View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20376_low_7 (Length: 399)

Name: NF20376_low_7
Description: NF20376
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20376_low_7
NF20376_low_7
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (9-399)||(27284190-27284581)
chr6 (9-390)||(29555537-29555919)
chr6 (25-390)||(16755815-16756182)
chr6 (27-390)||(13518031-13518395)
chr6 (9-390)||(26110248-26110629)
chr6 (10-399)||(27623535-27623927)
chr6 (9-390)||(27355948-27356330)
chr6 (27-388)||(27491130-27491492)
chr6 (26-390)||(28166490-28166856)
chr6 (27-387)||(16680136-16680498)
chr6 (25-390)||(27063477-27063842)
chr6 (9-390)||(4539595-4539978)
chr6 (9-399)||(22928709-22929102)
chr6 (26-390)||(4763759-4764124)
chr6 (9-390)||(26772466-26772847)
chr6 (9-390)||(27200165-27200548)
chr6 (9-390)||(27248685-27249068)
chr6 (26-390)||(29507412-29507779)
chr6 (9-390)||(8899536-8899918)
chr6 (9-390)||(28213433-28213816)
chr6 (26-390)||(4778876-4779242)
chr6 (9-390)||(34458345-34458725)
chr6 (33-390)||(29579018-29579375)
chr6 (20-390)||(30551837-30552208)
chr6 (9-394)||(33370264-33370650)
chr6 (33-390)||(13292788-13293140)
chr6 (9-390)||(4531267-4531649)
chr6 (25-390)||(26791811-26792177)
chr6 (25-390)||(14139237-14139597)
chr6 (48-390)||(16937862-16938204)
chr6 (25-390)||(27013728-27014087)
chr6 (25-390)||(26926763-26927113)
chr6 (26-390)||(27031019-27031381)
chr6 (25-399)||(27208899-27209270)
chr6 (25-399)||(27239958-27240329)
chr6 (111-390)||(26666495-26666774)
chr6 (25-389)||(24869705-24870064)
chr6 (26-390)||(27025141-27025502)
chr6 (26-390)||(24299597-24299957)
chr6 (26-390)||(15406370-15406731)
chr6 (26-390)||(15418157-15418518)
chr6 (27-399)||(20174545-20174929)
chr6 (27-399)||(22161062-22161446)
chr6 (9-106)||(23851450-23851547)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (33-390)||(11555367-11555724)
chr5 (21-390)||(3795539-3795910)
chr5 (27-390)||(18369322-18369686)
chr5 (27-390)||(33881133-33881497)
chr5 (26-390)||(30174471-30174837)
chr5 (26-390)||(40467343-40467708)
chr5 (26-390)||(13318618-13318982)
chr5 (25-390)||(28655247-28655614)
chr5 (25-390)||(9544497-9544864)
chr5 (20-390)||(6880303-6880675)
chr5 (25-390)||(13436464-13436836)
chr5 (9-390)||(9323466-9323847)
chr5 (33-387)||(23631982-23632339)
chr5 (27-390)||(24729977-24730341)
chr5 (34-390)||(30158048-30158405)
chr5 (9-399)||(22894405-22894795)
chr5 (9-390)||(12138165-12138546)
chr5 (25-390)||(15752648-15753008)
chr5 (25-390)||(37665276-37665642)
chr5 (9-390)||(2517054-2517437)
chr5 (32-387)||(18494561-18494916)
chr5 (26-396)||(34622524-34622896)
chr5 (9-390)||(32590066-32590447)
chr5 (25-389)||(30035431-30035795)
chr5 (9-390)||(31820200-31820580)
chr5 (9-390)||(37352434-37352816)
chr5 (25-390)||(5643805-5644169)
chr5 (26-390)||(13180583-13180944)
chr5 (20-390)||(33522382-33522754)
chr5 (25-390)||(37760987-37761354)
chr5 (25-390)||(37746112-37746484)
chr5 (27-390)||(11329644-11330010)
chr5 (25-389)||(18122207-18122572)
chr5 (25-390)||(31437469-31437828)
chr5 (27-390)||(8659262-8659625)
chr5 (9-390)||(26486385-26486756)
chr5 (32-390)||(43084270-43084629)
chr5 (9-390)||(33298522-33298908)
chr5 (26-390)||(41680710-41681076)
chr5 (9-390)||(28953570-28953952)
chr5 (9-388)||(25206266-25206653)
chr5 (9-388)||(25270422-25270809)
chr5 (25-390)||(22992914-22993272)
chr5 (25-390)||(15652550-15652914)
chr5 (32-389)||(23897886-23898238)
chr5 (25-390)||(33783492-33783853)
chr5 (32-390)||(24975861-24976214)
chr5 (25-390)||(24608250-24608612)
chr5 (26-390)||(30940642-30941001)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (33-390)||(12661543-12661900)
chr2 (25-390)||(37383673-37384039)
chr2 (48-390)||(39896088-39896430)
chr2 (26-390)||(9343867-9344232)
chr2 (26-390)||(254532-254897)
chr2 (26-390)||(37945745-37946111)
chr2 (25-390)||(27809697-27810065)
chr2 (26-390)||(39045702-39046067)
chr2 (27-390)||(34867681-34868044)
chr2 (9-390)||(12710481-12710863)
chr2 (48-390)||(22922023-22922368)
chr2 (26-390)||(27122522-27122885)
chr2 (26-390)||(13930424-13930791)
chr2 (26-390)||(16167475-16167840)
chr2 (25-390)||(34160840-34161208)
chr2 (25-390)||(12592806-12593176)
chr2 (48-390)||(19410364-19410709)
chr2 (26-390)||(31882284-31882648)
chr2 (25-390)||(32055798-32056163)
chr2 (26-390)||(37931369-37931741)
chr2 (25-390)||(3788490-3788855)
chr2 (20-399)||(21697044-21697427)
chr2 (9-390)||(37679771-37680155)
chr2 (9-390)||(37695036-37695420)
chr2 (20-390)||(16823217-16823588)
chr2 (20-390)||(16897892-16898263)
chr2 (9-390)||(11629065-11629446)
chr2 (9-390)||(21671050-21671435)
chr2 (9-390)||(40239489-40239870)
chr2 (25-387)||(34297152-34297508)
chr2 (9-390)||(27782212-27782594)
chr2 (77-390)||(31868666-31868979)
chr2 (9-399)||(27396303-27396704)
chr2 (9-399)||(19450289-19450689)
chr2 (25-389)||(34268807-34269167)
chr2 (25-390)||(28888275-28888636)
chr2 (26-390)||(23122458-23122818)
chr2 (25-399)||(27428324-27428692)
chr2 (26-390)||(20843909-20844274)
chr2 (225-390)||(23116993-23117158)
chr2 (26-82)||(31887682-31887738)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (9-390)||(3069-3453)
scaffold0159 (173-390)||(17952-18172)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (9-390)||(32296574-32296957)
chr3 (26-390)||(4790566-4790932)
chr3 (26-390)||(5727940-5728306)
chr3 (26-390)||(47029415-47029781)
chr3 (26-390)||(5717030-5717396)
chr3 (26-390)||(5764062-5764428)
chr3 (25-390)||(22381514-22381879)
chr3 (9-390)||(29658901-29659283)
chr3 (25-390)||(10402110-10402475)
chr3 (9-390)||(48471872-48472258)
chr3 (48-390)||(31958388-31958733)
chr3 (9-390)||(28027236-28027616)
chr3 (20-390)||(5590294-5590665)
chr3 (26-390)||(4422880-4423245)
chr3 (48-390)||(5603246-5603591)
chr3 (26-390)||(10649033-10649398)
chr3 (9-399)||(16422128-16422519)
chr3 (25-387)||(22864784-22865145)
chr3 (25-387)||(22879843-22880204)
chr3 (48-390)||(24334157-24334502)
chr3 (26-390)||(5019675-5020039)
chr3 (25-390)||(17970799-17971163)
chr3 (20-390)||(4340609-4340980)
chr3 (9-390)||(18248683-18249065)
chr3 (9-390)||(28109884-28110271)
chr3 (25-396)||(6536670-6537042)
chr3 (20-390)||(17978883-17979255)
chr3 (25-390)||(20071994-20072362)
chr3 (25-390)||(7079183-7079554)
chr3 (25-390)||(8217593-8217961)
chr3 (9-399)||(16618413-16618808)
chr3 (26-390)||(11104294-11104660)
chr3 (48-390)||(28345155-28345497)
chr3 (33-390)||(18286288-18286645)
chr3 (33-390)||(18301589-18301946)
chr3 (25-390)||(5472949-5473314)
chr3 (26-390)||(51787984-51788349)
chr3 (9-390)||(29142687-29143072)
chr3 (9-390)||(4629730-4630111)
chr3 (9-390)||(21680646-21681027)
chr3 (26-390)||(18231155-18231520)
chr3 (27-390)||(18336591-18336949)
chr3 (26-390)||(31030178-31030536)
chr3 (26-399)||(18057222-18057599)
chr3 (9-390)||(20570779-20571161)
chr3 (33-399)||(4727602-4727963)
chr3 (9-399)||(19700431-19700834)
chr3 (32-390)||(32445122-32445472)
chr3 (33-399)||(6207869-6208232)
chr3 (26-390)||(15735033-15735393)
chr3 (33-390)||(35886733-35887087)
chr3 (26-390)||(8283391-8283767)
chr3 (26-389)||(4689613-4689971)
chr3 (25-390)||(5658095-5658458)
chr3 (164-390)||(15886674-15886895)
chr3 (25-135)||(15886894-15887006)
chr3 (26-111)||(8002522-8002607)
chr3 (92-175)||(27561018-27561101)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (25-390)||(9532-9897)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (25-390)||(18796704-18797071)
chr8 (26-390)||(33248365-33248729)
chr8 (20-390)||(28355802-28356176)
chr8 (25-390)||(9360620-9360985)
chr8 (9-390)||(19680430-19680811)
chr8 (9-390)||(12086575-12086958)
chr8 (21-390)||(29835317-29835686)
chr8 (26-390)||(31360527-31360892)
chr8 (26-390)||(15773573-15773938)
chr8 (26-390)||(44566979-44567347)
chr8 (48-390)||(31483722-31484067)
chr8 (33-390)||(21342022-21342381)
chr8 (25-387)||(18715478-18715843)
chr8 (25-375)||(33264729-33265079)
chr8 (33-390)||(19911014-19911374)
chr8 (9-390)||(19202227-19202598)
chr8 (9-398)||(22074773-22075164)
chr8 (25-399)||(19655190-19655562)
chr8 (9-390)||(27602766-27603141)
chr8 (25-390)||(22138904-22139264)
chr8 (26-390)||(2131120-2131479)
chr8 (9-284)||(16260205-16260480)
chr8 (26-388)||(19694094-19694453)
chr8 (51-390)||(14569180-14569518)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (25-390)||(12034-12399)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (33-390)||(5164387-5164745)
chr7 (25-390)||(5154079-5154444)
chr7 (20-390)||(24586311-24586682)
chr7 (26-390)||(26518789-26519152)
chr7 (48-390)||(4139021-4139366)
chr7 (9-390)||(11446867-11447249)
chr7 (9-390)||(4205368-4205750)
chr7 (9-390)||(31084398-31084781)
chr7 (33-390)||(11418555-11418913)
chr7 (26-390)||(26663688-26664054)
chr7 (26-390)||(26678880-26679246)
chr7 (9-390)||(26268861-26269247)
chr7 (27-390)||(45393216-45393580)
chr7 (9-390)||(26313625-26314006)
chr7 (26-390)||(31558170-31558535)
chr7 (15-390)||(26441238-26441615)
chr7 (9-390)||(5141110-5141493)
chr7 (25-390)||(26509471-26509839)
chr7 (25-390)||(45737296-45737664)
chr7 (9-388)||(16745298-16745679)
chr7 (9-399)||(16047294-16047682)
chr7 (9-390)||(3451297-3451680)
chr7 (26-390)||(39206915-39207280)
chr7 (26-399)||(2160566-2160942)
chr7 (25-390)||(2779247-2779607)
chr7 (25-390)||(31129900-31130260)
chr7 (23-399)||(16443770-16444148)
chr7 (9-399)||(10847562-10847955)
chr7 (112-390)||(26595750-26596031)
chr7 (25-390)||(16512216-16512576)
chr7 (26-390)||(10910702-10911061)
chr7 (26-111)||(26531926-26532011)
chr7 (92-175)||(29027282-29027366)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (9-390)||(39856630-39857010)
chr4 (27-390)||(14104554-14104917)
chr4 (26-390)||(20332312-20332678)
chr4 (26-390)||(40099526-40099892)
chr4 (27-390)||(30759775-30760137)
chr4 (27-390)||(33667693-33668055)
chr4 (26-390)||(27157202-27157569)
chr4 (25-390)||(54839400-54839765)
chr4 (25-390)||(34182854-34183218)
chr4 (25-390)||(5700549-5700915)
chr4 (26-390)||(24586251-24586617)
chr4 (25-390)||(14753384-14753749)
chr4 (9-390)||(5011870-5012253)
chr4 (9-390)||(18794507-18794889)
chr4 (20-390)||(21975708-21976079)
chr4 (25-387)||(36338419-36338774)
chr4 (25-390)||(24118672-24119037)
chr4 (9-399)||(1906245-1906641)
chr4 (20-390)||(31120400-31120772)
chr4 (33-390)||(6575879-6576229)
chr4 (9-399)||(15276510-15276904)
chr4 (9-399)||(15380119-15380510)
chr4 (9-399)||(15233809-15234204)
chr4 (33-398)||(1673877-1674244)
chr4 (106-387)||(36324210-36324484)
chr4 (26-390)||(14671026-14671388)
chr4 (26-390)||(17019062-17019423)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (9-390)||(1639-2021)
scaffold0322 (9-396)||(12028-12427)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (26-390)||(3647147-3647512)
chr1 (27-390)||(28591085-28591448)
chr1 (26-390)||(41787199-41787566)
chr1 (9-399)||(20334296-20334689)
chr1 (26-390)||(10968666-10969032)
chr1 (25-390)||(28155726-28156094)
chr1 (9-390)||(51644204-51644588)
chr1 (34-390)||(10951100-10951458)
chr1 (9-396)||(16201911-16202307)
chr1 (9-399)||(20466761-20467160)
chr1 (9-390)||(21891652-21892020)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (25-399)||(4484-4862)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (26-390)||(18584-18951)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (25-390)||(8819-9184)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (9-390)||(13931-14314)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (25-390)||(9912-10277)
scaffold0143 (25-390)||(33295-33658)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-390)||(15551-15940)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (9-399)||(25097-25496)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (26-390)||(6065-6427)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (33-390)||(24796-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (9-190)||(359-540)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (240-398)||(1-159)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (9-169)||(26245-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (33-165)||(40759-40898)
scaffold0099 (305-390)||(40519-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284190
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctacttt 27284382  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284381 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 27284282  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27284281 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttcccc 27284190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555919
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttc 29555736  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555737 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaa 29555836  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29555837 acctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 29555919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 16755815 - 16756182
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755815 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 16755914  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755915 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 16756014  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756015 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 16756114  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16756115 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 16756182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13518031
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 13518196  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518195 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13518096  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13518095 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 13518031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110248
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 26110430  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26110429 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaa 26110330  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26110329 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcagg 26110248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623535
Alignment:
Q  10 catcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  110 tttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  208 caaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 27623535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355948
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27356130 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 27356031  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356030 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 388
Target Start/End: Original strand, 27491130 - 27491492
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491130 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27491229  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491230 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaaca 27491329  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491330 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27491429  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491430 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagca 27491492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 28166490 - 28166856
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166490 gcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28166589  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28166590 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaattt 28166689  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166690 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 28166789  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28166790 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28166856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 387
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680498
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  226 -attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16680336 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggta 16680435  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680436 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 16680498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063842
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 27063675  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063676 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27063775  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27063776 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 27063842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539595
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct-actt 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  207 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4539778 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 4539679  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539678 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4539595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928709
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22928903  T
Q  209 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||    
T  22928902 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagc 22928803  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928802 aaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 22928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 4763759 - 4764124
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4763759 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4763858  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4763859 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 4763957  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763958 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4764057  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764058 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 4764124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772466
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 26772649  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26772648 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaa 26772549  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26772548 acctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 26772466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200548
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27200363  T
Q  208 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200364 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27200463  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27200464 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248685
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27248870  T
Q  208 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248869 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27248770  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27248769 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 29507412 - 29507779
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29507412 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 29507511  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactct--atttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||||    
T  29507512 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaa 29507611  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507612 acattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 29507711  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29507712 tacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 29507779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899536
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 8899720  T
Q  208 caaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899719 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 8899620  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8899619 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacagg 8899536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213816
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28213633 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 28213732  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213733 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28213816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779242
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaa 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779076 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4779175  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4779176 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4779242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458345
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 34458527  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34458526 ctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 34458428  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458427 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 34458345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579375
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttcc 29579216  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29579217 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaa 29579316  T
Q  332 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29579317 atgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 29579375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551837
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 30552009  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30552008 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 30551909  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30551908 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 30551837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370264
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 33370452  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  33370451 caaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcg 33370352  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33370351 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctct 33370264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292788
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 13292941  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292940 ttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 13292846  T
Q  333 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13292845 tgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcagg 13292788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531649
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 4531466  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531467 aaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 4531566  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat-ttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4531567 acccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcagg 4531649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 26791811 - 26792177
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26791811 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26791910  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791911 aatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26792009  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792010 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26792109  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26792110 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 26792177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139237
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 14139398  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139397 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggta 14139303  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139302 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 14139237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16938204 - 16937862
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16938204 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccacc 16938105  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16938104 actcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataat 16938006  T
Q  248 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 346  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938005 ggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 16937906  T
Q  347 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16937905 gcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagg 16937862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014087
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 27013927  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013928 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 27014021  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27014022 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcagg 27014087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927113
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatt 26926961  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926962 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 26927061  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26927062 acattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 27031019 - 27031381
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27031019 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27031118  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27031119 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27031218  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031219 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27031314  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27031315 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 27031381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 27208899 - 27209270
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27208899 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27208998  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27208999 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27209098  T
Q  224 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27209099 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27209191  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209192 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27209270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27240329 - 27239958
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27240329 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27240230  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27240229 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27240130  T
Q  224 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27240129 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27240037  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27240036 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27239958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666495
Alignment:
Q  111 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  211 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  310 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 26666495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 389
Target Start/End: Original strand, 24869705 - 24870064
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24869705 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24869804  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  24869805 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 24869904  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  24869905 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 24869997  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24869998 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 24870064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 27025141 - 27025502
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27025141 gcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27025240  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27025241 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27025340  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  27025341 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27025433  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27025434 gtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 27025502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24299957 - 24299597
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24299957 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24299858  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||    
T  24299857 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaa 24299758  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    | ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24299757 cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggt 24299663  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24299662 acattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 24299597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15406731 - 15406370
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15406731 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15406632  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  15406631 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15406532  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  15406531 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15406438  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  15406437 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcagg 15406370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15418518 - 15418157
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15418518 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15418419  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  15418418 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15418319  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  15418318 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15418225  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  15418224 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcagg 15418157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 399
Target Start/End: Original strand, 20174545 - 20174929
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatt-tccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20174545 cttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgga 20174644  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| ||    
T  20174645 gtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaa 20174744  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgag 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20174745 aacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttag 20174844  T
Q  315 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20174845 caacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccc 20174929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22161446 - 22161062
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatt-tccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22161446 cttgtgaattcaaaatgctaaaggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgga 22161347  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| ||    
T  22161346 gtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaa 22161247  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgag 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22161246 aacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttag 22161147  T
Q  315 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22161146 caacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccc 22161062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555724
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 11555566  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555567 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 11555666  T
Q  333 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555667 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 11555724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 390
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795910
Alignment:
Q  21 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  121 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt-tcttctactttcaaagctatat 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatat 3795738  T
Q  219 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795739 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 3795838  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3795839 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcagg 3795910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369322
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18369487  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369486 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18369387  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369386 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 18369322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881497
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 33881332  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881333 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33881432  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33881433 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 33881497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174837
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174671 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30174770  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174771 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 30174837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467343
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 40467509  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467508 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40467409  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40467408 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 40467343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318618
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 13318783  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318782 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13318683  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13318682 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 13318618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 28655247 - 28655614
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655247 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 28655346  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655347 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28655445  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655446 cattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28655545  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28655546 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28655614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9544864 - 9544497
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9544864 tgcttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9544766  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544765 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9544667  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9544666 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacag 9544567  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544566 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 9544497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Original strand, 6880303 - 6880675
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 118  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880303 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 6880402  T
Q  119 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880403 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatat 6880502  T
Q  219 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880503 acaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 6880602  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6880603 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcagg 6880675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13436836 - 13436464
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436836 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 13436737  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13436736 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaa 13436637  T
Q  223 aacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436636 aacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13436537  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13436536 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcagg 13436464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323847
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 9323664  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9323665 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 9323764  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9323765 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 9323847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 33 - 387
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632339
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 23632181  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23632182 ttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattc 23632281  T
Q  330 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23632282 aaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagc 23632339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730341
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaata 24730175  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730176 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 24730275  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24730276 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 24730341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 30158048 - 30158405
Alignment:
Q  34 attcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 133  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158048 attcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 30158147  T
Q  134 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctt 233  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30158148 tttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcct 30158247  T
Q  234 tctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30158248 tctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaa 30158347  T
Q  333 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30158348 tgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 30158405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894795
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22894604  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22894605 aaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaa 22894703  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22894704 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttcccc 22894795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138546
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 12138363  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12138364 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 12138463  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12138464 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 12138546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15753008 - 15752648
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753008 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 15752909  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752908 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 15752810  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752809 cattttctttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15752714  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15752713 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagg 15752648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665276
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 37665443  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37665442 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacaggg 37665343  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37665342 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacagg 37665276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517437
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattcta-ttttcttctactttc 2517252  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517253 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 2517352  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2517353 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcagg 2517437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 32 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494561
Alignment:
Q  32 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 230  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttacttt 18494718  T
Q  231 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494717 cttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 18494618  T
Q  331 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494617 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 18494561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 396
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622896
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622724 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34622823  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34622824 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttc 34622896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590066
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttc 32590249  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590248 aaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 32590149  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32590148 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 32590066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 389
Target Start/End: Original strand, 30035431 - 30035795
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30035431 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 30035530  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035531 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 30035629  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035630 cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30035729  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30035730 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcag 30035795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820200
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttc 31820382  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31820381 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 31820282  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31820281 cctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 31820200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352434
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 37352618  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352617 caaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 37352518  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352517 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37352434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 5643805 - 5644169
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5643805 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 5643904  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5643905 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaa 5644003  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644004 cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5644103  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5644104 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcagg 5644169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180583
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180744 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13180650  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180649 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 13180583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522754
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatat 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatat 33522581  T
Q  219 acaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522582 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 33522681  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33522682 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 33522754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 37760987 - 37761354
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37760987 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcgg 37761086  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761087 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37761185  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37761186 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37761285  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37761286 gcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37761354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746112
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746284 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37746185  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37746184 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37746112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11330010
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttg-tttgaaactctatttttcttctactttcaaagct--atatacaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctaaatatacaat 11329842  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329843 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 11329942  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11329943 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 11330010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122207
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122372 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18122273  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18122272 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 18122207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437828
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31437668  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437669 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31437762  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437763 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 31437828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8659625 - 8659262
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8659625 cttgtgaattcaaagtttcg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggag 8659527  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659526 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 8659428  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659427 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 8659328  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8659327 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 8659262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486756
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccagg-aaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||               
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt----------- 26486573  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486574 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26486673  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26486674 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26486756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 390
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084629
Alignment:
Q  32 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  230 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  330 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcagg 43084629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298908
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactt 33298721  T
Q  207 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaa 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33298722 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaa 33298821  T
Q  304 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33298822 acaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 33298908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 41680710 - 41681076
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680710 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 41680809  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41680810 gtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41680909  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680910 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 41681009  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41681010 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcagg 41681076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953570
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcagg 28953570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Original strand, 25206266 - 25206653
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25206266 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25206365  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  25206366 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25206465  T
Q  208 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 299  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25206466 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25206565  T
Q  300 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 388  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206566 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25206653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Original strand, 25270422 - 25270809
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25270422 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25270521  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  25270522 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25270621  T
Q  208 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 299  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25270622 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25270721  T
Q  300 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 388  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270722 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25270809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22993272 - 22992914
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22993272 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22993173  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22993172 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 22993073  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993072 cattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22992979  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22992978 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 22992914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15652914 - 15652550
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15652914 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15652815  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15652814 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 15652715  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  15652714 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggta 15652615  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15652614 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15652550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 389
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898238
Alignment:
Q  32 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    |||||||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacat 23898085  T
Q  228 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 326  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          ||||||||||||||||||||||||||    
T  23898086 tttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtaca 23898175  T
Q  327 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23898176 ttcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcag 23898238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 33783492 - 33783853
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33783492 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33783591  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  33783592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 33783691  T
Q  224 acattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||||||    
T  33783692 acattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacag 33783784  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33783785 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 33783853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 390
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976214
Alignment:
Q  32 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 24976060  T
Q  231 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 328  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976061 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 24976152  T
Q  329 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24976153 caaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 24976214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 24608250 - 24608612
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24608250 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 24608349  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  24608350 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 24608449  T
Q  223 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  24608450 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 24608542  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24608543 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 24608612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 30940642 - 30941001
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30940642 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 30940741  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30940742 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 30940841  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  30940842 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30940933  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  30940934 gtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagg 30941001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661900
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 12661742  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661743 ttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 12661842  T
Q  333 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12661843 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 12661900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 37383673 - 37384039
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383673 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 37383772  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383773 gagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37383872  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383873 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37383972  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383973 acatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 37384039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Original strand, 39896088 - 39896430
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39896088 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccacc 39896187  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896188 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 39896287  T
Q  248 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896288 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 39896387  T
Q  348 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896388 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 39896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343867
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 9344033  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344032 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9343933  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9343932 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 9343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254532
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254697 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 254599  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254598 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 254532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945745
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945911 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37945812  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945811 acattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 37945745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 27809697 - 27810065
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809697 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27809796  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt--tcttctactttcaaagctatataca 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27809797 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  222 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27810065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045702
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 39045868  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045867 attttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39045768  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39045767 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 39045702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868044
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaaca 34867879  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867880 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34867979  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34867980 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 34868044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710481
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 12710665  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710664 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 12710565  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12710564 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 12710481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22922368 - 22922023
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922368 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 22922269  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922268 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 22922169  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22922168 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 22922069  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922068 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 22922023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 27122522 - 27122885
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27122522 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27122621  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122622 gtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 27122720  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27122721 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtac 27122820  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27122821 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 27122885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930424
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930591 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 13930492  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13930491 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcagg 13930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167840
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 16167673  T
Q  225 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167674 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16167773  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167774 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 16167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161208
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34161039  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161040 cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34161139  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34161140 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcagg 34161208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 12592806 - 12593176
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592806 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12592905  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592906 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 12593005  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12593006 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaaca 12593105  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593106 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12593176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19410709 - 19410364
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410709 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 19410610  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19410609 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgat 19410510  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19410509 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcat 19410410  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19410409 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 19410364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882648
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31882482  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31882483 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggta 31882582  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31882583 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31882648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 32055798 - 32056163
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32055798 tgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32055897  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055898 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 32055996  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055997 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 32056096  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32056097 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagg 32056163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931741
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt------cttctactttcaaagctatat 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  219 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37931569 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 37931668  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37931669 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 37931741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 3788490 - 3788855
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  3788490 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcgg 3788589  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788590 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 3788688  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788689 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 3788788  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3788789 acattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcagg 3788855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697044
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgta 21697228  T
Q  220 c--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 314  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697227 caaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 21697129  T
Q  315 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21697128 caacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccc 21697044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679771
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37679957  T
Q  208 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37679956 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37679857  T
Q  305 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37679856 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcagg 37679771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695036
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37695222  T
Q  208 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37695221 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37695122  T
Q  305 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37695121 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcagg 37695036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823217
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16823389  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16823388 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16823289  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16823288 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 16823217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898263
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16898091  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16898092 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16898191  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16898192 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 16898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629065
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttttattttc 11629248  T
Q  209 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11629247 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaaca 11629148  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11629147 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 11629065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671050
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 21671237  T
Q  208 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaa 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21671236 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaa 21671137  T
Q  304 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21671136 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcagg 21671050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239870
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  208 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 40239870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297508
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34297351  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297352 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 34297445  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34297446 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagc 34297508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782594
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 27782410  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782411 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 27782510  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27782511 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacagg 27782594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868666
Alignment:
Q  77 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgct 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  177 tttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaa 275  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31868879 tttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaa 31868781  T
Q  276 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31868780 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaata 31868681  T
Q  376 tgtgttacaagcagg 390  Q
    | |||||||||||||    
T  31868680 tatgttacaagcagg 31868666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396704
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 27396502  T
Q  209 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctatt 296  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||  ||    
T  27396503 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtccttt 27396602  T
Q  297 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 396  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396603 ttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 27396701  T
Q  397 ccc 399  Q
    |||    
T  27396702 ccc 27396704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450289
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 19450490  T
Q  209 aaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtctattt 297  Q
    |||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||| |||    
T  19450489 aaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttt 19450390  T
Q  298 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 397  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19450389 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttcc 19450291  T
Q  398 cc 399  Q
    ||    
T  19450290 cc 19450289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34269167 - 34268807
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34269167 tgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtgg 34269068  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  34269067 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 34268968  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  34268967 acattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34268875  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34268874 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcag 34268807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888636
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 28888474  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  28888475 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28888568  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28888569 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28888636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23122818 - 23122458
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23122818 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgg 23122719  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23122718 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 23122619  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122618 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 23122525  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23122524 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcagg 23122458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428324
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | |||    
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaa 27428493  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  27428492 acattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27428401  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  27428400 gtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccccc 27428324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 20843909 - 20844274
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20843909 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20844008  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--aca 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | |    
T  20844009 agtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaa 20844108  T
Q  222 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  20844109 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 20844203  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20844204 gggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 20844274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 225 - 390
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117158
Alignment:
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 23117158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31887738 - 31887682
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccacc 82  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31887738 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3069
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctact 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctact 3254  T
Q  206 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3253 ttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagc 3154  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3153 aaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 173 - 390
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18172
Alignment:
Q  173 tgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 269  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  270 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18151  T
Q  370 tcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18152 tcaatatatgttacaagcagg 18172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296957
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt-tcttctactt 206  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  207 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 32296957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4790932 - 4790566
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4790932 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 4790833  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790832 attcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 4790733  T
Q  225 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790732 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4790633  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790632 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 4790566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728306
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728140 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5728239  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728240 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 5728306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029781
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029615 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 47029714  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029715 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 47029781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717396
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717230 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5717329  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717330 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 5717396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764062
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764228 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5764129  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764128 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 5764062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22381879 - 22381514
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381879 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22381780  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381779 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 22381680  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22381679 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgt 22381580  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22381579 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 22381514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658901
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29659083 aaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 29658984  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 29658901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 10402110 - 10402475
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10402110 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 10402209  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10402210 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaa 10402308  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402309 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10402408  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10402409 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 10402475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 48471872 - 48472258
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471872 tcatcaaaagttcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 48471971  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471972 ctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 48472071  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472072 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaa 48472171  T
Q  304 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48472172 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 48472258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31958733 - 31958388
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958733 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 31958634  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958633 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 31958534  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31958533 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 31958434  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958433 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31958388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027616
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttc 28027434  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027435 aaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28027534  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28027535 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcagg 28027616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5590665 - 5590294
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5590665 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 5590566  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||    
T  5590565 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgta 5590466  T
Q  220 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590465 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 5590366  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5590365 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcagg 5590294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423245
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 4423078  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423079 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4423178  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4423179 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4423245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5603591 - 5603246
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603591 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 5603492  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603491 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 5603392  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5603391 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcat 5603292  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5603291 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649398
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 10649231  T
Q  225 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649232 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10649331  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649332 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 10649398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422519
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16422326  T
Q  209 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16422327 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagc 16422425  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422426 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 16422519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864784
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaa 22864947  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864946 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22864847  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22864846 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 22864784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879843
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaa 22880006  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880005 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22879906  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22879905 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 22879843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Original strand, 24334157 - 24334502
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334157 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 24334256  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24334257 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgat 24334356  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24334357 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 24334456  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334457 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 24334502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020039
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatc 5019873  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019874 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5019973  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5019974 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5020039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970799
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatt 17970965  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970964 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 17970865  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17970864 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcagg 17970799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340609
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 4340782  T
Q  219 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340781 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 4340682  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4340681 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4340609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249065
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18248883 aaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 18248982  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18248983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 18249065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109884
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 28110072  T
Q  207 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110071 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 28109972  T
Q  303 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109971 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 28109884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536670
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 6536843  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536842 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 6536743  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6536742 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttc 6536670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978883
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 17979056  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979055 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaa 17978956  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17978955 cagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 17978883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072362
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 20072192  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072193 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 20072292  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20072293 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 20072362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079554
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatatac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  221 aaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 7079482  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7079483 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 7079554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 8217593 - 8217961
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8217593 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtgg 8217692  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8217693 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaa 8217791  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217792 aatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8217891  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8217892 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 8217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618413
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16618609  T
Q  209 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaa 302  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |||||| ||    
T  16618608 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aa 16618510  T
Q  303 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16618509 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcccc 16618413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11104660 - 11104294
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104660 gcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11104561  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaa 223  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||     
T  11104560 gccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaat 11104461  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104460 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 11104361  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11104360 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 11104294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Original strand, 28345155 - 28345497
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345155 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 28345254  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28345255 actcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataat 28345353  T
Q  248 gacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345354 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 28345453  T
Q  347 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345454 gcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 28345497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286288
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18286447  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18286446 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18286347  T
Q  331 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286346 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 18286288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301589
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18301748  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18301747 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18301648  T
Q  331 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301647 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 18301589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473314
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5473147  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473148 acattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5473246  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5473247 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5473314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788349
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 51788182  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788183 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 51788282  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51788283 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 51788349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142687
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctacttt 29142873  T
Q  208 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaag 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  29142872 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaa 29142773  T
Q  305 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29142772 caaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 29142687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630111
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 4629928  T
Q  208 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629929 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4630028  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  4630029 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 4630111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681027
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  208 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 21681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231520
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 18231354  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18231355 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggta 18231454  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18231455 cagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 18231520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 18336591 - 18336949
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18336591 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18336690  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336691 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18336790  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336791 attttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18336885  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18336886 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 18336949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31030536 - 31030178
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31030536 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31030437  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030436 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31030337  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030336 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31030242  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  31030241 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcagg 31030178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 18057222 - 18057599
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18057222 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18057321  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  18057322 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 18057421  T
Q  225 -cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18057422 acattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 18057521  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057522 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 18057599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570779
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 20570963  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570962 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 20570863  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20570862 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacagg 20570779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 399
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727963
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttct 4727801  T
Q  233 ttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 330  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727802 ttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 4727895  T
Q  331 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727896 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 4727963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 19700431 - 19700834
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700431 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 19700530  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  19700531 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 19700630  T
Q  209 aaagctatatac-----------aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta 294  Q
    |||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  19700631 aaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta 19700730  T
Q  295 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  19700731 ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattct 19700829  T
Q  395 tcccc 399  Q
    |||||    
T  19700830 tcccc 19700834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 390
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445472
Alignment:
Q  32 gaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttc 32445321  T
Q  232 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 331  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445322 tttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 32445414  T
Q  332 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32445415 atg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 32445472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 399
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208232
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 6208068  T
Q  231 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 328  Q
    | ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208069 ccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 6208162  T
Q  329 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208163 caaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 6208232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735033
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaa 15735195  T
Q  225 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735194 catttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15735100  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15735099 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15735033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887087
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacatttt 35886932  T
Q  231 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 328  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35886933 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacatt 35887026  T
Q  329 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| | ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35887027 caaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 35887087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283391
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  225 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctga 313  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  8283567 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctga 8283468  T
Q  314 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8283467 gcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 8283391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 389
Target Start/End: Original strand, 4689613 - 4689971
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4689613 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 4689712  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||    
T  4689713 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaa 4689811  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  4689812 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 4689904  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 389  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  4689905 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcag 4689971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 5658095 - 5658458
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5658095 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5658194  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |    
T  5658195 agtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaa 5658294  T
Q  222 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| |||||||    
T  5658295 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaaca 5658388  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  5658389 gggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcagg 5658458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886674
Alignment:
Q  164 ttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaa 260  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  261 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 360  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttg 15886704  T
Q  361 atgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15886703 gtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15886674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15887006 - 15886894
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgt 122  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15887006 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgt 15886907  T
Q  123 ggagtcacgcctt 135  Q
    |||||||||||||    
T  15886906 ggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561018
Alignment:
Q  92 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcttgtgc 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcctgtgc 27561018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9532
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9897 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9798  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797 agtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9698  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9598  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9597 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcagg 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 18796704 - 18797071
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18796704 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtg 18796803  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796804 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 18796903  T
Q  224 a-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796904 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18797003  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797004 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 18797071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 33248365 - 33248729
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248365 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33248464  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248465 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 33248564  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248565 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33248664  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33248665 attcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcagg 33248729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28356176 - 28355802
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 118  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356176 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 28356077  T
Q  119 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctctatttttcttctactttcaaagcta 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||    
T  28356076 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagcta 28355977  T
Q  216 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355976 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 28355877  T
Q  316 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355876 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 28355802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9360985
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 9360818  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360819 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9360918  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9360919 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 9360985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680811
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 19680628  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19680629 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19680728  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19680729 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 19680811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086575
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12086758 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 12086659  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086658 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 12086575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 390
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835686
Alignment:
Q  21 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 120  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  121 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatata 29835515  T
Q  220 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835516 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 29835615  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29835616 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagg 29835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360892
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 31360725  T
Q  225 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360726 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31360825  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360826 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 31360892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 15773573 - 15773938
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15773573 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15773672  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  15773673 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaac 15773772  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773773 attttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15773872  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15773873 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15773938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 44566979 - 44567347
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttcc-aggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44566979 gcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 44567078  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567079 agtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 44567177  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567178 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 44567277  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44567278 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 44567347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31484067 - 31483722
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484067 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 31483968  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483967 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 31483868  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31483867 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcat 31483768  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31483767 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcagg 31483722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342022
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 21342182  T
Q  232 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342181 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 21342082  T
Q  331 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342081 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 21342022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715843
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18715676  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715677 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18715776  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18715777 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagc 18715843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 375
Target Start/End: Original strand, 33264729 - 33265079
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33264729 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33264828  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33264829 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaa 33264927  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264928 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 33265027  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33265028 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19911014
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacatttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacatttt 19911175  T
Q  231 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911174 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 19911075  T
Q  330 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911074 aaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 19911014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202227
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaat-ttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||               
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt----------- 19202410  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19202409 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19202310  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19202309 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcagg 19202227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074773
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22074965  T
Q  209 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22074964 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagc 22074866  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 398  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074865 aagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 22074773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19655562 - 19655190
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 122  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19655562 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 19655463  T
Q  123 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  19655462 ggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaa 19655363  T
Q  222 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| |||||||||||||||||||    
T  19655362 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaaca 19655270  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19655269 gggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttcccc 19655190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602766
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27602942  T
Q  209 aaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        |||||||||||    
T  27602941 aaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagc 27602850  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602849 aaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 22138904 - 22139264
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22138904 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 22139003  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  22139004 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 22139103  T
Q  223 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22139104 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacag 22139194  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22139195 ggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 22139264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2131479 - 2131120
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2131479 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2131380  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2131379 gtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 2131280  T
Q  225 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131279 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 2131187  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2131186 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 2131120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16260403  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260404 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 388
Target Start/End: Original strand, 19694094 - 19694453
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19694094 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19694193  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  19694194 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 19694293  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  19694294 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 19694387  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 388  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19694388 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagca 19694453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 390
Target Start/End: Original strand, 14569180 - 14569518
Alignment:
Q  51 aatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact 150  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569180 aatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact 14569279  T
Q  151 cttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgat 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  14569280 cttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaat 14569379  T
Q  245 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 343  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14569380 aatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 14569471  T
Q  344 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14569472 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcagg 14569518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12399
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaa 12232  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12233 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 12332  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 12399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164745
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttc 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttc 5164586  T
Q  232 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5164587 tttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaa 5164686  T
Q  332 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164687 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 5164745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 5154079 - 5154444
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5154079 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5154178  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  5154179 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 5154278  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154279 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5154378  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154379 catccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 5154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24586682 - 24586311
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 118  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586682 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 24586583  T
Q  119 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586582 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatat 24586483  T
Q  219 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586482 acaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24586383  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586382 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 24586311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 26518789 - 26519152
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518789 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26518888  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26518889 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatc 26518987  T
Q  226 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518988 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 26519087  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26519088 attcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26519152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4139366 - 4139021
Alignment:
Q  48 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139366 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 4139267  T
Q  148 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139266 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 4139167  T
Q  245 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139166 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 4139067  T
Q  345 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4139066 gagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 4139021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447249
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 11447065  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447066 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 11447165  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11447166 aacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 11447249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205750
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 4205566  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4205567 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 4205666  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205667 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 4205750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084398
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctacttt 31084582  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31084581 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagca 31084482  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31084481 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31084398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418555
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttcc 11418714  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418713 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 11418614  T
Q  332 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418613 atgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 11418555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663688
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663854 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26663755  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663754 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 26663688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678880
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679046 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26678947  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678946 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 26678880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268861
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 26269048  T
Q  209 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 303  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269047 aaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 26268948  T
Q  304 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26268947 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26268861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 45393216 - 45393580
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393216 cttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 45393315  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45393316 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatca 45393415  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393416 ttttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 45393515  T
Q  326 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  45393516 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcagg 45393580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313625
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 26313808  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313807 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26313708  T
Q  308 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26313707 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26313625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558170
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 31558337  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558336 cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31558237  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31558236 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31558170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441615
Alignment:
Q  15 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  115 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaag 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  213 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  313 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 26441615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141110
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 5141295  T
Q  208 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagc 305  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5141294 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagc 5141195  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5141194 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5141110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26509839 - 26509471
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26509839 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 26509740  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509739 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaa 26509640  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509639 aacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26509540  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509539 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737664
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 45737494  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737495 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 45737594  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45737595 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcagg 45737664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745298
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16745481  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745480 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 16745381  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 388  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745380 aaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 16745298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047682
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtc 16047493  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16047494 aaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaag 16047591  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16047592 cctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccc 16047682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451680
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 3451495  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451496 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 3451595  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3451596 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcagg 3451680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206915
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 39207082  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207081 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39206982  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39206981 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 39206915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 2160566 - 2160942
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2160566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2160665  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||    
T  2160666 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 2160765  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2160766 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacaggg 2160865  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160866 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 2160942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779607
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 2779446  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779447 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 2779541  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779542 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 2779607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130260
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31130099  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130100 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31130194  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31130195 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 31130260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16444148 - 16443770
Alignment:
Q  23 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16444148 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 16444049  T
Q  123 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  16444048 ggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 16443949  T
Q  221 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16443948 aaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 16443850  T
Q  320 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443849 gggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 16443770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847955
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttc 10847761  T
Q  209 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaa 302  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||    
T  10847762 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aa 10847860  T
Q  303 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10847861 agtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcccc 10847955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 112 - 390
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596031
Alignment:
Q  112 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttca 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  210 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 26596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16512576 - 16512216
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16512576 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 16512477  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16512476 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 16512377  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  16512376 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 16512285  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16512284 gtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 16512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10911061 - 10910702
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10911061 gcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 10910962  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  10910961 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 10910862  T
Q  225 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10910861 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatgg 10910769  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10910768 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 10910702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 175
Target Start/End: Original strand, 29027282 - 29027366
Alignment:
Q  92 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact-cttatacatcaatttgagcttgtgc 175  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||    
T  29027282 aattaccattttccaaacttttaaaatccgtggaaccacgcctttggcagaccaccactccatttacattaacttgagcttgtgc 29027366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857010
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttc 39856828  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856829 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 39856928  T
Q  309 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856929 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 39857010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104917
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaaca 14104753  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104754 ttttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 14104853  T
Q  327 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104854 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 14104917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332312
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332478 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 20332379  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332378 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 20332312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099526
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099692 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40099593  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099592 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 40099526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760137
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatca 30759973  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30759974 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 30760073  T
Q  327 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760074 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 30760137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667693
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatca 33667857  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33667856 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 33667757  T
Q  327 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667756 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 33667693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27157569 - 27157202
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157569 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 27157470  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27157370  T
Q  224 ac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157369 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27157270  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157269 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27157202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 54839400 - 54839765
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54839400 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 54839499  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54839500 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 54839598  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54839599 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 54839698  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54839699 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 54839765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182854
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 34183019  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183018 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34182920  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34182919 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 34182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700915
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 5700747  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5700748 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 5700847  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5700848 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5700915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24586617 - 24586251
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586617 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 24586518  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586517 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 24586418  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586417 acattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggt 24586318  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24586317 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 24586251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753384
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 14753551  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14753550 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacaggg 14753451  T
Q  323 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753450 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 14753384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012253
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5012070 caaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagca 5012169  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5012170 aacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 5012253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794507
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 18794691  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794690 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 18794591  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18794590 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 18794507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976079
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 21975907  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21975908 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 21976007  T
Q  319 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21976008 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 21976079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338419
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 36338575  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338574 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 36338481  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36338480 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagc 36338419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119037
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaa 24118871  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24118872 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggt 24118971  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24118972 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcagg 24119037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906641
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttc 1906444  T
Q  209 aaagctatataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 301  Q
    ||||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  1906445 aaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-a 1906543  T
Q  302 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1906544 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccc 1906641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120400
Alignment:
Q  20 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 119  Q
    |||||| |||||| |||| || || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  120 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 31120573  T
Q  220 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaa 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31120572 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaa 31120473  T
Q  318 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31120472 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 31120400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576229
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttct 6576078  T
Q  233 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576079 ttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 6576172  T
Q  333 tgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6576173 tg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 6576229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276510
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 15276705  T
Q  209 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaa 303  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |||    
T  15276704 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaa 15276606  T
Q  304 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15276605 gtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttcccc 15276510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380119
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15380311  T
Q  209 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15380310 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagca 15380212  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380211 agcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 15380119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234204
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15234008  T
Q  209 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaa 302  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| ||    
T  15234009 aaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aa 15234107  T
Q  303 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15234108 agcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcccc 15234204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 33 - 398
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674244
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 132  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  133 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacatttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| |||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatatttt 1674076  T
Q  231 ctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1674077 ctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacat 1674175  T
Q  328 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  1674176 tcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccc 1674244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324210
Alignment:
Q  106 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  206 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagc 36324291  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36324290 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagc 36324210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 14671026 - 14671388
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14671026 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14671125  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-a 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| |    
T  14671126 agttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaga 14671225  T
Q  224 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  14671226 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 14671319  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14671320 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 14671388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 17019062 - 17019423
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17019062 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 17019161  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||    
T  17019162 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaa 17019261  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  17019262 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17019355  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17019356 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 17019423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2021
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctacttt 1837  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1838 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagca 1937  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1938 aacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 2021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 396
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12427
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctacttt 12227  T
Q  208 caaagctat-----------atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctat 295  Q
    |||||||||           | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  12228 caaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctat 12327  T
Q  296 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328 tttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 3647147 - 3647512
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3647147 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 3647246  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647247 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 3647346  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647347 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 3647446  T
Q  325 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3647447 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcagg 3647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591448
Alignment:
Q  27 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  127 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 28591284  T
Q  227 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591285 ttctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 28591384  T
Q  327 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28591385 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28591448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41787566 - 41787199
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 41787467  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41787466 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 41787368  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787367 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 41787268  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41787267 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 41787199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334296
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 20334490  T
Q  209 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaag 304  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20334489 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaag 20334391  T
Q  305 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334390 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 20334296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 10968666 - 10969032
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 125  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968666 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10968765  T
Q  126 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10968766 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 10968865  T
Q  224 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968866 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10968965  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10968966 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacagg 10969032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156094
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28155924  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155925 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28156024  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28156025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 28156094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644588
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  207 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644404 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagc 51644503  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51644504 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951458
Alignment:
Q  34 attcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  134 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 10951299  T
Q  232 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10951300 tttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaa 10951399  T
Q  332 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951400 acgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 10951458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201911
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 16202108  T
Q  209 aaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctatttt 298  Q
    ||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||    
T  16202107 aaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctatttt 16202008  T
Q  299 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16202007 g-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttc 16201911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467160
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttc 20466960  T
Q  209 aaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtctatttt 298  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||||||||    
T  20466961 aaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctatttt 20467060  T
Q  299 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 398  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467061 g-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 20467159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891652
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||  ||    
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttttatgtt 21891821  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 305  Q
    ||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | |||||||||||    
T  21891820 ca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagc 21891736  T
Q  306 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21891735 aaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 21891652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4484
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 122  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4862 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 4763  T
Q  123 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4762 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 4663  T
Q  222 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4662 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacag 4563  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4562 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 4484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18951
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18584 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 18683  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 18782  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18882  T
Q  322 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18883 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 18951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8819
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 8986  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8985 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 8886  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8885 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 8819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14314
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  108 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14131 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 14230  T
Q  307 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14231 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 14314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10277
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9912 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatga 10011  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10012 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaa 10110  T
Q  225 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 cattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10210  T
Q  324 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10211 acattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33658
Alignment:
Q  25 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  124 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33494  T
Q  223 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33495 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacag 33589  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33590 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 33658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15940
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 15749  T
Q  208 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg- 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15750 caaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 15849  T
Q  300 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15850 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 15940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 399
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25496
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 25296  T
Q  209 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctatttt 298  Q
    |||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||    
T  25297 aaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgtttt 25396  T
Q  299 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 398  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25397 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 25495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6427
Alignment:
Q  26 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6065 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6164  T
Q  125 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--acaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||    
T  6165 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaa 6264  T
Q  223 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 320  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  6265 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6357  T
Q  321 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6358 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagg 6427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24796
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  132 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 24951  T
Q  231 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 328  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24950 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacatt 24857  T
Q  329 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 390  Q
    |||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24856 caaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcagg 24796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 398
Target Start/End: Original strand, 1 - 159
Alignment:
Q  240 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  339 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 398  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccc 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26245
Alignment:
Q  9 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  109 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 169  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagc 26245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  33 aattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 126  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  127 tcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40519
Alignment:
Q  305 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcagg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcagg 40519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University