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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF20384_high_37 (Length: 512)
Name: NF20384_high_37
Description: NF20384
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20384_high_37 |
 |  |
|
| [»] scaffold0440 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0208 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0363 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0064 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1114 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0185 (3 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0236 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0085 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0449 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1064 (1 HSPs) |
 |  |  |
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 38152531 - 38152039
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
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| T |
38152531 |
ttttattctttattatatttcaatatcatt-atc-ggacaaatattgtaacaataattatattaattatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
38152434 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
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| T |
38152433 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgaactcaatga-----tgtccggatgacccat |
38152339 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
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| T |
38152338 |
taacggaataatgggaaacc-taatgaccatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtacacgacaaactcgttcttctccccatctaaag |
38152240 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgtt |
398 |
Q |
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| T |
38152239 |
aaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaagaaccaaattagctgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcattgttgtt |
38152140 |
T |
 |
| Q |
399 |
gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgtttaata |
498 |
Q |
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| T |
38152139 |
gagaggattgtcatcaaagtttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgttcaata |
38152040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 34739571 - 34740066
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
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| T |
34739571 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgagggccttagttgattagtga |
34739669 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
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| T |
34739670 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
34739769 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
| |
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||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |
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| T |
34739770 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctgtggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctcccaatctgaag |
34739869 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
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|
| T |
34739870 |
agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcattttctctctttggttatcgtt |
34739968 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34739969 |
gttgatgagagggctgccttgaaaggtttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
34740066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 31051129 - 31051617
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
31051129 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
31051227 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
31051228 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
31051327 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
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| T |
31051328 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa |
31051427 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
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| T |
31051428 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt |
31051526 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
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||||| ||| |||| ||| | |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31051527 |
tgttgatgaaagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
31051617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 31057629 - 31058124
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31057629 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
31057727 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31057728 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat |
31057827 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
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||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |
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| T |
31057828 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccatacaatataaaagaggctatgatccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa |
31057927 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |
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|
| T |
31057928 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgt |
31058026 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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||||| |||||||| ||| | |||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31058027 |
tgttgatgagagggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
31058124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8093375 - 8092925
Alignment:
| Q |
47 |
gtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8093375 |
gtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattaataatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaat |
8093276 |
T |
 |
| Q |
147 |
taaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagagg |
245 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
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| T |
8093275 |
taaatgtttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaacgatcatcaaatataaaagagg |
8093176 |
T |
 |
| Q |
246 |
ctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagt |
344 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
8093175 |
ctatggtccccaatataccgaacacggcaaactctcttttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc |
8093076 |
T |
 |
| Q |
345 |
tgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaat |
438 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| || |
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| T |
8093075 |
cgccgctaaccta-gttgtttgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagaggactgctacaaaagctttatccaggtattcctcat |
8092977 |
T |
 |
| Q |
439 |
accctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
8092976 |
acccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcat |
8092925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25382111 - 25381614
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
25382111 |
ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg |
25382013 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
25382012 |
atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg |
25381917 |
T |
 |
| Q |
195 |
cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
25381916 |
cccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat |
25381817 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25381816 |
ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt |
25381718 |
T |
 |
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
25381717 |
atcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatttcgtagatccga |
25381618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25388057 - 25387583
Alignment:
| Q |
21 |
caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25388057 |
caatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattatttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct |
25387959 |
T |
 |
| Q |
121 |
a-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaa |
217 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||| ||| ||| |
|
|
| T |
25387958 |
aattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaa |
25387863 |
T |
 |
| Q |
218 |
ccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25387862 |
ccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa |
25387763 |
T |
 |
| Q |
316 |
tgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgc |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25387762 |
ggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgt |
25387664 |
T |
 |
| Q |
410 |
catcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25387663 |
ttttaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
25387583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 483
Target Start/End: Original strand, 44409593 - 44410083
Alignment:
| Q |
9 |
tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
44409593 |
tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgattaaatta |
44409691 |
T |
 |
| Q |
109 |
agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
44409692 |
ggtaataaggctattaggtttctaattggataattaattaaatatttaattagttaatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaa |
44409791 |
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305 |
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44409792 |
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44409891 |
T |
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389 |
Q |
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44409991 |
T |
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483 |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 50305781 - 50306262
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Q |
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194 |
Q |
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293 |
Q |
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| T |
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387 |
Q |
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388 |
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483 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 1077828 - 1078304
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Q |
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T |
 |
| Q |
100 |
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194 |
Q |
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| T |
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1078022 |
T |
 |
| Q |
195 |
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292 |
Q |
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| T |
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1078122 |
T |
 |
| Q |
293 |
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392 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24927293 - 24926840
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 |
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241 |
Q |
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| T |
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24927095 |
T |
 |
| Q |
242 |
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340 |
Q |
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| T |
24927094 |
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T |
 |
| Q |
341 |
cagttgccgctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcagg |
428 |
Q |
| |
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| T |
24926994 |
cagctgccactaaccgtgttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctctttatcgttgttgtcgagagtgctgccaccaaagcttcatcttcagg |
24926895 |
T |
 |
| Q |
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483 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattcctaatacgttaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24964229 - 24963788
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Q |
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T |
 |
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250 |
Q |
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|| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |
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| T |
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T |
 |
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349 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
350 |
ctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaa |
437 |
Q |
| |
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| T |
24963933 |
ctaaccgtgttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctctttatcgttgttgtcgagagggctaccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaa |
24963834 |
T |
 |
| Q |
438 |
taccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
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tactttaattcttactattcttgataaatcaaacatggcgtagatc |
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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
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Target Start/End: Original strand, 27954798 - 27955123
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Q |
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taattatattagttatttatcaattgtgaggcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaatttgataattaattaaatat |
27954897 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatg |
250 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | ||||| | |||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||| | |||| |
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| T |
27954898 |
ttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtatggatggctcattagtggaataatgggaaatcataatggtcatccaatataaaagatgttatg |
27954997 |
T |
 |
| Q |
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gt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgcc |
348 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| ||| || | ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | | |
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|
| T |
27954998 |
atccccaatacac---acacgacaatacattctcttctccccatct-gagagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaataactaaatcagtcgtc |
27955093 |
T |
 |
| Q |
349 |
gctaac-gtatgttgtgtatttcagatcat |
377 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||| ||||||||||| |
|
|
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gttaacattttgttgtgtgtttcagatcat |
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Q |
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|||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |
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ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg |
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T |
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Q |
| |
|
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|
| T |
25275523 |
atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatga |
25275428 |
T |
 |
| Q |
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201 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
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cccatta |
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Target: chr1; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33458434 - 33458326
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Q |
| |
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|||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |
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33458434 |
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33458335 |
T |
 |
| Q |
152 |
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160 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
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atttaatta |
33458326 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 52 - 141
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aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataa |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
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4280254 |
aataattatattaactatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagattattagatatctaatttgataa |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||| || ||||||| |||| || ||| |
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attagatttctatttggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtagatgtccggatggccaattaacggaataatgagaaa |
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T |
 |
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Q |
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ccctaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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|
|
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12183738 |
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12183670 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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78 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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Q |
| |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 5849116 - 5849598
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Q |
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| T |
5849116 |
ttttattatt-attatattctaatatcatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtga |
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T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
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398 |
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5849513 |
T |
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483 |
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| T |
5849514 |
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5849598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3817885 - 3817390
Alignment:
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T |
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199 |
Q |
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3817687 |
T |
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200 |
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298 |
Q |
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T |
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392 |
Q |
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| T |
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490 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3811745 - 3811248
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
198 |
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296 |
Q |
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390 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 351372 - 351866
Alignment:
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T |
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199 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
200 |
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298 |
Q |
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| T |
351571 |
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351670 |
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| Q |
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393 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28421534 - 28421038
Alignment:
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T |
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Q |
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| T |
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28421340 |
T |
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| Q |
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293 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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387 |
Q |
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| T |
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28421141 |
T |
 |
| Q |
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487 |
Q |
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| T |
28421140 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35148584 - 35148083
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
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198 |
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| T |
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T |
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199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
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| T |
35148385 |
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T |
 |
| Q |
298 |
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388 |
Q |
| |
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| T |
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35148186 |
T |
 |
| Q |
389 |
cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat |
487 |
Q |
| |
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| T |
35148185 |
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35148086 |
T |
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| Q |
488 |
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490 |
Q |
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||| |
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| T |
35148085 |
cat |
35148083 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 338966 - 339451
Alignment:
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|
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ttttattatttcttatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttgattagtga |
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T |
 |
| Q |
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tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
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Q |
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| T |
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tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
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T |
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| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
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| T |
339165 |
tactggaataatgggaaa-cctaatggccatccaatataaaagaggtcatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaag |
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T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
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| T |
339264 |
agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcatt |
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T |
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gttgttga-gagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
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gttgttgatgag----------agagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 26383252 - 26383569
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 |
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gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagt-tatatggactcaatgagtggatatctggatgaccc |
197 |
Q |
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26383351 |
gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaatgaatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc |
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T |
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attaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaa |
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Q |
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| T |
26383451 |
attaatggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccctaatacaccggacacggcaaactctctcttctccctatttga |
26383550 |
T |
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297 |
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315 |
Q |
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| T |
26383551 |
agagaacttgaggcataaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22742504 - 22742004
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22742504 |
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tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
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taaaattaagtaataaggctattagatttctaattagataattaattaaatatataagtagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
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T |
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200 |
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297 |
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387 |
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22742106 |
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486 |
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490 |
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|||| |
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22742007 |
tcat |
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Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 35153103 - 35152849
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Q |
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199 |
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35153004 |
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35152905 |
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255 |
Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
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Target Start/End: Complemental strand, 5979752 - 5979260
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Q |
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193 |
Q |
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290 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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385 |
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T |
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Target: chr7; HSP #12
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Q |
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| Q |
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258 |
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 |
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| Q |
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458 |
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196 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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292 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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| T |
43539858 |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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20238961 |
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Q |
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Q |
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gtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatg |
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T |
 |
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 |
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| T |
15843929 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Q |
| |
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taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa |
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T |
 |
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gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
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| T |
15860939 |
gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggttattgt |
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T |
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| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctta |
451 |
Q |
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tgttgattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta |
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| |
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T |
 |
| Q |
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aaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa |
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Q |
| |
|
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|
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42767561 |
aaccctaatggccat---atataaaagaggctatggtcccgaatataccgtacacggcaa |
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| |
|
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cccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccgcta |
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T |
 |
| Q |
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377 |
Q |
| |
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| | ||| |||||| ||||||||||| |
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|
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accatattttgtgtgtttcagatcat |
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| |
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
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493 |
Q |
| |
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gttcatgtt |
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| |
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|||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |
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atcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaatatgtcgtagatccga |
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 |
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tcat |
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Q |
| |
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|||| |
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Target: chr7; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18657132 - 18656884
Alignment:
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93 |
attagcgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatat-ttaattagttatatggactcaatgagtggatatctgg |
190 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |
|
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| T |
18657132 |
attagtgatcacattaagtaataaggctaattagatttttatttggataattaattatttaaattaatta---atatggactctatgagtggatgtctgg |
18657036 |
T |
 |
| Q |
191 |
atgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatc-caatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctcc |
288 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||| || | | |||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
18657035 |
atgacccattaatacaataatggtaaatcctaat-ggcatcacactgt--aagaggctattgtctccaatgcaccatacacgacaaactttctcttctct |
18656939 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag |
343 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18656938 |
ccgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcag |
18656884 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Original strand, 7608146 - 7608276
Alignment:
| Q |
137 |
gataattaattaaatattt-aattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaa |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7608146 |
gataattaattaaatattttaattagttgatatggggttaatgagtggatgtccggatgacccattaatgaaataatgaaaaaccctaatgaccatccaa |
7608245 |
T |
 |
| Q |
235 |
tataaaagaggctatggt-cccaatacaccg |
264 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7608246 |
tataaaagatgttatggtccccaatacaccg |
7608276 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18666972 - 18666881
Alignment:
| Q |
90 |
ttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggata---attaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatg |
177 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18666972 |
ttgataagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgtatagttattaattaaatttttaattagttgatatggactcaatg |
18666881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 30219428 - 30219332
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30219428 |
atcgttgatgctgagatggttgtcatgaaagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtcgtagatc |
30219332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Original strand, 8824446 - 8824542
Alignment:
| Q |
52 |
aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaa |
149 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8824446 |
aataattatattagctatttatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaattaggtaataaggatattagatttct-tttagataattaattaa |
8824542 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30219598 - 30219501
Alignment:
| Q |
53 |
ataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
30219598 |
ataataatagtagttatttattaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataaagttattagatttctaattagatagttaattaaa |
30219501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 386
Target Start/End: Original strand, 3677906 - 3677995
Alignment:
| Q |
296 |
aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc |
386 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
3677906 |
aagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaac-tatgtcgtgtatttcaaatcacagtttctcc |
3677995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 153
Target Start/End: Original strand, 24689729 - 24689772
Alignment:
| Q |
110 |
gtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatat |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24689729 |
gtaataaggctattagatttttaatttgataattaattaaatat |
24689772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 7608324 - 7608381
Alignment:
| Q |
296 |
aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7608324 |
aagagaacttgagtcataaaggtaccgatttaggaagtaccaaatcagtcgccgctaa |
7608381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18666676 - 18666575
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18666676 |
atcgttgttggtgagagggttgtcatcagagcttcatgtgtgtattcctaatgtc-taattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgta-atctga |
18666579 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18666578 |
tcat |
18666575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 354
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12803938
Alignment:
| Q |
309 |
gcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
12803893 |
gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaac |
12803938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10761225 - 10760729
Alignment:
| Q |
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ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10761225 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtga |
10761127 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10761126 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
10761027 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10761026 |
taacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa |
10760927 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10760926 |
gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt |
10760828 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10760827 |
tgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
10760729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38456125 - 38455629
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
38456125 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtgttagttgattagtga |
38456027 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
38456026 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat |
38455927 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
38455926 |
taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa |
38455827 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
38455826 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt |
38455728 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38455727 |
tgttgatgagagggctgcctcgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcat |
38455629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 8331372 - 8331867
Alignment:
| Q |
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ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
8331372 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtggaccttagttgattagtga |
8331470 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
8331471 |
tcaaattaagtaataaggatataagatttctaattggataattaattaaatatttaatcagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat |
8331570 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
| |
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|
| T |
8331571 |
taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag |
8331670 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8331671 |
agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgtt |
8331769 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8331770 |
gttgacgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
8331867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 49151197 - 49151692
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
49151197 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
49151295 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
49151296 |
tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
49151395 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
| |
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| T |
49151396 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaag |
49151495 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
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| T |
49151496 |
agaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt |
49151594 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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| T |
49151595 |
gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
49151692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 49157264 - 49157759
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49157264 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
49157362 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
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|
| T |
49157363 |
tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
49157462 |
T |
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200 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38449638 - 38449142
Alignment:
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30051675 - 30051184
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10769544 - 10769167
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11840301 - 11839804
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10238788 - 10238291
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10244910 - 10244413
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42197738 - 42197241
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386 |
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42197345 |
T |
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387 |
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486 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17056367 - 17055872
Alignment:
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Q |
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T |
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194 |
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293 |
Q |
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387 |
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487 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 490
Target Start/End: Original strand, 28964468 - 28964948
Alignment:
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4 |
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Q |
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T |
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202 |
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28964666 |
T |
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301 |
Q |
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| T |
28964667 |
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28964766 |
T |
 |
| Q |
302 |
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398 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
399 |
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490 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 55003977 - 55003491
Alignment:
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Q |
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Q |
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T |
 |
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cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc |
293 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
294 |
taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca |
387 |
Q |
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Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26429964 - 26429639
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
225 |
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322 |
Q |
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T |
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323 |
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352 |
Q |
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26429668 |
gttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta |
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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23138991 - 23138783
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Q |
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T |
 |
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199 |
Q |
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23138793 |
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| Q |
200 |
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209 |
Q |
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taacggaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 490
Target Start/End: Original strand, 46656341 - 46656764
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T |
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275 |
Q |
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T |
 |
| Q |
276 |
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374 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
375 |
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460 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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ataaatcaaacatatcgtagatccgatcat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48128451 - 48128126
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Q |
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||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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|
| T |
48128451 |
atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatatac |
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T |
 |
| Q |
263 |
cgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg |
362 |
Q |
| |
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| T |
48128351 |
cgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaacat-tgttg |
48128253 |
T |
 |
| Q |
363 |
tgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcc-taataccctaattcttaatatgttt |
459 |
Q |
| |
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| | || ||||||| | ||| | | ||||||||| ||| |||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
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| T |
48128252 |
tttgttccagatcacctcatttttttaccgttgttgt---gagagctgccatgaaagtttta-tcaggtattccaaaataccctaattcttaatattctt |
48128157 |
T |
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| Q |
460 |
gataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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| T |
48128156 |
aataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53071789 - 53071638
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Q |
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caaatatcataacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgga |
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T |
 |
| Q |
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taattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctg |
189 |
Q |
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| T |
53071689 |
taattaattgaatatttaattagttgatatgaactcaatgagtggatgtctg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11846552 - 11846343
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100 |
Q |
| |
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ttttattatttaataatattccatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatggattagtga |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
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| T |
11846453 |
tcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatattgagtcaatgagtggatgtccggatggccca |
11846354 |
T |
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| Q |
199 |
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209 |
Q |
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| T |
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ttaacggaata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
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ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
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| |
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 |
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atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 40 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12109203 - 12108754
Alignment:
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40 |
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139 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||||||| ||| |
|
|
| T |
12109203 |
aaatatcgtaataataattgtattagttatttatcaattgtgatctttaattgattagtgataaaattaagtgataatgttataag-tttctaattagat |
12109105 |
T |
 |
| Q |
140 |
aattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaata |
236 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| | |||||| |||| || ||| ||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
12109104 |
aattgattaaacatttgattaattgatatggactcaatatgagttgatgtctagatgactcgttaacggaataatgagaaataacaatggtcattcaata |
12109005 |
T |
 |
| Q |
237 |
taaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac |
335 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
12109004 |
taaaagagagtacggtcctcaatacatcgtacacggcaaactatcttttcttccgatct-----gaacttgaggcataaaggtaccggttaaagaagaac |
12108910 |
T |
 |
| Q |
336 |
caaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca--tggtttctcc-------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattca |
426 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| | | ||||| | |||| |||| ||| || || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
12108909 |
caaatcagtcgccgctaacctatgttgtgtgtttcatatcacctcatctctccgtttcagaccgttcatgttcagaaggttgtcattagagcttcattca |
12108810 |
T |
 |
| Q |
427 |
ggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12108809 |
ggtattcttaata-cctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgtcttagatc |
12108754 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2982802 - 2982458
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | | || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
2982802 |
ttttattatttaattatatttcgatatcatt-atgcgaacaaatattgtaataataattatataatctatttatcaatagcgagccttatttgattagtg |
2982704 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaat--gagtggatatctggatgac |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || || ||||||| |
|
|
| T |
2982703 |
atcaaattaaataataaagatatttagatttctaattgaaaaattaattaaatatttaattagttgatataaactcaatacgagtatatgtcaggatgac |
2982604 |
T |
 |
| Q |
196 |
ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtct |
294 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
2982603 |
ccattaaaagaataat-gaaaatcctaatgaccaacaaatataaaagaggtcatggtcccaaatataccatatacggcgaactctcttttctccctatct |
2982505 |
T |
 |
| Q |
295 |
aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatc |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2982504 |
gaagagaacttaagacataaagatacttattgaagaagaaccaaatc |
2982458 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 13444840 - 13445141
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199 |
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296 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | | | ||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
13444840 |
ttaacgaaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaataggttatggtccccaatacaccgtacacaacgatattctctcttctccccatctga |
13444939 |
T |
 |
| Q |
297 |
agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc---------a |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13444940 |
agagaacttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaaccc-tgttttgtggttcagatcatcacatctcctctttgttta |
13445038 |
T |
 |
| Q |
388 |
tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat |
487 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |||| ||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13445039 |
tggttgttactgagagagctgtcatgaatgttttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat |
13445138 |
T |
 |
| Q |
488 |
cat |
490 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13445139 |
cat |
13445141 |
T |
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Target: chr3; HSP #27
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98 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
8474711 |
ttttattatttaattatatttcgatatcatt-atgtgaacaaatatcgtaataataattatattaacttttaatcaattgtgggcctttaattgattagt |
8474613 |
T |
 |
| Q |
99 |
gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatta |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8474612 |
gatcaaattaagtaataatgttattagatttataattcaataattaattaaatatttaatta |
8474551 |
T |
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Target: chr3; HSP #28
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390 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
11846340 |
gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcg |
11846242 |
T |
 |
| Q |
391 |
ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11846241 |
ttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
11846142 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 34300022 - 34300181
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| Q |
1 |
ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
34300022 |
ttttattattttattatttttcgatatcatt-acgtgggcaaacatcataataataattatattaactatttatcaattgtgagaattaattgattagta |
34300120 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatta |
160 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34300121 |
attgaattaagtaataagactattaaatttttaattggataattaattaaatatttaatta |
34300181 |
T |
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Target: chr3; HSP #30
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390 |
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489 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34300477 |
gttgctgttgagagggttgccatgaaagcttaattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctttataaatcaaatatgtcgtagatccgatca |
34300576 |
T |
 |
| Q |
490 |
t |
490 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
34300577 |
t |
34300577 |
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486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17593464 |
atcgttgttgatgagagggctgcctcgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaaacatgtcgtagatccga |
17593365 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17593364 |
tcat |
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Target: chr3; HSP #32
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149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17602058 |
aataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtggtcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat--- |
17601962 |
T |
 |
| Q |
150 |
atatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccat |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17601961 |
-tatttaattagttgatatggactcaacatgattggatgtccgaatgacccattaacggaataatgacaaaccctaatggccat |
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T |
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agggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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Q |
| |
|
||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10767038 |
agggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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T |
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285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
53069437 |
ggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatgatcgtccaatataaaaaagaggctatggtcctcaatacaccgtacatggcaaactctctcttc |
53069338 |
T |
 |
| Q |
286 |
tccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat---ggtt |
381 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
53069337 |
tccccatctgaagagaact----------aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacacct |
53069248 |
T |
 |
| Q |
382 |
tctc--catcgttgttgttg---agagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt |
475 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||||||| ||| | || |||| |||| || || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53069247 |
tctcatctttgttgttgttgttaagatgactaccatgaaagttttatccaggtattcttaatacccctgattcttaatatccttgataaatcaaacatgt |
53069148 |
T |
 |
| Q |
476 |
cgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| |
|
|
| T |
53069147 |
catagatccgatcat |
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Target: chr3; HSP #35
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9 |
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97 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
9586579 |
tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattag |
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T |
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354 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac |
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T |
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ccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |
|
|
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24643878 |
ccatccaatataaaagaggctatggccccaatacaccgt--acgacaaactctctcttctccc |
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T |
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gtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtaca |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13367233 |
gtggatgtctggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatat-aaagaggctatggtccccaatataccgtaca |
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T |
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gatcaaattaagtaataaggctatta-gatttctaattggataattaattaaatatttaatta |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27103343 |
gatcaaataaagtaataagacaattaagattttaaattggataattaattaaatatttaatta |
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T |
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354 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34300371 |
aagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaac |
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T |
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ccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaac |
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Q |
| |
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|
|
| T |
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ccatacaatataaaagaggctctggtcccaaatataccgtacacggcaaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 34)
Name: chr4
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Target: chr4; HSP #1
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ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
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Q |
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Target: chr4; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 48160544 - 48161039
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Target: chr4; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6257771 - 6257284
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Target Start/End: Complemental strand, 10739903 - 10739418
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Target Start/End: Complemental strand, 10953672 - 10953187
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490 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 24287571 - 24288059
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taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca |
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388 |
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482 |
Q |
| |
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| T |
24287965 |
tcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagat |
24288059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26972129 - 26971824
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
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|
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| T |
26972129 |
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26972031 |
T |
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| Q |
101 |
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199 |
Q |
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| T |
26972030 |
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26971931 |
T |
 |
| Q |
200 |
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297 |
Q |
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| T |
26971930 |
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26971832 |
T |
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| Q |
298 |
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305 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26971831 |
gagaactt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 479
Target Start/End: Original strand, 50168218 - 50168662
Alignment:
| Q |
40 |
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139 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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238 |
Q |
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| T |
50168318 |
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50168417 |
T |
 |
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239 |
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337 |
Q |
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| T |
50168418 |
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T |
 |
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432 |
Q |
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| T |
50168517 |
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50168616 |
T |
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| Q |
433 |
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479 |
Q |
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| T |
50168617 |
ccttata-cctaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgta |
50168662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44832152 - 44831699
Alignment:
| Q |
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138 |
Q |
| |
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caaatattgtaacaataattatattagttatttatcaattatagatcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggttataagatttttaattaga |
44832053 |
T |
 |
| Q |
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237 |
Q |
| |
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| T |
44832052 |
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44831953 |
T |
 |
| Q |
238 |
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336 |
Q |
| |
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| T |
44831952 |
aaaagaggctatggtccccaatataccgaacac----aactctctcttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgaggaagaacc |
44831857 |
T |
 |
| Q |
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424 |
Q |
| |
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| ||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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482 |
Q |
| |
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| T |
44831756 |
taggtattcttaataccctagttcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagat |
44831699 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33458662 - 33458346
Alignment:
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278 |
Q |
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T |
 |
| Q |
279 |
tttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatg |
378 |
Q |
| |
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| T |
33458562 |
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T |
 |
| Q |
379 |
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472 |
Q |
| |
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| T |
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tcatctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctaagaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaaca |
33458364 |
T |
 |
| Q |
473 |
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490 |
Q |
| |
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33458363 |
tgtcgtagatccgatcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17627350 - 17627019
Alignment:
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Q |
| |
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17627350 |
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17627252 |
T |
 |
| Q |
100 |
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198 |
Q |
| |
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| T |
17627251 |
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17627152 |
T |
 |
| Q |
199 |
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297 |
Q |
| |
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| T |
17627151 |
ttaacggaataattgaaaaccctaatggttgttaaatataaaagaggccatgatccccaatacacagtacac-----acattctcttctccccatctgaa |
17627057 |
T |
 |
| Q |
298 |
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335 |
Q |
| |
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| T |
17627056 |
gagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaagaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33461787 - 33461483
Alignment:
| Q |
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278 |
Q |
| |
|
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|
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33461787 |
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33461688 |
T |
 |
| Q |
279 |
tttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatg |
378 |
Q |
| |
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| T |
33461687 |
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T |
 |
| Q |
379 |
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472 |
Q |
| |
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| T |
33461588 |
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33461490 |
T |
 |
| Q |
473 |
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479 |
Q |
| |
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| T |
33461489 |
tgtcgta |
33461483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 377
Target Start/End: Original strand, 35177413 - 35177760
Alignment:
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Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
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T |
 |
| Q |
136 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
35177513 |
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35177612 |
T |
 |
| Q |
233 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
35177613 |
aatataaaagaggttatagtcctcaatacaccgtacacaacaataaatc-atggtctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgaga |
35177711 |
T |
 |
| Q |
330 |
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377 |
Q |
| |
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|| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35177712 |
aataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttcagatcat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 490
Target Start/End: Original strand, 49976236 - 49976667
Alignment:
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aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa |
150 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttttgtttagaatattaattaat |
49976335 |
T |
 |
| Q |
151 |
tatttaattagttatatggactcaat--gagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggcta |
248 |
Q |
| |
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| T |
49976336 |
taattaatgg---atatggattcaatatgggtggatgtctggatgac--------gtaataatggaaaaccctaatggccatccaatataaaagaggtta |
49976424 |
T |
 |
| Q |
249 |
tggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgcc |
348 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
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tggtc----tccaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa-gtacc-gttgaggaagaaccaaatcagccgcc |
49976518 |
T |
 |
| Q |
349 |
gctaa--cgtatgttgtgtatttcagatcat---------ggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaa |
437 |
Q |
| |
|
||||| | ||| |||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
49976519 |
gctaacccttattttgtgtgtttgagatcatcacctcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggagtgttatcaaagcttca-tctggtattcctaa |
49976617 |
T |
 |
| Q |
438 |
taccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
49976618 |
tactctaa---ttattatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
49976667 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19686833 - 19686414
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160 |
Q |
| |
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| T |
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attagctatttatcgattgtgtgtcttaattgattagtgatcaaattaaataataagactgttaaatttataataaaataattaattgaatatttaatta |
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T |
 |
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gtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaata |
259 |
Q |
| |
|
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| T |
19686733 |
attgatatgaactcaagcagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatgagaaaccctactgaccatccaatataaaagagactatagtctcaata |
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T |
 |
| Q |
260 |
caccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatg |
359 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19686633 |
catc--acaaggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacgaaccaaatcagctgctg-------ata |
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 |
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360 |
ttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaat |
453 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| | | ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |
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| T |
19686542 |
ttgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtgatcattgctgttgaaatgtctgtcatcaaagctttgttca-gtattcataatacccgaattcttaat |
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T |
 |
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atgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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| |
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||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |
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atgcttgattaatcaagcatgttgtagatc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 353
Target Start/End: Original strand, 50155657 - 50155897
Alignment:
| Q |
113 |
ataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| | || | |
|
|
| T |
50155657 |
ataaggctattagatttttaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc---gagtggatgtccggatgatccattaacgaactaat |
50155753 |
T |
 |
| Q |
212 |
ggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttc-ttctccctgtctaaagagaacttgagg |
309 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| || ||||||| ||| |
|
|
| T |
50155754 |
gagaaaccataatgatcatccaatataaaagaagttatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaagg |
50155853 |
T |
 |
| Q |
310 |
cataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa |
353 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50155854 |
cataaaggtaccagtcgagaaagaatcaaatcagccgccgctaa |
50155897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 490
Target Start/End: Original strand, 3769436 - 3769647
Alignment:
| Q |
281 |
tcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggt |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
3769436 |
tcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaacctatgttgtgtatttcacatcacgat |
3769535 |
T |
 |
| Q |
381 |
ttctcc------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatg |
474 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
3769536 |
ttcttctctgtgatcgttgctgttgagagg---accatcaaagcctcattcaagtattcctaata-cctaattattaatatccttgattaatgaaacatg |
3769631 |
T |
 |
| Q |
475 |
tcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3769632 |
tcgtagatccgatcat |
3769647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10733428 - 10733325
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10733428 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
10733329 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
10733328 |
tcat |
10733325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10947197 - 10947094
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10947197 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
10947098 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
10947097 |
tcat |
10947094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33461889 - 33461797
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
33461889 |
ttttattatttattatattccaatatc-tttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgat |
33461797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 490
Target Start/End: Original strand, 4632192 - 4632471
Alignment:
| Q |
227 |
ccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||| ||| | |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4632192 |
ccatccaatataaaagaggttatggtccccaatatacagtacatgacaatactttctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggt |
4632291 |
T |
 |
| Q |
325 |
tgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcaga-------tcatggtttctcc---------atcgttgttgttgagagggctg |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
4632292 |
tgaggaagaaccaaatcagaagccgctaac-tatgttttgtgtttcagaattcagatcatcacatctcctatttgtttatggttgttgttgaaagggttg |
4632390 |
T |
 |
| Q |
409 |
ccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4632391 |
tcatgaaagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
4632471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 26963518 - 26963427
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26963518 |
gttgttgttgagagggctaccataaaagctttatccaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
26963427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33458764 - 33458672
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgat |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
33458764 |
ttttattatttattatattccaatatcctt-atgtgggcaattatcgtaacaataattatattaactatttatcaattgtgagccttagttgat |
33458672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 50426882 - 50426980
Alignment:
| Q |
52 |
aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50426882 |
aataattatattagttatttatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagttattaaattttcaatgagataattaattaaa |
50426980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31986832 - 31986745
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31986832 |
atcgttgttgttgaaagggccgccatcaaaacttcattcagatattcctaata-cctaattattgttatccttgataaatcaaacatgt |
31986745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 469
Target Start/End: Original strand, 50427353 - 50427427
Alignment:
| Q |
395 |
tgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaa |
469 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
50427353 |
tgttgagagggcttccatgaacgctatatccaggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaa |
50427427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 339
Target Start/End: Original strand, 50427238 - 50427281
Alignment:
| Q |
296 |
aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaa |
339 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50427238 |
aagagaagttgaggcataaatgtaccggttgagtaagaaccaaa |
50427281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 286
Target Start/End: Original strand, 9237107 - 9237251
Alignment:
| Q |
143 |
taattaaatatttaatt--agttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatc-caatataa |
239 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
9237107 |
taattaattatttaattgaagtgatatggactctatgagtggatgtctggatgaccaattaacgggataatgg-aaaccttaatgaccatcacactat-- |
9237203 |
T |
 |
| Q |
240 |
aagaggctatg-gtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttct |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
9237204 |
aagaggctatgattcccaatacattgtacacgacaaactctttgttct |
9237251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 55473297 - 55473245
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagc-ttcattcaggtattcctaatacc |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55473297 |
gttgttgttgagagggctaccatcaaaactttaattcaggtattcctaatacc |
55473245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 32284561 - 32284619
Alignment:
| Q |
296 |
aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
32284561 |
aagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaaatcagtcgccactaac |
32284619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 343
Target Start/End: Original strand, 33045085 - 33045173
Alignment:
| Q |
255 |
caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | || ||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
33045085 |
caatacaccgttcacgacgaattctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcag |
33045173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8651378 - 8650882
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
8651378 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga |
8651280 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
8651279 |
tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccat |
8651180 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
8651179 |
taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa |
8651080 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
8651079 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt |
8650981 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8650980 |
tgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
8650882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21771139 - 21770644
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || |
|
|
| T |
21771139 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtga |
21771041 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
21771040 |
tcaaattaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatga-ccat |
21770942 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
21770941 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccaaccaatataaaagaggctacggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctcc--atctgaa |
21770844 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt--------atgttgtgtatttcagatca--tggtttctcc |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||||| | | ||||| |
|
|
| T |
21770843 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgttgatgaagttgatgtttgtttcagatcacctcctatctcc |
21770744 |
T |
 |
| Q |
387 |
--atcg---ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtaga |
481 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21770743 |
ttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttattcagatattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtaga |
21770646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31756786 - 31756301
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
31756786 |
ttttattatttattatatttcaatattatt-atgtggataaatattgtaacaataattatatt-------tatcaattgtgggtcttagttgattagtga |
31756695 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
31756694 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaataattaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat |
31756595 |
T |
 |
| Q |
200 |
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298 |
Q |
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| T |
31756594 |
taa-ggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcaaacacgacaaactctctcttctccccatctgaag |
31756496 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatca-----tggtttctc----cat |
388 |
Q |
| |
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| T |
31756495 |
agaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatattgtgtgtttcagatcatcacctcctctctctgtgtat |
31756396 |
T |
 |
| Q |
389 |
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483 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
31756395 |
ggttgctgttgagagggctgtcatgaaagctctatccagatattcataataccctaattcttaatatccttgataattcaaacatgtcgtagatc |
31756301 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4580876 - 4580400
Alignment:
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Q |
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T |
 |
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215 |
Q |
| |
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aattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatggga |
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T |
 |
| Q |
216 |
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313 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4580681 |
aaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcata |
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T |
 |
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407 |
Q |
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| T |
4580581 |
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4580483 |
T |
 |
| Q |
408 |
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490 |
Q |
| |
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| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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4580482 |
gttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Original strand, 25353818 - 25354291
Alignment:
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120 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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25353818 |
caatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct |
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T |
 |
| Q |
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-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaa |
216 |
Q |
| |
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| T |
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aattagatttat-tttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgggaa |
25354011 |
T |
 |
| Q |
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accctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataa |
314 |
Q |
| |
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| T |
25354012 |
actctaatggtcatctaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa |
25354111 |
T |
 |
| Q |
315 |
atgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctg |
408 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |
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| T |
25354112 |
aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctg |
25354210 |
T |
 |
| Q |
409 |
ccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
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ctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21191445 - 21190945
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |
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| T |
21191346 |
tcaaattaagtaatatggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgttcggatggccca |
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T |
 |
| Q |
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ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaa |
296 |
Q |
| |
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| T |
21191246 |
ttaacggaataatgtgaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccttacacggcaatactctctcttctccccatctga |
21191147 |
T |
 |
| Q |
297 |
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387 |
Q |
| |
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| T |
21191146 |
agagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcatatcatctcctctctttggtta |
21191048 |
T |
 |
| Q |
388 |
tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat |
487 |
Q |
| |
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| T |
21191047 |
tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatatctttgataaatcaaatatatcgtagatccgat |
21190948 |
T |
 |
| Q |
488 |
cat |
490 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
21190947 |
cat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 25343211 - 25343704
Alignment:
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Q |
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T |
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atcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgac |
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Q |
| |
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|
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| T |
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attaaattaagtaataaggctaattagatttat-tttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgttcggatggt |
25343404 |
T |
 |
| Q |
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ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtct |
294 |
Q |
| |
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| T |
25343405 |
ccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatgtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatct |
25343504 |
T |
 |
| Q |
295 |
aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------cat |
388 |
Q |
| |
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|
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| T |
25343505 |
gaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttat |
25343603 |
T |
 |
| Q |
389 |
cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatc |
488 |
Q |
| |
|
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| T |
25343604 |
cgttgttgatgaaagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaatat-cttgataaatcaaaaatgtcgtagatccgatc |
25343702 |
T |
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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30906156 - 30905821
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Q |
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T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
| |
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| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
30906057 |
accaaataaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactctatgagtagatgtctggatgatcct |
30905958 |
T |
 |
| Q |
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297 |
Q |
| |
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||||| |||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| || |
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| T |
30905957 |
ttaacagaataatgggaaaccataatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtactcgacaaactctctcttc-ccccatctgaa |
30905859 |
T |
 |
| Q |
298 |
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335 |
Q |
| |
|
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|
|
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30905858 |
gagaacttgaggcataaatataccaattgaggaagaac |
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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21783896 - 21783549
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Q |
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T |
 |
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attaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaac |
203 |
Q |
| |
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attaagtaataaaactattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaac |
21783698 |
T |
 |
| Q |
204 |
gtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt---cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaaga |
299 |
Q |
| |
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| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |
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| T |
21783697 |
ggaataatgggaaaccctaat-ggcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaaga |
21783599 |
T |
 |
| Q |
300 |
gaacttgaggcataaatgta------ccggttgaggaagaaccaaatcag |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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gaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcag |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21197588 - 21197250
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Q |
| |
|
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ttatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaactgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatt |
21197489 |
T |
 |
| Q |
129 |
tctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagc |
227 |
Q |
| |
|
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tctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaacctaatggc |
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T |
 |
| Q |
228 |
catccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-----------actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaa |
315 |
Q |
| |
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| T |
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catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactcggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa |
21197289 |
T |
 |
| Q |
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tgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21789999 - 21789772
Alignment:
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
225 |
agccatccaatataaaagaggctatggt---cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgta- |
319 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
21789899 |
-ggcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaa |
21789801 |
T |
 |
| Q |
320 |
-----ccggttgaggaagaaccaaatcag |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21789800 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 450
Target Start/End: Original strand, 17581384 - 17581675
Alignment:
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Q |
| |
|
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17581384 |
atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaataaccgtccaatataaaagaggctatggtccc--caaact |
17581480 |
T |
 |
| Q |
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gtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg |
362 |
Q |
| |
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| T |
17581481 |
gtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgttgatg |
17581580 |
T |
 |
| Q |
363 |
tgtatttcagatca--tggtttctc-----catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctt |
450 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| | | |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17581581 |
tttgcttcagatcacctcctctctccttgtcgttgttgttgttgagagggctgtcatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt |
17581675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 6096895 - 6097067
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| || |
|
|
| T |
6096895 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatagtaacaataattatattacttatttgtcaattgtcagccttacttgattagtga |
6096993 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaa-ttggataattaattaaatatttaattagtt-atatggact |
172 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6096994 |
tgaaattaagtaataaggctattaaatttctaattttgataattaattaaatatttaattagttgatatggact |
6097067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17581188 - 17581350
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | | |||||||| | |
|
|
| T |
17581188 |
ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctcaattgattagtg |
17581286 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17581287 |
atcaaattaagtaataagactattatggttctaattggataattaattaaatatttaattagtt |
17581350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 1105921 - 1106206
Alignment:
| Q |
25 |
atcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctatta |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
1105921 |
atcaattatgtgggcaaatatggtagtaataattatatttgatatttatcaattgtaagttttatttgattagtgttcaaattaaatgataaggctatta |
1106020 |
T |
 |
| Q |
125 |
gatttctaattggataattaattaaatattt-aattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaacccta |
222 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |
|
|
| T |
1106021 |
aatttttaactacataattaattaaatatttaaattaattaatatggattcaatgagtggatgtccggatgactcattaacgaaataatggaaaaccgta |
1106120 |
T |
 |
| Q |
223 |
atagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgag |
308 |
Q |
| |
|
|| ||| | |||||| |||| ||||||||| | | || ||||||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
1106121 |
atgatcattgagtataaatgaggatatggtcccca-atactgtacacgtcaaaactttctcttctccctatgtgaagagaacttgag |
1106206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21782935 - 21782832
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21782935 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
21782836 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
21782835 |
tcat |
21782832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32035468 - 32035365
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32035468 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
32035369 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
32035368 |
tcat |
32035365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21783486 - 21783395
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21783486 |
gttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
21783395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21789709 - 21789618
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21789709 |
gttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
21789618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12802063 - 12801891
Alignment:
| Q |
52 |
aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggc-tattagatttctaattggataattaattaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
12802063 |
aataattatattagctatttgtcaatttggagccttaattgattagtgatcaatttaagtaataaagcttattagatttctatttagaatattaattaat |
12801964 |
T |
 |
| Q |
151 |
tatttaattagttatatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12801963 |
tatttaat---ggatttggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaat |
12801891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8662922 - 8662860
Alignment:
| Q |
428 |
gtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8662922 |
gtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
8662860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21197198 - 21197107
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21197198 |
gttgttgttgagagggctgccataaaagatttatccaggtattcataata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgttgtagatc |
21197107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 18778564 - 18778663
Alignment:
| Q |
391 |
ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatca |
489 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18778564 |
ttgttgttaagagggctgccatgaaagttttatccaggtattcctaaaacccctaattcttaatat-attgataaatcaaatacgtcgtagatccgatca |
18778662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 493
Target Start/End: Original strand, 1106222 - 1106297
Alignment:
| Q |
419 |
ttcattcaggtattcctaataccct-aattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgtt |
493 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1106222 |
ttcattgaggtattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcatgtt |
1106297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 428 - 483
Target Start/End: Original strand, 6097999 - 6098053
Alignment:
| Q |
428 |
gtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6097999 |
gtattcctaataccctaattcttaacat-cttgataaatcaaacacgtcgtagatc |
6098053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 160
Target Start/End: Original strand, 1283280 - 1283318
Alignment:
| Q |
122 |
ttagatttctaattggataattaattaaatatttaatta |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1283280 |
ttagatttctaattggataattaattatatatttaatta |
1283318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 31001961 - 31002457
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
31001961 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
31002059 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
31002060 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat |
31002159 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
31002160 |
taacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaa |
31002259 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
31002260 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctttttggttatcgt |
31002358 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31002359 |
tgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
31002457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28683519 - 28683024
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
28683519 |
ttttattatttattatatcttaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
28683421 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
28683420 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaacatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
28683321 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
28683320 |
taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag |
28683221 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc------atcgtt |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | | |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
28683220 |
agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaac-tctattgtgtgtttcagatcatccactctccttggttatcgtt |
28683122 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28683121 |
gttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
28683024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 30964912 - 30965408
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
30964912 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
30965010 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
30965011 |
tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgtccggatggcccat |
30965110 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
30965111 |
taacggaataatgggaaatcctaatggccatctaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa |
30965210 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
30965211 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgt |
30965309 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30965310 |
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Target: chr2; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 31007985 - 31008435
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13150264 - 13149765
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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 13455683 - 13456180
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Target: chr2; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 13461624 - 13462121
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Target: chr2; HSP #9
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Target: chr2; HSP #10
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35091228 - 35090728
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cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt |
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ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac-------gtatgttgtgtatttcagatca-tggtttct |
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T |
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484 |
Q |
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35090833 |
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35090734 |
T |
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485 |
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| |
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|||||| |
|
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35090733 |
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Target Start/End: Complemental strand, 35439945 - 35439671
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199 |
Q |
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T |
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274 |
Q |
| |
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|
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taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaa |
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T |
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207 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
| |
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| T |
19879386 |
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19879484 |
T |
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| Q |
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352 |
Q |
| |
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105 |
Q |
| |
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ttatttattatattccaatatcatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattcgctatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaa |
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T |
 |
| Q |
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204 |
Q |
| |
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ttaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacg |
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T |
 |
| Q |
205 |
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221 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| |
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gaataatggaaaaccct |
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Q |
| |
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T |
 |
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314 |
Q |
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| T |
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ctaatggcgatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaaccaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa |
11048811 |
T |
 |
| Q |
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409 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
410 |
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479 |
Q |
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cataaaagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtacatcaaacatgacgta |
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T |
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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
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Target Start/End: Original strand, 23343147 - 23343633
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T |
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Q |
| |
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atcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagagtaattaattaa---------tgg--atatggactcaatataggtggatgtccggatgac |
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T |
 |
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ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtct |
294 |
Q |
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| T |
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ccattaacagaataatggaaa-ccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgggaaactctctcttctccccatct |
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T |
 |
| Q |
295 |
aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttct |
384 |
Q |
| |
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23343434 |
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T |
 |
| Q |
385 |
ccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat |
482 |
Q |
| |
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|| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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ttattgttgttgtcgagagggctgccaccaaagtttcatctccatgtattcctaataccccaactcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagat |
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238 |
Q |
| |
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| T |
7771622 |
attaattaaatatttaattagttgatacgggactcgatgagtggacgtccggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaatcgtcatccaatata |
7771524 |
T |
 |
| Q |
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263 |
Q |
| |
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||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
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Target: chr2; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 29832878 - 29833288
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T |
 |
| Q |
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281 |
Q |
| |
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|| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||||| | ||| | |||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
| T |
29832978 |
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29833068 |
T |
 |
| Q |
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cttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcatgg |
379 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
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29833168 |
T |
 |
| Q |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tttctcctctctgattcagatcgttgttgttgagagggttgtcatcaaa-cttcatccaggtattcttaata-cctaattattgttat-cttgataaatc |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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|||||||| || |||| |||||| |
|
|
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Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438825
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| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |
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|
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T |
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tatttcagatca--tggtttctcc--atcgttgttgtt------gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacccta |
444 |
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| |
|
| |||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |
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|
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23283827 |
ttttattattttattatatttcaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttggagtcttaattgattagtg |
23283925 |
T |
 |
| Q |
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atcaaattaagtaataaggc-tattagatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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atcaaattaagtaataaggcttattagatt |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||| ||| ||| | | ||||| |||| || ||||| || | |
|
|
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ttgattagtgatcaaattaaatgataaggctaattatatttttatttggataattaactaa-tata-aataattgatatgaactcgatatgagtgaatgt |
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T |
 |
| Q |
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ctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttct |
286 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| | | |||| |
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|
| T |
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atggatgactcatcaacggaataatggaaaactctaatggcgattcaatataaaagaggcaatggtcccattacaccatacacgacaaacattatattct |
28765452 |
T |
 |
| Q |
287 |
ccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatca |
342 |
Q |
| |
|
| | || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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ctcattccgaagagaatttgaggcatcaaggtacctattgaggaagaaccaaatca |
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| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |
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31651318 |
aattaagtaataaatcaattagatttttatgtagataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtcgatgtctagatgatccattaa |
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Q |
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attagtgatcaaattaaataataagattaattagatttctaattagataattaattatatgtttaa |
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190 |
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255 |
Q |
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||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |
|
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| T |
23284719 |
gatgacccattaacggaataatgtgaaactctaatggccatcaaatataaaagatgttatggtccc |
23284784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 439
Target Start/End: Original strand, 28765558 - 28765610
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata |
439 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |
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| T |
28765558 |
atcattgttgttgatagagctgccatcaaaacatcatccaggtattcctaata |
28765610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28525960 - 28525465
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
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| T |
28525960 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
28525862 |
T |
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101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
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| T |
28525861 |
tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
28525762 |
T |
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| Q |
200 |
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298 |
Q |
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| T |
28525761 |
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28525662 |
T |
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| Q |
299 |
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392 |
Q |
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| T |
28525661 |
agaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt |
28525563 |
T |
 |
| Q |
393 |
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490 |
Q |
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| T |
28525562 |
gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
28525465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28532056 - 28531561
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
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| T |
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28531958 |
T |
 |
| Q |
101 |
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199 |
Q |
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| T |
28531957 |
tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat |
28531858 |
T |
 |
| Q |
200 |
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298 |
Q |
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| T |
28531857 |
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28531758 |
T |
 |
| Q |
299 |
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392 |
Q |
| |
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| T |
28531757 |
agaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt |
28531659 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
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| T |
28531658 |
gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
28531561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7390122 - 7389627
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
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| T |
7390122 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacgataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga |
7390024 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
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| T |
7390023 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgttcggatgacccat |
7389924 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatgg-tcccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
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| T |
7389923 |
taacggaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatggttcccaatatactgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaa |
7389824 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
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| T |
7389823 |
gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt |
7389725 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
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| T |
7389724 |
tgttgatgagagagcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtggatccgatcat |
7389627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 41296872 - 41297357
Alignment:
| Q |
9 |
tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta |
108 |
Q |
| |
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| T |
41296872 |
tttattatattacaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta |
41296970 |
T |
 |
| Q |
109 |
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207 |
Q |
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| T |
41296971 |
agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacagaa |
41297070 |
T |
 |
| Q |
208 |
tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagaga---a |
302 |
Q |
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| T |
41297071 |
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41297170 |
T |
 |
| Q |
303 |
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396 |
Q |
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| T |
41297171 |
cttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcacctcctctccttggttatcgttgttg |
41297269 |
T |
 |
| Q |
397 |
ttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
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| T |
41297270 |
atgagagggttgccttgaaagc------caggtattcctaataccctaattctttatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
41297357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12686754 - 12686258
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
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| T |
12686754 |
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T |
 |
| Q |
100 |
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194 |
Q |
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|
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| T |
12686655 |
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12686560 |
T |
 |
| Q |
195 |
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293 |
Q |
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| T |
12686559 |
cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatc |
12686460 |
T |
 |
| Q |
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taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca |
387 |
Q |
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| T |
12686459 |
tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta |
12686361 |
T |
 |
| Q |
388 |
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487 |
Q |
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| T |
12686360 |
tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat |
12686261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12692856 - 12692360
Alignment:
| Q |
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ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
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ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg |
12692758 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga |
194 |
Q |
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| T |
12692757 |
atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg |
12692662 |
T |
 |
| Q |
195 |
cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc |
293 |
Q |
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| T |
12692661 |
cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatc |
12692562 |
T |
 |
| Q |
294 |
taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca |
387 |
Q |
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| T |
12692561 |
tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta |
12692463 |
T |
 |
| Q |
388 |
tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat |
487 |
Q |
| |
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| T |
12692462 |
tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat |
12692363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30384959 - 30384586
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
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30384959 |
ttttattattttattatattccgatatcatt-atgtggacaaatattgtaataataattatattagctatttatcagttgtgagccttaattgattagtg |
30384861 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
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| T |
30384860 |
attaaattaagtaataaggctattggatttctaattagataattaattaaatatttcattaatagatatggattcaatgagtggatgtctggatgactca |
30384761 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
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| T |
30384760 |
ttaacggaataatggaaaatc-taatagtcatccaatataaaagagactatggtcccaatacaccgtacacggcaaacattctcttctccccatctgaag |
30384662 |
T |
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| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagat |
374 |
Q |
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| T |
30384661 |
agaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaagctatgttgtgtgtttcagat |
30384586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 20499722 - 20500218
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
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| T |
20499722 |
ttttattatttaattatatttcaacatcatt-atatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtg |
20499820 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
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| T |
20499821 |
atcaaattaagtaataagactattagatttctagtaagataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtctggatggccca |
20499920 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaa |
296 |
Q |
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| T |
20499921 |
ttaacgaaataatggaaaaccctaatggtcatccaataaataagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctgttctctccatttga |
20500020 |
T |
 |
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297 |
agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtt-tctc----catcgt |
391 |
Q |
| |
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| T |
20500021 |
agagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaagaaccaaatcaaccgctgctaacct-tcttgtttgtttcagatcgcctttctctctgtttatcgt |
20500119 |
T |
 |
| Q |
392 |
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490 |
Q |
| |
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| T |
20500120 |
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20500218 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 30771876 - 30772363
Alignment:
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9 |
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108 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||| |
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| T |
30771876 |
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30771971 |
T |
 |
| Q |
109 |
agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgt |
205 |
Q |
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30772071 |
T |
 |
| Q |
206 |
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304 |
Q |
| |
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| T |
30772072 |
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30772171 |
T |
 |
| Q |
305 |
tgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat-----ggtttctccatcgttgttgtt |
398 |
Q |
| |
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| T |
30772172 |
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30772271 |
T |
 |
| Q |
399 |
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490 |
Q |
| |
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gagagggctgccataaaaactttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19060298 - 19059850
Alignment:
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150 |
Q |
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19060199 |
T |
 |
| Q |
151 |
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247 |
Q |
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| T |
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19060099 |
T |
 |
| Q |
248 |
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346 |
Q |
| |
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| T |
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19059999 |
T |
 |
| Q |
347 |
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434 |
Q |
| |
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| T |
19059998 |
ccgctaaccgtgttgatgtggatgtttgtttcagatcaccttctctctttatcgttgttgtcgagagggctgccaccaaagcttcatctccaggtatttc |
19059899 |
T |
 |
| Q |
435 |
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483 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
19059898 |
taataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
19059850 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32094797 - 32094419
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99 |
Q |
| |
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| T |
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32094699 |
T |
 |
| Q |
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194 |
Q |
| |
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| T |
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atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtgtatgtccggatgg |
32094603 |
T |
 |
| Q |
195 |
cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt |
292 |
Q |
| |
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| T |
32094602 |
cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctatggtcccaaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccat |
32094503 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat |
377 |
Q |
| |
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|
|
| T |
32094502 |
ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32097597 - 32097220
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| | |
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|
| T |
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ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattggttagtg |
32097499 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgac |
195 |
Q |
| |
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| T |
32097498 |
atcaaattaaataataagctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggc |
32097403 |
T |
 |
| Q |
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ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtc |
293 |
Q |
| |
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|
| T |
32097402 |
ccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggaaatactctctattctccccatc |
32097303 |
T |
 |
| Q |
294 |
taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat |
377 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32097302 |
tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat |
32097220 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19066632 - 19066193
Alignment:
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52 |
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150 |
Q |
| |
|
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|
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19066533 |
T |
 |
| Q |
151 |
tatttaattagttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatg |
250 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |
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| T |
19066532 |
taattaatgg---atatgga-tatatgagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaataggttgtg |
19066437 |
T |
 |
| Q |
251 |
gtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccg |
349 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19066436 |
gtccccaatacaccggacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgccg |
19066337 |
T |
 |
| Q |
350 |
ctaa-cgt----atgt-tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaata |
439 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19066336 |
ctaaccgtgttgatgtgggtttgtttcagatcactttctctctttatcgttgttgtcgagagagctgccaccaaagcttcatctcctggtattcctaata |
19066237 |
T |
 |
| Q |
440 |
ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19066236 |
ccataattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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T |
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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Original strand, 14609918 - 14610108
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14609918 |
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14610016 |
T |
 |
| Q |
263 |
cgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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14610017 |
cgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac |
14610108 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8706919 - 8706745
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| |
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|
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8706919 |
attgtaataataattatattagctatttatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataagacgattaaatttctaattagataatt |
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T |
 |
| Q |
144 |
aattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaa |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
8706819 |
tattaaatatttaattaattgatatggatccaataagtggatatgcagatgacccattaacggaataatggaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 14609736 - 14609888
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caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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caatatcatt-atgtgtgcaaatatcgtaataataattatattagttacttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaact |
14609834 |
T |
 |
| Q |
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attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactc |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
14609835 |
attagatttctagtaagataattaattaaacatttaattaattgatatggactc |
14609888 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 483
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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32094340 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 391 - 483
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ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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32097138 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
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388 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| || |
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|
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gagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaaatcagccgccaccgactctatgttgtgtatttcagatcgcgatttctcctctttcagat |
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T |
 |
| Q |
389 |
cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtag |
480 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
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|
| T |
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cgttgatgttgagaggactgtcatcaaagcttcattcatatattcctaata-cctaattcttaatat-cttgatgaatcaaatatgtcgtag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 214 - 363
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311 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| |||| |||| | || | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || | |
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|
| T |
26318621 |
aaaaccctaatggtcatcacactatataagaggctatgatccccaatatatcggaaacgacaaactctctcttctccca-tctgaagagaacttatggta |
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T |
 |
| Q |
312 |
taaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgt |
363 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
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taaatgtaccggttgagaaagaaccaaatcaattgccgctaacctttgttgt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
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| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30384532 - 30384457
Alignment:
| Q |
414 |
aaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
30384532 |
aaagcttcatccaggtattcttaatacccttattcttaatatccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcat |
30384457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33753634 - 33753476
Alignment:
| Q |
175 |
atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggca |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || |
|
|
| T |
33753634 |
atgagtggatttatggatgatacattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacaccgtacacacca |
33753536 |
T |
 |
| Q |
274 |
aactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaga |
333 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
33753535 |
tactctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga |
33753476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26318435 - 26318381
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26318435 |
atcgttgttgttgagaggcccgtcatcaaagcttcattaaggtattcctaatacc |
26318381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8706601 - 8706536
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatat |
455 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8706601 |
gttgctgttgagatggttgtcatgaaagcataattcaggtattcctaataccctaattcttaatat |
8706536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33753806 - 33753710
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattag |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
33753806 |
ttttattatttaattatatttcaatatcatt-atgtgggtaaatattattatcataattatattagctatttatcaatttggagctttaattgattag |
33753710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33753435 - 33753381
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33753435 |
atcgttgttgttgagaggactgtcatcaaaacttcatcaaggtattcctaatacc |
33753381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33849069 - 33849015
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33849069 |
atcgttgttgttgagaggactgtcatcaaaacttcatcaaggtattcctaatacc |
33849015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215260
Alignment:
| Q |
434 |
ctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc |
483 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16215309 |
ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatc |
16215260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25408537 - 25408435
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
25408537 |
ttttattatttaataatatttcgatatcatt-atgtggacaaatatcgtaaaagtaattatata---tatttatcaattgtgagccttaattgattagtg |
25408442 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaat |
106 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25408441 |
atcaaat |
25408435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 480
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542308
Alignment:
| Q |
441 |
cctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtag |
480 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28542269 |
cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag |
28542308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 490
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610229
Alignment:
| Q |
445 |
attcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14610184 |
attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcat |
14610229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26318765 - 26318676
Alignment:
| Q |
54 |
taattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataatt |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||| || | ||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
26318765 |
taattatattagttatctatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataaagatattagatttttatttagataatt |
26318676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0440 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:
Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1273
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
1762 |
ttttattatttattatatttcaatattatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga |
1664 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
1663 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacc--- |
1567 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
1566 |
---cggaataatggaaaatcctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaag |
1470 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
1469 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt |
1371 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1370 |
gttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatatcgtagatccgatcat |
1273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5542736 - 5542239
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||| || |
|
|
| T |
5542736 |
ttttattatttaataatattctatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtga |
5542638 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5542637 |
tcaaattaagtaataagactaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccca |
5542538 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaa |
296 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |
|
|
| T |
5542537 |
ttaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctga |
5542438 |
T |
 |
| Q |
297 |
agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcg |
390 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
5542437 |
agagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcccctctttggttatcg |
5542339 |
T |
 |
| Q |
391 |
ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5542338 |
ttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
5542239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22220292 - 22219796
Alignment:
| Q |
11 |
tattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaag |
110 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22220292 |
tattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaatagttatattagctatttatcaatcgtaagccttagttgattagtgatcaaattaag |
22220194 |
T |
 |
| Q |
111 |
taataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaata |
209 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22220193 |
taataagggtattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgaatggatgtccggatggcccattaacggaata |
22220094 |
T |
 |
| Q |
210 |
gtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttga |
307 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22220093 |
atgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttga |
22219994 |
T |
 |
| Q |
308 |
ggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca---------tggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||| | |||||||||| | |||| || | ||| |
|
|
| T |
22219993 |
ggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac-tttattgtttgtttcagatcaattttttctttgtttatcgttgttgttggtt |
22219895 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttc-attcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22219894 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcaatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
22219796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Original strand, 10699616 - 10700109
Alignment:
| Q |
3 |
ttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatc |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10699616 |
ttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatactagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatc |
10699714 |
T |
 |
| Q |
103 |
aaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
10699715 |
aaattaagtaattaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccatta |
10699814 |
T |
 |
| Q |
202 |
acgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaaga |
299 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| | || |
|
|
| T |
10699815 |
acggagtaatgggaaaccctaatggtcatcaaatataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctctccatctgacga |
10699914 |
T |
 |
| Q |
300 |
gaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttg |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
10699915 |
aaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatttcctctctttggttatcgttg |
10700013 |
T |
 |
| Q |
394 |
ttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| | |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10700014 |
ttgatgagagggctgctacaaaagttttatccagatattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
10700109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Original strand, 10705428 - 10705917
Alignment:
| Q |
6 |
ttatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10705428 |
ttatttattatattccaatatcattt-tgtgggcgaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaa |
10705526 |
T |
 |
| Q |
106 |
ttaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacg |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10705527 |
ttaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacg |
10705626 |
T |
 |
| Q |
205 |
taatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaa |
302 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
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| T |
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Target Start/End: Complemental strand, 39736112 - 39735639
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Target: chr8; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 32890472 - 32890969
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Target: chr8; HSP #10
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tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
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293 |
ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42993284 |
ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt |
42993186 |
T |
 |
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42993185 |
atcgttgttgatgagagggtggctacaaaagctttatcaaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
42993087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39727859 - 39727656
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
39727859 |
ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagacttagttgattagtga |
39727761 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
39727760 |
tcaaattaagtaataaggctattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtccggatagcccat |
39727661 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacg |
204 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
39727660 |
taacg |
39727656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 239 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 39727645 - 39727405
Alignment:
| Q |
239 |
aaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaa-ctctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaacc |
336 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39727645 |
aaagaggatatggtccccaatataccgtacacaacaaaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc |
39727546 |
T |
 |
| Q |
337 |
aaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcc |
434 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||| | |
|
|
| T |
39727545 |
aaatcagcagccgctaacccttgctgtttgtttcagatcaccttctctctttaccgttgttgttgagagggttgccaagaaagttttttccaggtatttc |
39727446 |
T |
 |
| Q |
435 |
taataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt |
475 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39727445 |
ttataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt |
39727405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1883384 - 1883185
Alignment:
| Q |
30 |
ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggc-tattagatt |
128 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1883384 |
ttatgcgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaatttggagccttacttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatt |
1883285 |
T |
 |
| Q |
129 |
tctaattggataattaattaaatatttaattagttatatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatag |
226 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
1883284 |
tctatttagaatattaattaa----ttaat---ggatatggactcaatatgagtggatgtccggatgacccattaacgaaataatgggaaaccttaatgg |
1883192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1882937 - 1882846
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatt--caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtc |
476 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1882937 |
atcgttgttgttgagagggctgccatgaaagcttcatctccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtc |
1882846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1883151 - 1883039
Alignment:
| Q |
243 |
aggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatc |
341 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1883151 |
aggctatggtccccaatacacaatacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaatt |
1883052 |
T |
 |
| Q |
342 |
agttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |
|
|
| T |
1883051 |
agccgccgctaac |
1883039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Original strand, 7771210 - 7771312
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7771210 |
atcgttgttgatgagagggttgctacaaaagctt-atccaggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccga |
7771308 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7771309 |
tcat |
7771312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 17954141 - 17954316
Alignment:
| Q |
52 |
aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatt----aagtaataaggctattagatttctaattggataattaatt |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
17954141 |
aataattatattagctatttatcaatttggagacttaattgattagtgatcagattactaaagtaataagcctattagatttctatt----taattaatt |
17954236 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaatatttaattagtt-atatggactc--aatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat |
224 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17954237 |
aattaattaattagttgatatggactcaaaatgagtggatgttcagatgacccactaacggaataatggaaaaccctaat |
17954316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14799559 - 14799495
Alignment:
| Q |
425 |
caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14799559 |
caggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
14799495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 479
Target Start/End: Original strand, 1171327 - 1171414
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgta |
479 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1171327 |
gttgctgttgagagagctgccataaaagctttaaccaggtattcctaata-cctaattcttgttat-cttgataaatcaaatatgtcgta |
1171414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 160
Target Start/End: Original strand, 11641418 - 11641447
Alignment:
| Q |
131 |
taattggataattaattaaatatttaatta |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11641418 |
taattggataattaattaaatatttaatta |
11641447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 354
Target Start/End: Original strand, 1171249 - 1171285
Alignment:
| Q |
318 |
taccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1171249 |
taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac |
1171285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1882996 - 1882960
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1882996 |
atcgttgttgttgaaagggctgccatgaaagcttcat |
1882960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 173465 - 172969
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
173465 |
ttttattattttattatattccaatattatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagcgatttatcaattgtgggtcttagttgattagtg |
173367 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | | |
|
|
| T |
173366 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgttcta |
173267 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa |
297 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
173266 |
ttaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtatacggcaaactctctcttctccccatctgaa |
173167 |
T |
 |
| Q |
298 |
gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
173166 |
gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgt |
173068 |
T |
 |
| Q |
392 |
tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| | | ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
173067 |
tgttgataagagggctatcttgaaagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcat |
172969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:
Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 11979 - 12468
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
11979 |
ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg |
12077 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
12078 |
atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg |
12173 |
T |
 |
| Q |
195 |
cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
12174 |
cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat |
12273 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12274 |
ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt |
12372 |
T |
 |
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12373 |
atcgttgttgatgagaggactgccttgaaagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagat |
12468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 6106 - 6595
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
6106 |
ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttaaagccttaattgattagtg |
6204 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
6205 |
atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg |
6300 |
T |
 |
| Q |
195 |
cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
6301 |
cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat |
6400 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6401 |
ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt |
6499 |
T |
 |
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6500 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagat |
6595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0363 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:
Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 698
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || |
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| T |
1173 |
ttttattatttattatataccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga |
1075 |
T |
 |
| Q |
101 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat |
199 |
Q |
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| T |
1074 |
tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatgggctcaatgagtggatgttcggatgtcccat |
975 |
T |
 |
| Q |
200 |
taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag |
298 |
Q |
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| T |
974 |
taacgaaataatgggaaa--------------------aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag |
895 |
T |
 |
| Q |
299 |
agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt |
392 |
Q |
| |
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| T |
894 |
agaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-aactattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtc |
796 |
T |
 |
| Q |
393 |
gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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|||| | |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
795 |
gttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0064 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:
Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 13857 - 14121
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
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|
| T |
13857 |
ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatagtaataataattatattagctatttatcaatcgtgagccttaattgactagtg |
13955 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
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| T |
13956 |
atcaaattaagtaataattctattagatttgtaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgtccggatgaccca |
14055 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacacc |
263 |
Q |
| |
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| T |
14056 |
ttaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaatacacc |
14121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1114 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:
Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 647 - 937
Alignment:
| Q |
1 |
ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg |
99 |
Q |
| |
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| T |
647 |
ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcataataataattatattagttatttatcaattgtgagcctcaattgattagtg |
745 |
T |
 |
| Q |
100 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatt-agttatatggactcaatgagtggatatctggatgaccca |
198 |
Q |
| |
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| T |
746 |
atcaaattaagtaataaggctattagatttaaaatcagataattgattaaatatttaattaactgatatgtactcaatgagtgaatgtctagatgaccca |
845 |
T |
 |
| Q |
199 |
ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccc |
289 |
Q |
| |
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| T |
846 |
ttaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacgacaaactctctcttctccc |
937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 490
Target Start/End: Original strand, 1068 - 1168
Alignment:
| Q |
390 |
gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatca |
489 |
Q |
| |
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| T |
1068 |
gttgatgttgagagagctgccatgaaagttttatccagatatttctaatactctaattgttaatatgcatgataagtcaaacatgtcgttgatccgatca |
1167 |
T |
 |
| Q |
490 |
t |
490 |
Q |
| |
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| |
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| T |
1168 |
t |
1168 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0185 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:
Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 5602 - 5821
Alignment:
| Q |
52 |
aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaat |
151 |
Q |
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| T |
5602 |
aataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatgactattagatttctaattcgataattaattaaat |
5701 |
T |
 |
| Q |
152 |
atttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggcta |
248 |
Q |
| |
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| T |
5702 |
atttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgttcggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaacggccattcaatataaaagaggcta |
5800 |
T |
 |
| Q |
249 |
tgg-tcccaatacaccgtaca |
268 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5801 |
tggttcccaatacatcgtaca |
5821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Original strand, 5825 - 5884
Alignment:
| Q |
295 |
aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac |
354 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
5825 |
aaagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaac |
5884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6003
Alignment:
| Q |
431 |
ttcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5945 |
ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat |
6003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Original strand, 5512 - 5615
Alignment:
| Q |
387 |
atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga |
486 |
Q |
| |
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|
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| T |
5512 |
atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga |
5611 |
T |
 |
| Q |
487 |
tcat |
490 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5612 |
tcat |
5615 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0085 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:
Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 38411 - 38508
Alignment:
| Q |
391 |
ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat |
490 |
Q |
| |
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| T |
38411 |
ttgttgttgagatgattgtcgtcaaagcttcatccaggtattcctaata-cctaattattaatattcttgataaa-caaacatgttgtagatccgatcat |
38508 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0449 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:
Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1325 - 1281
Alignment:
| Q |
30 |
ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatc |
74 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1325 |
ttatatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatc |
1281 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1064
Description:
Target: scaffold1064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 375
Target Start/End: Original strand, 1255 - 1334
Alignment:
| Q |
296 |
aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatc |
375 |
Q |
| |
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| T |
1255 |
aagagaacttgaaacataaatgtaccgattaaggaagaaccaaa-aagtcgccgctaaccctatgttgtatgtttcagatc |
1334 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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