View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
	Query
	Query hiting target	Query hiting target's complemental strand
	Query's complemental strand hiting target	Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20367_high_51 (Length: 238)

Name: NF20367_high_51

Description: NF20367

Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]

Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)

[»] NF20367_high_51

[»] chr7 (1 HSPs)

[»] chr1 (1 HSPs)

[»] scaffold0203 (1 HSPs)

[»] scaffold0390 (1 HSPs)

[»] chr6 (4 HSPs)

[»] chr3 (2 HSPs)

[»] chr4 (6 HSPs)

[»] chr8 (3 HSPs)

[»] scaffold0657 (1 HSPs)

[»] scaffold1679 (1 HSPs)

[»] chr5 (1 HSPs)

[»] scaffold0008 (1 HSPs)

[»] scaffold0234 (4 HSPs)

Alignment Details

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)

Name: chr7

Description:

Target: chr7; HSP #1

Raw Score: 176; E-Value: 6e-95

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Original strand, 11540804 - 11541005

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	11540804	atttgtgtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacc-ttt	11540902	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11540903	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttcttcaattgaataaattaattaaacat-aatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	11541001	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	11541002	atct	11541005	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)

Name: chr1

Description:

Target: chr1; HSP #1

Raw Score: 176; E-Value: 6e-95

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 18254404 - 18254201

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18254404	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatgatgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	18254305	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|
T	18254304	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccatttgaataaattaattaaacataaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaatcgg	18254205	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	18254204	atct	18254201	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)

Name: scaffold0203

Description:

Target: scaffold0203; HSP #1

Raw Score: 168; E-Value: 4e-90

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Original strand, 28006 - 28208

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	28006	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctatt	28104	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	28105	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttcacaaattgaataaattaattaaacataaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	28204	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	28205	atct	28208	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)

Name: scaffold0390

Description:

Target: scaffold0390; HSP #1

Raw Score: 164; E-Value: 9e-88

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Original strand, 11712 - 11914

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	11712	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgccaaaattaagcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctctt	11810	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	11811	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	11910	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	11911	atct	11914	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 4)

Name: chr6

Description:

Target: chr6; HSP #1

Raw Score: 164; E-Value: 9e-88

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Original strand, 17689254 - 17689456

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	17689254	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgccaaaattaagcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctctt	17689352	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	17689353	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	17689452	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	17689453	atct	17689456	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2

Raw Score: 164; E-Value: 9e-88

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 27274176 - 27273974

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	27274176	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgccaaaattaagcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctctt	27274078	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27274077	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	27273978	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	27273977	atct	27273974	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3

Raw Score: 156; E-Value: 5e-83

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 27299051 - 27298850

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|
T	27299051	atttgggtgaccaatttgtttc-aaaacaaattatggtgccaaaattaagcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaac-tctt	27298954	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	27298953	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	27298854	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	27298853	atct	27298850	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4

Raw Score: 125; E-Value: 2e-64

Query Start/End: Original strand, 26 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 29311319 - 29311125

Alignment:

Q	26	gaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaacctttttcaaaat	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29311319	gaccaatttgtttcaaaaataaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaaatcatatatgatattgaaa-ctctttcaaaat	29311221	T

Q	125	catcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	29311220	catgatcttttaaatttactacctttcaccaattgaataaattaattaa-aataaataatttcaagaattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	29311125	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)

Name: chr3

Description:

Target: chr3; HSP #1

Raw Score: 164; E-Value: 9e-88

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 13244069 - 13243867

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	13244069	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgccaaaattaagcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctctt	13243971	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	13243970	tcaaaatcatcatattttaaatttactacctttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	13243871	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	13243870	atct	13243867	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2

Raw Score: 119; E-Value: 6e-61

Query Start/End: Original strand, 26 - 221

Target Start/End: Original strand, 10577227 - 10577423

Alignment:

Q	26	gaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaa	123	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|
T	10577227	gaccaatttgtttccaaaacaaattacagtgctaaaattaagcaaataatttattaccaaattcaaaaagtcacatctgatgttgaaac-tctttcaaaa	10577325	T

Q	124	tcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10577326	tcatgatcttttaaatttactacctttctccaattaaataaataaattaaacataaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	10577423	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 6)

Name: chr4

Description:

Target: chr4; HSP #1

Raw Score: 156; E-Value: 5e-83

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 26965898 - 26965696

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	26965898	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgccaaaattaatcaaatattttattactaaattcaaaatcatatatgatattgaaa-ctctt	26965800	T

Q	118	tcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	217	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	26965799	tcaaaatcatcatattttaaatttactacatttctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttctaggattgtttgtttagcatgaacaaccgg	26965700	T

Q	218	atct	221	Q
		\|\|\|\|
T	26965699	atct	26965696	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2

Raw Score: 126; E-Value: 4e-65

Query Start/End: Original strand, 27 - 221

Target Start/End: Original strand, 10626072 - 10626267

Alignment:

Q	27	accaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaat	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10626072	accaatttgtttccaaaacaaattatagtgctaaaattaagcaaataatttattaccaaattcaaaaagtcacatttgatgttgaaac-tctttcaaaat	10626170	T

Q	125	catcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	10626171	catgatcttttaaatttactacctttctccaattaaataaattaattaaacataaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	10626267	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3

Raw Score: 121; E-Value: 4e-62

Query Start/End: Original strand, 26 - 221

Target Start/End: Original strand, 19924492 - 19924686

Alignment:

Q	26	gaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaacctttttcaaaat	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19924492	gaccaatttgtttccaaaataaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaaatcatatatgatattgaaa-ctctttcaaaat	19924590	T

Q	125	catcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	19924591	catgatcttttaaatttactacctttcaccaattgaataaattaattaa-aataaataatttcaagaattgcttgtttagaatgaacaaccggatct	19924686	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4

Raw Score: 105; E-Value: 1e-52

Query Start/End: Original strand, 26 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 5709753 - 5709559

Alignment:

Q	26	gaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaacctttttcaaaat	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5709753	gaccaatttgtttccaaaataaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaaatcatatctgatattgaaa-ctctttcaaaat	5709655	T

Q	125	catcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5709654	catgatcttttaaatttactacctttcaccaattgaataaattaatt-agaataaattaattcaagaattgcttgtttagaatgaacaaccggatct	5709559	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5

Raw Score: 64; E-Value: 4e-28

Query Start/End: Original strand, 69 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 18264480 - 18264327

Alignment:

Q	69	aaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaat	166	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18264480	aaatctttaattaccaaattcaaaaaatcatatctgatattgaaacccttt-caaaatcacgatcttttaaatttactacctttcacaaattgaataaat	18264382	T

Q	167	taattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	18264381	taattaaaaataaacaatttcaagaattgtttgtttagcatgaacaatcggatct	18264327	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6

Raw Score: 55; E-Value: 1e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 127

Target Start/End: Complemental strand, 18264630 - 18264521

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaaccttt	116	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	18264630	atttgggcgaccaatttgtttcaaaaacaaattatggtactataactaagccaatattttattatcaaattcaaaaatcatatctaatattgaaa-ctct	18264532	T

Q	117	ttcaaaatcat	127	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	18264531	ttcaaaatcat	18264521	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)

Name: chr8

Description:

Target: chr8; HSP #1

Raw Score: 125; E-Value: 2e-64

Query Start/End: Original strand, 26 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 24638058 - 24637864

Alignment:

Q	26	gaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaacctttttcaaaat	124	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24638058	gaccaatttgtttccaaaataaattatggtactaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaaatcatatatgatattgaaa-ctctttcaaaat	24637960	T

Q	125	catcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	24637959	catgatcttttaaatttactacctttcaccaattgaataaattaattaa-aataaataatttcaagaattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	24637864	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2

Raw Score: 64; E-Value: 4e-28

Query Start/End: Original strand, 90 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 22108142 - 22108013

Alignment:

Q	90	aaaatcatatatgatattgaaacctttttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaa	189	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|
T	22108142	aaaatcatatctgatattgaaacccttt-caaaatcacgatcttttaaatttactacctttcaccaattgaataaattaattaa-aataaataatttcaa	22108045	T

Q	190	ggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22108044	gaattgcttgtttagcatgaacaaccggatct	22108013	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3

Raw Score: 63; E-Value: 2e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 127

Target Start/End: Complemental strand, 22108315 - 22108206

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaaccttt	116	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|
T	22108315	atttgggcgaccaatttgtttcaaaaacaaattatggtactataactaagccaatattttattaccaaattcaaaaatcatatctaatattgaaa-cttt	22108217	T

Q	117	ttcaaaatcat	127	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	22108216	ttcaaaatcat	22108206	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)

Name: scaffold0657

Description:

Target: scaffold0657; HSP #1

Raw Score: 115; E-Value: 2e-58

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 5136 - 4932

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctt	115	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	5136	atttgggcgaccaatttgtttcaaaaacaaattatggtactataattaagccaatattttattaccaaattcaaaaagtcacatccgatattgaaac-tc	5038	T

Q	116	tttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaacc	215	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	5037	tttcaaaatcatgatcttttaaatttactacctatctccaattgaataaattaattaaacataaatagtttgaaggattgtttgtttagcatgaacaacc	4938	T

Q	216	ggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|
T	4937	agatct	4932	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1679 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)

Name: scaffold1679

Description:

Target: scaffold1679; HSP #1

Raw Score: 107; E-Value: 9e-54

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 797

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc--aaaatcatatatgatattgaaacctt	115	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	1000	atttgggcgaccaatttgtttctaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattacaaaattcaaaaaatcatatctgatattgaaacc-c	902	T

Q	116	tttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaacc	215	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	901	tttcaaaatcatgatcttttaattttactacctttctccaattgaataaataaattaa-aataaataatttcaaaatttgcttgtttagcatgaacaacc	803	T

Q	216	ggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|\|
T	802	ggatct	797	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)

Name: chr5

Description:

Target: chr5; HSP #1

Raw Score: 99; E-Value: 5e-49

Query Start/End: Original strand, 18 - 221

Target Start/End: Original strand, 19711985 - 19712188

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctt	115	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|
T	19711985	atttgggcgaccaatttgtctccaaaacaaattatggtgctaaaattaagaaaatattt-attacaaaattcaaaaaatcatatctgatattgaaaccct	19712083	T

Q	116	tttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaattaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaacc	215	Q
		\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|
T	19712084	tt-caaaatcatgatcttttaattttattacctttctccaattgaataaattaattaaaaataaataatttcaaaaattgtttgtttagcatgaacagcc	19712182	T

Q	216	ggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|
T	19712183	agatct	19712188	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)

Name: scaffold0008

Description:

Target: scaffold0008; HSP #1

Raw Score: 81; E-Value: 3e-38

Query Start/End: Original strand, 68 - 221

Target Start/End: Original strand, 228273 - 228427

Alignment:

Q	68	caaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaa	165	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	228273	caaatattttattaccaaattcaaaaagtcacatttgatattgaaac-tctttcaaaatcatgatcttttaaatttactaaatttctccaattgaataaa	228371	T

Q	166	ttaattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	228372	ttaattaaacattaataatttgaaggattgtttgcttagcatgaacaaccggatct	228427	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)

Name: scaffold0234

Description:

Target: scaffold0234; HSP #1

Raw Score: 69; E-Value: 4e-31

Query Start/End: Original strand, 69 - 218

Target Start/End: Original strand, 16004 - 16154

Alignment:

Q	69	aaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaat	166	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16004	aaatctttaattaccaaattcaaaaaatcatatatgatattgaaacccttt-caaaatcacgatattttaaatttactacctttcacaaattgaataaat	16102	T

Q	167	taattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccgga	218	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	16103	taattaaaaataaacaatttcaagaattgcttgtttagcatgaacaaccgga	16154	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2

Raw Score: 64; E-Value: 4e-28

Query Start/End: Original strand, 69 - 221

Target Start/End: Original strand, 9152 - 9305

Alignment:

Q	69	aaatattttattaccaaattcaaaa--tcatatatgatattgaaacctttttcaaaatcatcatattttaaatttactaccttttttcaattgaataaat	166	Q
		\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9152	aaatctttaattaccaaattcaaaaaatcatatctgatattgaaacccttt-caaaatcacgatcttttaaatttactacctttcacaaattgaataaat	9250	T

Q	167	taattaaccatgaatagtttcaaggattgtttgtttagcatgaacaaccggatct	221	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|
T	9251	taattaaaaataaacaatttcaagaattgtttgtttagcatgaacaatcggatct	9305	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3

Raw Score: 55; E-Value: 1e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 127

Target Start/End: Original strand, 9002 - 9111

Alignment:

Q	18	atttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaaccttt	116	Q
		\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|
T	9002	atttgggcgaccaatttgtttcaaaaacaaattatggtactataactaagccaatattttattatcaaattcaaaaatcatatctaatattgaaa-ctct	9100	T

Q	117	ttcaaaatcat	127	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	9101	ttcaaaatcat	9111	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4

Raw Score: 50; E-Value: 9e-20

Query Start/End: Original strand, 19 - 127

Target Start/End: Original strand, 15855 - 15963

Alignment:

Q	19	tttgggtgaccaatttgtttccaaaacaaattatggtgctaaaattaagcaaatattttattaccaaattc-aaaatcatatatgatattgaaacctttt	117	Q
		\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|
T	15855	tttgggcgaccaatttgtttcaaaaacaaattatggtactgtaactaagccaatattttattaccaaattcaaaaatcatatctaattttgaaa-ctctt	15953	T

Q	118	tcaaaatcat	127	Q
		\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|
T	15954	tcaaaatcat	15963	T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]