View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20381_high_41 (Length: 251)

Name: NF20381_high_41
Description: NF20381
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20381_high_41
NF20381_high_41
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-243)||(29432763-29433005)
chr8 (7-235)||(14080142-14080370)
chr8 (5-235)||(19396658-19396888)
chr8 (5-233)||(36603382-36603610)
chr8 (5-235)||(41906305-41906534)
chr8 (5-235)||(44598221-44598451)
chr8 (7-235)||(22357757-22357986)
chr8 (5-235)||(45295364-45295594)
chr8 (7-235)||(33425567-33425795)
chr8 (5-235)||(42812262-42812492)
chr8 (5-235)||(41627348-41627578)
chr8 (7-235)||(23967700-23967923)
chr8 (7-235)||(42061974-42062197)
chr8 (7-235)||(44939026-44939249)
chr8 (7-235)||(30824901-30825131)
chr8 (9-235)||(6301786-6302007)
chr8 (5-235)||(12758950-12759180)
chr8 (5-235)||(41975914-41976144)
chr8 (19-220)||(39203101-39203302)
chr8 (5-220)||(38961014-38961229)
chr8 (5-220)||(38991359-38991574)
chr8 (5-235)||(41155087-41155317)
chr8 (5-235)||(44384252-44384482)
chr8 (7-235)||(37028421-37028644)
chr8 (5-186)||(19246628-19246809)
chr8 (5-186)||(19319812-19319993)
chr8 (74-235)||(20664240-20664401)
chr8 (74-235)||(30549606-30549767)
chr8 (74-235)||(44214356-44214517)
chr8 (125-235)||(27629247-27629357)
chr8 (5-68)||(23627172-23627235)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-243)||(42245902-42246133)
chr7 (5-235)||(47164885-47165115)
chr7 (5-235)||(5961404-5961634)
chr7 (5-235)||(17169765-17169995)
chr7 (5-235)||(9148097-9148327)
chr7 (5-235)||(31899107-31899337)
chr7 (5-235)||(42686274-42686504)
chr7 (5-235)||(47173195-47173425)
chr7 (7-235)||(23767764-23767992)
chr7 (8-231)||(9227553-9227775)
chr7 (5-235)||(27736376-27736606)
chr7 (5-235)||(33640013-33640243)
chr7 (5-235)||(19519300-19519534)
chr7 (5-235)||(11499337-11499567)
chr7 (21-235)||(48529078-48529292)
chr7 (7-235)||(19518731-19518960)
chr7 (7-235)||(6912671-6912894)
chr7 (7-235)||(47574649-47574872)
chr7 (5-232)||(19519874-19520105)
chr7 (5-235)||(3794218-3794443)
chr7 (11-235)||(39650267-39650491)
chr7 (5-197)||(17481092-17481284)
chr7 (5-197)||(17571930-17572122)
chr7 (5-197)||(17476646-17476838)
chr7 (5-197)||(17512289-17512481)
chr7 (5-197)||(17540733-17540925)
chr7 (5-197)||(17576376-17576568)
chr7 (7-235)||(14307628-14307866)
chr7 (7-232)||(8927222-8927449)
chr7 (74-235)||(20764171-20764332)
chr7 (74-235)||(33231274-33231435)
chr7 (74-235)||(34283417-34283578)
chr7 (5-235)||(42916564-42916785)
chr7 (74-232)||(19034977-19035135)
chr7 (74-232)||(20719501-20719659)
chr7 (74-232)||(29489749-29489907)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (5-235)||(20997260-20997490)
chr5 (5-235)||(3027126-3027356)
chr5 (5-235)||(34375723-34375953)
chr5 (5-235)||(41690014-41690244)
chr5 (11-235)||(34716333-34716557)
chr5 (5-235)||(19446811-19447041)
chr5 (5-235)||(25697838-25698067)
chr5 (5-235)||(27064569-27064799)
chr5 (19-231)||(3211523-3211735)
chr5 (7-235)||(19394158-19394386)
chr5 (5-235)||(35541182-35541412)
chr5 (8-232)||(289279-289502)
chr5 (5-232)||(3398657-3398885)
chr5 (7-235)||(4880954-4881182)
chr5 (5-235)||(3151926-3152163)
chr5 (7-235)||(31296854-31297077)
chr5 (5-235)||(12589600-12589825)
chr5 (7-235)||(33612461-33612690)
chr5 (7-235)||(1853240-1853466)
chr5 (7-235)||(2193456-2193684)
chr5 (7-235)||(26322395-26322624)
chr5 (5-197)||(20348653-20348845)
chr5 (11-235)||(30141248-30141472)
chr5 (80-235)||(7284419-7284574)
chr5 (7-203)||(21028877-21029073)
chr5 (5-210)||(12420344-12420549)
chr5 (74-235)||(37463136-37463297)
chr5 (87-219)||(18037352-18037476)
chr5 (175-235)||(30688153-30688213)
chr5 (5-68)||(9701570-9701633)
chr5 (41-91)||(18039615-18039665)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (5-235)||(7221429-7221659)
chr6 (7-235)||(1074595-1074823)
chr6 (7-235)||(18600318-18600546)
chr6 (5-235)||(9980378-9980608)
chr6 (5-235)||(24444666-24444896)
chr6 (1-220)||(25531950-25532169)
chr6 (5-235)||(1219263-1219493)
chr6 (7-219)||(3052127-3052339)
chr6 (21-235)||(15274304-15274518)
chr6 (7-235)||(14889270-14889498)
chr6 (7-235)||(34854643-34854871)
chr6 (7-235)||(13458044-13458267)
chr6 (5-204)||(4423083-4423282)
chr6 (5-235)||(33977655-33977885)
chr6 (5-235)||(34319775-34320006)
chr6 (1-225)||(2519838-2520062)
chr6 (5-235)||(7220125-7220355)
chr6 (50-232)||(17938253-17938434)
chr6 (7-235)||(1080921-1081149)
chr6 (74-235)||(248682-248843)
chr6 (74-235)||(12581110-12581271)
chr6 (76-220)||(3089377-3089521)
chr6 (11-235)||(11937118-11937333)
chr6 (156-235)||(22375178-22375257)
chr6 (111-228)||(11517713-11517830)
chr6 (21-117)||(11517943-11518039)
chr6 (127-228)||(11269536-11269637)
chr6 (8-117)||(11269299-11269409)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (1-235)||(54794278-54794512)
chr3 (5-232)||(18742115-18742342)
chr3 (5-235)||(48975384-48975614)
chr3 (5-235)||(52841846-52842076)
chr3 (7-235)||(6105438-6105666)
chr3 (5-235)||(8241407-8241637)
chr3 (5-235)||(16494582-16494812)
chr3 (5-235)||(54648834-54649064)
chr3 (8-235)||(35435680-35435907)
chr3 (5-235)||(40828251-40828481)
chr3 (11-235)||(11952601-11952825)
chr3 (5-235)||(16340375-16340602)
chr3 (7-235)||(31370341-31370569)
chr3 (7-235)||(39797654-39797877)
chr3 (5-235)||(21700882-21701112)
chr3 (5-235)||(52854765-52854995)
chr3 (7-235)||(35089159-35089387)
chr3 (48-235)||(51247115-51247302)
chr3 (5-235)||(17911075-17911304)
chr3 (7-235)||(5253566-5253789)
chr3 (8-235)||(12169258-12169486)
chr3 (11-235)||(49111785-49112004)
chr3 (5-229)||(2846077-2846305)
chr3 (5-235)||(23192233-23192463)
chr3 (7-197)||(50772557-50772747)
chr3 (7-197)||(50740106-50740297)
chr3 (5-235)||(22476419-22476639)
chr3 (8-235)||(36168776-36169007)
chr3 (98-235)||(11326966-11327103)
chr3 (74-235)||(917469-917630)
chr3 (74-235)||(44074034-44074195)
chr3 (125-235)||(55296103-55296213)
chr3 (5-91)||(52463389-52463475)
chr3 (5-93)||(11327299-11327387)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (7-235)||(42884131-42884359)
chr2 (5-235)||(16882669-16882899)
chr2 (5-235)||(17040359-17040589)
chr2 (11-233)||(30568181-30568403)
chr2 (8-235)||(33905036-33905263)
chr2 (21-235)||(4291960-4292174)
chr2 (5-235)||(19168941-19169171)
chr2 (5-235)||(26826265-26826494)
chr2 (5-235)||(28607960-28608190)
chr2 (21-235)||(9544938-9545152)
chr2 (5-235)||(10049308-10049538)
chr2 (5-231)||(36634404-36634630)
chr2 (6-235)||(18094037-18094265)
chr2 (7-235)||(21096439-21096667)
chr2 (8-227)||(14751911-14752129)
chr2 (5-231)||(45206284-45206510)
chr2 (7-235)||(6344037-6344260)
chr2 (7-235)||(14324521-14324744)
chr2 (7-235)||(1994249-1994472)
chr2 (5-197)||(9918050-9918242)
chr2 (7-235)||(28501025-28501248)
chr2 (7-235)||(26820368-26820586)
chr2 (74-235)||(3709716-3709877)
chr2 (74-235)||(11867539-11867700)
chr2 (74-235)||(35358932-35359093)
chr2 (127-235)||(4810407-4810515)
chr2 (125-228)||(7360888-7360991)
chr2 (8-117)||(7360654-7360763)
chr2 (149-232)||(33665091-33665174)
chr2 (5-95)||(4810305-4810395)
chr2 (5-68)||(17091164-17091227)
chr2 (8-68)||(17036659-17036719)
chr2 (5-68)||(17024979-17025042)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (5-235)||(28567028-28567258)
chr1 (5-235)||(4890839-4891069)
chr1 (5-235)||(29187418-29187648)
chr1 (5-235)||(33360441-33360671)
chr1 (7-235)||(31618400-31618629)
chr1 (7-235)||(34686299-34686527)
chr1 (5-235)||(13663726-13663956)
chr1 (5-235)||(29841996-29842226)
chr1 (7-235)||(10695500-10695728)
chr1 (7-235)||(18812930-18813158)
chr1 (7-231)||(41831369-41831592)
chr1 (7-235)||(41964240-41964468)
chr1 (5-235)||(51967042-51967271)
chr1 (7-235)||(18110434-18110657)
chr1 (7-235)||(43255864-43256087)
chr1 (7-235)||(50396278-50396501)
chr1 (5-235)||(42681106-42681331)
chr1 (7-235)||(34690837-34691065)
chr1 (5-232)||(52308545-52308772)
chr1 (9-235)||(18095526-18095752)
chr1 (5-235)||(38846534-38846764)
chr1 (5-235)||(50559760-50559990)
chr1 (5-235)||(48339104-48339333)
chr1 (21-220)||(49225006-49225202)
chr1 (7-235)||(52522879-52523096)
chr1 (8-170)||(17709794-17709960)
chr1 (1-123)||(21729456-21729578)
chr1 (126-235)||(15314084-15314193)
chr1 (7-105)||(10700519-10700617)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (12-235)||(28971820-28972043)
chr4 (5-235)||(33504326-33504556)
chr4 (5-235)||(52799765-52799995)
chr4 (5-235)||(56000038-56000268)
chr4 (11-235)||(35496853-35497078)
chr4 (7-235)||(19832725-19832953)
chr4 (5-235)||(1943219-1943449)
chr4 (7-233)||(28136396-28136622)
chr4 (5-234)||(17738762-17738991)
chr4 (7-235)||(34057903-34058131)
chr4 (5-232)||(39715839-39716066)
chr4 (11-231)||(575347-575567)
chr4 (7-235)||(5275084-5275312)
chr4 (7-235)||(14830849-14831077)
chr4 (7-235)||(23477626-23477854)
chr4 (5-235)||(7645450-7645680)
chr4 (5-235)||(36855851-36856080)
chr4 (5-235)||(39746184-39746414)
chr4 (5-235)||(53341129-53341359)
chr4 (7-235)||(15519575-15519798)
chr4 (5-235)||(19589567-19589797)
chr4 (7-235)||(741617-741840)
chr4 (5-235)||(16903992-16904225)
chr4 (7-235)||(15656150-15656377)
chr4 (5-235)||(13626771-13627002)
chr4 (5-235)||(35713450-35713675)
chr4 (74-235)||(10260646-10260807)
chr4 (74-235)||(21563648-21563809)
chr4 (74-235)||(26925588-26925749)
chr4 (74-235)||(43331169-43331330)
chr4 (74-235)||(51451235-51451396)
chr4 (74-235)||(24078716-24078877)
chr4 (8-235)||(47721403-47721628)
chr4 (127-235)||(40620988-40621096)
chr4 (21-117)||(16891768-16891864)
chr4 (127-228)||(16891991-16892092)
chr4 (5-91)||(41984705-41984791)
chr4 (5-118)||(40618528-40618641)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (5-235)||(19697-19927)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-235)||(8632-8860)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (5-235)||(65951-66181)
scaffold0006 (5-235)||(153491-153721)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (5-235)||(12509-12739)
[»] scaffold1884 (1 HSPs)
scaffold1884 (5-233)||(531-759)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (7-235)||(27683-27911)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (5-235)||(16654-16884)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (8-235)||(14170-14396)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (8-235)||(48771-48999)
scaffold0051 (8-203)||(64156-64352)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (5-235)||(118743-118973)
scaffold0010 (5-218)||(59319-59532)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (21-220)||(5592-5791)
scaffold0032 (21-220)||(12041-12240)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (179-235)||(13795-13851)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29432763 - 29433005
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29432763 tgttagcatcagatgataaaattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtagaaatatggttgatgtaacactatgagaa 29432862  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29432863 aaatacttcgtagctttaccatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacctaaatatatacaacaattggtcag 29432962  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtttcttctca 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29432963 gttcgaggctgctcatcaacttacatcatccagtttcttctca 29433005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14080370 - 14080142
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14080370 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 14080271  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14080270 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 14080171  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14080170 ggctgctcatcaacctacatcatccggtt 14080142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19396888 - 19396658
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19396888 agcatcggatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 19396789  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19396788 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 19396689  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19396688 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 19396658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36603610 - 36603382
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36603610 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtaatgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 36603511  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36603510 actccgtagctttatcatttaccatctatttagcttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 36603411  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccgg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36603410 gaggctgctcatcaacgtacatcatccgg 36603382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41906305 - 41906534
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41906305 agcatcagatgataagattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtgacactatg-gaaaaat 41906403  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41906404 atttcgtagctttatcatttaccatatatttaccctgagtactttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41906503  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41906504 gaggctgctcatcaacctatatcatccggtt 41906534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 44598221 - 44598451
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44598221 agcatcagatgttagaattttgtataagtttgataatgacccgaataatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 44598320  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44598321 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 44598420  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44598421 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 44598451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22357986 - 22357757
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-agaaaaata 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22357986 catcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaata 22357887  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22357886 ctccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcg 22357787  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22357786 aggctgctcatcaacctacatcatccggtt 22357757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45295594 - 45295364
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45295594 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 45295495  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45295494 attttgtagctttatcatttatcatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattgatcaggttt 45295395  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  45295394 gaggttgatcatcaacctacattatccggtt 45295364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33425795 - 33425567
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33425795 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtttttccttatatagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 33425696  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33425695 ttcgtagctttatcatttaccatctatttaacttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 33425596  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33425595 ggttgctcattaacctacatcatccggtt 33425567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42812492 - 42812262
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42812492 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataattacccgaaagatgtctttcctaatgtagtggaaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 42812393  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||     
T  42812392 acgccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaataattggtcagatta 42812293  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42812292 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 42812262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41627348 - 41627578
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  41627348 agcatcagatgataggattttgtataagtttgatgatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactataggaaaaat 41627447  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  41627448 actctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaactcaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41627547  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  41627548 gaggtttttcatcaacctacatcatccggtt 41627578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23967923 - 23967700
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23967923 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 23967824  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23967823 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 23967729  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23967728 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 23967700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42062197 - 42061974
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42062197 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 42062098  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42062097 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 42062003  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42062002 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 42061974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 44939026 - 44939249
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44939026 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 44939125  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44939126 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 44939220  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44939221 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 44939249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 30824901 - 30825131
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg--agaaaaat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| || | |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  30824901 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaaat 30825000  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30825001 actctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaggtctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 30825100  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30825101 gaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 30825131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6302007 - 6301786
Alignment:
Q  9 tcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatactt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6302007 tcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatactc 6301908  T
Q  109 cgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgagg 208  Q
     ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6301907 tgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgagg 6301813  T
Q  209 ctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6301812 ctgctcatcaacctacattatccggtt 6301786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 12758950 - 12759180
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  12758950 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatataacactatgggaaaaat 12759049  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  12759050 attacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatgacaacccaaatatatataacaattagtcaggttc 12759149  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12759150 gaggctgatcatcaacctacattatccggtt 12759180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41975914 - 41976144
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41975914 agcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 41976013  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41976014 attccgtagctttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41976113  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||| ||| |||||  |||||||    
T  41976114 gaggttgctcattaacctacattttccggtt 41976144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 39203101 - 39203302
Alignment:
Q  19 aaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagcttta 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39203101 aaattttgtataagtttgataatgatctgaaatatgtatttccttatgcagtgggaatatggttggattaacactatgggaaaaatactttgtagcttta 39203200  T
Q  119 ccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatca 218  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  39203201 tcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaatcaaaatatatgtaacaattggtcaggttcgagactgcttatca 39203300  T
Q  219 ac 220  Q
    ||    
T  39203301 ac 39203302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 38961014 - 38961229
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38961014 agcattagatgataggattttgtataagtttggtaatgatccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaaat 38961113  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38961114 actttgtaactttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcatccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 38961213  T
Q  205 gaggctgctcatcaac 220  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38961214 gaggctgttcatcaac 38961229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 38991359 - 38991574
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38991359 agcattagatgataggattttgtataagtttggtaatgatccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaaat 38991458  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38991459 actttgtaactttatcatttaacatctatttaccttgagttctttgcatccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 38991558  T
Q  205 gaggctgctcatcaac 220  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38991559 gaggctgttcatcaac 38991574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41155087 - 41155317
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  41155087 agcataaggtgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaact 41155186  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41155187 atttcgtagctttttcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41155286  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||||||    
T  41155287 gaggctgttcatttacctacattatccggtt 41155317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44384482 - 44384252
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||| |||||| | ||   |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  44384482 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaaaatgtcttttcttatgtagtgaggatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 44384383  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44384382 atttcgtagctttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgcagttaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 44384283  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44384282 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 44384252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 37028421 - 37028644
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37028421 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttctttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaatac 37028520  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||     |||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37028521 tccgtagcttgatcatttaccatctatttatcttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 37028615  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37028616 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 37028644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 19246628 - 19246809
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19246628 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatggttgatgtaacactatgggaaatat 19246727  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatg 186  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19246728 attccgtagctttataatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatg 19246809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 19319812 - 19319993
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19319812 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatggttgatgtaacactatgggaaatat 19319911  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatg 186  Q
    | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19319912 attccgtagctttataatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatg 19319993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20664401 - 20664240
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20664401 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 20664302  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20664301 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 20664240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30549767 - 30549606
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30549767 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 30549668  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30549667 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 30549606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44214517 - 44214356
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44214517 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 44214418  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44214417 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 44214356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 27629247 - 27629357
Alignment:
Q  125 accatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttac 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  27629247 accatctatttatcttgagttctttgcttccattttgtacacaatgacatgacagatatatgtaacaattggttaggttcgaggctgctcatcaacctac 27629346  T
Q  225 atcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||    
T  27629347 atcatctggtt 27629357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23627235 - 23627172
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgca 68  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23627235 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca 23627172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42246133 - 42245902
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42246133 tgttagcatcagatgataaaattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtagaaatatggttgatgtaacactatgagaa 42246034  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42246033 aaatacttcgtagctttacc-----------atttaccttgagtcctttgcttccatttcgtagtcaattgcaacccaaatatatgcaacaattggtcag 42245945  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtttcttctca 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245944 gtttgaggcttctcatcaacttacatcatccggtttcttctca 42245902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47165115 - 47164885
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  47165115 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgatctaaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggctgatgtaacaccatgggaaaaat 47165016  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  47165015 acttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 47164916  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  47164915 gaggttgttcatcaacctacatcatccggtt 47164885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 5961404 - 5961634
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5961404 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 5961503  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  5961504 actatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatacatgtaacaattggtcaggttc 5961603  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5961604 gaggctgctcatcaacctacatcatgcggtt 5961634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 17169765 - 17169995
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17169765 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17169864  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17169865 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 17169964  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17169965 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 17169995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 9148097 - 9148327
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  9148097 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggtaaaaat 9148196  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  9148197 atttcgaagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatttatgtaacaattggtcaggttc 9148296  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9148297 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 9148327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31899337 - 31899107
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31899337 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaat 31899238  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  31899237 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttc 31899138  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  31899137 gaggctgctcatcaacctacattattcggtt 31899107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 42686274 - 42686504
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42686274 agcatcagatgataggtttttttataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaact 42686373  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  42686374 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtcaatgacaatccaaatatatgtaataattggtcaggttc 42686473  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42686474 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 42686504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 47173195 - 47173425
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47173195 agcatcagatgatagaattttgtataagtttaataatgacttgaaagatgtctttccttatggagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 47173294  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  47173295 actctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatataaaacaattggtcaggttc 47173394  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  47173395 gagactgctcatcaacctacaccatccggtt 47173425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23767992 - 23767764
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| || | |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23767992 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 23767893  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23767892 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 23767793  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||    
T  23767792 ggttggtcatcaacctacatcatccggtt 23767764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9227775 - 9227553
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  9227775 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtaacactgtggaaaaaatact 9227676  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  9227675 tcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgctt-cattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgag 9227577  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatcc 231  Q
    |||| |||||||| || |||||||    
T  9227576 gctggtcatcaacctagatcatcc 9227553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27736606 - 27736376
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27736606 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactattggaaaaat 27736507  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  27736506 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaaccaaaatatatgtaacaattggtcaggttc 27736407  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27736406 gaggctgctcatcaacctacattattcggtt 27736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33640243 - 33640013
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33640243 agcataagatgataggattttgtataagtttaataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagcgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 33640144  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  33640143 attttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 33640044  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33640043 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 33640013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 19519300 - 19519534
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg---agaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||   | |||    
T  19519300 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaa 19519399  T
Q  102 aatacttcgtagctttaccattcaccatctattt-accttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19519400 aatactccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcag 19519499  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19519500 gttcgaggctgctcgtcaacctacatcatccggtt 19519534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 11499337 - 11499567
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11499337 agcagcagatgataggattttgtataagtttgataatgatccgaaagatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaaat 11499436  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||     
T  11499437 actacgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttatttgtttccattttgtagtcaatgacagcccaaatatatgtaacaattgatcaggttc 11499536  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11499537 gaggttgctcatcaacctacatcattcggtt 11499567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48529292 - 48529078
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |    
T  48529292 attttgtataattttgataatgatctgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaatatttcgtagccttatc 48529193  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  48529192 atttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaatttttcaggtttgaggttgttcatcaac 48529093  T
Q  221 ttacatcatccggtt 235  Q
     ||||| ||||||||    
T  48529092 ctacattatccggtt 48529078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 19518731 - 19518960
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  19518731 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaatat 19518830  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctattt-accttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  19518831 tccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaacccaaatatatgtaaaaattggtcaggttcg 19518930  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19518931 aggctgctcgtcaacctacatcatccggtt 19518960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6912894 - 6912671
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6912894 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 6912795  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6912794 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 6912700  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6912699 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 6912671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47574872 - 47574649
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  47574872 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 47574773  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  47574772 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 47574678  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47574677 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 47574649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 19519874 - 19520105
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg---agaaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||   | |||    
T  19519874 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaa 19519973  T
Q  102 aatacttcgtagctttaccattcaccatctattt-accttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19519974 aatactccgtagctttatcatttaccatctattttaccttgagttctttgcttccattttgtattcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcag 19520073  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  19520074 gttcgaggctgttcgtcaacctacatcatccg 19520105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 3794218 - 3794443
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3794218 agcataagatgatagaattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 3794317  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |     
T  3794318 attccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaactcaaatatatgtaacaattggt-----tc 3794412  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  3794413 gaggctgctcatcaacctacattatctggtt 3794443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39650491 - 39650267
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39650491 agatgataggattttgtataagtttgttaatgacctgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcg 39650392  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  39650391 tagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaaatatatataacaattggtcaggttcgaggct 39650292  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||||| ||||| || |||||    
T  39650291 actcatcaacctacattattcggtt 39650267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 17481092 - 17481284
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17481092 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17481191  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17481192 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggt 17481284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17572122 - 17571930
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17572122 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17572023  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17572022 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggt 17571930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 17476646 - 17476838
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17476646 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17476745  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17476746 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggt 17476838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 17512289 - 17512481
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17512289 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17512388  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17512389 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatctcaacccaaatatatgtaacaattggt 17512481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17540925 - 17540733
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17540925 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17540826  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17540825 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatctcaacccaaatatatgtaacaattggt 17540733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17576568 - 17576376
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17576568 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 17576469  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17576468 actccgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggt 17576376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 14307628 - 14307866
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactat--gagaaaaat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  14307628 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtcttcccttatgtaatgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaaaat 14307727  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccattt--------cgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattgg 196  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  14307728 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcatgtagtcaatggaaacccaaatatatgtaacaattgg 14307827  T
Q  197 tcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14307828 tcgggttcgaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 14307866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8927449 - 8927222
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa--t 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  8927449 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgcaacactatgggaaaaaaat 8927350  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  8927349 actctgtagctttatcatttatcatctatttaccttgagtttcttgcttccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggctc 8927250  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8927249 gaggttgctcatcaacctacatcatccg 8927222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 20764171 - 20764332
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20764171 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 20764270  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20764271 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 20764332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33231435 - 33231274
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33231435 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 33231336  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33231335 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 33231274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34283578 - 34283417
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34283578 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 34283479  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34283478 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 34283417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 42916564 - 42916785
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  42916564 agcatcagatgataggattttgtataaatttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 42916663  T
Q  105 acttc--gtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggt 202  Q
    |  |   ||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  42916664 atattatgtagctttatcatt-----------taccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtgtggt 42916752  T
Q  203 ttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  42916753 tcgaggctgatcatcaacctacattatccggtt 42916785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19035135 - 19034977
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19035135 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 19035036  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19035035 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccg 19034977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 20719501 - 20719659
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20719501 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 20719600  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20719601 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccg 20719659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 29489749 - 29489907
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29489749 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 29489848  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29489849 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccg 29489907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20997490 - 20997260
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20997490 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtatttccttatgtagtggaaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 20997391  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20997390 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 20997291  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20997290 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 20997260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 3027126 - 3027356
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3027126 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtattttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgaggaaaat 3027225  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  3027226 acttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggttaggttc 3027325  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3027326 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 3027356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34375953 - 34375723
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34375953 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtggcaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 34375854  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34375853 actacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 34375754  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34375753 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 34375723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41690014 - 41690244
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41690014 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 41690113  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41690114 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 41690213  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41690214 gaagctgctcatcaacctacattatccggtt 41690244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 34716333 - 34716557
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34716333 agatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcg 34716432  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34716433 tagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 34716532  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  34716533 gctcatcaacctacattatccggtt 34716557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 19446811 - 19447041
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  19446811 agcatcagatgataggattttgtataagttttataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 19446910  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  19446911 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgaagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattgttcaggttc 19447010  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19447011 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 19447041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25698067 - 25697838
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25698067 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcgttagaa-tatagttgatgtaacactatgagaaaaat 25697969  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  25697968 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattgtgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttc 25697869  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25697868 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 25697838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 27064569 - 27064799
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  27064569 agcattagatgataggattttgtataagtttgataatgacccggaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagctgatgtaacactatggaaaaaat 27064668  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  27064669 actccgtagctttaccatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattgatcaggttc 27064768  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27064769 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 27064799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3211735 - 3211523
Alignment:
Q  19 aaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagcttta 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3211735 aaattttgtataagtttaataatgacctgaaatatgtatttccttatgtagtgggaatatggttgatgtaacactatgggaaaaatacttcgtagcttta 3211636  T
Q  119 ccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatca 218  Q
     | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3211635 tcttttaccatatatttacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatca 3211536  T
Q  219 acttacatcatcc 231  Q
    || ||||| ||||    
T  3211535 acctacattatcc 3211523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 19394158 - 19394386
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  19394158 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaaatac 19394257  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |  ||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19394258 tctgtagcttgattatttaccatttatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 19394357  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19394358 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 19394386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35541412 - 35541182
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  35541412 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 35541313  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  35541312 attccgtagctttatcatttaccatctatttatcttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattagtcaggttc 35541213  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35541212 gaggctactcatcaacctacatcatccggtt 35541182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 289279 - 289502
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  289279 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatggttgatgtaacattatggaaaaaatact 289378  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  289379 tcgtggctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaa-ccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgag 289477  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  289478 gctggtcatcaacctacatcatccg 289502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3398885 - 3398657
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3398885 agcatcagatgataggattttgtttaagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgttgtgtaaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 3398786  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaa-ttggtcaggtt 203  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3398785 actccgtagctttatcatttaccttctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacgacaatccaaatatatgtaacaatttggtcaggtt 3398686  T
Q  204 tgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3398685 cgaggctgctcatcaacctacatcatccg 3398657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 4880954 - 4881182
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4880954 catcagatgataagattttgtataagtttgataataacccgaaagatatctttccttatgtaataagaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatac 4881053  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4881054 ttcgtagttatatcatttaccatctatttaccttgagttctttgctttcattttgtagtcaatgataacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 4881153  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4881154 ggctgctcatggacctacatcatccggtt 4881182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3152163 - 3151926
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaa-------gatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatga 97  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||       ||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  3152163 agcatcaaatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgg 3152064  T
Q  98 gaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3152063 aaaaaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttctattttgtagtcaatgacaatccaaatatatgtaacaattggt 3151964  T
Q  198 caggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3151963 caggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 3151926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31297077 - 31296854
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31297077 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 31296978  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     |||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31296977 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 31296883  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31296882 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 31296854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12589825 - 12589600
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12589825 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 12589726  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |     
T  12589725 attccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggt-----tc 12589631  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12589630 gaggctgctcatcaacctgcattatccggtt 12589600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33612690 - 33612461
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-agaaaaata 105  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  33612690 catcagatgatagaattttgaataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaata 33612591  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  33612590 ctccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagtttcttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatataacaattggtaaggttcg 33612491  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33612490 aggttgctcatcaacctacatcatccggtt 33612461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1853466 - 1853240
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||    
T  1853466 catcagatgatagaattgtgtataagtttgataatgacccgaaatatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaa-tac 1853368  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || ||    
T  1853367 ttcgtagctttatcatttatcgtctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatat-tgtaacaattggtcatcttcga 1853269  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1853268 ggctgctcatcgacctacatcatccggtt 1853240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 2193456 - 2193684
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||| |||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  2193456 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccaaaaaatgtcttttcttatgtagtgggaatatagctgatgtaacactatgggaaaaatac 2193555  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2193556 tccgtagctttatcgtttaccatctatttaccttaagttccttccttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 2193655  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2193656 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 2193684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26322624 - 26322395
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa-ta 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26322624 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaaata 26322525  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
    || |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  26322524 ctccgtaactttatcatttactatctatttaccttgagttcctttcttgcattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtgaggttcg 26322425  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26322424 aggttgctcatcaacctacatcatccggtt 26322395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 20348653 - 20348845
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  20348653 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgagaatatatttgatgtaacactatgggaaaaat 20348752  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20348753 acttcgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggt 20348845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 30141248 - 30141472
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30141248 agatgataggattttgtatacgtttgttaatgacctgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcg 30141347  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  30141348 tagctttatcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaaatatatataataattggtcaggttcgaggct 30141447  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||||| ||||| || |||||    
T  30141448 actcatcaacctacattattcggtt 30141472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 7284419 - 7284574
Alignment:
Q  80 gttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  7284419 gttgatgtaacactatgagaaaaatactccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtaaatggcaacccaa 7284518  T
Q  180 atatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  7284519 atatatgtaacaattggtcaggttcgaggttgcttatcaacctacatcatccggtt 7284574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 21028877 - 21029073
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  21028877 catcatatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgttttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaataa 21028976  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtt 203  Q
    |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21028977 tatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggtt 21029073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12420549 - 12420344
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  12420549 agcattagatgatatgattttgtataagtttgataataagctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaacactatggaaaaaat 12420450  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12420449 attatgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaatcccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 12420350  T
Q  205 gaggct 210  Q
    ||||||    
T  12420349 gaggct 12420344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 37463136 - 37463297
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37463136 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttatcttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 37463235  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37463236 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 37463297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18037476 - 18037352
Alignment:
Q  87 taacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatg 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||         |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18037476 taacactatgggaaaaatacttcgtagttttatcatttatcatctatttacctg--------tgcttctattttatagtcaatgacaacccaaatatatg 18037385  T
Q  187 caacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaa 219  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18037384 taacaattggtcaagttcgaggctgctcatcaa 18037352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 30688153 - 30688213
Alignment:
Q  175 cccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30688153 cccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 30688213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 9701570 - 9701633
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgca 68  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9701570 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca 9701633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18039665 - 18039615
Alignment:
Q  41 tgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaaca 91  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18039665 tgatttgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaaca 18039615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 7221429 - 7221659
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7221429 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 7221528  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7221529 acttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 7221628  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7221629 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 7221659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1074823 - 1074595
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1074823 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 1074724  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1074723 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 1074624  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1074623 ggctgctcatcaacctacatcatccggtt 1074595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18600546 - 18600318
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18600546 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 18600447  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18600446 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 18600347  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18600346 ggctgctcatcaacctacatcatccggtt 18600318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9980608 - 9980378
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9980608 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 9980509  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9980508 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 9980409  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9980408 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 9980378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 24444666 - 24444896
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24444666 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 24444765  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24444766 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 24444865  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24444866 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 24444896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 25531950 - 25532169
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25531950 tgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgagaa 25532049  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25532050 aaatatttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcatccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcag 25532149  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  25532150 gttcgaggatgctcatcaac 25532169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 1219263 - 1219493
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1219263 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgaccttaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 1219362  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1219363 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttcttggcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 1219462  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1219463 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 1219493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3052339 - 3052127
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3052339 catcagatggtaagattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaacactatgggaaaaatat 3052240  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  3052239 tttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaaccaaaatatatgtaacaattggtcaagttcga 3052140  T
Q  207 ggctgctcatcaa 219  Q
    |||| ||||||||    
T  3052139 ggctactcatcaa 3052127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 15274304 - 15274518
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  15274304 attttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtaggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagctttatc 15274403  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274404 atttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaaacaaaatatatgtaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 15274503  T
Q  221 ttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||||| ||||    
T  15274504 ctacatcatcaggtt 15274518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14889498 - 14889270
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  14889498 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgaagtgggaatatagttgatgtaacactataggaaaaatac 14889399  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14889398 tccgtagatttatcatttaccatctatttactttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 14889299  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14889298 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 14889270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 34854643 - 34854871
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34854643 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgcctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 34854742  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34854743 tccgtagctttatcatttaccgtctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 34854842  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  34854843 ggttgctcatcaacctccatcatccggtt 34854871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13458267 - 13458044
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13458267 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 13458168  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13458167 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 13458073  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13458072 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 13458044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 4423083 - 4423282
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  4423083 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatctagttgatgtaacactgtgggaaaaat 4423182  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4423183 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttt 4423282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 33977655 - 33977885
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  33977655 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcctttcttatgcagtggtaatatagttgatgtaacactatgggtaaaat 33977754  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  33977755 actctgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatagatgtaacaattggtcaggttc 33977854  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33977855 gaggctgttcatcaacctacatcatccggtt 33977885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 34319775 - 34320006
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttc-cttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa 103  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  34319775 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttctcttatgcagtgggaatatagtcgatgtaacactatgggtaaaa 34319874  T
Q  104 tacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtt 203  Q
    || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  34319875 tatttcgtagctttatcatttacaatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatatatgtaagaattggttaggtt 34319974  T
Q  204 tgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  34319975 cgaggctgatcatcaacctacattatccggtt 34320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2519838 - 2520062
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | |||| || | |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2519838 tgttaacatcagatgatagaattttgtataagtttaataatgacccgaaaaatctctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaa 2519937  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2519938 aaatactccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccagatatatgtaacaattggtcag 2520037  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttaca 225  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  2520038 gttcgaggttgctcatcaacctaca 2520062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7220355 - 7220125
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7220355 agcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 7220256  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||     
T  7220255 actcagtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccatattgtagtcaaagacaaaccaaatatatgtaacaattagtcaagttc 7220156  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  7220155 gaggctaatcatcaacctacataatccggtt 7220125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 17938253 - 17938434
Alignment:
Q  50 agatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttcttt 149  Q
    |||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17938253 agatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatg-gaaaaatattttatagctttatcatttactatctatttaccttgagttcttt 17938351  T
Q  150 gcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17938352 gcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcattaacctacatcatccg 17938434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1081149 - 1080921
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||| | ||| | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  1081149 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccatatgtagtggga-tatagttaatgcaacactatggaaaaaatac 1081051  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1081050 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 1080951  T
Q  207 -ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1080950 cggttgctcatcaacctacatcatccggtt 1080921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 248682 - 248843
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  248682 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 248781  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  248782 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 248843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12581271 - 12581110
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12581271 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 12581172  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12581171 acgcaaatagatgtaacaattggtcaagttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 12581110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3089521 - 3089377
Alignment:
Q  76 tatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaac 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3089521 tatggttgatgtaacactataggaaaaatacttcgtaactttatcatttaccatatatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgacaac 3089422  T
Q  176 ccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3089421 acaaataaatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 3089377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11937333 - 11937118
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||  | ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  11937333 agatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatatagtgggaatataattgatgtaacactatgggaaaaataatctg 11937234  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  11937233 tatctttatcatttaccatctatttaccttg---------cttccattttgtagtcaatgaaaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggtt 11937143  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  11937142 gctcatcaacctacatcatccggtt 11937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22375257 - 22375178
Alignment:
Q  156 atttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22375257 attttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgcacatcaacctacatcatccggtt 22375178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11517830 - 11517713
Alignment:
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11517830 tagctttgtcatttaccatctatttaccttgagttatttgcttccattttaaagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggct 11517731  T
Q  211 gctcatcaacttacatca 228  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  11517730 gctcattaacctacatca 11517713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11518039 - 11517943
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagcttt 117  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  11518039 attttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgcaatggcaatatgattgatgtaacacaatgggaaaaatactccgtagcttt 11517943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 11269536 - 11269637
Alignment:
Q  127 catctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  11269536 catctatttaccttgagttatttgcttccattttaaagaaaatgacaagtcaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggttgctcattaacctacat 11269635  T
Q  227 ca 228  Q
    ||    
T  11269636 ca 11269637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Original strand, 11269299 - 11269409
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgc-aatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11269299 atcaaatgataggattttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgccaatgacaatatgattgatgtaacacaatgggaaaaatac 11269398  T
Q  107 ttcgtagcttt 117  Q
    | |||||||||    
T  11269399 tccgtagcttt 11269409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54794512 - 54794278
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  54794512 tgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtatttccctatgtagtgggaatatggtagatgtaacactatgtgaa 54794413  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54794412 aaatacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcag 54794313  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  54794312 gtttgaggctgttaatcaacctacatcatccggtt 54794278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18742342 - 18742115
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18742342 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 18742243  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  18742242 actctgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttggttccattttgtagtcaatgacaacacaaatatatgtaacaattggtcaggttc 18742143  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18742142 gaggctgctcatcaacctacatcatccg 18742115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 48975384 - 48975614
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  48975384 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatatggttgatgtaacactatggaaaaaat 48975483  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  48975484 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 48975583  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  48975584 gagactgttcatcaacctacatcagccggtt 48975614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52842076 - 52841846
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  52842076 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 52841977  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  52841976 acttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaattgcaaccaaaatatatgtaacaattggtcaggttc 52841877  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52841876 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 52841846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6105666 - 6105438
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  6105666 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactttgggaaaaatac 6105567  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6105566 tccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 6105467  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6105466 ggctgctcatcaacctacatcatccggtt 6105438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 8241407 - 8241637
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  8241407 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtagcattatgagaaaaat 8241506  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  8241507 actttgtagctttatcatttaccatctatttactttgagttctttgctaccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 8241606  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8241607 gagtctgctcatcaacccacatcatccggtt 8241637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 16494582 - 16494812
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  16494582 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaacactatgggaaaaat 16494681  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16494682 acttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaacaattagtcaggttt 16494781  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16494782 gaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 16494812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54649064 - 54648834
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  54649064 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccgtatgtagtgggaatatagttggtgtaacactatggaaaaaat 54648965  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  54648964 acttcatagctttatcatttaccatctatttagcttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 54648865  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54648864 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 54648834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 35435680 - 35435907
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  35435680 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtgggaatatagttgatgtaacattatggaaaaaatact 35435779  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  35435780 tcgtggctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaatttgtcaggttcgag 35435879  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35435880 gctgatcatcaacctacatcatccggtt 35435907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40828481 - 40828251
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  40828481 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactacaggaaaaat 40828382  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40828381 attccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 40828282  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40828281 gaggttgctcatcaacctacattatccggtt 40828251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11952825 - 11952601
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  11952825 agatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaatattccg 11952726  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  11952725 tagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaaccgaaatatatgtaacaattggttaggttcgaggct 11952626  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  11952625 gctcatcaacctacattatccggtt 11952601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 16340375 - 16340602
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16340375 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtccttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 16340474  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16340475 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaaccaaaatatatgtaacaattggtcaggttt 16340574  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||   |||||||||| || |||||||||||    
T  16340575 gag---gctcatcaacctatatcatccggtt 16340602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31370569 - 31370341
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31370569 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttctttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 31370470  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31370469 tccgtacctttatcatttaccatctatttaccttaagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 31370370  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31370369 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 31370341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39797877 - 39797654
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39797877 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 39797778  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39797777 ttcgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 39797683  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39797682 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 39797654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21701112 - 21700882
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21701112 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacgcgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatataattgatgtaacactatgggaaaaat 21701013  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21701012 actccgtagctttatcatttaccatctttttactttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 21700913  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21700912 aaggctgctcgtcaacctacatcatccggtt 21700882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52854995 - 52854765
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52854995 agcatcatatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 52854896  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  52854895 attccgtagctttatcatttaccatttatttaccttgatttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaaatttatgtaacaattggtcaggttt 52854796  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52854795 gaggctgctcatcaacctacatcatctggtt 52854765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35089387 - 35089159
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35089387 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 35089288  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35089287 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 35089188  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35089187 ggttgctcatcaacctacattatccggtt 35089159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 51247115 - 51247302
Alignment:
Q  48 aaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttct 147  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51247115 aaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttatcatttaccgtctatttaccttgagttat 51247214  T
Q  148 ttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51247215 ttgcttccattttgtagtcaatggcaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 51247302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17911304 - 17911075
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||| |||| |||||||    
T  17911304 agcatcagatgattgaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtaatagaa-tatagtagatgttacattatgggaaaaat 17911206  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  17911205 actccgtagctttatcatttaccatctatataccttgagttctttgcttccgttttgtagtcaatgacaacccaaataaatgtaacaattggtcaggttc 17911106  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17911105 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 17911075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5253789 - 5253566
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5253789 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 5253690  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     |||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5253689 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 5253595  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5253594 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 5253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12169486 - 12169258
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactat-gagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12169486 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacatgaaagaagtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaacactatagaaaaaaatac 12169387  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12169386 ttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtattcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 12169287  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12169286 ggatgctcatcaacctacatcatctggtt 12169258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 49111785 - 49112004
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49111785 agatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtgacactatgggaaaaatacttcg 49111884  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49111885 tagctttatcatttactatctatttaccttgagttctttgcatccattttgtagtcaatg-----gcaaatatatgtaacaattggtcaggtttgaggct 49111979  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  49111980 gctcatcaacctacatcatccggtt 49112004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2846305 - 2846077
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  2846305 agcatcagatgatagaattttgtatacatttaataatgacctgaaagatgtctttccttatgcaccgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaag 2846206  T
Q  104 ---tacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcag 200  Q
       ||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  2846205 gcatactttgtggctttattatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatggcagcccaaatatatgtaacaattggtcag 2846106  T
Q  201 gtttgaggctgctcatcaacttacatcat 229  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2846105 gttcgaggctgctcatcaacctacatcat 2846077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 23192233 - 23192463
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||  |||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  23192233 agcatcagatgatatgattttatataagtttagtaatgacccgaaatatgtttttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaagt 23192332  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  23192333 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaaatatatgtaacaattgatcaagttc 23192432  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23192433 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 23192463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50772747 - 50772557
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50772747 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 50772648  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50772647 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgtgttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggt 50772557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Original strand, 50740106 - 50740297
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-agaaaaata 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  50740106 catcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacaccatggaaaaaaata 50740205  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50740206 cttcgtagctttatcatttactatctatttaccttgtgttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggt 50740297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 22476419 - 22476639
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22476419 agcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgatttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 22476518  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |  ||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     || |     
T  22476519 attctgtagct-----atttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaatt-----ggctc 22476608  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22476609 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 22476639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36169007 - 36168776
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-----agaaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||     | ||||    
T  36169007 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacatatgtagtgggaatatggttgatgtaacactatggaaaaaaaaaa 36168908  T
Q  103 atacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggt 202  Q
    | |||||||||||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36168907 aaacttcgtagcttgattatttaccatctatatacattgagttatttgcttccattttgt-gtcaatgtaaacccaaatatatgtaacaattggtcaggt 36168809  T
Q  203 ttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36168808 tcaagactgctcatcaacctacatcatccggtt 36168776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11327103 - 11326966
Alignment:
Q  98 gaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11327103 gaaaaatactctgtagctttatcatttaccatttatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgaaaacccaaatatatgtaacaattggt 11327004  T
Q  198 caggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11327003 caggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 11326966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 917469 - 917630
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  917469 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaatactttgcttctattttgtagtcaatgaca 917568  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  917569 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 917630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44074195 - 44074034
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44074195 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtacctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 44074096  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44074095 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 44074034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55296213 - 55296103
Alignment:
Q  125 accatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  55296213 accatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctac 55296114  T
Q  225 atcatccggtt 235  Q
    || ||||||||    
T  55296113 attatccggtt 55296103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 52463475 - 52463389
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaaca 91  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  52463475 agcatcagatgataggattttgtataagtttggtaatgacctgaaagatgtctttctttatgcagtgggaatatagttgatgtaaca 52463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11327387 - 11327299
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacact 93  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||    
T  11327387 agcatcagatgataggattttgtataagttttataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagttggaatatagttgatgtaacact 11327299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 42884131 - 42884359
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  42884131 catcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtggaaatatagttgatgtaacactatgagaaaaatat 42884230  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42884231 ttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 42884330  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42884331 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 42884359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 16882669 - 16882899
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16882669 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtattttcttatgcagtgaaaatatgattgatgtaacactatgggaaaaat 16882768  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16882769 acttcgtagttttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccaatttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 16882868  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16882869 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 16882899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 17040359 - 17040589
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17040359 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtattttcttatgcagtgaaaatatgattgatgtaacactatgggaaaaat 17040458  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17040459 acttcgtagttttgtcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccaatttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 17040558  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17040559 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 17040589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30568403 - 30568181
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30568403 agatgataggattttgtataaatttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatataattgatgtaacactatgagaaaaatactccg 30568304  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30568303 tagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggct 30568204  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatccgg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  30568203 gctcatcaacctacatcatccgg 30568181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 33905036 - 33905263
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33905036 atcagatgataaaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatact 33905135  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
     |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33905136 ccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgag 33905235  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33905236 gctgctcatcaacctacatcatctggtt 33905263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4292174 - 4291960
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  4292174 attttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcgtagctttatc 4292075  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4292074 atttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 4291975  T
Q  221 ttacatcatccggtt 235  Q
     ||||| ||||||||    
T  4291974 ctacattatccggtt 4291960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19169171 - 19168941
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  19169171 agcatcagatgataggattttgtagaagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacaatatgggaaaaat 19169072  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||     
T  19169071 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattaatcaggttc 19168972  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19168971 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 19168941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 26826265 - 26826494
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| || | |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26826265 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgaccaaaaaaatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatg-gaaaaat 26826363  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  26826364 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 26826463  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26826464 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 26826494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 28607960 - 28608190
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28607960 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtttttccttatgtagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 28608059  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28608060 atttcgtagctttatcatttaccatatatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 28608159  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28608160 gaggctactcatcaacctacattatccggtt 28608190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9545152 - 9544938
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  9545152 attttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcgtagccttatc 9545053  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9545052 atttaccatctatttacctttagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 9544953  T
Q  221 ttacatcatccggtt 235  Q
     ||||| ||||||||    
T  9544952 ctacattatccggtt 9544938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10049538 - 10049308
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  10049538 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 10049439  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10049438 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 10049339  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10049338 gaggctgctcatcaacctatattatccggtt 10049308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36634630 - 36634404
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || | || | ||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36634630 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataaagacccgagaaatgtatttccttatgtagtaggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 36634531  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36634530 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 36634431  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatcc 231  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36634430 gaggttgctcatcaacctacatcatcc 36634404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18094265 - 18094037
Alignment:
Q  6 gcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaata 105  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18094265 gcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgacaatatagttgacgtaacactatgagaaaa-ta 18094167  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
     |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18094166 tttcgtagcttaatcatttaccatttatttaccttgagttctttgcttcaattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcg 18094067  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18094066 aggctgctcatcaacctacattatccggtt 18094037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 21096439 - 21096667
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||| || | |||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21096439 catcagatgatagtattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatatctttccttatgtagtgggaatatagttgatgcaacactatgggaaaaatac 21096538  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21096539 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 21096638  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21096639 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 21096667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Original strand, 14751911 - 14752129
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14751911 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgcagtggaa-tatggttgatgtaacactatggaaaaaatact 14752009  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
    | ||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14752010 ttgtagctttatcatttaccctctatatacattgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgag 14752109  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatc 227  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  14752110 gctggtcatcaacctacatc 14752129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45206510 - 45206284
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45206510 agcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 45206411  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||     
T  45206410 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagttaatgacagcccaaatatatgtaacaattggttaagttc 45206311  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatcc 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45206310 gaggctgctcatcaacctacatcatcc 45206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6344260 - 6344037
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6344260 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 6344161  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6344160 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 6344066  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6344065 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 6344037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14324744 - 14324521
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14324744 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 14324645  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14324644 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 14324550  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14324549 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 14324521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1994472 - 1994249
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1994472 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 1994373  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  1994372 tccggagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatataagtaacaattggtcaggttcga 1994278  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1994277 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 1994249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9918242 - 9918050
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9918242 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 9918143  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggt 197  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9918142 attccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcattgacaacccaaatatatgtaacaattggt 9918050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 28501025 - 28501248
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  28501025 catcagatgatagaatttcgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaacactatggcaaaaatac 28501124  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     |||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28501125 ttcgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttatagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 28501219  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28501220 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 28501248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 26820368 - 26820586
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||          |||||||||||||| |||||||||    
T  26820368 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgg----------gatgtaacactatgggaaaaatac 26820457  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26820458 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 26820557  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  26820558 ggttgcccatcaacctacattatccggtt 26820586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 3709716 - 3709877
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3709716 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 3709815  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3709816 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 3709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11867700 - 11867539
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11867700 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 11867601  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11867600 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 11867539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35359093 - 35358932
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35359093 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 35358994  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35358993 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 35358932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 4810407 - 4810515
Alignment:
Q  127 catctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacat 226  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4810407 catcaatttatcttgagttctttgctaccattttgtagtcaatggcaatccaaatatatgtgacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacat 4810506  T
Q  227 catccggtt 235  Q
    |||||||||    
T  4810507 catccggtt 4810515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Original strand, 7360888 - 7360991
Alignment:
Q  125 accatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttac 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  7360888 accatctatttaccttgagttatttgcttccattttaaagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggctgctcattaacctac 7360987  T
Q  225 atca 228  Q
    ||||    
T  7360988 atca 7360991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Original strand, 7360654 - 7360763
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    |||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7360654 atcaaatgataggattttgtataggtttgataatgacttgaaagatgtcttttcttatgcaatggcaatatgattgatgtaacacaatgggaaaaatact 7360753  T
Q  108 tcgtagcttt 117  Q
     |||||||||    
T  7360754 ccgtagcttt 7360763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33665174 - 33665091
Alignment:
Q  149 tgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  33665174 tgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggttgagcatcaacctacatcatccg 33665091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Original strand, 4810305 - 4810395
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactat 95  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4810305 agcatcagatgataggattttatataagtttgataatgacatgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactat 4810395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 17091164 - 17091227
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgca 68  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17091164 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca 17091227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 68
Target Start/End: Original strand, 17036659 - 17036719
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgca 68  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17036659 atcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaaagatgtatttccttatgca 17036719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 17024979 - 17025042
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgca 68  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  17024979 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctaaatgatgtatttccttatgca 17025042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28567258 - 28567028
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28567258 agcatcagatgataggattttgtataagtttggtaatgacctgaaagatgtattcccttatgtagtgggaatatggctgatgtaacactatgggaaaaat 28567159  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28567158 acttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttt 28567059  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28567058 gagcttgctcatcaacctacatcatccggtt 28567028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 4890839 - 4891069
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4890839 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 4890938  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4890939 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 4891038  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4891039 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 4891069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29187648 - 29187418
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29187648 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 29187549  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29187548 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 29187449  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29187448 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 29187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 33360441 - 33360671
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  33360441 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 33360540  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  33360541 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 33360640  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33360641 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 33360671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 31618400 - 31618629
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-agaaaaata 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  31618400 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaata 31618499  T
Q  106 cttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttg 205  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31618500 cttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcg 31618599  T
Q  206 aggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31618600 aggttgctcatcaacctacatcatccggtt 31618629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 34686299 - 34686527
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34686299 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 34686398  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34686399 tccgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 34686498  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34686499 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 34686527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13663956 - 13663726
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  13663956 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaacactatgggaaaaat 13663857  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13663856 acttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaacaattagtcaggttt 13663757  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13663756 gaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 13663726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29842226 - 29841996
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29842226 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 29842127  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29842126 attccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggttaggttc 29842027  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29842026 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 29841996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10695728 - 10695500
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  10695728 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatat 10695629  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10695628 tctgtagctttatcatttaccatatatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgaaaactcaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 10695529  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10695528 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 10695500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 18812930 - 18813158
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  ||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18812930 catcagatgatagaattttgtataagtttgataataacccaaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 18813029  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18813030 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 18813129  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18813130 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 18813158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41831592 - 41831369
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41831592 catcagatgatataattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 41831493  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41831492 tccgtagatttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatg-caacccaaatatatgtaacaattggtcaggtttga 41831394  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatcc 231  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  41831393 ggttgctcatcaacctacatcatcc 41831369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41964468 - 41964240
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  41964468 catcagatgatagaattttgtataagtttgataataacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatataattgatgtaacactatgggaaaaatac 41964369  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  41964368 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 41964269  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41964268 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 41964240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51967271 - 51967042
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  51967271 agcataagatgataggattttgtataagttt-ataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatataattgatgtaacactatgggaaaaat 51967173  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  51967172 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgcgttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattgatcaggttc 51967073  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51967072 aaggctgctcatcaacctacattatccggtt 51967042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 18110434 - 18110657
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18110434 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 18110533  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18110534 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 18110628  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18110629 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 18110657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43256087 - 43255864
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43256087 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 43255988  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43255987 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 43255893  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43255892 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 43255864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50396501 - 50396278
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50396501 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 50396402  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50396401 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 50396307  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50396306 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 50396278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 42681106 - 42681331
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42681106 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 42681205  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |     
T  42681206 attccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggt-----tc 42681300  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42681301 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 42681331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 34690837 - 34691065
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34690837 catcaaatgatagaattttggataagtttgataatgacccaaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 34690936  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  34690937 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtaaggttcga 34691036  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34691037 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 34691065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 52308545 - 52308772
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52308545 agcataagatgataggattttgtataaatttgataatgacctggaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 52308644  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | || ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  52308645 attttgtagctttgtcatttatcatctatttaccttgagttttttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtagcaattggtcaggttc 52308744  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52308745 gaggctgctcatcaacctacattatccg 52308772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 18095526 - 18095752
Alignment:
Q  9 tcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatactt 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  18095526 tcagatgataggattttgtataggtttgataatgacctgaaaaatgtctttccttatgcagtgagaatatggttgatgtaacattatgggaaaaatacat 18095625  T
Q  109 cgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgagg 208  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18095626 cgtagctttatcatctaccatctatttgccttgagttctttgcttccattttgtagacaatggcaagccagatatatttaacaattggtcaggtttgagg 18095725  T
Q  209 ctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18095726 ctgctcatcaacctacatcatctggtt 18095752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38846764 - 38846534
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38846764 agcattagacgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttctttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 38846665  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38846664 actatgtagctttatcatttaccatctagataccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacggcaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 38846565  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38846564 gaggcttctcatcaacctacatcatccggtt 38846534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 50559760 - 50559990
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50559760 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 50559859  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | | |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  50559860 attccgtagctttatcatttgccatatatttaccttgagttatttgttttcattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 50559959  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50559960 gaggctgttcatcaacctacattatccggtt 50559990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 48339104 - 48339333
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  48339104 agcatcagatgataggattttatataagtttaataatgacccgaaagatgtttttcattatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaa-t 48339202  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||     
T  48339203 actccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagttaatgacagcccaaatatatgtaacaattggttaagttc 48339302  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48339303 gaggctgctcatcaacctacaacatccggtt 48339333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 49225006 - 49225202
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||   |||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  49225006 attttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttt---tatgtagtggaaatttagttgatgtaacactatgggaaaaatactctgtagctttatc 49225102  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49225103 atttaccttctatttaccttgagttctttgctacctttttgtagtcaacgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 49225202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52523096 - 52522879
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| | ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  52523096 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaaaatgtctttccatatgtagtgggaatataattgatgtaacactatgggaaaaatac 52522997  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| ||||           |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52522996 tccgtagctttatcatt-----------taccttgagttccttgcttccattttgtagttaatggaaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 52522908  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52522907 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 52522879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17709960 - 17709794
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgaga-----aaa 102  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |     |||    
T  17709960 atcagaggataggattttgtataagtttgataatgacatgaaagatgtctttccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacactatgaaacaaaaaaa 17709861  T
Q  103 atacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17709860 atacttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattt-gtagtcaatg 17709794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 21729456 - 21729578
Alignment:
Q  1 tgttagcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21729456 tgttagcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaatatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaa 21729555  T
Q  101 aaatacttcgtagctttaccatt 123  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  21729556 aaatactccgtagctttatcatt 21729578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Original strand, 15314084 - 15314193
Alignment:
Q  126 ccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttaca 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15314084 ccatctatttacattaagttctttgattccattttttagtcaatggcaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctaca 15314183  T
Q  226 tcatccggtt 235  Q
    |||| |||||    
T  15314184 tcattcggtt 15314193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10700617 - 10700519
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaata 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10700617 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaata 10700519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 28971820 - 28972043
Alignment:
Q  12 gatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgt 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28971820 gatgatagaattttgtataagtttgataatgatccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatactccgt 28971919  T
Q  112 agctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctg 211  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28971920 agctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctg 28972019  T
Q  212 ctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  28972020 ctcatcaacctacatcatccggtt 28972043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33504556 - 33504326
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33504556 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagatgatgtaacactatgagaaaaat 33504457  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  33504456 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttccttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattgttcaggttc 33504357  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33504356 gaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 33504326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 52799765 - 52799995
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52799765 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 52799864  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  52799865 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 52799964  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  52799965 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 52799995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56000268 - 56000038
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  56000268 agcatcagatgatatgattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtaggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 56000169  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  56000168 actccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 56000069  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56000068 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 56000038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35497078 - 35496853
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatg-agaaaaatacttc 109  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  35497078 agatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatggaaaaaaatatttc 35496979  T
Q  110 gtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggc 209  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  35496978 gtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggtttgaggt 35496879  T
Q  210 tgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35496878 tgctcatcaacctacattatccggtt 35496853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19832953 - 19832725
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19832953 catcagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttattaagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 19832854  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19832853 tccgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttccttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 19832754  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19832753 ggctgctcatcaacctacatcatccggtt 19832725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 1943219 - 1943449
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  1943219 agcatcatatgatagaattttatataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaacacaatggaaaaaat 1943318  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1943319 acttcgtagctttattatttaccatctatttaccttgagttctatgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 1943418  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  1943419 gtggttgttcatcaacctacatcaaccggtt 1943449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28136622 - 28136396
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28136622 catcagatgataagattttgtataaatttgatgatgactcgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgcaacactatgggaaaaatac 28136523  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28136522 ttcgtagctttatcatttaccatctatttttcttgagttctttgcttccattttgtagtcaataacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 28136423  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccgg 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28136422 ggctgctcatcaacctacatcatccgg 28136396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 17738762 - 17738991
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17738762 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcagtgagaatatagttgatgaaacactatgagaaaaat 17738861  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17738862 atttcgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggaaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 17738961  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggt 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17738962 gaggctgctcatcaacctacattatccggt 17738991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34058131 - 34057903
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34058131 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 34058032  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34058031 tccgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 34057932  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34057931 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 34057903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39716066 - 39715839
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39716066 agcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 39715967  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  39715966 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacatcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttc 39715867  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39715866 gaggctgctcatcaacctacattatccg 39715839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 575567 - 575347
Alignment:
Q  11 agatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcg 110  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  575567 agatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatatttcg 575468  T
Q  111 tagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggct 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  575467 tagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggttaggttcgaggct 575368  T
Q  211 gctcatcaacttacatcatcc 231  Q
    ||| |||||| ||||| ||||    
T  575367 gcttatcaacctacattatcc 575347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5275312 - 5275084
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5275312 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgattcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgcaacactatgggaaaaatac 5275213  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5275212 ttcgtaactttatcatttactatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 5275113  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5275112 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 5275084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14831077 - 14830849
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14831077 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 14830978  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14830977 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 14830878  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14830877 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 14830849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 23477626 - 23477854
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||  ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23477626 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccaaaaaatgtcattccttatgtagtgggaatattgttgatgtaacactatggaaaaaatac 23477725  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23477726 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 23477825  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23477826 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 23477854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7645680 - 7645450
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7645680 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgtgaaaaat 7645581  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7645580 actccatagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttacttccattttgtagtcaatgccaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 7645481  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7645480 aaagctgctcatcaacctacatcatccggtt 7645450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 36855851 - 36856080
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  36855851 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaa-t 36855949  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  36855950 acttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttcttttcttccattttgtagtcaatggcaaccctaatacatgtaacaattggtcaggttc 36856049  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36856050 gaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 36856080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39746414 - 39746184
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  39746414 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatggaaaaaat 39746315  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39746314 actttgtagctttatcatttaccatctatttaccttgggttatttggttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttt 39746215  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  39746214 aaggcttctcatcaacctacatcatctggtt 39746184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 53341129 - 53341359
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||| ||||  ||||||    
T  53341129 agcatcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatataattgatgtaacagtatggaaaaaat 53341228  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||   |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||     
T  53341229 actctctagcttcatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaataattggtcacgttc 53341328  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53341329 gaggctgctcattaacctacatcatccggtt 53341359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 15519575 - 15519798
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15519575 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 15519674  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15519675 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 15519769  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15519770 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 15519798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 19589567 - 19589797
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||    
T  19589567 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtccttccttatgcagtgggaatacagttgatgtaacactatgggtaaaat 19589666  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  19589667 actctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgaattctttgcttccattttgtagtcaatggtaacccaaatagatgtaacaattggtcaggttc 19589766  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19589767 gaggctgttcatcaacctacatcattcggtt 19589797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 741840 - 741617
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  741840 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 741741  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  741740 tccgtagcttgatcatttaccatctatttaccttgagtt-----cttccattttgtagtcattcgcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 741646  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  741645 ggctgctcatcaacctacattatccggtt 741617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 16903992 - 16904225
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttat---gcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaa 101  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16903992 agcataagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttattatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaa 16904091  T
Q  102 aatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcagg 201  Q
    |||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16904092 aatattctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaagatatgtaacaattgttcagg 16904191  T
Q  202 tttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16904192 ttcgaggctgctcatcaacctacattatccggtt 16904225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15656377 - 15656150
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15656377 catcagatgatatagttttgtataagtttgataaagatccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 15656278  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  15656277 tccgtagctttatcatttcccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtc-atggaaacccaaatatatgtaataattgatcaggttcga 15656179  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15656178 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 15656150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 13626771 - 13627002
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||| | |||||| || ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13626771 agcatcatatgataggattttgtataagtttggtaatgacccgaaagaggtctttccttgtgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 13626870  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttc-tttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtt 203  Q
    |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13626871 actatgtagctttatcatttaccatctatttaccttaagttcttttgcttccattttgaagtaaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggtt 13626970  T
Q  204 tgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13626971 cgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 13627002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35713675 - 35713450
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35713675 agcataagatgatatgattttgtagaagtttgataatgacttgaaagatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 35713576  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |     
T  35713575 attctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacacaaatatatgtaacaattggt-----tc 35713481  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35713480 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 35713450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10260807 - 10260646
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10260807 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 10260708  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10260707 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 10260646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 21563648 - 21563809
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21563648 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 21563747  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21563748 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 21563809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26925749 - 26925588
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26925749 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 26925650  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26925649 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 26925588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 43331169 - 43331330
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43331169 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 43331268  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43331269 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 43331330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 51451235 - 51451396
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51451235 aatatagttgatgtaacattatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 51451334  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51451335 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 51451396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24078877 - 24078716
Alignment:
Q  74 aatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgaca 173  Q
    ||||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24078877 aatatagttgatgtaaccttatgggtaaaatactttgtagctttatcatttaccatttatttaccttgaattctttgcttctattttgtagtcaatgaca 24078778  T
Q  174 acccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24078777 acgcaaatagatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaacctacatcatccggtt 24078716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47721628 - 47721403
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  ||     ||| |||||||||    
T  47721628 atcaggtgatacaattttatataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatacagtgggaatatggttgat--aatgacctgaaaaaaatact 47721531  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
    | ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47721530 ttgtagctttatcatttactatctatatacattgagttatttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgag 47721431  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| |||||||| || |||||| ||||    
T  47721430 gctggtcatcaacctaaatcatctggtt 47721403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 40620988 - 40621096
Alignment:
Q  127 catctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  40620988 catctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgttcatcaacctacat 40621087  T
Q  227 catccggtt 235  Q
     ||||||||    
T  40621088 tatccggtt 40621096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Original strand, 16891768 - 16891864
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagcttt 117  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16891768 attttgtataggtttgataatgacctgaaagatgtcttttcttatgcaatggaaatatgattgatgtaacactatgggaaaaatactccgtagcttt 16891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 16891991 - 16892092
Alignment:
Q  127 catctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacat 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16891991 catctatttaccttgagttatttgcttccattttatagaaaatggcaagccaaatatatgtaacaattggtcaagtttgaggcttctcattaacctacat 16892090  T
Q  227 ca 228  Q
    ||    
T  16892091 ca 16892092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41984791 - 41984705
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaaca 91  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  41984791 agcatcagatgatatgattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgcagtaggaatatagttgatgtaaca 41984705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 40618528 - 40618641
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||  |||||     
T  40618528 agcatcagatgataggattttgtataagtttgataatgacatgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttcatgtaacactatggaaaaaaa 40618627  T
Q  105 acttcgtagcttta 118  Q
    | ||||||||||||    
T  40618628 atttcgtagcttta 40618641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19927 - 19697
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19927 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgcagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 19828  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19827 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 19728  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19727 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 19697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 8632 - 8860
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8632 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 8731  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8732 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 8831  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8832 ggttgctcatcaacctacatcatccggtt 8860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 66181 - 65951
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  66181 agcatcatatgatagaattttatataagtttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcagtgggaatatggttgatgtaacacaatggaaaaaat 66082  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  66081 acttcgtagctttattatttaccatctatttaccttgagttctatgcttccattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 65982  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  65981 gtggttgttcatcaacctacatcaaccggtt 65951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 153721 - 153491
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  153721 agcatcaaatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttccttatgtagtgggaatatggctaatgcaacactatgggaaaaat 153622  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  153621 acttcgtaactttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaacggcaacccaaatatatgtaacaattagtcaggttt 153522  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  153521 gaggttgctcatcaacctacatcatccggtt 153491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 12509 - 12739
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12509 agcataagatgataggattttgtataagtttgataatgacctgaaagatgtatttacttatgaagtgagaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 12608  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  12609 atttcgtagctttatcatttaccatctatttacctcgagttctttacttccattttgtagtcaatgacaacctaaatatatgtaacaattggtcaggttc 12708  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12709 gaggctgctcatcaacctacattatccggtt 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 531 - 759
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  531 agcatcaaatgatagaattttatataagtttgataatgacccgaaaaatgtctttccttatgttgtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 630  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  631 actacgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaatgtcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 730  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccgg 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  731 gaggctgctcatcaacctacattatccgg 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27911 - 27683
Alignment:
Q  7 catcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatac 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911 catcagatgatagaattttgtataagtttgataatgactcgaaaaatgtctttccttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaatac 27812  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27811 tccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttccttacttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 27712  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27711 ggttgctcatcaacctacatcatctggtt 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16884 - 16654
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16884 agcattagacgatagaattttgtataagtttgataatgacccgaaagatgtctttctttatgtagtgggaatatagttgatgtaacactatgggaaaaat 16785  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16784 actctgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttgtagtcaacggcaatccaaatatatgtaacaattggtcaggttc 16685  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16684 gaggcttctcatcaacctacatcatccggtt 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14396 - 14170
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatact 107  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14396 atcagatgataggattttgtataagtttgataatgacttgaaatatgtctttccttatgcagtgagaatatagttgatataacactatgagaaaaatatt 14297  T
Q  108 tcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgag 207  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  14296 ccgtagctttatcatttaccatctatttaccttgagttctttgcttctattttgtagtcaatgacaacccaaata-atgtaacaattggttaggttcgag 14198  T
Q  208 gctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14197 gctgctcatcaacctacattatccggtt 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 48771 - 48999
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa-tac 106  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  48771 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaatgatgtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaacactatggaaaaaagtac 48870  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttga 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  48871 ttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcga 48970  T
Q  207 ggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48971 gaatgcacatcaacctacatcatccggtt 48999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Original strand, 64156 - 64352
Alignment:
Q  8 atcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaa-tac 106  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  64156 atcagatgatataattttatataagtttgataatgacctgaatgatgtatttacttatacagtgggcatatggttgatgtaacactatggaaaaaagtac 64255  T
Q  107 ttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtt 203  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64256 ttcgtagctttatcatttaccatctatatacattgagttctttgcttctattttgtagtcaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggtt 64352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 118743 - 118973
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  118743 agcatcagatgataggattttgtgtaagtttgataatgacctgaaagatgtcattccttatgcagtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaaat 118842  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  118843 agtatgtagctttattatttaccatctatttaccttgagttctttgcttccattttatagtcaatgacaacccaaatatataaaacaattggtcaggttc 118942  T
Q  205 gaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||    
T  118943 gaggctactcatcatcctacttgatccggtt 118973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 59319 - 59532
Alignment:
Q  5 agcatcagatgataaaattttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaat 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  59319 agcatcagatgataggattttgtgtaagtttgataatgacctgaaagatgtctttccttatgtggtgggaatatagttgatgtaacattatgggaaaaat 59418  T
Q  105 acttcgtagctttaccattcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggttt 204  Q
    | |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  59419 agtctgtagctttatcatttaccatctatttaccttaagttctttgcttccattttgtagtcaatgacaacccaaatatataaaacaattggtcaggttc 59518  T
Q  205 gaggctgctcatca 218  Q
    |||| |||||||||    
T  59519 gaggttgctcatca 59532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5791 - 5592
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||| |    
T  5791 attttatataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgttgtaacactatcggaaaaatattccgtagctttatc 5692  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
     || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5691 ttttaccatctctttaccttgagttatttgcttccatttggtagtgaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 5592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12240 - 12041
Alignment:
Q  21 attttgtataaatttgataatgatctgaaagatgtatttccttatgcaatggaaatatggttgatgtaacactatgagaaaaatacttcgtagctttacc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||| |    
T  12240 attttatataagtttgataatgacctgaaagatatctttccttatgcagtgagaatatagttgttgtaacactatcggaaaaatattccgtagctttatc 12141  T
Q  121 attcaccatctatttaccttgagttctttgcttccatttcgtagtcaatgacaacccaaatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaac 220  Q
     || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12140 ttttaccatctctttaccttgagttatttgcttccatttggtagtgaatggcaacccaaatatatgtaacaattggtcaggttcgaggctgctcatcaac 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13851 - 13795
Alignment:
Q  179 aatatatgcaacaattggtcaggtttgaggctgctcatcaacttacatcatccggtt 235  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13851 aatatatgtaacaattgatcagattcaaggctgctcatcaacctacattatccggtt 13795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University