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Alignment Overview

Query: NF20384_low_40 (Length: 512)

Name: NF20384_low_40
Description: NF20384
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20384_low_40
NF20384_low_40
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-499)||(38152039-38152531)
chr1 (1-490)||(34739571-34740066)
chr1 (1-483)||(31051129-31051617)
chr1 (1-490)||(31057629-31058124)
chr1 (47-490)||(8092925-8093375)
chr1 (1-490)||(25381614-25382111)
chr1 (21-490)||(25387583-25388057)
chr1 (9-483)||(44409593-44410083)
chr1 (1-483)||(50305781-50306262)
chr1 (1-490)||(1077828-1078304)
chr1 (52-483)||(24926840-24927293)
chr1 (52-483)||(24963788-24964229)
chr1 (54-377)||(27954798-27955123)
chr1 (1-201)||(25275421-25275622)
chr1 (52-160)||(33458326-33458434)
chr1 (52-141)||(4280165-4280254)
chr1 (121-224)||(12183963-12184069)
chr1 (414-483)||(12183670-12183738)
chr1 (1-78)||(12184095-12184172)
chr1 (295-344)||(12183819-12183868)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-483)||(5849116-5849598)
chr7 (1-490)||(3817390-3817885)
chr7 (1-490)||(3811248-3811745)
chr7 (1-490)||(351372-351866)
chr7 (1-490)||(28421038-28421534)
chr7 (1-490)||(35148083-35148584)
chr7 (1-490)||(338966-339451)
chr7 (1-315)||(26383252-26383569)
chr7 (1-490)||(22742004-22742504)
chr7 (1-255)||(35152849-35153103)
chr7 (1-483)||(5979260-5979752)
chr7 (60-466)||(26380751-26381134)
chr7 (1-490)||(43539577-43540065)
chr7 (228-490)||(20238762-20239031)
chr7 (352-491)||(26383568-26383707)
chr7 (200-451)||(15843730-15843988)
chr7 (200-451)||(15860839-15861097)
chr7 (118-274)||(42767505-42767661)
chr7 (253-377)||(35150737-35150862)
chr7 (387-493)||(12803975-12804083)
chr7 (387-490)||(42767374-42767477)
chr7 (93-343)||(18656884-18657132)
chr7 (137-264)||(7608146-7608276)
chr7 (90-177)||(18666881-18666972)
chr7 (387-483)||(30219332-30219428)
chr7 (52-149)||(8824446-8824542)
chr7 (53-150)||(30219501-30219598)
chr7 (296-386)||(3677906-3677995)
chr7 (110-153)||(24689729-24689772)
chr7 (296-353)||(7608324-7608381)
chr7 (387-490)||(18666575-18666676)
chr7 (309-354)||(12803893-12803938)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-490)||(10760729-10761225)
chr3 (1-490)||(38455629-38456125)
chr3 (1-490)||(8331372-8331867)
chr3 (1-490)||(49151197-49151692)
chr3 (1-490)||(49157264-49157759)
chr3 (1-490)||(38449142-38449638)
chr3 (1-487)||(30051184-30051675)
chr3 (1-377)||(10769167-10769544)
chr3 (1-490)||(11839804-11840301)
chr3 (1-490)||(10238291-10238788)
chr3 (1-490)||(10244413-10244910)
chr3 (1-490)||(42191299-42191796)
chr3 (1-490)||(42197241-42197738)
chr3 (1-490)||(17055872-17056367)
chr3 (4-490)||(28964468-28964948)
chr3 (1-490)||(55003491-55003977)
chr3 (30-352)||(26429639-26429964)
chr3 (1-209)||(23138783-23138991)
chr3 (78-490)||(46656341-46656764)
chr3 (164-490)||(48128126-48128451)
chr3 (39-189)||(53071638-53071789)
chr3 (1-209)||(11846343-11846552)
chr3 (1-181)||(24643885-24644066)
chr3 (40-483)||(12108754-12109203)
chr3 (1-341)||(2982458-2982802)
chr3 (199-490)||(13444840-13445141)
chr3 (1-160)||(8474551-8474711)
chr3 (298-490)||(11846142-11846340)
chr3 (1-160)||(34300022-34300181)
chr3 (390-490)||(34300477-34300577)
chr3 (387-490)||(17593361-17593464)
chr3 (52-230)||(17601879-17602058)
chr3 (402-483)||(10766957-10767038)
chr3 (189-490)||(53069133-53069437)
chr3 (9-97)||(9586492-9586579)
chr3 (275-354)||(13837534-13837613)
chr3 (227-289)||(24643818-24643878)
chr3 (179-268)||(13367144-13367233)
chr3 (99-160)||(27103281-27103343)
chr3 (296-354)||(34300371-34300429)
chr3 (227-276)||(17593487-17593537)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-490)||(48166763-48167258)
chr4 (1-490)||(48160544-48161039)
chr4 (9-490)||(6257284-6257771)
chr4 (9-490)||(10739418-10739903)
chr4 (9-490)||(10953187-10953672)
chr4 (1-354)||(26957023-26957378)
chr4 (9-343)||(10733583-10733916)
chr4 (9-343)||(10947352-10947685)
chr4 (1-482)||(24287571-24288059)
chr4 (1-305)||(26971824-26972129)
chr4 (40-479)||(50168218-50168662)
chr4 (39-482)||(44831699-44832152)
chr4 (180-490)||(33458346-33458662)
chr4 (1-335)||(17627019-17627350)
chr4 (180-479)||(33461483-33461787)
chr4 (40-377)||(35177413-35177760)
chr4 (52-490)||(49976236-49976667)
chr4 (61-483)||(19686414-19686833)
chr4 (113-353)||(50155657-50155897)
chr4 (281-490)||(3769436-3769647)
chr4 (387-490)||(10733325-10733428)
chr4 (387-490)||(10947094-10947197)
chr4 (1-94)||(33461797-33461889)
chr4 (227-490)||(4632192-4632471)
chr4 (390-483)||(26963427-26963518)
chr4 (1-94)||(33458672-33458764)
chr4 (52-150)||(50426882-50426980)
chr4 (387-475)||(31986745-31986832)
chr4 (395-469)||(50427353-50427427)
chr4 (296-339)||(50427238-50427281)
chr4 (143-286)||(9237107-9237251)
chr4 (390-441)||(55473245-55473297)
chr4 (296-354)||(32284561-32284619)
chr4 (255-343)||(33045085-33045173)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-490)||(8650882-8651378)
chr6 (1-483)||(21770644-21771139)
chr6 (1-483)||(31756301-31756786)
chr6 (21-490)||(4580400-4580876)
chr6 (21-490)||(25353818-25354291)
chr6 (1-490)||(21190945-21191445)
chr6 (1-490)||(25343211-25343704)
chr6 (1-335)||(30905821-30906156)
chr6 (5-343)||(21783549-21783896)
chr6 (30-354)||(21197250-21197588)
chr6 (126-343)||(21789772-21789999)
chr6 (164-450)||(17581384-17581675)
chr6 (1-172)||(6096895-6097067)
chr6 (1-163)||(17581188-17581350)
chr6 (25-308)||(1105921-1106206)
chr6 (387-490)||(21782832-21782935)
chr6 (387-490)||(32035365-32035468)
chr6 (390-483)||(21783395-21783486)
chr6 (390-483)||(21789618-21789709)
chr6 (52-224)||(12801891-12802063)
chr6 (428-490)||(8662860-8662922)
chr6 (390-483)||(21197107-21197198)
chr6 (391-490)||(18778564-18778663)
chr6 (419-493)||(1106222-1106297)
chr6 (428-483)||(6097999-6098053)
chr6 (122-160)||(1283280-1283318)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-490)||(31001961-31002457)
chr2 (1-490)||(28683024-28683519)
chr2 (1-490)||(30964912-30965408)
chr2 (1-490)||(44716884-44717380)
chr2 (48-490)||(31007985-31008435)
chr2 (1-490)||(13149765-13150264)
chr2 (1-490)||(13455683-13456180)
chr2 (1-490)||(13461624-13462121)
chr2 (1-490)||(36749998-36750495)
chr2 (1-490)||(35084755-35085255)
chr2 (1-490)||(35090728-35091228)
chr2 (1-274)||(35439671-35439945)
chr2 (9-352)||(19879187-19879536)
chr2 (6-221)||(35442187-35442402)
chr2 (121-479)||(11048643-11049010)
chr2 (1-482)||(23343147-23343633)
chr2 (41-263)||(7771500-7771722)
chr2 (90-490)||(29832878-29833288)
chr2 (265-444)||(35438825-35439014)
chr2 (1-128)||(23283827-23283955)
chr2 (90-342)||(28765255-28765508)
chr2 (104-202)||(31651318-31651417)
chr2 (296-343)||(29034702-29034749)
chr2 (93-157)||(8342606-8342671)
chr2 (190-255)||(23284719-23284784)
chr2 (387-439)||(28765558-28765610)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-490)||(28525465-28525960)
chr5 (1-490)||(28531561-28532056)
chr5 (1-490)||(7389627-7390122)
chr5 (9-490)||(41296872-41297357)
chr5 (1-490)||(12686258-12686754)
chr5 (1-490)||(12692360-12692856)
chr5 (1-374)||(30384586-30384959)
chr5 (1-490)||(20499722-20500218)
chr5 (9-490)||(30771876-30772363)
chr5 (52-483)||(19059850-19060298)
chr5 (1-377)||(32094419-32094797)
chr5 (1-377)||(32097220-32097597)
chr5 (52-483)||(19066193-19066632)
chr5 (164-354)||(14609918-14610108)
chr5 (44-217)||(8706745-8706919)
chr5 (21-173)||(14609736-14609888)
chr5 (388-483)||(32094246-32094340)
chr5 (391-483)||(32097047-32097138)
chr5 (298-480)||(26509731-26509920)
chr5 (214-363)||(26318471-26318621)
chr5 (414-490)||(24054338-24054415)
chr5 (414-490)||(30384457-30384532)
chr5 (175-333)||(33753476-33753634)
chr5 (387-441)||(26318381-26318435)
chr5 (390-455)||(8706536-8706601)
chr5 (1-97)||(33753710-33753806)
chr5 (387-441)||(33753381-33753435)
chr5 (387-441)||(33849015-33849069)
chr5 (434-483)||(16215260-16215309)
chr5 (1-106)||(25408435-25408537)
chr5 (441-480)||(28542269-28542308)
chr5 (445-490)||(14610184-14610229)
chr5 (54-143)||(26318676-26318765)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-490)||(1273-1762)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-490)||(5542239-5542736)
chr8 (11-490)||(22219796-22220292)
chr8 (3-490)||(10699616-10700109)
chr8 (6-490)||(10705428-10705917)
chr8 (1-482)||(39735639-39736112)
chr8 (1-490)||(32890472-32890969)
chr8 (1-490)||(32896596-32897093)
chr8 (1-490)||(36818556-36819051)
chr8 (1-354)||(42033382-42033740)
chr8 (1-490)||(14417546-14418021)
chr8 (1-490)||(9934867-9935359)
chr8 (1-490)||(42993083-42993575)
chr8 (1-204)||(39727656-39727859)
chr8 (239-475)||(39727405-39727645)
chr8 (30-233)||(1883185-1883384)
chr8 (387-476)||(1882846-1882937)
chr8 (243-354)||(1883039-1883151)
chr8 (387-490)||(7771210-7771312)
chr8 (52-224)||(17954141-17954316)
chr8 (425-490)||(14799495-14799559)
chr8 (390-479)||(1171327-1171414)
chr8 (131-160)||(11641418-11641447)
chr8 (318-354)||(1171249-1171285)
chr8 (387-423)||(1882960-1882996)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-490)||(172969-173465)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-482)||(11979-12468)
scaffold0208 (1-482)||(6106-6595)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-490)||(698-1173)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-263)||(13857-14121)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (1-289)||(647-937)
scaffold1114 (390-490)||(1068-1168)
[»] scaffold0185 (3 HSPs)
scaffold0185 (52-268)||(5602-5821)
scaffold0185 (295-354)||(5825-5884)
scaffold0185 (431-490)||(5945-6003)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (387-490)||(5512-5615)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (391-490)||(38411-38508)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (30-74)||(1281-1325)
[»] scaffold1064 (1 HSPs)
scaffold1064 (296-375)||(1255-1334)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 38152531 - 38152039
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Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
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T  38152531 ttttattctttattatatttcaatatcatt-atc-ggacaaatattgtaacaataattatattaattatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 38152434  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
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T  38152433 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgaactcaatga-----tgtccggatgacccat 38152339  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
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T  38152338 taacggaataatgggaaacc-taatgaccatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtacacgacaaactcgttcttctccccatctaaag 38152240  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgtt 398  Q
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T  38152239 aaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaagaaccaaattagctgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcattgttgtt 38152140  T
Q  399 gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgtttaata 498  Q
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T  38152139 gagaggattgtcatcaaagtttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgttcaata 38152040  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 34739571 - 34740066
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T  34739571 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgagggccttagttgattagtga 34739669  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  34739670 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 34739769  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||    
T  34739770 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctgtggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctcccaatctgaag 34739869  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||  | ||||       ||||||    
T  34739870 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcattttctctctttggttatcgtt 34739968  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34739969 gttgatgagagggctgccttgaaaggtttattcaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 34740066  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 31051129 - 31051617
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Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31051129 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 31051227  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  31051228 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 31051327  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  31051328 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa 31051427  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  31051428 gagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 31051526  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||| ||| |||| ||| |  |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31051527 tgttgatgaaagggttgctacaaaagttttatccaggtattcttaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatc 31051617  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 31057629 - 31058124
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Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31057629 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 31057727  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31057728 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat 31057827  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  31057828 taacggaataatgggaaaccctaatggccatacaatataaaagaggctatgatccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa 31057927  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| ||| |||||||    ||||       |||||    
T  31057928 gagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgt 31058026  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||| ||| |  |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31058027 tgttgatgagagggttgctacaaaagttttatccaagtattcttaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 31058124  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8093375 - 8092925
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Q  47 gtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaat 146  Q
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T  8093375 gtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattaataatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaat 8093276  T
Q  147 taaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagagg 245  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||| |||||||||||||    
T  8093275 taaatgtttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaacgatcatcaaatataaaagagg 8093176  T
Q  246 ctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagt 344  Q
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T  8093175 ctatggtccccaatataccgaacacggcaaactctcttttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 8093076  T
Q  345 tgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaat 438  Q
     ||||||||| || ||||| | |||||||||||    ||||       |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| || ||||||||||| ||    
T  8093075 cgccgctaaccta-gttgtttgtttcagatcatctcatctctttggttatcgttgttgatgagaggactgctacaaaagctttatccaggtattcctcat 8092977  T
Q  439 accctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
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T  8092976 acccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcatagatccgatcat 8092925  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25382111 - 25381614
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  25382111 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 25382013  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  25382012 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 25381917  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  25381916 cccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 25381817  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  25381816 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 25381718  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  25381717 atcgttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatttcgtagatccga 25381618  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25388057 - 25387583
Alignment:
Q  21 caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25388057 caatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattatttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct 25387959  T
Q  121 a-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaa 217  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||| ||| |||    
T  25387958 aattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaa 25387863  T
Q  218 ccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaa 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25387862 ccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 25387763  T
Q  316 tgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgc 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||||||| |||||||||||     
T  25387762 ggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctgt 25387664  T
Q  410 catcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
      | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25387663 ttttaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 25387583  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 483
Target Start/End: Original strand, 44409593 - 44410083
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||    
T  44409593 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgattaaatta 44409691  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||    
T  44409692 ggtaataaggctattaggtttctaattggataattaattaaatatttaattagttaatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaa 44409791  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaactt 305  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  44409792 taatgagaaaccctaatggccatccaatataaaagaggttatggtccccaatacactatacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaactt 44409891  T
Q  306 gaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt--------atgttgtgtatttcagatca--tggtttctcc--atc--- 389  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||         || ||| | ||||||||||  |  | |||||  |||       
T  44409892 gaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgaagttgatgtttgtttcagatcacctcctctctccttatcgtt 44409991  T
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44409992 gttgttgttgagagggctgccataaaagctttatccaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 44410083  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 50305781 - 50306262
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  50305781 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 50305879  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  50305880 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 50305975  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  50305976 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaattctctcttctccccatc 50306075  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  50306076 tgaagagaacttgaggc-------taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 50306167  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50306168 tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatc 50306262  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 1077828 - 1078304
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  1077828 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 1077926  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
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T  1077927 atcaaattaagtaataagactaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatga 1078022  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |    
T  1078023 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctcaccat 1078122  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgtt 392  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||||||||     ||||           
T  1078123 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagcggccgctaac-tctattgtgtgtttcagatca-----tctc------- 1078209  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
       | |||||||||||  |  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1078210 ---gatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 1078304  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24927293 - 24926840
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattgga----taattaat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||    ||||||||    
T  24927293 aataattatattagctatttatcaatttggagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttataagatttctatttagaatattaattaat 24927194  T
Q  147 taaatatttaattagtta-----tatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaa 241  Q
    ||| || ||||||| |||     ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  24927193 taattaattaattaattaatggatatggactcaatg-gtggatgtctggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaa 24927095  T
Q  242 gaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaat 340  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||  || ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24927094 gaggctatggttcccaatactccatacgtggaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcatataggtaccggttgaggaagaaccaaat 24926995  T
Q  341 cagttgccgctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcagg 428  Q
    ||| |||| |||| |||    ||||   ||| | ||||||||||  |  | |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  24926994 cagctgccactaaccgtgttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctctttatcgttgttgtcgagagtgctgccaccaaagcttcatcttcagg 24926895  T
Q  429 tattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24926894 tattcctaatacgttaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatc 24926840  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24964229 - 24963788
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||  |||||||||     
T  24964229 aataattatattagctatttatcaatttgaagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagcttataagatttctatttagaatattaattaat 24964130  T
Q  151 tatttaattagttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatg 250  Q
    || |||||     ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||    
T  24964129 taattaatgg---atatgaactcaatgggtggatgtctgaatgacccattaacggaaaaatggaaa-ccctaattgtcatctaatataaaagatgctatg 24964034  T
Q  251 gtc-ccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccg 349  Q
     || |||| ||||||||   |||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  24964033 atcaccaagacaccgtatgtggcaaactctctcttctccccatctgaagaggacttgaggcataaatgtactggttgaggaagaaccaaatcagtttcca 24963934  T
Q  350 ctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaa 437  Q
    |||| |||    ||||   ||| | ||||||||||  |  | |||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24963933 ctaaccgtgttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctctttatcgttgttgtcgagagggctaccaccaaagcttcatcttcaggtattcctaa 24963834  T
Q  438 taccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24963833 tactttaattcttactattcttgataaatcaaacatggcgtagatc 24963788  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 377
Target Start/End: Original strand, 27954798 - 27955123
Alignment:
Q  54 taattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatat 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27954798 taattatattagttatttatcaattgtgaggcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaatttgataattaattaaatat 27954897  T
Q  154 ttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatg 250  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||| | |||||  | |||| ||| ||| | |||| | |||||||||||||||| | ||||    
T  27954898 ttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtatggatggctcattagtggaataatgggaaatcataatggtcatccaatataaaagatgttatg 27954997  T
Q  251 gt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgcc 348  Q
     | ||||||||||   ||||| ||| ||  | |||||||||  |||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |    
T  27954998 atccccaatacac---acacgacaatacattctcttctccccatct-gagagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaataactaaatcagtcgtc 27955093  T
Q  349 gctaac-gtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    | ||||  | |||||||| |||||||||||    
T  27955094 gttaacattttgttgtgtgtttcagatcat 27955123  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25275622 - 25275421
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  25275622 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 25275524  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  25275523 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatga 25275428  T
Q  195 cccatta 201  Q
    |||||||    
T  25275427 cccatta 25275421  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33458434 - 33458326
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaat 151  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33458434 aatagttatattggttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataatgctattagatttctaactagataattacttaaat 33458335  T
Q  152 atttaatta 160  Q
    |||||||||    
T  33458334 atttaatta 33458326  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4280254 - 4280165
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  4280254 aataattatattaactatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagattattagatatctaatttgataa 4280165  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12184069 - 12183963
Alignment:
Q  121 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaa 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||| || ||||||| |||| ||  |||    
T  12184069 attagatttctatttggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtagatgtccggatggccaattaacggaataatgagaaa 12183970  T
Q  218 ccctaat 224  Q
    |||||||    
T  12183969 ccctaat 12183963  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12183738 - 12183670
Alignment:
Q  414 aaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12183738 aaagctttattcaggtattcctaatactcaaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatc 12183670  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12184172 - 12184095
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaatt 78  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12184172 ttttattatttaataatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatt 12184095  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12183868 - 12183819
Alignment:
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  12183868 aaagagaacttgaggcataaaggtagcggttgagaaataaccaaatcagt 12183819  T

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Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 5849116 - 5849598
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  5849116 ttttattatt-attatattctaatatcatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtga 5849213  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||    
T  5849214 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgttcggatggtccat 5849313  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||    
T  5849314 taacggaataatgagaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtcctcaatataccgtacacggcaaactctcttttctccccatctgaag 5849413  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgtt 398  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5849414 ataacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagacgccgctaacatatgttgtgtatttcagatcatagtttctccatcgttgttgtt 5849513  T
Q  399 gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5849514 gagagagctgtcattaaagcttcatccaggtattcctaatatcctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 5849598  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3817885 - 3817390
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3817885 ttttattatttattatatttcaatatcatt-atgtaggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 3817787  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3817786 tgaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 3817687  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  3817686 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag 3817587  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||  | ||||       ||||||    
T  3817586 agaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtt 3817488  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3817487 gttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 3817390  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3811745 - 3811248
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcat--ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagc 98  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  3811745 ttttattatttattatattccaatat-atcattatgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagt 3811647  T
Q  99 gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  3811646 gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggccc 3811547  T
Q  198 attaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaa 296  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  3811546 attaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctga 3811447  T
Q  297 agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcg 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||  | ||||       ||||    
T  3811446 agagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctcttttgttatcg 3811348  T
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3811347 ttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 3811248  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 351372 - 351866
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||    
T  351372 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttgattagtga 351470  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  351471 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 351570  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||  | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||    
T  351571 tactggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaag 351670  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca-----tggtttctccatcgttg 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||||||||     |  |||    |||||||    
T  351671 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctcttttggttatcgttg 351769  T
Q  394 ttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  351770 ttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 351866  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28421534 - 28421038
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  28421534 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 28421436  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  28421435 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 28421340  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  28421339 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatc 28421240  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  28421239 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 28421141  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28421140 tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 28421041  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35148584 - 35148083
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtgga-caaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |    
T  35148584 ttttattatttattatattctaatatcatt-atgtggggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattatgagccttagttgattagtg 35148486  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||    
T  35148485 atcaaattaagtaataaggctattggatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggctca 35148386  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  35148385 ttaacagaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatgatccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaa 35148286  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgct-aacgtatgttgtgtatttcagatcat---ggtttctc-----cat 388  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| | | ||| |||||| |||||||||||      |||||       |    
T  35148285 gagaatttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctgaccatattttgtgtgtttcagatcatcccaccttctcatatttgt 35148186  T
Q  389 cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
     |||||||||  ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35148185 tgttgttgttacgagggctaccatgaaagctttatccaggtattcctaatacccctaattcttaatatccttgataaatcaaacgtgtcgtagatccgat 35148086  T
Q  488 cat 490  Q
    |||    
T  35148085 cat 35148083  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 338966 - 339451
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||    
T  338966 ttttattatttcttatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttgattagtga 339064  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  339065 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 339164  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||  | |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||    
T  339165 tactggaataatgggaaa-cctaatggccatccaatataaaagaggtcatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaag 339263  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||| ||    
T  339264 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcatt 339362  T
Q  393 gttgttga-gagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||| |||          | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  339363 gttgttgatgag----------agagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 339451  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 26383252 - 26383569
Alignment:
Q  1 ttttattattt--attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagc 98  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  26383252 ttttattattttaattatatttcaatatcattt-tgtgggcaaatatcataataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagt 26383350  T
Q  99 gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagt-tatatggactcaatgagtggatatctggatgaccc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26383351 gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaatgaatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccc 26383450  T
Q  198 attaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaa 296  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |    
T  26383451 attaatggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccctaatacaccggacacggcaaactctctcttctccctatttga 26383550  T
Q  297 agagaacttgaggcataaa 315  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26383551 agagaacttgaggcataaa 26383569  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22742504 - 22742004
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| ||    
T  22742504 ttttattatttattatattccaatattatt-atgtaggcaaataccgtaacaataattatattagttatttatcaactgtgagccttagttgattagtga 22742406  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22742405 taaaattaagtaataaggctattagatttctaattagataattaattaaatatataagtagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 22742306  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||    
T  22742305 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtctccaatataccgtacatggcaaaactctctcttctcccaatctgaa 22742206  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt----atgttg---tgtatttcagatca--tggtttctcca 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||    ||||||   | | ||||||||||  |  | |||  |    
T  22742205 gagaacttgaggcataaaggtaccagttgatgaaaaaccaaatcagccgccgctaaccgtgttgatgttgatatttgtttcagatcatctcctctcttta 22742106  T
Q  388 tcgttg-ttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22742105 tcgttgtttgtcaagagggctgccaccatagcttcatccaggtattcctaata-cctaatcctcaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 22742008  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  22742007 tcat 22742004  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35153103 - 35152849
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  35153103 ttttattatttattatattccaatgtcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagatatttatcaattgtgagccttagttgattagtga 35153005  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35153004 tcaaattaagtaataaggctattcgatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat 35152905  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc 255  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35152904 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccc 35152849  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 5979752 - 5979260
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggct-ttagttgattagc 98  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||  ||| ||||||||     
T  5979752 ttttattatttaataatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcccttaattgattagt 5979654  T
Q  99 gatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |  |||||    
T  5979653 gatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatggatggatgttcggatg 5979558  T
Q  194 acccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaata-taaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccct 290  Q
     || ||||||  |||| ||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  5979557 gccaattaacagaataatgggaaagtctaatggtcatccaataataaaagaggttatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctcccc 5979458  T
Q  291 gtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc----- 385  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||         
T  5979457 atctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttgg 5979359  T
Q  386 -catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
      |||||||||| |||||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  5979358 ttatcgttgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttaataaatcaaacatgtcgtagatc 5979260  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 466
Target Start/End: Original strand, 26380751 - 26381134
Alignment:
Q  60 tattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatt 159  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  26380751 tattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaaataataaggctattagatttctaattggataattaattga---------- 26380840  T
Q  160 agttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaa-t 258  Q
         |||| |||||||||||| || || |||||||||||       ||| ||| ||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  26380841 -----tatgaactcaatgagtgcatgtccggatgacccat-------ataatgggaaatcttaatggtcatccaatataaaagag-ctatggtccccagt 26380927  T
Q  259 acaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtat 358  Q
    ||| |  ||||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  26380928 acatcagacacgacaaactctctcttctcccgatctgaagaaaactttaggcataaaggtagcagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaacgtaa 26381027  T
Q  359 gttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtt 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||| |    
T  26381028 gttgtgtatttcatatcatggtttcttcatcgttgttgttgagagggttgtcatcaaagcttcatcca-gtactcctaataccctaattcttagcatgct 26381126  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 43539577 - 43540065
Alignment:
Q  1 ttttattattta---ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattag 97  Q
    ||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  43539577 ttttattatttaattttatattccaatatcatt-atgtgtgcaaatatcgtaaaaataattatattaattatttatcatttgtgagccttaattgattag 43539675  T
Q  98 cgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacc 196  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||                 ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43539676 tgatcaaattaagtaataaggtt-ttagatttataat-----------------atttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtctggatgacc 43539757  T
Q  197 cattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctg---t 292  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |    |    
T  43539758 cattaacggaataacggaaaaccctaatggtcacccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtgcacggcaaactctctcttctccttcccat 43539857  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat---------ggttt 382  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||           |||    
T  43539858 ctgaagagaactttaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacctcctctcttt 43539957  T
Q  383 ctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
     |  ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  43539958 gtttatcgttgttgttgagaggattgttatcaaagcttcatccaggtattcataataccctaatttttaatattcttgataaatcaaacatgttgtagat 43540057  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 228 - 490
Target Start/End: Original strand, 20238762 - 20239031
Alignment:
Q  228 catccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20238762 catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 20238861  T
Q  326 gaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagct 419  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       || ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  20238862 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttattgttgttgatgagagggctgccttgaaagct 20238960  T
Q  420 tcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20238961 ttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 20239031  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 352 - 491
Target Start/End: Original strand, 26383568 - 26383707
Alignment:
Q  352 aacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctta 451  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26383568 aacgtatgttgtgtatttcatatcatggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatcaaggtattcctaataccctaattctta 26383667  T
Q  452 atatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatg 491  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26383668 gtatgcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatg 26383707  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 451
Target Start/End: Original strand, 15843730 - 15843988
Alignment:
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccg-tacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||| ||    
T  15843730 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15843829  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||| ||||||    ||||       || ||    
T  15843830 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggttattgt 15843928  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctta 451  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15843929 tgttgattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15843988  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 451
Target Start/End: Original strand, 15860839 - 15861097
Alignment:
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccg-tacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||| ||    
T  15860839 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15860938  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||| ||||||    ||||       || ||    
T  15860939 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggttattgt 15861037  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctta 451  Q
    ||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15861038 tgttgattagagggctgctatgaaagcttgatccaggtattcctaataccctaattctta 15861097  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42767661 - 42767505
Alignment:
Q  118 gctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggac-tcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaa 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |    
T  42767661 gctattagatttttaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttcaatgagtggatgtctggatgatccattaacggaataatagga 42767562  T
Q  216 aaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa 274  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42767561 aaccctaatggccat---atataaaagaggctatggtcccgaatataccgtacacggcaa 42767505  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35150862 - 35150737
Alignment:
Q  253 cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgcta 352  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  35150862 cccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccgcta 35150763  T
Q  353 a-cgtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    | | ||| |||||| |||||||||||    
T  35150762 accatattttgtgtgtttcagatcat 35150737  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 493
Target Start/End: Original strand, 12803975 - 12804083
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattc--aggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatct 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  12803975 atcgttgttgtcgagagggctgctaccaaagcttcatccccaggtattcttaataccctaattcttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatcc 12804074  T
Q  485 gatcatgtt 493  Q
    | |||||||    
T  12804075 gttcatgtt 12804083  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42767477 - 42767374
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42767477 atcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaatatgtcgtagatccga 42767378  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  42767377 tcat 42767374  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18657132 - 18656884
Alignment:
Q  93 attagcgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatat-ttaattagttatatggactcaatgagtggatatctgg 190  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||  |||||||   |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18657132 attagtgatcacattaagtaataaggctaattagatttttatttggataattaattatttaaattaatta---atatggactctatgagtggatgtctgg 18657036  T
Q  191 atgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatc-caatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctcc 288  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||| |||||| | |||| || | |  |||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||| | |||||||     
T  18657035 atgacccattaatacaataatggtaaatcctaat-ggcatcacactgt--aagaggctattgtctccaatgcaccatacacgacaaactttctcttctct 18656939  T
Q  289 ctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    | |||| |||||||||  || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18656938 ccgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcag 18656884  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Original strand, 7608146 - 7608276
Alignment:
Q  137 gataattaattaaatattt-aattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaa 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| | |||| || |||||||||||  ||||||||    
T  7608146 gataattaattaaatattttaattagttgatatggggttaatgagtggatgtccggatgacccattaatgaaataatgaaaaaccctaatgaccatccaa 7608245  T
Q  235 tataaaagaggctatggt-cccaatacaccg 264  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7608246 tataaaagatgttatggtccccaatacaccg 7608276  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18666972 - 18666881
Alignment:
Q  90 ttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggata---attaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatg 177  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18666972 ttgataagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgtatagttattaattaaatttttaattagttgatatggactcaatg 18666881  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 387 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 30219428 - 30219332
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30219428 atcgttgatgctgagatggttgtcatgaaagctttatccagatattcctaataccataattcttaatatctttaataaatcaaacatgtcgtagatc 30219332  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Original strand, 8824446 - 8824542
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8824446 aataattatattagctatttatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaattaggtaataaggatattagatttct-tttagataattaattaa 8824542  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30219598 - 30219501
Alignment:
Q  53 ataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30219598 ataataatagtagttatttattaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataaagttattagatttctaattagatagttaattaaa 30219501  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 386
Target Start/End: Original strand, 3677906 - 3677995
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  3677906 aagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaac-tatgtcgtgtatttcaaatcacagtttctcc 3677995  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 153
Target Start/End: Original strand, 24689729 - 24689772
Alignment:
Q  110 gtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatat 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24689729 gtaataaggctattagatttttaatttgataattaattaaatat 24689772  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Original strand, 7608324 - 7608381
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa 353  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7608324 aagagaacttgagtcataaaggtaccgatttaggaagtaccaaatcagtcgccgctaa 7608381  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18666676 - 18666575
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18666676 atcgttgttggtgagagggttgtcatcagagcttcatgtgtgtattcctaatgtc-taattattaatatcattgctaaatcaaacatgtcgta-atctga 18666579  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  18666578 tcat 18666575  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 354
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12803938
Alignment:
Q  309 gcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  12803893 gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaac 12803938  T

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Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10761225 - 10760729
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  10761225 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtga 10761127  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  10761126 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 10761027  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  10761026 taacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa 10760927  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  10760926 gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 10760828  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10760827 tgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 10760729  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38456125 - 38455629
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  38456125 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtgttagttgattagtga 38456027  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38456026 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat 38455927  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  38455926 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 38455827  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  38455826 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 38455728  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38455727 tgttgatgagagggctgcctcgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcat 38455629  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 8331372 - 8331867
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  8331372 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtggaccttagttgattagtga 8331470  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  8331471 tcaaattaagtaataaggatataagatttctaattggataattaattaaatatttaatcagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat 8331570  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  8331571 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag 8331670  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||| |||||||    ||||       ||||||    
T  8331671 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggttatcgtt 8331769  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
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T  8331770 gttgacgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 8331867  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 49151197 - 49151692
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T  49151197 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 49151295  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
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T  49151296 tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 49151395  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
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T  49151396 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaag 49151495  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||    
T  49151496 agaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt 49151594  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49151595 gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 49151692  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 49157264 - 49157759
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
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T  49157264 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 49157362  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  49157363 tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 49157462  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
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T  49157463 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaag 49157562  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||    
T  49157563 agaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt 49157661  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49157662 gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 49157759  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38449638 - 38449142
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
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T  38449638 tttttttatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 38449540  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38449539 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat 38449440  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
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T  38449439 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 38449340  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
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T  38449339 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 38449241  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38449240 tgttgatgagagggctgcctcgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcat 38449142  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30051675 - 30051184
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
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T  30051675 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtga 30051577  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
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T  30051576 tcaaattaagtaataaagatattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaacgagtggatgtccggatggcccat 30051477  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
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T  30051476 taacggaataatgg-aaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctgcccatctgaag 30051378  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccatcgttgttgtt 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||  | ||| |||||    
T  30051377 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgtcgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttattgtt 30051279  T
Q  399 g------agagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
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T  30051278 gtcgattagagggctgtaatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 30051184  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10769544 - 10769167
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
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T  10769544 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtga 10769446  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
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T  10769445 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 10769346  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
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T  10769345 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 10769246  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  10769245 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtatttcagatcat 10769167  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11840301 - 11839804
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  11840301 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 11840203  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  11840202 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 11840107  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  11840106 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 11840007  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  11840006 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 11839908  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11839907 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 11839808  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10238788 - 10238291
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  10238788 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 10238690  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  10238689 ttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 10238594  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  10238593 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 10238494  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||| |||||    ||||           
T  10238493 ctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcatatcatatcctctctttggtt 10238395  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238394 atcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 10238295  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10244910 - 10244413
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  10244910 ttttattatttaataatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 10244812  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  10244811 ttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 10244716  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  10244715 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 10244616  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||| |||||    ||||           
T  10244615 ctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcatatcatctcctctctttggtt 10244517  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10244516 atcgttgttgatgagagggctgtcttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 10244417  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42191796 - 42191299
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  42191796 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 42191698  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
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T  42191697 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 42191602  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
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T  42191601 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 42191502  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  42191501 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42191403  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42191402 atagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 42191303  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42197738 - 42197241
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  42197738 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 42197640  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  42197639 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 42197544  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  42197543 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 42197444  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  42197443 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42197345  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42197344 atagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 42197245  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17056367 - 17055872
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  17056367 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattatctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 17056269  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  17056268 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatg- 17056174  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    || ||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  17056173 cctattaacggaataatgggaaaccctaatggacatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaactctctcttctccccatc 17056074  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctcca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||        |||    |    
T  17056073 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctatctttggtta 17055975  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
     |||||||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17055974 ccgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 17055875  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 490
Target Start/End: Original strand, 28964468 - 28964948
Alignment:
Q  4 tattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatca 103  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  28964468 tattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgtgagccttagttgattagtgatca 28964566  T
Q  104 aattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaa 202  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  28964567 aattaagtaataaagttattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggtccattaa 28964666  T
Q  203 cgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagaga 301  Q
    || |||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||    
T  28964667 cggaataatgagaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggaaaactctctcttctccccatctgaagaga 28964766  T
Q  302 acttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctccat---cgttgttgtt 398  Q
    ||| |||||||        |||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |  ||| | ||||||||||   |||||| ||    |||| | ||    
T  28964767 actcgaggcat--------cggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaacactttatgtttgtttcagatca-cctttctctattcatgttgctttt 28964857  T
Q  399 gagagggctgccatcaaagcttc-attcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28964858 gaga-ggcttccatcaaagcttcaatccaggtattcctaat-ttctaactattgatatctttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 28964948  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 55003977 - 55003491
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||| || ||||| |    
T  55003977 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatttattagtg 55003879  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  55003878 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatga 55003783  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||       | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  55003782 cccattaacggaataatgggaaac-------gtcatccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatc 55003690  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||       |    
T  55003689 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgag---gaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtatttcagatcatcttttctctttggtta 55003594  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  55003593 tcgttgttgattagagggctgctatgaaagctttatccagatatttctaataccctaattcttaatatacttgataaattaaacatgtcgtagatccgat 55003494  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26429964 - 26429639
Alignment:
Q  30 ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatt 128  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26429964 ttatgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatt 26429865  T
Q  129 tcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat 224  Q
    ||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26429864 tctattttggataattaat----tatttaattagttgatatgggctcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaat 26429769  T
Q  225 agccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccg 322  Q
     | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26429768 ggtcatccagtataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccg 26429669  T
Q  323 gttgaggaagaaccaaatcagttgccgcta 352  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26429668 gttgaggaagaaccaaatcagccgccgcta 26429639  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23138991 - 23138783
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  23138991 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 23138893  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23138892 tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccat 23138793  T
Q  200 taacgtaata 209  Q
    ||||| ||||    
T  23138792 taacggaata 23138783  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 78 - 490
Target Start/End: Original strand, 46656341 - 46656764
Alignment:
Q  78 tgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaat 176  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  46656341 tgtgagctttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgtactcgat 46656440  T
Q  177 gagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatgg-tcccaatacaccgtacacggcaaa 275  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||      |||    
T  46656441 gagtggatgtccggatgacctattaacggaataatgggaaaccctattggttatccaatataaaagaggttatggttcccaatacaccgta------aaa 46656534  T
Q  276 ctctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg-tgtatttcagat 374  Q
    |  | |||||||||  ||| || |||| | ||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||| | ||||||  | ||||||| ||| ||||| ||    
T  46656535 cattctcttctccccatctgaatagaattagagacataaaggtgccggttaaggaagagccaaatcaatcgccgctggcatatgttgatgtgtttcatat 46656634  T
Q  375 catggtttctcc--------------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttg 460  Q
     ||    |||||              ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||    
T  46656635 tatatcatctcctctccttgttttagatcgttgttgttgagagggttgtcatgaaagcttcattcaggtatttctaataccctcattctcaatatcattg 46656734  T
Q  461 ataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46656735 ataaatcaaacatatcgtagatccgatcat 46656764  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48128451 - 48128126
Alignment:
Q  164 atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48128451 atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatatac 48128352  T
Q  263 cgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg 362  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||    
T  48128351 cgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaacat-tgttg 48128253  T
Q  363 tgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcc-taataccctaattcttaatatgttt 459  Q
    | | || |||||||  |  ||| |  | |||||||||   ||| |||||||| |||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  48128252 tttgttccagatcacctcatttttttaccgttgttgt---gagagctgccatgaaagtttta-tcaggtattccaaaataccctaattcttaatattctt 48128157  T
Q  460 gataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48128156 aataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcat 48128126  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53071789 - 53071638
Alignment:
Q  39 caaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgga 138  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071789 caaatatcataacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgga 53071690  T
Q  139 taattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53071689 taattaattgaatatttaattagttgatatgaactcaatgagtggatgtctg 53071638  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11846552 - 11846343
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||| | |||||| ||    
T  11846552 ttttattatttaataatattccatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatggattagtga 11846454  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11846453 tcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatattgagtcaatgagtggatgtccggatggccca 11846354  T
Q  199 ttaacgtaata 209  Q
    |||||| ||||    
T  11846353 ttaacggaata 11846343  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24644066 - 24643885
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |    
T  24644066 ttttattattttattatattccaatattatt-atgtgggcaaatatcctaacaataattacattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtg 24643968  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtg 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  24643967 atcaaattaagtaacaaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaacgagtg 24643885  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12109203 - 12108754
Alignment:
Q  40 aaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggat 139  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||||||| |||    
T  12109203 aaatatcgtaataataattgtattagttatttatcaattgtgatctttaattgattagtgataaaattaagtgataatgttataag-tttctaattagat 12109105  T
Q  140 aattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaata 236  Q
    |||| |||||| |||| |||| || |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||| | |||||| |||| ||  |||    ||| | ||| |||||    
T  12109104 aattgattaaacatttgattaattgatatggactcaatatgagttgatgtctagatgactcgttaacggaataatgagaaataacaatggtcattcaata 12109005  T
Q  237 taaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac 335  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||  |||     |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  12109004 taaaagagagtacggtcctcaatacatcgtacacggcaaactatcttttcttccgatct-----gaacttgaggcataaaggtaccggttaaagaagaac 12108910  T
Q  336 caaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca--tggtttctcc-------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattca 426  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |  | |||||       | ||||  |||| ||| || || ||| | |||||||||||    
T  12108909 caaatcagtcgccgctaacctatgttgtgtgtttcatatcacctcatctctccgtttcagaccgttcatgttcagaaggttgtcattagagcttcattca 12108810  T
Q  427 ggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12108809 ggtattcttaata-cctaattgttaatatccttgataaatcaaacatgtcttagatc 12108754  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2982802 - 2982458
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | | || ||| |||||||| |    
T  2982802 ttttattatttaattatatttcgatatcatt-atgcgaacaaatattgtaataataattatataatctatttatcaatagcgagccttatttgattagtg 2982704  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaat--gagtggatatctggatgac 195  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||  || || |||||||    
T  2982703 atcaaattaaataataaagatatttagatttctaattgaaaaattaattaaatatttaattagttgatataaactcaatacgagtatatgtcaggatgac 2982604  T
Q  196 ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtct 294  Q
    |||||||   |||| | ||||| ||||||  ||| | |||||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||| |||||| | |||||||| |||    
T  2982603 ccattaaaagaataat-gaaaatcctaatgaccaacaaatataaaagaggtcatggtcccaaatataccatatacggcgaactctcttttctccctatct 2982505  T
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatc 341  Q
     |||||||||| || ||||||  |||   |||| |||||||||||||    
T  2982504 gaagagaacttaagacataaagatacttattgaagaagaaccaaatc 2982458  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 490
Target Start/End: Original strand, 13444840 - 13445141
Alignment:
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaa 296  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  | | | ||| |||||||||  ||| |    
T  13444840 ttaacgaaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaataggttatggtccccaatacaccgtacacaacgatattctctcttctccccatctga 13444939  T
Q  297 agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc---------a 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||| |||  ||||||||||    |||||         |    
T  13444940 agagaacttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaaccc-tgttttgtggttcagatcatcacatctcctctttgttta 13445038  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    | ||||||  |||||| |||| ||| || | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13445039 tggttgttactgagagagctgtcatgaatgttttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 13445138  T
Q  488 cat 490  Q
    |||    
T  13445139 cat 13445141  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8474711 - 8474551
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggc-tttagttgattagc 98  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  8474711 ttttattatttaattatatttcgatatcatt-atgtgaacaaatatcgtaataataattatattaacttttaatcaattgtgggcctttaattgattagt 8474613  T
Q  99 gatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8474612 gatcaaattaagtaataatgttattagatttataattcaataattaattaaatatttaatta 8474551  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 298 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11846340 - 11846142
Alignment:
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc------atcg 390  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||  | ||||       ||||    
T  11846340 gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcg 11846242  T
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11846241 ttgttgatgagagggctgttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatacttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 11846142  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 34300022 - 34300181
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||      
T  34300022 ttttattattttattatttttcgatatcatt-acgtgggcaaacatcataataataattatattaactatttatcaattgtgagaattaattgattagta 34300120  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    ||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34300121 attgaattaagtaataagactattaaatttttaattggataattaattaaatatttaatta 34300181  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 390 - 490
Target Start/End: Original strand, 34300477 - 34300577
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatca 489  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34300477 gttgctgttgagagggttgccatgaaagcttaattcaggtattcctaataccctaattcttaatatcctttataaatcaaatatgtcgtagatccgatca 34300576  T
Q  490 t 490  Q
    |    
T  34300577 t 34300577  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17593464 - 17593361
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17593464 atcgttgttgatgagagggctgcctcgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatattcttgataaattaaacatgtcgtagatccga 17593365  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  17593364 tcat 17593361  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17602058 - 17601879
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaa 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||       
T  17602058 aataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtggtcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat--- 17601962  T
Q  150 atatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccat 230  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| || | |||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||    
T  17601961 -tatttaattagttgatatggactcaacatgattggatgtccgaatgacccattaacggaataatgacaaaccctaatggccat 17601879  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 402 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 10767038 - 10766957
Alignment:
Q  402 agggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10767038 agggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 10766957  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 53069437 - 53069133
Alignment:
Q  189 ggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaa--gaggctatggtcc-caatacaccgtacacggcaaactctttcttc 285  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||   | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53069437 ggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatgatcgtccaatataaaaaagaggctatggtcctcaatacaccgtacatggcaaactctctcttc 53069338  T
Q  286 tccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat---ggtt 381  Q
    ||||  ||| |||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||| |||||||||||      |    
T  53069337 tccccatctgaagagaact----------aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacacct 53069248  T
Q  382 tctc--catcgttgttgttg---agagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt 475  Q
    ||||  | | ||||||||||   ||| | || |||| |||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53069247 tctcatctttgttgttgttgttaagatgactaccatgaaagttttatccaggtattcttaatacccctgattcttaatatccttgataaatcaaacatgt 53069148  T
Q  476 cgtagatctgatcat 490  Q
    | |||||| ||||||    
T  53069147 catagatccgatcat 53069133  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9586579 - 9586492
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattag 97  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9586579 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattag 9586492  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Original strand, 13837534 - 13837613
Alignment:
Q  275 actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13837534 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 13837613  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24643878 - 24643818
Alignment:
Q  227 ccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  24643878 ccatccaatataaaagaggctatggccccaatacaccgt--acgacaaactctctcttctccc 24643818  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13367233 - 13367144
Alignment:
Q  179 gtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtaca 268  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13367233 gtggatgtctggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatat-aaagaggctatggtccccaatataccgtaca 13367144  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27103343 - 27103281
Alignment:
Q  99 gatcaaattaagtaataaggctatta-gatttctaattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27103343 gatcaaataaagtaataagacaattaagattttaaattggataattaattaaatatttaatta 27103281  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 34300371 - 34300429
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34300371 aagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaac 34300429  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17593537 - 17593487
Alignment:
Q  227 ccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaac 276  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17593537 ccatacaatataaaagaggctctggtcccaaatataccgtacacggcaaac 17593487  T

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Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 48166763 - 48167258
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48166763 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 48166861  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  48166862 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgttcggatggcccat 48166961  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  48166962 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 48167061  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  48167062 gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 48167160  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48167161 tgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 48167258  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 48160544 - 48161039
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  48160544 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 48160642  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  48160643 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgttcggatggcccat 48160742  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  48160743 taacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 48160842  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  48160843 gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 48160941  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48160942 tgttgatgagagggctgttacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 48161039  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6257771 - 6257284
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  6257771 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 6257673  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  6257672 agtaataaagctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatgggctcaatgagtggatatccggatggcccattaacggaa 6257573  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaactt 305  Q
    || ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  6257572 taatgg-aaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaactt 6257474  T
Q  306 gaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcgttgttgttg 399  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||        |||    |||||||||| ||    
T  6257473 gaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctcactttggttatcgttgttgatg 6257375  T
Q  400 agagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6257374 agagggctgctacgaaagctttatccaggtattcctaatatcctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgttgtagatccgatcat 6257284  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10739903 - 10739418
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Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10739903 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 10739805  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  10739804 agtaataaggctattagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaa 10739705  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttg 306  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  10739704 taatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttg 10739607  T
Q  307 aggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttga 400  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||| |||||    ||||       |||||||||| |||    
T  10739606 aggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatga 10739508  T
Q  401 gagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10739507 gagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 10739418  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10953672 - 10953187
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10953672 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 10953574  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  10953573 agtaataaggctattagatttctgattggataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaa 10953474  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttg 306  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  10953473 taatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttg 10953376  T
Q  307 aggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttga 400  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||| |||||    ||||       |||||||||| |||    
T  10953375 aggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggttatcgttgttgatga 10953277  T
Q  401 gagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10953276 gagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 10953187  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26957378 - 26957023
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||    
T  26957378 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattaattagtga 26957280  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  26957279 tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggctcat 26957180  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  26957179 taacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 26957080  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26957079 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac 26957023  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10733916 - 10733583
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10733916 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 10733818  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
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T  10733817 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaa 10733718  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttg 306  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  10733717 taatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttg 10733620  T
Q  307 aggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10733619 aggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcag 10733583  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10947685 - 10947352
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10947685 tttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 10947587  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||    
T  10947586 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaa 10947487  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttg 306  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  10947486 taatgggaaaccctaatggccatccaatat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttg 10947389  T
Q  307 aggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10947388 aggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcag 10947352  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 24287571 - 24288059
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |    
T  24287571 ttttattatttaataatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttataaattgtgagccttaattgattagtg 24287669  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    || |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  24287670 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgga----tatttaaatatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 24287765  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  24287766 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatgtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatc 24287865  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  24287866 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 24287964  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
    ||||||||| | |||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  24287965 tcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagat 24288059  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26972129 - 26971824
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||    
T  26972129 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtga 26972031  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  26972030 tcaaattaagtgataaggatattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtctggatggtccat 26971931  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  26971930 taacggaataatgg-aaaccctaatggccatccaatataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 26971832  T
Q  298 gagaactt 305  Q
    ||||||||    
T  26971831 gagaactt 26971824  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 479
Target Start/End: Original strand, 50168218 - 50168662
Alignment:
Q  40 aaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggat 139  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50168218 aaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtggtcaaatcaagtaacaaggctattagatttctaattggat 50168317  T
Q  140 aattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatata 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  50168318 aattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgaccgaatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcattcaatata 50168417  T
Q  239 aaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaacca 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  50168418 aaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctcttttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtacc-gttgaggaagaacta 50168516  T
Q  338 aatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagat--catggtttctc-catcgttgttgttg-agag-ggctgccatcaaagcttcattcaggtatt 432  Q
    |||||   ||||||||    |||||| | ||||||||  |||  | ||||  || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  50168517 aatcaaccgccgctaatccttgttgtttgtttcagatcacatcctctctctgattgttgttgttgttgagtggctgccatgaaagcctcaaccaggtatt 50168616  T
Q  433 cctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgta 479  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50168617 ccttata-cctaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgta 50168662  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44832152 - 44831699
Alignment:
Q  39 caaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattgga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||    
T  44832152 caaatattgtaacaataattatattagttatttatcaattatagatcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggttataagatttttaattaga 44832053  T
Q  139 taattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||| | | |||||||||| | ||||||||||    
T  44832052 taattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtgcatgtccggatggtccattaacggaataattggaaaccctaatggtcatccaatat 44831953  T
Q  238 aaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaacc 336  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    |||||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44831952 aaaagaggctatggtccccaatataccgaacac----aactctctcttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgaggaagaacc 44831857  T
Q  337 aaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat-ggtttctc----------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatt 424  Q
    | |||||  | |||||| | ||| |||||| |||||||||||    |||||           ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  44831856 acatcagccgtcgctaaccctattttgtgtgtttcagatcatcaccttctctctctctgtttatcgttgttgttgagagggttgttatcaaagcttcatc 44831757  T
Q  425 caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  44831756 taggtattcttaataccctagttcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagat 44831699  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33458662 - 33458346
Alignment:
Q  180 tggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactc 278  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||     
T  33458662 tggatgtctggatggcccattaacgaaataatgcgaaaccctaacggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactt 33458563  T
Q  279 tttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatg 378  Q
    | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  33458562 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatc 33458464  T
Q  379 gtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaaca 472  Q
       ||||       |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33458463 tcatctctttggttatcgttgttgatgagagggctgctaagaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaaca 33458364  T
Q  473 tgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  33458363 tgtcgtagatccgatcat 33458346  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17627350 - 17627019
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||||||| |    
T  17627350 ttttattatttaataatatttcgatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaataataattatattagctatttatcgattgtgagtctgaattgattagtg 17627252  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  17627251 attaaattaagtaataagcctattagatttccaattagataattaattaaatatttgattaattaatatggactcaatgaggggatgtcaggatgaccca 17627152  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| |   |  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||     ||  | |||||||||  ||| ||    
T  17627151 ttaacggaataattgaaaaccctaatggttgttaaatataaaagaggccatgatccccaatacacagtacac-----acattctcttctccccatctgaa 17627057  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac 335  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17627056 gagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaagaac 17627019  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33461787 - 33461483
Alignment:
Q  180 tggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactc 278  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  33461787 tggatgtccggatgactcattaacgggataatgggaaaccctgatgatcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggtaaactc 33461688  T
Q  279 tttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatg 378  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  33461687 tctcttctccccatctgaaaagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatc 33461589  T
Q  379 gtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaaca 472  Q
       ||||       |||||||||| ||||||||||||    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33461588 tcatctctttgattatcgttgttgatgagagggctgctgcaaaagctttatccagatattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaaca 33461490  T
Q  473 tgtcgta 479  Q
    |||||||    
T  33461489 tgtcgta 33461483  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 377
Target Start/End: Original strand, 35177413 - 35177760
Alignment:
Q  40 aaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgg----gctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaatt 135  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||     || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35177413 aaatatcgtaataataattatattagatatttatcaattatgaacgagcattaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctgttagttttctaatt 35177512  T
Q  136 ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaat--gagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatcc 232  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| | |||| ||  |||||||||| | |||||    
T  35177513 agataattatttaaatatttaatttgttgacatggactcaatacgagtgtatgtctggatgacctattaaaggaataatgagaaaccctaatggtcatcc 35177612  T
Q  233 aatataaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggca--aactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgagg 329  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||  || ||  |  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35177613 aatataaaagaggttatagtcctcaatacaccgtacacaacaataaatc-atggtctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgaga 35177711  T
Q  330 aagaaccaaatcagttgccgctaac-gtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    || || ||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  35177712 aataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttcagatcat 35177760  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 490
Target Start/End: Original strand, 49976236 - 49976667
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||  |||||||||     
T  49976236 aataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttttgtttagaatattaattaat 49976335  T
Q  151 tatttaattagttatatggactcaat--gagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggcta 248  Q
    || |||||     ||||||| |||||  | |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49976336 taattaatgg---atatggattcaatatgggtggatgtctggatgac--------gtaataatggaaaaccctaatggccatccaatataaaagaggtta 49976424  T
Q  249 tggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgcc 348  Q
    |||||    | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  49976425 tggtc----tccaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa-gtacc-gttgaggaagaaccaaatcagccgcc 49976518  T
Q  349 gctaa--cgtatgttgtgtatttcagatcat---------ggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaa 437  Q
    |||||  | ||| |||||| ||| |||||||           ||| |  ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  49976519 gctaacccttattttgtgtgtttgagatcatcacctcctctctttgtttatcgttgttgttgagaggagtgttatcaaagcttca-tctggtattcctaa 49976617  T
Q  438 taccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||| ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49976618 tactctaa---ttattatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 49976667  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19686833 - 19686414
Alignment:
Q  61 attagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  19686833 attagctatttatcgattgtgtgtcttaattgattagtgatcaaattaaataataagactgttaaatttataataaaataattaattgaatatttaatta 19686734  T
Q  161 gtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaata 259  Q
     || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  19686733 attgatatgaactcaagcagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatgagaaaccctactgaccatccaatataaaagagactatagtctcaata 19686634  T
Q  260 caccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatg 359  Q
    || |  ||| |||||||||| ||||||||   ||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||| |       ||     
T  19686633 catc--acaaggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacgaaccaaatcagctgctg-------ata 19686543  T
Q  360 ttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaat 453  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||       ||| ||| |||||| | | ||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19686542 ttgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtgatcattgctgttgaaatgtctgtcatcaaagctttgttca-gtattcataatacccgaattcttaat 19686444  T
Q  454 atgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  19686443 atgcttgattaatcaagcatgttgtagatc 19686414  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 353
Target Start/End: Original strand, 50155657 - 50155897
Alignment:
Q  113 ataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| || |||||| ||||||||| | || |    
T  50155657 ataaggctattagatttttaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactc---gagtggatgtccggatgatccattaacgaactaat 50155753  T
Q  212 ggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttc-ttctccctgtctaaagagaacttgagg 309  Q
    |  ||||| ||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||   ||| || ||||||| |||    
T  50155754 gagaaaccataatgatcatccaatataaaagaagttatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaagg 50155853  T
Q  310 cataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa 353  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  50155854 cataaaggtaccagtcgagaaagaatcaaatcagccgccgctaa 50155897  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 490
Target Start/End: Original strand, 3769436 - 3769647
Alignment:
Q  281 tcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggt 380  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |    
T  3769436 tcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaacctatgttgtgtatttcacatcacgat 3769535  T
Q  381 ttctcc------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatg 474  Q
    |||| |      ||||||| ||||||||||    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||    
T  3769536 ttcttctctgtgatcgttgctgttgagagg---accatcaaagcctcattcaagtattcctaata-cctaattattaatatccttgattaatgaaacatg 3769631  T
Q  475 tcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3769632 tcgtagatccgatcat 3769647  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10733428 - 10733325
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10733428 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 10733329  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  10733328 tcat 10733325  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10947197 - 10947094
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10947197 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 10947098  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  10947097 tcat 10947094  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33461889 - 33461797
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgat 94  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33461889 ttttattatttattatattccaatatc-tttatgtgggcaattatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgat 33461797  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 490
Target Start/End: Original strand, 4632192 - 4632471
Alignment:
Q  227 ccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||| ||| | |||||| |   ||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4632192 ccatccaatataaaagaggttatggtccccaatatacagtacatgacaatactttctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggt 4632291  T
Q  325 tgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcaga-------tcatggtttctcc---------atcgttgttgttgagagggctg 408  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||       ||||    |||||         || ||||||||||| |||| ||    
T  4632292 tgaggaagaaccaaatcagaagccgctaac-tatgttttgtgtttcagaattcagatcatcacatctcctatttgtttatggttgttgttgaaagggttg 4632390  T
Q  409 ccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
     ||| ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4632391 tcatgaaagctttatccaagtatttctgataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 4632471  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 26963518 - 26963427
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26963518 gttgttgttgagagggctaccataaaagctttatccaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 26963427  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33458764 - 33458672
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgat 94  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  33458764 ttttattatttattatattccaatatcctt-atgtgggcaattatcgtaacaataattatattaactatttatcaattgtgagccttagttgat 33458672  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 50426882 - 50426980
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||  ||||||||||||||    
T  50426882 aataattatattagttatttatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagttattaaattttcaatgagataattaattaaa 50426980  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31986832 - 31986745
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt 475  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||    
T  31986832 atcgttgttgttgaaagggccgccatcaaaacttcattcagatattcctaata-cctaattattgttatccttgataaatcaaacatgt 31986745  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 469
Target Start/End: Original strand, 50427353 - 50427427
Alignment:
Q  395 tgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaa 469  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  50427353 tgttgagagggcttccatgaacgctatatccaggtattcctaataccctaattcttaatcttcttgataaatcaa 50427427  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 339
Target Start/End: Original strand, 50427238 - 50427281
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaa 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50427238 aagagaagttgaggcataaatgtaccggttgagtaagaaccaaa 50427281  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 286
Target Start/End: Original strand, 9237107 - 9237251
Alignment:
Q  143 taattaaatatttaatt--agttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatc-caatataa 239  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||| ||||  ||||| || |||      
T  9237107 taattaattatttaattgaagtgatatggactctatgagtggatgtctggatgaccaattaacgggataatgg-aaaccttaatgaccatcacactat-- 9237203  T
Q  240 aagaggctatg-gtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttct 286  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  9237204 aagaggctatgattcccaatacattgtacacgacaaactctttgttct 9237251  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 55473297 - 55473245
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagc-ttcattcaggtattcctaatacc 441  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  55473297 gttgttgttgagagggctaccatcaaaactttaattcaggtattcctaatacc 55473245  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 32284561 - 32284619
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32284561 aagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaaatcagtcgccactaac 32284619  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 343
Target Start/End: Original strand, 33045085 - 33045173
Alignment:
Q  255 caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    ||||||||||| |||| | || ||| ||||||||  |  | |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  33045085 caatacaccgttcacgacgaattctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcag 33045173  T

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Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8651378 - 8650882
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  8651378 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 8651280  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  8651279 tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccat 8651180  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  8651179 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaa 8651080  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  8651079 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 8650981  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8650980 tgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 8650882  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21771139 - 21770644
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  21771139 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtga 21771041  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  21771040 tcaaattaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatga-ccat 21770942  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||    
T  21770941 taacggaataatgggaaaccctaatggccaaccaatataaaagaggctacggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctcc--atctgaa 21770844  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt--------atgttgtgtatttcagatca--tggtttctcc 386  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||         || ||| | ||||||||||  |  | |||||    
T  21770843 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgttgatgaagttgatgtttgtttcagatcacctcctatctcc 21770744  T
Q  387 --atcg---ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtaga 481  Q
      ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21770743 ttatcgttgttgttgttgagagggctgccataaaagctttattcagatattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtaga 21770646  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31756786 - 31756301
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  31756786 ttttattatttattatatttcaatattatt-atgtggataaatattgtaacaataattatatt-------tatcaattgtgggtcttagttgattagtga 31756695  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31756694 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaataattaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat 31756595  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||  ||| |||    
T  31756594 taa-ggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcaaacacgacaaactctctcttctccccatctgaag 31756496  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatca-----tggtttctc----cat 388  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||| ||||||||||     |  | ||||     ||    
T  31756495 agaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatattgtgtgtttcagatcatcacctcctctctctgtgtat 31756396  T
Q  389 cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31756395 ggttgctgttgagagggctgtcatgaaagctctatccagatattcataataccctaattcttaatatccttgataattcaaacatgtcgtagatc 31756301  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4580876 - 4580400
Alignment:
Q  21 caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4580876 caatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct 4580778  T
Q  121 -attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaa 215  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||| |    
T  4580777 aattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatggga 4580682  T
Q  216 aaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcata 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4580681 aaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcata 4580582  T
Q  314 aatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggct 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||| || |||||||||||    ||||       |||||||||| |||||||| |    
T  4580581 aaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgcgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggtt 4580483  T
Q  408 gccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |  |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4580482 gttacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 4580400  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Original strand, 25353818 - 25354291
Alignment:
Q  21 caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25353818 caatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct 25353916  T
Q  121 -attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaa 216  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  25353917 aattagatttat-tttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgggaa 25354011  T
Q  217 accctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataa 314  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  25354012 actctaatggtcatctaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa 25354111  T
Q  315 atgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttgttgagagggctg 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||||||| |||||||||||    
T  25354112 aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttgatgagagggctg 25354210  T
Q  409 ccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    | |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25354211 ctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 25354291  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21191445 - 21190945
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||| |||||||| ||    
T  21191445 ttttattatttaataatattccatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtga 21191347  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  21191346 tcaaattaagtaatatggctaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgttcggatggccca 21191247  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaa 296  Q
    |||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||| |    
T  21191246 ttaacggaataatgtgaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccttacacggcaatactctctcttctccccatctga 21191147  T
Q  297 agagaact---tgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||| |||||    ||||       |    
T  21191146 agagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcatatcatctcctctctttggtta 21191048  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  21191047 tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtatttctaataccctaattcttaatatctttgataaatcaaatatatcgtagatccgat 21190948  T
Q  488 cat 490  Q
    |||    
T  21190947 cat 21190945  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 25343211 - 25343704
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |    
T  25343211 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgaaccttaattgattagtg 25343309  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgac 195  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  |||||      
T  25343310 attaaattaagtaataaggctaattagatttat-tttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgttcggatggt 25343404  T
Q  196 ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtct 294  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||    
T  25343405 ccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatgtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatct 25343504  T
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------cat 388  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||    
T  25343505 gaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttat 25343603  T
Q  389 cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatc 488  Q
    |||||||| ||| |||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25343604 cgttgttgatgaaagggctgctacaaaagctttatctaggtattcctaatactctaattcttaatat-cttgataaatcaaaaatgtcgtagatccgatc 25343702  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30906156 - 30905821
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  30906156 ttttattattttattatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagta 30906058  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||     
T  30906057 accaaataaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactctatgagtagatgtctggatgatcct 30905958  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatgg-tcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    |||||  |||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| ||    
T  30905957 ttaacagaataatgggaaaccataatggtcatccaatataaaagaggctatggttcccaatacaccgtactcgacaaactctctcttc-ccccatctgaa 30905859  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  30905858 gagaacttgaggcataaatataccaattgaggaagaac 30905821  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21783896 - 21783549
Alignment:
Q  5 attatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaa 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||    
T  21783896 attatttattatattctaatattatt-atgtgggtaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagtcttagtggattagtgatcaa 21783798  T
Q  105 attaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaac 203  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21783797 attaagtaataaaactattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaac 21783698  T
Q  204 gtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt---cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaaga 299  Q
    | |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  21783697 ggaataatgggaaaccctaat-ggcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaaga 21783599  T
Q  300 gaacttgaggcataaatgta------ccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    |||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||    
T  21783598 gaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaagaaccaaatcag 21783549  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21197588 - 21197250
Alignment:
Q  30 ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatt 128  Q
    ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21197588 ttatgtgggtaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaactgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatt 21197489  T
Q  129 tctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagc 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||    
T  21197488 tctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaacctaatggc 21197389  T
Q  228 catccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-----------actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||           ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21197388 catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactcggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 21197289  T
Q  316 tgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
      ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21197288 gataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 21197250  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21789999 - 21789772
Alignment:
Q  126 atttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21789999 atttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaat 21789900  T
Q  225 agccatccaatataaaagaggctatggt---cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgta- 319  Q
     | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  21789899 -ggcatccaatataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaa 21789801  T
Q  320 -----ccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
         ||||||||||||||||||||||||    
T  21789800 aggtgccggttgaggaagaaccaaatcag 21789772  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 450
Target Start/End: Original strand, 17581384 - 17581675
Alignment:
Q  164 atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacacc 263  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   | ||     
T  17581384 atatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaataaccgtccaatataaaagaggctatggtccc--caaact 17581480  T
Q  264 gtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg 362  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||   || ||    
T  17581481 gtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaaccgttgatg 17581580  T
Q  363 tgtatttcagatca--tggtttctc-----catcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattctt 450  Q
    | |  |||||||||  |  | ||||     | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17581581 tttgcttcagatcacctcctctctccttgtcgttgttgttgttgagagggctgtcatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattctt 17581675  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 6096895 - 6097067
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  || ||| |||||||| ||    
T  6096895 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatagtaacaataattatattacttatttgtcaattgtcagccttacttgattagtga 6096993  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaa-ttggataattaattaaatatttaattagtt-atatggact 172  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6096994 tgaaattaagtaataaggctattaaatttctaattttgataattaattaaatatttaattagttgatatggact 6097067  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17581188 - 17581350
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | | |||||||| |    
T  17581188 ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctcaattgattagtg 17581286  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581287 atcaaattaagtaataagactattatggttctaattggataattaattaaatatttaattagtt 17581350  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 1105921 - 1106206
Alignment:
Q  25 atcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctatta 124  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  1105921 atcaattatgtgggcaaatatggtagtaataattatatttgatatttatcaattgtaagttttatttgattagtgttcaaattaaatgataaggctatta 1106020  T
Q  125 gatttctaattggataattaattaaatattt-aattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaacccta 222  Q
     |||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  1106021 aatttttaactacataattaattaaatatttaaattaattaatatggattcaatgagtggatgtccggatgactcattaacgaaataatggaaaaccgta 1106120  T
Q  223 atagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgag 308  Q
    ||   |||  | |||||| |||| ||||||||| | | || ||||||| | ||||| | |||||||||| | | |||||||||||||    
T  1106121 atgatcattgagtataaatgaggatatggtcccca-atactgtacacgtcaaaactttctcttctccctatgtgaagagaacttgag 1106206  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21782935 - 21782832
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21782935 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccagctattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 21782836  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  21782835 tcat 21782832  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32035468 - 32035365
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32035468 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaaggtttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 32035369  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  32035368 tcat 32035365  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21783486 - 21783395
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21783486 gttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 21783395  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21789709 - 21789618
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21789709 gttgttgttgagaggggtgccataaaagctttattcaggtattcctaata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 21789618  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12802063 - 12801891
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggc-tattagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||  |||||||||     
T  12802063 aataattatattagctatttgtcaatttggagccttaattgattagtgatcaatttaagtaataaagcttattagatttctatttagaatattaattaat 12801964  T
Q  151 tatttaattagttatatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat 224  Q
    ||||||||     || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  12801963 tatttaat---ggatttggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaat 12801891  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8662922 - 8662860
Alignment:
Q  428 gtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8662922 gtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 8662860  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21197198 - 21197107
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  21197198 gttgttgttgagagggctgccataaaagatttatccaggtattcataata--ctaattcttgatatccttgataaatcaaacatgttgtagatc 21197107  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 18778564 - 18778663
Alignment:
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatca 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  18778564 ttgttgttaagagggctgccatgaaagttttatccaggtattcctaaaacccctaattcttaatat-attgataaatcaaatacgtcgtagatccgatca 18778662  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 493
Target Start/End: Original strand, 1106222 - 1106297
Alignment:
Q  419 ttcattcaggtattcctaataccct-aattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcatgtt 493  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1106222 ttcattgaggtattcctaataccttgaattattaatattcttgatgaatcaaacatgttgtagatccgatcatgtt 1106297  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 428 - 483
Target Start/End: Original strand, 6097999 - 6098053
Alignment:
Q  428 gtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6097999 gtattcctaataccctaattcttaacat-cttgataaatcaaacacgtcgtagatc 6098053  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 160
Target Start/End: Original strand, 1283280 - 1283318
Alignment:
Q  122 ttagatttctaattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1283280 ttagatttctaattggataattaattatatatttaatta 1283318  T

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Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 31001961 - 31002457
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31001961 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 31002059  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31002060 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccat 31002159  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  31002160 taacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaa 31002259  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||        |||    |||||    
T  31002260 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctttttggttatcgt 31002358  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31002359 tgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaataccctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 31002457  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28683519 - 28683024
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28683519 ttttattatttattatatcttaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 28683421  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28683420 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaacatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 28683321  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  28683320 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag 28683221  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc------atcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||| | | |||||| |||||||||||    |||||      ||||||    
T  28683220 agaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgctgttaac-tctattgtgtgtttcagatcatccactctccttggttatcgtt 28683122  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28683121 gttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaataaccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 28683024  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 30964912 - 30965408
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30964912 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 30965010  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  30965011 tcaaattaagtaataagactattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgtccggatggcccat 30965110  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||    
T  30965111 taacggaataatgggaaatcctaatggccatctaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaa 30965210  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  30965211 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggttatcgt 30965309  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30965310 tgttgatgagagggctgctacaaaagatttatacaggtattcctaataccctaattcttaaaataattgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 30965408  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44717380 - 44716884
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  44717380 ttttatgatttattatattccaatatcatt-atgtgggcacatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 44717282  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  44717281 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatataattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatggcccat 44717182  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||| ||    
T  44717181 taacggaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactatctcttctccccatctgaa 44717082  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  44717081 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 44716983  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44716982 tgttgatgagagagctgctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 44716884  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 490
Target Start/End: Original strand, 31007985 - 31008435
Alignment:
Q  48 taacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaatt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31007985 taacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaatt 31008084  T
Q  148 aaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31008085 aaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccgaatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggc 31008184  T
Q  247 tatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagt 344  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31008185 tatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagt 31008284  T
Q  345 tgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaat 438  Q
     ||||||||| | | |||||| |||||||||||        |||    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  31008285 cgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctttttggttatcgttgttgatgagagggctgctacaaaagctttattcaggtattcctaat 31008383  T
Q  439 accctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31008384 accctaattcttgatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 31008435  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13150264 - 13149765
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  13150264 ttttattatttattatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcattagttgattattga 13150166  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  13150165 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtacggatgacccat 13150066  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctcc----ct-gt 292  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    ||  |    
T  13150065 taacggaataatgggaaaccctaatggtcatctaatataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacggcaatattctctcttctcctcatctcat 13149966  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  13149965 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13149867  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13149866 atcgttgttgatgagagggctgctacaaaagtttta-tcaggtattcttaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 13149769  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 13455683 - 13456180
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  13455683 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 13455781  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  13455782 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 13455877  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  13455878 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 13455977  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  13455978 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13456076  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13456077 atagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 13456176  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 13461624 - 13462121
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  13461624 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 13461722  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  13461723 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 13461818  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  13461819 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 13461918  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  13461919 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccaccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13462017  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13462018 atagttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatacccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 13462117  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 36749998 - 36750495
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  36749998 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 36750096  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  36750097 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 36750192  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |    
T  36750193 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccat 36750292  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  36750293 ctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 36750391  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36750392 atcgttgttgattagagggctgctatgaaagttttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 36750491  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35085255 - 35084755
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  35085255 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 35085157  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  35085156 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 35085061  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  35085060 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccat 35084961  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac-------gtatgttgtgtatttcagatca-tggtttct 384  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        | | |||| | ||||||||||    | | |    
T  35084960 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatttatttattgtttgtttcagatcacctctctgt 35084861  T
Q  385 ccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatct 484  Q
      || |||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  35084860 ttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatcc 35084761  T
Q  485 gatcat 490  Q
    ||||||    
T  35084760 gatcat 35084755  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35091228 - 35090728
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  35091228 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggtaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 35091130  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| || |||||     
T  35091129 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatagactcaacatgagtggatgtccggatgg 35091034  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  35091033 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccat 35090934  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac-------gtatgttgtgtatttcagatca-tggtttct 384  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        | | |||| | ||||||||||    | | |    
T  35090933 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctatttatttattgtttgtttcagatcacctctctgt 35090834  T
Q  385 ccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatct 484  Q
      || |||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  35090833 ttattgttgatgctgagagggctgccatgaaagctttatccaggtattcctaatacactaattgttaatattcttgataaatcaaacatgtcgtagatcc 35090734  T
Q  485 gatcat 490  Q
    ||||||    
T  35090733 gatcat 35090728  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35439945 - 35439671
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||  |||||||| ||    
T  35439945 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattcgttatttatcaattgtgagccttgattgattagtga 35439847  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  35439846 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatgaacttaatgagtggatgtccggatggcccat 35439747  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa 274  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35439746 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaa 35439671  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Original strand, 19879187 - 19879536
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19879187 tttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaataataactatattagctatttattaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 19879285  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||    
T  19879286 agtaataaggctattagatttctaattggataaataattaaatatttaattaattgatattgactcaatgagtgaatgtccagatgacccattaacggaa 19879385  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaat-----ataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaagag 300  Q
    || ||| ||| | |||| ||||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||    
T  19879386 taatgggaaa-cttaatggccatccaatataacataaaagaggttatggtcgccaatacatcgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagag 19879484  T
Q  301 aacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgcta 352  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  19879485 aacttgaggcataaaggtaccgattgaagaagaatcaaatcagccgccgcta 19879536  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35442402 - 35442187
Alignment:
Q  6 ttatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaa 105  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||    
T  35442402 ttatttattatattccaatatcatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattcgctatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaa 35442304  T
Q  106 ttaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35442303 ttaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgtccggatgacccattaacg 35442204  T
Q  205 taatagtggaaaaccct 221  Q
     |||| |||||||||||    
T  35442203 gaataatggaaaaccct 35442187  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11049010 - 11048643
Alignment:
Q  121 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaacc 219  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  11049010 attagatttctgattagataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgggtggatgtctggatgacccattaacggaataatgggaaacc 11048911  T
Q  220 ctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggca----aactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataa 314  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  11048910 ctaatggcgatccaatataaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaaccaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataa 11048811  T
Q  315 atgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttg---tgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgc 409  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||   | | ||||||||||  |  | |||  || |||||||| ||||||||||     
T  11048810 aggtaccagttgaggaagaaccaaattagtcgccg-taac-tgtgttgatatttgtttcagatcaccttctctcttgattgttgttgtcgagagggctgt 11048713  T
Q  410 catcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgta 479  Q
    ||| ||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||    
T  11048712 cataaaagctttatccaagtattcctagtgccctaattcttaatatccttggtacatcaaacatgacgta 11048643  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 23343147 - 23343633
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||||| |    
T  23343147 ttttattattttattatattctaatatcatt-atgtggacaaatatcataataataattatattaactatttatcaatttggagccttaattgattagtg 23343245  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattgga-taattaattaaatatttaattagttatatggactcaatga--gtggatatctggatgac 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||         | |  |||||||||||||    |||||| || |||||||    
T  23343246 atcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagagtaattaattaa---------tgg--atatggactcaatataggtggatgtccggatgac 23343334  T
Q  196 ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtct 294  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||    
T  23343335 ccattaacagaataatggaaa-ccctaatgaccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgggaaactctctcttctccccatct 23343433  T
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttct 384  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    ||||   ||| | ||||||||||  |  | | |    
T  23343434 gaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaaccgtgttgatgttgatgtttgtttcagatcacctcctctat 23343533  T
Q  385 ccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
      || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  | || ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23343534 ttattgttgttgtcgagagggctgccaccaaagtttcatctccatgtattcctaataccccaactcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagat 23343633  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7771722 - 7771500
Alignment:
Q  41 aatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggata 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7771722 aatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtaagtcttagttgattactgatcaaattaagtaataaagctattagatttctaattggata 7771623  T
Q  141 attaattaaatatttaattagtt-ata-tggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  7771622 attaattaaatatttaattagttgatacgggactcgatgagtggacgtccggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaatcgtcatccaatata 7771524  T
Q  239 aaagaggctatggtcccaatacacc 263  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  7771523 aaa-aggttatggtcccaatacacc 7771500  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 490
Target Start/End: Original strand, 29832878 - 29833288
Alignment:
Q  90 ttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactc------aatgagtgg 182  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||      ||||||||     
T  29832878 ttgattagtgataaaattaagtaataagactattagacttttaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgggaatgagtga 29832977  T
Q  183 atatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactcttt 281  Q
    || || | ||||||||| |||  |||| ||  |||||||||| | ||| | ||||||   | |||||||| ||||||||||   |||    ||||||| |    
T  29832978 atgtcagaatgacccatcaacagaataatgagaaaccctaatggtcattcgatataa---atgctatggtccccaatacac--gaca----aaactctat 29833068  T
Q  282 cttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcatgg 379  Q
     ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  29833069 attctctctgtctgaagagaacttgaaggataaatgtatcggttgaggaagaaccaaatttagccgccgctaacccgatgttgtgtatttcggatcacgg 29833168  T
Q  380 tttctcc------------atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatc 467  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  29833169 tttctcctctctgattcagatcgttgttgttgagagggttgtcatcaaa-cttcatccaggtattcttaata-cctaattattgttat-cttgataaatc 29833265  T
Q  468 aaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||| || |||| ||||||    
T  29833266 aaacatgttgtcgatccgatcat 29833288  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438825
Alignment:
Q  265 tacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtg 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   || |||     
T  35439014 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccgttgatgtt 35438915  T
Q  365 tatttcagatca--tggtttctcc--atcgttgttgtt------gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacccta 444  Q
    | ||||||||||  |  | |||||  ||||||||||||      |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35438914 tgtttcagatcacctcctctctccttatcgttgttgttgttgtcgagacggctgccatgaaagctttatacaggtattcctaatacccta 35438825  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23283827 - 23283955
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |  ||| |||||||| |    
T  23283827 ttttattattttattatatttcaatatcatt-atgtggacaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttggagtcttaattgattagtg 23283925  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggc-tattagatt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23283926 atcaaattaagtaataaggcttattagatt 23283955  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 342
Target Start/End: Original strand, 28765255 - 28765508
Alignment:
Q  90 ttgattagcgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttatatggactcaat--gagtggatat 186  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||| |||  ||| | | ||||| |||| ||  ||||| || |    
T  28765255 ttgattagtgatcaaattaaatgataaggctaattatatttttatttggataattaactaa-tata-aataattgatatgaactcgatatgagtgaatgt 28765352  T
Q  187 ctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttct 286  Q
     |||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  | | ||||    
T  28765353 atggatgactcatcaacggaataatggaaaactctaatggcgattcaatataaaagaggcaatggtcccattacaccatacacgacaaacattatattct 28765452  T
Q  287 ccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatca 342  Q
    | |  ||  ||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  28765453 ctcattccgaagagaatttgaggcatcaaggtacctattgaggaagaaccaaatca 28765508  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 31651318 - 31651417
Alignment:
Q  104 aattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaa 202  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  31651318 aattaagtaataaatcaattagatttttatgtagataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtcgatgtctagatgatccattaa 31651417  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 343
Target Start/End: Original strand, 29034702 - 29034749
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcag 343  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29034702 aagagaacttgagacataaaggtaccagttgaggaagaatcaaatcag 29034749  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8342671 - 8342606
Alignment:
Q  93 attagcgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaa 157  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8342671 attagtgatcaaattaaataataagattaattagatttctaattagataattaattatatgtttaa 8342606  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Original strand, 23284719 - 23284784
Alignment:
Q  190 gatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc 255  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23284719 gatgacccattaacggaataatgtgaaactctaatggccatcaaatataaaagatgttatggtccc 23284784  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 439
Target Start/End: Original strand, 28765558 - 28765610
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaata 439  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28765558 atcattgttgttgatagagctgccatcaaaacatcatccaggtattcctaata 28765610  T

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Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28525960 - 28525465
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28525960 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 28525862  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28525861 tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 28525762  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  28525761 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaag 28525662  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||| || | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||    
T  28525661 agaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt 28525563  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28525562 gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 28525465  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28532056 - 28531561
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28532056 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 28531958  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28531957 tcaaattaagtaataaggctgttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccat 28531858  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  28531857 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaag 28531758  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| || | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||    
T  28531757 agaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaagaatcaaatcagccaccgctgac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt 28531659  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28531658 gttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcataataccctaattcttaatatccttaataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 28531561  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7390122 - 7389627
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  7390122 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaacgataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 7390024  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  7390023 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaatgagtggatgttcggatgacccat 7389924  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatgg-tcccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||    
T  7389923 taacggaataatgggaaactctaatggccatccaatataaaagaggctatggttcccaatatactgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaa 7389824  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||    
T  7389823 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgt 7389725  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| |||||| || || |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7389724 tgttgatgagagagcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtggatccgatcat 7389627  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 41296872 - 41297357
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  41296872 tttattatattacaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaatta 41296970  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  41296971 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccattaacagaa 41297070  T
Q  208 tagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagaga---a 302  Q
    || ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||||||   |    
T  41297071 taatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacta 41297170  T
Q  303 cttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc------atcgttgttg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| ||||||||||     |||||      ||||||||||    
T  41297171 cttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcacctcctctccttggttatcgttgttg 41297269  T
Q  397 ttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
     |||||||| |||| | |||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41297270 atgagagggttgccttgaaagc------caggtattcctaataccctaattctttatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 41297357  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12686754 - 12686258
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  12686754 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 12686656  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  12686655 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 12686560  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  12686559 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatc 12686460  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  12686459 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 12686361  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12686360 tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 12686261  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12692856 - 12692360
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  12692856 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 12692758  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  12692757 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 12692662  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  12692661 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatc 12692562  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  12692561 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 12692463  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12692462 tcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 12692363  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30384959 - 30384586
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |    
T  30384959 ttttattattttattatattccgatatcatt-atgtggacaaatattgtaataataattatattagctatttatcagttgtgagccttaattgattagtg 30384861  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30384860 attaaattaagtaataaggctattggatttctaattagataattaattaaatatttcattaatagatatggattcaatgagtggatgtctggatgactca 30384761  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||| |||    
T  30384760 ttaacggaataatggaaaatc-taatagtcatccaatataaaagagactatggtcccaatacaccgtacacggcaaacattctcttctccccatctgaag 30384662  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagat 374  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  30384661 agaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagtcgccgctaagctatgttgtgtgtttcagat 30384586  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 20499722 - 20500218
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| |    
T  20499722 ttttattatttaattatatttcaacatcatt-atatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtg 20499820  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20499821 atcaaattaagtaataagactattagatttctagtaagataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtctggatggccca 20499920  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaa 296  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  | | |    
T  20499921 ttaacgaaataatggaaaaccctaatggtcatccaataaataagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctgttctctccatttga 20500020  T
Q  297 agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtt-tctc----catcgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| | | |||| | |||||||||    || ||||     |||||    
T  20500021 agagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaagaaccaaatcaaccgctgctaacct-tcttgtttgtttcagatcgcctttctctctgtttatcgt 20500119  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    || |||||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  20500120 tgatgttgagagggctgccataaaagttttatccaggtatttctaatactctaattcttagtatccttgataaatcaagtatgtcgtagatccgatcat 20500218  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Original strand, 30771876 - 30772363
Alignment:
Q  9 tttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatta 108  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  30771876 tttactatatttcaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagct---tatcagttgtgagccttaattgattagtgatcaaatta 30771971  T
Q  109 agtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgt 205  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||      
T  30771972 agtaataaggctataaagtttcttattggataattaattaaataattaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaacag 30772071  T
Q  206 aatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaact 304  Q
    |||| || |||||||| ||   ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |  ||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  30772072 aataatgaaaaaccctgatgatcatccaatatagaagagactatggtccacaatatatcagacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaact 30772171  T
Q  305 tgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatcat-----ggtttctccatcgttgttgtt 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | | |||||||| |||||||||||       | |||   |  ||||||||    
T  30772172 tgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaaccctttgttgtgtgtttcagatcatcacaccttctcttgtttattgttgtt 30772271  T
Q  399 gagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  30772272 gagagggctgccataaaaactttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtcgatccgatcat 30772363  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19060298 - 19059850
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||     
T  19060298 aataattatattagctatttgtcaatttggagacttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagaatattaattaat 19060199  T
Q  151 tatttaattagtt-atatggactcaat--gagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggct 247  Q
    || ||||||| |  |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19060198 taattaattaatggatatggactcaatatgagtggatgtctggatgtcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggct 19060099  T
Q  248 atggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttg 346  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  19060098 atggtccccaatacatcagacacgacaaactctctcttctcccgatatgaagagaacttgaggcataaaagtaccagttgaggaagaaccaaatcagccg 19059999  T
Q  347 ccgctaa-cgt----atgt---tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcc 434  Q
    ||||||| |||    ||||   ||| | ||||||||||  |  | |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  19059998 ccgctaaccgtgttgatgtggatgtttgtttcagatcaccttctctctttatcgttgttgtcgagagggctgccaccaaagcttcatctccaggtatttc 19059899  T
Q  435 taataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19059898 taataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 19059850  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32094797 - 32094419
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  32094797 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 32094699  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || |||||     
T  32094698 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtgtatgtccggatgg 32094603  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |    
T  32094602 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctatggtcccaaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccat 32094503  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  32094502 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaattagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat 32094419  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32097597 - 32097220
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |    
T  32097597 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattggttagtg 32097499  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgac 195  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  32097498 atcaaattaaataataagctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggc 32097403  T
Q  196 ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtc 293  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  ||    
T  32097402 ccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggaaatactctctattctccccatc 32097303  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat 377  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  32097302 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaactaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat 32097220  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19066632 - 19066193
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattggataattaattaaa 150  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||   | || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||  ||||||| |     
T  19066632 aataattatattaattatttgtcaatctggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttattagatttctatttagaatattaattgat 19066533  T
Q  151 tatttaattagttatatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatg 250  Q
    || |||||     ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||    
T  19066532 taattaatgg---atatgga-tatatgagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaataggttgtg 19066437  T
Q  251 gtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccg 349  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19066436 gtccccaatacaccggacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgccg 19066337  T
Q  350 ctaa-cgt----atgt-tgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttca--ttcaggtattcctaata 439  Q
    |||| |||    ||||  || | ||||||||||  |  | |||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||    
T  19066336 ctaaccgtgttgatgtgggtttgtttcagatcactttctctctttatcgttgttgtcgagagagctgccaccaaagcttcatctcctggtattcctaata 19066237  T
Q  440 ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19066236 ccataattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 19066193  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Original strand, 14609918 - 14610108
Alignment:
Q  164 atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14609918 atatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatggaaa-ccctaatggtcatctaatgtaaaagaggttatggtccccaatacac 14610016  T
Q  263 cgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    || |||||||||||| | | |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14610017 cgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 14610108  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8706919 - 8706745
Alignment:
Q  44 attgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataatt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  8706919 attgtaataataattatattagctatttatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataagacgattaaatttctaattagataatt 8706820  T
Q  144 aattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaa 217  Q
     |||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8706819 tattaaatatttaattaattgatatggatccaataagtggatatgcagatgacccattaacggaataatggaaaa 8706745  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 14609736 - 14609888
Alignment:
Q  21 caatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggct 120  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  14609736 caatatcatt-atgtgtgcaaatatcgtaataataattatattagttacttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaact 14609834  T
Q  121 attagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactc 173  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  14609835 attagatttctagtaagataattaattaaacatttaattaattgatatggactc 14609888  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 32094340 - 32094246
Alignment:
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32094340 tcgttgttgttgagagggctgctatgaaagctttattcaggtattcctaata-cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 32094246  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 32097138 - 32097047
Alignment:
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32097138 ttgttgttgagaggactgctatgaaagctttattcaggtaatcctaatacc-taattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatc 32097047  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 480
Target Start/End: Original strand, 26509731 - 26509920
Alignment:
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacg-tatgttgtgtatttcagatcatggtttctcc--------at 388  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  ||| |  ||  ||||||||||||||||||||  | |||||||        ||    
T  26509731 gagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaaatcagccgccaccgactctatgttgtgtatttcagatcgcgatttctcctctttcagat 26509830  T
Q  389 cgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtag 480  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  26509831 cgttgatgttgagaggactgtcatcaaagcttcattcatatattcctaata-cctaattcttaatat-cttgatgaatcaaatatgtcgtag 26509920  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26318621 - 26318471
Alignment:
Q  214 aaaaccctaatagccatc-caatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggca 311  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| |||| |||| | || | ||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||  || |    
T  26318621 aaaaccctaatggtcatcacactatataagaggctatgatccccaatatatcggaaacgacaaactctctcttctccca-tctgaagagaacttatggta 26318523  T
Q  312 taaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgt 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  26318522 taaatgtaccggttgagaaagaaccaaatcaattgccgctaacctttgttgt 26318471  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Original strand, 24054338 - 24054415
Alignment:
Q  414 aaagcttcattcaggtattcctaata-ccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24054338 aaagctttatccaggtattcctaatatcccaaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 24054415  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30384532 - 30384457
Alignment:
Q  414 aaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  30384532 aaagcttcatccaggtattcttaatacccttattcttaatatccttgataaatcagacatgtc-tagatccgatcat 30384457  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33753634 - 33753476
Alignment:
Q  175 atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcc-caatacaccgtacacggca 273  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||  || |||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  ||    
T  33753634 atgagtggatttatggatgatacattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcatat-taaaagagcctatgttcctcagtacaccgtacacacca 33753536  T
Q  274 aactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaga 333  Q
     ||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33753535 tactctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33753476  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26318435 - 26318381
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc 441  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26318435 atcgttgttgttgagaggcccgtcatcaaagcttcattaaggtattcctaatacc 26318381  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8706601 - 8706536
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatat 455  Q
    |||| |||||||| || || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8706601 gttgctgttgagatggttgtcatgaaagcataattcaggtattcctaataccctaattcttaatat 8706536  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33753806 - 33753710
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattag 97  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  33753806 ttttattatttaattatatttcaatatcatt-atgtgggtaaatattattatcataattatattagctatttatcaatttggagctttaattgattag 33753710  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33753435 - 33753381
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc 441  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  33753435 atcgttgttgttgagaggactgtcatcaaaacttcatcaaggtattcctaatacc 33753381  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33849069 - 33849015
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaatacc 441  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  33849069 atcgttgttgttgagaggactgtcatcaaaacttcatcaaggtattcctaatacc 33849015  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16215309 - 16215260
Alignment:
Q  434 ctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatc 483  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16215309 ctaataccctaatttttaatatccttgataaatcaaacatttcgtagatc 16215260  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25408537 - 25408435
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    ||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  25408537 ttttattatttaataatatttcgatatcatt-atgtggacaaatatcgtaaaagtaattatata---tatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 25408442  T
Q  100 atcaaat 106  Q
    |||||||    
T  25408441 atcaaat 25408435  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 480
Target Start/End: Original strand, 28542269 - 28542308
Alignment:
Q  441 cctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtag 480  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28542269 cctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtag 28542308  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 490
Target Start/End: Original strand, 14610184 - 14610229
Alignment:
Q  445 attcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14610184 attcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcat 14610229  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26318765 - 26318676
Alignment:
Q  54 taattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataatt 143  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |  ||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||| || || |||||||    
T  26318765 taattatattagttatctatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataaagatattagatttttatttagataatt 26318676  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1273
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1762 ttttattatttattatatttcaatattatt-atgtgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtga 1664  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||       
T  1663 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacc--- 1567  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
       || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  1566 ---cggaataatggaaaatcctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaag 1470  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||    
T  1469 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaaaccaaatcagtcgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgtt 1371  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1370 gttgatgagagggatgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatatcgtagatccgatcat 1273  T

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Target: chr8 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5542736 - 5542239
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||| |||||||| ||    
T  5542736 ttttattatttaataatattctatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtga 5542638  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5542637 tcaaattaagtaataagactaattagatttctaattggataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgaccca 5542538  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaa 296  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |    
T  5542537 ttaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctga 5542438  T
Q  297 agagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctccatcg 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||        |||    ||||    
T  5542437 agagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcccctctttggttatcg 5542339  T
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5542338 ttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatctaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 5542239  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22220292 - 22219796
Alignment:
Q  11 tattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaag 110  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22220292 tattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaatagttatattagctatttatcaatcgtaagccttagttgattagtgatcaaattaag 22220194  T
Q  111 taataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacgtaata 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  22220193 taataagggtattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgaatggatgtccggatggcccattaacggaata 22220094  T
Q  210 gtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaacttga 307  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  22220093 atgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttga 22219994  T
Q  308 ggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca---------tggtttctc------catcgtt 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | | |||| | ||||||||||         | |||| ||        | |||    
T  22219993 ggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac-tttattgtttgtttcagatcaattttttctttgtttatcgttgttgttggtt 22219895  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttc-attcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22219894 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcaatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 22219796  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Original strand, 10699616 - 10700109
Alignment:
Q  3 ttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatc 102  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  10699616 ttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatactagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatc 10699714  T
Q  103 aaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccatta 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10699715 aaattaagtaattaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgacccatta 10699814  T
Q  202 acgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaaga 299  Q
    ||| | || ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||| | ||    
T  10699815 acggagtaatgggaaaccctaatggtcatcaaatataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctctccatctgacga 10699914  T
Q  300 gaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttg 393  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |||||||    
T  10699915 aaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatttcctctctttggttatcgttg 10700013  T
Q  394 ttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||| |||||||||||| |  |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10700014 ttgatgagagggctgctacaaaagttttatccagatattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 10700109  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Original strand, 10705428 - 10705917
Alignment:
Q  6 ttatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  10705428 ttatttattatattccaatatcattt-tgtgggcgaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaa 10705526  T
Q  106 ttaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccattaacg 204  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10705527 ttaagtaataaaactattagatttctaattgaataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccattaacg 10705626  T
Q  205 taatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtc-ccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgtctaaagagaa 302  Q
     |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  10705627 gaataatgg-aaaccctaatagtcatcaaatataaaagaggctatggtctccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaa 10705725  T
Q  303 cttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgttgttg 396  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       ||||||||||    
T  10705726 cttaagccataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggttatcgttgttg 10705824  T
Q  397 ttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
     |||||||||||| |  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10705825 atgagagggctgctacaaaagctttatccaggtaatcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 10705917  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 39736112 - 39735639
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  39736112 ttttattatttattatattcca-tattatt-atgtggacaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcattagttgattagtga 39736015  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  39736014 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatcagtggatgtccggatgacccat 39735915  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtcccaatacaccgtacacggc-aaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||        |||||||||| | ||||||| |||||||||  ||| |||    
T  39735914 taacggaata-agggaaaccctaatggccatctaatataaaagaggctctggt--------accgtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaag 39735824  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttg 396  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||   |||||| | ||||||||||  |  | |||  | ||||||||    
T  39735823 agtacttgaggcataaatgtaccagttaaggaagaatcaaatcagccgccgctaacccttgttgtttgtttcagatcaccttctctctttaccgttgttg 39735724  T
Q  397 ttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
    ||||||||| |||||| |||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39735723 ttgagagggttgccatgaaa-ttttatccaggtattccttataccctagttcttaatatctttgataaatcaaacatgtcgtagat 39735639  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 32890472 - 32890969
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |    
T  32890472 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgacccttaattgattagtg 32890570  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  32890571 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 32890666  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  32890667 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccat 32890766  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  32890767 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 32890865  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| |||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32890866 attgttgttgatgagagggttgccttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccga 32890965  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 32896596 - 32897093
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  32896596 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 32896694  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  32896695 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 32896790  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  32896791 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccat 32896890  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  32896891 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 32896989  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    || ||||||| |||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32896990 attgttgttgatgagagggttgtcttgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccga 32897089  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 36818556 - 36819051
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  36818556 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 36818654  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  36818655 atcaaattaagtaataaggttaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 36818750  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  36818751 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatcaaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatc 36818850  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------ca 387  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||       |    
T  36818851 tgatgagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtta 36818949  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
    ||||||||| ||||||||| || |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36818950 tcgttgttgatgagagggcggctacaaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 36819048  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 42033382 - 42033740
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  42033382 ttttattatttattatatttcaatatcatt-atgcgggtaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtga 42033480  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatg----ac 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     |    
T  42033481 tcaaattaagtaataaggttattagatttctaattagataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatggcccgc 42033580  T
Q  196 ccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtct 294  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  42033581 ccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaggaggctatggtccccaatacattgtacacggcaaactctctcttctctccatct 42033680  T
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42033681 gaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 42033740  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 14417546 - 14418021
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  14417546 ttttattatttattatataccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 14417644  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  14417645 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatgggctcaatgagtggatgttcggatgtcccat 14417744  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||                    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  14417745 taacgaaataatgggaaa--------------------aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag 14417824  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    | |||||| |||||||||||  | ||||       |||||     
T  14417825 agaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-aactattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtc 14417923  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14417924 gttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 14418021  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 9934867 - 9935359
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| |    
T  9934867 ttttattatttaataatatttcaatatgatt-atgtgggtaaatattgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttaattgattagtg 9934965  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    |||||||  || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  9934966 atcaaattaagtaataaagctaattagatttctattttggataattaatta----tttaatttattgatatggactcaacatgagtggatatccggatga 9935061  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtc 293  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||    
T  9935062 cccattaacggaataatgggaaacc-taatggccatccaa-ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaaactct--cttctccccatc 9935157  T
Q  294 taaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat------ggtttctcca 387  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | | |||||| |||||||||||        |||    |    
T  9935158 tgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-atctattgtgtgtttcagatcatctcctatctttggtta 9935256  T
Q  388 tcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgat 487  Q
     |||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9935257 acgttgttgattagagggctgctatgaaagatttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgat 9935356  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42993575 - 42993083
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  42993575 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atatgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 42993477  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||     
T  42993476 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc-cgatgg 42993382  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||  |    
T  42993381 cccattaacggaataatgggaaaccctaatcgccatccaatataaaagaggttatggtccccaatataccgaacacggcaatactct---ttctccccat 42993285  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  42993284 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42993186  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| ||||||||  || |  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42993185 atcgttgttgatgagagggtggctacaaaagctttatcaaggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 42993087  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39727859 - 39727656
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  39727859 ttttattatttattatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagacttagttgattagtga 39727761  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||    
T  39727760 tcaaattaagtaataaggctattaaatttctaattggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgagtggatgtccggatagcccat 39727661  T
Q  200 taacg 204  Q
    |||||    
T  39727660 taacg 39727656  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 239 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 39727645 - 39727405
Alignment:
Q  239 aaagaggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaa-ctctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaacc 336  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39727645 aaagaggatatggtccccaatataccgtacacaacaaaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 39727546  T
Q  337 aaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatca--tggtttctccatcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcc 434  Q
    |||||||  |||||||||   || ||| | ||||||||||  |  | |||  | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  | |||||||| |    
T  39727545 aaatcagcagccgctaacccttgctgtttgtttcagatcaccttctctctttaccgttgttgttgagagggttgccaagaaagttttttccaggtatttc 39727446  T
Q  435 taataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgt 475  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39727445 ttataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgt 39727405  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1883384 - 1883185
Alignment:
Q  30 ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggc-tattagatt 128  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1883384 ttatgcgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaatttggagccttacttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatt 1883285  T
Q  129 tctaattggataattaattaaatatttaattagttatatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatag 226  Q
    |||| || ||  |||||||||    |||||     |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |    
T  1883284 tctatttagaatattaattaa----ttaat---ggatatggactcaatatgagtggatgtccggatgacccattaacgaaataatgggaaaccttaatgg 1883192  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1882937 - 1882846
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcatt--caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtc 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1882937 atcgttgttgttgagagggctgccatgaaagcttcatctccaggtattcctaataccctaattcttaacatccttgataaatcaaacatgtc 1882846  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1883151 - 1883039
Alignment:
Q  243 aggctatggtccc-aatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatc 341  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  1883151 aggctatggtccccaatacacaatacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaatt 1883052  T
Q  342 agttgccgctaac 354  Q
    ||  |||||||||    
T  1883051 agccgccgctaac 1883039  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Original strand, 7771210 - 7771312
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7771210 atcgttgttgatgagagggttgctacaaaagctt-atccaggtattcttaataccctaattcttaatatccttggtaaatcaaacatgtcgtagatccga 7771308  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  7771309 tcat 7771312  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 17954141 - 17954316
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaatt----aagtaataaggctattagatttctaattggataattaatt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||||||| ||||| |||    |||||||||| |||||||||||||| |    |||||||||    
T  17954141 aataattatattagctatttatcaatttggagacttaattgattagtgatcagattactaaagtaataagcctattagatttctatt----taattaatt 17954236  T
Q  148 aaatatttaattagtt-atatggactc--aatgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaat 224  Q
    || || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  17954237 aattaattaattagttgatatggactcaaaatgagtggatgttcagatgacccactaacggaataatggaaaaccctaat 17954316  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 14799559 - 14799495
Alignment:
Q  425 caggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14799559 caggtattcctaataccctaattcttaatat-cttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 14799495  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 479
Target Start/End: Original strand, 1171327 - 1171414
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgta 479  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  1171327 gttgctgttgagagagctgccataaaagctttaaccaggtattcctaata-cctaattcttgttat-cttgataaatcaaatatgtcgta 1171414  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 160
Target Start/End: Original strand, 11641418 - 11641447
Alignment:
Q  131 taattggataattaattaaatatttaatta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641418 taattggataattaattaaatatttaatta 11641447  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 354
Target Start/End: Original strand, 1171249 - 1171285
Alignment:
Q  318 taccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1171249 taccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 1171285  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1882996 - 1882960
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcat 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1882996 atcgttgttgttgaaagggctgccatgaaagcttcat 1882960  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 173465 - 172969
Alignment:
Q  1 ttttattattt-attatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  173465 ttttattattttattatattccaatattatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagcgatttatcaattgtgggtcttagttgattagtg 173367  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  173366 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatgagtggatgtccggatgttcta 173267  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaa 297  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  173266 ttaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtatacggcaaactctctcttctccccatctgaa 173167  T
Q  298 gagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||  | ||||       |||||    
T  173166 gagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgt 173068  T
Q  392 tgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||| | ||||||||  | | ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  173067 tgttgataagagggctatcttgaaagctttatccatgtattcctaatatcctaattcttaatatccttgataaattaaacatgtcgtagatccgatcat 172969  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 11979 - 12468
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  11979 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 12077  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||     
T  12078 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 12173  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  12174 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 12273  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  12274 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 12372  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12373 atcgttgttgatgagaggactgccttgaaagctttatccagatattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagat 12468  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 6106 - 6595
Alignment:
Q  1 ttttattatttatta-tctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    || ||| |||||||| |    
T  6106 ttttattatttaataatattccaatatcatt-atgtgggcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttaaagccttaattgattagtg 6204  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaa--tgagtggatatctggatga 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||     
T  6205 atcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggataattaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgg 6300  T
Q  195 cccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaa-actctttcttctccctgt 292  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  6301 cccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccat 6400  T
Q  293 ctaaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------c 386  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||||    ||||           
T  6401 ctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 6499  T
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagat 482  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6500 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgttgtagat 6595  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 698
Alignment:
Q  1 ttttattatttattatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcga 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  1173 ttttattatttattatataccaatatcatt-atgtgggaaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtga 1075  T
Q  101 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgacccat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  1074 tcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattgaatatttaattagttgatatgggctcaatgagtggatgttcggatgtcccat 975  T
Q  200 taacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccctgtctaaag 298  Q
    ||||| |||| ||| |||                    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  974 taacgaaataatgggaaa--------------------aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaag 895  T
Q  299 agaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcatggtttctc------catcgtt 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    | |||||| |||||||||||  | ||||       |||||     
T  894 agaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-aactattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggttatcgtc 796  T
Q  393 gttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  795 gttgattagagggctgctatgaaagctttatccaggtattcctaataccctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 698  T

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Target: scaffold0064 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 13857 - 14121
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
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T  13857 ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatagtaataataattatattagctatttatcaatcgtgagccttaattgactagtg 13955  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaattagtt-atatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
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T  13956 atcaaattaagtaataattctattagatttgtaattggataattaattaaatatttaattagttgatatggattcaatgagtggatgtccggatgaccca 14055  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacacc 263  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14056 ttaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaatacacc 14121  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 647 - 937
Alignment:
Q  1 ttttattattta-ttatctttcaatatcatttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcg 99  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||| |    
T  647 ttttattatttaattatattccaatatcatt-atgtgggaaaatatcataataataattatattagttatttatcaattgtgagcctcaattgattagtg 745  T
Q  100 atcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaatatttaatt-agttatatggactcaatgagtggatatctggatgaccca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||    
T  746 atcaaattaagtaataaggctattagatttaaaatcagataattgattaaatatttaattaactgatatgtactcaatgagtgaatgtctagatgaccca 845  T
Q  199 ttaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggctatggt-cccaatacaccgtacacggcaaactctttcttctccc 289  Q
    |||||  |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  846 ttaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacgacaaactctctcttctccc 937  T

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Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 490
Target Start/End: Original strand, 1068 - 1168
Alignment:
Q  390 gttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatca 489  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| || || ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  1068 gttgatgttgagagagctgccatgaaagttttatccagatatttctaatactctaattgttaatatgcatgataagtcaaacatgtcgttgatccgatca 1167  T
Q  490 t 490  Q
    |    
T  1168 t 1168  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 5602 - 5821
Alignment:
Q  52 aataattatattagctatttatcaattgtgggctttagttgattagcgatcaaattaagtaataaggctattagatttctaattggataattaattaaat 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5602 aataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatgactattagatttctaattcgataattaattaaat 5701  T
Q  152 atttaattagtt-atatggactca--atgagtggatatctggatgacccattaacgtaatagtggaaaaccctaatagccatccaatataaaagaggcta 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  5702 atttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgttcggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaacggccattcaatataaaagaggcta 5800  T
Q  249 tgg-tcccaatacaccgtaca 268  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  5801 tggttcccaatacatcgtaca 5821  T

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Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Original strand, 5825 - 5884
Alignment:
Q  295 aaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaac 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  5825 aaagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaac 5884  T

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Target: scaffold0185; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6003
Alignment:
Q  431 ttcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5945 ttcctaatacc-taattaataatatttttgataaatcaaacatgtcgtagatccgatcat 6003  T

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Target: scaffold0236 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 490
Target Start/End: Original strand, 5512 - 5615
Alignment:
Q  387 atcgttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctga 486  Q
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T  5512 atcgttgttgatgagagggctgccttgaaagctttatccaggtattcctaatagcctaattcttaatatccttgataaatcaaacatgtcgtagatccga 5611  T
Q  487 tcat 490  Q
    ||||    
T  5612 tcat 5615  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 490
Target Start/End: Original strand, 38411 - 38508
Alignment:
Q  391 ttgttgttgagagggctgccatcaaagcttcattcaggtattcctaataccctaattcttaatatgtttgataaatcaaacatgtcgtagatctgatcat 490  Q
    |||||||||||| |  || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  38411 ttgttgttgagatgattgtcgtcaaagcttcatccaggtattcctaata-cctaattattaatattcttgataaa-caaacatgttgtagatccgatcat 38508  T

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Target: scaffold0449 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1325 - 1281
Alignment:
Q  30 ttatgtggacaaatattgtaacaataattatattagctatttatc 74  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1325 ttatatggacaaatatcgtaataataattatattagctatttatc 1281  T

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Target: scaffold1064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1064
Description:

Target: scaffold1064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 375
Target Start/End: Original strand, 1255 - 1334
Alignment:
Q  296 aagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaatcagttgccgctaa-cgtatgttgtgtatttcagatc 375  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  1255 aagagaacttgaaacataaatgtaccgattaaggaagaaccaaa-aagtcgccgctaaccctatgttgtatgtttcagatc 1334  T

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