View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20392_low_49 (Length: 216)

Name: NF20392_low_49
Description: NF20392
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20392_low_49
NF20392_low_49
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (1-110)||(10078-10187)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (94-216)||(25140473-25140596)
chr2 (95-216)||(14184051-14184172)
chr2 (95-216)||(14184334-14184455)
chr2 (141-216)||(10744230-10744305)
chr2 (95-207)||(14180307-14180419)
chr2 (141-207)||(25140318-25140384)
chr2 (94-213)||(21368266-21368383)
chr2 (141-216)||(25140602-25140677)
chr2 (94-215)||(25587419-25587538)
chr2 (95-204)||(14184541-14184650)
chr2 (94-216)||(1384351-1384471)
chr2 (126-204)||(14180425-14180503)
chr2 (126-216)||(25140538-25140627)
chr2 (98-216)||(21336273-21336389)
chr2 (94-185)||(22686079-22686170)
chr2 (107-216)||(25587369-25587476)
chr2 (99-185)||(28345796-28345882)
chr2 (94-170)||(21336332-21336408)
chr2 (94-170)||(36735210-36735286)
chr2 (94-169)||(36736897-36736972)
chr2 (95-185)||(14184179-14184269)
chr2 (90-152)||(23609805-23609867)
chr2 (94-166)||(1384414-1384486)
chr2 (94-170)||(21316439-21316515)
chr2 (141-216)||(21368326-21368399)
chr2 (101-177)||(25085721-25085797)
chr2 (141-215)||(21316423-21316495)
chr2 (141-216)||(25140374-25140448)
chr2 (99-169)||(28345980-28346050)
chr2 (95-216)||(14184114-14184235)
chr2 (94-169)||(25085666-25085741)
chr2 (92-170)||(21368244-21368322)
chr2 (141-206)||(23799481-23799544)
chr2 (96-169)||(21336473-21336546)
chr2 (95-168)||(21368183-21368256)
chr2 (145-213)||(36736885-36736951)
chr2 (141-185)||(21368408-21368452)
chr2 (94-155)||(23799410-23799475)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (90-216)||(17979078-17979202)
chr8 (94-207)||(31724159-31724273)
chr8 (94-216)||(20517850-20517970)
chr8 (94-185)||(22473858-22473949)
chr8 (94-216)||(36405713-36405833)
chr8 (141-216)||(36728672-36728747)
chr8 (94-207)||(23669823-23669934)
chr8 (94-205)||(6573746-6573855)
chr8 (94-170)||(22473810-22473886)
chr8 (94-185)||(22473921-22474012)
chr8 (94-185)||(23669969-23670060)
chr8 (92-216)||(18819457-18819579)
chr8 (96-216)||(22473955-22474073)
chr8 (94-216)||(5080275-5080395)
chr8 (94-212)||(5080216-5080332)
chr8 (94-169)||(20517913-20517988)
chr8 (94-216)||(22207572-22207692)
chr8 (141-216)||(31724143-31724217)
chr8 (94-185)||(38988773-38988864)
chr8 (94-185)||(39019870-39019961)
chr8 (95-185)||(6573684-6573774)
chr8 (95-185)||(17438051-17438141)
chr8 (92-170)||(18815547-18815625)
chr8 (107-216)||(22344304-22344411)
chr8 (126-216)||(36728722-36728812)
chr8 (141-207)||(36728837-36728903)
chr8 (94-214)||(38988630-38988748)
chr8 (94-214)||(39019727-39019845)
chr8 (94-216)||(17979145-17979265)
chr8 (94-216)||(18819522-18819642)
chr8 (94-177)||(22207483-22207566)
chr8 (94-185)||(22207538-22207629)
chr8 (94-169)||(22355946-22356021)
chr8 (94-185)||(23669906-23669997)
chr8 (149-204)||(31724036-31724091)
chr8 (94-185)||(36733242-36733333)
chr8 (94-184)||(18817127-18817217)
chr8 (107-216)||(22355964-22356071)
chr8 (94-184)||(38988595-38988685)
chr8 (94-184)||(39019692-39019782)
chr8 (94-169)||(4381458-4381533)
chr8 (94-185)||(18819396-18819487)
chr8 (94-169)||(22344286-22344361)
chr8 (94-169)||(36405776-36405851)
chr8 (94-185)||(36733179-36733270)
chr8 (94-169)||(38988547-38988622)
chr8 (94-169)||(39019644-39019719)
chr8 (108-216)||(17438001-17438107)
chr8 (101-216)||(22483009-22483122)
chr8 (99-207)||(23883305-23883411)
chr8 (141-185)||(12800592-12800636)
chr8 (94-185)||(18815488-18815577)
chr8 (141-216)||(23885790-23885863)
chr8 (141-212)||(38988811-38988880)
chr8 (141-212)||(39019908-39019977)
chr8 (94-169)||(17979208-17979283)
chr8 (126-185)||(18819365-18819424)
chr8 (107-170)||(18833777-18833840)
chr8 (94-185)||(21513563-21513654)
chr8 (94-185)||(22474047-22474138)
chr8 (94-169)||(22482991-22483066)
chr8 (94-169)||(23885772-23885847)
chr8 (141-216)||(18815649-18815722)
chr8 (113-169)||(21677216-21677272)
chr8 (144-207)||(22258941-22259002)
chr8 (149-216)||(23670003-23670068)
chr8 (157-216)||(36733179-36733236)
[»] scaffold1223 (2 HSPs)
scaffold1223 (141-216)||(489-564)
scaffold1223 (141-207)||(579-643)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (126-216)||(17902429-17902519)
chr1 (94-216)||(18120808-18120928)
chr1 (94-216)||(50543929-50544049)
chr1 (94-185)||(7321579-7321670)
chr1 (94-216)||(18120745-18120865)
chr1 (94-185)||(50544147-50544238)
chr1 (90-185)||(18120900-18120995)
chr1 (94-185)||(44891756-44891847)
chr1 (95-185)||(48301160-48301250)
chr1 (94-169)||(14793215-14793290)
chr1 (94-185)||(21244609-21244700)
chr1 (90-185)||(24720355-24720450)
chr1 (94-216)||(50543866-50543986)
chr1 (94-185)||(50544021-50544112)
chr1 (94-185)||(50544084-50544175)
chr1 (99-207)||(14793750-14793855)
chr1 (141-205)||(51475685-51475749)
chr1 (94-216)||(6833481-6833601)
chr1 (94-169)||(7321642-7321717)
chr1 (141-216)||(21244593-21244666)
chr1 (94-185)||(24720422-24720513)
chr1 (95-170)||(25262898-25262973)
chr1 (107-216)||(39060358-39060465)
chr1 (107-216)||(48301194-48301301)
chr1 (101-170)||(45496251-45496320)
chr1 (141-189)||(1642169-1642217)
chr1 (113-185)||(22824095-22824167)
chr1 (94-169)||(39060340-39060415)
chr1 (94-169)||(50543848-50543923)
chr1 (97-169)||(6833463-6833535)
chr1 (141-185)||(12710180-12710224)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (94-186)||(35660140-35660232)
chr4 (90-185)||(14508057-14508152)
chr4 (94-216)||(46740413-46740534)
chr4 (141-216)||(14629377-14629452)
chr4 (90-185)||(19566580-19566675)
chr4 (94-185)||(12622679-12622770)
chr4 (94-215)||(55582465-55582583)
chr4 (94-170)||(9923545-9923621)
chr4 (94-170)||(11479238-11479314)
chr4 (94-170)||(26445128-26445204)
chr4 (98-170)||(46225337-46225409)
chr4 (94-216)||(46740350-46740471)
chr4 (94-169)||(9621669-9621744)
chr4 (94-169)||(10272748-10272823)
chr4 (94-169)||(13164366-13164441)
chr4 (94-216)||(14507902-14508022)
chr4 (94-212)||(14507969-14508085)
chr4 (94-185)||(46740506-46740597)
chr4 (94-216)||(10272766-10272882)
chr4 (97-170)||(14507883-14507956)
chr4 (96-185)||(44024259-44024348)
chr4 (94-207)||(14629323-14629436)
chr4 (141-215)||(13164385-13164457)
chr4 (141-207)||(35660045-35660109)
chr4 (94-169)||(40229626-40229701)
chr4 (94-216)||(45315002-45315122)
chr4 (143-207)||(44024736-44024798)
chr4 (141-216)||(40229644-40229717)
chr4 (141-216)||(46740540-46740613)
chr4 (94-169)||(12622632-12622707)
chr4 (141-215)||(26445148-26445220)
chr4 (94-185)||(13164525-13164612)
chr4 (70-107)||(12384834-12384871)
chr4 (157-216)||(9621687-9621744)
chr4 (141-185)||(25512941-25512985)
chr4 (141-185)||(26922455-26922499)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (141-216)||(262-337)
scaffold1186 (126-207)||(172-251)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (141-216)||(33851-33926)
scaffold0113 (94-185)||(33817-33910)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (94-216)||(26749392-26749512)
chr5 (94-216)||(20198384-20198504)
chr5 (94-206)||(21399736-21399846)
chr5 (94-214)||(26749331-26749449)
chr5 (94-205)||(26761717-26761826)
chr5 (94-185)||(8833825-8833916)
chr5 (94-216)||(14026536-14026656)
chr5 (94-169)||(16062639-16062714)
chr5 (94-216)||(14026599-14026719)
chr5 (94-216)||(16062755-16062875)
chr5 (141-205)||(20565086-20565150)
chr5 (90-185)||(14026469-14026564)
chr5 (94-185)||(18743892-18743983)
chr5 (94-185)||(20198321-20198412)
chr5 (94-169)||(21503271-21503346)
chr5 (95-163)||(21399951-21400019)
chr5 (97-169)||(26749248-26749320)
chr5 (94-185)||(1628046-1628137)
chr5 (94-185)||(1628109-1628200)
chr5 (94-169)||(8504522-8504597)
chr5 (94-216)||(8833888-8834008)
chr5 (94-169)||(14026662-14026737)
chr5 (126-216)||(16062818-16062906)
chr5 (94-169)||(18743795-18743870)
chr5 (94-185)||(20198447-20198538)
chr5 (113-215)||(21399692-21399792)
chr5 (122-207)||(23200122-23200205)
chr5 (94-166)||(16062740-16062812)
chr5 (141-216)||(20198305-20198378)
chr5 (141-216)||(21399934-21400007)
chr5 (98-169)||(30613311-30613382)
chr5 (94-189)||(30613602-30613697)
chr5 (94-169)||(1628225-1628300)
chr5 (126-216)||(16062657-16062745)
chr5 (103-170)||(21401715-21401782)
chr5 (141-215)||(21503290-21503362)
chr5 (103-185)||(21399843-21399925)
chr5 (94-216)||(26749266-26749386)
chr5 (100-189)||(30611615-30611704)
chr5 (141-189)||(30611574-30611622)
chr5 (141-189)||(30613561-30613609)
chr5 (98-170)||(30613684-30613756)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (126-216)||(19957566-19957656)
chr6 (94-216)||(35056605-35056725)
chr6 (94-207)||(20411322-20411433)
chr6 (97-216)||(29044465-29044582)
chr6 (94-170)||(18928072-18928148)
chr6 (94-169)||(29044447-29044522)
chr6 (94-169)||(35056587-35056662)
chr6 (141-212)||(23492572-23492643)
chr6 (126-205)||(23492658-23492737)
chr6 (141-212)||(23498170-23498241)
chr6 (126-205)||(23498256-23498335)
chr6 (94-216)||(25920933-25921053)
chr6 (98-216)||(25920996-25921112)
chr6 (105-185)||(13284940-13285020)
chr6 (94-170)||(18584930-18585006)
chr6 (97-185)||(21680592-21680680)
chr6 (101-185)||(32259105-32259189)
chr6 (94-185)||(22556483-22556574)
chr6 (90-216)||(29044528-29044652)
chr6 (101-216)||(13284974-13285084)
chr6 (166-216)||(19957541-19957591)
chr6 (141-216)||(35056668-35056741)
chr6 (94-169)||(22556392-22556467)
chr6 (127-185)||(10445382-10445440)
chr6 (126-214)||(22556519-22556605)
chr6 (149-216)||(20411314-20411379)
chr6 (141-185)||(35056750-35056794)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (141-216)||(187931-188006)
scaffold0005 (94-207)||(187947-188060)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (141-207)||(66347-66413)
scaffold0054 (94-205)||(65659-65768)
scaffold0054 (94-169)||(65722-65797)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (94-207)||(16180307-16180420)
chr3 (94-169)||(3528209-3528284)
chr3 (141-204)||(11191633-11191696)
chr3 (141-216)||(11562218-11562293)
chr3 (94-216)||(3528146-3528266)
chr3 (141-216)||(16180291-16180365)
chr3 (94-216)||(17207415-17207535)
chr3 (94-216)||(21846261-21846381)
chr3 (94-169)||(25201203-25201278)
chr3 (98-216)||(25201221-25201337)
chr3 (99-185)||(24553187-24553273)
chr3 (99-185)||(24556300-24556386)
chr3 (94-167)||(54330971-54331044)
chr3 (94-189)||(11562091-11562187)
chr3 (96-188)||(15025876-15025968)
chr3 (94-216)||(17207478-17207598)
chr3 (101-185)||(24553537-24553621)
chr3 (101-185)||(24556587-24556671)
chr3 (141-207)||(11191488-11191552)
chr3 (94-185)||(17207570-17207661)
chr3 (126-215)||(22842344-22842431)
chr3 (99-185)||(24546018-24546104)
chr3 (94-170)||(12540566-12540642)
chr3 (94-170)||(33564478-33564554)
chr3 (141-216)||(11562129-11562203)
chr3 (142-204)||(11191544-11191605)
chr3 (92-216)||(12540585-12540707)
chr3 (101-169)||(1208733-1208801)
chr3 (126-216)||(14519595-14519683)
chr3 (94-169)||(17207397-17207472)
chr3 (94-169)||(21846324-21846399)
chr3 (94-185)||(24545892-24545983)
chr3 (94-185)||(24553656-24553747)
chr3 (94-185)||(24556706-24556797)
chr3 (94-185)||(50351822-50351913)
chr3 (94-170)||(54331088-54331166)
chr3 (98-168)||(14519578-14519648)
chr3 (107-185)||(17207633-17207711)
chr3 (107-185)||(30175207-30175285)
chr3 (141-205)||(17044292-17044354)
chr3 (94-183)||(24553308-24553397)
chr3 (94-183)||(24556358-24556447)
chr3 (70-107)||(52466145-52466182)
chr3 (141-189)||(16727975-16728023)
chr3 (157-216)||(33564497-33564554)
chr3 (141-189)||(35065978-35066026)
[»] scaffold0645 (3 HSPs)
scaffold0645 (141-216)||(402-477)
scaffold0645 (94-189)||(508-604)
scaffold0645 (141-216)||(492-566)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (94-185)||(7322-7413)
scaffold0639 (106-216)||(7271-7379)
[»] scaffold0086 (4 HSPs)
scaffold0086 (94-212)||(36227-36343)
scaffold0086 (94-216)||(36290-36412)
scaffold0086 (94-169)||(36353-36430)
scaffold0086 (141-216)||(36211-36284)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (94-216)||(61997-62117)
scaffold0063 (94-169)||(61979-62054)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (94-173)||(64696-64775)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (141-216)||(13133863-13133938)
chr7 (94-185)||(13745509-13745600)
chr7 (98-216)||(15576689-15576805)
chr7 (94-216)||(43747739-43747859)
chr7 (141-207)||(13133964-13134030)
chr7 (141-205)||(14220371-14220435)
chr7 (94-205)||(15119975-15120084)
chr7 (141-205)||(37785671-37785735)
chr7 (141-205)||(47093798-47093862)
chr7 (94-170)||(48213661-48213737)
chr7 (141-204)||(13133808-13133871)
chr7 (94-185)||(15576496-15576587)
chr7 (94-216)||(15576622-15576742)
chr7 (94-185)||(38294600-38294691)
chr7 (94-216)||(38294634-38294754)
chr7 (94-185)||(43747705-43747796)
chr7 (94-170)||(20253007-20253083)
chr7 (94-185)||(4691561-4691652)
chr7 (94-216)||(8470755-8470875)
chr7 (95-213)||(8470929-8471045)
chr7 (94-185)||(9743735-9743826)
chr7 (94-185)||(9743798-9743889)
chr7 (98-185)||(25941540-25941627)
chr7 (98-216)||(25941574-25941690)
chr7 (98-216)||(25941637-25941753)
chr7 (94-185)||(33556909-33556999)
chr7 (94-185)||(36301489-36301580)
chr7 (94-215)||(15576559-15576678)
chr7 (94-170)||(8470736-8470812)
chr7 (94-170)||(8472770-8472846)
chr7 (94-213)||(8473030-8473146)
chr7 (141-216)||(37538471-37538544)
chr7 (141-216)||(38294697-38294770)
chr7 (107-185)||(8851842-8851920)
chr7 (141-216)||(15119959-15120032)
chr7 (141-216)||(36301473-36301546)
chr7 (94-216)||(8471080-8471200)
chr7 (94-185)||(20253070-20253161)
chr7 (141-207)||(33556893-33556957)
chr7 (107-185)||(20619577-20619655)
chr7 (107-216)||(25941700-25941807)
chr7 (107-169)||(30237042-30237104)
chr7 (94-151)||(37538471-37538528)
chr7 (94-170)||(8471061-8471137)
chr7 (141-185)||(37538654-37538698)
chr7 (141-185)||(48213645-48213689)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (94-207)||(24657-24768)
scaffold0162 (141-216)||(24641-24714)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (95-216)||(142812-142931)
scaffold0020 (95-185)||(142778-142868)
scaffold0020 (126-216)||(142875-142963)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (141-205)||(7015-7079)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (94-170)||(1053-1129)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (94-170)||(18475-18551)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (95-170)||(7641-7716)
scaffold0111 (95-170)||(14760-14835)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (94-215)||(7447-7567)
scaffold0108 (94-216)||(7511-7631)
scaffold0108 (98-185)||(7578-7665)
[»] scaffold0505 (2 HSPs)
scaffold0505 (95-177)||(3940-4022)
scaffold0505 (95-170)||(1927-2002)
[»] scaffold0231 (3 HSPs)
scaffold0231 (94-215)||(18307-18426)
scaffold0231 (98-216)||(18437-18553)
scaffold0231 (98-168)||(18500-18570)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (94-170)||(642-718)
scaffold0462 (94-170)||(6148-6224)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (141-205)||(1074-1138)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (102-170)||(19373-19441)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (94-166)||(40377-40449)
scaffold0011 (126-207)||(40303-40382)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (95-170)||(1150-1225)
scaffold1539 (107-216)||(1169-1276)
[»] scaffold1256 (2 HSPs)
scaffold1256 (99-185)||(37-123)
scaffold1256 (94-185)||(95-186)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (101-216)||(9973-10086)
scaffold0379 (94-169)||(9955-10030)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (94-170)||(5294-5370)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (94-170)||(11074-11150)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (94-170)||(7519-7595)
[»] scaffold1354 (2 HSPs)
scaffold1354 (94-169)||(427-502)
scaffold1354 (127-216)||(397-484)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (97-164)||(14-81)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (94-168)||(4277-4351)
scaffold0628 (94-168)||(8837-8911)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (107-185)||(2517-2595)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (113-185)||(27591-27663)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (94-169)||(8143-8218)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (126-185)||(3153-3212)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (94-169)||(56300-56375)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (94-185)||(62816-62907)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (104-212)||(7194-7300)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (144-216)||(8224-8294)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (141-185)||(29849-29893)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (141-189)||(20337-20385)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (141-185)||(29397-29441)


Alignment Details
Target: scaffold0145 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 10187 - 10078
Alignment:
Q  1 ttactagaactagtatcatgtacctatcattcttttaagtcatataactgattttaaaattaataacaatgatgtgttatttaacgaagtttaattgatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10187 ttactagaactagtatcatgtacctatcattcttttaaatcatataactgattttaaaattaataacaatgatgggttatttaacgaagtttgattgatg 10088  T
Q  101 aattattata 110  Q
    ||||||||||    
T  10087 aattattata 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25140596 - 25140473
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  25140596 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgat 25140497  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  25140496 gaatatgatgttatatgatgttgt 25140473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 14184051 - 14184172
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  14184051 ttgatgatttattatatgaatgtatatgtttataaatatgatgttatatgatgttgttcatgcttgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatga 14184150  T
Q  195 atatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  14184151 atatgatgttatatgatgttgt 14184172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 14184334 - 14184455
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  14184334 ttgatgatttattatatgaatgtatatgtttataaatatgatgttatatgatgttgttcataattgatgaattattgtatgaatgtaaatgatgtgatga 14184433  T
Q  195 atatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  14184434 atatgatgttatatgatgttgt 14184455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 10744230 - 10744305
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10744230 tatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 10744305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Original strand, 14180307 - 14180419
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  14180307 ttgatgatttattatatgaatgtatatgttcatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgcttgatgaactattgtatgaatgtatatgatgtgatga 14180406  T
Q  195 atatgatgttata 207  Q
    |||||||||||||    
T  14180407 atatgatgttata 14180419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25140384 - 25140318
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25140384 tatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttata 25140318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21368383 - 21368266
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  21368383 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcataattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 21368286  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgt 213  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21368285 aatatgatgttatatgatgt 21368266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25140677 - 25140602
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25140677 tatgatgttgttcattattgatgagttattttatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 25140602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 25587419 - 25587538
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||   ||| |    
T  25587419 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatgtg--ttgatg 25587516  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  25587517 aatatgatgttatatgatgttg 25587538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Original strand, 14184541 - 14184650
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||  ||    
T  14184541 ttgatgatttattatataaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttcttcattcttgatgaattattatatgaatatatatgatgtggtga 14184640  T
Q  195 atatgatgtt 204  Q
    ||||||||||    
T  14184641 atatgatgtt 14184650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 1384351 - 1384471
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  1384351 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatcttatataatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 1384448  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  1384449 aatatgatgttatatgatgttgt 1384471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 14180425 - 14180503
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtt 204  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14180425 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgcttgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtt 14180503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25140627 - 25140538
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25140627 atgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgttatatgatgttgt 25140538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 21336273 - 21336389
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||    
T  21336273 atgaattattctatgaatgtatatgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaata 21336370  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  21336371 tgatgttatatgatgttgt 21336389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22686170 - 22686079
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22686170 attgatgaattattatatgaatatatatattgatgaatatgatgtcatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22686079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 25587369 - 25587476
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  25587369 tatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgctcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttat 25587466  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  25587467 atgatgttgt 25587476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 28345796 - 28345882
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  28345796 tgaattgttatatgaatgtatatattgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 28345882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 21336332 - 21336408
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21336332 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgatgaattatt 21336408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 36735210 - 36735286
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36735210 attgatgaattattttatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 36735286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 36736897 - 36736972
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36736897 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgtcgttcatgattgatgaattat 36736972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 14184179 - 14184269
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14184179 ttgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttatacttgatgaattattgtatgaatgtatatg 14184269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23609867 - 23609805
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgtt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23609867 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgtt 23609805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Original strand, 1384414 - 1384486
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaat 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1384414 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaat 1384486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 21316439 - 21316515
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21316439 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgatcatggttgatgaattatt 21316515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21368399 - 21368326
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21368399 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 21368326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25085797 - 25085721
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaa 177  Q
    ||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25085797 aattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaa 25085721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Original strand, 21316423 - 21316495
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21316423 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttg 21316495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25140448 - 25140374
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  25140448 tatgatcttgttcattattgatgaattattatatgaacgtttatgat-tgatgaatacgattttatatgatgttgt 25140374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 28345980 - 28346050
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||||||  ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28345980 tgaattattataggaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 28346050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 14184114 - 14184235
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatct-at-taatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| | || | |||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||   |||     
T  14184114 ttgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgatgatttattatatgaatgtatatg--ttgat 14184211  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  14184212 gaatatgatgttatatgatgttgt 14184235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25085741 - 25085666
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||| ||| |   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25085741 attgatgaattattacatgaatgtacatgttaatgaatatgatgttacgtgatgttgttcataattgatgaattat 25085666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21368322 - 21368244
Alignment:
Q  92 taattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  21368322 taattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgtgtttaatgcttgatgaattatt 21368244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23799544 - 23799481
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||    
T  23799544 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgt--tgaatatgatgttat 23799481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 21336473 - 21336546
Alignment:
Q  96 tgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||| |  |||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21336473 tgatgaattattatgtggatgtatgtgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 21336546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21368256 - 21368183
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatta 168  Q
    |||||||||||||||||  |||||  | || |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  21368256 ttgatgaattattatatggatgtagatgttgatgaatataatgttatatgatgttcttcataattaatgaatta 21368183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 36736885 - 36736951
Alignment:
Q  145 atgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||    
T  36736885 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgt 36736951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21368452 - 21368408
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21368452 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 21368408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23799475 - 23799410
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctat----taatgaatataatgatctatgatgttgttcat 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||    | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23799475 attgatgaattattatatgaatgtatatatatgttgatgaatataatgttatatgatgttgttcat 23799410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 216
Target Start/End: Original strand, 17979078 - 17979202
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   |    
T  17979078 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--tt 17979175  T
Q  190 gacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17979176 gacgagtatgatgttatatgatgttgt 17979202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 31724159 - 31724273
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||     
T  31724159 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgattgtatatgatgtgat 31724258  T
Q  193 gaatatgatgttata 207  Q
    |||||||||||||||    
T  31724259 gaatatgatgttata 31724273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 20517850 - 20517970
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  20517850 attgatgaattattatatgaatgtatgtgtcgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 20517947  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20517948 aatatgatgttatatgatgttgt 20517970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22473949 - 22473858
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22473949 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22473858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 36405713 - 36405833
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  36405713 attgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 36405810  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  36405811 aatatgatgttacatgatgttgt 36405833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 36728672 - 36728747
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36728672 tatgatgttgttcatgatttatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 36728747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23669934 - 23669823
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  23669934 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 23669837  T
Q  194 aatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||    
T  23669836 aatatgatgttata 23669823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 205
Target Start/End: Original strand, 6573746 - 6573855
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||   ||| |    
T  6573746 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaataatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatg--ttgatg 6573843  T
Q  194 aatatgatgtta 205  Q
    ||||||||||||    
T  6573844 aatatgatgtta 6573855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22473886 - 22473810
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22473886 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcatgattgatgaattatt 22473810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22474012 - 22473921
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22474012 attgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatgatttatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22473921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23670060 - 23669969
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  23670060 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 23669969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 216
Target Start/End: Original strand, 18819457 - 18819579
Alignment:
Q  92 taattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtga 191  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||   |||    
T  18819457 taattgatgaagtattatatgaatgtatatgtttatgaatatgatgtcatatgatgttgttcatgattgatgaattattatgtgaatgtatatg--ttga 18819554  T
Q  192 cgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  18819555 tgaatatgatgttatatgatgttgt 18819579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22474073 - 22473955
Alignment:
Q  96 tgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaa 195  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| |||    
T  22474073 tgatgaaatattatatgaatgtatatggtaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatga--tgatgaa 22473976  T
Q  196 tatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| | || ||||||||    
T  22473975 tatgatgatttatgatgttgt 22473955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5080395 - 5080275
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   |||     
T  5080395 attgatgaactattatatgaatgtatatattgattaatatgaatg-tatatgatgttgttcatgattgatgaattattagatgaatgtatatg--ttgat 5080299  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  5080298 gaatatgatgttatatgatgttgt 5080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5080332 - 5080216
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  5080332 attgatgaattattagatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtccatgattgatgaattattatatgaaagtatatg--ttgatg 5080235  T
Q  194 aatatgatgttatacgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5080234 aatatgatgttatatgatg 5080216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 20517913 - 20517988
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20517913 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 20517988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22207692 - 22207572
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||   ||| |    
T  22207692 attgatgaattattagatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtgtatg--ttgatg 22207595  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  22207594 aaaatgatgttatatgatgttgt 22207572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 31724143 - 31724217
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31724143 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgttatatgatgttgt 31724217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38988864 - 38988773
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  38988864 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 38988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39019961 - 39019870
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  39019961 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 39019870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 6573684 - 6573774
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  6573684 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 6573774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 17438051 - 17438141
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17438051 ttgaggaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 17438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 170
Target Start/End: Original strand, 18815547 - 18815625
Alignment:
Q  92 taattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18815547 taattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 18815625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22344411 - 22344304
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||   |||  |||||||||||||    
T  22344411 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattgtatgaatgtatatg--ttgataaatatgatgttat 22344314  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  22344313 atgatgttgt 22344304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Original strand, 36728722 - 36728812
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36728722 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgttaatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 36728812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 36728837 - 36728903
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36728837 tatgatgttgttcattattgatgaattattatataaatgtatatgatgtgatgaatatgatcttata 36728903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38988748 - 38988630
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  38988748 attgatgaattattatatgaatttatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 38988651  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgtt 214  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  38988650 aatatgatgttacatgatgtt 38988630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39019845 - 39019727
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  39019845 attgatgaattattatatgaatttatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 39019748  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgtt 214  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  39019747 aatatgatgttacatgatgtt 39019727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 17979145 - 17979265
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || | || ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  17979145 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgacgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg--ttgatg 17979242  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  17979243 aatatgatgttacatgatgttgt 17979265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 18819522 - 18819642
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  18819522 attgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattaatgaagtattatatgaaggtatatg--ttgatg 18819619  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  18819620 aatatgatgttacatgatgttgt 18819642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22207566 - 22207483
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaa 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22207566 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatggtgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaa 22207483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22207629 - 22207538
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22207629 attgatgaattattatatgaatgtgtatgttgatgaaaatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22207538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22356021 - 22355946
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22356021 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 22355946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23669997 - 23669906
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  23669997 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtattatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 23669906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Original strand, 31724036 - 31724091
Alignment:
Q  149 tgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31724036 tgttcattattgatgagttattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtt 31724091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 36733242 - 36733333
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  36733242 attgataaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatg 36733333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Original strand, 18817127 - 18817217
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatat 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18817127 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatctgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 18817217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22356071 - 22355964
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   |||  |||||||||||||    
T  22356071 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgataaatatgatgttat 22355974  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  22355973 atgatgttgt 22355964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38988685 - 38988595
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatat 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  38988685 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 38988595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39019782 - 39019692
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatat 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  39019782 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 39019692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 4381458 - 4381533
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||  |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4381458 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgattttacatgatgttgttcataattgatgaattat 4381533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 18819396 - 18819487
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  18819396 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatattgttcataattgatgaagtattatatgaatgtatatg 18819487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22344361 - 22344286
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22344361 attgatgaattattgtatgaatgtatatgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 22344286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 36405776 - 36405851
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36405776 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattaatgaattat 36405851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 36733179 - 36733270
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||||    
T  36733179 attgatgaattattgtatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgataaagtattatatgaatgtatatg 36733270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38988622 - 38988547
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | | |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  38988622 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgaggttacatgatgttgtttataattgatgaattat 38988547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39019719 - 39019644
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | | |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  39019719 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgaggttacatgatgttgtttataattgatgaattat 39019644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 17438001 - 17438107
Alignment:
Q  108 atataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  17438001 atatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgaggaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 17438098  T
Q  208 cgatgttgt 216  Q
     ||||||||    
T  17438099 tgatgttgt 17438107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22483122 - 22483009
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||   ||| |||||||    
T  22483122 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgaatgca-tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatttg--ttgatgaatatg 22483026  T
Q  200 atgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22483025 atgttatatgatgttgt 22483009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23883411 - 23883305
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatat 198  Q
    ||||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||   ||| ||||||    
T  23883411 tgaattattatatgaatgtgtatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgctgaattattatatgaatgtgtatg--ttgatgaatat 23883314  T
Q  199 gatgttata 207  Q
    |||||||||    
T  23883313 gatgttata 23883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12800636 - 12800592
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12800636 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg 12800592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 18815488 - 18815577
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  18815488 attgatgaattattata--aatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcataattgatgaagtattatatgaatgtatatg 18815577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23885863 - 23885790
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23885863 tatgatgttgttcatgattgctgaattattatatgaacgtgtatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 23885790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38988880 - 38988811
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38988880 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatg 38988811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39019977 - 39019908
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||    
T  39019977 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatg 39019908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 17979208 - 17979283
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17979208 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgtttataattgatgaattat 17979283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Original strand, 18819365 - 18819424
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18819365 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 18819424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18833840 - 18833777
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18833840 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 18833777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21513654 - 21513563
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||  || | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  21513654 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatggtgttgtattatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 21513563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22474138 - 22474047
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||  | ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  22474138 attgatgaattattatattaatgtatatgttgatgagtatgatattatatgatgttgttcatgactgatgaaatattatatgaatgtatatg 22474047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22483066 - 22482991
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  22483066 attgatgaattattatatgaatgtatttgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttacgatcgatgaattat 22482991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23885847 - 23885772
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||| ||||||||||||| || || | | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23885847 attgctgaattattatatgaacgtgtatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 23885772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 18815649 - 18815722
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  18815649 tatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg--ttgatgaatatgatgttacatgatgttgt 18815722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 21677216 - 21677272
Alignment:
Q  113 aatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21677216 aatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 21677272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 207
Target Start/End: Original strand, 22258941 - 22259002
Alignment:
Q  144 gatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  22258941 gatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 22259002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23670068 - 23670003
Alignment:
Q  149 tgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23670068 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 23670003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 36733179 - 36733236
Alignment:
Q  157 attgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  36733179 attgatgaattattgtatgaatgtatatgttg--atgaatatgatgttatatgatgttgt 36733236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 489 - 564
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  489 tatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 579 - 643
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  579 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Original strand, 17902429 - 17902519
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17902429 atgaatatgatgttatatgatgttgtttattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 17902519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18120928 - 18120808
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  18120928 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 18120831  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  18120830 aatatgatgttatatgatgttgt 18120808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50544049 - 50543929
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||   ||| |    
T  50544049 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatgtgaatgtatatg--ttgatg 50543952  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  50543951 aatatgatgttatatgatgttgt 50543929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 7321579 - 7321670
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  7321579 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatataatgttacatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 7321670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18120865 - 18120745
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  18120865 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg--ttgatg 18120768  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  18120767 aatatgatgttacatgatgttgt 18120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50544238 - 50544147
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  50544238 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 50544147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18120995 - 18120900
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  18120995 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 18120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44891847 - 44891756
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  44891847 attgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgtccatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 44891756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48301250 - 48301160
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  48301250 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaaatattatatgaatgtatatg 48301160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 14793215 - 14793290
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14793215 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatgttacatgatgttgtttataattgatgaattat 14793290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 21244609 - 21244700
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  21244609 attgatgaattattacatgaatgtatatattgatgaatatgatgtcatatgatgttgttcatgattgataaattattatatgaatgtatatg 21244700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Original strand, 24720355 - 24720450
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||  | ||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  24720355 tttaattgattaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatattatatgacgctgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 24720450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50543986 - 50543866
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  50543986 attgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgataaagtattatatgaatgtatatg--ttgatg 50543889  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  50543888 aatatgatgttacatgatgttgt 50543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50544112 - 50544021
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  50544112 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgctgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 50544021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50544175 - 50544084
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  50544175 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtattatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 50544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Original strand, 14793750 - 14793855
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatat 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||    
T  14793750 tgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatg-attattatatgaatgtatatg--ttgatgaatat 14793846  T
Q  199 gatgttata 207  Q
    |||||||||    
T  14793847 gatgttata 14793855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51475749 - 51475685
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  51475749 tatgatgtcgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgtgataaatatgatgtta 51475685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6833601 - 6833481
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| |  |||||||||||  ||| | ||||| |   ||| |    
T  6833601 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgctgttcatgaaagatgaattattatatggatgtatacg--ttgatg 6833504  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  6833503 aatatgatgttataagatgttgt 6833481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 7321642 - 7321717
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7321642 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaacatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 7321717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 21244593 - 21244666
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  21244593 tatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtatat-at-tgatgaatatgatgtcatatgatgttgt 21244666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 24720422 - 24720513
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||  ||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  24720422 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtatgattatgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 24720513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 25262898 - 25262973
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25262898 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgacgaatatgaggttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 25262973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39060465 - 39060358
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   | | ||||||||||||||    
T  39060465 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgaggttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ctaatgaatatgatgttat 39060368  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  39060367 atgatgttgt 39060358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48301301 - 48301194
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  48301301 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcgtggttgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttat 48301204  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  48301203 atgatgttgt 48301194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45496320 - 45496251
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45496320 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttataagatgttgttcatgattgatgaattatt 45496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1642217 - 1642169
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1642217 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgt 1642169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Original strand, 22824095 - 22824167
Alignment:
Q  113 aatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22824095 aatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22824167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39060415 - 39060340
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||| | |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  39060415 attgatgaattattatatgaatgtatatgctaatgaatatgatgttatatgatgttgtttacgatcgatgaattat 39060340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50543923 - 50543848
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50543923 attgataaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 50543848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6833535 - 6833463
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||  ||||||   || |||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||||    
T  6833535 gatgaattattatatggatgtatacgttgatgaatatgatgttataagatgttgttcatgattgatgaattat 6833463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12710224 - 12710180
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12710224 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 12710180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35660232 - 35660140
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatga 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35660232 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatga 35660140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14508152 - 14508057
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14508152 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 14508057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46740534 - 46740413
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatg-tgac 192  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||     
T  46740534 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga- 46740436  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  46740435 -aatatgatgttatatgatgttgt 46740413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14629452 - 14629377
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  14629452 tatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgttgttatatgatgttgt 14629377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Original strand, 19566580 - 19566675
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  19566580 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 19566675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12622770 - 12622679
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12622770 attgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 12622679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 55582583 - 55582465
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  55582583 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatg-attattatatgaatgtatatg--ttgatg 55582487  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  55582486 aatatgatgttatatgatgttg 55582465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9923621 - 9923545
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9923621 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 9923545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 11479238 - 11479314
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11479238 attgttgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 11479314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26445204 - 26445128
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  26445204 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgatcatgatttatgaattatt 26445128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 46225337 - 46225409
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46225337 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcatgattgaagaattatt 46225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46740471 - 46740350
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaa-tataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   |||     
T  46740471 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg--ttgat 46740374  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  46740373 aaatatgatgttatatgatgttgt 46740350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9621744 - 9621669
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9621744 attgatgaattattacatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 9621669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10272823 - 10272748
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10272823 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttatatgatgttgttcatcattgatgaattat 10272748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13164441 - 13164366
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13164441 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgatcatgattgatgaattat 13164366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14508022 - 14507902
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  14508022 attgatgaattattatatgaatatatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgatcgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 14507925  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  14507924 aatatgatgttgtatgatgttgt 14507902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14508085 - 14507969
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||   ||| |    
T  14508085 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgattttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatatatatg--ttgatg 14507988  T
Q  194 aatatgatgttatacgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  14507987 aatatgatgttatatgatg 14507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46740597 - 46740506
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  46740597 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 46740506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10272882 - 10272766
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||||||||||||    |||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  10272882 attgatgaattattatat----gtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 10272789  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  10272788 attatgatgttatatgatgttgt 10272766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14507956 - 14507883
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14507956 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtatgatgttgttcatgattgatgaagtatt 14507883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 185
Target Start/End: Original strand, 44024259 - 44024348
Alignment:
Q  96 tgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  44024259 tgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatgtcctgtgatgttgttcatgattgatgacttattatatgaatgtatatg 44024348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14629436 - 14629323
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-at-taatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtga 191  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||    
T  14629436 attgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgttgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttga 14629339  T
Q  192 cgaatatgatgttata 207  Q
     |||||||||||||||    
T  14629338 tgaatatgatgttata 14629323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13164457 - 13164385
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13164457 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttg 13164385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35660109 - 35660045
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  35660109 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 35660045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40229701 - 40229626
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  40229701 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgtttacgatcgatgaattat 40229626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 45315002 - 45315122
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||||   ||| |    
T  45315002 attgctgaattattatatggatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattagatgaaggaatatg--ttgatg 45315099  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  45315100 aatatgatgttacatgatgttgt 45315122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 44024736 - 44024798
Alignment:
Q  143 tgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  44024736 tgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgaagaatatgatgttata 44024798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40229717 - 40229644
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  40229717 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttaatgaatatgatgttatatgatgttgt 40229644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46740613 - 46740540
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  46740613 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgagtatgatgttatatgatgttgt 46740540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12622707 - 12622632
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | | |  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12622707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgacgttacatgatgctgttcataattgatgaattat 12622632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26445220 - 26445148
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   | | ||||||||||||||| |||||||    
T  26445220 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttaatgaatatgatgttatatgatgttg 26445148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13164612 - 13164525
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    | |||||||| |||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13164612 attgatgaattattatatgaatgtat----tgatgaatatgatgtcatatgacgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 13164525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Original strand, 12384834 - 12384871
Alignment:
Q  70 tgatgtgttatttaacgaagtttaattgatgaattatt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12384834 tgatgagttatttaacgaagtgtaattgatgaattatt 12384871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9621744 - 9621687
Alignment:
Q  157 attgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9621744 attgatgaattattacatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 9621687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25512985 - 25512941
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25512985 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 25512941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Original strand, 26922455 - 26922499
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  26922455 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 26922499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 337 - 262
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  337 tatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 172
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  251 atgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33926 - 33851
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33926 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 33851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33910 - 33817
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-at-taatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  33910 attgatgaattattatatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg 33817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26749512 - 26749392
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  26749512 attgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 26749415  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  26749414 aatatgatgttatatgatgttgt 26749392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 20198384 - 20198504
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  20198384 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgataaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 20198481  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20198482 aatatgatgttatatgatgttgt 20198504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 206
Target Start/End: Original strand, 21399736 - 21399846
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  21399736 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgctcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 21399833  T
Q  194 aatatgatgttat 206  Q
    |||||||||||||    
T  21399834 aatatgatgttat 21399846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26749449 - 26749331
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  26749449 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 26749352  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgtt 214  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  26749351 aatatgatgttacatgatgtt 26749331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26761826 - 26761717
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||   ||| |    
T  26761826 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatg--ttgatg 26761729  T
Q  194 aatatgatgtta 205  Q
    ||||||||||||    
T  26761728 aatatgatgtta 26761717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 8833825 - 8833916
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8833825 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 8833916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 14026536 - 14026656
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  14026536 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatacgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 14026633  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  14026634 agtatgatgttatatgatgttgt 14026656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16062714 - 16062639
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16062714 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatataatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 16062639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 14026599 - 14026719
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||   ||| |    
T  14026599 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattaatatatgaatgtatatg--ttgatg 14026696  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  14026697 aatatgatgttacatgatgttgt 14026719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16062875 - 16062755
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  16062875 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatggtgttgttcatgattgataaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 16062778  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  16062777 aatatgatgttatatggtgttgt 16062755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20565150 - 20565086
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20565150 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatgaatttatatgatgtgatgaatatgatgtta 20565086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Original strand, 14026469 - 14026564
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||  || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  14026469 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatcttgatgagtatgttgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 14026564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18743983 - 18743892
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  18743983 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgctgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 18743892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 20198321 - 20198412
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  20198321 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 20198412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21503346 - 21503271
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21503346 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgctcatgattgatgaattat 21503271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Original strand, 21399951 - 21400019
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatg 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  21399951 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatg 21400019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26749320 - 26749248
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26749320 gatgaattcttatatgaatgtatatattgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 26749248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 1628046 - 1628137
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  1628046 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgctcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 1628137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 1628109 - 1628200
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  1628109 attgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcatatgatgttgttaatgattgatgaactattatatgaatgtatatg 1628200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 8504522 - 8504597
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8504522 attgatgaattattatatgaatgtatatactgatgaatatgatgttacatgatgttgtttataattgatgaattat 8504597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 8833888 - 8834008
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||  || | ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||| |||   ||| |    
T  8833888 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatggtgttatatgatgttgttcatgattgataaattattacaagaatgtacatg--ttgatg 8833985  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  8833986 aatatgatgttacatgatgttgt 8834008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 14026662 - 14026737
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14026662 attgatgaattaatatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 14026737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16062906 - 16062818
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  16062906 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatggtgttgt 16062818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18743870 - 18743795
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18743870 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgataaattat 18743795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 20198447 - 20198538
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  20198447 attgataaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtccatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 20198538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 21399692 - 21399792
Alignment:
Q  113 aatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatg 212  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   | | ||||||||||||||| ||||    
T  21399692 aatgtatttgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttaatgaatatgatgttatatgatg 21399789  T
Q  213 ttg 215  Q
    |||    
T  21399790 ttg 21399792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 23200122 - 23200205
Alignment:
Q  122 attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    |||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  23200122 attaatgaatatgaggttatatgatattgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 23200205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16062812 - 16062740
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaat 166  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  16062812 attgataaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatggtgttgttcatgattgatgaat 16062740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 20198305 - 20198378
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  20198305 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgagtatgatgttatatgatgttgt 20198378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 21399934 - 21400007
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21399934 tatgatgttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 21400007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30613382 - 30613311
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  30613382 atgaattattatatgaatgtatctgttgatgaatatgaatg-tatatgatgttgtttatgattgatgaattat 30613311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30613697 - 30613602
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  30613697 attgatgaattattatatgagtgtatatgttgatgaatatgaatg-tatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatatatgatgt 30613602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 1628225 - 1628300
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1628225 attgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 1628300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16062745 - 16062657
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  16062745 atgaatatgatgttatatggtgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatataatgttatatgatgttgt 16062657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Original strand, 21401715 - 21401782
Alignment:
Q  103 ttattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21401715 ttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatggattatt 21401782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21503362 - 21503290
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21503362 tatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttg 21503290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 185
Target Start/End: Original strand, 21399843 - 21399925
Alignment:
Q  103 ttattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21399843 ttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttattcaggattgatgaattattatatgaatgtatatg 21399925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26749386 - 26749266
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  ||||| |||||| || ||| |    
T  26749386 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttctttatgatcgatgaattcttatatgaatgtatat-at-tgatg 26749289  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  26749288 aatatgatgttacatgatgttgt 26749266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30611704 - 30611615
Alignment:
Q  100 gaattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  30611704 gaattattatataagtgtatatgttgatgaatatgaatg-tatatgatgtttttcataattgatgaattattatatgaatatatatgatgt 30611615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30611622 - 30611574
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  30611622 tatgatgttgttcgtaattgatgaattattatatgaatgtatatgatgt 30611574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30613609 - 30613561
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  30613609 tatgatgttgttcgtaattgatgaattattatatgaatgtatatgatgt 30613561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30613756 - 30613684
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||| | ||||| | || |||||||| | | | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30613756 atgaattattatatgagtgtatatgttgatgaatatgaggttatatgatgttgttaatgattgatgaattatt 30613684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Original strand, 19957566 - 19957656
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  19957566 atgaatatgatgttatatgatgttgtttattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatttgatgttgt 19957656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35056725 - 35056605
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  35056725 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 35056628  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  35056627 aatatgatgttatatgatgttgt 35056605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 20411322 - 20411433
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  20411322 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 20411419  T
Q  194 aatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||    
T  20411420 aatatgatgttata 20411433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29044582 - 29044465
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaat 196  Q
    |||||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||    
T  29044582 gatgaattattatatggatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaat 29044485  T
Q  197 atgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  29044484 atgatgttatatgatgttgt 29044465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18928148 - 18928072
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18928148 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatattatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 18928072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29044522 - 29044447
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29044522 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 29044447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35056662 - 35056587
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35056662 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 35056587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 23492572 - 23492643
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatg 212  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23492572 tatgatgatgtttattattgatgaattatcgtacgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatg 23492643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 23492658 - 23492737
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23492658 atgaatatgatgttatatgatgttgtttattattgaaggattattgtatgaatgtatatgatatgatgaatatgatgtta 23492737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 23498170 - 23498241
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatg 212  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23498170 tatgatgatgtttattattgatgaattatcgtacgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatg 23498241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 23498256 - 23498335
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23498256 atgaatatgatgttatatgatgttgtttattattgaaggattattgtatgaatgtatatgatatgatgaatatgatgtta 23498335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25921053 - 25920933
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||   |||| |||||||   ||| |    
T  25921053 attgatgaattattatacgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttatgattgatgaattattatgtgaatgtatatg--ttgatg 25920956  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  25920955 aatacgatgttatatgatgttgt 25920933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25921112 - 25920996
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| |||||||   || |||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| |||||||   ||| |||||    
T  25921112 atgaattattatatgaatgtatacgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttatgattgatgaattattatacgaatgtatatg--ttgatgaata 25921015  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  25921014 tgatgttatatgatgttgt 25920996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13285020 - 13284940
Alignment:
Q  105 attatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13285020 attatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 13284940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18585006 - 18584930
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18585006 attgatgaactaatatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 18584930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Original strand, 21680592 - 21680680
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  21680592 gatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 21680680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32259189 - 32259105
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| | ||||||| | || |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  32259189 aattattatttgaatgtatatgttgatgaatataatgttatatggtgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 32259105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22556574 - 22556483
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  22556574 attgatgaagtattatttgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatg 22556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29044652 - 29044528
Alignment:
Q  90 tttaattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||| | ||||  |  |||||||||||  ||| | |||||||   |    
T  29044652 tttaattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgctattcaggaaagatgaattattatatggatgtatatg--tt 29044555  T
Q  190 gacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  29044554 gatgaatatgatgttatatgatgttgt 29044528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13285084 - 13284974
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatga 200  Q
    ||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||||||   ||| ||||||||    
T  13285084 aattattatatgaatgtttatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgattaattat---atgaatgtatatg--ttgatgaatatga 13284990  T
Q  201 tgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13284989 tgttatatgatgttgt 13284974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 19957541 - 19957591
Alignment:
Q  166 ttattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19957541 ttattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgttatatgatgttgt 19957591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35056741 - 35056668
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  35056741 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgattatgatgttatatgatgttgt 35056668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22556467 - 22556392
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22556467 attgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 22556392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10445440 - 10445382
Alignment:
Q  127 tgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  10445440 tgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 10445382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22556605 - 22556519
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgtt 214  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||||   | | ||||||||||||||| ||||||    
T  22556605 atgaatatgatgatatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatttgaatgtatatg--ttaatgaatatgatgttatatgatgtt 22556519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 20411314 - 20411379
Alignment:
Q  149 tgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20411314 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 20411379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35056794 - 35056750
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  35056794 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 35056750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 187931 - 188006
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  187931 tatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgttgttatatgatgttgt 188006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 187947 - 188060
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-at-taatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtga 191  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||    
T  187947 attgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgttgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttga 188044  T
Q  192 cgaatatgatgttata 207  Q
     |||||||||||||||    
T  188045 tgaatatgatgttata 188060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 66347 - 66413
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  66347 tatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgattgtatatgatgtgatgaatatgatgttata 66413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 205
Target Start/End: Original strand, 65659 - 65768
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| || ||| |    
T  65659 attgatgaattattatttgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatat-at-tgatg 65756  T
Q  194 aatatgatgtta 205  Q
    ||||||||||||    
T  65757 aatatgatgtta 65768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 65722 - 65797
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||| || ||||  |||||||||||||    
T  65722 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatgttacatgatatttttcaaaattgatgaattat 65797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 16180307 - 16180420
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||     
T  16180307 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgat 16180405  T
Q  193 gaatatgatgttata 207  Q
    |||||||||||||||    
T  16180406 gaatatgatgttata 16180420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 3528209 - 3528284
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3528209 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 3528284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11191696 - 11191633
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11191696 tatgatgttgttcattattgatgagttattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtt 11191633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11562293 - 11562218
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  11562293 tatgatgctgttcattattgatgaattattgtacgaatgtatatgatgtgatgaatataatgttatatgatgttgt 11562218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 3528146 - 3528266
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   | | |    
T  3528146 attgctgaattattatatgaatgtgtatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttaatg 3528243  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  3528244 aatatgatgttatatgatgttgt 3528266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 16180291 - 16180365
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16180291 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgttatatgatgttgt 16180365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17207535 - 17207415
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  17207535 attgatgaattattatatgagtgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg--ttgatg 17207438  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  17207437 aatatgatgttacatgatgttgt 17207415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 21846261 - 21846381
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  21846261 attgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgattttatatgatgttgttcatgattggtgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 21846358  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  21846359 aatatgatgttatatgatgttgt 21846381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25201278 - 25201203
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25201278 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 25201203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25201337 - 25201221
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||    
T  25201337 atgaattattatatgaatgtttatgttgatgaatatgatgttatgtgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaata 25201240  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  25201239 tgatgttatatgatgttgt 25201221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 24553187 - 24553273
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24553187 tgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcttgattgacgaattattgtatgaatgtatatg 24553273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 24556300 - 24556386
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24556300 tgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcttgattgacgaattattgtatgaatgtatatg 24556386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Original strand, 54330971 - 54331044
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatt 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54330971 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaatt 54331044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11562187 - 11562091
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  11562187 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgtattatgatgttgttcattattgatgaattattgtacgaatatatatgatgt 11562091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 15025876 - 15025968
Alignment:
Q  96 tgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatg 188  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15025876 tgatgagttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgatg 15025968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17207598 - 17207478
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||   |||     
T  17207598 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgaatg-tttatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgagtgtatatg--ttgat 17207502  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  17207501 gaatatgatgttatatgatgttgt 17207478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 24553537 - 24553621
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24553537 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcttgattgacgaattattgtatgaatgtatatg 24553621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 24556587 - 24556671
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24556587 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcttgattgacgaattattgtatgaatgtatatg 24556671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11191552 - 11191488
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  11191552 tatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 11191488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17207661 - 17207570
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17207661 attgatgaattattatatgaatgtatatgtagatgaatatgaggttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 17207570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 215
Target Start/End: Original strand, 22842344 - 22842431
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22842344 atgaatatgatgttctatgatgttgttcataattgttgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttg 22842431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24546104 - 24546018
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24546104 tgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgacgttgttcttgattgacgaattattgtatgaatgtatatg 24546018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12540642 - 12540566
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | |  |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12540642 attgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 12540566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33564554 - 33564478
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33564554 attgatgaattattacatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcttgattgatgaattatt 33564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11562203 - 11562129
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  11562203 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgtattatgatgttgt 11562129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11191605 - 11191544
Alignment:
Q  142 atgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  11191605 atgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgtt 11191544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12540707 - 12540585
Alignment:
Q  92 taattgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtga 191  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||   |||| |||||||    ||    
T  12540707 taatcgatgaattattacatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatctgatgttattcatgattgatgaattattatttgaatgtatatg--tcga 12540610  T
Q  192 cgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  12540609 tgaatatgatgttatatgatgttgt 12540585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 1208733 - 1208801
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1208733 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 1208801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14519683 - 14519595
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14519683 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgataaatatgatgttatatgatgttgt 14519595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17207472 - 17207397
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17207472 attgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattgatgaattat 17207397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 21846324 - 21846399
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  21846324 attggtgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgctaaattat 21846399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24545983 - 24545892
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  24545983 attgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtcttatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 24545892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 24553656 - 24553747
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  24553656 attgatgaaatattatataaaggtacatgttgatgaatatgatgtgttatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 24553747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 24556706 - 24556797
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  24556706 attgatgaaatattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtcttatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 24556797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 50351822 - 50351913
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||  |||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  50351822 attgataaattattatatgaatgtatatgttgatacatatgatgttatatggtgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 50351913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 54331088 - 54331166
Alignment:
Q  94 attgatgaattat--tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54331088 attgatgaattatattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtatgatgttgttcatgattgatgaagtatt 54331166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14519648 - 14519578
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatta 168  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14519648 atgaattattatatgaatgtatatgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcataattaatgaatta 14519578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17207711 - 17207633
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17207711 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgaggttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 17207633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 30175207 - 30175285
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  30175207 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatg 30175285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17044354 - 17044292
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||   ||| |||||||||||||    
T  17044354 tatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatg--ttgatgaatatgatgtta 17044292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Original strand, 24553308 - 24553397
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtata 183  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  24553308 attgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtcttatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtata 24553397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Original strand, 24556358 - 24556447
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtata 183  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  24556358 attgacgaattattgtatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtcttatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtata 24556447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Original strand, 52466145 - 52466182
Alignment:
Q  70 tgatgtgttatttaacgaagtttaattgatgaattatt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52466145 tgatgagttatttaacgaagtgtaattgatgaattatt 52466182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16728023 - 16727975
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  16728023 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatcaatgtatatgatgt 16727975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33564554 - 33564497
Alignment:
Q  157 attgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33564554 attgatgaattattacatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 33564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Original strand, 35065978 - 35066026
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  35065978 tatgatgttgtttattattggtggattattgtatgaatgtatatgatgt 35066026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 402 - 477
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  402 tatgatgctgttcattattgatgaattattgtacgaatgtatatgatgtgatgaatataatgttatatgatgttgt 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 508 - 604
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatct-attaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  508 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgtattatgatgttgttcattattgatgaattattgtacgaatatatatgatgt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 492 - 566
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  492 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgat-tgatgaatatgatgtattatgatgttgt 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7413
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  7322 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Original strand, 7271 - 7379
Alignment:
Q  106 ttatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  7271 ttatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgtta 7368  T
Q  206 tacgatgttgt 216  Q
    || ||||||||    
T  7369 tatgatgttgt 7379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Original strand, 36227 - 36343
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  36227 attgatgaattattatatgaatgcatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgaag 36324  T
Q  194 aatatgatgttatacgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  36325 aatatgatgttatatgatg 36343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 36290 - 36412
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  36290 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgaagaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtgttgatg 36389  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  36390 gatatgatgttatatgatgttgt 36412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 36353 - 36430
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctat--taatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36353 attgatgaattattatatgaatgtatatgtgttgatggatatgatgttatatgatgttgttcataattgatgaattat 36430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 36211 - 36284
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36211 tatgttgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgcatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 36284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 62117 - 61997
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  62117 attgatgaattattatatgaatgtatacgttaatgaatatgatatcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 62020  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  62019 aatatgatgttacatgatgttgt 61997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 62054 - 61979
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  62054 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttacatgatgttgttcataattaatgaattat 61979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 173
Target Start/End: Original strand, 64696 - 64775
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgca 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  64696 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattgca 64775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 13133863 - 13133938
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  13133863 tatgatgttgttcattattgatggattattgtatgaatatatatgatgtgatgaatatggtgttatatgatgttgt 13133938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 13745509 - 13745600
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13745509 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttatatgatgttgatcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 13745600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 15576689 - 15576805
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||  |||  ||||    
T  15576689 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatga--tgataaata 15576786  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15576787 tgatgttatatgatgttgt 15576805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43747859 - 43747739
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||  ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  43747859 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaataagattttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 43747762  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  43747761 aatatgatgttatatgatgttgt 43747739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 13133964 - 13134030
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13133964 tatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatattata 13134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Original strand, 14220371 - 14220435
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14220371 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtta 14220435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 205
Target Start/End: Original strand, 15119975 - 15120084
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||   ||| |    
T  15119975 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatg--ttgatg 15120072  T
Q  194 aatatgatgtta 205  Q
    ||||||||||||    
T  15120073 aatatgatgtta 15120084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Original strand, 37785671 - 37785735
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37785671 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtta 37785735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47093862 - 47093798
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47093862 tatgatgttgtttatcattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtta 47093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 48213661 - 48213737
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48213661 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatgtgatgatttatgatgttgttcatgattgatgaattatt 48213737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 13133808 - 13133871
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtt 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13133808 tatgatgatgtttattattgatgaattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtt 13133871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 15576496 - 15576587
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  15576496 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatgtgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 15576587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 15576622 - 15576742
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  15576622 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgatcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 15576719  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  15576720 aatatgatgttatatgatgttgt 15576742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38294691 - 38294600
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  38294691 attgatgaattattatatgaatgtatacgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattctatgaatgtatatg 38294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38294754 - 38294634
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | || |||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |   ||| |    
T  38294754 attgatgaattattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtccatgattgatgaattattatatgaatgtatacg--ttgatg 38294657  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  38294656 aatatgatgttatatgatgttgt 38294634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43747796 - 43747705
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  43747796 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaagtatatg 43747705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 20253007 - 20253083
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20253007 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 20253083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 4691561 - 4691652
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  4691561 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgtttgatgaagtattatatgaaggtatatg 4691652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8470875 - 8470755
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | || || ||||| ||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||   ||| |    
T  8470875 attgatgaattattatacaaatgcatgtgttgattaatatgatgttataggatgttgttcatgattgaagaattattatatgaatgtatgtg--ttgatg 8470778  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8470777 aatatgatgttatacgatgttgt 8470755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8471045 - 8470929
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||   ||| ||    
T  8471045 ttgatgaattattatatgaatgtatgtgttgataaatatgatgttatacgatgttgttcatgattgacgaattattatatgaatgtatatg--ttgatga 8470948  T
Q  195 atatgatgttatacgatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8470947 atatgatgttataggatgt 8470929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 9743735 - 9743826
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  9743735 attgatgaattattatatgaatatatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 9743826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 9743798 - 9743889
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  9743798 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgtatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 9743889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25941627 - 25941540
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25941627 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatggtgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 25941540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25941690 - 25941574
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||    
T  25941690 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatggtgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaata 25941593  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  25941592 tgatgttatatggtgttgt 25941574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25941753 - 25941637
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||    
T  25941753 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaacatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaata 25941656  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  25941655 tgatgttatatggtgttgt 25941637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 33556909 - 33556999
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  33556909 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatg-tgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 33556999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 36301489 - 36301580
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  36301489 attgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttataagatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 36301580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 15576559 - 15576678
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |  |||| ||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  15576559 attgatgaattattatatgaatgtatatgtagatgagtatgatgttatatgatgctgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 15576656  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  15576657 agtatgatgttatatgatgttg 15576678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8470812 - 8470736
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8470812 attgaagaattattatatgaatgtatgtgttgatgaatatgatgttatacgatgttgttcatgattgatgaattatt 8470736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8472846 - 8472770
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8472846 attgatgaattattatacaaatgtatgtgttgattaatatgatgttatacgatgttgttcatgattgatgaattatt 8472770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8473146 - 8473030
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || || |||||||| ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  8473146 attgatcaattattatatgaatgtaactgttgatgaatatgatgttatac-atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 8473050  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgt 213  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  8473049 aatatgatgttataggatgt 8473030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37538544 - 37538471
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37538544 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 37538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38294770 - 38294697
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38294770 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaaagtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 38294697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 8851842 - 8851920
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8851842 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 8851920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 15119959 - 15120032
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15119959 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaaaatgatgttatatgatgttgt 15120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 36301473 - 36301546
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36301473 tatgatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttataagatgttgt 36301546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8471200 - 8471080
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||   ||| |    
T  8471200 attgatgaattattatacaaatgtatgtgttgattaatatgatgttatacaatgttgttcatgattgaagaattattatatgaatgtatgtg--ttgatg 8471103  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  8471102 aatatgatcttatacgatattgt 8471080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 20253070 - 20253161
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||  | ||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| |||||||    
T  20253070 attgatgaattattatattaatgtatatgttgatgaacatgatattatatgatgttgttcataattaatgaattactatatgaatgtatatg 20253161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 33556893 - 33556957
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  33556893 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 33556957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20619655 - 20619577
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  20619655 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 20619577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25941807 - 25941700
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||    
T  25941807 tatatgaatgtatatgttgaagaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaacatgatgttat 25941710  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  25941709 atgatgttgt 25941700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30237104 - 30237042
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30237104 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 30237042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37538528 - 37538471
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||    
T  37538528 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 37538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8471137 - 8471061
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||  | || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8471137 attgaagaattattatatgaatgtatgtgttgatgaatatgatcttatacgatattgtttattattgatgaattatt 8471061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37538698 - 37538654
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  37538698 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 37538654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Original strand, 48213645 - 48213689
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  48213645 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 48213689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Original strand, 24657 - 24768
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  24657 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 24754  T
Q  194 aatatgatgttata 207  Q
    ||||||||||||||    
T  24755 aatatgatgttata 24768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 24641 - 24714
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  24641 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgagtatgatgttatatgatgttgt 24714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 142931 - 142812
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacga 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| |||||||   ||| ||    
T  142931 ttgatgaattattatattaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgaggaattattatatgaatgtatatg--ttgatga 142834  T
Q  195 atatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  142833 atatgatgttatatgatgttgt 142812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 142868 - 142778
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  142868 ttgaggaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 142778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 142963 - 142875
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  || || |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  142963 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatggttgatgaattattatattaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 142875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7079 - 7015
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7079 tatgatgttgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtta 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1129 - 1053
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1129 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18551 - 18475
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18551 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 18475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7716 - 7641
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7716 ttgatgaattattatatcaatgtatatattgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 7641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14835 - 14760
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14835 ttgatgaattattatatcaatgtatatattgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 14760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 7447 - 7567
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatc-tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgac 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   |||     
T  7447 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgat 7544  T
Q  193 gaatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  7545 gagtatgatgttatatgatgttg 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 7511 - 7631
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||   ||| |    
T  7511 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgatcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatg 7608  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  7609 aatatgatgttatatgatgttgt 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Original strand, 7578 - 7665
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  7578 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgatttatgaattattatatgaatgtatatg 7665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4022 - 3940
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaa 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4022 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgacgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattgtatgaa 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2002 - 1927
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2002 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgacgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 1927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 18307 - 18426
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacg 193  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||   ||| |    
T  18307 attgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatataatgttatatgatgttgttcatgattgatgaataattatatgaatgtatatg--ttgatg 18404  T
Q  194 aatatgatgttatacgatgttg 215  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  18405 agtatgatgttatatgatgttg 18426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 18437 - 18553
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaata 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||  ||||| |||||||   |||  ||||    
T  18437 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttaatgatttatgaattattatatgaatgtatatg--ttgataaata 18534  T
Q  198 tgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  18535 tgatgttatatgatgttgt 18553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Original strand, 18500 - 18570
Alignment:
Q  98 atgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatta 168  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18500 atgaattattatatgaatgtatatgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcataattaatgaatta 18570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 642
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  718 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6224 - 6148
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6224 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 1074
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgtta 205  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1138 tatgatggtgtttattattgatggattattgtatgaatgtatatgatgtgatgaatatgatgtta 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19441 - 19373
Alignment:
Q  102 attattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19441 attattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcatgattgatgaattatt 19373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40449 - 40377
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaat 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40449 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaat 40377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40382 - 40303
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttata 207  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  40382 atgaatatgatgttatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttata 40303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1150
Alignment:
Q  95 ttgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1225 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgactgatgaattatt 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1276 - 1169
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttat 206  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  1276 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgctgttgtttatggttgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgttat 1179  T
Q  207 acgatgttgt 216  Q
    | ||||||||    
T  1178 atgatgttgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 185
Target Start/End: Original strand, 37 - 123
Alignment:
Q  99 tgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  37 tgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatttatgatgttgttcttgattgacgaattattatatgaatgtatatg 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 95 - 186
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||  ||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  95 attgacgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgtcttatgatgttgttcatgattgatgaaatattatatgaaggtatatg 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10086 - 9973
Alignment:
Q  101 aattattatataaatgtatctattaatgaatat-aatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||   ||| |||||||    
T  10086 aattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgaatg-tatgtgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg--ttgatgaatatg 9990  T
Q  200 atgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||| ||||||||    
T  9989 atgttatatgatgttgt 9973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10030 - 9955
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  10030 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgtttacgatcgatgaattat 9955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 5294 - 5370
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5294 attgatgaattattaaatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcttgattgatgaattatt 5370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11150
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  11074 attgatgaattattatataaatgtagatgttgatgaatatgatgttatatgacgttggtcatgattgatgaattatt 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 170
Target Start/End: Original strand, 7519 - 7595
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattatt 170  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7519 attgatgaactaatatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatt 7595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1354 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1354
Description:

Target: scaffold1354; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Original strand, 427 - 502
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||| | || |||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  427 attgatgaattattatttgaaagtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattat 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1354; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Original strand, 397 - 484
Alignment:
Q  127 tgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  397 tgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatttgaaagtatatg--ttgatgaatatgatgttatatgatgttgt 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 81 - 14
Alignment:
Q  97 gatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatga 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  81 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatga 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 168
Target Start/End: Original strand, 4277 - 4351
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatta 168  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4277 attgatgaattcttatatgaatgtatctgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcataattaatgaatta 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 168
Target Start/End: Original strand, 8837 - 8911
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaatta 168  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8837 attgatgaattcttatatgaatgtatctgttgataaatatgatgttatatgatgttgttcataattaatgaatta 8911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 2517 - 2595
Alignment:
Q  107 tatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  2517 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgctatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 2595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27663 - 27591
Alignment:
Q  113 aatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  27663 aatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattttatgaatgtatatg 27591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8218 - 8143
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8218 attgatgtattattatatgaatgtatatattgatgactatgatgttacatgatgttgtttataattgatgaattat 8143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3212 - 3153
Alignment:
Q  126 atgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3212 atgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 56375 - 56300
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  56375 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgactatgatgttacatgatgttgtttataattgattaattat 56300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 62816 - 62907
Alignment:
Q  94 attgatgaattattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  62816 attgacgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtcttatgatgttgttcacgattgatgaagtattatatgaaggtatatg 62907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Original strand, 7194 - 7300
Alignment:
Q  104 tattatataaatgtatctattaatgaatataatgatctatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgt 203  Q
    |||||||| ||||||| | || |||| ||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||||    
T  7194 tattatatgaatgtatatgttgatgagtatgattttatatgatgttgttcatgattgatgaagtattagatgaatgtatatg--ttgatgaatatgatgt 7291  T
Q  204 tatacgatg 212  Q
    |||| ||||    
T  7292 tatatgatg 7300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8224
Alignment:
Q  144 gatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgtgacgaatatgatgttatacgatgttgt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  8294 gatgttgttcatgattgatgaattgttatatgaatgtatatgttgttt--aatatgatgttatacgatgttgt 8224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29893 - 29849
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  29893 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 29849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20385 - 20337
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatgatgt 189  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  20385 tatgatgttgtttattattgattgattattgtatgaatgtatatgatgt 20337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29441 - 29397
Alignment:
Q  141 tatgatgttgttcattattgatgaattattgcatgaacgtatatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  29441 tatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 29397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University