View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20375_high_7 (Length: 342)

Name: NF20375_high_7
Description: NF20375
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20375_high_7
NF20375_high_7
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (23-340)||(2043-2362)
scaffold0234 (23-340)||(10934-11253)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (23-340)||(21940831-21941150)
chr8 (23-340)||(22171653-22171972)
chr8 (23-340)||(6094289-6094608)
chr8 (79-340)||(15326422-15326683)
chr8 (79-340)||(15506791-15507052)
chr8 (23-340)||(24642815-24643133)
chr8 (201-340)||(28548393-28548532)
chr8 (34-275)||(14983710-14983950)
chr8 (91-227)||(24797224-24797359)
chr8 (29-340)||(8371255-8371563)
chr8 (37-340)||(21969333-21969633)
chr8 (37-340)||(12562123-12562423)
chr8 (37-340)||(27007519-27007819)
chr8 (37-340)||(27014662-27014962)
chr8 (37-340)||(27880489-27880789)
chr8 (37-340)||(28020670-28020970)
chr8 (91-340)||(25611250-25611495)
chr8 (37-340)||(22130611-22130911)
chr8 (103-340)||(22659496-22659729)
chr8 (29-326)||(38232115-38232412)
chr8 (37-340)||(21916676-21916976)
chr8 (37-340)||(45534275-45534575)
chr8 (103-340)||(26240551-26240784)
chr8 (103-340)||(6430953-6431186)
chr8 (111-257)||(8781959-8782102)
chr8 (29-245)||(18835342-18835556)
chr8 (235-332)||(24796731-24796826)
chr8 (75-178)||(2375231-2375332)
chr8 (103-340)||(2962934-2963171)
chr8 (139-326)||(20535226-20535409)
chr8 (70-162)||(32872741-32872833)
chr8 (229-340)||(36970439-36970549)
chr8 (229-338)||(2375411-2375520)
chr8 (82-134)||(10920427-10920479)
chr8 (76-132)||(29645575-29645631)
chr8 (23-58)||(28555049-28555084)
chr8 (109-168)||(34659059-34659118)
chr8 (103-142)||(36970332-36970371)
chr8 (193-315)||(29645675-29645797)
chr8 (282-330)||(41368106-41368154)
chr8 (282-330)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (23-340)||(17684191-17684510)
chr6 (23-340)||(27380974-27381293)
chr6 (23-340)||(27471357-27471676)
chr6 (23-340)||(11651889-11652208)
chr6 (23-340)||(17691162-17691481)
chr6 (23-340)||(29309056-29309375)
chr6 (23-340)||(29316016-29316334)
chr6 (23-340)||(188699-189018)
chr6 (103-340)||(27296877-27297114)
chr6 (70-340)||(16394167-16394437)
chr6 (101-338)||(25536915-25537152)
chr6 (120-340)||(16559194-16559414)
chr6 (19-325)||(13359010-13359314)
chr6 (91-340)||(27508349-27508594)
chr6 (37-340)||(16789071-16789371)
chr6 (37-340)||(22859890-22860190)
chr6 (91-328)||(27527947-27528180)
chr6 (23-125)||(16566257-16566361)
chr6 (37-340)||(1586110-1586410)
chr6 (75-332)||(2669513-2669768)
chr6 (37-201)||(18019981-18020143)
chr6 (103-320)||(10359073-10359285)
chr6 (37-340)||(14074480-14074780)
chr6 (103-340)||(8612982-8613219)
chr6 (105-257)||(20736413-20736562)
chr6 (88-273)||(8510155-8510338)
chr6 (35-245)||(19218427-19218630)
chr6 (103-245)||(21994655-21994794)
chr6 (74-208)||(27925973-27926103)
chr6 (71-158)||(28172772-28172859)
chr6 (103-340)||(17120507-17120740)
chr6 (38-239)||(17850321-17850521)
chr6 (229-340)||(33317055-33317165)
chr6 (110-257)||(5758565-5758709)
chr6 (103-214)||(22560311-22560419)
chr6 (186-325)||(28756145-28756283)
chr6 (70-170)||(19347092-19347191)
chr6 (201-264)||(28172899-28172963)
chr6 (29-159)||(20553492-20553622)
chr6 (23-68)||(25537155-25537200)
chr6 (37-130)||(13995151-13995245)
chr6 (112-209)||(4073652-4073745)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (23-340)||(18262378-18262697)
chr4 (23-340)||(18269239-18269558)
chr4 (23-340)||(55612849-55613168)
chr4 (23-340)||(26963806-26964125)
chr4 (23-340)||(26970629-26970948)
chr4 (23-340)||(868763-869082)
chr4 (23-340)||(19926482-19926801)
chr4 (23-340)||(5707486-5707805)
chr4 (23-340)||(5714114-5714433)
chr4 (23-340)||(8858333-8858652)
chr4 (23-340)||(10621055-10621374)
chr4 (29-340)||(10628134-10628447)
chr4 (23-340)||(28392856-28393175)
chr4 (23-340)||(8845369-8845688)
chr4 (23-340)||(4426338-4426645)
chr4 (33-340)||(5667851-5668156)
chr4 (29-340)||(35223732-35224045)
chr4 (110-337)||(10677308-10677534)
chr4 (110-337)||(10890948-10891174)
chr4 (23-340)||(20311458-20311775)
chr4 (37-340)||(15461497-15461797)
chr4 (37-340)||(34975551-34975851)
chr4 (37-340)||(2677013-2677313)
chr4 (37-340)||(15815021-15815321)
chr4 (37-340)||(18111045-18111345)
chr4 (37-340)||(3369025-3369325)
chr4 (37-324)||(17299977-17300261)
chr4 (91-241)||(21453961-21454110)
chr4 (37-340)||(20243937-20244237)
chr4 (37-340)||(26531613-26531913)
chr4 (103-326)||(19365586-19365806)
chr4 (37-340)||(4675985-4676285)
chr4 (37-340)||(18163162-18163462)
chr4 (103-340)||(1941791-1942024)
chr4 (91-340)||(5870473-5870718)
chr4 (33-167)||(56516232-56516368)
chr4 (103-325)||(19362477-19362695)
chr4 (110-326)||(5616469-5616681)
chr4 (74-329)||(32646536-32646789)
chr4 (103-326)||(5528495-5528714)
chr4 (110-340)||(9487625-9487851)
chr4 (122-340)||(30040491-30040705)
chr4 (104-240)||(32636552-32636685)
chr4 (110-326)||(9538033-9538244)
chr4 (103-257)||(4546147-4546298)
chr4 (125-340)||(11421096-11421307)
chr4 (82-209)||(34777850-34777975)
chr4 (91-245)||(33888594-33888743)
chr4 (41-117)||(24700213-24700291)
chr4 (216-264)||(24701363-24701411)
chr4 (233-314)||(9937745-9937826)
chr4 (112-203)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (23-340)||(6110230-6110549)
chr3 (23-340)||(16482205-16482524)
chr3 (23-340)||(10579077-10579396)
chr3 (23-340)||(15600606-15600925)
chr3 (23-340)||(15607151-15607470)
chr3 (23-340)||(10572314-10572633)
chr3 (23-340)||(18520141-18520460)
chr3 (30-338)||(18522836-18523146)
chr3 (38-340)||(8490676-8490980)
chr3 (23-340)||(13211468-13211787)
chr3 (23-340)||(15357308-15357627)
chr3 (23-340)||(17780840-17781159)
chr3 (29-340)||(13248779-13249092)
chr3 (23-340)||(15341941-15342260)
chr3 (23-340)||(32056621-32056941)
chr3 (23-340)||(17199906-17200225)
chr3 (23-340)||(13516977-13517292)
chr3 (29-340)||(1647243-1647556)
chr3 (23-340)||(17136525-17136838)
chr3 (23-340)||(29925137-29925456)
chr3 (23-340)||(29974290-29974609)
chr3 (71-340)||(16200646-16200915)
chr3 (37-340)||(21034238-21034538)
chr3 (37-340)||(15846538-15846838)
chr3 (37-340)||(20147556-20147856)
chr3 (91-340)||(21398847-21399092)
chr3 (37-340)||(14890391-14890691)
chr3 (37-340)||(55427021-55427321)
chr3 (104-340)||(12299978-12300210)
chr3 (103-340)||(25978730-25978963)
chr3 (29-324)||(24253130-24253423)
chr3 (29-244)||(14147013-14147226)
chr3 (110-308)||(15526827-15527021)
chr3 (76-268)||(32280313-32280507)
chr3 (103-340)||(11787654-11787887)
chr3 (103-340)||(15317178-15317408)
chr3 (157-340)||(28088227-28088406)
chr3 (74-203)||(28953965-28954093)
chr3 (189-304)||(30464147-30464261)
chr3 (23-68)||(19089741-19089786)
chr3 (74-146)||(8251933-8252005)
chr3 (181-245)||(36138033-36138097)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (23-340)||(18252196-18252515)
chr1 (23-340)||(18532236-18532555)
chr1 (23-340)||(27131132-27131450)
chr1 (23-340)||(27310299-27310618)
chr1 (23-340)||(16358757-16359076)
chr1 (29-340)||(3855641-3855954)
chr1 (29-333)||(36816363-36816668)
chr1 (73-340)||(22641596-22641859)
chr1 (29-340)||(27277280-27277592)
chr1 (23-214)||(21171081-21171274)
chr1 (37-340)||(19706441-19706741)
chr1 (37-340)||(43802367-43802667)
chr1 (91-340)||(28134725-28134970)
chr1 (150-340)||(9916499-9916688)
chr1 (37-340)||(9456116-9456416)
chr1 (37-340)||(20391241-20391541)
chr1 (37-340)||(20779647-20779947)
chr1 (37-340)||(22670259-22670559)
chr1 (37-340)||(42816991-42817291)
chr1 (23-175)||(22657108-22657262)
chr1 (74-340)||(23507119-23507383)
chr1 (91-340)||(22612547-22612792)
chr1 (103-322)||(634001-634216)
chr1 (29-264)||(12014084-12014319)
chr1 (110-340)||(8727741-8727967)
chr1 (74-144)||(9917837-9917906)
chr1 (103-326)||(29096789-29097008)
chr1 (37-340)||(47667487-47667776)
chr1 (110-245)||(51997353-51997485)
chr1 (110-242)||(21881475-21881604)
chr1 (103-167)||(35930649-35930713)
chr1 (229-340)||(28145725-28145835)
chr1 (75-140)||(12006461-12006526)
chr1 (90-255)||(24301691-24301855)
chr1 (114-169)||(26923553-26923608)
chr1 (195-275)||(12006332-12006413)
chr1 (124-203)||(31236402-31236478)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (23-338)||(15152609-15152926)
chr7 (23-340)||(29327950-29328269)
chr7 (23-340)||(11535784-11536103)
chr7 (23-340)||(11542702-11543021)
chr7 (18-340)||(12750987-12751311)
chr7 (23-340)||(12738702-12739021)
chr7 (23-340)||(18561173-18561483)
chr7 (74-340)||(13392369-13392635)
chr7 (32-330)||(18257577-18257874)
chr7 (37-340)||(2204552-2204852)
chr7 (37-340)||(8464999-8465299)
chr7 (37-340)||(18400104-18400404)
chr7 (37-340)||(18407088-18407388)
chr7 (37-340)||(48808498-48808798)
chr7 (102-324)||(2365169-2365389)
chr7 (37-330)||(30254138-30254428)
chr7 (37-340)||(15729751-15730051)
chr7 (37-340)||(18139340-18139640)
chr7 (37-340)||(19230888-19231188)
chr7 (103-340)||(41680970-41681203)
chr7 (103-330)||(47166871-47167094)
chr7 (37-340)||(10668903-10669204)
chr7 (110-340)||(34128647-34128873)
chr7 (103-320)||(24443349-24443562)
chr7 (103-340)||(28130628-28130861)
chr7 (114-320)||(25845498-25845700)
chr7 (114-320)||(25845917-25846119)
chr7 (103-340)||(18259126-18259359)
chr7 (103-304)||(19393462-19393659)
chr7 (110-257)||(19388626-19388774)
chr7 (110-245)||(14591924-14592056)
chr7 (110-245)||(16011515-16011647)
chr7 (117-256)||(31190524-31190660)
chr7 (70-167)||(10235377-10235474)
chr7 (110-242)||(22969024-22969153)
chr7 (194-331)||(39112138-39112275)
chr7 (75-158)||(7662569-7662651)
chr7 (28-135)||(19859113-19859221)
chr7 (23-68)||(15148308-15148353)
chr7 (154-340)||(15169292-15169474)
chr7 (193-268)||(22948499-22948574)
chr7 (74-144)||(47833875-47833945)
chr7 (91-168)||(3132910-3132986)
chr7 (100-142)||(7396469-7396511)
chr7 (74-124)||(29983184-29983234)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (29-340)||(24695188-24695501)
chr5 (23-340)||(19714220-19714539)
chr5 (23-340)||(19706941-19707259)
chr5 (23-340)||(18569583-18569904)
chr5 (23-220)||(39538754-39538953)
chr5 (76-336)||(17298627-17298885)
chr5 (70-336)||(17285476-17285740)
chr5 (29-255)||(18806843-18807069)
chr5 (168-340)||(27347258-27347428)
chr5 (235-340)||(24701952-24702057)
chr5 (37-340)||(20941027-20941327)
chr5 (37-340)||(25805387-25805687)
chr5 (103-340)||(22941317-22941550)
chr5 (37-340)||(31899-32199)
chr5 (37-340)||(12789665-12789965)
chr5 (37-340)||(23545922-23546222)
chr5 (34-209)||(22546872-22547046)
chr5 (37-340)||(24933308-24933608)
chr5 (37-340)||(31096816-31097116)
chr5 (39-330)||(20100255-20100543)
chr5 (110-329)||(5097725-5097940)
chr5 (110-340)||(12764992-12765222)
chr5 (117-255)||(18806483-18806619)
chr5 (117-255)||(18806663-18806799)
chr5 (103-340)||(7865432-7865669)
chr5 (110-340)||(9811735-9811965)
chr5 (110-340)||(12703876-12704106)
chr5 (93-340)||(18829283-18829530)
chr5 (257-340)||(28719477-28719558)
chr5 (103-340)||(26129695-26129928)
chr5 (103-340)||(26245169-26245402)
chr5 (261-340)||(39538954-39539033)
chr5 (29-115)||(27347425-27347513)
chr5 (113-209)||(31651917-31652009)
chr5 (91-167)||(33477193-33477269)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (23-340)||(7273-7592)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (23-340)||(6656-6975)
scaffold0390 (23-340)||(13672-13991)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (23-340)||(18454-18772)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (23-340)||(25712-26031)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (23-340)||(21329970-21330289)
chr2 (23-340)||(18796672-18796991)
chr2 (29-333)||(18619976-18620281)
chr2 (71-333)||(20978091-20978351)
chr2 (29-340)||(36270338-36270648)
chr2 (82-328)||(6991847-6992094)
chr2 (23-330)||(18822249-18822556)
chr2 (29-328)||(22183220-22183518)
chr2 (37-340)||(30174377-30174677)
chr2 (37-340)||(24250034-24250334)
chr2 (103-330)||(15342014-15342237)
chr2 (37-340)||(24229217-24229517)
chr2 (110-326)||(29800545-29800757)
chr2 (75-167)||(19279508-19279600)
chr2 (179-313)||(17241034-17241167)
chr2 (38-165)||(18851956-18852085)
chr2 (110-257)||(19616509-19616653)
chr2 (110-244)||(40301034-40301164)
chr2 (112-317)||(41316305-41316506)
chr2 (43-144)||(36801899-36802003)
chr2 (110-209)||(21626824-21626919)
chr2 (275-337)||(41661694-41661756)
chr2 (195-275)||(36799745-36799826)
chr2 (181-257)||(28740910-28740986)
chr2 (106-169)||(28718943-28719006)
chr2 (103-144)||(24763751-24763792)
chr2 (103-144)||(28741220-28741261)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (23-323)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (23-340)||(5695-6007)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (86-340)||(230113-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (37-340)||(183-483)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (37-340)||(3677-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-340)||(119730-120030)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (103-330)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (103-340)||(67376-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (37-304)||(130262-130526)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (103-340)||(26609-26842)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (37-201)||(8305-8467)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-340)||(39990-40290)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (112-314)||(8807-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (152-340)||(102-286)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (110-340)||(11528-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (110-245)||(83111-83243)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (29-158)||(90019-90151)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (103-340)||(53832-54064)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (74-165)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (122-214)||(11328-11417)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2043
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatca 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10934
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatca 10934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941150
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatca 21941150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171972
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatca 22171972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094608
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatca 6094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326683
Alignment:
Q  79 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  179 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  279 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15326683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507052
Alignment:
Q  79 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  179 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  279 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15507052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643133
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatca 24643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548532
Alignment:
Q  201 atagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  301 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 28548532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 131  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| || | | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  132 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcga 230  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  231 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797224
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 24797260  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccaccctt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24797259 agatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371255
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctct 8371368  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  8371367 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatggg 8371269  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||  ||||||||    
T  8371268 tacttgatgaatca 8371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969633
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  21969628 gaatca 21969633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562423
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  12562418 gaatca 12562423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007519
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  27007524 gaatca 27007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014662
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  27014667 gaatca 27014662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880489
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  27880494 gaatca 27880489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020670
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  28020675 gaatca 28020670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611495
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcata 25611346  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | |||  ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25611347 agatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25611445  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25611446 gtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatca 25611495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130611
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  22130616 gaatca 22130611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659496
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 22659496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccaccc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcc 38232216  T
Q  226 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 325  Q
    |  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  38232215 tcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgg 38232116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916976
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  21916971 gaatca 21916976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534275
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  45534280 gaatca 45534275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240784
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||  |  | |||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| |||    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 26240784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431186
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 6431186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  111 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagt--ctgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  211 tggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835556
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||  ||| ||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactct 18835537  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatg 245  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  18835538 tagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 178
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375332
Alignment:
Q  75 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||  ||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata--aaaagt 2375328  T
Q  175 tatg 178  Q
    ||||    
T  2375329 tatg 2375332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962934
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  ||||||    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  200 catagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 299  Q
    || | ||||| | |  |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  300 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatca 2962934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  139 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaac 238  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  239 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    |||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  70 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 162  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970549
Alignment:
Q  229 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  329 ctccatgaatca 340  Q
    ||  ||||||||    
T  36970538 cttgatgaatca 36970549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 338
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375520
Alignment:
Q  229 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  329 ctccatgaat 338  Q
    ||||||||||    
T  2375511 ctccatgaat 2375520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  82 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  76 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  109 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 142
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 315
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  193 atattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 292  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  293 ccgtaacaggatgactataaagt 315  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  282 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  282 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684191
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatca 17684191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380974
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatca 27380974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471357
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatca 27471357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652208
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatca 11652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691162
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatca 17691162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309375
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatca 29309375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316334
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatca 29316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188699
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  188718 gatggatactccataaatca 188699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297114
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 27297114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 70 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394167
Alignment:
Q  70 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 169  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  170 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  270 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 16394167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 101 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  101 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  201 atagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  301 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 120 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559194
Alignment:
Q  120 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  220 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  320 tgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatca 16559194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  19 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccac--agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 116  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||| | |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  117 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggta 215  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||     
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  216 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  316 tggttgatgg 325  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27508594 - 27508349
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27508594 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27508498  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27508497 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27508399  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27508398 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 27508349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789371
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  16789366 gaatca 16789371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859890
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  22859895 gaatca 22859890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27528180 - 27527947
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27528180 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27528084  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27528083 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27527985  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27527984 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  121 ggagt 125  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586110
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  1586115 gaatca 1586110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 332
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669768
Alignment:
Q  75 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 174  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  175 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 273  Q
    | |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||  || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  274 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 332  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019981
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 201  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  303 atgactataaagttggtt 320  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074780
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   || |||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  14074775 gaatca 14074780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613219
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  200 catagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 299  Q
    || | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  300 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatca 8613219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  105 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  205 tgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
    ||||| | || |||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  88 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 186  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  187 cataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 273  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||  ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  133 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacc 232  Q
    ||||||     | || || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || ||||| | || ||| ||||    
T  19218526 atattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  233 tgaaaccactatg 245  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
    | ||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 208
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926103
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||     
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactacacag--aaaa 27926069  T
Q  174 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 208  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926070 ttatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 158
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172859
Alignment:
Q  71 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 158  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120507
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatca 17120507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 135  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | |  | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  136 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctga 235  Q
    ||||||||| || || | ||||||||||||  |     |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacat--tgggttttatg-taagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctga 17850325  T
Q  236 aacc 239  Q
    ||||    
T  17850324 aacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317165
Alignment:
Q  229 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  329 ctccatgaatca 340  Q
    ||  ||||||||    
T  33317154 cttgatgaatca 33317165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  203 agtgatagtggt 214  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  186 tcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  286 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 325  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  70 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 169  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  201 atagtgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 264  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcaca--ccacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaata 159  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537155
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcaca 68  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcaca 25537155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 4073652 - 4073745
Alignment:
Q  112 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  4073652 taaatattagaggtaatatttatatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgata 4073745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262697
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatca 18262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269558
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatca 18269558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613168
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatca 55613168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964125
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatca 26964125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970948
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatca 26970948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869082
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatca 869082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926482
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatca 19926482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707805
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatca 5707805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714433
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatca 5714433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858652
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatca 8858652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621055
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatca 10621055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628134
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatca 10628134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392856
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatca 28392856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845688
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatca 8845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426338
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||            |||||||||||||||||| |||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatca 4426338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667851
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||   ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatcatctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatattt 5668057  T
Q  133 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacc 232  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5668056 atactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacc 5667957  T
Q  233 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667956 tgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactcc 5667859  T
Q  333 atgaatca 340  Q
    | ||||||    
T  5667858 acgaatca 5667851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224045
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||| ||||||    
T  35224032 tactccacgaatca 35224045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677308
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  310 taaagttggttgatgggtactccatgaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10677308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890948
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  310 taaagttggttgatgggtactccatgaa 337  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311775
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatatt 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | |||||||  || | |||||   ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  220 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  320 tgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | || ||||||||| ||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatca 20311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461797
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  15461792 gaatca 15461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975851
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  34975846 gaatca 34975851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677313
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  2677308 gaatca 2677313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815321
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  15815316 gaatca 15815321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111045
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  18111050 gaatca 18111045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369025
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  3369030 gaatca 3369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299977
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 324  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatg 17299977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccac 241  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244237
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  20244232 gaatca 20244237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531913
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  26531908 gaatca 26531913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  202 tagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 301  Q
     | ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  302 gatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675985
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  4675990 gaatca 4675985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163462
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  18163457 gaatca 18163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942024
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| |||    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 1942024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Original strand, 5870473 - 5870718
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  5870473 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 5870569  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
     |||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| ||||||    
T  5870570 tgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgtt 5870668  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5870669 gtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatca 5870718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgagcaca--ccacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  131 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 167  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgg 325  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     |||| ||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  310 taaagttggttgatggg 326  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646536
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 173  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||  ||| |    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaagg 32646692  T
Q  174 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 272  Q
    ||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || |||    
T  32646691 ttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactt 32646593  T
Q  273 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 329  Q
    |||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32646592 tgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtac 32646536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |||| |||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  303 atgactataaagttggttgatggg 326  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487851
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  310 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatca 9487851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040491
Alignment:
Q  122 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattcc 221  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  222 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 321  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  322 atgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||||  ||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatca 30040491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  104 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  204 gtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaacca 240  Q
     ||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     |||  |  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  310 taaagttggttgatggg 326  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546298
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 340
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421307
Alignment:
Q  125 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacc 224  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  | |||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  225 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 324  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  325 ggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||| ||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatca 11421307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  82 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 181  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  182 agtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 117
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  41 ctattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 264
Target Start/End: Original strand, 24701363 - 24701411
Alignment:
Q  216 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701363 tattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  233 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  112 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 203  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110549
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatca 6110549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482205
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatca 16482205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579077
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatca 10579077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600606
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatca 15600606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607151
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatca 15607151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572314
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatca 10572314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520460
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatca 18520460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 338
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  128 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  228 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  328 actccatgaat 338  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 38 - 340
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490980
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  136 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  236 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  336 aatca 340  Q
    |||||    
T  8490976 aatca 8490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211787
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatca 13211787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357308
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatca 15357308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780840
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatca 17780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249092
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatca 13249092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatca 15341941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056621
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  120 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatatt 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  220 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  320 tgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatca 32056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199906
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatca 17199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517292
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatca 13517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647243
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatca 1647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136838
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatca 17136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925456
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatca 29925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974609
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatca 29974609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 71 - 340
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200915
Alignment:
Q  71 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  171 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 270  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  271 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatca 16200915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034538
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  21034533 gaatca 21034538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846538
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  15846543 gaatca 15846538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147556
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  20147561 gaatca 20147556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21399092
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21398943  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||| | | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21398944 agatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21399042  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21399043 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 21399092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890691
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  14890686 gaatca 14890691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427321
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  55427316 gaatca 55427321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 340
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300210
Alignment:
Q  104 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  204 gtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagga 303  Q
     ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  304 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12300210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978730
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 25978730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccacag--atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||  ||| ||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactct 14147208  T
Q  227 tcgacctgaaaccactat 244  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14147209 tagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 308
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 308  Q
     |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 268
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  76 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 175  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  176 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787887
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatca 11787887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317178
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || ||   | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatca 15317178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088406
Alignment:
Q  157 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 256  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  257 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | ||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28088324 t-ggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatca 28088406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  173 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 203  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 304
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  189 taagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  289 ttgtccgtaacaggat 304  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089741
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcaca 68  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 19089741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8252005 - 8251933
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatc 146  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8252005 gatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatatttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  181 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252515
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatca 18252515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532236
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatca 18532236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131132
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatca 27131132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310299
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatca 27310299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358757
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatca 16358757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855641
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatca 3855641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816363
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  327 tactcca 333  Q
    |||||||    
T  36816369 tactcca 36816363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641596
Alignment:
Q  73 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  173 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  273 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatca 22641596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277280
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    |||||||| |||||    
T  27277293 tactccataaatca 27277280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706441
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  19706446 gaatca 19706441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802367
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  43802372 gaatca 43802367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28134970 - 28134725
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28134970 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 28134874  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28134873 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28134775  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28134774 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 28134725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916499
Alignment:
Q  150 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  248 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatca 9916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456416
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  9456411 gaatca 9456416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391241
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |  | ||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  20391246 gaatca 20391241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779647
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  20779652 gaatca 20779647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670259
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  22670264 gaatca 22670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816991
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  42816996 gaatca 42816991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccacaga--tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| | || |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 175  Q
     |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 340
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507383
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||  || |    
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacg 23507216  T
Q  174 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 272  Q
    || || |||  | |||||| ||||||||||||||| |||||  |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||    
T  23507217 ttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  273 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatca 23507383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612792
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 190  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22612643  T
Q  191 agatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 290  Q
    ||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22612644 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22612742  T
Q  291 gtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22612743 gtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatca 22612792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 322
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634216
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  303 atgactataaagttggttga 322  Q
    || || |||| |||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| |||||| |||| | ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccaccc 225  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | | ||||   ||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccc 12014123  T
Q  226 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 264  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014122 ttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727967
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
       || |||  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  310 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatca 8727967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 326
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |||| | |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  303 atgactataaagttggttgatggg 326  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667487
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||           |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
     || ||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccact 242  Q
      ||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145725
Alignment:
Q  229 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  329 ctccatgaatca 340  Q
    ||  ||||||||    
T  28145736 cttgatgaatca 28145725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006461
Alignment:
Q  75 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 140  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  90 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtca 188  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  189 taagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  114 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 169  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  195 attctcatagtgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 275  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  124 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 203  Q
    |||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  321 gatgggtactccatgaat 338  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328269
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatca 29328269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535784
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatca 11535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542702
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatca 11542702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751311
Alignment:
Q  18 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  116 tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  216 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  316 tggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatca 12751311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739021
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatca 12739021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561483
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||||| || ||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatca 18561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 74 - 340
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392635
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 173  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  174 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  274 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatca 13392635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257577
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 129  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  130 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcg 229  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  230 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 329  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204852
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  2204847 gaatca 2204852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465299
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  8465294 gaatca 8465299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400404
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  18400399 gaatca 18400404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407388
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  18407383 gaatca 18407388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808498
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  48808503 gaatca 48808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365389
Alignment:
Q  102 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  202 tagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 300  Q
    | ||||| |||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  301 ggatgactataaagttggttgatg 324  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatg 2365389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730051
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  15730046 gaatca 15730051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139340
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  18139345 gaatca 18139340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231188
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  19231183 gaatca 19231188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680970
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatca 41680970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    || || |||| |||||||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668903
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtatattccacccttcgacct 233  Q
    | | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | || |||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  234 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 333  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  334 tgaatca 340  Q
    |||||||    
T  10668909 tgaatca 10668903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128873
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  310 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatca 34128873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443349
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    ||||||| |||| |||  ||| ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  303 atgactataaagttggtt 320  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  24443366 atgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130861
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | | ||| | || |||  ||  ||| ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatca 28130861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845498
Alignment:
Q  114 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  214 tatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 313  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  314 gttggtt 320  Q
    |||||||    
T  25845504 gttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845917
Alignment:
Q  114 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  214 tatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 313  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  314 gttggtt 320  Q
    |||||||    
T  25845923 gttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259126
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393462
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaagg 19393464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388774
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  208 tagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
    || | || ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
     | || |||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
     |  | |||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  117 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtat 216  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  217 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 256  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 167
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235474
Alignment:
Q  70 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||  |||||||    
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatgagaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccact 242  Q
      ||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  194 tattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 293  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  294 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 331  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  75 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 158  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  28 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 125  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  126 aatatttata 135  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148353
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcaca 68  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 15148353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169292
Alignment:
Q  154 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 253  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  254 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatca 15169292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  193 atattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 268  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47833945 - 47833875
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 144  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  47833945 gatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttatatttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 168  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 142
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  100 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 142  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Original strand, 29983184 - 29983234
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983184 gatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695188
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  327 tactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatca 24695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714220
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatca 19714220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatca 19706941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569583
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  119 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  219 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  319 ttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatca 18569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298627
Alignment:
Q  76 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  176 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttg 274  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  275 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 336  Q
    |  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17298627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285476
Alignment:
Q  70 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  170 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 268  Q
    ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| ||||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  269 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 336  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17285476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccaccc 225  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccc 18806873  T
Q  226 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 255  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806872 ttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347258
Alignment:
Q  168 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  268 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 27347258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701952
Alignment:
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  24701957 gaatca 24701952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941327
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  20941322 gaatca 20941327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805387
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  25805392 gaatca 25805387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941550
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 22941550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32199
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  32194 gaatca 32199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789665
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | ||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  12789670 gaatca 12789665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546222
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  23546217 gaatca 23546222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546872
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 131  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  132 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933308
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  24933313 gaatca 24933308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097116
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  31097111 gaatca 31097116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  39 gactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  137 tggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaa 236  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  237 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    |||||||||  ||| |||||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatgt-ggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 329
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097940
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  310 taaagttggttgatgggtac 329  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtac 5097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764992
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  207 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 306  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  307 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12764992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  117 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggta 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |     
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  216 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  117 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggta 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |     
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  216 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865432
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  200 catagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 299  Q
    || | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  300 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatca 7865432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811735
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  207 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 306  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  307 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 9811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703876
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  207 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 306  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  307 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 12703876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829283
Alignment:
Q  93 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 192  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  193 atattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 291  Q
     |||||||||| |||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  292 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatca 18829283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719477
Alignment:
Q  257 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 28719477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129695
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| |||| |||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatca 26129695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245402
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | || || | || |||  | | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatca 26245402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539033
Alignment:
Q  261 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatca 39539033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  113 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33477269 - 33477193
Alignment:
Q  91 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 167  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477269 tatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7592
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatca 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6656
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatca 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13672
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatca 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18772
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatca 18772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25712
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25731 gatgggtactccataaatca 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329970
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatca 21329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796991
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  321 gatgggtactccatgaatca 340  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatca 18796991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620281
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||| | ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccaccct 226  Q
    ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  227 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 326  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  327 tactcca 333  Q
    |||||||    
T  18620275 tactcca 18620281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 333
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978351
Alignment:
Q  71 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  171 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 269  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  270 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 333  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactcca 20978351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 340
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270648
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca-ga-tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| | || || |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccaccc 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccc 36270533  T
Q  226 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 325  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36270534 ttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgg 36270633  T
Q  326 gtactccatgaatca 340  Q
    |||||| ||||||||    
T  36270634 gtactcaatgaatca 36270648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6992094 - 6991847
Alignment:
Q  82 ataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga 179  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||| |||||     
T  6992094 ataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattatg- 6991998  T
Q  180 aaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtca 277  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||      
T  6991997 taagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgttt 6991898  T
Q  278 ccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 328  Q
    |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6991897 ctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 330
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacac--cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||| ||||   ||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtatatt 219  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||| ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||| ||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtatt 18822445  T
Q  220 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18822446 ccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggt 18822545  T
Q  320 tgatgggtact 330  Q
    | |||||||||    
T  18822546 taatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183220
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 126  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||| || | |  ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  127 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtatattccaccc 225  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  226 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 325  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174677
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  30174672 gaatca 30174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250034
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  24250039 gaatca 24250034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229217
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  24229222 gaatca 24229217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 326
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800757
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 309  Q
     |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  310 taaagttggttgatggg 326  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  29800741 taatgttggttaatggg 29800757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  75 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241167
Alignment:
Q  179 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  279 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 313  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaa 17241167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851956
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 135  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  136 ttggattgatccgccatgagaatactacat 165  Q
    |||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18851985 ttggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616653
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| || || |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
     | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactat 244  Q
     || | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  112 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  212 ggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 311  Q
    ||   || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  312 aagttg 317  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  43 attatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga-tataaatattaggagtaatatttatattgg 139  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  140 attga 144  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626919
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgct--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661756
Alignment:
Q  275 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaa 41661756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  195 attctcatagtgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 275  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  181 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  106 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 144  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  221 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  321 gat 323  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6007
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacacc--acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  121 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcatagtg---------catt 5885  T
Q  220 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 318  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  319 ttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatca 6007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 86 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230113
Alignment:
Q  86 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  186 tcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  286 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatca 230113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 183 - 483
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  478 gaatca 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3677
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  3682 gaatca 3677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120030
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  120025 gaatca 120030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtact 330  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67376
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 67376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 304  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26842
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
    ||||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatca 26842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8467
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || | ||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 201  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39990
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  135 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctg 234  Q
    |  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  235 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 334  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  335 gaatca 340  Q
    ||||||    
T  39995 gaatca 39990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  112 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagt--atgttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  212 ggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 311  Q
    ||| ||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 102 - 286
Alignment:
Q  152 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 251  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  252 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  199 agatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11528
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  207 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 306  Q
    |||   || ||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  307 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 11528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  110 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 209  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  210 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 245  Q
     |||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90019
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgagcacaccaca--gatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 125  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||| | ||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  126 aatatttatattggattgatccgccatgagaat 158  Q
    || ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90051 aacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54064
Alignment:
Q  103 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 202  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  203 agtgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 302  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  303 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 340  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 54064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 165
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  74 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 165  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11417
Alignment:
Q  122 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 214  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggt 11417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University