View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20367_low_4 (Length: 577)

Name: NF20367_low_4
Description: NF20367
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20367_low_4
NF20367_low_4
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (15-564)||(15016406-15016955)
chr1 (12-564)||(15024405-15024957)
chr1 (12-564)||(15031746-15032298)
chr1 (12-564)||(15001395-15001947)
chr1 (12-562)||(15036308-15036858)
chr1 (12-564)||(15010288-15010840)
chr1 (45-564)||(14503303-14503822)
chr1 (125-564)||(14467204-14467643)
chr1 (149-564)||(14522896-14523311)
chr1 (125-564)||(14533017-14533456)
chr1 (129-371)||(15040161-15040403)
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (152-564)||(12207-12619)
scaffold0400 (125-564)||(5892-6331)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (152-564)||(12850-13262)
scaffold0365 (125-564)||(6536-6975)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (125-443)||(16102283-16102601)
chr7 (125-443)||(16171961-16172279)
chr7 (152-283)||(17847959-17848090)
chr7 (153-309)||(15665775-15665931)
chr7 (125-462)||(16024482-16024819)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (153-309)||(18643-18799)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 564
Target Start/End: Original strand, 15016406 - 15016955
Alignment:
Q  15 aataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgattca 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||     
T  15016406 aataggcttaccgatttgaaagcactcgatttgtatgataataattttgttggtcatttacctcataatatttgtgtcggtgggaagttggaaaaattct 15016505  T
Q  115 ctgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaa 214  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15016506 ctgctgctcttaaccagttcacaggcctagttccagagagtttgaagaattgctcaagccttaagagactgaggcttgaacaaaaccaactgactggaaa 15016605  T
Q  215 tataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15016606 tataacaaatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggaattgagtgataataatttgtatggtcaaatttctccaaattggggaaagtgcaag 15016705  T
Q  315 aatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaa 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016706 aatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaa 15016805  T
Q  415 accatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagca 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15016806 accatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgaaca 15016905  T
Q  515 aattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15016906 aattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcagcaaataatt 15016955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 564
Target Start/End: Original strand, 15024405 - 15024957
Alignment:
Q  12 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |  ||    
T  15024405 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttagatgttaataattttgttggtcatttacctcacaatatttgtgtcggtgggaagataaaaaaat 15024504  T
Q  112 tcactgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactgg 211  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  15024505 tcactgctggacttaaccagttcactggcttagttccagagagtttgaagaattgcttaagccttaaaagagtgaggcttgatcaaaaccaactgactgg 15024604  T
Q  212 aaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15024605 aaatataacaaatagttttggtgtgtatccaaacttgtactacatggacttgaatgataataatttttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 15024704  T
Q  312 aagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtctt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15024705 aagaatctcacaagccttaaaatctctggtaataatttaacaggaagaataccaccagagctaggcagcgcaacaaatttacaggagcttaacttgtctt 15024804  T
Q  412 caaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctga 511  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  15024805 caaaccatctaacgggaaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgt 15024904  T
Q  512 gcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
     ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15024905 acaaattgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaacaaataatt 15024957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 564
Target Start/End: Original strand, 15031746 - 15032298
Alignment:
Q  12 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |  ||    
T  15031746 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttagatgttaataattttgttggtcatttacctcacaatatttgtgtcggtgggaagataaaaaaat 15031845  T
Q  112 tcactgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactgg 211  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  15031846 tcactgctggacttaaccagttcactggcttagttccagagagtttgaagaattgcttaagccttaaaagagtgaggcttgatcaaaaccaactgactgg 15031945  T
Q  212 aaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031946 aaatataacaaatagttttggtgtgtatccaaacttgtactacatggacttgaatgataataatttttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 15032045  T
Q  312 aagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtctt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15032046 aagaatctcacaagccttaaaatctctggtaataatttaacaggaagaataccaccagagctaggcagcgcaacaaatttacaggagcttaacttgtctt 15032145  T
Q  412 caaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctga 511  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  15032146 caaaccatctaacgggaaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcacctttctggagaagttcctgt 15032245  T
Q  512 gcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
     ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032246 acaaattgcatcattgcacgagctaactgcattggagcttgcaacaaataatt 15032298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 564
Target Start/End: Original strand, 15001395 - 15001947
Alignment:
Q  12 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgat 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |   |    
T  15001395 atgaataggcttacagatttggaagtactccatttatctgataataattttgttggtcatttacctcacaatatttgtaacggtgggaagttaaaaatgt 15001494  T
Q  112 tcactgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactgg 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  15001495 tcactgttgcacttaaccagttcacaggcctagttccagagagtttgaagaattgctcaagccttacgagagtgagacttcaacaaaaccaactgactgg 15001594  T
Q  212 aaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 311  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001595 aaatataacagacagctttggtgtgtatccaaatttggaatacatggatttgagtgataataatttttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 15001694  T
Q  312 aagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtctt 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15001695 aagaatctcacaagcctaaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacaggagcttaacttgtctt 15001794  T
Q  412 caaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctga 511  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |     
T  15001795 caaaccatctaatgcgaaaaattccaaaggagttagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttatggagaagttccagt 15001894  T
Q  512 gcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
     ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001895 acaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaacaaataatt 15001947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 562
Target Start/End: Original strand, 15036308 - 15036858
Alignment:
Q  12 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgat 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  15036308 atgaataggcttacggatttggaagtactcgaattatatgataataaatttattggtcatttacctcacaatatttgtgtcggtgggaagttaaaaacat 15036407  T
Q  112 tcactgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactgg 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15036408 tcactgctgcacttaaccagttcagaggcctagttccagagagtttgaagaattgctcaagccttgagagattgaggcttaaccaaaaccaactgactgg 15036507  T
Q  212 aaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036508 aaatataacagagagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttgagtgataataatttttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 15036607  T
Q  312 aagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtctt 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15036608 aagaatctcacaagcctaaaaatctccggtaataatttaactggaagaataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacaggagcttaacttgtctt 15036707  T
Q  412 caaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctga 511  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15036708 caaacgatctaatgggaaaaattccaaaggagctaaaatatttatctttgttgttcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgt 15036807  T
Q  512 gcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataa 562  Q
     ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036808 acaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaacaaataa 15036858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 564
Target Start/End: Original strand, 15010288 - 15010840
Alignment:
Q  12 atgaataggcttaccgatttggaagcactccatttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgat 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |  ||    
T  15010288 atgaataggcttatcgatttggaagtactccatttatctgataatatttttgttggtcatttacctcacaatatttgtgttggtgggaagttaaaaacat 15010387  T
Q  112 tcactgcagcacttaaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactgg 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  15010388 tcactgctgcacttaaccagttcacaggcctagttccagagagtttgaagaattgctcaagccttacgagactgaggcttgatcaaaaccaacttactgg 15010487  T
Q  212 aaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010488 aaatataacagagagttttggtgtgtatccaaacttggactacatggaattgagtgataataatttttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgc 15010587  T
Q  312 aagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtctt 411  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15010588 aagattctcacaagcctaaaaatctctggtaataatttaacaggaagaataccaccagaactaggaagtgcaacaaatttacaggagcttaacttgtctt 15010687  T
Q  412 caaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctga 511  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15010688 caaaccatctaatgggaaaaattccaaaggagttagaatacttatctttgttgttcaaactctccttaagtaacaatcatctttctggagaagttcctgt 15010787  T
Q  512 gcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
     ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15010788 acaaattgcatcattgcatcaactaactgcattggagcttgcaataaataatt 15010840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 45 - 564
Target Start/End: Original strand, 14503303 - 14503822
Alignment:
Q  45 ttatatgataataattttgttggtcatttacctcaaaatatttgtgtcggtgggaagttgagacgattcactgc-agcacttaaccagttcacaggccta 143  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| |   |||||||| || | | ||||| |||||||| | |    
T  14503303 ttatctgataataatttcataggccatttacctcacaacatttgtgttggtggaatgttgacaaatttcactgctagtaat-aaccaattcacagggcca 14503401  T
Q  144 gttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaa 243  Q
     ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| || || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  14503402 attccaaagagtttaaagaattgctccagccttattagagttaggcttcaaaaaaatcaattaactggaaatataacagatggttttggtgtttatccac 14503501  T
Q  244 acttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaagccttaaaatctccaacaa 343  Q
    | |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14503502 atttggactacatggaattgagtgaaaataatttgtatggccatctatcaccaaattggggaaagtgcaagagtctcacaagccttaaaatctccaataa 14503601  T
Q  344 taatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagag-caacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttacggggaaaattccaaagga 442  Q
     ||||| |||||||  ||||||| |||| | ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14503602 caatttaacaggaaatataccacaagaa-ttggctgagacaattaatttacatgaacttaacttgtcatcaaaccatcttactggaaaaattccaaagga 14503700  T
Q  443 gctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatcattgcacgaattaactgca 542  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||| ||||||||| | | ||||| |     
T  14503701 tctaggaaacttgtctttgttgatcaaactctcgataagtaacaatcatctttctggagaggttcctatacaaattgcatcattgcaagcactaactacc 14503800  T
Q  543 ttggagcttgcaacaaataatt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14503801 ttggagcttgcaacaaataatt 14503822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 125 - 564
Target Start/End: Original strand, 14467204 - 14467643
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| || ||||||| ||| | ||||  |||||||| |||    
T  14467204 taaccaattcacaggcccaattccaaagagtttgaagaactgctctagcctttatagagtaaggcttcaacaaaatcaactaactgacaatataactgat 14467303  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
       ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||     
T  14467304 gcctttggcgtgcatccaaaattggactacatggaattgagtgataataatttgtatggccatctatcaccgaattggggaaaatgcatgaatctcacat 14467403  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14467404 gccttaaaatcttcaataacaatttaacaggaagcataccgccagaactaggccgagcaacaaatttacatgaactaaacctgtcttcaaaccatcttac 14467503  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatca 524  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||    
T  14467504 gggaaaaattccaaaggagctagaaagcttatctttgttgatccaactctcggtaagtaacaatcatctttcaggagaagttcctgcacaagttgcatca 14467603  T
Q  525 ttgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
    |||||  || ||  | | ||||||||| ||||||||||||    
T  14467604 ttgcaaaaactagataccttggagctttcaacaaataatt 14467643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 149 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14523311 - 14522896
Alignment:
Q  149 agagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttg 248  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||  ||| ||||  || | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14523311 agagagtttgaagaactgttctagccttataagattgagacttaaccaaaacaaaatgacaggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaatttg 14523212  T
Q  249 gactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatt 348  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14523211 gactacatagaattaagtgataataatttttatggttatctttctccaaattgggggaagtgcaagaatctgacaagccttaaaatctccaataataatt 14523112  T
Q  349 tgacaggaagcataccaccagaactaggcag-agcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctag 447  Q
    | | ||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  14523111 taataggaagcataccaccagaa-ttggctgaagcaaccaatttacatatacttgacttgtcctcaaatcaacttataggaaaaattccaaaggatctag 14523013  T
Q  448 aaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattgga 547  Q
     ||||||||||    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  14523012 gaaacttatctgcactgatccaactctcgataagtaataatcatctttcgggagaagttcctatgcagattgcatcattgcatgaactaactacattgga 14522913  T
Q  548 gcttgcaacaaataatt 564  Q
     ||||||||||||||||    
T  14522912 tcttgcaacaaataatt 14522896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 125 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14533456 - 14533017
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||  || ||||||| ||| | ||||  |||||||| |||    
T  14533456 taaccaattcacaggcccaattccaaagagtttgaagaagtgctccagtcttatcagagtaagacttcaacaaaatcaaataactgacaatataactgat 14533357  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
       ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14533356 gcctttggcgtgtatccaaatttggactacatggaattgagtgataataatttttatggccatatatcaccaaattggggtaagtgcaagaaactcacaa 14533257  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14533256 gtcttcaaatctccaacaataatttaactggaagcatacctcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaaccatcttac 14533157  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatca 524  Q
     || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  14533156 tggaaaaattccagaggagctaggaaacttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatca 14533057  T
Q  525 ttgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
     |||| | | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  14533056 ctgcaggcactaactgccttggagcttgaaaaaaataatt 14533017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 371
Target Start/End: Original strand, 15040161 - 15040403
Alignment:
Q  129 cagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagtt 228  Q
    ||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  15040161 cagttcacaggtccaattccaaagagtttgaagaattgttcaagtctaaagagagtgagacttgaacaaaaccaacttgctggaaatataacagatagct 15040260  T
Q  229 ttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaagcct 328  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| ||||||   || ||| ||| |||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  15040261 ttggtgtgtgtccaaacttgtactacatggaattgagtggtaataaatattttggccatatttcacctaattggggaaaacgcaagaatctcataagcct 15040360  T
Q  329 taaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  15040361 taaaatctccaacaataatttaacagggagtataccactagaa 15040403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 564
Target Start/End: Original strand, 12207 - 12619
Alignment:
Q  152 gagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggac 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |    
T  12207 gagtttgaagaattgctccagccttattagagttaggcttcaaaaaaatcaattaactggaaatataacagatggttttggtgtttatccacatttggtc 12306  T
Q  252 tacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttga 351  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  12307 tacatggaattaagtgataataatttttatggccatatatcaccaaattggggtaagtgcaagaaactcacaagtcttcaaatctccaacaataatttaa 12406  T
Q  352 caggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaa 451  Q
    | ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  12407 ctggaagcataccgcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaaccatcttactggaaaaattccaaaggagctaggaaa 12506  T
Q  452 cttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagctt 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||| |||| | | ||||||| |||||||||    
T  12507 cttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagctt 12606  T
Q  552 gcaacaaataatt 564  Q
    | || ||||||||    
T  12607 gaaaaaaataatt 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 564
Target Start/End: Original strand, 5892 - 6331
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||||||||  || ||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5892 taaccagttcattggtctagttccaaagagtttaaaaaattgctcaagccttaagagagtgagacttcaacaaaaccaactgactgcaaatataacagat 5991  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
    || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5992 agctttggtgtgtatccgaatttggaatatatggaattgagtgataataatttttatggtcatctctctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 6091  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    |||||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||||| ||| | | |  |||||| ||||||  |  |||  || | || || || || || ||    
T  6092 gccttaaagttttcaataataatatatcaggaagcataccacccgaattggccgaagcaaccaatttaactatactggacctttcctcgaatcaactcac 6191  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatca 524  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| | |||| | |||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||| || |    
T  6192 aggagaaattccaaaggagctaggaaacttatcctcattgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaacaaattgcatta 6291  T
Q  525 ttgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
    |||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  6292 ttgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaataatt 6331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 564
Target Start/End: Original strand, 12850 - 13262
Alignment:
Q  152 gagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggac 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |    
T  12850 gagtttgaagaattgctccagccttattagagttaggcttcaaaaaaatcaattaactggaaatataacagatggttttggtgtttatccacatttggtc 12949  T
Q  252 tacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaagccttaaaatctccaacaataatttga 351  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  12950 tacatggaattaagtgataataatttttatggccatatatcaccaaattggggtaagtgcaagaaactcacaagtcttcaaatctccaacaataatttaa 13049  T
Q  352 caggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttacggggaaaattccaaaggagctagaaaa 451  Q
    | ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  13050 ctggaagcataccgcaagaactaggtggagcaacacaattacaagaacttaatctgtcttcaaaccatcttactggaaaaattccaaaggagctaggaaa 13149  T
Q  452 cttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatcattgcacgaattaactgcattggagctt 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||| |||| | | ||||||| |||||||||    
T  13150 cttatctttgttaatcaaactctcgataaataacaataatcttttgggagaagttcctgtacaaattgcatcactgcaggcactaactgccttggagctt 13249  T
Q  552 gcaacaaataatt 564  Q
    | || ||||||||    
T  13250 gaaaaaaataatt 13262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 125 - 564
Target Start/End: Original strand, 6536 - 6975
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||||||||  || ||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6536 taaccagttcattggtctagttccaaagagtttaaaaaattgctcaagccttaagagagtgagacttcaacaaaaccaactgactgcaaatataacagat 6635  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
    || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6636 agctttggtgtgtatccgaatttggaatatatggaattgagtgataataatttttatggtcatctctctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 6735  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    |||||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||||| ||| | | |  |||||| ||||||  |  |||  || | || || || || || ||    
T  6736 gccttaaagttttcaataataatatatcaggaagcataccacccgaattggccgaagcaaccaatttaactatactggacctttcctcgaatcaactcac 6835  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgttgatcaaactctcgttaagtaacaatcatctttctggagaagtccctgagcaaattgaatca 524  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| | |||| | |||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||| || |    
T  6836 aggagaaattccaaaggagctaggaaacttatcctcattgatccagctcttgataagtagcaatcatcttgtaggagaagttcctgaacaaattgcatta 6935  T
Q  525 ttgcacgaattaactgcattggagcttgcaacaaataatt 564  Q
    |||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  6936 ttgcataaaataactatcttggagcttgcaacaaataatt 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Original strand, 16102283 - 16102601
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | ||  |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |     
T  16102283 taaccacttcaccggccgagttcctaagagtttgaagaattgctctagcattataagacttagacttgaccaaaaccaacttactggaaatataacacaa 16102382  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
      |||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||  | ||||||||||||||  | || || ||||    
T  16102383 gattttagtgtttatccaaatttgaattacatagacttaagtgaaaacaatttttacggacacctttcatcgaattggggaaagtgtcaaaacctaacaa 16102482  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    || | | ||| ||| | |||||| |  ||||    |||||||||||| |||| || ||| | |||||   |  |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  16102483 gcttcataatttcccataataatatatcaggtcatataccaccagaaataggaagggcacccaatttgggtatacttgacttatcttcaaaccatctcac 16102582  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggag 443  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16102583 agggaaaattccgaaggag 16102601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Original strand, 16171961 - 16172279
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | ||  |||| ||||||||| | ||||||||||||||| |     
T  16171961 taaccacttcaccggccgagttcctaagagtttgaagaattgctctagcattataagacttagacttgaccaaaaccaacttactggaaatataacacaa 16172060  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
      |||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||| || || |||||  | ||||||||||||||  | || || ||||    
T  16172061 gattttagtgtttatccaaatttgaattacatagacttaagtgaaaacaatttttacggacacctttcatcgaattggggaaagtgtcaaaacctaacaa 16172160  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
    || | | ||| ||| | |||||| |  ||||    |||||||||||| |||| || ||| | |||||   |  |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  16172161 gcttcataatttcccataataatatatcaggtcatataccaccagaaataggaagggcatccaatttgggtatacttgacttatcttcaaaccatctcac 16172260  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggag 443  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16172261 agggaaaattccgaaggag 16172279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 17847959 - 17848090
Alignment:
Q  152 gagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggac 251  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   ||| | ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||     
T  17847959 gagtttgaagaattgctcaagcattgtaagaattaggcttgaacaaaaccaactttctggaaatataacagatttctttggtgtgtatccgaatttggat 17848058  T
Q  252 tacatggacttaagtgataataatctttatgg 283  Q
    |||||| | || ||| | |||||| |||||||    
T  17848059 tacatgcatttgagtcaaaataatttttatgg 17848090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15665931 - 15665775
Alignment:
Q  153 agtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggact 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||| ||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  15665931 agtttgaagaattgctctagccttattagacttaggcttgaacataaccatatggatggaaacataacagatgatttgggtgtatacccaaatttggagt 15665832  T
Q  253 acatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagt 309  Q
     |||||  ||   ||| |||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  15665831 tcatgggattggatgacaataatttttatggtcacctttcatccaattggggaaagt 15665775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 462
Target Start/End: Original strand, 16024482 - 16024819
Alignment:
Q  125 taaccagttcacaggcctagttcaagagagtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagat 224  Q
    |||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||     
T  16024482 taaccacttcactggccgcgttccaaagagtttgaagaattgctctagcattataagacttcgacttgaacaaaaccaacttactggaaatataaccgaa 16024581  T
Q  225 agttttggtgtgtatccaaacttggactacatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagtgcaagaatctcacaa 324  Q
       |||||||| |||||| | ||||  |||||| | |||||| | || ||| ||||||| || |||||  | ||||||| ||||| | | || || ||||    
T  16024582 gactttggtgtatatccagatttggtttacatgcaattaagtcaaaacaatttttatggacacctttcatccaattgggaaaagttccataacctgacaa 16024681  T
Q  325 gccttaaaatctccaacaataatttgacaggaagcataccaccagaactaggcagagcaacaaatttacatgaacttaacttgtcttcaaaccatcttac 424  Q
     | | || || ||||| |||||| |  ||||    |||||||||||| ||||  | ||| | |||||   |  |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  16024682 ccttcaatatttccaataataatatatcaggccatataccaccagaaataggaggggcacccaatttgggttcacttgacttatcttcaaaccatctcac 16024781  T
Q  425 ggggaaaattccaaaggagctagaaaacttatctttgt 462  Q
     ||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  16024782 aggggaaattccaaaggagttaagcaacttatctttgt 16024819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18799 - 18643
Alignment:
Q  153 agtttgaagaattgctccagccttaagagagtgaggattgaacaaaaccaattgactggaaatataacagatagttttggtgtgtatccaaacttggact 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||| ||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  18799 agtttgaagaattgctctagccttattagacttaggcttgaacataaccatatggatggaaacataacagatgatttgggtgtatacccaaatttggagt 18700  T
Q  253 acatggacttaagtgataataatctttatggtcatctttctccaaattggggaaagt 309  Q
     |||||  ||   ||| |||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  18699 tcatgggattggatgacaataatttttatggtcacctttcatctaattggggaaagt 18643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University