View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20384_low_173 (Length: 304)

Name: NF20384_low_173
Description: NF20384
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20384_low_173
NF20384_low_173
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (6-286)||(48238629-48238909)
chr1 (6-286)||(52500456-52500736)
chr1 (6-286)||(36207002-36207282)
chr1 (6-286)||(6311146-6311427)
chr1 (6-286)||(16041812-16042092)
chr1 (6-286)||(2328956-2329236)
chr1 (6-284)||(2453269-2453545)
chr1 (6-286)||(18148475-18148755)
chr1 (6-269)||(48775487-48775750)
chr1 (6-286)||(37390304-37390577)
chr1 (114-286)||(25074115-25074285)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (6-286)||(18343912-18344192)
chr6 (6-286)||(10187331-10187611)
chr6 (6-286)||(2202331-2202611)
chr6 (6-286)||(12517175-12517455)
chr6 (6-286)||(15333429-15333710)
chr6 (114-286)||(12519394-12519566)
chr6 (6-179)||(31510351-31510524)
chr6 (6-179)||(29640180-29640354)
chr6 (185-286)||(29641678-29641779)
chr6 (185-286)||(31511842-31511943)
chr6 (6-82)||(30881318-30881394)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (6-286)||(27192276-27192556)
chr2 (6-286)||(27842090-27842370)
chr2 (6-286)||(24269222-24269502)
chr2 (6-286)||(35609472-35609752)
chr2 (6-286)||(17683981-17684261)
chr2 (6-286)||(21395157-21395437)
chr2 (6-278)||(27509169-27509441)
chr2 (6-286)||(41920325-41920605)
chr2 (6-286)||(28666324-28666605)
chr2 (6-286)||(37825158-37825439)
chr2 (143-285)||(24245640-24245782)
chr2 (6-82)||(24245816-24245892)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (6-288)||(54-336)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (6-286)||(5411-5691)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (6-286)||(25218717-25218997)
chr8 (6-286)||(21113896-21114176)
chr8 (6-286)||(30306964-30307244)
chr8 (11-286)||(31978684-31978959)
chr8 (6-286)||(25209184-25209464)
chr8 (6-286)||(7821625-7821905)
chr8 (113-286)||(33861639-33861812)
chr8 (114-286)||(14714052-14714224)
chr8 (167-286)||(14767350-14767469)
chr8 (212-286)||(7781535-7781609)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (6-286)||(42231871-42232151)
chr7 (6-286)||(21070214-21070494)
chr7 (6-286)||(5828707-5828987)
chr7 (6-286)||(9001297-9001577)
chr7 (6-286)||(7036507-7036787)
chr7 (6-286)||(12786130-12786411)
chr7 (6-232)||(12781300-12781527)
chr7 (6-82)||(22843795-22843871)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (6-282)||(25542945-25543221)
chr5 (6-286)||(14192964-14193244)
chr5 (6-286)||(27880871-27881151)
chr5 (6-286)||(30346696-30346976)
chr5 (6-278)||(37261110-37261382)
chr5 (6-286)||(24630013-24630293)
chr5 (6-286)||(10024850-10025130)
chr5 (6-286)||(39882970-39883250)
chr5 (6-286)||(8428726-8429006)
chr5 (11-286)||(37372723-37372998)
chr5 (6-282)||(3689768-3690044)
chr5 (6-282)||(3876743-3877019)
chr5 (53-286)||(6088997-6089230)
chr5 (114-283)||(15032841-15033010)
chr5 (114-286)||(2261274-2261446)
chr5 (114-286)||(4051595-4051765)
chr5 (114-286)||(30313986-30314156)
chr5 (6-82)||(17871789-17871865)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (6-286)||(28786-29066)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (6-286)||(35855694-35855974)
chr4 (6-286)||(1860464-1860744)
chr4 (6-286)||(49709960-49710240)
chr4 (6-286)||(55559190-55559470)
chr4 (6-286)||(38517883-38518163)
chr4 (6-286)||(49786980-49787260)
chr4 (113-286)||(31921260-31921433)
chr4 (114-286)||(787667-787839)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (6-288)||(18791-19073)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (6-286)||(321488-321768)
scaffold0002 (241-286)||(310079-310124)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (11-286)||(19244-19519)
scaffold0073 (6-286)||(31721-32000)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (6-286)||(10038427-10038707)
chr3 (6-286)||(11368433-11368714)
chr3 (6-286)||(10000194-10000474)
chr3 (6-286)||(10110387-10110667)
chr3 (6-286)||(10968933-10969213)
chr3 (6-286)||(13529827-13530106)
chr3 (6-286)||(47692756-47693036)
chr3 (7-286)||(50409959-50410238)
chr3 (6-286)||(10237344-10237622)
chr3 (6-286)||(46912858-46913138)
chr3 (6-286)||(11362045-11362326)
chr3 (113-286)||(41763621-41763794)
chr3 (6-141)||(52917998-52918133)
chr3 (6-179)||(32665-32838)
chr3 (167-286)||(15328876-15328995)
chr3 (224-286)||(32597-32659)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (6-286)||(724-1004)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (6-248)||(18021-18263)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (6-286)||(49088-49369)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-286)||(186344-186621)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (6-285)||(788-1067)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (6-285)||(182599-182878)
scaffold0003 (6-286)||(165317-165598)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (8-286)||(16472-16749)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (115-286)||(126016-126187)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (114-286)||(97083-97255)
[»] scaffold1424 (2 HSPs)
scaffold1424 (21-137)||(1584-1700)
scaffold1424 (185-286)||(1471-1569)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (241-286)||(132262-132307)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 48238629 - 48238909
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238629 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 48238728  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238729 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccggttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 48238828  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238829 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 48238909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52500736 - 52500456
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||   |    
T  52500736 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggt 52500637  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | | |||| || |||||||||||    
T  52500636 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttgtgctgatgagaaacatcga 52500537  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52500536 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacaatagatgctaccgtaattac 52500456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36207282 - 36207002
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  36207282 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagtgagttgt 36207183  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||| | | |||| | || ||||||||| |    
T  36207182 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgaaactccaaatcaccggttgaaactaaggatgagatgtccagttatgttgatgagaaacatcaa 36207083  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36207082 tcaagccaatggactatgtaatggtacgaggctggcagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 36207002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 6311146 - 6311427
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtc-gatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtat 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  6311146 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtgg 6311245  T
Q  105 ttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||| || |||||||||| | | |||||| || ||||||||||    
T  6311246 ttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcg 6311345  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6311346 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggttgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 6311427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16042092 - 16041812
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  16042092 gaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 16041993  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  16041992 tcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 16041893  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041892 ttaggccaataaactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatttagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 16041812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2329236 - 2328956
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  2329236 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagagagtggt 2329137  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  2329136 tcacaacggaatttctaaatggtattaagagctatggaattccaaatcaccggttgaaactaagggcgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 2329037  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2329036 tcagaccaatggactgagtaatggtacgaggctgaccgttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccataattac 2328956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 2453269 - 2453545
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |    
T  2453269 gaatatatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaaacgaga--t 2453366  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  2453367 tcacaatggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccgattgaaactaacggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 2453466  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatt 284  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2453467 tcatgcaaatggattgtgtaatggtacgaggttgacagttacacatctatggaagagcaagatagttgctaccgtaatt 2453545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18148755 - 18148475
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||  |    
T  18148755 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattcttatgtccaaagcaagtggt 18148656  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | || ||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  18148655 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattctaaatcaccggttgaaactaaagatgagatgtccagttatgctgattagaaacatcga 18148556  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  18148555 taaggccaatggagtgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagatcatgatagctgctaccgtaattac 18148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 48775487 - 48775750
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||  |    
T  48775487 gaatatatgatgtaaatgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtctgatgtccagagcgagtggt 48775586  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |   |||||| || |||||||||||    
T  48775587 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcaccagttgaaactgagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcga 48775686  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgata 269  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775687 tcaggtcattggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgata 48775750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 37390304 - 37390577
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||       ||||  |    
T  37390304 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgt-------gagtggt 37390396  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || ||||| |||||    
T  37390397 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaatatcga 37390496  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37390497 tcaggccaatggactgtgtaatggtactagactgacagtcacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 37390577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Original strand, 25074115 - 25074285
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||||| | |    
T  25074115 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcagacaa 25074214  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  25074215 atggactgtgtaatagtactaggctgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctcctaccgtagttac 25074285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18344192 - 18343912
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18344192 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtatt 18344093  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  18344092 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctaaaattccaaatcaccagttgaaaccaagggtgggatgtccggctatgctgatgagaaacatcga 18343993  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18343992 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctaacagttacacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 18343912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10187611 - 10187331
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  10187611 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggt 10187512  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  10187511 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctcttgaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 10187412  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10187411 tcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacaattacacatctagggaagaccacgattgttgctaccgtaattac 10187331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 2202331 - 2202611
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  2202331 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 2202430  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | | |||||  || |||||||||||    
T  2202431 tcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaattccaaatcactggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgccgatgagaaacatcga 2202530  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2202531 tcaggcaaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaaggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 2202611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12517455 - 12517175
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  12517455 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 12517356  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||| | || |||||||||||    
T  12517355 tcacatcggaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccggttatgttgatgagaaacatcga 12517256  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12517255 tcaggccaatggactgtgtaatggtactagtctgacatttacacttctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 12517175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15333710 - 15333429
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||   |    
T  15333710 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagaggt 15333611  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcat-aagaaacatcg 204  Q
    ||| |    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||| | | |||| | ||  | |||||| |    
T  15333610 tcatatcgaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttaaaactaaaggtgggatgtccagttatggtgatggaaaaacattg 15333511  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15333510 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttactcatctagggaagagcacaatagctgctaccgtaattac 15333429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12519566 - 12519394
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  12519566 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaagcatcgatcaggcca 12519467  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| |||||||||||| |||  | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12519466 atggaccgtgtaatggtacgaggttgacaattatacgtctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 12519394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 31510351 - 31510524
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |    
T  31510351 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggt 31510450  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgt 179  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||    
T  31510451 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgt 31510524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 29640180 - 29640354
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |    
T  29640180 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggt 29640279  T
Q  106 tcaca-atagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgt 179  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||    
T  29640280 tcacaccaagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgt 29640354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Original strand, 29641678 - 29641779
Alignment:
Q  185 tatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatt 284  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29641678 tatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgttatt 29641777  T
Q  285 ac 286  Q
    ||    
T  29641778 ac 29641779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Original strand, 31511842 - 31511943
Alignment:
Q  185 tatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatt 284  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31511842 tatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactatgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaatt 31511941  T
Q  285 ac 286  Q
    ||    
T  31511942 ac 31511943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30881394 - 30881318
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30881394 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaa 30881318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27192556 - 27192276
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27192556 gaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatt 27192457  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  27192456 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtgggatgtccggctatgctgatgagaaacatcga 27192357  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27192356 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 27192276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27842370 - 27842090
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27842370 gaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatt 27842271  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  27842270 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtgggatgtccggctatgctgatgagaaacatcga 27842171  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27842170 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatatctgctaccgtaattac 27842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 24269222 - 24269502
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  24269222 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 24269321  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  24269322 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 24269421  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24269422 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagaccacgatagctgctaccgtaattac 24269502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35609752 - 35609472
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  35609752 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 35609653  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  35609652 tcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcactggttgaaactaagggttggatgtccagttatgctgatgagaaacattga 35609553  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35609552 tcaggccaatggactgtgtagtggtacgaggctgacagttacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 35609472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 17683981 - 17684261
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  17683981 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggt 17684080  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  17684081 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 17684180  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  17684181 tcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctaacagttacacatctagggaagaccacgattgctgctaacgtaattac 17684261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21395437 - 21395157
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  21395437 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 21395338  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | || |||||||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  21395337 tcacgccggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaagctaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacataga 21395238  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21395237 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 21395157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27509441 - 27509169
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||  |    
T  27509441 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctaatgtccaaagcgagtggt 27509342  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| | | |||| | || |||||||||||    
T  27509341 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaatttcaaatcaccggttgaaaataagggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcga 27509242  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctacc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27509241 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgatagtcactcatctagggaagagcacgatagctgctacc 27509169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 41920325 - 41920605
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  41920325 gaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagataaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 41920424  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | ||||||  | |||||||||||    
T  41920425 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcga 41920524  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41920525 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 41920605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 28666324 - 28666605
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  28666324 gaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 28666423  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaac-caagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || |||||||||| | | ||||||  | ||||||||||    
T  28666424 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcg 28666523  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28666524 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 28666605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 37825158 - 37825439
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  37825158 gaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 37825257  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaac-caagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || |||||||||| | | ||||||  | ||||||||||    
T  37825258 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcg 37825357  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37825358 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 37825439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24245782 - 24245640
Alignment:
Q  143 aattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggca 242  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  24245782 aattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgaca 24245683  T
Q  243 gttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24245682 gttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaatta 24245640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24245892 - 24245816
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245892 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 24245816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 288
Target Start/End: Original strand, 54 - 336
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  |    
T  54 gaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgggtgaaaattctgatttccaaaacgagtggt 153  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  154 tcacaatggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccagttgaaactaagggtgggatgtccggttatgctgatgagaaacatcga 253  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattactg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattactg 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 5411 - 5691
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  5411 gaatatatgatgtcactgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 5510  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  5511 tcacaacagaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgatactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 5610  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5611 tcagaccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 5691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 25218717 - 25218997
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  25218717 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 25218816  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  25218817 tcacaccggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 25218916  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25218917 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 25218997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 21113896 - 21114176
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  21113896 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 21113995  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  21113996 tcacaacgaaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 21114095  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21114096 tcaagccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 21114176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30307244 - 30306964
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  30307244 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 30307145  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  30307144 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctgcaattccaaatcacaagttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 30307045  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30307044 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctaacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 30306964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 31978684 - 31978959
Alignment:
Q  11 tatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttcaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||    
T  31978684 tatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtccaaagcgagtggttcaca 31978783  T
Q  111 atagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcagg 210  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||||| |    
T  31978784 tcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaag 31978883  T
Q  211 ccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31978884 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 31978959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 25209184 - 25209464
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |    
T  25209184 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtccaaagctagtggt 25209283  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  25209284 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggtattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 25209383  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25209384 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 25209464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7821905 - 7821625
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  7821905 gaatttatgatgtcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 7821806  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||| || | | | |||||| || |||||||||||    
T  7821805 tcacaccagaatttcttaattgtattaagagctctggaattccaaatcacatgttgaaactaaaggtggaatttccagttatgctgatgagaaacatcga 7821706  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7821705 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 7821625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Original strand, 33861639 - 33861812
Alignment:
Q  113 agaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||     
T  33861639 agaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgct 33861738  T
Q  213 aatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33861739 aatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattac 33861812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14714224 - 14714052
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||   | || ||| || |||||||| ||| ||| ||    
T  14714224 gaatttcttaatggtattaagagctctggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtgggatgtctagttaggctgatgagaaacattgatgaggtca 14714125  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14714124 atggtctgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgcaactgtaattac 14714052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14767469 - 14767350
Alignment:
Q  167 aagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacg 266  Q
    ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14767469 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgccaatggactgtgtaatggtgcgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 14767370  T
Q  267 atagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14767369 atagctgctaccgtaattac 14767350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7781609 - 7781535
Alignment:
Q  212 caatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7781609 caatggactgtgtaatggtactaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 7781535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42232151 - 42231871
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  42232151 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 42232052  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  42232051 tcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 42231952  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42231951 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 42231871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 21070214 - 21070494
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |    
T  21070214 gaatatatgatgtcactgattcctggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatttagatgtccaaagtgagtggt 21070313  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  21070314 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 21070413  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070414 tcaggccaatggactgtgtactgttgcgaggctgaaagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 21070494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 5828707 - 5828987
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  5828707 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggt 5828806  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  5828807 tcacattgtaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactagaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 5828906  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5828907 tcaggccaatggactgcgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgacagctgctaccgtaattac 5828987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 9001297 - 9001577
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  9001297 gaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 9001396  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| | | | |||||| || |||||||||||    
T  9001397 tcacaccggaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatatccagttatgctgatgagaaacatcga 9001496  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9001497 tcaggccaatggactgcgtaatggtactaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaccggaattac 9001577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7036787 - 7036507
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  7036787 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 7036688  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  7036687 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccggttatgctgatgagaaacatcga 7036588  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7036587 tcaaggcaatggactgtgtaatggtactaggctgacaattacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 7036507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 12786130 - 12786411
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  12786130 gaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 12786229  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaac-caagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || |||||||||| | | ||||||  | ||||||||||    
T  12786230 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcg 12786329  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12786330 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 12786411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 12781300 - 12781527
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtc-gatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtat 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  12781300 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtgg 12781399  T
Q  105 ttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || ||||||||||    
T  12781400 ttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcg 12781499  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781500 atcaggccaatggactgtgtaatggtac 12781527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22843871 - 22843795
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22843871 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaa 22843795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 25542945 - 25543221
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  25542945 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggt 25543044  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  25543045 tcacaacgaaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 25543144  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25543145 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaaggaagagcacgatagctgctaccgtaa 25543221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 14192964 - 14193244
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  14192964 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 14193063  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  14193064 tcacgacggaatttcgtaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggttggatgtccagttatgctgatgagaaacattga 14193163  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14193164 tcaggccaatggactgtgtagtggtacaaggctgacagttacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 14193244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27881151 - 27880871
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  27881151 gaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggt 27881052  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  27881051 tcacactggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 27880952  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880951 tcaggctaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 27880871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 30346696 - 30346976
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  30346696 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 30346795  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  30346796 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 30346895  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  30346896 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggttgacagttacacatctagggaagagcacaatagctgctactgtaattac 30346976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37261382 - 37261110
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  37261382 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgaatggt 37261283  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  37261282 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacattga 37261183  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctacc 278  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261182 tcaggccaatggactatgtagtggtacgaggctggaaattacacatctagggaagagcacgatagttgctacc 37261110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 24630013 - 24630293
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||   |    
T  24630013 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggt 24630112  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | | |||| || |||||||||||    
T  24630113 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttgtgctgatgagaaacatcga 24630212  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24630213 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacaatagatgctaccgtaattac 24630293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10025130 - 10024850
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  10025130 gaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 10025031  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  10025030 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggtattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatgga 10024931  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10024930 tcaggccaatgaactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgccaccgtaattac 10024850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39883250 - 39882970
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||  |    
T  39883250 gaatttatgatgtcgttgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattatgatgtccaaagcgagtggt 39883151  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  39883150 tcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacatgttgaaattaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 39883051  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39883050 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 39882970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 8428726 - 8429006
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | | |||||||||||||||||  |    
T  8428726 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattctgatgtccaaagcgagtggt 8428825  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | ||||||  | |||||||||||    
T  8428826 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcga 8428925  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8428926 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 8429006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37372998 - 37372723
Alignment:
Q  11 tatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttcaca 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||    
T  37372998 tatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 37372899  T
Q  111 atagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcagg 210  Q
      |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||| |||    
T  37372898 ccagaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgattagg 37372799  T
Q  211 ccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37372798 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 37372723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3690044 - 3689768
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| || | |||||||  |    
T  3690044 gaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggt 3689945  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  3689944 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 3689845  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3689844 tcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagatgctactgtaa 3689768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 3876743 - 3877019
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| || | |||||||  |    
T  3876743 gaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggt 3876842  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  3876843 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 3876942  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3876943 tcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagatgctactgtaa 3877019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6089230 - 6088997
Alignment:
Q  53 ctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  6089230 ctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttaatatccaaggtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgggatttcaaat 6089131  T
Q  153 caccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatc 252  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||| |||||||    
T  6089130 cactagttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatgaactgtgtaatggtacgaagctgccagtcacacatc 6089031  T
Q  253 tagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6089030 tagggaagagcacgatagttgctactgtagttac 6088997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 15032841 - 15033010
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||| |   |||||| || |||||||||||||||||||    
T  15032841 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcatcggttgaaactaagggtgtgatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcaggcca 15032940  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaat 283  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032941 atggaccgtgtaatggtacgaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaat 15033010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Original strand, 2261274 - 2261446
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | | || ||| || |||||||| ||| ||| ||    
T  2261274 gaatttcttaatggtattaagagctttggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtgggatgtccagttaggctgatgagaaacattgatgaggtca 2261373  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2261374 atggtctgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgcaaccgtaattac 2261446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4051765 - 4051595
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||||| | |    
T  4051765 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcagacaa 4051666  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4051665 atggactgtgtaatagtactaggctgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctcctaccgtagttac 4051595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30314156 - 30313986
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||||  | |    
T  30314156 gaatttcttcatggtattaagacctctggaattccaaatcaccgattgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcaaacaa 30314057  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||| |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30314056 atggactgtgtaatagtactaggttgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 30313986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 17871789 - 17871865
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17871789 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaa 17871865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 28786 - 29066
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  28786 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagtatttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggt 28885  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  28886 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 28985  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28986 tcaggccaatggattgtgtaatggtacaagactgacagttacacatctagggaagagcacaatagctgctaccgtaattac 29066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35855974 - 35855694
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  35855974 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 35855875  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  35855874 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 35855775  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35855774 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 35855694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1860744 - 1860464
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  1860744 gaatatatgatgtcactgattctgggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 1860645  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  1860644 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctatggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgataagaaacatcga 1860545  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860544 tcatgccaatggattgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 1860464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49710240 - 49709960
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  49710240 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 49710141  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  49710140 tcacaccggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacataga 49710041  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49710040 tcaggccattggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 49709960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 55559190 - 55559470
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |    
T  55559190 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggt 55559289  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||| | || |||||||||||    
T  55559290 tcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatttcaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcga 55559389  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55559390 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagatcacgatagctgctaccgtaattac 55559470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38518163 - 38517883
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  38518163 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 38518064  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  38518063 tcacaccaaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 38517964  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38517963 tcaggtcaatggactgtgtaatggtactaggctgaaagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 38517883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 49786980 - 49787260
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  49786980 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 49787079  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||| || |||||||||| | | ||||||  | |||||||||||    
T  49787080 taacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacagattgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcga 49787179  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49787180 tcaggccaatggattgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 49787260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31921433 - 31921260
Alignment:
Q  113 agaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||     
T  31921433 agaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgct 31921334  T
Q  213 aatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31921333 aatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattac 31921260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 787839 - 787667
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  787839 gaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgagatgttcagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcca 787740  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||  |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  787739 atggaacgtgtaatggtacgaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaacgtaattac 787667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19073 - 18791
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||  |    
T  19073 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtgcaaagcgagtggt 18974  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  18973 tcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 18874  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattactg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18873 tcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagctacacatctagggaagagtacgatagctgctaccgtaattactg 18791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 321488 - 321768
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  321488 gaatttatgatatcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 321587  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||    
T  321588 tcacatcagaatttcttaatggtattcagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgataagaaacctcga 321687  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  321688 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 321768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Original strand, 310079 - 310124
Alignment:
Q  241 cagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  310079 cagttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 310124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19519 - 19244
Alignment:
Q  11 tatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttcaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  19519 tatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 19420  T
Q  111 atagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcagg 210  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||||  |    
T  19419 tcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcttg 19320  T
Q  211 ccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19319 ctaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 19244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32000 - 31721
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  32000 gaatttatgatgttgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 31901  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  31900 tcacatcggaatttcttaatggtattaagatctttggaatcccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 31801  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31800 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctaggg-agagcacgatagctgctaccgtaattac 31721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10038707 - 10038427
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |  |    
T  10038707 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgcccaaagcgaatggt 10038608  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  10038607 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaggttgggatgtccagttatgctgatgagaaacattga 10038508  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10038507 tcaggccaatggactgtgtagtggtacgaggctggcaattacacatctagggaagagcacaatagctgctaccgtaattac 10038427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11368714 - 11368433
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactt-tgatgtccaaagcgagtat 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||      
T  11368714 gaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagtctgatgtccagagcgagtgg 11368615  T
Q  105 ttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||| | || ||||||||||    
T  11368614 ttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcg 11368515  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11368514 atcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctactgtaattac 11368433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10000474 - 10000194
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||  |    
T  10000474 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggt 10000375  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  10000374 tcacaacggaattccctaatgatattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 10000275  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10000274 tcgggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattac 10000194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10110667 - 10110387
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||  |    
T  10110667 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggt 10110568  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  10110567 tcacaacggaattccttaatgatattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 10110468  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10110467 tcgggccaatggactgtgtaatggtatgaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattac 10110387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 10968933 - 10969213
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  10968933 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 10969032  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||  ||   | |||||| || ||||||||| |    
T  10969033 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctagaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtggggagtcgagttatgctgatgagaaacatcaa 10969132  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10969133 tcaggccaatggactgtataatggtacgaggctcacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 10969213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13530106 - 13529827
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  13530106 gaatatatgatgtcactgagtccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaattttggtgtccaaagcgagtggt 13530007  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  13530006 tcacaacggaatttcttagtggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgt-ctagtatgctcatgagaaacatcga 13529908  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  13529907 tcaggccaatggattgtgtaatggtatgaggctgacagtcacacatctagggaagagaacgatagctgctatcgtaattac 13529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47693036 - 47692756
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |    
T  47693036 gaatacatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtccagagcgagtggt 47692937  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||| || | | | | |||||| || |||| ||||||    
T  47692936 tcacaacgaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaggggtaggttttccagttatgctgatgagaagcatcga 47692837  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47692836 tcaggtcaatggactgtgtaatggtatgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 47692756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50410238 - 50409959
Alignment:
Q  7 aatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtattt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||  ||    
T  50410238 aatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaatgagagtggtt 50410139  T
Q  107 cacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgat 206  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  50410138 cacagcggaatttctaaatggtattaagagctctggaattccaaatcgctggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgat 50410039  T
Q  207 caggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50410038 cagaccaatggactgagtaatggtacgaggctgaccgttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccataattac 50409959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10237622 - 10237344
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||  |    
T  10237622 gaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaagagtatt-aagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggt 10237524  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||  |||||| || |||||||||||    
T  10237523 tcacaacggaattccttaatgatattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccgt-tatgctgatgagaaacatcga 10237425  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10237424 tcgggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattac 10237344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46913138 - 46912858
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||  |    
T  46913138 gaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtccaaagcgagtggt 46913039  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||| |||||    
T  46913038 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctatggaattcaaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaatatcga 46912939  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  46912938 tcaggccaatggattgtgtaatggtacgaggctgacagttacccatctagggaagagcatgatagctgctatcgtaattac 46912858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11362326 - 11362045
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaa-ctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtat 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||      
T  11362326 gaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtgg 11362227  T
Q  105 ttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | |  ||||| || ||||||||||    
T  11362226 ttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagtcatgctgatgagaaacatcg 11362127  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  11362126 atcaggtcaatggattgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcatgatagctgctactgtaattac 11362045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 286
Target Start/End: Original strand, 41763621 - 41763794
Alignment:
Q  113 agaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||     
T  41763621 agaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgct 41763720  T
Q  213 aatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41763721 aatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattac 41763794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52918133 - 52917998
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  52918133 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 52918034  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctg 141  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52918033 tcacaacggaatttcttaatggtactaagagctctg 52917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32838 - 32665
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  32838 gaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 32739  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgt 179  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| || |||| |||||    
T  32738 tcacaccataatttcttaatggtattaagagctctggaaatccaaatcacaggttgaaactaaaggtgagatgt 32665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 15328876 - 15328995
Alignment:
Q  167 aagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacg 266  Q
    ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15328876 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgccaatggactgtgtaatggtgcgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 15328975  T
Q  267 atagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  15328976 atagctgctaccgtaattac 15328995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32659 - 32597
Alignment:
Q  224 taatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32659 taatggcactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctatcgtaattac 32597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 724 - 1004
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  724 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 823  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| | ||  ||||||||| |   |||||| || |||||||||||    
T  824 tcacatcggaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaagctaaaagtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcga 923  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  924 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacaaatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Original strand, 18021 - 18263
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  18021 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggt 18120  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||    
T  18121 tcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 18220  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttaca 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18221 tcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttaca 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 49088 - 49369
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |    
T  49088 gaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 49187  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaac-caagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || |||||||||| | | ||||||  | ||||||||||    
T  49188 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcg 49287  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49288 atcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattac 49369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 186621 - 186344
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  |    
T  186621 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaat-tctgatgtccaaagcgagtggt 186523  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||   | |||||| || |||||||||||    
T  186522 tctcaacggaattccttaatggtattaagagctctgg--ttccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtctagttatgctgatgagaaacatcga 186425  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  186424 tcaggccagtggactgtgtaatggtacgaggctgacagtttaacatctagggaagaggacgatagctgctaccgtaattac 186344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1067 - 788
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  |    
T  1067 gaatatatgatgtcactgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatgaccagagcgagtggt 968  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | | |||||| || |||||  | ||    
T  967 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaagctaagggtaggatgtccagttatgctgatgagaaatgttga 868  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatta 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  867 tcaggccaatggattgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacaatagctactaccgtaatta 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 182878 - 182599
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| | | || ||||  |    
T  182878 gaatatatgatgtcagtgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatctgatggctagagtgagtggt 182779  T
Q  106 tcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcga 205  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||| || ||||||||| |    
T  182778 tcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcaa 182679  T
Q  206 tcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatta 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  182678 tcaggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctactgtaatta 182599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 165598 - 165317
Alignment:
Q  6 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaa-ctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtat 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||      
T  165598 gaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtgg 165499  T
Q  105 ttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcg 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| | |  ||||| || ||||||||||    
T  165498 ttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagtcatgctgatgagaaacatcg 165399  T
Q  205 atcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  165398 atcaggtcaatggattgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcatgatagctgctactgtaattac 165317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16749 - 16472
Alignment:
Q  8 atatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttc 107  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||| | ||||| | |||||||||||||||||  |||    
T  16749 atatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttttcaatcgagcgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttc 16650  T
Q  108 acaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatc 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||| | |||||| |   ||||||  | |||||||||||||    
T  16649 acaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatgaccggttgaaactaagg-taggatgtccacttatgcttctgagaaacatcgatc 16551  T
Q  208 aggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550 aggccaatgaattgtgcaatggtacaaggctgaaagttacacatctaggaaagagcacgatagttgctaccgtaattac 16472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 126187 - 126016
Alignment:
Q  115 aatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggccaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||  ||||||||||| | | | |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  126187 aattttttaatggtattaagagctctgacgttccaaatcacaggttgaaaataagggtgggatttccagttatgttgatgagaaacatcgatcagaccaa 126088  T
Q  215 tggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  126087 tggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaggaaagagcacgatagttgctaccgtaattac 126016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Original strand, 97083 - 97255
Alignment:
Q  114 gaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccagttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataagaaacatcgatcaggcca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||| | | || ||| || |||||||| ||||||| ||    
T  97083 gaatttcttaatggtattaagagctccagcattccaaatcacaggttgaaattaagggtgggatgtccagttaggctgatgagaaacattgatcaggtca 97182  T
Q  214 atggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  97183 atggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgctatcgtaattac 97255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1700 - 1584
Alignment:
Q  21 ctgattccaggcgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  1700 ctgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttc 1601  T
Q  121 ttaatggtattaagagc 137  Q
    |||||||||||||||||    
T  1600 ttaatggtattaagagc 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1569 - 1471
Alignment:
Q  185 tatgctcataagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaatt 284  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  1569 tatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatgtagggaatagcacgata---gctaccgtaatt 1473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 286
Target Start/End: Original strand, 132262 - 132307
Alignment:
Q  241 cagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattac 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  132262 cagttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccgtaattac 132307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University