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Alignment Overview

Query: NF20392_low_36 (Length: 263)

Name: NF20392_low_36

Description: NF20392

Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]

Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)

Alignment Details

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 15)

Name: chr1

Description:

Target: chr1; HSP #1

Raw Score: 145; E-Value: 2e-76

Query Start/End: Original strand, 18 - 192

Target Start/End: Complemental strand, 8092955 - 8092779

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatgacttaaa 117
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T 8092955 gataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatgacttaaa 8092856

Q 118     tttccatcagaatcacctattttctagagccctga-ggggttgcatatgtcaca-atatatcagacacataacaatt 192
          |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
T 8092855 tttccaacagaatcacctattttctagagccctaagggggttgcatatgtcacagatatatcagacacataacaatt 8092779

Target: chr1; HSP #2

Raw Score: 78; E-Value: 2e-36

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 31058094 - 31058187

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 31058094 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 31058187

Target: chr1; HSP #3

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 31051594 - 31051687

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 31051594 gataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 31051687

Target: chr1; HSP #4

Raw Score: 64; E-Value: 5e-28

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Original strand, 1078276 - 1078367

Alignment:

Q 20      taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 1078276 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattaataattgttgaacatgtattatga 1078367

Target: chr1; HSP #5

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 25387613 - 25387520

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |   |||||||| |||| ||||||
T 25387613 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatatttgttgaacatgttttatga 25387520

Target: chr1; HSP #6

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 34740036 - 34740129

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||| |||| |||| ||||||
T 34740036 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgatgaacatgttttatga 34740129

Target: chr1; HSP #7

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 50306239 - 50306332

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 50306239 gataaatcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 50306332

Target: chr1; HSP #8

Raw Score: 56; E-Value: 3e-23

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 25381642 - 25381551

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||
T 25381642 taaatcaaacatttcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatga 25381551

Target: chr1; HSP #9

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 170 - 241

Target Start/End: Original strand, 8094873 - 8094944

Alignment:

Q 170     aatatatcagacacataacaattgatttggaattcatgtatgatgtgtttccataccattttttccaaggaa 241
          ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
T 8094873 aatatatcagacacgcaacaatttattttgaattcatgtatgatatgtttccatacaattttttccaaggaa 8094944

Target: chr1; HSP #10

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 23 - 86

Target Start/End: Original strand, 27955216 - 27955279

Alignment:

Q 23       atcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 27955216 atcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 27955279

Target: chr1; HSP #11

Raw Score: 46; E-Value: 3e-17

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 44410060 - 44410153

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 44410060 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 44410153

Target: chr1; HSP #12

Raw Score: 45; E-Value: 1e-16

Query Start/End: Original strand, 199 - 247

Target Start/End: Complemental strand, 8090751 - 8090703

Alignment:

Q 199     gaattcatgtatgatgtgtttccataccattttttccaaggaactcaaa 247
          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
T 8090751 gaattcatgtatgatatgtttccataccattttttccaaggaactcaaa 8090703

Target: chr1; HSP #13

Raw Score: 45; E-Value: 1e-16

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 24963811 - 24963743

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 24963811 gataaatcaaacatggcgtagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 24963743

Target: chr1; HSP #14

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 24926863 - 24926770

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 24926863 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattaatgttcaatgttttggttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 24926770

Target: chr1; HSP #15

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 12183693 - 12183625

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||  |||||||||
T 12183693 gataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataattatgttcaatattttgtttgcttccactattgatt 12183625

Target: chr2 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 16)

Name: chr2

Description:

Target: chr2; HSP #1

Raw Score: 78; E-Value: 2e-36

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 13149795 - 13149702

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 13149795 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 13149702

Target: chr2; HSP #2

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 31002427 - 31002520

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 31002427 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 31002520

Target: chr2; HSP #3

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 31008405 - 31008498

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 31008405 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 31008498

Target: chr2; HSP #4

Raw Score: 70; E-Value: 1e-31

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 30965378 - 30965471

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||
T 30965378 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttatgattgttgaacatgtattatga 30965471

Target: chr2; HSP #5

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 13456150 - 13456243

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||
T 13456150 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatga 13456243

Target: chr2; HSP #6

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 13462091 - 13462184

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||
T 13462091 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatga 13462184

Target: chr2; HSP #7

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 28683054 - 28682961

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 28683054 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 28682961

Target: chr2; HSP #8

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 35090758 - 35090665

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 35090758 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 35090665

Target: chr2; HSP #9

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 36750465 - 36750558

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 36750465 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 36750558

Target: chr2; HSP #10

Raw Score: 60; E-Value: 1e-25

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 35438816 - 35438725

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  | ||||||| |||| ||||||
T 35438816 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataactgttgaacatgttttatga 35438725

Target: chr2; HSP #11

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 35084785 - 35084692

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 35084785 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 35084692

Target: chr2; HSP #12

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 29833258 - 29833351

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||| || || |||||||||||
T 29833258 gataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataattatgttcaatattttatttgtttccgttattgattcacaattattaaacatgtattatga 29833351

Target: chr2; HSP #13

Raw Score: 48; E-Value: 2e-18

Query Start/End: Original strand, 20 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 44716912 - 44716845

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt-atttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||
T 44716912 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttcttttgcttccgctattgatt 44716845

Target: chr2; HSP #14

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 23 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 11048657 - 11048569

Alignment:

Q 23       atcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||| | |||| ||||||
T 11048657 atcaaacatgacgtatatccaatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttcagctattgattcataattgttggacatgttttatga 11048569

Target: chr2; HSP #15

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 23343611 - 23343679

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||
T 23343611 gataaatcaaacatgtcgtagattcgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgatt 23343679

Target: chr2; HSP #16

Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006

Query Start/End: Original strand, 27 - 66

Target Start/End: Original strand, 31651664 - 31651703

Alignment:

Q 27       aacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
           |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
T 31651664 aacatgtcataaatccgatcataatcatgttcaatgtttt 31651703

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 17)

Name: chr6

Description:

Target: chr6; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 25354261 - 25354354

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 25354261 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgctttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 25354354

Target: chr6; HSP #2

Raw Score: 70; E-Value: 1e-31

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 21782862 - 21782769

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 21782862 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatga 21782769

Target: chr6; HSP #3

Raw Score: 70; E-Value: 1e-31

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Original strand, 25343674 - 25343755

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
T 25343674 gataaatcaaaaatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgatttacgattgttgaa 25343755

Target: chr6; HSP #4

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 8650912 - 8650819

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 8650912 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 8650819

Target: chr6; HSP #5

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 8662890 - 8662797

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 8662890 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 8662797

Target: chr6; HSP #6

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 32035395 - 32035302

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 32035395 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 32035302

Target: chr6; HSP #7

Raw Score: 60; E-Value: 1e-25

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 4580428 - 4580337

Alignment:

Q 20      taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |   |||||||| |||||||||||
T 4580428 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcatagttgttgaacatgtattatga 4580337

Target: chr6; HSP #8

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Complemental strand, 21783418 - 21783337

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||
T 21783418 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttactattgttgaa 21783337

Target: chr6; HSP #9

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Complemental strand, 21789641 - 21789560

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||
T 21789641 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttactattgttgaa 21789560

Target: chr6; HSP #10

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Complemental strand, 21190975 - 21190894

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||||||
T 21190975 gataaatcaaatatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaa 21190894

Target: chr6; HSP #11

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 21770667 - 21770574

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||
T 21770667 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttgtttacttcctctattaatttacgattgttgatcatgtattatga 21770574

Target: chr6; HSP #12

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 31756324 - 31756231

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 31756324 gataattcaaacatgtcgtagatccgattataatcatgttcaatgttttatttgcttccgttgttgattcataattgttgaacatgttttatga 31756231

Target: chr6; HSP #13

Raw Score: 44; E-Value: 4e-16

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Original strand, 17581678 - 17581769

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |  || |||||| |||| ||||||
T 17581678 taaatcaaacatgtcgtagatcctataataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgattcataatagttgaacatgttttatga 17581769

Target: chr6; HSP #14

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 21197130 - 21197037

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 21197130 gataaatcaaacatgttgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 21197037

Target: chr6; HSP #15

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 18778633 - 18778701

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||
T 18778633 gataaatcaaatacgtcgtagatccgatcataattatgttcaacgttttgtttgcttccgctattgatt 18778701

Target: chr6; HSP #16

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 71

Target Start/End: Complemental strand, 34603439 - 34603386

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 71
           ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||
T 34603439 gataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttg 34603386

Target: chr6; HSP #17

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 71

Target Start/End: Complemental strand, 34724716 - 34724663

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 71
           ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||
T 34724716 gataaatcaaacatgccatagatccgatcataattatgttcaatgctttgtttg 34724663

Target: chr5 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 19)

Name: chr5

Description:

Target: chr5; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 32097070 - 32096977

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
T 32097070 gataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattatga 32096977

Target: chr5; HSP #2

Raw Score: 72; E-Value: 8e-33

Query Start/End: Original strand, 18 - 109

Target Start/End: Complemental strand, 32094269 - 32094178

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattat 109
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
T 32094269 gataaatcaaacatgtcgtagatcctatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatgtattat 32094178

Target: chr5; HSP #3

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 12686288 - 12686195

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||
T 12686288 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 12686195

Target: chr5; HSP #4

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 12692390 - 12692297

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||
T 12692390 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 12692297

Target: chr5; HSP #5

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 41297327 - 41297420

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 41297327 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 41297420

Target: chr5; HSP #6

Raw Score: 65; E-Value: 1e-28

Query Start/End: Original strand, 19 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 28525494 - 28525402

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 28525494 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 28525402

Target: chr5; HSP #7

Raw Score: 65; E-Value: 1e-28

Query Start/End: Original strand, 19 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 28531590 - 28531498

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 28531590 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 28531498

Target: chr5; HSP #8

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 7389657 - 7389564

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 7389657 gataaatcaaacatgtcgtggatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 7389564

Target: chr5; HSP #9

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 24054385 - 24054478

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||
T 24054385 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatagatttataattgttgaacatgttttatga 24054478

Target: chr5; HSP #10

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 14610199 - 14610292

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 14610199 gataaatcaaacatgtcgtaaatccgatcataatcatgttcaatggtttatttgcttccgctattaattcataattgttgaacatgttttatga 14610292

Target: chr5; HSP #11

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 16215283 - 16215190

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||
T 16215283 gataaatcaaacatttcgtagatccaatcataatcatgttaaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaatatgtgttatga 16215190

Target: chr5; HSP #12

Raw Score: 46; E-Value: 3e-17

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 30384486 - 30384394

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 30384486 gataaatcagacatgtc-tagatccgatcataatcgtgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 30384394

Target: chr5; HSP #13

Raw Score: 46; E-Value: 3e-17

Query Start/End: Original strand, 18 - 103

Target Start/End: Complemental strand, 37896407 - 37896322

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatg 103
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| | |||| || ||||||
T 37896407 gataaatcaatcatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaacattttatttacttctgctgttgattcatgattattaaatatg 37896322

Target: chr5; HSP #14

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 67

Target Start/End: Original strand, 28542288 - 28542337

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttta 67
           ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
T 28542288 gataaatcaaacatgtcgtagtttcgatcataatcatgttcaatgtttta 28542337

Target: chr5; HSP #15

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 88

Target Start/End: Complemental strand, 19066216 - 19066146

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgattta 88
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||| ||| |||| |||||||
T 19066216 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgcttaatgttttgtttgcttccgctaatgattta 19066146

Target: chr5; HSP #16

Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004

Query Start/End: Original strand, 17 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 26316902 - 26316808

Alignment:

Q 17       agataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||  ||| ||||| |||| ||||||
T 26316902 agataaatcaaacatgtcctagatccaatcatattaatgttcaatgttttttttgcttccactattaatttaaaattattgaacatgttttatga 26316808

Target: chr5; HSP #17

Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 66

Target Start/End: Original strand, 30772333 - 30772381

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
           |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||
T 30772333 gataaatcaaacatgttgtcgatccgatcataatcatgttcattgtttt 30772381

Target: chr5; HSP #18

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 61

Target Start/End: Original strand, 20500188 - 20500231

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 61
           ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
T 20500188 gataaatcaagtatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaat 20500231

Target: chr5; HSP #19

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 19059873 - 19059780

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||| |||| |||  ||| |||||||  || |||||||| || ||||||
T 19059873 gataaatcaaacatgtcgtagatccgtttatattcatgtttaatattttgtttgcttcccctaatgatttataatcgttgaatacgttttatga 19059780

Target: chr3 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 25)

Name: chr3

Description:

Target: chr3; HSP #1

Raw Score: 74; E-Value: 5e-34

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10760759 - 10760666

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 10760759 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatga 10760666

Target: chr3; HSP #2

Raw Score: 68; E-Value: 2e-30

Query Start/End: Original strand, 18 - 109

Target Start/End: Complemental strand, 11846172 - 11846081

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattat 109
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||
T 11846172 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattat 11846081

Target: chr3; HSP #3

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 17593391 - 17593298

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||
T 17593391 gataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcgattgatttacgattgttgaacatctattatga 17593298

Target: chr3; HSP #4

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 38449172 - 38449079

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 38449172 gataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatga 38449079

Target: chr3; HSP #5

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 38455659 - 38455566

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 38455659 gataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatga 38455566

Target: chr3; HSP #6

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 42191329 - 42191236

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||
T 42191329 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatga 42191236

Target: chr3; HSP #7

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 42197271 - 42197178

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||
T 42197271 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcaggttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcacaattgttgaacatgtattatga 42197178

Target: chr3; HSP #8

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 55003521 - 55003428

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 55003521 gataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 55003428

Target: chr3; HSP #9

Raw Score: 65; E-Value: 1e-28

Query Start/End: Original strand, 19 - 111

Target Start/End: Original strand, 49151663 - 49151755

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 49151663 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 49151755

Target: chr3; HSP #10

Raw Score: 65; E-Value: 1e-28

Query Start/End: Original strand, 19 - 111

Target Start/End: Original strand, 49157730 - 49157822

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 49157730 ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 49157822

Target: chr3; HSP #11

Raw Score: 64; E-Value: 5e-28

Query Start/End: Original strand, 18 - 109

Target Start/End: Original strand, 8331837 - 8331928

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattat 109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||
T 8331837 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttat 8331928

Target: chr3; HSP #12

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10244443 - 10244350

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10244443 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10244350

Target: chr3; HSP #13

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10766980 - 10766887

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 10766980 gataaatcaaacatgtcgtagatccggtcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgatttataattgttgaacatgtattatga 10766887

Target: chr3; HSP #14

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 11839834 - 11839741

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||
T 11839834 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtatcatga 11839741

Target: chr3; HSP #15

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10238321 - 10238228

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10238321 gataaatcaaacatgtcgtagatctgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10238228

Target: chr3; HSP #16

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Complemental strand, 17055902 - 17055821

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||||||
T 17055902 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaa 17055821

Target: chr3; HSP #17

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 19 - 104

Target Start/End: Complemental strand, 48128155 - 48128070

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgt 104
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||
T 48128155 ataaatcaaacatgtcgtagaaccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgtttccgctattgattcataattgttgaacatgt 48128070

Target: chr3; HSP #18

Raw Score: 57; E-Value: 7e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 28964918 - 28964986

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 28964918 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 28964986

Target: chr3; HSP #19

Raw Score: 56; E-Value: 3e-23

Query Start/End: Original strand, 18 - 109

Target Start/End: Complemental strand, 53069163 - 53069072

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattat 109
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||
T 53069163 gataaatcaaacatgtcatagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttttat 53069072

Target: chr3; HSP #20

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 30051211 - 30051118

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 30051211 gataaatcaaacatgtcgtagatctgattataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 30051118

Target: chr3; HSP #21

Raw Score: 46; E-Value: 3e-17

Query Start/End: Original strand, 19 - 80

Target Start/End: Original strand, 34300548 - 34300609

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgcta 80
           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||
T 34300548 ataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcta 34300609

Target: chr3; HSP #22

Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 70

Target Start/End: Original strand, 46656734 - 46656786

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttattt 70
           |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||
T 46656734 gataaatcaaacatatcgtagatccgatcataattatattgaatgttttattt 46656786

Target: chr3; HSP #23

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 51

Target Start/End: Original strand, 13445111 - 13445144

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataat 51
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
T 13445111 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataat 13445144

Target: chr3; HSP #24

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001

Query Start/End: Original strand, 18 - 66

Target Start/End: Complemental strand, 12108777 - 12108729

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
           ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||
T 12108777 gataaatcaaacatgtcttagatcaaatcataatcatattcaatgtttt 12108729

Target: chr3; HSP #25

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002

Query Start/End: Original strand, 44 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 24643635 - 24643593

Alignment:

Q 44       atcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||
T 24643635 atcataatcatgttcaatgttttatttacttccgctattgatt 24643593

Target: chr4 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 23)

Name: chr4

Description:

Target: chr4; HSP #1

Raw Score: 70; E-Value: 1e-31

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 33458376 - 33458283

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||
T 33458376 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgatttacgattgttgaacatatattatga 33458283

Target: chr4; HSP #2

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 6257314 - 6257221

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||
T 6257314 gataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgatttatgattgttgaacatgtattatga 6257221

Target: chr4; HSP #3

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10733355 - 10733262

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10733355 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10733262

Target: chr4; HSP #4

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10739448 - 10739355

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10739448 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10739355

Target: chr4; HSP #5

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10947124 - 10947031

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10947124 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10947031

Target: chr4; HSP #6

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 10953217 - 10953124

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 10953217 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttctgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 10953124

Target: chr4; HSP #7

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 24288037 - 24288130

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 24288037 gataaatcaaacatgtcgtagatacgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 24288130

Target: chr4; HSP #8

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Complemental strand, 33461502 - 33461421

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||
T 33461502 gataaatcaaacatgtcgtaaatccgaccataatcatgttcaatgttttgtttgcttccactattgatttacgattgttgaa 33461421

Target: chr4; HSP #9

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 49976637 - 49976730

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||
T 49976637 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgctttcgctatcgattcataattgttgaatatgttttatga 49976730

Target: chr4; HSP #10

Raw Score: 53; E-Value: 2e-21

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 48161009 - 48161077

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 48161009 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 48161077

Target: chr4; HSP #11

Raw Score: 53; E-Value: 2e-21

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 48167228 - 48167296

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 48167228 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataattatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 48167296

Target: chr4; HSP #12

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 99

Target Start/End: Original strand, 50168643 - 50168724

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaa 99
           |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||||||
T 50168643 gataaatcaaacatgtcgtatattcgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaa 50168724

Target: chr4; HSP #13

Raw Score: 46; E-Value: 3e-17

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 26963450 - 26963357

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 26963450 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 26963357

Target: chr4; HSP #14

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 26 - 71

Target Start/End: Original strand, 3769625 - 3769670

Alignment:

Q 26      aaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 71
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
T 3769625 aaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttg 3769670

Target: chr4; HSP #15

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 59

Target Start/End: Original strand, 4632441 - 4632482

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 59
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T 4632441 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttca 4632482

Target: chr4; HSP #16

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 27 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 26956929 - 26956845

Alignment:

Q 27       aacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 26956929 aacatgtcgtagatccgttcatacttatgttcaatgttttatttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 26956845

Target: chr4; HSP #17

Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 81

Target Start/End: Complemental strand, 44831721 - 44831658

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctat 81
           ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||
T 44831721 gataaattaaacatgtcgtagattcgatcatattcatgttcaatgattaatttgcttccgctat 44831658

Target: chr4; HSP #18

Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009

Query Start/End: Original strand, 18 - 64

Target Start/End: Original strand, 9237413 - 9237459

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtt 64
          |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||
T 9237413 gataaatcaaacatgtcgtaaatccgagcataatcatattcaatgtt 9237459

Target: chr4; HSP #19

Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 75

Target Start/End: Original strand, 28704561 - 28704618

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttc 75
           |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
T 28704561 gatacatcaaacatgttgtagatctgatcatattcatgctcaatattttatttgtttc 28704618

Target: chr4; HSP #20

Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006

Query Start/End: Original strand, 19 - 66

Target Start/End: Original strand, 50427427 - 50427473

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
           |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
T 50427427 ataaattaaacatgtcgtacatccgatcataatcat-ttcaatgtttt 50427473

Target: chr4; HSP #21

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 80

Target Start/End: Original strand, 33045266 - 33045328

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgcta 80
           |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||
T 33045266 gatagatcaaacaagttgtagatccgattataatcatgtttagttttttatttgcttctgcta 33045328

Target: chr4; HSP #22

Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009

Query Start/End: Original strand, 18 - 87

Target Start/End: Original strand, 32284702 - 32284771

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgattt 87
           ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||
T 32284702 gataaataaaacatgttctagatctgattatattcctgttcaatattttatttgtttccgctaatgattt 32284771

Target: chr4; HSP #23

Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009

Query Start/End: Original strand, 39 - 88

Target Start/End: Complemental strand, 55473230 - 55473181

Alignment:

Q 39       atccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgattta 88
           |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||
T 55473230 atccaatcataatcatattcaatattttatttgcttccgctattgattta 55473181

Target: chr8 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 16)

Name: chr8

Description:

Target: chr8; HSP #1

Raw Score: 68; E-Value: 2e-30

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Original strand, 7771284 - 7771375

Alignment:

Q 20      taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||
T 7771284 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgtattatga 7771375

Target: chr8; HSP #2

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 14799525 - 14799432

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 14799525 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 14799432

Target: chr8; HSP #3

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 42993113 - 42993020

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 42993113 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 42993020

Target: chr8; HSP #4

Raw Score: 64; E-Value: 5e-28

Query Start/End: Original strand, 18 - 109

Target Start/End: Complemental strand, 5542269 - 5542178

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattat 109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||
T 5542269 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattat 5542178

Target: chr8; HSP #5

Raw Score: 64; E-Value: 5e-28

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Original strand, 32890941 - 32891032

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 32890941 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 32891032

Target: chr8; HSP #6

Raw Score: 64; E-Value: 5e-28

Query Start/End: Original strand, 20 - 111

Target Start/End: Original strand, 32897065 - 32897156

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 32897065 taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 32897156

Target: chr8; HSP #7

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 9935329 - 9935422

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 9935329 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 9935422

Target: chr8; HSP #8

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 36819021 - 36819114

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 36819021 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatattcaatgttttgtttgcttccactattgattcataattgttgaacatgtattatga 36819114

Target: chr8; HSP #9

Raw Score: 57; E-Value: 7e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 14417991 - 14418059

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 14417991 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 14418059

Target: chr8; HSP #10

Raw Score: 53; E-Value: 2e-21

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 10705887 - 10705986

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatca------taatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||
T 10705887 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttacgctattgatttacgattgttaaacatgtattatga 10705986

Target: chr8; HSP #11

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 22219826 - 22219757

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgt-ttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||
T 22219826 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaaagttttctttttcttctgctattgatt 22219757

Target: chr8; HSP #12

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 39735661 - 39735568

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 39735661 gataaatcaaacatgtcgtagatacaatcataatcatgttcaatattttatttacttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 39735568

Target: chr8; HSP #13

Raw Score: 49; E-Value: 4e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 66

Target Start/End: Original strand, 10700079 - 10700127

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T 10700079 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 10700127

Target: chr8; HSP #14

Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 1882862 - 1882793

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgt-agatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
          ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 1882862 gataaatcaaacatgtcattagatccgttcatattcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 1882793

Target: chr8; HSP #15

Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009

Query Start/End: Original strand, 36 - 86

Target Start/End: Original strand, 24250171 - 24250221

Alignment:

Q 36       tagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||
T 24250171 tagatccgatcataataatgttcaatattttgtttgtttccgctattgatt 24250221

Target: chr8; HSP #16

Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001

Query Start/End: Original strand, 43 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 39727404 - 39727336

Alignment:

Q 43       gatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 39727404 gatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgttattgattcataattgttgaacatgttttatga 39727336

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 16)

Name: chr7

Description:

Target: chr7; HSP #1

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 3811278 - 3811185

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 3811278 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 3811185

Target: chr7; HSP #2

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 3817420 - 3817327

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 3817420 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 3817327

Target: chr7; HSP #3

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 20239001 - 20239094

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||
T 20239001 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatgtatgattgttgaacatgttttatga 20239094

Target: chr7; HSP #4

Raw Score: 66; E-Value: 3e-29

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 28421068 - 28420975

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||
T 28421068 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatttataattgttgaacatgttttatga 28420975

Target: chr7; HSP #5

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 339421 - 339514

Alignment:

Q 18     gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 339421 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 339514

Target: chr7; HSP #6

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 351836 - 351929

Alignment:

Q 18     gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 351836 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctgttgattcataattgttgaacatgttttatga 351929

Target: chr7; HSP #7

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 35148113 - 35148020

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||
T 35148113 gataaatcaaacgtgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctatcgatttataattgttgaacatgttttatga 35148020

Target: chr7; HSP #8

Raw Score: 58; E-Value: 2e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 42767404 - 42767311

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||
T 42767404 gataaatcaaatatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatattttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgtattatga 42767311

Target: chr7; HSP #9

Raw Score: 57; E-Value: 7e-24

Query Start/End: Original strand, 19 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 5979282 - 5979190

Alignment:

Q 19      ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||
T 5979282 ataaatcaaacatgtcgtagatccaatcataatcatgttcaatagtttgtttgctttcgctattgatttacgattgttcaacatgtattatga 5979190

Target: chr7; HSP #10

Raw Score: 54; E-Value: 4e-22

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 26383676 - 26383769

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 26383676 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatgatcatgttcaatattttgtttgtttctgttgttgattcataattgttgaacatgtcttatga 26383769

Target: chr7; HSP #11

Raw Score: 49; E-Value: 4e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 43540035 - 43540103

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||
T 43540035 gataaatcaaacatgttgtagatccgatcataatcatgttcaatattttatttaattccgctattgatt 43540103

Target: chr7; HSP #12

Raw Score: 47; E-Value: 6e-18

Query Start/End: Original strand, 18 - 64

Target Start/End: Complemental strand, 22742034 - 22741988

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtt 64
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T 22742034 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtt 22741988

Target: chr7; HSP #13

Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 12804050 - 12804143

Alignment:

Q 18       gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
           |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||
T 12804050 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatgttcatgttcaatgttttgcttgcttccgctattgattcataatcgttgaacatgttttatga 12804143

Target: chr7; HSP #14

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 5849575 - 5849643

Alignment:

Q 18      gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
          |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||
T 5849575 gataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatatttatgttcaatgttttggttgcttccgctattgatt 5849643

Target: chr7; HSP #15

Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001

Query Start/End: Original strand, 19 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 30219354 - 30219287

Alignment:

Q 19       ataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
           ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||
T 30219354 ataaatcaaacatgtcgtagatccgttcatattcatgttcaacgttttgtttgattccgctaatgatt 30219287

Target: chr7; HSP #16

Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006

Query Start/End: Original strand, 20 - 71

Target Start/End: Complemental strand, 18666602 - 18666552

Alignment:

Q 20       taaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 71
           |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||
T 18666602 taaatcaaacatgtcgta-atctgatcataatcaagttcaatgttttgtttg 18666552

Target: scaffold0236 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)

Name: scaffold0236

Description:

Target: scaffold0236; HSP #1

Raw Score: 62; E-Value: 7e-27

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Original strand, 5585 - 5678

Alignment:

Q 18   gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 5585 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgttgaacatgttttatga 5678

Target: scaffold0363 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)

Name: scaffold0363

Description:

Target: scaffold0363; HSP #1

Raw Score: 57; E-Value: 7e-24

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Complemental strand, 728 - 660

Alignment:

Q 18  gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 728 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 660

Target: scaffold0208 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)

Name: scaffold0208

Description:

Target: scaffold0208; HSP #1

Raw Score: 53; E-Value: 2e-21

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 12446 - 12514

Alignment:

Q 18    gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
T 12446 gataaatcaaacatgtcgtagattcgatcataattatgttcaatgttttatttgcttccgctattgatt 12514

Target: scaffold0208; HSP #2

Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002

Query Start/End: Original strand, 18 - 86

Target Start/End: Original strand, 6573 - 6641

Alignment:

Q 18   gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatt 86
       |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||
T 6573 gataaatcaaacatgttgtagattcagtcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgctattgatt 6641

Target: scaffold0440 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0440

Description:

Target: scaffold0440; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 1303 - 1210

Alignment:

Q 18   gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||
T 1303 gataaatcaaacatatcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttgtttgcttccgcctttgattcataattgttgaacatgttttatga 1210

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)

Name: scaffold0012

Description:

Target: scaffold0012; HSP #1

Raw Score: 50; E-Value: 1e-19

Query Start/End: Original strand, 18 - 111

Target Start/End: Complemental strand, 172999 - 172906

Alignment:

Q 18     gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttgtttctgctattgatttacgattgttgaatatgtattatga 111
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||
T 172999 gataaattaaacatgtcgtagatccgatcataatcattttcaatgttttgtttgcttccgctattgattcataattgtagaacatgttttatga 172906

Target: scaffold0185 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)

Name: scaffold0185

Description:

Target: scaffold0185; HSP #1

Raw Score: 45; E-Value: 1e-16

Query Start/End: Original strand, 18 - 66

Target Start/End: Original strand, 5973 - 6021

Alignment:

Q 18   gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgtttt 66
       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
T 5973 gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcatattcatgttcaatgtttt 6021

Target: scaffold0085 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)

Name: scaffold0085

Description:

Target: scaffold0085; HSP #1

Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002

Query Start/End: Original strand, 25 - 71

Target Start/End: Original strand, 38485 - 38531

Alignment:

Q 25    caaacatgtcgtagatccgatcataatcatgttcaatgttttatttg 71
        ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||
T 38485 caaacatgttgtagatccgatcataactatgttcaatgttttgtttg 38531

Target: scaffold1114 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)

Name: scaffold1114

Description:

Target: scaffold1114; HSP #1

Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004

Query Start/End: Original strand, 18 - 54

Target Start/End: Original strand, 1138 - 1174

Alignment:

Q 18   gataaatcaaacatgtcgtagatccgatcataatcat 54
       ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
T 1138 gataagtcaaacatgtcgttgatccgatcataatcat 1174