View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20378_high_1_N (Length: 431)

Name: NF20378_high_1_N
Description: NF20378
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20378_high_1_N
NF20378_high_1_N
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (14-423)||(27623520-27623927)
chr6 (13-423)||(8899512-8899918)
chr6 (24-423)||(27355924-27356319)
chr6 (24-423)||(34458321-34458714)
chr6 (13-423)||(27284175-27284581)
chr6 (24-423)||(33370244-33370639)
chr6 (30-423)||(13518007-13518396)
chr6 (29-423)||(27491128-27491518)
chr6 (24-423)||(4539571-4539967)
chr6 (24-423)||(26110224-26110618)
chr6 (31-423)||(4763760-4764148)
chr6 (24-423)||(28213444-28213840)
chr6 (24-423)||(26772442-26772836)
chr6 (31-423)||(16755817-16756206)
chr6 (31-423)||(27063479-27063866)
chr6 (13-423)||(22928694-22929102)
chr6 (31-423)||(28166491-28166880)
chr6 (13-423)||(29555537-29555943)
chr6 (24-399)||(27200176-27200548)
chr6 (24-399)||(27248685-27249057)
chr6 (31-423)||(29507413-29507803)
chr6 (31-423)||(26791813-26792201)
chr6 (24-423)||(30551813-30552208)
chr6 (30-423)||(16680135-16680525)
chr6 (37-423)||(29579018-29579399)
chr6 (24-423)||(4531278-4531673)
chr6 (14-423)||(16937838-16938243)
chr6 (31-423)||(4778877-4779266)
chr6 (37-423)||(13292764-13293140)
chr6 (31-423)||(14139213-14139595)
chr6 (31-423)||(27013730-27014111)
chr6 (31-423)||(26926765-26927137)
chr6 (31-423)||(27031020-27031405)
chr6 (115-423)||(26666471-26666774)
chr6 (31-423)||(27208901-27209285)
chr6 (31-423)||(27239943-27240327)
chr6 (31-423)||(24869707-24870089)
chr6 (31-423)||(27025142-27025526)
chr6 (31-423)||(24299573-24299956)
chr6 (31-423)||(15406346-15406730)
chr6 (31-423)||(15418133-15418517)
chr6 (74-412)||(20174589-20174933)
chr6 (74-412)||(22161058-22161402)
chr6 (13-110)||(23851450-23851547)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (13-423)||(39856630-39857034)
chr4 (24-423)||(18794483-18794878)
chr4 (31-423)||(20332288-20332677)
chr4 (31-423)||(40099502-40099891)
chr4 (31-423)||(27157178-27157568)
chr4 (31-423)||(24586227-24586616)
chr4 (30-423)||(14104553-14104941)
chr4 (30-423)||(30759774-30760161)
chr4 (30-423)||(33667669-33668056)
chr4 (31-423)||(54839402-54839789)
chr4 (31-423)||(14753360-14753747)
chr4 (31-423)||(5700551-5700939)
chr4 (13-423)||(5011870-5012277)
chr4 (31-423)||(34182830-34183216)
chr4 (24-423)||(21975708-21976103)
chr4 (31-423)||(1906263-1906656)
chr4 (24-423)||(31120376-31120772)
chr4 (31-423)||(15233827-15234219)
chr4 (31-423)||(24118674-24119061)
chr4 (31-423)||(36338392-36338772)
chr4 (37-423)||(6575879-6576253)
chr4 (13-422)||(15380105-15380510)
chr4 (37-423)||(1673877-1674260)
chr4 (13-423)||(15276495-15276904)
chr4 (31-423)||(17019063-17019447)
chr4 (31-423)||(14671027-14671412)
chr4 (110-423)||(36324183-36324484)
chr4 (24-83)||(18311379-18311439)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (13-423)||(5141086-5141493)
chr7 (16-423)||(26441235-26441639)
chr7 (13-423)||(4138997-4139405)
chr7 (31-423)||(26678856-26679245)
chr7 (13-423)||(16745272-16745679)
chr7 (31-423)||(26663664-26664053)
chr7 (13-423)||(3451297-3451704)
chr7 (13-423)||(24586287-24586693)
chr7 (16-423)||(16443755-16444159)
chr7 (31-423)||(39206891-39207279)
chr7 (24-423)||(26268837-26269236)
chr7 (24-423)||(11446878-11447273)
chr7 (13-423)||(4205368-4205774)
chr7 (31-423)||(5154081-5154468)
chr7 (37-423)||(5164387-5164769)
chr7 (31-423)||(26518790-26519176)
chr7 (13-423)||(26313601-26314006)
chr7 (31-423)||(31558146-31558534)
chr7 (27-423)||(45393212-45393604)
chr7 (37-423)||(11418531-11418913)
chr7 (31-399)||(26509471-26509837)
chr7 (31-423)||(45737298-45737688)
chr7 (13-423)||(31084374-31084781)
chr7 (31-423)||(2160567-2160957)
chr7 (13-423)||(16047294-16047697)
chr7 (116-423)||(26595750-26596055)
chr7 (31-423)||(2779249-2779631)
chr7 (31-423)||(31129902-31130284)
chr7 (13-423)||(10847562-10847970)
chr7 (31-421)||(16512194-16512574)
chr7 (31-423)||(10910678-10911060)
chr7 (31-115)||(26531926-26532010)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (13-423)||(4629730-4630135)
chr3 (13-423)||(21680646-21681051)
chr3 (24-423)||(29658877-29659272)
chr3 (13-423)||(29142663-29143072)
chr3 (13-423)||(32296574-32296981)
chr3 (31-423)||(5727941-5728330)
chr3 (31-423)||(47029416-47029805)
chr3 (31-423)||(5717031-5717420)
chr3 (31-423)||(5764038-5764427)
chr3 (24-423)||(4340585-4340980)
chr3 (24-423)||(18248694-18249089)
chr3 (31-423)||(10649034-10649422)
chr3 (24-423)||(20570755-20571150)
chr3 (13-423)||(28109860-28110271)
chr3 (13-423)||(31958364-31958772)
chr3 (24-423)||(28027247-28027640)
chr3 (13-423)||(5603222-5603630)
chr3 (13-423)||(24334118-24334526)
chr3 (31-423)||(5472951-5473338)
chr3 (31-423)||(8217595-8217985)
chr3 (13-423)||(5590270-5590676)
chr3 (31-423)||(51787985-51788373)
chr3 (13-423)||(16422128-16422534)
chr3 (31-423)||(4422881-4423269)
chr3 (13-423)||(28345116-28345521)
chr3 (31-423)||(4790542-4790931)
chr3 (24-423)||(17978859-17979255)
chr3 (31-423)||(22381490-22381877)
chr3 (31-423)||(17970775-17971161)
chr3 (31-423)||(10402112-10402499)
chr3 (13-422)||(16618399-16618808)
chr3 (37-423)||(18286264-18286645)
chr3 (37-423)||(18301565-18301946)
chr3 (31-423)||(20071996-20072386)
chr3 (31-423)||(5019676-5020063)
chr3 (31-423)||(18231156-18231544)
chr3 (31-423)||(22864757-22865143)
chr3 (31-423)||(22879816-22880202)
chr3 (31-423)||(6536652-6537040)
chr3 (39-423)||(11104270-11104651)
chr3 (31-423)||(7079185-7079578)
chr3 (31-423)||(48471890-48472282)
chr3 (31-423)||(18057223-18057614)
chr3 (31-423)||(31030154-31030535)
chr3 (37-423)||(6207869-6208247)
chr3 (29-423)||(18336589-18336973)
chr3 (36-423)||(19700454-19700849)
chr3 (37-423)||(4727602-4727978)
chr3 (36-423)||(32445122-32445496)
chr3 (31-423)||(15735009-15735392)
chr3 (37-423)||(35886733-35887111)
chr3 (31-423)||(4689614-4689996)
chr3 (31-423)||(8283367-8283766)
chr3 (31-423)||(5658097-5658482)
chr3 (211-423)||(15886650-15886857)
chr3 (31-139)||(15886894-15887004)
chr3 (31-115)||(8002523-8002607)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (13-423)||(40239489-40239894)
chr2 (31-423)||(27809699-27810089)
chr2 (31-423)||(254508-254896)
chr2 (24-423)||(27782223-27782618)
chr2 (31-423)||(37945721-37946110)
chr2 (13-423)||(12710457-12710863)
chr2 (31-423)||(16167476-16167864)
chr2 (13-423)||(22921999-22922407)
chr2 (31-423)||(12592808-12593200)
chr2 (37-423)||(12661543-12661924)
chr2 (31-423)||(13930400-13930790)
chr2 (31-423)||(3788492-3788879)
chr2 (13-423)||(39896048-39896454)
chr2 (13-423)||(19410340-19410748)
chr2 (31-423)||(37931370-37931765)
chr2 (31-423)||(27122523-27122909)
chr2 (30-423)||(34867680-34868068)
chr2 (31-423)||(37383675-37384063)
chr2 (31-423)||(9343843-9344231)
chr2 (13-423)||(11629041-11629446)
chr2 (13-423)||(37679747-37680155)
chr2 (13-423)||(37695012-37695420)
chr2 (13-423)||(21697029-21697438)
chr2 (31-423)||(39045678-39046066)
chr2 (31-423)||(34160842-34161232)
chr2 (24-423)||(16823193-16823588)
chr2 (24-423)||(16897892-16898287)
chr2 (13-423)||(21671026-21671435)
chr2 (31-423)||(31882285-31882672)
chr2 (31-423)||(32055800-32056187)
chr2 (81-423)||(31868642-31868979)
chr2 (31-423)||(34297154-34297535)
chr2 (13-422)||(27396303-27396718)
chr2 (13-423)||(19450274-19450689)
chr2 (31-423)||(28888277-28888660)
chr2 (31-423)||(34268782-34269165)
chr2 (31-423)||(27428309-27428690)
chr2 (31-423)||(23122434-23122817)
chr2 (31-423)||(20843910-20844298)
chr2 (234-423)||(23116993-23117182)
chr2 (31-86)||(31887682-31887737)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (13-423)||(28355778-28356187)
chr8 (31-423)||(9360622-9361009)
chr8 (31-423)||(31360528-31360916)
chr8 (32-423)||(31483698-31484087)
chr8 (24-423)||(12086551-12086947)
chr8 (31-423)||(33248366-33248753)
chr8 (13-423)||(19680430-19680835)
chr8 (13-423)||(29835305-29835710)
chr8 (31-423)||(18796706-18797095)
chr8 (31-423)||(15773574-15773962)
chr8 (37-423)||(21341998-21342381)
chr8 (31-423)||(44566980-44567371)
chr8 (13-423)||(19202203-19202598)
chr8 (37-423)||(19910990-19911374)
chr8 (31-423)||(18715480-18715870)
chr8 (13-423)||(27602742-27603141)
chr8 (31-384)||(33264731-33265079)
chr8 (36-422)||(22074758-22075141)
chr8 (24-293)||(16260216-16260480)
chr8 (31-423)||(19655175-19655560)
chr8 (31-423)||(2131096-2131478)
chr8 (31-423)||(19694095-19694479)
chr8 (31-423)||(22138906-22139288)
chr8 (69-423)||(14569194-14569542)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (13-423)||(33298522-33298932)
chr5 (31-423)||(30174472-30174861)
chr5 (25-423)||(3795539-3795934)
chr5 (30-423)||(33881132-33881521)
chr5 (30-423)||(18369298-18369687)
chr5 (13-423)||(28953546-28953952)
chr5 (37-423)||(11555367-11555748)
chr5 (27-423)||(30158037-30158429)
chr5 (24-423)||(32590042-32590436)
chr5 (13-423)||(22894405-22894810)
chr5 (24-423)||(31820176-31820569)
chr5 (31-423)||(37760989-37761378)
chr5 (31-423)||(41680711-41681100)
chr5 (13-423)||(6880292-6880699)
chr5 (24-423)||(37352410-37352805)
chr5 (13-423)||(9323466-9323871)
chr5 (24-423)||(2517065-2517461)
chr5 (13-423)||(12138165-12138570)
chr5 (27-423)||(8659238-8659629)
chr5 (31-423)||(13318594-13318981)
chr5 (36-423)||(43084270-43084653)
chr5 (36-423)||(18494534-18494916)
chr5 (31-423)||(37746088-37746482)
chr5 (31-423)||(28655249-28655638)
chr5 (31-423)||(40467319-40467707)
chr5 (31-423)||(9544473-9544862)
chr5 (13-423)||(26486385-26486780)
chr5 (30-423)||(11329643-11330034)
chr5 (30-423)||(24729976-24730365)
chr5 (31-423)||(15752624-15753006)
chr5 (37-423)||(23631982-23632366)
chr5 (24-423)||(33522382-33522778)
chr5 (31-423)||(13180559-13180943)
chr5 (31-423)||(30035433-30035820)
chr5 (31-423)||(5643807-5644193)
chr5 (31-423)||(13436440-13436834)
chr5 (31-423)||(18122182-18122570)
chr5 (31-423)||(34622525-34622914)
chr5 (31-423)||(37665252-37665640)
chr5 (31-423)||(31437471-31437852)
chr5 (31-423)||(15652526-15652912)
chr5 (36-397)||(25206289-25206653)
chr5 (36-397)||(25270445-25270809)
chr5 (31-423)||(22992890-22993270)
chr5 (36-423)||(23897886-23898263)
chr5 (31-423)||(33783494-33783877)
chr5 (36-423)||(24975861-24976238)
chr5 (31-423)||(24608252-24608636)
chr5 (31-423)||(30940643-30941025)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (31-423)||(12036-12423)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (31-423)||(3647148-3647536)
chr1 (31-423)||(10968667-10969056)
chr1 (24-423)||(51644215-51644612)
chr1 (38-423)||(10951100-10951482)
chr1 (30-423)||(28591084-28591472)
chr1 (13-423)||(20334281-20334689)
chr1 (31-423)||(28155728-28156118)
chr1 (31-423)||(41787175-41787565)
chr1 (37-423)||(20466785-20467175)
chr1 (13-423)||(16201893-16202307)
chr1 (13-423)||(21891628-21892020)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (13-423)||(3045-3453)
scaffold0159 (207-423)||(17980-18196)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (24-423)||(15562-15964)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (31-423)||(9508-9895)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (24-423)||(13942-14338)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (31-423)||(8795-9182)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (31-423)||(4469-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (31-423)||(9914-10301)
scaffold0143 (31-423)||(33297-33682)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (31-423)||(18585-18975)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (13-423)||(1639-2045)
scaffold0322 (13-423)||(12028-12445)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (13-422)||(25097-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (31-423)||(6066-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (37-423)||(24772-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (24-191)||(370-537)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (249-423)||(1-175)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (13-175)||(26243-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (314-423)||(40495-40606)
scaffold0099 (37-169)||(40759-40898)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623520
Alignment:
Q  14 catctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 113  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  114 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctac 27623731  T
Q  214 tttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623730 tttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27623631  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27623630 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 27623531  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  27623530 tagtctgtggt 27623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899512
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 8899724  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899723 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 8899624  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |    
T  8899623 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccagg 8899524  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  8899523 atagtctgtggt 8899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27356319 - 27355924
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356319 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27356220  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||    
T  27356219 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagct 27356125  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27356124 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 27356025  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  27356024 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 27355925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34458714 - 34458321
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458714 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 34458615  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||| |||||    
T  34458614 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttctaagct 34458520  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34458519 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgag 34458421  T
Q  324 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  34458420 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284175
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttcta 27284386  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284385 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 27284286  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27284285 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccagga 27284186  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  27284185 tagtctgtggt 27284175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33370639 - 33370244
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370639 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33370540  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  33370539 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 33370445  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33370444 atatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctga 33370345  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  33370344 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccaggatagtctgtgg 33370245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13518396 - 13518007
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518396 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13518297  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  13518296 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 13518201  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518200 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 13518101  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  13518100 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 13518007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Original strand, 27491128 - 27491518
Alignment:
Q  29 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491128 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27491227  T
Q  129 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||    
T  27491228 agtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtata 27491322  T
Q  229 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491323 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27491422  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||    
T  27491423 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 27491518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4539967 - 4539571
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4539967 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 4539868  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||        | || ||||||||||||    
T  4539867 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt---ctttttactttcaaagc 4539772  T
Q  223 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4539771 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctga 4539672  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  4539671 gcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtgg 4539572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26110618 - 26110224
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110618 ttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26110519  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  26110518 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagct 26110424  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26110423 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgag 26110324  T
Q  324 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  26110323 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 26110224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 4763760 - 4764148
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763760 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4763859  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4763860 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4763954  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763955 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4764054  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  4764055 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4764148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 28213444 - 28213840
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28213444 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 28213543  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         ||||||||||||||||    
T  28213544 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagc 28213638  T
Q  223 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  28213639 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 28213738  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  28213739 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26772836 - 26772442
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772836 ttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 26772737  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||    
T  26772736 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagct 26772643  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26772642 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctga 26772543  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  26772542 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 26772443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 16755817 - 16756206
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16755916  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16755917 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 16756011  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat--tttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756012 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16756111  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  16756112 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27063479 - 27063866
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063479 cttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27063578  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27063579 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27063672  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063673 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27063772  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27063773 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27063866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928694
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22928908  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 309  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  22928907 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttg 22928808  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928807 aaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 22928708  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||||||||||    
T  22928707 ggatagtctgtggt 22928694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 28166491 - 28166880
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166491 cttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28166590  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28166591 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 28166685  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166686 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28166785  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28166786 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28166880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555943
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttcttttta 29555731  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29555732 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaa 29555831  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||| |    
T  29555832 agcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccctccagg 29555931  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  29555932 atagtctgtggt 29555943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Original strand, 27200176 - 27200548
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27200176 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27200275  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||    
T  27200276 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagc 27200369  T
Q  223 tatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 320  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200370 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27200469  T
Q  321 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27200470 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27249057 - 27248685
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27249057 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27248958  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||    
T  27248957 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagc 27248864  T
Q  223 tatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 320  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248863 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27248764  T
Q  321 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27248763 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcagg 27248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 29507413 - 29507803
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507413 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 29507512  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||           || ||||||||||||||||||||    
T  29507513 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttcttt--ttttactttcaaagctatataca 29507609  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507610 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29507709  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  29507710 ggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 26791813 - 26792201
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26791813 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaa 26791912  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26791913 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26792007  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792008 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26792107  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  26792108 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 26792201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551813
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 30552014  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30552013 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 30551914  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  30551913 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 30551814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 16680135 - 16680525
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680135 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtgga 16680234  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |||||||    
T  16680235 gtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagttatatac 16680330  T
Q  230 aaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680331 aaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 16680525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579399
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttctattttcaaagctatatacaaatcat 29579211  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 335  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579212 tttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 29579311  T
Q  336 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  29579312 atcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 29579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 4531278 - 4531673
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531278 ttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4531377  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||    
T  4531378 cgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagct 4531472  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4531473 gtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccga 4531572  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctat-ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  4531573 gcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4531671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937838
Alignment:
Q  14 catctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 16938050  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16938049 ttttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaa 16937950  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||    
T  16937949 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaag 16937850  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||    
T  16937849 ataatctgtggt 16937838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 4778877 - 4779266
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778877 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 4778976  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaa-gctatata 228  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||| ||| ||||    
T  4778977 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaaagctgtata 4779071  T
Q  229 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779072 cgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4779171  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  4779172 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 4779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292764
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 13292946  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292945 tttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 13292851  T
Q  337 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13292850 tcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14139595 - 14139213
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139595 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14139496  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  14139495 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 14139401  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14139400 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatg 14139306  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  14139305 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 14139213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27013730 - 27014111
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27013730 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27013829  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  27013830 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 27013924  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  27013925 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27014018  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  27014019 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 27014111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 26926765 - 26927137
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26926765 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 26926864  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26926865 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 26926958  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926959 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 26927058  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||             ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  26927059 ggtacattcaaatga-------------gagtat--gttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 26927137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27031020 - 27031405
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031020 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27031119  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27031120 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtaca 27031214  T
Q  230 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  27031215 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaac 27031310  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27031311 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27031405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 115 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666471
Alignment:
Q  115 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctact 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctact 26666681  T
Q  215 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26666680 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  314 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagat 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggat 26666481  T
Q  414 agtctgtggt 423  Q
    ||||||||||    
T  26666480 agtctgtggt 26666471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27208901 - 27209285
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27208901 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27209000  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27209001 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27209095  T
Q  230 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27209096 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27209188  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27209189 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27209285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27240327 - 27239943
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240327 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27240228  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  27240227 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 27240133  T
Q  230 aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||    
T  27240132 aaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagca 27240040  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27240039 acagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27239943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 24869707 - 24870089
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869707 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24869806  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  24869807 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 24869901  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  24869902 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 24869994  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  24869995 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 24870089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27025142 - 27025526
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025142 cttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27025241  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  27025242 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 27025336  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  27025337 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 27025429  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27025430 cagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24299956 - 24299573
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299956 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24299857  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || |||| |||||| ||| |||     
T  24299856 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactctcaaagttatgtaca 24299762  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||    
T  24299761 aaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaaca 24299667  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24299666 gggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24299573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15406730 - 15406346
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15406730 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15406631  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15406630 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15406536  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15406535 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15406442  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15406441 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15406346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15418517 - 15418133
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15418517 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15418418  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  15418417 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagatatgtac 15418323  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||    
T  15418322 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 15418229  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15418228 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15418133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 412
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174933
Alignment:
Q  74 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  174 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 271  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 20174785  T
Q  272 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 364  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  20174786 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 20174885  T
Q  365 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
      |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20174886 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 20174933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161058
Alignment:
Q  74 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  174 ctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaac 271  Q
    || |||||||||||| ||||||||        |  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctc--tttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaac 22161206  T
Q  272 aaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtata 364  Q
    ||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  22161205 aaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcg 22161106  T
Q  365 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
      |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22161105 catcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaaga 22161058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 110  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857034
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctttttt-----cttcta 39856823  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856824 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 39856923  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  39856924 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 39857023  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  39857024 tagtctgtggt 39857034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18794878 - 18794483
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 18794779  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  18794778 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 18794684  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18794683 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 18794584  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  18794583 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 18794484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20332677 - 20332288
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332677 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 20332578  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20332577 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 20332481  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332480 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 20332381  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20332380 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20332288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40099891 - 40099502
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099891 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 40099792  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  40099791 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 40099695  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099694 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 40099595  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  40099594 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157178
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 27157372  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157371 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 27157272  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27157271 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27157178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24586616 - 24586227
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586616 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24586517  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  24586516 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 24586421  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586420 aaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatag 24586321  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24586320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 14104553 - 14104941
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104553 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 14104652  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  14104653 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatatac 14104747  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104748 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 30759774 - 30760161
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759774 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30759873  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  30759874 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 30759967  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759968 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30760067  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30760068 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33668056 - 33667669
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668056 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33667957  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  33667956 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 33667863  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667862 aaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33667763  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33667762 ggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33667669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 54839402 - 54839789
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839402 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 54839501  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  54839502 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaa-ctctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 54839595  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54839596 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 54839695  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  54839696 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 54839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14753747 - 14753360
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753747 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14753648  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  14753647 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 14753554  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14753553 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaaca 14753454  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14753453 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14753360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5700551 - 5700939
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700551 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5700650  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  5700651 gtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 5700744  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5700745 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaaca 5700844  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5700845 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5700939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012277
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttct 5012064  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5012065 actttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaa 5012164  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  5012165 aagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5012264  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  5012265 gatagtctgtggt 5012277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34183216 - 34182830
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34183216 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34183117  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  34183116 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 34183022  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183021 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34182923  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  34182922 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 34182830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976103
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 21975902  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21975903 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 21976002  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||| |||    
T  21976003 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctatgg 21976102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 1906263 - 1906656
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  1906263 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggag 1906362  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||| || ||||    
T  1906363 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttctactttcaaagccatgtaca 1906457  T
Q  231 aaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 323  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906458 aaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgag 1906556  T
Q  324 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1906557 caacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 1906656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120376
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 31120578  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctg 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31120577 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccg 31120478  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31120477 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 15233827 - 15234219
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15233827 cttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagag 15233926  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||| ||||    
T  15233927 tcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttctactttcaaagctatgtaca 15234021  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 324  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15234022 aaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggc 15234120  T
Q  325 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15234121 aacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 15234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24119061
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatataca 24118868  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118869 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacag 24118968  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||    
T  24118969 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggt 24119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36338772 - 36338392
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338772 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 36338673  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  36338672 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 36338578  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  36338577 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 36338484  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  36338483 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 36338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576253
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 6576073  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576074 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 6576167  T
Q  337 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  6576168 tcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380105
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 15380316  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||    
T  15380315 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttgaa 15380216  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15380215 a-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 15380117  T
Q  411 gatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||    
T  15380116 gatagtctgtgg 15380105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674260
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat 1674071  T
Q  237 --tttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1674072 attttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacttgagcaacaggg 1674170  T
Q  332 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  1674171 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggt 1674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276495
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 15276710  T
Q  213 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctatttt 307  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtttt 15276610  T
Q  308 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 407  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276609 g-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccc 15276511  T
Q  408 caagatagtctgtggt 423  Q
    || |||||||||||||    
T  15276510 caggatagtctgtggt 15276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 17019063 - 17019447
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17019063 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 17019162  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatata 228  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||| |||||||| ||    
T  17019163 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaaagctatgta 17019257  T
Q  229 c-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  17019258 caaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 17019351  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  17019352 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17019447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 14671027 - 14671412
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671027 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 14671126  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  14671127 gttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 14671221  T
Q  230 aa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  14671222 aagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 14671315  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  14671316 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggt 14671412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324183
Alignment:
Q  110 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnncctt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----ctt 36324390  T
Q  210 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||    
T  36324389 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttga 36324296  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 36324197  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||||||||||    
T  36324196 ggatagtctgtggt 36324183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18311439 - 18311379
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtg-gttactg-tgttcaatgtacc 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  18311439 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaa-tgtagtgtattactgttgttcaatgtacc 18311379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141086
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 5141299  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aa 310  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5141298 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 5141199  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  5141198 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 5141099  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  5141098 gatagtctgtggt 5141086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Original strand, 26441235 - 26441639
Alignment:
Q  16 tctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441235 tctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26441334  T
Q  116 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||| |||||    
T  26441335 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccatttttt---cttttactt 26441431  T
Q  216 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441432 tcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 26441531  T
Q  316 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  26441532 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 26441631  T
Q  416 tctgtggt 423  Q
    ||||||||    
T  26441632 tctgtggt 26441639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4139405 - 4138997
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139405 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4139306  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  4139305 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 4139208  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139207 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 4139108  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  4139107 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaaga 4139008  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    || ||||||||    
T  4139007 taatctgtggt 4138997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26679245 - 26678856
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679245 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26679146  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26679145 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26679049  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26679048 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26678949  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  26678948 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745272
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 16745485  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745484 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 16745385  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||     
T  16745384 aagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcag 16745285  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  16745284 gatagtctgtggt 16745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26664053 - 26663664
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664053 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26663954  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  26663953 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 26663857  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26663856 aaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggg 26663757  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  26663756 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 26663664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451704
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||         ||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttcta 3451490  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451491 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 3451590  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  3451591 aaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctcca 3451690  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||| ||||||    
T  3451691 ggatagtatgtggt 3451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24586693 - 24586287
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586693 tcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 24586594  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||         |||||    
T  24586593 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctattttt----cttct 24586499  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586498 actttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 24586399  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  24586398 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 24586299  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  24586298 atagtctgtggt 24586287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16444159 - 16443755
Alignment:
Q  16 tctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 115  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444159 tctgaagcttatgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 16444060  T
Q  116 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 215  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | ||||||||    
T  16444059 tgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctacttt----ctttctactt 16443965  T
Q  216 tcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaa 312  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  16443964 tcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa- 16443866  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16443865 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 16443766  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  16443765 tagtctgtggt 16443755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39207279 - 39206891
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207279 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 39207180  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  39207179 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 39207085  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207084 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39206985  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  39206984 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39206891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26269236 - 26268837
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26269236 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 26269137  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  26269136 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 26269042  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269041 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26268942  T
Q  319 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  26268941 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 26268842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 11446878 - 11447273
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 11446977  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||    
T  11446978 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagct 11447071  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg--aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447072 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 11447171  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||    
T  11447172 agcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 11447271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205774
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 4205561  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4205562 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 4205661  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4205662 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaa 4205761  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||| ||||||||    
T  4205762 gataatctgtggt 4205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5154081 - 5154468
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154081 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5154180  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  5154181 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 5154275  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154276 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5154375  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5154376 gtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5154468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164769
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc-tatatacaaaaca 235  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagcctatatacaaaaca 5164581  T
Q  236 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164582 ttttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 5164681  T
Q  336 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5164682 tccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 26518790 - 26519176
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26518889  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  26518890 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 26518983  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518984 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26519083  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  26519084 gtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26519176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313601
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 26313813  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26313812 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26313713  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  26313712 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26313613  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||    
T  26313612 ataatctgtggt 26313601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31558534 - 31558146
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558534 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31558435  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31558434 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31558340  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558339 aatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31558240  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  31558239 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31558146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 423
Target Start/End: Original strand, 45393212 - 45393604
Alignment:
Q  27 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393212 tgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 45393311  T
Q  127 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  45393312 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctactttt----cttctactttcaaagctata 45393406  T
Q  227 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393407 cacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 45393506  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  45393507 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 45393604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418531
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttttactttcaaagctatatacaaaacat 11418719  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418718 tttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 11418619  T
Q  336 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||    
T  11418618 ttcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtggt 11418531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26509837 - 26509471
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509837 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 26509738  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  26509737 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 26509642  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509641 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 26509542  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509541 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 45737298 - 45737688
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737298 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 45737397  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  45737398 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 45737491  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737492 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 45737591  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  45737592 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 45737688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084374
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctattttt----cttct 31084587  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31084586 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaa 31084487  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  31084486 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaa 31084387  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||| ||||||||    
T  31084386 gataatctgtggt 31084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 2160567 - 2160957
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160567 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2160666  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| ||||    
T  2160667 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtaca 2160761  T
Q  231 aaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  2160762 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaac 2160861  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2160862 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 2160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047697
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16047488  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttgaaa- 16047586  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  16047587 gcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccggga 16047686  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  16047687 tagtctgtggt 16047697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 116 - 423
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596055
Alignment:
Q  116 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactt 26595846  T
Q  216 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595847 tcaaagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 26595946  T
Q  315 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  26595947 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggata 26596046  T
Q  415 gtctgtggt 423  Q
    |||||||||    
T  26596047 gtctgtggt 26596055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 2779249 - 2779631
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2779249 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2779348  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  2779349 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 2779443  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  2779444 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 2779538  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  2779539 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 2779631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 31129902 - 31130284
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31129902 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31130001  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31130002 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31130096  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31130097 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31130191  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  31130192 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggt 31130284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847970
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||        |  ||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactcta----ttttctctcta 10847756  T
Q  213 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattt 306  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttt 10847856  T
Q  307 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 406  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10847857 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttcc 10847953  T
Q  407 ccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||| |||||||||||||    
T  10847954 ccaggatagtctgtggt 10847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16512574 - 16512194
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512574 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16512475  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  16512474 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 16512380  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  16512379 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 16512288  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16512287 agggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10911060 - 10910678
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10911060 cttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10910961  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  10910960 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 10910866  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  10910865 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 10910773  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10910772 atggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26532010 - 26531926
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 115  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532010 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630135
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 4629924  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629925 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 4630024  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  4630025 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 4630123  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  4630124 atagtctgtggt 4630135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681051
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 21680840  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680841 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 21680940  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  21680941 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 21681039  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  21681040 atagtctgtggt 21681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29659272 - 29658877
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659272 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 29659173  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| |    
T  29659172 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagtt 29659078  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29659077 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 29658978  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  29658977 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 29658878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142663
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttt----ttcta 29142877  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29142876 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 29142777  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  29142776 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 29142677  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||||||||||    
T  29142676 ggatagtctgtggt 29142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296981
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttcta 32296770  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296771 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 32296870  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  32296871 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 32296970  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  32296971 tagtctgtggt 32296981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5727941 - 5728330
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727941 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5728040  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5728041 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5728137  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728138 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5728237  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5728238 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5728330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 47029416 - 47029805
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029416 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 47029515  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  47029516 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 47029612  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029613 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 47029712  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  47029713 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 47029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5717031 - 5717420
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717031 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5717130  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5717131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5717227  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717228 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5717327  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5717328 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5764427 - 5764038
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764427 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5764328  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5764327 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 5764231  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764230 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 5764131  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5764130 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5764038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340585
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 4340786  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 4340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 18248694 - 18249089
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18248694 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatc 18248793  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||         |||||||||||||||||    
T  18248794 cgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaa-ctctattttt----cttctactttcaaagct 18248888  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18248889 acatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 18248988  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  18248989 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 18249088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 10649034 - 10649422
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649034 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10649133  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  10649134 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 10649228  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649229 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10649328  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10649329 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20571150 - 20570755
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571150 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 20571051  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||    
T  20571050 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 20570956  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20570955 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 20570856  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  20570855 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtgg 20570756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109860
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttct 28110076  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110075 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 28109976  T
Q  308 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  28109975 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctc 28109876  T
Q  408 caagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28109875 caagataatctgtggt 28109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31958772 - 31958364
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958772 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31958673  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  31958672 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 31958575  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31958574 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 31958475  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  31958474 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 31958375  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  31958374 tagtctgtggt 31958364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 28027247 - 28027640
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027247 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 28027346  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||         |||||||||||||||||    
T  28027347 cgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagct 28027440  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 323  Q
    ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027441 atatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 28027540  T
Q  324 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28027541 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5603630 - 5603222
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603630 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5603531  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  5603530 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 5603433  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5603432 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 5603333  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  5603332 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 5603233  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  5603232 tagtctgtggt 5603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 24334118 - 24334526
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334118 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 24334217  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  24334218 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 24334315  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24334316 ctttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 24334415  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  24334416 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 24334515  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  24334516 tagtctgtggt 24334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5472951 - 5473338
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472951 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5473050  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5473051 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 5473145  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473146 aaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5473244  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  5473245 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5473338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 8217595 - 8217985
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217595 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggag 8217694  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  8217695 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 8217789  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217790 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 8217889  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8217890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8217985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5590676 - 5590270
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590676 tcatctaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5590577  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         | || ||    
T  5590576 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttcttttta 5590482  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590481 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 5590382  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |    
T  5590381 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccagg 5590282  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||| ||||    
T  5590281 atagtctatggt 5590270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 51787985 - 51788373
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787985 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 51788084  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  51788085 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 51788179  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788180 aaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 51788279  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  51788280 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 51788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422534
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccg-gaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16422321  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttga 309  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16422322 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttga 16422421  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422422 aa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 16422520  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||||||||||    
T  16422521 ggatagtctgtggt 16422534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 4422881 - 4423269
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4422881 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4422980  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4422981 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 4423075  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423076 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 4423175  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  4423176 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4423269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 28345116 - 28345521
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345116 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28345215  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||    
T  28345216 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttcta 28345309  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28345310 ttttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 28345409  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  28345410 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaag 28345509  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||    
T  28345510 ataatctgtggt 28345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4790931 - 4790542
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790931 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4790832  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  4790831 ttcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 4790737  T
Q  230 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790736 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 4790637  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  4790636 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978859
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 17979061  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctg 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17979060 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctg 17978961  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  17978960 agcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22381877 - 22381490
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381877 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 22381778  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22381777 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 22381683  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381682 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacag 22381583  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22381582 tgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22381490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17971161 - 17970775
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971161 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 17971062  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  17971061 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 17970968  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970967 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17970868  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  17970867 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17970775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 10402112 - 10402499
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10402112 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10402211  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||          |||||||||||||||||||||||    
T  10402212 tcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-----ttctactttcaaagctatataca 10402305  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402306 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10402405  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10402406 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618399
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 16618614  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---tttttgtctattt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattt 16618514  T
Q  307 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16618513 tgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcc 16618415  T
Q  407 ccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16618414 ccaggatagtctgtgg 16618399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286264
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18286452  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18286451 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18286352  T
Q  335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18286351 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301565
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 18301753  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18301752 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtac 18301653  T
Q  335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18301652 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18301565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 20071996 - 20072386
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20071996 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 20072095  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  20072096 tcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 20072189  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072190 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20072289  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20072290 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20072386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5019676 - 5020063
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5019676 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5019775  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5019776 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagctatataca 5019869  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019870 aatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5019969  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  5019970 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 5020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 18231156 - 18231544
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18231156 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggag 18231255  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         | |||||||||||||||||||||||    
T  18231256 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct----gttttctttctactttcaaagctatataca 18231350  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231351 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacag 18231450  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18231451 ggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22865143 - 22864757
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22865143 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22865044  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22865043 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22864950  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22864949 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22864850  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| | |||||||||||    
T  22864849 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22880202 - 22879816
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880202 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22880103  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  22880102 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgcttt---cttctactttcaaagctgtataca 22880009  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880008 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22879909  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| | |||||||||||    
T  22879908 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22879816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 6537040 - 6536652
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6537040 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 6536941  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  6536940 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 6536846  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6536845 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6536746  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  6536745 ggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 6536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 39 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11104651 - 11104270
Alignment:
Q  39 ttcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcct 138  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11104651 ttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgcct 11104552  T
Q  139 ttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tatacaaaacat 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||  |||||||   ||    
T  11104551 tcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctaaatatacaatttat 11104457  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 336  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104456 tttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11104357  T
Q  337 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  11104356 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11104270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 7079185 - 7079578
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7079185 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 7079284  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata-- 228  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||         | || ||||||||||||||||||      
T  7079285 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagctatatata 7079379  T
Q  229 --caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 324  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079380 tacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 7079479  T
Q  325 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  7079480 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 7079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 48471890 - 48472282
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48471890 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggag 48471989  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  48471990 tcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 48472084  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472085 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagca 48472184  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  48472185 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 18057223 - 18057614
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18057223 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18057322  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  18057323 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 18057417  T
Q  230 aaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18057418 aaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 18057517  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18057518 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 18057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31030535 - 31030154
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030535 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31030436  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31030435 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 31030341  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  31030340 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31030246  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31030245 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31030154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208247
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaaca 6208064  T
Q  236 ttttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 333  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208065 ttttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 6208158  T
Q  334 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6208159 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 6208247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 423
Target Start/End: Original strand, 18336589 - 18336973
Alignment:
Q  29 tacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18336589 tacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 18336688  T
Q  128 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat 227  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  18336689 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttt----cttctactttcaaagctatat 18336783  T
Q  228 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  18336784 acaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 18336878  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  18336879 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctatggt 18336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700849
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa-- 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||||||||||||||| |||||||      
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 19700648  T
Q  234 ---------cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctg 321  Q
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19700649 aaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctg 19700747  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19700748 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727978
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaacat 4727796  T
Q  237 tttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 334  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727797 tttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 4727890  T
Q  335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4727891 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtggt 4727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445496
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatatacaaaaca 32445316  T
Q  236 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445317 ttttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 32445409  T
Q  336 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  32445410 ttcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32445496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15735392 - 15735009
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735392 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15735293  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||||||| ||| |||     
T  15735292 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttcaaagttatgtaca 15735199  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  15735198 aaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaac 15735104  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15735103 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15735009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887111
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaac 35886927  T
Q  235 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 332  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35886928 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggt 35887021  T
Q  333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  35887022 acattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 35887111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 4689614 - 4689996
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4689614 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 4689713  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||          ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  4689714 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-----gctttcttttactttctaagttatgtac 4689807  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  4689808 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 4689900  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  4689901 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtggt 4689996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8283766 - 8283367
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283766 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 8283667  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||     
T  8283666 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtaca 8283572  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaac 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||    
T  8283571 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaac 8283472  T
Q  319 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtct 418  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  8283471 ctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 8283372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5658097 - 5658482
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658097 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5658196  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 228  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||| ||||||||| | ||| ||    
T  5658197 tcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttccttttactttcaacgttatgta 5658291  T
Q  229 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| ||||    
T  5658292 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagca 5658385  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||    
T  5658386 acagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtggt 5658482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15886857 - 15886650
Alignment:
Q  211 tactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 307  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||       ||    
T  15886857 tactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tt 15886765  T
Q  308 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  15886764 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 15886666  T
Q  408 caagatagtctgtggt 423  Q
    |  |||||||||||||    
T  15886665 ccggatagtctgtggt 15886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15887004 - 15886894
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgtgg 128  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15887004 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtgg 15886905  T
Q  129 agtcatgcctt 139  Q
    ||||| |||||    
T  15886904 agtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Original strand, 8002523 - 8002607
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 115  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002523 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239894
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 40239683  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239684 ctttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 40239783  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  40239784 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 40239882  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  40239883 atagtctgtggt 40239894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27809699 - 27810089
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809699 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27809798  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27809799 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttt--cttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27810089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 254896 - 254508
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254896 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 254797  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  254796 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 254700  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254699 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 254601  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  254600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 254508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 27782223 - 27782618
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782223 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27782322  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||    
T  27782323 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 27782417  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27782418 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 27782517  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  27782518 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtgg 27782617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37946110 - 37945721
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946110 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37946011  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37946010 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 37945914  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945913 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37945814  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37945813 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710457
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||         ||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttt-----cttcta 12710670  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710669 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 12710570  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||     
T  12710569 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 12710470  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  12710469 gatagtctgtggt 12710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167864
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 16167670  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167671 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 16167770  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  16167771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16167864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22922407 - 22921999
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922407 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22922308  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  22922307 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 22922210  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22922209 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 22922110  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  22922109 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 22922010  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  22922009 tagtctgtggt 22921999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 12592808 - 12593200
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592808 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12592907  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  12592908 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 12593003  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12593004 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaa 12593103  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12593104 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661924
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 12661737  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661738 tttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 12661837  T
Q  337 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12661838 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12661924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13930790 - 13930400
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13930691  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  13930690 tcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 13930595  T
Q  231 aaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930594 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13930495  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13930494 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 13930400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 3788492 - 3788879
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3788492 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggag 3788591  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  3788592 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 3788686  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788687 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3788786  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3788787 gtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3788879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 39896048 - 39896454
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39896048 tcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccga 39896147  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  39896148 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttct 39896242  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39896243 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 39896342  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  39896343 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 39896442  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  39896443 atagtctgtggt 39896454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19410748 - 19410340
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410748 tcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 19410649  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  19410648 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 19410551  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19410550 ctttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 19410451  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  19410450 gcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 19410351  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  19410350 tagtctgtggt 19410340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 37931370 - 37931765
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931370 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37931469  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnc--cttctactttcaaagctatata 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||    
T  37931470 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatata 37931569  T
Q  229 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931570 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 37931669  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  37931670 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 37931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 27122523 - 27122909
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122523 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27122622  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27122623 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 27122716  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27122717 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagg 27122816  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  27122817 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 34867680 - 34868068
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867680 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtaga 34867779  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||||||||    
T  34867780 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatatac 34867873  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867874 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 34867973  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  34867974 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34868068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 37383675 - 37384063
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383675 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37383774  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  37383775 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 37383869  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383870 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 37383969  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37383970 ggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37384063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9344231 - 9343843
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9344231 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9344132  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  9344131 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 9344037  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344036 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacag 9343937  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9343936 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629041
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||| ||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----ctttta 11629253  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11629252 ttttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaa 11629153  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||     
T  11629152 aaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 11629054  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  11629053 gatagtctgtggt 11629041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679747
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37679962  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37679961 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37679862  T
Q  309 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||    
T  37679861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37679762  T
Q  409 aagatagtctgtggt 423  Q
    | |||||||||||||    
T  37679761 aggatagtctgtggt 37679747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695012
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 37695227  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  37695226 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttg 37695127  T
Q  309 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||    
T  37695126 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctcc 37695027  T
Q  409 aagatagtctgtggt 423  Q
    | |||||||||||||    
T  37695026 aggatagtctgtggt 37695012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21697438 - 21697029
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697438 tcatctaaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21697339  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | | |||    
T  21697338 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----cttccta 21697244  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatttt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21697243 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctatttt 21697144  T
Q  308 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 407  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21697143 gaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccc 21697045  T
Q  408 caagatagtctgtggt 423  Q
    || |||||||||||||    
T  21697044 caggatagtctgtggt 21697029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39046066 - 39045678
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| |  || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39046066 cttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 39045967  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  39045966 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 39045872  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045871 aaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 39045772  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  39045771 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39045678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 34160842 - 34161232
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34160842 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34160941  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34160942 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34161036  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161037 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 34161136  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  34161137 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823193
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16823394  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16823393 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16823294  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  16823293 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 16823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898287
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctct----gttttctttttactttcaaagct 16898086  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16898087 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16898186  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  16898187 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 16898286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671026
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 21671242  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctatttt 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  21671241 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctatttt 21671142  T
Q  308 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |    
T  21671141 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctc 21671042  T
Q  408 caagatagtctgtggt 423  Q
    || |||||||||||||    
T  21671041 caggatagtctgtggt 21671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 31882285 - 31882672
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882285 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31882384  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  31882385 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 31882478  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31882479 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacgg 31882578  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31882579 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31882672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 32055800 - 32056187
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32055800 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 32055899  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  32055900 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 32055993  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055994 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 32056093  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  32056094 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 32056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 81 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868642
Alignment:
Q  81 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  181 tttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 280  Q
    ||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt 31868786  T
Q  281 -gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctattt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  31868785 tgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctattt 31868686  T
Q  380 caatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31868685 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31868642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 34297154 - 34297535
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297154 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 34297253  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  34297254 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 34297348  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  34297349 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34297442  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  34297443 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 34297535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396718
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 27396497  T
Q  213 ctttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgt 300  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||    
T  27396498 ctttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgt 27396597  T
Q  301 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 400  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396598 cctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggc 27396696  T
Q  401 tcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27396697 tcttccccaggatagtctgtgg 27396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450274
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||        |  ||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctctcta 19450495  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtc 301  Q
    ||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  302 tattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 401  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19450394 tgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggct 19450296  T
Q  402 cttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  19450295 cttccccaggatagtctgtggt 19450274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 28888277 - 28888660
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888277 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28888376  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||     
T  28888377 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtaca 28888471  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 28888565  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28888566 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28888660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 34269165 - 34268782
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34269165 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggag 34269066  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  34269065 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 34268971  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  34268970 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 34268878  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||    
T  34268877 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtggt 34268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27428690 - 27428309
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428690 cttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27428591  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||| ||| | |     
T  27428590 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtgca 27428496  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||    
T  27428495 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 27428404  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  27428403 agggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggt 27428309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23122817 - 23122434
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23122817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgga 23122718  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  23122717 gtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 23122623  T
Q  230 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  23122622 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaac 23122529  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  23122528 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23122434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 20843910 - 20844298
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843910 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 20844009  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttc-aaagctatat- 227  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||| ||| |||| ||| |     
T  20844010 gtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttaccttcaaaagttatgtt 20844104  T
Q  228 -acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 324  Q
     | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||    
T  20844105 caaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagc 20844199  T
Q  325 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  20844200 aacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 423
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117182
Alignment:
Q  234 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 333  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  334 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31887737 - 31887682
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 86  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887737 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28356187 - 28355778
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356187 tcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28356088  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||    
T  28356087 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttt--cttct 28355990  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355989 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 28355890  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  28355889 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 28355790  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  28355789 atagtctgtggt 28355778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 9360622 - 9361009
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360622 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9360721  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9360722 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9360816  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360817 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9360916  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9360917 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 31360528 - 31360916
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360528 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 31360627  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||    
T  31360628 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagttatataca 31360722  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360723 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 31360822  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31360823 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31360916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 32 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31484087 - 31483698
Alignment:
Q  32 ttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 131  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484087 ttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagt 31483988  T
Q  132 catgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaa 231  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  31483987 cacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttctactttcaaagctatatacaa 31483890  T
Q  232 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31483889 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaagg 31483790  T
Q  332 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  31483789 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12086947 - 12086551
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12086947 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 12086848  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         ||||||||||||||||    
T  12086847 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagc 12086753  T
Q  223 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12086752 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctg 12086653  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  12086652 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 12086553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 33248366 - 33248753
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248366 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33248465  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  33248466 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt----cttctactttcaaagctatataca 33248560  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248561 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33248660  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33248661 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680835
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 19680623  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19680624 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19680723  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  19680724 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 19680823  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  19680824 atagtctgtggt 19680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 29835305 - 29835710
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835305 tcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29835404  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |         ||||||    
T  29835405 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttcta 29835499  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29835500 ctttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 29835599  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  29835600 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaaga 29835699  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    || ||||||||    
T  29835700 taatctgtggt 29835710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 18796706 - 18797095
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18796706 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 18796805  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18796806 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18796900  T
Q  230 aaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796901 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18797000  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18797001 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 15773574 - 15773962
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773574 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15773673  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||| |||||||||||    
T  15773674 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcagagctatataca 15773768  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773769 aaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 15773868  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15773869 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21341998
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 21342187  T
Q  236 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342186 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 21342087  T
Q  335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||    
T  21342086 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtggt 21341998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 44566980 - 44567371
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44566980 cttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 44567079  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  44567080 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 44567173  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567174 aaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 44567273  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  44567274 acagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 44567371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202203
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagt-ttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 19202413  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19202412 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 19202315  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  19202314 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 19202215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19910990
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||||||  |    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttc----ctttttactttcaaagctatgtacaaaaaac 19911180  T
Q  235 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19911179 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggta 19911080  T
Q  334 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19911079 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 19910990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 18715480 - 18715870
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715480 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18715579  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18715580 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 18715673  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715674 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18715773  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  18715774 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602742
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttcttttta 27602947  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 309  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        ||||||    
T  27602946 ctttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttga 27602855  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  27602854 aaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27602756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 384
Target Start/End: Original strand, 33264731 - 33265079
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264731 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33264830  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||     
T  33264831 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatacg 33264924  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264925 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33265024  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaata 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  33265025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22075141 - 22074758
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22075141 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 22075042  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa-- 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||        | |||||||||||||||||| |||||||      
T  22075041 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttctactttcaaagctatgtacaaaaaa 22074947  T
Q  234 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 332  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||    
T  22074946 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttgaaa-gcaagcatgagcaacaaggt 22074848  T
Q  333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22074847 acattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggatagtctgtgg 22074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Original strand, 16260216 - 16260480
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16260216 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 16260315  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  16260316 cgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 16260410  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260411 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19655560 - 19655175
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 128  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655560 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19655461  T
Q  129 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 228  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| ||    
T  19655460 agtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgta 19655366  T
Q  229 c-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||    
T  19655365 caaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagca 19655273  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19655272 acagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtctttggt 19655175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2131478 - 2131096
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131478 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2131379  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  2131378 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgtaca 2131284  T
Q  230 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||    
T  2131283 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaac 2131191  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  2131190 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 19694095 - 19694479
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19694095 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 19694194  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  19694195 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 19694289  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||    
T  19694290 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 19694383  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||    
T  19694384 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtggt 19694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 22138906 - 22139288
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138906 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 22139005  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||    
T  22139006 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtac 22139100  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||    
T  22139101 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaa 22139191  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22139192 cagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22139288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 423
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569542
Alignment:
Q  69 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  169 tgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aa 261  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaa 14569388  T
Q  262 tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 361  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14569389 tgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagt 14569480  T
Q  362 atatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
     | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14569481 gtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtggt 14569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298932
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttt---ttcta 33298718  T
Q  213 ctttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--ga 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  33298719 ctttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaa 33298818  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  33298819 aaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 33298918  T
Q  410 agatagtctgtggt 423  Q
     |||||||||||||    
T  33298919 ggatagtctgtggt 33298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 30174472 - 30174861
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174472 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30174571  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30174572 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 30174668  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174669 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30174768  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30174769 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795934
Alignment:
Q  25 tctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 124  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  125 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttt---cttctactttcaaagcta 3795735  T
Q  225 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795736 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 3795835  T
Q  325 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3795836 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3795934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 33881132 - 33881521
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881132 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33881231  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||    
T  33881232 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt----ttccactttcaaagctatatac 33881327  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881328 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 33881427  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  33881428 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 33881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18369687 - 18369298
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369687 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 18369588  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18369587 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctattttt----cttctactttcaaagctatatac 18369492  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369491 aaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18369392  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18369391 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18369298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953546
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttcta 28953758  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28953757 ctttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaa 28953658  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||     
T  28953657 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccag 28953559  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  28953558 gatagtctgtggt 28953546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555748
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 11555561  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555562 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 11555661  T
Q  337 tcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||    
T  11555662 tcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtcggtggt 11555748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 423
Target Start/End: Original strand, 30158037 - 30158429
Alignment:
Q  27 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158037 tgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 30158136  T
Q  127 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  30158137 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctaccttt----cttctactttcaaagctata 30158231  T
Q  227 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158232 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 30158331  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30158332 acggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 32590436 - 32590042
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32590436 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatt 32590337  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||    
T  32590336 cgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttt-----cttctactttcaaagct 32590243  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590242 atatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 32590143  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  32590142 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 32590043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894810
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 22894599  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaa 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttgaaa 22894699  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22894700 -gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccccagg 22894798  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||    
T  22894799 atagtctgtggt 22894810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31820569 - 31820176
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820569 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 31820470  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| ||||||||||    
T  31820469 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagct 31820376  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 323  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820375 atatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 31820276  T
Q  324 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  31820275 caacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31820176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 37760989 - 37761378
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37760989 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggag 37761088  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  37761089 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 37761183  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37761184 aaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 37761283  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||    
T  37761284 gggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtggt 37761378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 41680711 - 41681100
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680711 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 41680810  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  41680811 tcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 41680906  T
Q  231 aaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41680907 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaaca 41681006  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  41681007 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41681100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 6880292 - 6880699
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880292 tcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 6880391  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||         |||||    
T  6880392 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctattttt----cttct 6880486  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880487 actttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 6880586  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||    
T  6880587 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaa 6880686  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||| ||||||||    
T  6880687 gataatctgtggt 6880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37352805 - 37352410
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352805 ttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 37352706  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  37352705 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 37352611  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352610 atatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 37352511  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |||||||    
T  37352510 gcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtgg 37352411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323871
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 9323659  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9323660 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 9323759  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  9323760 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 9323859  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||    
T  9323860 ataatctgtggt 9323871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 2517065 - 2517461
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517065 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 2517164  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||         |||||||||||||||||    
T  2517165 cgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagat-tctatttt-----cttctactttcaaagct 2517258  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517259 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 2517358  T
Q  321 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgt 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  2517359 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgt 2517458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138570
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttct 12138358  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12138359 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 12138458  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  12138459 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 12138558  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||| ||||||||    
T  12138559 ataatctgtggt 12138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8659629 - 8659238
Alignment:
Q  27 tgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8659629 tgtacttgtgaattcaaagtttcgg-gaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgt 8659531  T
Q  127 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctata 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  8659530 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctata 8659436  T
Q  227 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659435 tacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagca 8659336  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8659335 acagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13318981 - 13318594
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13318981 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 13318882  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  13318881 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatataca 13318787  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13318786 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 13318687  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  13318686 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 13318594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084653
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaac- 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||| |||||||||||      
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctattttcaaagttatatacaaaaat 43084464  T
Q  235 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084465 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 43084564  T
Q  335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  43084565 attcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 43084653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494534
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaaca 235  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||   |    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-----cttctactttcaaagctatatacaattta 18494722  T
Q  236 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 335  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494721 ctttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 18494622  T
Q  336 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  18494621 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37746482 - 37746088
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746482 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37746383  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || ||||||||||||||||||||    
T  37746382 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt----ctttttactttcaaagctatataca 37746287  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37746286 aaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37746187  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagc--gagtat----atgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37746186 gtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37746088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 28655249 - 28655638
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655249 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28655348  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28655349 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28655442  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655443 aaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 28655542  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28655543 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40467707 - 40467319
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40467707 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggag 40467608  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  40467607 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt----ctttctactttcaaagctatataca 40467513  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467512 aaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 40467413  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  40467412 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40467319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9544862 - 9544473
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544862 cttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9544764  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9544763 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 9544670  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9544669 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaa 9544570  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  9544569 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 9544473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486780
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaag-aactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||                  
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat------------- 26486570  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 311  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26486571 --tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 26486668  T
Q  312 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  26486669 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26486768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 11329643 - 11330034
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329643 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11329742  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagcta--tat 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||  |||    
T  11329743 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctaaatat 11329837  T
Q  228 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329838 acaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 11329937  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  11329938 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 24729976 - 24730365
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729976 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24730075  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  24730076 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 24730169  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730170 aaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24730269  T
Q  328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  24730270 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggt 24730365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15753006 - 15752624
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753006 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15752907  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  15752906 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 15752813  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752812 aaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15752717  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  15752716 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtggt 15752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632366
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacat 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatatacaaaacat 23632176  T
Q  237 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632177 tttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 23632276  T
Q  334 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  23632277 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtggt 23632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522778
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||           || |||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctt---ttttactttcaaagct 33522577  T
Q  224 atatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522578 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 33522677  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  33522678 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtgg 33522777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13180943 - 13180559
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13180943 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13180844  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  13180843 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatatac 13180748  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180747 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 13180653  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  13180652 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggt 13180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 30035433 - 30035820
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035433 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 30035532  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  30035533 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 30035626  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035627 aaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 30035726  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||| | |||||||| ||||||||    
T  30035727 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagattctcctccaagataatctgtggt 30035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644193
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         ||| ||||||||||||||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttttactttcaaagctatataca 5644000  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644001 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 5644100  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  5644101 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 5644193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13436834 - 13436440
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436834 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13436735  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||    
T  13436734 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttt---cttctactttcaaagctatatac 13436639  T
Q  230 aaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436638 aaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 13436539  T
Q  325 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13436538 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18122570 - 18122182
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122570 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18122471  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  18122470 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttttt---ttctactttcaaagctatataca 18122375  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122374 atttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18122275  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  18122274 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 18122182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 34622525 - 34622914
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622525 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgga 34622624  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  34622625 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 34622719  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34622720 aaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 34622819  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  34622820 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 34622914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37665640 - 37665252
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665640 cttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37665541  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  37665540 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctgtataca 37665446  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37665445 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaaca 37665346  T
Q  329 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  37665345 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggt 37665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 31437471 - 31437852
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437471 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31437570  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  31437571 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 31437665  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  31437666 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 31437759  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  31437760 gtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggt 31437852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15652912 - 15652526
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652912 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15652813  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  15652812 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 15652718  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||    
T  15652717 aaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagg 15652618  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  15652617 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15652526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 397
Target Start/End: Original strand, 25206289 - 25206653
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 134  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25206289 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25206388  T
Q  135 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25206389 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25206483  T
Q  233 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25206484 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25206582  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206583 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25206653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 397
Target Start/End: Original strand, 25270445 - 25270809
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcat 134  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25270445 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25270544  T
Q  135 gcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac--aaa 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||| |||  |||    
T  25270545 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 25270639  T
Q  233 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25270640 acattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaa 25270738  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270739 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 25270809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22993270 - 22992890
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22993270 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22993171  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||||||||||||    
T  22993170 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagctatataca 22993076  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22993075 aaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 22992982  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  22992981 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22992890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898263
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac----aa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | || ||||||||||||||| |||    ||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta----ttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaa 23898080  T
Q  232 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||    
T  23898081 aacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagg 23898170  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  23898171 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtggt 23898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 33783494 - 33783877
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783494 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33783593  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac- 229  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |||     
T  33783594 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ttttctttttactttcaaagttatgtaca 33783688  T
Q  230 aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||    
T  33783689 aaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaa 33783781  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33783782 cagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33783877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 423
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976238
Alignment:
Q  36 gaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24976055  T
Q  235 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 332  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976056 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 24976147  T
Q  333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||    
T  24976148 acattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 24976238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 24608252 - 24608636
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608252 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24608351  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||          | || ||||||||||| ||| |||    
T  24608352 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttg-aaactc----cgctttctttttactttcaaagttatgtac 24608446  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  24608447 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 24608539  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24608540 cagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 30940643 - 30941025
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30940643 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 30940742  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  30940743 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttg-aaattct----gctttctttttactttcaaagttatgtac 30940837  T
Q  230 -aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||    
T  30940838 aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaa 30940929  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  30940930 cagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12423
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12036 cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12135  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |    
T  12136 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatata 12230  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 12330  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  12331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 3647148 - 3647536
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647148 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 3647247  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||||||||    
T  3647248 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttt----cttctactttcaaagctatataca 3647343  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647344 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 3647443  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  3647444 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3647536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 10968667 - 10969056
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968667 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10968766  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  10968767 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatataca 10968863  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968864 aaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 10968963  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||| |||||||||    
T  10968964 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtggt 10969056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 51644215 - 51644612
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644215 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 51644314  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  51644315 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagct 51644411  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644412 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctga 51644511  T
Q  323 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||    
T  51644512 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcacctccaagataatctgtgg 51644611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 38 - 423
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951482
Alignment:
Q  38 attcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcc 137  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  138 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaacatt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttt---cttctactttcaaagctatatacaaaacatt 10951296  T
Q  238 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10951297 ttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacatt 10951396  T
Q  338 caaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  10951397 caaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggt 10951482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Original strand, 28591084 - 28591472
Alignment:
Q  30 acttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591084 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28591183  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||         | || |||||||||||||||||||    
T  28591184 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctct----gctttctttttactttcaaagctatatac 28591278  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591279 aaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28591472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334281
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||        | |||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaa-ctctacttt----ctttcta 20334495  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttg 308  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20334494 ctttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg 20334395  T
Q  309 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334394 aaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 20334296  T
Q  409 aagatagtctgtggt 423  Q
    | |||||||||||||    
T  20334295 aggatagtctgtggt 20334281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 28155728 - 28156118
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155728 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28155827  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  28155828 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 28155921  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155922 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 28156021  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  28156022 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28156118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 41787565 - 41787175
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41787565 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 41787466  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  41787465 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 41787372  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787371 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 41787272  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  41787271 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 20466785 - 20467175
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20466785 aattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 20466884  T
Q  137 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatacaaaa--c 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||| |||||||||||||| |||||||  |    
T  20466885 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttccactttcaaagctatgtacaaaaacc 20466979  T
Q  235 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20466980 attttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttg-aaagcaaacctgagcag 20467078  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467079 caaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccatgatagtctgtggt 20467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201893
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||        | || ||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt----cttttta 16202113  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaa-----cattttctttctatttt-gataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttt---gtct 302  Q
    |||||||||| || |||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   ||||    
T  16202112 ctttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtct 16202013  T
Q  303 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16202012 attttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttc 16201914  T
Q  403 ttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  16201913 ttctccaggatagtctgtggt 16201893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891628
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        | ||||     
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta--------ctttctt 21891830  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 309  Q
     ||       ||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | ||||||    
T  21891829 ttt-------tatgttcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttga 21891741  T
Q  310 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  21891740 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 21891642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3045
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgtt--cttcta 3256  T
Q  213 ctttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3255 ctttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaa 3156  T
Q  313 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaaga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  3155 gcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 3056  T
Q  413 tagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||    
T  3055 tagtctgtggt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 207 - 423
Target Start/End: Original strand, 17980 - 18196
Alignment:
Q  207 cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17980 cttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattt 18079  T
Q  307 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |     
T  18080 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 18179  T
Q  407 ccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18180 ccaggatagtctgtggt 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 15562 - 15964
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15562 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 15661  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  15662 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-----cttctactttcaaagct 15756  T
Q  224 atatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagca 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15757 atatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagca 15856  T
Q  316 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  15857 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 15956  T
Q  416 tctgtggt 423  Q
    ||||||||    
T  15957 tctgtggt 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9508
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9895 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9796  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9795 tcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatataca 9701  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 9601  T
Q  331 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  9600 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 423
Target Start/End: Original strand, 13942 - 14338
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13942 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 14041  T
Q  123 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||         ||||||||||||||||    
T  14042 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagc 14136  T
Q  223 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14137 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 14236  T
Q  322 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtg 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  14237 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9182 - 8795
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9083  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9082 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-----cttctactttcaaagctatataca 8989  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacag 8889  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  8888 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4469
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 128  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4860 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4761  T
Q  129 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatata 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4760 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt----cttctactttcaaagctatata 4666  T
Q  229 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4665 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaa 4566  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4565 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10301
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 130  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9914 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaag 10013  T
Q  131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatataca 230  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||         |||||| |||||||||||||||||    
T  10014 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctattttcaaagctatataca 10107  T
Q  231 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108 aaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 10207  T
Q  330 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  10208 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 33297 - 33682
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33297 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 33396  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| |||    
T  33397 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gttttctttttactttcaaagttatgtac 33491  T
Q  230 -aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 326  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||    
T  33492 aaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18975
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18585 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 18684  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac 229  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  18685 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-----cttctactttcaaagctatatac 18778  T
Q  230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 18878  T
Q  327 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  18879 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2045
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  112 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-----cttct 1832  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1833 actttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaa 1932  T
Q  311 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||      
T  1933 aagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgg 2032  T
Q  411 gatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||    
T  2033 gatagtctgtggt 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 423
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12445
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttct 211  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||        | ||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctactat----ctttct 12222  T
Q  212 actttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttg 299  Q
    |||||||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttg 12322  T
Q  300 tctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323 tctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12421  T
Q  400 ctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  12422 ctcttctccaggatagtctgtggt 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25510
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttcta 212  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||        | |||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttcta 25291  T
Q  213 ctttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtct 302  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtct 25391  T
Q  303 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 402  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25392 gttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 25490  T
Q  403 ttccccaagatagtctgtgg 422  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  25491 ttccccaggatagtctgtgg 25510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 423
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6451
Alignment:
Q  31 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 129  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 6165  T
Q  130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatat-- 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||| ||| |      
T  6166 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta----ctttctttttactttcaaagttatgttc 6260  T
Q  228 acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 325  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||    
T  6261 aaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagca 6353  T
Q  326 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  6354 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24772
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 135  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  136 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctannnnnnnnccttctactttcaaagctatatac-aaaac 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | || ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct----gctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaac 24956  T
Q  235 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 332  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24955 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggt 24862  T
Q  333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  24861 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 370 - 537
Alignment:
Q  24 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  370 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 469  T
Q  124 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 191  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  470 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 249 - 423
Target Start/End: Original strand, 1 - 175
Alignment:
Q  249 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  348 atgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaagatagtctgtggt 423  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26243
Alignment:
Q  13 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 112  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  113 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 175  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40495
Alignment:
Q  314 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccaag 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||| |    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  412 atagtctgtggt 423  Q
    ||||| ||||||    
T  40506 atagtatgtggt 40495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  37 aattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 130  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  131 tcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaattt 169  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University