View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20381_low_13 (Length: 468)

Name: NF20381_low_13
Description: NF20381
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20381_low_13
NF20381_low_13
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (18-468)||(10474116-10474567)
chr5 (84-468)||(16776193-16776580)
chr5 (78-468)||(21948061-21948460)
chr5 (87-468)||(658220-658597)
chr5 (78-468)||(39854518-39854913)
chr5 (78-468)||(18511064-18511456)
chr5 (78-468)||(6745104-6745499)
chr5 (92-468)||(1189474-1189853)
chr5 (70-468)||(40221557-40221963)
chr5 (87-468)||(17818352-17818734)
chr5 (87-468)||(4236664-4237049)
chr5 (78-468)||(2818186-2818580)
chr5 (89-468)||(25921333-25921717)
chr5 (86-468)||(2174954-2175323)
chr5 (78-468)||(24126891-24127283)
chr5 (87-468)||(38882141-38882509)
chr5 (78-444)||(41585588-41585963)
chr5 (78-468)||(18596680-18597071)
chr5 (83-468)||(6747341-6747730)
chr5 (108-468)||(26097768-26098127)
chr5 (78-468)||(18466719-18467115)
chr5 (78-468)||(27912571-27912967)
chr5 (109-468)||(18509201-18509562)
chr5 (77-468)||(25804060-25804456)
chr5 (78-468)||(27910485-27910864)
chr5 (87-468)||(37705644-37706024)
chr5 (78-468)||(6756529-6756919)
chr5 (78-468)||(36402178-36402572)
chr5 (69-468)||(16092044-16092444)
chr5 (78-466)||(25904140-25904528)
chr5 (87-463)||(10528955-10529338)
chr5 (78-425)||(20505695-20506041)
chr5 (69-468)||(18469046-18469449)
chr5 (78-456)||(2954463-2954841)
chr5 (87-468)||(34476910-34477298)
chr5 (86-436)||(2723970-2724311)
chr5 (87-468)||(21684310-21684695)
chr5 (83-468)||(31465846-31466222)
chr5 (87-457)||(695924-696292)
chr5 (87-468)||(34479275-34479663)
chr5 (93-468)||(17072918-17073298)
chr5 (69-468)||(31179212-31179615)
chr5 (87-443)||(4410084-4410442)
chr5 (78-428)||(39798123-39798460)
chr5 (87-461)||(10586873-10587236)
chr5 (78-468)||(21288799-21289185)
chr5 (89-468)||(31542770-31543153)
chr5 (85-468)||(12555773-12556167)
chr5 (210-468)||(31545115-31545374)
chr5 (86-468)||(15552280-15552668)
chr5 (177-468)||(31472563-31472857)
chr5 (78-423)||(36208656-36208999)
chr5 (85-314)||(26098146-26098378)
chr5 (87-408)||(10749796-10750121)
chr5 (78-408)||(38959980-38960314)
chr5 (78-408)||(3372985-3373320)
chr5 (135-468)||(39397915-39398237)
chr5 (87-408)||(10757273-10757597)
chr5 (86-424)||(20053923-20054251)
chr5 (87-425)||(6661053-6661386)
chr5 (210-408)||(15354560-15354757)
chr5 (210-408)||(23665140-23665337)
chr5 (210-408)||(23793250-23793447)
chr5 (210-408)||(15356836-15357033)
chr5 (87-423)||(9020299-9020633)
chr5 (210-401)||(23741844-23742034)
chr5 (282-468)||(34530722-34530910)
chr5 (78-272)||(20043222-20043416)
chr5 (154-422)||(15143547-15143817)
chr5 (342-468)||(20045045-20045172)
chr5 (346-468)||(20043085-20043208)
chr5 (259-422)||(17413200-17413365)
chr5 (159-404)||(4897828-4898071)
chr5 (376-468)||(26098402-26098495)
chr5 (69-190)||(34530558-34530679)
chr5 (95-198)||(20045292-20045395)
chr5 (87-330)||(15445135-15445372)
chr5 (221-326)||(23667497-23667601)
chr5 (289-363)||(42770951-42771025)
chr5 (86-422)||(2144437-2144763)
chr5 (200-404)||(22672837-22673043)
chr5 (223-407)||(1170811-1170994)
chr5 (345-407)||(35385573-35385634)
chr5 (219-402)||(25445501-25445684)
chr5 (345-404)||(25452498-25452556)
chr5 (345-407)||(2298122-2298183)
chr5 (225-290)||(11917000-11917065)
chr5 (225-289)||(9353361-9353425)
chr5 (225-289)||(36932379-36932443)
chr5 (85-144)||(15354429-15354487)
chr5 (85-144)||(15356705-15356763)
chr5 (85-144)||(23665411-23665469)
chr5 (85-144)||(23741712-23741770)
chr5 (85-144)||(23793118-23793176)
chr5 (345-404)||(28786407-28786465)
chr5 (225-288)||(28832263-28832326)
chr5 (345-407)||(1240428-1240489)
chr5 (336-425)||(42770847-42770934)
chr5 (225-289)||(10281755-10281819)
chr5 (225-289)||(15464536-15464600)
chr5 (225-289)||(17003989-17004053)
chr5 (223-290)||(35385450-35385518)
chr5 (219-290)||(42238376-42238448)
chr5 (345-404)||(11962554-11962612)
chr5 (345-404)||(17841370-17841428)
chr5 (437-468)||(20507675-20507706)
chr5 (380-422)||(34033725-34033768)
chr5 (345-422)||(4754235-4754312)
chr5 (346-407)||(16093413-16093473)
chr5 (225-269)||(533893-533937)
chr5 (225-289)||(12084204-12084268)
chr5 (225-269)||(19806487-19806531)
chr5 (225-269)||(32636948-32636992)
chr5 (225-269)||(42428430-42428474)
[»] chr6 (108 HSPs)
chr6 (78-468)||(11982880-11983273)
chr6 (78-468)||(9019996-9020390)
chr6 (84-468)||(30728683-30729072)
chr6 (87-468)||(28241179-28241565)
chr6 (65-468)||(3629706-3630108)
chr6 (86-468)||(4816087-4816475)
chr6 (90-468)||(14507037-14507419)
chr6 (87-468)||(30967271-30967657)
chr6 (86-468)||(1230105-1230493)
chr6 (78-468)||(3631792-3632182)
chr6 (78-468)||(14458615-14459009)
chr6 (78-468)||(13057264-13057651)
chr6 (87-468)||(30034463-30034847)
chr6 (85-468)||(26065056-26065440)
chr6 (85-468)||(26085025-26085409)
chr6 (69-468)||(32280066-32280464)
chr6 (95-419)||(1069588-1069913)
chr6 (88-468)||(19704422-19704813)
chr6 (87-468)||(2628743-2629129)
chr6 (86-467)||(20915213-20915599)
chr6 (83-468)||(15541003-15541384)
chr6 (78-468)||(3233575-3233975)
chr6 (160-468)||(13039824-13040132)
chr6 (83-468)||(26932416-26932806)
chr6 (78-468)||(24338303-24338692)
chr6 (78-426)||(15367144-15367490)
chr6 (206-468)||(3390449-3390713)
chr6 (68-468)||(12195352-12195759)
chr6 (65-436)||(5273050-5273427)
chr6 (70-364)||(15346522-15346813)
chr6 (205-468)||(25477344-25477616)
chr6 (78-408)||(29754557-29754892)
chr6 (69-408)||(26065960-26066307)
chr6 (78-408)||(26068243-26068578)
chr6 (87-408)||(33308988-33309313)
chr6 (66-468)||(3027699-3028095)
chr6 (78-461)||(14466399-14466783)
chr6 (87-408)||(33311257-33311582)
chr6 (177-468)||(12161510-12161799)
chr6 (268-468)||(15530166-15530366)
chr6 (217-468)||(15532674-15532925)
chr6 (152-423)||(12186000-12186271)
chr6 (83-424)||(26945258-26945597)
chr6 (177-423)||(15719758-15720004)
chr6 (332-468)||(19227515-19227652)
chr6 (222-424)||(16455421-16455625)
chr6 (78-424)||(17012155-17012494)
chr6 (290-468)||(22490710-22490889)
chr6 (87-344)||(25465460-25465710)
chr6 (87-422)||(19696556-19696887)
chr6 (187-307)||(10584227-10584348)
chr6 (162-422)||(22857893-22858152)
chr6 (78-211)||(3394695-3394829)
chr6 (78-233)||(22490921-22491071)
chr6 (155-407)||(12937126-12937376)
chr6 (86-218)||(15530022-15530156)
chr6 (264-422)||(20526922-20527081)
chr6 (222-421)||(28037722-28037927)
chr6 (78-155)||(18322482-18322558)
chr6 (86-340)||(28078063-28078310)
chr6 (204-422)||(25078537-25078755)
chr6 (233-363)||(30445699-30445832)
chr6 (87-192)||(6610378-6610478)
chr6 (225-288)||(31979517-31979580)
chr6 (415-468)||(1072067-1072121)
chr6 (78-144)||(8717203-8717268)
chr6 (223-407)||(13878727-13878910)
chr6 (345-407)||(13883475-13883536)
chr6 (223-407)||(16785919-16786102)
chr6 (345-407)||(26887345-26887406)
chr6 (345-407)||(31248835-31248896)
chr6 (345-407)||(35201447-35201508)
chr6 (78-198)||(25480219-25480338)
chr6 (345-407)||(3577636-3577696)
chr6 (200-309)||(12911421-12911531)
chr6 (345-404)||(17036058-17036116)
chr6 (345-404)||(17694972-17695030)
chr6 (87-217)||(22610999-22611122)
chr6 (225-289)||(5757507-5757571)
chr6 (225-289)||(10077194-10077258)
chr6 (347-422)||(11138423-11138499)
chr6 (345-400)||(12166267-12166321)
chr6 (345-404)||(22351973-22352031)
chr6 (294-422)||(7542452-7542581)
chr6 (157-290)||(30443537-30443670)
chr6 (78-123)||(13040179-13040224)
chr6 (347-404)||(19701985-19702041)
chr6 (345-401)||(25941650-25941704)
chr6 (206-290)||(35201309-35201393)
chr6 (225-289)||(5572270-5572334)
chr6 (345-404)||(13467585-13467642)
chr6 (223-290)||(13883590-13883658)
chr6 (225-289)||(21356040-21356104)
chr6 (219-290)||(25941785-25941857)
chr6 (177-217)||(26505339-26505379)
chr6 (345-404)||(22342922-22342980)
chr6 (345-404)||(26643179-26643237)
chr6 (345-404)||(26749145-26749203)
chr6 (225-288)||(31936591-31936654)
chr6 (345-404)||(33215830-33215888)
chr6 (87-125)||(10584357-10584395)
chr6 (439-468)||(8995549-8995578)
chr6 (231-288)||(24436001-24436058)
chr6 (225-269)||(9183031-9183075)
chr6 (394-426)||(15346492-15346524)
chr6 (225-269)||(26954286-26954330)
chr6 (225-269)||(33211185-33211229)
chr6 (219-290)||(33215943-33216015)
[»] chr7 (138 HSPs)
chr7 (92-468)||(44724624-44725000)
chr7 (87-468)||(31434910-31435291)
chr7 (78-468)||(38394031-38394426)
chr7 (78-468)||(13099325-13099720)
chr7 (78-468)||(20626083-20626473)
chr7 (78-468)||(20629974-20630364)
chr7 (78-468)||(20642393-20642783)
chr7 (85-468)||(40836599-40836986)
chr7 (78-468)||(7471829-7472224)
chr7 (99-467)||(21592018-21592386)
chr7 (85-468)||(443640-444027)
chr7 (90-463)||(27306096-27306469)
chr7 (78-468)||(4295789-4296179)
chr7 (83-468)||(20299504-20299895)
chr7 (95-467)||(21990196-21990570)
chr7 (87-468)||(48457698-48458084)
chr7 (86-468)||(11355303-11355688)
chr7 (78-468)||(42330854-42331243)
chr7 (88-468)||(1850026-1850411)
chr7 (78-468)||(7469872-7470266)
chr7 (83-468)||(9679104-9679491)
chr7 (78-468)||(3035766-3036164)
chr7 (78-468)||(9680864-9681257)
chr7 (85-468)||(37411982-37412372)
chr7 (78-468)||(21678111-21678498)
chr7 (87-468)||(24748639-24749017)
chr7 (83-468)||(35674-36064)
chr7 (78-468)||(3878622-3879019)
chr7 (92-468)||(18345586-18345967)
chr7 (95-468)||(39145856-39146231)
chr7 (78-468)||(20297407-20297802)
chr7 (78-468)||(21680072-21680464)
chr7 (78-468)||(44609-45004)
chr7 (212-468)||(1046912-1047168)
chr7 (78-468)||(28487598-28487993)
chr7 (69-468)||(25542575-25542977)
chr7 (89-468)||(40946373-40946759)
chr7 (86-468)||(42223202-42223584)
chr7 (212-468)||(1049283-1049539)
chr7 (87-436)||(7092070-7092423)
chr7 (87-468)||(43253374-43253760)
chr7 (87-443)||(7094317-7094678)
chr7 (78-468)||(28485611-28486005)
chr7 (87-437)||(38396712-38397070)
chr7 (177-468)||(20137063-20137353)
chr7 (86-467)||(7351508-7351895)
chr7 (78-468)||(27832496-27832877)
chr7 (210-468)||(31155896-31156155)
chr7 (87-468)||(24813364-24813739)
chr7 (279-468)||(11757274-11757465)
chr7 (86-468)||(7349134-7349517)
chr7 (68-408)||(1606486-1606829)
chr7 (87-408)||(2935374-2935700)
chr7 (86-468)||(25276186-25276550)
chr7 (69-360)||(22393876-22394162)
chr7 (86-468)||(7188587-7188962)
chr7 (78-408)||(9027042-9027376)
chr7 (210-408)||(22137184-22137381)
chr7 (210-408)||(40552211-40552408)
chr7 (199-468)||(24258508-24258783)
chr7 (210-408)||(22108173-22108370)
chr7 (210-408)||(40549933-40550130)
chr7 (87-468)||(24817219-24817594)
chr7 (83-363)||(26295598-26295872)
chr7 (92-245)||(22251452-22251605)
chr7 (78-422)||(24465629-24465967)
chr7 (259-425)||(20091581-20091745)
chr7 (321-468)||(26804614-26804765)
chr7 (83-262)||(26804762-26804942)
chr7 (265-468)||(22828672-22828877)
chr7 (78-277)||(11759364-11759567)
chr7 (282-468)||(22251602-22251786)
chr7 (129-422)||(16296932-16297222)
chr7 (156-422)||(6332311-6332574)
chr7 (181-422)||(11081598-11081842)
chr7 (396-468)||(18567658-18567731)
chr7 (290-363)||(6348933-6349006)
chr7 (219-407)||(25351353-25351539)
chr7 (86-422)||(6048961-6049295)
chr7 (157-366)||(6046641-6046848)
chr7 (219-423)||(2120881-2121087)
chr7 (157-419)||(40281316-40281572)
chr7 (380-426)||(22392549-22392595)
chr7 (345-422)||(11084467-11084544)
chr7 (219-407)||(25357047-25357233)
chr7 (193-407)||(3320020-3320232)
chr7 (193-407)||(3324768-3324980)
chr7 (219-407)||(25410130-25410318)
chr7 (86-215)||(6349097-6349220)
chr7 (345-407)||(7069780-7069841)
chr7 (345-407)||(7074787-7074848)
chr7 (223-407)||(25405393-25405576)
chr7 (345-407)||(42006663-42006724)
chr7 (225-288)||(9190038-9190101)
chr7 (225-288)||(20284093-20284156)
chr7 (345-404)||(30246973-30247031)
chr7 (345-404)||(44512646-44512704)
chr7 (345-407)||(8378625-8378686)
chr7 (345-407)||(15541116-15541177)
chr7 (187-290)||(6067159-6067264)
chr7 (225-289)||(21983288-21983352)
chr7 (356-404)||(44143997-44144045)
chr7 (225-289)||(46516339-46516403)
chr7 (225-288)||(2580394-2580457)
chr7 (106-246)||(20091041-20091176)
chr7 (345-404)||(34546984-34547042)
chr7 (85-144)||(40550204-40550262)
chr7 (359-404)||(7464652-7464697)
chr7 (225-289)||(2647725-2647789)
chr7 (225-289)||(4796696-4796760)
chr7 (68-144)||(22137454-22137529)
chr7 (225-289)||(29159807-29159871)
chr7 (225-269)||(31732969-31733013)
chr7 (219-290)||(34546874-34546946)
chr7 (68-144)||(40552481-40552556)
chr7 (225-269)||(41649011-41649055)
chr7 (86-150)||(1046774-1046839)
chr7 (225-288)||(9185195-9185258)
chr7 (376-407)||(21369642-21369673)
chr7 (380-422)||(26210631-26210674)
chr7 (225-288)||(28617255-28617318)
chr7 (225-288)||(33332480-33332543)
chr7 (193-290)||(7069895-7069992)
chr7 (228-289)||(55955-56015)
chr7 (359-404)||(44010884-44010929)
chr7 (86-155)||(1049146-1049216)
chr7 (87-139)||(1502832-1502883)
chr7 (219-290)||(2075231-2075303)
chr7 (225-269)||(4586285-4586329)
chr7 (219-290)||(7464513-7464585)
chr7 (87-123)||(25357324-25357360)
chr7 (225-269)||(27347941-27347985)
chr7 (225-269)||(30814560-30814604)
chr7 (225-289)||(35960820-35960884)
chr7 (225-265)||(38671222-38671262)
chr7 (225-269)||(41317434-41317478)
chr7 (356-404)||(44016792-44016840)
chr7 (225-289)||(44848713-44848777)
[»] chr8 (108 HSPs)
chr8 (86-468)||(14807842-14808235)
chr8 (86-468)||(28251427-28251811)
chr8 (78-468)||(15072801-15073194)
chr8 (87-468)||(30480365-30480747)
chr8 (84-468)||(3874101-3874473)
chr8 (87-468)||(27829388-27829774)
chr8 (78-468)||(15068072-15068464)
chr8 (87-468)||(27827077-27827463)
chr8 (78-468)||(14419043-14419435)
chr8 (78-461)||(43530213-43530601)
chr8 (87-468)||(15809310-15809695)
chr8 (87-468)||(608825-609214)
chr8 (86-468)||(22684509-22684900)
chr8 (87-468)||(32339400-32339787)
chr8 (78-468)||(41384835-41385225)
chr8 (78-468)||(18810799-18811194)
chr8 (78-468)||(27106755-27107141)
chr8 (87-468)||(4424109-4424496)
chr8 (78-468)||(28283070-28283463)
chr8 (87-468)||(36865629-36866012)
chr8 (89-467)||(44720935-44721318)
chr8 (78-461)||(18812980-18813368)
chr8 (70-468)||(13858334-13858728)
chr8 (78-466)||(25952613-25953002)
chr8 (83-468)||(41382764-41383141)
chr8 (89-468)||(1225257-1225626)
chr8 (86-468)||(33541271-33541632)
chr8 (86-468)||(43079693-43080080)
chr8 (86-468)||(43082064-43082451)
chr8 (78-468)||(15956052-15956435)
chr8 (193-468)||(27911105-27911380)
chr8 (193-468)||(27957524-27957799)
chr8 (84-468)||(15185578-15185954)
chr8 (78-468)||(24873047-24873425)
chr8 (86-468)||(5372042-5372422)
chr8 (78-468)||(21482405-21482790)
chr8 (87-425)||(31162344-31162683)
chr8 (78-426)||(21480636-21480982)
chr8 (83-280)||(37214122-37214319)
chr8 (87-422)||(3005502-3005829)
chr8 (78-338)||(35872309-35872553)
chr8 (132-436)||(181623-181905)
chr8 (78-291)||(14477519-14477732)
chr8 (87-354)||(2467995-2468259)
chr8 (316-468)||(14477367-14477520)
chr8 (86-422)||(31578148-31578476)
chr8 (155-425)||(31035252-31035522)
chr8 (84-200)||(27911439-27911553)
chr8 (84-200)||(27957858-27957972)
chr8 (342-468)||(37214317-37214435)
chr8 (383-468)||(26775292-26775378)
chr8 (78-193)||(3883444-3883556)
chr8 (293-422)||(31573794-31573924)
chr8 (376-468)||(5622889-5622982)
chr8 (86-422)||(17847661-17847986)
chr8 (397-468)||(35872555-35872627)
chr8 (345-407)||(28332631-28332692)
chr8 (380-426)||(2468261-2468307)
chr8 (345-407)||(9021228-9021289)
chr8 (345-407)||(16752643-16752704)
chr8 (345-407)||(16757388-16757449)
chr8 (345-407)||(28327908-28327969)
chr8 (345-407)||(28895502-28895563)
chr8 (193-407)||(6376141-6376356)
chr8 (86-268)||(31566425-31566601)
chr8 (225-289)||(23799606-23799670)
chr8 (345-404)||(590797-590855)
chr8 (345-404)||(33032657-33032715)
chr8 (345-407)||(4812608-4812669)
chr8 (347-404)||(29554908-29554964)
chr8 (225-289)||(4696625-4696689)
chr8 (225-289)||(7412345-7412409)
chr8 (225-289)||(9765848-9765912)
chr8 (225-289)||(26403259-26403323)
chr8 (345-404)||(3276347-3276405)
chr8 (206-422)||(33838902-33839120)
chr8 (78-136)||(183244-183302)
chr8 (388-468)||(31035160-31035238)
chr8 (206-290)||(4812470-4812554)
chr8 (224-320)||(16833789-16833886)
chr8 (225-269)||(4743214-4743258)
chr8 (225-289)||(5702512-5702576)
chr8 (225-289)||(6127225-6127289)
chr8 (223-290)||(16757266-16757334)
chr8 (359-407)||(17799558-17799606)
chr8 (223-290)||(25684758-25684826)
chr8 (223-290)||(28890881-28890949)
chr8 (225-289)||(31071258-31071322)
chr8 (259-422)||(3895957-3896124)
chr8 (225-288)||(19752424-19752487)
chr8 (219-269)||(10930193-10930243)
chr8 (345-407)||(21033870-21033930)
chr8 (210-267)||(28228656-28228714)
chr8 (249-290)||(29554810-29554851)
chr8 (87-123)||(2467797-2467833)
chr8 (87-123)||(2467896-2467932)
chr8 (225-269)||(6599096-6599140)
chr8 (225-269)||(6674549-6674593)
chr8 (383-422)||(13985971-13986011)
chr8 (225-269)||(15212910-15212954)
chr8 (219-290)||(17799418-17799490)
chr8 (225-289)||(19175783-19175847)
chr8 (219-290)||(23179555-23179627)
chr8 (356-404)||(23179692-23179740)
chr8 (225-269)||(27811402-27811446)
chr8 (223-290)||(28328023-28328091)
chr8 (225-269)||(33352274-33352318)
chr8 (225-269)||(40321204-40321248)
[»] chr3 (168 HSPs)
chr3 (78-468)||(4308130-4308523)
chr3 (78-468)||(18099018-18099412)
chr3 (83-468)||(43228306-43228692)
chr3 (78-468)||(1313424-1313814)
chr3 (78-468)||(18096748-18097142)
chr3 (83-468)||(53917519-53917906)
chr3 (87-468)||(1626543-1626925)
chr3 (87-468)||(1321494-1321881)
chr3 (78-468)||(43226100-43226487)
chr3 (78-468)||(3314699-3315092)
chr3 (85-468)||(32263896-32264281)
chr3 (69-468)||(45882954-45883358)
chr3 (78-468)||(36011842-36012235)
chr3 (87-468)||(42990319-42990701)
chr3 (78-468)||(43423316-43423705)
chr3 (78-468)||(53915346-53915738)
chr3 (78-467)||(9604455-9604848)
chr3 (78-468)||(27101030-27101423)
chr3 (87-468)||(10084245-10084631)
chr3 (83-468)||(12267832-12268207)
chr3 (88-468)||(38890055-38890441)
chr3 (78-468)||(43421268-43421657)
chr3 (78-468)||(5926617-5927006)
chr3 (87-457)||(51674626-51674997)
chr3 (87-468)||(53468313-53468698)
chr3 (87-468)||(10955883-10956269)
chr3 (78-468)||(25533457-25533834)
chr3 (85-433)||(25688015-25688367)
chr3 (99-468)||(51943386-51943758)
chr3 (87-468)||(5191668-5192052)
chr3 (86-461)||(32219106-32219486)
chr3 (78-468)||(28101856-28102244)
chr3 (78-468)||(24979722-24980118)
chr3 (86-468)||(880312-880694)
chr3 (83-468)||(47148758-47149137)
chr3 (78-468)||(15780886-15781285)
chr3 (86-468)||(6484374-6484757)
chr3 (78-468)||(18162678-18163072)
chr3 (177-468)||(30005856-30006150)
chr3 (87-468)||(4103752-4104137)
chr3 (87-468)||(10958179-10958565)
chr3 (87-465)||(51726863-51727245)
chr3 (85-468)||(3859543-3859914)
chr3 (87-468)||(10191168-10191551)
chr3 (86-468)||(25388921-25389309)
chr3 (97-468)||(48361538-48361913)
chr3 (87-457)||(5522482-5522857)
chr3 (210-468)||(11170419-11170678)
chr3 (87-468)||(22114159-22114547)
chr3 (69-468)||(746772-747178)
chr3 (78-461)||(7606451-7606822)
chr3 (87-361)||(27635515-27635792)
chr3 (85-423)||(5886261-5886601)
chr3 (87-420)||(11168165-11168503)
chr3 (85-423)||(5899734-5900074)
chr3 (78-468)||(38210385-38210781)
chr3 (69-468)||(50494014-50494418)
chr3 (87-468)||(458299-458686)
chr3 (78-468)||(10621374-10621772)
chr3 (108-468)||(26720563-26720928)
chr3 (87-468)||(455922-456309)
chr3 (78-468)||(54691425-54691816)
chr3 (141-468)||(39715484-39715809)
chr3 (87-437)||(6231848-6232192)
chr3 (78-457)||(53591210-53591589)
chr3 (78-468)||(6065641-6066038)
chr3 (78-468)||(28412878-28413274)
chr3 (85-436)||(4666562-4666913)
chr3 (78-468)||(6063291-6063688)
chr3 (263-468)||(29956701-29956907)
chr3 (78-357)||(47701528-47701801)
chr3 (78-406)||(3306839-3307168)
chr3 (68-468)||(28761285-28761670)
chr3 (78-468)||(31151363-31151746)
chr3 (78-426)||(17795316-17795661)
chr3 (78-426)||(19103756-19104101)
chr3 (227-468)||(35917944-35918191)
chr3 (78-468)||(23633474-23633854)
chr3 (162-468)||(42992301-42992594)
chr3 (268-468)||(6561825-6562028)
chr3 (233-468)||(889779-890015)
chr3 (87-468)||(561640-562016)
chr3 (87-300)||(41849243-41849454)
chr3 (86-246)||(28181242-28181401)
chr3 (319-468)||(35777436-35777587)
chr3 (87-418)||(25635447-25635772)
chr3 (264-423)||(13420222-13420382)
chr3 (87-423)||(53597297-53597628)
chr3 (332-468)||(28100146-28100283)
chr3 (86-422)||(36871166-36871497)
chr3 (155-422)||(1674034-1674292)
chr3 (197-366)||(24181498-24181668)
chr3 (69-291)||(53893892-53894121)
chr3 (332-468)||(28181037-28181174)
chr3 (272-461)||(54884177-54884367)
chr3 (78-238)||(880092-880251)
chr3 (336-461)||(28137415-28137541)
chr3 (307-468)||(23637041-23637200)
chr3 (87-341)||(25634030-25634278)
chr3 (87-263)||(42992607-42992783)
chr3 (86-422)||(1620328-1620657)
chr3 (210-291)||(35919098-35919179)
chr3 (272-422)||(14634486-14634638)
chr3 (392-468)||(41849167-41849244)
chr3 (131-247)||(8183040-8183154)
chr3 (219-404)||(29913949-29914132)
chr3 (290-436)||(4560355-4560493)
chr3 (345-407)||(10094195-10094256)
chr3 (345-407)||(10201075-10201136)
chr3 (345-407)||(16462203-16462264)
chr3 (345-407)||(22626105-22626166)
chr3 (380-468)||(24177294-24177380)
chr3 (345-407)||(47883003-47883064)
chr3 (219-404)||(10897008-10897193)
chr3 (416-468)||(11163165-11163218)
chr3 (219-404)||(47878165-47878350)
chr3 (225-289)||(1736324-1736388)
chr3 (225-289)||(18552902-18552966)
chr3 (225-289)||(30709809-30709873)
chr3 (345-404)||(54193229-54193287)
chr3 (345-407)||(10100212-10100273)
chr3 (345-407)||(10208121-10208182)
chr3 (359-407)||(6303310-6303358)
chr3 (382-422)||(7768632-7768672)
chr3 (225-289)||(8370505-8370569)
chr3 (374-422)||(25633982-25634030)
chr3 (225-289)||(26298992-26299056)
chr3 (225-289)||(27974971-27975035)
chr3 (225-289)||(27986465-27986529)
chr3 (225-288)||(1417510-1417573)
chr3 (345-404)||(20031439-20031497)
chr3 (345-404)||(27762107-27762165)
chr3 (345-404)||(54188512-54188570)
chr3 (206-290)||(10612761-10612844)
chr3 (87-191)||(11170670-11170772)
chr3 (380-422)||(13419941-13419983)
chr3 (382-422)||(31021300-31021341)
chr3 (228-289)||(48438221-48438282)
chr3 (395-435)||(7606828-7606868)
chr3 (223-290)||(10094073-10094141)
chr3 (223-290)||(10100090-10100158)
chr3 (223-290)||(10200953-10201021)
chr3 (219-290)||(10595028-10595100)
chr3 (225-289)||(16264354-16264418)
chr3 (225-289)||(21711227-21711291)
chr3 (225-269)||(23391909-23391953)
chr3 (225-269)||(29196386-29196430)
chr3 (225-289)||(32143325-32143389)
chr3 (225-289)||(33386685-33386749)
chr3 (347-407)||(38002869-38002928)
chr3 (225-269)||(40734622-40734666)
chr3 (223-290)||(54193342-54193410)
chr3 (345-407)||(5858546-5858605)
chr3 (345-404)||(10595155-10595213)
chr3 (345-404)||(10612899-10612957)
chr3 (345-422)||(11066652-11066731)
chr3 (225-288)||(37466295-37466358)
chr3 (345-399)||(4535622-4535675)
chr3 (345-403)||(10949381-10949438)
chr3 (345-407)||(11079517-11079578)
chr3 (345-407)||(27544273-27544334)
chr3 (249-290)||(6303425-6303466)
chr3 (225-289)||(6794732-6794796)
chr3 (225-289)||(27452962-27453026)
chr3 (223-290)||(27544388-27544456)
chr3 (225-289)||(36029097-36029161)
chr3 (225-269)||(40913417-40913461)
chr3 (225-269)||(44331669-44331713)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (87-468)||(14247-14626)
scaffold0131 (204-468)||(15063-15326)
scaffold0131 (78-114)||(15395-15431)
[»] chr4 (159 HSPs)
chr4 (78-468)||(22800713-22801106)
chr4 (78-468)||(36921346-36921738)
chr4 (78-468)||(22802585-22802978)
chr4 (78-468)||(36919437-36919829)
chr4 (78-466)||(24888887-24889278)
chr4 (90-468)||(40637163-40637545)
chr4 (78-466)||(40091267-40091657)
chr4 (78-468)||(38928032-38928422)
chr4 (87-457)||(17662108-17662478)
chr4 (87-468)||(8631276-8631663)
chr4 (78-468)||(37089220-37089615)
chr4 (85-468)||(22046542-22046929)
chr4 (87-468)||(24348307-24348676)
chr4 (85-468)||(22044247-22044634)
chr4 (78-468)||(12395698-12396089)
chr4 (78-468)||(12400660-12401051)
chr4 (125-468)||(24879078-24879425)
chr4 (87-468)||(38409294-38409679)
chr4 (85-468)||(51015335-51015722)
chr4 (87-468)||(2484731-2485116)
chr4 (83-468)||(11435044-11435434)
chr4 (78-468)||(14787282-14787675)
chr4 (78-468)||(16453398-16453788)
chr4 (78-468)||(48486408-48486801)
chr4 (78-468)||(6764928-6765327)
chr4 (83-468)||(33415347-33415731)
chr4 (78-467)||(9148343-9148719)
chr4 (78-468)||(14633408-14633802)
chr4 (125-468)||(24880540-24880889)
chr4 (69-416)||(2891433-2891781)
chr4 (87-468)||(11006111-11006481)
chr4 (92-468)||(47274816-47275190)
chr4 (78-468)||(47868490-47868886)
chr4 (87-468)||(11008425-11008810)
chr4 (87-468)||(7941410-7941798)
chr4 (87-468)||(31849456-31849843)
chr4 (87-467)||(5198510-5198879)
chr4 (87-468)||(36378381-36378761)
chr4 (89-468)||(26085836-26086220)
chr4 (78-468)||(27499134-27499528)
chr4 (89-468)||(22132248-22132634)
chr4 (86-468)||(18847242-18847628)
chr4 (83-468)||(37312937-37313310)
chr4 (89-468)||(22134476-22134859)
chr4 (78-410)||(13547302-13547635)
chr4 (78-468)||(19095971-19096362)
chr4 (78-468)||(16931639-16932033)
chr4 (87-468)||(36380438-36380818)
chr4 (78-468)||(44599688-44600082)
chr4 (87-468)||(9176331-9176718)
chr4 (86-468)||(18709020-18709407)
chr4 (87-363)||(5635334-5635614)
chr4 (87-468)||(19322785-19323161)
chr4 (78-468)||(22780220-22780617)
chr4 (87-468)||(9174003-9174390)
chr4 (78-444)||(16455354-16455706)
chr4 (78-468)||(16933996-16934387)
chr4 (85-468)||(22782592-22782982)
chr4 (78-468)||(53405219-53405618)
chr4 (85-381)||(4215483-4215775)
chr4 (78-364)||(11437557-11437847)
chr4 (78-468)||(619306-619691)
chr4 (282-468)||(3824627-3824814)
chr4 (229-468)||(47210756-47210984)
chr4 (284-468)||(5637524-5637709)
chr4 (87-310)||(47563009-47563230)
chr4 (91-468)||(18537345-18537716)
chr4 (83-468)||(41997581-41997962)
chr4 (91-468)||(18534703-18535074)
chr4 (78-468)||(56030533-56030937)
chr4 (86-468)||(38890090-38890467)
chr4 (245-468)||(13544048-13544272)
chr4 (86-290)||(6133105-6133309)
chr4 (78-338)||(24446510-24446754)
chr4 (72-468)||(30136641-30137031)
chr4 (87-467)||(8756119-8756493)
chr4 (78-357)||(5101130-5101396)
chr4 (78-290)||(14789281-14789495)
chr4 (86-468)||(18409209-18409591)
chr4 (87-424)||(15032410-15032748)
chr4 (87-423)||(12102221-12102550)
chr4 (87-422)||(28453818-28454151)
chr4 (86-422)||(25357772-25358107)
chr4 (90-407)||(16185707-16186018)
chr4 (303-468)||(52942537-52942690)
chr4 (86-264)||(52942346-52942527)
chr4 (78-336)||(49088791-49089036)
chr4 (84-422)||(9863842-9864182)
chr4 (70-423)||(31983383-31983727)
chr4 (332-468)||(3937316-3937453)
chr4 (78-251)||(3937134-3937300)
chr4 (340-466)||(6132963-6133090)
chr4 (155-422)||(47150826-47151092)
chr4 (85-245)||(3824464-3824630)
chr4 (206-419)||(3982156-3982374)
chr4 (84-422)||(10113003-10113337)
chr4 (266-422)||(40998990-40999148)
chr4 (397-468)||(24446756-24446828)
chr4 (88-191)||(47210655-47210755)
chr4 (155-310)||(22295412-22295565)
chr4 (345-407)||(7050378-7050439)
chr4 (223-407)||(11853549-11853732)
chr4 (87-217)||(5664576-5664706)
chr4 (225-289)||(10047383-10047447)
chr4 (200-404)||(16688915-16689119)
chr4 (225-289)||(38152468-38152532)
chr4 (92-170)||(38270016-38270091)
chr4 (397-468)||(38270158-38270230)
chr4 (225-289)||(39245998-39246062)
chr4 (345-404)||(4556180-4556238)
chr4 (345-404)||(4558314-4558372)
chr4 (194-407)||(5336747-5336964)
chr4 (345-404)||(8529270-8529328)
chr4 (345-404)||(15316961-15317019)
chr4 (345-404)||(18586969-18587027)
chr4 (345-404)||(31300427-31300485)
chr4 (345-407)||(55822265-55822326)
chr4 (222-309)||(26557833-26557922)
chr4 (225-289)||(5269220-5269284)
chr4 (219-290)||(18587082-18587154)
chr4 (200-290)||(4884990-4885081)
chr4 (375-422)||(10114463-10114510)
chr4 (345-404)||(15831144-15831202)
chr4 (345-404)||(16489352-16489410)
chr4 (345-404)||(25699752-25699810)
chr4 (226-289)||(36315258-36315321)
chr4 (226-289)||(36329467-36329530)
chr4 (345-407)||(4570094-4570155)
chr4 (225-289)||(5396700-5396764)
chr4 (219-290)||(8529383-8529455)
chr4 (225-289)||(24333813-24333877)
chr4 (225-269)||(46147391-46147435)
chr4 (422-468)||(5101086-5101133)
chr4 (226-289)||(6743444-6743507)
chr4 (86-144)||(52043427-52043483)
chr4 (225-279)||(5147681-5147735)
chr4 (86-124)||(18311232-18311270)
chr4 (345-407)||(36771396-36771457)
chr4 (359-404)||(4884877-4884922)
chr4 (195-298)||(10114576-10114680)
chr4 (235-288)||(34495853-34495906)
chr4 (440-468)||(2891406-2891434)
chr4 (225-289)||(5143263-5143327)
chr4 (225-269)||(12739550-12739594)
chr4 (225-269)||(12743925-12743969)
chr4 (225-269)||(12745314-12745358)
chr4 (225-289)||(16623322-16623386)
chr4 (225-289)||(16630709-16630773)
chr4 (225-289)||(25862051-25862115)
chr4 (225-269)||(26175636-26175680)
chr4 (225-269)||(29254618-29254662)
chr4 (225-289)||(31985663-31985726)
chr4 (225-269)||(36463389-36463433)
chr4 (219-290)||(36769595-36769667)
chr4 (335-363)||(38270120-38270148)
chr4 (225-269)||(45687182-45687226)
chr4 (225-269)||(47038411-47038455)
chr4 (225-269)||(48893638-48893682)
chr4 (225-277)||(54867188-54867239)
[»] chr2 (126 HSPs)
chr2 (86-468)||(19007651-19008034)
chr2 (78-468)||(27104810-27105204)
chr2 (78-436)||(43623431-43623791)
chr2 (78-466)||(21520542-21520935)
chr2 (78-468)||(6264001-6264393)
chr2 (78-468)||(45279850-45280228)
chr2 (87-468)||(23452094-23452481)
chr2 (78-468)||(6258670-6259059)
chr2 (86-464)||(17849132-17849511)
chr2 (92-467)||(42923373-42923752)
chr2 (65-468)||(22287176-22287580)
chr2 (83-468)||(28196648-28197032)
chr2 (98-430)||(5375218-5375550)
chr2 (86-468)||(13909902-13910288)
chr2 (210-468)||(19501996-19502255)
chr2 (78-468)||(14837284-14837671)
chr2 (105-468)||(42064526-42064878)
chr2 (87-468)||(19504194-19504589)
chr2 (141-468)||(40031968-40032302)
chr2 (78-468)||(34979442-34979823)
chr2 (210-468)||(42452794-42453050)
chr2 (90-468)||(3022174-3022562)
chr2 (86-468)||(35215449-35215830)
chr2 (140-468)||(44288982-44289312)
chr2 (105-468)||(17848454-17848814)
chr2 (117-366)||(22407346-22407595)
chr2 (90-468)||(24162084-24162456)
chr2 (86-468)||(35217826-35218207)
chr2 (87-468)||(28459054-28459434)
chr2 (78-468)||(11739429-11739804)
chr2 (78-408)||(36560989-36561324)
chr2 (87-344)||(22707613-22707872)
chr2 (69-408)||(36558720-36559047)
chr2 (99-354)||(7462819-7463077)
chr2 (86-468)||(11577974-11578349)
chr2 (78-314)||(22162877-22163111)
chr2 (108-468)||(31732666-31733009)
chr2 (78-468)||(45238850-45239220)
chr2 (185-468)||(22874145-22874425)
chr2 (78-408)||(45332028-45332364)
chr2 (97-422)||(17897125-17897443)
chr2 (155-422)||(20146540-20146806)
chr2 (177-468)||(18800267-18800554)
chr2 (93-345)||(23870951-23871205)
chr2 (91-249)||(15539396-15539553)
chr2 (156-424)||(40699429-40699697)
chr2 (303-468)||(15539553-15539719)
chr2 (87-190)||(38020370-38020473)
chr2 (158-422)||(35107351-35107618)
chr2 (195-425)||(27136101-27136326)
chr2 (78-423)||(37962799-37963137)
chr2 (323-468)||(38020213-38020349)
chr2 (383-468)||(22163106-22163191)
chr2 (338-443)||(38414194-38414297)
chr2 (290-407)||(20589763-20589881)
chr2 (78-199)||(38414036-38414156)
chr2 (407-468)||(22407591-22407653)
chr2 (86-270)||(20592288-20592467)
chr2 (86-422)||(35028632-35028959)
chr2 (219-404)||(17943540-17943723)
chr2 (290-422)||(43139432-43139564)
chr2 (225-289)||(8390179-8390243)
chr2 (78-158)||(22874431-22874511)
chr2 (223-407)||(2736205-2736388)
chr2 (345-407)||(17462436-17462497)
chr2 (345-407)||(20054886-20054947)
chr2 (345-407)||(22712637-22712698)
chr2 (345-407)||(22717346-22717407)
chr2 (345-407)||(39680045-39680106)
chr2 (345-407)||(39686983-39687044)
chr2 (345-407)||(45567409-45567470)
chr2 (225-290)||(34682362-34682427)
chr2 (87-164)||(42453798-42453874)
chr2 (225-289)||(14699036-14699100)
chr2 (290-423)||(15693958-15694094)
chr2 (87-158)||(19501859-19501930)
chr2 (225-289)||(28259206-28259270)
chr2 (345-404)||(12781342-12781400)
chr2 (345-422)||(17921754-17921833)
chr2 (345-404)||(17932637-17932695)
chr2 (345-404)||(27517760-27517818)
chr2 (345-407)||(2740941-2741002)
chr2 (155-271)||(8173539-8173653)
chr2 (380-421)||(27583494-27583535)
chr2 (219-287)||(1345572-1345640)
chr2 (225-289)||(13569332-13569396)
chr2 (225-289)||(20522224-20522288)
chr2 (225-289)||(33118140-33118204)
chr2 (380-423)||(26345661-26345704)
chr2 (345-404)||(37170873-37170931)
chr2 (345-407)||(28458949-28459011)
chr2 (225-289)||(8040064-8040128)
chr2 (225-289)||(10445473-10445537)
chr2 (225-289)||(16940238-16940302)
chr2 (225-289)||(17010903-17010967)
chr2 (225-269)||(17057369-17057413)
chr2 (225-269)||(17085352-17085396)
chr2 (223-290)||(17462551-17462619)
chr2 (219-290)||(30479110-30479182)
chr2 (225-269)||(36773686-36773730)
chr2 (359-407)||(38190997-38191045)
chr2 (225-269)||(38312364-38312408)
chr2 (225-289)||(39482935-39482999)
chr2 (223-290)||(45679838-45679906)
chr2 (437-468)||(5377642-5377673)
chr2 (345-404)||(30478997-30479055)
chr2 (345-422)||(30720732-30720811)
chr2 (380-422)||(34575265-34575308)
chr2 (249-290)||(2741056-2741097)
chr2 (219-272)||(2838076-2838129)
chr2 (219-290)||(20050015-20050088)
chr2 (228-269)||(29867993-29868034)
chr2 (249-290)||(33670992-33671033)
chr2 (206-290)||(39680160-39680244)
chr2 (225-269)||(723744-723788)
chr2 (225-289)||(10707281-10707345)
chr2 (222-340)||(13828338-13828458)
chr2 (225-289)||(17865207-17865271)
chr2 (359-407)||(20050156-20050204)
chr2 (225-289)||(33528650-33528714)
chr2 (258-309)||(33604092-33604144)
chr2 (225-269)||(34139770-34139814)
chr2 (225-289)||(34388862-34388926)
chr2 (225-269)||(39284960-39285004)
chr2 (223-290)||(39687098-39687166)
chr2 (92-124)||(42923315-42923347)
[»] chr1 (133 HSPs)
chr1 (78-468)||(47906305-47906696)
chr1 (85-456)||(27336799-27337173)
chr1 (86-468)||(51750074-51750461)
chr1 (78-468)||(2949087-2949477)
chr1 (78-468)||(18839622-18840014)
chr1 (85-468)||(27338990-27339376)
chr1 (92-468)||(13215116-13215496)
chr1 (85-468)||(14097830-14098216)
chr1 (69-468)||(15823581-15823985)
chr1 (86-468)||(12302367-12302751)
chr1 (78-468)||(50307397-50307793)
chr1 (78-468)||(17324486-17324882)
chr1 (78-468)||(4131229-4131625)
chr1 (78-468)||(11457330-11457721)
chr1 (78-468)||(39462554-39462948)
chr1 (78-468)||(25251129-25251521)
chr1 (87-468)||(15294694-15295080)
chr1 (78-468)||(46431556-46431953)
chr1 (78-468)||(6995548-6995946)
chr1 (105-468)||(28840715-28841083)
chr1 (78-468)||(31735373-31735767)
chr1 (78-468)||(10399677-10400074)
chr1 (78-468)||(41646955-41647347)
chr1 (78-468)||(31424870-31425265)
chr1 (86-468)||(9240950-9241332)
chr1 (78-463)||(50248425-50248813)
chr1 (87-468)||(13761872-13762257)
chr1 (97-468)||(18307144-18307516)
chr1 (78-468)||(39932108-39932506)
chr1 (116-468)||(50076566-50076918)
chr1 (87-468)||(2617551-2617939)
chr1 (83-468)||(38925341-38925724)
chr1 (78-468)||(24325698-24326093)
chr1 (87-468)||(28842530-28842915)
chr1 (78-458)||(31489958-31490337)
chr1 (212-468)||(6823050-6823306)
chr1 (78-363)||(23816027-23816315)
chr1 (78-468)||(28206920-28207312)
chr1 (69-468)||(17318928-17319322)
chr1 (78-443)||(25248406-25248772)
chr1 (92-468)||(28998116-28998499)
chr1 (92-468)||(29003832-29004215)
chr1 (78-468)||(9459285-9459663)
chr1 (78-468)||(9463112-9463490)
chr1 (111-468)||(16428688-16429043)
chr1 (83-468)||(17185992-17186374)
chr1 (87-468)||(20302494-20302863)
chr1 (78-468)||(16226202-16226599)
chr1 (78-468)||(40133979-40134370)
chr1 (87-468)||(20291492-20291878)
chr1 (78-468)||(25127907-25128299)
chr1 (78-419)||(16429042-16429379)
chr1 (87-468)||(2510202-2510570)
chr1 (210-466)||(51752402-51752657)
chr1 (94-463)||(17324103-17324484)
chr1 (78-468)||(31422714-31423120)
chr1 (153-468)||(6756562-6756877)
chr1 (261-468)||(21948226-21948433)
chr1 (183-468)||(50078779-50079067)
chr1 (86-468)||(47179748-47180136)
chr1 (78-412)||(51757623-51757965)
chr1 (78-457)||(16432440-16432813)
chr1 (193-468)||(3579587-3579862)
chr1 (69-408)||(23785935-23786279)
chr1 (86-468)||(47177397-47177785)
chr1 (78-436)||(16231631-16231994)
chr1 (78-424)||(6114961-6115304)
chr1 (78-468)||(47451683-47452057)
chr1 (282-468)||(48665212-48665400)
chr1 (86-468)||(14183470-14183835)
chr1 (87-425)||(18800439-18800775)
chr1 (108-468)||(15669281-15669637)
chr1 (177-424)||(42922310-42922556)
chr1 (78-468)||(8348913-8349295)
chr1 (83-425)||(8347139-8347475)
chr1 (195-423)||(49495182-49495411)
chr1 (78-330)||(15916564-15916813)
chr1 (305-468)||(6823920-6824091)
chr1 (87-200)||(50078653-50078766)
chr1 (86-424)||(13125326-13125660)
chr1 (87-299)||(13358778-13358995)
chr1 (87-424)||(30790266-30790602)
chr1 (87-426)||(16561544-16561878)
chr1 (157-422)||(30738561-30738830)
chr1 (195-422)||(26613211-26613440)
chr1 (87-251)||(13447133-13447301)
chr1 (78-212)||(3579439-3579572)
chr1 (86-422)||(28279346-28279680)
chr1 (177-422)||(27916576-27916822)
chr1 (247-422)||(155788-155963)
chr1 (219-404)||(21353342-21353525)
chr1 (163-424)||(26520061-26520321)
chr1 (78-189)||(30780361-30780474)
chr1 (87-192)||(25860270-25860371)
chr1 (347-422)||(26332613-26332688)
chr1 (345-407)||(2232597-2232658)
chr1 (345-404)||(2401342-2401400)
chr1 (345-404)||(9526469-9526527)
chr1 (185-422)||(14353047-14353282)
chr1 (345-404)||(25134074-25134132)
chr1 (266-418)||(43104245-43104400)
chr1 (345-407)||(4144804-4144865)
chr1 (225-289)||(13598402-13598466)
chr1 (225-289)||(16124545-16124609)
chr1 (225-289)||(37069774-37069838)
chr1 (225-289)||(47703965-47704029)
chr1 (87-163)||(51752715-51752789)
chr1 (345-404)||(9521718-9521776)
chr1 (205-314)||(13127669-13127779)
chr1 (225-288)||(19072932-19072995)
chr1 (225-288)||(19120822-19120885)
chr1 (375-422)||(26332714-26332761)
chr1 (225-288)||(47098854-47098917)
chr1 (225-290)||(21536597-21536662)
chr1 (228-289)||(29651818-29651879)
chr1 (225-289)||(9476265-9476329)
chr1 (225-285)||(26644930-26644990)
chr1 (225-288)||(47102871-47102934)
chr1 (380-422)||(49959129-49959172)
chr1 (346-404)||(2393404-2393461)
chr1 (228-286)||(3281715-3281773)
chr1 (86-147)||(10116125-10116184)
chr1 (225-269)||(834167-834211)
chr1 (223-286)||(2232710-2232774)
chr1 (225-269)||(3156989-3157033)
chr1 (223-290)||(9526582-9526650)
chr1 (225-289)||(13604652-13604716)
chr1 (87-158)||(26519305-26519373)
chr1 (225-289)||(27104401-27104465)
chr1 (225-269)||(28220226-28220270)
chr1 (225-269)||(28223421-28223465)
chr1 (225-269)||(28265554-28265598)
chr1 (225-269)||(49918474-49918518)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (78-468)||(79229-79623)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (87-468)||(69149-69535)
scaffold0025 (409-468)||(73207-73267)
scaffold0025 (398-436)||(73160-73198)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (87-468)||(41341-41727)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (78-468)||(11322-11717)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (78-468)||(52055-52448)
scaffold0005 (78-468)||(183490-183884)
scaffold0005 (78-290)||(50235-50449)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (80-445)||(1303-1673)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (92-468)||(4041-4415)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (78-468)||(79903-80297)
scaffold0004 (345-407)||(188363-188424)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (87-468)||(29215-29600)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (78-468)||(85274-85665)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (78-468)||(6243-6638)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (87-468)||(2924-3309)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (88-468)||(85-455)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (256-468)||(2086-2298)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (87-424)||(1509-1842)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (210-408)||(22221-22418)
scaffold0140 (210-408)||(24496-24693)
scaffold0140 (225-289)||(8448-8512)
scaffold0140 (85-144)||(22491-22549)
scaffold0140 (85-144)||(24766-24824)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (177-424)||(15775-16021)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (86-468)||(16516-16892)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (78-290)||(35817-36031)
scaffold0011 (333-468)||(35683-35819)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (78-422)||(4901-5239)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (78-257)||(1300-1483)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (87-279)||(4535-4733)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (78-193)||(12723-12835)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (345-407)||(224819-224880)
scaffold0006 (225-289)||(5687-5751)
scaffold0006 (225-289)||(2496-2560)
scaffold0006 (225-289)||(133309-133373)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (345-404)||(16328-16386)
[»] scaffold0209 (2 HSPs)
scaffold0209 (219-290)||(16980-17052)
scaffold0209 (345-404)||(17107-17165)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (228-288)||(10736-10796)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (193-290)||(3039-3136)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (249-407)||(57452-57613)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (225-289)||(43990-44054)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (83-124)||(9-49)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (225-289)||(45257-45321)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (225-269)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 18 - 468
Target Start/End: Original strand, 10474116 - 10474567
Alignment:
Q  18 tttgtttgttaaaatgaacttaaagaaagactatgatttaaataaacctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10474116 tttgtttgttaaaatgaacttaaagaaagactatgatttaaataaacctatgtgttgtgtattcgatgaaaaattacatcaataataaacttgatgtgtg 10474215  T
Q  118 gagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10474216 gagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaaaggaagagagaacaca 10474315  T
Q  218 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaat 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  10474316 aaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatat 10474415  T
Q  318 caatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  10474416 caatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgt 10474515  T
Q  418 atcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474516 atcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 10474567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 84 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16776580 - 16776193
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||  | |||| |||||||    
T  16776580 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagta 16776482  T
Q  184 gaaaacaac---gagagagaaagga-agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||||   |||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16776481 gaaaacaacagcgagagaaaaagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctcc 16776382  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16776381 gatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 16776283  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16776282 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaac 16776193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21948460 - 21948061
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21948460 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagc 21948361  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
     |||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21948360 caaaagtagaaaatagcgagagagagggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagaga 21948261  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948260 gcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcc 21948161  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948160 tcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 21948061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 658220 - 658597
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  658220 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaacataagccaaaagtagaa 658319  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||| | |||    
T  658320 aacagcaagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccatccgtttcac 658414  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  658415 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 658514  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  658515 gactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaac 658597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39854913 - 39854518
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| | || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  39854913 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 39854814  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  39854813 aaaagtaaaaaacaacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcag 39854714  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  39854713 ccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctctt 39854614  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854613 cccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 39854518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 18511064 - 18511456
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  18511064 attcgatgataaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcaa 18511163  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  18511164 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 18511263  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |    
T  18511264 tccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttccc 18511363  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18511364 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 18511456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6745499 - 6745104
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6745499 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaag 6745400  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    | |||||| ||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  6745399 ccaaaagtcgaaaacaacagcgagagaaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagca 6745300  T
Q  273 gccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6745299 gccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctct 6745200  T
Q  373 cctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6745199 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaac 6745104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Original strand, 1189474 - 1189853
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||      
T  1189474 cacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactg 1189573  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggg-ggagagagcagccctccgatccactat- 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  1189574 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactata 1189673  T
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagac 389  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||||||||    
T  1189674 attatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagac 1189773  T
Q  390 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189774 tcaatcataatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 1189853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 70 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40221963 - 40221557
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221963 tgttgtaaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaac 40221864  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg 263  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||      |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40221863 acaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 40221764  T
Q  264 gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 362  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40221763 gagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagt 40221664  T
Q  363 cccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40221663 cccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactcta 40221564  T
Q  462 tacaaac 468  Q
    |||||||    
T  40221563 tacaaac 40221557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 17818352 - 17818734
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17818352 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 17818451  T
Q  187 aacaacgagagaga--aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  17818452 aacagcgagagagagaaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttcc 17818549  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| | |||||||||    
T  17818550 actgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaa 17818649  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17818650 gagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaac 17818734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4237049 - 4236664
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  4237049 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 4236953  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    |  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4236952 aacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctcc 4236854  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4236853 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 4236754  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236753 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 4236664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 2818186 - 2818580
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  2818186 attcgatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 2818284  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  2818285 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagt 2818384  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2818385 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttc 2818484  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc-aacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818485 ccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 2818580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Original strand, 25921333 - 25921717
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||    
T  25921333 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaa 25921429  T
Q  189 caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||     
T  25921430 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgt 25921529  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  25921530 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaac 25921629  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921630 caagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 25921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2175323 - 2174954
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  2175323 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtaga 2175227  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2175226 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2175137  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2175136 ctatatgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 2175038  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175037 agactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 2174954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24127283 - 24126891
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  24127283 attcgatgaaaaatcacacaaataacaaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacataagtc 24127184  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24127183 aaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 24127084  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  24127083 tccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 24126984  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  24126983 gtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaac 24126891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38882509 - 38882141
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38882509 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38882413  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38882412 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccac 38882323  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38882322 tatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 38882224  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38882223 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaac 38882141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 444
Target Start/End: Original strand, 41585588 - 41585963
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  41585588 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 41585687  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaga---------gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41585688 aaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagag 41585787  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||      
T  41585788 agcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaat 41585887  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttc 444  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41585888 ctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagttttgttc 41585963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18597071 - 18596680
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  18597071 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 18596972  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  18596971 aaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagcca 18596874  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |     
T  18596873 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcc 18596774  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596773 cgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 18596680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6747730 - 6747341
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaa 179  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6747730 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaa 6747631  T
Q  180 agtagaaaacaac-gagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  6747630 agtcgaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccct 6747531  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  6747530 ccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccg 6747432  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  6747431 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaac 6747341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 108 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097768
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcag-cctctgttccactatatgatgagtaacgttaca 26097929  T
Q  308 aaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26097928 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgttt 26097829  T
Q  408 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26097828 -ccaaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaac 26097768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18467115 - 18466719
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  18467115 attcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcca 18467018  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18467017 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 18466918  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466917 cagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 18466818  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18466817 ctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaac 18466719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27912967 - 27912571
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  27912967 attcgatgaaaaatcccaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcta 27912870  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27912869 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 27912770  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27912769 cagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcct 27912670  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912669 cttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaac 27912571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 109 - 468
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509562
Alignment:
Q  109 tgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaag 207  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttaca 18509400  T
Q  308 aaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509401 aaatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 18509500  T
Q  408 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18509501 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 18509562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 77 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25804456 - 25804060
Alignment:
Q  77 tattccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||    
T  25804456 tattcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agc 25804360  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  25804359 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agag 25804261  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  25804260 agcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaat 25804161  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25804160 ctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa 25804061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27910864 - 27910485
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  27910864 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatacaagcta 27910767  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||| ||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||    
T  27910766 aaagtataaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctct 27910677  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  27910676 ccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccg 27910577  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910576 taaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 27910485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 37705644 - 37706024
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  37705644 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaacacaagccaaaagtagaa 37705743  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| | || | |||    
T  37705744 aacagcgagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcac 37705841  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  || |  |||| | |||||||||||    
T  37705842 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 37705941  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  37705942 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaac 37706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6756919 - 6756529
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||     
T  6756919 attcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcc 6756820  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6756819 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccc 6756720  T
Q  277 tccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    | || | |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |     
T  6756719 t-cgtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat--gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 6756623  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756622 cgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 6756529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 36402178 - 36402572
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  36402178 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaacacaagct 36402277  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  36402278 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcaga 36402377  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||  |    
T  36402378 catctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctc 36402477  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402478 ccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 36402572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Original strand, 16092044 - 16092444
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16092044 gtgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataacaaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaa 16092142  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| | | ||||||    
T  16092143 cgcaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagag 16092242  T
Q  269 agcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16092243 agcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa 16092342  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16092343 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaa 16092442  T
Q  467 ac 468  Q
    ||    
T  16092443 ac 16092444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25904528 - 25904140
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  25904528 attcgatgagaaaacacacca-taataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaacca 25904430  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  25904429 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 25904330  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |  |||| | ||    
T  25904329 ccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccg 25904230  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904229 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaa 25904140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 87 - 463
Target Start/End: Original strand, 10528955 - 10529338
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10528955 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10529051  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  10529052 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcctt 10529151  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||    
T  10529152 ccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccg 10529251  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529252 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata 10529338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 78 - 425
Target Start/End: Original strand, 20505695 - 20506041
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20505695 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaag 20505794  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  20505795 ccaaaactagaaaacaacgagagaaaat--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga--gcagc 20505890  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  20505891 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 20505990  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505991 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20506041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18469449 - 18469046
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  18469449 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaa 18469352  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgg 261  Q
     | |||| |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18469351 tacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctgg 18469252  T
Q  262 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 361  Q
    |  |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18469251 g--agagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaag 18469154  T
Q  362 tcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactct 460  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18469153 tcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactct 18469054  T
Q  461 atacaaac 468  Q
    ||||||||    
T  18469053 atacaaac 18469046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2954841 - 2954463
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattata-aacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||     
T  2954841 attcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaagcc 2954742  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2954741 aaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccc 2954644  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  2954643 tccgcttcactatatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctc 2954545  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaa 456  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2954544 gtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaa 2954463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 34476910 - 34477298
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  34476910 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 34477006  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34477007 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 34477106  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  34477107 cgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg 34477205  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34477206 taaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 34477298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 86 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2724311 - 2723970
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2724311 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 2724212  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  2724211 aaacagcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttca 2724112  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||         |||  |||| | ||||||||||    
T  2724111 ctatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaag 2724021  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2724020 agactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcatccctcaaaccctag 2723970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 21684310 - 21684695
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||||||    
T  21684310 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aataaaagccaaaagtagaa 21684406  T
Q  187 aacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||| |||||||       |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21684407 aacaacg-gagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 21684505  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  21684506 cgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgt 21684604  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21684605 aaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 21684695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 31465846 - 31466222
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31465846 atgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaag 31465945  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||          
T  31465946 tagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc------ 31466039  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
        |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||    
T  31466040 ----ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaac 31466134  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31466135 caagagactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 31466222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 696292 - 695924
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaa-acaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  696292 aaaatcataccaataacagacttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaaac-aaaagtaga 696194  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||    
T  696193 aaacaac---agagaaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttca 696097  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||    
T  696096 ctataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaa 695997  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  695996 gagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagatacaaac 695924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 34479275 - 34479663
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||  ||| |||||||||    
T  34479275 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaatgca--agccaaaagtaga 34479371  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34479372 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 34479471  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |    
T  34479472 cgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctg 34479570  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34479571 taaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 34479663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 93 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17073298 - 17072918
Alignment:
Q  93 acaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac 192  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  17073298 acaccaataataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaac 17073199  T
Q  193 ---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
       |||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  17073198 agcgagagaaaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactat 17073099  T
Q  290 a-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |||| | | |||||||||||    
T  17073098 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagaga 17072999  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17072998 ttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 17072918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Original strand, 31179212 - 31179615
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  31179212 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta--aa 31179308  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaa-aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttg 260  Q
    || |||| |||||||||| |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  31179309 cacaagccaaaagtagaagaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacagaa--atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg 31179406  T
Q  261 ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179407 ggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 31179505  T
Q  361 gtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaact 458  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31179506 gtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaact 31179605  T
Q  459 ctatacaaac 468  Q
    ||||||||||    
T  31179606 ctatacaaac 31179615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 87 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4410442 - 4410084
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  4410442 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 4410347  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||| ||      ||||   || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  4410346 aacagcggcgaaaagagcacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctcc 4410247  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4410246 aatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 4410148  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgtt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4410147 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagttttgtt 4410084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39798460 - 39798123
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  39798460 attcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 39798364  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39798363 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccct 39798274  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | ||    
T  39798273 ccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccg 39798174  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798173 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10587236 - 10586873
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||  ||||||||||    
T  10587236 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagga-taatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagtcaaaagtagaa 10587140  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg-agagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10587139 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatcca 10587050  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||   ||||| ||||    
T  10587049 ctatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaag 10586951  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgtt-ccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10586950 agactgaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta 10586873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21289185 - 21288799
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |    
T  21289185 attcgatgaaaaatcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagcca 21289086  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21289085 aaagtagaaaacaacgagagaacaa--aagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 21288988  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||        ||| ||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| | ||    
T  21288987 ccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaag--------atgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccg 21288896  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-------ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288895 taaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 21288799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31543153 - 31542770
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  31543153 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaa 31543057  T
Q  189 caacga----gagag-aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||     ||||  ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31543056 caacggcgaggagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaa 31542957  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  31542956 tccactatatgatgagtactgttac-aaagagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 31542859  T
Q  382 caagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31542858 caagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 31542770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 12555773 - 12556167
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  12555773 gaaaactcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtag 12555872  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaag----------agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  12555873 aaaacaacgagagagaaaagaagagaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagc 12555972  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    |||||| | | || || ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| || |||||||  | ||||||||||| ||| | |||  ||||     
T  12555973 cctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaact-ccaatctctt 12556071  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12556072 cccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 12556167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 210 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545115
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac-aa 31545276  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31545275 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttc 31545176  T
Q  409 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31545175 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 31545115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15552668 - 15552280
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |||||||||    
T  15552668 aaaaatcacaccaataac-aacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagctaaaagtaga 15552572  T
Q  186 aaacaa---cgagagaga----aaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||| ||   ||||| |||    || |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15552571 aaataatggcgaga-agaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccc 15552473  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  15552472 tccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 15552374  T
Q  377 gtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  15552373 gtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaac 15552280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 177 - 468
Target Start/End: Original strand, 31472563 - 31472857
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaa-aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  31472563 aaaattagaaaacaatgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaacc 31472662  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || | |  ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |    
T  31472663 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttc 31472762  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31472763 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 31472857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36208999 - 36208656
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |    
T  36208999 attcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatcacaagcca 36208900  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||     
T  36208899 aaagtagaaaacaacga--gagaaagaaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggaaagagcagcccg 36208804  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtct-cccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||  |||| |     
T  36208803 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 36208704  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  36208703 cgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 26098146 - 26098378
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26098146 gaaaactcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 26098245  T
Q  185 aaaacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagt-ttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||     
T  26098246 aaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgt 26098345  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26098346 ttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagaga 26098378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10750121 - 10749796
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10750121 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10750025  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10750024 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10749926  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  10749925 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 10749827  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749826 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 38959980 - 38960314
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  38959980 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 38960076  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagag-----agaaaggaagagagaa---cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||| |      | ||| ||| | ||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38960077 aaagtagaaaacaacgacaagaagaacaaaagaaaaaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagaga 38960176  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  38960177 gcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatc 38960274  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960275 tcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 3372985 - 3373320
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  |||     
T  3372985 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agcc 3373081  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacg------agagagaaag--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||      ||||  ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  3373082 aaaagtagaaaacaacggcgagaagagcaaaagaagaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 3373180  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3373181 agcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 3373279  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373280 ctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 468
Target Start/End: Original strand, 39397915 - 39398237
Alignment:
Q  135 acaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccc 234  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||            ||||||||||||||| | ||||||     
T  39397915 acaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag------------agaacacaaaagaatgttttgacct 39398002  T
Q  235 agttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaat 334  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |  ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  39398003 agttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 39398102  T
Q  335 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 434  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39398103 aagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cct 39398201  T
Q  435 ag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39398202 agtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 39398237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10757597 - 10757273
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  10757597 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 10757501  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10757500 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 10757402  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  10757401 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgt 10757304  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757303 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20054251 - 20053923
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| || | |||||||||    
T  20054251 aaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaacacaaac-aaaagtaga 20054155  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||     
T  20054154 aaacgaagagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttct 20054056  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||   |||||    |||||    
T  20054055 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtccca--atctcc---aaacca 20053964  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053963 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 20053923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 425
Target Start/End: Original strand, 6661053 - 6661386
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  6661053 aaaatcacaccaattaaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 6661149  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |||| |||   |||||| | |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| | |||| ||||    
T  6661150 aacaacgagaga-aaagaaagagaacacacgaaa---tttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttcca 6661245  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||   ||| | ||| |||||    
T  6661246 ctataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaa 6661345  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6661346 gagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaaccc 6661386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354757
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15354658  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354659 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665140
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23665239  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665238 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793447
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23793348  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793349 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15357033
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aa 15356934  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356935 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9020633 - 9020299
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9020633 aaaatcacacgaataaaatatttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 9020538  T
Q  187 aacaacgagagagaaagga-agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    || ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9020537 aataacgataga-aaagaagagagagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatcc 9020439  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| | ||| ||||    
T  9020438 actataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgacca 9020339  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9020338 agaaactcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaac 9020299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23742034
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 23741942  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaata 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741943 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 282 - 468
Target Start/End: Original strand, 34530722 - 34530910
Alignment:
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||| | ||||     
T  34530722 tccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtag 34530821  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34530822 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 34530910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20043416 - 20043222
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataa-tcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  20043416 attcaatgagaaaacacatcaataacaaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 20043317  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  20043316 aaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143547
Alignment:
Q  154 tggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgac 252  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  | |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  253 atagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaat 350  Q
     |||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaat 15143619  T
Q  351 tctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15143618 tctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20045045
Alignment:
Q  342 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gttt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  441 gttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaac 20045045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 346 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20043085
Alignment:
Q  346 ctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttc 444  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  445 caaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaac 20043085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 17413200 - 17413365
Alignment:
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacc 356  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||    
T  17413200 tgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacc 17413299  T
Q  357 caaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
     |||||| ||  |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17413300 taaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17413365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4898071 - 4897828
Alignment:
Q  159 caattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagt 257  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | |||| ||||    
T  4898071 caattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagag-gaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagt 4897977  T
Q  258 ttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctccc-gcctaattctac 355  Q
     ||||||||| |||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||    
T  4897976 atgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctac 4897877  T
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||| ||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4897876 ccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 468
Target Start/End: Original strand, 26098402 - 26098495
Alignment:
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26098402 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 26098495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 190
Target Start/End: Original strand, 34530558 - 34530679
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34530558 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaa 34530657  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    || |||  ||||||||| ||||    
T  34530658 cacaagtcaaaagtagacaaca 34530679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20045395 - 20045292
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20045395 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacga 20045296  T
Q  195 gaga 198  Q
    ||||    
T  20045295 gaga 20045292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Original strand, 15445135 - 15445372
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||  |||||||||| |||| |||  |||||    
T  15445135 aaaaacacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaa--attataaacacaagcaaaagatagaa 15445230  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||| |||||||  ||| |||||| ||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||| ||||  ||||||||||||| || ||||    
T  15445231 aacatcgagaga--aagaaagagaaaacacacga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttcca 15445326  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15445327 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 15445372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23667601 - 23667497
Alignment:
Q  221 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23667601 gaatttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaa 23667503  T
Q  321 tgggtt 326  Q
    ||||||    
T  23667502 tgggtt 23667497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770951
Alignment:
Q  289 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 42770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Original strand, 2144437 - 2144763
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| ||   |  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2144437 aaaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagtaa--aataatcaagcaactaaaacaatgtgggt--aacaattataaacacaagc-aaaagtaga 2144531  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||       ||||||||||||| | ||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2144532 aaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aattt-------cagttcggtccaatactggtttagtttgagggagagagcagccctccgttcc 2144621  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaat-caatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcc-cagcctctcctcgtaa 380  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||  ||  |||||||| ||| |||| ||   |||||||| |||||||||||  |  |||| | ||  |    
T  2144622 actataatgatgagtaactttac-aaagagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcctgaatctcttcccgcga 2144720  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2144721 ccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 2144763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22673043 - 22672837
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaac--acaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat- 294  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  22673043 aaaggaagagagaaagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgata 22672944  T
Q  295 -gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactca 392  Q
     ||||  | ||||||| |||| ||   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22672943 tgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactca 22672849  T
Q  393 atcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||    
T  22672848 atcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1170994 - 1170811
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  1170994 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 1170899  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170898 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 35385573 - 35385634
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385573 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25445684 - 25445501
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  25445684 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 25445586  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatag 402  Q
     ||   || || |||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445585 tat---tgagtaacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25452556 - 25452498
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25452556 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298122 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11917000
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactata 11917000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353361
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932379
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15354429 - 15354487
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  15354429 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 15354487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15356705 - 15356763
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  15356705 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 15356763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23665469 - 23665411
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23665469 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23665411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 23741712 - 23741770
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23741712 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23741770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 23793118 - 23793176
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  23793118 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 23793176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28786465 - 28786407
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786465 cctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 28832263 - 28832326
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28832263 ttgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 28832326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1240489 - 1240428
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1240489 cctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770847
Alignment:
Q  336 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaaccc 42770847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281819
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464600
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17003989
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactat 17003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Original strand, 35385450 - 35385518
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35385450 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 35385518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42238448 - 42238376
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42238448 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 42238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 11962554 - 11962612
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11962554 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacacaatcctaatagtg 11962612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 17841370 - 17841428
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17841370 cctaattctacccaa-gttccagcctcttcccgtgacctagagactcaatcctaatagtg 17841428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 468
Target Start/End: Original strand, 20507675 - 20507706
Alignment:
Q  437 gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507675 gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 20507706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 422
Target Start/End: Original strand, 34033725 - 34033768
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34033725 accaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa 34033768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754235
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||| |  || |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa 4754235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Original strand, 16093413 - 16093473
Alignment:
Q  346 ctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||| || ||||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093413 ctaattctacctaa-gtcccagacttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533893
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12084268 - 12084204
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| || | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  12084268 ttgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactat 12084204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428474
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 42428474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 108)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 11982880 - 11983273
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| |    
T  11982880 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatcacaagcca 11982978  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11982979 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 11983078  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11983079 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 11983178  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983179 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 11983273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9020390 - 9019996
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  9020390 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagcca 9020291  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9020290 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagc 9020191  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  9020190 cccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 9020091  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020090 ctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaac 9019996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 84 - 468
Target Start/End: Original strand, 30728683 - 30729072
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  30728683 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagta 30728782  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  30728783 gaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttc 30728882  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaa----atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  30728883 cactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgta 30728982  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30728983 accaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 30729072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 28241179 - 28241565
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  28241179 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 28241275  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||      |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  28241276 aacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctcc 28241375  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  28241376 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgta 28241475  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241476 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 28241565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 65 - 468
Target Start/End: Original strand, 3629706 - 3630108
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3629706 ctatgtgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta 3629805  T
Q  165 taaacataagcgaaaa-gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg 263  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3629806 taaacacaagccaaaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg 3629903  T
Q  264 gagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
     |||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3629904 -agagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagcc 3630002  T
Q  364 ccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctat 462  Q
    |||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  3630003 ccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctat 3630102  T
Q  463 acaaac 468  Q
    ||||||    
T  3630103 acaaac 3630108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 4816087 - 4816475
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  |||||||||    
T  4816087 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtaga 4816183  T
Q  186 aaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||| |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4816184 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 4816283  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  4816284 ccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccg 4816383  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816384 taaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 4816475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 468
Target Start/End: Original strand, 14507037 - 14507419
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  14507037 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaac 14507133  T
Q  190 aacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    ||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14507134 aacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgat 14507233  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14507234 tcactatatgataagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacc 14507332  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14507333 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 14507419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30967657 - 30967271
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  30967657 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataattaaataca--agtcaaaagtagaa 30967561  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30967560 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctcc 30967461  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||    
T  30967460 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgta 30967361  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967360 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 30967271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 1230105 - 1230493
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| |||| ||||||| |    
T  1230105 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaataca-aagccaaaagtata 1230202  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  1230203 aaacaacggcgagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 1230302  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  1230303 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaat 1230402  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230403 aaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 1230493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 3631792 - 3632182
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  3631792 attcgatgaaaaaacacaccaataacaaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 3631891  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||    
T  3631892 aaagtagaaaacatcgagagaaaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggacagagcagccct 3631989  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |    
T  3631990 ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttcc 3632089  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3632090 gtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 3632182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 14458615 - 14459009
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  14458615 attcgatgaaaaatcacaccaataatag-cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 14458711  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14458712 aaaagtagaaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14458811  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458812 gcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 14458911  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14458912 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag--gaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 14459009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13057651 - 13057264
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| | |||||    | ||||||||||| || || | |    
T  13057651 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataatcacaaac-a 13057556  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13057555 aaagtagaaaacagatagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccct 13057457  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  13057456 ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 13057357  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057356 gtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 13057264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 30034463 - 30034847
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  30034463 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagga-taatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaag--ttataaatacaagctaaaagtagaa 30034557  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  30034558 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctc 30034656  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  30034657 cgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccctt 30034756  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30034757 aaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 30034847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26065440 - 26065056
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||    
T  26065440 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26065342  T
Q  184 gaaaacaac-----gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||||||     ||   | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26065341 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctc 26065243  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26065242 cgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 26065144  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26065143 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag--tgtttccaaagagacaaactctatacaaac 26065056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26085409 - 26085025
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||    
T  26085409 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagta 26085311  T
Q  184 gaaaacaac-----gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||||||     ||   | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26085310 gaaaacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctc 26085212  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26085211 cgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 26085113  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26085112 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag--tgtttccaaagagacaaactctatacaaac 26085025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32280464 - 32280066
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||    |  | ||||||||||||    
T  32280464 gtgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacaattataaa 32280368  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
     | |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32280367 tacaagccaaaagtagaaaataacatgagagaaaggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 32280268  T
Q  269 agcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  32280267 agcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaa 32280168  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32280167 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaa 32280068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 95 - 419
Target Start/End: Original strand, 1069588 - 1069913
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  1069588 accaataacaaattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcga 1069687  T
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atga 293  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  1069688 gagagaaaagaagagagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatga 1069787  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||||||||||||    
T  1069788 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaa 1069887  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1069888 tcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 88 - 468
Target Start/End: Original strand, 19704422 - 19704813
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  19704422 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 19704518  T
Q  186 aaa--caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||  |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19704519 aaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 19704618  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  19704619 tccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc 19704718  T
Q  376 cgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19704719 cgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 19704813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 2628743 - 2629129
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  2628743 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 2628839  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2628840 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 2628939  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  2628940 cgatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 2629038  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2629039 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaac 2629129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 467
Target Start/End: Original strand, 20915213 - 20915599
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20915213 aaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataattaaataca--agccaaaagtaga 20915309  T
Q  186 aaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||| |||||| |||| |||    | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20915310 aaaacaacgacgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 20915408  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  20915409 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcg 20915507  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20915508 taaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 20915599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 15541003 - 15541384
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatgg-aacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||   ||| |||| |||||| || || | ||||     
T  15541003 atgaaaaatcaaaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaa-gt---tggtaacagttataatcacaaac-aaaat 15541097  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  || |     
T  15541098 tagaaaacaacgagagagaaaa-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgt 15541196  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  15541197 ttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgac 15541296  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541297 caagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaac 15541384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 3233575 - 3233975
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || |     
T  3233575 attcgatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaacacaaacc 3233674  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc-----ggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  3233675 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagaga 3233774  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |    
T  3233775 gcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatc 3233874  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3233875 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaa 3233974  T
Q  468 c 468  Q
    |    
T  3233975 c 3233975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 160 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13040132 - 13039824
Alignment:
Q  160 aattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagttt 259  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  13040132 aattataatcataaac-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtct 13040035  T
Q  260 gggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 358  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13040034 aggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgca 13039935  T
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    ||||| ||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039934 aagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaac 13039835  T
Q  458 tctatacaaac 468  Q
    |||||||||||    
T  13039834 tctatacaaac 13039824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 26932416 - 26932806
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||| ||    
T  26932416 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaggt 26932512  T
Q  183 agaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||| |||||  |||| |||    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |    
T  26932513 agaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaac 26932611  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  26932612 cctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 26932710  T
Q  375 tcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26932711 ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaac 26932806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 24338303 - 24338692
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  24338303 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaacca 24338402  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  24338403 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggg--gagagcagccct 24338498  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||  |  ||||   |    
T  24338499 ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttcc 24338598  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa-ccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||||| ||| |||||    
T  24338599 ataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaac 24338692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 78 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15367490 - 15367144
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15367490 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 15367391  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg-gagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||     
T  15367390 aaagtagaaaaatac--gagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagcct 15367294  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  |||| | |    
T  15367293 tccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttccc 15367194  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15367193 gcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 15367144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 206 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390449
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  305 acaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 3390514  T
Q  405 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3390513 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaac 3390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 68 - 468
Target Start/End: Original strand, 12195352 - 12195759
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattata 166  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   |||||    
T  12195352 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaag--ttata 12195448  T
Q  167 aacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtt 258  Q
    || | |||| |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||| ||||     
T  12195449 aatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtc 12195548  T
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  12195549 tgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactca 12195647  T
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaa 456  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12195648 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaa 12195747  T
Q  457 ctctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||    
T  12195748 ctctatacaaac 12195759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 436
Target Start/End: Original strand, 5273050 - 5273427
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaat 162  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   |    
T  5273050 ctatgtgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--t 5273146  T
Q  163 tataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacata 255  Q
    | |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5273147 tttaaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccta 5273246  T
Q  256 gtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctac 355  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5273247 gtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctac 5273345  T
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273346 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 5273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15346813 - 15346522
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346813 tgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 15346714  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    | |||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15346713 acaagccaaaagtagaaaacaac--aagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 15346617  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||||  |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346616 gcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 205 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477344
Alignment:
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg- 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||     
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacga 25477517  T
Q  303 ------ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcc 396  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   ||| |||||||||||||||||    
T  25477516 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcc 25477417  T
Q  397 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25477416 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaac 25477344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 29754557 - 29754892
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |  | |    
T  29754557 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaatacg-agccaa 29754654  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  29754655 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 29754754  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  29754755 cagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatct 29754853  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754854 ctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 408
Target Start/End: Original strand, 26065960 - 26066307
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  26065960 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 26066058  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtt 258  Q
    || |  | ||||||||||||||||   ||||   | ||| |||||      ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26066059 ca-agccaaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc 26066157  T
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26066158 taggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccta 26066256  T
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066257 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 26068243 - 26068578
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |  | |    
T  26068243 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca-agccaa 26068340  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  26068341 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagag 26068440  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  26068441 cagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatct 26068539  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068540 cttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33309313 - 33308988
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  33309313 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 33309217  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33309216 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 33309117  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  33309116 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 33309019  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309018 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 468
Target Start/End: Original strand, 3027699 - 3028095
Alignment:
Q  66 tatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattat 165  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||| |||||||   ||||    
T  3027699 tatgtgttgtgaattcaatgaaaaatcacaccgataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaag--ttat 3027794  T
Q  166 aaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttggggg 264  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| |||  |||| |||| ||||||    
T  3027795 aaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggg 3027891  T
Q  265 -agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 362  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  3027892 gaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagt 3027991  T
Q  363 cccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    | ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  3027992 ctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 3028088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14466783 - 14466399
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| |||| ||||||||||||| | |||| ||   |||||| || || | |    
T  14466783 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaag--ttataatcacaaac-a 14466687  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |     
T  14466686 aaagtagaaaacagcagcgagagaaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtca 14466587  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||       
T  14466586 tccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttc 14466487  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  14466486 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33311582 - 33311257
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  33311582 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 33311486  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33311485 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctc 33311386  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  33311385 cgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 33311288  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311287 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 468
Target Start/End: Original strand, 12161510 - 12161799
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||     
T  12161510 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagcca 12161608  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||  |||| | |    
T  12161609 tccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttccc 12161708  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12161709 gtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaac 12161799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 268 - 468
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530366
Alignment:
Q  268 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||     
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 15530364  T
Q  467 ac 468  Q
    ||    
T  15530365 ac 15530366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 217 - 468
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532925
Alignment:
Q  217 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| | ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagata 15532772  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15532773 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 15532872  T
Q  417 aatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15532873 aatcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaac 15532925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 423
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186271
Alignment:
Q  152 tatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattga 12186097  T
Q  252 catagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcc-cgcctaa 349  Q
    | ||||  | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||   |||||    
T  12186098 cctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaa 12186197  T
Q  350 ttctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    || ||||||||||| ||  |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186198 ttgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26945597 - 26945258
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | || | |||| |||||||||| || |||| |||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  26945597 atgaaaaatcacaccaataaaacacttgatatgtgaaacaagtaataatcaaagaatcaaa-caaagtgtaaggaag--ttataaacacaagccaaaagt 26945501  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||     
T  26945500 agaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgt 26945403  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  |||| | |||     
T  26945402 tctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtg 26945303  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26945302 accaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15720004 - 15719758
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg-agagagcagcc 275  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| |     
T  15720004 aaaaatagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaact 15719907  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  15719906 ctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 15719807  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15719806 ccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaac 15719758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 468
Target Start/End: Original strand, 19227515 - 19227652
Alignment:
Q  332 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227515 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 19227614  T
Q  432 cctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19227615 cctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaac 19227652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455625
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 419  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 16455620  T
Q  420 caacc 424  Q
    |||||    
T  16455621 caacc 16455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17012494 - 17012155
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||| |    
T  17012494 attcgatgaaaaatcacaacaataaaatacttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg-aacg-tta-aaacacaagcca 17012398  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||| |  |||   |||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  | | |    
T  17012397 aaagtagaaaata--gtgagagaaagaaagagagaatatgaaa---tttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctc 17012303  T
Q  277 tccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |  | ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  |||| ||    
T  17012302 tatgttcc-ctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttct 17012204  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17012203 cgtgaccaagagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacc 17012155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 290 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490710
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagac 389  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  390 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||    || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaac 22490710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 344
Target Start/End: Original strand, 25465460 - 25465710
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25465460 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattataaactcaagc-aaaagtaga 25465553  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  25465554 aaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttcc 25465650  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg 344  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  25465651 actataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19696887 - 19696556
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||   ||  ||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  19696887 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaag--taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaa 19696793  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||  | | ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||  || | ||||    
T  19696792 aaaca-gcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttcca 19696695  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||  ||||    || || |    
T  19696694 ctataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaa 19696595  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19696594 agagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 19696556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10584348 - 10584227
Alignment:
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  10584348 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcac 10584249  T
Q  287 tat-atgatgagtaacgttaca 307  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  10584248 tataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 422
Target Start/End: Original strand, 22857893 - 22858152
Alignment:
Q  162 ttataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttg 260  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| | |||| |||| ||    
T  22857893 ttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  261 ggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatc-aatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctaccc 357  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||| || ||||||||| ||| |||| ||   ||||| ||||||     
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacct 22858087  T
Q  358 aaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||| ||  |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22858088 aaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22858152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3394829 - 3394695
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  3394829 attcgatgagaaaacacaccaataaaaatcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 3394730  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagag 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3394729 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagag 3394695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22491071 - 22490921
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||    |  | |||||||||||||||| || |    
T  22491071 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaag---tgggtaacaattataaacataggcca 22490975  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 233  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22490974 aaagtagaaaacaacga--gagaaagaaagagagagcacaaaagaatttgttgacc 22490921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 407
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937376
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gaca 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||   |||     
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacc 12937222  T
Q  254 tagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaatt 351  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||  |||||||| ||| || | ||   |||||||    
T  12937223 tagtctgggg-agagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaacctaatt 12937320  T
Q  352 ctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||| |||||  ||  || | ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937321 ctaccaaaagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Original strand, 15530022 - 15530156
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||   |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  15530022 aaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataatcagacaatcaaaatttaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtag 15530121  T
Q  185 aaaacaacgagagag-aaaggaagagagaacacaa 218  Q
    ||||||||   |||| ||| |||||||||||||||    
T  15530122 aaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 264 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20526922
Alignment:
Q  264 gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 361  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||| |   |||||||||||| ||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaag 20526983  T
Q  362 tcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||  |  |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526982 tcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 421
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037927
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccga---tccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| | ||    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataag-tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 415  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |    ||||||||||||||||||| ||  || |   ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 28037921  T
Q  416 gaatca 421  Q
    ||||||    
T  28037922 gaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18322558 - 18322482
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatg 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18322558 attctatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 340
Target Start/End: Original strand, 28078063 - 28078310
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  28078063 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaaa-aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataaacacaagc-aaaagtag 28078157  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||| || |||||||  ||| || ||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| | |   |||    
T  28078158 aaa-cagcgagaga--aagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatc 28078253  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtct 340  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  28078254 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa-aggttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 422
Target Start/End: Original strand, 25078537 - 25078755
Alignment:
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaac 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||  ||||  ||| ||||| |||||| |||||| || ||| |||||||    
T  25078537 gaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaac 25078634  T
Q  302 gttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaat 400  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||   |||||||||||  ||| || ||  ||||   ||| |||||||||||||||| |||     
T  25078635 tttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacttaaa-tctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaac 25078733  T
Q  401 agtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  25078734 ggtgtttaccaaggtgaatcaa 25078755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30445832 - 30445699
Alignment:
Q  233 ccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 330  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30445832 ccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 30445733  T
Q  331 aaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
     ||| |||| ||   |||||||||||||||||||    
T  30445732 gaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtc 30445699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 6610378 - 6610478
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6610378 aaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtggat--aacaattataaacataagc-aaaagtataa 6610472  T
Q  187 aacaac 192  Q
    ||||||    
T  6610473 aacaac 6610478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979580
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccacta 31979580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 468
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072121
Alignment:
Q  415 tgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 1072121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Original strand, 8717203 - 8717268
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8717203 attcgatgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13878910 - 13878727
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  13878910 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 13878815  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878814 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13883536 - 13883475
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883536 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16786102 - 16785919
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  16786102 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 16786007  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16786006 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 31248835 - 31248896
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248835 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25480338 - 25480219
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| |||| ||| || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||  |    
T  25480338 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagtca 25480240  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagaga 198  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  25480239 aaagtagaaaacagcgagaga 25480219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 3577636 - 3577696
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577636 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 12911421 - 12911531
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgag 297  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12911421 aaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgag 12911519  T
Q  298 taacgttacaaa 309  Q
    |||| |||||||    
T  12911520 taactttacaaa 12911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 17694972 - 17695030
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17694972 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22611122 - 22610999
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22611122 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaaagt---gggaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 22611029  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||||    
T  22611028 aaacaa--tgagaaaaagaaagagagaacaca 22610999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757507
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10077258 - 10077194
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10077258 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  347 taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| ||||||||   |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 400
Target Start/End: Original strand, 12166267 - 12166321
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaat 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12166267 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaat 12166321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 22351973 - 22352031
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22351973 cctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 422
Target Start/End: Original strand, 7542452 - 7542581
Alignment:
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagc-ctctcctcgtaaccaagagactc 391  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |   |||||||||| ||||| |||||   |||| | ||| ||||||||||||    
T  7542452 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactc 7542550  T
Q  392 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542551 aatcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30443670 - 30443537
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacata 255  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| | |   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  30443670 aacaattttaaacacaagcaaaaa-tagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttaccta 30443572  T
Q  256 gtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    || | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  30443571 gtctcggggagagagcagctctccgttacactata 30443537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13040224 - 13040179
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13040224 attcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaa 13040179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 404
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  347 taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25941704 - 25941650
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaata 401  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25941704 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaata 25941650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 35201309 - 35201393
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201309 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5572334 - 5572270
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5572334 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 13467585 - 13467642
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13467585 cctaattctacc--aagtcacagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13883658 - 13883590
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13883658 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13883590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356104
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25941857 - 25941785
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25941857 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25941785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Original strand, 26505339 - 26505379
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26505339 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaaagagagaacaca 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 22342922 - 22342980
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22342922 cctaatactacccaaa-tcccagcctcttcccgtgaccaagagacgcaatcctaatagtg 22342980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26643237 - 26643179
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  26643237 cctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26643179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26749203 - 26749145
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  26749203 cctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26749145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936654
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccacta 31936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33215888 - 33215830
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33215888 cctaattctatccaa-gtcccagcctcttgccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10584395 - 10584357
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10584395 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg 10584357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995549
Alignment:
Q  439 ttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaac 8995549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24436058 - 24436001
Alignment:
Q  231 acccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    |||||||||| |||||  |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436058 acccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 9183031 - 9183075
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  9183031 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagaga 9183075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346492
Alignment:
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 15346492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 26954286 - 26954330
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  26954286 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagaga 26954330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33216015 - 33215943
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33216015 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggatagagcagctctccgttccactata 33215943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 138)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44725000 - 44724624
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaaca-attataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44725000 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 44724901  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44724900 acgagaga--aatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 44724803  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44724802 tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagact 44724703  T
Q  391 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724702 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 44724624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 31434910 - 31435291
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31434910 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 31435009  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31435010 aacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccac 31435107  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31435108 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaag 31435207  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435208 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 31435291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38394426 - 38394031
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  38394426 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 38394330  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38394329 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 38394230  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394229 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 38394130  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394129 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 38394031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 13099325 - 13099720
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  13099325 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 13099424  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13099425 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 13099524  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  13099525 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 13099624  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099625 cccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 13099720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20626473 - 20626083
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20626473 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20626377  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20626376 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20626277  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20626276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 20626177  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20626176 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaac 20626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20630364 - 20629974
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20630364 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20630268  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20630267 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20630168  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20630167 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 20630068  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20630067 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaac 20629974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20642783 - 20642393
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |    
T  20642783 attcgatgaaaaatcacaccaataacaacct-gatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaag--ttataaatataagcca 20642687  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20642686 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 20642587  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20642586 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 20642487  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20642486 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaac 20642393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 40836599 - 40836986
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  40836599 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 40836695  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||      |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40836696 aaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 40836795  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  40836796 ccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccg 40836894  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40836895 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 40836986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 7471829 - 7472224
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  7471829 attcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 7471925  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7471926 aaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 7472025  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7472026 cagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcct 7472125  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7472126 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaac 7472224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 99 - 467
Target Start/End: Original strand, 21592018 - 21592386
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  21592018 ataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 21592116  T
Q  199 gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagt 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21592117 gaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagt 21592216  T
Q  299 aacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatccta 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  21592217 aacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatccta 21592316  T
Q  399 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592317 atagtgcttgccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 21592386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 444027 - 443640
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  444027 gaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtag 443928  T
Q  185 aaaacaacgagagaga--aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg-agagagcagccctccga 281  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||     
T  443927 aaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgt 443828  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||     
T  443827 ttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaat 443728  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  443727 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 443640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 90 - 463
Target Start/End: Original strand, 27306096 - 27306469
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  27306096 atcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagaagaaaac 27306195  T
Q  190 aac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27306196 aacagcgagagaaaagaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccacta 27306293  T
Q  289 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27306294 tatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 27306393  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27306394 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata 27306469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 4295789 - 4296179
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  4295789 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaacacaagcca 4295888  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  4295889 aaagtagaaa--atggcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccct 4295986  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  4295987 ctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg 4296086  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4296087 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 4296179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20299895 - 20299504
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||    
T  20299895 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagt 20299799  T
Q  183 agaaaacaac-gagaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||| | |||| |||    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  20299798 agaaaacaactgcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaacc 20299699  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20299698 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 20299599  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20299598 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 20299504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 95 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 21990570 - 21990196
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacg 193  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  21990570 accaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcg 21990471  T
Q  194 agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21990470 agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatga 21990371  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  21990370 tgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 21990271  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990270 ttctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 21990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48458084 - 48457698
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  48458084 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 48457988  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48457987 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 48457888  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  48457887 gttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 48457788  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457787 accaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 48457698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11355688 - 11355303
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11355688 aaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 11355589  T
Q  185 aaaacaacgagagaga-aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||    
T  11355588 aaaacaacaagagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttc 11355489  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||    
T  11355488 cactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaacca 11355389  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  11355388 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaac 11355303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 42330854 - 42331243
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  42330854 attcgatgagaaatcacgccaataataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 42330953  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||    
T  42330954 aaagtagaaaacagcgagagagaaag----agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccct 42331049  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct--cct 375  Q
    ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||     
T  42331050 ccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 42331149  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42331150 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaac 42331243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 88 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1850411 - 1850026
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||    
T  1850411 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtagaaa 1850315  T
Q  188 acaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    ||||| || || ||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1850314 acaac-agtgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 1850216  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  1850215 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgta 1850116  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1850115 agcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 1850026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 7469872 - 7470266
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  7469872 attcgatgaaaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaggga-taatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 7469967  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  7469968 aaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggag 7470067  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7470068 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcct 7470167  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7470168 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaac 7470266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9679491 - 9679104
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9679491 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaag 9679392  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||  |||||     
T  9679391 tagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgt 9679292  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  9679291 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaac 9679192  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9679191 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 9679104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3036164 - 3035766
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  3036164 attcgatgagaaatcacaccaataacaat-ttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 3036068  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3036067 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 3035968  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3035967 cagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcct 3035868  T
Q  371 ctcct---cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3035867 cttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaa 3035768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9681257 - 9680864
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  9681257 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 9681158  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9681157 aaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 9681058  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | |    
T  9681057 tccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc 9680958  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9680957 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 9680864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 37411982 - 37412372
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||    
T  37411982 gaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactag 37412081  T
Q  185 aaaacaacgagaga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||||||||   |||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||     
T  37412082 aaaacaacgagagaaaagaagagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgt 37412181  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||    
T  37412182 tccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgta 37412281  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37412282 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaac 37412372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21678498 - 21678111
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  21678498 attcgatgaaaaatcacaccgataacaaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagcca 21678399  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||     
T  21678398 aaagtagaaaacagcgggagaaaa--gaagagagaacacaa--gaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagccca 21678303  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | | | ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||    
T  21678302 ctgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcg 21678203  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21678202 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 21678111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24749017 - 24748639
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||||||    
T  24749017 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagtagaa 24748921  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  24748920 aacaacgagagaaata--aagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcac 24748823  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||    
T  24748822 tataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaag 24748723  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748722 agactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 24748639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36064 - 35674
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |  | ||||||    
T  36064 atgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaatacaaa--ccaaaagt 35968  T
Q  183 agaaaacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  35967 agaaaacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagc 35869  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35868 tctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 35769  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35768 ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaac 35674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3879019 - 3878622
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaag-tatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| |  |     
T  3879019 attcgatgagaaatcacatcaataataa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaattaaatacaaa--cc 3878923  T
Q  177 aaaagtagaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3878922 aaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagag 3878823  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3878822 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc 3878723  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878722 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 3878623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18345967 - 18345586
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||    
T  18345967 cacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaacaa 18345871  T
Q  192 cga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18345870 cggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatcc 18345771  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  18345770 actatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaa 18345671  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18345670 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaac 18345586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 95 - 468
Target Start/End: Original strand, 39145856 - 39146231
Alignment:
Q  95 accaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39145856 accaataacaaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacga 39145955  T
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  39145956 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatga 39146055  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  39146056 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 39146155  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39146156 tcataatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 39146231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20297802 - 20297407
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  20297802 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 20297706  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20297705 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 20297606  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  20297605 cagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatct 20297506  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20297505 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 20297407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21680464 - 21680072
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  21680464 attcgatgaaaacccacaccaataacaagcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 21680365  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccag---ttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  21680364 aaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagc 21680267  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |    
T  21680266 tctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttc 21680167  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21680166 cggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaac 21680072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45004 - 44609
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  45004 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaa 44908  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  44907 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaag 44808  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  44807 cagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacct 44708  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44707 cttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaac 44609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 212 - 468
Target Start/End: Original strand, 1046912 - 1047168
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1046912 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-g 1047010  T
Q  312 agaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047011 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 1047110  T
Q  412 aggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1047111 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 1047168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28487993 - 28487598
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  |    
T  28487993 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtca 28487897  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28487896 aaagtagaaaacaacggctaga-agaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28487798  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  28487797 gcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatc 28487698  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28487697 tcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaac 28487598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25542977 - 25542575
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  25542977 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaattaaata 25542879  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgg 261  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |    
T  25542878 ca--agccaaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctag 25542781  T
Q  262 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542780 gggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaag 25542682  T
Q  362 tcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactct 460  Q
    |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  25542681 tcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtcttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactct 25542583  T
Q  461 atacaaac 468  Q
    ||||||||    
T  25542582 atacaaac 25542575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40946759 - 40946373
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||| |||||||    
T  40946759 aatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaaatagaaaa 40946663  T
Q  189 caa-----cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
     ||     ||||| ||||    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  40946662 aaaaacggcgaga-agaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctt 40946564  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40946563 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 40946464  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40946463 aactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaac 40946373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42223584 - 42223202
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  42223584 aaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaacacaaggcaaaagtaga 42223485  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  | ||    
T  42223484 aaacaatgagagaaaa--gaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttca 42223387  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||  |||| | ||||||||||    
T  42223386 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaag 42223287  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42223286 agactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 42223202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 212 - 468
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049539
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-g 1049381  T
Q  312 agaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1049382 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttccca 1049481  T
Q  412 aggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049482 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaac 1049539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 87 - 436
Target Start/End: Original strand, 7092070 - 7092423
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||  || |||||  ||||||||||    
T  7092070 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta--aatataagtcaaaagtagaa 7092167  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7092168 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctc 7092265  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||    
T  7092266 cgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgt 7092365  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7092366 aaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 7092423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 43253374 - 43253760
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  43253374 aaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 43253470  T
Q  187 aa----caacgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||    || ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  43253471 aaacaacagcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 43253569  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||    
T  43253570 ctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccg 43253669  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253670 taatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 43253760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 87 - 443
Target Start/End: Original strand, 7094317 - 7094678
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  7094317 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 7094414  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7094415 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 7094514  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||    
T  7094515 gattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgta 7094614  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgtt 443  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7094615 attaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28486005 - 28485611
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  28486005 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 28485909  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaa-------aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||| || ||||       | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  28485908 aaagtagaaaacaacg-gatagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagg-agaga 28485811  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  |    
T  28485810 gcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatc 28485711  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28485710 tcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 28485611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38397070 - 38396712
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38397070 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38396974  T
Q  187 aacaa--------cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    || ||        ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  38396973 aaaaaaacaacggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaag 38396875  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38396874 ccctccgatccactatatgatgagtaaagttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt 38396776  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagg 437  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396775 cccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagg 38396712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 177 - 468
Target Start/End: Original strand, 20137063 - 20137353
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  20137063 aaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccc 20137159  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  20137160 tccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc 20137259  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20137260 cgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 20137353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 467
Target Start/End: Original strand, 7351508 - 7351895
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  7351508 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 7351604  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7351605 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccct 7351704  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  7351705 ccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg 7351803  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7351804 taaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa 7351895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 27832496 - 27832877
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||||| || || | |    
T  27832496 attcgatgaaaaatcataccaataacaaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaacca 27832593  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  27832594 aaagtagaaaaca--gtgagagaaagaaagagataacacaa--gaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccct 27832684  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| | |    
T  27832685 ccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttccc 27832784  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27832785 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaagagacaaactctatacaaac 27832877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 210 - 468
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156155
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttac-aa 31155994  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31155995 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31156094  T
Q  409 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31156095 ccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 31156155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 24813364 - 24813739
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||    | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24813364 aaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaacgtg---gtaacaattataaacataaac-aaaagtaga 24813459  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  24813460 aaacaacgagaga-aaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctcc 24813557  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||| ||||    
T  24813558 actataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcacca 24813657  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  24813658 agagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaac 24813739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 279 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11757465 - 11757274
Alignment:
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11757465 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 11757366  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11757365 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 11757274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 7349134 - 7349517
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||| |    
T  7349134 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagta-a 7349229  T
Q  186 aaacaacg------agagagaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||      |||  | || |||||   ||||||||||  |||||||||||    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7349230 aaacaacggcgagaagaacgcaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 7349325  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  7349326 ccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 7349424  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349425 taaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 7349517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1606829 - 1606486
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |     
T  1606829 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaat 1606731  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttg 260  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||    
T  1606730 aca--agccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctg 1606633  T
Q  261 ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606632 ggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaa 1606535  T
Q  361 gtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606534 gtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2935700 - 2935374
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |  | ||||||||||    
T  2935700 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca-agccaaaaagtagaa 2935603  T
Q  187 aacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2935602 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2935503  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||    
T  2935502 gatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 2935404  T
Q  380 accaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935403 accaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25276550 - 25276186
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||| | ||||||  ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||    
T  25276550 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggatcaagt--taatcaagcaaccaatatcaaagtggat--aacaatta--aacacaagtaaaaagtag 25276458  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||        |||| |    |||    
T  25276457 aaaacaacgagagaaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctgggg--------agccgt----tcc 25276372  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||    
T  25276371 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacca 25276272  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25276271 agagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 25276186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22394162 - 22393876
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||     
T  22394162 gtgttgtgaattcgatgaaaaattccaccaataataaacttgatgt--ggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataat 22394067  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22394066 cacaaaccaaaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagag 22393969  T
Q  269 agcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 360  Q
    | || ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22393968 aacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7188962 - 7188587
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||||    
T  7188962 aaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtaga 7188866  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||  || |||||   |||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||    
T  7188865 aaacagcgagaga-aaagaaagagaacacgcaaaa---tttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttcc 7188770  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | | ||| ||||    
T  7188769 actataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgacca 7188670  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  7188669 agagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaac 7188587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 9027042 - 9027376
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  9027042 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 9027138  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa-------aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggaga 267  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||       |  |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  9027139 aaagtagaaaacaacggctaga-agaacataattaataaga-agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggaga 9027236  T
Q  268 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9027237 gagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa 9027334  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
     |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027335 tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137184
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22137283  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137282 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552211
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40552310  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552309 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24258783 - 24258508
Alignment:
Q  199 gaaaggaagagagaacacaaaagaattt-gttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata----tga 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||    |||    
T  24258783 gaaaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatga 24258684  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||  || | | ||| ||||||||||||||    
T  24258683 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaa 24258584  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24258583 tcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 24258508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108173
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22108272  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108271 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40549933
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 40550032  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550031 agagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 24817219 - 24817594
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||  || ||| | ||| ||    | |||| ||||||||| || | |||| ||||    
T  24817219 aaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaagtaataatcaagaaaacaatatcaacgtg---gtaacagttataaacacaaac-aaaattaga 24817314  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  24817315 aaacaacgagaga-aaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttcc 24817412  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||    
T  24817413 actataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacca 24817512  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24817513 agagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaac 24817594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26295872 - 26295598
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||| ||||||    
T  26295872 atgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaa--attataaacacaagccaaaagt 26295776  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | || | |    
T  26295775 agaaaacaacgaaaga--aagaaagagataacacaa--gaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtt 26295680  T
Q  283 ccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26295679 tcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 26295598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 245
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251605
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  22251452 cacaccaataacaaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 22251551  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 245  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251552 caagagagaaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24465967 - 24465629
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | |    
T  24465967 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaacca 24465870  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||   |||||| || ||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||| |      
T  24465869 aaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacgaaa---tttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcac 24465774  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | || |||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  24465773 ccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 24465675  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24465674 atgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa 24465629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Original strand, 20091581 - 20091745
Alignment:
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20091581 tgggggagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccca 20091678  T
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    ||||| ||  |||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091679 aagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20091745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 321 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804614
Alignment:
Q  321 tgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  421 aacccacaaaccctag----gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 26804614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26804942 - 26804762
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  26804942 atgagaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagt 26804843  T
Q  183 agaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggg 262  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26804842 agaaaacaacatcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 265 - 468
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828877
Alignment:
Q  265 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  364 ccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctat 462  Q
     ||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  463 acaaac 468  Q
    ||||||    
T  22828872 acaaac 22828877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11759567 - 11759364
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  11759567 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 11759471  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||| | ||||       || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11759470 aaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11759372  T
Q  270 gcagccct 277  Q
    ||| ||||    
T  11759371 gcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 282 - 468
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251786
Alignment:
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | |    
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttccc 22251701  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22251702 gtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaac 22251786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 422
Target Start/End: Original strand, 16296932 - 16297222
Alignment:
Q  129 aatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||    |||||||    
T  16296932 aatcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagaga--aag--agagagaacacacggaaatttgt 16297024  T
Q  229 tgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagaga-aatcaatgggt 325  Q
    | || ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||| | | || ||||    
T  16297025 ttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaaagggt 16297124  T
Q  326 tacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||| ||| | || ||    |||||||||||||||||| ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297125 tacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332311
Alignment:
Q  156 gaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacat 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacaga--aag--agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacct 6332481  T
Q  255 agtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctccc-gcctaattc 352  Q
    ||| | ||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  6332480 agtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtcttcaagcctaattc 6332381  T
Q  353 tacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||| |||||| ||  |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  6332380 tacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaatcaa 6332311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081598
Alignment:
Q  181 gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagag-gaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatcc 11081745  T
Q  280 gatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatc--aatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    | |||| | | | |||||||||| ||||| |||||| |||  || ||||||||| ||| |||| ||   ||||||| ||| |||| ||| |  |||| |     
T  11081744 gttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcc 11081645  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11081644 cgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaa 11081598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567658
Alignment:
Q  396 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 18567658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348933
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 6348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25351539 - 25351353
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |    
T  25351539 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25351441  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351440 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6049295 - 6048961
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||| ||   |  ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6049295 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--attaatcaagcaaccaatatcaacgtgggt--aacaattataaacataagc-aaaattag 6049201  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||| | ||||||| ||||  ||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||  | |||  |||| ||||||  |||||| | ||||| ||    
T  6049200 aaaatagcgagagaaaaag--agagagaacacacg-gaatttgtctacctagttcggtccattactgagctagtatggggggaagagcaactctccgttc 6049104  T
Q  284 cactatat---gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| || |||| |||| |   |||||||||| |||||||| ||   ||| |||||     
T  6049103 cactatataatgatgagtaactttacaaagg-gatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtg 6049005  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6049004 accaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 6048961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6046848 - 6046641
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacata 255  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||   |  |||||||  | ||| |||||||||| | |||| ||    
T  6046848 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaaaacgagagaaaaag--agagagaacatgcat-aatttgtctatccaattcggtccaatactgaccta 6046753  T
Q  256 gtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattct 353  Q
    || |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||| |   |||||||||    
T  6046752 gtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggtttacaagaataagtcttcaaacctaattct 6046654  T
Q  354 acccaaagtccca 366  Q
    |||||||||||||    
T  6046653 acccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2121087 - 2120881
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  2121087 aagaatttgtttacccaattcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 2120989  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--ccca 411  Q
     ||   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2120988 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtcca 2120893  T
Q  412 aggtgaatcaac 423  Q
    ||||||||||||    
T  2120892 aggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 419
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281572
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacata 255  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||| | |||  ||    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagaga-aaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaacta 40281413  T
Q  256 gtttgggggagagagcagccctccgatccacta-tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattct 353  Q
    || |||||||||||||| |||| || ||||| |  | |||||||||| ||||       ||||||| ||||||||| |||||||| ||   ||||||||     
T  40281414 gtctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttac-------aaatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattcc 40281506  T
Q  354 acccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 419  Q
    ||| |||||| ||  |||| | ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40281507 accaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22392595 - 22392549
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392595 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 22392549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084467
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||| |||||||||| | |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25357233 - 25357047
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||||| || | || |||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |    
T  25357233 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 25357135  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357134 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 407
Target Start/End: Original strand, 3320020 - 3320232
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata- 290  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3320020 gagagagagagagagagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataa 3320118  T
Q  291 tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    ||| |||||  | |||||||   || || |||| ||| ||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3320119 tgaatgagtttctttacaaa---gagat-aatgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagaga 3320213  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3320214 ctcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 407
Target Start/End: Original strand, 3324768 - 3324980
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata- 290  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3324768 gagagagagagagagagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataa 3324866  T
Q  291 tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    ||| |||||  | |||||||   || || |||| ||| ||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3324867 tgaatgagtttctttacaaa---gagat-aatgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagaga 3324961  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3324962 ctcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25410318 - 25410130
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  25410318 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 25410220  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
     ||   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410219 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6349220 - 6349097
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||||||| |||| |||||||||    
T  6349220 aaaactcacaccaataa-atacttgacgtatggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaagc-aaaagtaga 6349125  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaaca 215  Q
    ||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  6349124 aaata--gcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7069841 - 7069780
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069841 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7074848 - 7074787
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074848 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25405576 - 25405393
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  25405576 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 25405481  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405480 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190038
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284156
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 20284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 8378625 - 8378686
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378625 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 15541116 - 15541177
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541116 cctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 290
Target Start/End: Original strand, 6067159 - 6067264
Alignment:
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |    
T  6067159 aacaacaagagagaaaagaaaagaagaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttc 6067258  T
Q  285 actata 290  Q
    ||||||    
T  6067259 actata 6067264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983352
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 404
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516339
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580457
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 2580457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091176
Alignment:
Q  106 acttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaa-acaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaagg 204  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||   |||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaag--ttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaga 20091136  T
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa 246  Q
    ||||||||||||  | |||||| || | ||||||||||||||    
T  20091137 aagagagaacac--acgaatttatttatccagttcggtccaa 20091176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 34546984 - 34547042
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34546984 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40550262 - 40550204
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  40550262 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 40550204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 7464652 - 7464697
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7464652 aagtcccagcctctccccgtgacaaagagactcaatcctaatagtg 7464697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2647789 - 2647725
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2647789 ttgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactat 2647725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796696
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactat 4796696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22137529 - 22137454
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||    
T  22137529 tgtgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa 22137454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159871
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 31732969 - 31733013
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31732969 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 31733013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 34546874 - 34546946
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34546874 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 34546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40552556 - 40552481
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||    
T  40552556 tgtgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa 40552481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 41649011 - 41649055
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  41649011 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 41649055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 1046774 - 1046839
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc--aaaacaaagt 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||    
T  1046774 aaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagt 1046839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185195
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccacta 9185195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21369673 - 21369642
Alignment:
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369673 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26210674 - 26210631
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26210674 accaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28617318 - 28617255
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28617318 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccacta 28617255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33332543 - 33332480
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33332543 ttgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 33332480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7069992 - 7069895
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7069992 gagagagagagacagaaagaacacaaaata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactata 7069895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 289
Target Start/End: Original strand, 55955 - 56015
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55955 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactat 56015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 44010884 - 44010929
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  44010884 aagtcccagcctcttctcatgactaagagactcaatcctaatagtg 44010929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 1049146 - 1049216
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc--aaaacaaagtatatg 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  1049146 aaaattcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg 1049216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Original strand, 1502832 - 1502883
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaac 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  1502832 aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075231
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactata 2075231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4586329 - 4586285
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  4586329 ttgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagaga 4586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 7464513 - 7464585
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7464513 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactata 7464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25357360 - 25357324
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25357360 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaa 25357324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814560
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 30814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 35960820 - 35960884
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35960820 ttgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactat 35960884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Original strand, 38671222 - 38671262
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggga 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  38671222 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctattttggggga 38671262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 404
Target Start/End: Original strand, 44016792 - 44016840
Alignment:
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  44016792 ccaaattcccagcctcttctcatgactaagagactcaatcctaatagtg 44016840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44848777 - 44848713
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| ||   |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44848777 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactat 44848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 108)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14808235 - 14807842
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14808235 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtaga 14808136  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag----------cagcc 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||          |||||    
T  14808135 aaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagcc 14808036  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  14808035 ctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 14807936  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807935 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 14807842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 28251427 - 28251811
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  28251427 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccacaagtaga 28251525  T
Q  186 aaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28251526 aaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatc 28251625  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28251626 cactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 28251725  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251726 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 28251811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15073194 - 15072801
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  15073194 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 15073095  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15073094 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15072995  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctctcct 375  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  15072994 tccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttct 15072895  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072894 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 15072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 30480365 - 30480747
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  30480365 aaaatgacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaa 30480464  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  | |||    
T  30480465 aacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcac 30480564  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | ||| |||||||    
T  30480565 tatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaaga 30480664  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480665 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 30480747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 84 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3874473 - 3874101
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  3874473 tgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagta 3874377  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3874376 gaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatc 3874287  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3874286 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 3874187  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874186 agagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 3874101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27829774 - 27829388
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||  ||||||||||    
T  27829774 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta--aatataagtcaaaagtagaa 27829677  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27829676 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 27829577  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  27829576 gatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgta 27829478  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829477 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 27829388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15068464 - 15068072
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |    
T  15068464 attcgatgaaaaatcacaccaacaacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaacacaagcca 15068365  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15068364 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15068265  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |    
T  15068264 tccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttcc 15068165  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068164 gtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 15068072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27827463 - 27827077
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||    
T  27827463 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtagaa 27827366  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27827365 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctcc 27827266  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||    
T  27827265 gatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgta 27827167  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827166 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 27827077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 14419043 - 14419435
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  14419043 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 14419142  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  14419143 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccat 14419242  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    | | | |||||| |||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  14419243 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 14419342  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa-ccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14419343 gtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaac 14419435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 78 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 43530601 - 43530213
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  43530601 attcaatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 43530505  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |    
T  43530504 aaagtagaaaacaatggcaaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagaca 43530406  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530405 gcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 43530306  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43530305 tcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactcta 43530213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15809695 - 15809310
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||  |||| |||||    
T  15809695 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--aggcaaaaatagaa 15809599  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||     
T  15809598 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctct 15809499  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||    
T  15809498 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgta 15809399  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15809398 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-agacaaactctatacaaac 15809310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 609214 - 608825
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  609214 aaaatcgcaccaataacaa-cttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtag 609118  T
Q  185 aaaacaacg---agagagaa----aggaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||   ||| ||||    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  609117 aaaacaacggcaaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagcc 609019  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  609018 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 608919  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608918 cataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 608825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 22684509 - 22684900
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  22684509 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 22684605  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  22684606 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccct 22684705  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat---gggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22684706 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 22684805  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22684806 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaac 22684900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 32339787 - 32339400
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||  |||||||||    
T  32339787 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtaga 32339691  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||| ||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32339690 aaataacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 32339591  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||    
T  32339590 cgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgt 32339491  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339490 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 32339400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41385225 - 41384835
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  41385225 attccatgaaaaatcacacaaataacaaacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 41385130  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41385129 aaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagagaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 41385030  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||  |||  |||| |    
T  41385029 cctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttc 41384930  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41384929 ccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 41384835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18811194 - 18810799
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  18811194 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 18811098  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    ||||||||||||| || || |||||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  18811097 aaaagtagaaaacgac-agcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagag 18810999  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18810998 agcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagc 18810900  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18810899 ctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaa 18810800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 27106755 - 27107141
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || |  | |    
T  27106755 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacagac-a 27106851  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  27106852 aaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccct 27106949  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  27106950 ccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccg 27107049  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27107050 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 27107141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4424496 - 4424109
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  4424496 aaaatcacaccaataacaa-cttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 4424400  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4424399 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 4424300  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||| | |||    
T  4424299 tgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgt 4424200  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  4424199 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaac 4424109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 28283070 - 28283463
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  ||||| | |||| |    
T  28283070 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaatacaagcca 28283166  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  28283167 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagag 28283265  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  28283266 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatct 28283364  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28283365 cttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaac 28283463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36866012 - 36865629
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36866012 aaaaccacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaa 36865913  T
Q  187 aacaacgagag--agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagt-ttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |     
T  36865912 aacaacgagagaaagaaaaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgttt 36865813  T
Q  284 cactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||        
T  36865812 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt---g 36865716  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36865715 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 36865629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 89 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 44721318 - 44720935
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||  ||  ||||||||||||    
T  44721318 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca--agtcaaaagtagaaaa 44721222  T
Q  189 caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |    
T  44721221 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaa 44721122  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44721121 tccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 44721023  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtg-tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44721022 caagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaa 44720935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 18813368 - 18812980
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  18813368 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 18813272  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18813271 aaaagtagaaaacgacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagaga 18813172  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18813171 gcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcc 18813073  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18813072 tcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 18812980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 70 - 468
Target Start/End: Original strand, 13858334 - 13858728
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaac 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  13858334 tgttgtaaattcgatgaaaaatcacaccaataagaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaac 13858431  T
Q  170 ataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13858432 acaagccaaaagtagaaaaca--gtgagagaaagaaagggagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagaga 13858528  T
Q  270 gcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  13858529 gcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaat 13858627  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  13858628 ctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaa 13858727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25953002 - 25952613
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || | |    
T  25953002 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaacacaatcca 25952903  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  25952902 aaagtagaaaacggcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccct 25952804  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||   ||| |||    
T  25952803 ccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctc 25952704  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  25952703 gtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatacaa 25952613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41383141 - 41382764
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  41383141 atgaaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagccagaagt 41383042  T
Q  183 agaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  41383041 agaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctg 41382942  T
Q  281 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||    
T  41382941 tttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaa 41382842  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||| ||||           ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41382841 ccaagagactcaatcataat-----------aggtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaac 41382764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1225626 - 1225257
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  1225626 aatcacgccaataacatacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaa----------caattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 1225537  T
Q  189 caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| | |||||    
T  1225536 cagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcacta 1225439  T
Q  289 tatgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagag 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||    
T  1225438 tatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagag 1225339  T
Q  388 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1225338 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaac 1225257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 33541271 - 33541632
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33541271 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 33541370  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||    
T  33541371 aatcagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttca 33541470  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||                      ||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||    
T  33541471 ctatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat----------------------gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 33541548  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541549 atactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 33541632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43080080 - 43079693
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||  |||||||||    
T  43080080 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagtcaaaagtaga 43079984  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43079983 aaacaacggcgagaagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 43079884  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  43079883 caatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 43079785  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43079784 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 43079693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43082451 - 43082064
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  43082451 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 43082355  T
Q  186 aaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43082354 aaacaacgtcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 43082255  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  43082254 caatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 43082156  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43082155 aaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 43082064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15956435 - 15956052
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  | | |||||| || || ||     
T  15956435 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataatcacaaacg- 15956339  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||||||| | ||||    
T  15956338 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccct 15956241  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  15956240 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 15956141  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15956140 gtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 15956052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27911380 - 27911105
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatg 292  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  27911380 gagagagagagagagagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatg 27911282  T
Q  293 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactca 392  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  27911281 atgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactca 27911182  T
Q  393 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27911181 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 27911105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27957799 - 27957524
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatg 292  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  27957799 gagagagagagagagagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatg 27957701  T
Q  293 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactca 392  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  27957700 atgagtaactttacaatagagatatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactca 27957601  T
Q  393 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27957600 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 27957524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 84 - 468
Target Start/End: Original strand, 15185578 - 15185954
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||| | |||||||    
T  15185578 tgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcataaac-aaaagta 15185674  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||| |     
T  15185675 gaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgttt 15185772  T
Q  284 cactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||        |||| | |||||||    
T  15185773 cactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttcccgtaacc 15185865  T
Q  383 a--agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  15185866 aagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaac 15185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 24873047 - 24873425
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  24873047 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 24873143  T
Q  177 aaaag-tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||         ||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  24873144 aaaaggtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacagaa--atttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagcc 24873231  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||       
T  24873232 ctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttc 24873330  T
Q  376 cgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24873331 cgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaac 24873425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 5372042 - 5372422
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||| ||||  ||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  5372042 aaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtag 5372141  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg-agagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||| ||||||      |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||| |     
T  5372142 aaaacaatgagaga------aagaaagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgttt 5372235  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||| | | |||||    
T  5372236 cactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataacc 5372335  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  5372336 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaac 5372422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21482790 - 21482405
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| |  |||| |||||||   |||||| || || |    
T  21482790 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaag--ttataatcacaaac 21482693  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21482692 -aaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 21482596  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  21482595 ctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 21482496  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  21482495 ccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaac 21482405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31162683 - 31162344
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  31162683 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 31162586  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttggggg--agagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||| ||   || ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||||||| | ||    
T  31162585 aacaacgagagaaaagaaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttc 31162487  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |  || |||    
T  31162486 cactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgacc 31162387  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162386 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31162344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21480982 - 21480636
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||| || || |    
T  21480982 attcgatgaaaaataacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac 21480885  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | | ||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21480884 -aaaagaagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 21480788  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||   ||| |    
T  21480787 ctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttc 21480688  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21480687 ccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 21480636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 280
Target Start/End: Original strand, 37214122 - 37214319
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37214122 atgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagt 37214221  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  37214222 agaaaacaacgagagagaaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Original strand, 3005502 - 3005829
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||  |||||    |    
T  3005502 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaatacaag--aaaaggtaca 3005596  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||   || ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3005597 aacaacgagaga---agaaagggagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttcca 3005691  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||| |||||    
T  3005692 ctataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaa 3005791  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3005792 gagactcaatgctaatagtgttttccaaagtgaatcaa 3005829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Original strand, 35872309 - 35872553
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  35872309 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagcca 35872408  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  35872409 aaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccct 35872492  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagt 338  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35872493 ccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 181905 - 181623
Alignment:
Q  132 caaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttga 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  181905 caaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttga 181808  T
Q  232 cccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaa 331  Q
    ||||||||||                    |||||||||||| | || | | ||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||     
T  181807 cccagttcgg--------------------gggagagagcagtcatctgtttcactat--gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaag 181731  T
Q  332 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct--cctcgtaaccaagagactcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  181730 aataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttca 181631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14477732 - 14477519
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |    
T  14477732 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaacacaagcca 14477633  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-cagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||  | |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||     
T  14477632 aaa-aaaaaaaaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagcca 14477534  T
Q  277 tccgatccactatat 291  Q
    |||| | ||||||||    
T  14477533 tccgtttcactatat 14477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 354
Target Start/End: Original strand, 2467995 - 2468259
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||   |||||| || ||   |||| |||||    
T  2467995 aaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaag--ttataatcacaaaacaaaattagaa 2468092  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||   | |||    
T  2468093 aacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcac 2468190  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattcta 354  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2468191 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 316 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477367
Alignment:
Q  316 atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 415  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggt 14477421  T
Q  416 gaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14477420 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaac 14477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Original strand, 31578148 - 31578476
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||| |  || |||  | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31578148 aaaaatcacacgaataaaatacttgatgtgtgtagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa-tatgggcaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 31578243  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||||||||      |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||| |||| | |||||||||||||  ||||| |||    
T  31578244 aaacaacgagaga------aagagagagcacacaa-aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttcc 31578336  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||  |||| | | | |||    
T  31578337 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgacc 31578436  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31578437 aagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31035522 - 31035252
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgac- 252  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  31035522 ggaacaattaaaaacacaagc-aaaactagaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacc 31035427  T
Q  253 -atagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaa 349  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||    
T  31035426 tatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaa 31035328  T
Q  350 ttctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    ||||||| |||||| ||  |||| |  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31035327 ttctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27911553 - 27911439
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27911553 tgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataattaga-aactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagta 27911456  T
Q  184 gaaaacaacgagagaga 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  27911455 gaaaacaacgagagaga 27911439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27957972 - 27957858
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27957972 tgaaaaatcacaccaataaaaaacttgatgtgtggagcaagtgataattaga-aactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagta 27957875  T
Q  184 gaaaacaacgagagaga 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  27957874 gaaaacaacgagagaga 27957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214435
Alignment:
Q  342 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gttt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | || | |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  441 gttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaac 37214435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775292
Alignment:
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaac 26775292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 3883444 - 3883556
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  3883444 attcgatgaaaaatcacatcaataacaa-cttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 3883540  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg 193  Q
    ||||||||||||||||    
T  3883541 aaagtagaaaacaacg 3883556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 422
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573924
Alignment:
Q  293 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactc 391  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  392 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31573924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 468
Target Start/End: Original strand, 5622889 - 5622982
Alignment:
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5622889 cgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatacaaac 5622982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17847986 - 17847661
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||  | |||| || |||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  17847986 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaaaaa--attaattaagcaaccaaaacaatgtaggtg--acaattataaacacaagc-aagagtaga 17847892  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||| |    ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||  ||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  17847891 aaaaat---gagagaaataaagagagaacacatgaaaattagttttcccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattcc 17847795  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||||  |||| |    |||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| | ||    
T  17847794 actata--atgatt----ttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatca 17847702  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847701 agagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 468
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872627
Alignment:
Q  397 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaac 35872627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 426
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468307
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 2468307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 9021228 - 9021289
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021228 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 16757388 - 16757449
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757388 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28327969 - 28327908
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327969 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28895563 - 28895502
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895563 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6376356 - 6376141
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-a 290  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| |    
T  6376356 gagagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataa 6376258  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagac 389  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||  ||| |||| ||| |||| ||   |||||||||||  |||||| ||  |||| |  || ||||||||||    
T  6376257 tgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggtaacaagaattagtcttcaaacctaattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagac 6376159  T
Q  390 tcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  6376158 tcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 268
Target Start/End: Original strand, 31566425 - 31566601
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |  || | |  | |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  31566425 aaaaatcacaccaataaaatacttgatctatggagcaa--aataatcaaacaactaatatcaa-tgtgggtaacaattataaacacaagc-agaagtaga 31566520  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagag 268  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  31566521 aaacagcgagaga--aagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggggagag 31566601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799606
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactat 23799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 590855 - 590797
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  590855 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33032715 - 33032657
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33032715 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 4812608 - 4812669
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4812608 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 404
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  347 taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696625
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 4696625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412409
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765848
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403259
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3276405 - 3276347
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3276405 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 422
Target Start/End: Original strand, 33838902 - 33839120
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata--tgatgagtaacg 302  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||  |  | ||||||     
T  33838902 agagagaacacacgaaaatttgtttacccaattcggtcgaatactgacatattatgggggagagagcagttctccgttccactataacttttaagtaact 33839001  T
Q  303 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaata 401  Q
    ||||||||||     ||| ||||||||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||||   |  |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  33839002 ttacaaaagattc--caaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctt-gaatctcttcctgaccaagagactcaatcctaata 33839098  T
Q  402 gtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  33839099 gtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 183302 - 183244
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaac 136  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  183302 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaac 183244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035160
Alignment:
Q  388 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 31035160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 4812470 - 4812554
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812470 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 4812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833789
Alignment:
Q  224 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| |||| || |||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaa 16833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 4743214 - 4743258
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4743214 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagaga 4743258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5702576 - 5702512
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  5702576 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctat 5702512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 6127225 - 6127289
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  6127225 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactat 6127289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Original strand, 16757266 - 16757334
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16757266 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 16757334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 407
Target Start/End: Original strand, 17799558 - 17799606
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799558 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25684826 - 25684758
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25684826 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25684758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28890949 - 28890881
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28890949 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31071322 - 31071258
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31071322 ttgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3896124 - 3895957
Alignment:
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca-atgggttacaa-aaataagtctcccgcctaattctac 355  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||| || ||| | ||   ||||||| |||    
T  3896124 tgggggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatcataagagttacaagaattaattttcaaacctaattatac 3896025  T
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
     ||||||||||   ||| | ||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3896024 tcaaagtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttctccaaagtgaatcaa 3895957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752424
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccacta 19752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 269
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930243
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21033930 - 21033870
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033930 cctatttctacccaa-gtcccagcccttcct-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28228714 - 28228656
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggaga 267  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  28228714 agaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgacctactttgggggaga 28228656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554851
Alignment:
Q  249 tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 29554851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 2467797 - 2467833
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2467797 aaaatcacactaataataaacttgatgtatggagcaa 2467833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 2467896 - 2467932
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2467896 aaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaa 2467932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6599096
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674549
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 422
Target Start/End: Original strand, 13985971 - 13986011
Alignment:
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985971 aagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 17799418 - 17799490
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17799418 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggagagagagcagctctccgttccactata 17799490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19175847 - 19175783
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  19175847 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 23179555 - 23179627
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23179555 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactata 23179627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 404
Target Start/End: Original strand, 23179692 - 23179740
Alignment:
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  23179692 ccaaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28328091 - 28328023
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28328091 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 28328023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 168)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 4308130 - 4308523
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  4308130 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 4308228  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4308229 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagc 4308328  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4308329 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttc 4308428  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308429 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 4308523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 18099018 - 18099412
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  18099018 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagcc 18099117  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  18099118 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaagaaa-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcag 18099216  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18099217 ccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt 18099316  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099317 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 18099412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43228692 - 43228306
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||| |    
T  43228692 atgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aaatacaagccaaaatt 43228595  T
Q  183 agaaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43228594 agaaaacaacagcgagagtaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 43228495  T
Q  281 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43228494 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaa 43228395  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228394 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 43228306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1313814 - 1313424
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  1313814 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtc 1313715  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1313714 aaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 1313617  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  1313616 tccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 1313517  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1313516 gtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 1313424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 18096748 - 18097142
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  18096748 attcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 18096847  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  18096848 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 18096946  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18096947 ctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt 18097046  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097047 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 18097142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 53917519 - 53917906
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  53917519 atgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagt 53917618  T
Q  183 agaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  53917619 agaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgt 53917718  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||    
T  53917719 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaac 53917818  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53917819 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 53917906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 1626543 - 1626925
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||    
T  1626543 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaa 1626642  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||    
T  1626643 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcac 1626742  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1626743 tatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaaga 1626842  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1626843 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaac 1626925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1321881 - 1321494
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  1321881 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 1321784  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1321783 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 1321684  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  1321683 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgta 1321584  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1321583 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 1321494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43226487 - 43226100
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||| |    
T  43226487 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaatta-aaatacaagcca 43226391  T
Q  178 aaagtagaaa--acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43226390 aaagtagaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 43226294  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43226293 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 43226194  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43226193 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaac 43226100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3315092 - 3314699
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  3315092 attcgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 3314993  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3314992 aaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccc 3314893  T
Q  277 tccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| | |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |     
T  3314892 tccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcc 3314793  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314792 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 3314699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 32263896 - 32264281
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32263896 gaaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 32263995  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32263996 aaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 32264094  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttac-aaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  32264095 actataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataacc 32264194  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264195 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 32264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45883358 - 45882954
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  45883358 gtgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataat 45883259  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagaga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagttt-ggggg 264  Q
    || |||| | |||||||||||| | |||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  45883258 cacaagccagaagtagaaaacagcaagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggg 45883159  T
Q  265 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883158 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 45883059  T
Q  365 cagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45883058 caacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctata 45882959  T
Q  464 caaac 468  Q
    |||||    
T  45882958 caaac 45882954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36012235 - 36011842
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012235 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcga 36012136  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  36012135 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagcc 36012036  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| |     
T  36012035 ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcc 36011936  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36011935 cgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaac 36011842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42990701 - 42990319
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  42990701 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 42990604  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42990603 aacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattc 42990504  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42990503 accatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaa 42990404  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990403 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 42990319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 43423316 - 43423705
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  43423316 attcgatgaaaaattacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 43423415  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||    
T  43423416 aaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctct 43423513  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||    
T  43423514 cagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccg 43423613  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43423614 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 43423705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 53915346 - 53915738
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  53915346 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 53915445  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53915446 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 53915545  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  53915546 tccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 53915645  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53915646 gtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaac 53915738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 78 - 467
Target Start/End: Original strand, 9604455 - 9604848
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | || |    
T  9604455 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataatcacaggcca 9604553  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaa-aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||| |||||||||||   |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9604554 aaaatagaaaacaacagcgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcag 9604653  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  9604654 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctt 9604753  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9604754 tccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaa 9604848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 27101030 - 27101423
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  27101030 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagca 27101128  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  27101129 aaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagc 27101228  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  27101229 catccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttc 27101328  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101329 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 27101423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 10084245 - 10084631
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10084245 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10084341  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  10084342 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctcc 10084441  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10084442 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 10084541  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084542 accaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 10084631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 12267832 - 12268207
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12267832 atgaaaaattacaccaataacaaatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagt 12267931  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12267932 agaaaacaacgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtt 12268030  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||    
T  12268031 tcactatatgatgagtaacgttacaaaaga-----------gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacc 12268119  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12268120 aagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 12268207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 88 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890055
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38890441 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38890345  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  38890344 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctcc 38890245  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||    
T  38890244 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 38890145  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38890144 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 38890055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 43421268 - 43421657
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  43421268 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 43421367  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  43421368 aaagtataaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccat 43421465  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  || | | ||    
T  43421466 ctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccg 43421565  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  43421566 taaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaac 43421657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 5926617 - 5927006
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  5926617 attcgatgaaaactcacaccaataacaaacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc-a 5926715  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |    
T  5926716 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcat 5926814  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | || ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||    
T  5926815 ccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccg 5926914  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5926915 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaac 5927006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Original strand, 51674626 - 51674997
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  51674626 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaacacaagccaaaagtagaa 51674725  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  | ||     
T  51674726 aacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcag 51674825  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  51674826 tatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaaga 51674925  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51674926 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagggacaaac 51674997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 53468313 - 53468698
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  53468313 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaa 53468412  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacata--gtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||  |||||||||||||| | |    
T  53468413 aatagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttc 53468512  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  53468513 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaacca 53468612  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53468613 agagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaac 53468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 10955883 - 10956269
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10955883 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10955979  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10955980 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctcc 10956079  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  10956080 gttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgta 10956179  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10956180 accaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 10956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25533834 - 25533457
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  25533834 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 25533739  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  25533738 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 25533649  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25533648 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccg 25533549  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533548 taaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 25533457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 85 - 433
Target Start/End: Original strand, 25688015 - 25688367
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  25688015 gaaaactcacaccaataacaaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagta 25688114  T
Q  184 gaaaaca---acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25688115 gaaaacatcaacgagaga-aaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 25688213  T
Q  281 atccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
     | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688214 tttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgta 25688313  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688314 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 99 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51943758 - 51943386
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  51943758 ataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 51943659  T
Q  199 ---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatg 295  Q
       |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  51943658 aaagaagagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatg 51943559  T
Q  296 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatc 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51943558 agtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatc 51943460  T
Q  396 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51943459 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaac 51943386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5192052 - 5191668
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5192052 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5191956  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5191955 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagaacagccctc 5191858  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5191857 tgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 5191759  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5191758 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 5191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 86 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 32219486 - 32219106
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32219486 aaaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 32219387  T
Q  185 aaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  32219386 aaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtt 32219287  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| | || |||    
T  32219286 tcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaac 32219187  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32219186 caagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaactcta 32219106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 28101856 - 28102244
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  || |  ||||||  |||| || |     
T  28101856 attcgatgaaaaattacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caatta--aacacaaccc 28101951  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||     
T  28101952 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagcca 28102051  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |    
T  28102052 tccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccc 28102151  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28102152 gtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 28102244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24980118 - 24979722
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  24980118 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 24980019  T
Q  177 aaaagtagaaaa----caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24980018 aaaagtagaaaaacaacaacgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagca 24979920  T
Q  273 gccctccgatccactatatgatgagtaacg-ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||    
T  24979919 gccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctc 24979820  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979819 tttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 24979722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 880312 - 880694
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || | |||||||||    
T  880312 aaaaatcacacccataacaaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtaga 880411  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |  |    
T  880412 aaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttta 880509  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||||    
T  880510 ctatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaag 880609  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  880610 agactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaac 880694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 47148758 - 47149137
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  47148758 atgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggg-------ataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagt 47148850  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |    
T  47148851 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtt 47148950  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||    
T  47148951 tcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaacc 47149050  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttg-ttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47149051 aagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaac 47149137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15781285 - 15780886
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |    
T  15781285 attcgatggaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaagtca 15781186  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca---gc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||    
T  15781185 aaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgc 15781086  T
Q  275 cctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaa----atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||| || |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15781085 ccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcc 15780986  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15780985 tcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaac 15780886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6484757 - 6484374
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6484757 aaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtag 6484658  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  6484657 aaaacagcgagagagaat--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttc 6484560  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||||    
T  6484559 actatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaa 6484460  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  6484459 gagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaac 6484374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18163072 - 18162678
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  18163072 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 18162973  T
Q  177 aaaagtagaaaac---aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18162972 aaaagtagaaaactgcagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcag 18162875  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct 372  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18162874 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctct 18162775  T
Q  373 cctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18162774 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaac 18162678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 177 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30006150 - 30005856
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||    
T  30006150 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagc 30006051  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30006050 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 30005951  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005950 tcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 30005856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 4103752 - 4104137
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||   ||||||| | | |  ||||||| ||    
T  4103752 aaaatcacaccaataacaaacttgatgcgtggagcaagga-tagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaag--ttataaatacatgtcaaaagtaaaa 4103848  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4103849 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctcc 4103948  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4103949 gatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 4104047  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4104048 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaac 4104137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 10958179 - 10958565
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10958179 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10958275  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10958276 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 10958375  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||    
T  10958376 gttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccata 10958475  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10958476 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 10958565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Original strand, 51726863 - 51727245
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  51726863 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggggcaag-aataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 51726958  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  51726959 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 51727058  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  51727059 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgt 51727158  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctataca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727159 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccagtgtttgttccaaagagacaaactctataca 51727245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3859914 - 3859543
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  3859914 gaaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aaatacaagccaaaagtag 3859817  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3859816 aaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatcc 3859727  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  3859726 actatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaa 3859628  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3859627 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 3859543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 10191168 - 10191551
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  10191168 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaattaaataca--agccaaaagtagaa 10191264  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  10191265 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctcc 10191362  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  10191363 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagt-ccagcctcttcctgta 10191461  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10191462 accaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaac 10191551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25389309 - 25388921
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |  | |||||||||    
T  25389309 aaaaatcataccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-agccaaaaagtaga 25389212  T
Q  186 aaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||  ||||       ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25389211 aaacaacggcgagaagaatacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 25389112  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  25389111 ccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg 25389013  T
Q  378 taaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25389012 taaccaagagactccaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 25388921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 97 - 468
Target Start/End: Original strand, 48361538 - 48361913
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  48361538 caataacaaacttaatgtatggaacaatgaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgaga 48361637  T
Q  197 ga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatga 293  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |    
T  48361638 gaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatatta 48361737  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | |||||| |||||||||||    
T  48361738 tgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaa 48361837  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48361838 tcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaac 48361913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Original strand, 5522482 - 5522857
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || | ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  5522482 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 5522578  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  5522579 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctc 5522678  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5522679 cgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 5522777  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  5522778 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagagacaaac 5522857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 210 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170419
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11170479  T
Q  410 caaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170478 caaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 11170419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 22114159 - 22114547
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  22114159 aaaatcacaccaatagcaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 22114255  T
Q  186 aaacaa----cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||| ||    ||||| ||||    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || |||    
T  22114256 aaaaaaacggcgaga-agaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccc 22114354  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22114355 tccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttccc 22114454  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22114455 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 22114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 747178 - 746772
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||    
T  747178 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataa 747082  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaac-gagaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagttt 259  Q
    | | |||| |||||||||||||||| | |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  747081 atacaagccaaaagtagaaaacaactgcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct 746982  T
Q  260 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaa 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  746981 gggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 746883  T
Q  360 agtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  746882 agtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaac 746783  T
Q  458 tctatacaaac 468  Q
    |||||||||||    
T  746782 tctatacaaac 746772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 461
Target Start/End: Original strand, 7606451 - 7606822
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||    |     
T  7606451 attcgatgaaaaat-acaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaatacaggc-ca 7606547  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||||| || |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7606548 aaaagtagaaaacaac-agcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 7606637  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7606638 tccgatccactatatgacgagtaacgttacaaat-agaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccc 7606736  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7606737 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 87 - 361
Target Start/End: Original strand, 27635515 - 27635792
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27635515 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 27635614  T
Q  187 aacaacgagaga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  27635615 aacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttt 27635714  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27635715 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag 27635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5886601 - 5886261
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  5886601 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5886504  T
Q  185 aaaacaacgagag-----agaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||||| | ||     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5886503 aaaacaacaacagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5886404  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||    
T  5886403 cgatccactatatgatgagtaacgtttc-aaagacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgt 5886305  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5886304 aaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 87 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 11168503 - 11168165
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  11168503 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 11168407  T
Q  186 aaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||      |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11168406 aaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 11168307  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  11168306 cgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgt 11168207  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 420  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168206 aaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 85 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5900074 - 5899734
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  5900074 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 5899977  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||       |||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5899976 aaaacaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 5899877  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || | |||    
T  5899876 cgatccactatatgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgt 5899778  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5899777 aaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38210781 - 38210385
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||| |    
T  38210781 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--agcca 38210685  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  38210684 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagaga 38210585  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  38210584 gcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatc 38210486  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38210485 tcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaa 38210386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 50494418 - 50494014
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |    
T  50494418 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaata 50494320  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgg 261  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||    
T  50494319 ca--agccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 50494222  T
Q  262 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50494221 gggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaag 50494123  T
Q  362 tcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactc 459  Q
    |||||  | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50494122 tcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactc 50494023  T
Q  460 tatacaaac 468  Q
    |||||||||    
T  50494022 tatacaaac 50494014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 458686 - 458299
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  458686 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 458590  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  458589 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctc 458490  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  458489 caatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 458391  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  458390 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 458299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 10621374 - 10621772
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| |||| ||   ||||||| | ||||    
T  10621374 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagc 10621470  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggaga 267  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||    
T  10621471 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggaga 10621570  T
Q  268 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621571 gagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 10621669  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctataca 465  Q
     |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10621670 tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctataca 10621769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720563
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa---- 201  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||        
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  202 aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaa 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtat 26720731  T
Q  301 cgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26720730 cgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaat 26720631  T
Q  401 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26720630 agt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaac 26720563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 456309 - 455922
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  456309 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 456213  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  456212 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctc 456113  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  456112 caatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 456014  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  456013 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 455922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 54691425 - 54691816
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |    
T  54691425 attcgatgagaaaacacatcaataacaaattt-atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagcca 54691523  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  54691524 aaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaaacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccc 54691623  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |  |||| | |    
T  54691624 tccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttccc 54691723  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54691724 ataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 54691816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 141 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715484
Alignment:
Q  141 aaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  240 ggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc 339  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||  || || || | | ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtatgggggagag--caaccatctgtttcactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtc 39715614  T
Q  340 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39715613 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 39715514  T
Q  439 ttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39715513 ttgtttcaaatagacaaactctatacaaac 39715484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6232192 - 6231848
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| || ||    
T  6232192 aaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagtaa----taatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaaataaaa 6232097  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||| | |||    
T  6232096 aacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcac 6231999  T
Q  287 tat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    | | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||    
T  6231998 tgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaag 6231900  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagg 437  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6231899 agactcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagg 6231848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 78 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 53591589 - 53591210
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |    
T  53591589 attcaatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacataagtca 53591490  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaat--ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  53591489 aaagcagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggg-agagagcatcc 53591393  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | ||    
T  53591392 cttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattct 53591293  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53591292 cgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaac 53591210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 6065641 - 6066038
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  6065641 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 6065737  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||  ||||       |||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| | ||||||||    
T  6065738 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagag 6065837  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6065838 agcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 6065936  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6065937 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaa 6066036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 28412878 - 28413274
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||| ||   ||||||| | |||  |    
T  28412878 attcgatgaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaag--ttataaatacaagtca 28412973  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  28412974 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagag 28413073  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28413074 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 28413172  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28413173 ctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaa 28413272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 85 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4666913 - 4666562
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  || ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||     
T  4666913 gaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtat 4666814  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| | |    
T  4666813 aaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccctccgtttc 4666717  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataag--tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||    
T  4666716 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaac 4666617  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4666616 ctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctag 4666562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 6063291 - 6063688
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   ||||||| | ||||     
T  6063291 attcgatgaaaaatcacaccgataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagcc 6063387  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||  ||||       |||| | |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  6063388 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 6063487  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6063488 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 6063586  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6063587 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaa 6063686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956701
Alignment:
Q  263 ggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 29956808  T
Q  363 cccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29956807 cccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactcta 29956708  T
Q  462 tacaaac 468  Q
    |||||||    
T  29956707 tacaaac 29956701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 47701528 - 47701801
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  47701528 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt---gatcaagtaataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacacaagcca 47701624  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  47701625 aaagtagaaaacaatgagaga--aaggaa-agagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccct 47701721  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccc 357  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47701722 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3307168 - 3306839
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaa-cttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  3307168 attcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagc 3307069  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |   |||||||||| ||    
T  3307068 caaaagtagaaaacagcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct--aggagagagcaacc 3306971  T
Q  276 ctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     |||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||   |||      
T  3306970 atccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatcttt 3306871  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 406  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306870 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 468
Target Start/End: Original strand, 28761285 - 28761670
Alignment:
Q  68 tgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  28761285 tgtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaa--attataa 28761382  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacatagtttgggggag 266  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28761383 tcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa--------------caaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggag 28761467  T
Q  267 agagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 365  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  28761468 agagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctc 28761567  T
Q  366 agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatac 464  Q
    |   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  28761568 aatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatac 28761666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31151746 - 31151363
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||  |    
T  31151746 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagt-a 31151651  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    | |||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31151650 agagtagaaaaaca-gcgagagaaaagaagagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccc 31151552  T
Q  277 tccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |     
T  31151551 tccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcc 31151454  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  31151453 cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 31151363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17795661 - 17795316
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||| || || | |    
T  17795661 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataatcacaaac-a 17795565  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  17795564 aaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcctt 17795466  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||   |    
T  17795465 ccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttcc 17795366  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17795365 gtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccca 17795316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19104101 - 19103756
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||| || || | |    
T  19104101 attcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataatcacaaac-a 19104005  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  19104004 aaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcctt 19103906  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||   |    
T  19103905 ccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttcc 19103806  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19103805 gtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccca 19103756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 468
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918191
Alignment:
Q  227 gttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 326  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  327 acaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  35918043 acaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccct 35918142  T
Q  427 caaaccctag-------gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918143 caaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 35918191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23633854 - 23633474
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  23633854 attcgatgaaaaatcacaccaataa-atactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaacacaagcca 23633758  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
     |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  23633757 caagtagaaaacatcgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggg-agagagcagccct 23633661  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | |    
T  23633660 ccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc 23633562  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  23633561 gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaac 23633474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 162 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42992594 - 42992301
Alignment:
Q  162 ttataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagttt 259  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  42992594 ttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 42992495  T
Q  260 gggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaa 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||               ||||||||    
T  42992494 gggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaa 42992410  T
Q  360 agtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaact 458  Q
    ||| |||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42992409 agt-ccactctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaact 42992311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 268 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561825
Alignment:
Q  268 gagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  366 agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatac 464  Q
    |  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 6561829  T
Q  465 aaac 468  Q
    ||||    
T  6561828 aaac 6561825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 468
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890015
Alignment:
Q  233 ccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  333 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 432  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagcccca-actcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 889977  T
Q  433 ctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  889978 ccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaac 890015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 561640 - 562016
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  561640 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtagaa 561735  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgg-gggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||| ||||||| | || ||||||||||||   | |||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||    
T  561736 aacatcgagaga-agagaaagagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttcc 561833  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||    
T  561834 actataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgacca 561933  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  561934 agagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaac 562016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41849454 - 41849243
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  41849454 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 41849358  T
Q  187 aacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  41849357 aacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttca 41849258  T
Q  286 ctatatgatgagtaa 300  Q
    |||||||||||||||    
T  41849257 ctatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28181401 - 28181242
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28181401 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggac-aatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 28181303  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa 246  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28181302 aaacagcgacagagaaaagaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777436
Alignment:
Q  319 aatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 417  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  418 atcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 35777436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 25635772 - 25635447
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |  | |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25635772 aaaatcacactaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacagttataaacacaagc-aaaagtagaa 25635678  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| |||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||    |||||||||||| ||||| | | ||    
T  25635677 aacaacgagtga--aagaaagaagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttca 25635581  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| |||||    
T  25635580 ccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa 25635481  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25635480 gagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 423
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420382
Alignment:
Q  264 gagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 362  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 13420321  T
Q  363 cccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    | ||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420322 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 13420382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 53597628 - 53597297
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  53597628 aaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataaacacaagcaaaaa-taga 53597535  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaag-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||  | |||| | | ||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  53597534 aaacaacgagaga--aagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattc 53597438  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| || ||  || | ||| | |||    
T  53597437 cactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgacc 53597338  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597337 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53597297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 332 - 468
Target Start/End: Original strand, 28100146 - 28100283
Alignment:
Q  332 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28100146 aataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctcaaac 28100245  T
Q  432 cctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28100246 cctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 28100283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Original strand, 36871166 - 36871497
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||  ||||    
T  36871166 aaaaatcacaccgataa-atacttgatgtgtggagcaag-aataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagataga 36871260  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36871261 aaacagcgagaga-aaataaagagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 36871358  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| |||| | ||| ||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  ||||   ||| |||    
T  36871359 actataatgatgattaactttacaaa-gagataacaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgacc 36871457  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36871458 aagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaa 36871497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674034
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaca 253  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| || | ||||     
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagaga-aaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacc 1674195  T
Q  254 tagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattct 353  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||  |        ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  1674194 tagtctggtggagagagcagccatccgttccaaaa--------gtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttct 1674103  T
Q  354 acccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||||  |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1674102 acccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaa 1674034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24181668 - 24181498
Alignment:
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  24181668 gagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgat 24181570  T
Q  295 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 366  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24181569 gagtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 24181498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 291
Target Start/End: Original strand, 53893892 - 53894121
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |    
T  53893892 gtgttgtaaattcgatcgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaata 53893990  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagttt 259  Q
    || |||| |||||||||||| |||||  |||| |||    | |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  53893991 ca-aagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 53894089  T
Q  260 gggggagagagcagccctccgatccactatat 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53894090 gggggagagagcagccctccaatccaatatat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 332 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28181174 - 28181037
Alignment:
Q  332 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 431  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  28181174 aatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaat 28181075  T
Q  432 cctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28181074 cccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 28181037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 272 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884177
Alignment:
Q  272 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||  ||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaaaa-taagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatct 54884269  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  54884268 ctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactcta 54884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Original strand, 880092 - 880251
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||| || || |     
T  880092 attcgatgaaaaagtcacaccaataataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaaacc 880191  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtt 238  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  880192 aaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 461
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137541
Alignment:
Q  336 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  436 g-gtttgttccaaagagacaaactcta 461  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaactcta 28137541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23637041
Alignment:
Q  307 aaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| | | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  407 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaac 23637041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25634278 - 25634030
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |  | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25634278 aaaatcacaccaataa-atacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaag---tgggtaacaattataaacacaagc-aaaagtagaa 25634184  T
Q  187 aacaacgagag--agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||| ||||  ||||||||   ||||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||||| | || | |    
T  25634183 aacaacaagagtaagaaagga---gagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttc 25634088  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctc 341  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25634087 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42992783 - 42992607
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||| |  ||||| ||||    
T  42992783 aaaatcacactaataacaaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatatatgtcaaaagcagaa 42992686  T
Q  187 aacaa---cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg 263  Q
    |||||   ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42992685 aacaatggcgaga-agaaaaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 42992607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Original strand, 1620328 - 1620657
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  1620328 aaaaatcacaccaataa-aaacttgatatgtggagaaa--attaatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaga 1620420  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||| |||||| | |||| | ||||||||||| || | |||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  1620421 aaaccacgagata-aaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttcc 1620518  T
Q  285 actat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  || | ||   ||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||    
T  1620519 actataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgacc 1620617  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1620618 aaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919179
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 422
Target Start/End: Original strand, 14634486 - 14634638
Alignment:
Q  272 agccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||  |    
T  14634486 agccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatc 14634585  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634586 tcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849167
Alignment:
Q  392 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 41849167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 247
Target Start/End: Original strand, 8183040 - 8183154
Alignment:
Q  131 tcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttg 230  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8183040 tcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgttg 8183137  T
Q  231 acccagttcggtccaaa 247  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  8183138 acccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Original strand, 29913949 - 29914132
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |    
T  29913949 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 29914047  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29914048 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Original strand, 4560355 - 4560493
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagac 389  Q
    |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||         | ||||||||||||||||||  |||  |||| |  |||||||| || |    
T  4560355 atgatgagtaactttgcaaaagagatattaatgggttacaaaag--------ctgcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggc 4560446  T
Q  390 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4560447 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 4560493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 10094195 - 10094256
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094195 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 10201075 - 10201136
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201075 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177294
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 24177294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10897193 - 10897008
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg--atgagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||  | |||| |||||||    
T  10897193 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga 10897095  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
     ||   || ||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10897094 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163165
Alignment:
Q  416 gaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 11163165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Original strand, 47878165 - 47878350
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||| ||||    
T  47878165 aagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gaga 47878263  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
     ||   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47878264 tat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736324
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 1736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552902
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709809
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 30709809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54193287 - 54193229
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54193287 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 10100212 - 10100273
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100212 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 10208121 - 10208182
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208121 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6303358 - 6303310
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303358 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370505
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25634030 - 25633982
Alignment:
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25634030 ctcgtgaccaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaa 25633982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 26298992 - 26299056
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26298992 ttgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactat 26299056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974971
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986465
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417510
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccacta 1417510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 20031439 - 20031497
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20031439 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 27762107 - 27762165
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27762107 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54188570 - 54188512
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54188570 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 10612761 - 10612844
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10612761 agagagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 10612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11170772 - 11170670
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||  ||| |||||||||    
T  11170772 aaaatcacattaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataattaaataca--agccaaaagtaga 11170676  T
Q  186 aaacaa 191  Q
    ||||||    
T  11170675 aaacaa 11170670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13419983 - 13419941
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13419983 accaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 13419941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Original strand, 31021300 - 31021341
Alignment:
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021300 caagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 31021341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 289
Target Start/End: Original strand, 48438221 - 48438282
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48438221 ttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 48438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 435
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606868
Alignment:
Q  395 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccta 7606868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Original strand, 10094073 - 10094141
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10094073 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10094141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Original strand, 10100090 - 10100158
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10100090 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10100158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Original strand, 10200953 - 10201021
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10200953 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 10595028 - 10595100
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10595028 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactata 10595100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264418
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711291
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactat 21711291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 23391909 - 23391953
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  23391909 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 23391953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 29196386 - 29196430
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  29196386 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 29196430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143389
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33386749 - 33386685
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33386749 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002869
Alignment:
Q  347 taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaatggtgttt 38002869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40734666 - 40734622
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  40734666 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 40734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54193410 - 54193342
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54193410 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 54193342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5858605 - 5858546
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5858605 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaga--ctcaatcctaatagtgttt 5858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 10595155 - 10595213
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10595155 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 10612899 - 10612957
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  10612899 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtg 10612957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| | ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 37466295 - 37466358
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37466295 ttgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccacta 37466358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4535675 - 4535622
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaa 399  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4535675 cctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 403
Target Start/End: Original strand, 10949381 - 10949438
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagt 403  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10949381 cctaattcaacccaa-gttccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11079578 - 11079517
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11079578 cctaattctacctaa-gtcccagccttttcccgtgaccaagagactcaatcctgatagtgttt 11079517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27544334 - 27544273
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544334 cctaattctacccaa-gttccacgctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303425
Alignment:
Q  249 tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 6303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6794796 - 6794732
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6794796 ttgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 6794732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 27452962 - 27453026
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || |  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27452962 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27544456 - 27544388
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27544456 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactata 27544388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 36029097 - 36029161
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  36029097 ttgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactat 36029161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 14247 - 14626
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14247 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 14345  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14346 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccac 14443  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  14444 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 14543  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14544 gactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaac 14626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 204 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15326 - 15063
Alignment:
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 303  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  15326 gaagagagaacacaa--gaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactt 15229  T
Q  304 tacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagt 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228 tacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 15129  T
Q  404 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15128 gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaac 15063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15431 - 15395
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15431 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgt 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 159)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 22800713 - 22801106
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22800713 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagcca 22800812  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22800813 aaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 22800912  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  22800913 ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcc 22801012  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801013 cgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 22801106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 36921346 - 36921738
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  36921346 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 36921445  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |    
T  36921446 aaagtagaaaacagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccat 36921545  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36921546 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 36921645  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36921646 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaac 36921738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 22802585 - 22802978
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  22802585 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 22802684  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  22802685 aaagtagaaagcaacagcgagagaaaaagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaacc 22802784  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22802785 ctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 22802884  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802885 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 22802978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 36919437 - 36919829
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  36919437 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtca 36919536  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  36919537 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccat 36919636  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  36919637 ctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccg 36919736  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36919737 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaac 36919829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24889278 - 24888887
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  24889278 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 24889180  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24889179 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 24889080  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  24889079 cctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttc 24888980  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888979 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaa 24888887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 90 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40637545 - 40637163
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  40637545 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 40637447  T
Q  188 acaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40637446 acaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcca 40637347  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||    
T  40637346 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaag 40637247  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637246 agactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 40637163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Original strand, 40091267 - 40091657
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaat-cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  40091267 attcgatgaaaaattcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaacacaagcc 40091366  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40091367 aaaagtagaaaatagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccc 40091466  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  40091467 tctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccc 40091566  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40091567 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaa 40091657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 38928032 - 38928422
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |    
T  38928032 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca 38928131  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38928132 aaagtagaaaacaacgagataaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 38928229  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | | ||    
T  38928230 ccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccg 38928329  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38928330 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 38928422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 87 - 457
Target Start/End: Original strand, 17662108 - 17662478
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  17662108 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacatgccaaaagtagaa 17662206  T
Q  187 aacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17662207 aacaac-agcgagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 17662305  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  17662306 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaag 17662405  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17662406 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaac 17662478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 8631276 - 8631663
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  8631276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 8631372  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8631373 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 8631472  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8631473 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 8631572  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8631573 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 8631663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 37089220 - 37089615
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  37089220 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 37089317  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37089318 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 37089417  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089418 cagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 37089516  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37089517 cttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaac 37089615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 22046542 - 22046929
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||  ||||||||    
T  22046542 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agtcaaaagtag 22046638  T
Q  185 aaaacaacga-gagag-----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||| ||||      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  22046639 aaaacaacgacgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22046738  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22046739 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 22046837  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22046838 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaac 22046929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24348676 - 24348307
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||  ||| |||| |||||    
T  24348676 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaactaaataca--agccaaaaatagaa 24348580  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348579 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccac 24348490  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24348489 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 24348390  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24348389 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaac 24348307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 22044247 - 22044634
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  22044247 gaaaaataacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtag 22044343  T
Q  185 aaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||      |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  22044344 aaaacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 22044443  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22044444 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 22044542  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22044543 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 22044634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 12395698 - 12396089
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | || |    
T  12395698 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgcca 12395797  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  12395798 aaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccc 12395897  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  12395898 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccg 12395997  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||    
T  12395998 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaac 12396089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 12400660 - 12401051
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | || |    
T  12400660 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgcca 12400759  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  12400760 aaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccc 12400859  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  12400860 ccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccg 12400959  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||    
T  12400960 taaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaac 12401051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 125 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24879425 - 24879078
Alignment:
Q  125 gaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24879425 gaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagaga 24879326  T
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24879325 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaat 24879226  T
Q  322 gggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879225 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 24879126  T
Q  422 acccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879125 accctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 24879078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38409679 - 38409294
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  38409679 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 38409583  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||      |||   ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38409582 aacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 38409483  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38409482 gatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgta 38409384  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38409383 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 38409294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51015722 - 51015335
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||    
T  51015722 gaaaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtag 51015626  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||    
T  51015625 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacct 51015526  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  51015525 ccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 51015427  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51015426 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaac 51015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 2484731 - 2485116
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  2484731 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 2484827  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2484828 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2484927  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2484928 gatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgta 2485026  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2485027 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 2485116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11435434 - 11435044
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||    
T  11435434 atgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaag 11435338  T
Q  182 tagaaaacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||||||   ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  11435337 tagaaaacaatggcgaga-agaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 11435239  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  11435238 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactctt 11435140  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11435139 ccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 11435044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 14787282 - 14787675
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  14787282 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 14787381  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaag-gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggaga--gagcag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  14787382 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 14787479  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||     
T  14787480 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctctt 14787579  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14787580 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaac 14787675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16453788 - 16453398
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||| |    
T  16453788 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaagcca 16453689  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |    
T  16453688 aaagtagaaaaca--gtgagagaaaagaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccat 16453591  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    | | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  16453590 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctc 16453491  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16453490 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaac 16453398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48486801 - 48486408
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |    
T  48486801 attcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgcgtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagcca 48486702  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg---agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48486701 aaagtagaaaacaacatcaagaga-aaaggaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 48486603  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  48486602 catccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 48486503  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48486502 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaac 48486408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6765327 - 6764928
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  6765327 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttataaatacaagcca 6765231  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    || |||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6765230 aa-gtagaaaacaacggcgagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 6765132  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6765131 cagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcct 6765032  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttcc-----aaagagacaaactctatac 464  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||     |||||||||||||||||||    
T  6765031 cttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatac 6764932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 33415347 - 33415731
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaag 181  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  33415347 atgagaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaacacaagccaaaag 33415446  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||     
T  33415447 tagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgt 33415544  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | ||||||    
T  33415545 ttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaac 33415644  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33415645 caagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcc-aagagacaaactctatacaaac 33415731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 78 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 9148719 - 9148343
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  9148719 attcgatgagaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 9148623  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9148622 aaagtagaaaacaacg-gtgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9148533  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  9148532 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccg 9148434  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148433 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 9148343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14633802 - 14633408
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  14633802 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 14633706  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  14633705 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagag 14633606  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14633605 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatct 14633506  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633505 cttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 14633408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 125 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24880889 - 24880540
Alignment:
Q  125 gaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaa 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  24880889 gaataatcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaga 24880790  T
Q  221 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24880789 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatca 24880690  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 419  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24880689 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaac 24880590  T
Q  420 caacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880589 caaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 24880540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 69 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2891781 - 2891433
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2891781 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaa 2891682  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||    
T  2891681 cacaagccaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagag 2891582  T
Q  269 agcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    ||||| | || | | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  2891581 agcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaa 2891482  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 416  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891481 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 11006111 - 11006481
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  11006111 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaa 11006207  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    || ||||| | |||||         ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11006208 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 11006297  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11006298 ctatatgatgagtaccattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 11006396  T
Q  386 agact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11006397 agactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 11006481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47275190 - 47274816
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  47275190 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 47275091  T
Q  192 cgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  47275090 cgagaga--aatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactata 47274994  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47274993 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagact 47274894  T
Q  391 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47274893 caatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaac 47274816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47868886 - 47868490
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||  |||     
T  47868886 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataaaataca--agcc 47868790  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47868789 aaaagtagaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 47868690  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47868689 gcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcc 47868590  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868589 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaac 47868490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 11008425 - 11008810
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  11008425 aaaaacacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaa 11008521  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11008522 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 11008621  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11008622 caatccactatatgatgagtaccattacaa---agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 11008718  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11008719 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 11008810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7941798 - 7941410
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||  ||  ||||||||||    
T  7941798 aaaatcacaccaacaacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatgaaataca--aggcaaaagtagaa 7941702  T
Q  187 aacaa---cgagagagaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    |||||   ||||| ||||    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7941701 aacaatggcgaga-agaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 7941603  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  7941602 caatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgt 7941503  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag---gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7941502 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaac 7941410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 31849456 - 31849843
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  31849456 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 31849552  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31849553 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 31849652  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  31849653 cgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgt 31849751  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31849752 aagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 31849843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5198879 - 5198510
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5198879 aaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5198783  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    || ||||| | |||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5198782 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5198693  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | |||||||||     
T  5198692 ctatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaa 5198593  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198592 agactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 5198510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36378761 - 36378381
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36378761 aaaatcacaccaataaaatacttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaaacgaaaagtagaa 36378663  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36378662 aacagc-ag-gagaaaagaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccac 36378565  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| |||    
T  36378564 tataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaag 36378465  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36378464 agacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 36378381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Original strand, 26085836 - 26086220
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||||    
T  26085836 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaa 26085932  T
Q  188 acaacga-gagagaaag-----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    ||||||  |||| |||      ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  26085933 acaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccg 26086032  T
Q  281 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||    
T  26086033 atccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaa 26086131  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086132 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 26086220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27499528 - 27499134
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |    
T  27499528 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagtca 27499429  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  27499428 aaagtagaaaacaacgagagagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagc 27499330  T
Q  272 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||| || | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||    
T  27499329 agcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatta---ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatct 27499233  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27499232 cttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 27499134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Original strand, 22132248 - 22132634
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag--a 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||   |    
T  22132248 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaagaa 22132344  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22132345 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccct 22132444  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22132445 ccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 22132543  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22132544 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaac 22132634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18847628 - 18847242
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||| |  | |||||||||    
T  18847628 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataattaaataca-agccaaaaagtaga 18847532  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  18847531 aaacaacggcgagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctc 18847433  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  18847432 caatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 18847334  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18847333 aaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 18847242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 37312937 - 37313310
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37312937 atgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcataagccaaaagt 37313036  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||| ||||||| ||              |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  37313037 agaaaacagcgagagaaaa--------------caaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgtt 37313122  T
Q  283 ccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||    
T  37313123 ccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaac 37313222  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  37313223 caagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaac 37313310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 89 - 468
Target Start/End: Original strand, 22134476 - 22134859
Alignment:
Q  89 aatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag--aa 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||   ||    
T  22134476 aatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaagaaa 22134572  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  22134573 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctcc 22134671  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||    
T  22134672 aatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccata 22134770  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22134771 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaac 22134859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13547635 - 13547302
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  13547635 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 13547536  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13547535 aaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 13547436  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | |    
T  13547435 tccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc 13547336  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547335 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19096362 - 19095971
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||    |  | |||| |||||| || || | |    
T  19096362 attcgatgaaaaatcacactaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaag---tgggtaacagttataatcacaaac-a 19096267  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaa---aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19096266 aaagtagaaaacaacgagagaaaataaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 19096167  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  |||| |    
T  19096166 tctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttc 19096067  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19096066 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 19095971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 16931639 - 16932033
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||| |    
T  16931639 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--agcca 16931735  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagc 271  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  16931736 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagc 16931835  T
Q  272 agccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16931836 agccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctc 16931934  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16931935 ttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaac 16932033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36380818 - 36380438
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36380818 aaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 36380720  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  36380719 aaca--gaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccac 36380622  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||||    
T  36380621 tataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaag 36380522  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta--ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  36380521 atactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggttt-ttgccaagagacaaactctatacaaac 36380438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 44599688 - 44600082
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||  |    
T  44599688 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagga-taattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--aggca 44599783  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  44599784 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 44599883  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44599884 cagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatct 44599982  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44599983 cttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 44600082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 9176331 - 9176718
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  9176331 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca--agccaaaagtagaa 9176427  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagagag-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    || |||||  |||| |||    | |||||||  ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9176428 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 9176527  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||    
T  9176528 caatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 9176626  T
Q  379 aaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9176627 aaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaac 9176718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 18709020 - 18709407
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| || ||||||    
T  18709020 aaaaaccacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaatagtaga 18709116  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  18709117 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcct 18709216  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  18709217 ccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccg 18709315  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18709316 taaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 18709407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 363
Target Start/End: Original strand, 5635334 - 5635614
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  5635334 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 5635430  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5635431 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 5635530  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635531 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19323161 - 19322785
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||   |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  19323161 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaag--ttataaacacgagc-aaaagtataa 19323065  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||| |  ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19323064 aacacctggaga--aagaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttcca 19322967  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| |||||    
T  19322966 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa 19322867  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19322866 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 19322785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 22780220 - 22780617
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||  ||   ||||||| ||||||     
T  22780220 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatcaaag--ttataaatataagcc 22780316  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  22780317 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 22780416  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  22780417 agcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaat 22780515  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22780516 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaa 22780615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 9174003 - 9174390
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  9174003 aaaatcacactaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataattaaataca--agccaaaagtagaa 9174099  T
Q  187 aa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    || |||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9174100 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctc 9174199  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| | |||    
T  9174200 caatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 9174298  T
Q  379 aaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9174299 aaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 9174390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16455706 - 16455354
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  16455706 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcataagcta 16455607  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||| ||||||||| |||||||                ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  16455606 aaactagaaaacagcgagaga----------------acacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 16455523  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |      
T  16455522 ccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcct 16455423  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttc 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16455422 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 16933996 - 16934387
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |  || || |||||||||||| |  ||||||| ||||| | |||  ||| |    
T  16933996 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttaatgtgtggagcaaggga--attaagcaaccaaaacaa-gcgtatggaataattaaataca--agcca 16934089  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagc 271  Q
    ||||||||||||||||  ||||     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  16934090 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagc 16934189  T
Q  272 agccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16934190 agccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctc 16934288  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16934289 ttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 16934387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 22782592 - 22782982
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  |||| ||   ||||||| | |||| |||||||    
T  22782592 gaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagta 22782688  T
Q  184 gaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  22782689 gaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 22782788  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  22782789 ctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc 22782887  T
Q  376 cgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782888 cgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 22782982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 53405618 - 53405219
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||   ||||||| | |||| |    
T  53405618 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaag--ttataaatacaagcca 53405521  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||| ||      |||    || ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  53405520 aaagtagaaaacatcggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag-- 53405423  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataag------tctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||| |||||||||| ||||||     
T  53405422 cagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtct 53405323  T
Q  365 cagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatac 464  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  53405322 cagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagttttgttctaaagagacaaactctatac 53405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4215775 - 4215483
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4215775 gaaaactcacacaaataacaa-cttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtag 4215677  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||  ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  4215676 aaaactgcgagagaaaa--gaa-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcc 4215580  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||    
T  4215579 actatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11437847 - 11437557
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||     
T  11437847 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcc 11437751  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  11437750 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 11437651  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437650 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 619306 - 619691
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||| |||| ||  ||   ||| |||||| || |||| |    
T  619306 attcgatgagaaaacacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatcacaagc-a 619401  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |    
T  619402 aaagtagaaaacaacagcagagaa-gaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttagggg-agagagcagtcat 619499  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |     
T  619500 ccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttccct 619599  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  619600 taaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaac 619691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 282 - 468
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824814
Alignment:
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3824627 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 3824726  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824727 caatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaac 3824814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 229 - 468
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47210984
Alignment:
Q  229 tgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttac 47210855  T
Q  329 aaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  47210856 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------caca 47210943  T
Q  429 aaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47210944 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 47210984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 284 - 468
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637709
Alignment:
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 5637709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47563230 - 47563009
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47563230 aaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagtagaa 47563131  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  47563130 aaca--gcgagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcac 47563033  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaa 310  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  47563032 tataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 468
Target Start/End: Original strand, 18537345 - 18537716
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||||||||| || | ||||||| ||||||    
T  18537345 tcacacctataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-aaaagtataaaaca 18537441  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18537442 acgagaga--aagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactat 18537538  T
Q  290 a-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | ||| |||||||||    
T  18537539 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 18537638  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  18537639 ctcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaac 18537716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41997962 - 41997581
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||    
T  41997962 atgaaaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagt 41997866  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||||||||  |  | |||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |    
T  41997865 agaaaacagcgagagc-aaagaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctgggg-agagagcggccctccgtt 41997769  T
Q  283 ccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||  || | | ||||||    
T  41997768 tcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaac 41997669  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41997668 taagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 41997581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 468
Target Start/End: Original strand, 18534703 - 18535074
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || | |||||||||||| |    
T  18534703 tcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-aaaagtagaaaata 18534799  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
     |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18534800 gcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactat 18534896  T
Q  290 a-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    | | |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||    
T  18534897 aattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagaga 18534996  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  18534997 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 18535074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 56030937 - 56030533
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | || | |    
T  56030937 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaaac-a 56030841  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagaga--gaaag----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggt-------------ccaaattgacatagtt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||             |||||||||| ||||     
T  56030840 aaagtagaaaacagcgagagaaagaaagaagtgaatagagaacacgaaataatttgttgacccagttcggtgacccagttcggtccaaattgacctagtc 56030741  T
Q  259 tgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccca 358  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  56030740 taggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctaccca 56030644  T
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    |||  |||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  56030643 aagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaac 56030544  T
Q  458 tctatacaaac 468  Q
    |||||||||||    
T  56030543 tctatacaaac 56030533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 38890090 - 38890467
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||  |||| ||||    
T  38890090 aaaaatcacaccaataaaatatttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaaggcaaaattaga 38890186  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||||||| | |||    
T  38890187 aaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttcc 38890284  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| | ||| | ||    
T  38890285 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatca 38890384  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  38890385 agagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatcaaccc-caaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 38890467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544048
Alignment:
Q  245 aaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg 344  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  444 -ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaac 13544048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6133309 - 6133105
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  6133309 aaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtaga 6133210  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||    
T  6133209 aaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttcca 6133110  T
Q  286 ctata 290  Q
    |||||    
T  6133109 ctata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Original strand, 24446510 - 24446754
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  24446510 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagcca 24446609  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  24446610 aaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccct 24446693  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagt 338  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24446694 ccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30137031 - 30136641
Alignment:
Q  72 ttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacat 171  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| | | ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||||     
T  30137031 ttgtaaattcgatgtaaaatcacatcaataa-atatttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaag--ttataaacac 30136936  T
Q  172 aagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagc 271  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  30136935 aaaccaaaagtagaaaacaacaagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagc 30136837  T
Q  272 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||| || | | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |    
T  30136836 agccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaattt 30136737  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  30136736 cttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaac 30136641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 467
Target Start/End: Original strand, 8756119 - 8756493
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  8756119 aaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaaaa 8756214  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||   ||| |||| ||| |||||||||| || |||| ||||    
T  8756215 aacaacgagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttcca 8756311  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc-a 383  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| | ||| ||| |    
T  8756312 ctataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa 8756411  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8756412 agagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 8756493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5101396 - 5101130
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  5101396 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 5101297  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    || | |||||||| ||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  5101296 aagggagaaaacaccgagagagaa------------cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agatagcagccct 5101210  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccc 357  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  5101209 ccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 290
Target Start/End: Original strand, 14789281 - 14789495
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  14789281 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 14789380  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg--gagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  14789381 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 14789478  T
Q  274 ccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| | |||||||    
T  14789479 ccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 18409209 - 18409591
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || |||  |||||||||    
T  18409209 aaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaagacaaaagtaga 18409306  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||| | ||||||| |||  || | | || | | | ||| |||||| |||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||| | | |    
T  18409307 aaatagcgagagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttc 18409406  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |   |||| |    
T  18409407 actataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataacta 18409505  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18409506 agagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaac 18409591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 424
Target Start/End: Original strand, 15032410 - 15032748
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  15032410 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacataaac-aaaagtagaa 15032505  T
Q  187 aa-caacgagaga--gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccc-agttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    || || |||||||  ||||| |||| ||||||||  | |||||||  |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||     
T  15032506 aaacagcgagagaaagaaagaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgt 15032604  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  || | |||||      
T  15032605 tccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgt 15032704  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15032705 ccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaacc 15032748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12102550 - 12102221
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  12102550 aaaatcacaccaataaactacttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagtaaaa 12102454  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||  | |||||||||  |||||| | || |||   |||||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12102453 aaca--gtgagagaaag--agagagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttcca 12102361  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||  || | | | | ||||    
T  12102360 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgacca 12102261  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102260 agatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28454151 - 28453818
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||    ||||||||| || |||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28454151 aaaatcacaccaatatattacttgatgtgtgaagcaa--aataatcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaa 28454057  T
Q  187 aacaac--gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||  ||||| ||    
T  28454056 aacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttc 28453958  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| |  |||| | |||||||    
T  28453957 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaacc 28453858  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28453857 aagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 28453818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25358107 - 25357772
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaa-aacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || | |  ||||| ||||||| ||||| ||    |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25358107 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggaggaaagca--atcaagcaaccaataacaacgtg---ggaacaattataaacacaagc-aaaagtag 25358014  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||  |||| ||    
T  25358013 aaaacaacgagagaaa---gaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttc 25357917  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattc----tacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||   | ||||||    || |||||||||||  |||| | |     
T  25357916 tactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttccca 25357817  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25357816 tgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 407
Target Start/End: Original strand, 16185707 - 16186018
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16185707 atcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--attaatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaac 16185800  T
Q  190 aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16185801 aacgagaaacaaaa-aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccacta 16185898  T
Q  289 ta-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    || ||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||||||| |||  |||| | ||| |||||||    
T  16185899 taatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaaga 16185997  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16185998 gactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 303 - 468
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942690
Alignment:
Q  303 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatag 402  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||||||||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatag 52942623  T
Q  403 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52942624 tgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaac 52942690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 264
Target Start/End: Original strand, 52942346 - 52942527
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52942346 aaaaatcacacaaataacaaatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtag 52942445  T
Q  185 aaaacaac-gagagag-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg 264  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52942446 aaaacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 52942527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 49089036 - 49088791
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  49089036 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 49088937  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagt-ttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||||||              |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |    
T  49088936 aaagtagaaaacaacga--------------gagaacgc-aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttc 49088852  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag-agaaatcaatgggttacaaaaataa 336  Q
    || | | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||    
T  49088851 tctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9864182 - 9863842
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa--cataagcgaaaag 181  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||  |||||||||  |||||||| |||||    |||||| |||||||  || |||| |||||    
T  9864182 tgaaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataaaatcacaagc-aaaag 9864087  T
Q  182 tagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttggggg--agagagcagccctc 278  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||| |||    
T  9864086 tagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctc 9863990  T
Q  279 cgatccactat----atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    || ||||||||    |||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||| ||| |||| ||   | ||||||||||||||||| ||  ||||     
T  9863989 cgttccactataatgatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctctt 9863891  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9863890 cccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaa 9863842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 423
Target Start/End: Original strand, 31983383 - 31983727
Alignment:
Q  70 tgttgtatattccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||    |||||||||||||    
T  31983383 tgttgtaaattcgatgaaaaaatcacatcaataaaatatttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaacaattataa 31983477  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggag 266  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||| || | | || |||| | ||| ||    
T  31983478 acacaagt-aaaagtagaaaacaacgagaga------aagaaagaacacacga-aatttgtttacccagtttggtctaatacttacctagtattggg-ag 31983568  T
Q  267 agagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||     
T  31983569 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtct 31983668  T
Q  365 cagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    ||  |||| | | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983669 caatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 468
Target Start/End: Original strand, 3937316 - 3937453
Alignment:
Q  332 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3937316 aataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaac 3937415  T
Q  432 cctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3937416 cctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaac 3937453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 251
Target Start/End: Original strand, 3937134 - 3937300
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  || || || || | |    
T  3937134 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaatcacaaac-a 3937228  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 251  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937229 aaagtagaaaacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattga 3937300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 340 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132963
Alignment:
Q  340 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  439 ttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaa 6132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47151092
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaca 253  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||     
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagaga--aagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgacc 47150921  T
Q  254 tagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaatt 351  Q
    |||| | ||||||| | || |  || | ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  47150922 tagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaatt 47151021  T
Q  352 ctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||| || ||  |||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47151022 ctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Original strand, 3824464 - 3824630
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataag-cgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  3824464 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagt 3824563  T
Q  183 agaaaa----caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 245  Q
    ||||||    || | |||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824564 agaaaaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 419
Target Start/End: Original strand, 3982156 - 3982374
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgt 303  Q
    ||||||||||||  | || ||||| |||  ||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  3982156 agagagaacacatgaaaaattgtttaccttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactt 3982255  T
Q  304 tacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaata 401  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| ||   | ||||||||||||||||||| |  |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3982256 tacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaata 3982355  T
Q  402 gtgtttc-ccaaggtgaat 419  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3982356 gtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10113337 - 10113003
Alignment:
Q  84 tgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10113337 tgaaaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagta 10113243  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    || ||||  |||||||| |  |||| ||||||||  | | ||| || |||||||||||||||| | | || |||| | |||||||||||||| ||||  |    
T  10113242 gataacattgagagagaga--aagaaagaacacatga-attttttttacccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccatt 10113146  T
Q  283 ccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-ggttacaaaaataagtctcccgc-ctaattctacccaaagtcccagcctct-cctcgt 378  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||||| ||| ||||| |    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||    
T  10113145 ccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggttacaagaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgt 10113047  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10113046 gaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa 10113003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 422
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999148
Alignment:
Q  266 gagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtc 363  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||   |||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  364 ccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
     |   |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa 40999148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 468
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446828
Alignment:
Q  397 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaac 24446828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Original strand, 47210655 - 47210755
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |||||||||||    
T  47210655 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagccaaaagtagaaa 47210751  T
Q  188 acaa 191  Q
    ||||    
T  47210752 acaa 47210755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaca 253  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| | || |     
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagaga--aaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgccc 22295470  T
Q  254 tagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaa 310  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22295469 tagtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 7050378 - 7050439
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050378 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11853732 - 11853549
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  11853732 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 11853637  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853636 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5664706 - 5664576
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||  | || | ||||||||||    
T  5664706 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatgacaaaccaaaagtagaa 5664609  T
Q  187 aac---aacgagagagaaaggaagagagaacaca 217  Q
    |||   ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5664608 aacattaacgagaga-aaagaaagagagaacaca 5664576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047447
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10047447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 16688915 - 16689119
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg--atg 295  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||    
T  16688915 aaaggaagaaagagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtttgtgggagagagcagctctccgttccactataatgatatg 16689014  T
Q  296 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaat 394  Q
    |||  | |||| ||||||| ||   || ||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  16689015 agtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaat 16689109  T
Q  395 cctaatagtg 404  Q
    ||||||||||    
T  16689110 cctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152468
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 38270016 - 38270091
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38270016 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataaaca 38270091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 468
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270230
Alignment:
Q  397 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaac 38270230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246062
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 39246062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 407
Target Start/End: Original strand, 5336747 - 5336964
Alignment:
Q  194 agagagaaaggaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat- 289  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  5336747 agagataaaggaagaaggagaacacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactata 5336846  T
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    ||||||| |  | ||   ||||||| || |  || |||||| ||| |||| ||   ||||||||||||| ||||||||  |||| | ||| |||||||||    
T  5336847 atgatgaatttcttttacaaagagatataagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccaatctcttcccgtgaccaagaga 5336945  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  5336946 ctcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8529328 - 8529270
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8529328 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15317019 - 15316961
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15317019 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18587027 - 18586969
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587027 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31300485 - 31300427
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31300485 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55822326 - 55822265
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822326 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557833
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttacaaa 26557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269220
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 5269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18587154 - 18587082
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18587154 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 18587082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4885081 - 4884990
Alignment:
Q  200 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4885081 aaaggaagaaagagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10114510 - 10114463
Alignment:
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10114510 tcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaa 10114463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15831202 - 15831144
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15831202 cctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489410 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25699810 - 25699752
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699810 cctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315258
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329467
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4570155 - 4570094
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4570155 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396700
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8529455 - 8529383
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8529455 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 8529383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 24333813 - 24333877
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24333813 ttgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 24333877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 46147391 - 46147435
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  46147391 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 46147435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5101086
Alignment:
Q  422 acccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaac 5101086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743444
Alignment:
Q  226 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || | |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactat 6743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 52043427 - 52043483
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  52043427 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagca--gaataatcaagcaaccaaaa 52043483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Original strand, 5147681 - 5147735
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  5147681 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctcc 5147735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Original strand, 18311232 - 18311270
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18311232 aaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaag 18311270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36771457 - 36771396
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36771457 cctaattctacccaa-gtcacagcctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4884922 - 4884877
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4884922 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10114680 - 10114576
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  10114680 gagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacctaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatg 10114582  T
Q  293 atgagt 298  Q
    ||||||    
T  10114581 atgagt 10114576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34495906 - 34495853
Alignment:
Q  235 agttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34495906 agttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccacta 34495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 440 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891406
Alignment:
Q  440 tgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaac 2891406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143327
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactat 5143327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12743969
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12743969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745358
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16623386 - 16623322
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  16623386 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630709
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactat 16630709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25862115 - 25862051
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25862115 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactat 25862051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29254662 - 29254618
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  29254662 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagaga 29254618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985663
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactat 31985663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36769667 - 36769595
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36769667 aagaatttgtttatccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 36769595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 363
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270148
Alignment:
Q  335 aagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtc 38270148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 45687182 - 45687226
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  45687182 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagaga 45687226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 47038411 - 47038455
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  47038411 ttgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagaga 47038455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 277
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867239
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 126)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19008034 - 19007651
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19008034 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaga 19007935  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||    
T  19007934 aaacaacgagagagaaatgaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttca 19007835  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||    
T  19007834 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaag 19007735  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007734 aaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 19007651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27105204 - 27104810
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||  ||| |    
T  27105204 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaatgca--agcca 27105107  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27105106 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 27105007  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105006 cagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 27104908  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27104907 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagttttgtttcgaagagacaaactctatacaaac 27104810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 436
Target Start/End: Original strand, 43623431 - 43623791
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  43623431 attcgatgaaaaatcacaccaataactaacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataatcataagcc 43623530  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43623531 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 43623630  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43623631 ctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 43623730  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43623731 cgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctag 43623791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Original strand, 21520542 - 21520935
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaac-aaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  21520542 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 21520641  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac---gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21520642 aaaagtagaaaacaacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 21520741  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21520742 ccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctctt 21520841  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520842 cctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaa 21520935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 6264001 - 6264393
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||      
T  6264001 attcgatgagaaaacacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaacacaagccg 6264100  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6264101 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 6264200  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  || |  ||    
T  6264201 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatc 6264300  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6264301 gtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaac 6264393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 45279850 - 45280228
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  45279850 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 45279946  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45279947 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 45280036  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45280037 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 45280136  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280137 taaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 45280228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 23452094 - 23452481
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  23452094 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agctaaaagtaga 23452190  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23452191 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 23452290  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  23452291 caatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgt 23452390  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452391 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 23452481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 6258670 - 6259059
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |    
T  6258670 attcgatgagaaaacataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagcta 6258769  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  6258770 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagcagccct 6258868  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||| | |    
T  6258869 ccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagcccca--atcttccc 6258966  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6258967 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaac 6259059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 17849511 - 17849132
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  17849511 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattttaaacacaagccaaaagtaga 17849412  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| | ||    
T  17849411 aaacaacgggagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttca 17849313  T
Q  286 ctat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||   |||||||||    
T  17849312 ctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaa 17849213  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatac 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17849212 gagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatac 17849132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 92 - 467
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923752
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  42923373 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaaca 42923472  T
Q  191 acgagagaga--aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  42923473 acgagagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcacta 42923572  T
Q  289 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||||||||||    
T  42923573 tatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaga 42923672  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923673 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa 42923752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 65 - 468
Target Start/End: Original strand, 22287176 - 22287580
Alignment:
Q  65 ctatgtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    |||| ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22287176 ctatttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaatta 22287275  T
Q  165 taaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg 264  Q
    |||| | |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  22287276 taaaaacaagtcaaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggg 22287375  T
Q  265 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  22287376 agagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgt 22287475  T
Q  365 cagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
    ||  |||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22287476 caatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctata 22287575  T
Q  464 caaac 468  Q
    |||||    
T  22287576 caaac 22287580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28197032 - 28196648
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  28197032 atgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagt 28196933  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |    
T  28196932 agaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtt 28196835  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  |||| | | |||||    
T  28196834 tcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataacc 28196735  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28196734 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 28196648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 430
Target Start/End: Original strand, 5375218 - 5375550
Alignment:
Q  98 aataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa-caacgaga 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | |||    
T  5375218 aataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaaga 5375317  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5375318 gagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatga 5375417  T
Q  297 gtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcc 396  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5375418 gtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcc 5375516  T
Q  397 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5375517 taatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 13909902 - 13910288
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  13909902 aaaagtcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 13909998  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  13909999 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatc 13910098  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  13910099 tgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgt 13910197  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13910198 aaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 13910288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 210 - 468
Target Start/End: Original strand, 19501996 - 19502255
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19501996 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaa 19502095  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502096 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 19502195  T
Q  410 caaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19502196 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaac 19502255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14837671 - 14837284
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaa-acttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     
T  14837671 attcgatgagaaatcacatcaataacaatacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagcc 14837572  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  14837571 aaaagtataaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatcca 14837472  T
Q  277 tccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||  |||| |     
T  14837471 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc- 14837373  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14837372 -----ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaac 14837284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 105 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064526
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaagg 204  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||         |     
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcaaaaagtagaaaacaacg---------gc 42064790  T
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt-gacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42064789 aaga-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgt 42064691  T
Q  304 tacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagt 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064690 tacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 42064592  T
Q  404 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42064591 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 42064526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 19504194 - 19504589
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  19504194 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 19504290  T
Q  186 a---------aacaacg---agagaga---aaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |         |||||||   ||| | |   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  19504291 agaaaaaaaaaacaacggcaagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagata 19504390  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504391 gcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 19504490  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19504491 tcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 19504589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 141 - 468
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032302
Alignment:
Q  141 aaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  239 cggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttacaaaaa 333  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||| ||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaa 40032166  T
Q  334 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40032167 taagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 40032266  T
Q  434 tag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032267 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 40032302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 34979442 - 34979823
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  34979442 attcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtca 34979541  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggag-agagcagccc 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  34979542 aaagtagaaaacagcgagagagaa------------cacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagccc 34979629  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |     
T  34979630 ttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcc 34979729  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34979730 cgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaac 34979823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 210 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452794
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 42452952  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452951 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42452852  T
Q  410 caaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  42452851 caaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgtt--acagagacaaactttatacaaac 42452794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 90 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3022562 - 3022174
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3022562 atcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaaac 3022463  T
Q  190 aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | | || |||    
T  3022462 aacgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattat 3022363  T
Q  290 ----------atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
              |||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||  |||| |  |||    
T  3022362 aacgatgataatgatgagtaacttta-taaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggta 3022264  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3022263 accaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 3022174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 35215449 - 35215830
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||  ||  |||||||||    
T  35215449 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataattaaataca--agtcaaaagtaga 35215545  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||||  |||| |||   |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35215546 aaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35215644  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  35215645 cactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaacca 35215743  T
Q  384 agagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35215744 agagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaac 35215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 140 - 468
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289312
Alignment:
Q  140 caaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 239  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  240 ggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagt 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || | | |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagt 44289181  T
Q  339 ctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-g 437  Q
     | || | ||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  44289182 tttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtg 44289281  T
Q  438 tttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  44289282 tttgttgccaagagacagactctatacaaac 44289312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 105 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848454
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 203  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||| ||      
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaa-- 17848717  T
Q  204 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17848716 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgt 17848617  T
Q  304 tacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagt 403  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848616 tacaaaagagatatcaat-ggttacaagaataagtctcccgcc---ttctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 17848521  T
Q  404 gtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848520 gtttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 17848454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 117 - 366
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407595
Alignment:
Q  117 ggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacac 216  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  217 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagata 22407545  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22407546 tcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 90 - 468
Target Start/End: Original strand, 24162084 - 24162456
Alignment:
Q  90 atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaac 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  24162084 atcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaattaaataca--agccaaaagtagaaaac 24162180  T
Q  190 aacga-gagagaaag-----gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    ||||  |||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||    
T  24162181 aacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaat 24162280  T
Q  283 ccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  24162281 ccactatatgatgagtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc----------aacc 24162369  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24162370 aagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 24162456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 35217826 - 35218207
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||  ||  |||||||||    
T  35217826 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataattaaataca--agtcaaaagtaga 35217922  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||||  |||| |||   |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35217923 aaacaacggcgagaagaacaaaaga-agaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35218021  T
Q  284 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  35218022 cactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacca 35218120  T
Q  384 agagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35218121 agagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaac 35218207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 28459054 - 28459434
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28459054 aaaatcacaccaataaaacacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaa 28459153  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||  |||||| ||||||||| | |||    
T  28459154 aaca--gggagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcac 28459250  T
Q  287 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||  |||| | ||||||||||    
T  28459251 tataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaag 28459350  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  28459351 agactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaac 28459434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 11739429 - 11739804
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||  |||||||||| |||| |||||||||||| | |||  |    
T  11739429 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaagtca 11739528  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||                 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  11739529 aaag-----------------ggaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcat 11739611  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |      
T  11739612 ccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcct 11739711  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11739712 ataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaac 11739804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 36560989 - 36561324
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |  | |    
T  36560989 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaatacg-agccaa 36561086  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagag--agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    |||||||||||||||   ||||   | ||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  36561087 aaagtagaaaacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagag 36561186  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36561187 cagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatct 36561285  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561286 cttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 344
Target Start/End: Original strand, 22707613 - 22707872
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  22707613 aaaaccacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaggcagaagtagaa 22707712  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttg--ggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||| | | |    
T  22707713 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttc 22707812  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22707813 actatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 408
Target Start/End: Original strand, 36558720 - 36559047
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  36558720 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 36558818  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |  |  | ||||||||||||||||  | |||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  36558819 cg-agccaaaaagtagaaaacaact-gcgagaa---------gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 36558907  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36558908 agcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 36559006  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36559007 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 354
Target Start/End: Original strand, 7462819 - 7463077
Alignment:
Q  99 ataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaac-gagag 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | |||    
T  7462819 ataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgag 7462918  T
Q  198 agaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatg 295  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7462919 agaaagagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatg 7463018  T
Q  296 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattcta 354  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7463019 ggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 11577974 - 11578349
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    | |||||| |||| |||||||||    
T  11577974 aaaaatcacattaataa-aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaag---tttaaacacaagccaaaagtaga 11578069  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||||||| | |  |||||| ||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  11578070 aaacaacgagagaaagaa-aagagaaaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcg 11578167  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||    
T  11578168 actataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgacca 11578267  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  11578268 agagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaacc--ccaacccta-gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaac 11578349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 314
Target Start/End: Original strand, 22162877 - 22163111
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||| |    
T  22162877 attcgatgagaaaacacaccaataacaattttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataagcacaagcca 22162976  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  22162977 aaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctct 22163074  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163075 ccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 468
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31733009
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||||| || || | |||||||||||||| ||||||| ||||  |     
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaag--ttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagaga-aaag--at 31732760  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 306  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31732761 agagaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttac 31732858  T
Q  307 aaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732859 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtt 31732946  T
Q  407 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31732947 tcccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 31733009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 45238850 - 45239220
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagt--atatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||| | ||||  ||||  |||| |||||| || |||    
T  45238850 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatc-aacagttataatcacaag 45238948  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||                    |||| ||||||||||||||||    
T  45238949 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaaaaatttgttgacc--------------------tagtctgggggagagagcagc 45239026  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||  |||| |    
T  45239027 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcttaattctaccaaaaaccccaatctcttc 45239126  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  45239127 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagag--aaagtctatacaaac 45239220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22874425 - 22874145
Alignment:
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| | | |    
T  22874425 aaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttc 22874327  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||| | ||| || |    
T  22874326 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgacta 22874227  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22874226 agagactcaatcctaatactgttttccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 22874145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 45332028 - 45332364
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  | || |||||||| | ||| |  | |    
T  45332028 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtttgtaacaattaaataca-agccaa 45332125  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  45332126 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 45332225  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  45332226 gcagccctccaattcactatatgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatc 45332324  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332325 tcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 422
Target Start/End: Original strand, 17897125 - 17897443
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17897125 caataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgaga 17897219  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 294  Q
    ||  ||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  17897220 ga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggg-agagagcagccatccgttctactataatgat 17897315  T
Q  295 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaat 394  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || | ||| | |||||||||||||||    
T  17897316 gagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaat 17897415  T
Q  395 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897416 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17897443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146806
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaca 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||     
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgact 20146636  T
Q  254 tagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattc 352  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20146637 tagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattc 20146736  T
Q  353 tacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||| || ||  || | | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20146737 tacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaa 20146806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 177 - 468
Target Start/End: Original strand, 18800267 - 18800554
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| | || ||||| |||||| ||||    
T  18800267 aaaagtagaaaacagc-aga-agaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggg-agagagtagcc 18800363  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  18800364 ctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttc 18800463  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  18800464 ctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaac 18800554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23871205 - 23870951
Alignment:
Q  93 acaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa--caattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  23871205 acaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaacaattaaataaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaaca 23871106  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || | |  ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  23871105 gcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata 23871006  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgc 345  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23871005 tgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 249
Target Start/End: Original strand, 15539396 - 15539553
Alignment:
Q  91 tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaaca 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15539396 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggatta-tcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaaca 15539494  T
Q  191 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539495 acgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699429
Alignment:
Q  156 gaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacat 254  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| || | |||| |    
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaata-gcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgacct 40699601  T
Q  255 agtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattc 352  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |   ||||||||    
T  40699600 agtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacctaattc 40699501  T
Q  353 tacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699500 tacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 303 - 468
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539719
Alignment:
Q  303 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatag 402  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  403 tgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 15539719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38020473 - 38020370
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38020473 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtagaa 38020374  T
Q  187 aaca 190  Q
    ||||    
T  38020373 aaca 38020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35107618 - 35107351
Alignment:
Q  158 acaattataaacataagcgaaaagtagaaaa--caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacat 254  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||| | |||| |    
T  35107618 acaattataaacataagt-aaaggtagaaaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacct 35107521  T
Q  255 agtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgc--ctaatt 351  Q
    ||| ||||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| |     ||||||    
T  35107520 agtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaagg-ttacaagaataagtcttcaaaatctaatt 35107422  T
Q  352 ctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||| ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35107421 ctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaa 35107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 425
Target Start/End: Original strand, 27136101 - 27136326
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatga 293  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| || ||||| | || ||||         
T  27136101 gagagaaagaaaaagagaacacataa-aatttgtttactcagttcggtccaatactgacttagttttggggagagaacaaccctctgttctacta----- 27136194  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactca 392  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||   |||   ||| ||||||||| |||    
T  27136195 -gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattca 27136293  T
Q  393 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27136294 atcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccc 27136326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 423
Target Start/End: Original strand, 37962799 - 37963137
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||| ||  || ||||||| ||| ||| |||   |||||| || ||   |    
T  37962799 attcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaag--ttataatcacaaat-a 37962895  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||| ||     
T  37962896 aaagtagaaaacaacttgaga-aaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtcca 37962993  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    | | | ||||||| |||||| |||| ||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||  |||| |      
T  37962994 ctgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaatggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcag 37963090  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||    
T  37963091 gtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatcaac 37963137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020213
Alignment:
Q  323 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccc----------caataccaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaa 38020260  T
Q  423 cccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  38020259 ccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaac 38020213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 468
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163191
Alignment:
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaac 22163191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 443
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414297
Alignment:
Q  338 tctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagg 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttc-cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T
Q  438 tttgtt 443  Q
    ||||||    
T  38414292 tttgtt 38414297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 199
Target Start/End: Original strand, 38414036 - 38414156
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |  ||||| |  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |    
T  38414036 attccatgaaaaatcacaccaa-aacaaaattggtgtgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggta 38414134  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38414135 aaagtagaaaacaacgagagag 38414156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 468
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407653
Alignment:
Q  407 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 22407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20592467 - 20592288
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||| |||||||||    
T  20592467 aaaaatcacaccaataaaatacgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaagc-aaaagtaga 20592371  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||| | |   |||||||| |||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  20592370 aaatatc--aagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagag 20592288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35028959 - 35028632
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||  |||||||||||| | |||| |||  ||||    
T  35028959 aaaaatcacaccaataaaatatttaatgtgtggagcaa--aataatcaaacaatcaaaacaacgtggat--aacaattataaaaacaagcaaaa--taga 35028866  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||  | || |||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |  | | |||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35028865 aaaca--gtgaaagaaagaaagagagaatacaaaa-aatttgtttagccagttcgat--atactgacctagtaagggggagagagcagctctccgttcca 35028771  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcc-taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    ||  | ||||||||||  ||| |||||||| || ||  |||||||| ||| ||| | |   | ||||||||||||||||  ||  |||| ||||| | ||    
T  35028770 ctgcaatgatgagtaattttagaaaagagatattaaaaggttacaagaattagtattcaaacataattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatca 35028671  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  35028670 agagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaa 35028632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17943723 - 17943540
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| |    
T  17943723 aagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagata 17943625  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |   || ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17943624 t---tgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43139564 - 43139432
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagaga 388  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||   | |||||||||||| |||||| ||   ||| | ||| |||||||||    
T  43139564 atgatgagtaactttacaaa-gagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagaga 43139466  T
Q  389 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43139465 ctcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa 43139432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390179
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22874511 - 22874431
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  22874511 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2736388 - 2736205
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    |    
T  2736388 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---ta 2736293  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736292 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattcta-ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17462497 - 17462436
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462497 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 20054886 - 20054947
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054886 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39687044 - 39686983
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687044 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682362
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactata 34682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42453874 - 42453798
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatta 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  42453874 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaacaatta 42453798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699036
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 14699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693958
Alignment:
Q  290 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagag 387  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||||||||||| |  |||| |  || ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  388 actcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaac 423  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 19501859 - 19501930
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaacc-aaaacaaagtatatggaa 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  19501859 aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19501930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259206
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921754
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 27517760 - 27517818
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27517760 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2741002 - 2740941
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741002 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8173653 - 8173539
Alignment:
Q  155 ggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgaca 253  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  8173653 ggaacaattataaacacaaac-aaaggtaaaaaacaacgagaga-aaagaaagagtgaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacc 8173557  T
Q  254 tagtttgggggagagagc 271  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8173556 tagtatgggggagagagc 8173539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 421
Target Start/End: Original strand, 27583494 - 27583535
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27583494 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1345640 - 1345572
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccact 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1345640 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccact 1345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569396
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522288
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 20522288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 33118140 - 33118204
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33118140 ttgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactat 33118204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26345704 - 26345661
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345704 accaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 37170873 - 37170931
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  37170873 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040128
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8040128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10445537 - 10445473
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10445537 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16940302 - 16940238
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  16940302 ttgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactat 16940238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17010967 - 17010903
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  17010967 ttgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactat 17010903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17462619 - 17462551
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462619 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17462551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30479182 - 30479110
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30479182 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactata 30479110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36773730 - 36773686
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  36773730 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagaga 36773686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38312408 - 38312364
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38312408 ttgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagaga 38312364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 39482935 - 39482999
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39482935 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactat 39482999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 45679906 - 45679838
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45679906 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 468
Target Start/End: Original strand, 5377642 - 5377673
Alignment:
Q  437 gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377642 gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 5377673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30479055 - 30478997
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30479055 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 30478997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Original strand, 30720732 - 30720811
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30720732 cctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 422
Target Start/End: Original strand, 34575265 - 34575308
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575265 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2741056
Alignment:
Q  249 tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2741056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2838129 - 2838076
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||    
T  2838129 aagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 20050015 - 20050088
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagt-ttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20050015 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggggagagagcagctctccgatccactata 20050088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29868034 - 29867993
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  29868034 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 29867993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  249 tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39680244 - 39680160
Alignment:
Q  206 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39680244 agagagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 39680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10707345 - 10707281
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  10707345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactat 10707281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828458
Alignment:
Q  222 aatttgttgacccagttcggtcca-aattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca 319  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||| |||   | | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  320 atgggttacaaaaataagtct 340  Q
    | ||| ||||| |||||||||    
T  13828438 aagggctacaagaataagtct 13828458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 17865207 - 17865271
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17865207 ttgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 17865271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 407
Target Start/End: Original strand, 20050156 - 20050204
Alignment:
Q  359 aagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050156 aagtcctagcctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33528714 - 33528650
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  33528714 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactat 33528650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33604144 - 33604092
Alignment:
Q  258 ttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33604144 ttgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 34388862 - 34388926
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  34388862 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39687166 - 39687098
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39687166 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 39687098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Original strand, 42923315 - 42923347
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42923315 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaag 42923347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 133)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47906696 - 47906305
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  47906696 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacaagcca 47906598  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  47906597 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccc 47906498  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |    
T  47906497 tccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttccc 47906398  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906397 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 47906305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 85 - 456
Target Start/End: Original strand, 27336799 - 27337173
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27336799 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27336898  T
Q  184 gaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27336899 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 27336998  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  27336999 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaac 27337097  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaa 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27337098 caagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa 27337173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51750461 - 51750074
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  51750461 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 51750365  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51750364 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 51750265  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51750264 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 51750165  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51750164 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 51750074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 2949087 - 2949477
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  2949087 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 2949186  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  2949187 aaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctag-tcgggggagagagcagccct 2949285  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||    
T  2949286 ctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcg 2949385  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2949386 taaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 2949477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18840014 - 18839622
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  18840014 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 18839915  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  18839914 aaactagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccct 18839815  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    | | | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  18839814 ctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctc 18839715  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta-ggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18839714 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaac 18839622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 27338990 - 27339376
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27338990 gaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagta 27339089  T
Q  184 gaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27339090 gaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccga 27339189  T
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  27339190 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaac 27339288  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339289 taagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaac 27339376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13215496 - 13215116
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  13215496 cacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 13215397  T
Q  192 cgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata- 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13215396 cgagagagaaaggaagagagaaca--aaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataa 13215299  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  13215298 tgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 13215199  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215198 gactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 13215116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 85 - 468
Target Start/End: Original strand, 14097830 - 14098216
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagta 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14097830 gaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagta 14097929  T
Q  184 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  14097930 gaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgttt 14098029  T
Q  284 cactatatgatgagtaacg-ttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |  |||| | |||||||    
T  14098030 cactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaacc 14098129  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14098130 aagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaac 14098216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15823985 - 15823581
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataa 167  Q
    |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15823985 gtgttgcaaattcctttaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataa 15823886  T
Q  168 acataagcgaaaagtagaaaacaacga---gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg 264  Q
     || |||  |||||||||||||||| |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15823885 tcacaaggcaaaagtagaaaacaacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctggggg 15823786  T
Q  265 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 364  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15823785 agagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 15823686  T
Q  365 cagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15823685 cagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata 15823586  T
Q  464 caaac 468  Q
    |||||    
T  15823585 caaac 15823581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 12302367 - 12302751
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  12302367 aaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtag 12302466  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |    
T  12302467 aaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttc 12302566  T
Q  285 actatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||||    
T  12302567 actatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaa 12302666  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12302667 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaac 12302751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 50307397 - 50307793
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  50307397 attcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 50307496  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaagg-aagagagaacacaaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50307497 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 50307596  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  50307597 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 50307696  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50307697 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 50307793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 17324486 - 17324882
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||     
T  17324486 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataagcc 17324585  T
Q  177 a-aaagtagaaaacaacgagaga---gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    | ||||||||||||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17324586 agaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 17324685  T
Q  273 gccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct 372  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17324686 gccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctct 17324785  T
Q  373 cctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17324786 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaac 17324882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 4131229 - 4131625
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaa-tcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  4131229 attcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 4131328  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4131329 aaaaatagaaaacaacgagagagaaaagaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 4131428  T
Q  277 tccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaa----atcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131429 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagt-ccagcctc 4131527  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131528 ttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 4131625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 11457330 - 11457721
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  11457330 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaagcca 11457429  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  11457430 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacat 11457529  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | ||    
T  11457530 ccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcg 11457629  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  11457630 taaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaac 11457721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39462948 - 39462554
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  39462948 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 39462849  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39462848 aaaattagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 39462749  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  39462748 tctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 39462649  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462648 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 39462554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 25251129 - 25251521
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  25251129 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagcca 25251228  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  25251229 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccct 25251328  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    | | | |||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  25251329 ctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 25251428  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  25251429 gtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaac 25251521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 15294694 - 15295080
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  15294694 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 15294790  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15294791 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 15294890  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  15294891 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgta 15294990  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15294991 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaac 15295080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 46431556 - 46431953
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  46431556 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaataca--agcca 46431652  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gagag------aaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggg--aga 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  46431653 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggaga 46431752  T
Q  268 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46431753 gagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccat 46431851  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46431852 cctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaa 46431951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 6995548 - 6995946
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |    
T  6995548 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaacacaagcca 6995647  T
Q  178 aaagtagaaaacaac---gagagagaaag----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  6995648 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagag 6995747  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  6995748 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatct 6995847  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995848 cttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 6995946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 105 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840715
Alignment:
Q  105 aacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa- 201  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||     
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  202 ---aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 297  Q
       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 28840886  T
Q  298 taacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcct 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28840885 taacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 28840787  T
Q  398 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28840786 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 28840715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 31735373 - 31735767
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  31735373 attcgatgagaaattacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agcca 31735469  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||| ||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31735470 aaa-tagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 31735568  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735569 cagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 31735668  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31735669 cttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 31735767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 10399677 - 10400074
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  |||    
T  10399677 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agc 10399773  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
     |||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10399774 caaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 10399873  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  10399874 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaat 10399973  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10399974 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa 10400073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41647347 - 41646955
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||      
T  41647347 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaacacaagtc 41647248  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  41647247 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccc 41647148  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| | |    
T  41647147 tccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttccc 41647048  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647047 gtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 41646955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 31424870 - 31425265
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||  |    
T  31424870 attcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaacacaagtca 31424969  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  31424970 aaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-ggggagagagcagcctt 31425068  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |    
T  31425069 ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttcc 31425168  T
Q  377 gtaaccaagag---actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31425169 gtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaac 31425265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 9240950 - 9241332
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||    
T  9240950 aaaaatcacaccaataacaaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtaga 9241049  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9241050 aaacagcgagaga--aagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttcca 9241147  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  9241148 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaa 9241247  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9241248 gagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 9241332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 463
Target Start/End: Original strand, 50248425 - 50248813
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  50248425 attcgatgataaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaccacaagcca 50248524  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag--cagcc 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||  || ||    
T  50248525 aaagttgaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaacc 50248624  T
Q  276 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
     || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||| |     
T  50248625 atctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcc 50248724  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50248725 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata 50248813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13762257 - 13761872
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  13762257 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 13762161  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13762160 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctcc 13762061  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  13762060 ggtccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgta 13761962  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761961 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 13761872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 97 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18307516 - 18307144
Alignment:
Q  97 caataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgaga 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  18307516 caataacaaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgaga 18307417  T
Q  197 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  18307416 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccatccgtttcactataatgatg 18307318  T
Q  296 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatc 395  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  18307317 agtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 18307218  T
Q  396 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18307217 ctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaac 18307144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39932506 - 39932108
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||| |    
T  39932506 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaatacaagcca 39932409  T
Q  178 aaagtagaaaa-caacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggga-gag 268  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  39932408 aaagtagaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagag 39932309  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39932308 agcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagt 39932209  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932208 ctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 39932109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 116 - 468
Target Start/End: Original strand, 50076566 - 50076918
Alignment:
Q  116 tggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaaca 215  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50076566 tggagcaatgaataataaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aagagagaaca 50076664  T
Q  216 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50076665 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggg-agagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaga 50076763  T
Q  315 aatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 414  Q
     |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076764 tatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 50076863  T
Q  415 tgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  50076864 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaac 50076918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2617939 - 2617551
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  2617939 aaaaccacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 2617843  T
Q  186 aaacaac---gagagagaa----aggaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||   |||||| ||    | ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  2617842 aaacaacagcgagagaaaacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccct 2617743  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2617742 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccg 2617643  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617642 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 2617551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 38925341 - 38925724
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa--caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaa 180  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  38925341 atgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataaacacaagccaaaa 38925440  T
Q  181 gtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccg 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38925441 gtagaaaacaatgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccg 38925537  T
Q  281 atccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
     |  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||    
T  38925538 ttttactat--gatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaa 38925635  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925636 ccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 38925724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24326093 - 24325698
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||  ||  |    
T  24326093 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaattaaataca--agtca 24325997  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    || ||| |||||||||  |||| |||    | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  24325996 aaggtaaaaaacaacggtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagag 24325897  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24325896 cagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcct 24325797  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325796 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 24325698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28842915 - 28842530
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  28842915 aaaatcacactaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 28842819  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  28842818 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctcc 28842719  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  28842718 gttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgta 28842620  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28842619 accaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 28842530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 78 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31490337 - 31489958
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  |    
T  31490337 attcgatgaaaaatcacaccaata-caaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagtca 31490239  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  31490238 aaagtagaaaacagggagagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccct 31490140  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| | ||    
T  31490139 ccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccg 31490040  T
Q  378 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaact 458  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31490039 taaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaact 31489958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 212 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823050
Alignment:
Q  212 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  312 agaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 411  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 6823107  T
Q  412 aggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6823106 aggtgaatcaacccacaaaccctagttttgttcctaagagacaaactctatacaaac 6823050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23816315 - 23816027
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |    
T  23816315 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtca 23816217  T
Q  178 aaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaa---gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  23816216 aaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcat 23816117  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816116 ccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 28206920 - 28207312
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  28206920 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagcc 28207019  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28207020 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 28207119  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||  |||| |    
T  28207120 cctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttc 28207217  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28207218 ctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaac 28207312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17319322 - 17318928
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  17319322 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcgcaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaa 17319223  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||    
T  17319222 cacaagccaaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-agggagag 17319124  T
Q  269 agcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag 367  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  17319123 agcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaa 17319024  T
Q  368 cctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
     || | | |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  17319023 tctgttcccgtaaccaagagactcaatcc------tgtttcccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaa 17318930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 443
Target Start/End: Original strand, 25248406 - 25248772
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |    
T  25248406 attcgatgaaaaatcacaacaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacaaaagtca 25248505  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||    
T  25248506 aaagtagaaaacagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcct 25248605  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |      
T  25248606 ccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcct 25248705  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgtt 443  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25248706 gtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagttttgtt 25248772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Original strand, 28998116 - 28998499
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28998116 cacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 28998215  T
Q  189 caacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||||   ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | ||    
T  28998216 caacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttca 28998315  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||    
T  28998316 ccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaag 28998415  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  28998416 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaac 28998499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Original strand, 29003832 - 29004215
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa---caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29003832 cacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 29003931  T
Q  189 caacgagag---agaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||||   ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | ||    
T  29003932 caacgagagaaaagaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttca 29004031  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||    
T  29004032 ccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaag 29004131  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  29004132 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaac 29004215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 9459285 - 9459663
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  9459285 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 9459381  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9459382 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9459471  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  9459472 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 9459570  T
Q  378 taaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459571 taaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaac 9459663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 9463112 - 9463490
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||||||| | |||| |    
T  9463112 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcca 9463208  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||||||||||||| | |||||         |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9463209 aaagtagaaaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccct 9463298  T
Q  278 ccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcg 377  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||    
T  9463299 ccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 9463397  T
Q  378 taaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9463398 taaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaac 9463490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16429043 - 16428688
Alignment:
Q  111 atgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagaga 210  Q
    |||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  16429043 atgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaag--ttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaa--gaagaga 16428948  T
Q  211 gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  16428947 gaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaa 16428848  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 409  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16428847 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 16428748  T
Q  410 caaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16428747 caaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaac 16428688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 83 - 468
Target Start/End: Original strand, 17185992 - 17186374
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||| || || | ||||||    
T  17185992 atgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatcacaaac-aaaagt 17186088  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgat 282  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  17186089 agaaaacagcgagaga--aagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgtt 17186186  T
Q  283 ccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||| | ||||||    
T  17186187 ccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaac 17186286  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17186287 caagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaac 17186374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20302863 - 20302494
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20302863 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 20302767  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||| | |||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  20302766 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatcca 20302677  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||    
T  20302676 ctatctgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaag 20302578  T
Q  386 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20302577 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 20302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16226599 - 16226202
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  16226599 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 16226503  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  16226502 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 16226403  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16226402 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaat 16226304  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16226303 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaa 16226204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40134370 - 40133979
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag-ga-ataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||| |  ||||    
T  40134370 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataatctcaagc 40134273  T
Q  176 gaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40134272 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 40134174  T
Q  276 ctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
     |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||  |||| |    
T  40134173 atccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttc 40134074  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  40134073 ccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaac 40133979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20291878 - 20291492
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||    
T  20291878 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtaga 20291782  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||    
T  20291781 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctc 20291682  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  20291681 cgatccactatatgatgagaatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgt 20291583  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20291582 gaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 20291492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25128299 - 25127907
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |  ||||||||| || ||       
T  25128299 attcaatgaaaactcacgtcaataacaaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat- 25128203  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagaga--gaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  25128202 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagc 25128103  T
Q  275 cctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||     
T  25128102 cctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctctt 25128003  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  25128002 cccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaac 25127907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16429379 - 16429042
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || | |    
T  16429379 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaacca 16429282  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16429281 aaagt-gaaaacagcgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 16429185  T
Q  278 ccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16429184 ccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttccc 16429085  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16429084 gtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 2510202 - 2510570
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||| |||||    
T  2510202 aaaatcacaccaataacaa-cttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaaaca--agtcaaaaatagaa 2510298  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  2510299 aacaacg-gcgagaa---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcac 2510388  T
Q  287 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaaga 386  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |    
T  2510389 tatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtct-ctgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaa 2510487  T
Q  387 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510488 gactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 2510570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 210 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51752657 - 51752402
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  51752657 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aa 51752559  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51752558 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaat-ctaatagtgtttca 51752460  T
Q  410 caaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaa 466  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51752459 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaa 51752402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324103
Alignment:
Q  94 caccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  17324484 caccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagtg 17324385  T
Q  194 agagaga------------aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||     
T  17324384 agagagagagagagagagaaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgt 17324287  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| | | ||     
T  17324286 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatat 17324187  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctata 463  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17324186 tcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 17324103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 31422714 - 31423120
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa-cataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||||| || |||      
T  31422714 attcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaacacaagtc 31422813  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31422814 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccc 31422913  T
Q  277 tccg------------atccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 363  Q
    || |             | |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422914 tctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 31423013  T
Q  364 ccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gttt-gttccaaagagacaaactcta 461  Q
     ||  |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  31423014 tcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactcta 31423113  T
Q  462 tacaaac 468  Q
    || ||||    
T  31423114 tataaac 31423120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756562
Alignment:
Q  153 atggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgac 252  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagag-gaaag-aagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgac 6756780  T
Q  253 atagtttggggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaat 350  Q
     |||| |||||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6756779 ctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaat 6756680  T
Q  351 tctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgtt-ccaaa 448  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  6756679 tctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaa 6756582  T
Q  449 gagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6756581 gagacaaactctatacaaac 6756562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 261 - 468
Target Start/End: Original strand, 21948226 - 21948433
Alignment:
Q  261 ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948226 ggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 21948325  T
Q  361 gtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactc 459  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21948326 gtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 21948424  T
Q  460 tatacaaac 468  Q
    |||||||||    
T  21948425 tatacaaac 21948433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 468
Target Start/End: Original strand, 50078779 - 50079067
Alignment:
Q  183 agaaaacaacgagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |     
T  50078779 agaaaacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgt 50078878  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | |||||    
T  50078879 tccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaa 50078978  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50078979 ccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaac 50079067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47180136 - 47179748
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  47180136 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataattaaataca--agccaaaagtag 47180040  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  47180039 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccc 47179941  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  47179940 tccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 47179842  T
Q  377 gtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47179841 gtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaac 47179748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 51757965 - 51757623
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||  ||| |    
T  51757965 attcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattgaataca--agcca 51757869  T
Q  178 aaagtag-----aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttggggga 265  Q
    |||||||     |||||||||  |||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51757868 aaagtagggaaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 51757769  T
Q  266 gagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51757768 gagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctc 51757670  T
Q  366 agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 412  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757669 agcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 78 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16432813 - 16432440
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||| ||   |||||||||||| | |    
T  16432813 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaag--ttataaacataaacca 16432716  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagt-ttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16432715 aaagtagaaaa-------acagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtcc 16432623  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||  |||| |     
T  16432622 gccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcc 16432523  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaac 457  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  16432522 cataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 468
Target Start/End: Original strand, 3579587 - 3579862
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatg 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  | |||| | ||||| |||    
T  3579587 gagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atg 3579685  T
Q  293 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactca 392  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||   ||||| |||||||||||    
T  3579686 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactca 3579785  T
Q  393 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3579786 atcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaac 3579862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23786279 - 23785935
Alignment:
Q  69 gtgttgtatattccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaa 168  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  23786279 gtgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattaaata 23786181  T
Q  169 cataagcgaaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgg 261  Q
    || |  | |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||    
T  23786180 ca-agccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgg 23786082  T
Q  262 gggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23786081 gggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 23785983  T
Q  362 tcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    |||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23785982 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47177785 - 47177397
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  47177785 aaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataattaaataca--agccaaaagtag 47177689  T
Q  185 aaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  47177688 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccc 47177590  T
Q  277 tccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  47177589 tccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 47177491  T
Q  377 gtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47177490 gtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaac 47177397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16231994 - 16231631
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||||     
T  16231994 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagcc 16231898  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagag 268  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||    | |||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  16231897 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagag 16231799  T
Q  269 agcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  16231798 agcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaat 16231700  T
Q  369 ctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231699 ctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 16231631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 424
Target Start/End: Original strand, 6114961 - 6115304
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||| ||| | |||||||   ||||||| | |||  |    
T  6114961 attcaatgaaaaatcacaccggtaatatacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaag--ttataaatacaagtca 6115058  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  6115059 aaagtagaagacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcatt 6115156  T
Q  278 ccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctc 376  Q
    ||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |      
T  6115157 ccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcat 6115256  T
Q  377 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6115257 gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47452057 - 47451683
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  47452057 attcaatgaaaaatcacatcaataacaaatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 47451958  T
Q  178 aaagtagaaa---acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||             | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  47451957 aaagtagaaagcaacaacgagaga-aaaggaagagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagt 47451872  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  47451871 cattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttc 47451772  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||         | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47451771 ccgtaaccaagagactcaatcctaa------acactaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 47451683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 282 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48665400 - 48665212
Alignment:
Q  282 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc-tcctcgtaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  48665400 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaa 48665301  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48665300 ccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaac 48665212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 14183470 - 14183835
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| |||    
T  14183470 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagc-aaaagaaga 14183566  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    |||||||||||||               ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  14183567 aaacaacgagagac--------------cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttcc 14183652  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |  |||| | ||||||||    
T  14183653 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaacca 14183752  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  14183753 agagactcaattataatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaac 14183835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 425
Target Start/End: Original strand, 18800439 - 18800775
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18800439 aaaatcacaccaacaaaatacttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagccaaaagtagaa 18800536  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||||||  | |||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  18800537 aacaacgagaga-aaacaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgcttca 18800634  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||| | ||| ||| |    
T  18800635 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtgaccta 18800734  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18800735 gagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaaccc 18800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 468
Target Start/End: Original strand, 15669281 - 15669637
Alignment:
Q  108 ttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaag 207  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||   ||||||||| || | ||||||| || ||| ||||||| |||| |||    
T  15669281 ttgatgtgtgaagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaag--ttataaacacaaac-aaaagtataacacagcgagaga-aaagaaag 15669376  T
Q  208 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 305  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||| ||| |||  |||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||    
T  15669377 agagaacacaacaaaatttgtttacacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagcttta 15669476  T
Q  306 caaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 405  Q
    | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15669477 cgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 15669576  T
Q  406 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  15669577 ttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaac 15669637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42922556 - 42922310
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||| |    
T  42922556 aaaagtagaaaacaacgggaga--aagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 42922460  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  42922459 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 42922360  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42922359 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc 42922310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 8348913 - 8349295
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| || | |    
T  8348913 attcgatgaaaaatcacaccaataa-aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaaac-a 8349007  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||| || |||    
T  8349008 aaagtagaaaacaattagaga--aagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccc 8349104  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    ||   ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| |     
T  8349105 tctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcc 8349204  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  8349205 cgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 8349295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 425
Target Start/End: Original strand, 8347139 - 8347475
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagt 182  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||    
T  8347139 atgaaaaatcacacaagtaa-atacttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaag--ttataaacataagc-aaaagt 8347233  T
Q  183 agaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccga 281  Q
    |||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||  | ||||||||  ||  ||||||||||||  |||| |||| | ||||| |||||| |||||||     
T  8347234 agaaaacagcgataga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgt 8347330  T
Q  282 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaa 380  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| | ||| |    
T  8347331 tccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtga 8347430  T
Q  381 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 425  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8347431 tcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccc 8347475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 423
Target Start/End: Original strand, 49495182 - 49495411
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tga 293  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||| || | ||||||| |||    
T  49495182 gagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatga 49495281  T
Q  294 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaa 393  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   ||| ||||| ||||||||    
T  49495282 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaa 49495381  T
Q  394 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 423  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  49495382 ttttattagtgtttcccaaggtgaatcaac 49495411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15916813 - 15916564
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  15916813 attcgatgaaaagtcacaccaataa-atacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaagcca 15916717  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||  | | |||| |||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15916716 aaagtagaaaaaca-gcgagaaaaagaaagagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 15916619  T
Q  277 tccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 330  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15916618 tccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaa 15916564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823920
Alignment:
Q  305 acaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc-------aagagactcaatcct 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||       |||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  398 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 6823920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 200
Target Start/End: Original strand, 50078653 - 50078766
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50078653 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 50078752  T
Q  187 aacaacgagagaga 200  Q
    ||||||||||||||    
T  50078753 aacaacgagagaga 50078766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 424
Target Start/End: Original strand, 13125326 - 13125660
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  13125326 aaaaatcacaccaataaattacttgatgtgtggagcaaa-aataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaga 13125420  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||  ||||| ||||||| | ||||| |||    
T  13125421 aaacaacgagagaaagaa-aagagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttcc 13125518  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||  |||| | | | |||    
T  13125519 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgacc 13125618  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  13125619 aagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaacc 13125660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13358995 - 13358778
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | |||| |||||||||    
T  13358995 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaag--ttataaatacaagccaaaagtaga 13358899  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13358898 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 13358799  T
Q  279 cgatccactatatgatgagta 299  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  13358798 cgatccactatatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 424
Target Start/End: Original strand, 30790266 - 30790602
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtag-- 184  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || | |||| |||      
T  30790266 aaaatcacaccaataaaatacctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaag--ttataaacacaaacaaaaa-tagta 30790362  T
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||| |  | ||||||||| ||||||| |||||  | | |||||| | |||||||||||||||  |||| |||| ||||  ||||||||| | |||  ||    
T  30790363 aaaagacagcgagagaaagaaagagagcacacacga-attttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattc 30790460  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| |   |||| | ||||||    
T  30790461 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaac 30790560  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30790561 caaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaacc 30790602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16561878 - 16561544
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||| ||     ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16561878 aaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaa--aataatcaagcaaccaatatcaacgtga---gaacaattataaacacaagc-aaaagtaga 16561785  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||  |||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| | |||| |||| |  ||||||||||| ||||  | |||    
T  16561784 aaacggcgagaga--aagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttcc 16561688  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacc 382  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||  || |   |||  ||    
T  16561687 actgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggcc 16561588  T
Q  383 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561587 aagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 16561544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 422
Target Start/End: Original strand, 30738561 - 30738830
Alignment:
Q  157 aacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacat 254  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |    
T  30738561 aacaattataaacacaagc-aagagtagaaaaaatagtgagagaaagaaaagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacct 30738658  T
Q  255 agtttgggggagagagcagccctccgatccactata---tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaat 350  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  30738659 agtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaat 30738758  T
Q  351 tctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| |||||  |||| |   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738759 tctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 422
Target Start/End: Original strand, 26613211 - 26613440
Alignment:
Q  195 gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tg 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| || | |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||    
T  26613211 gagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatg 26613309  T
Q  293 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactc 391  Q
    || |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||  |||| |  || |||||| |||||    
T  26613310 attagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactc 26613409  T
Q  392 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26613410 aatccgaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 13447133 - 13447301
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||||||||    
T  13447133 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagccaaaagtagaa 13447229  T
Q  187 aacaac-gagagaga-----aaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 251  Q
    |||||| | |||| |     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447230 aacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Original strand, 3579439 - 3579572
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  3579439 attcgatgaaaaa-cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagcca 3579537  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagaga 212  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3579538 aaagtagaaaacagagagagagagagggagagaga 3579572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28279680 - 28279346
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||   ||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28279680 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagt--taaacaaacaaccaaatcaacgtgggtg--acaattataaacacaagcgaaa-gtaga 28279586  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagttt-gggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    ||||||||| | |  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| || || | |||| |||| | |||||| ||| || | |||   ||    
T  28279585 aaacaacgaaaaa--aagggagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttcgatctaatactgacctagtctagggggaaagaacaactctcaattc 28279488  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||| ||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||  |||| | ||| ||    
T  28279487 cactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgac 28279388  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28279387 caagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaa 28279346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27916822 - 27916576
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    | |||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  27916822 aaaagtagaaaacaacgagagagaaa--aaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagcc 27916726  T
Q  276 ctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg--ggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||| |  ||||| || ||| |||| ||   |||||||| |||||||||| ||  |||    
T  27916725 ctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaaagaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctc 27916627  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    | |  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27916626 ttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 27916576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  247 attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccg- 344  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||| ||| | ||| |       
T  155963 attgacctagtttgggg-agagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353525
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaa 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| |    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagata 21353440  T
Q  317 tcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |   || ||||||| ||| |||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21353441 t---tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 424
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520321
Alignment:
Q  163 tataaacataagcgaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcc-aaattgacatagtttgg 261  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacga-tatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctaatttgg 26520158  T
Q  262 gggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcc-cgcctaattctacccaa 359  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| || || || ||| ||||         ||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||    
T  26520159 gggaaagagcaaccctccgttccactataattataagcaactttac--------tatcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaa 26520250  T
Q  360 agtcccagcctctcctc------gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    |||||||  |||| | |      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520251 agtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 26520321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30780474 - 30780361
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatg--gagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagc 175  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||      
T  30780474 attcgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaaat 30780375  T
Q  176 gaaaagtagaaaac 189  Q
     |||||||||||||    
T  30780374 caaaagtagaaaac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Original strand, 25860270 - 25860371
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25860270 aaaaccacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 25860365  T
Q  187 aacaac 192  Q
    ||||||    
T  25860366 aacaac 25860371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332688
Alignment:
Q  347 taattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2232658 - 2232597
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232658 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 2401342 - 2401400
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2401342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14353282 - 14353047
Alignment:
Q  185 aaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatc 283  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||| || |||||||||| |  || |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||  || || || ||    
T  14353282 aaaacaacgagagagaa--gaagaaaaaacataagagaatttgtttataca-ttcggtccattactgacatactttgggggagagagtggctcttcgttc 14353186  T
Q  284 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaac 381  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||    |||| ||||||||| |||| || ||   ||||||||||||||||||| | |  ||||   ||| ||    
T  14353185 cactataatgatgaataactttacaaaagatt--tcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgac 14353089  T
Q  382 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353088 caagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43104400 - 43104245
Alignment:
Q  266 gagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa-aaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagt 362  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||   ||||||||||||||||||    
T  43104400 gagagcatctctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagt 43104301  T
Q  363 cccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 418  Q
      ||   ||| |  || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43104300 ttcaatgtcttcctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598466
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 13598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16124609 - 16124545
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16124609 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 16124545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069838
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703965
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51752789 - 51752715
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaatt 163  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51752789 aaaatcacaccaataataa-ctt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatt 51752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9521776 - 9521718
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9521776 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 314
Target Start/End: Original strand, 13127669 - 13127779
Alignment:
Q  205 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg 302  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||     
T  13127669 aagagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaact 13127767  T
Q  303 ttacaaaagaga 314  Q
    ||||||||||||    
T  13127768 ttacaaaagaga 13127779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072995
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19072995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120885
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19120885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 422
Target Start/End: Original strand, 26332714 - 26332761
Alignment:
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332714 tcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098854
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 47098854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21536662 - 21536597
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21536662 ttgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactata 21536597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 289
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651879
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476329
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644930
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26644930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102871
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccacta 47102871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 49959172 - 49959129
Alignment:
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49959172 accaagagactcattcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 404
Target Start/End: Original strand, 2393404 - 2393461
Alignment:
Q  346 ctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2393404 ctaattctacccaa-gtcccagactattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 286
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281773
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccac 3281773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10116184 - 10116125
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaa 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  10116184 aaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--attaatcaaataaccaaaacaa 10116125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2232774 - 2232710
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccac 286  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2232774 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccac 2232710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156989
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 3156989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9526650 - 9526582
Alignment:
Q  223 atttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9526650 atttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 9526582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13604716 - 13604652
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13604716 ttgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 13604652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Original strand, 26519305 - 26519373
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaa 158  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  26519305 aaaatcacaccaataaaatactt--tgtgtggagcaagtaataatcaagcaacc-aaacaaagtgtatggaa 26519373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27104465 - 27104401
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||  | || || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27104465 ttgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223465
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 28223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 49918518 - 49918474
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  49918518 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 49918474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 79623 - 79229
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  79623 attcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaagcc 79524  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79523 aaaagtagaaaacaacagcaagagaaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 79424  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  79423 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttc 79324  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79323 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 79229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 69149 - 69535
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||   ||||||| | |||| ||||||||||    
T  69149 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaag--ttataaatacaagccaaaagtagaa 69246  T
Q  187 aacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  69247 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 69346  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  69347 gatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgta 69445  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69446 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 69535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 468
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73267
Alignment:
Q  409 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 73267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 436
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73198
Alignment:
Q  398 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 73198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 41341 - 41727
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  41341 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 41437  T
Q  187 aacaacg------agagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctcc 279  Q
    |||||||      |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  41438 aacaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctcc 41537  T
Q  280 gatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgta 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  41538 gattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgta 41637  T
Q  380 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41638 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 41727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11717
Alignment:
Q  78 attccatgaaaa-atcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaaca--aagtatatggaacaattataaacataag 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||| |  |||| |||||||||||||||| || |||    
T  11322 attcgatgaaaatatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaattataatcacaag 11420  T
Q  175 cgaaaagtagaaaacaac-gagagagaaag-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagca 272  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11421 ccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11520  T
Q  273 gccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct 372  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11521 gctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctct 11620  T
Q  373 cctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11621 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaac 11717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 52448 - 52055
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  52448 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 52349  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaag-gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag--cag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  52348 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 52251  T
Q  274 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctc 373  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||     
T  52250 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctctt 52151  T
Q  374 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52150 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaac 52055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 183490 - 183884
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||  ||| |    
T  183490 attcgatgagaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaattaaataca--agcca 183586  T
Q  178 aaagtagaaaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  183587 aaagtagaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagag 183686  T
Q  271 cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 370  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  183687 cagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatct 183786  T
Q  371 ctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183787 cttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 183884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50449 - 50235
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |    
T  50449 attcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcca 50350  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagag-aaaggaagag-agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggg--gagagagcag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  50349 aaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 50252  T
Q  274 ccctccgatccactata 290  Q
    ||||||| | |||||||    
T  50251 ccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 445
Target Start/End: Original strand, 1303 - 1673
Alignment:
Q  80 tccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||  ||| |||    
T  1303 tccataaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaattaaataca--agccaaa 1399  T
Q  180 agtagaaaa-caacga-gaga-ga----aaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagc 271  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1400 agtagaaaaacaacggcgagaagatcacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagc 1499  T
Q  272 agccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1500 agccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctc 1598  T
Q  372 tcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttcc 445  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1599 ttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 92 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4041
Alignment:
Q  92 cacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaaaacaa 191  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  4415 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 4316  T
Q  192 cgagagagaaaggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  4315 cgagaga--aatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactata 4219  T
Q  291 tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4218 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagact 4119  T
Q  391 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4118 caatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaac 4041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 80297 - 79903
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  80297 attcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaacacaagcc 80198  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaa-ggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagc 274  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  80197 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 80098  T
Q  275 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||| |    
T  80097 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaa-tctacccaaagccccaatctcttc 79999  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct-aggtttgtt-ccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79998 ccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaac 79903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29600 - 29215
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||||||    
T  29600 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta--aataaaagccaaaagtagaa 29504  T
Q  187 aacaacgagagagaa-------aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||| |||||||       |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29503 aacaacg-gagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 29405  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  29404 cgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgt 29306  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29305 aaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 29215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 85665 - 85274
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  85665 attcgatgaaaaatcacaccaataacaatcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtc 85566  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |     
T  85565 aaaagtagaaaacaacgagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtca 85468  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcct 375  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||  |||| ||    
T  85467 tccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttct 85368  T
Q  376 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  85367 cgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaac 85274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6243
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||| |||   ||| | ||||     
T  6638 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataat---aaatacaagcc 6543  T
Q  177 aaaagtagaaaacaacga-gagag----aaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||  ||||     ||| |||||   ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  6542 aaaagtagaaaacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaga 6443  T
Q  270 gcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcc 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6442 gcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatc 6344  T
Q  370 tctcctcgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 467  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6343 tcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3309 - 2924
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataag-cgaaaagtaga 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||   ||||||| | ||| | |||||||||    
T  3309 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaag--ttataaatacaagtcaaaaagtaga 3214  T
Q  186 aaacaacga-gaga-gaa----aggaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctc 278  Q
    ||||||||  |||| |||    | ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  3213 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctc 3114  T
Q  279 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgt 378  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |    
T  3113 caatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccat 3015  T
Q  379 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3014 aaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaac 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 88 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 85
Alignment:
Q  88 aaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  455 aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 359  T
Q  187 aa-caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    || ||||| | |||||         |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  358 aaacaacg-gcgagaa---------gaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T
Q  286 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaag 385  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||    
T  268 ctatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaag 170  T
Q  386 agact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  169 agactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaac 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 256 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2298 - 2086
Alignment:
Q  256 gtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctac 355  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2298 gttttggggagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctac 2199  T
Q  356 ccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctaggtttgttccaaagagacaa 455  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  2198 ccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagttttattccgaagagacaa 2099  T
Q  456 actctatacaaac 468  Q
    ||||| |||||||    
T  2098 actctgtacaaac 2086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 424
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1842
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  1509 aaaatcacaccaataa-atatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaag--ttataaacacaagccaaaagtagaa 1604  T
Q  187 aacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcca 285  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  1605 aacaatgagaga-aaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttcca 1702  T
Q  286 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaa 384  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||    
T  1703 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaa 1802  T
Q  385 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1803 gaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatcaacc 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22221
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 22320  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22319 agagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24496
Alignment:
Q  210 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aa 24595  T
Q  310 agagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 408  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24594 agagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8448
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22549 - 22491
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22549 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 22491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24824 - 24766
Alignment:
Q  85 gaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  24824 gaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 24766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 424
Target Start/End: Original strand, 15775 - 16021
Alignment:
Q  177 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||| |    
T  15775 aaaagtagaaaacaacgggaga--aagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 15871  T
Q  276 ctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  15872 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 15971  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15972 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16892
Alignment:
Q  86 aaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtaga 185  Q
    |||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||   ||||||| | |||| |||| ||||    
T  16516 aaaaattataccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaa-caaagtgcatggaag--ttataaatacaagcaaaaa-taga 16611  T
Q  186 aaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatcc 284  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||  | ||||  |  ||    
T  16612 aaacaacgagaga-aaagaaagagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtccc 16709  T
Q  285 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaacca 383  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||| | ||| ||||    
T  16710 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcacca 16809  T
Q  384 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  16810 agtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaac 16892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36031 - 35817
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaa-caaagtatatggaacaattataaacataagcg 176  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||     
T  36031 attcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcc 35932  T
Q  177 aaaagtagaaaacaac-gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagcc 275  Q
    |||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||    
T  35931 aaaactcgaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagcc 35832  T
Q  276 ctccgatccactata 290  Q
    ||||| |||||||||    
T  35831 ctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 333 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35683
Alignment:
Q  333 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  433 ctag-gtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaac 35683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5239 - 4901
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||| ||||||||| |||| |||  ||||| ||||||    ||||||||  |||| |    
T  5239 attcaatgaaaaatcacaccattaaaatacttgatgtatcaaacaagtaataatcaagcaacaaaataaaagtgtatggacg--ttataaacgcaagcca 5142  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaa-attgacatagtttgggggagagagcagccc 276  Q
    |||||| |||||| ||||||   ||| ||||||||||||||     ||| || ||||| |||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||  |    
T  5141 aaagta-aaaacagcgagagg--aagaaagagagaacacaat----tttttttacccaattcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttc 5049  T
Q  277 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctcc 374  Q
    |  | ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  |||| |    
T  5048 tatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttc 4949  T
Q  375 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 422  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4948 tcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaa 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1483
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |    
T  1300 attcgatgaaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaat--taaatacaagcca 1396  T
Q  178 aaagtagaaaacaacgagagaga-------aaggaag-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagt 257  Q
    |||||||||||||||| | ||||       || |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1397 aaagtagaaaacaacg-gcgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 4535 - 4733
Alignment:
Q  87 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcgaaaagtagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||  ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  4535 aaaatcacaccaataacaat-ttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaattaaataca--agccaaaagtagaa 4631  T
Q  187 aacaa---cgagag----agaaaggaagag--agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccct 277  Q
    |||||   |||||     | ||| |||||   | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4632 aacaatggcgagaagaacaaaaaagaagaagaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 4731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 12723 - 12835
Alignment:
Q  78 attccatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacataagcga 177  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||| | |||| |    
T  12723 attcgatgaaaaatgacaccaataacaa-cttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagcca 12819  T
Q  178 aaagtagaaaacaacg 193  Q
    |||||||| |||||||    
T  12820 aaagtagacaacaacg 12835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5751
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2560
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2496 ttgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactat 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 133373 - 133309
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  133373 ttgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16386 - 16328
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16386 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Original strand, 16980 - 17052
Alignment:
Q  219 aagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16980 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 17107 - 17165
Alignment:
Q  345 cctaattctacccaaagtcccagcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 404  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17107 cctaattctacccaa-gtcctagcttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Original strand, 10736 - 10796
Alignment:
Q  228 ttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccacta 288  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10736 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccacta 10796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Original strand, 3039 - 3136
Alignment:
Q  193 gagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata 290  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3039 gagagagagagggagaaagaacacaagata-tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 407
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  249 tgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtc-tcccgcc 346  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || ||   ||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagatcttcaaacc 57551  T
Q  347 taattctacccaaagtccc-agcctctcctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 407  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||| |   | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57552 taattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 43990
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactat 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 9
Alignment:
Q  83 atgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaag 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49 atgaaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtggagcaag 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 289
Target Start/End: Original strand, 45257 - 45321
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 289  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45257 ttgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 45321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  225 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtttgggggagaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University