttcaacaacatgggttgtggatg 19832196  T
Q  130 taattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaa 191  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  19832195 taaatttttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagagtaa 19832134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19989871 - 19989797
Alignment:
Q  107 ttgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19989871 ttgatcagcatgggttgtggttgtaaatttttgaacctctcccaaacccaaacttgaaccaagtaaaagggtgat 19989797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30914959 - 30914814
Alignment:
Q  140 aacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggatattttaacagat 239  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||  ||| |||||  || | |||| ||||||||||||||   ||| |||||||| ||| |     
T  30914959 aacctctcccaaacccaaatttgtaccaagtcaaagggtgagtgaagagtaacctccataggacatctatcaccacca---acttgatattttgacaaac 30914863  T
Q  240 caataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaa 288  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30914862 caactattgttttcttaaacaaacttaaatctttgtatatgctagccaa 30914814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 24839667 - 24839820
Alignment:
Q  28 tgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggt 127  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |    ||||  |||| ||||||||||     
T  24839667 tgagtctaatgccaacctcacattgtcaattttcaaggccttaacattatgccacctcaacaatacatggtctcgattattgcccaacttgggttgtggc 24839766  T
Q  128 tgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    || || |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24839767 tgcaaatttttgaacctttcccaaacccaaacttgaaccaggtaaaagggtgat 24839820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19944138 - 19943989
Alignment:
Q  32 tctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggttgta 131  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |    |||||||||| | |||||||| || |    
T  19944138 tctaatgccaaccccacattgtcaattttcaaggccttaacattatgccacctcaacaatacatggtctccattattgatcaactttggttgtggctgca 19944039  T
Q  132 attttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19944038 aatttttgaacctttcccaaacccaaacttgaaccaggtaaaagggtgat 19943989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19943925 - 19943876
Alignment:
Q  250 tttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19943925 tttcttaaacaaactcaaatccttatataagctagccaaaacagcaggtg 19943876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19853840 - 19853766
Alignment:
Q  107 ttgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  19853840 ttgatcaacttcggttgtggctgcaaatttatgaatctctcccacacccaagcttgtaccaagtaaaagggtgat 19853766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12497651 - 12497371
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   ||  || | |||    
T  12497651 aagaaaatcattgacagttgagcctaatgcacacttaacattgccaattttcaaggccagaaccttatgccacctcaacaataaatgttctatgtggttg 12497552  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||    
T  12497551 atcaacatgagttgtggttgcaagtttgcgagcctctccca-acccaaacatgaaccaagtaaaaaggtgagagaaaagtaaattcaacagaaaatatat 12497453  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagc 294  Q
     | |||||  ||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12497452 tatcaccaataa---gatgttttgacagatcaataattgttttcttaaataaagttaaatcgttatttatgctagccaaaacagc 12497371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12521516 - 12521236
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   ||  || | |||    
T  12521516 aagaaaatcattgacagttgagcctaatgcacacttaacattgccaattttcaaggccagaaccttatgccacctcaacaataaatgttctatgtggttg 12521417  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||    
T  12521416 atcaacatgagttgtggttgcaagtttgcgagcctctccca-acccaaacatgaaccaagtaaaaaggtgagagaaaagtaaattcaacagaaaatatat 12521318  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagc 294  Q
     | |||||  ||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12521317 tatcaccaataa---gatgttttgacagatcaataattgttttcttaaataaagttaaatcgttatttatgctagccaaaacagc 12521236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 12579763 - 12580032
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  || | |||    
T  12579763 aagaaaatcattaacacttgagtctaatgcaaacttaacattgtcaatttgcaaggcctgaaccttattcaacctaagcaataaagggtctatgcggttg 12579862  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||| |||||||||||  | |||||||| | |||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| || |||    
T  12579863 atcaatatggg-tgtggttgatagtttgtgaacctctcccgtatccaaacttaagccaagtaaaaaggtgatggaagagtaaattaaacaggatatatat 12579961  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaa 288  Q
    || ||||| |||   |||||||| ||||||      || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  12579962 catcaccaacaa---gatattttgacagat-----ttttttttcttaaataatgttaaatccttatttatgctagccaa 12580032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 12495667 - 12495934
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  || | |||    
T  12495667 aagaaaatcattgacacttgagtctaatgcaaactgaacattgtcaatttgcaaggcctgaaccttattcaacctaagcaataaagggtctatgtggttg 12495766  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    || |||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| || |||    
T  12495767 atgaacatggg-tgtggttgatagtttgtgaacctctcccgtatccaaacttaagccaaataaaaaggtgatataagagtaaattaaataggatatatat 12495865  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaa 288  Q
    || ||||| |||   |||||||| ||||       ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12495866 catcaccaacaa---gatattttgacag-------atttttttattaaataaagttaaatccttatttatgctagccaa 12495934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12581632 - 12581555
Alignment:
Q  216 caccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacag 293  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12581632 caccaacaagatattttgacagatcaataattgttttcttaaataaagttaaatccttatttatgctagccaaaacag 12581555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 12519468 - 12519553
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaag 95  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12519468 aagaaaatcattgacacttgagtctaatgcaaacttaacattgtcaatttgcaaggcctgaaccttattcaacctaagcaataaag 12519553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12581766 - 12581647
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |   |   || | |||    
T  12581766 aagaaaatcattggcagttgagcctaatgcacacttaacattgctaattttcaaggccagaaccttatgccacctcaacaatatatgttatatgtggttg 12581667  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttg 129  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12581666 atcaacatgggttgtggttg 12581647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9815461 - 9815194
Alignment:
Q  29 gagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggtt 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||| |    
T  9815461 gagtctaatgccagcttaacattgtcaattttcaaggcctgaaccttatgtcacctaaacaataaagggtctccgtgattgatcaacatgggttctggct 9815362  T
Q  129 gtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggata 228  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||    ||||    
T  9815361 gtaaattttggaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagagtaacttctaaaggatatctatcaccaccaaca----gata 9815266  T
Q  229 -ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
     |||| ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  9815265 attttgacaaattaactattgttttcttaaacaaacttaaatcgttataaatactagctaaaacagctggtg 9815194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 26354619 - 26354885
Alignment:
Q  30 agtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggttg 129  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |   | ||||||||||||||||| |||||    
T  26354619 agtctaattccagcttaacattgtcaattttcaaggcttgtaccctatgccatctaaacaataaagggtctccacggttgatcaacatgggttgcggttg 26354718  T
Q  130 taattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggata- 228  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||    ||||     
T  26354719 taattttttgaacctctcccacacccaaatttgaaccaagtaaaacggtgattgaagagtaacttctaaaggatatctatcaccaccaaca----gataa 26354814  T
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  26354815 ttttgacaaatcaacaatggttttcttaaacacgcttaaatccttatatatgctagctaaaacagccggtg 26354885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 6397411 - 6397691
Alignment:
Q  10 aagaatatcatcgacagttgagtctaatgccaacttaacattatcaattttcaatgcctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattg 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  || |  |     
T  6397411 aagaaaattatcgacagttgagtctcatgccaacttaatattgtcaattttaaaggcctgaaccttataccacctaaaaaataaagggtctatgtgggta 6397510  T
Q  110 atcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctat 209  Q
    |||||||| |||||||   | || | || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  6397511 atcaacataggttgtgaacgcaaatgtgtgaacctcttccacgcccaaacttgaaccaagtaaaaaggtgatagaagagtaaattcaacatgaaatttat 6397610  T
Q  210 caccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacag 293  Q
    || ||||| |||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6397611 catcaccaacaa---gatatttcgacaaatcaataattgttttcttaaataaagataaatccttatatatgatagccaaaacag 6397691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6398650 - 6398440
Alignment:
Q  67 ctgaaccttatgccacctaaacaataaagtgtcgctgggattgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaacc 166  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||   |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6398650 ctgaaccttatgcttcttaaacaataaagagtgtctgttgttgatcaacatgagttgtggttgcaagtttgtgaacctctcccacacctaaacttgaacc 6398551  T
Q  167 aaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgtttt-cttaaataaactt 265  Q
    |  ||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| || || ||    |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  6398550 acgtaaaaaggtgacaacagagtaaattcaacaggaaatctatcatcatcaacat---gatattttgacatatcaataattttttttcttaaataaagtt 6398454  T
Q  266 aaatccttatatat 279  Q
    ||||||||||||||    
T  6398453 aaatccttatatat 6398440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 22689444 - 22689519
Alignment:
Q  106 attgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22689444 attgatcaacatgggccgtggttgcaaatttttgaacctctcccacacccaaacttgaaccaagtaaaagggtgat 22689519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11544419 - 11544345
Alignment:
Q  107 ttgatcaacatgggttgtggttgtaattttgcgaacctctcccacacccaaacttgaaccaaataaaagggtgat 181  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11544419 ttgatcaacttgggttttggttgcaaatttttgaacctctcccaaacccaaacttgaaccaagtaaatgggtgat 11544345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 299
Target Start/End: Original strand, 22651781 - 22651851
Alignment:
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22651781 ttttgacaaatcaacaattgttttcttaaacaaagttaaatccttatacatgctagccaaaacagctggtg 22651851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 22689564 - 22689613
Alignment:
Q  250 tttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22689564 tttcttaaacaaactcaaatccttatatatgctagccaaaacagcaggtg 22689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 22685596 - 22685641
Alignment:
Q  229 ttttaacagatcaataattgttttcttaaataaacttaaatcctta 274  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22685596 ttttgacaaatcaacaattgttttcttaaaaaaacttaaatcctta 22685641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1717517 - 1717371
Alignment:
Q  150 acacccaaacttgaaccaaataaaagggtgatagaatagtaaattcaacaggaaatctatcaccaccaccaactggatattttaacagatcaataattgt 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||  ||   || ||||||||| |||||| ||   ||||||||| ||| | |||  |||||    
T  1717517 acacccaaatttgaaccaagtaaaagggtgattgaagactaacctccttagaaaatctatcgccaccaaca---ggatattttgacaaaccaactattgt 1717421  T
Q  250 tttcttaaataaacttaaatccttatatatgctagccaagacagcaggtg 299  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1717420 tttcttaaacaaagttaaatccttatatatgctagctaaaacagccggtg 1717371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University